5AQNA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 124
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqnA04
5TKYA 1BG3A 2YI1A 2E8AA 2E1ZA 5AQRA 2P9NB 5I9EB 4H0VB 1JCFA 2FF6A 3R6MA 2HMPA 4C23A 3W0LA 1BA1A 3BP8A 2IVOA 1NGGA 2P9LA 1CZAN 2I7PA 5AQPA 4BREA 3HM8A 3A0IX 4YDUC 5E26A 5FPNA 5BR9A 1DKGD 1GLEG 3MMVA 1S22A 1XC3A 1SAZA 1Q18A 1Z6RA 2ZGZA 2QWOA 2P9NA 5AQNA 1YXQA 2QM1A 1HLUA 5AQTA 2PBDA 2NRHA 1WOQA 1NBWA 3FLCO 2QWPA 3UKRB 3OHRA 3WXJA 2DPNA 1ESVA 2A40A 2BUPA 3FGUA 4H03B 4PL7A 4A62A 3M6GA 3DWLA 4BRCA 3SMPA 5KQ8A 4CZMA 1C0GA 5LJWA 2FXUA 2F9TA 3DXKB 4IZ9A 3VEVA 3EO3A 4HWIA 4QS7A 1XUPO 4FWPA 5B8HA 3FE1A 2QWQA 5EVZA 3EKUA 2VYPA 3GE1A 4BRIA 4EFHA 2Q1NA 5AQGA 1C0FA 3C7NB 1NGCA 1QZ6A 3VEZA 4BGAA 2ASMA 3UKRA 1QHAA 2E20A 2P9SB 3QMLA 1KXPA 3HI0A 2CGLA 3H1QA 3VGLA 4E1JA 4BGBA 4BR9A 2CGKA 2IVNA 3DXKA 3W3DA 4IJAA 5BN8A 2YHYA 3B8AX 3ZEUA 5AQQA 3FZMA 4FWMA 2D0PA 3GG4A 1LOTB 1BDGA 1JCEA 3RSEB 4BRNA 3H1VX 4GY2B 3ZETB 1BUPA 4BVPA 1BWFO 4CI6A 3CJ1A 3C7NA 3I33A 1RGIA 4CZLA 1V4SA 1XQSC 3D7EO 3ZX0A 3EZWA 4BRKA 5AQVA 2P9SA 4JD2B 4CZKA 5F1XA 3BF1A 3VF4A 1E4FT 3QFUA 4K41A 5JLFA 4B1UB 3ZX3A 4LC9B 2P9UB 1NGFA 4WQ4C 4B1ZA 1D4XA 5AQUA 3RSEA 3VEWA 4RWTA 3ZETA 4YDUA 3CJAA 3MK6A 5AFUH 4H0XB 3QB0A 2PAVA 2ITMA 1WUAA 3ATUA 5AQKA 4MLHA 4BC3A 1JCGA 4K25A 5AR0A 3R9PA 4RCHA 1ZXOA 4GNIA 4JD2A 4BRGA 2A41A 1J6ZA 1HKCA 4DHYA 4XH4A 2GELA 2FLOA 4FO0A 4MO4A 3L4IA 3JXUA 2GEMA 3C0BA 3CHWA 4BR5A 5KQDA 5LY3A 2QXLA 3LDPA 2P9LB 4H0TB 4AM7A 2P9UA 3O8MA 1NGAA 2FF3B 3MN6A 3DAWA 1DEJA 1IJJA 1LCUA 3F9MA 5AQLA 2YJEA 4PL8A 5EY4A 3O6WA 3WQUA 1T6CA 4IXCA 5AQMA 3HBTA 1V4TA 1TYQB 1DGKN 3QDKA 3TPQA 4CZFA 2J4RA 3CETA 2V51B 4JAXA 4BRDA 4H5NA 4K43A 1Z05A 4BRQA 1OKJA 1SQKA 3LDOA 1TUYA 1P8ZA 3A5NC 4H0PA 5JMVA 5BRHA 1SZ2A 5AZIA 2W40A 3M1FA 3I8BA 1GLCG 3WXKA 1TYQA 1QZ5A 1HJOA 1ATRA 1MWMA 1YUWA 3AARA 4BVOA 2Q36A 5JLHA 3VGKA 1TUUA 4IO8A 5FPDA 3CIPA 3CQXA 4BR4A 4DQ8A 2FSNA 3WT0A 3VENA 4RTFD 4ISFA 4B1VA 3VERA 4JNEA 4BC5A 4A2BA 2E88A 3VEOA 3ATVA 4H5WA 3BEXA 3ZEUB 4B1XB 4MO5A 2Q2RA 1Y64A 3CI5A 1S3XA 4DCHA 1BU6O 2ASPA 3BUZB 2FSKA 1X3NA 2A5XA 4BQZA 4PKGA 5ADXA 1NGHA 4H5RA 3HSCA 3WEEB 3D2FB 1GLFO 3SLCA 2EWSA 3GOIA 5BPLA 1EQYA 2KHOA 4CJ7A 3KVGA 2V7YA 5BN9A 4BG9A 2A42A 1NGIA 1IG8A 4AM6A 1ZBSA 4FWQA 4B1WB 5AQHA 4FSVA 4MLEA 1NMDA 2V52B 3DXMB 2HOEA 5EX5A 1BA0A 3U8XA 2ZGYA 4BC4A 3EL2A 3EKSA 3IFRA 3WEEA 3D2FA 4CZHA 5AQYA 2CGJA 3VPZA 2VCPA 4A61A 3QBWA 1BO5O 3VEXA 4B1YB 4BRHA 3ID8A 3LDLA 3QFPA 4XH5A 2YHWA 2W41A 3ULEB 3CJCA 4K42A 4FWKA 5AQFA 4JN4A 3A8YA 3A5MC 4FWSA 1GLJO 3DXMA 2Q31A 2H3GX 2AP1A 3MCPA 4BR7A 4CZGA 4H5TA 2NZTA 2BTFA 2E1YA 3UKUB 4PKIA 3H3NO 4QS9A 3BF3A 3O80A 3VEYA 2GWKA 3WUHA 3AAQA 3A5OC 3DJCA 4CBWA 2AA4A 3ULEA 1MDUB 1E4GT 1MWKA 3JS6A 4IJNA 4CZJA 1X3MA 4BRAA 5BRFA 1YVNA 4BQLA 2NLXA 5AZIB 1KAXA 1QQMA 1NGDA 4CZIA 5BPNA 3R8EA 3UB5A 3FZFA 4WQ5C 3SK3A 1GLAG 4J8FA 5CE3A 2HF4A 5BPMA 3UKUA 1QQNA 3H46O 4NB4A 4XEIA 4EHUA 4KBOA 2P9PB 1YAGA 4QS8A 5JICA 5FPEA 2WUSA 3EN9A 4H0YB 4BRFA 1GLLO 1HKGA 3O4WA 1U2VB 5AQOA 2GUPA 4ISGA 4BR0A 3D2EB 5EXWA 1RFQA 4M63C 1HPMA 2A3ZA 4H5VA 3SJHA 3VOVA 4Z94A 5AQIA 1BOTO 3CJBA 5AQXA 3VF2A 3LDQA 1R59O 3HZ6A 3KZBA 5LJVA 2D1KA 3LDNA 2P9PA 3MN7A 2YHXA 4BR2A 2VWBA 2YJFA 2D0OA 5ELZA 2QWRA 4WYBA 4DB3A 1KAZA 3GL1A 1U2VA 4EHTA 2QWLA 3D2EA 3WQTA 2V7ZA 2GTDA 2ZF5O 3CJ9A 3CJ7A 1T6DA 4BROA 4F9OA 5KPTA 3AY9A 2QWMA 2E2QA 3QBXA 1ATSA 2ZWHA 2HF3A 3VESA 3IDHA 2IIRA 4I6MB 4WQ4A 3HTVA 3FZHA 3G25A 1GLBG 3VETA 5AQJA 4XH1A 3L0QA 5KPRA 5BRDA 2CH6A 4FWRA 5ADXH 2UYTA 3IMXA 1ATNA 3ENHA 2D4WA 4FWLA 4FOEA 1NGJA 3SMSA 4CZEA 3FFKB 3O5BA 4BRLA 2E2PA 1NWKA 3O1BA 4B9QA 4FPBA 4A2AA 4I6MA 2I7NA 2CH5A 2YCHA 3ZX2A 3IUCA 3L6QA 5AZJB 4BRPA 4O5FA 2QW9A 2Q0UA 3TU5A 4EIAA 1G99A 5F2RA 2P9KB 3U9DA 4HTLA 1HX1A 3H3OB 3H45C 4WQ5A 5E84A 1GLDG 1NLVA 1K8KB 4NO7A 3O08A 2E2NA 4BG8A 3LL3A 4O8KA 1T44A 5KPZA 3GBTA 1X9JA 2E2OA 1HKBA 3ENOA 4FWNA 3A5LC 5AZJA 4BC2A 1KAYA 3QICA 4CBUA 1NGEA 3FZLA 2GWJA 3J8AA 4L3QA 3FZKA 2P9IB 2P9KA 5BREA 4Y0WA 4IWVA 3KHYA 3M3ZA 1MA9B 4PKHA 1K8KA 3MDQA 4M7XA 4CD1A 4JHDB 2ASOA 4FWOA 3U9ZA 1HUXA 4CD3A 4CBXA 3UE5A 3CERA 1QQOA 3FR0A 1RDWX 5AFUA 4M7YA 3U4LA 5AQZA 3GDQA 3MN5A 2QWNA 3WXLA 3P4IA 3CQYA 5F0XA 4BRMA 2F9WA 2P9IA 2Q97A 4EAHD 3O1WA 1NM1A 4FOIA 2A6AA 5EOYA 3VF6A 4JHDA 2Q0RA 1NGBA 5AQWA 3LM2A 3MN9A 4H0OA 3WXIA 2IVPA 2OANA 1U6ZA 3H6EA 3LM9A 3VGMA 3AAPA 1H1VA 5AQSA 5FPMA 4ISEA 3S41A 4FL9A 2FSJA 4FPAA 1ZC6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1WN7A 1BG3A 3LWLA 2OPSA 3E7RL 4IFYA 2P9NB 1QQCA 1JLEA 4E3SA 4AHRA 1VHXA 2N69A 3W0LA 3CQ8A 1J53A 1BA1A 2IVOA 4BWMA 3TAEA 1NGGA 4CEBA 2VQEK 1XHZA 3QO9A 1JXEA 1LW2A 1X9SA 4NCGA 3IG1A 1KRPA 4YDUC 1LV5A 1QSSA 3E66A 5FPNA 2ZGZA 1Z6RA 3NCIA 5HBMA 4OPAA 4KO0A 1BK8A 2QM1A 2G8KA 1HLUA 2HHXA 1OH6A 4XIUA 1KFDA 2E6LA 3R3LA 3OHRA 3QESA 2DPNA 2E6MA 4RW4A 3SYZA 2Y1IA 3FGUA 4H03B 4PL7A 3DWLA 3SMPA 4DU1A 4JKAA 1RT6A 4FK4A 3K5OA 4K0KK 1YTUA 3SQ2A 3GE1A 2VYPA 3P5JA 1FW6A 1C0MA 1YJNN 5BR8K 2NRTA 4DV7K 5DM6L 3B6PA 1W97L 3DI6A 5DMRA 4FK0A 4KHSA 1SEGA 3QEIA 4BDYA 3VGLA 2LY6A 2KBKA 3AVGA 2XY7A 3QERA 1CHZA 2O8CB 5BN8A 3B8AX 3OJUA 2YC1C 4BE2A 3GG4A 1I2VA 2O8DA 3ZETB 5E41A 4CQKA 4NCAA 3CJ1A 4RW7A 3TAMA 1RGIA 1LQHA 2P9SA 1UA0A 3OYCA 1NNEA 1E4FT 3QFUA 4M3YA 4DF4A 2KSKA 3OYLA 1P90A 1KSPA 1ZBHA 3DLEA 4PUOA 4B1ZA 1D4XA 4B3TK 3ISNC 3L3UA 1D8YA 4E7JA 3N4QA 4YOXA 3CJAA 1CN2A 3MK6A 5AFUH 4OPKA 4GVMA 3KP1A 1KC8O 1JCGA 4CGFA 5AR0A 3LAMA 4RCHA 3QEXA 3T69A 1JZBA 2JDQD 3JAMO 2GELA 4FO0A 3C6AA 4MO4A 4C8KA 5KQDA 4DWIA 3LDPA 3E7UX 3ZLJA 3O8MA 3VTHA 3T1HK 4NLBA 1R0AA 1DEJA 1IJJA 4LH5A 1RTJA 4CHPA 2I5JA 4WF9L 1ZVEA 2O8BA 4DS5A 3M8RA 3MWPA 1ZBFA 5AQMA 3CYGA 3K58A 1EP4A 3RTVA 3TPQA 1TGOA 3EYZA 1NH5A 3I56N 1RT2A 5HRPA 4FJLA 1ZYWA 1G15A 1Z05A 4DFPA 4BRQA 3OY9A 2NNWA 1IKXA 5M1QA 1Q7YO 5LMUK 4JKGA 4DU4A 4CE9A 4KHWA 1T05A 3THWA 2W40A 4KKOA 1EX4A 3PX0A 2HW3A 1TYQA 4AB0A 1WAJA 2HHHK 1RT4A 2OCEA 3WNHA 5HROA 4CEFA 1JKHA 5C42A 5GAGP 1J9AA 4B1VA 3IRXA 4O55A 2C1GA 4FW2A 3ZSZA 4IOCL 2UUCK 3K0SA 1UOCA 4YOVA 1JKZA 1XRSB 3BK3C 2D0AA 1RDUA 1IBKK 2ASPA 4DQPA 1JZAA 1VNBA 2YKNA 1NKCA 3D2FB 2GV9A 2EWSA 3GOIA 2KHOA 3SUPA 3QETA 4KI6A 4B1WB 1ZBSA 4B9TA 2G8HA 4FSVA 4MLEA 3OYIA 2YV0X 4DV1K 4CJLA 4DV6K 5LMNK 3OA9A 4DR5K 4CECA 2FC0A 2DFFA 3IFRA 3VQ4A 3WEEA 4JI3K 5CYQA 5AQYA 4CF2A 2KJAA 2VCPA 4A61A 3QBWA 1ZYQA 4B1YB 3LDLA 4Y1DA 4XH5A 2W41A 3N4PA 4OJRA 3J80O 2YNHA 4O8UA 5GADP 4IOAL 4BE1A 1XMOK 1L3SA 5CY4A 4NXMK 2ZQBA 4BR7A 1N8RO 2YBRC 2ZJQL 2NZTA 3CCRN 4PWDA 3ITHA 5EU7A 2ETJA 4PKIA 3H3NO 3SAGA 4I7FA 3P83D 4QS9A 3BF3A 3K57A 4Z4EA 2GWKA 1VSMA 3AAQA 4C8MA 3OJSA 4CBWA 1MDUB 1KV0A 4IJNA 3KK1A 5SZTA 4BRAA 1NRBA 5IWAK 3R2VA 1NKBA 3HM9A 4W5TA 1POIA 4AQYK 2MN5A 1BL3A 1GLAG 1W9HA 4KH4A 4FZXC 4J8FA 4Z4IA 5BPMA 4U67L 4JI7K 4NCBA 3PSIA 4J2EA 2HBJA 2PY5A 4I9QA 1YAGA 4H0YB 1YJ9N 1HJRA 1Q9YA 3WXMB 3LWMA 4DU3A 2GUPA 3D2EB 3VQ5A 2YNIA 4IBNA 1HPMA 4M63C 4LFBK 1BQMA 3RMCA 3AVJA 4FLTA 4M3TA 3PSFA 4YOWA 3THYB 2X78A 2HMIA 3LDSA 4KH6A 3K9KA 2N66A 2A7TA 3DRPA 3OYDA 3VF2A 2MBKA 1R59O 3HZ6A 3KZBA 5LJVA 3ULDA 3HSTB 1FKOA 2B68A 3LDNA 2P9PA 3MN7A 3SBGA 4KHUA 2YHXA 1RNHA 2YJFA 3EE9A 2E2FA 2QWRA 4OPHA 5LL6Z 1KAZA 3GL1A 4EHTA 4HVJA 2QWLA 3WQTA 3CJ7A 3AVBA 4F9OA 3OYGA 1X9WA 1S1WA 1TKXA 4DR3K 1WB9A 1ATSA 2HF3A 3MX2A 4IEEA 4CJVA 2IIRA 4I6MB 4WQ4A 3SPYA 3HTVA 3K59A 4FJ9A 3G25A 4DTUA 4DMNA 3KIOA 4A5AA 1ASWA 4FJGA 3ASMA 5BRDA 4FWRA 4KH5A 2XY6A 1ATNA 3ENHA 2OPQA 3V1QA 1NGJA 2O8FB 1WBBA 4CZEA 2QKBA 3O3FA 4M3XA 3O5BA 1VSKA 1S6PA 4RW6A 4CJ3A 4FPBA 3DLBA 3ZSVA 1T7BA 2I7NA 3L6QA 2BRZA 1LWEA 4E1NA 3PX6A 4EIAA 1RT3A 3KD1E 3CG7A 2Z1IA 2RHKA 2HHUA 3H3OB 4FW1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1WN7 A;  1BG3 A;  3LWL A;  2OPS A;  3E7R L;  4IFY A;  2P9N B;  1QQC A;  1JLE A;  4E3S A;  4AHR A;  1VHX A;  2N69 A;  3W0L A;  3CQ8 A;  1J53 A;  1BA1 A;  2IVO A;  4BWM A;  3TAE A;  1NGG A;  4CEB A;  2VQE K;  1XHZ A;  3QO9 A;  1JXE A;  1LW2 A;  1X9S A;  4NCG A;  3IG1 A;  1KRP A;  4YDU C;  1LV5 A;  1QSS A;  3E66 A;  5FPN A;  2ZGZ A;  1Z6R A;  3NCI A;  5HBM A;  4OPA A;  4KO0 A;  1BK8 A;  2QM1 A;  2G8K A;  1HLU A;  2HHX A;  1OH6 A;  4XIU A;  1KFD A;  2E6L A;  3R3L A;  3OHR A;  3QES A;  2DPN A;  2E6M A;  4RW4 A;  3SYZ A;  2Y1I A;  3FGU A;  4H03 B;  4PL7 A;  3DWL A;  3SMP A;  4DU1 A;  4JKA A;  1RT6 A;  4FK4 A;  3K5O A;  4K0K K;  1YTU A;  3SQ2 A;  3GE1 A;  2VYP A;  3P5J A;  1FW6 A;  1C0M A;  1YJN N;  5BR8 K;  2NRT A;  4DV7 K;  5DM6 L;  3B6P A;  1W97 L;  3DI6 A;  5DMR A;  4FK0 A;  4KHS A;  1SEG A;  3QEI A;  4BDY A;  3VGL A;  2LY6 A;  2KBK A;  3AVG A;  2XY7 A;  3QER A;  1CHZ A;  2O8C B;  5BN8 A;  3B8A X;  3OJU A;  2YC1 C;  4BE2 A;  3GG4 A;  1I2V A;  2O8D A;  3ZET B;  5E41 A;  4CQK A;  4NCA A;  3CJ1 A; 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