5AFUH

Cryo-em structure of dynein tail-dynactin-bicd2n complex
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
b'AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Structure of the Dynactin Complex and its Interaction with Dynein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DYNEIN TAIL
molecule tags Motor protein
total genus 92
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-01-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5afuH01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5afuH02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5afuH03
4F9OA 1BUPA 4PKIA 3GG4A 2YJEA 4FWRA 1WUAA 4JAXA 1JCEA 2V51B 3W3DA 2GEMA 2P9KB 5BN8A 1XQSC 1ATNA 4A2AA 2E1YA 2P9UB 5AR0A 5AQNA 3R8EA 4CD1A 3HI0A 4EHTA 1HKCA 3ULEA 4BR2A 3VPZA 3CIPA 2ZGYA 1YXQA 1ZXOA 3A5LC 2FF3B 2E88A 3UKUA 2Q36A 1TYQB 3CJ9A 3GL1A 3MN5A 4JN4A 3VGLA 2HF4A 1U2VA 1NGIA 2DPNA 3ZEUA 1NM1A 3FZKA 5BRDA 1OKJA 4K41A 4BQZA 3HSCA 1YAGA 2FSNA 1Q18A 3DXMB 4EAHD 4BR4A 3LDNA 4MO5A 3FR0A 3GBTA 3I33A 4RCHA 1NGBA 5F0XA 4CZHA 1H1VA 4FWKA 4FWPA 3LDOA 3CJ1A 3H6EA 2E2NA 3MN6A 4XH4A 3RSEA 1QZ5A 3IMXA 3L0QA 4BRAA 1HUXA 2P9PB 4BGBA 2ASOA 2P9LB 3O08A 3VESA 3BUZB 5BRFA 1GLJO 3VF4A 2GTDA 2QWRA 2YHWA 3D2EB 5F2RA 4A2BA 3AARA 4BREA 3VGKA 1R59O 3H1VX 2ZGZA 4H03B 2A42A 2P9NB 2QM1A 4JNEA 5JMVA 2Q31A 5AZIB 2IIRA 3H3NO 4GY2B 4CI6A 1LOTB 1EQYA 2D0PA 1JCFA 2FSJA 2HOEA 3U9ZA 4BC4A 1HKGA 2Q0RA 3VGMA 4BRPA 1IG8A 4FWSA 1GLEG 1QQMA 2Q97A 3VOVA 2ZWHA 4B1ZA 3UE5A 2W40A 2YCHA 3FGUA 1U6ZA 1JCGA 2P9IB 2KHOA 3HM8A 4CZLA 1RDWX 3JS6A 1Z05A 3D2FA 3GDQA 3MDQA 5AQQA 4BRNA 4RTFD 4FOIA 1K8KB 4BVPA 3WUHA 1X3MA 2VCPA 4BRDA 4CBUA 3IUCA 3LDQA 5TKYA 4LC9B 1BG3A 3P4IA 3KZBA 4QS7A 1GLFO 4H5WA 2ASMA 5ELZA 1TUUA 1KAXA 1NGJA 1C0GA 1MA9B 4B1WB 2NZTA 5BPLA 1QZ6A 4YDUC 1GLDG 2YHYA 3CQXA 3SMSA 2E20A 3U9DA 3BF3A 1KAYA 5AQGA 4BG9A 2A41A 1XC3A 3FE1A 3A5NC 3WXLA 1S3XA 4J8FA 3WQUA 3ENOA 2QWLA 1MWMA 3S41A 4M7XA 5AQJA 2V52B 5CE3A 3IFRA 5JICA 4CZFA 4WQ5C 1HX1A 3LL3A 4H0YB 3A0IX 5EVZA 3C7NB 4B1XB 3CERA 5AQTA 3EO3A 1U2VB 3ZEUB 3FZFA 3A5MC 3HZ6A 1NGEA 4B9QA 3GOIA 3IDHA 3ZETB 4H5NA 4QS8A 4AM6A 2CH6A 1D4XA 2HF3A 4ISGA 1TUYA 3EL2A 4BRMA 5LJWA 4H5RA 3U8XA 3LDPA 3SMPA 1NGGA 4BVOA 3O8MA 2P9UA 2E1ZA 2QWQA 5KQDA 1LCUA 3VF2A 3BEXA 1G99A 2PBDA 1QHAA 2FLOA 2CH5A 2A3ZA 3R6MA 1HJOA 3RSEB 3BF1A 5AQWA 3H3OB 1TYQA 2Q0UA 2V7YA 4XH1A 3WT0A 4IWVA 3VETA 2F9WA 3TPQA 3HBTA 2W41A 4BC2A 2ASPA 4EHUA 1V4SA 3MN7A 3J8AA 2GELA 4FWMA 4ISFA 2GWKA 4CZMA 4ISEA 3VEYA 4CJ7A 1E4FT 3G25A 1DKGD 2WUSA 4I6MA 1BDGA 4BG8A 5LJVA 2PAVA 3CI5A 5KQ8A 3O1BA 3JXUA 2AA4A 1DGKN 4FWNA 5AZJA 3CJAA 4FWLA 3QMLA 1HKBA 1ATSA 3CHWA 5BREA 4EFHA 1T6DA 3SK3A 5AQFA 2P9PA 2QW9A 3KHYA 3U4LA 2P9LA 3ID8A 1SAZA 2Q1NA 3HTVA 1DEJA 5E26A 1NWKA 4A62A 3H1QA 4FPAA 4E1JA 4IZ9A 4MO4A 3O4WA 4HWIA 4QS9A 1NGDA 4CZEA 4DCHA 3O80A 4JHDA 1C0FA 4H0TB 4AM7A 2P9NA 3LM9A 5BN9A 3FZHA 4BRKA 4BR9A 2QWOA 5AQVA 1YVNA 3BP8A 3VEOA 2QWNA 1S22A 3WXIA 4BRHA 5ADXH 3DWLA 3F9MA 4WQ4A 3DXKA 4XH5A 2HMPA 3AY9A 1CZAN 2P9SB 1ATRA 4FOEA 4JD2A 1YUWA 4BR5A 5ADXA 2ITMA 2UYTA 4FWQA 2BTFA 4DHYA 5KPZA 4BGAA 1NGFA 3KVGA 4M7YA 2AP1A 3UKRA 4BROA 4GNIA 3H46O 3EKSA 3ZX3A 4FWOA 4NO7A 5E84A 5AQPA 1NMDA 3SJHA 3WEEA 4KBOA 4A61A 4BRIA 1NBWA 4H0VB 1X3NA 1K8KA 4FPBA 3CJCA 3FLCO 4WYBA 2IVNA 5AQRA 3ULEB 3QDKA 3R9PA 4Y0WA 3LDLA 3MN9A 4CD3A 2J4RA 2E2PA 4FL9A 4IJAA 5BPNA 1NGAA 3UKUB 5B8HA 3MMVA 4K43A 3EKUA 1ESVA 2NRHA 1BA1A 3VERA 4BRQA 2BUPA 2D1KA 2GUPA 1BA0A 3B8AX 2FF6A 3O5BA 1GLAG 3CETA 3QBXA 4IXCA 5AQSA 5JLHA 1J6ZA 1NGCA 4H0XB 5AFUH 1RGIA 2FXUA 4PL7A 2VWBA 5AQKA 3CJBA 3DAWA 2VYPA 3VF6A 5AQMA 3QBWA 4BR7A 2QWPA 5AFUA 2P9KA 3TU5A 4FO0A 2ZF5O 2V7ZA 5FPMA 5AQYA 3EN9A 4PL8A 3I8BA 2I7PA 1SZ2A 4BC3A 2H3GX 3C7NA 3VEWA 4C23A 4MLHA 4B1YB 4IJNA 3FZLA 4BRCA 1KAZA 1MDUB 3LM2A 5EOYA 3ZETA 1NLVA 1SQKA 2F9TA 4WQ4C 5KPRA 5EX5A 3GE1A 1QQOA 4MLEA 3QICA 4O5FA 3EZWA 1BU6O 3L6QA 4Z94A 1XUPO 1Y64A 1KXPA 4K25A 1E4GT 5AQOA 4B1UB 4I6MB 4M63C 1ZC6A 3DXMA 2IVPA 3WXKA 4BC5A 3QB0A 4CZGA 4IO8A 2CGKA 3H45C 2FSKA 1BWFO 3O1WA 5AZJB 4EIAA 1HLUA 2NLXA 1RFQA 2QXLA 1X9JA 3M3ZA 3L4IA 4YDUA 4O8KA 3ZX0A 2I7NA 4DB3A 4HTLA 4BR0A 1IJJA 5AQLA 4CBWA 4PKHA 4BRGA 1BO5O 3WQTA 4DQ8A 2A6AA 1GLLO 3OHRA 2A5XA 4WQ5A 4JHDB 4CBXA 3DJCA 3D2EA 5AQHA 4FSVA 1T44A 3A5OC 3MCPA 1P8ZA 2D4WA 3D2FB 2CGLA 4XEIA 1Z6RA 4BRFA 3VEZA 5KPTA 1MWKA 1T6CA 3CJ7A 4BRLA 5AZIA 4CZKA 1WOQA 3FZMA 3DXKB 5FPDA 5I9EB 4CZIA 3M6GA 1QQNA 2YJFA 4JD2B 3A8YA 4PKGA 4B1VA 3ZX2A 3MK6A 1BOTO 5FPEA 3M1FA 1NGHA 5AQZA 3UKRB 2A40A 4H0OA 3FFKB 5AQXA 3VENA 5EXWA 5LY3A 2Q2RA 2E8AA 1GLBG 1ZBSA 4H0PA 3WEEB 4BQLA 3AAQA 3C0BA 3WXJA 2E2OA 3ATUA 2P9IA 2IVOA 1GLCG 2CGJA 2YI1A 5AQIA 2E2QA 4RWTA 2QWMA 3QFPA 4H5TA 4L3QA 5BRHA 3O6WA 2GWJA 5AQUA 5F1XA 4NB4A 3UB5A 5JLFA 3CQYA 5FPNA 2YHXA 4H5VA 3ENHA 2EWSA 3QFUA 1HPMA 2D0OA 3W0LA 5BPMA 5BR9A 2P9SA 4CZJA 2OANA 3AAPA 3VEVA 1V4TA 3ATVA 3D7EO 4K42A 5EY4A 3SLCA 3VEXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4F8RA 4PKIA 3CM6A 4FWRA 4L8RB 1VQ6N 3DLGA 2V51B 3PIOL 5BN8A 1ATNA 4KHYA 5AR0A 4CD1A 3T1YK 4E0DA 4IEEA 4M41A 2XY6A 3VN5A 2OTLN 3HVRA 3PLAA 1ZXOA 5H1SQ 3DLBA 2NRXA 1S9GA 3AGKA 1TYQB 3MN5A 4JN4A 1KTQA 2W42A 3KTQA 4LF5K 4GV3A 4DR5K 1RT6A 1OKJA 2GBZA 3AVFA 1YAGA 4FJHA 4A57A 1Q18A 2UUCK 3DXMB 1BHLA 5JS2A 4BR4A 4NCAA 1Q82O 2X78A 3EY1A 1BI4B 3ZYYX 1VQPN 2KTQA 1S1UA 3LDOA 2XRIA 3CJ1A 3HSTB 3H6EA 2E2NA 2X74A 1KSPA 4U67L 4DR1K 3MN6A 1WBBA 2UXDK 1JLAA 5CHIA 3RSEA 1J5OA 1WSIA 3V9WA 4F2SA 3L0QA 1HUXA 1OH6A 2P9LB 2HHIA 3MX2A 1P90A 5BRFA 3D2EB 4BREA 3TTDA 3ZSQA 2ZE2A 4DV0K 1NOZA 1D9DA 4CJPA 3H1VX 3ZT4A 4NLCA 3DM2A 1VSFA 4E19A 4GY2B 1SS6A 3CFOA 2HOEA 2VG5A 1J9AA 3WXMB 4B3OA 3ID6A 1U47A 2Q0RA 3KWGA 1IG8A 1QQMA 1XC9A 4B1ZA 2HB5A 1LV5A 1N33K 3V1OA 2KHOA 4CCHA 4CZLA 3JS6A 4B9MA 1TKTA 1Y97A 3GDQA 5AQQA 3VTIA 4FOIA 4FZYA 2HVIA 4CJUA 1NJXA 3OYKA 4CBUA 2QI2A 3IUCA 3NH2A 3LDQA 1LW2A 4LC9B 1BG3A 4GVMA 4RW7A 5A2QO 2ASMA 1VAZA 4JK7A 1KAXA 1U4BA 3KIOA 2YNGA 3KK7A 5M1QA 5MLCQ 1C0GA 4CVNE 4FJIA 1HJRA 3SPZA 3BF3A 3ALYA 4HTUA 4BG9A 1QSLA 1XC3A 3THYB 3WXLA 1N32K 3WQUA 3SAHA 3ENOA 1MWMA 3AA2A 4C8NA 3QINA 3RWUA 2WOMA 5CE3A 5JICA 1NKBA 4WQ5C 4DR7K 1XHZA 1B92A 3CCMN 1Q8IA 4CIEA 2HBKA 3A0IX 3ZSRA 4NCBA 1ASWA 4KI6A 3CERA 3ZT0A 1MU2A 4YOTA 1U48A 1FW6A 3R1XA 3IDHA 2C1IA 4CJFA 4QS8A 2CH6A 4E7IA 4BRMA 5LJWA 1NU0A 2ZM6K 2NRRA 1NGGA 4NLBA 3MX5A 3SI6A 2E1ZA 1EWQA 3EEQA 1L3VA 1RTIA 4H4OA 3OYBA 2DFHA 2PBDA 3OS0A 1QHAA 5J2PA 2A3ZA 3BF1A 3P39A 1TYQA 3ULDA 2Q0UA 4B9SA 1NKCA 3HVTA 4DV4K 3SV4A 3AGRA 3NH0A 1L3TA 4UY8O 5AJ3K 3EZ5A 2GWKA 4DTPA 3HK2A 2GX9A 4O5BA 4CJQA 3G25A 2HBJA 3AVGA 1BI4A 3O1BA 5FROA 3OA9A 4DV2K 4CJEA 2LSNA 3HL8A 3I8DA 3QIPA 3OYIA 1N8RO 3U4LA 2P9LA 3ID8A 1XWLA 2Q1NA 1YJNN 3QO9A 1DEJA 1JXEA 5E26A 3DLRA 4A62A 3H1QA 2HMIA 3RRGA 3QETA 4ZTJA 4A59A 1VQ9N 1I39A 4CEZA 3O4WA 2YHAA 4KH4A 2QXFA 3V1QA 1FKOA 4H0TB 2QWOA 5AQVA 3F5TA 3S9HA 3BP8A 1S22A 2EHGA 3KKSA 4BRHA 4LFCK 3VMFB 5ADXH 1CZ9A 3ZCMA 4H8KA 2G8HA 2VWJA 2P9SB 4CIFA 4FOEA 2YV0X 3F2KA 4DU3A 3MXMA 5ADXA 5KPZA 4KREA 4BGAA 4HHTA 3UKRA 2AP1A 1XMQK 4GNIA 4IKFA 5E84A 4A5AA 4KBOA 3AVAA 4NXMK 1NK7A 1M1KO 1RT1A 3NVMA 4OGCA 5DM6L 3OTOK 4DTOA 4FPBA 1BIUA 5GAHP 1YTUA 3OYAA 5HLFA 2HBLA 1WSEA 4N5SA 2E2PA 3UKUB 3CPEA 3L2QA 3VQQA 1XHXA 1HNIA 1ESVA 3M5RA 5DM7L 5C2FA 3ZLJA 2GUPA 1RDCA 4IXCA 3O5BA 1GLAG 4B3RK 4H0XB 2FXUA 1FJGK 3AVKA 1DLOA 3DAWA 3KLGA 3THYA 3VF6A 3TABA 3LZIA 4DTMA 4DFMA 1OVQA 4FO0A 1U49A 5FPMA 4JI6K 1ZBHA 3V4IA 4FVUA 4BECA 4JS4A 1NJIO 3D0PA 4YOWA 3C6UA 3ZSVA 3THXB 3CF5L 2O8EB 2JGUA 1HYZA 3MECA 2OA8A 4GV9A 1HPZA 3NVKA 1KAZA 4HVJA 4J2EA 3GE1A 3L4QA 4AHSA 1SL2A 4BEBA 4O5FA 4Z94A 2UXCK 4KHWA 3QB0A 3OS2A 3TARA 3K58A 1R0AA 2YKMA 4IO8A 2NLXA 1RFQA 3M3ZA 1X9JA 3K57A 3HPOA 1SKRA 1LWFA 4DB3A 1NJZA 5JENA 3OJUA 4CK1A 4FM0A 4CBWA 5GADP 4GKKK 1IKYA 1BO5O 1RT5A 4DQ8A 3JYTA 2HVHA 2IS3A 4JHDB 3HO1A 1SKWA 1YJ9N 3AO5A 4FSVA 1T44A 3MCPA 1Z6RA 2WTUA 3RRHA 5KPTA 4B08A 4BWMA 1T6CA 3C6HA 2IGIA 1YI2N 4N76A 5AZIA 2ZJQL 4CF1A 1K73O 3FZMA 1A5XA 5C12A 5FPDA 3VTHA 4FJKA 2ETJA 2YJFA 3S3NA 1RNHA 3A8YA 2DFFA 4MQ3A 4JRQA 2G8UA 3CFRA 3LAKA 3MK6A 1VQNN 4HCBA 4CFAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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