5AFUH

Cryo-em structure of dynein tail-dynactin-bicd2n complex
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Structure of the Dynactin Complex and its Interaction with Dynein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DYNEIN TAIL
molecule tags Motor protein
total genus 92
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-01-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5afuH01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5afuH02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5afuH03
2A6AA 3U9DA 1T6CA 3UKUA 4FWLA 3D7EO 1P8ZA 1NM1A 2Q31A 2F9TA 4CI6A 5BN9A 1JCGA 3H1VX 4IJAA 1G99A 1DGKN 3F9MA 4FOIA 2Q0UA 5AQXA 1HKBA 5BPLA 3ZETA 5AQTA 1NGJA 4MLEA 4BR0A 1BWFO 2NLXA 3D2FA 2Q1NA 2AA4A 2F9WA 2P9IA 4FWPA 1U2VB 4FPBA 4CZEA 2NRHA 1LOTB 4BRPA 3CHWA 4FWKA 5AQQA 3A0IX 4BRMA 4CD3A 4XH5A 1HJOA 1X9JA 2V7YA 2D1KA 2A41A 3R6MA 2Q36A 4PKIA 3ENHA 4H5NA 3WXLA 1QZ6A 2GWJA 2YCHA 2GTDA 3MK6A 4BC4A 5JLHA 3GL1A 1YAGA 3EZWA 5AFUA 3O4WA 1DKGD 3O1BA 4XH1A 3IFRA 3A5NC 4WQ5C 1WOQA 2W41A 4M7XA 3G25A 2W40A 2ZGYA 3GG4A 3EKUA 2FF3B 3KVGA 4JHDA 1MWMA 1TUUA 3FE1A 5AQSA 5KPTA 3GOIA 1NGGA 4H0VB 3R8EA 3VEOA 3ZX3A 4IO8A 4QS8A 4BVOA 5AZJA 1NMDA 5AQOA 1T6DA 3HSCA 1V4SA 2E2OA 2GELA 1RFQA 3AAQA 4E1JA 2NZTA 3SLCA 1ATSA 2P9SB 4H0YB 2GWKA 1MA9B 4BRNA 1NGHA 3ZX0A 4PKGA 3ULEB 4BRFA 3JS6A 4K41A 1E4FT 3SK3A 1ZBSA 4ISFA 3CJCA 3VEVA 2ZWHA 4A2BA 3WUHA 3UKRB 1ZXOA 4XH4A 3VGKA 1BG3A 1SAZA 4H03B 3U8XA 2CH6A 2IVPA 3DXMB 2UYTA 3FZHA 4CZJA 1NWKA 2FLOA 1C0GA 3CETA 2QWPA 2Q97A 4H0TB 3EKSA 3VESA 1YUWA 1NGCA 2D0OA 2D0PA 3I8BA 4JAXA 4BC5A 5AQMA 4DCHA 5KQ8A 1Z05A 3A5MC 4BG8A 4XEIA 1E4GT 3HTVA 3GE1A 1BA0A 2H3GX 4FWNA 4FWOA 4FSVA 4CBXA 1GLBG 3HI0A 3WEEB 3WQTA 2QXLA 3BF3A 3VEWA 2QWOA 1C0FA 2ASOA 1ZC6A 5BPNA 5TKYA 1XC3A 3VGMA 3ENOA 2P9LA 4MO4A 4QS7A 2Q0RA 1D4XA 2KHOA 2YI1A 1GLCG 3EL2A 4B1UB 5ADXH 3GDQA 3C7NB 5AQPA 2DPNA 4FL9A 3M3ZA 4M63C 2QWRA 3S41A 3DXMA 2VCPA 3FZMA 4B1YB 1Y64A 4BROA 1QHAA 3FR0A 4BR7A 3FZLA 5AQLA 4CZIA 2E20A 4A61A 1DEJA 1K8KB 1RGIA 1KAZA 3MN5A 3LM9A 3TU5A 1HKCA 3LDNA 3H6EA 2BUPA 2E88A 1EQYA 3CI5A 4PKHA 3U4LA 3WQUA 4K25A 4K42A 3LL3A 2QW9A 4CD1A 2A42A 2CH5A 2EWSA 3CJBA 3H45C 1Z6RA 5AQJA 1X3MA 3D2EB 4GY2B 2I7PA 2CGLA 4M7YA 5JICA 2V52B 2QWNA 1BA1A 1TYQB 3M1FA 3LDLA 1SQKA 4WQ5A 3ID8A 5AQGA 1HPMA 4MO5A 3VF2A 1NGEA 2ZGZA 1NGBA 3R9PA 3FFKB 4FWSA 3QFUA 2V51B 4BC3A 1CZAN 1JCEA 1K8KA 4DB3A 5AQUA 4FOEA 3VOVA 3VETA 2J4RA 3CJ1A 5AQYA 3DXKB 4FWRA 4BC2A 4L3QA 3WXJA 2VYPA 4I6MB 1U2VA 3ZEUB 4B1WB 2HOEA 1BOTO 1JCFA 5AQWA 3DAWA 3MN6A 4BRLA 4H0OA 5LJWA 4AM6A 5AZIB 3MDQA 2QWLA 1ESVA 3LM2A 1HUXA 3O6WA 5AQZA 3BP8A 3D2EA 5B8HA 5FPDA 3QB0A 5BR9A 2P9NB 2GEMA 4B1VA 3O80A 3HZ6A 3LDPA 4IZ9A 3IDHA 4O5FA 2AP1A 5AQKA 1YXQA 3FZFA 3IMXA 4BRIA 4J8FA 3AY9A 4HTLA 1KXPA 2IVOA 3RSEB 4H5WA 4IXCA 1KAXA 4JD2B 3DJCA 3DXKA 3CQXA 4BVPA 4EAHD 1R59O 4BR4A 2A5XA 3QFPA 2BTFA 2OANA 5BN8A 3O5BA 2HF4A 3QMLA 5F2RA 5AR0A 3VF6A 5AZIA 4BRQA 3FZKA 1MDUB 1YVNA 3LDQA 4FWMA 2ASMA 5FPNA 1HX1A 3ATUA 2P9PB 2P9SA 4BQLA 4DHYA 4BRHA 3UKUB 4F9OA 4NB4A 3MMVA 3ULEA 2P9NA 4B1XB 5I9EB 3W3DA 4BRGA 2IVNA 3MN9A 4H5RA 4H5TA 5AFUH 2QM1A 2QWMA 4FO0A 3ZETB 1S22A 5CE3A 3RSEA 3SMSA 4A62A 3L6QA 3UKRA 4PL8A 1U6ZA 4CJ7A 2E1YA 2WUSA 3D2FB 4BREA 4H5VA 2P9IB 2E8AA 4Y0WA 1IJJA 3IUCA 5JMVA 3GBTA 1GLJO 2FF6A 3QICA 4ISGA 4H0PA 3W0LA 5JLFA 4CZKA 4CZLA 3FLCO 4NO7A 3CJ7A 5EOYA 3VEXA 5FPMA 5LJVA 3A5LC 3WEEA 2PAVA 2P9PA 2ASPA 3KHYA 3SJHA 3WT0A 5BRDA 2P9KB 1MWKA 3J8AA 4FPAA 3QDKA 4IWVA 1NGIA 1ATRA 5F1XA 5AQFA 2CGJA 4WQ4A 2E2QA 2FSNA 5E26A 2PBDA 2VWBA 2E2PA 1V4TA 3AARA 4JN4A 2HF3A 4O8KA 2Q2RA 3ZX2A 3CQYA 4CZFA 4B9QA 3C7NA 5ELZA 3P4IA 4C23A 1NGDA 4WQ4C 5EY4A 3FGUA 4QS9A 4EHTA 5KPZA 3A8YA 2YJEA 4JNEA 2YHWA 4RTFD 4BRKA 4JHDB 1BUPA 4BRAA 2ZF5O 5KPRA 1BDGA 4BG9A 4BR5A 1WUAA 1GLFO 3L4IA 4CZHA 3EO3A 5AZJB 4BRCA 4BR2A 4CZGA 3VERA 1RDWX 3H1QA 1NGAA 3O1WA 2A3ZA 5FPEA 3M6GA 3I33A 2E1ZA 2P9KA 4CBUA 3BEXA 4RCHA 5AQVA 2V7ZA 2FSJA 4BGBA 1HKGA 3UE5A 3WXKA 1T44A 2YJFA 1GLEG 2P9UB 1XQSC 3EN9A 1LCUA 4BRDA 3L0QA 1XUPO 4RWTA 1NBWA 3MCPA 5BPMA 3CJ9A 2ITMA 1OKJA 2GUPA 3CIPA 5ADXA 3H3NO 5E84A 4EHUA 5LY3A 1TYQA 3HM8A 4WYBA 3VPZA 3B8AX 2FSKA 3O8MA 4B1ZA 3WXIA 1GLDG 4BQZA 4HWIA 4BR9A 3AAPA 2IIRA 1Q18A 1BO5O 5AQRA 4CZMA 3LDOA 4CBWA 3HBTA 4H0XB 4I6MA 3UB5A 3ZEUA 1NLVA 2D4WA 2A40A 4EFHA 3BF1A 3H3OB 3VGLA 1QZ5A 1X3NA 5AQIA 5EXWA 2P9LB 4A2AA 4BGAA 3JXUA 2P9UA 2YHXA 3VEZA 3TPQA 5AQNA 5BREA 2E2NA 3VENA 3VEYA 3QBWA 4ISEA 4K43A 1BU6O 3A5OC 3QBXA 5EX5A 4PL7A 3BUZB 1QQOA 5BRHA 1QQMA 4YDUA 2I7NA 2HMPA 3CJAA 3KZBA 1TUYA 3O08A 4KBOA 4MLHA 5EVZA 3C0BA 1J6ZA 3SMPA 2FXUA 5AQHA 4YDUC 4Z94A 1NGFA 1QQNA 5BRFA 1H1VA 4LC9B 3U9ZA 3DWLA 4JD2A 3VF4A 1GLAG 1IG8A 3MN7A 3OHRA 1GLLO 3CERA 2YHYA 1S3XA 4FWQA 3H46O 4EIAA 1SZ2A 1ATNA 1HLUA 1KAYA 4IJNA 4DQ8A 5F0XA 3ATVA 4GNIA 4AM7A 5KQDA 2QWQA 2CGKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3B6PA 4B9UA 1T6CA 4FWLA 3RR8A 1P8ZA 2Q31A 1WBDA 1G99A 3CMEN 3M5RA 4OPHA 1HKBA 4CF2A 3LDSA 1NGJA 3P83D 3NF9A 4CHQA 3EYZA 3NF6A 4CCHA 1VAZA 3VQAA 4JI7K 3Q7BA 2Q1NA 4FZZA 1N6QA 5EU7A 1VSMA 4CK2A 4KO0A 3AO5A 1RT7A 1U2VB 5D3GA 2ZJRL 3CPWM 3QESA 2NNWA 3TTFA 2NRHA 1X1PA 3I56N 4KPYA 3VQ5A 1QE1A 1S1TA 4OKEA 1XNRK 2A41A 4PKIA 2ITGA 3ZT0A 1QZ6A 4FK0A 4HHTA 2W42A 2P51A 5M1OA 2GTDA 3MK6A 1RBTA 3OJUA 3BDPA 4B3TK 2WTUA 3QNNA 1T05A 3NHGA 3EZWA 5KRTA 3O4WA 4JKHA 4CGDA 3VQ6A 3O1BA 3OYIA 3IFRA 3A5NC 4FJXA 4G1QA 2W41A 3HOSA 1QVGM 1S5JA 4F2RA 2ZGYA 2FBTA 3ENBA 4DFJA 3GOIA 4H0VB 5FDLA 4IO8A 4QS8A 1NJXA 4WCEL 1NMDA 1T6DA 2YHBA 3HSCA 2HBLA 1RFQA 3VN5A 1NOZA 2NZTA 4Q5VA 4CJ5A 2O4GA 5E41A 1N8RO 4RW7A 4FVUA 3ULEB 1IKVA 3AA3A 2HNDA 1UOCA 3SK3A 2BGGA 3V1QA 3WUHA 3ID6A 1ZXOA 2HBKA 4OKKA 4FJ9A 1I3AA 2HHSA 2FLOA 3EKSA 3VESA 1VSJA 2D0PA 4DCHA 4DV6K 5CR4A 3NH1A 2O8CB 3A5MC 3AGRA 5I3UA 1WSIA 1BA0A 2H3GX 1EWQA 4FWNA 2VG5A 4FWOA 5DMRA 4E3SA 2QXLA 1VQLN 1L3SA 2QWOA 4GVEA 3AVJA 2ASOA 5BPNA 4NXNK 4GVMA 5TKYA 3P31A 2HHQA 4K0KK 4DLEA 4DR1K 4QS7A 3EL2A 3CM6A 2QI2A 1K73O 3OYNA 3HK2A 5AQPA 1QHTA 1Z26A 4F2SA 4FL9A 3M3ZA 2QWRA 2X74A 4KB1A 4LH4A 4CJ3A 3C94A 5JVGL 3NMUA 3VQDA 4FJKA 2DFHA 3FR0A 4BR7A 3OYHA 4JI4K 3ZYYX 3K5LA 4LFBK 4CZIA 3KLIA 2P5GA 2NRWA 3MN5A 4CW7B 4DR6K 5KI6A 4CGJA 4W5TA 3H6EA 2BUPA 1B92A 2E88A 4FZXC 4DTUA 4O0IA 4DSLA 3WQUA 3SZ2A 4CD1A 4G9ZA 4FJHA 3KIOA 3CQ8A 1XWLA 3V1RA 1Z6RA 1RDDA 1X3MA 3THYA 3V4IA 1KSPA 1C1CA 2ZGZA 3R9PA 3FFKB 3V9ZA 3CC2N 2E6LA 5LMNK 4BC3A 1CZAN 3QINA 4DTSA 4WF9L 3QEWA 5AQYA 4DSFA 4CGIA 1IKWA 3WXJA 1BOTO 1JLCA 3F5TA 2ZJQL 1RT1A 3HRGA 4E72A 5HRSA 2P1JA 1J5OA 4AM6A 1WBBA 2QWLA 3LM2A 1TAUA 5HRRA 3KLEA 3E9OA 4CJSA 3MWPA 3O6WA 3D2EA 4KHNA 1BI4A 1YF5L 5BR9A 2P9NB 4CJEA 4JLHA 3V81A 5C10A 4B9LA 2NRRA 2HBJA 4FJLA 3CCLN 3NF8A 4J8FA 4PY5A 1VQ8N 4FM1A 2IVOA 3RSEB 1FJGK 3ULDA 1T8EA 5JS1A 5C24A 2ZM6K 4JD2B 1CZBA 3DJCA 4PA1A 3EZ5A 2XY7A 4HCBA 3CQXA 4BVPA 1R59O 1FK9A 1NJZA 5BN8A 3O5BA 3DOKA 4E7IA 4H8KA 5AZIA 3FZKA 4WFBL 5J1EA 2ASMA 1IBLK 3S3NA 4BRHA 4DFPA 2HMIA 2EHGA 1L5UA 3W3DA 2HHXA 2IVNA 3OBWA 5AFUH 3PO4A 1ILYA 1NOYA 2QM1A 4CJ4A 3HP9A 3VQ8A 4NCAA 2QKKA 1S22A 3ZSYA 3SMSA 4A62A 3UKRA 3KK2A 4QAGA 3L2VA 2E8AA 4ID1A 1IJJA 4O4GA 1K9MO 4BE0A 3GBTA 1GLJO 4DQQA 1WLJA 4JI0K 4NO7A 3SQ0A 4CFBA 5M1FA 4FLUA 3L8BA 2PAVA 1VQON 3PY8A 2ASPA 3KHYA 4BDZA 4FPAA 3SV3A 3L3UA 3RTVA 4KH5A 1HYVA 1WN7A 4I9LA 2E2QA 1EKEA 2VWBA 4ICLA 3OA9A 3AARA 4JN4A 3SQ4A 3LP1A 4O8KA 3ZX2A 1T7PA 4JRPA 4A57A 4C23A 4CK1A 3TANA 3TAQA 4X62K 3QIOA 3ZSVA 1HQUA 3D6RA 4N41A 5LL6Z 4M41A 3QLHA 4CE9A 1BDGA 3DI6A 3QERA 2QTDA 4OGEA 3U6FA 2NRTA 1NGAA 4DWIA 4LD0A 2E1ZA 2G8KA 2YNFA 2IDOA 2V7ZA 3K58A 2FSJA 5M1PA 1HKGA 3OBYA 5AJ3K 2KKZA 4CF0A 3IAYA 4JKBA 3L0QA 4M3UA 2HVHA 1C1BA 2LSNA 2ITMA 5ADXA 4AH9A 3CC7N 3H3NO 3HPOA 4EHUA 5LY3A 1J53A 1TYQA 3HM8A 3VPZA 4FCYA 1OH7A 4PHTX 2IC3A 4B1ZA 4R5PA 3WXIA 1GLDG 4BQZA 4DF4A 4HWIA 4JI3K 4BR9A 3HM9A 1Q18A 2JLEA 3HL8A 2F7TA 4CZMA 1NLVA 1RBRA 2A40A 5KTQA 1RT3A 5GADP 3H3OB 3VGLA 1BISA 2A1SA 1SL0A 5MLCQ 3Q7CA 4A2AA 4BGAA 2VGMA 3ZSZA 2Z1GA 3BY5A 5AQNA 3K5OA 3AGKA 1TKTA 5IT9O 3VENA 3AVAA 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1VSKA 3ZX0A 1Z25A 4M3XA 4PKGA 2FBVA 3IG1A 4H4OA 4BRFA 1KFSA 2G8IA 4GKJK 1BQMA 1VSFA 4JK8A 4K41A 1SL2A 3SAHA 1E4FT 1XHZA 1ZBSA 5GINA 3THXA 3J81O 2KTQA 4DU3A 1BG3A 4DFKA 3U8XA 3RRHA 3R1XA 3QEPA 4ID5A 2UYTA 4CZJA 4Z4FA 3CETA 3ZT4A 3ZT1A 3G4SN 2QKBA 1D9DA 4JAXA 3ALYA 5AQMA 1N5YA 4U7BA 4XEIA 1E4GT 1TL3A 3HTVA 1RBUA 3E1YA 2VG7A 3E9LA 4Z0UA 1NK9A 4EZ6A 3WQTA 3WEEB 3VEWA 2FC0A 2RF2A 4HVJA 1R0AA 3VGMA 1EXQA 3NGZA 4CVNE 2KHOA 2YI1A 4B8AB 2G8UA 1L3UA 4ZTJA 4B1UB 3QEXA 3LWLA 3AVGA 3C7NB 2DPNA 4M63C 3FZMA 4AHCA 4B1YB 1Y64A 4IFEA 4BROA 3OYBA 1WAFA 5HBMA 4W5QA 4FW1A 3KLFA 2F8TA 2O8FB 1ITGA 1KQSM 4KRFA 1C6VA 4FK4A 1RGIA 4JI6K 5FRMA 1HKCA 3LDNA 1EQYA 4PKHA 3SYZA 1BIZA 5CHIA 3U4LA 4LF7K 4K25A 4K42A 3LL3A 2A42A 4AHVA 4C1NK 3H45C 5AQJA 3F2KA 3EY1A 3MCAB 4GY2B 2I7PA 3ZSXA 2CGLA 5JICA 2ZQBA 3PSFA 3SPYA 4BACA 3M1FA 5GAGP 3NE6A 1KRPA 4WQ5A 3ID8A 4MO5A 1NGEA 5GIPA 1RTDA 2IS3A 3LPUA 4DSEA 1QS4A 1BQNA 1RILA 3QFUA 1JCEA 4Y1DA 5CYMA 1MU2A 2J4RA 3AVBA 3DXKB 4FWRA 4E7KA 2IGIA 4L3QA 4I6MB 3IS9A 1JCFA 1DTQA 3DAWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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