5AQNA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MSKGPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 124
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence C, E
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqnA04
4K42A 3F9MA 4IO8A 3VEWA 2P9UB 2A5XA 2V52B 4BGBA 4BRDA 4EFHA 3LM9A 3DXKA 4BRHA 2GTDA 5JLFA 3CERA 3I8BA 4B1YB 2H3GX 3HM8A 2YI1A 3ULEA 3W3DA 1SQKA 2UYTA 4QS9A 1EQYA 2HF3A 4XH5A 1NGHA 3L0QA 1T6CA 2F9TA 1T6DA 3EKUA 4QS8A 2ZGZA 3FZFA 1MWKA 4WQ5A 2IVNA 3DXMB 2Q36A 4O5FA 2PAVA 5AQNA 5FPEA 4ISGA 3FZMA 3B8AX 4YDUA 2DPNA 1LCUA 1NM1A 4Z94A 4A62A 4BRQA 3KHYA 4FWOA 4PL8A 5LJVA 5EXWA 3GL1A 3M6GA 1QHAA 4JN4A 4BRNA 4CBWA 3R9PA 1E4GT 3IMXA 4A61A 2F9WA 3QBXA 3VF2A 2FSKA 4AM6A 1BO5O 1S3XA 4BR7A 4BRPA 3O8MA 1ESVA 3ENHA 2ZF5O 3SLCA 2QXLA 4A2BA 1NWKA 5EX5A 4BRGA 1HLUA 4EHTA 1OKJA 3CJBA 4J8FA 2E2NA 1NGBA 1TUYA 2IVPA 3L6QA 2P9SA 3RSEA 4JD2B 2E1ZA 3LDQA 1ZXOA 1YUWA 4BRFA 1NGFA 3EZWA 5EVZA 4FWQA 2FXUA 2E2PA 4PKIA 5AQHA 1GLDG 3ZETB 2BTFA 2E2QA 4BGAA 1R59O 3ATVA 2D1KA 1TUUA 1ZC6A 3ATUA 1HKGA 4FWPA 1D4XA 4BRMA 4AM7A 4EHUA 5AR0A 4BRCA 3SK3A 2Q1NA 3U8XA 5JICA 3UKUA 2YHXA 2E8AA 3D2EB 5AQVA 1QQNA 3LDPA 3D2EA 3GOIA 4CD3A 2P9KB 4H0VB 4EIAA 1KAZA 2Q0UA 1DEJA 3BP8A 5CE3A 5AQWA 3HBTA 3QICA 4I6MA 3ZX3A 3O1WA 4MLHA 1YAGA 4CJ7A 2AP1A 4BROA 1HKCA 3VEZA 3A8YA 5TKYA 1NBWA 3LM2A 4F9OA 2E2OA 2P9IB 5AFUA 5KPRA 4H5VA 4JHDA 4BQZA 1JCGA 3IUCA 4BVPA 5AQFA 4B1XB 3HTVA 3BEXA 3HI0A 4BREA 4RTFD 1CZAN 1JCEA 5AQOA 1WUAA 3H3OB 4H5TA 4BR5A 1TYQB 5AQYA 3OHRA 1TYQA 4BRLA 1NGEA 5EOYA 3GDQA 3SJHA 2FF6A 4NB4A 2HOEA 3DXKB 4BR4A 2I7PA 3FFKB 5BREA 3O5BA 4B1ZA 5AZJA 3AY9A 1BDGA 4CBUA 1J6ZA 2V7ZA 3ULEB 1RFQA 2Q2RA 2A41A 2HF4A 1NGGA 3CJCA 4FWRA 5BRFA 3FLCO 1RGIA 3S41A 1KAXA 5BRDA 3LL3A 2IIRA 4IJAA 4CZIA 2QWLA 4IXCA 2D4WA 2Q31A 1X3NA 2NZTA 4BRAA 3MN6A 5KPZA 4M7YA 4A2AA 1XUPO 1ZBSA 5AQLA 3WQUA 3C7NA 4CZEA 1X3MA 3VOVA 2ASPA 3EN9A 1ATSA 2GEMA 3DWLA 2GWKA 3WQTA 3UB5A 4XH4A 3WXLA 4DB3A 4LC9B 3CJ1A 2VCPA 4BC5A 2GWJA 3DAWA 4FOIA 2A3ZA 3A0IX 3MCPA 5AQRA 4PKGA 2J4RA 3MN7A 4H0OA 5B8HA 3EO3A 3J8AA 4IJNA 1U6ZA 4PL7A 1NGDA 3QBWA 1JCFA 1GLJO 2E88A 1RDWX 3VF4A 3R6MA 3KVGA 2VWBA 2W41A 5BRHA 3QB0A 3QFUA 2AA4A 2P9SB 1NGAA 4FOEA 4H0YB 4RCHA 3RSEB 3CJ9A 1LOTB 3WUHA 4CBXA 1HX1A 1SZ2A 1U2VA 2YHYA 3HSCA 1C0FA 1BU6O 5AQJA 1S22A 3FE1A 3IDHA 5I9EB 3C0BA 2CH6A 3UKRB 4FPAA 2BUPA 3WXKA 4B1VA 2P9PA 5F1XA 5AQSA 1QQOA 5AZIA 3UKRA 1XQSC 1HKBA 3HZ6A 4BVOA 3SMSA 4BC3A 4KBOA 1NGIA 5BPLA 1QZ6A 3O08A 3M1FA 2IVOA 3O1BA 1BOTO 3D7EO 3H6EA 4MO5A 4BG9A 2QWPA 4ISFA 4RWTA 4H5RA 3O6WA 3UKUB 2CGKA 3LDLA 2I7NA 3CI5A 4L3QA 4H0XB 5EY4A 3A5NC 2ASOA 4FL9A 4E1JA 3AAQA 3TU5A 5FPDA 3FGUA 2QWRA 4I6MB 2ITMA 1QZ5A 2E20A 4BG8A 3TPQA 2P9NA 4CZFA 3FZLA 1GLAG 3CETA 5KQ8A 3EKSA 2GUPA 3U9ZA 4C23A 3JS6A 1HJOA 4EAHD 2FSJA 1BA0A 3EL2A 3WEEA 5AFUH 2ZGYA 4BRKA 1T44A 4K43A 2CGJA 4WQ4C 1DKGD 4JHDB 5BPNA 2W40A 3MN9A 5AQMA 1MA9B 3GG4A 3JXUA 5JMVA 3H1VX 4O8KA 3ENOA 5FPMA 1K8KA 2A40A 1ATRA 3CHWA 4CZMA 3ZEUA 3WT0A 3O80A 4CZKA 4H03B 3D2FA 3AARA 2YCHA 1GLCG 5JLHA 4K41A 1NMDA 3H1QA 4B9QA 3VESA 4CI6A 2V51B 3H46O 3MDQA 5AZJB 2P9LA 3MN5A 2E1YA 5AQGA 3VF6A 3FZKA 5AQTA 4GNIA 5AQKA 1E4FT 3ID8A 2WUSA 3WXIA 5F0XA 4BQLA 2QWMA 1BA1A 4JAXA 4QS7A 1SAZA 4ISEA 5BN9A 3IFRA 5AQXA 1V4TA 2Q97A 5AQIA 1Q18A 4WYBA 1YVNA 3L4IA 1MWMA 3VENA 2QW9A 2P9UA 2Q0RA 5AQZA 1V4SA 3C7NB 4FWMA 4BC4A 1NGJA 3VGLA 3MK6A 4XH1A 3ZX0A 4CZLA 3VGMA 2NLXA 1GLLO 3I33A 1NGCA 3KZBA 1HUXA 3CJ7A 4NO7A 5FPNA 4H0PA 3DJCA 2YHWA 5AQUA 4Y0WA 4CZJA 4DQ8A 3A5MC 1XC3A 3VEOA 3DXMA 1QQMA 1BWFO 1H1VA 3QMLA 4WQ5C 2PBDA 5KPTA 3CJAA 3VETA 4B1WB 2QWQA 3FZHA 3WXJA 3LDOA 4PKHA 3VPZA 3CQYA 2ZWHA 1GLEG 4YDUC 1BUPA 4MLEA 4IZ9A 4FPBA 1HPMA 3GE1A 1U2VB 3SMPA 2D0PA 4BRIA 3BF1A 3P4IA 5LJWA 4BR2A 2V7YA 3GBTA 3H3NO 1NLVA 3VEVA 2D0OA 2P9PB 4FWNA 5AZIB 2FSNA 3CIPA 4CD1A 4FWSA 5F2RA 3CQXA 3MMVA 3W0LA 3VERA 3VEXA 4GY2B 1GLFO 4B1UB 4H5WA 1BG3A 5E26A 1C0GA 1Z6RA 3M3ZA 4FWLA 4BC2A 4JD2A 1GLBG 3G25A 2QM1A 1Z05A 1KXPA 3UE5A 2QWOA 1G99A 1ATNA 1WOQA 4MO4A 4HTLA 2GELA 5BR9A 4CZGA 2P9NB 3ZETA 4BR0A 5BPMA 4H5NA 2QWNA 3BF3A 4IWVA 3U9DA 3O4WA 1KAYA 3QFPA 1YXQA 4M63C 2EWSA 4WQ4A 3U4LA 4DCHA 2A6AA 5BN8A 3WEEB 2CH5A 2VYPA 3R8EA 2A42A 3BUZB 2CGLA 3A5LC 2OANA 4H0TB 5AQQA 4M7XA 2YJEA 4HWIA 1IG8A 2NRHA 2P9KA 2FF3B 4CZHA 1IJJA 1K8KB 3AAPA 3FR0A 1Y64A 4FSVA 5E84A 3ZEUB 5LY3A 3H45C 4JNEA 5ADXH 3VEYA 1DGKN 5ADXA 3D2FB 1X9JA 4FWKA 3ZX2A 1MDUB 3LDNA 4DHYA 2P9IA 3QDKA 2P9LB 4FO0A 2HMPA 4K25A 1P8ZA 2FLOA 4XEIA 4BR9A 5ELZA 2KHOA 2YJFA 5AQPA 5KQDA 2ASMA 3VGKA 3A5OC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4K42A 1FH3A 4N5SA 2HSTA 2G8FA 3FFIA 2A5XA 1S9EA 4CF0A 1N34K 5A2QO 3H08A 3ITHA 3AA4A 1BI4B 3IS9A 4FLXA 3KLIA 5CHIA 3HM8A 3BZKA 1K8AO 4IOXA 4QS9A 1EQYA 3ZT2A 1NGHA 1T6CA 1T6DA 3RR8A 4JKFA 4OLBA 3HM9A 4R5PA 3QEVA 1K73O 4HVJA 3AO4A 2QXFA 1NM1A 3QIOA 2DFHA 4FWOA 1VQON 4B08A 3GL1A 4E7HA 2UXBK 1T8EA 5CY0A 3AA3A 4I9LA 4OPHA 3RTVA 1C0TA 2F9WA 2YNGA 5GINA 4A5AA 1U4BA 3ENHA 2ZF5O 3SLCA 3SV4A 1DTTA 3HOTA 4A2BA 4DMNA 1NWKA 3LP3A 3O4QA 4BRGA 3MECA 3CJBA 3JAMO 1HNIA 3ZLJA 1EETA 3CCEN 2E1ZA 3LZIA 1OZZA 1ZXOA 5EU7A 3S3OA 2YEOA 1X9WA 2FXUA 2OPRA 4PKIA 1GLDG 2NRXA 2BTFA 1RT4A 3AO5A 3CXCM 4KV8A 1QS4A 4CFCA 1QSSA 2N69A 3DRSA 5CYQA 5MLCQ 3ATUA 3AVAA 4DV5K 1D4XA 2QKKA 4BRMA 3DRPA 4AM7A 4CHPA 1YTAA 4BRCA 4KTQA 1BISA 1S1VA 3U8XA 4FLVA 1SV5A 1NPIA 2A1RA 3C6UA 2O8CA 2E8AA 5AQVA 2ZM6K 1N8RO 1QQNA 3D2EA 4CD3A 4H0VB 2Q0UA 4E89A 3VA3A 3HPOA 5C2DA 5CE3A 1U48A 4I6MA 3VQDA 3ZX3A 1YAGA 2N66A 1ASVA 3ZT3A 3AO2A 4CJUA 1ZU3A 4F9OA 2P9IB 5AJ3K 3K5NA 3ULDA 1IBLK 3NH2A 3SPYA 3I55N 1HQUA 4DSIA 4CEDA 4Z4IA 5GADP 3QEXA 4YOWA 2LN8A 5I3UA 2UXCK 4CEEA 1VRTA 3WNGA 3JYTA 1WUAA 5KK4A 3NCIA 3RMAA 3OHRA 3VQ5A 4UJ0A 1NGEA 1YJWN 2G8VA 3KD5E 3NAEA 3ZSYA 4JS5A 3OYCA 3TTFA 1D9FA 1RNHA 4C8LA 1JLBA 1RDAA 2GBZA 2BANA 1YT3A 5C12A 2XHBA 1QTMA 4CBUA 1VNAA 1XNRK 2Q2RA 2A41A 1UA0A 4DF8A 1C1AA 5FLXO 3HP9A 4UAFE 3G71N 1YITN 3S41A 1RDUA 1Q86O 4CVNE 1VSDA 4KO0A 5BRDA 2G8KA 4CK3A 1NJWA 2IIRA 4O5BA 1RBVA 4IXCA 4BWJA 4DU1A 3PSIA 2NZTA 1TV6A 4KTWA 4Z4GA 4FVUA 1RT5A 4M7YA 1ZBSA 1JKHA 1S9GA 3VOVA 1ATSA 3CC4N 4DB3A 1D9DA 1TL1A 3CJ1A 5CR4A 4BC5A 4FOIA 3MCPA 1VQKN 5AQRA 2P51A 4O8UA 1WSJA 5B8HA 2Z1GA 1ZBFA 4PL7A 1NMNA 1JCFA 4I2QA 3K2PA 3OYHA 1KSPA 4CGIA 2D56A 4HHFA 5JVGL 4GV6A 1Q9YA 3VMFB 3MX2A 4KHPK 4FOEA 4N41A 3CJ9A 4CBXA 3WUHA 4OX9K 4NXMK 1Q81O 1C0FA 2NRRA 4KYPA 4OKKA 3FE1A 3C0BA 4WFBL 3O9SA 2P9PA 1GPSA 3CMEN 3UKRA 5AZIA 5M1QA 2I61A 1HKBA 2HNYA 4JKEA 1A5XA 1RILA 3HZ6A 5HL7L 2IAJA 3CCJN 4DF4A 3PX0A 1VSJA 1KTQA 2HB5A 3BGRA 5C0YA 1HNXK 4JI0K 3KK3A 2DY4A 4RWTA 3OYEA 4OGEA 4KI6A 4K8ZA 2PFUA 4M3TA 2ETJA 1NH5A 2YNHA 3DRRA 3CI5A 1IKVA 1SEGA 3A5NC 1UAXA 1JZBA 2OTJN 4FL9A 3NFAA 1FKOA 5FPDA 2E20A 3TPQA 1VSIA 1KVBA 4CZFA 3FZLA 4F8RA 4F3TA 3CETA 3EKSA 3U9ZA 4C23A 1NOYA 4AB0A 3C6AA 3RRHA 3EL2A 5AFUH 2ZGYA 4BRKA 3K59A 4CESA 4FLZA 1OH7A 2AJQA 4K43A 2OA8A 4WQ4C 2KFNA 2E3FA 4KPYA 2W40A 3MN9A 1A5VA 1WSFA 1J54A 2YKMA 2GMOA 3DLKA 3TSQA 3ENOA 2A40A 3O9TA 2GX9A 3CHWA 3EEQA 1JLQA 3VQQA 5C25A 4KHSA 4CEFA 4KRFA 2YHBA 1N5YA 1K9MO 4B3MK 3KKRA 1NG9A 3OS2A 1NMDA 2BGGA 3VESA 3K9KA 4CI6A 3H46O 2Z1IA 4BWMA 4E7KA 4AH9A 1KVAA 3O9UA 2ZJQL 1DT9A 1GOAA 4E7IA 4PUOA 5DMRA 3WXIA 5F0XA 3SCXA 1SL0A 1BA1A 3EE9A 1SAZA 3IFRA 4G1QA 5T7BA 2Q97A 1YVNA 3L4IA 1WB9A 4LH4A 3VENA 3J7ZO 1LQIA 4A57A 3C7NB 1NGJA 3VGLA 2KJAA 2W6KA 3PSMA 4I9QA 1PTXA 4IEEA 3AVIA 2YHWA 3NVMA 4Z4EA 2PYLA 4AHUA 5AQUA 4M3YA 4CJLA 4KH5A 4CZJA 3NH0A 4DQ8A 4CEAA 3TAPA 4ID5A 4B8CA 2W00A 3J7YP 3DXMA 4DTPA 1ICAA 3PLAA 3NH1A 1JXCA 4PHTX 4AILC 2OCEA 3QMLA 2WFBA 3L3UA 4B1WB 4LY7A 3FZHA 2QEXN 3VTHA 3T19A 3VPZA 2W6LA 1RDBA 4JI5K 1VSFA 4O4GA 4CJVA 4MLEA 4IZ9A 4FPBA 3THYB 1RBRA 1TKDA 4BRIA 4CK1A 4QCLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4K42 A;  1FH3 A;  4N5S A;  2HST A;  2G8F A;  3FFI A;  2A5X A;  1S9E A;  4CF0 A;  1N34 K;  5A2Q O;  3H08 A;  3ITH A;  3AA4 A;  1BI4 B;  3IS9 A;  4FLX A;  3KLI A;  5CHI A;  3HM8 A;  3BZK A;  1K8A O;  4IOX A;  4QS9 A;  1EQY A;  3ZT2 A;  1NGH A;  1T6C A;  1T6D A;  3RR8 A;  4JKF A;  4OLB A;  3HM9 A;  4R5P A;  3QEV A;  1K73 O;  4HVJ A;  3AO4 A;  2QXF A;  1NM1 A;  3QIO A;  2DFH A;  4FWO A;  1VQO N;  4B08 A;  3GL1 A;  4E7H A;  2UXB K;  1T8E A;  5CY0 A;  3AA3 A;  4I9L A;  4OPH A;  3RTV A;  1C0T A;  2F9W A;  2YNG A;  5GIN A;  4A5A A;  1U4B A;  3ENH A;  2ZF5 O;  3SLC A;  3SV4 A;  1DTT A;  3HOT A;  4A2B A;  4DMN A;  1NWK A;  3LP3 A;  3O4Q A;  4BRG A;  3MEC A;  3CJB A;  3JAM O;  1HNI A;  3ZLJ A;  1EET A;  3CCE N;  2E1Z A;  3LZI A;  1OZZ A;  1ZXO A;  5EU7 A;  3S3O A;  2YEO A;  1X9W A;  2FXU A;  2OPR A;  4PKI A;  1GLD G;  2NRX A;  2BTF A;  1RT4 A;  3AO5 A;  3CXC M;  4KV8 A;  1QS4 A;  4CFC A;  1QSS A;  2N69 A;  3DRS A;  5CYQ A;  5MLC Q;  3ATU A;  3AVA A;  4DV5 K;  1D4X A;  2QKK A;  4BRM A;  3DRP A;  4AM7 A; 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