5AFUH

Cryo-em structure of dynein tail-dynactin-bicd2n complex
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Motor protein
publication title The Structure of the Dynactin Complex and its Interaction with Dynein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DYNEIN TAIL
total genus 92
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-01-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5afuH01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5afuH02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5afuH03
1QQOA 3FGUA 2E2NA 4ISGA 3VEVA 2CGLA 3GE1A 3AAPA 4BRQA 3IUCA 5KPRA 3KVGA 4M7YA 3CERA 4CI6A 1GLAG 5AQOA 2F9WA 2ASMA 3JXUA 5AQSA 4RCHA 4BRLA 1BG3A 2GEMA 1Q18A 5FPEA 2ZF5O 4PKGA 4BGBA 5KPZA 1KAZA 2GWKA 3DXKA 3VENA 5AQTA 4BVPA 4H5NA 1HJOA 1T44A 3DXMA 2OANA 4M7XA 1RGIA 3WEEB 3GG4A 4HTLA 3FFKB 1GLCG 3C0BA 3SJHA 3O5BA 5AQLA 3LDQA 2Q0RA 4QS8A 3M3ZA 4BRFA 4HWIA 1JCGA 5AQVA 3M6GA 5AQJA 5AQNA 4FWQA 3AAQA 4FWSA 4J8FA 1K8KA 5EX5A 3VPZA 1Z6RA 3R9PA 2AP1A 1BUPA 2YHXA 3UKRB 5LY3A 2HF3A 4H0YB 4BG9A 3A5OC 3L0QA 3VOVA 5BRHA 4BRCA 2YJEA 1XC3A 3FZLA 1NGAA 2ASPA 1NGBA 2FSJA 3IDHA 4H5RA 4NB4A 3AY9A 5CE3A 4MO5A 3MN9A 4BREA 2A42A 2UYTA 4FWMA 1SQKA 5AQMA 4XH4A 1IJJA 4B1YB 3VEOA 1HPMA 1BA0A 5AQFA 1HX1A 4IZ9A 4MLEA 5BN8A 1X3MA 3SMSA 3H45C 4FPAA 4BR7A 1NGJA 4FWRA 5BN9A 2IVNA 4WQ4A 5FPMA 1JCFA 4Y0WA 2IVPA 4K42A 3CJAA 2P9PB 4FSVA 5KPTA 4GNIA 2QM1A 2QW9A 4WQ5C 3U9DA 4BRGA 1GLDG 3B8AX 2I7PA 4PL8A 4DQ8A 2IIRA 4BG8A 2E1YA 1LCUA 5AQWA 1ZXOA 3LDPA 3IFRA 3UKUB 5FPNA 3MCPA 3DWLA 3HM8A 1XQSC 2D4WA 3LL3A 1QZ5A 4FOEA 3ZETB 2VCPA 4EFHA 1BOTO 2YJFA 3D7EO 3M1FA 4BVOA 3H3OB 3MN5A 5AQIA 2Q31A 4LC9B 2VYPA 5KQDA 2P9UB 5LJWA 4BR5A 3UKRA 4K41A 4H5VA 5F0XA 3FZHA 4B1XB 2HMPA 2YCHA 3U8XA 5JMVA 3BEXA 2CH6A 1YXQA 1T6CA 4B9QA 1BDGA 3A5NC 1U2VB 5I9EB 1G99A 1ZC6A 2EWSA 4I6MB 3BUZB 1KXPA 3GBTA 2J4RA 4BC2A 5LJVA 3L4IA 4ISEA 3VF2A 3EN9A 3CQXA 5F1XA 2ZGYA 1H1VA 3VETA 4CD1A 3OHRA 3S41A 1V4SA 5AQUA 3WT0A 3LDNA 3I33A 3EKUA 4BR0A 4H5TA 2KHOA 2E2PA 1IG8A 3UE5A 5BRDA 3MMVA 3AARA 3QBXA 4IJNA 2P9PA 1T6DA 3BF1A 3W3DA 3QBWA 4BC4A 3H6EA 3UB5A 2Q2RA 2A3ZA 4IWVA 2FF6A 3D2FA 2HF4A 3UKUA 1P8ZA 2E8AA 4YDUA 5AZJB 4CZKA 3H1QA 3HI0A 4H0PA 1DGKN 1MWKA 3O4WA 3DJCA 1LOTB 3GL1A 2QWNA 3O1BA 3LM2A 3H1VX 3LDLA 3QFPA 3ZETA 1OKJA 3EL2A 3O1WA 1EQYA 4WQ4C 3A8YA 4JD2A 3CETA 3C7NB 4XH5A 4PKHA 2NRHA 2P9UA 4DCHA 3LM9A 3ZX0A 2P9KA 3QDKA 4K43A 1TUUA 4KBOA 2QWRA 1NGDA 3HZ6A 5AR0A 2BUPA 3VGKA 3U4LA 3WQTA 4B1WB 3VEYA 4FO0A 1U2VA 1CZAN 1WOQA 4EHTA 4I6MA 3GDQA 5EXWA 2I7NA 4EHUA 3A5LC 3KZBA 5E84A 2PAVA 1MWMA 5AQZA 1C0FA 1U6ZA 4FPBA 4JN4A 4BRKA 2GELA 4CZLA 3ZX2A 5BR9A 4FOIA 5AZIB 5BPLA 2V7ZA 2DPNA 1S3XA 3U9ZA 4BR4A 1NGIA 4JHDA 4CJ7A 2HOEA 3SK3A 1GLBG 1BU6O 3CJ9A 1GLFO 1SZ2A 2E20A 3WUHA 4DB3A 5JLFA 3EKSA 2YHWA 5AQGA 1DKGD 2A6AA 3D2FB 1YAGA 5BRFA 3HTVA 4BRDA 1QZ6A 2V52B 2A5XA 3VF4A 3GOIA 1XUPO 3EZWA 4BRMA 2P9LA 3BP8A 4CZMA 4B1UB 2FXUA 3VEZA 3O08A 3O8MA 3ZEUB 3D2EA 3QICA 1JCEA 1NM1A 4EAHD 1ZBSA 4F9OA 1RFQA 1GLLO 4BQLA 4XEIA 3WQUA 2FSNA 1HLUA 3KHYA 4FWLA 4DHYA 4JNEA 3CJ1A 2QXLA 4JD2B 1WUAA 3CJCA 2AA4A 1C0GA 4Z94A 4B1ZA 4BRIA 3CJBA 2QWLA 4FWPA 1DEJA 2P9KB 3R6MA 4H5WA 5AQPA 2Q1NA 4JAXA 5AZJA 3L6QA 1NGHA 1NGFA 2E88A 2P9SB 4FWKA 3CI5A 3HBTA 3CHWA 3QB0A 2D0PA 1TYQA 3JS6A 3C7NA 4WQ5A 3CIPA 5JLHA 1TUYA 1HKBA 2P9NB 4BROA 4H0TB 4CD3A 4A2AA 4A61A 3SMPA 5EVZA 4IJAA 3FZKA 1R59O 2QWOA 2QWMA 3FLCO 3QMLA 2W41A 4JHDB 5E26A 4WYBA 3W0LA 4BQZA 5B8HA 1QHAA 1MDUB 3DAWA 4YDUC 5EOYA 4A2BA 3I8BA 1ATSA 4K25A 4NO7A 1QQNA 4H0OA 3RSEA 2F9TA 3ZX3A 4O8KA 1NMDA 5ADXH 2P9LB 4FL9A 3VGMA 5AZIA 4E1JA 3D2EB 1HKCA 1NGGA 4BRPA 4M63C 4BRNA 4QS7A 2NZTA 2ZGZA 3F9MA 1MA9B 3MN7A 4BR9A 4IXCA 3LDOA 4BC5A 1S22A 1YUWA 1BO5O 1BA1A 3O80A 3MDQA 2Q0UA 1NBWA 2ZWHA 4FWOA 1RDWX 1BWFO 2GUPA 1J6ZA 2E2QA 3SLCA 2YI1A 1KAXA 2NLXA 4GY2B 4AM7A 3WXJA 2ITMA 3ZEUA 2FLOA 2ASOA 2D1KA 3TU5A 4CZJA 2E2OA 1TYQB 2P9IB 3P4IA 3ULEB 3WXKA 4CZHA 5TKYA 3ATUA 5AFUH 4BC3A 1NWKA 3CQYA 3HSCA 3VERA 1NGCA 1ATRA 4CZIA 4FWNA 4EIAA 2PBDA 1NLVA 4MLHA 5AQRA 4CZFA 1E4GT 2P9SA 2WUSA 4H03B 2E1ZA 4A62A 5ADXA 4CZEA 3J8AA 1QQMA 2GWJA 2CGJA 2FSKA 3O6WA 3RSEB 3H46O 1KAYA 5EY4A 2CH5A 3VESA 3CJ7A 3A0IX 2P9NA 3VF6A 3H3NO 2Q36A 3BF3A 5ELZA 2A41A 3ID8A 3TPQA 5AQKA 5AQXA 1ATNA 1HUXA 5BREA 1Y64A 2V7YA 3DXKB 2BTFA 4O5FA 5AQQA 4IO8A 3DXMB 3ENOA 4PL7A 4ISFA 1GLEG 2D0OA 2VWBA 3ATVA 4XH1A 3VEXA 4C23A 4H0VB 4CBUA 4MO4A 5AQHA 3G25A 1SAZA 5AFUA 4H0XB 2Q97A 5JICA 3FZMA 4QS9A 4CBXA 2V51B 4BR2A 4RTFD 5F2RA 3R8EA 3ENHA 2YHYA 2H3GX 1K8KB 3FZFA 2FF3B 3WEEA 1E4FT 1Z05A 1ESVA 3EO3A 1X3NA 1YVNA 3IMXA 3WXLA 2QWQA 3FR0A 4RWTA 2CGKA 4BRAA 5FPDA 3VEWA 3WXIA 3ULEA 2P9IA 5BPMA 3A5MC 3MK6A 3FE1A 1NGEA 2A40A 2QWPA 3MN6A 2GTDA 3QFUA 1X9JA 4BGAA 4BRHA 1GLJO 2IVOA 3VGLA 2W40A 1V4TA 4CZGA 5BPNA 1HKGA 4L3QA 4AM6A 4PKIA 4B1VA 5KQ8A 1D4XA 5AQYA 4CBWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QQOA 2DFFA 2BE2A 3CFOA 1SKRA 1C1AA 3K0SA 4IFYA 4BE7B 3IUCA 3L3UA 4H4MA 5KPRA 4CIEA 3ID6A 1KVAA 5FRMA 1ASUA 5C2DA 3CERA 5AQOA 2RKIA 3JXUA 4BRLA 5AQSA 4RCHA 1HMVA 1QSYA 1KD1O 4PKGA 2OPQA 3AGKA 1WNSA 2P1JA 4ELTA 1SL0A 3ENBA 1VRUA 3DXMA 2OANA 1D8YA 4HUEA 3OYGA 3HP9A 3SJHA 5AQLA 4LSLA 3O4NA 1IO2A 4NYNA 3QEIA 4CJTA 1SUQA 5KGXA 3M6GA 2ITGA 5DM6L 3Q7BA 2XO7A 3THXB 4E1MA 4I2PA 4IOCL 3AAQA 1JXBA 1Z6RA 1BUPA 2HF3A 3A5OC 4NYFA 3VOVA 3TSUA 4IEEA 4DR3K 2XY7A 1IBMK 3C94A 1DTQA 4F8RA 4IOAL 4H5RA 4NB4A 3SNNA 3AY9A 5CYQA 5CE3A 4E72A 4BREA 3QEWA 1YI2N 4CGIA 1Z26A 2UYTA 3TSPA 4B9UA 3I0SA 2P51A 1SQKA 5AQMA 4CEEA 1R0AA 2A1SA 3SPYA 2ZJPL 2GUIA 4FLUA 4KPYA 1DT9A 3HP6A 3D6RA 4OGCA 4FJGA 2XY8A 4YNQA 2KZMA 1X3MA 3SMSA 3H45C 1RDAA 3OA9A 3EE8A 5LMUK 3J7YP 4BR7A 3VA0A 1LWEA 1OH6A 3HOSA 1KSPA 1JLAA 4ELVA 4F3TA 4WQ4A 3K5LA 1WSEA 5FPMA 1D9DA 1W97L 1QTMA 4K42A 4GNIA 4ILJA 4DFPA 4DFMA 3U9DA 3LDSA 3CM5A 3B8AX 1E3MA 2E1YA 5AQWA 3LPTA 1ZXOA 1ZBFA 3AA4A 5FPNA 3KD1E 4JK7A 1VSLA 4CGDA 3H3OB 1G15A 1VRTA 3MCAB 3MN5A 3ZSQA 2Q31A 3C95A 3CCSN 4G9ZA 2P9UB 2XRIA 3VTIA 4H5VA 3V6DA 3FZHA 3T1HK 4FM1A 2HMPA 2YCHA 4CEDA 4FJJA 3V9XA 4FW1A 4QCLA 2HBLA 3A5NC 4LH4A 1FK9A 3BUZB 1KXPA 3KK3A 3GBTA 3TAQA 1C6VA 4Z4FA 1L3VA 1TL3A 3CQXA 4FJXA 5F1XA 4I2QA 3IG1A 1H1VA 2PY5A 3OHRA 1JXEA 3S41A 4DSEA 3CPWM 1O1WA 3WT0A 1J5EK 4BR0A 1QVFM 3HM9A 2KHOA 2E2PA 5BRDA 3NBPA 3KWGA 4O5BA 4K8ZA 4JK9A 3LZIA 1D5AA 4NLBA 4N41A 4JI0K 3LWLA 3D45A 3UB5A 3NGZA 2NNWA 4A59A 4IO9L 4IBNA 3WNEA 5C42A 1P8ZA 3ZT0A 1JLFA 3OJSA 3GL1A 1NK7A 3O1BA 3DLLL 1C0TA 3H1VX 3LDLA 2O8FB 5CR4A 3EL2A 3VMFB 3K5OA 1C0UA 1C0MA 1I94K 4JD2A 3OYDA 4PKHA 3O3FA 4DCHA 5KI6A 1TVRA 1VHXA 2P9KA 3QDKA 2YNGA 3ZCMA 2ZM6K 4LFCK 4KHPK 3NH2A 4FLTA 1NGDA 2JLEA 4X62K 3HZ6A 1N6QA 2VGMA 3R1XA 4GV9A 1OH5A 1JL1A 1UWBA 4KKOA 3KLGA 3A5LC 1J9AA 2D5RA 1NNEA 1C0FA 2GELA 4FW2A 3ZX2A 2X78A 2V7ZA 3V1OA 5FLXO 4W5TA 4BR4A 2HOEA 4BE0A 3QETA 1BU6O 2IS3A 1WBDA 4M42A 4EZ9A 2E20A 4HCBA 4O0JA 2YHWA 3OVNA 4F4KA 1DKGD 2A6AA 2A5XA 1RDBA 3V9WA 1XUPO 3EZWA 4BRMA 2P9LA 5HRRA 3O08A 3D2EA 1ZBSA 2HBMA 4KTZA 1JLCA 3L2WA 3KHYA 4CESA 4WF9L 4C8OA 2QXLA 1VQPN 4AF1A 5HL7L 1EX4A 4E7JA 3QNOA 2QWLA 4FWPA 3R6MA 2Q1NA 4JAXA 5CZ2A 4DSFA 1S1XA 5C24A 2KFZA 2P9SB 3M8SA 3HVRA 4ID5A 2W00A 3QEVA 4DTSA 4FLWA 4DTNA 3SV3A 1TYQA 3C7NA 2YNFA 5K14A 2JWKA 3CIPA 3CM6A 5EU7A 1TUYA 4PY5A 4GVMA 4JKGA 1HKBA 2P9NB 1LAVA 1HJRA 2HBKA 4CJEA 1DTTA 3QMLA 3FLCO 3IKMA 1Q7YO 4WYBA 2QTDA 1S6QA 1MDUB 3DAWA 4C1NK 4YDUC 5EOYA 1YTUA 3E9LA 1QQNA 3K58A 2DFHA 3PIPL 3ZSZA 4OX9K 1VSDA 1HYSA 3VGMA 1HNZK 3G0ZA 4DR5K 3SYZA 1NGGA 1W0HA 2QXFA 4QS7A 3QLHA 3F9MA 1HNXK 4MDAA 1GOBA 4CEBA 3H08A 3LDOA 2HNYA 2IC3A 1SV5A 3L2QA 1BI4A 4KTWA 1BA1A 1KQSM 3OS0A 4PQUA 1NBWA 4FWOA 1BWFO 2GUPA 1J6ZA 3VQCA 3SLCA 2YI1A 3TANA 4AM7A 2NLXA 2ASOA 4MFBA 3T19A 4DV4K 3TU5A 2O8EA 3P4IA 2P9IB 2HHHK 2WONA 2LSNA 1N36K 3VQDA 3ATUA 5AFUH 1YVUA 2HB5A 3CQYA 4N76A 2YNHA 3EE9A 3MWPA 4FWNA 2G8KA 2WFBA 4E1NA 2PBDA 1NLVA 4H4OA 1NG9A 1W2BM 4GVEA 1LWCA 4LH5A 1E4GT 1IV0A 4XIUA 3E9OA 1RNHA 5GAEP 2FBVA 4YOYA 3QESA 2PYLA 2IOCA 2X74A 2OZSA 3DOLA 3SUNA 3TPQA 5AQKA 3T1AA 1HNVA 4X65K 1HUXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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