5AHN | Genus

Total Genus 102

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	102
sequence length	467
structure length	297
Chain Sequence	MLRISQEALTFDDVLLIPGYSEVLPKDVSLKTRLTRGIELNIPLVSAAMDTVTEARLAIAMAQEGGIGIIHKNMGIEQQAAEVRKVKKHTYPLASKDEQGRLRVGAAVGTGADTGERVAALVAAGVDVVVVDTAHGHSKGVIERVRWVKQTFPDVQVIGGNIATAEAAKALAEAGADAVKVGIGPGSICTTRIVAGVGVPQISAIANVAAALEGTGVPLIADGGIRFSGDLAKAMVAGAYCVMMGSMFAGTEEAPGGALSAIVHQLMGGLRAAMGYTGSADIQQMRTQPQFVRITGA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Pseudomonas aeruginosa pao1
publication title	Crystallographic Studies of Two Variants of Pseudomonas Aeruginosa Impdh with Impaired Allosteric Regulation pubmed doi rcsb
molecule keywords	INOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DEHYDROGENASE
total genus	102
structure length	297
sequence length	467
ec nomenclature	ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date	2015-02-06

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00478	IMPDH	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
A	PF00571	CBS	CBS domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	5ahnA00

1SQ7A 4LS1A 5HULA 1BEUA 4DO5A 2O7SA 4UTMA 4RV8A 3SFKA 3L5MA 3WJYA 4CCCA 4A3UA 3O15A 2Z6JA 1JCYA 1B3OA 3OVPA 1QPOA 1FWWA 1A5CA 1HO4A 3QC3A 2VOMA 3R5EA 2A6LA 1W54A 2V0TA 3NEVA 1P5BA 4JTKA 1TV8A 4TMCA 1S5VA 3TC7A 1OFDA 1IXNA 2NWRA 2J24A 4DO4A 3EWBX 3T7VA 3P8JA 1W37A 4E0CA 2JK2A 4MYXA 5I3FA 2QCHA 4R53A 5AHFA 3LRKA 2E5CA 4WUIA 2B7PA 3TMLA 1FQ0A 4HPJA 1NAL1 2V2HA 1PCKA 4EIVA 5A8GA 5LNRA 5AC6A 3M47A 2E5DA 3GB6A 4IGHA 4S1FA 3STCA 1SR9A 3B06A 4MJZA 4XUGA 1W5OA 4LS0A 4M6QA 4JNMA 1X1ZA 5EPDA 1LLWA 1GVRA 3E49A 3C6CA 2Z0IA 4OV4A 2J9XA 3DAQA 5DELA 3DZ1A 3N2MA 1TTQA 4K37A 5AFDA 4OBTA 2X1UA 3TFXA 4DF1A 4Y96A 4EF8A 1MSSA 5CZJA 1QOPA 1WDWA 2NUXA 3DFPA 2H3DA 2YFOA 5CZTA 4U28A 1KA9F 2FIQA 1Y0EA 3IIXA 4UUIA 4LUIA 3QW4B 3MMTA 3QYQA 1I45A 4OV9A 4E2DA 4QISA 3YPIA 3QF0A 4O1AA 3TX9A 3TROA 5K9DA 1AL8A 1EP2A 5K9XA 4CNOA 4O19A 4Q32A 4M6PA 3VKJA 2LLEA 2QF7A 3DI1A 3C61A 4Y6GA 1KW1A 3GXPA 2WJZA 3B05A 4IMEA 1ONRA 3W70A 5LGXA 3LCWA 1DVJA 2O7QA 4K39A 4S2BA 1DQWA 4MY1A 1TQJA 2A7RA 1K8ZA 1K8YA 3NQEA 3QJAA 1SO6A 2CZDA 4PTNA 4E2BA 3S5OA 4JTHA 1TV7A 2RKXA 1MEWA 4POCA 1JRCA 5CPOA 2CLKA 4G1KA 2GJNA 4DEFA 2PURA 1EA0A 5CPLA 3N2XA 2QCCA 2VKZG 4KKXA 1I2OA 3LHZA 3NZ1A 3MHFA 3O6CA 2B7QA 2AQWA 3SJ3A 4N9EA 1O5XA 3MBFA 3MUXA 3HGOA 4ORIA 2RFGA 1KM6A 2YR1A 3GNNA 2Q8ZA 4HNTA 4UCGA 1JUBA 4NX5A 1G4SA 1RD5A 2ZYFA 3C2VA 3KOFA 3PF3A 2V2CA 1XBXA 3DKJA 3S5NA 4NZFA 3LDVA 2H90A 4FIQA 4RX0A 3SIZA 1KM4A 2GVGA 4FNPA 5HNRA 3W9ZA 3LCLA 3SGUA 3G0XA 3GDRA 2DZWA 3UQNA 2J27A 2CLEA 3BG9A 5D04C 3PUDA 5FEZA 3P5YA 3I6RA 3W1NA 3IGUA 2OZ0A 4P61A 3R13A 3NQ8A 2QR6A 2B7OA 4MIMA 3UY8A 3G1SA 3LCXA 1LZOA 1UUMA 4MVAA 4JEQA 2V2DA 1W0MA 1YXCA 1W56A 1SO4A 1QWGA 3TV8A 4GUGA 4BFAA 2ZZ2A 1IGSA 3EX6A 4O10A 5HWJA 4MFEA 4R34A 1WA3A 3L67A 5KZMA 2ZRXA 1LBFA 4JIPA 4DBDA 1A50A 1FCVA 1FUYA 4AHPA 5HWNA 5LNSA 5G2HA 1X8FA 3G24A 5LGZA 1RV8A 3W84A 4Z1AA 3LHWA 3C56A 1QO2A 1L6YA 3TR2A 3W3OA 3MYPA 1I2RA 1UBSA 3MP5A 5AYZA 4ADSA 3W7LA 1LOQA 3LERA 4H6KA 2FPVA 1W3NA 3HMJG 3M44A 3W1MA 1DJQA 3P5ZA 3W7IA 5K9CA 4PL2A 4BI5A 1VPXA 3GLCA 4IQLA 4GUJA 5AHNA 1G4PA 4LVFA 3FEMA 4NNBA 2WO5A 3S5YA 4HNVA 2CLIA 1NVMA 3W1RA 2JKEA 3S9YA 1BWLA 2FJKA 2QUUA 3EXTA 3IIPA 4ZQPA 3NXFA 3PUOA 1LRNA 2DORA 1W8SA 4NJJA 1JQXA 2QCGA 1K7XA 2FDSA 3THAA 2Q3RA 5KMYA 3WFAA 3DXIA 3FLUA 1OVDA 3NL2A 3QH2A 3SY5A 3LTPA 3OBKA 3W7QA 4KWVA 4UFIA 3WJXA 3G3DA 1LM1A 2X30A 1TYGA 1WYIA 4UTTC 2HS6A 3L66A 2CZ5A 1FCBA 3NM1A 1KFBA 4LUJA 4LY8A 1G7VA 4N9CA 1QMLA 3EWUA 1RPXA 4H3DA 1SFJA 3G18A 3FA5A 1WAUA 1DV7A 3W7CA 2DZVA 2NX3A 3HB9A 2H3BA 3LV5A 2RH9A 4RK8A 1R2SA 2ISWA 2C1HA 4UTKA 3LHVA 3R89A 3QZEA 1F05A 3T44A 3IV3A 3NO5A 3U6WA 4KFOA 5J5DA 3KVLA 1KV8A 2NWSA 3P7YA 3U8GA 1GQNA 1IF2A 2XFWA 1U5JA 1YXYA 4ML9A 1KFJA 2ZZ4A 2C18A 4E38A 3EX3A 3L0GA 4FXRA 2NXGA 1ICSA 1W5QA 4HNNA 1VH7A 4ZQMA 1Q6LA 4M5PA 3HGJA 4MZYA 4OT7A 2QCFA 3KRZA 1TPH1 3GDLA 2ABAA 2E77A 2TRSA 2VFFA 2ZZ6A 4LRTA 1ICQA 1I2QA 1YTKA 4CNPA 3BW3A 4YWIA 3KHJA 2Y7GA 1H60A 1UCWA 4JY8A 3O63A 2QKFA 3KFTA 3C2EA 1RQHA 2YYTA 2I9EA 3RMJA 3GXTA 4Q4KA 3L9CA 3P8IA 5GVJA 1JCNA 1B4KA 1SU5A 3D0CA 3NPXA 3UPWA 1E51A 3M5ZA 5D30A 1A5BA 1LRQA 4AHOA 4S2CA 3UZ5A 1TPWA 3B8DA 3F1QA 1ZJIA 2EHHA 3O8AA 5KITA 3UXAA 2J88A 2NX9A 1K03A 1ALDA 3NAVA 2NXHA 1YDOA 4UMCA 1QPRA 6TIMA 4DXVA 4IX2A 4EF9A 2F84A 3NQDA 4LVAA 5G4EA 4FO4A 3V1PA 3L68A 1ZNNA 4JTLA 5CZSA 2YCEA 1ME7A 3TJLA 3W87A 2AAMA 4FF7A 3QPYA 5C6MA 4AF0A 3MHUA 5D2WA 1KM2A 3L5AA 1FDYA 2VFIA 3S1UA 5CGQA 1H7PA 3CQ0A 4A21A 4FIRA 1D3HA 4WD0A 4IMDA 4FB7A 5I3JA 3W1PA 2Y61A 3ZS4A 2BSLA 3UYCA 1TO3A 2ZQ0A 3AJXA 4GWEA 4QSHA 2A21A 1UUOA 1YTDA 4IOTA 2YX0A 1OFPA 1OF8A 1F5ZA 3CM4A 2J9ZA 2QCDB 4JTIA 3BVJA 3GXNA 3ABQA 1LOLA 4UMBA 5LSMA 4O0KA 2NV2A 2V30A 5F2MA 5F1VA 2CLHA 2YDAA 1F74A 3KRSA 4JD4A 3FFSA 3IIOA 1KTBA 3W75A 3BV4A 3EB2A 1S3HA 3M5VA 3GAYA 4CLMA 1YDVA 3IIZA 3W22A 1EUNA 2VXNA 2FPTA 1OFAA 4KFPA 3G1XA 2VELA 1G69A 2X16A 4OU1A 3QRHA 3LRLA 4WY0B 4QIUA 1TREA 3UWQA 1EUAA 3PG8A 3FJLA 4ZQRA 1EWEA 4WQ6A 4RLIA 4NZJA 1WOAA 2X2GA 5D02A 4O1BA 1YXDA 2ZCGA 3PAJA 4NNCA 5AN7A 5DBTA 4JY9A 4JR5A 1VC4A 3U2OA 2GJLA 4UNLA 2TYSA 3C0JA 4N9DA 5FESA 5AHMA 4L4MA 6ALDA 4WXZA 3DBPA 3TQVA 3IVUA 1B9BA 5LHEA 2HMCA 3PB0A 3STGA 1GT8A 1W3TA 3LHYA 1H1ZA 4HSNA 1EP1A 3W76A 1O95A 4PC8A 5F2GA 4X9SA 1PVNA 3WK1A 1NEYA 4JDYA 1H5YA 3P80A 4AWUA 4LS2A 1OFBA 3SECA 3QQ1A 5BMWA 3QMSA 1OK4A 5U4NA 3Q94A 4P2VA 4R33A 4UIOA 4O1DA 5FF7A 3A22A 1OFEA 3Q2DA 1SPQA 4A29A 2BXVA 1H7NA 3Q58A 4ALDA 4YCOA 3TXVA 1FDJA 4HPXA 5D37A 3TIMA 1KBJA 1M7PA 1L9WA 1PV8A 3C4UA 1QO5A 1JCMP 4AHQA 2QCDA 1LTDA 4O1CA 1FY6A 2ABBA 4RZ6A 3VI2A 2R8WA 4RXFA 3C2FA 3FKRA 5IBXC 5FF3A 4MZ8A 3INPA 1VLWA 2A5HA 3GVGA 3BW4A 3DFOA 1W3IA 4NJIA 1ZY9A 3CWOX 1H7RA 1PHQA 3NQ6A 4FNQA 2B4GA 4UTWA 1PS9A 1SW0A 4NXKA 5SWUA 2G97A 3S42A 3N73A 2QJIA 2ZA2A 5HQEA 3GKFA 4QQ3A 1XI3A 2C0AA 3E96A 2FQIA 4WY0A 3HPSA 4XBKA 4NVTA 2H6RA 5K3VA 3W72A 3IVTA 3KXQA 3S1WA 3HJZA 1GZGA 2DJLA 2WKJA 4O52A 4JS3A 5F2IA 3PG9A 1F6PA 1TRIA 3VE7A 4ADTA 3MHGA 2G95A 2TSYA 2Z1BA 4GUHA 1I2PA 1Q6RA 5BW6A 3B4UA 5AYYA 3N14A 2ALDA 5I3HA 1MZHA 3TSBA 2NZLA 4ZQNA 3NA8A 4MLJA 5C5YA 3G8EA 4Z08A 3G0SA 3NOEA 2PE4A 3O6YX 5K2ZA 3IEBA 4AB4A 3I68A 4MPQA 1YADA 1PCWA 4JX5A 2V82A 4ADUA 4YXGA 1XL9A 1XDLA 3HG4A 3LXCA 1N8FA 1H1YA 4O17A 4ZL1A 3M9YA 2ZBTA 4BF9A 3DI0A 3NZRA 1Q45A 1R2TA 3PUEA 3THQA 1SSDA 3EX4A 1IXQA 4X3ZA 3HIJA 1LROA 4A2SA 2R14A 1BWKA 1TV5A 3M41A 3FJ6A 3SI9A 1TTIA 3NG3A 1XUZA 3S1XA 5DY3A 4AWSA 4CCEA 5FI8A 4O8RA 1TTPA 1N55A 3W7EA 5DCEA 2WOQA 3LGEA 4PA8A 3DFSA 3DHFA 2ZA1A 4UTHA 1B57A 3NPWA 3BO9A 4RZ5A 3F4WA 1GG1A 4NNAA 4O12A 2C15A 3L0KA 3PBYA 4Y90A 3PB2A 3UWYA 5D33A 1XBZA 4WY0F 2Y89A 3LI1A 1F76A 2ZTKA 1L2UA 2NLIA 2EPHA 3KVKA 4DF2A 1Z48A 3OVQA 3W7RA 3HQ1A 2ZRZA 5K4XA 3WJSA 2Q8LA 4O54A 4OHQA 2GOUA 4Z1BA 4HT3A 3TA6A 4NJKA 4RR4A 1AG1O 3SZ8A 1SFLA 5FEWA 4UTIA 1TIMA 1P1XA 2VEKA 1Q3NA 4J9JA 2ATMA 5D38A 3RLUA 3RFAA 3MI6A 2WSQA 3G8RA 5BNKA 2ZRUA 3CC1A 3Q37A 4RZ4A 5FF2A 3BW2A 1FCUA 2DZTA 5LHFA 1F73A 5FEXA 3QQ0A 4Z0SA 3G1FA 3CIWA 2XN0A 1P4CA 2QAFA 3F4NA 3CEUA 2E5BA 5CG7A 3GNDA 2E68A 3UXDA 1VYRA 1TPEA 1OABA 2FB2A 5C54A 2X1TA 1GYNA 4TO8A 3C2OA 2CLOA 3R12A 5AHEA 1VHCA 3TQ0A 3I7QA 3GX9A 4OQVA 1LRTA 2DZXA 3TSMA 5EL1A 4PODA 2JGQA 1OFRA 3W1TA 4IXXA 3A9IA 2ISSA 3W2JA 2FB3A 2GVLA 4HSOA 4ONVA 1AK5A 2GQAA 3AO0A 3PM6A 3W2NA 3PC0A 4DBEA 4FX7A 2NUWA 4KWWA 1GJPA 4M7SA 3NQ2A 4H4IA 3CTLA 1H7XA 1SO5A 3TH6A 2GQ9A 4DF0A 2Y62A 1PIIA 1DL3A 3ATYA 2YXGA 2G96A 4O15A 4IWWA 3P62A 1JVNA 4HKPA 5F4SA 4N02A 3W71A 1RVGA 5DLCA 3W7DA 1GOXA 1FXPA 2YW3A 4GRSA 3JS3A 3GAKA 3HG2A 4O57A 1JR1A 4GC4A 1HO1A 3O05A 1P0KA 3PWAA 4N9BA 2ATSA 4LVDA 3S8HA 3TQKA 2ZZ3A 2JKAA 3M43A 1JRBA 1GVOA 3W2KA 1K02A 4UC5A 1VGAA 3MO7A 1PHWA 2JGYA 3I7RA 2QCNA 4ZQCA 4O28A 3PY2A 3LOTA 3QMTA 4LU0A 4IMFA 1C9DA 4JYFA 2CLLA 2A85A 4BWLA 4MYAA 2X1SA 1Q6OA 1FX6A 1LP6A 4O18A 3NR0A 1FCQA 4OWGA 3DFTA 5T26A 1A5SA 1EWDA 3EXSA 1MEHA 4DQWA 2WNZA 3UWUA 5TIMA 3QFEA 1H7OA 1IIGA 2Y7EA 1QAPA 1A53A 1S5TA 5I3GA 4LT9A 3G1AA 4TX9A 3DHDA 4JYDA 3W7KA 3GDMA 4AF0B 1ZCOA 1TB3A 3LCIA 5G4WA 2EGZA 1MO0A 4NU7A 4O4WA 3L65A 1TRDA 2RDWA 3HG5A 4TU1A 3A24A 3LLFA 1TPVA 5G5IA 1T8XA 4MZ1A 3NGJA 3CLMA 3TXZA 1O94A 3IRDA 1F2JA 3H54A 2Y6ZA 1TPC1 3TE9A 4LNYA 2JBMA 2VFEA 1OFOA 3RU6A 1JCLA 3GZ3A 1KV5A 3JR2A 1YPFA 4A22A 4UXDA 1TSIA 2J9YA 2V8ZA 2V9DA 4LC8A 3I65A 3M6YA 3A23A 4Z1DA 3DFNA 4OE7A 3O1NA 3LHUA 1VQTA 4TIMA 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2CLMA 5MHBA 4D2JA 3NYZA 5EKYA 1EIXA 4TR9A 4O50A 3GDKA 4O4VA 1I8JA 3IGXA 3WJZA 4YLWA 3UY7A 1QR7A 3VCRA 5F1UA 5EYWA 1IXPA 4I7VA 3ZWTA 4PL1A 4HIBA 1H50A 1YLVA 4O53A 1W5MA 3W1LA 4LVBA 1I4NA 2EKCA 3HPXA 3PR2A 5I3KA 3BGJA 1FXQA 3SR7A 1RR2A 5AC8A 3PULA 2E6AA 4CQ8A 3HGRA 1UASA 1X1OA 1KM1A 3H55A 4L4LA 3I7SA 1IXOA 1KFLA 4X22A 1YPIA 3W7HA 4LV4A 3LTYA 4UTLA 2EF9A 1JCXA 4AH7A 2OMAA 4JTSA 4ZVJA 4HNUA 4XBSA 4IPJA 3QW3A 1OK6A 1WBHA 3LRMA 5AYXA 2A7NA 2HS8A 1SZFA 3E12A 1RQBA 2BZNA 2C13A 1TPDA 5HR6A 4NQ1A 4FNUA 3LCHA 4OGZA 4LV9A 4RCXA 1H63A 3SW6A 2QDGA 2ZDRA 4O16A 1YTEA 3USBA 3TUUA 3QPZA 3CEPA 4GJ1A 3HO8A 2A4AA 3ATZA 5EMUA 3PBUA 4EOUA 3RF9A 4N6EA 2OX1A 4JN6A 5F4WA 3STEA 2UV8G 2F7FA 4IPIA 1K7FA 1O4UA 1G67A 3DU0A 3NPUA 1KTNA 1G6CA 2PCQA 3EXRA 4GE8A 4XKYB 5D05A 4I9AA 1EB3A 2ZZ7A 3NL3A 1FWSA 4XWUA 3N19B 2VEMA 5F2LA 2X1RA 4N4QA 4Q33A 4ZQOA 5CKSA 4JTTA 4BI6A 1D3GA 3JRKA 4DPPA 2QCMA 4QNEA 1OHLA 2I1OA 3W2UA 4LOCA 2BTMA 4MY9A 3LI0A 3G3MA 3IVSA 3KX6A 3LV6A 3PVFA 4LVGA 3NQMA 3HPZA 3ZFHA 1WOBA 4HHPA 4JDBA 3BLEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5AHNA

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