5ADXH

Cryoem structure of dynactin complex at 4.0 angstrom resolution
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
b'AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Structure of the Dynactin Complex and its Interaction with Dynein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACTIN RELATED PROTEIN 1
molecule tags Structural protein
total genus 92
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5adxH01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5adxH02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5adxH03
2V7YA 4DQ8A 1J6ZA 1ATRA 1BDGA 2ZGYA 1C0GA 4CZEA 4PKHA 2A40A 1K8KA 2YJEA 4BC3A 4BRLA 5FPEA 5FPMA 3LDOA 4FPAA 1Z6RA 4WQ5A 1YUWA 1C0FA 4FL9A 1RFQA 3VEVA 3VGKA 5KPRA 3IFRA 4FWSA 1X3NA 3AAQA 4K43A 5EY4A 3J8AA 2OANA 2QW9A 4IJAA 3VEYA 3ZETB 2ITMA 3L0QA 4B1WB 3O80A 2UYTA 3GBTA 4DB3A 3H6EA 4H5TA 2CH6A 4CZLA 5AFUA 2E1ZA 2E2QA 1Q18A 1GLAG 4FPBA 5JICA 5AQPA 3DXMB 2E2OA 2P9UA 4BRDA 4GY2B 5AQZA 4RWTA 1MWMA 1LCUA 2W40A 3HBTA 4CD3A 4QS9A 2ZWHA 3WQTA 2HF4A 2YHYA 2A42A 4A62A 1NGFA 1NM1A 4JNEA 4BR0A 4CI6A 3UKRB 3CERA 3SK3A 4BR2A 3UKUB 4DCHA 1BA1A 2E88A 3SMSA 5E84A 5BREA 4XH1A 3VF2A 1SQKA 5AQXA 3MN6A 1E4FT 5BN8A 5JMVA 2VCPA 4BC5A 5ADXH 1TUYA 2QWPA 5AQIA 2CGKA 4CZGA 1U2VB 1ZC6A 5AQFA 2V7ZA 3C7NB 1HKCA 2W41A 2QWMA 2YCHA 2QWLA 4WQ4C 4B1XB 4ISEA 4BRMA 5AQTA 2ZF5O 1BO5O 3HM8A 3QDKA 2NZTA 4BRFA 1XQSC 1S22A 3MN7A 5AZJA 3O1BA 3CI5A 4XEIA 3DAWA 2FF3B 2E2NA 3A0IX 3KVGA 2CGLA 2Q97A 1E4GT 3L4IA 5AQUA 4H0XB 1G99A 2V51B 3BP8A 5AZIB 2I7PA 4H0TB 2F9TA 2GEMA 2V52B 4KBOA 2P9PB 4CBUA 4A2BA 3LM2A 4K25A 1RGIA 3R8EA 1XUPO 5F2RA 4XH5A 3W3DA 4IJNA 4JD2A 3TPQA 1MA9B 3QBWA 4K42A 3CJ9A 1GLJO 4WQ5C 2WUSA 1YAGA 4BG9A 1QZ5A 3QB0A 3D2EA 1HX1A 4CJ7A 4CZFA 2IIRA 3DJCA 2FLOA 2P9LB 3WEEB 4MO5A 4B1VA 3VF6A 4M63C 1BUPA 1WOQA 4NB4A 1HLUA 3EN9A 4H5NA 1HUXA 3FZHA 3O08A 4BG8A 2D0PA 2D0OA 3QFUA 1ATSA 2EWSA 3FR0A 4H5VA 1H1VA 3U4LA 1BA0A 4CBWA 3U8XA 4FWOA 3CETA 5KQ8A 1NMDA 3C0BA 4JHDB 5EVZA 2YJFA 3AARA 3FE1A 1KXPA 3SMPA 1OKJA 3EL2A 4H03B 3F9MA 1NGIA 3AY9A 4CZIA 4XH4A 5TKYA 3R9PA 2ZGZA 3HSCA 4B1UB 3VEZA 1GLBG 2IVPA 3VPZA 5BRDA 3FFKB 2P9SB 5AQHA 5AQMA 4F9OA 1S3XA 2QWQA 1TYQB 5LY3A 4NO7A 4E1JA 5E26A 2YHXA 4BRHA 2HMPA 1QHAA 5AQVA 3EKSA 3VERA 3A5MC 1NBWA 4PL8A 4QS8A 4AM6A 5BPMA 3LDPA 1ESVA 4BREA 1IG8A 3D2FA 2D1KA 3OHRA 4IWVA 3GE1A 1IJJA 4WYBA 3DXKA 1NGAA 3RSEA 4CZMA 2P9NB 5BRHA 2P9KB 1NGBA 5AQWA 3ID8A 5EXWA 5AFUH 2HOEA 4BRCA 1T6CA 2Q31A 4FWNA 3M6GA 3H3NO 3MN5A 5ELZA 5LJVA 2QWOA 3CJBA 3VOVA 4H0YB 4HTLA 5AQOA 2VYPA 1CZAN 4BVPA 2GELA 4BROA 4FSVA 3GOIA 4FWPA 1XC3A 4L3QA 4BR4A 4I6MA 1GLLO 4H0PA 2F9WA 1JCFA 1ZXOA 1ATNA 3ZEUA 1D4XA 2PBDA 3WT0A 1QQOA 2P9IA 4FOIA 3QMLA 4YDUC 5AQYA 4A2AA 3MDQA 2E8AA 2IVNA 2CH5A 5JLHA 4BC4A 2ASPA 3G25A 1K8KB 3GG4A 1R59O 4JN4A 3ULEA 2BUPA 3ZX2A 2IVOA 4H0VB 4BRNA 4BR7A 2Q0RA 3QFPA 3UE5A 2PAVA 3MCPA 3CQYA 4PKGA 4CBXA 2E1YA 3VETA 4BVOA 3FGUA 3HI0A 5EX5A 4H0OA 4JAXA 4BRIA 3CQXA 4MLHA 3CJAA 2QWRA 2P9UB 4FWMA 1EQYA 1KAYA 2Q36A 4FWLA 3EO3A 5AQLA 3ZETA 3BF3A 2E20A 1DEJA 3VEXA 3JS6A 3GL1A 2QM1A 4K41A 2Q1NA 3FLCO 3WXJA 5LJWA 3DXMA 3MK6A 3A5NC 4Z94A 2A3ZA 1SZ2A 4GNIA 3AAPA 2ASOA 4LC9B 2ASMA 5BPNA 3H1QA 3KZBA 1NWKA 4BRKA 2A6AA 3FZMA 4BR9A 4EAHD 3A5LC 2A41A 4RTFD 4AM7A 3QICA 1Y64A 4RCHA 1JCGA 3LDQA 3UKRA 3VGMA 3UB5A 2E2PA 4M7XA 4WQ4A 3UKUA 3ATVA 3L6QA 3H45C 4ISFA 2NRHA 4MO4A 4B1YB 3M1FA 3VEOA 1HPMA 5AZJB 1BWFO 2YI1A 3KHYA 3LDNA 3BEXA 2GTDA 3O6WA 2GUPA 1U2VA 5B8HA 5FPNA 4DHYA 4CZKA 2BTFA 3C7NA 3SLCA 5F0XA 1GLCG 3EKUA 5EOYA 4FWQA 3CHWA 1Z05A 4CZJA 1NGJA 5AQNA 3IUCA 1U6ZA 4FWKA 1T44A 3ZX3A 3BUZB 4IXCA 3CJ7A 1TUUA 1V4SA 3MMVA 3IDHA 3VESA 3R6MA 3DWLA 5F1XA 4JD2B 2FXUA 4J8FA 3IMXA 3H1VX 2AP1A 3SJHA 3H46O 3D2EB 1QZ6A 5AZIA 4BQZA 5AQSA 3U9ZA 1SAZA 3HZ6A 4ISGA 2P9PA 5AQJA 4MLEA 4BRQA 4CZHA 1KAZA 3LDLA 3VEWA 1NGHA 2DPNA 4EFHA 5CE3A 5FPDA 2KHOA 3WXLA 3FZLA 1GLEG 4O8KA 4EHTA 3GDQA 1HJOA 2H3GX 5KPZA 2QXLA 4FWRA 3M3ZA 3B8AX 2AA4A 5JLFA 2P9LA 3WEEA 3MN9A 2GWJA 3W0LA 4PL7A 3U9DA 1YXQA 3VF4A 3CJCA 1KAXA 3I33A 1MDUB 5ADXA 1NGEA 3ATUA 4B9QA 1NGDA 1X3MA 4BR5A 1BU6O 5AQKA 3A8YA 4IZ9A 3O4WA 3LL3A 1DGKN 1ZBSA 3CIPA 1BOTO 4BGAA 3ENHA 4JHDA 3JXUA 4HWIA 3QBXA 1HKBA 1NLVA 4QS7A 4A61A 4FO0A 3WUHA 3ENOA 4C23A 1QQNA 3LM9A 4O5FA 4BRAA 4BGBA 5I9EB 1RDWX 3O5BA 1V4TA 4B1ZA 3CJ1A 3I8BA 1HKGA 4BRGA 4H5RA 2YHWA 4EIAA 2P9SA 1NGGA 4Y0WA 3HTVA 3TU5A 3ZX0A 4EHUA 1TYQA 2FSKA 1JCEA 3D2FB 3H3OB 5AR0A 3S41A 3WXKA 1LOTB 3DXKB 2FSNA 3RSEB 2QWNA 2J4RA 1DKGD 1P8ZA 2FF6A 1GLDG 5AQGA 1YVNA 3BF1A 4CD1A 1WUAA 4BRPA 1GLFO 5AQRA 2FSJA 3VENA 5KPTA 2I7NA 4PKIA 2A5XA 4IO8A 5BPLA 4M7YA 3VGLA 3WQUA 3A5OC 2D4WA 3EZWA 4BC2A 2P9NA 2NLXA 2P9KA 5BRFA 1T6DA 2Q0UA 1X9JA 2HF3A 3O8MA 4I6MB 2VWBA 3FZFA 2GWKA 4FOEA 3ZEUB 3O1WA 1QQMA 5BR9A 4YDUA 2P9IB 2CGJA 1BG3A 5KQDA 3FZKA 3P4IA 3WXIA 5AQQA 1NGCA 3ULEB 1MWKA 2Q2RA 3D7EO 4BQLA 4H5WA 5BN9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DQ8A 4FM2A 3I0RA 1J6ZA 1BDGA 3SV3A 1NKBA 4CJTA 2PFUA 4J2AA 2YJEA 3SUNA 1NJXA 5IWAK 1WN7A 5FPMA 4AHUA 3HOSA 4KHPK 1RNHA 4WQ5A 3VQPA 4FL9A 3K9JA 2YV0X 3AAQA 2QEXN 1Z26A 3ZETB 2UYTA 3GBTA 3ZSXA 4C8MA 3SPZA 3S3MA 5AFUA 2E1ZA 4YY3K 3DLGA 4C8NA 1LWFA 2E2OA 4BRDA 4MDAA 1MWMA 1LCUA 3OYIA 3THYB 5HROA 2O8EB 2HBMA 1RTDA 4OPHA 1NGFA 1RT6A 2HVHA 3UKRB 3OYFA 3HRGA 3SK3A 2F8TA 1SKWA 3UKUB 3V1QA 3O4QA 3OA9A 3WNFA 1VQ8N 4FLYA 4JI7K 4XH1A 2O8CA 1E4FT 4JKFA 3R1XA 2QWPA 1ZC6A 2X6SA 4M3UA 3OS0A 3JSMA 3SAGA 2HNYA 3HM8A 4YFUA 5KGWA 3M8PA 3K57A 1HMVA 3NF6A 3MN7A 3DAWA 4GV6A 2QK9A 5FRNA 1L3TA 3TAMA 1E4GT 4CE9A 4C8OA 1SL1A 1G99A 3BP8A 2HB5A 1S9EA 5FDLA 2QA4N 4H0TB 3C6TA 2V52B 1GOAA 2UUAK 2P9PB 1OH8A 4FJ8A 4A2BA 3LM2A 4AHVA 3CC7N 3AV9A 3AA5X 4HTUA 4BDYA 3ASMA 3R8EA 1XUPO 4XH5A 3O9TA 4ILHA 3TPQA 1MA9B 4ILJA 3SQ4A 4JKCA 3VQCA 5GAHP 1VQNN 4KHWA 5LMUK 1QZ5A 5HL7L 3KD1E 4KTWA 3NVKA 2KLAA 2IIRA 3DJCA 3O9UA 2P9LB 3WEEB 4MO5A 2WONA 2HNDA 4M63C 3T1HK 1HLUA 1YTAA 2OTLN 5FLXO 2G8HA 3C95A 3S9HA 3KWIA 5J2QA 1NMDA 3PX6A 2QI2A 3CQ8A 3N4PA 1RDUA 2YJFA 1OH6A 3NAEA 4M3XA 4CFCA 3S3NA 3EL2A 4H03B 2DFEA 4PQUA 4XH4A 5TKYA 2WC9A 4O0IA 3LPTA 3VPZA 5BRDA 4DR4K 4JI0K 3P1GA 1SUQA 3C94A 5AQHA 4F9OA 3TARA 4KV8A 4A5BA 2ZD1A 1ZBFA 1HPZA 1RTJA 4K0KK 5E26A 3AO3A 3OYBA 5TKWA 3E9PA 3D0PA 4B08A 4DSKA 4CGIA 5AQVA 4ICLA 2RE2A 3A5MC 1C1AA 1NBWA 1LAVA 5CZ1A 4DSIA 4CJWA 4EZ9A 1T05A 2D1KA 4LH5A 4IWVA 3ULDA 4WYBA 3BZKA 4CZMA 1O1WA 3CPWM 2OPSA 4CIEA 4OX9K 1NGBA 1VSFA 4JEPA 4FJKA 5AFUH 2HOEA 4O0JA 4BRCA 4CJSA 2HHTA 3P5JA 3M6GA 4KTQA 1N33K 3M8RA 4HTLA 4JS5A 2NRVA 2VYPA 4BVPA 4DU4A 4BROA 4DFMA 1S1UA 4L3QA 3LP3A 3HOTA 1ZXOA 1ATNA 5C0YA 1TKDA 4RW8A 2Z1IA 1QQOA 5I42A 4A2AA 4LH4A 3KLHA 4B9MA 3JYTA 4CJLA 2BUPA 3N4QA 3PX0A 3OBWA 4BRNA 2Q0RA 1X1PA 1IBLK 4KREA 3MAQA 3MCPA 3NF9A 1W2BM 1ILYA 3VETA 4M42A 3VTHA 1VAZA 4CEZA 4DTOA 4JKGA 4DSJA 3OYJA 4DTNA 3OYEA 2E6LA 2Q36A 5SWMA 3SZ2A 4CJ3A 1K8AO 1XHZA 2E20A 4H4OA 4AH9A 1NK7A 2HHWA 1DEJA 5KI6A 3I56N 3L8BA 2Q1NA 1YJ9N 3FLCO 4Z4HA 3SBGA 3DXMA 4DSFA 5GIOA 1SZ2A 1JXEA 3AAPA 3NE6A 3DOKA 3ZCMA 5AJ3K 4I2PA 3CCMN 2O8CB 4G9ZA 4BR9A 1P90A 4MDBA 4DS5A 4M3TA 4DU3A 1EWQA 1HQEA 1JKHA 1JCGA 3LDQA 4Q5VA 3OYAA 3KD5E 4M7XA 2GV9A 3ATVA 4Z4EA 3L6QA 3H45C 1U04A 3V81A 3NBPA 4B1YB 3DLEA 4DV1K 1XMOK 1ASWA 2E5LK 1VSLA 4BE0A 5B8HA 4CZKA 3O3FA 3IKMA 3EKUA 2GBZA 3C6HA 1IKYA 3IUCA 4YOWA 4FZXC 3CCJN 4PUOA 1R0AA 3L2RA 2Z1JA 3BUZB 5EU7A 1HR0K 1V4SA 5SZTA 4DTJA 3VESA 3DWLA 4EP5A 5F1XA 1WBDA 3MX2A 1VQPN 2FXUA 3IMXA 4DS4A 1WSGA 2W6KA 1S1VA 1QZ6A 5AZIA 3VTIA 1TK5A 1Q9YA 1EP4A 4A57A 4MLEA 2RF2A 4CZHA 1KAZA 4CF8A 4FYDA 3QETA 2YNGA 4EHTA 1D8YA 1HJOA 2QXLA 2C1IA 2OA8A 1C1CA 4IOAL 3B8AX 5JLFA 3CF5L 3W0LA 4PL7A 4A59A 3U9DA 3CJCA 3I33A 1MDUB 5ADXA 3ATUA 1NGDA 4B3RK 3CC2N 4IZ9A 2IS3A 3LP0A 3DOLA 1SKSA 1ZBSA 3CIPA 3RTVA 4OPJA 3QBXA 1ZBUA 3ISNC 5J1EA 4A61A 4FO0A 3RVCA 1WSEA 4C23A 3SQ2A 1B9FA 4O5FA 4LD0A 4DF8A 2JWLA 1S72N 4GVMA 4JRPA 1D9DA 1V4TA 2QKBA 4DQSA 3LZIA 3HSTB 1YTUA 4M3RA 2YHWA 3HPHA 1WBBA 2P9SA 3NHGA 1BCOA 2G8WA 3OTOK 3T1AA 2VQFK 1A5VA 1HJRA 2HHVA 3U3GA 4CHOA 4CEAA 4CJPA 1N36K 2QWNA 3K5NA 2YNFA 4K8ZA 1P8ZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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