5AFUH

Cryo-em structure of dynein tail-dynactin-bicd2n complex
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Structure of the Dynactin Complex and its Interaction with Dynein.
pubmed doi rcsb
molecule tags Motor protein
molecule keywords DYNEIN TAIL
total genus 92
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-01-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5afuH01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5afuH02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5afuH03
3CJ1A 3VETA 3H45C 4H0YB 4YDUA 1Y64A 3BP8A 3GE1A 4BC3A 4FPBA 4AM7A 2QWPA 5BRHA 1QQMA 2YHWA 3EKUA 2QWOA 1NGHA 3AY9A 4BR7A 4BR2A 3A5MC 3VGMA 3VPZA 3GBTA 3HTVA 1SZ2A 2GUPA 4CZMA 2Q97A 3SLCA 5AQXA 3SMPA 5AQLA 5KQ8A 3DJCA 1NGGA 3SMSA 3UKRB 3WQTA 4ISGA 4H0OA 1X9JA 3FR0A 4XEIA 1SQKA 4NB4A 1NGJA 3FZFA 3ZEUA 2FF6A 1NGEA 1V4TA 3R9PA 3GDQA 1TUUA 5FPNA 1BDGA 1WUAA 4Y0WA 3ZETA 4CZHA 4EAHD 2YHYA 2A40A 3AAQA 1ATRA 1NBWA 1JCGA 4IO8A 4CD1A 2E8AA 2UYTA 4ISEA 2ITMA 3B8AX 1IG8A 2I7NA 4HWIA 4BRIA 1MA9B 2FXUA 3KVGA 3WXKA 4A2BA 4K43A 2IVOA 4NO7A 5LJWA 3RSEA 5AZJA 3CJ7A 4H0VB 4JAXA 4BR0A 3VEWA 3ZX0A 4J8FA 3VF4A 5BN8A 3OHRA 2PAVA 2YI1A 4EIAA 3DXKA 1OKJA 1T6DA 3H1VX 3QBXA 1S3XA 3BF3A 1RFQA 1ZBSA 5AQIA 1C0GA 3M1FA 3GOIA 3WEEB 3MN9A 2P9LA 3BF1A 3QMLA 1U2VA 2A42A 1Z6RA 4XH5A 2GWKA 1GLBG 2P9PB 2HOEA 4FWQA 2P9SA 4BRLA 3WEEA 2F9WA 1NGDA 5AFUH 5AQRA 3DXMB 5I9EB 2BUPA 5EXWA 4B9QA 3I33A 3JXUA 1NGCA 3HSCA 3CJAA 3UKUB 4BC4A 4FPAA 4KBOA 4K42A 4IXCA 4H5TA 1BWFO 5AQTA 2Q0UA 5FPMA 4B1ZA 5BR9A 1U6ZA 3VENA 2Q1NA 5ELZA 3CETA 4QS7A 2P9UA 2W41A 3WXJA 5AQHA 5JLFA 4BR5A 2YJEA 1XUPO 2DPNA 2KHOA 2A41A 2J4RA 5EOYA 2HF4A 4FWKA 3ENOA 2D1KA 4YDUC 3S41A 3WT0A 3WXIA 1DEJA 2VCPA 3VEVA 1HJOA 2E2OA 4B1YB 1BUPA 1HKBA 3GG4A 3MN5A 3O80A 2E1YA 4XH1A 4FWPA 3H46O 4H5NA 4MO5A 3U8XA 4JHDB 1J6ZA 4M7XA 3LDNA 3CERA 4B1WB 5BRDA 2H3GX 3WUHA 5AZIB 2E1ZA 5AQPA 2VWBA 3ZEUB 4K25A 5AQKA 4BREA 4FWLA 5JMVA 5AQGA 2NZTA 1Z05A 3ENHA 3O08A 1V4SA 1XC3A 4BRHA 5AQZA 3R8EA 2CH6A 3U9ZA 2A5XA 1GLAG 2ZWHA 4C23A 1LCUA 3P4IA 3AARA 4BR9A 3LL3A 1S22A 3MDQA 3HBTA 1LOTB 3DWLA 1E4FT 4A2AA 3LM9A 4IJAA 2I7PA 3FZMA 1ESVA 5FPDA 4WQ4A 2A6AA 3QB0A 4JD2B 4BRAA 4CJ7A 2ZGYA 4O8KA 3QBWA 4IZ9A 5CE3A 4BRKA 4A62A 1G99A 4BVPA 2GELA 3ATUA 3HI0A 1H1VA 3H3OB 3I8BA 5EVZA 5JLHA 2IVNA 3SJHA 3CJCA 3BUZB 2F9TA 1IJJA 3ULEB 1NGIA 2AP1A 4GNIA 3UB5A 1GLFO 3ULEA 3D2EB 3ZETB 1ATNA 2CH5A 5KQDA 1ZC6A 2D0OA 3L4IA 4H0XB 5AR0A 5EX5A 5AQFA 2QWLA 3D2EA 4BQZA 4BGBA 5FPEA 2FSKA 3M3ZA 4QS8A 2QWNA 1BA1A 5AQYA 2QWMA 1QHAA 3EL2A 3C7NA 3A5OC 1K8KA 4QS9A 4CZFA 2D4WA 2FSNA 1MWKA 1TYQB 3A8YA 5AZIA 3RSEB 4BRFA 3EN9A 3VF6A 4MO4A 5ADXH 3IMXA 3VESA 5BPMA 1YXQA 1DGKN 3DXKB 1YUWA 2GTDA 1NGBA 2E2NA 1BU6O 1NM1A 4PKGA 1YAGA 2P9KA 4BRCA 4CD3A 1BOTO 2Q31A 4BRGA 1RGIA 4CZJA 5E84A 3JS6A 1CZAN 4M7YA 1TYQA 1T44A 1QQOA 3VEOA 4MLEA 3KZBA 4LC9B 1K8KB 4PKHA 4CZEA 2CGKA 2V51B 4BROA 1GLCG 3VEZA 1QZ6A 1Q18A 5AQJA 5BRFA 3FLCO 5AZJB 1RDWX 3EO3A 2V7YA 4FO0A 4JN4A 4MLHA 3ZX3A 1P8ZA 3CHWA 4CZGA 2FF3B 4CZKA 4O5FA 5AQWA 3A0IX 5JICA 2NLXA 1QQNA 3VGLA 1KXPA 3EKSA 4BGAA 1HUXA 4H5VA 2GEMA 4JHDA 5BPLA 3VERA 3L6QA 2P9LB 2BTFA 4H5RA 2P9NA 2A3ZA 4DQ8A 4CBUA 4WQ4C 3VGKA 2YHXA 2D0PA 3DXMA 1BG3A 1HPMA 3EZWA 2AA4A 2QW9A 3O5BA 3CQYA 4RCHA 2NRHA 3O1WA 5AQSA 1NWKA 4FWMA 2E2PA 3FZLA 2OANA 3D2FB 3H6EA 4F9OA 1U2VB 3MN6A 4I6MB 2ASOA 2WUSA 3VEYA 3ZX2A 2YCHA 3CIPA 4ISFA 4K41A 3R6MA 5LJVA 2Q2RA 3O1BA 4CZIA 3CI5A 1GLLO 5TKYA 2FLOA 1HKCA 4WYBA 2Q36A 3MMVA 2E88A 1GLDG 2QXLA 3QFPA 4BRNA 3LM2A 3H3NO 3UE5A 4PKIA 4B1XB 3LDQA 5AQMA 1XQSC 4FL9A 4Z94A 1D4XA 1GLJO 2ZF5O 5BN9A 3BEXA 5F0XA 3W3DA 3O4WA 4BVOA 2ASPA 4A61A 4FWRA 3L0QA 4BG8A 3HZ6A 5LY3A 1BA0A 1HKGA 3ATVA 3VOVA 3CQXA 3CJBA 5KPRA 4EHUA 5AQQA 2W40A 4DCHA 2P9NB 3F9MA 3A5LC 4CBWA 5KPTA 4H0TB 3MK6A 2V7ZA 4H03B 3SK3A 3WQUA 5E26A 4BQLA 3UKRA 1ZXOA 3MCPA 2CGJA 4FWOA 3CJ9A 3FZKA 3KHYA 4RTFD 3TPQA 5B8HA 3J8AA 3DAWA 4CBXA 3IFRA 4M63C 4BC2A 1JCFA 5AFUA 4WQ5C 3GL1A 2FSJA 3FE1A 3D7EO 1HLUA 1YVNA 1T6CA 2VYPA 3O8MA 3FZHA 4JNEA 5EY4A 4FWNA 4RWTA 4WQ5A 4I6MA 4BRQA 2EWSA 4PL7A 3FGUA 3LDOA 3QDKA 4H0PA 1TUYA 4CI6A 3C7NB 5KPZA 4IJNA 1NMDA 3FFKB 2HMPA 1QZ5A 3A5NC 3HM8A 1WOQA 2ASMA 5AQUA 5ADXA 1X3MA 1KAYA 3MN7A 1GLEG 4BR4A 2CGLA 3M6GA 4BG9A 4BRDA 3QICA 1KAZA 1MWMA 4CZLA 5BPNA 4PL8A 2P9UB 1DKGD 4FOEA 3G25A 5F1XA 1ATSA 4BRMA 4FOIA 2P9IB 1HX1A 4HTLA 2P9IA 4E1JA 4EFHA 2PBDA 4FWSA 3O6WA 5BREA 3LDPA 4FSVA 4BRPA 3U4LA 4EHTA 1NGAA 3LDLA 2QWQA 4GY2B 3ID8A 3IDHA 2IIRA 2Q0RA 1X3NA 2QM1A 3H1QA 3IUCA 5AQNA 4H5WA 4B1UB 3UKUA 4IWVA 1MDUB 3AAPA 2GWJA 2HF3A 3VF2A 3WXLA 1NLVA 4B1VA 1JCEA 2IVPA 2P9SB 4BC5A 4DHYA 2QWRA 1R59O 2P9PA 3QFUA 2P9KB 3C0BA 3TU5A 5AQOA 4JD2A 2E2QA 2E20A 4L3QA 1NGFA 3W0LA 3D2FA 2ZGZA 1C0FA 3U9DA 4DB3A 4AM6A 1SAZA 1BO5O 2YJFA 3VEXA 1E4GT 5F2RA 4XH4A 5AQVA 1KAXA 1EQYA 2V52B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CJ1A 4YDUA 3D0PA 2DY4A 4KV8A 3KK7A 4AM7A 3HOTA 1IO2A 3VQPA 2YHWA 4CJ5A 4L8RB 1U04A 4F3OA 1HNZK 3NVKA 1W97L 3VGMA 4NCBA 4CZMA 4KHUA 1KFSA 5AQLA 2AJQA 3WQTA 1VQPN 4CIFA 3OBYA 1N8RO 2PY5A 3FR0A 1WSEA 3KLFA 4OPAA 1NGJA 1NK4A 2FF6A 4M3ZA 4JK9A 4CF0A 3SAFA 3DLRA 3GDQA 2OYQA 3ALYA 1TUUA 5FPNA 4CFCA 2G8WA 1NOYA 4ZTFA 4FM1A 3PX6A 3VA3A 4JI0K 1LWCA 4JKBA 4CJRA 4CD1A 3HM9A 4M45A 3AGRA 3EY1A 4E19A 1L3SA 4J2DA 2XY7A 1X9SA 3WXKA 1RBSA 4A2BA 2IVOA 3RSEA 3OYIA 1N5YA 4DR3K 4YOVA 1NG9A 3KTQA 4BR0A 2NRRA 4DUZK 3SQ4A 3OHRA 4CFAA 4LF4K 4JEPA 1OKJA 1T6DA 4NCGA 1C1AA 1S3XA 1C0GA 4LF8K 1S9GA 3CCRN 3BF1A 1U2VA 4XH5A 1Z6RA 2GWKA 2O8FA 1REVA 4FWQA 4YOTA 2VQFK 1W7AA 4EP4A 3QNOA 1RT1A 1RCHA 4W5QA 2BUPA 4O55A 3CCVN 2EHGA 1JXBA 3J80O 3CJAA 3UKUB 4C8NA 3SQ1A 1BHLA 3QETA 1NOZA 2JLEA 2WONA 4K42A 4CIEA 5AQTA 4B1ZA 2Q0UA 4WCEL 1QSLA 1NK5A 2NRVA 4N41A 5ELZA 1EETA 3ZT4A 3OTOK 4KB0A 1QTMA 2E5LK 2HF4A 3ENOA 2D1KA 3WT0A 4DV4K 4F8RA 1DEJA 3VEVA 2IGIA 4BWMA 2YKMA 1HKBA 1NK7A 3O4QA 4JKGA 4FWPA 5J2PA 3SI6A 1UA0A 2Y1JA 5FROA 4JHDB 1J6ZA 2GX9A 3LDNA 4B1WB 3HOSA 3V9UA 4FK4A 3P31A 2D0BA 5FDLA 1Z05A 3ENHA 4JRPA 1XC3A 3L2RA 4DUYK 3BY5A 3AA4A 4KTQA 2A5XA 4CJVA 3THXB 1EP4A 3MDQA 5CZ2A 4CF2A 1LOTB 3LM9A 1YTUA 4IJAA 1K8AO 2I7PA 4E0DA 4JKCA 4JD2B 5SWMA 2ZGYA 2UXCK 2I5JA 3T3FA 2ITGA 3QBWA 1NMNA 1TKDA 3LANA 3OYHA 1C0MA 3QEPA 1G99A 3SAHA 2DFEA 3HI0A 3IS9A 3TAFA 5M1OA 3H3OB 1OH6A 3VN5A 3CJCA 3BUZB 3V9WA 4JK7A 4K0KK 3UB5A 1GLFO 3NBPA 5HL7L 3D2EB 3TTFA 4X66K 5KQDA 3QLHA 4H0XB 1WB9A 5KTQA 2QWLA 3O4NA 2F8SA 4HUGA 4IEIA 4BQZA 3Q7CA 4CGJA 3C65A 1BA1A 4ELVA 2P5GA 4XIUA 3EL2A 3I0RA 3MXMA 4YFUA 3DLHA 1HNWK 5HOOA 2FSNA 1MWKA 4C8LA 3RWUA 3RSEB 1LW2A 3VF6A 4BRFA 1SL2A 4MO4A 3LZJA 1WAFA 5ADXH 1A5VA 3IMXA 3VESA 2PYJA 1YXQA 1NGBA 1BU6O 2JWKA 1JLBA 3CCQN 2Z1HA 3R1XA 4PKGA 3O3HA 3SBTA 1LW0A 3OVNA 2NUBA 1JLQA 1S9EA 1HNXK 3OJSA 4CERA 4DTJA 1VQ9N 1BOTO 1WSJA 3OYGA 1X9MA 4KHWA 1RGIA 2A1SA 4EP5A 4WFAL 3PSIA 3OYKA 3RVCA 1TYQA 1T44A 1QQOA 1ASWA 5M1KA 5GAHP 4MLEA 4Q0BA 4PKHA 2HHHK 2CGKA 2V51B 4BROA 3KLIA 1GLCG 4QOZB 5AQJA 3K5MA 4ILGB 4DV7K 3ZSWA 4CF8A 3NDKA 3KWGA 1P8ZA 4CZGA 4MQ3A 4CZKA 4AH9A 4I9LA 3A0IX 3DRPA 1Q9YA 5JICA 3U3GA 1QQNA 3VGLA 1LAVA 4DF4A 4BGAA 3B6OA 3HO1A 4H5VA 5KI6A 4JHDA 3KD5E 1Z25A 5CZ1A 5AJ3K 4OKEA 2Y1IA 5C24A 4DQ8A 4NYNA 4WQ4C 3SQ0A 2YHXA 1JLCA 4ID5A 5FLXO 3NAEA 4CJ4A 3DXMA 1NKEA 3EZWA 2QW9A 2OTLN 2HHIA 1RTIA 2IDOA 4J2EA 2NRHA 1BI4B 3OYAA 5AQSA 1NWKA 1IKXA 4AHVA 3D45A 1YJ9N 4FK0A 4B9TA 1NJIO 3EZ5A 3D2FB 3C95A 1U2VB 3TAGA 4I6MB 2ASOA 2WUSA 4LF7K 2QKBA 3DLKA 3ZYYX 1RBRA 5TKYA 4LSLA 3L8BA 4CHYA 3PIPL 2QXLA 3V1QA 2GV9A 3LM2A 3QEIA 2ZQBA 4B1XB 1XQSC 4CEZA 1IBKK 1D4XA 3OYNA 5H1SQ 1GLJO 1XI1A 5K14A 3PO5A 3W3DA 3NF8A 4BE1A 1T03A 2XY6A 1HKGA 3VOVA 3CJBA 3PLAA 1CZ9A 4EHUA 4JKGB 3KD1E 4DTOA 3A5LC 5D3GA 4F2SA 4DMNA 5KPTA 4H0TB 3MK6A 4H03B 1OVQA 4H8KA 3OBWA 5E26A 2E6MA 3TAMA 2O8BB 1ZXOA 4O8UA 3TPQA 3CPWM 3THWB 2HHSA 3TTCA 3J8AA 4M63C 4FJIA 2HVIA 4IFVA 4KI6A 5AFUA 3GL1A 4UQGA 4FLTA 4DSLA 1YVNA 1VQON 4RWTA 3FZHA 4CJ3A 3PO4A 3KLHA 3VQCA 3K9JA 5GIPA 4H0PA 1TUYA 1EKEA 3SUPA 3C7NB 4IJNA 4O44A 4FZYA 3FFKB 3A5NC 1NK8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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