5AQVA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK COGNATE 71 KDA PROTEIN
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 125
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqvA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqvA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqvA04
5EX5A 2CGJA 5AQFA 1ATRA 4CJ7A 3U8XA 4F9OA 3IMXA 3L6QA 2KHOA 4H5RA 5AQNA 2ZGZA 3VF2A 1MWKA 3QBWA 3WXLA 4AM7A 4ISGA 2IIRA 3LM9A 1S22A 1QHAA 1NWKA 1TUUA 2ASOA 3CJ9A 3QICA 3LM2A 4IXCA 5KQDA 2FSNA 3HSCA 2CH5A 4FOIA 2W41A 3L0QA 5EOYA 1SAZA 2E2NA 2YI1A 3IDHA 3IFRA 2E1YA 1NBWA 2ASMA 1K8KA 2QW9A 4B1XB 4PL7A 5KPZA 5E84A 3A5MC 4BC5A 1ESVA 3LDPA 2YJEA 4ISFA 1GLJO 2D4WA 4RCHA 4H0OA 1X9JA 3WEEB 1OKJA 5KPTA 3FZHA 4WYBA 2DPNA 4A2BA 5EVZA 4O8KA 5AQVA 1XQSC 2CGLA 1NGDA 3GBTA 1NGJA 4WQ5C 3CJBA 1H1VA 3GL1A 4CZEA 3O08A 2ZGYA 5I9EB 3GE1A 4BR7A 3AAQA 1ATSA 4BRCA 4BRKA 5AQIA 3VEVA 3D7EO 5EY4A 1GLDG 4BC4A 4BRIA 3ATVA 1P8ZA 2CH6A 1V4SA 5AQGA 4M7XA 3VEOA 4IWVA 3QFPA 3KHYA 2QWNA 1T6DA 3MDQA 5LJVA 2YHXA 1NGIA 3GDQA 3HTVA 4H0PA 1S3XA 2Q0UA 1K8KB 4EAHD 5AZIA 2P9KA 3JXUA 2GEMA 4JD2A 3SLCA 3HZ6A 4BR0A 5AR0A 3VEYA 4FWSA 3EN9A 5AQTA 4C23A 4H0YB 2QWOA 3FE1A 1SQKA 3O1BA 3EO3A 2ZWHA 3VEZA 1NMDA 4I6MA 3MN6A 3ZETB 3KZBA 3VGLA 3KVGA 1MA9B 4NO7A 5BRHA 3R8EA 3D2FA 4FWMA 4FWNA 4CZFA 3SK3A 3TPQA 3O1WA 5B8HA 2P9SA 3DXKB 4BQLA 2EWSA 3VPZA 2QWMA 5BRDA 1RGIA 1BO5O 5CE3A 2HF3A 5AZJB 5BREA 2P9KB 4LC9B 4QS9A 1DEJA 2E88A 1HKBA 4B1YB 4BR4A 1RDWX 2A40A 4YDUA 4WQ4C 4XEIA 3FLCO 2ASPA 4H5VA 5AQYA 4BRQA 5AQQA 4FWOA 1BU6O 4JHDB 5F0XA 4M63C 5AQHA 1BA1A 5AQOA 3AAPA 4A62A 4CBXA 3C7NB 4BR5A 1NLVA 1EQYA 4BROA 4Y0WA 1R59O 3ENOA 1IG8A 4O5FA 2P9SB 3U9DA 1C0FA 1DKGD 2WUSA 1LCUA 1ZC6A 2E2PA 3VENA 3VF4A 4WQ5A 5AFUH 2YJFA 1QQOA 4A2AA 3EL2A 3UKUB 2CGKA 3QBXA 1Q18A 1JCFA 3QMLA 2Q31A 1HUXA 2P9UB 4H0XB 5AQJA 4YDUC 2GWJA 3HM8A 4M7YA 3WUHA 3F9MA 4PKHA 1MDUB 4H0TB 1QZ6A 4B1VA 3MN9A 3ZX3A 3ENHA 3M6GA 3UKRA 3GOIA 2QWQA 3OHRA 5ELZA 2V51B 2E1ZA 3ULEA 3D2EA 4JN4A 4B1ZA 4EIAA 4CZIA 3CQXA 1NGAA 1RFQA 1YAGA 3EKSA 2E2QA 1XUPO 4B1WB 4IZ9A 2OANA 1TUYA 4BGBA 3M3ZA 3DAWA 3HBTA 4BRHA 2IVOA 4QS7A 2D1KA 3A5LC 2E2OA 3EKUA 3ID8A 1NGGA 4H5NA 4DHYA 3WQTA 2P9IA 1DGKN 2YHYA 3ZX0A 1GLAG 3DXMA 5LJWA 3DWLA 3S41A 4QS8A 4CZMA 4MLHA 2FXUA 1LOTB 2FF6A 2F9WA 5LY3A 3ATUA 5BPMA 5JLFA 2GTDA 1GLEG 1TYQA 4BVOA 3SMPA 1KXPA 3B8AX 1BWFO 4K42A 4BRDA 3MN5A 4IJNA 1IJJA 3ULEB 5JMVA 1GLLO 3BF1A 4FOEA 2GELA 4NB4A 1YUWA 3L4IA 4BRGA 4K25A 3AY9A 3O4WA 1X3MA 3O80A 4BRAA 3CJ7A 3SMSA 1YVNA 3FZLA 4WQ4A 1U2VA 2FSKA 4BC3A 4GNIA 3JS6A 4FPBA 2VCPA 4E1JA 1G99A 4RWTA 3FR0A 2P9PA 1T44A 1HX1A 3U4LA 4MO5A 2Q0RA 1NM1A 4FWQA 3WT0A 1HKCA 1V4TA 4CD1A 4PKIA 2UYTA 4IJAA 4KBOA 2W40A 2P9NA 5AFUA 1TYQB 3FZKA 3AARA 2QWRA 3LDNA 4K41A 4MO4A 2A42A 3H3NO 1CZAN 3QB0A 3VOVA 4CBWA 5FPNA 3VEWA 5AZIB 2YHWA 2GUPA 1D4XA 5KQ8A 2QXLA 4JD2B 3M1FA 3RSEA 3DJCA 3A5NC 4CI6A 3H1QA 1U6ZA 3VESA 4H0VB 3VGMA 1HKGA 1HPMA 4EFHA 3CHWA 1Z05A 5EXWA 4I6MB 4FSVA 4BRPA 3TU5A 3VF6A 5AQKA 4BQZA 4BRLA 3EZWA 2QWLA 1E4GT 3D2FB 2HMPA 4BRMA 3H3OB 3O8MA 4B9QA 3O5BA 4A61A 4CZLA 5AQUA 4RTFD 4BR2A 4CBUA 4BC2A 4FWLA 1XC3A 5BRFA 3SJHA 3W3DA 3QDKA 3A8YA 4AM6A 3LL3A 4CZGA 5BPLA 2A5XA 1GLCG 3CQYA 3LDQA 1T6CA 3LDLA 1QQNA 3BEXA 3HI0A 3VGKA 3VETA 1HLUA 3ZEUA 5AQWA 2V52B 4BVPA 3WQUA 3WXIA 2V7YA 3MK6A 4DQ8A 3WEEA 1E4FT 1Y64A 4EHUA 2PBDA 1ATNA 2AP1A 3MN7A 5FPDA 5FPMA 2D0OA 1QQMA 2I7NA 2QWPA 4FWKA 3C0BA 1BA0A 4JNEA 3QFUA 3CIPA 2P9LA 2VYPA 4PL8A 5AQZA 1HJOA 4XH4A 3CJCA 4IO8A 5F2RA 1KAZA 5ADXH 1NGBA 1KAYA 2A6AA 5F1XA 3MCPA 3WXKA 4FWPA 4H5WA 2NLXA 3A5OC 4J8FA 4BR9A 4BRFA 4K43A 3O6WA 2HF4A 2J4RA 3FFKB 2BTFA 3IUCA 3UE5A 3ZEUB 3I33A 3CETA 4CZKA 3WXJA 3J8AA 2F9TA 2HOEA 2I7PA 4FO0A 2Q1NA 3CERA 1BG3A 3U9ZA 2IVPA 3FGUA 5AQLA 4DB3A 3CJ1A 3UKRB 3MMVA 4DCHA 4BRNA 1NGHA 3D2EB 1JCGA 1ZBSA 1WOQA 1NGFA 3W0LA 3ZETA 2VWBA 2E8AA 4HTLA 2P9LB 5JLHA 5AQRA 4CD3A 4H5TA 3H45C 2YCHA 1WUAA 1NGCA 3H1VX 2PAVA 3LDOA 4B1UB 1MWMA 1ZXOA 3G25A 4H03B 3BUZB 2AA4A 2P9IB 3DXKA 2V7ZA 3FZMA 1C0GA 2IVNA 3DXMB 2NZTA 2ITMA 3P4IA 1BUPA 5E26A 3UB5A 5AZJA 2FF3B 3FZFA 3A0IX 4L3QA 4Z94A 1QZ5A 3H6EA 2Q2RA 2FSJA 3VERA 2Q36A 2QM1A 1GLFO 3ZX2A 5BR9A 5KPRA 3R9PA 3CJAA 3BF3A 4FPAA 4XH1A 1YXQA 1Z6RA 4ISEA 4PKGA 2D0PA 5JICA 3BP8A 1KAXA 2E20A 4JHDA 5BN8A 4CZHA 4CZJA 5AQMA 2GWKA 1GLBG 1U2VB 3C7NA 5AQXA 4EHTA 5AQPA 1BOTO 3H46O 4MLEA 4BG9A 1NGEA 4GY2B 5ADXA 4BGAA 2P9PB 5BN9A 5FPEA 3I8BA 2H3GX 2ZF5O 4HWIA 2P9NB 3UKUA 2FLOA 1X3NA 3GG4A 3CI5A 1BDGA 2P9UA 4BG8A 1J6ZA 3VEXA 2A41A 4JAXA 5BPNA 1JCEA 2NRHA 2A3ZA 4XH5A 4FL9A 2Q97A 5AQSA 3RSEB 5TKYA 4FWRA 1SZ2A 2BUPA 3R6MA 4BREA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1OH6A 1SEGA 1VQKN 1KV0A 4H4MA 2E2FA 1VK0A 2QK9A 3U8XA 4OKJA 4F9OA 4M3XA 4FM0A 3RRGA 1F21A 3OYHA 4H5RA 3AVJA 2KBHA 3QIPA 3VF2A 1CZ9A 1MWKA 3QBWA 1DT9A 4O5BA 2RF2A 2IIRA 3LM9A 2WBNA 3DOLA 3KLFA 3D0PA 4A5AA 2B3CA 1SN1A 4FOIA 3L0QA 4CJEA 3KLEA 4G9ZA 4O55A 2YI1A 5J2MA 2W42A 4B1XB 1X1PA 3AVMA 5KRSA 3NDKA 4BC5A 3CCQN 4ISFA 4UAFE 1OKJA 5KPTA 2DPNA 4LSNA 5AQVA 1TL1A 3RMDA 2HVHA 4CZEA 2R7YA 1RTJA 2ZGYA 2KBJA 1YJNN 1LQIA 3GE1A 2YC1C 3AAQA 1ATSA 4CJSA 1JJ2M 5CY0A 5AQIA 1JL2A 2EX3A 3VEVA 4FJJA 4CJLA 1SN4A 4KV8A 3AO1A 4CFDA 2O8FA 1MU2A 2HHVA 5AQGA 1K8BA 4M7XA 3KHYA 1T6DA 1NGIA 4H0PA 4DTNA 1K8AO 3OYJA 1LQQA 2GEMA 3R1XA 4RW8A 2P51A 3JSMA 1QTMA 1QSLA 3U3GA 4U7BA 3EN9A 4C23A 5JENA 4DU3A 1N34K 3FE1A 1SQKA 2BGGA 3EO3A 3MWPA 3VEZA 3KTQA 2ITGA 4CEQA 4CEBA 3M8RA 4E7KA 3KVGA 4NO7A 3R8EA 4DF8A 3T69A 4CZFA 4WFAL 3AA2A 3SK3A 3V9WA 5IT9O 4RW7A 4FJ5A 5JS1A 2P9SA 3SZ2A 1Q8IA 3DRRA 4M41A 1HMVA 3OY9A 3VPZA 1WNSA 5CE3A 2HF3A 4JEPA 3SAGA 2OYQA 1KSPA 4CEEA 2A1SA 3AVNA 1DEJA 1HKBA 4BR4A 1RDWX 1GPSA 1SKRA 4XEIA 3FLCO 1T03A 1QS4A 5C24A 2KQ2A 4YORA 3CF5L 1WAJA 4FJXA 1JLBA 4H5VA 4CK2A 3AVBA 5AQQA 4JHDB 3ZSWA 2YNGA 4YOYA 3TSPA 2N69A 1EWRA 3ULDA 4HE7A 3L2VA 4IG3A 3DLLL 1IKWA 1AHOA 2P9SB 1KVBA 2E2PA 4M45A 3CMAN 5DMRA 4WQ5A 1VQ8N 4U67L 4KB0A 1QQOA 3LPTA 3UKUB 2CGKA 1EP4A 1XI1A 4GW6A 1JCFA 4MQ3A 1HUXA 1LWEA 2Q31A 1EO1A 5AQJA 4YDUC 5CZ2A 4JKBA 3F9MA 2VY6A 1ILYA 1WBDA 4KHWA 3CCRN 2QWQA 3T19A 4B3SK 2C1GA 5ELZA 2V51B 3VQ6A 3K57A 4EIAA 4B1ZA 4CZIA 2HHIA 5J2PA 1YAGA 1T7EA 3S5TA 3OYBA 2E2QA 4BGBA 3M3ZA 3DAWA 3OYEA 3NGIA 4BRHA 1JKHA 1HQUA 2D1KA 3EKUA 2MZ0A 2QTDA 3ZX0A 1DGKN 3RWUA 4M3TA 5LJWA 1NG9A 3RMAA 3ZT3A 4M42A 5LY3A 2FF6A 2F9WA 3KK3A 4JI5K 2HHQA 3KLGA 5BPMA 4JI1K 4DTSA 4UQGA 2GTDA 2I5JA 4KTZA 4BVOA 1JXBA 2XHBA 1KXPA 3MX5A 1BWFO 4EZ6A 4OVLA 1JXCA 1YT3A 3S3NA 1HJRA 3HK2A 1YUWA 2E3FA 4DLGA 3AY9A 4CF2A 4BRAA 2YBRC 1YVNA 4NYFA 2G8IA 4BE0A 3FZLA 1KD1O 4KHSA 2Z1JA 2FSKA 1WT7A 1C6VA 2VCPA 4W5QA 1NNEA 3OYLA 3NCIA 2LKBA 1WMTA 4LH5A 3AO5A 4MO5A 3ZSQA 1NM1A 4FWQA 5J1EA 2O8DA 3AGKA 1S5JA 1JLQA 4PKIA 3C6AA 2HSTA 3SPYA 1T1TA 4YFUA 2LT8A 2P9NA 4FJIA 4CVNE 3OYDA 2UUAK 1UA0A 1RT5A 4WFBL 4DUZK 3EEQA 1BIUA 1GOCA 1S1UA 3H3NO 3QB0A 3TWHA 4FM1A 1T05A 4DU4A 4DSKA 1D4XA 4JD2B 1BIZA 2Y1JA 4KI6A 1HPMA 4KHNA 1KVCA 1Z05A 3I8DA 3T1AA 1NOYA 3OS1A 4I2PA 4LFAK 4AHTA 1DTQA 3TAFA 3CM5A 3CFRA 3TU5A 3VF6A 3I0SA 3O4QA 4KYPA 3SCXA 4IO9L 2PFUA 4B9QA 3O8MA 1IBKK 2PYLA 4CZLA 4RTFD 4CBUA 4BC2A 3NVMA 1DQ7A 4CF9A 1IO2A 3E9OA 3NHGA 1POIA 1S1WA 2ZQBA 4W5NA 3QDKA 3HOTA 3MEGA 2A5XA 1YTUA 2KZZA 2NRZA 1QQNA 4YNQA 3BEXA 3VGKA 2HMIA 1KTQA 1YHQN 4F4KA 3LP1A 1NK5A 5AQWA 2V52B 2GL1A 1TAQA 1YJ9N 4J2DA 2G2KA 4RW4A 2RN2A 3E01A 2QI2A 2XY6A 4BE1A 1VQ4N 5FPMA 1QQMA 2I7NA 3KD5E 3OYMA 4QOZB 3QFUA 2VYPA 4BECA 1TI5A 3C6HA 4IO8A 3CJCA 4HCBA 1NGBA 1AYJA 3PY8A 4KI4A 4NCBA 2F96A 3RVCA 2NLXA 2RHKA 4K43A 2NY8X 1XHXA 3TAMA 1J5EK 2J4RA 1C0TA 3PLAA 1SKSA 4NCGA 3FFKB 2VG7A 4H8KA 2BTFA 4PQUA 3NVKA 1BI4B 4JI3K 2UU9K 3I33A 4JKHA 1IBMK 5KK4A 2NRRA 1NK6A 4CEFA 2Q1NA 1BG3A 2VGMA 5FLXO 1VAZA 1D8YA 4DB3A 3UKRB 4DFJA 3MMVA 5IWAK 4C8NA 3D2EB 3NF7A 2B68A 1VSMA 5KGXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1OH6 A;  1SEG A;  1VQK N;  1KV0 A;  4H4M A;  2E2F A;  1VK0 A;  2QK9 A;  3U8X A;  4OKJ A;  4F9O A;  4M3X A;  4FM0 A;  3RRG A;  1F21 A;  3OYH A;  4H5R A;  3AVJ A;  2KBH A;  3QIP A;  3VF2 A;  1CZ9 A;  1MWK A;  3QBW A;  1DT9 A;  4O5B A;  2RF2 A;  2IIR A;  3LM9 A;  2WBN A;  3DOL A;  3KLF A;  3D0P A;  4A5A A;  2B3C A;  1SN1 A;  4FOI A;  3L0Q A;  4CJE A;  3KLE A;  4G9Z A;  4O55 A;  2YI1 A;  5J2M A;  2W42 A;  4B1X B;  1X1P A;  3AVM A;  5KRS A;  3NDK A;  4BC5 A;  3CCQ N;  4ISF A;  4UAF E;  1OKJ A;  5KPT A;  2DPN A;  4LSN A;  5AQV A;  1TL1 A;  3RMD A;  2HVH A;  4CZE A;  2R7Y A;  1RTJ A;  2ZGY A;  2KBJ A;  1YJN N;  1LQI A;  3GE1 A;  2YC1 C;  3AAQ A;  1ATS A;  4CJS A;  1JJ2 M;  5CY0 A;  5AQI A;  1JL2 A;  2EX3 A;  3VEV A;  4FJJ A;  4CJL A;  1SN4 A;  4KV8 A;  3AO1 A;  4CFD A;  2O8F A;  1MU2 A;  2HHV A;  5AQG A;  1K8B A;  4M7X A;  3KHY A;  1T6D A;  1NGI A;  4H0P A;  4DTN A;  1K8A O;  3OYJ A;  1LQQ A;  2GEM A;  3R1X A;  4RW8 A;  2P51 A;  3JSM A;  1QTM A;  1QSL A;  3U3G A;  4U7B A;  3EN9 A;  4C23 A;  5JEN A; 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