5AQVA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
total genus 125
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqvA04
2YHWA 3WXKA 4O8KA 4JAXA 4BRDA 4CJ7A 1C0FA 3O5BA 2AP1A 3QDKA 3U9DA 3JXUA 3EL2A 2GWKA 2YJFA 1QZ5A 2P9IB 2YHXA 3VF4A 5BN9A 2A40A 4WQ4C 2J4RA 4IWVA 4AM7A 5E84A 3D7EO 4JN4A 5AZIB 2V7ZA 3VEYA 2P9PB 3QFPA 1NGEA 1GLCG 4CZIA 1KAZA 1K8KB 1T44A 1Z6RA 2F9TA 4PKHA 4BR4A 1HLUA 4DCHA 4M7XA 3WEEA 5JICA 4BVOA 1WOQA 3HTVA 1NGIA 3AAPA 1P8ZA 4B1YB 3H6EA 1NLVA 3UE5A 1TUUA 5AQNA 2QWQA 3FR0A 4XH4A 2BUPA 1NGDA 4BC3A 3M6GA 4M63C 3UKRA 4DHYA 2YHYA 3ID8A 3CJ9A 1BU6O 2A5XA 3MMVA 3BP8A 3GE1A 4Y0WA 3CJCA 3VOVA 1X3NA 3CQYA 1U2VA 3FGUA 3U9ZA 3A5LC 1HKBA 4MLHA 2IVOA 3L6QA 1DEJA 1NWKA 1NM1A 1GLBG 2QWMA 2E8AA 2E2NA 4BROA 2NRHA 4FOIA 1YUWA 3QBXA 5AR0A 2CH6A 1YXQA 3MN6A 3MN9A 1MWMA 4BREA 2E2QA 4WYBA 2CGLA 4EFHA 4QS7A 3A0IX 4JHDB 4Z94A 2P9KA 4H5WA 4BG8A 3GL1A 4H5NA 1WUAA 1XUPO 1GLLO 3HI0A 2FSNA 4JD2A 3ATVA 2IVNA 5AQSA 3R9PA 4H5TA 2IVPA 2VWBA 1E4FT 4BRHA 2ZGYA 1BA0A 4B1ZA 5AQYA 3H46O 2ZGZA 1NGAA 2A6AA 4BR9A 2QWPA 2E88A 3LDOA 2Q0RA 5BR9A 3O08A 3AY9A 4B1XB 2D1KA 4BRGA 4BR0A 4BGBA 4H0XB 2E1YA 4J8FA 1GLFO 5BRDA 4E1JA 2D4WA 3A5NC 1BA1A 3D2EA 2V51B 1TYQA 5AQKA 2IIRA 2P9UA 3H45C 4BRKA 5LY3A 4BRLA 4GNIA 2D0PA 3DXMB 1KAYA 4YDUA 5KQDA 3O80A 3VF2A 5LJWA 1T6CA 1BDGA 3WEEB 5AZJB 5AQFA 3D2FA 2FLOA 1R59O 2FSJA 4I6MA 1GLEG 3A5OC 3CJ1A 3EKSA 3UB5A 1HPMA 4FPBA 1KXPA 1TUYA 2HF4A 3TPQA 2OANA 2QM1A 1NGBA 4XH1A 4BRFA 5JMVA 4JNEA 2HOEA 2QWOA 4H03B 1HUXA 4PKGA 3VGKA 3CIPA 3EN9A 4IXCA 5AQPA 5F0XA 3KVGA 5FPNA 1IG8A 4ISFA 4BQZA 5AQMA 3BF3A 4CZGA 3OHRA 1OKJA 3M1FA 2ZF5O 4LC9B 4EHUA 4IJNA 4B9QA 1QZ6A 4FWQA 5EXWA 4MLEA 4O5FA 1QQNA 5TKYA 4PL7A 4I6MB 3AARA 2V7YA 4DQ8A 3UKRB 4FPAA 4RWTA 5F2RA 4H0VB 2HMPA 4IO8A 1GLAG 3WUHA 1S22A 1LOTB 3ZETB 1Q18A 4H5RA 5EOYA 2EWSA 3BF1A 3I33A 2P9UB 3DXKB 2VCPA 3BUZB 5ADXH 1BWFO 3HSCA 3EZWA 4CZMA 2Q36A 4AM6A 3LDQA 3FZLA 5BN8A 5FPMA 2Q97A 4B1VA 3VEZA 4BRQA 2ZWHA 3D2FB 4BR7A 3C7NA 1RDWX 1ATSA 4FWMA 3O1BA 3ULEA 3R6MA 3MK6A 2GEMA 5FPDA 3JS6A 4A2AA 1BO5O 3GDQA 1ESVA 2V52B 2P9PA 5AQXA 2FF3B 2H3GX 1QHAA 2W41A 5AZIA 3HBTA 1S3XA 1ATRA 4FWOA 4C23A 2ASPA 2QW9A 5I9EB 3IFRA 3SK3A 1KAXA 3SMSA 3IUCA 4CBUA 5F1XA 3FZHA 4M7YA 1NMDA 5AQRA 4BRNA 3LM2A 2AA4A 2P9LA 2FSKA 4CBXA 1HKGA 1BUPA 4XEIA 3ZEUB 3FFKB 5AQUA 3CHWA 1X3MA 3U8XA 2E2OA 1Y64A 5AQOA 3MN5A 2QXLA 3J8AA 5CE3A 3O6WA 1TYQB 3UKUA 4BRAA 1JCGA 4F9OA 3R8EA 2GTDA 5E26A 3IDHA 4BR5A 4K41A 1ZBSA 3ZETA 2D0OA 4NB4A 2F9WA 5AQTA 5ADXA 4HWIA 4A2BA 2A3ZA 1GLJO 3DAWA 5EVZA 4CD3A 4IJAA 5AQJA 2P9NB 2P9SB 4DB3A 2YJEA 3I8BA 3C0BA 4WQ4A 3W0LA 3VEWA 2I7PA 4MO5A 3L4IA 3VEVA 3ULEB 3QMLA 4BRMA 3RSEB 1NGCA 1YAGA 2W40A 2E2PA 1X9JA 4HTLA 3SJHA 3GG4A 4CZEA 3A8YA 2DPNA 4EHTA 4YDUC 4H0TB 5BPNA 3VESA 1JCEA 2A41A 4H5VA 2P9SA 4CD1A 4CI6A 2UYTA 4FWPA 3FZFA 2Q2RA 3QFUA 1SQKA 3LL3A 4BC4A 2E1ZA 2CH5A 3DXMA 2PBDA 4PKIA 3VERA 3VEOA 4K42A 1IJJA 3O1WA 1BG3A 4RTFD 3D2EB 4EAHD 4PL8A 4ISEA 5KPZA 3DWLA 1ZXOA 4B1WB 3ATUA 4GY2B 3P4IA 3FE1A 2Q0UA 1U2VB 2P9IA 4BC2A 2NZTA 3VF6A 4K43A 1NGFA 3ZX2A 2HF3A 2FXUA 4NO7A 4FWNA 5AQQA 3KZBA 3O4WA 3CQXA 3F9MA 2CGJA 3ENOA 1U6ZA 4BG9A 1V4SA 1HJOA 2BTFA 2YI1A 3H1VX 4JD2B 5JLHA 3CJBA 4QS9A 3QICA 3CJAA 2FF6A 3HM8A 3SMPA 2QWNA 5BRFA 1HX1A 3DJCA 3FZMA 1V4TA 3FZKA 3MN7A 3WT0A 1XC3A 4CZHA 3DXKA 2P9NA 1RFQA 3QB0A 3LDNA 3FLCO 4BGAA 3QBWA 4BQLA 4RCHA 1LCUA 5AQLA 4MO4A 2A42A 5AQIA 1H1VA 4FOEA 5ELZA 4FSVA 3LDPA 3A5MC 4FO0A 1CZAN 4CZLA 4A61A 2NLXA 4H0PA 3VEXA 3LDLA 2E20A 3EO3A 4WQ5A 4A62A 3GOIA 4FWLA 3KHYA 5AQVA 1JCFA 3RSEA 1GLDG 2P9KB 5BRHA 3ZX0A 3UKUB 2CGKA 5JLFA 5EY4A 5EX5A 1MA9B 1XQSC 4IZ9A 1RGIA 3MDQA 3H3NO 5AFUA 1HKCA 3B8AX 3EKUA 5FPEA 3VGMA 2ASMA 3S41A 4KBOA 2QWLA 3O8MA 1NGJA 3G25A 3SLCA 5AQGA 1D4XA 4QS8A 1Z05A 1C0GA 4EIAA 4BRIA 1K8KA 3CI5A 4L3QA 3H1QA 5KPTA 5LJVA 1J6ZA 2Q31A 3CETA 4FWKA 5BPMA 2WUSA 4BRCA 4BVPA 5B8HA 4BRPA 2KHOA 5AFUH 1YVNA 3MCPA 4FWRA 3WXLA 3AAQA 5KPRA 1NGGA 3U4LA 2GUPA 4FWSA 4CZKA 5KQ8A 3BEXA 2VYPA 4FL9A 4JHDA 1MWKA 2GWJA 5BREA 1MDUB 1BOTO 3VGLA 4CZJA 3CERA 3WQTA 3IMXA 3M3ZA 3VETA 3C7NB 4BR2A 3W3DA 3L0QA 5AQHA 4H0YB 4XH5A 3LM9A 2ITMA 1DKGD 1NBWA 3VENA 2PAVA 1DGKN 3ZX3A 3WQUA 4ISGA 5AZJA 1QQOA 4BC5A 3ZEUA 4CBWA 3GBTA 1ZC6A 4H0OA 3WXJA 2P9LB 1QQMA 1EQYA 3ENHA 4K25A 1SAZA 3VPZA 2YCHA 2GELA 1G99A 1E4GT 2I7NA 3HZ6A 4CZFA 3TU5A 5AQWA 5BPLA 1ATNA 1SZ2A 4WQ5C 3WXIA 5AQZA 3CJ7A 2QWRA 4B1UB 1T6DA 2ASOA 2Q1NA 1NGHA 3H3OB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JAXA 1C0FA 3O5BA 2OPSA 1NK9A 1I6GA 1VQON 2F96A 3CCSN 3PX4A 5BN9A 4LSNA 4BACA 5AZIB 1NOYA 3QFPA 2WONA 4OPHA 1KFSA 1T44A 3LAMA 2LY6A 1CZ9A 4PKHA 4BR4A 1VK0A 3M5RA 3SBGA 1Q82O 3WEEA 2QKBA 1NGIA 3PIPL 4RW4A 1NK7A 1ASUA 4XH4A 4C8MA 3LPUA 4CK2A 4H4MA 3HVRA 3MMVA 2ZQBA 2GMOA 4B9SA 1L3UA 3V9WA 3A5LC 2QTDA 4JI4K 1TL1A 2IVOA 4HHTA 2OPQA 4DSKA 1NOZA 2E8AA 2E2NA 1WSEA 1VQ4N 3KKRA 3QBXA 2N2RA 5AR0A 1B3CA 3MN6A 3MN9A 3OYJA 3WNFA 5HP1A 1BIUA 2E2QA 4JI0K 3CFOA 2CGLA 1BGXT 1HR0K 1HNWK 1GOBA 3CCUN 4CHPA 2WBNA 4LD0A 3A0IX 3RRHA 3NHGA 3V9UA 1ASVA 3TSPA 1ZYWA 1FKPA 1K8AO 4DV1K 1W9HA 4AH9A 4CEAA 3HI0A 4WCEL 2OTJN 4JI5K 5AQSA 2HNZA 2B6AA 1E4FT 2ZGYA 4J2BA 2YIPA 4X65K 2N69A 2B68A 1RTJA 3O08A 5BR8K 1VNAA 3S5TA 3P83D 5HBMA 3KD5E 3ID6A 1LV5A 4B9LA 2E2FA 2VGMA 3IAYA 4FXDA 4JEPA 3S9HA 2IIRA 2P9UA 3H45C 5LY3A 4GNIA 4FJ9A 1ZBIA 3VF2A 3CG7A 4HVJA 1T6CA 2O4GA 4W5TA 1VSMA 3C6AA 5K14A 3A5OC 4FJHA 1OH6A 2OA8A 3EKSA 4YFUA 3AVHA 2WFBA 2HHSA 3UB5A 1YHQN 3ZSRA 2QKKA 3NF9A 2OANA 2QM1A 1NGBA 3VQBA 4BRFA 1LAVA 1DTQA 4JKAA 4KREA 2E6LA 3CIPA 2X6NA 4IXCA 5AQPA 3E01A 4J2EA 4DFPA 3BK3C 4ISFA 3BF3A 3CM6A 3OHRA 3OBYA 1S1UA 4LFAK 1RBUA 4DUZK 4FWQA 3E9PA 2MZ0A 1XNQK 1QQNA 5TKYA 3AARA 3AVMA 4DQ8A 3UKRB 4Y1CA 2HMPA 1R0AA 3EYZA 4IO8A 4L8RB 1S22A 2YNIA 2W6KA 3ZETB 3CCVN 1FK9A 3I33A 4DV2K 3KOWA 2YC1C 2VCPA 2HNDA 1S1WA 2GUIA 3VQPA 2OPRA 5LMNK 2Q36A 3LDQA 5BN8A 4B1VA 4E7LA 1C6VA 4JK8A 3PX6A 3CC2N 1NK0A 1LWFA 2GEMA 3G10A 4M3TA 4CIFA 1ESVA 2V52B 3SZ2A 1WSGA 2H3GX 2WC9A 3I8DA 1ITGA 1AHOA 2W41A 3HBTA 4X64K 4AHSA 1ATRA 1RILA 1KVCA 1RT1A 2QW9A 3ZT1A 5I9EB 3OYGA 1B9FA 3K2PA 2NRWA 2GV9A 1JL2A 3S3OA 4N5SA 4I2QA 1JLAA 3FZHA 4M7YA 1TI5A 3ZSQA 3E7RL 2P9LA 4NCAA 4E0DA 1N33K 4DU1A 2FBXA 5C25A 4XEIA 2NY8X 4YHHK 3D6RA 5AQUA 3CHWA 4FJKA 5AQOA 4CFCA 4WF9L 1MU2A 5CE3A 3NGIA 1XMQK 3L56A 3GKUA 4K8ZA 4K41A 3ZETA 3CPEA 2F4VK 4NB4A 5AQTA 1ZBUA 1BL3A 5ADXA 4LF8K 3VQAA 4KB0A 4IFYA 3VTIA 4DV7K 3N4QA 4NCGA 4CD3A 3THXB 1C0UA 2E6MA 4DB3A 2YJEA 4WQ4A 3SAHA 3TR8A 4MO5A 3JYTA 4PHTX 5GAHP 2O8CB 1NGCA 5HRPA 3PO4A 4BECA 1T3VA 5A2QO 4CZEA 2DPNA 4B08A 4H0TB 5BPNA 3VESA 2RE2A 2RN2A 3AGKA 1RBVA 2A41A 2P9SA 1X9MA 4M3XA 1T7BA 4FM1A 4CI6A 2FBYA 3ZYYX 4C8NA 1W97L 1SUQA 2E1ZA 2F8TA 3DXMA 2WOMA 4PKIA 3VERA 1NKEA 1ZVGA 1F21A 4PL8A 5KPZA 3DWLA 1U04A 1VQLN 2Q0UA 1ILYA 3CCJN 4W5NA 4KH5A 3HK2A 3AVFA 3RR7A 3MXIA 4JKEA 1X9WA 4FWNA 4MDAA 3ZSOA 3KZBA 2UU9K 3ZT3A 4BG9A 4DF8A 1VSFA 5J2NA 2KPYA 1FKOA 3SYZA 2KKZA 5BRFA 4DTSA 5HROA 3DJCA 1S9GA 4CESA 3VQDA 4CF9A 3VQCA 5JS2A 3T19A 1GPTA 3QB0A 2IC3A 4BGAA 3TANA 3QBWA 4BQLA 4DLGA 3TABA 4E7IA 3H08A 5AQIA 4F4KA 5ELZA 1CZAN 1RBRA 3THXA 4H0PA 1I39A 4YOYA 2E20A 1I3AA 2X78A 4OPKA 3V1RA 1YF5L 3OYCA 3GOIA 3R3LA 3SJJA 1JJ2M 3QESA 5KRSA 5CZ2A 4CJTA 1GLDG 4FLUA 1LQHA 5CY0A 2PYJA 4CE9A 5EX5A 1MA9B 3H3NO 3CD6N 3EKUA 2HHUA 2ASMA 3S41A 4CIGA 1NGJA 3V1QA 4NLCA 1IKWA 2RHKA 4OPJA 3KHWA 4JI6K 3V6DA 1NE5A 3H1QA 2X6SA 3KLIA 4CGDA 4DSJA 4FWKA 3ZSZA 2C1IA 4BVPA 3CCEN 4BRPA 1L3SA 5AFUH 1FH3A 3E9LA 4Z4GA 3BEXA 2WTUA 1Q9XA 1BRZA 1HYVA 4O55A 2G8KA 3M3ZA 3VETA 1W7AA 1RTDA 3LM9A 2ITMA 3CYGA 3RMCA 3LP0A 2W6LA 4EP5A 3WQUA 1WT7A 4CCHA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4ISE A;  5KPZ A;  3DWL A;  1ZXO A;  4B1W B;  3ATU A;  4GY2 B;  3P4I A;  3FE1 A;  2Q0U A;  1U2V B;  2P9I A;  4BC2 A;  2NZT A;  3VF6 A;  4K43 A;  1NGF A;  3ZX2 A;  2HF3 A;  2FXU A;  4NO7 A;  4FWN A;  5AQQ A;  3KZB A;  3O4W A;  3CQX A;  3F9M A;  2CGJ A;  3ENO A;  1U6Z A;  4BG9 A;  1V4S A;  1HJO A;  2BTF A;  2YI1 A;  3H1V X;  4JD2 B;  5JLH A;  3CJB A;  4QS9 A;  3QIC A;  3CJA A;  2FF6 A;  3HM8 A;  3SMP A;  2QWN A;  5BRF A;  1HX1 A;  3DJC A;  3FZM A;  1V4T A;  3FZK A;  3MN7 A;  3WT0 A;  1XC3 A;  4CZH A;  3DXK A;  2P9N A;  1RFQ A;  3QB0 A;  3LDN A;  3FLC O;  4BGA A;  3QBW A;  4BQL A;  4RCH A;  1LCU A;  5AQL A;  4MO4 A;  2A42 A;  5AQI A;  1H1V A;  4FOE A;  5ELZ A;  4FSV A;  3LDP A;  3A5M C;  4FO0 A;  1CZA N;  4CZL A;  4A61 A;  2NLX A;  4H0P A;  3VEX A;  3LDL A;  2E20 A;  3EO3 A;  4WQ5 A;  4A62 A;  3GOI A;  4FWL A;  3KHY A;  5AQV A;  1JCF A;  3RSE A;  1GLD G;  2P9K B;  5BRH A;  3ZX0 A;  3UKU B;  2CGK A;  5JLF A;  5EY4 A;  5EX5 A;  1MA9 B;  1XQS C;  4IZ9 A;  1RGI A;  3MDQ A;  3H3N O;  5AFU A;  1HKC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4JAX A;  1C0F A;  3O5B A;  2OPS A;  1NK9 A;  1I6G A;  1VQO N;  2F96 A;  3CCS N;  3PX4 A;  5BN9 A;  4LSN A;  4BAC A;  5AZI B;  1NOY A;  3QFP A;  2WON A;  4OPH A;  1KFS A;  1T44 A;  3LAM A;  2LY6 A;  1CZ9 A;  4PKH A;  4BR4 A;  1VK0 A;  3M5R A;  3SBG A;  1Q82 O;  3WEE A;  2QKB A;  1NGI A;  3PIP L;  4RW4 A;  1NK7 A;  1ASU A;  4XH4 A;  4C8M A;  3LPU A;  4CK2 A;  4H4M A;  3HVR A;  3MMV A;  2ZQB A;  2GMO A;  4B9S A;  1L3U A;  3V9W A;  3A5L C;  2QTD A;  4JI4 K;  1TL1 A;  2IVO A;  4HHT A;  2OPQ A;  4DSK A;  1NOZ A;  2E8A A;  2E2N A;  1WSE A;  1VQ4 N;  3KKR A;  3QBX A;  2N2R A;  5AR0 A;  1B3C A;  3MN6 A;  3MN9 A;  3OYJ A;  3WNF A;  5HP1 A;  1BIU A;  2E2Q A;  4JI0 K;  3CFO A;  2CGL A;  1BGX T;  1HR0 K;  1HNW K;  1GOB A;  3CCU N;  4CHP A;  2WBN A;  4LD0 A;  3A0I X;  3RRH A;  3NHG A;  3V9U A;  1ASV A;  3TSP A;  1ZYW A;  1FKP A;  1K8A O;  4DV1 K;  1W9H A;  4AH9 A;  4CEA A;  3HI0 A;  4WCE L;  2OTJ N;  4JI5 K;  5AQS A;  2HNZ A;  2B6A A;  1E4F T;  2ZGY A;  4J2B A;  2YIP A;  4X65 K;  2N69 A;  2B68 A;  1RTJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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