5AA4A

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in complex with cell-wall tetrapeptide
Total Genus 142
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
142
sequence length
418
structure length
418
Chain Sequence
EGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFAQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Lyase
total genus 142
structure length 418
sequence length 418
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.2.2.-:
pdb deposition date 2015-07-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa4A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa4A02
4OFLA 1KWHA 3GZGA 4R6HA 1IXHA 1LLSA 3CFLA 1F9BA 4PETA 4ZE8A 1T0KA 2XX7A 4G68A 5H8SA 1MY0A 3MVXA 2I3WA 2O1MA 3S9EA 4OFOA 4NF8B 1IXIA 1GR2A 1Z7NE 3KN3A 2XXPA 4JDFA 3U72A 2YLNA 2I4BA 2G29A 1OVBA 4RPNA 1MQGA 2E1SA 1NH7A 3TCFA 2F7AA 3N6UA 3H06B 5ITPA 4R9FA 2ESNA 3MZ9A 1XS5A 4OEVA 2DVZA 1MPBA 1NNFA 3IOWA 2DYXA 2UYEA 3Q29A 1UQWA 5L9MA 2QMWA 1LBCA 2ZXTA 2PT2A 3VXCA 3G3FA 3IB1A 2V25A 3CVGA 4GXSB 1LAXA 4HCYA 2B3FA 2XXQA 5CMBA 1DSNA 1BTJA 1LAGE 2NUVA 1YTVA 4XTCQ 2H25A 2XXUA 4U4XA 3CFXA 4YKKA 4F31B 4ELOA 2W7YA 5BWJA 2ZNTA 3K1NA 4LP2B 4OVJA 3V83A 1L5TA 4HS7A 3C35A 3TTKA 2DP8A 1B32A 2VOZA 4MLVA 2VP1A 5CM6A 3FVKA 3LUYA 2O84X 5CBRA 1B7UA 5JTYA 3CR9A 3Q26A 4G68C 1MS7A 4F3GA 3HHGA 3C33A 3TYHA 3VVFA 3TFLA 3K6VA 2V84A 4F18A 4FE8A 1B40A 1UIVA 5JTYB 4OHNA 1MG1A 2HZKA 3HO7A 4C0RA 4U21A 3W15C 3S9MC 2RC7A 1O63A 4FEBA 3T96B 1SI1A 2Q89A 2I4CA 4KCDA 4OTEA 1EZPA 5I2NA 4E0XA 4I62A 4FIMA 3U8QA 5EHSA 3O6GA 4JBZA 4UACA 5CMKA 3D4GA 4R9GA 3HSTA 1IITA 2RINA 4I8CA 4YICA 4GL0A 3IJXB 3LR1A 1VFDA 4F29A 4OYVA 1CE2A 1MPDA 4KPTA 1B1XA 3KOTA 2O51A 2NXOA 3LBSA 1BIYA 4H0WA 2DWHA 1SQYA 3UN6A 1PB8A 3FIRA 5HPQA 1SW4A 4H65A 3Q25A 3E9XA 1FQBA 2AYSA 5CMCA 3HHFA 1JEUA 4ESXA 3HCQA 1ZBMA 2Y7WA 4U2RA 3IOVA 4RJZA 2AIXA 1LBBA 3L6HA 2I6EA 3JZJA 1SW5A 2R71A 4ECFA 5DVIA 3IOTA 5KCJB 3ZKLA 3QUFA 3O29A 1LAFE 1R6ZA 5H8HA 3GBAA 1FQCA 4U23A 3ONMA 1P1NA 2B65A 2HQ0A 3M3FA 3PMWA 1JQFA 5L9SA 2GHAA 2UYFA 5H8HB 2Z23A 2Y7IA 4H5FA 1B3FA 1ZU0A 3MUQA 3PUXE 5DT6A 4JWYA 1JVXA 1N3WA 4DDDA 1SD3A 5I59A 2UXAA 4P0IA 4O3AA 4QFKA 1AMFA 4FATA 1QUIA 4HTGA 1IZ1A 3H03A 3BKIB 4MH5A 1ELJA 3UIFA 1AIVA 4JXIA 3E3KA 3SEUA 4I1DA 1GVCA 1H3DA 4EF2A 5K2XA 1B3GA 3JYRA 5I59B 3KGCA 1MM7A 3HPIA 1QKAA 3FXRA 3M3LA 3TZAA 2XXHA 2QS3A 3O9PA 2AL5A 3OSRA 3TTMA 4HW8A 4ZEKA 4LUBA 2GRVA 1GGGA 3C4MA 3W9WA 4DXUA 3C32A 1B6HA 4F1YA 3MBPA 3TTLA 1B0HA 1B1HA 4LZ5A 4TLMB 2D3IA 2M8CA 2Q2AA 4H8JA 4M1VA 5TPAA 2F36A 4PFYA 2DSFA 1YAEA 4LQ5A 2I3VA 1PDAA 2QS1A 2DWAA 1QVSA 1SW1A 1MXYA 3UGWA 1A54A 3OD7A 3IB0A 3KJ7A 5TPAB 1NFTA 4LQ2A 3USDA 2V3UA 3OMBA 3S4UA 4KI0E 1NNTA 1UTBA 3PGFA 3CG1A 2XD2A 5EYFA 1IUDA 3VLUA 2PMSA 5TU0A 2DOJA 3SDFA 2IEEA 5JK4A 4BDRA 3K4UA 5LOMA 3H6UA 5KZTA 4RYAA 2F7BA 3PPQA 1H44A 1UTBB 4YU0A 1JETA 3IO4A 3K6WA 1US4A 4XXUA 3OEMA 4F2OA 3TTRA 2ZNUA 5KDTA 3IAZA 3RUMA 2H9BA 2VGQA 3E4RA 1B0LA 3FJGA 4H5GA 5CBSA 4K3FA 1H45A 2R9JA 3DLNA 1NL5A 4NF4A 2QSXA 5H8NA 3LSFB 4KQPA 1B51A 5KDTB 3KEIA 3N26A 1VFEA 2O1LA 4OFJA 1A8EA 3ILUB 1MDP1 4NF4B 1WODA 1SW2A 3K1PA 2OBGA 4BDMA 1B3HA 3VLWA 3PUZE 1OQGA 5AA2A 3MP6A 1N84A 3VV5A 4RA1A 3FVGA 1ZJLA 1MY4A 3TPAA 4U4SA 2P1SA 5AA2B 2D5WA 4UA8A 1SDXA 1A7LA 2P2AA 3ILTB 4GFRA 3MPLA 5I58A 1MQJA 3UK4A 3DM0A 3EF7A 3RGYA 1S9TA 1MY3A 3SERA 1H76A 2XX9A 1Q35A 3A3CA 1FTKA 1M5DA 4R74A 2V93A 3BFUA 4NF8A 2FA7A 5I58B 2V3TA 3MZBA 1PB7A 1Z7ME 3H4ZA 3S2VA 4MLQA 1B3LA 1HSLA 2QMXA 4OEUA 1US5A 3JV9A 2G93A 1VSOA 2R6GE 2Z22A 3LC8A 4JSOA 2A5TA 2F78A 2PT1A 1P1QA 5DVFA 4U1ZA 3MVYA 2YJPA 2XXVA 2ANJA 4ZZEA 2XXWA 1PB9A 1B5IA 3I3VA 1O7TA 3QYTA 3WAFA 2A5TB 4IB2A 3SEWA 5ISUA 2REJA 4DCXA 1B4ZA 5ICTA 1ZLQA 2NWJA 1IXGA 3PUWE 1FQFA 3K2DA 3O6HA 3G3HA 5FTIA 1FQDA 1TXFA 1XHYA 4GIZA 3I5OA 1SYHA 5F7VA 1M5EA 3FATA 5H8FB 1SI0A 4RPOA 1FCKA 3KFMA 1Y3NA 3MC2A 3IR1A 4MFIA 1B7HA 3K0VA 3KSJA 4U22A 3MPKA 3OELA 1USYH 5H8QB 3MVZA 3QK6A 4XIGQ 3OOAA 2OCUA 1M5BA 1DTGA 3T93B 3K6XA 4YB6A 4LZ8A 5I84A 3UP9A 3WAEA 3N5LA 1QW0A 4X9TA 1JW4A 4GOTA 4F3PA 5F1QA 4R6KA 3SETA 4H67A 1D4NA 2Z8EA 4YKPA 3Q27A 5CC2A 4TLLB 1OLAA 4QFPA 4OENA 1N0TA 3O2AA 2RC8A 3N94A 4JWXA 3S9LC 1B7ZA 1QUJA 4O3BA 3R7XA 4RNSA 3A09A 1D9VA 4NWDA 1NKXA 1MQIA 3OO8A 3UA8A 4X1DA 1JW5A 3PMXA 4QSDA 4G8HA 2I0CA 3PD9A 1M5FA 4F2QA 4H8IA 4G77A 3PPOA 5L9OA 3VDFA 4YKIA 3BFTA 1JNFA 2Q2CA 2IA4A 3OENA 3FV1A 2XX8A 3M3KA 4RY1A 5CRYA 3BBRA 1GV8A 4Z7EA 1UIUA 3H6VA 2HXWA 4QFNA 2QL3A 1PBPA 4NE4A 4C1UA 1D3KA 1LFGA 5IAIA 5HBCA 5KCJA 4ISUA 3PUYE 3RTFB 2NVUB 1DMBA 4BLAA 5DYHA 2O68A 2GFEA 3W9VA 2F7CA 2ZYMA 2DE3A 1WVJA 3H7MA 1TFAA 3K01A 4YB5A 1MQDA 4OQOA 4E0WA 1ATGA 4FJPA 4F19A 4F39A 4IO7A 2F6GA 2ONRA 1HSEA 2HCAA 2OK2A 4GWOA 2OJTA 3E13X 3CFZA 3FGSA 3O6IA 4OESA 1FQEA 1Y9UA 2ALUA 4WEPA 3VXBA 5AE4A 1VR5A 1LSTA 3TCGA 2OWTA 5AA4A 1AH5A 4H1XA 1FQAA 3QAXA 4R2BA 3ZKKA 3O66A 4IO4A 3KG2A 4G2ZA 4GQOA 1DPEA 4F1UA 1HSJA 5ICQA 1BKAA 5AA4B 2DXRA 1LFIA 4GL8A 1JVYA 4LATA 4R6YA 3K00A 2VHAA 1I6BA 4ZEDA 3RNNA 4NF6A 3KSXA 1POTA 1LB8A 1XVXA 2Q9TA 3SEYA 2ZMBA 3GBBA 2REGA 4ZZAA 4KHZE 3T9HB 5AA2D 5JEIA 4NF6B 1BLFA 2Y7KA 1AL3A 4XKRA 1MXXA 2UVHA 4N13A 3HN0A 2RC9A 2Y84A 2CMOA 3RT6B 3D4CA 4HCWA 1H43A 3EHUA 4TQUQ 1IEJA 1LGBC 1XOCA 1D9YA 2XXXA 3G7WA 2Q88A 1RYXA 2H99A 1O64A 4BDLA 4KFQA 2NOOA 4KYSA 4OMBA 3RQTA 4OZ9A 1PEBA 4AQ4A 4MF3A 2DS9A 2DQVA 4N07A 3U92A 4KD5A 4ONYA 4RK9A 4POXA 2I49A 1Y4TA 5CI5A 4GF8A 1B9JA 4YKJA 3UORA 2Q8JA 2WKYA 1JW1A 4IO6A 4C1TA 3VLVA 3THIA 3V8XB 1PC3A 4G4PA 5I57A 1B46A 3TEPA 2FYIA 3DELB 2F97A 2XXRA 5I2KA 1UTHA 3RT8A 3MP8A 2RCAA 2HEUA 5B70A 4Z0IA 1I6QA 2O7IA 3KBRA 1QJMA 3TMGA 5I57B 2OLBA 5FHNA 2P0SA 4ELPA 4PFWA 5I2KB 4DZ1A 1UTHB 3U94A 4IO2A 2HZLA 1NNKA 3AXFA 3OEKA 3IO6A 3RTWB 1POY1 4G8NA 5ITOA 4GXAA 3MW0A 1FTOA 3TAJA 3F11A 1SBPA 3CI8A 3CIJA 4KR5A 4XKQA 2ZYKA 3OXNA 3SESA 2ZYOA 1OVTA 1MXWA 1MXVA 2QPQA 4M4GA 2X7PA 3H6WA 1GTKA 4JB7A 3K02A 3TTNA 3MP1A 4PP0A 3FJMA 4KCCA 1NNPA 3EN3A 4XKNA 2FNCA 3QUJA 3VFJA 3G3KA 4EQ7A 4JWOA 3OO9A 1A8FA 3QIMA 1TFDA 4IGRA 3PUVE 1NMUA 1B58A 4PE5B 2CZLA 3CRBA 2DVCA 4LONB 3PU5A 1LFHA 1LB9A 4ELRA 1Y1ZA 3CSGA 4WEDA 3FJ7A 5EHMA 4EDPA 2XXIA 3VVDA 2DE4A 3GLBA 1FTLA 4POWA 2HFBA 3KOSA 1J1NA 3M8UA 3RLFE 1B2HA 4G68B 4F1VA 1LAHE 3B7DA 4EXKA 4H6DA 2ZYNA 5H8FA 5L8DA 4BDNA 2Y7RA 1QULA 3H6TA 3T66A 3TUSA 1MM6A 5K2YA 1MH4A 1B52A 1ZTYA 2ONKE 1Y3PA 5H8QA 4ZDMA 1PBQA 3EHTA 3IOUA 2D21A 3IORA 4DCYA 2O69A 1TWYA 1BP5A 5TP9A 4ZS9A 3MQ9A 4DLDA 2VD2A 3O97A 1URSA 3SEXA 3B6TA 3S9NC 4GVOA 1N7WA 5TP9B 4NMYA 3T9UA 3PPPA 5FHMA 3TQWA 4R72A 4F22A 2BJJX 4F3SA 5M2VA 4L17A 4FECA 2DXYA 1Y20A 3K6UA 1EZOA 2DWIA 4WKMA 3CSBA 1FTJA 1ANFA 1MDQA 1IIWA 4O3CA 2PVUA 3OO7A 1B5JA 3C9HA 1NH8A 1LCTA 2RF1A 1SYIA 3PPRA 1OQHA 1B05A 2VD3A 3TKDA 2ZNSA 4BDQA 2HAVA 3T9VA 3KN8A 3RN8A 1A55A 1P1UA 2XHDA 3R26A 3FXUA 2KLFA 1B5HA 2B3BA 1B3EA 4R2FA 2QJEA 3RY3A 4EQBA 1WDNA 4IGTA 2V3QA 2F8DA 2THIA 1A40A 3G3GA 4DXBA 3K1MA 1XC1A 1Y1MA 2X7QA 3C34A 4FAJA 3PMVA 4NF5A 2YPNA 3A3UA 4X48A 3DP6A 3PV0E 3OO6A 2I0BA 2O6AA 3IB2A 4PFUA 5DVJA 1P1OA 4KYEA 1A99A 2HAUA 3C31A 4X1BA 2Y7PA 4Q30B 1YPNA 2E0SA 1QUKA 2Z8FA 5I2NB 2XXTA 3MJNA 4NF5B 1S7YA 3IJOB 3MAMA 5B7DA 4ZECA 4P11A 4QRZA 1N04A 2O7UA 3VVEA 3KZGA 4TOZA 4QHQA 4DXCA 5CMMA 1FTMA 1MRPA 4EUOA 3B6QA 2PBWA 4RK2A 1IXCA 1USYE 5DEXA 3IL1B 4FORA 3PD8A 3FUZA 5ELVA 1MPCA 4MBPA 4IY5A 1DOTA 1URGA 4ESWA 5J1DA 2H5YA 1Y4CA 4QF9A 4DE8A 5DEXB 3O28A 3HV1A 4EQ9A 4ZEBA 2XXYA 4QSCA 4JSDA 4NWCA 3Q28A 3R6UA 4QFLA 2PX1A 5AA3A 1ZKBA 3FD3A 3H3GA 4BDOA 2UVIA 2Z8DA 1OLCA 1OIBA 4YAHX 3LSLA 3T22A 4OWDA 4YMAA 4XKPA 4FEDA 4LVQA 4YZZA 1MH3A 2ABHA 5HM4B 5BUUA 3N6TA 2F5XA 4ND9A 2QS2A 3SEVA 1ZMGA 2PYYA 2UVJA 4OXVA 2OZZA 5AA1A 1YCJA 1MY2A 3MWBA 3QSLA 4PQJA 2GHBA 4GLIA 1AOVA 3OSQA 2F34A 1Y3QA 4G8MA 1I6AA 3FXQA 1R9LA 3RPWA 4OERA 3DP8A 1QKBA 1VE4A 3TDJA 3ODBA 1MXUA 1CB6A 1MXZA 3EHSA 3VE1B 4ZEIA 5A5XA 1XT8A 2GH9A 1N7XA 2I48A 3ECRA 4QSEA 4ELQA 4Q8RA 1ZIUA 1DTZA 3LSXA 4EXLA 4Q5TA 4AB5A 4GD5A 2ONSA 3U93A 2QS4A 3G3IA 4LA9A 2X26A 5FHOA 4QFOA 5A5XB 3B6WA 3IX1A 3L6GA 4NTLA 3KJTA 3EPEA 3T9XB 4ZEFA 3C36A 1FW0A 1EH3A 4WXJA 4R73A 4KYDA 1S50A 3KN7A 3FVOA 5IKBA 2DE2A 1EU8A 1EZ9A 3FVNA 4U1OA 4IY6A 2H98A 1II5A 1MY1A 1P1WA 3SKPA 3FZVA 1LCFA 3IK6B 3CG3A 4LZ7A 3G3JA 3ZSFA 1URDA 3EQ1A 1RYOA 1RKMA 3TELA 1XVYA 2UVGA 4DIGA 4THIA 1OMPA 2RCBA 4NEDA 3DP4A 3FV2A 3MZ1A 2A5SA 1R1NA 1P99A 4PFTA 4YMBA 3LSWA 4RXLA 1TT1A 4F3BA 2XD3A 3GXAA 5FTHA 5I56A 1B4HA 1I69A 4N6PA 1SVXB 1IQ7A 3I6VA 2H4IA 4Q0CA 2F35A 2LAOA 3PPNA 2QRYA 4R75A 3U1OA 5H8NB 2DWJA 1DPPA 2RKMA 4EF1A 5I56B 3TCHA 1JEVA 1N3XA 4IO3A 1R9QA 4P0GA 2I58A 1N76A 4GRKA 3MVWA 3P7IA 3FASA 1Q1KA 3V5AA 1M5CA 4ZE9A 4IO5A 3TQLA 4I9DA 5DTBA 3ZS6A 3QXMA 4AB6A 2OWSA 3TODA 4OETA 2AL4A 4YB7A 2F6PA 1MQHA 3V89B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OFLA 1KWHA 3GZGA 1AWBA 2OWZA 1IXHA 1LLSA 4R6HA 5IZ3A 3CFLA 1F9BA 1NUYA 4PETA 4ZE8A 3RYDA 2XX7A 1T0KA 4G68A 4N81A 5H8SA 1MY0A 3MVXA 2I3WA 2O1MA 3S9EA 4OVSA 4OFOA 4NF8B 1IXIA 1GR2A 1Z7NE 3KN3A 2XXPA 4JDFA 3U72A 2P3VA 2YLNA 5IZ3B 2I4BA 3B8BA 2G29A 1OVBA 4RPNA 1MQGA 2E1SA 1NH7A 3TCFA 2F7AA 3N6UA 3H06B 1D9QA 4R9FA 2XXKA 5ITPA 2ESNA 3MZ9A 5LTCA 1XS5A 4OEVA 2DVZA 1MPBA 1NNFA 4AS5A 3A29A 4O8MA 4PGPA 3IOWA 4OA4A 2DYXA 2UYEA 3Q29A 1UQWA 5L9MA 2QMWA 1LBCA 4NG7A 2ZXTA 3PTYA 4NHBA 4PGNA 2PT2A 3VXCA 3G3FA 2VPNA 3IB1A 2V25A 2XWKA 3CVGA 4N8YA 4GXSB 1LAXA 4HCYA 2B3FA 2XXQA 4O7MA 5CMBA 1DSNA 1BTJA 1LAGE 2NUVA 1YTVA 3ISPA 4XTCQ 2H25A 4NX1A 2XXUA 4U4XA 3CFXA 4YKKA 4F31B 4ELOA 2W7YA 5BWJA 2ZNTA 1FPDA 2MKZA 3K1NA 4LP2B 4OVJA 3V83A 1IMCA 2F3DA 1L5TA 4HS7A 3C35A 3TTKA 2DP8A 4H45A 1B32A 5EYHA 2VOZA 4MLVA 2VP1A 5CM6A 3FVKA 3LUYA 2O84X 5CBRA 1B7UA 5JTYA 3CR9A 3Q26A 4G68C 1MS7A 4F3GA 3HHGA 3C33A 3TYHA 3VVFA 2FVZA 1INPA 3TFLA 3K6VA 2V84A 4F18A 4FE8A 1FJ6A 1JP4A 2XA5A 1B40A 5FBPA 1UIVA 2XWVA 5JTYB 4OHNA 1MG1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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