5ADXH

Cryoem structure of dynactin complex at 4.0 angstrom resolution
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN RELATED PROTEIN 1
publication title The Structure of the Dynactin Complex and its Interaction with Dynein.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 92
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5adxH01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5adxH02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5adxH03
3MMVA 3MN9A 4JHDA 5JICA 3DXKA 4HWIA 3GE1A 1EQYA 4NB4A 2HF3A 2GTDA 3VEVA 1BWFO 3FZKA 1KAXA 2IIRA 5AQVA 3MN6A 3ID8A 3FR0A 1U6ZA 4Z94A 1T6CA 3CJ7A 4XH4A 5BN8A 4B1ZA 5AQXA 5BRDA 1QQOA 4BC4A 3QFPA 4BR2A 2E2NA 2F9TA 2ZGZA 5LY3A 1NGEA 3AY9A 3VGMA 1GLLO 3W0LA 3KZBA 4BRPA 5FPDA 3QBWA 2V51B 5AQRA 3ATUA 3UE5A 2DPNA 2VWBA 1XC3A 1X3NA 3EKUA 3HBTA 4H5VA 3GDQA 3WEEB 3H1QA 5ADXH 1HKBA 2KHOA 4BQLA 3QBXA 5LJWA 1ESVA 2QWOA 5AZJA 1QZ5A 2FLOA 2I7PA 4WYBA 2P9PA 4BRDA 2P9KB 2CH6A 2PAVA 5AQFA 1C0GA 1NGGA 2BTFA 4H0TB 1K8KB 5FPEA 4PKGA 2PBDA 5JLFA 2NZTA 3C7NB 4AM7A 3KHYA 1C0FA 4BR0A 4GY2B 3U9ZA 3ULEA 3VEOA 4FWKA 2P9SB 3DXMB 4B1UB 3QICA 1QQMA 1TYQA 4YDUA 4BRIA 5B8HA 2A3ZA 4CJ7A 4JN4A 1V4SA 1GLDG 5I9EB 5AQUA 4H0OA 3BEXA 2HF4A 4FWQA 3C0BA 5AQTA 3WQTA 2QWRA 2Q0UA 1J6ZA 4BRGA 1LCUA 5JMVA 4JD2B 3CJBA 4EHUA 2Q31A 2IVNA 3ZETA 4EAHD 2ASPA 3I8BA 3L4IA 4CD1A 3VEWA 1HPMA 1BDGA 2D0OA 3VGKA 2WUSA 1R59O 3A5MC 1DGKN 4DB3A 4FWLA 3UKUB 3CI5A 4I6MA 3R9PA 2E88A 3UKRB 3HTVA 3WXIA 4CZFA 1P8ZA 5AQMA 3JXUA 2P9IB 1ZBSA 5EX5A 2QWMA 5BREA 4A62A 4Y0WA 3M1FA 4BRHA 4CZKA 2E2QA 3CJAA 3TU5A 2FSKA 4XH1A 4CI6A 4XH5A 4PKHA 3FE1A 5AZIB 1YVNA 2YJEA 3CIPA 3HI0A 4EHTA 4BC3A 1Z05A 2A41A 2E2PA 5AQPA 3U9DA 3LL3A 1NBWA 2Q97A 4H5RA 1MWKA 4BREA 3WXLA 4HTLA 1G99A 1X9JA 4ISGA 4CZEA 3GOIA 2QXLA 1D4XA 4RTFD 1U2VB 1GLBG 4FPAA 5AQIA 2QWQA 3BF3A 3A8YA 1RFQA 2D4WA 4BC2A 3H6EA 3HSCA 1NMDA 3AAQA 2D0PA 4CZMA 4DHYA 3D2EB 4H5NA 3FFKB 2Q1NA 1JCGA 1X3MA 3ZX2A 2F9WA 3LDLA 3LDQA 4A61A 4H0YB 1ATRA 2E8AA 3O6WA 3D2FB 3ZEUB 2P9NA 5AFUA 2YJFA 1NGFA 3ENHA 5F1XA 1SQKA 2YI1A 3A5OC 5EXWA 1HKCA 5BRHA 5AQYA 3WEEA 1GLJO 3UB5A 3W3DA 1NGBA 2BUPA 5E84A 3R8EA 3ENOA 3SMSA 4H5TA 3SMPA 4CZHA 3L6QA 4JHDB 4FWRA 4PKIA 1YUWA 2P9KA 3FZHA 3VERA 1HLUA 1JCFA 5KPTA 3EO3A 1Y64A 3IMXA 1S22A 3GG4A 1K8KA 1MWMA 4BGBA 2Q36A 4BG8A 2V7YA 4EFHA 2GWKA 3SJHA 5AQGA 2HOEA 2GEMA 3CQYA 3U8XA 2P9SA 3KVGA 4H03B 3EKSA 4B1WB 3DAWA 4BVPA 1LOTB 2UYTA 3LM2A 4WQ5C 1MDUB 3O08A 3MCPA 2V7ZA 4NO7A 1Z6RA 3MN7A 3MK6A 4K41A 4B1XB 2OANA 4K42A 5BPMA 4JD2A 3BF1A 4QS8A 4CZJA 4MO5A 4O5FA 5ELZA 3F9MA 2CH5A 3TPQA 2IVOA 4DCHA 3LDOA 1ZXOA 4WQ4C 1RDWX 4CZIA 3RSEB 1TUUA 2VYPA 5KQ8A 1TUYA 4RCHA 4MO4A 2ASOA 3ZX3A 5KQDA 4IZ9A 4H0XB 2AA4A 2P9IA 1SAZA 3EN9A 5KPRA 1BO5O 2J4RA 1H1VA 4CZGA 1XQSC 4DQ8A 3WUHA 3QMLA 3H45C 4BR7A 1T44A 5BR9A 2E1YA 5AZIA 1IJJA 2FXUA 2EWSA 3ZX0A 2GELA 1NWKA 4FWOA 2ITMA 1NGCA 3JS6A 1WUAA 4K43A 2NLXA 2A40A 3A5LC 4M63C 1BUPA 3CHWA 2Q0RA 4M7YA 2P9LB 1U2VA 1QQNA 3EZWA 3BP8A 3IUCA 3WXKA 4A2AA 1DEJA 1T6DA 3I33A 4FOEA 4LC9B 4BR4A 4CBXA 5AQWA 4B9QA 2P9UB 3CERA 1WOQA 3H3OB 2CGLA 4FSVA 4QS7A 5AQOA 3VPZA 1NGIA 5AQNA 2FF3B 3D2EA 3IDHA 4F9OA 4AM6A 3LDPA 5AR0A 3H3NO 3FZMA 1SZ2A 2CGJA 3D7EO 1BG3A 3O5BA 4B1YB 2ZWHA 2VCPA 2QWNA 1E4GT 3D2FA 2YHXA 3ZEUA 4BR5A 3HM8A 3QFUA 4H5WA 4H0VB 5BN9A 2YCHA 2NRHA 3FZLA 3G25A 4BRMA 3H46O 3VETA 4L3QA 5EOYA 1BA1A 3CETA 4KBOA 5CE3A 3O4WA 3P4IA 5TKYA 4FWSA 4PL8A 2GUPA 1DKGD 3FGUA 4FWPA 4FOIA 5F0XA 3O1WA 4FO0A 3VEYA 1KAYA 4BRCA 1GLCG 4MLEA 3B8AX 2E1ZA 3A5NC 4XEIA 3GBTA 2W41A 4BRLA 1QHAA 3MDQA 3DXKB 2FF6A 1GLAG 3O1BA 3CJCA 3QB0A 1NGAA 5AQSA 1HJOA 4EIAA 4CZLA 3R6MA 4B1VA 5EVZA 3VGLA 1NLVA 2QWLA 3C7NA 3AARA 3VEXA 3BUZB 4IWVA 2P9NB 1HKGA 1CZAN 1YXQA 2QM1A 3DXMA 4BRKA 3CJ1A 2ZF5O 2ZGYA 4ISEA 4C23A 4BVOA 4RWTA 4ISFA 3VF2A 4PL7A 3WQUA 1GLFO 4GNIA 1Q18A 2Q2RA 1BOTO 1KXPA 4BRQA 4WQ5A 3LM9A 3RSEA 4K25A 5AQLA 2E20A 3OHRA 3FZFA 3MN5A 4IJAA 1ZC6A 3CQXA 5AZJB 1QZ6A 1OKJA 3ATVA 4BRFA 4O8KA 1E4FT 2D1KA 2GWJA 4FWNA 1GLEG 1S3XA 2P9PB 4YDUC 3UKUA 3UKRA 1IG8A 4JAXA 4MLHA 5AQQA 4WQ4A 5F2RA 5FPNA 2YHYA 2E2OA 5BPLA 4BRAA 4BRNA 1HX1A 2QW9A 3AAPA 1JCEA 2CGKA 1NM1A 3VENA 3WXJA 3ULEB 3QDKA 4BQZA 5EY4A 2A5XA 4BROA 3IFRA 1TYQB 5AFUH 1ATSA 3SK3A 5LJVA 4BC5A 2AP1A 1BA0A 2A6AA 3EL2A 5JLHA 1MA9B 5BPNA 2A42A 2P9LA 4A2BA 2W40A 4E1JA 1NGHA 3S41A 1RGIA 1ATNA 1NGDA 1XUPO 5AQJA 3VESA 4M7XA 3VEZA 2HMPA 3DWLA 3CJ9A 2I7NA 1BU6O 5AQZA 4CBWA 2P9UA 2H3GX 3SLCA 2QWPA 3A0IX 3LDNA 4JNEA 4QS9A 3ZETB 3HZ6A 5ADXA 1YAGA 2V52B 3J8AA 2FSNA 2FSJA 4IXCA 5AQHA 3DJCA 2IVPA 3M6GA 4I6MB 3H1VX 3M3ZA 5AQKA 4IJNA 5FPMA 1NGJA 4BR9A 3O8MA 4J8FA 4BGAA 4CD3A 4FL9A 3VF6A 3U4LA 2ASMA 4CBUA 5KPZA 1V4TA 3O80A 4H0PA 1KAZA 4FPBA 5BRFA 3L0QA 3FLCO 3WT0A 3VOVA 4BG9A 2YHWA 4FWMA 1HUXA 4IO8A 3VF4A 5E26A 3GL1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MMVA 3L2VA 3GE1A 3THYA 4OO1J 5CYQA 4BE0A 2VWJA 3AVGA 1D5AA 4YOXA 4J2EA 5BN8A 5HBMA 4AILC 1VSKA 5BRDA 1QQOA 4CGFA 1N5YA 4CVNE 4BR2A 2E2NA 1VSIA 1NGEA 3L2WA 3V6DA 3W0LA 4DR5K 4BRPA 5J2NA 5CYMA 4I7FA 1QVFM 3QBWA 4YOTA 2O8FB 4C1NK 1KTQA 3Q7CA 3LAKA 2DPNA 1RBVA 1T8EA 3OYFA 3EKUA 1X3NA 3HBTA 2PZSA 1RTHA 3H1QA 3OJUA 2QWOA 2P9PA 3OW2M 4DF4A 5C24A 4O8UA 3PO4A 5EU7A 1X1PA 1XHZA 4RW8A 3TARA 3SNNA 4PKGA 2BGGA 3OBYA 3KHYA 4JKAA 1Q81O 3QERA 4GY2B 3ULEA 1KFSA 3VMFB 4G1QA 4FWKA 4JRPA 3TAQA 3EE8A 4YDUA 3KWIA 2KW4A 3QEIA 4NYFA 4DTSA 5I9EB 4DV3K 4H0OA 4YOWA 4DS4A 1RT3A 1LCUA 1VAZA 3T1AA 5JMVA 2O8EA 4EHUA 4W5OA 1YJNN 2ASPA 4DU1A 2UXBK 1VSEA 3ID6A 3NH0A 2WUSA 4CJSA 3HVTA 2YKNA 3M8PA 3NAEA 4V19S 4OJRA 3KK1A 4FLYA 1ZBSA 4A62A 3THWA 4BEBA 1BQMA 3QIPA 1LV5A 2FSKA 3LWMA 4CI6A 4XH5A 3OYGA 4DV5K 1DLOA 3CIPA 3KLGA 3HI0A 4BC3A 1Z05A 1MU2A 4N41A 2F8SA 3E66A 5M1QA 4JKFA 2Q97A 4H5RA 1MWKA 4JLHA 1X9JA 4F2RA 1YTAA 4RTFD 1U2VB 4FJHA 2YV0X 2X6SA 1RFQA 1NMDA 4CZMA 3D2EB 4H5NA 4DQSA 3RRGA 3SV4A 1RT7A 1T7PA 1X3MA 3RRHA 1UOCA 2F9WA 3LDLA 3LDQA 3MEGA 5JVHL 1L5UA 1Q8IA 5KRTA 2PYJA 4E7HA 3ZSRA 1NGFA 3ENHA 5F1XA 4LF8K 2YI1A 3A5OC 5EXWA 3LALA 5BRHA 3KK3A 3SPYA 1NGBA 1K6YA 4LY7A 4E7KA 3MWPA 4PKIA 3O9RA 4JS5A 3VERA 3LP3A 4AHUA 1JKHA 1RDAA 1Y64A 4Q0BA 1S22A 4DV0K 4BGBA 2Q36A 4DG1A 1IO2A 1HNWK 3THVA 2V7YA 5HRSA 4EFHA 1QHTA 3MWTA 1C1CA 2HOEA 3KVGA 3EKSA 1Q86O 4HHTA 3G0ZA 1U47A 1Z6RA 3MN7A 3KK2A 3RMCA 3TAFA 4OX9K 3B6OA 3MX5A 1LWEA 3TSUA 4CZJA 2CH5A 4FLXA 1OH5A 4PQUA 1B92A 4AHRA 1RCHA 1XI1A 4OPKA 4DMNA 3RSEB 3UIQA 5KQ8A 1TUYA 1N36K 4RCHA 4DQPA 3IAYA 3K59A 4F3TA 2ASOA 4DSLA 5KQDA 4IZ9A 4H0XB 3G10A 3CYGA 4X65K 1ILYA 2W6KA 1BO5O 1FK9A 2WONA 2J4RA 3E1YA 1XQSC 1T44A 4DR2K 1GOBA 3TAGA 2HVHA 3K5LA 2FBYA 1NWKA 1NGCA 2ETJA 2NLXA 4M3XA 4Z4CA 3OYDA 1LAVA 2Q0RA 5T7BA 1U2VA 3HPHA 4DQQA 4M42A 3WXKA 4M45A 5GIOA 1T6DA 4BR4A 3IKMA 4LC9B 4CJ3A 2BH1A 3QEVA 1WN7A 2P9UB 3H08A 4I2QA 1WOQA 4QS7A 2CGLA 3H3OB 4KH4A 3AVNA 1NGIA 3DLKA 3R1XA 5AQNA 3D2EA 4RW9A 2UUBK 2RN2A 1U04A 5AR0A 4CFBA 4OGCA 1SZ2A 3D7EO 4CEOA 2ZWHA 3SBGA 4C1NI 4BR5A 3QFUA 4CF1A 4IG3A 1NJIO 2W00A 5BN9A 3M5RA 1QSSA 3FZLA 3F73A 3VETA 2A1RA 5EOYA 3CF5L 1BA1A 4W5RA 1RNHA 5CE3A 4YNQA 4BDPA 5TKYA 4PL8A 4PWDA 2GUPA 1DKGD 1S1TA 4FO0A 1DTTA 4KHUA 3DLGA 4DTNA 1GLCG 4MLEA 1SKSA 4CHPA 2QA4N 2O8BA 4XEIA 1RBSA 3GBTA 4LFCK 1QHAA 3MDQA 3DXKB 3ZSZA 2HB5A 3O1BA 1EKEA 4C8NA 4EIAA 2ZQBA 4B1VA 3DLEA 1NK4A 2QWLA 2JLEA 4PA1A 3NH1A 4JEPA 4NLCA 2P9NB 2VG7A 3NHGA 4HUEA 3J7YP 2X74A 2QM1A 2ZF5O 4ISEA 4CHNA 1W7AA 4ISFA 3CCRN 4CEQA 1BIZA 3HM9A 1A5XA 3NDKA 3RSEA 4DTRA 1B9FA 5C10A 5AQLA 1VQ5N 1ZBIA 5FDLA 3HK2A 3FZFA 4IJAA 1ZC6A 5AZJB 4BRFA 3CCLN 2D1KA 2GWJA 4KH5A 5J2QA 1T05A 4YDUC 4AHVA 2E6LA 3HP6A 3UKRA 3HXMA 3CCSN 4KHNA 1EXQA 4JAXA 1QE1A 4WQ4A 5FPNA 4LFAK 1JXBA 3K57A 5DM7L 1HX1A 4LF9K 1I3AA 3VENA 1W9HA 3QDKA 3DRSA 3V9SA 2A5XA 3AVHA 1SL2A 4CCHA 3IFRA 2A6AA 5CY4A 1MA9B 4IOCL 4A2BA 4I9LA 4E1JA 1GOAA 1RGIA 2RPIA 1NGDA 1XUPO 4DV2K 2HMPA 3DWLA 3CFRA 2I7NA 4DV7K 4EZ6A 2P9UA 2H3GX 4CFAA 3ZETB 3LDNA 3V9ZA 1FW6A 1K8AO 3AA3A 5ADXA 3OYEA 2FSJA 4K8XA 1F21A 3CC7N 5AQHA 4FM1A 4I6MB 1P90A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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