5AQWA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
382
structure length
379
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIKST
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HEAT SHOCK 70 KDA PROTEIN 1A
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 120
structure length 379
sequence length 382
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqwA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqwA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqwA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqwA04
4AM6A 2P9UB 3VF2A 4FWOA 2CGJA 5AQIA 3TU5A 3UKRB 3IFRA 4I6MA 3I8BA 3ULEA 1WUAA 1E4GT 2KHOA 4JNEA 5B8HA 4CZEA 5F2RA 2I7PA 2YI1A 4FOIA 2A5XA 2A40A 4CZHA 1BUPA 4LC9B 1OKJA 3TPQA 1LCUA 2AP1A 3A0IX 5FPMA 2J4RA 1HKGA 3VEXA 2NRHA 4GY2B 1LOTB 3VEWA 3QFPA 5AQQA 4EHUA 2CH5A 3KHYA 5AZIB 5BPMA 3R8EA 3H1VX 2QWLA 5AQMA 2IVNA 1GLDG 5EOYA 3A8YA 3W0LA 1T44A 4BROA 3EZWA 1GLAG 3H3NO 1S3XA 3D7EO 1XC3A 2E1YA 3VF4A 1K8KB 1KAYA 2D1KA 3F9MA 4BR4A 1MWMA 3VEOA 1X3MA 3J8AA 3ZEUB 5CE3A 2FSKA 1DKGD 3VETA 3SMSA 3ZX0A 2P9KB 5AQUA 1TYQA 1S22A 1JCFA 5LJWA 1NGDA 5AQJA 2D0PA 2F9TA 3QBXA 5AQRA 3FZFA 5AQWA 2CGKA 2Q97A 1C0GA 2NZTA 2QWMA 1KAZA 3GL1A 1DGKN 2QWNA 4WQ4A 1XUPO 2HOEA 3EKSA 3FR0A 3VGMA 1GLFO 3C7NA 4B9QA 3D2EB 5ADXH 3U4LA 2V52B 3DWLA 4CZGA 2QW9A 3ENHA 3U9DA 1X3NA 1GLBG 2EWSA 3GBTA 4I6MB 2P9LA 1BDGA 2I7NA 3AARA 3ULEB 1BG3A 3DXKA 4RCHA 2BUPA 4H03B 2E20A 1XQSC 3SK3A 5F0XA 4BQLA 2NLXA 4H5RA 3BP8A 3O8MA 1NGEA 1IJJA 2UYTA 3ID8A 3SJHA 1BA0A 3A5LC 1HUXA 3LDQA 5JLFA 5AQSA 4XH5A 2F9WA 2DPNA 3QFUA 4FL9A 3DXMA 5FPNA 3CHWA 3WEEA 4PL8A 1R59O 3QICA 5KQDA 3EKUA 4IJAA 4FWLA 2QWPA 1JCGA 2IVOA 4PL7A 2E2QA 2A42A 1YVNA 3GOIA 2W40A 5AQHA 4M7XA 1HX1A 3SLCA 2ZF5O 3CI5A 5BN8A 4CZLA 1TYQB 4K25A 4NO7A 1T6DA 4FWNA 2Q0UA 4DQ8A 4WQ5A 4DCHA 4CZMA 5EX5A 5BRDA 1JCEA 3ZETA 1BU6O 4QS7A 4M7YA 4CBUA 5ADXA 1SAZA 3CJAA 5FPDA 4BC3A 1Y64A 3WT0A 4PKIA 3VF6A 3FZKA 3CJCA 3C7NB 4BR9A 2YJEA 1WOQA 1U6ZA 1KAXA 4H5NA 3VESA 4A61A 3IMXA 5TKYA 4BR7A 3ZX2A 1E4FT 1YXQA 3BF3A 3MK6A 2P9LB 4JAXA 5LY3A 1CZAN 4JN4A 3AAPA 1ZBSA 4IJNA 1BO5O 3DXKB 5KPTA 3CQYA 5BRHA 4BGAA 4BRCA 4BRAA 4WQ4C 1ATSA 4BRMA 3MN7A 2GEMA 3HI0A 1NGGA 3U8XA 5AQZA 3MDQA 3WXIA 3HBTA 3GE1A 1ESVA 4BG9A 4H0XB 4H5WA 2PBDA 5EXWA 2P9IA 4DB3A 3MN5A 4AM7A 3LDLA 3H1QA 3LDPA 3FZMA 2HF3A 3HM8A 1RGIA 2ASMA 3FLCO 2FSNA 1QZ5A 3L0QA 4B1ZA 3S41A 3DXMB 4F9OA 4EAHD 2IIRA 1NGAA 3L6QA 2YHWA 3WEEB 4J8FA 3BEXA 3FFKB 3O1WA 2H3GX 3A5MC 3DJCA 5JLHA 3FZLA 3O08A 5BPLA 2QWRA 2ITMA 2GWJA 5AZJA 1NBWA 3D2FA 1HLUA 3QDKA 4BVOA 2E1ZA 2FF3B 4C23A 2W41A 5KQ8A 3OHRA 4H5VA 1NGHA 3VEYA 5EY4A 4ISFA 3O4WA 1NLVA 3CQXA 1HKCA 3VOVA 3O80A 4CBWA 2ASPA 4FOEA 5AFUH 5I9EB 3ZETB 1NGFA 4BGBA 1HJOA 1ATRA 4CZFA 4MO4A 3FGUA 1RFQA 1YUWA 3QMLA 4FWSA 4YDUA 4MO5A 2VWBA 2FXUA 4BC5A 1NGBA 3VGLA 5F1XA 4ISEA 3VEVA 2YHYA 4BRKA 5AQFA 4B1VA 3CIPA 4FWQA 4BRPA 1SZ2A 3AAQA 3GDQA 4CBXA 3G25A 4BVPA 5AQXA 2YCHA 1D4XA 3W3DA 3I33A 3B8AX 2VCPA 4BRIA 3MN9A 4FWPA 3EO3A 5KPZA 4H0TB 2P9SA 4MLEA 4BQZA 2ASOA 1RDWX 3VPZA 3UB5A 1KXPA 4O5FA 3FE1A 1NGCA 3VEZA 1X9JA 2P9IB 3BF1A 2E88A 1DEJA 3CJ1A 4L3QA 3LM2A 5E26A 3H46O 4EIAA 4B1WB 5E84A 2PAVA 3UE5A 3A5OC 1NMDA 1YAGA 4H5TA 2QXLA 1TUUA 3WUHA 3LDNA 4RTFD 5AZJB 1NGIA 2QWQA 5BREA 3D2FB 1TUYA 3H45C 4JHDA 4E1JA 1C0FA 5AR0A 4H0OA 4K41A 5AFUA 2V7ZA 4WYBA 2QWOA 3HZ6A 4BR0A 4CD1A 4Z94A 3HSCA 2V51B 3MCPA 4H0YB 1V4SA 1U2VA 1J6ZA 3ENOA 4BRFA 2GWKA 5LJVA 5JMVA 2ZWHA 3H3OB 3DAWA 5AQKA 4BR5A 4QS8A 5AQVA 4CD3A 5BR9A 1QZ6A 1ZC6A 4Y0WA 4FWKA 4K43A 3MN6A 3UKUA 4B1YB 2P9NA 2D4WA 3RSEA 3U9ZA 3C0BA 2YJFA 1BOTO 5AQTA 4FPBA 4BRQA 3VGKA 3CJ7A 3IUCA 3A5NC 4IXCA 4A62A 1G99A 4IO8A 4BRLA 1MA9B 3QB0A 5FPEA 1ZXOA 3ZX3A 4GNIA 4YDUC 5AQYA 4PKHA 4MLHA 4EHTA 2P9SB 4FSVA 5JICA 4BREA 2A6AA 3QBWA 1Q18A 3LDOA 3AY9A 2P9PA 2ZGYA 3M1FA 3VENA 1SQKA 2Q2RA 4XH4A 3WQUA 4A2AA 3CETA 1EQYA 3HTVA 3IDHA 4ISGA 5AQNA 4JD2A 4QS9A 4CZIA 2OANA 2Q1NA 4B1UB 2E2NA 2GTDA 1BWFO 4BC4A 1P8ZA 2YHXA 3CERA 2D0OA 3M3ZA 4FO0A 4A2BA 4BRHA 4CJ7A 1NGJA 3WQTA 4CZKA 3EN9A 4JHDB 2Q36A 1NWKA 2HMPA 4FWRA 1V4TA 2P9UA 4PKGA 4BR2A 2BTFA 3R9PA 1BA1A 5KPRA 3VERA 1GLEG 3UKRA 2FLOA 3JS6A 1QQMA 2A41A 2ZGZA 1HKBA 1IG8A 2FSJA 3LL3A 3MMVA 4DHYA 2GUPA 3BUZB 1Z6RA 1U2VB 3LM9A 3R6MA 4FPAA 4EFHA 2E2PA 2GELA 5BRFA 1GLJO 4H0PA 3JXUA 4IZ9A 5AQGA 4KBOA 2V7YA 3P4IA 4WQ5C 4XEIA 1QQOA 4B1XB 3FZHA 4CZJA 2IVPA 3O1BA 3UKUB 2HF4A 4HTLA 2E2OA 2P9NB 3CJ9A 1H1VA 3RSEB 5BPNA 4M63C 4BRDA 2A3ZA 2Q31A 5AQPA 3SMPA 3L4IA 5AZIA 2VYPA 3GG4A 1GLCG 3WXLA 4RWTA 2FF6A 4BG8A 4BC2A 1NM1A 2CH6A 1T6CA 2WUSA 3H6EA 3KVGA 1K8KA 4CI6A 3ATVA 2QM1A 1ATNA 4FWMA 4K42A 3O6WA 3WXJA 3ZEUA 4BRNA 5AQLA 2CGLA 2Q0RA 4HWIA 3ATUA 1QHAA 1QQNA 5BN9A 2P9KA 2E8AA 4H0VB 1HPMA 2P9PB 3WXKA 5EVZA 4O8KA 4XH1A 5AQOA 1MDUB 1MWKA 4IWVA 4JD2B 3CJBA 4BRGA 2AA4A 5ELZA 3M6GA 1Z05A 3D2EA 1GLLO 3EL2A 3O5BA 3KZBA 4NB4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2O4IA 4IO9L 4AHSA 5AQIA 1JL1A 4CGHA 1LQHA 3I8BA 3ULEA 1KCFA 1BI4A 2KHOA 4JNEA 2LJ7A 4CZEA 2NRVA 2WFBA 3CCQN 3BZCA 3T69A 4LC9B 4NCBA 4FM2A 4FLTA 1SEGA 1LQIA 4HE7A 1VSEA 4RG8A 4U67L 1NH5A 1BL3A 2XY8A 3PSIA 3VEWA 4K8ZA 4W5TA 3QFPA 5I3UA 4WFAL 4EHUA 3CMAN 2CH5A 2QWLA 2IVNA 3W0LA 5EOYA 3A8YA 3AA3A 4BECA 1WN7A 3KJVA 1S3XA 3D7EO 1QTMA 4HHTA 2E1YA 1EETA 3NCIA 4DR2K 3C6UA 1TI5A 2LKBA 3RVCA 3G0ZA 1X3MA 1OVQA 3J8AA 3ZEUB 2UUCK 3TAMA 1ZUTA 1FKPA 2FSKA 4DMNA 1DKGD 2FC0A 2P9KB 1S22A 1DLOA 3ITHA 4OJRA 5LJWA 4O0JA 3SV4A 3G4SN 1TKTA 1BISA 5LMNK 4Z0UA 1KD1O 1YITN 1KAZA 4QOZB 1ZBUA 1DGKN 3KC6A 4HUFA 3M5RA 3VGMA 3THYB 3LP0A 5GAGP 3U4LA 2G8WA 3ULDA 2OPPA 1IBKK 3C6TA 1TKDA 3U9DA 2ZM6K 2SN3A 2P9LA 5HLFA 1DTQA 3RMDA 3AARA 4ILGB 4CHNA 3PIOL 4H4MA 3RMAA 4H03B 2HNZA 2NLXA 1YVUA 4FZXC 1REVA 1IJJA 2UYTA 4KI4A 2O8FA 4CJQA 2W6LA 2B6AA 3E66A 2HBKA 4CESA 5DMRA 3THXA 3LDQA 3TSPA 1TK5A 4XH5A 3TARA 4FK0A 3KWGA 2RPIA 1BMRA 4B8CA 1TVRA 3F73A 3NVMA 4NLCA 2HHTA 3RTVA 4LFAK 2XY6A 1B3CA 2UXCK 1JCGA 1XNRK 1JLBA 1YVNA 3OYEA 5HRSA 4M7XA 2KBHA 2X6NA 4O55A 2ITGA 3SLCA 1ASVA 3CG7A 4LF8K 4FWNA 1JL2A 4CZMA 5BRDA 3OYKA 3AA2A 5SZTA 3TSUA 3LANA 1NK9A 4JI4K 1UOCA 5FPDA 2ZQBA 4BR9A 4CIFA 4DV4K 4ZTJA 1WOQA 4KI6A 3EE8A 4O44A 4H5NA 3MXJA 4R79A 5C10A 1YXQA 4JAXA 5LY3A 1ZBSA 1IH7A 1BO5O 4CFDA 4IDHA 3U3GA 3P1GA 1TL3A 1RT3A 2OPRA 1ATSA 4KTZA 4WQ4C 4BRMA 2GEMA 3S3OA 1QVGM 1YI2N 4EZ9A 4CJ5A 3V9SA 1NNEA 3Q7BA 3WXIA 3J7ZO 4ICLA 2P5GA 3I8DA 4H5WA 4KKOA 5EXWA 4DB3A 1YIJN 1BRZA 4AM7A 2G8UA 1KV0A 3HM8A 3K9JA 4DR5K 3EY1A 1HYSA 3S41A 2PYJA 4EAHD 4E19A 3L6QA 1L3VA 3O08A 4M3TA 2ITMA 2GWJA 1ICAA 1RTDA 5C25A 3D2FA 3AO2A 4C23A 4AAZA 5A2QO 4V19S 1NKEA 5HBMA 3VEYA 3O9TA 1JJ2M 3DRRA 1QHTA 4ISFA 3CQXA 3VOVA 3O80A 3T19A 2ASPA 3ZETB 4JS5A 4M3YA 3N4PA 1N34K 4MO4A 1RT6A 3ZLJA 3HP9A 1RFQA 3QIOA 2O8CB 4FWSA 4MO5A 2VWBA 4BC5A 3PV8A 4FM0A 3VEVA 1EWRA 1VRUA 4W5OA 3C65A 1T7PA 3IKMA 5AQFA 4B1VA 3O9SA 3KK3A 3THWB 3SF4D 1W97L 2KSKA 3L56A 3AAQA 4DF8A 4B3OA 4XJXA 4C1NK 1JZBA 1D4XA 5GIOA 2K35A 2VCPA 5K14A 2PZSA 3MN9A 4AEIA 2LN8A 4M3WA 2QEXN 4UY8O 2UXDK 4CQKA 3I0SA 5JS2A 3SPZA 2BDPA 2P9IB 3BF1A 4L3QA 3CJ1A 4BACA 3CFOA 1OH6A 3WUHA 3MWPA 4FJHA 4KO0A 5BREA 3T1HK 4WF9L 1TUYA 4DTSA 4JI7K 5AR0A 4N5SA 4A5BA 1KVCA 3L2QA 1J53A 3THVA 5E41A 4IDKA 4Z4CA 3MCPA 4LD0A 4TSXA 3NH1A 4DR4K 2P51A 1OH7A 3ENOA 2MBKA 1RT5A 4IBNA 5JMVA 3H3OB 3CXCM 3DAWA 1Q86O 5BR9A 1VSDA 4C8OA 1XNQK 1JLEA 2IGIA 3QEVA 3UKUA 4JKGA 5HOOA 3RSEA 3U9ZA 2E0HA 4FPBA 3K5LA 2OPQA 3VGKA 4OPHA 3KD1E 2LSNA 4NYNA 4IO8A 3NAEA 3TTDA 4FLYA 1IKYA 1ZXOA 3D6RA 5D3GA 2LY5A 4Y1CA 5IWAK 3ZCMA 5FRNA 4EHTA 1NOZA 3R3LA 1VSJA 3KOYA 3ASMA 4MQ3A 1ZFUA 1JLQA 3QBWA 4CGIA 4OLAA 1U45A 3IS9A 2XHBA 3M1FA 2WBNA 1SQKA 4XH4A 3LZIA 3E7UX 4CERA 2VG5A 4JD2A 3TTFA 1VK0A 1VNAA 3D45A 2OANA 4C8NA 4B1UB 2E2NA 4CGJA 1K8AO 3OYDA 2PFUA 3CERA 4DFMA 3SQ2A 1WNSA 2VGNA 2BE2A 4CZKA 3EN9A 4JHDB 3OVNA 4OPKA 4PKGA 3K57A 1BA1A 5KPRA 4WE1A 2FLOA 1ZBFA 3AVNA 3T7ZA 3T1YK 1NJXA 4B9UA 2GUPA 1FK9A 4DSFA 1BIUA 1SN1A 1Z6RA 4JK7A 2E2PA 2N66A 1I2VA 4NLBA 1C1AA 4JI6K 4CF0A 1GLJO 1TAQA 3TAGA 3FZHA 3TAPA 4HTLA 2P9NB 1YJ9N 1H1VA 5BPNA 4CHOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2O4I A;  4IO9 L;  4AHS A;  5AQI A;  1JL1 A;  4CGH A;  1LQH A;  3I8B A;  3ULE A;  1KCF A;  1BI4 A;  2KHO A;  4JNE A;  2LJ7 A;  4CZE A;  2NRV A;  2WFB A;  3CCQ N;  3BZC A;  3T69 A;  4LC9 B;  4NCB A;  4FM2 A;  4FLT A;  1SEG A;  1LQI A;  4HE7 A;  1VSE A;  4RG8 A;  4U67 L;  1NH5 A;  1BL3 A;  2XY8 A;  3PSI A;  3VEW A;  4K8Z A;  4W5T A;  3QFP A;  5I3U A;  4WFA L;  4EHU A;  3CMA N;  2CH5 A;  2QWL A;  2IVN A;  3W0L A;  5EOY A;  3A8Y A;  3AA3 A;  4BEC A;  1WN7 A;  3KJV A;  1S3X A;  3D7E O;  1QTM A;  4HHT A;  2E1Y A;  1EET A;  3NCI A;  4DR2 K;  3C6U A;  1TI5 A;  2LKB A;  3RVC A;  3G0Z A;  1X3M A;  1OVQ A;  3J8A A;  3ZEU B;  2UUC K;  3TAM A;  1ZUT A;  1FKP A;  2FSK A;  4DMN A;  1DKG D;  2FC0 A;  2P9K B;  1S22 A;  1DLO A;  3ITH A;  4OJR A;  5LJW A;  4O0J A;  3SV4 A;  3G4S N;  1TKT A;  1BIS A;  5LMN K;  4Z0U A;  1KD1 O;  1YIT N;  1KAZ A;  4QOZ B;  1ZBU A;  1DGK N;  3KC6 A;  4HUF A;  3M5R A;  3VGM A;  3THY B;  3LP0 A;  5GAG P;  3U4L A;  2G8W A;  3ULD A;  2OPP A;  1IBK K;  3C6T A;  1TKD A;  3U9D A;  2ZM6 K; 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