5AQVA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
b'GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 125
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqvA04
4EHUA 5AR0A 4M7XA 5FPEA 4BR5A 4FOIA 2QM1A 5FPDA 1TUUA 4ISGA 4PKGA 3R8EA 1GLJO 3O4WA 4MO4A 4NO7A 2QW9A 2I7PA 5AQSA 4FO0A 1KAZA 3WXKA 2E2PA 4BVPA 2VCPA 2CH5A 3P4IA 5EY4A 1DEJA 3LDPA 3EKSA 1SQKA 4PL7A 2QWPA 3ID8A 3R6MA 3CETA 1NGAA 4EHTA 2E1ZA 2CH6A 4FWSA 4XH4A 3O5BA 4EIAA 4QS8A 3BUZB 4BRIA 4BRDA 3QBWA 1BOTO 3HBTA 3D2FA 2E88A 4JHDA 3ATUA 5AQKA 2I7NA 3L0QA 5F1XA 1IG8A 2NLXA 2QWOA 4B1ZA 5BRDA 4JNEA 1E4GT 3CQYA 3IDHA 2H3GX 2BTFA 3WT0A 4BC3A 3FLCO 1U6ZA 2E1YA 4WQ4C 1OKJA 5AQHA 3DXMA 4LC9B 1BU6O 1HX1A 1U2VA 3TU5A 3ZETB 2P9UB 3QMLA 2IIRA 3LDQA 1BDGA 2GWKA 5I9EB 2P9PB 1GLCG 1GLLO 1Z6RA 4BRGA 2YHXA 4QS9A 2P9NB 1GLBG 2F9TA 1BA0A 5KQDA 4CD3A 3HI0A 3DXKB 2ZF5O 3QFPA 4B1YB 1EQYA 2NRHA 5AQPA 3U9ZA 3LM2A 3CHWA 2A5XA 3GBTA 5AQYA 4B1WB 3A5MC 1HLUA 4XEIA 5AQWA 2ASMA 3LM9A 5FPNA 1HKGA 3W0LA 5BPLA 4CZIA 1ATRA 1JCGA 2Q0RA 4BRMA 3UE5A 2HMPA 1DKGD 3KZBA 3CI5A 1C0FA 4BRPA 2A6AA 4FWPA 3IFRA 4FWQA 5KPZA 4JHDB 4H0YB 4CZJA 2D4WA 2P9KA 5TKYA 2HF4A 1MDUB 4JN4A 2GELA 2V51B 3EN9A 3O1WA 3L4IA 3BP8A 4RCHA 3DXMB 4FWMA 2OANA 3AAPA 2VWBA 3H1QA 4BC4A 2D0PA 3W3DA 4H5TA 1U2VB 3VESA 3LDOA 2YHWA 3O8MA 1NGFA 5AQLA 3IMXA 5ADXA 3VGLA 4FWLA 1GLAG 3L6QA 3DAWA 4O8KA 5AQTA 3VF4A 4A62A 5AFUA 2ASPA 2J4RA 1NGBA 3VEYA 5JMVA 3A0IX 4XH1A 5AZJB 4L3QA 3FZMA 5KPTA 4K43A 4BRLA 3UKRA 5ELZA 3LL3A 1NM1A 4FWNA 5BPMA 1ATNA 4BRFA 3AARA 1SAZA 1WUAA 2PAVA 1NLVA 1C0GA 3MN6A 3S41A 5LJWA 3AY9A 1QHAA 4O5FA 3CJAA 4H5RA 3SJHA 3SMPA 3KVGA 4BGBA 2CGKA 2E2OA 3FGUA 2YJFA 2FF6A 2IVOA 1QZ5A 4BGAA 4BG8A 5AQOA 3MK6A 2QWMA 1R59O 4NB4A 5F0XA 4FOEA 1GLDG 2P9KB 1BUPA 4I6MA 2BUPA 3MMVA 4MLEA 2A40A 3JXUA 1TYQA 4JD2A 4RTFD 2NZTA 4BROA 3WUHA 4K41A 3MN9A 3BEXA 3VF6A 4CZMA 3MN5A 2F9WA 3A5OC 1XUPO 3MDQA 3O80A 2FSJA 1NGEA 4H0OA 2V7ZA 1X3MA 2HOEA 3VF2A 4A2BA 1X9JA 2ZWHA 4YDUA 3VPZA 1RGIA 4AM6A 1KXPA 3VEWA 1LCUA 1HJOA 2DPNA 5AQXA 3HM8A 5AQNA 3A5NC 3CERA 5AZIA 2ASOA 3SK3A 2WUSA 3I33A 1MWMA 5LY3A 4AM7A 4HTLA 4FWOA 3VEVA 4CZEA 4XH5A 3WQTA 1E4FT 3B8AX 4PL8A 4IO8A 1MA9B 2YI1A 3KHYA 1YXQA 1GLEG 1LOTB 2AA4A 2CGJA 3EKUA 5KQ8A 4BRAA 1NGCA 3F9MA 2W41A 2E20A 3LDLA 1Q18A 2FSKA 3D2EA 1T6CA 3VOVA 3VERA 3SLCA 4BRHA 4FSVA 1MWKA 2E8AA 2CGLA 4C23A 1G99A 3D7EO 5AQVA 3DWLA 4I6MB 4EFHA 3U8XA 1TYQB 3GL1A 3MN7A 3A8YA 3D2FB 2P9SA 3HSCA 1TUYA 2A41A 3M1FA 4BG9A 3ULEA 5AQZA 2A3ZA 2D0OA 3FZFA 4H5WA 2FLOA 1BG3A 4H0XB 3ZX0A 3LDNA 1NBWA 4CZFA 2YJEA 3M3ZA 3QICA 2AP1A 4WQ5A 5AZIB 5KPRA 4CZLA 3CJ9A 5AQUA 3DJCA 4WYBA 3ENOA 5LJVA 1KAXA 2E2NA 3UKUA 4DB3A 3VENA 1JCFA 4KBOA 4BRCA 1RFQA 1XC3A 4DCHA 1NGDA 2YHYA 4H5NA 4BRQA 2Q0UA 1T6DA 2HF3A 3AAQA 4H5VA 3C0BA 4BREA 3ZX2A 1ESVA 2Q2RA 3EL2A 3GG4A 3I8BA 4A2AA 5B8HA 3FZHA 2P9LA 4BC2A 4JAXA 4CBXA 3IUCA 3GOIA 4J8FA 3ZEUA 3H1VX 3EZWA 4CBWA 2Q36A 4BR0A 4FWRA 3H45C 3GDQA 3ZETA 3JS6A 1BWFO 1HUXA 1SZ2A 2GEMA 4PKHA 5AQGA 1JCEA 3OHRA 1S22A 2P9SB 4QS7A 2GTDA 2P9NA 3VGKA 1ATSA 3A5LC 1YUWA 5AQRA 2ITMA 3ULEB 2Q1NA 3QBXA 4IJAA 3DXKA 4H0TB 1YAGA 1V4SA 3R9PA 1WOQA 3EO3A 3MCPA 2QWQA 1NGJA 3ENHA 5EX5A 2Q31A 3BF1A 4IJNA 4CI6A 3WXIA 3FE1A 3GE1A 1NMDA 3WXJA 4YDUC 2D1KA 3CQXA 3CJ1A 4DQ8A 1K8KA 2KHOA 4GY2B 3VEXA 4BRKA 2GUPA 1ZC6A 3UKUB 5E26A 4GNIA 3TPQA 5JLFA 3VETA 5E84A 3G25A 1ZXOA 2P9IA 4B9QA 1NGIA 3HTVA 3C7NA 5CE3A 3BF3A 1NWKA 3UKRB 2E2QA 5BN8A 3ATVA 1J6ZA 4F9OA 4H03B 3WEEA 1DGKN 5ADXH 1NGHA 2P9LB 1ZBSA 2Q97A 3RSEA 4A61A 4BR7A 5BRFA 1KAYA 5AFUH 3UB5A 3ZEUB 1YVNA 4E1JA 4WQ4A 4MO5A 4PKIA 5AQFA 5JICA 2GWJA 1Y64A 2YCHA 5EXWA 3M6GA 5BREA 2FF3B 3H6EA 3H3NO 2QXLA 4BVOA 2V52B 3HZ6A 4Z94A 1NGGA 1HKCA 1CZAN 1BA1A 4CBUA 4M63C 3O08A 1QZ6A 4B1UB 4FL9A 4EAHD 4BQZA 2PBDA 5FPMA 5AQIA 4JD2B 5AZJA 1S3XA 5AQJA 5EOYA 4BR4A 3WQUA 2ZGYA 4M7YA 3WXLA 2FSNA 3CJBA 4BQLA 4BR9A 4CJ7A 1HPMA 2EWSA 1D4XA 4FPAA 2ZGZA 1K8KB 4K25A 1QQNA 2FXUA 4ISFA 3CJCA 3H46O 3U4LA 4WQ5C 3VEZA 5BRHA 2VYPA 4B1XB 3J8AA 3QDKA 4Y0WA 1H1VA 1HKBA 4H0VB 4B1VA 1X3NA 4CZGA 2P9IB 3ZX3A 4CD1A 3C7NB 1T44A 3FFKB 2A42A 3FZLA 3SMSA 5EVZA 5BN9A 3FR0A 3O6WA 3VGMA 5JLHA 4BC5A 4HWIA 1IJJA 2IVPA 5AQMA 4K42A 2W40A 3WEEB 2V7YA 3RSEB 1P8ZA 2QWNA 4ISEA 4BRNA 2IVNA 5BPNA 4BR2A 5BR9A 1QQOA 4IZ9A 3CIPA 5AQQA 3CJ7A 4IWVA 2QWLA 4CZHA 3QB0A 3D2EB 3QFUA 5F2RA 4DHYA 4IXCA 3FZKA 3O1BA 4RWTA 3H3OB 4FPBA 1V4TA 1XQSC 4MLHA 1GLFO 1Z05A 4H0PA 1QQMA 3VEOA 2P9UA 2QWRA 4FWKA 4CZKA 1RDWX 1BO5O 2UYTA 2P9PA 3U9DA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DTMA 3O9RA 3RMBA 1EX4A 1MR4A 4C1NI 4CJLA 1I94K 2QW9A 2HSTA 4C8OA 3SBTA 4FW2A 1KAZA 4OX9K 3M8RA 1TK0A 4J2EA 2HHWA 1KVAA 4LH4A 5EY4A 1DEJA 1JLGA 4W5TA 3EKSA 1BQNA 1VK0A 2QWPA 4I2QA 1W2BM 3L3VA 3HVRA 1VQ4N 4FCYA 2O8DB 3QBWA 4HUGA 1BOTO 4DR7K 4JHDA 1JKZA 2OYQA 3L0QA 4DMNA 5F1XA 3CM5A 1E4GT 2W6KA 3OA9A 3CQYA 5E41A 4DLEA 2QK9A 1EWQA 3K57A 1VSFA 2E1YA 1OKJA 3NF6A 3KC6A 4W5RA 4FJJA 3TU5A 3ZETB 3RRGA 2P9UB 3QMLA 2BGGA 5HLFA 4CE9A 3C6UA 2GWKA 3VQ4A 5I9EB 4HHFA 3K2PA 4O8UA 1GLBG 2F9TA 4JKGB 3QNOA 5CYQA 1S1WA 4PUOA 2LT8A 3V9ZA 1Z26A 4FW1A 4Z4GA 3QFPA 4B1YB 1EQYA 3QNNA 3MX2A 2NRHA 1TAUA 3LM2A 3CHWA 1ZVGA 2IS3A 1S9GA 4XEIA 1P00A 1AHOA 5AQWA 4OPHA 3EE8A 3DLHA 1ASUA 3W0LA 2YNGA 4BRMA 4DSLA 3DOLA 4JI2K 4JI6K 1VNAA 4BRPA 4FWPA 4CJQA 2LJ7A 1HNZK 4JHDB 4H0YB 4DV7K 1WBBA 1QSSA 4O4GA 1NG9A 5TKYA 4CFAA 4K0KK 3EEQA 4EZ9A 2OPRA 1A5XA 2LKBA 4M3YA 4JI1K 3R3LA 3G0ZA 3S5TA 2V51B 2VWKA 5HRNA 2OANA 2XY6A 3H1QA 3IS9A 4AEIA 3O8MA 4X64K 1TV6A 1NGFA 1Q9XA 1I2UA 4H4OA 1ILYA 4GVMA 1S1TA 5ADXA 3DAWA 4O8KA 4Z4CA 4CEBA 3VEYA 3TAMA 4IKFA 1VQ5N 4XH1A 4CJRA 4L3QA 2N69A 5KPTA 3UKRA 4A5AA 3CYMA 3PX4A 2UUCK 1ATNA 4BRFA 3AARA 5LJWA 1C0GA 2RE2A 3AY9A 3OYNA 1RTDA 1NJIO 3CJAA 3DI6A 2KLAA 1FH3A 3KVGA 1JLBA 4BGBA 4JV5K 2E2OA 3OYFA 3MX5A 3H08A 4BG8A 3MK6A 3F73A 3N4QA 2QWMA 1R59O 3CQ8A 2G8KA 4NB4A 2ZM6K 3ZT0A 4FOEA 3OYMA 1Q81O 3AVMA 4MLEA 2BUPA 3JXUA 1L3SA 4RTFD 1XUPO 4NCBA 4LSLA 3NE6A 2O4GA 1C0MA 3HT3A 4H0OA 2HOEA 4M3WA 4A2BA 1X9JA 2ZWHA 2BANA 3PLAA 3K5LA 1KXPA 3VQ7A 1LCUA 4AHCA 3S3MA 2G2KA 3AV9A 3CERA 4WFAL 2ASOA 2GMOA 1RT4A 2B3CA 1M1KO 4AM7A 3AVKA 3VEVA 5I42A 2BDPA 4CZEA 4QCLA 5CZ1A 3B8AX 1X1PA 5CR4A 3TAGA 4KI6A 3L2UA 2YI1A 3ALYA 4FM1A 1DLOA 1YXQA 4AILC 1LOTB 3AVGA 3EKUA 1EXQA 2O8FA 2ASCA 3LDLA 5IWAK 3VOVA 3VERA 3J7ZO 1LWFA 2WFBA 4A59A 2E8AA 1T8EA 4Z0UA 3SQ4A 4CEDA 4MQ3A 2HHSA 1VSDA 1QS4A 3KK7A 3WNHA 3AVAA 2HHVA 2BH1A 3MN7A 1NNEA 3A8YA 3D2FB 4IOCL 3ZSVA 1NKCA 4YOWA 1SN4A 3M1FA 3VQQA 4N56A 4IBNA 1NKBA 2D0CA 3U6FA 1I2VA 2KGQA 1NOYA 2FLOA 2O8EA 4H0XB 3S3OA 3M8SA 5GAEP 3QICA 4WYBA 4MFBA 5GAGP 2E2FA 2E6MA 3RMDA 2DY4A 3UKUA 3VENA 1JCFA 1RFQA 3KLEA 4H5NA 4F4KA 3ZSQA 1T6DA 3AAQA 2ZJPL 2UXCK 2HVIA 3C0BA 2IGIA 3P5JA 3ZX2A 2O8FB 1VSEA 3L2QA 3VQDA 2UU9K 4B3RK 3PO5A 2P9LA 2G8WA 2YIOA 1IBMK 3C95A 3VQ8A 4JAXA 3PIOL 1CXUA 3ZEUA 1SKWA 1J54A 4JEPA 4BR0A 4FWRA 4LF4K 3SPZA 4DQPA 2E5LK 1YVUA 4PKHA 5AQGA 2XY8A 3I55N 2KZZA 4CJFA 2GTDA 2P9NA 4NYNA 3JYTA 4FJ5A 4KPYA 4NYFA 5AQRA 3QINA 2ITMA 2GX9A 3QBXA 1WBDA 4IJAA 1N8RO 3G6EN 1YAGA 1V4SA 3R9PA 1TK8A 3ENHA 2O8EB 4CHYA 5EX5A 3BF1A 4CF8A 4AHUA 1ZYVA 3WXJA 1VQNN 1XMQK 3THXA 3C94A 5KGWA 4GY2B 4FJ8A 2VQFK 3KJVA 3UKUB 4GNIA 1LQQA 4CF9A 3VETA 3CYGA 2YIPA 5KTQA 1Q86O 1NWKA 1B9FA 1FK9A 4OO1J 1NK5A 2KKZA 3IKMA 3ATVA 4AHSA 1NK7A 3RVCA 1NGHA 2P9LB 4A61A 1RCHA 5AFUH 1GOCA 2VG7A 1HPZA 3DLKA 3ZEUB 2W6LA 4MO5A 1Q7YO 1TL3A 3QIOA 4PKIA 5AQFA 5JICA 2YCHA 5EXWA 1GOAA 3HZ6A 3LZJA 4E7JA 2OTLN 1BIZA 1TL1A 3PY8A 4CEFA 1VSHA 1ITGA 2Z1HA 5FROA 4FK0A 4JD2B 5AZJA 3DLBA 3V1QA 4O55A 3OW2M 2JWKA 4JKBA 1HR0K 3D45A 2FSNA 4BR9A 3J81O 3EYZA 2XHBA 4N47A 4LFAK 4BWJA 3O3HA 1HNIA 1A5WA 4BDYA 1XHZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4DTM A;  3O9R A;  3RMB A;  1EX4 A;  1MR4 A;  4C1N I;  4CJL A;  1I94 K;  2QW9 A;  2HST A;  4C8O A;  3SBT A;  4FW2 A;  1KAZ A;  4OX9 K;  3M8R A;  1TK0 A;  4J2E A;  2HHW A;  1KVA A;  4LH4 A;  5EY4 A;  1DEJ A;  1JLG A;  4W5T A;  3EKS A;  1BQN A;  1VK0 A;  2QWP A;  4I2Q A;  1W2B M;  3L3V A;  3HVR A;  1VQ4 N;  4FCY A;  2O8D B;  3QBW A;  4HUG A;  1BOT O;  4DR7 K;  4JHD A;  1JKZ A;  2OYQ A;  3L0Q A;  4DMN A;  5F1X A;  3CM5 A;  1E4G T;  2W6K A;  3OA9 A;  3CQY A;  5E41 A;  4DLE A;  2QK9 A;  1EWQ A;  3K57 A;  1VSF A;  2E1Y A;  1OKJ A;  3NF6 A;  3KC6 A;  4W5R A;  4FJJ A;  3TU5 A;  3ZET B;  3RRG A;  2P9U B;  3QML A;  2BGG A;  5HLF A;  4CE9 A;  3C6U A;  2GWK A;  3VQ4 A;  5I9E B;  4HHF A;  3K2P A;  4O8U A;  1GLB G;  2F9T A;  4JKG B;  3QNO A;  5CYQ A;  1S1W A;  4PUO A;  2LT8 A;  3V9Z A;  1Z26 A;  4FW1 A;  4Z4G A;  3QFP A;  4B1Y B;  1EQY A;  3QNN A;  3MX2 A;  2NRH A;  1TAU A;  3LM2 A;  3CHW A;  1ZVG A;  2IS3 A;  1S9G A;  4XEI A;  1P00 A;  1AHO A;  5AQW A;  4OPH A;  3EE8 A;  3DLH A;  1ASU A;  3W0L A;  2YNG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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