5AQNA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
b'MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 124
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqnA04
2PBDA 2IVPA 3WQUA 1BU6O 4PKGA 3U4LA 2CGKA 1GLFO 3H1QA 2AA4A 4BROA 4BRKA 2I7NA 1GLCG 3G25A 3A5MC 3WXJA 4C23A 5JLFA 5BR9A 4M7YA 4EHUA 1BA1A 5AQWA 1X3NA 2EWSA 3GE1A 2QWNA 5AQNA 2E2OA 2HOEA 2Q2RA 5AZJB 3LDLA 2E1ZA 1NGJA 1BOTO 5FPNA 4BC3A 5I9EB 4PL7A 1TYQA 3CJCA 3ENHA 3H1VX 3FZMA 1NBWA 2ZF5O 4PKIA 3FZFA 3VEWA 2FF3B 4MO5A 3CQYA 2FSKA 4CD3A 1ZC6A 5E84A 2V7ZA 3MN5A 1GLLO 3VF6A 1NM1A 1S22A 3A5LC 4RWTA 3QICA 3WT0A 3HTVA 3QB0A 3VF4A 2QWPA 4B1WB 3FGUA 3QFPA 4K42A 5JLHA 4BRCA 4Y0WA 1QQNA 3LDNA 1NMDA 2FLOA 3MDQA 4WYBA 4BQZA 5F0XA 1XUPO 4JN4A 4BR2A 1QHAA 2P9IB 3BP8A 4FOIA 4XH4A 2P9SB 5F1XA 1ZBSA 4DCHA 1IJJA 4CZKA 3CJAA 3O6WA 3AY9A 4B1YB 4CZGA 5BREA 5AQJA 1T6DA 2FXUA 1QZ6A 4FWRA 4JD2B 4DB3A 3EKUA 2HF3A 5AQUA 3DXMA 2UYTA 3O1WA 1U6ZA 3AARA 3VETA 5JMVA 4BG8A 2BUPA 1ZXOA 2YHWA 3VENA 2P9UA 1GLDG 2Q1NA 1X3MA 3ZX3A 3M3ZA 4BQLA 4DQ8A 1CZAN 2PAVA 3BEXA 1DGKN 2P9PB 5KPRA 4RCHA 3VGKA 4CZIA 1TUYA 1U2VB 1DEJA 4BG9A 3RSEA 5AQRA 2V51B 4BC4A 3ULEA 2YCHA 1J6ZA 1V4SA 3A5NC 4YDUC 2E1YA 1GLBG 1MWKA 3IFRA 3F9MA 3WQTA 3I33A 1Z6RA 4CZHA 3S41A 1P8ZA 4CBUA 2P9KA 4B1ZA 5JICA 2CGLA 5BN9A 3QMLA 4CZEA 3O4WA 1SAZA 4B1UB 3A0IX 3LM2A 3BUZB 4H5NA 3UKUA 5AQHA 2GWKA 3WEEB 4IO8A 1SQKA 5AFUA 4I6MB 4FSVA 2BTFA 4M63C 2OANA 3VEXA 4EAHD 1IG8A 3O5BA 2CGJA 3EO3A 3DWLA 1X9JA 4ISGA 5TKYA 2A5XA 3DXKA 3R9PA 1KAXA 3L4IA 1BG3A 2YHYA 3MN7A 1C0FA 3HI0A 2YJEA 5ADXA 5CE3A 5EXWA 1EQYA 1T6CA 1NGBA 2NZTA 3H45C 4H5RA 3W3DA 3H46O 2QW9A 4FOEA 4GNIA 4A2BA 4JNEA 1Z05A 2NRHA 2FSJA 2ZGYA 3MN9A 3SMSA 2DPNA 3ID8A 4FL9A 1GLJO 2A42A 2QM1A 5AZIA 3U9ZA 4H5TA 3JXUA 1BDGA 1YXQA 4FWQA 2GEMA 3VGMA 4H5VA 2P9NA 2YHXA 4A2AA 3O08A 1ATRA 4ISFA 4IXCA 3CETA 5AR0A 3SLCA 1TYQB 4BC2A 2P9LA 5AQXA 1TUUA 3H3NO 1BO5O 4HTLA 1HPMA 2A41A 2E20A 3GG4A 1RGIA 3KZBA 1YAGA 3FE1A 2D4WA 1E4FT 4FWKA 2VWBA 4CZLA 1ESVA 1KXPA 3OHRA 4K25A 1G99A 1Y64A 4BRPA 2FF6A 1T44A 1WUAA 4FWNA 5AZJA 2GTDA 4IJAA 4K43A 4BRLA 3H3OB 3MMVA 5AQMA 3MK6A 2A40A 3ZEUA 4XH5A 1LCUA 4WQ4C 3ENOA 1QZ5A 2YI1A 3O80A 1GLAG 1NGHA 3CJ7A 2E2NA 3DAWA 3VESA 4BRDA 3GDQA 4CBWA 3FLCO 3D2FA 2YJFA 3ATUA 2ASPA 1NGFA 2IVNA 4JHDA 3IMXA 5EOYA 4FWSA 5BRDA 3VEZA 3DXMB 1H1VA 4BR0A 3GL1A 4CBXA 1YVNA 1NGGA 2D0OA 2P9UB 5BN8A 4K41A 3EL2A 2Q0RA 2GELA 5AQKA 3DJCA 4BRHA 5BPMA 4BR7A 2ITMA 3D2EA 1HJOA 1HKCA 2VYPA 3CJ1A 2GWJA 1QQOA 3EN9A 3B8AX 2Q36A 2QWLA 3CJBA 3GOIA 4CZFA 4BR4A 3SJHA 4Z94A 5AQQA 4WQ4A 2J4RA 5LJWA 1DKGD 3P4IA 4BVOA 3J8AA 3TU5A 2P9KB 3U8XA 4BR9A 4HWIA 4EFHA 4MLHA 4B9QA 4CJ7A 1KAZA 5BRHA 5FPEA 4CD1A 3TPQA 3O1BA 3HBTA 3GBTA 1ATNA 4BRMA 4BRNA 4H0OA 3UKUB 4H0YB 5AFUH 3C7NA 1Q18A 4FWPA 1K8KB 4MO4A 2ZWHA 4M7XA 2GUPA 3O8MA 3DXKB 3VEOA 5F2RA 4WQ5C 4IZ9A 1HKBA 3EKSA 3HSCA 5AQGA 4JAXA 5AQZA 3LM9A 4O5FA 4FWMA 2E2PA 2VCPA 4PKHA 5ADXH 2E88A 4BRIA 5ELZA 4B1XB 3ZX2A 3WEEA 4BGAA 3WXKA 2W40A 3UKRA 3ZETA 1HKGA 1BUPA 3ZX0A 5B8HA 4YDUA 4EIAA 3HZ6A 4BREA 2D0PA 5AZIB 4AM7A 4O8KA 2HMPA 4LC9B 3CQXA 3M6GA 2HF4A 1RDWX 2P9NB 2E2QA 4AM6A 3FZHA 3CI5A 3IUCA 1NGCA 4H0TB 3EZWA 3LDOA 4XH1A 5AQYA 1NGIA 3FR0A 4CZMA 1JCEA 2P9LB 2D1KA 2IVOA 4MLEA 5KPTA 3IDHA 5EVZA 1R59O 4IWVA 2CH6A 4QS7A 3C0BA 3KVGA 4BRGA 2IIRA 3A8YA 1E4GT 3I8BA 5AQPA 4WQ5A 3L6QA 2QWOA 3QBWA 1RFQA 1KAYA 1ATSA 3U9DA 4L3QA 3BF3A 4QS8A 4FWLA 3ATVA 5AQFA 5LY3A 3VEYA 2ASOA 1D4XA 5EY4A 3ZEUB 4BRQA 4NO7A 3WUHA 2F9TA 3SMPA 4BRFA 2V52B 4QS9A 5LJVA 2QWRA 3UE5A 5AQIA 3QBXA 3D2FB 2H3GX 3CIPA 4KBOA 2V7YA 1MA9B 5BPLA 4B1VA 3BF1A 4JHDB 1XC3A 4IJNA 4A62A 4PL8A 3CHWA 1MWMA 4CI6A 1S3XA 2AP1A 4NB4A 3LDQA 1BWFO 3LDPA 2ZGZA 1JCFA 1NLVA 4BC5A 2P9IA 3QFUA 2P9SA 3H6EA 3JS6A 4J8FA 3AAPA 4H03B 2A3ZA 2F9WA 2FSNA 1XQSC 3D2EB 4H0VB 5AQTA 4XEIA 2Q97A 3RSEB 4JD2A 4E1JA 4F9OA 3CERA 4ISEA 3ULEB 1NGAA 4BR5A 4BRAA 4BVPA 5EX5A 4FO0A 2W41A 3VF2A 4CZJA 2KHOA 3CJ9A 5BRFA 5AQOA 1LOTB 2QXLA 4FPBA 3UB5A 1MDUB 2P9PA 4EHTA 5FPDA 3W0LA 1HX1A 1NGEA 5KQ8A 5BPNA 2ASMA 1U2VA 2Q31A 3FZLA 5E26A 3VOVA 3L0QA 3R6MA 3A5OC 3WXIA 5KPZA 3MCPA 3VEVA 3KHYA 3C7NB 1NGDA 1HUXA 3MN6A 1V4TA 1GLEG 3M1FA 1YUWA 1C0GA 3LL3A 5AQSA 4H5WA 2QWMA 4GY2B 5AQLA 3VERA 2WUSA 3R8EA 3HM8A 1WOQA 1BA0A 1OKJA 5KQDA 5AQVA 2I7PA 3D7EO 1QQMA 4RTFD 3VGLA 3FZKA 1JCGA 4FPAA 4H0PA 4DHYA 4A61A 3UKRB 3ZETB 5FPMA 1NWKA 4H0XB 4I6MA 3FFKB 3SK3A 1K8KA 2Q0UA 3QDKA 2A6AA 1HLUA 1SZ2A 2QWQA 3WXLA 4BGBA 4FWOA 2E8AA 2CH5A 2NLXA 3AAQA 3VPZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2IVPA 3OYJA 1SN4A 4PKGA 3U4LA 2CGKA 2FBXA 2MZ0A 4JKCA 4DQIA 2BANA 4FJHA 4BROA 3NHGA 1B92A 3EE9A 3P39A 3NDKA 1RBSA 3WXJA 4C23A 2QK9A 4W5TA 2YHAA 2EWSA 4CJLA 1UAXA 3GE1A 4E72A 4IFVA 2QWNA 1D9DA 2Q2RA 1KFSA 1BOTO 2PFUA 3ENHA 2ZF5O 4CEAA 4OPKA 1L3UA 3AO3A 4MO5A 5KRSA 5E84A 1RDUA 2XY7A 3VF6A 2UUCK 3A5LC 3QICA 3WT0A 4B9UA 4UAFE 3HTVA 3QB0A 4G1QA 1JLFA 5KK4A 4B1WB 5JLHA 1RDCA 4Y0WA 4BQZA 1XUPO 3BP8A 4PUOA 3VQQA 5F1XA 1ZBSA 1IJJA 1Z26A 4E7HA 3AY9A 4E7IA 1KV0A 5DK5A 3V9WA 1T6DA 4KHWA 1QZ6A 4JD2B 4DB3A 2HF3A 4DV6K 4OLBA 3OS2A 1U6ZA 3Q7BA 3TTFA 5GAGP 3NVMA 2YHWA 4OGEA 1GLDG 2Q1NA 1X3MA 4KFBA 4OKEA 2RF2A 3M3ZA 1JLCA 4B3OA 4I2QA 1T03A 4ID5A 4F8RA 4LH4A 3Q7CA 3OW2M 4RCHA 1S1WA 3RSEA 5AQRA 1NOZA 4X66K 3JSMA 3J7ZO 3QERA 1OMYA 2F7TA 3V6DA 3CC7N 1S9GA 3F5TA 3ULEA 3PO4A 1FXXA 1J6ZA 4FCYA 3KD1E 3ZT0A 4JI0K 2EHGA 1N6QA 4IG3A 3WQTA 3CPEA 5J2QA 4CZHA 3S41A 3EZ5A 2P9KA 3ZT2A 2F4VK 4JS5A 2G8IA 1VQNN 2CGLA 3QMLA 1BRZA 3E7UX 3KC6A 1SAZA 3A0IX 5CYQA 1KVBA 1RBUA 2UXDK 3HXMA 3WEEB 2WBNA 1ASVA 2BTFA 4M63C 3VEXA 5JS2A 5GIOA 3OYKA 4DQRA 3WNHA 3C6AA 4ISGA 5TKYA 2O4IA 3TR8A 1X9MA 5HOOA 2F8TA 1KAXA 2XO7A 1BG3A 3OBWA 4CF2A 4X62K 4DLGA 1WSHA 4DTSA 4J2BA 5HP1A 2YNFA 5KI6A 5CE3A 3TARA 1T0ZA 3G10A 2NZTA 3SAFA 2QW9A 4FOEA 5H1SQ 3O3FA 4LD0A 5FDLA 1FH3A 1EXQA 4FL9A 1GLJO 2A42A 5AZIA 2DFFA 3OYEA 2E6LA 1T7PA 4OKJA 1D5AA 3KOYA 2RN2A 4EZ6A 4UJ0A 4IXCA 4DFJA 4CFCA 3CETA 4C8NA 4BC2A 4DSLA 4CHOA 1J5OA 4DFMA 4FLYA 4WF9L 1GOBA 3IKMA 3RWUA 4K25A 3CPWM 4FM1A 3CFRA 1RT7A 3BK3C 1WUAA 5AZJA 4CJWA 1JJ2M 1C0TA 1VNBA 2O8DA 2KKZA 2Z1GA 4DF4A 2LT8A 1QTMA 4FXDA 1LCUA 2PZSA 1TK0A 3O80A 1NGHA 3ZT3A 4DQPA 4CBWA 4KB1A 1LQQA 1BCOA 3FLCO 3D2FA 4KHUA 2Q3SA 2YJFA 1CLQA 3ATUA 4A57A 4CF9A 1QSLA 2IAJA 3IMXA 1SEGA 1ICAA 4JS4A 3VEZA 3AO2A 1H1VA 1RDAA 2KLAA 1YVNA 4CBXA 1NGGA 4JI7K 4K41A 1N5YA 4WFNL 4H4OA 3AVAA 3EL2A 2OPPA 3SQ1A 3OYDA 1VSIA 4JI5K 3K57A 2VG7A 3T1AA 2HBJA 3TI0A 1HJOA 4DQQA 4AHTA 4E19A 2GWJA 4KI6A 3O4NA 4O44A 3HP6A 1NRAA 4Z94A 1DJTA 5AQQA 1ZBLA 3R2VA 3DLEA 5MLCQ 4WQ4A 4LFCK 4BVOA 2UUAK 2O4GA 2P9KB 2G2KA 4BR9A 1I2VA 4B9QA 5FPEA 3RR8A 1ZU3A 3TPQA 4FJXA 3AVGA 4BRMA 3AVKA 1KLMA 3KK3A 3SPZA 1KFDA 1SKRA 5J2NA 3CMEN 2ZWHA 4M7XA 4QCLA 4ELTA 3S5TA 1HKBA 3EKSA 3HSCA 5AQGA 3O3GA 4IBNA 2E2PA 2ATBA 2NRZA 4BRIA 4DMNA 4YOUA 1QSYA 2LJ7A 4NCGA 3WXKA 1NKEA 3DLRA 1N34K 3CD6N 1JXCA 3TSUA 4OX9K 3DOKA 4J2EA 1NK8A 4YDUA 1KCFA 4B9TA 2KSKA 2WOMA 3HZ6A 2D0PA 2LN8A 5AZIB 1PX9A 4AM7A 4KO0A 4DTXA 3AGRA 4OKKA 1RT4A 3CI5A 5C15A 3QEWA 3IUCA 4A5BA 4JKGA 1NGCA 2ITGA 3EZWA 4JKFA 1VSDA 1UA0A 4CF8A 4LH5A 1SV5A 4IEEA 4DFPA 2BDPA 1VQ9N 1WLJA 2IVOA 1IBMK 4IWVA 4Z4CA 2GX9A 5K14A 3C0BA 4BRGA 3AO4A 3A8YA 4WQ5A 3L6QA 3QBWA 1RFQA 1Q82O 1VQ6N 4V19S 3QINA 2KW4A 1ATSA 4L3QA 4KAZA 3BF3A 3SYZA 1Q9XA 3ATVA 3R3LA 2O8DB 1VSHA 2ASOA 3MEGA 1L3VA 4OGCA 2F9TA 4E7KA 4FZZA 2V52B 5C0YA 1P0AA 3L2UA 5AQIA 4EP5A 3D2FB 2IGIA 1N33K 2FBVA 2RKIA 1VQ4N 4IJNA 4A62A 3TWHA 2Y1JA 4JK9A 3CHWA 4I7FA 1S3XA 3QNOA 3HVRA 1DTQA 2KJAA 4NB4A 3THXB 4M41A 1LAVA 3LDSA 1YJNN 2HNDA 5HLFA 5CR4A 1K6YA 1U47A 2P9SA 1LW0A 3CQ8A 2A7TA 4J8FA 4GV9A 1P00A 2A3ZA 2E3FA 5M1OA 2FSNA 2D0CA 2FBYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2IVP A;  3OYJ A;  1SN4 A;  4PKG A;  3U4L A;  2CGK A;  2FBX A;  2MZ0 A;  4JKC A;  4DQI A;  2BAN A;  4FJH A;  4BRO A;  3NHG A;  1B92 A;  3EE9 A;  3P39 A;  3NDK A;  1RBS A;  3WXJ A;  4C23 A;  2QK9 A;  4W5T A;  2YHA A;  2EWS A;  4CJL A;  1UAX A;  3GE1 A;  4E72 A;  4IFV A;  2QWN A;  1D9D A;  2Q2R A;  1KFS A;  1BOT O;  2PFU A;  3ENH A;  2ZF5 O;  4CEA A;  4OPK A;  1L3U A;  3AO3 A;  4MO5 A;  5KRS A;  5E84 A;  1RDU A;  2XY7 A;  3VF6 A;  2UUC K;  3A5L C;  3QIC A;  3WT0 A;  4B9U A;  4UAF E;  3HTV A;  3QB0 A;  4G1Q A;  1JLF A;  5KK4 A;  4B1W B;  5JLH A;  1RDC A;  4Y0W A;  4BQZ A;  1XUP O;  3BP8 A;  4PUO A;  3VQQ A;  5F1X A;  1ZBS A;  1IJJ A;  1Z26 A;  4E7H A;  3AY9 A;  4E7I A;  1KV0 A;  5DK5 A;  3V9W A;  1T6D A;  4KHW A;  1QZ6 A;  4JD2 B;  4DB3 A;  2HF3 A;  4DV6 K;  4OLB A;  3OS2 A;  1U6Z A;  3Q7B A;  3TTF A;  5GAG P;  3NVM A;  2YHW A;  4OGE A;  1GLD G;  2Q1N A;  1X3M A;  4KFB A;  4OKE A;  2RF2 A;  3M3Z A;  1JLC A;  4B3O A;  4I2Q A;  1T03 A;  4ID5 A;  4F8R A;  4LH4 A;  3Q7C A;  3OW2 M;  4RCH A;  1S1W A; 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