5AA4A

Crystal structure of mltf from pseudomonas aeruginosa in complex with cell-wall tetrapeptide
Total Genus 142
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
142
sequence length
418
structure length
418
Chain Sequence
EGVLRVITRNSPATYFQDRNGETGFEYELAKRFAERLGVELKIETADNLDDLYAQLSREGGPALAAAGLTPGREDDASVRYSHTYLDVTPQIIYRNGQQRPTRPEDLVGKRIMVLKGSSHAEQLAELKKQYPELKYEESDAVEVVDLLRMVDVGDIDLTLVDSNELAMNQVYFPNVRVAFDFGEARGLAWALPGGDDDSLMNEVNAFLDQAKKEGLLQRLKDRYYGHVDVLGYVGAYTFAQHLQQRLPRYESHFKQSGKQKDTDWRLLAAIGYQESLWQPGATSKTGVRGLMMLTNRTAQAMGVSNRLDPKQSIQGGSKYFVQIRSELPESIKEPDRSWFALAAYNIGGAHLEDARKMAEKEGLNPNKWLDVKKMLPRLAQKQWYAKTRYGYARGGETVHFVQNVRRYYDILTWVTQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Activation by Allostery in Cell-Wall Remodeling by a Modular Membrane-Bound Lytic Transglycosylase from Pseudomonas aeruginosa.
pubmed doi rcsb
molecule tags Lyase
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE F
total genus 142
structure length 418
sequence length 418
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 4.2.2.-:
pdb deposition date 2015-07-23
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa4A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5aa4A02
3H03A 4GWOA 2VHAA 2QPQA 1UQWA 1DPEA 1ZIUA 4LQ2A 2ANJA 4OTEA 1MRPA 4GD5A 5I2NA 1IIWA 3ZKLA 4E0WA 3T93B 1YTVA 4KR5A 1NFTA 3VLVA 3RY3A 2Y7KA 1A8FA 1FTJA 3G3IA 1B7ZA 4IO7A 2QMXA 4F39A 3TMGA 4YMAA 3B7DA 2XXRA 2I4BA 1F9BA 1XVYA 4NF4A 1US4A 4OQOA 1B3LA 4ZZEA 2XD2A 1FQBA 4YZZA 4DCYA 4FORA 2OWTA 3LBSA 1MY3A 1P1OA 4ELRA 4P0GA 3IO6A 2B3FA 3QUJA 5I2NB 1QKBA 3OO9A 4FJPA 3ZSFA 1AIVA 1LFGA 2F6GA 2PT2A 3PMWA 3C9HA 1PB8A 4DXUA 1A40A 2I49A 3TPAA 1O63A 4EQ7A 4QSCA 5M2VA 3FUZA 3CFLA 4DXBA 3V83A 3RNNA 3VLWA 1B3EA 3C4MA 4Q0CA 1GGGA 4NF4B 4M1VA 3ZKKA 4QHQA 3CG1A 1GTKA 5EHSA 2IEEA 1Y1MA 1J1NA 2AL4A 4JBZA 1YCJA 5CMBA 2F34A 2YPNA 3OD7A 1HSLA 2DWIA 1S50A 4ISUA 5L9MA 2WKYA 2XXHA 2F7BA 1LGBC 4R2BA 2G29A 3I6VA 2XXIA 5H8HA 2V3UA 3PPNA 3IL1B 3OSQA 1LB8A 5B70A 3K01A 3EN3A 3RT8A 1LCTA 3WAEA 3TCHA 5EYFA 1B7HA 2D5WA 5K2XA 1BKAA 2QS4A 4RK2A 3ZS6A 4WXJA 2DYXA 1MPDA 3HHFA 3N26A 4OEVA 3KJ7A 4PE5B 4ELQA 1MG1A 1JEUA 3H6UA 3FXUA 1PBQA 5H8HB 1VE4A 3EHUA 2XXUA 3DELB 4GLIA 4EQBA 4R2FA 5JK4A 3OSRA 1T0KA 4IGRA 4H8JA 4H0WA 4FATA 3EHTA 3RLFE 4QSEA 3FZVA 3IJXB 1SYIA 4E0XA 1A54A 3UORA 4JSDA 4KYDA 3U92A 2RKMA 4G77A 4I62A 2F35A 3K00A 1NL5A 2Q2AA 1Y9UA 1QKAA 4H67A 4HCYA 3KN8A 4ZS9A 5DEXA 1B46A 1ZJLA 2P0SA 2V25A 2XXPA 5F7VA 4KFQA 3LC8A 3IK6B 4K3FA 1LLSA 1MY2A 2OCUA 3QSLA 3VVEA 3W15C 2Q9TA 1CE2A 2DWHA 2UYFA 3ODBA 1D4NA 2RC9A 3GLBA 1R9QA 4H1XA 4FEDA 3HV1A 3N6UA 1D9VA 1M5DA 2DWAA 5DVIA 5EHMA 2ZNTA 2XXQA 2X7QA 5DEXB 1JEVA 4C0RA 5AA2A 2Y7RA 4WKMA 5FHNA 4YKPA 2R9JA 3Q25A 3SEVA 3M3KA 2B3BA 2I3WA 1AH5A 2GH9A 3KSJA 3S9EA 3N94A 1MS7A 2XXWA 3VV5A 1Y4CA 3MQ9A 1FQDA 5AA2D 3TYHA 4R6YA 4OHNA 1DMBA 1LBBA 3SEXA 2D3IA 3TQWA 4DIGA 1M5EA 3PUVE 3BFUA 2V3TA 1RYXA 2CMOA 3VXBA 3KEIA 2LAOA 3KOTA 5AA2B 1MPCA 4ESXA 1B7UA 2O1LA 4YICA 4G68A 4Z7EA 1B52A 3PMXA 4N13A 3LUYA 5ISUA 2YLNA 5DVFA 4QFKA 3D4GA 5HM4B 5IAIA 3K4UA 5ITPA 4F3SA 1FCKA 4RYAA 3KFMA 3TDJA 2F36A 1IUDA 2UVHA 3OMBA 3THIA 1XC1A 4FECA 3CSGA 5CI5A 4U23A 2OBGA 1ZLQA 2ONKE 1IXHA 2QMWA 1PDAA 4GXAA 1KWHA 3N6TA 4YMBA 4G68B 4HW8A 3V5AA 1US5A 4RA1A 4FE8A 1MDP1 1MQGA 1WVJA 2XD3A 3IOUA 3MWBA 4GQOA 1JVXA 5CMMA 3TTMA 5CBRA 1LAXA 2O1MA 3O66A 3PUXE 5CRYA 4H8IA 2IA4A 1QUKA 2I48A 4X1BA 4O3CA 2Z8EA 2H99A 3IB0A 4IO5A 5I59A 2F7CA 2CZLA 3FJGA 1M5CA 2W7YA 5I57A 3FV2A 4R73A 3LSWA 3FJMA 3SEYA 3H6WA 1B05A 1OLCA 2PX1A 1OQGA 3VVDA 2VGQA 3MBPA 1FQCA 1P1NA 3O9PA 1OVTA 3VXCA 1MXUA 2ABHA 3MVZA 2ZYKA 3B6TA 5CM6A 1XS5A 1I6AA 3FJ7A 1A8EA 3IOTA 3T9HB 3U94A 5I59B 2HAVA 4DDDA 2Z8DA 4MF3A 4BDLA 4F19A 4HTGA 2Y7WA 4KCCA 2I4CA 5ITOA 3B6WA 5I57B 2I6EA 3GBAA 3IOWA 2DS9A 3MPLA 1QULA 4PFTA 5KZTA 4F3PA 3OENA 1TFDA 3GZGA 4LZ8A 2QJEA 4AB6A 4HCWA 4U1ZA 2XX7A 1ELJA 3PUYE 2DE4A 1NNPA 3KN3A 3N5LA 3T96B 4FAJA 1N3XA 4YB7A 1JW4A 3ILTB 3P7IA 5TPAA 2O68A 4DCXA 2XX8A 1TFAA 5H8QA 4YKJA 2F97A 4PETA 3PD8A 3MPKA 3PGFA 2V84A 5IKBA 1SQYA 4RY1A 1M5FA 2Z8FA 3EQ1A 4ZZAA 1B1XA 3K0VA 2DQVA 4PP0A 1B6HA 4LA9A 3JYRA 4N07A 4KCDA 1SYHA 5TPAB 1MXYA 3C35A 4XKNA 5TP9A 4EF1A 4Z0IA 5CMKA 3F11A 4DXCA 5H8QB 3TTNA 1UTHA 3D4CA 1ATGA 2GHBA 3KSXA 3PMVA 5AE4A 1M5BA 4WEPA 3TUSA 3H6TA 2OZZA 4LZ5A 1POTA 3G3JA 1QUIA 3MVXA 5H8SA 4F31B 3CVGA 4JWXA 2Y7IA 1H44A 5FHMA 3FATA 1B51A 1R9LA 3S9MC 3U72A 1JVYA 3TODA 3QK6A 4KYEA 4ZEKA 2F6PA 2H5YA 1P1QA 2ZNSA 2QS3A 3S4UA 1VR5A 1CB6A 1MQHA 4L17A 2R6GE 5TP9B 1SVXB 1YAEA 5CMCA 2DWJA 4XKPA 1B5IA 1OMPA 1PB9A 1UIVA 4BDRA 3TTRA 1B4HA 2FNCA 4IO6A 4IO2A 1UTHB 3BKIB 4POWA 1RKMA 3MZ1A 3MJNA 2PVUA 1FW0A 4OFOA 1N04A 2I0BA 2OWSA 1GVCA 3IO4A 3UN6A 3E13X 4QFLA 3EHSA 1QJMA 4KPTA 3MP6A 4OEUA 3W9WA 4YB5A 3K02A 4NF8A 4OXVA 3K1PA 1SDXA 3JZJA 5CBSA 5DTBA 1ZMGA 3ONMA 1O7TA 4UACA 2I58A 3IORA 3MC2A 1NMUA 2H98A 4ZECA 1SI0A 3K6WA 1MQJA 2A5TA 3CFXA 1MQDA 3IB1A 3DP4A 4I1DA 1H3DA 2HAUA 4EDPA 4XKQA 3Q27A 4G8NA 4I9DA 3KG2A 4NF8B 1DPPA 2VP1A 1D3KA 3TTKA 1P1UA 2UVGA 2BJJX 1OQHA 1VSOA 4BDNA 1NH7A 4EQ9A 2NOOA 4NF6A 1MM6A 4NF5A 1QVSA 3H3GA 3E9XA 1MM7A 4ZEIA 1D9YA 4C1UA 3M3LA 3C36A 3U1OA 1IQ7A 5I58A 4KHZE 1Y20A 4TLMB 2A5TB 4ZE9A 4IGTA 4G68C 4Q5TA 4EUOA 1MH4A 4PQJA 4PFYA 4R9FA 3RN8A 1LB9A 3GXAA 3C34A 3OO7A 3DP8A 4QSDA 3TKDA 1HSJA 1I6QA 2HEUA 1SW2A 1Z7ME 3PPRA 3TCFA 1BP5A 3IX1A 3HHGA 3Q26A 1AOVA 5A5XA 4NF6B 2FYIA 4NF5B 4ZEFA 4BDQA 3WAFA 4OFJA 4C1TA 5I58B 3W9VA 3DP6A 2HQ0A 4YAHX 2PBWA 4POXA 3SKPA 3FXQA 4F22A 4AB5A 2G93A 4XKRA 5FHOA 1USYH 3IJOB 3HPIA 1B0LA 4BDMA 1B5HA 3VE1B 4OESA 5A5XB 4MLVA 2OK2A 1H45A 3PPQA 5B7DA 5JTYA 4EF2A 1PEBA 4KD5A 3UIFA 2AYSA 5ICQA 3TELA 4GRKA 1BIYA 1Y3PA 4BLAA 2F5XA 5I84A 2DVCA 3K2DA 3IR1A 3G3HA 3OEKA 3A09A 3AXFA 1Q1KA 1EZ9A 2ALUA 2ONSA 3T66A 4ND9A 1B1HA 1SW5A 2YJPA 4IY5A 5J1DA 3PV0E 1B40A 2D21A 4QF9A 1GV8A 2DE3A 3IOVA 1B2HA 3OO6A 4OMBA 4N6PA 4X48A 1N7XA 5JTYB 2GHAA 1FTLA 4WEDA 4RNSA 1A7LA 3ILUB 1RYOA 3CRBA 2QS2A 4TLLB 1URSA 4U1OA 3PUZE 3IAZA 1LAFE 1OLAA 4IO4A 3S9LC 2F8DA 1GR2A 3K6UA 3O29A 3MP1A 2M8CA 4H6DA 3U8QA 3QAXA 1B3GA 2XXXA 3K6VA 2DOJA 4LUBA 3OELA 1LBCA 1ZU0A 4THIA 1NKXA 3PPPA 3VDFA 3M8UA 2REJA 2Q89A 2DSFA 1POY1 1URGA 3E3KA 4DZ1A 5KCJA 1SW4A 4OENA 4U4XA 4LONB 3RTFB 2GRVA 2P2AA 4NWDA 3USDA 1S7YA 3MZ9A 3G7WA 4R6KA 3S2VA 1B3FA 4RK9A 1ZKBA 2V93A 3K1NA 4OWDA 3HCQA 1R1NA 4P11A 2ZYOA 2XXYA 2B65A 1SBPA 4OYVA 2DVZA 4QFOA 3HO7A 4NEDA 1FTOA 2XXVA 3CSBA 3CI8A 3UA8A 5AA3A 3FXRA 1HSEA 1N3WA 3PU5A 5KCJB 3KGCA 3O97A 3MW0A 1ANFA 2OLBA 3OO8A 1XVXA 3TAJA 3RTWB 1UTBA 2Y7PA 1N0TA 3TEPA 4ZEBA 4F18A 2UVIA 2E0SA 3Q28A 4M4GA 4ZE8A 3B6QA 4BDOA 4X9TA 4O3AA 1NNKA 3TZAA 5HBCA 2RCBA 4KYSA 3T9XB 1OIBA 2H25A 3MZBA 4YKIA 4G8HA 5L9SA 1BLFA 5BWJA 3G3KA 2QRYA 4O3BA 2RCAA 1UTBB 1MXXA 1Y3NA 5F1QA 1FTKA 3VVFA 4MLQA 3UP9A 1MPBA 5HPQA 2VOZA 1MDQA 3FVKA 3G3GA 3L6GA 3O6GA 3MUQA 4GF8A 4ECFA 4ESWA 1N7WA 2UVJA 1IITA 4LZ7A 2H4IA 4G8MA 3VFJA 3FD3A 4FIMA 1EU8A 3ECRA 2O7UA 1BTJA 2DXYA 3FVNA 2RC8A 3RPWA 2Q2CA 4OFLA 2O51A 3LR1A 1IEJA 1QUJA 3HN0A 4F3GA 3SERA 2UYEA 1ZBMA 4G2ZA 4NMYA 2QS1A 4AQ4A 3V89B 4PFWA 3C33A 2O84X 4GFRA 3QIMA 1TXFA 2O6AA 3O6IA 3LSFB 2ZYNA 1A99A 3TQLA 1N76A 2VD2A 1JW1A 4GIZA 2ONRA 4RXLA 3KJTA 4LVQA 2QL3A 5H8FA 2REGA 5AA4A 3I5OA 3BFTA 4RPOA 3RUMA 2HZKA 2FA7A 3O28A 5BUUA 3FASA 2I3VA 4EXLA 1MY1A 3I3VA 2Z22A 1R6ZA 2PMSA 3R7XA 3VLUA 1EZOA 3A3CA 5ELVA 5TU0A 4R72A 3RQTA 3QUFA 5KDTA 2NUVA 4UA8A 4JSOA 3DLNA 4R6HA 1B9JA 5K2YA 4U21A 4MH5A 5H8FB 4F3BA 5AA4B 2X7PA 2ZXTA 2F78A 4IO3A 3Q29A 2H9BA 4EXKA 1OVBA 3H4ZA 4G4PA 2R71A 2HFBA 3MP8A 1SW1A 3KZGA 1DOTA 4NWCA 3SESA 3MVYA 3EPEA 2HCAA 3M3FA 1I69A 1B58A 1SD3A 1II5A 4GOTA 4NTLA 4ZEDA 4HS7A 5I56A 3L6HA 5KDTB 3FVGA 1B32A 3T22A 3EF7A 4QFNA 2ESNA 3G3FA 1XOCA 5DVJA 5I2KA 3DM0A 1Z7NE 2Y84A 2P1SA 5FTHA 3CFZA 5L8DA 1SI1A 3QYTA 3PUWE 1JQFA 1LCFA 3K1MA 1WODA 1FTMA 3FIRA 4GL8A 1Y3QA 3C31A 2O7IA 4KI0E 4R9GA 3CG3A 3O6HA 4R74A 3KN7A 4XXUA 3PD9A 4F2QA 1I6BA 5I56B 3SEUA 2NXOA 4KQPA 3R6UA 5L9OA 5FTIA 1LFIA 4R75A 1VFEA 3SEWA 3LSLA 2AIXA 2ZNUA 3RT6B 5I2KB 3T9VA 4GXSB 4U22A 3TFLA 2KLFA 1Y1ZA 3TCGA 3SDFA 3FVOA 1MY4A 2O69A 5JEIA 4FEBA 1FQFA 4LP2B 5H8NA 4ELOA 5AA1A 2E1SA 2DXRA 2F7AA 1JNFA 1H76A 1LAHE 2XX9A 4ONYA 1DTGA 3HSTA 4F1UA 3UK4A 2PT1A 3FGSA 1Q35A 4F1VA 4Q8RA 1DSNA 3OEMA 1FQAA 1MXVA 4TOZA 4OVJA 2XXTA 4DLDA 4YU0A 1EZPA 3RGYA 1WDNA 4H5FA 4OZ9A 4XTCQ 3BBRA 3H06B 4MFIA 1TT1A 2ZMBA 4OERA 4IB2A 1P1WA 5H8NB 1JETA 4JB7A 1IXCA 1NNFA 4RPNA 1LFHA 1A55A 3H7MA 1UIUA 2Q88A 3OXNA 3PPOA 2I0CA 4YKKA 3U93A 2Z23A 4U4SA 4I8CA 1MXZA 3CIJA 1MXWA 2RF1A 3S9NC 2X26A 4H65A 4JWOA 3R26A 3H6VA 2VD3A 1JW5A 2XHDA 3T9UA 3MAMA 4IY6A 4OETA 3QXMA 4F1YA 1LSTA 1N84A 1DTZA 4F29A 5ICTA 3GBBA 4JXIA 1PC3A 4X1DA 1PB7A 1B4ZA 4GL0A 4U2RA 3IB2A 3FV1A 1URDA 2NWJA 1NH8A 4QRZA 1MQIA 1XHYA 1S9TA 2Q8JA 3SETA 1O64A 3JV9A 3TTLA 2HXWA 4MBPA 2AL5A 4F2OA 4YB6A 2HZLA 2RC7A 2UXAA 3UGWA 4PFUA 3O2AA 4JWYA 4TQUQ 1NNTA 3CR9A 4DE8A 4LATA 4ZDMA 1USYE 1QW0A 4LQ5A 2GFEA 1MH3A 4XIGQ 5DYHA 3E4RA 2NVUB 1EH3A 4JDFA 2OJTA 4P0IA 1YPNA 1MY0A 4RJZA 1TWYA 5LOMA 1B5JA 1Y4TA 1L5TA 4GVOA 1AL3A 1PBPA 1IXGA 2DP8A 2A5SA 3KOSA 4H5GA 1FQEA 3C32A 4Q30B 1B0HA 1IXIA 1XT8A 4NE4A 5CC2A 1H43A 1B3HA 2QSXA 1IZ1A 3LSXA 4QFPA 3V8XB 1ZTYA 1AMFA 3K6XA 1P99A 2ZYMA 1LAGE 2THIA 2DE2A 3KBRA 3MVWA 4ELPA 2PYYA 1VFDA 2V3QA 3OOAA 5DT6A 2RINA 3A3UA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3H03A 4GWOA 2VHAA 2QPQA 5EQ8A 1UQWA 1DPEA 1ZIUA 4LQ2A 2ANJA 4OTEA 1MRPA 4GD5A 5I2NA 4MAGA 1IIWA 3ZKLA 4E0WA 3T93B 1YTVA 4XEQA 1KZ8A 4KR5A 2FVZA 1NFTA 4O7IA 3VLVA 3RPLA 3RY3A 2Y7KA 1A8FA 1FTJA 3G3IA 1B7ZA 4IO7A 2QMXA 4F39A 2QVRA 2R8TA 3TMGA 4YMAA 3B7DA 2XXRA 2XWVA 2I4BA 1F9BA 1XVYA 4NF4A 1US4A 2XWKA 4OQOA 1B3LA 3FXBA 4ZZEA 2XD2A 1NI9A 4X04A 1FQBA 4YZZA 4DCYA 4FORA 2OWTA 3LBSA 1MY3A 1P1OA 4ELRA 4P0GA 3IO6A 3LUZA 2B3FA 3QUJA 5I2NB 1QKBA 3OO9A 4FJPA 3ZSFA 1AIVA 1LFGA 2F6GA 2PT2A 3PMWA 3C9HA 1PB8A 3RPLB 4MX6A 4DXUA 3NOHA 1A40A 4GX3A 2I49A 3TPAA 1O63A 4EQ7A 3GYYA 4QSCA 5M2VA 3FUZA 2QVUA 3CFLA 4DXBA 3V83A 3RNNA 3VLWA 1B3EA 4PBQA 3C4MA 4Q0CA 1GGGA 4NF4B 2ZZXA 4M1VA 3ZKKA 2HHMA 4QHQA 4GX4A 3KBZA 3CG1A 1GTKA 5EHSA 2IEEA 1Y1MA 1J1NA 2AL4A 4JBZA 5I3SA 1YCJA 5CMBA 2F34A 2YPNA 3OD7A 1HSLA 2DWIA 1S50A 4ISUA 5L9MA 1EYIA 2WKYA 2XXHA 2F7BA 1LGBC 4R2BA 2G29A 3I6VA 1LBWA 2XXIA 5H8HA 2V3UA 3PPNA 3IL1B 3OSQA 1LB8A 5B70A 3K01A 3EN3A 4GWUA 4NAPA 4I40A 3RT8A 1LCTA 5IZZA 2GQ1A 3WAEA 3TCHA 5EYFA 1B7HA 2D5WA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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