5AQVA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 125
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqvA04
2NLXA 2GTDA 3DXKA 5F1XA 4H0VB 3UKRB 4K25A 1GLAG 2EWSA 5BREA 4XEIA 3IFRA 3TU5A 5KQDA 3L4IA 3EKUA 2ZWHA 4CZLA 5AQZA 4JN4A 3VEXA 1K8KB 5BN9A 5AQLA 2A3ZA 2Q0RA 5ADXA 1YXQA 2BTFA 3M1FA 2A42A 2QWNA 3CJBA 3O08A 4Z94A 3ATVA 4MO4A 1BA1A 2D0PA 3O5BA 4YDUC 4CZEA 4EAHD 1BDGA 1TYQB 1HKGA 4BC2A 5E26A 1Z05A 4M63C 1NGAA 3FZMA 3EN9A 3VERA 4CZKA 4YDUA 3FZFA 1WUAA 3HI0A 5EX5A 3UE5A 1KAYA 3U8XA 3R9PA 3UKUA 3L6QA 3BF1A 4CZFA 4K41A 3CHWA 3DXKB 5FPMA 4JHDA 4FPBA 3U4LA 2FXUA 2E20A 5AQTA 3GE1A 1BUPA 1BO5O 2QM1A 1BOTO 1QQMA 1C0FA 2NZTA 3WT0A 1SZ2A 1YUWA 3MCPA 2QW9A 1GLBG 2F9TA 1TUUA 4CZIA 2E88A 1S3XA 2ZGZA 5AQQA 3O80A 2I7PA 1NWKA 4BC4A 3LL3A 3VEVA 2YI1A 4HWIA 3MN9A 1WOQA 1SAZA 3VESA 4WQ5C 4PKHA 2QWQA 2V52B 1JCEA 3ZEUA 1HUXA 1HKBA 4M7YA 4BC3A 3WXKA 1JCFA 3JS6A 3MN5A 1X3MA 3EO3A 2CGLA 4BVOA 3HZ6A 5EY4A 3CJ9A 3AY9A 4FWRA 4H03B 4HTLA 3KHYA 1NGGA 3UKUB 4BRHA 5ADXH 3HTVA 2IIRA 5AFUH 1HX1A 4FSVA 1J6ZA 1KAZA 2ASOA 2YHWA 3GL1A 3FFKB 3O1BA 1ZBSA 3LDPA 5AQFA 4I6MA 4B1YB 4CZGA 3QBXA 4BQZA 3H3NO 1DKGD 5E84A 5AQPA 2QWPA 2ASMA 1ZXOA 3LDOA 3ENHA 3HSCA 3LDNA 3GBTA 5AQHA 3QMLA 3MDQA 4FWOA 4ISFA 1NGCA 2FSKA 4CBUA 1XC3A 3ZEUB 1DEJA 5AQXA 4EIAA 5TKYA 2E2PA 2GWKA 2Q2RA 5LJWA 3WQUA 4DHYA 3G25A 3CJCA 4BRMA 1NGJA 4A61A 1EQYA 3O8MA 4CD3A 2HOEA 1TYQA 5BN8A 3U9DA 4BRKA 3FLCO 4C23A 4I6MB 4K43A 1R59O 3DAWA 3R6MA 5ELZA 1MWKA 2P9KA 4NB4A 1NMDA 4H0TB 4CBWA 2GUPA 3BF3A 3QFPA 4BGBA 4IXCA 4PKGA 5FPEA 4RTFD 2A6AA 3EZWA 2V51B 5CE3A 2P9SB 4JAXA 5LY3A 1D4XA 2P9IB 4B1XB 4QS7A 2QWLA 3A8YA 5AFUA 4PKIA 3IMXA 4H0OA 3D2EA 3SMSA 4BR0A 5F0XA 2ASPA 3JXUA 4QS8A 3WXLA 4IO8A 3CETA 3L0QA 3SLCA 4RWTA 4BQLA 3CQXA 3DWLA 4B1UB 5KPRA 1S22A 1Q18A 5AZJA 5JICA 2UYTA 1CZAN 1P8ZA 3CIPA 4BR2A 4FWSA 4EHTA 4H5TA 2BUPA 2IVPA 2FLOA 2P9KB 1H1VA 4FWPA 1GLJO 3EL2A 2Q1NA 1NBWA 1NGIA 2GELA 4BRGA 1E4FT 5BPLA 1NGBA 1E4GT 3C7NA 2A5XA 4IZ9A 4BRPA 4BGAA 4DB3A 1KXPA 3D7EO 5LJVA 1ATNA 4FWQA 4BRLA 4BR5A 3FZHA 2OANA 5KQ8A 5AQJA 1MDUB 2A41A 3D2EB 4IJNA 1NLVA 2CH6A 2A40A 5F2RA 5AQOA 3IDHA 4L3QA 2GWJA 4BROA 1IJJA 3CI5A 2CGJA 3VF6A 5AQNA 1BU6O 5AZJB 3S41A 4BR9A 3GG4A 2GEMA 1T6CA 5EXWA 4WQ5A 2WUSA 3KVGA 2E2OA 4XH1A 4CJ7A 1BWFO 4Y0WA 2FSNA 3ID8A 3SK3A 2E1YA 2IVOA 3VETA 3BUZB 4MLHA 1YAGA 4H0XB 3BP8A 3C7NB 3AAPA 2AA4A 4BRAA 1BA0A 1GLDG 5KPTA 3VOVA 5EOYA 1RGIA 3H46O 3J8AA 4GY2B 4MLEA 2CH5A 2D1KA 3FR0A 2P9UA 3A5NC 3CERA 3LM2A 3VF2A 4BG8A 3RSEA 3A5LC 4NO7A 1NGFA 1IG8A 3CJ1A 3FZKA 3GOIA 3VEZA 1SQKA 4FO0A 3CJ7A 4A2BA 1GLLO 2P9SA 4FWMA 3HBTA 1ATSA 3VGLA 1MA9B 2J4RA 3H6EA 2VYPA 2P9IA 4FOIA 3M3ZA 3WXJA 3A5MC 2P9PA 4H5WA 2W41A 1RFQA 3C0BA 2V7YA 2P9NA 1U2VA 4CZJA 3MMVA 5AQRA 1HJOA 4BR4A 3AARA 4CI6A 4A2AA 1GLFO 3H1QA 2I7NA 2HMPA 4IWVA 3U9ZA 2P9LA 3H3OB 5BRFA 3MN7A 1RDWX 4BRFA 4K42A 5AZIA 3DJCA 1G99A 4B9QA 3BEXA 3ATUA 3LM9A 1HLUA 4PL8A 3VEWA 2P9UB 2Q31A 4FPAA 1XQSC 3RSEB 2Q97A 2DPNA 1QQOA 3M6GA 1ZC6A 1ATRA 4FOEA 2H3GX 3W3DA 3ZX0A 2E1ZA 3W0LA 3F9MA 1Z6RA 3UB5A 4XH4A 2P9PB 2ZGYA 1Y64A 3WQTA 2VWBA 2P9NB 3WUHA 1U2VB 4XH5A 4CD1A 4QS9A 1BG3A 5AQIA 1LOTB 3GDQA 1XUPO 5BPNA 1KAXA 5BPMA 4B1VA 3SJHA 3ZX3A 2V7ZA 2KHOA 2D0OA 2P9LB 3A5OC 4O5FA 4H5NA 5AZIB 2FSJA 2E2NA 1QHAA 3I8BA 1GLCG 3FGUA 3IUCA 5B8HA 4H0PA 4CBXA 2YJFA 3D2FA 5AR0A 1NM1A 1QZ5A 2E2QA 2YJEA 4BG9A 1X3NA 4DQ8A 5AQUA 5AQMA 1TUYA 5KPZA 4JD2A 3VEYA 3H45C 3WXIA 4BRNA 3MN6A 4WQ4C 5JLHA 1HPMA 1JCGA 3EKSA 3SMPA 4LC9B 4CZMA 2QWRA 2Q0UA 2HF4A 2FF6A 3ENOA 4BC5A 4WQ4A 4EFHA 4A62A 2YHXA 1V4TA 3WEEA 3R8EA 1QQNA 3VGMA 4IJAA 3ZETA 5AQKA 4BR7A 4BREA 5JLFA 3AAQA 1GLEG 1HKCA 2YCHA 4B1WB 1NGDA 3H1VX 4B1ZA 3QICA 3VEOA 1ESVA 3D2FB 1MWMA 5AQVA 5JMVA 4CZHA 4BRQA 5BRDA 2F9WA 5FPNA 1OKJA 1T44A 2QWOA 4H5VA 4AM6A 3LDQA 4JD2B 1DGKN 4EHUA 2HF3A 4M7XA 2ITMA 2ZF5O 4KBOA 3O1WA 2AP1A 4ISGA 3MK6A 3ULEA 1NGEA 3CQYA 3VGKA 5AQSA 3DXMA 2D4WA 4BRDA 4FWNA 4MO5A 3QFUA 3O6WA 3QB0A 4JHDB 3HM8A 4DCHA 4JNEA 2QXLA 2PBDA 3TPQA 4ISEA 3VF4A 3WEEB 3ZETB 4BRCA 3CJAA 4FWKA 5BR9A 4FL9A 1LCUA 4H0YB 3QDKA 2YHYA 3VPZA 4BVPA 2NRHA 1YVNA 3VENA 2E8AA 2IVNA 3QBWA 3LDLA 4RCHA 1NGHA 5AQYA 3UKRA 3ZX2A 3KZBA 4WYBA 3OHRA 4GNIA 1V4SA 1K8KA 3FZLA 1X9JA 2VCPA 3I33A 4F9OA 5I9EB 2Q36A 4AM7A 3ULEB 3FE1A 1C0GA 4FWLA 5EVZA 5FPDA 5BRHA 4PL7A 3DXMB 1U6ZA 5AQGA 4J8FA 2CGKA 1T6DA 2W40A 4E1JA 4BRIA 4H5RA 2PAVA 1QZ6A 3B8AX 4O8KA 2QWMA 5AQWA 3A0IX 3O4WA 3P4IA 2FF3B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YILA 2GTDA 4LFAK 2DTUA 4KKOA 5F1XA 1T1TA 4H0VB 1NH5A 4CGJA 3UKRB 1GLAG 3EE8A 5BREA 1KC8O 3VQ6A 4GV9A 3CFPA 3VEXA 1RT2A 3QLHA 1HPZA 4CF1A 1BCMA 2Q0RA 4CGGA 4AEIA 2BTFA 4CJFA 2QWNA 2O4GA 3O4QA 3KK7A 4CZEA 2KPYA 2WFBA 4YDUC 1HKGA 1J5OA 5JS2A 1J9AA 3EN9A 4JI2K 1NKCA 4OVLA 4YDUA 3DOKA 4IEEA 5EX5A 2YKNA 5KGXA 4JI3K 3UKUA 4LF8K 3HM9A 2FBYA 2LJ7A 2RPIA 3DXKB 4FLYA 2LN8A 4IKFA 5J2QA 3O9TA 4IOCL 3SQ4A 4UADE 4B3OA 2QM1A 1GLBG 1TUUA 2PZSA 3O80A 3DRRA 1IH7A 3NF8A 1PX9A 2ATBA 4I9LA 3MN9A 3SNNA 3CCLN 4IFEA 1W97L 4GVMA 1WOQA 1C55A 4ID5A 3OS1A 4CHNA 2HNDA 3VESA 4PKHA 1YF5L 3ZEUA 1O1WA 1JXCA 4BC3A 5JVHL 1L5UA 1J53A 2CGLA 4IG0A 4HTLA 1WLJA 4BWMA 1NGGA 3A2FA 4BRHA 4CF9A 1NPIA 2IIRA 1LW2A 4CIFA 1K6YA 1HX1A 1R0AA 1HYSA 3TAPA 1N36K 4BE7B 3FFKB 5KRTA 1GOBA 4CK1A 3SQ2A 5AQFA 4I6MA 4B1YB 3KD1E 3QBXA 4BQZA 5AQPA 3V1OA 2QWPA 2OTLN 1TV6A 1ZXOA 4DQQA 3Q7CA 1RBTA 1WBDA 4NYNA 3LDNA 4MDBA 1WNSA 3MDQA 1IO2A 3AO2A 2YX6A 1ZFUA 3SV3A 4FZXC 1ZBIA 2VG5A 3CQ8A 2SN3A 5AQXA 3TARA 1RDDA 2E2PA 1AYJA 4UQGA 2Q2RA 3CYGA 2LJMA 4KI6A 1L3SA 2KQ2A 4CQKA 1J54A 2KFZA 3ZSVA 4KH4A 4DSFA 1TYQA 4ZHRA 5BN8A 3BGRA 2IC3A 3U9DA 3KP1A 3TSQA 2PY5A 2E6LA 4XJXA 3OYBA 2NRWA 1AHOA 3NMUA 5EU7A 1U04A 3CXCM 3O9QA 5HRPA 5HROA 3AA2A 4H0TB 2YNFA 3BF3A 3AVJA 3L3UA 3F2KA 3LP0A 4IOXA 2DFEA 4EP4A 4OLBA 1NKEA 4ELVA 4FLTA 2P9SB 3ZT1A 4JAXA 4AQYK 1Q8IA 4B1XB 4QS7A 1C56A 1HNIA 3ID6A 1YJNN 1IBMK 3P38A 5AFUA 3L2QA 2P5GA 3SMSA 4JI6K 2VG6A 1GPTA 3DI6A 2O8FB 3S3NA 3SLCA 3PSMA 4NCBA 4CW7B 4RWTA 2HHXA 3VQBA 1Y97A 2B3CA 5AZJA 2A1RA 4YOVA 5JICA 3HRGA 3OBYA 1TL1A 1VQLN 5C15A 4KHPK 1U47A 4RG8A 4H5TA 2BUPA 3ASMA 2FLOA 1NRAA 3Q7BA 4DR5K 4FWPA 1GLJO 3I55N 3MWPA 4I2PA 1E4FT 3MEGA 4CJ5A 3NF6A 3MECA 1NGBA 1TI5A 2GX9A 3QESA 4DB3A 2WONA 3D7EO 3F9KA 1ATNA 4FWQA 4LH4A 4CFCA 1LW0A 4FJ8A 1HMVA 4BE0A 5HBMA 1C0MA 1OH5A 4UAFE 1VQ9N 4DQPA 4L3QA 4CHOA 4KTQA 4ZTFA 1W0HA 4FJHA 2QXFA 3BZKA 2HVIA 1BU6O 3GG4A 2GEMA 3S9HA 4WQ5A 3C6AA 2B5JA 3ZSWA 3S5TA 1I6GA 1FH3A 1I94K 2HW3A 2D56A 2ETJA 3KK1A 3ID8A 3E9LA 5SWMA 4JKFA 2G8UA 2YC1C 3ITHA 4BRAA 1ITGA 1GLDG 1QTMA 4DKWA 5EOYA 4JKDA 3ZSRA 2GBZA 5T7BA 3J8AA 4GY2B 4MLEA 1BI4A 2P9UA 2KKZA 4H4OA 5GAHP 3AA3A 4NO7A 1OZZA 1WWNA 3VEZA 5CR4A 4X62K 4J2DA 4DR6K 4LY7A 4FO0A 4A2BA 1GLLO 2NY9X 3L2VA 1Q81O 5CHIA 3DMJA 1ATSA 4YOUA 1MA9B 2J4RA 2VYPA 5JVGL 3J7AP 3T1AA 4MDAA 2P5OA 4KFBA 1KFSA 1VQNN 4H5WA 1GOCA 1RFQA 3NCIA 1IV0A 1VQ6N 3KWIA 1OH6A 4CZJA 1ILYA 4FJGA 1ASUA 3HP9A 2I7NA 1NU0A 4IWVA 3AVCA 3H3OB 4ID1A 3ZT0A 4O4GA 3MN7A 3AGRA 4BRFA 4K42A 3U3GA 1EETA 3O3HA 1RT7A 3BEXA 5HP1A 4J2BA 4LSLA 2QKBA 4AILC 1S1UA 4FLXA 3RSEB 4KV8A 3QNOA 2DPNA 4B08A 2ITGA 1WSHA 3CC4N 1ZC6A 3RVCA 2OCEA 2H3GX 3CF5L 2B6AA 4MFBA 3AVMA 3O9RA 4JKGA 3KOXA 5C2FA 3W0LA 3AVHA 3QIPA 2P9PB 5LMUK 2O8CA 3EYZA 1Q86O 2VWBA 3WUHA 1U2VB 2IDOA 4AHVA 4CD1A 4AHRA 4BE2A 3OS2A 1BG3A 2OPSA 3OW2M 3NE6A 1VQ8N 3KIOA 5BPMA 2MBKA 1JLCA 4B1VA 2D0OA 3A5OC 3SBGA 1C0TA 4H5NA 5AZIB 4CJPA 2E2NA 3I8BA 4LF6K 3LALA 4ZTJA 3DOLA 3FGUA 4C8KA 4H0PA 1RT3A 1N33K 1VSDA 4F4KA 4FLUA 3R2VA 2YJEA 4BG9A 4CJSA 2GUIA 2LT8A 1ASVA 3AVIA 5KPZA 3ZSOA 4JD2A 3VEYA 4DUZK 3PV8A 4B9UA 1HNWK 4DU4A 1VQ7N 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2YIL A;  2GTD A;  4LFA K;  2DTU A;  4KKO A;  5F1X A;  1T1T A;  4H0V B;  1NH5 A;  4CGJ A;  3UKR B;  1GLA G;  3EE8 A;  5BRE A;  1KC8 O;  3VQ6 A;  4GV9 A;  3CFP A;  3VEX A;  1RT2 A;  3QLH A;  1HPZ A;  4CF1 A;  1BCM A;  2Q0R A;  4CGG A;  4AEI A;  2BTF A;  4CJF A;  2QWN A;  2O4G A;  3O4Q A;  3KK7 A;  4CZE A;  2KPY A;  2WFB A;  4YDU C;  1HKG A;  1J5O A;  5JS2 A;  1J9A A;  3EN9 A;  4JI2 K;  1NKC A;  4OVL A;  4YDU A;  3DOK A;  4IEE A;  5EX5 A;  2YKN A;  5KGX A;  4JI3 K;  3UKU A;  4LF8 K;  3HM9 A;  2FBY A;  2LJ7 A;  2RPI A;  3DXK B;  4FLY A;  2LN8 A;  4IKF A;  5J2Q A;  3O9T A;  4IOC L;  3SQ4 A;  4UAD E;  4B3O A;  2QM1 A;  1GLB G;  1TUU A;  2PZS A;  3O80 A;  3DRR A;  1IH7 A;  3NF8 A;  1PX9 A;  2ATB A;  4I9L A;  3MN9 A;  3SNN A;  3CCL N;  4IFE A;  1W97 L;  4GVM A;  1WOQ A;  1C55 A;  4ID5 A;  3OS1 A;  4CHN A;  2HND A;  3VES A;  4PKH A;  1YF5 L;  3ZEU A;  1O1W A;  1JXC A;  4BC3 A;  5JVH L;  1L5U A;  1J53 A;  2CGL A;  4IG0 A;  4HTL A;  1WLJ A;  4BWM A;  1NGG A;  3A2F A;  4BRH A;  4CF9 A;  1NPI A;  2IIR A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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