5AQVA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
source organism Homo sapiens
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
total genus 125
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqvA04
3GBTA 3LDOA 2AP1A 3O6WA 5BR9A 2I7NA 3WXJA 5JICA 3O8MA 3JXUA 3DWLA 3ZX0A 1T44A 4EIAA 3FGUA 3FZKA 3L0QA 1HKGA 5AFUH 5AZJA 4WQ4A 3GOIA 2A3ZA 3IMXA 3U9ZA 1KAZA 2FSNA 3ZETB 4BR7A 3R9PA 1BOTO 2QWRA 2FSKA 3A5MC 4CZEA 2IVOA 5AQMA 1D4XA 2IVPA 5AQVA 5JLFA 5ADXA 1V4TA 3A0IX 4H5RA 1YVNA 3U4LA 1J6ZA 3ZEUB 1HUXA 2ZGYA 3IFRA 3LM9A 5AQGA 1IG8A 4JHDA 4IO8A 3H6EA 5AQXA 1NWKA 3HTVA 2GTDA 3HM8A 4QS8A 1JCFA 1HKBA 2D4WA 4BR4A 1TUYA 5AQSA 1X3NA 2CGLA 3GL1A 5AQWA 3IUCA 4CJ7A 5B8HA 3CJ7A 3GDQA 3FR0A 2E2PA 4CD1A 4QS9A 2FF6A 4AM7A 5EY4A 2E2QA 4MLEA 4BRIA 3VF6A 5BPLA 2EWSA 4J8FA 4K43A 2QM1A 3G25A 4BGBA 3J8AA 1U6ZA 2A6AA 3O80A 4E1JA 3EKUA 3H1VX 4IJAA 3D2EA 4BC2A 1GLFO 3ENOA 3FZMA 1GLJO 5F0XA 2Q36A 3SMSA 3ENHA 2PBDA 3RSEA 4BRMA 1BUPA 3VERA 2P9IA 3GE1A 2ZWHA 3MN7A 4LC9B 1ATRA 4CZLA 2QWNA 4RCHA 4F9OA 2NZTA 2ASMA 2P9SA 3O1WA 4WYBA 3I33A 1MWMA 3CJBA 1BDGA 4FSVA 4BRFA 4I6MB 1U2VA 4IXCA 2GWKA 4AM6A 3O5BA 3VENA 4PL7A 4H5VA 4PKGA 1X9JA 4BVOA 5AQNA 1OKJA 5KQDA 4MLHA 3ULEB 3VGMA 1QQNA 3DXMB 5AQOA 1ZC6A 4JN4A 1TYQB 2Q1NA 3AAQA 4BC4A 4BRKA 1K8KB 1WUAA 3M3ZA 5FPNA 2P9LB 5AQFA 5AQRA 4ISFA 4DQ8A 1NGHA 5BPNA 4YDUC 3H3OB 4BC5A 4IJNA 2GUPA 3UB5A 5JMVA 2P9PA 5FPEA 3QBWA 3TU5A 3VETA 3VEYA 1V4SA 3D2FB 2ZF5O 3SJHA 3C0BA 4O5FA 3VEVA 5AZIA 3M1FA 4BQZA 3FLCO 2HMPA 2P9NB 4M7XA 1BO5O 2KHOA 2Q31A 1GLCG 3OHRA 3A8YA 5LJWA 1SZ2A 2FXUA 5ELZA 4B1WB 1BU6O 1JCEA 4H5WA 1ZBSA 3SMPA 2VYPA 3KZBA 5E26A 2ASOA 3VEOA 4PL8A 4JD2B 3H1QA 5AZJB 4H0XB 1NGJA 3UKUB 1NGBA 2ASPA 5KPRA 3LDPA 4H5NA 3H46O 2E2NA 3BP8A 4CZFA 3HI0A 4FWLA 4FOEA 4B1ZA 2H3GX 4CZIA 2Q2RA 2A41A 2GELA 3ZETA 4DHYA 1QZ6A 3WT0A 2A42A 2YJEA 3I8BA 1ZXOA 4H0TB 4BROA 4FWSA 1MA9B 4FWMA 3C7NA 2IIRA 1NGCA 3ZEUA 2HF4A 2Q0RA 1ATSA 4MO4A 5KQ8A 2NRHA 3CJ1A 4FWPA 2F9TA 1NLVA 3EZWA 5AR0A 2VWBA 3LDNA 1C0GA 3EN9A 2QWLA 4B1UB 4BREA 5AQLA 4C23A 1Z05A 4BRQA 1EQYA 1ESVA 3U8XA 2FLOA 2BTFA 3VGKA 4A2BA 1QQMA 5AQHA 3JS6A 4XH5A 3R8EA 2AA4A 3SK3A 4B9QA 5AQKA 5BREA 4K25A 3FZHA 1SQKA 3CIPA 5LY3A 3QDKA 3M6GA 4QS7A 1T6CA 5KPZA 2QWMA 1MWKA 4BG9A 2P9UA 3RSEB 5EX5A 5ADXH 3QFUA 3DXKA 4ISGA 1NGFA 2CGKA 2P9IB 1C0FA 3MDQA 4H0PA 2A40A 2J4RA 3CJAA 4O8KA 1NGEA 3HZ6A 1LOTB 1NGAA 1YUWA 4H0YB 1YXQA 3DAWA 4FPBA 5AQQA 4K42A 5BRFA 3L6QA 4WQ5C 1TUUA 1KXPA 4CZHA 4CZJA 4CZMA 2D0OA 3WEEA 2YHWA 4HWIA 4GNIA 3UKRA 2W41A 5AFUA 3F9MA 5EOYA 4EAHD 4I6MA 2CGJA 2P9KA 4BR2A 3CETA 2DPNA 3LDLA 4CZGA 5BN9A 4XH4A 2HOEA 4A62A 1NMDA 5LJVA 1YAGA 3SLCA 4PKHA 4FL9A 1GLLO 1E4GT 3DXMA 1HJOA 3BUZB 2QWOA 2HF3A 2PAVA 5AQIA 3DJCA 2ZGZA 1K8KA 4MO5A 3D7EO 3WQUA 4NO7A 3WXLA 2P9LA 3FE1A 1XQSC 3CQXA 3CI5A 3H3NO 1LCUA 4YDUA 3AAPA 3TPQA 4A61A 1WOQA 5EXWA 4FPAA 5F2RA 4KBOA 3LM2A 5AZIB 4BRDA 3D2FA 3EL2A 1G99A 3QBXA 2GEMA 4FWOA 1DGKN 2QXLA 1R59O 2GWJA 4JAXA 3VGLA 3VF2A 3FZLA 2E1YA 1QZ5A 3EKSA 5FPDA 1E4FT 5AQUA 5E84A 5JLHA 3A5OC 5BN8A 3QICA 1NGIA 3A5LC 4WQ4C 1XUPO 5EVZA 3MMVA 4ISEA 4CI6A 1NM1A 2YHXA 3P4IA 1H1VA 5AQJA 4FWNA 1RGIA 1SAZA 4JD2A 5F1XA 3UKUA 4Z94A 1GLEG 4EHTA 1NGGA 1S22A 5AQPA 1DEJA 1KAXA 3MN9A 1ATNA 4FO0A 4K41A 4CBWA 5AQTA 4FWKA 2E1ZA 3EO3A 4BR5A 3CJ9A 3CJCA 2YCHA 2D0PA 1X3MA 3CQYA 5BPMA 4HTLA 2CH6A 2YI1A 4JHDB 4B1YB 3C7NB 3VPZA 4H03B 4B1XB 5AQYA 4BQLA 3WXIA 2NLXA 3LDQA 1HLUA 3ZX3A 3KHYA 2FSJA 4BRHA 3HSCA 2E88A 1BA1A 3O4WA 3ZX2A 2E2OA 5CE3A 3CHWA 3MN5A 1DKGD 4EFHA 1NGDA 4B1VA 3KVGA 1XC3A 2UYTA 3VEWA 1Y64A 3VEXA 4M7YA 4M63C 4CBXA 1RDWX 4RTFD 3VEZA 3AY9A 2A5XA 3MCPA 4A2AA 5KPTA 1KAYA 5BRDA 3U9DA 5FPMA 3B8AX 3BEXA 2E20A 3MK6A 3S41A 2YJFA 3LL3A 3D2EB 2V7YA 4BRGA 3W3DA 3QB0A 4FOIA 2V52B 4BG8A 1BWFO 4FWQA 3ATUA 5BRHA 1IJJA 2IVNA 3O08A 4EHUA 4FWRA 2W40A 1HKCA 1MDUB 3H45C 4NB4A 4BRAA 2P9UB 3ATVA 3CERA 5AQZA 3DXKB 4CBUA 2I7PA 2P9SB 2QW9A 4CD3A 4H5TA 5I9EB 4Y0WA 4BRCA 3VF4A 3BF1A 1U2VB 1T6DA 2YHYA 3IDHA 3O1BA 3AARA 4CZKA 4WQ5A 3WEEB 4DCHA 3A5NC 2Q97A 2BUPA 1P8ZA 3UKRB 2FF3B 1CZAN 3GG4A 5TKYA 1NBWA 2OANA 4IZ9A 3L4IA 3WUHA 2P9KB 4BRNA 2QWQA 3ULEA 1GLBG 1QHAA 3VOVA 1JCGA 4BC3A 3FZFA 1TYQA 2CH5A 4L3QA 3ID8A 4XEIA 3WQTA 2WUSA 1HPMA 4BR9A 3W0LA 2QWPA 3UE5A 3QFPA 1QQOA 4GY2B 3FFKB 3VESA 3QMLA 1Q18A 2P9PB 4BGAA 4BVPA 4H0VB 4IWVA 4XH1A 2F9WA 4BRLA 1BA0A 4JNEA 2V7ZA 2D1KA 3HBTA 1GLAG 1RFQA 4BR0A 2Q0UA 1HX1A 4RWTA 1GLDG 2ITMA 4BRPA 2E8AA 2VCPA 3MN6A 3R6MA 4H0OA 4PKIA 2P9NA 1BG3A 4DB3A 1S3XA 2V51B 3BF3A 1Z6RA 3WXKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GBTA 3LDOA 3DLEA 3VQCA 3OYBA 5BR9A 3O3FA 4M3WA 3ZT3A 1Q7YO 4IDKA 2DFFA 2XY8A 3O9UA 4FLWA 2KFNA 2A3ZA 3IMXA 3U9ZA 1ZYQA 3TSPA 1CN2A 3AVBA 3R9PA 4CZEA 3CPWM 2IVPA 3SJJA 4CFDA 4FW2A 4CEEA 4H5RA 1YVNA 2XY6A 1EWQA 4F2SA 1HUXA 4CVNE 4DSEA 1FKPA 3NGIA 4DUZK 1VSLA 4WFAL 4E72A 3CM6A 1BRZA 3CW4A 4CGHA 1HNZK 4FLXA 3V9WA 3E1YA 4KHWA 2GTDA 4QS8A 1JLGA 2VGMA 4KAZA 1NJWA 3PSMA 1TUYA 3KIOA 3U3YA 3OYLA 1IG9A 1SKRA 1VSJA 1U04A 4CJ3A 5AQWA 1MR4A 4KH5A 4IKFA 4Z4FA 1X1PA 2B5JA 2LY5A 3AO1A 3C6TA 4RW6A 1HYVA 5LMNK 4CHQA 3AA5X 5EY4A 2QKKA 1A5VA 1XMOK 4BRIA 3P31A 4JKHA 4JYAK 2QM1A 1NKEA 1VSIA 4BGBA 3V1OA 1RDBA 1U6ZA 2A6AA 4E1JA 3HYFA 4CEZA 2ZJQL 3ENOA 5F0XA 3RTVA 4JV5K 3SMSA 1RDAA 1POIA 2ZJPL 4CFCA 3F9KA 3GE1A 4X65K 2QEXN 2IS3A 3MN7A 1TL3A 3OYMA 1RTHA 1WSJA 4KH6A 5C12A 1KRPA 3FFIA 2GBZA 4RCHA 1LQHA 4F9OA 2ASMA 3THYB 4DS4A 1QSYA 4XIUA 4CJ4A 3I33A 2RN2A 4I6MB 2FBXA 4NLBA 1U2VA 4IG3A 2GWKA 3THVA 5J2PA 3KHWA 3O9SA 5C15A 4H5VA 4CF9A 1SL1A 4DKWA 4BVOA 4DR7K 4MLHA 3KK3A 1JZBA 1QQNA 3DXMB 4DR4K 4JN4A 1TYQB 2NRXA 4M3ZA 2OYQA 1CXUA 2AJQA 3L56A 2HHXA 4LF7K 5AQFA 1LQIA 4ISFA 3QERA 1N34K 5BPNA 4YNQA 4BC5A 4AB0A 3UB5A 3CMAN 2HHWA 1T7AA 3QNOA 4JKGA 3SV3A 3CC4N 1NOYA 3VEVA 4BQZA 3FLCO 1TK8A 1VQLN 2B68A 2Y1JA 2WC9A 3OHRA 4JEPA 1VQ6N 2FXUA 1RILA 1VRTA 4PQUA 3HM9A 3F73A 4H5WA 2G8VA 2W6KA 1R0AA 3KZBA 1VSKA 3KD5E 4OKEA 4PL8A 3H1QA 3AV9A 4H8KA 4CZFA 4B1ZA 4FWLA 2IOCA 3JYTA 3M5RA 3MWPA 2GELA 4BDPA 3G10A 3ZETA 1QZ6A 2P5GA 1EETA 2A42A 1P90A 3AGRA 4F8RA 4OLBA 4FZXC 1NK4A 4A5BA 4DFJA 4BROA 1MA9B 4FWMA 3VN5A 1EWRA 2W6LA 4JI2K 4MO4A 1LAVA 4FLVA 1A5XA 2LKBA 5AR0A 3AVAA 1UWBA 3LDNA 1C0GA 4OVLA 4DS5A 1ZU3A 3EN9A 3OBYA 3OTOK 3L2UA 4FJLA 3TR8A 3AVGA 4FJGA 4I7FA 1G15A 4C23A 4DUYK 3RVCA 1Z05A 2Q3SA 4LY7A 3K0SA 1EQYA 1ESVA 2O4GA 3NCIA 3VGKA 4AHVA 4J2BA 1QQMA 5AQHA 1P0AA 3KK1A 4FJ9A 3DLHA 5AQKA 5BREA 4K25A 4DQQA 3CCQN 4X66K 2KQ2A 2ASCA 1J54A 3QNNA 3M6GA 4QS7A 1T6CA 4H4MA 4YOYA 2F8TA 4TSXA 1MWKA 3PO4A 3RSEB 3M8RA 1WAFA 4OLAA 3QFUA 1HJRA 2N66A 4O8KA 4M3XA 1NGAA 1YUWA 4YOVA 3IAYA 3DAWA 1IKYA 3HP6A 3SI6A 1D9FA 1VQON 1N4NA 3AVKA 2G8WA 5I3UA 4E7HA 3HPOA 3DOKA 3A2FA 4HWIA 4DR2K 3LDSA 5J2QA 4QOZB 1QTMA 4Z4IA 2WOMA 1WSFA 3H08A 3NF8A 4KHNA 1I2UA 4CZGA 3PX6A 2NRTA 2D0CA 4F2RA 4Q5VA 5LJVA 3KKRA 2HHUA 5HROA 3AA3A 3KLIA 1GLLO 1E4GT 1HJOA 4OJRA 3BUZB 1WSGA 4HHFA 4K8ZA 3MEGA 1N6QA 1J5OA 4MO5A 4B08A 4NO7A 4BDZA 2G8KA 3CI5A 1VSEA 1ILYA 4K0KK 3AVJA 4AEIA 2ZM6K 4JRPA 5KK4A 5K14A 1LV5A 5F2RA 3AVMA 2K35A 3TAEA 4B3OA 4DFMA 1HYSA 4BRDA 1JL1A 4O0IA 4IOCL 2GEMA 3VQ4A 4KPYA 1QZ5A 3KLHA 1I3AA 1BHLA 2IDOA 1RBRA 1E4FT 1KFDA 5E84A 4CEQA 3SUOA 1NGIA 2KBHA 4WQ4C 3QEIA 2FBVA 1NM1A 4KREA 3CM5A 3UKUA 4FJ5A 2Z1JA 1NGGA 3ID6A 4EHTA 1I6GA 2G8FA 4FO0A 3V9ZA 1Q9YA 2Z1GA 4AHUA 1B3CA 2N2QA 4FWKA 4MDBA 4AH9A 2E1ZA 3EO3A 4BR5A 3TWHA 1JZAA 2KFZA 5BPMA 4DQPA 3AVNA 4B1YB 5HRNA 1K73O 4FJMA 2WONA 4B1XB 4DU1A 2MN5A 4CJ5A 3ZX3A 3KHYA 3WXMB 1D8YA 2F8SA 4CERA 1BA1A 3THXB 4FLZA 3TTCA 3JAMO 2FBYA 1QE1A 4CJQA 4EFHA 5C25A 4AHRA 1YHQN 3BDPA 4F3TA 2UYTA 2LY6A 3QLHA 4IEIA 4GV3A 2A5XA 2BH1A 3MCPA 3VQAA 1HQUA 1KAYA 2LR3A 4CGJA 4CJPA 2B6AA 3B8AX 3O4NA 3U6FA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3GBT A;  3LDO A;  3DLE A;  3VQC A;  3OYB A;  5BR9 A;  3O3F A;  4M3W A;  3ZT3 A;  1Q7Y O;  4IDK A;  2DFF A;  2XY8 A;  3O9U A;  4FLW A;  2KFN A;  2A3Z A;  3IMX A;  3U9Z A;  1ZYQ A;  3TSP A;  1CN2 A;  3AVB A;  3R9P A;  4CZE A;  3CPW M;  2IVP A;  3SJJ A;  4CFD A;  4FW2 A;  4CEE A;  4H5R A;  1YVN A;  2XY6 A;  1EWQ A;  4F2S A;  1HUX A;  4CVN E;  4DSE A;  1FKP A;  3NGI A;  4DUZ K;  1VSL A;  4WFA L;  4E72 A;  3CM6 A;  1BRZ A;  3CW4 A;  4CGH A;  1HNZ K;  4FLX A;  3V9W A;  3E1Y A;  4KHW A;  2GTD A;  4QS8 A;  1JLG A;  2VGM A;  4KAZ A;  1NJW A;  3PSM A;  1TUY A;  3KIO A;  3U3Y A;  3OYL A;  1IG9 A;  1SKR A;  1VSJ A;  1U04 A;  4CJ3 A;  5AQW A;  1MR4 A;  4KH5 A;  4IKF A;  4Z4F A;  1X1P A;  2B5J A;  2LY5 A;  3AO1 A;  3C6T A;  4RW6 A;  1HYV A;  5LMN K;  4CHQ A;  3AA5 X;  5EY4 A;  2QKK A;  1A5V A;  1XMO K;  4BRI A;  3P31 A;  4JKH A;  4JYA K;  2QM1 A;  1NKE A;  1VSI A;  4BGB A;  3V1O A;  1RDB A;  1U6Z A;  2A6A A;  4E1J A;  3HYF A;  4CEZ A;  2ZJQ L;  3ENO A;  5F0X A;  3RTV A;  4JV5 K;  3SMS A;  1RDA A;  1POI A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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