5AFUA

Cryo-em structure of dynein tail-dynactin-bicd2n complex
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
b'IANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGPKAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKEQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKNRERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSIMRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQYYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFSNIVLSGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIRISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKMWVSKKEYEEDGARSIHRKTF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Structure of the Dynactin Complex and its Interaction with Dynein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DYNEIN TAIL
molecule tags Motor protein
total genus 85
structure length 370
sequence length 370
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, I
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5afuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5afuA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5afuA03
3QFPA 5B8HA 4BR0A 4H0VB 3AY9A 2P9LB 2VCPA 5BN9A 4WQ5A 3BP8A 5KPZA 2V7ZA 4BG9A 4QS7A 2YHXA 4WQ5C 2YCHA 4B1WB 4K43A 3UE5A 4K42A 3FLCO 4QS8A 3EO3A 1OKJA 2P9PA 4A61A 3UKRB 4K41A 3EN9A 3LDNA 1C0FA 1RDWX 3DXKB 3O1BA 3D2EB 1JCGA 2IVPA 2BUPA 1NGGA 3KHYA 4FSVA 1HKGA 3VGKA 1GLDG 2WUSA 3D2FA 1ESVA 4FWPA 5KQ8A 2Q1NA 4PKHA 4RCHA 5JLFA 2QM1A 3QBWA 1NGAA 1RGIA 2W41A 2QWOA 3LDOA 2PAVA 4CBXA 3CJ7A 3FZFA 3CETA 2ITMA 1YVNA 3WXLA 4DB3A 4PKGA 4IWVA 2E1YA 3MDQA 2P9UB 1WUAA 3D7EO 4B1ZA 3MN7A 4CZFA 3HSCA 4XH1A 4BQZA 1XQSC 4MLEA 1LCUA 3A8YA 4H0YB 1NMDA 3EKSA 3ID8A 3WEEB 5EX5A 3I33A 4BC3A 3SJHA 3UKUB 1NGIA 2YHYA 5AZIA 1QQMA 5AQHA 2QW9A 4M7XA 4BRNA 1DEJA 4H0TB 3VETA 4BGBA 5AQMA 1RFQA 4B1YB 1DKGD 4EAHD 4CZEA 3MN6A 3O1WA 4BR7A 4BREA 3IUCA 4EIAA 5BR9A 5AQLA 2A42A 1U2VA 1SZ2A 5AQJA 3AAQA 4H5WA 4IXCA 3U8XA 4CJ7A 4B1UB 4FPBA 5AQWA 3HM8A 3GBTA 4ISGA 2FSJA 3H6EA 2ZGZA 1ZC6A 4FWMA 5AQVA 5FPMA 2P9LA 3ZX3A 4BRLA 4AM7A 2OANA 1HUXA 2ZF5O 4IO8A 2CGKA 3CJBA 2A41A 3F9MA 1EQYA 2FXUA 1MWKA 1KAYA 4H03B 4JD2B 2I7PA 4BGAA 4FL9A 3ZETB 5AQIA 1Z6RA 2HF4A 4I6MA 3UKRA 1HJOA 3H45C 4CZKA 3DAWA 4GY2B 5BRHA 3U9ZA 1GLFO 3O5BA 3D2EA 1GLEG 3ZEUB 1GLJO 2GTDA 1Q18A 5EOYA 3VOVA 1U6ZA 4IJNA 4DHYA 3H3NO 1E4GT 3W0LA 2HF3A 5AZJA 3ULEA 1V4SA 4DCHA 3ENHA 3FGUA 1C0GA 2FSNA 4JN4A 2QWQA 5EY4A 4MLHA 4PL8A 3TU5A 5AQXA 3HI0A 4XH5A 2Q36A 1ZXOA 3VERA 1XC3A 3CERA 4GNIA 4BRPA 4M63C 5LY3A 3J8AA 2QXLA 5KPTA 2V7YA 1K8KB 3HZ6A 2HOEA 4CZGA 5F0XA 2ZWHA 3WEEA 3M3ZA 3P4IA 3UKUA 4JAXA 3WXIA 2P9KB 3VENA 1YXQA 3FZKA 5BN8A 4BC5A 4E1JA 2ASMA 3KZBA 1BG3A 3KVGA 4EHTA 5TKYA 3CI5A 4H5TA 3HTVA 3RSEA 2QWRA 1SQKA 1TYQA 5ADXH 5LJWA 3VF6A 4Z94A 4B1XB 4O5FA 3O80A 3LDQA 5AR0A 1KXPA 5AQSA 4FWOA 1JCEA 3VEVA 2QWNA 3IDHA 3JXUA 3SMPA 2Q31A 2E8AA 5BPMA 5ELZA 2GEMA 4XH4A 5CE3A 2VWBA 1X9JA 3ZETA 3OHRA 2A40A 2GELA 2J4RA 1NGHA 2KHOA 2GWJA 3GG4A 3QBXA 1X3NA 1BWFO 2E88A 1HKCA 1ZBSA 2A5XA 1BA1A 2D4WA 1MWMA 1QQOA 3L0QA 1Y64A 2Q97A 3FE1A 3GE1A 3VGMA 4CZMA 5KQDA 3H1VX 4WQ4A 3BEXA 1NGDA 5BRDA 5F2RA 4DQ8A 4IJAA 4BRGA 4WQ4C 4A2AA 4CBWA 1YUWA 4HTLA 1GLLO 2YI1A 2NZTA 2IVOA 3FR0A 3L4IA 4CD1A 2FF6A 3WQTA 5JICA 3ENOA 2P9NB 1CZAN 2E2PA 3DJCA 2AA4A 3FZMA 5AFUH 2QWLA 4H5NA 1T6CA 3O8MA 3CQXA 3H1QA 3VESA 3UB5A 1J6ZA 1LOTB 2P9KA 3U9DA 5AQOA 3M6GA 4ISEA 2EWSA 3MMVA 4BVPA 4NO7A 2P9PB 4CZIA 2ASPA 5EXWA 4BR2A 3GL1A 2E2QA 1TUUA 4H0XB 3FZLA 4HWIA 3MN5A 4RTFD 4JHDB 3VGLA 3GDQA 2V52B 4BRQA 3DXKA 5AQPA 4L3QA 2VYPA 1DGKN 3ZX0A 3C7NB 4FO0A 2FSKA 2F9TA 1S22A 3MN9A 5AQNA 1ATSA 1NGBA 4B1VA 3BUZB 3R8EA 1GLCG 1MA9B 2PBDA 4XEIA 1BDGA 3A5NC 4FPAA 5AQRA 1TUYA 2BTFA 3QB0A 5AQFA 2QWPA 2FF3B 4RWTA 1HPMA 2P9UA 3VEZA 4BRIA 2E1ZA 3ZX2A 2ASOA 4F9OA 3HBTA 5FPNA 3VEXA 3AARA 2Q0RA 4PKIA 5AQGA 5EVZA 1JCFA 5AQTA 3CQYA 2E20A 1H1VA 1YAGA 3WQUA 3O08A 5AZIB 3FZHA 1NGCA 3EKUA 3ATUA 4BC4A 3WXKA 4BROA 3VEWA 1Z05A 2CGJA 4FWKA 4YDUA 1QHAA 1QQNA 4PL7A 3WUHA 2F9WA 1HKBA 4H5VA 1BUPA 1NGJA 4YDUC 1BOTO 4AM6A 1BU6O 1IJJA 1NLVA 5KPRA 4BRCA 1X3MA 2P9NA 3SLCA 3G25A 2CGLA 5AQQA 2A6AA 2GUPA 5BRFA 4J8FA 2YHWA 2DPNA 3QICA 3AAPA 2P9IB 2W40A 3I8BA 3WXJA 1ATRA 2Q0UA 3CJ1A 4CZHA 4I6MB 2P9SB 5BREA 3A5MC 4JD2A 3QFUA 4KBOA 3GOIA 1P8ZA 4BRMA 1NBWA 4C23A 4MO5A 4JHDA 3SMSA 3MK6A 1T44A 3O6WA 3QMLA 3M1FA 4CZJA 4H0OA 4BRDA 4EFHA 1WOQA 3DXMB 4NB4A 3C7NA 3FFKB 3ZEUA 5AZJB 3LM2A 4WYBA 3ULEB 4FWNA 2D0OA 1S3XA 3EL2A 1NWKA 2Q2RA 4CD3A 5FPDA 4IZ9A 4FOIA 3C0BA 1D4XA 2NRHA 4K25A 5E26A 1QZ6A 3S41A 3CJ9A 1R59O 3LDLA 3CHWA 4CI6A 3A5OC 3H46O 1GLBG 3BF3A 1V4TA 3IFRA 3VF4A 1K8KA 2CH5A 3TPQA 4EHUA 3ATVA 1HLUA 3VPZA 2AP1A 5I9EB 1XUPO 5ADXA 2D1KA 4CBUA 4A62A 2YJEA 1ATNA 3CIPA 5E84A 4BRFA 2IIRA 4FOEA 2H3GX 1HX1A 4CZLA 3R6MA 3B8AX 4ISFA 5AQUA 5FPEA 3SK3A 3RSEB 1BA0A 3DWLA 4MO4A 3LM9A 1TYQB 4FWLA 3U4LA 4BRHA 3CJAA 2CH6A 2NLXA 4QS9A 4BQLA 5JLHA 2UYTA 2YJFA 1BO5O 1MDUB 3D2FB 3MCPA 5AQZA 4H0PA 3A0IX 4LC9B 4B9QA 2ZGYA 1NM1A 4BR5A 1NGFA 2P9IA 1T6DA 4O8KA 2D0PA 2IVNA 3A5LC 3VEOA 2QWMA 4FWRA 5BPNA 2P9SA 1QZ5A 5AQKA 2E2OA 3LL3A 4H5RA 3BF1A 5AQYA 3VEYA 1KAXA 4FWSA 3WT0A 4M7YA 4BC2A 2HMPA 3L6QA 5LJVA 1SAZA 4BG8A 3W3DA 4BRKA 2GWKA 3DXMA 1NGEA 4JNEA 3QDKA 3LDPA 1KAZA 3R9PA 2A3ZA 3JS6A 2FLOA 5BPLA 4FWQA 4BRAA 1IG8A 2V51B 4BR9A 3CJCA 2E2NA 4BR4A 4BVOA 3VF2A 5AFUA 4Y0WA 3IMXA 1GLAG 3EZWA 4A2BA 1U2VB 1E4FT 1G99A 3H3OB 5F1XA 2I7NA 3O4WA 5JMVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3P5JA 4F2RA 4DLEA 4AH9A 2P9LB 3QETA 3DLKA 3MCAB 4DSLA 2V7ZA 4BG9A 3N4PA 2YHXA 4KKOA 3AVNA 4NCBA 2IAJA 2EHGA 2JWLA 3PUFA 4K42A 4OPAA 3VQEA 4QS8A 3SQ2A 4E7LA 3KLFA 4A61A 3LDNA 1S1VA 3VQDA 4OVLA 3AVIA 1BIUA 1LWCA 1RBSA 4KH6A 1Q7YO 1CXUA 1HKGA 1NK5A 4FLTA 1GLDG 3F2KA 3NE6A 1HRHA 4FWPA 4JI1K 4DR1K 4E7IA 4IFEA 5E41A 1L5UA 5JLFA 1VQ8N 3VN5A 3TTDA 1K8AO 2W41A 2PAVA 2HW3A 3CJ7A 3CC7N 1YI2N 3PSIA 4IWVA 3DOLA 2X78A 3KD1E 1X9SA 5DMRA 5JS1A 3T69A 4CZFA 4FCYA 1RT5A 3CCMN 4XH1A 4HHTA 4MLEA 1LCUA 4B9MA 4H0YB 3T1AA 3ID8A 3THXA 4I2QA 1JKHA 1TKTA 2YHYA 4W5NA 2O4GA 1JXEA 1WAJA 2E6LA 3ZLJA 4M7XA 4H0TB 3VETA 2P1JA 5AQMA 1RFQA 4B1YB 3AO1A 4CZEA 3MN6A 4BR7A 4E7KA 4CJ3A 5AJ3K 1J5EK 4KTQA 5HROA 3KLHA 5BR9A 5HBMA 4IXCA 4CJ7A 2E5LK 3HM8A 2FSJA 4DR5K 5I42A 1ZC6A 3K59A 3ZX3A 3CC2N 1NK9A 3IAYA 1HUXA 3OYKA 5JS2A 1X9WA 2ZF5O 3KK1A 3F9MA 2ITGA 1EQYA 1NJIO 2I5JA 1KAYA 4JD2B 2BH1A 4FL9A 4DR4K 4ELUA 1W7AA 1W0HA 1W9HA 3UKRA 2KQ2A 2YHAA 5HLFA 4LF7K 5BRHA 3U9ZA 3OJSA 1GLFO 3L2QA 2Z1HA 2KFNA 1GLJO 1Q18A 4DSFA 4IJNA 3G0ZA 3H3NO 1N33K 1E4GT 1ZBIA 3SBGA 1V4SA 3TARA 4CJWA 4JN4A 2QWQA 5GAGP 4CJVA 1NK4A 4PL8A 1NK6A 3TU5A 4AF1A 2Y1JA 4LFBK 1XC3A 4GNIA 5JENA 4GW6A 3J8AA 1IO2A 4CHQA 4PY5A 1C1BA 1OVQA 2HOEA 3ZT2A 5F0XA 2ZWHA 3VMFB 1NJZA 4JAXA 4O44A 3WXIA 1TVRA 4NCGA 3L8BA 1UAXA 2RPIA 3CCRN 1FKOA 4QAGA 3ASMA 1BI4A 3Q7CA 2QWRA 1BIZA 2VWJA 5ADXH 3SBTA 3E9OA 4B1XB 4I2PA 3LDQA 4GV9A 1ZBLA 3PX0A 5AQSA 4B9VA 2Y1IA 1TGOA 1I3AA 3VEVA 4FK2A 4CJUA 4YY3K 3MEEA 4DU1A 4X66K 1TKXA 2QWNA 3HRGA 3SMPA 2KZMA 2KFZA 3OYNA 2ZJPL 1FW6A 1KLNA 4JI2K 1NGHA 3QBXA 4CJFA 1EWRA 3TAMA 3VQ8A 1BA1A 4I9QA 1MWMA 1P90A 3VQ4A 4UY8O 1EO1A 5J1EA 3THYB 3PV8A 2YNIA 3VGMA 3TWHA 5LMNK 1RCHA 4BRGA 4G1QA 2DTUA 1YUWA 1XHZA 1IKXA 3E1YA 1E3MA 2YI1A 2GBZA 2NZTA 1LV5A 4DR3K 1NMNA 5DK5A 3ENOA 1RT3A 2P9NB 4LY7A 3JAMO 3U6FA 3VQAA 4DWIA 4BE0A 4B9UA 3L2VA 4B9LA 5AQOA 3L2UA 3AVJA 1N34K 5EXWA 1M1KO 4ELTA 3MN5A 4RTFD 2OPQA 1JLCA 3DYAA 4JI4K 2HHUA 1S22A 3PX6A 2LSNA 3BUZB 4B08A 4BE7B 1GLCG 3C6HA 4CGJA 4LH5A 1IBKK 1S6QA 3QEVA 2PZSA 4FPAA 2BTFA 1T8EA 3NF8A 4CHOA 4YHHK 2DFFA 1RTJA 4B9TA 1HPMA 1Q9XA 3NF9A 3VEZA 4ILGB 1WSJA 3T7ZA 4F9OA 3HBTA 1NK8A 3V1OA 3AARA 2Q0RA 4PKIA 3NHGA 4JKGA 1JCFA 5AQTA 1Q82O 4FJ9A 3HK2A 3WQUA 3ZCMA 3O08A 5AZIB 4W5OA 3FZHA 4M41A 3V9UA 4BC4A 4BROA 2BGGA 3V9ZA 4FWKA 4ILHA 1QE1A 3P83D 2OYQA 4M3UA 5M1OA 4MQ3A 4FZXC 1NGJA 4YDUC 2ZM6K 2HHHK 3K9KA 1YJ9N 3LWLA 3G25A 1OH5A 4OPKA 1B9FA 2DY4A 2XY6A 4KB1A 1LW0A 2GUPA 5GADP 1EWQA 2RF2A 3LAMA 3ZSZA 1BQNA 2NRRA 3HP6A 3AVLA 2RN2A 2P51A 4JD2A 3FFIA 2YV0X 4WFAL 1P8ZA 4BRMA 1NBWA 5KGWA 3SMSA 1JLAA 3O6WA 5CYQA 4HUGA 4CJ5A 4EFHA 3C7NA 3FFKB 1IKWA 4J2DA 3LM2A 4WYBA 3ULEB 4KHSA 3EL2A 1U47A 4ELVA 4B3OA 1WSEA 5FPDA 5C42A 4LSNA 3C0BA 5KI6A 3HO1A 1W2BM 1S5JA 3S41A 1LAVA 4Z4CA 3AVMA 2DFHA 3O9SA 2OA8A 5HRSA 3AVCA 4CI6A 1Q81O 1LAWA 3AVFA 4DMNA 3WNHA 4J2BA 3VPZA 2AP1A 4B3MK 1IG9A 4H8KA 4ZHRA 2GX9A 4YOWA 5CHIA 1ZBFA 1UA1A 4AHVA 3B8AX 4ISFA 3RSEB 3DWLA 4MO4A 4FWLA 3U4LA 3EZ5A 5FRNA 4NLBA 2NLXA 4BQLA 2NRWA 2YJFA 1MDUB 4FJLA 2HHVA 3AVBA 5AQZA 1RDUA 4H0PA 4NCAA 4BACA 4RW9A 1VQNN 1UOCA 4F2SA 3O9TA 4TSXA 1SKSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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