5AQWA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
382
structure length
379
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIKST
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK 70 KDA PROTEIN 1A
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 120
structure length 379
sequence length 382
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqwA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqwA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqwA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqwA04
1BDGA 4DQ8A 5BREA 3LDOA 4PL7A 3VOVA 2J4RA 3BUZB 3TU5A 1HUXA 4WQ4A 3CERA 4FO0A 4FPBA 4EAHD 5BN8A 1GLLO 1ZXOA 2YHWA 3VF2A 4RTFD 2E2QA 1C0GA 1GLDG 3WXLA 5AQGA 3VGLA 3ZETA 5AZJA 1S22A 3BP8A 1DGKN 4BGBA 5AR0A 3MN9A 1QZ6A 1TYQA 3JS6A 2YJFA 2GUPA 4FWOA 3QDKA 3EL2A 4NB4A 3VEZA 1K8KA 1HX1A 4BREA 4BRDA 4H0TB 3WXKA 3HSCA 2Q31A 3MCPA 1BG3A 4Z94A 1LOTB 2QWMA 2YHXA 2F9TA 5F0XA 3AARA 4BROA 4CZMA 1JCFA 2VWBA 4H5WA 5FPDA 5JICA 1E4GT 5AQJA 2E2NA 4EHUA 3L4IA 1GLCG 2FF3B 2V7YA 3R8EA 5EY4A 5BPNA 1RFQA 3UE5A 4BRGA 2QWNA 2FSNA 2CH6A 1NGHA 3ZX3A 3VPZA 3LDLA 3CJ7A 5BPMA 3EZWA 5AQYA 1ESVA 3EO3A 4JHDB 5AFUA 2W40A 2P9IA 3BF1A 3W3DA 3M6GA 2V51B 1K8KB 5LJVA 2A40A 2GEMA 2QWQA 1TUUA 3ZX0A 1J6ZA 4FWMA 4A62A 4CD3A 1KAZA 2IVOA 3FLCO 2QWPA 4PKHA 3KZBA 5BRDA 3DXKA 5ADXA 2ASPA 3GG4A 3L0QA 2IVPA 3WQUA 1T6DA 1XQSC 1Z6RA 3FZHA 3C0BA 4MO5A 3A0IX 3FR0A 2A41A 3D2FA 3L6QA 3CHWA 4H5VA 4BR7A 3AY9A 3DWLA 4FOIA 4BVPA 5KPTA 1GLJO 2GWKA 3KVGA 2CH5A 1NGBA 3HM8A 4H0XB 4WQ5C 2P9PB 3H6EA 3M1FA 3S41A 2E88A 3O6WA 2EWSA 4Y0WA 1T44A 4JD2B 4BR9A 1V4SA 2E2OA 2ASOA 3MN5A 4B1WB 3WQTA 1IG8A 3H3NO 4EFHA 2P9LA 3GOIA 1DEJA 3DAWA 4CBXA 3VGKA 2DPNA 1T6CA 5AQNA 4GNIA 3VETA 1ZBSA 4JNEA 4MLHA 3EKSA 1U6ZA 1S3XA 1YXQA 5EVZA 2E1ZA 3R9PA 3MK6A 3J8AA 3H1VX 2NRHA 5BN9A 3C7NB 4M63C 4BC2A 1XC3A 3LDQA 3LM9A 4C23A 4E1JA 3EN9A 5AQPA 4CZHA 2P9UB 1GLFO 2E20A 2W41A 4L3QA 4CZKA 3D2EA 3O80A 4A2BA 2FSKA 4DCHA 3WEEB 3D7EO 5FPNA 1BOTO 1YUWA 2CGKA 4IJNA 1V4TA 2QWRA 3GE1A 3H3OB 2QM1A 1HKGA 2GTDA 1QQNA 4FSVA 1YAGA 4BQZA 1BA0A 3H46O 1NGFA 3AAQA 3IDHA 5F2RA 2GWJA 3ULEB 3I8BA 4FOEA 2HF4A 1X3NA 4H5RA 2FLOA 5E26A 4JHDA 1NGAA 4KBOA 1HLUA 5AQHA 1ZC6A 4BRMA 3O08A 5CE3A 3D2EB 4IO8A 1BA1A 2HOEA 5TKYA 3VENA 4CBUA 4B1YB 3U9DA 4BG9A 5F1XA 5KQDA 3A5MC 1Y64A 4BRNA 1RDWX 4MO4A 5EXWA 4PL8A 3HTVA 2Q1NA 3GDQA 3FZFA 4O8KA 2P9PA 2D0PA 2PAVA 2D4WA 2VCPA 2I7PA 1NGDA 3FZKA 1SQKA 5AQXA 4HWIA 1LCUA 5LJWA 4JD2A 2QXLA 2Q0UA 3U9ZA 2A5XA 4BR4A 2PBDA 3JXUA 3P4IA 3CJBA 3R6MA 4DB3A 1E4FT 1GLEG 4B1ZA 4H5TA 1CZAN 4J8FA 3UB5A 3FFKB 4BR2A 4IWVA 2A42A 3FZLA 4O5FA 2Q97A 1MDUB 4ISFA 4IJAA 3ZX2A 3G25A 3I33A 2OANA 5AQMA 5ELZA 4BG8A 2D0OA 4PKIA 4CD1A 5LY3A 2H3GX 3B8AX 1ATRA 2BTFA 2CGLA 3M3ZA 2AA4A 2GELA 2IIRA 3LM2A 3C7NA 2FXUA 3EKUA 4ISEA 4WQ5A 4K42A 2QW9A 4BRFA 2P9UA 3RSEB 3LDNA 4BQLA 4FWPA 4RWTA 4H5NA 5AQTA 1WOQA 5AQQA 3SK3A 2P9NB 4BVOA 1X9JA 5AQOA 4A61A 3OHRA 4CJ7A 3WEEA 5KQ8A 3DXMB 4I6MB 3VF4A 4B1XB 4GY2B 4K25A 3VEYA 1GLBG 4A2AA 3O8MA 5AFUH 4NO7A 3UKRB 4FPAA 4EIAA 3LDPA 5AZIB 5AQIA 1MA9B 3SJHA 3GBTA 4FWLA 3ATVA 4BGAA 2P9KB 3QFPA 3ULEA 3SMPA 3WXIA 3QBXA 3IUCA 3O4WA 4H0OA 4IXCA 4K43A 2FSJA 1MWKA 3CJ1A 5BRFA 1Z05A 4XH1A 1OKJA 1NGJA 4CZFA 2A3ZA 2NZTA 1U2VB 4WYBA 2P9SB 5JMVA 4CZIA 3WT0A 4BC5A 3VERA 2ZWHA 1D4XA 3BF3A 2Q2RA 2KHOA 3BEXA 5I9EB 1NBWA 1NLVA 4H0PA 3SLCA 2AP1A 3IMXA 2ASMA 3UKUB 3TPQA 4YDUC 4XEIA 4H03B 4JAXA 3CQYA 3CJ9A 3LL3A 3ZEUA 1HKBA 2HF3A 3VGMA 1BWFO 2IVNA 1G99A 1BUPA 4M7YA 3ATUA 5AQSA 4BRQA 4BR0A 4BRPA 1NM1A 4MLEA 1TUYA 2CGJA 4WQ4C 1DKGD 1HKCA 3MDQA 3WUHA 5AQFA 3VEVA 2Q0RA 1Q18A 4BR5A 4CZLA 3ENOA 2YCHA 1NGEA 3MMVA 4DHYA 1RGIA 3FZMA 3IFRA 5KPRA 1XUPO 1C0FA 3MN7A 5KPZA 2ZGYA 5BPLA 2ZF5O 3QB0A 4XH5A 3VEOA 1QZ5A 3FGUA 3ZEUB 2V7ZA 3W0LA 1BO5O 2Q36A 4BRCA 3VESA 5FPEA 3QICA 3A8YA 4FWRA 3WXJA 2F9WA 1KAYA 3U8XA 3RSEA 2NLXA 2HMPA 3QBWA 4QS9A 1HJOA 1P8ZA 3SMSA 4F9OA 4AM6A 5JLHA 2P9NA 3MN6A 4EHTA 1BU6O 2BUPA 3DXMA 5EX5A 1WUAA 4I6MA 1R59O 3AAPA 4FWQA 3CIPA 4CI6A 1JCEA 3HBTA 3UKRA 3ZETB 5AZJB 5AZIA 1H1VA 2ITMA 3VEWA 1TYQB 2P9KA 2WUSA 3DJCA 1ATSA 4QS7A 4H0YB 3F9MA 5FPMA 2V52B 3ID8A 3A5NC 1GLAG 1HPMA 1KXPA 3U4LA 1NGGA 1EQYA 1YVNA 3CI5A 1U2VA 2A6AA 3ENHA 3H1QA 2I7NA 2P9SA 3O1BA 4B1VA 4RCHA 4CZGA 4FL9A 5AQRA 4B9QA 2FF6A 4PKGA 1QQOA 4HTLA 4BRLA 5AQUA 1JCGA 3UKUA 4BRAA 3KHYA 4FWSA 4BRHA 3A5LC 5EOYA 4CZEA 3CJAA 4BRIA 5AQVA 2P9IB 4XH4A 5E84A 5BRHA 4BC4A 4JN4A 4LC9B 4M7XA 5AQKA 1ATNA 2QWLA 5ADXH 1MWMA 2E8AA 4H0VB 3DXKB 4K41A 5AQWA 2E2PA 4AM7A 3HZ6A 5AQLA 2YHYA 4FWNA 3CJCA 4B1UB 1X3MA 5JLFA 3O5BA 5B8HA 1QQMA 3D2FB 2ZGZA 4BC3A 2UYTA 5AQZA 1NMDA 1NWKA 3QFUA 3VF6A 2E1YA 4BRKA 5BR9A 1SAZA 3CETA 3VEXA 4CBWA 1KAXA 2QWOA 3H45C 3QMLA 2YI1A 3FE1A 3CQXA 4QS8A 3O1WA 2D1KA 3A5OC 4YDUA 2YJEA 4FWKA 1NGCA 1NGIA 4CZJA 1SZ2A 4IZ9A 2P9LB 3HI0A 2VYPA 4ISGA 1QHAA 1IJJA 3GL1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HQEA 4FM0A 3KOXA 4JI5K 3HOTA 3T1AA 2JWLA 1VQ5N 3TU5A 2O8EB 1W0HA 4BACA 3CERA 1GLLO 3CCSN 3VF2A 4CK2A 5HL7L 4FLZA 2HBLA 3VGLA 3ZETA 4BGBA 1VSHA 5AR0A 1N6QA 1RBUA 3JS6A 4NB4A 4FWOA 3QDKA 3EL2A 4CF8A 1K8KA 4LSNA 4M3RA 3SUPA 1SNBA 3RMDA 5J2QA 3WXKA 5JS1A 4GV6A 1LOTB 1WSIA 2YHXA 2X78A 2I61A 2FBTA 3M8PA 1JCFA 2VWBA 5FPDA 5AQJA 3L4IA 3KOWA 1MU2A 3C65A 3VQBA 1JL2A 3MEGA 3RMBA 3CMEN 1CLQA 2GUIA 1RDBA 1KVAA 2ZJRL 1ZUTA 3CJ7A 5GAEP 1ESVA 4CHOA 4E7HA 3KK1A 4DU3A 4KHYA 3BF1A 4F8RA 3L2WA 4C8LA 5LJVA 3LALA 2A40A 3AVLA 1TAUA 4BEBA 3KWIA 4CD3A 1HMVA 2QWPA 3NMUA 3S9HA 2ASPA 3NGIA 2HVHA 1XHZA 1T6DA 3FZHA 1YIJN 1OH6A 2PYJA 3L6QA 4FOIA 5KPTA 1GLJO 4NYNA 1NPIA 4WQ5C 4CEAA 3THXB 4LF7K 2P9PB 4JK9A 3H6EA 4CVNE 3M1FA 3P39A 4CJKA 2EWSA 3OS2A 2LR3A 3T1HK 3KJVA 1C1BA 4CE9A 2E2OA 2HNZA 3WQTA 4EP4A 2UXCK 3H3NO 2KZMA 3NVKA 1HYVA 2HHIA 2BRZA 2O8DB 4JLHA 1T6CA 4DFJA 3LP2A 2EHGA 4Z4FA 3EKSA 2KLAA 2BH1A 1U6ZA 2JLEA 3KP1A 4AHCA 3OYNA 1AYJA 1EKEA 3MK6A 4W5QA 2G8KA 3HXMA 2YNIA 3H1VX 1B9FA 3RRHA 1A5VA 1BISA 3ZSQA 4B3RK 3P83D 2KKZA 1SN1A 1YF5L 5JVGL 1GLFO 5JVHL 1JXBA 2E20A 3O9QA 2W41A 4B3OA 1ILYA 3EE9A 4CZKA 1WN7A 4A2BA 3J7YP 3V81A 1KFSA 4DSIA 3BDPA 3WNGA 2XO7A 4M3WA 1NU0A 4AQYK 1VQ6N 3H3OB 4CGIA 4LF6K 2GTDA 3MEDA 4FSVA 4BQZA 2OA8A 1BA0A 3AVJA 1KCFA 4R79A 4IG0A 1NKEA 4FOEA 2ZJQL 2FLOA 4FW2A 1Q81O 4IOXA 4BE7B 5AQHA 1WNSA 4KH5A 4DWIA 2YC1C 3VQCA 3VQ4A 2B68A 3O9TA 2HOEA 5TKYA 3T7ZA 2K35A 4BG9A 3TAMA 1TKXA 4YFUA 5KQDA 3I8DA 1NK9A 1NOYA 4KHUA 3AVHA 4BE2A 5DM7L 3CC4N 4AAZA 3HTVA 4CHPA 3AVFA 3AVMA 1ASWA 2PAVA 2I7PA 1SQKA 4B9LA 5LJWA 1LCUA 4WFBL 1KSPA 1RTHA 4KPYA 2Q0UA 4N47A 1EXQA 3HOSA 4KRFA 2XRIA 1GLEG 2OZMA 2B3CA 1CZAN 3IS9A 1SL1A 4OVLA 4O44A 2P5GA 1Q82O 4M3XA 4YOXA 5KRSA 1MDUB 2OPQA 3AO4A 4ICLA 4B9UA 3OYEA 3ZX2A 3I33A 4BG8A 4Z4CA 4HTUA 2E3FA 2BTFA 2CGLA 3ITHA 3C7NA 3LWMA 4C8KA 3J81O 1VQ8N 1XWLA 4CJUA 4WQ5A 4E3SA 3RSEB 3LDNA 4BQLA 4H5NA 5AQQA 3CW4A 1BCOA 4JI1K 4AHUA 4PHTX 4WCEL 1X9JA 4A61A 1VQKN 3OHRA 4CJ7A 1K8AO 4CJQA 3DXMB 1WBBA 4CJVA 3Q7CA 4GY2B 3ZSWA 1OH5A 1HYSA 2OCEA 4XIUA 4NO7A 2W42A 4JKHA 5CYQA 1MA9B 1TL3A 3QINA 4JK7A 2OPRA 4CF0A 3PIOL 4N56A 3ULEA 2N2QA 3V1RA 2VY6A 1BMRA 3HP6A 2BGGA 1VHXA 3VQAA 1NGJA 2SN3A 2A3ZA 4WYBA 1NNEA 4CZIA 3AO2A 1SL2A 1RDCA 5GINA 4H4MA 1T03A 3AVGA 4YOUA 1W7AA 1NBWA 1XC9A 3SLCA 2XY7A 3F9KA 2KBHA 3IMXA 5M1PA 3KLFA 3UKUB 4YOTA 2RHKA 4CJTA 4JAXA 2O8BB 4FZXC 3VQ5A 4DV3K 3CYMA 1RBTA 1BWFO 4M7YA 3ATUA 2QTDA 5KGXA 1L5UA 3SZ2A 3PY8A 4BR0A 1NH5A 4DV2K 4HUEA 4PQUA 5KK4A 3E1YA 4WQ4C 3K58A 2WOMA 1DKGD 3WUHA 4B9SA 1Q18A 3PSIA 3PSMA 1T1TA 4CZLA 4DHYA 2XY5A 1WSFA 2VQFK 3NF7A 1J5OA 3AA5X 3PIPL 3QIPA 1YHQN 2ZF5O 3CCMN 3V1QA 1BCGA 5C15A 2E5LK 3ZSOA 1P00A 3W0LA 1BO5O 3TANA 4HVJA 4CEBA 3QICA 1XMQK 1R0AA 3O3HA 3U8XA 3DLKA 4DTMA 1VQON 4GVEA 3SUNA 2ASCA 1P8ZA 5KTQA 4F9OA 4AM6A 5JLHA 1RBVA 2P9NA 2QI2A 1N8RO 5EX5A 4I6MA 4KYPA 1NRBA 4FJ5A 2NY8X 5C2FA 3VTIA 2RE2A 2HSTA 4CJPA 4FK4A 3ZETB 4M3ZA 4MDAA 2I5JA 4CJRA 2PZSA 1I2VA 3THYA 2V52B 1IKYA 3A5NC 3OYLA 4KAZA 3U4LA 1VSJA 2NNWA 1EQYA 1YTAA 4W5NA 3CI5A 1U2VA 1JLBA 2A6AA 4J2DA 2X74A 3SAHA 1BGXT 4DU1A 4B9QA 2XHBA 4PKGA 1QQOA 3LZJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3DJC A;  1ATS A;  4QS7 A;  4H0Y B;  3F9M A;  5FPM A;  2V52 B;  3ID8 A;  3A5N C;  1GLA G;  1HPM A;  1KXP A;  3U4L A;  1NGG A;  1EQY A;  1YVN A;  3CI5 A;  1U2V A;  2A6A A;  3ENH A;  3H1Q A;  2I7N A;  2P9S A;  3O1B A;  4B1V A;  4RCH A;  4CZG A;  4FL9 A;  5AQR A;  4B9Q A;  2FF6 A;  4PKG A;  1QQO A;  4HTL A;  4BRL A;  5AQU A;  1JCG A;  3UKU A;  4BRA A;  3KHY A;  4FWS A;  4BRH A;  3A5L C;  5EOY A;  4CZE A;  3CJA A;  4BRI A;  5AQV A;  2P9I B;  4XH4 A;  5E84 A;  5BRH A;  4BC4 A;  4JN4 A;  4LC9 B;  4M7X A;  5AQK A;  1ATN A;  2QWL A;  5ADX H;  1MWM A;  2E8A A;  4H0V B;  3DXK B;  4K41 A;  5AQW A;  2E2P A;  4AM7 A;  3HZ6 A;  5AQL A;  2YHY A;  4FWN A;  3CJC A;  4B1U B;  1X3M A;  5JLF A;  3O5B A;  5B8H A;  1QQM A;  3D2F B;  2ZGZ A;  4BC3 A;  2UYT A;  5AQZ A;  1NMD A;  1NWK A;  3QFU A;  3VF6 A;  2E1Y A;  4BRK A;  5BR9 A;  1SAZ A;  3CET A;  3VEX A;  4CBW A;  1KAX A;  2QWO A;  3H45 C;  3QML A;  2YI1 A;  3FE1 A;  3CQX A;  4QS8 A;  3O1W A;  2D1K A;  3A5O C;  4YDU A;  2YJE A;  4FWK A;  1NGC A;  1NGI A;  4CZJ A;  1SZ2 A;  4IZ9 A;  2P9L B;  3HI0 A;  2VYP A;  4ISG A;  1QHA A;  1IJJ A;  3GL1 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1HQE A;  4FM0 A;  3KOX A;  4JI5 K;  3HOT A;  3T1A A;  2JWL A;  1VQ5 N;  3TU5 A;  2O8E B;  1W0H A;  4BAC A;  3CER A;  1GLL O;  3CCS N;  3VF2 A;  4CK2 A;  5HL7 L;  4FLZ A;  2HBL A;  3VGL A;  3ZET A;  4BGB A;  1VSH A;  5AR0 A;  1N6Q A;  1RBU A;  3JS6 A;  4NB4 A;  4FWO A;  3QDK A;  3EL2 A;  4CF8 A;  1K8K A;  4LSN A;  4M3R A;  3SUP A;  1SNB A;  3RMD A;  5J2Q A;  3WXK A;  5JS1 A;  4GV6 A;  1LOT B;  1WSI A;  2YHX A;  2X78 A;  2I61 A;  2FBT A;  3M8P A;  1JCF A;  2VWB A;  5FPD A;  5AQJ A;  3L4I A;  3KOW A;  1MU2 A;  3C65 A;  3VQB A;  1JL2 A;  3MEG A;  3RMB A;  3CME N;  1CLQ A;  2GUI A;  1RDB A;  1KVA A;  2ZJR L;  1ZUT A;  3CJ7 A;  5GAE P;  1ESV A;  4CHO A;  4E7H A;  3KK1 A;  4DU3 A;  4KHY A;  3BF1 A;  4F8R A;  3L2W A;  4C8L A;  5LJV A;  3LAL A;  2A40 A;  3AVL A;  1TAU A;  4BEB A;  3KWI A;  4CD3 A;  1HMV A;  2QWP A;  3NMU A;  3S9H A;  2ASP A;  3NGI A;  2HVH A;  1XHZ A;  1T6D A;  3FZH A;  1YIJ N;  1OH6 A;  2PYJ A;  3L6Q A;  4FOI A;  5KPT A;  1GLJ O;  4NYN A;  1NPI A;  4WQ5 C;  4CEA A;  3THX B;  4LF7 K; 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