5ADXH

Cryoem structure of dynactin complex at 4.0 angstrom resolution
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Structure of the Dynactin Complex and its Interaction with Dynein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACTIN RELATED PROTEIN 1
molecule tags Structural protein
total genus 92
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5adxH01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5adxH02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5adxH03
4O8KA 2P9KA 2VWBA 3O1BA 4K41A 3CJBA 5E26A 4BRPA 1ZBSA 2P9UB 2E88A 1Z6RA 3VF6A 2IIRA 2GUPA 2QWNA 4CI6A 4BRMA 1NGBA 2HF3A 3SMSA 3VEXA 5AQYA 2HF4A 1HPMA 4BRDA 1V4SA 3BEXA 5FPNA 4BVPA 3QFPA 2CGJA 4FOIA 1NGCA 4BVOA 5E84A 3WQTA 1S3XA 3AAQA 3FLCO 3ENHA 2AA4A 1ZXOA 4WQ5A 4IWVA 1NWKA 3GE1A 2HMPA 3VESA 2V51B 2GELA 3O5BA 1GLJO 4FO0A 3WXJA 4L3QA 3RSEB 1J6ZA 4B9QA 1TUYA 1T6DA 5EXWA 2IVOA 2E2NA 2P9KB 1WOQA 2GTDA 2A5XA 3UKRA 2YHWA 3EO3A 1LCUA 4BR9A 1GLAG 1SAZA 4CZHA 2VYPA 3CI5A 2I7NA 2FLOA 3GOIA 3FZHA 5B8HA 1BO5O 3HI0A 5TKYA 3MN5A 4BRFA 4QS7A 3I33A 2E8AA 3MN7A 3D2EA 2PAVA 2NZTA 3O1WA 3VGLA 1KXPA 1CZAN 5AQNA 1MDUB 3F9MA 5KQ8A 2E1YA 3LDPA 1QZ6A 4RWTA 1BA0A 4FPAA 3L6QA 2FSKA 4DQ8A 3IFRA 3O6WA 3R6MA 2P9IA 2I7PA 3U8XA 4HWIA 2H3GX 2FXUA 2P9PA 2GWKA 3J8AA 4RCHA 1NBWA 3UKRB 4FWKA 3DAWA 2QWQA 4BR2A 3U9DA 4MLHA 1H1VA 1NM1A 4C23A 2YJEA 2FSJA 3AAPA 3QMLA 3GBTA 4IZ9A 3O80A 3D2EB 1RFQA 3IDHA 3ZX3A 4EHTA 4FPBA 2P9LA 4QS8A 3SMPA 4DHYA 5AQUA 4PL7A 3EKSA 3WXKA 1HX1A 1U6ZA 3WXLA 4O5FA 1ATRA 2CGKA 2YHXA 3U4LA 3DXMA 1ZC6A 3HZ6A 2P9IB 2P9SA 4FWRA 3MN6A 2P9PB 4JD2A 5AQSA 4JAXA 5EVZA 3W0LA 2QWMA 2YJFA 1DKGD 5AFUH 1BA1A 2D1KA 3IMXA 1E4FT 2E2OA 4IJAA 3H1VX 2BUPA 1Z05A 4EAHD 3CJCA 4MLEA 1R59O 5EY4A 1Y64A 2J4RA 4RTFD 1TYQA 5AQZA 5AZIA 3MN9A 1K8KA 4NB4A 2QM1A 2YHYA 2V52B 4CD3A 2IVPA 4GNIA 4H5VA 3LM2A 4BGAA 3A5NC 2V7YA 3DXMB 2P9NA 3UKUA 3C0BA 3G25A 1GLBG 2P9SB 2W41A 1T6CA 5AQXA 4JD2B 3GG4A 1QQOA 2ZWHA 3CERA 5LJVA 3B8AX 4IO8A 3VGKA 5KQDA 5FPMA 2D0PA 5AQQA 1YAGA 2Q36A 3EL2A 4I6MA 3H6EA 5BN9A 1BDGA 5JICA 4KBOA 3VPZA 2F9WA 1TYQB 2E2PA 4A2BA 2QW9A 3LDNA 4IXCA 3MDQA 5AZIB 3VEYA 1K8KB 2Q97A 5FPEA 4H03B 5BRDA 1C0GA 4BRAA 2YI1A 5AQTA 4PKHA 3BUZB 3FZKA 2P9NB 3UKUB 1T44A 3CHWA 1QQNA 3MCPA 3ZETA 1WUAA 4IJNA 4H5NA 3VEZA 1G99A 4CZIA 1MA9B 3A0IX 3DWLA 4A62A 4H0OA 5BPLA 1KAXA 2EWSA 4BR7A 5AQVA 3ULEA 3EN9A 4BRGA 4CZLA 3WXIA 4I6MB 3L4IA 1NGFA 4CZKA 4FWPA 3KVGA 4NO7A 3AARA 3FFKB 2ASPA 3GL1A 3SJHA 5I9EB 1YXQA 1HJOA 5ELZA 4CZGA 1E4GT 2ZGZA 3WEEA 4H0VB 3FR0A 3QDKA 3H45C 4AM7A 3FZLA 3HBTA 1HKCA 2OANA 2BTFA 1BOTO 1BWFO 4E1JA 4FWLA 4FWOA 5BRFA 2NLXA 1SQKA 2Q0UA 3ZETB 4BC3A 4B1ZA 4Z94A 5AFUA 3U9ZA 3DJCA 5BPNA 3TPQA 5AQJA 2E2QA 5KPRA 4BRQA 4FWQA 1S22A 3MMVA 1NGDA 1XC3A 4BR5A 4F9OA 3OHRA 4HTLA 1NGIA 5ADXH 3CJAA 3UE5A 1X9JA 3WEEB 3KHYA 1JCGA 1GLFO 3VEVA 2YCHA 1Q18A 4ISFA 2GEMA 3JXUA 5BPMA 4Y0WA 4BG8A 3CIPA 3WT0A 4K42A 2CGLA 2ASMA 3O08A 1SZ2A 3SK3A 2UYTA 4BC4A 1X3NA 3O8MA 5BREA 3VOVA 1NGEA 4H5RA 4AM6A 1NGHA 4FWMA 4H0YB 3H3OB 5AQMA 3CJ9A 4PKIA 4M7YA 2P9LB 2QWOA 3EKUA 2KHOA 4JN4A 2D0OA 2HOEA 3HM8A 1GLEG 3IUCA 1ESVA 3A5LC 5FPDA 2A41A 3LM9A 4BRHA 2Q2RA 4B1XB 3QICA 1HKBA 3UB5A 4EFHA 5AQOA 5LY3A 2V7ZA 3CETA 1ATSA 4BRCA 5AQRA 3VF4A 1KAYA 1C0FA 3SLCA 5LJWA 1NLVA 4PL8A 1BUPA 5BN8A 1RGIA 4CBUA 3BF1A 1NGAA 2D4WA 4MO4A 2FSNA 3BP8A 4BROA 1U2VA 3FZFA 3VEWA 3D7EO 4DB3A 5AZJA 4M7XA 3C7NA 3VERA 3P4IA 4WQ4A 3FGUA 2QWPA 1HUXA 2DPNA 3H46O 5JLFA 3QB0A 3JS6A 3A8YA 2A40A 2GWJA 3EZWA 4YDUA 3ZX2A 5CE3A 4CZEA 3LDQA 4H5TA 4WYBA 1ATNA 5EOYA 1QQMA 2QWRA 4GY2B 3LL3A 1IJJA 1DEJA 2QWLA 1P8ZA 3CJ7A 4H0PA 5F1XA 3HTVA 1BG3A 3AY9A 2IVNA 2F9TA 3ATUA 1U2VB 5EX5A 1D4XA 4ISEA 4K25A 5AZJB 3VENA 3D2FA 3C7NB 2A3ZA 4LC9B 3QBXA 3M6GA 4FL9A 4K43A 3H1QA 4J8FA 4BQZA 4BR4A 4BREA 2NRHA 5KPZA 4BQLA 3LDLA 3ZX0A 1MWKA 5ADXA 1KAZA 3QBWA 1NGJA 1NMDA 4A2AA 3VGMA 3S41A 4BC2A 1X3MA 4EHUA 3M1FA 1BU6O 3ID8A 3VEOA 4BGBA 2E20A 5AQGA 4BR0A 2ITMA 4M63C 2A6AA 4XEIA 2FF6A 4FOEA 4XH1A 4FWSA 1GLLO 3W3DA 5AQFA 4CJ7A 4DCHA 3ULEB 2Q31A 4ISGA 3CJ1A 3FE1A 3L0QA 2FF3B 3WUHA 4CZFA 5KPTA 4BG9A 4CD1A 4BRLA 3MK6A 1TUUA 3D2FB 3O4WA 2ASOA 2CH6A 2AP1A 2CH5A 3FZMA 1XQSC 4MO5A 1JCEA 4H0XB 1XUPO 1QZ5A 4H5WA 4XH5A 3VF2A 4FWNA 3BF3A 4WQ4C 3DXKA 5F0XA 3M3ZA 4JNEA 3CQXA 4JHDA 1YUWA 4A61A 2E1ZA 4CZMA 4CZJA 5AQHA 4QS9A 5AQLA 5BRHA 4YDUC 5AQPA 3ZEUA 1MWMA 1HKGA 1EQYA 4H0TB 4BRKA 3GDQA 2QXLA 4BRNA 2WUSA 4B1YB 2ZGYA 3R9PA 2A42A 3QFUA 5JMVA 1HLUA 4WQ5C 1DGKN 3TU5A 2P9UA 3VETA 2ZF5O 3HSCA 3I8BA 3R8EA 2Q1NA 3ENOA 4CBWA 3H3NO 4PKGA 4BC5A 5F2RA 3A5MC 4EIAA 3WQUA 3A5OC 1QHAA 3ATVA 4B1VA 3DXKB 1GLCG 2W40A 4JHDB 1NGGA 4B1WB 5AQWA 3LDOA 1GLDG 5AQKA 2Q0RA 4CBXA 4B1UB 4FSVA 5AR0A 1V4TA 4BRIA 1JCFA 2PBDA 1OKJA 1IG8A 2VCPA 3KZBA 3RSEA 3ZEUB 5JLHA 1YVNA 1RDWX 1LOTB 5BR9A 4XH4A 5AQIA 3CQYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ASWA 2D0BA 3M8SA 3VQPA 1FKOA 2DTUA 4K41A 2KFZA 4YNQA 1YI2N 1CXQA 1RTDA 3VF6A 3EYZA 2HHHK 2QWNA 4Z4GA 4CI6A 2IC3A 4Z0UA 2HF3A 1RDBA 4E7JA 3T1AA 5AQYA 1XMQK 4YOTA 1V4SA 5FPNA 5JVGL 3V4IA 3QFPA 2CGJA 1RT2A 3DRRA 3WNGA 1NGCA 3NH0A 1NK7A 1X9SA 3WQTA 3WXMB 3ENHA 4AHSA 2HMPA 3VESA 4F8RA 3WXJA 4B9VA 1TUYA 2BDPA 1T6DA 4RW7A 5EXWA 4BDPA 2IVOA 3CFOA 3UKRA 4HCBA 3DMJA 4NLCA 1NJZA 4BR9A 1GLAG 1IO2A 4DTPA 3DLEA 3OA9A 2VYPA 2FLOA 3CYGA 3QETA 3BGRA 3V9ZA 3RMBA 4CJSA 4O0JA 3D2EA 1HR0K 4O8UA 2PAVA 2NZTA 3O1WA 1VQKN 3N4QA 2YV0X 4FJXA 4LY7A 3ZSXA 2E1YA 4RWTA 3KLEA 3DOLA 1EKEA 3H08A 3PV8A 5CZ2A 2RKIA 4DQ8A 1VSFA 1VQ5N 4JK7A 3DLKA 4LFBK 3J8AA 2GWKA 3O4QA 2E4LA 3G4SN 3UKRB 2F8SA 1EP4A 4FWKA 3IRXA 2NRTA 2QWQA 3I8DA 3U9DA 1NK0A 2HHVA 1RT1A 4RW8A 4CIGA 3L2RA 4Z4EA 4YOVA 2FSJA 3AAPA 4CEBA 4MDAA 4IZ9A 4CJ5A 3OTOK 3O3GA 3D2EB 2KZMA 3KLHA 4OVLA 4CFBA 1VQ9N 4E0DA 4PL7A 3LZJA 1IG9A 3WXKA 4O0IA 1U6ZA 4OPKA 3PIPL 3WNHA 4O55A 2CGKA 3M8QA 3U4LA 3RMCA 3DXMA 4O44A 3JSMA 3HZ6A 2P9SA 3MN6A 2QWMA 4CGGA 5AFUH 4WF9L 3NFAA 1E4FT 3F5TA 1XWLA 4CK2A 3ZSVA 4ILJA 1HRHA 3L3UA 3SBGA 4MLEA 1Y64A 1YJNN 4M3UA 1IKVA 4M42A 4FJ8A 1WAJA 2YHYA 2E6LA 4GNIA 1SKWA 3A5NC 2V7YA 3DXMB 4IKFA 3CMEN 1GLBG 2P9SB 1C0MA 3KLGA 4W5QA 1T6CA 4E1NA 1U45A 3GG4A 4B9MA 5HRPA 3B8AX 4IO8A 5FPMA 1SL2A 3EL2A 4L8RB 5DK5A 3A2FA 5JICA 1RDDA 2IOCA 4KBOA 3PO5A 2F9WA 5GINA 1EETA 2QW9A 3ID6A 3MDQA 5KGXA 4FLXA 1BISA 2Q97A 3G71N 5BRDA 4Y1CA 4ELVA 4PKHA 4IFEA 3SPYA 3O9UA 2OPSA 4I7FA 5HL7L 3MCAB 4UQGA 4KTZA 4AHRA 1QQNA 1ZBUA 3ZETA 4B8AB 3DWLA 4V19S 5BPLA 4FJIA 3LPUA 2R7YA 4WCEL 4RW4A 5CYQA 3KLFA 5KGWA 4LSNA 3CFPA 1TKXA 3RMAA 3VTHA 3HYFA 3DLBA 3BDPA 4FLYA 4BWJA 4NO7A 3RR7A 4DFPA 1NU0A 5I9EB 3B6OA 3PUFA 1YXQA 3TWHA 3OBYA 5ELZA 3ZT2A 2HSTA 4CJVA 3SUPA 1F21A 3RRGA 2NRVA 3SCXA 4CEQA 3EE8A 3QDKA 4N41A 1NOYA 4W5NA 1HKCA 3LAMA 4E1JA 4FWLA 1SQKA 2F96A 2Q0UA 3ZETB 4BC3A 2RF2A 5GAHP 3AVMA 1VSIA 3DJCA 4W5TA 1CZBA 4JI0K 2E2QA 5KPRA 4H4OA 2HBLA 3MMVA 1NGDA 3I0RA 4BR5A 3OHRA 4HTLA 1VRUA 4RW9A 3TSPA 1NGIA 3KLIA 3SYZA 3UE5A 1HNWK 1X9JA 3AVJA 5SWMA 3MX2A 4FCYA 3KHYA 1HYVA 1GLFO 2YCHA 3QERA 4ID1A 2GEMA 1S9GA 2NRXA 4AQYK 2IS3A 4DSIA 4BG8A 3OYHA 2KTQA 2CGLA 3NMUA 3SK3A 3O9TA 3T7ZA 1VQ6N 1JJ2M 3VOVA 2GBZA 5E41A 4AM6A 1NGHA 3DLGA 4X65K 4LSLA 4PKIA 4KTWA 2P9LB 5M1OA 2VQEK 2UUAK 4JN4A 4HUEA 2D0OA 4FJ9A 3AVIA 3IUCA 4WE1A 3QLHA 2YNHA 3QICA 4CGFA 4BRCA 3SV4A 4Q0BA 2G8WA 1NG9A 5DM7L 1C0FA 5LJWA 1LW0A 1NLVA 1ZBLA 4G1QA 3CQ8A 1R0AA 2ZJQL 4BE2A 1NGAA 1I94K 1S1VA 4DV5K 3VA0A 1S6QA 4FJ5A 5AZJA 3AVCA 4M7XA 5SZTA 4WQ4A 3FFIA 5FROA 3PY8A 1HYSA 2XHBA 1CLQA 1L3TA 3OYFA 4IBNA 2OTLN 4E72A 4YHHK 3EZWA 3AA3A 5CE3A 2FBYA 3LDSA 1ATNA 4KHPK 2QWRA 4GY2B 4DU4A 4DV0K 1WSFA 3AVHA 1IJJA 5KRTA 1RDUA 2UUBK 1DEJA 4CVNE 4FJKA 3ZT0A 4H0PA 4FLTA 3NAEA 4DQIA 2IVNA 3SQ4A 3ATUA 1S1UA 1D4XA 1NKCA 4ISEA 5AZJB 3TTCA 2IDOA 3QBXA 3HVTA 3H1QA 5HROA 1YHQN 4BQZA 2I5JA 2NUBA 4BREA 5KPZA 1KFSA 1SL1A 4FZZA 4BQLA 4CGJA 3ZX0A 2FC0A 4CK1A 3LALA 5ADXA 2F8TA 1NGJA 3VGMA 1NK4A 5HBMA 4U67L 3I55N 4FM1A 3ID8A 1S72N 3SQ0A 4CJ7A 3W3DA 5AQFA 4DU1A 5J2PA 1WAFA 3VQ4A 1ZBHA 3CJ1A 1KFDA 4DS5A 4CZFA 3WUHA 5KPTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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