5AFUH

Cryo-em structure of dynein tail-dynactin-bicd2n complex
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords DYNEIN TAIL
publication title The Structure of the Dynactin Complex and its Interaction with Dynein.
pubmed doi rcsb
molecule tags Motor protein
total genus 92
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-01-26
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5afuH01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5afuH02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5afuH03
1WUAA 1TYQB 1NGEA 3VF6A 2GELA 3H3NO 1RDWX 3IMXA 4BRDA 5EVZA 5ADXA 4ISFA 2E20A 3CI5A 5AQTA 4BRMA 3O08A 5AQUA 5BR9A 3CJ7A 3CJCA 1E4GT 1U2VB 2WUSA 2ZGZA 2P9IB 3MCPA 2QWNA 4JD2A 4B1YB 2E2QA 2IVOA 4BR0A 4IJNA 4EHUA 2NLXA 4JNEA 2Q97A 2A42A 2E1ZA 5AZJA 5AQWA 2AP1A 1HX1A 4H5TA 5AZIB 3C0BA 4GY2B 1S3XA 3R6MA 4XEIA 1GLEG 4JHDB 3H6EA 5AQFA 5LJVA 1XC3A 1NMDA 4BGAA 3ID8A 1HJOA 4I6MA 3HM8A 1DGKN 1U6ZA 3A5LC 3KZBA 1T44A 2YI1A 3CIPA 1MWKA 2HOEA 3R9PA 1ESVA 1KAXA 5EX5A 3UKUA 3WXJA 3WQUA 3G25A 4PKIA 4F9OA 1GLLO 1ATSA 4BROA 3L0QA 5AQYA 1GLDG 5KQDA 3J8AA 1R59O 5FPEA 3ZEUA 4A61A 3VEOA 3VEXA 4FWKA 4H5NA 5JICA 1NGFA 1NGHA 4B1VA 1JCFA 5JLFA 3VEWA 5BRFA 3QBWA 3U9ZA 2W41A 1NLVA 4H0YB 1Y64A 2V7YA 3VF4A 1K8KB 2HF3A 1H1VA 5BN8A 2YCHA 3U9DA 4WQ5A 5TKYA 2CGKA 3OHRA 3BUZB 5AQIA 4FWPA 3EN9A 1YUWA 2A5XA 2CGLA 4M7XA 2Q36A 5AQZA 3B8AX 2GTDA 1NM1A 2P9SB 2V52B 5AR0A 4BRKA 5FPDA 1EQYA 2Q0RA 5AQNA 1NGAA 2IVPA 2H3GX 3VERA 3I33A 2HF4A 4BRAA 1BWFO 3HI0A 4PKGA 1MWMA 3BF3A 4B1XB 2IVNA 2P9NA 3HTVA 5AQQA 4K41A 4Z94A 3UKRB 4FWQA 3VEVA 3DJCA 3CJBA 3QFUA 4CZGA 1WOQA 1JCGA 4BQLA 2E88A 3QBXA 2E2OA 3F9MA 2QW9A 3O80A 4H0PA 1IG8A 3ZX3A 3GL1A 4BRLA 4IO8A 2V51B 1SQKA 3FE1A 3QB0A 3UE5A 3CQYA 4BVPA 4BR9A 2VYPA 2D4WA 3KHYA 4CBWA 1YVNA 1V4TA 4A62A 3H1VX 2ZWHA 2F9TA 1NGIA 3DXKB 1Z05A 4B1UB 3LDPA 3DXMA 3VPZA 4QS9A 4BQZA 4E1JA 1Z6RA 4FPAA 4CZIA 3IUCA 2ASPA 2FLOA 2E1YA 3O8MA 4FWNA 1HKGA 4BR4A 4XH5A 3WEEA 3FZHA 4MLHA 4BRFA 5KQ8A 4LC9B 4H5RA 3ZETB 4FOEA 4PKHA 1NBWA 3GE1A 3VEZA 4BVOA 4EIAA 1TYQA 4M7YA 3WXKA 2GEMA 2YHXA 4H0VB 5F2RA 3A5MC 3MN6A 1QQMA 3MK6A 1P8ZA 5BN9A 1LCUA 3BEXA 4A2BA 3O5BA 3VESA 3KVGA 3LDOA 1U2VA 2E2PA 2P9UB 3GG4A 4FO0A 1CZAN 4KBOA 2GUPA 5AQGA 4BRPA 1KXPA 4DHYA 4BC5A 3DAWA 3SMPA 4BREA 1ZC6A 3GOIA 2I7NA 3FZKA 5BPNA 1GLCG 4QS8A 3P4IA 2YHYA 3FLCO 3LM9A 2IIRA 4JHDA 1TUUA 1HLUA 3AAPA 4I6MB 3VF2A 4DB3A 3M3ZA 4HWIA 1V4SA 3ATVA 1TUYA 1NGCA 3M1FA 5AQOA 5AQPA 2ITMA 2YHWA 3C7NB 3CJ9A 5EY4A 3QFPA 2CGJA 2E2NA 2P9PB 1BO5O 4K42A 3W3DA 3WXLA 3LL3A 5LJWA 3TPQA 3CQXA 4BC4A 5E26A 4WQ5C 3H46O 4K25A 4DCHA 4YDUC 5AQLA 4K43A 3ENOA 2GWKA 4CBUA 4DQ8A 3MN7A 1XQSC 5AQXA 3QDKA 2Q2RA 4XH1A 4WYBA 3ULEB 4CZFA 4AM6A 3WT0A 4WQ4C 1QHAA 1YXQA 4EAHD 4MLEA 4EFHA 2E8AA 1K8KA 2FF6A 3L4IA 2QWPA 2DPNA 3MN5A 4PL7A 2Q31A 3VETA 3VGMA 3I8BA 2BUPA 4FPBA 4BG8A 3BF1A 3AARA 3SLCA 4FWLA 1YAGA 3O4WA 2VCPA 1GLAG 5BPLA 2QWRA 3EO3A 2QXLA 2KHOA 2P9SA 4FWOA 2A6AA 4RCHA 4BR5A 4PL8A 4CD3A 3GBTA 1BDGA 4CZHA 3SK3A 2Q1NA 2Q0UA 3D2FB 4BRCA 1BOTO 1NGBA 3D2EB 2FXUA 1NGGA 4B9QA 3UKRA 1ATRA 3EKUA 2P9LB 1ZXOA 2F9WA 3IFRA 5AFUH 4ISEA 1GLJO 3VENA 1T6CA 2V7ZA 4CI6A 5JMVA 1JCEA 5EOYA 1X9JA 4CZLA 3WQTA 4CD1A 1XUPO 2FSNA 4IZ9A 4Y0WA 1QQNA 2CH6A 3LM2A 1SAZA 2YJEA 2FSKA 3RSEB 2OANA 3U8XA 4FWMA 2PBDA 4H0XB 3ENHA 2BTFA 4CZKA 3EZWA 4IJAA 5AQKA 3CHWA 2P9KB 5B8HA 4H0TB 4BRQA 3H1QA 3AY9A 3UB5A 1QZ6A 1HKBA 1J6ZA 4BR2A 3DXKA 5AQVA 4ISGA 4CZEA 3MMVA 5KPZA 4C23A 1SZ2A 2CH5A 3JS6A 4BC3A 3BP8A 3JXUA 1D4XA 5BPMA 5LY3A 1KAYA 1MDUB 3WUHA 1E4FT 3ATUA 3W0LA 2D0OA 4GNIA 3ZETA 3A0IX 3TU5A 2W40A 2D0PA 5FPMA 4CZMA 4BC2A 5AQRA 2P9IA 2YJFA 3H3OB 4JD2B 5AQSA 5FPNA 5AQJA 2QM1A 2J4RA 4FWRA 4FOIA 4RTFD 3FGUA 4FSVA 5AZJB 5AZIA 2P9UA 1T6DA 3D7EO 4EHTA 2A40A 3ZX0A 4O5FA 1ATNA 2ZGYA 5I9EB 3ZX2A 3QICA 5ADXH 4NB4A 3LDLA 1RFQA 1NWKA 2GWJA 3FZFA 3UKUB 3A5OC 4H5VA 5AQMA 4BRHA 2VWBA 3C7NA 1BU6O 3M6GA 2UYTA 3EL2A 3O1WA 3O6WA 3QMLA 3SMSA 4AM7A 4QS7A 1OKJA 2NZTA 5KPRA 3ZEUB 2P9PA 2A41A 3FR0A 1X3NA 4RWTA 4BG9A 3O1BA 2QWQA 1DKGD 1X3MA 4BRIA 3VOVA 4CZJA 5E84A 5KPTA 2ASMA 4J8FA 3A5NC 3EKSA 3H45C 3VGLA 3A8YA 3FFKB 4NO7A 1HPMA 3ULEA 2D1KA 2ZF5O 4CBXA 3CJAA 1DEJA 1NGJA 4A2AA 2A3ZA 2HMPA 5AFUA 4H03B 1S22A 2QWOA 4YDUA 1BUPA 1GLBG 1IJJA 4O8KA 4WQ4A 1LOTB 2P9NB 3HSCA 4MO5A 2AA4A 3D2FA 3HZ6A 5BRHA 3FZMA 5F0XA 1KAZA 3D2EA 3WXIA 5CE3A 1HKCA 4BRNA 1Q18A 3DWLA 1QZ5A 5AQHA 4JN4A 5F1XA 4FWSA 2P9LA 4BR7A 4JAXA 4IWVA 2FF3B 3FZLA 4IXCA 3VEYA 3LDQA 4B1WB 5BREA 2QWLA 3AAQA 2NRHA 1C0FA 1RGIA 5EXWA 5BRDA 4HTLA 3VGKA 4H5WA 2PAVA 3GDQA 3CETA 1MA9B 5ELZA 3RSEA 1C0GA 4H0OA 4BRGA 3R8EA 2FSJA 5JLHA 3MDQA 3DXMB 2P9KA 3U4LA 1HUXA 4CJ7A 4B1ZA 2ASOA 3CJ1A 1BA1A 1BA0A 1QQOA 4FL9A 4M63C 3MN9A 3LDNA 1ZBSA 2I7PA 4XH4A 1G99A 2QWMA 3IDHA 1BG3A 3WEEB 3L6QA 4BGBA 1GLFO 2EWSA 4MO4A 4L3QA 3SJHA 1NGDA 3HBTA 3CERA 3S41A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SBTA 3C6HA 3K5MA 1VQNN 4EP5A 1RDWX 4BRDA 4ISFA 5AQTA 4BRMA 3ZSVA 4CJ3A 4AHSA 1U2VB 4OO1J 4C8LA 3MCPA 3VN5A 4DR3K 1BGXT 3I0RA 3M8PA 4C1NI 4IJNA 4KH4A 2NLXA 4JNEA 4IKFA 2A42A 2E1ZA 2HNZA 5AZIB 3TI0A 2O8CB 1BQMA 1RBVA 4XEIA 3R6MA 5LJVA 4JHDB 1XC3A 4I9QA 1L3UA 1DGKN 3A5LC 1RDDA 2KW4A 4YOWA 1BL3A 5C2DA 3VA0A 1ESVA 1KAXA 5EX5A 1HR0K 1RDBA 3NF9A 3WQUA 1LAVA 4F9OA 1GLLO 4BROA 1F21A 1I39A 4HUEA 4M3TA 5AQYA 1R59O 3HJFA 1WSIA 5FPEA 1FXXA 4DSLA 3VEOA 3CCUN 1NGFA 4B1VA 1C0MA 1JCFA 2VWKA 1WAFA 4KH5A 1NOZA 1S1WA 3VEWA 3QBWA 2W41A 4FZZA 1Y64A 3SUQA 1H1VA 5BN8A 3OW2M 3U9DA 1RCHA 3ZT3A 1QS4A 4WF9L 2CGKA 3OHRA 1RTIA 1LV5A 4O44A 3THXA 1VSMA 2XHBA 4M7XA 1VQ8N 4JK8A 2P5GA 5AQZA 1J54A 3OJSA 4XJXA 4DR1K 2D5RA 4DLEA 3DRSA 3K5LA 1WB9A 3LAKA 4DSJA 2D0BA 2HF4A 4PKGA 1T05A 2IVNA 1YITN 2P9NA 2VWJA 3HL8A 1VHXA 1SL1A 4RW8A 3CFRA 3CJBA 3QFUA 2XO7A 2E2OA 4IBNA 1HNWK 3G6EN 3O80A 3RVCA 3CCSN 3CD6N 4E19A 3S3NA 1TKDA 4YOVA 4CFDA 5SWMA 5BR8K 4BRLA 2V51B 1SQKA 3FE1A 3QB0A 2W6KA 3KLIA 1IKWA 3UE5A 3CF5L 4BR9A 4CFCA 1RTHA 2I5JA 3L8BA 4A62A 2HHXA 3H1VX 3K0SA 3VMFB 2WOMA 2C1IA 4AHVA 3QEIA 4IO9L 1EWQA 4QCLA 4JK9A 1Z6RA 3IUCA 2ASPA 3O8MA 4CERA 1RT4A 4C1NK 4XH5A 4CEZA 1SUQA 4MLHA 5J2PA 4EIAA 4CIGA 2UXDK 4CEOA 3WXKA 2PYJA 2YNHA 4CF9A 4E7HA 4IG0A 1IH7A 4A2BA 3C94A 3O5BA 3VESA 3ZT4A 4ZTFA 4AH9A 4FO0A 4BACA 4DFJA 4BC5A 3DAWA 3KLGA 3SMPA 4NXMK 4FZXC 3L2QA 5C15A 4Z4HA 3FZKA 3OYLA 3CCMN 2IIRA 4IFYA 1TUUA 4XIUA 1N5YA 4FM2A 5C12A 4JK7A 1V4SA 3L3VA 4HUFA 1LWFA 3QFPA 3SBGA 4JV5K 2P9PB 1YJ9N 4K42A 1WSJA 3CQXA 2RHKA 4WQ5C 4DV7K 4E7LA 3H46O 4DCHA 4YDUC 5AQLA 4DS5A 3OS2A 1XQSC 3MXJA 2Q2RA 3QDKA 4FW1A 4CZFA 4U67L 3WT0A 4FLXA 4WQ4C 4EAHD 3CFPA 3S3MA 1K8KA 2E8AA 3MN5A 1S5JA 3PX0A 3S9HA 3VETA 3D0PA 1N34K 3I8BA 4BY9C 2BUPA 1KCFA 4FPBA 4BG8A 3BF1A 4DTUA 1L5UA 4FWLA 3O4WA 4B8CA 3KWIA 5CZ2A 3KJVA 2C1GA 3AVFA 2G8IA 4DQPA 2A6AA 4FJMA 4CZHA 1ZBHA 1NNEA 2HHQA 3THYB 2Q0UA 1TL3A 1NGBA 4O5BA 1BHLA 3AGKA 1NGGA 4KI6A 4B3MK 3IFRA 3J7YP 3KLHA 5AFUH 3QETA 3VENA 1T6CA 4DFKA 1NMNA 3T19A 1W7AA 3NF8A 1HRHA 1SS6A 3AA3A 4IFVA 1XMQK 4JS4A 1N33K 1S9EA 4IZ9A 4CE9A 3VTHA 4C8NA 3AGRA 3SCXA 3RSEB 2FSKA 2EHGA 3PSIA 3U8XA 4IEIA 3V9UA 1VQ5N 4KHQA 4MDAA 1J5EK 3ENHA 2O8DA 4CJLA 2P9KB 4FLYA 3TSPA 4DTRA 4BR2A 3OYHA 1R0AA 1D5AA 1NU0A 2QXFA 3I55N 1TK5A 2A1RA 1Q86O 2P5OA 1LW0A 1RDAA 3BDPA 4Z4FA 2HW3A 2QKBA 2OZSA 4KHUA 3D45A 1KAYA 1VSDA 3K59A 1TGOA 4ZHRA 2D0OA 3ZETA 1B9FA 1GOCA 4DU4A 2D0PA 4LSNA 5FPMA 4CZMA 1FJGK 5AQRA 4CK3A 3PIOL 4DV2K 3NAEA 4CF0A 3RTVA 4OGCA 2GBZA 4O0JA 1X9MA 1EXQA 4FSVA 1RT3A 5AZJB 2G8FA 3CMEN 2P9UA 1T6DA 3AVJA 1D9FA 4M41A 4EHTA 5HP1A 3RMAA 1JLCA 3ZX0A 4UQGA 4DSFA 1NG9A 2ZGYA 1OH7A 3ITHA 4M42A 3RMBA 4HCCA 1FKOA 1XNQK 4YOTA 3SV3A 2VG5A 1UAXA 4PA1A 2RE2A 4GVEA 5HOOA 2BH1A 2VWBA 1BU6O 3M6GA 2UYTA 4QS7A 4CJVA 2JGUA 3AO3A 2A41A 3FR0A 4DR2K 1OVQA 1C1BA 2E4LA 4B9LA 1X3MA 1VQ6N 5KPTA 2XY8A 3SQ4A 3EKSA 5IWAK 3HOSA 1J53A 1CZ9A 1S1XA 3CJAA 4LF8K 1OH6A 2P51A 5TKWA 4B3SK 3J7ZO 3VQCA 4HUGA 4MQ3A 4KV8A 4H03B 5DK5A 1JLBA 3ZT2A 2QWOA 5HLFA 3LDSA 4YDUA 1SKSA 3RMCA 4FJGA 5HRRA 4WQ4A 3LP0A 4RW9A 3HSCA 1EP4A 4CGDA 3D2FA 1U48A 3HZ6A 1JLAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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