5AQNA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 124
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqnA04
4YDUC 3WQTA 2YI1A 2QWQA 2NRHA 3FZHA 3AAPA 3VEOA 2CH5A 5AFUH 2Q0RA 2IVPA 3DXKA 1X3MA 3BEXA 4CZGA 4FWQA 3SMSA 3ZX3A 5EXWA 3HZ6A 3C0BA 3VF2A 4FWKA 1NGDA 2A40A 3U9DA 2IIRA 4H5RA 2NLXA 2YHWA 3CERA 2YJFA 2YCHA 1ZXOA 4FWPA 1GLBG 3W3DA 4IWVA 1J6ZA 3BP8A 3FLCO 3L4IA 3U8XA 3VEZA 2E1ZA 4ISGA 4NB4A 2QWLA 3FR0A 4XEIA 4XH1A 2A5XA 4CBXA 4BR0A 3ULEB 1HX1A 1CZAN 3O08A 5CE3A 1HKCA 1U2VB 4BRKA 3M3ZA 1GLEG 3A5OC 4BVPA 1TYQA 1Y64A 3ATVA 4B1WB 3VOVA 1GLLO 4A61A 1MDUB 4GY2B 3IFRA 3MMVA 1BDGA 3AARA 2H3GX 3ID8A 4CZIA 3WUHA 5JICA 5AR0A 3UKRB 3C7NB 4H5VA 4BRDA 3EKUA 1MWMA 3VF6A 2GWKA 1RDWX 3EKSA 1T6DA 3F9MA 3D2EB 5FPNA 2WUSA 3TU5A 2P9UA 2PAVA 2Q0UA 2A3ZA 2ZGYA 3A5NC 5FPDA 1NGEA 3LM2A 2J4RA 3RSEA 3WXLA 1E4FT 4QS9A 1S22A 3LDNA 2AP1A 4PKHA 4BQZA 1C0GA 2QWRA 3M6GA 5KQ8A 1NGJA 2P9KA 3AAQA 3AY9A 3DXMA 3J8AA 2E20A 5E84A 3SLCA 1X3NA 4KBOA 1BWFO 1KXPA 4O8KA 1DKGD 3ZX0A 1E4GT 1NGGA 2CGJA 4BGAA 3WQUA 4CD3A 2KHOA 2E8AA 1HKGA 5BN8A 3LDQA 3CJ1A 1Q18A 3VGKA 3FZMA 4ISFA 4BGBA 3ULEA 3EN9A 1SZ2A 4IZ9A 1IJJA 3TPQA 4H0PA 3HTVA 3BF1A 3A5MC 3GE1A 1G99A 4DHYA 5LJVA 1TUYA 1S3XA 1QQMA 3CIPA 3KZBA 1JCEA 3VERA 1BA1A 3H6EA 3CQYA 3FGUA 3WXJA 4BRIA 1MA9B 4FWSA 4H03B 3FZLA 1QZ6A 3ATUA 4FL9A 1NGCA 3IDHA 4PL8A 4AM6A 5JMVA 1MWKA 3C7NA 3LDPA 3GBTA 4MO5A 1KAXA 2YHYA 4BROA 5BRFA 5F1XA 2GEMA 4WQ5A 4DQ8A 4BRLA 3EO3A 3H3OB 5TKYA 3D2EA 3ZETB 4JNEA 1GLFO 3FZFA 5BRDA 5BRHA 4PKGA 1XC3A 4BG8A 3H45C 1JCGA 1BG3A 2ASPA 3VENA 2FF6A 4XH4A 4CZJA 2E2NA 4E1JA 2FSNA 2P9NB 2FSKA 3GDQA 1JCFA 5E26A 4JD2A 2NZTA 3VGMA 1X9JA 1YUWA 3W0LA 4CZKA 2FXUA 3UE5A 4CBWA 4BRQA 5BR9A 2Q1NA 4XH5A 4BRGA 4MLEA 3DAWA 3L0QA 1K8KB 3JXUA 4A2AA 3GOIA 3KVGA 2P9IA 3R9PA 3I8BA 1KAZA 1GLCG 3ENHA 5AQYA 1HKBA 3A0IX 4B1UB 2ASOA 4K43A 3ZEUB 5KPRA 5EX5A 3O80A 1C0FA 5EVZA 3QBXA 4BRMA 4JHDA 2E2QA 2P9SB 4EAHD 5AQIA 4FWNA 3U4LA 5AQZA 4H5TA 3I33A 3SK3A 3D7EO 4Y0WA 5BPNA 2ZGZA 5AQLA 4BR9A 3P4IA 5F0XA 3MN6A 1NGAA 1SQKA 2D0PA 5AQKA 2EWSA 5AQNA 4IJNA 3HI0A 3CHWA 3UKUA 3UB5A 5JLHA 3D2FB 3DJCA 2GWJA 2P9PB 4YDUA 5AQGA 4CZEA 3QICA 4WQ4C 5KPZA 3ZETA 3LDOA 1T6CA 4DB3A 1U6ZA 3GL1A 1LCUA 2D1KA 4RWTA 3JS6A 1NGBA 2E2PA 1NLVA 1NGHA 2QWPA 5EOYA 5LJWA 3CJBA 5ELZA 5AQRA 4BQLA 3QMLA 3FZKA 4MO4A 3U9ZA 1SAZA 3HM8A 1WOQA 1RFQA 4QS8A 3IUCA 2GUPA 3MN5A 4K25A 4FOIA 5F2RA 4CZLA 2A42A 4H5NA 2I7PA 5AQJA 1RGIA 4BRFA 2E1YA 3LM9A 2CGLA 2Q97A 2VYPA 5AQQA 4CBUA 4B1XB 1IG8A 2UYTA 2ITMA 3DXKB 1LOTB 5AQSA 2VWBA 4B1YB 2W41A 3QDKA 5AFUA 2HMPA 1U2VA 4M7YA 5AZJB 3LDLA 1BUPA 3MN9A 3A5LC 4RTFD 1QHAA 4C23A 4BR4A 2V52B 4H0VB 3KHYA 4MLHA 2CGKA 4BRNA 3BUZB 3G25A 2BTFA 4CZFA 1P8ZA 4M63C 1GLAG 1R59O 4IJAA 5ADXH 3SMPA 5LY3A 1NGIA 3UKRA 4BR7A 4CZHA 3CJAA 1GLDG 2V51B 5AZIB 1NWKA 2FSJA 4AM7A 4BC5A 4J8FA 1TUUA 3QB0A 4H0TB 1ZBSA 1XQSC 3EL2A 4M7XA 2W40A 2P9LB 2Q31A 4IO8A 3MDQA 2V7YA 3S41A 5AQVA 4BRPA 3A8YA 4FWOA 4EFHA 1ESVA 3H46O 5AQFA 4EHTA 1WUAA 2BUPA 1HUXA 3O6WA 4FOEA 1OKJA 4QS7A 2F9TA 4BVOA 1V4SA 3L6QA 4A2BA 4BRCA 5JLFA 4BC2A 5BPMA 4HTLA 2OANA 4H0XB 3O1BA 4IXCA 1GLJO 2P9UB 1T44A 4BG9A 5AQMA 1QQOA 3RSEB 4BRHA 4B9QA 3H1VX 1YAGA 4Z94A 5AZJA 2IVOA 2HF4A 5AQOA 2QWNA 2P9KB 3B8AX 1D4XA 3DXMB 4BRAA 3VGLA 2HF3A 5AQHA 1Z6RA 3CJ7A 4GNIA 2VCPA 3QFUA 2F9WA 3O1WA 3R6MA 1QZ5A 2DPNA 3VESA 4H0YB 3ZX2A 2PBDA 2E2OA 4JN4A 4BC3A 2Q2RA 1ATRA 1NMDA 3VETA 3ENOA 1NGFA 2CH6A 1YVNA 2QXLA 1Z05A 5AZIA 1NBWA 3R8EA 5BPLA 4FPBA 2YHXA 5AQWA 3DWLA 5AQUA 3H1QA 3HSCA 1BOTO 2P9LA 4FWRA 2D4WA 1XUPO 2QW9A 3WXKA 4BC4A 3LL3A 4CJ7A 4CZMA 3WEEB 1DGKN 3CETA 5EY4A 3VEWA 4O5FA 2P9NA 3OHRA 2GELA 4LC9B 1NM1A 3H3NO 3M1FA 3CI5A 3CJCA 4I6MB 5ADXA 3HBTA 4FWLA 4ISEA 4PKIA 4WQ5C 1K8KA 1HJOA 4L3QA 1HLUA 4PL7A 5AQPA 2ZF5O 1EQYA 4EHUA 3EZWA 3O5BA 4BR5A 3IMXA 5AQTA 4HWIA 1ATNA 4WYBA 3VEYA 1H1VA 3ZEUA 5B8HA 3BF3A 1BU6O 5FPEA 2D0OA 4JAXA 5FPMA 2P9SA 3WT0A 3QBWA 5AQXA 3MK6A 1V4TA 2QM1A 4JD2B 2QWMA 2FLOA 5I9EB 5BREA 1DEJA 3FE1A 3O8MA 4BR2A 4H0OA 5KPTA 3WXIA 4B1ZA 4EIAA 5BN9A 5KQDA 4K42A 4BREA 2HOEA 2A41A 2A6AA 1BA0A 1HPMA 2QWOA 3CJ9A 3VF4A 4CD1A 2P9IB 3D2FA 4FWMA 2P9PA 2ASMA 4WQ4A 3CQXA 2Q36A 1ZC6A 2IVNA 3VEVA 2I7NA 4K41A 4FO0A 1QQNA 4JHDB 4DCHA 3VEXA 1KAYA 3O4WA 4B1VA 1YXQA 2GTDA 2V7ZA 1TYQB 2ZWHA 2E88A 4FSVA 4CI6A 3VPZA 3WEEA 1BO5O 2YJEA 3SJHA 2FF3B 4H5WA 3GG4A 4A62A 3FFKB 4F9OA 3UKUB 3MN7A 4RCHA 4FPAA 1ATSA 3MCPA 3QFPA 4NO7A 2AA4A 4I6MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YDUC 2YI1A 4FXDA 3LP0A 4CHYA 4DS4A 2WC9A 2P5GA 2AJQA 2NRHA 3AAPA 4AQYK 2CH5A 4KRFA 4FJNA 4W5NA 4CGHA 1K6YA 5EXWA 1UWBA 3C0BA 1I2VA 1UA0A 2YHWA 4DLGA 3Q7CA 4M41A 1IKYA 4WE1A 1HMVA 4CEZA 4FJ7A 3AO3A 1DTQA 2Z1IA 4NB4A 2QWLA 1VSIA 4XH1A 1RDBA 2A5XA 3L2RA 4CBXA 4DFKA 3QEPA 4E7LA 1LV5A 3ULEB 1HX1A 1CZAN 3O08A 1FK9A 4CHOA 3K5NA 4B9LA 3ISNC 5A2QO 4C8LA 4GVMA 3A5OC 1TYQA 3PX6A 3NH0A 3MXJA 4R5PA 2HMIA 2XY5A 1MDUB 1Z25A 3O9UA 4JK9A 4CJQA 4HTUA 1RT5A 4FK0A 1NKEA 1RT4A 4QOZB 4Z4HA 4F2RA 2H3GX 4CZIA 4CF8A 3V6DA 1LWCA 4CHQA 3VF6A 1SL0A 1O13A 3F9MA 4AHUA 3TU5A 2P9UA 1S1UA 2Q0UA 3SNNA 4CGIA 4MQ3A 1E4FT 3NF9A 3HVTA 1LWFA 1BMRA 2UU9K 2MN5A 3M6GA 4DTRA 2QA4N 5E41A 1T7BA 3AY9A 3DXMA 4F3TA 4YOYA 4F3OA 1DKGD 4BWMA 4N76A 1NJZA 2A1SA 1L3VA 4CJ5A 4J2AA 3WQUA 3VQ7A 2KHOA 2E8AA 1J5OA 5J2MA 3BK3C 4H4MA 4JI6K 4ISFA 4KO0A 4BGBA 3EN9A 1SZ2A 1OH7A 4N5SA 3KJVA 1EETA 4K8XA 4H0PA 4Z4CA 3HP9A 4UADE 2VG5A 3GE1A 3AA3A 1KSPA 1E3MA 1RBTA 4JK7A 1QQMA 2G2KA 2BGGA 4AB0A 3CIPA 3ZLJA 3P83D 3KZBA 3L2WA 4FK4A 3H6EA 5AJ3K 3MEEA 1B92A 3CQYA 3HT3A 1MA9B 4FWSA 4DU4A 1RT6A 3FZLA 3ATUA 2G8IA 2KBJA 4CK1A 5KGXA 1S5JA 3CC7N 4DTUA 2NRXA 3ITHA 4B9NA 3NVKA 4MO5A 4JI4K 4AF1A 1ZBUA 4BROA 2GEMA 2HBJA 4BRLA 1C1BA 4E7IA 3ZETB 1WBDA 1ASUA 4PKGA 4FJMA 3H45C 5DM7L 3CC2N 3IS9A 2YKMA 1JCGA 2ASPA 3NF7A 4FM2A 1T03A 4FLUA 1OH5A 2BDPA 4UJ0A 1CXQA 4DF8A 2OA8A 4CZJA 3K9JA 4JI1K 1TAQA 2B4JA 2O4IA 5E26A 3SPZA 4B9SA 4J2BA 4O0JA 1YUWA 3W0LA 3HPHA 4E7KA 3LANA 4BRGA 4DR1K 2YHBA 3JXUA 3E01A 1U45A 2P9IA 3R9PA 2WTUA 3PX0A 3I8BA 3F9KA 1KAZA 2HVHA 3A0IX 4K43A 3ZEUB 4AHTA 3OBYA 5KPRA 4BECA 3IKMA 3O80A 4E0DA 2VG7A 4FW1A 3NFAA 4JHDA 4DKWA 2P9SB 1QS4A 3U4LA 4Q5VA 1RDAA 5AQLA 4BR9A 3R3LA 5JS1A 4JKGB 5AQNA 3UKUA 2GBZA 1RBVA 4CJRA 2KBKA 3HO1A 5JLHA 3D2FB 3DJCA 4CF1A 1IKVA 4YDUA 3KK1A 4E72A 3O3GA 4YY3K 4UAEF 2ZJRL 4KI4A 1W7AA 1VQLN 4OGEA 3JS6A 3VQ8A 4JS4A 1NLVA 3KKSA 5EOYA 1WSGA 5T7BA 4OPJA 1SEGA 1T7EA 5ELZA 4HUFA 5LMNK 4LD0A 4CFDA 3U9ZA 1SAZA 3QINA 4K25A 4FOIA 4CESA 1UA1A 4JKCA 4V19S 2I7PA 4DTJA 4BRFA 3LM9A 2Q97A 2VYPA 4DV2K 3C6AA 4CECA 4DTOA 2UYTA 1T7AA 4R79A 2EX3A 3G6EN 3OYEA 3VTHA 1LOTB 3DRSA 3HPGA 1B9FA 2W41A 3DYAA 3QDKA 4JI7K 4PUOA 2G8FA 2W42A 1QHAA 4C23A 1EWQA 3SCXA 2CGKA 3OTOK 1RDDA 1R59O 4IJAA 5CHIA 2EHGA 3RVCA 5HL7L 3SMPA 4LSNA 5AZIB 3KK2A 1VSEA 2HB5A 3O9SA 3KWIA 1KVBA 1TUUA 3QB0A 2JDQD 4H0TB 4ID5A 2HBLA 3WNEA 4AHVA 3LWLA 4DUZK 2W40A 3MDQA 4A5BA 4WCEL 3L2QA 4KAZA 1DTTA 4NYFA 4FYDA 1PTXA 5AQVA 4BRPA 1Q81O 4JI2K 1SV5A 2BANA 3MEDA 4EFHA 4PA1A 3K2PA 5BR8K 4E3SA 4C8KA 3NMUA 1VSHA 4FJ5A 2F8TA 2GX9A 4JKAA 3PSIA 4HUGA 1OKJA 2SN3A 3OYFA 4FZZA 4W5RA 2E5LK 3L6QA 4A2BA 3SAHA 4H0XB 1N32K 5H1SQ 1Q82O 3O1BA 3DLHA 1YF5L 2HSTA 3KOXA 1JLBA 3T1AA 1N8RO 2JWKA 4LFAK 3T19A 4BRHA 3LWMA 3KP1A 4Z94A 4LFBK 3DLRA 4JRQA 2HF4A 5GAHP 4DTNA 1I6FA 4CGDA 3AO4A 3VGLA 3PSFA 2F9WA 4A5AA 3KKRA 4W5TA 4F4KA 4H0YB 1L3SA 1ZBFA 3C6UA 3QNNA 3PX4A 3NDKA 1VNAA 3OY9A 2E2OA 3MXMA 3ENOA 5J2NA 2CH6A 4CJLA 1YVNA 1RBRA 1Z05A 1HRHA 5JVGL 1S1XA 2ATQA 3L3VA 2XHBA 3TANA 4C8OA 4Z4IA 5AQWA 1WAFA 1BOTO 2P9LA 4U67L 2WONA 4RW8A 2QI2A 4CFAA 1GOAA 4BC4A 1B7DA 3LL3A 4CZMA 5J2PA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4YDU C;  2YI1 A;  4FXD A;  3LP0 A;  4CHY A;  4DS4 A;  2WC9 A;  2P5G A;  2AJQ A;  2NRH A;  3AAP A;  4AQY K;  2CH5 A;  4KRF A;  4FJN A;  4W5N A;  4CGH A;  1K6Y A;  5EXW A;  1UWB A;  3C0B A;  1I2V A;  1UA0 A;  2YHW A;  4DLG A;  3Q7C A;  4M41 A;  1IKY A;  4WE1 A;  1HMV A;  4CEZ A;  4FJ7 A;  3AO3 A;  1DTQ A;  2Z1I A;  4NB4 A;  2QWL A;  1VSI A;  4XH1 A;  1RDB A;  2A5X A;  3L2R A;  4CBX A;  4DFK A;  3QEP A;  4E7L A;  1LV5 A;  3ULE B;  1HX1 A;  1CZA N;  3O08 A;  1FK9 A;  4CHO A;  3K5N A;  4B9L A;  3ISN C;  5A2Q O;  4C8L A;  4GVM A;  3A5O C;  1TYQ A;  3PX6 A;  3NH0 A;  3MXJ A;  4R5P A;  2HMI A;  2XY5 A;  1MDU B;  1Z25 A;  3O9U A;  4JK9 A;  4CJQ A;  4HTU A;  1RT5 A;  4FK0 A;  1NKE A;  1RT4 A;  4QOZ B;  4Z4H A;  4F2R A;  2H3G X;  4CZI A;  4CF8 A;  3V6D A;  1LWC A;  4CHQ A;  3VF6 A;  1SL0 A;  1O13 A;  3F9M A;  4AHU A;  3TU5 A;  2P9U A;  1S1U A;  2Q0U A;  3SNN A;  4CGI A;  4MQ3 A;  1E4F T;  3NF9 A;  3HVT A;  1LWF A;  1BMR A;  2UU9 K;  2MN5 A;  3M6G A;  4DTR A;  2QA4 N;  5E41 A;  1T7B A;  3AY9 A;  3DXM A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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