5ADXH

Cryoem structure of dynactin complex at 4.0 angstrom resolution
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Structure of the Dynactin Complex and its Interaction with Dynein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACTIN RELATED PROTEIN 1
molecule tags Structural protein
total genus 92
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5adxH01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5adxH02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5adxH03
5F2RA 2FSJA 2GWKA 3CI5A 3GG4A 1YAGA 5BPLA 5ELZA 4H0YB 3VENA 3GL1A 3U9ZA 4FO0A 5BR9A 2D0OA 2YHXA 3IFRA 2ZGYA 1GLJO 2ZWHA 3JS6A 3BEXA 4EFHA 3IDHA 4PL8A 3HM8A 4QS8A 3OHRA 5AQLA 2FF3B 2V7YA 2CGJA 2QWOA 4MO4A 3MDQA 3UKUB 2P9PB 3H1QA 5BREA 4WQ5C 2QW9A 5AQSA 3A5LC 5ADXH 1GLEG 1HJOA 2GWJA 3HBTA 3MK6A 5AQKA 3B8AX 3BF1A 3O6WA 3WQUA 4BRFA 4PL7A 3DXMA 3ULEB 4FWQA 5AQTA 4C23A 3H46O 1S3XA 2I7PA 2A41A 4B1WB 5B8HA 1ATRA 3AAQA 1C0FA 3HZ6A 3I33A 1Q18A 3ENHA 4RTFD 2DPNA 3LDQA 4BRDA 1KAXA 2A3ZA 4A62A 5EY4A 3EO3A 3WXKA 3AY9A 3BUZB 4BQLA 4JD2B 3P4IA 2F9WA 2HF4A 3GOIA 4DB3A 1C0GA 3ATVA 3TU5A 1E4FT 4FPBA 2NLXA 4B9QA 4BVPA 2W41A 4BQZA 4A2AA 4IXCA 1NGJA 4FWMA 2D0PA 1NGBA 4L3QA 1ATSA 2W40A 4HTLA 2QWQA 5AR0A 4BROA 4BRGA 4M63C 4BR9A 3QICA 1X3NA 3HSCA 3ZEUB 4BRPA 3UKRA 4H5WA 3FZFA 2F9TA 2QWPA 3FZHA 1J6ZA 4BR5A 3CJCA 1Z05A 5FPNA 5KPZA 5EOYA 1QZ6A 2P9KA 2FXUA 5AZIB 5AQVA 4J8FA 1BA0A 1JCEA 2E8AA 4IZ9A 3WXLA 1YVNA 2HF3A 4CBXA 4I6MA 5AZJB 4QS7A 2ITMA 4BRIA 4FSVA 1T44A 2CH6A 2GELA 3ATUA 3VGMA 3MN5A 5JICA 5KPRA 4JNEA 2IVNA 1BO5O 3JXUA 1BU6O 3ZX0A 2EWSA 3ZETB 2H3GX 3D2FB 4JHDB 2E88A 2QWMA 3ENOA 2QWLA 5ADXA 1ESVA 4BRAA 2FSKA 1EQYA 3DAWA 1V4TA 4FOEA 3VOVA 1H1VA 1ZXOA 1NM1A 3QBXA 4ISEA 1RDWX 4FWKA 1WOQA 3CQYA 4XH1A 3O1WA 1MDUB 3ZX2A 1X9JA 4NB4A 4EIAA 3WXIA 2KHOA 4XH5A 4ISFA 3UB5A 1NGDA 3KVGA 1MA9B 5CE3A 1K8KA 4CJ7A 3BF3A 3O08A 1QQMA 1NLVA 3L6QA 4BC4A 3VPZA 2P9LB 3CJ1A 3LDPA 3LM9A 4B1VA 4BRMA 2P9SB 3C7NB 2P9UB 5BRFA 1NGHA 4YDUA 2A40A 1BUPA 3AAPA 3LDLA 4CZKA 3GBTA 3MN6A 4WQ5A 5E84A 4B1ZA 2Q31A 1YUWA 3DJCA 4GNIA 4H5NA 4YDUC 3G25A 5LJWA 3WT0A 4IJAA 4F9OA 3L0QA 3FZMA 3VEVA 3M6GA 3U8XA 2YI1A 4BRLA 3D2EB 4BGBA 2GEMA 1BWFO 4JN4A 1HX1A 4ISGA 4CD3A 1GLFO 3DXKA 1DGKN 2D4WA 3MCPA 5AQRA 1HLUA 2A5XA 4M7YA 3D7EO 4BR7A 5JLFA 4IWVA 1NBWA 4CZMA 4H5TA 4PKIA 4HWIA 2P9IA 4BC2A 3A5NC 3HTVA 2WUSA 2AP1A 3VEXA 2IVOA 5EX5A 4DCHA 1NGAA 3QMLA 3SMSA 2BUPA 4BR2A 4LC9B 5JMVA 2YJFA 1KAYA 4FOIA 4M7XA 1YXQA 3U4LA 3RSEA 3IUCA 1IG8A 3CERA 3IMXA 4QS9A 3VEOA 5AQNA 4B1YB 5AQQA 4H0TB 3R6MA 3VEZA 5AFUH 4BG9A 4KBOA 3CJ9A 1OKJA 1T6DA 5AQGA 1U2VA 3DXMB 4H0VB 4EHUA 1GLLO 2YHYA 3C0BA 3SLCA 3WXJA 1QQNA 3A8YA 3R9PA 3F9MA 3SMPA 4BRCA 2E1YA 2P9NA 4IJNA 3VF2A 1NGGA 3DWLA 5AQOA 4FWSA 1TYQA 3VETA 4A61A 1GLBG 4H0XB 5AQYA 3SJHA 2E1ZA 1GLDG 3MN9A 5AQIA 2IIRA 4BVOA 3LL3A 1V4SA 4IO8A 5BPNA 3ZX3A 2D1KA 3TPQA 3CETA 3QB0A 1NGFA 1TUYA 1HUXA 3CJ7A 1MWMA 1Y64A 4FPAA 2IVPA 3VEWA 3AARA 2FF6A 1XUPO 2J4RA 5AQZA 2CGKA 3EZWA 1ZC6A 3W3DA 4O5FA 2A42A 1QHAA 4FWPA 2Q97A 2CH5A 3EN9A 3BP8A 4FWOA 4BG8A 4AM7A 1WUAA 3WEEA 2Q2RA 4WYBA 3EKSA 2GTDA 3FE1A 3R8EA 3VF6A 4BRQA 5F1XA 3UKRB 4WQ4A 4CZJA 3EL2A 3FZLA 5I9EB 5AQFA 1ZBSA 4PKGA 3VGLA 2P9KB 1RGIA 3O1BA 4K25A 4WQ4C 4BC3A 2A6AA 2QWNA 4CZGA 3H45C 4I6MB 4CZEA 3MMVA 4JAXA 4BREA 1MWKA 3FLCO 1HKBA 4BR4A 3O8MA 1G99A 5BN8A 5F0XA 1DKGD 3UKUA 2E20A 2P9PA 2CGLA 1XC3A 5EVZA 4DQ8A 3LM2A 1SQKA 3O5BA 1NGCA 4K42A 3O4WA 4Y0WA 1HKGA 4B1UB 2YJEA 3QFPA 3KHYA 5AFUA 2QM1A 5KQ8A 3VERA 5FPEA 1ATNA 3ULEA 3J8AA 3SK3A 4MO5A 4BRHA 3KZBA 1S22A 1BG3A 3A0IX 2E2NA 3FFKB 4MLHA 5AQUA 3VEYA 3CHWA 2NZTA 4CBUA 5TKYA 4DHYA 2ZGZA 2Q0RA 1BDGA 2YCHA 4EHTA 1K8KB 4CZFA 3LDOA 4JD2A 4CZHA 1LCUA 5AQXA 1T6CA 2Q36A 4EAHD 3FZKA 5AQWA 2ASPA 3VESA 3QFUA 2QXLA 4A2BA 2V52B 2FSNA 3UE5A 4BRKA 2ZF5O 3M1FA 2VCPA 4CZIA 4RCHA 1E4GT 3H3NO 1RFQA 1KXPA 3MN7A 1QZ5A 4AM6A 3ZEUA 3H6EA 1R59O 1JCFA 4H0PA 5FPDA 1BOTO 3A5OC 3I8BA 3DXKB 4CI6A 1HKCA 1LOTB 3M3ZA 4RWTA 3CIPA 3A5MC 5LJVA 3GE1A 2FLOA 1NWKA 3S41A 5AZIA 3EKUA 2P9IB 3H3OB 4PKHA 5BRHA 4O8KA 5KQDA 2ASMA 1XQSC 3O80A 4B1XB 2Q1NA 5AZJA 4FWNA 4CZLA 4BGAA 5LY3A 1KAZA 1TUUA 4H0OA 1NGEA 5BPMA 3CJAA 2V51B 2VYPA 5FPMA 3VGKA 3RSEB 3ZETA 3D2FA 3HI0A 1SZ2A 3ID8A 4JHDA 4XH4A 3U9DA 4Z94A 5JLHA 2PAVA 4XEIA 1BA1A 4H5VA 2AA4A 4CBWA 4K41A 3CQXA 3H1VX 1U2VB 2QWRA 5EXWA 1IJJA 5BN9A 4E1JA 4NO7A 3W0LA 2ASOA 2P9NB 4BRNA 3FR0A 1X3MA 2E2PA 1GLCG 2VWBA 3QBWA 3WUHA 1TYQB 3WQTA 2PBDA 4GY2B 3GDQA 1NMDA 1DEJA 1Z6RA 2V7ZA 3LDNA 2NRHA 3L4IA 1JCGA 2P9LA 5KPTA 2P9SA 1P8ZA 3C7NA 2Q0UA 2P9UA 4FL9A 4H5RA 1U6ZA 2E2QA 2OANA 4FWRA 5E26A 3FGUA 3VF4A 4BC5A 2HMPA 2BTFA 4K43A 2YHWA 1D4XA 2GUPA 2UYTA 3CJBA 5AQHA 4CD1A 5AQMA 3QDKA 4MLEA 2HOEA 4H03B 3WEEB 3D2EA 1GLAG 2E2OA 1HPMA 5BRDA 4FWLA 1NGIA 1QQOA 2I7NA 1SAZA 5AQPA 5AQJA 1CZAN 4BR0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PA1A 4E7LA 5F2RA 2FSJA 2VG7A 2GWKA 3GG4A 4AF1A 1TL3A 3PX6A 3VENA 1NJYA 3GL1A 1L3VA 3L2WA 3QETA 4I2QA 1OH8A 1U49A 3IFRA 4B9NA 3CFPA 2ZGYA 1GLJO 3IDHA 5HOOA 4QS8A 4CJLA 3OHRA 5AQLA 2FF3B 3AO1A 1UWBA 2V7YA 3WXMB 2JLEA 2QWOA 3OYFA 2OPRA 5BR8K 1B9FA 4WQ5C 5GADP 2QW9A 5AQSA 3BF1A 4FLTA 1KVAA 2VQFK 1T7PA 3H46O 3P31A 3OYLA 4CF0A 3ZT1A 4OKKA 5B8HA 4FLWA 5C10A 4CJTA 3O9TA 3HZ6A 1EWRA 1Q18A 2A3ZA 1HNZK 1JXBA 3BUZB 1BQMA 4BQLA 4OLAA 2F9WA 4JS4A 4DSEA 4KO0A 2YNGA 4CIFA 4CEOA 3ATVA 3TU5A 3VQDA 4BQZA 4JRQA 4DV0K 1NGJA 4FWMA 5K14A 3SQ1A 1S6QA 1NGBA 5GAHP 4M45A 3QINA 3SAGA 3NF9A 4CGJA 3LWMA 1BCMA 3O9RA 5JS1A 3HSCA 3QIPA 3V1QA 4IO9L 1C1CA 4DQQA 4CHQA 3UKRA 4H5WA 3FZFA 4YNQA 1J6ZA 3CM6A 4BR5A 3ZSVA 4Y1DA 5EOYA 1QZ6A 3LZJA 2P9KA 4E1MA 4IBNA 1ZBLA 4Q0BA 1BA0A 1E3MA 2O8CA 5CY4A 4IZ9A 3WXLA 2KZMA 4LSLA 2HF3A 3L3VA 5CZ2A 4CBXA 4QS7A 2Y1JA 3CCUN 3PX0A 2CH6A 3OA9A 3MN5A 5KPRA 4JNEA 3JXUA 1BU6O 3ZX0A 2EWSA 3D2FB 4JHDB 4HTUA 1N32K 2QWMA 2IS3A 2QWLA 3ZSWA 4BRAA 1TAQA 2FSKA 1S1XA 1RBSA 1C6VA 3OJUA 1S1WA 1RT7A 3NHGA 1H1VA 3QBXA 3L3UA 4OGCA 1RDWX 3V9ZA 4OKJA 1D5AA 1A5VA 4FLUA 3HYFA 2NRVA 1EX4A 3KK3A 3SPZA 2ZQBA 3F5TA 4ELTA 1NOYA 2A1RA 1LWFA 2EX3A 4EIAA 2RN2A 4KH5A 3LZIA 1SKSA 4YOWA 4ISFA 3KVGA 3BF3A 1S6PA 3MWTA 1IKXA 3O08A 4LF7K 4KHUA 4BC4A 4IDKA 2P9LB 1VQNN 1QSSA 3LDPA 2WBNA 1HNIA 3PX4A 3TSQA 4YDUA 3MWPA 5SWMA 4DFPA 1BUPA 4JV5K 3GBTA 3MN6A 3TANA 2VWKA 4N47A 2GBZA 4KFBA 4HHTA 5LJWA 4DTNA 3L0QA 2WOMA 1HR0K 3VEVA 3T3FA 1BWFO 3PIOL 4CD3A 3U3GA 3DXKA 3KK7A 4KREA 2D4WA 5AQRA 3IAYA 4JI7K 1X9WA 2P5GA 3OBWA 3MX5A 1VQMN 3KLFA 4IWVA 4H5TA 2O4GA 4PKIA 2P9IA 3HTVA 3S9HA 4F4KA 3LP3A 4DSIA 2BUPA 2QA4N 1D8YA 2YJFA 4FOIA 3U4LA 3RSEA 3V1OA 3VEOA 1S9EA 3LP2A 3R6MA 3VEZA 4B9TA 4DLGA 1VSHA 4EZ6A 1KLMA 1WAFA 3DXMB 1ILYA 5CYQA 4H0VB 4CEBA 1CZBA 1RT3A 3QIOA 1EKEA 5IWAK 4CGDA 5KTQA 4CEEA 1ZBFA 3C0BA 3WXJA 2HHQA 4NXMK 3R9PA 1Y97A 4HUFA 2P9NA 3K5NA 2GV9A 1NGGA 4RW6A 3WNGA 3HL8A 4B3MK 1TYQA 5HRRA 2C1GA 3OYCA 4B8CA 3KK1A 1WAJA 5CR4A 3VN5A 3SZ2A 5BPNA 4YORA 4CJPA 4E19A 4O44A 5M1NA 3SAFA 4JYAK 1NGFA 3CJ7A 3ZSOA 2HHWA 1JLEA 4FPAA 4AQYK 2IAJA 1NG9A 2FF6A 4JRPA 4FYDA 3AO2A 3J7AP 3W3DA 3VTHA 3C6AA 3WNEA 1XNQK 1VSDA 4FWOA 4KH4A 3J80O 3HOTA 3T1AA 3M8PA 2GTDA 3FE1A 4JK8A 1TV6A 3JAMO 3A2FA 1BISA 4FJ8A 3R8EA 3D6RA 5F1XA 4PUOA 4WQ4A 4OLBA 4B9LA 4JI8K 5I9EB 1T05A 1ZBSA 4PKGA 2NRTA 3VA3A 3L4QA 3SBTA 4PHTX 3AVHA 5J1EA 3OTOK 2QWNA 1SL2A 4JI5K 4AHRA 4CZEA 4DS5A 3OYAA 4BREA 4BR4A 2HBLA 4FJIA 5BN8A 3SCXA 4B3SK 1EP4A 4B1UB 1YJ9N 3KHYA 2E5LK 1KD1O 5FPEA 4FJ5A 1VQ6N 4CIEA 3ISNC 3IKMA 3A0IX 4N41A 4JKCA 5AQUA 4E3SA 2XY5A 2NZTA 5TKYA 4E89A 1WBDA 2O8FB 4UQGA 1K8KB 4CZHA 1LCUA 3ZT3A 4DTMA 3NDKA 3DLRA 4PY5A 3TAGA 1VSKA 2ASPA 5C42A 3VESA 2FSNA 4BDPA 3UE5A 3VQBA 3M1FA 2VCPA 4TSXA 2HNYA 4RCHA 1RNHA 4IDHA 3OYBA 1RFQA 5A2QO 3ITHA 3MN7A 3SQ2A 1K6YA 1IH7A 1KQSM 2W42A 3CFRA 1BHLA 4YY3K 2KTQA 1SL0A 4FJ7A 3NF7A 3D0PA 1CZ9A 3I8BA 4DSLA 4FJNA 1J5OA 1HKCA 2KFNA 3CC7N 4RWTA 4DR2K 3NVKA 4JI6K 1U4BA 4R79A 2FLOA 4FM1A 3S41A 1D9DA 4LF8K 4IFEA 3EKUA 4Q5VA 2VWJA 5BRHA 4W5TA 1XQSC 4B1XB 4FWNA 4CZLA 3S5TA 4BGAA 1KAZA 5BPMA 4B3OA 3HM9A 1LAWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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