5AFUH

Cryo-em structure of dynein tail-dynactin-bicd2n complex
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Structure of the Dynactin Complex and its Interaction with Dynein.
pubmed doi rcsb
molecule tags Motor protein
molecule keywords DYNEIN TAIL
total genus 92
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-01-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5afuH01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5afuH02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5afuH03
2A3ZA 1TYQB 1K8KB 3LM2A 4BREA 3GOIA 5JICA 5BPNA 1HUXA 1E4FT 4E1JA 1ZXOA 4H0YB 3U8XA 1NGHA 2F9WA 2HMPA 2J4RA 4H0VB 3H46O 2FSJA 3H3OB 3A0IX 3J8AA 5KPZA 2ZGZA 2P9PB 1XC3A 4BC5A 1TUUA 1DGKN 5E84A 3ENHA 5KPRA 4PL7A 4PKGA 5EOYA 1ATRA 2FF3B 3WUHA 4IO8A 4ISEA 2ASMA 1ESVA 1NGDA 3AAPA 4FWNA 1TYQA 4CZJA 1NLVA 4BRNA 4BRIA 3AAQA 2EWSA 2IVOA 3VGMA 1NGBA 4BRHA 2QXLA 1V4SA 3EO3A 3LDPA 5AQMA 5BREA 3O8MA 3FZHA 3IMXA 2CH6A 2QM1A 3WXLA 2BTFA 3CQYA 2YJFA 4CBXA 2P9NA 3CJ9A 3FZFA 3ZETA 3CJCA 3ZEUB 2DPNA 2YCHA 2V7ZA 4CZMA 3F9MA 2P9PA 5ELZA 4LC9B 4IJNA 3WXIA 5AQQA 3D2FB 3H6EA 2I7NA 3C7NB 1NGCA 1SZ2A 3QBXA 5AQNA 3EKUA 4ISFA 5F1XA 3CI5A 1TUYA 3VEVA 1NGEA 4FWKA 2YJEA 3ID8A 4XH1A 3HBTA 4B1ZA 1BG3A 1X3NA 4B1YB 4BRPA 1V4TA 2E2QA 4BR0A 5FPNA 2BUPA 3VEWA 3I33A 2P9IA 4FWLA 3CJAA 3R6MA 3DXKB 4GY2B 4FSVA 1GLAG 2QWLA 2ASOA 4FPAA 2WUSA 4H5NA 3A5LC 4DB3A 4KBOA 2V52B 5AQYA 4IZ9A 4CZFA 2W40A 4H0TB 3L0QA 1MDUB 4RCHA 1C0FA 4XEIA 4DCHA 5AZJA 2E1ZA 3CHWA 4BQLA 3FZKA 1CZAN 1KXPA 4FWPA 3WXKA 4BG8A 3FGUA 4BC2A 1T6DA 2QWPA 3U9DA 4ISGA 3FLCO 2OANA 2P9LB 3ATUA 3KHYA 2P9IB 3LDQA 3GDQA 4BRFA 3CERA 3O1WA 4EAHD 4H03B 5BPLA 1OKJA 3LDLA 2E2OA 1NM1A 5FPMA 2V7YA 3MMVA 3W0LA 3FZMA 2VWBA 3A8YA 5ADXH 1MA9B 5AQTA 5F2RA 3SLCA 2D0PA 5BRDA 3VF6A 1S22A 4H0XB 3VENA 2QWNA 3SJHA 4JNEA 1QZ6A 4IJAA 3O1BA 1RDWX 2A6AA 2QWOA 5AZJB 2P9NB 3SMSA 1U2VA 4CI6A 1HKBA 4EFHA 2E2PA 3WEEA 4A61A 4CZGA 4QS8A 4PKHA 2GEMA 4FWRA 2FXUA 4BR4A 1BO5O 3GL1A 3O4WA 1NGFA 5AQSA 5I9EB 4FWSA 3U4LA 2QWMA 3A5OC 4O5FA 1MWMA 2CGLA 5AQGA 3D7EO 4CZHA 5AQLA 1HJOA 3MCPA 3D2FA 3JS6A 4FL9A 4B1XB 1JCGA 2E88A 4CJ7A 2Q0RA 4FOEA 1R59O 4FOIA 2FSNA 1YUWA 4AM7A 4WQ4C 4MLEA 1BU6O 1SAZA 2GWJA 3VEOA 3DJCA 5CE3A 3H3NO 3UKUA 4Y0WA 2VYPA 3CIPA 3DWLA 3VEYA 4BC3A 1BWFO 3LL3A 4H5TA 3ZX3A 3UKRA 4CZLA 4O8KA 5LJVA 3DXMA 3OHRA 3VESA 3MK6A 1HPMA 1RGIA 4HTLA 4BROA 1QZ5A 1Q18A 4XH5A 3ULEA 4M7YA 1HX1A 1QHAA 1BUPA 4QS9A 5AZIB 3U9ZA 2P9UB 4EHUA 4Z94A 2H3GX 1WOQA 3AY9A 4BRLA 1D4XA 3TU5A 1GLBG 1NWKA 2PAVA 3HZ6A 2GTDA 3WQUA 5AQPA 4BC4A 4JD2A 4BR5A 2FLOA 2A42A 3W3DA 4L3QA 3M1FA 4I6MA 4YDUA 1Z6RA 2E1YA 4DHYA 4CZEA 2Q36A 1HKCA 1BA1A 4M7XA 3ATVA 4MO4A 4BQZA 3R9PA 3M3ZA 3A5MC 1NBWA 3L6QA 1KAXA 3D2EB 2A40A 3RSEB 4CZIA 1ZC6A 3CETA 2GUPA 3S41A 5LY3A 4AM6A 3KVGA 3H45C 4XH4A 3LDNA 3HM8A 5AQIA 3VF4A 5KQDA 2KHOA 3QFUA 4JN4A 2CGJA 3MN6A 4JAXA 4H5RA 3L4IA 1KAYA 3VEXA 4EIAA 3MN9A 4FO0A 3BUZB 3QBWA 2P9KA 2HOEA 4B9QA 3BP8A 3FE1A 4FWQA 3EN9A 4RWTA 4JHDB 2D4WA 2UYTA 1P8ZA 3CJ1A 3MN7A 5B8HA 3VF2A 1GLLO 2NLXA 3CJBA 3WT0A 2NZTA 4A62A 3HTVA 3JXUA 3M6GA 3UKUB 4BGBA 4FWOA 4BRGA 4QS7A 1RFQA 2ZGYA 2W41A 1YVNA 3EKSA 4J8FA 1C0GA 4BRCA 3VERA 5AQJA 1DKGD 4YDUC 3BF1A 4A2BA 2P9SB 1IG8A 4WQ5A 2GELA 5AQOA 5BN8A 3FZLA 1HLUA 5EXWA 4JHDA 3QFPA 1LCUA 4HWIA 1WUAA 4FWMA 3LM9A 5ADXA 3QB0A 2A5XA 5EY4A 3UE5A 4DQ8A 5JLFA 1SQKA 2QWQA 3SK3A 3WXJA 2D0OA 5AZIA 4CD3A 1GLJO 1KAZA 1LOTB 5E26A 4BRAA 1NGGA 1JCEA 4WYBA 3VOVA 4K43A 4K41A 1EQYA 1ZBSA 4BRMA 3UKRB 2P9SA 3GBTA 3D2EA 3RSEA 1GLFO 5AQFA 3TPQA 1YXQA 1BA0A 4B1VA 3DAWA 2PBDA 1GLEG 1U2VB 2YI1A 4PL8A 4JD2B 3AARA 1E4GT 1NMDA 3P4IA 3R8EA 4BR7A 2F9TA 4I6MB 3LDOA 1QQMA 3FFKB 4K25A 3H1QA 3GE1A 5AQHA 2ZWHA 4H0OA 4PKIA 3HI0A 3QICA 3SMPA 5AQVA 1JCFA 2AP1A 3QDKA 4B1UB 2HF3A 3CQXA 1YAGA 2P9UA 5F0XA 5KQ8A 4NB4A 1X9JA 2NRHA 1NGJA 1J6ZA 5AFUA 5BR9A 2QW9A 5BN9A 1BDGA 2HF4A 3ZETB 5EVZA 1NGAA 4K42A 1U6ZA 3MN5A 1GLCG 4BVPA 1Y64A 3QMLA 1QQNA 4MO5A 3WQTA 4BR9A 1T6CA 2E20A 2ZF5O 3KZBA 3VEZA 2E2NA 3ZX2A 5BRHA 5BRFA 4CBWA 4GNIA 1GLDG 4EHTA 2FSKA 2CGKA 4CBUA 5AFUH 1IJJA 4BRQA 5TKYA 5EX5A 4A2AA 4H0PA 1S3XA 5AQZA 5JMVA 1BOTO 2AA4A 4M63C 1MWKA 3CJ7A 3UB5A 2ITMA 2V51B 4FPBA 2IVNA 2Q31A 3IDHA 3G25A 3I8BA 3A5NC 3MDQA 3O80A 1NGIA 4IXCA 1G99A 4BRKA 3FR0A 1ATSA 5AQXA 4H5WA 5AQRA 3C0BA 3O6WA 2FF6A 2YHWA 1H1VA 5FPDA 1X3MA 2QWRA 3IFRA 4NO7A 4BVOA 3VPZA 5KPTA 4WQ4A 3BF3A 1QQOA 3IUCA 3EZWA 3H1VX 3VGKA 4WQ5C 3BEXA 2P9KB 4F9OA 3EL2A 4BGAA 4BR2A 1DEJA 2IIRA 5AQUA 3GG4A 4H5VA 1HKGA 3O08A 4BG9A 1XUPO 2E8AA 2Q1NA 2Q97A 5AQWA 5AR0A 3VETA 5FPEA 3C7NA 1XQSC 2D1KA 2P9LA 3B8AX 2Q0UA 3O5BA 3ZEUA 3ULEB 3ZX0A 5JLHA 1ATNA 3ENOA 1Z05A 4B1WB 1K8KA 3DXMB 2YHXA 4IWVA 2VCPA 4BRDA 4CZKA 2Q2RA 2I7PA 2A41A 3HSCA 3VGLA 2YHYA 4RTFD 4C23A 5BPMA 2CH5A 2IVPA 2ASPA 4MLHA 4CD1A 1T44A 3WEEB 5AQKA 2GWKA 5LJWA 3DXKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2A3ZA 4MFBA 1RBUA 1TYQB 4CHZA 3QEVA 3TTFA 4DU4A 4KFBA 5CY4A 1YT3A 3LM2A 4G9ZA 3MX2A 3DRRA 2O8CB 4YFUA 5BPNA 3U8XA 4FJ7A 1S1VA 2F9WA 4AHSA 3J81O 2J4RA 4FLVA 4HHTA 4KV8A 2HHQA 3H3OB 5M1NA 3CQ8A 4B9SA 2P9PB 1TUUA 1ATRA 2FF3B 2F4VK 5FROA 2XO7A 2QI2A 1ESVA 3AGKA 5M1PA 4KHUA 3AAPA 4IG0A 4A57A 4CZJA 4IFYA 3HP6A 2WBNA 2KTQA 2HVIA 4GV9A 3OS1A 4BRHA 5DMRA 2PYJA 2QXLA 3LDPA 5BREA 3G4SN 4V19S 3WXLA 1RDUA 4CBXA 2YJFA 2P9NA 4M45A 1VSHA 3KK3A 4B9LA 5EU7A 2DPNA 3EE9A 3LZIA 4CFBA 4NYNA 3THYA 1GOCA 4IJNA 3WXIA 3D2FB 2I7NA 4DMNA 1IH7A 5KTQA 4ISFA 5F1XA 4LF7K 4XJXA 3MWTA 1TUYA 1B9DA 4XH1A 1NGEA 4FWKA 4TSXA 3SJJA 2E2QA 3CF5L 4BDZA 4BY9C 4AHCA 1RDAA 3VN5A 2BUPA 3VEWA 3VQEA 3QLHA 4FWLA 1T05A 3SUNA 4GY2B 2FBTA 1GLAG 1VQON 3K5OA 4CJEA 2XY5A 4IZ9A 5GIOA 3CPWM 4RCHA 1OH5A 2HBKA 2OTJN 1VSIA 3FZKA 3D6RA 3FGUA 4C1NI 4BC2A 2QWPA 3SAHA 1YJWN 5JS1A 2OANA 4BRFA 2P9IB 4CEZA 4EAHD 3O1WA 4LH5A 1VQ5N 4EP4A 3NH1A 1OKJA 1BL3A 4HVJA 2YX6A 5FPMA 3VQ4A 1NNEA 3FZMA 3OBYA 4JK7A 3A8YA 3ULDA 4MDBA 1MA9B 5AQTA 5F2RA 1HQUA 3VF6A 4KI4A 1S22A 3DYAA 3VENA 3SJHA 1S5JA 4IBNA 1QZ6A 4NLBA 4N47A 2HBLA 5AJ3K 4IJAA 1KRPA 1U2VA 3V1RA 1HKBA 4EFHA 1QVGM 4A61A 1LV5A 4B9NA 4XIUA 1XMQK 4QS8A 2O8EA 4FWRA 2VG7A 4OPHA 3QESA 3PO5A 2HHXA 1YIJN 2HHHK 3AVHA 4DTUA 4CJ3A 3TAMA 2QWMA 1JXEA 4LFBK 2YNFA 2OPRA 4DR2K 3DLBA 1IKYA 4CZHA 5IWAK 1ZBUA 3QNOA 5TKWA 3D2FA 4H8KA 4CF1A 4FL9A 2YKNA 1Q8IA 2E88A 3M8SA 1IKWA 4FOEA 3OJSA 4JLHA 3F73A 4DR3K 4M3RA 4AM7A 4B9TA 3VQ7A 4MLEA 4M3YA 1A5VA 3DJCA 4DG1A 5CE3A 4M42A 1S1TA 3HRGA 3BDPA 2VYPA 5C2DA 4ZTJA 3LWMA 4N56A 1FJGK 3AA2A 2KFNA 4H5TA 2NRWA 5LJVA 3OHRA 3VESA 4DV3K 3CFPA 4HTLA 1QZ5A 3CFRA 4J2EA 4KH6A 1QHAA 1VSEA 4LF8K 2YHAA 4Y1DA 4QS9A 3DOKA 4CF8A 2G8UA 2HNDA 2P1JA 4FLUA 4M41A 3CCUN 4EHUA 4EP5A 4Z94A 1WOQA 3CCQN 3AY9A 3D0PA 4FJMA 3J80O 4R79A 2PAVA 4BR5A 3N4QA 3WQUA 1KQSM 4FJ5A 3AVAA 4JD2A 1Q82O 5GADP 4N5SA 4L3QA 2O8FA 3M1FA 4EZ6A 1QS4A 1Z6RA 1N34K 1HYVA 5M1OA 1JLBA 2QTDA 2YV0X 1HMVA 3OA9A 1HKCA 2W42A 1X1PA 2QXFA 3CC4N 4HUGA 4Z0UA 3T1YK 3R9PA 4E19A 1WSJA 3TAFA 3A5MC 1YHQN 1XHZA 5FRMA 4CJSA 2A40A 3T1AA 3CC2N 4NCGA 2WOMA 4R5PA 3MAQA 5KQDA 1VQPN 5HRNA 4Q5VA 3K2PA 1NKCA 4Z4GA 4F2RA 1LAVA 2CGJA 3MX5A 3L4IA 4DQSA 4BWMA 3VEXA 3LAMA 4EIAA 3MN9A 4FO0A 5KRSA 4FJIA 3ALYA 3BUZB 4CFCA 1KLMA 2HOEA 4DS4A 5M1KA 4FWQA 4RWTA 2D4WA 2UYTA 1P8ZA 3CFOA 1YF5L 2NLXA 2E4LA 3CJBA 2NZTA 3JXUA 3M6GA 3UKUB 1WBBA 4AHTA 4BGBA 1WNSA 4BRGA 4YOXA 4LSNA 2F96A 3AO3A 2W41A 4BRCA 1C0GA 1EX4A 5AQJA 4CJWA 4GKKK 1WAFA 4DSIA 4LF5K 3OYAA 5AQOA 5BN8A 3SQ4A 4CGDA 3TAGA 4M3TA 4OLBA 3SV3A 4FZZA 1VQ7N 3OYNA 4HWIA 1LCUA 4CE9A 1QE1A 3UE5A 5JLFA 4WF9L 3SK3A 1K8AO 5AZIA 4CD3A 1GLJO 1KAZA 1LOTB 2PFUA 5E26A 2G8WA 4JI6K 4DR1K 2X6NA 4K41A 1NK9A 1JL1A 2A1SA 3P38A 4FM1A 4OLAA 4OX9K 3LPUA 3OS2A 3VQBA 2RN2A 1YITN 2PBDA 4E89A 4CJPA 5J1EA 3AARA 3TI0A 1J53A 3ZT1A 3P4IA 2F9TA 4I6MB 4FK2A 3BZCA 1QQMA 2F8TA 5E41A 1K9MO 3IKMA 2ZQBA 3L2VA 4DFPA 2Z1IA 4KHSA 3DLHA 3L3VA 4BWJA 4B1UB 1C6VA 2HF3A 3R3LA 4JKGB 4CHQA 4QAGA 1X9JA 1NGJA 3L3UA 5AFUA 3SUOA 3KIOA 3DLEA 2HF4A 1DLOA 3NCIA 1IBMK 3MEDA 5GAEP 4BVPA 2C1IA 2Z1GA 3LALA 1BCOA 1QQNA 3I0SA 3WQTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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