5AA2B

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in complex with nam-pentapeptide.
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
416
structure length
413
Chain Sequence
GVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPPLKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHLGYVGAYTFTQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Lyase
total genus 143
structure length 413
sequence length 416
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2015-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00497 SBP_bac_3 Bacterial extracellular solute-binding proteins, family 3
B PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa2B01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa2B02
1QUJA 5I58A 4OEUA 4KYEA 4BDMA 3FZVA 4KI0E 2O68A 1JVYA 3U92A 4R73A 4H8IA 1POY1 1UTHA 2ONRA 1LCTA 2I48A 3O6IA 3TQWA 1FQEA 3MZBA 3DM0A 2H98A 2XXTA 4R6HA 4GXAA 4YKPA 1LCFA 4DXBA 1URSA 1VR5A 1ZTYA 4IGRA 4H8JA 2XXXA 3T93B 2F97A 2HFBA 3H6VA 3FVOA 3OO9A 4U4SA 2ESNA 5B70A 3PD9A 5ITPA 3L6HA 2AL4A 4F2OA 4F31B 3PMXA 3MW0A 3MAMA 1PBQA 2XXYA 4DE8A 2Y7RA 4BDLA 4YMBA 4Q0CA 1A54A 4GOTA 2P1SA 5H8QB 4HS7A 1H43A 3PMWA 2I49A 1SW4A 1B32A 1OMPA 3CFXA 4AB6A 4GQOA 3R6UA 4YMAA 3IL1B 4FE8A 3H7MA 3FD3A 4OQOA 1HSJA 3C9HA 5K2XA 3OO7A 4IO5A 2ZYNA 1R9LA 1TXFA 3D4CA 4C0RA 2PYYA 1IXCA 5DT6A 1Y4TA 3UN6A 3O29A 3OMBA 2PT1A 2XXVA 3H4ZA 4R9GA 4DXCA 1D3KA 3K2DA 4GL0A 4R6KA 5AA2A 1XVYA 1H76A 2ABHA 4F1UA 2PBWA 4FORA 1IEJA 4GXSB 1VFDA 3MPKA 4PFWA 4FATA 5H8FA 1OQHA 3MBPA 4X1BA 5AE4A 1BLFA 2DOJA 3C35A 1SDXA 1Y3QA 1AOVA 3K1PA 5I57B 1QKAA 1Y3PA 5I58B 1UIVA 3CRBA 5CMKA 1B4ZA 4NWCA 3TCGA 3RN8A 4BLAA 3LSFB 3EHUA 3DP8A 1O64A 3S9EA 1UTHB 5I59A 1OLCA 1II5A 3MP6A 4YKKA 1XOCA 1WDNA 1N7WA 4EXLA 1JQFA 2AL5A 2XXRA 3ZKKA 3PPRA 2Y7PA 1LLSA 3C34A 4C1UA 3IOVA 3MC2A 4U1ZA 5L8DA 3FASA 5F7VA 1NNKA 1B51A 2I4CA 2Z23A 3U94A 2DQVA 3V83A 1AH5A 1OVBA 1MPBA 2X7QA 3VXCA 4F3BA 4OWDA 3K01A 3HO7A 3N94A 3LSWA 3JV9A 3PUVE 3FGSA 1I6QA 3ECRA 4GD5A 1Z7NE 1SYIA 2QL3A 5KDTB 4FIMA 4O3BA 4KR5A 3OELA 2Q9TA 3W9VA 3C31A 2Z22A 4Q8RA 2UVIA 3OEMA 2Q2CA 2OLBA 4HTGA 3H6UA 4MFIA 2QRYA 2XX7A 4TLLB 4U22A 2Y84A 4ZE8A 2ONKE 1Z7ME 4ELOA 2ZYKA 1QUIA 3FVGA 4POWA 1S7YA 3TCHA 4O3AA 2F35A 2I58A 4FEDA 5L9SA 3MPLA 5ICQA 3HHFA 5ELVA 3F11A 1SD3A 2PMSA 4E0XA 4IO4A 3QAXA 1MH4A 5TP9B 4G68C 3RT6B 2DE2A 1TFDA 2G29A 2HZLA 4ESWA 1XT8A 1IQ7A 2DSFA 2XX8A 1M5EA 1TFAA 3H03A 4MLVA 4BDQA 4GIZA 3O6GA 1M5CA 2GRVA 4ZECA 1ZIUA 1USYH 4E0WA 4F29A 4IB2A 2ZYMA 5I59B 3ONMA 4BDNA 4JDFA 1DTZA 4Q30B 3LSXA 1IXIA 4LZ8A 1JW1A 3MVZA 4OERA 1URDA 3IJXB 3AXFA 3CIJA 3PUWE 4ZZEA 3O9PA 1EU8A 3OO6A 1N3WA 3G7WA 4F18A 3OD7A 1B2HA 2OCUA 5J1DA 3MP1A 4NWDA 3SETA 3O66A 4NTLA 4L17A 3RGYA 3VXBA 4IGTA 2WKYA 4RK2A 4KYDA 1SW2A 5DVIA 3A3UA 4LONB 1LFHA 1FCKA 1B46A 3CSBA 3HPIA 4R2FA 1RKMA 3HHGA 3OSRA 3TTMA 3TUSA 3H6WA 4XKNA 1LFGA 1B9JA 2FA7A 3B6QA 5CI5A 1TWYA 2VD2A 4LZ5A 1N0TA 2PVUA 2B65A 4RY1A 5EYFA 3GLBA 3UIFA 1UQWA 3LUYA 2HEUA 3FVKA 5CMMA 3S2VA 1B0LA 4BDOA 1PDAA 2DYXA 3ZS6A 4IY6A 3THIA 4G8HA 4WEDA 3DELB 5JTYB 1A99A 3TFLA 1MXXA 4JSOA 1OIBA 1LBCA 3H3GA 1B5JA 1B52A 1FTLA 3MQ9A 1FW0A 3Q28A 4LUBA 2RKMA 1N04A 4DXUA 3ZSFA 2I3VA 4R2BA 3KN7A 1IXGA 4ZS9A 2DXRA 2YJPA 5H8SA 1NKXA 2O7UA 1H45A 1Y1MA 4NF6A 3USDA 1NMUA 2REGA 1LB9A 1IXHA 4KPTA 4IO6A 3D4GA 3ILTB 3U93A 3SERA 3PUZE 4EDPA 5I57A 4OHNA 4NF5A 3DP6A 1PC3A 4U23A 4OFJA 1IIWA 4R72A 4YAHX 1MQHA 3ZKLA 1EZOA 1QVSA 3TTRA 5BWJA 2GH9A 4GWOA 4LZ7A 4ONYA 5FTHA 2NWJA 1MPDA 3IB0A 1B58A 2UVJA 3KJ7A 1TT1A 1EZPA 1Q35A 4OYVA 2E0SA 3U1OA 4DLDA 1S50A 1B3EA 2HZKA 1LAFE 1SI1A 4RA1A 2ZNSA 4ZDMA 1FQBA 5BUUA 3K00A 4N6PA 4RK9A 2Z8DA 3N26A 3IB1A 4LATA 1N7XA 1XVXA 3N6TA 3TPAA 2V3UA 4FEBA 3RQTA 1B5HA 1A40A 1B40A 3CFLA 3LBSA 2YPNA 3OOAA 3K02A 3BFTA 1PBPA 1R9QA 1MY0A 5TU0A 3TTLA 5I56A 3BFUA 3GZGA 2Y7KA 2Q88A 3E3KA 4I9DA 1P1QA 3KN3A 5KDTA 1FQAA 3U8QA 4ZEBA 2I0BA 3Q26A 2GHAA 4NF8A 4FJPA 3V8XB 2ZNTA 4YZZA 4QFOA 2XXIA 2DWHA 1JW4A 5L9OA 1H3DA 2OBGA 4PP0A 5KCJB 5DEXB 3UK4A 3FJMA 2X26A 3KZGA 4G4PA 4ESXA 5FHMA 2H9BA 2DE3A 3E9XA 5CBSA 3KG2A 4U2RA 2O51A 3IB2A 4FECA 4DCYA 3BKIB 3TTKA 2DWAA 1RYOA 2R9JA 2F7BA 1GVCA 4NF6B 5TP9A 2FNCA 4YB5A 4N07A 4G68B 4WXJA 2OZZA 1LSTA 2B3FA 3TAJA 4F1VA 4NF5B 3S4UA 1CE2A 3RPWA 5CC2A 1M5FA 1D9VA 2H25A 4F1YA 2O84X 1LBBA 3C36A 1B1HA 4NE4A 5DYHA 5IKBA 2HAVA 1T0KA 3CR9A 4JXIA 4IY5A 2QJEA 2VD3A 3FXUA 3W15C 1CB6A 4QSCA 2O69A 1SW1A 3T22A 4EXKA 4I62A 1VSOA 4LA9A 3U72A 4C1TA 3TYHA 1ELJA 4QSEA 3M8UA 3PPNA 3Q29A 4QFPA 2XXHA 3IK6B 4WKMA 2XD3A 2GFEA 3G3IA 4QHQA 4GLIA 1D4NA 4G8MA 4Q5TA 3MVWA 4EUOA 5KZTA 2F6PA 2HXWA 2ZNUA 3OSQA 5I56B 1QJMA 2RC7A 2VGQA 1LAXA 3ILUB 3IOWA 4K3FA 5DVFA 2XXWA 4DDDA 2RINA 1XHYA 1DPEA 3KSXA 4NF8B 1SQYA 3QUJA 5H8NB 3QXMA 3SDFA 5JEIA 1OVTA 2W7YA 3G3HA 3GXAA 2DVZA 4H6DA 1QULA 2A5SA 1N3XA 3CVGA 4Z0IA 3OXNA 5AA1A 2D21A 1LFIA 3MJNA 1QKBA 4RPOA 1Q1KA 1BIYA 2XXQA 5JTYA 3FUZA 2XD2A 2QMXA 4GF8A 4NMYA 1FTKA 2ZMBA 1M5BA 4M1VA 4X1DA 5IAIA 1I6BA 3S9MC 1MXYA 4H5GA 1MM7A 4YICA 4TOZA 3FATA 2HQ0A 2QS2A 3PPQA 4F19A 4G2ZA 5A5XB 3FXRA 5HBCA 1GV8A 2O6AA 1YCJA 1US4A 3HSTA 3MP8A 2F34A 1B7ZA 3TDJA 4JB7A 4UACA 3MZ9A 1EH3A 3B6TA 4AQ4A 5L9MA 1GR2A 4FAJA 1FQFA 2V3QA 3CFZA 1MG1A 3Q27A 3C4MA 1P1UA 2THIA 3RUMA 4IO3A 5FHNA 3KOSA 3DLNA 3I6VA 3QIMA 3FJ7A 1YAEA 4G8NA 3PU5A 3TEPA 3EF7A 3RNNA 2O7IA 3I5OA 2CZLA 3QYTA 4NF4A 4YU0A 5F1QA 1B7HA 2V84A 4THIA 1MXWA 3T9UA 2H99A 3T9XB 1AMFA 3K1NA 3KGCA 2O1MA 1MY2A 1OLAA 2PT2A 1ATGA 3VV5A 4PFTA 3K6XA 1P1NA 3K6VA 2V3TA 4LP2B 3G3KA 3E13X 5I84A 4PE5B 1IITA 4OMBA 3MWBA 2DS9A 1DOTA 4OVJA 3IO4A 3M3LA 1MM6A 2XX9A 5TPAB 1JEVA 3IX1A 4O3CA 3IR1A 2F8DA 3MVYA 3I3VA 1JVXA 3CI8A 2NOOA 2F5XA 5H8HA 3PV0E 1RYXA 5KCJA 5DEXA 3K6UA 4P11A 3LC8A 4H5FA 3R7XA 2XHDA 4N13A 1MXVA 2ONSA 3TODA 5I2KB 2GHBA 1NH8A 3G3GA 1GTKA 4M4GA 5I2NB 4OESA 2Y7IA 3EQ1A 2BJJX 2OK2A 3A3CA 2OWTA 2UYEA 3G3JA 3JZJA 2Q8JA 4U4XA 2F7CA 4XTCQ 1MPCA 3T96B 3KN8A 4R74A 4G68A 1WVJA 1ANFA 4ELRA 3M3KA 3UORA 2VOZA 3GBAA 2RCAA 3OEKA 3PPPA 3V89B 4ISUA 1NNPA 3RLFE 2QSXA 2VHAA 3KJTA 1IZ1A 1B4HA 4KFQA 4QFLA 3EPEA 4EF2A 3TMGA 1MS7A 2DXYA 2R71A 3VVDA 4H67A 2V25A 2Q89A 3IOUA 1NNTA 3VLWA 4RYAA 4DZ1A 4OTEA 1BP5A 2QPQA 5DTBA 3B6WA 4GRKA 4JWYA 4OFOA 3SEWA 4JWOA 5CMBA 4KD5A 4RNSA 5B7DA 3LSLA 3KBRA 5FHOA 3OO8A 2I6EA 1VE4A 3PUYE 3WAEA 4PETA 4NF4B 4F2QA 2HCAA 3TKDA 5ITOA 4ELQA 3OENA 3T66A 3FJGA 1L5TA 1YPNA 3TQLA 4IO2A 5CMCA 4H0WA 5CM6A 4ZEIA 4F39A 4JSDA 3HN0A 1POTA 3K0VA 3FV1A 4ZZAA 1ZBMA 1F9BA 1Y4CA 1DPPA 3SEYA 1Y20A 2A5TB 1VFEA 1OQGA 5AA4B 3R26A 1UTBA 3RTWB 2X7PA 4F3PA 4BDRA 5H8NA 5M2VA 2H4IA 3QK6A 2OWSA 1GGGA 2I4BA 4G77A 1FTOA 2REJA 3GBBA 5H8HB 3O6HA 3W9WA 4QFKA 4RJZA 4I8CA 2QS4A 2IA4A 2UVGA 2VP1A 4ND9A 4R9FA 2RC9A 1FTJA 3SESA 1N84A 4KYSA 3IAZA 4OEVA 1SI0A 4ECFA 2B3BA 2NVUB 3MZ1A 3CG3A 4YKJA 3C33A 1A7LA 4KCCA 4ZEDA 4ELPA 2QS1A 2E1SA 3KEIA 2QS3A 4PFYA 2I3WA 2CMOA 1BKAA 2ALUA 4RXLA 3CSGA 1NL5A 3A09A 1B1XA 5DVJA 4QSDA 3LR1A 2DWJA 1BTJA 4QF9A 5A5XA 3VLUA 4R75A 1A55A 1AIVA 1URGA 4TQUQ 1SW5A 3IORA 2F7AA 4AB5A 1SBPA 4MLQA 1B05A 3N5LA 1DSNA 3CG1A 3SKPA 4Z7EA 2DVCA 5HPQA 4KHZE 5CBRA 5AA3A 1DTGA 1B3FA 3UGWA 1ZLQA 3V5AA 4U21A 4MH5A 3FXQA 5EHMA 2HAUA 3HV1A 4MF3A 3SEXA 1PB8A 3VVFA 1B3HA 3HCQA 4UA8A 4XIGQ 3TELA 2O1LA 3BBRA 3PD8A 1ZJLA 4U1OA 1J1NA 3Q25A 4XKRA 3B7DA 3N6UA 2IEEA 2D5WA 1QW0A 2F78A 4EQBA 4DIGA 2OJTA 4DCXA 4OZ9A 4GL8A 2YLNA 4QRZA 3EHTA 1UIUA 1NFTA 2DWIA 2PX1A 1EZ9A 1UTBB 4PFUA 1LAGE 3FV2A 1LAHE 3QSLA 1FQDA 1MY3A 3RTFB 1O63A 4F22A 2D3IA 1MDQA 4GFRA 4ZEFA 3KFMA 3MUQA 3S9NC 3T9VA 5K2YA 5TPAA 1H44A 4R6YA 3E4RA 3PUXE 4F3GA 1O7TA 3IOTA 1B3LA 3PPOA 1MQGA 1JEUA 1I6AA 5EHSA 2AIXA 2DP8A 1XC1A 2NUVA 3T9HB 3RT8A 4ZEKA 3O97A 2DE4A 5ICTA 4EF1A 4YB7A 1MQJA 2Z8FA 1SVXB 5I2KA 1D9YA 5AA2B 1B5IA 2AYSA 3VE1B 1NH7A 2UVHA 4XKPA 5I2NA 4LQ5A 5AA2D 4XKQA 2ANJA 2KLFA 1LB8A 4IO7A 5JK4A 3H06B 5H8FB 2V93A 3TCFA 1N76A 3MVXA 1MXZA 3O2AA 4WEPA 4RPNA 1MH3A 1HSEA 3C32A 1B0HA 2UYFA 4P0IA 3EHSA 4QFNA 4MBPA 1SYHA 3FIRA 3UA8A 1S9TA 1R6ZA 3VFJA 4KCDA 3SEUA 1AL3A 1USYE 2XXPA 3UP9A 4I1DA 1MY4A 4H1XA 4OENA 2LAOA 3KOTA 2G93A 4EQ9A 2ZXTA 1MQDA 4TLMB 2QMWA 5FTIA 4YB6A 3VLVA 1B7UA 1ZMGA 4X9TA 3SEVA 4NEDA 1JETA 1MDP1 1B3GA 3H6TA 4XXUA 3O28A 3EN3A 4YKIA 1Y9UA 4EQ7A 1KWHA 2ZYOA 1WODA 3L6GA 2R6GE 4ZE9A 4JBZA 4H65A 1IUDA 3G3FA 1A8FA 3DP4A 1MXUA 3IJOB 4LQ2A 2F6GA 1PB7A 1MRPA 3ODBA 1LGBC 3K1MA 4HCWA 1NNFA 1PB9A 2FYIA 1QUKA 3K4UA 4POXA 1MQIA 1FTMA 4HW8A 2P0SA 3PGFA 2A5TA 3IO6A 4OFLA 2RF1A 5H8QA 5AA4A 1M5DA 1US5A 2H5YA 1JNFA 5ISUA 1PEBA 3TTNA 1ZKBA 3JYRA 1XS5A 3M3FA 2RC8A 2RCBA 1R1NA 3VVEA 4GVOA 4F3SA 3RY3A 4OETA 1P99A 2F36A 1FQCA 2Y7WA 1P1OA 1A8EA 3P7IA 4HCYA 1B6HA 4KQPA 1HSLA 2P2AA 1ZU0A 4PQJA 4OXVA 3S9LC 3PMVA 5HM4B 2XXUA 2Q2AA 1JW5A 3WAFA 3KSJA 4JWXA 5LOMA 2NXOA 3FVNA 4P0GA 3K6WA 2UXAA 4X48A 1MY1A 3VDFA 1Y3NA 2I0CA 2M8CA 3QUFA 1DMBA 2Z8EA 1I69A 1P1WA 3TZAA 1YTVA 1Y1ZA 5CRYA 4LVQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QUJA 4P1LA 5I58A 4OEUA 4KYEA 4BDMA 3MSTA 3FZVA 4KI0E 2JJKA 2O68A 1JVYA 3U92A 4R73A 4H8IA 1POY1 1UTHA 2ONRA 1LCTA 2I48A 3O6IA 3TQWA 1FQEA 3MZBA 3DM0A 2H98A 2XXTA 4R6HA 4GXAA 4YKPA 1LCFA 1K9YA 4DXBA 5ET6A 1URSA 3RYDA 1VR5A 1ZTYA 2FIXA 5I5PA 4IGRA 4H8JA 2XXXA 3T93B 2F97A 2HFBA 3H6VA 3FVOA 3OO9A 4U4SA 2ESNA 5B70A 3PD9A 1NI9A 4GWSA 5ITPA 3L6HA 2AL4A 4F2OA 4F31B 3PMXA 3MW0A 3MAMA 1PBQA 1IMEA 2XXYA 4DE8A 2Y7RA 4BDLA 4YMBA 3LUZA 4Q0CA 1A54A 4GOTA 4FBPA 2P1SA 4KXPA 5H8QB 4HS7A 1IMFA 1H43A 4PDDA 3PMWA 2I49A 3A29A 1SW4A 1B32A 1OMPA 3CFXA 4AB6A 4GQOA 2F3BA 3R6UA 2ZZVA 4YMAA 5T3JA 3IL1B 1NV0A 4FE8A 3H7MA 4OVSA 3FD3A 4OQOA 1HSJA 3E79A 3C9HA 3NOHA 5K2XA 3OO7A 4IO5A 5ET8A 2ZYNA 1R9LA 1TXFA 3D4CA 4C0RA 5J16A 1G0IA 2PYYA 1IXCA 3B50A 3QMFA 2KR0A 5DT6A 1SPIA 4P3LA 1Y4TA 3UN6A 3O29A 3OMBA 2PT1A 2XXVA 4I40A 3H4ZA 4R9GA 4DXCA 1D3KA 5FBPA 3K2DA 2FBPA 4GL0A 4R6KA 5AA2A 1XVYA 3HFUA 1H76A 3KC1A 2ABHA 4F1UA 2PBWA 4FORA 5ET5A 1IEJA 4GXSB 1K9ZA 1VFDA 3MPKA 4PFWA 4FATA 5H8FA 1OQHA 3MBPA 4X1BA 5AE4A 4GX4A 2QVRA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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