5AQWA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
382
structure length
379
Chain Sequence
KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIKST
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK 70 KDA PROTEIN 1A
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 120
structure length 379
sequence length 382
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqwA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqwA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqwA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqwA04
3WXKA 4DQ8A 1H1VA 2P9LB 4BR5A 1WUAA 4JHDB 5AQOA 3HI0A 4RTFD 2GUPA 5CE3A 3SK3A 3CI5A 3WQTA 1WOQA 1GLAG 2E2OA 2P9SA 5B8HA 3D2EA 4BQLA 2WUSA 4WQ4C 3CQYA 3SMSA 4H0OA 1DKGD 5KPTA 4CZIA 1OKJA 3L0QA 3F9MA 5EVZA 2E1ZA 2D4WA 3D2EB 3I33A 1NBWA 1J6ZA 3FZLA 2YCHA 1KXPA 1E4GT 4QS8A 2BUPA 3B8AX 3H3OB 2HF4A 3LL3A 4BVOA 3EKUA 4PKHA 3SMPA 1LCUA 3ZX3A 3UE5A 3IDHA 2A40A 3BF1A 4BRDA 3WEEA 3QBXA 5F0XA 1X3NA 2ZF5O 4H0PA 4WYBA 3LDQA 2EWSA 2IVPA 2ZGZA 3A8YA 1NLVA 1NGDA 5E84A 2Q36A 3WEEB 4CD3A 4CBUA 4IWVA 4M63C 1GLCG 2CGKA 4L3QA 4PL8A 4BRMA 4BR7A 1KAZA 4H0VB 3HM8A 3P4IA 1ZXOA 1ZBSA 3MN5A 4BG8A 3KVGA 4A2BA 3CJCA 4BGBA 3W3DA 3A5MC 3VF4A 3BF3A 3W0LA 4BRGA 2P9KB 4BROA 4IXCA 2V51B 3CHWA 4IZ9A 2CH6A 5JICA 2UYTA 4CI6A 4FWKA 4H5NA 3LDOA 4AM7A 4FOEA 4B1YB 1NM1A 3RSEB 4H5RA 2YI1A 1Y64A 1EQYA 3FR0A 4ISGA 4XH1A 4C23A 1E4FT 2P9NA 4JD2A 4BG9A 3C0BA 2BTFA 4ISFA 3VEOA 5AQYA 3MMVA 1GLLO 1BO5O 4F9OA 5AQIA 3R8EA 2QWPA 3QMLA 4NB4A 2P9NB 3CJ7A 4JD2B 4HTLA 4YDUA 1NGIA 4FWLA 5KQ8A 2PAVA 5LJWA 3HSCA 3BUZB 3LM9A 5AQRA 1S22A 1BUPA 5BPLA 5E26A 2QWQA 2GWKA 4FO0A 5BN8A 4IJNA 4A2AA 4CZEA 2Q0RA 1NWKA 1HLUA 3FZHA 3VF2A 4EHUA 1S3XA 3VETA 3EZWA 2F9WA 1G99A 3GE1A 5FPEA 4WQ5A 5AQKA 2ZWHA 1XC3A 3EL2A 3A0IX 5AQZA 5AZIA 2ITMA 3TU5A 3O80A 1KAYA 3UB5A 1TUUA 3CIPA 4A61A 3S41A 2FF3B 3I8BA 4XEIA 3O1BA 5AQPA 3ATUA 3KZBA 4FPAA 4K42A 3QDKA 4WQ4A 2E1YA 5AZJB 3WUHA 3GOIA 3H3NO 2V52B 4BREA 5AFUA 2ZGYA 3UKRB 2YHWA 4BRFA 3QICA 1NGEA 3UKUB 1BOTO 2H3GX 3U9ZA 3ENHA 1ATNA 3FLCO 4CZHA 4DCHA 5BRDA 4HWIA 4CZLA 4BRQA 1RGIA 1HKCA 4JAXA 2ASMA 3ZETB 3VF6A 4H5WA 2VYPA 4Y0WA 2HOEA 5LJVA 3WT0A 3WXIA 3CERA 4O5FA 4H0XB 5BRFA 1NMDA 3GBTA 2QWMA 3DAWA 3EO3A 4B1ZA 5AQGA 5AQUA 2NRHA 3H45C 4H0TB 2V7ZA 1TYQB 4BRAA 3O5BA 4IO8A 5BR9A 2A5XA 2W40A 5BPNA 3IFRA 1K8KB 4IJAA 3J8AA 2P9IB 1IJJA 4H5TA 3M6GA 4BR9A 3LDPA 2DPNA 3GG4A 2OANA 3DWLA 4MLEA 3VESA 3LDNA 4BVPA 1NGGA 3HBTA 4QS7A 5BN9A 4K25A 2NLXA 3LDLA 4B1UB 2E8AA 4GY2B 3AY9A 4CJ7A 2E2QA 4EHTA 3ID8A 3MN7A 2P9KA 2FLOA 4FWSA 1U2VA 4CBWA 3O6WA 1XUPO 2E20A 3VENA 5EX5A 3FZKA 3EKSA 3AAPA 1C0FA 3A5LC 3R9PA 1MA9B 4RCHA 3L4IA 3RSEA 1NGFA 3VEWA 1U2VB 1NGBA 4RWTA 3O08A 3VEVA 2CGLA 5KPRA 2E2PA 3H46O 3D2FB 3M3ZA 2CH5A 3ULEB 4BRLA 4H0YB 1HX1A 4BRCA 2ASPA 4FOIA 2FSJA 1NGJA 4BR4A 3ZX0A 4BC3A 1YAGA 2FSKA 1BA1A 2E2NA 3SLCA 1BG3A 5ADXA 4CZMA 1C0GA 4MO4A 4FWOA 3U4LA 1IG8A 1KAXA 5BPMA 4QS9A 3ENOA 5ADXH 1RDWX 4EIAA 1YXQA 2YHYA 3VGMA 3CQXA 1D4XA 3O4WA 2E88A 2Q97A 3QB0A 1U6ZA 4FSVA 5F2RA 5FPMA 2GEMA 4BRKA 3FGUA 4J8FA 4BC2A 3D7EO 4BQZA 2QM1A 2D0OA 2D0PA 4DHYA 1QZ5A 5I9EB 3CJAA 4PKIA 4NO7A 3A5OC 4FWQA 2HMPA 2QWRA 1Q18A 3R6MA 4FPBA 4BR2A 3MN9A 5AZJA 3AAQA 3DJCA 3WXJA 3H6EA 1T6DA 1QQOA 1JCEA 1Z05A 2A3ZA 4FWNA 2HF3A 4I6MB 3UKRA 4B1WB 1DEJA 3L6QA 5F1XA 3UKUA 3OHRA 3IMXA 5TKYA 3HTVA 5AQMA 4CZJA 1XQSC 3HZ6A 1BA0A 4JN4A 5FPDA 3ZETA 5JMVA 1HJOA 1BU6O 2KHOA 5AFUH 1ZC6A 4FL9A 2GTDA 4EFHA 1HKBA 1HPMA 3WXLA 5FPNA 2QW9A 3ZEUA 1NGHA 1GLFO 1YVNA 1ATRA 3H1VX 1MWKA 3U8XA 4M7XA 4JNEA 4XH4A 4BRIA 2FSNA 3VERA 1TYQA 3C7NA 1MDUB 5BRHA 3ZEUB 3U9DA 3FZFA 4CZFA 5BREA 3WQUA 4DB3A 1SAZA 1K8KA 1R59O 2I7PA 5KQDA 3CJ1A 4PKGA 2P9IA 3ZX2A 2QWLA 3IUCA 1GLBG 3C7NB 4PL7A 1BDGA 2I7NA 5AQXA 4XH5A 2P9SB 3CETA 4A62A 1SZ2A 2Q31A 3BEXA 1JCFA 1NGAA 4K43A 5ELZA 2VWBA 1TUYA 3QFUA 2A6AA 4BC5A 1T44A 2V7YA 4GNIA 1HKGA 1Z6RA 3AARA 4ISEA 2A41A 2ASOA 5AQHA 2FF6A 5AR0A 5EXWA 4H5VA 2FXUA 1P8ZA 3VEYA 3D2FA 4Z94A 2Q0UA 5AQLA 3MN6A 4FWPA 3ULEA 1GLDG 3SJHA 1T6CA 4FWRA 4BRNA 3TPQA 4M7YA 4BR0A 1LOTB 5JLHA 4FWMA 2PBDA 4MO5A 1DGKN 2AP1A 2GELA 5AQNA 1V4SA 4B1XB 1V4TA 1QHAA 3LM2A 1MWMA 5AQJA 3VGKA 2F9TA 1QZ6A 3VOVA 3KHYA 3GL1A 2QXLA 5EY4A 3FFKB 4BRHA 2AA4A 3H1QA 3VPZA 4CD1A 3CJBA 3MK6A 1ATSA 2W41A 2GWJA 2VCPA 2CGJA 3QBWA 1GLJO 1CZAN 1YUWA 4H03B 4BGAA 3O8MA 3JS6A 3GDQA 3MCPA 4BC4A 4K41A 1X9JA 2J4RA 4B9QA 3M1FA 3ATVA 1ESVA 4MLHA 5AQVA 5AQSA 1X3MA 3A5NC 5JLFA 4KBOA 1JCGA 4AM6A 2QWNA 1RFQA 5AQQA 2IVNA 1QQMA 2P9PA 3EN9A 1BWFO 4I6MA 3VGLA 2P9UA 4LC9B 5AQTA 3FZMA 2YJEA 3O1WA 2IVOA 3DXKA 3G25A 4B1VA 5LY3A 4EAHD 5AQFA 3JXUA 2Q2RA 2P9PB 3CJ9A 2P9UB 3VEXA 1NGCA 3DXKB 3DXMA 4YDUC 4BRPA 5EOYA 2NZTA 4CBXA 5AQWA 1HUXA 2YHXA 2A42A 2QWOA 1SQKA 4CZKA 4E1JA 4CZGA 3QFPA 3DXMB 3MDQA 2IIRA 2YJFA 1GLEG 2P9LA 3BP8A 5KPZA 4JHDA 4O8KA 4WQ5C 2D1KA 3VEZA 5AZIB 3FE1A 2Q1NA 1QQNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WXKA 4BR5A 1J9AA 2OPRA 5AQOA 3SK3A 3CCLN 1WOQA 3OYFA 3C65A 2Z1JA 3DOLA 3ALYA 4BQLA 3CQYA 4JKBA 5KPTA 3CCVN 4CZIA 3F9MA 3UIQA 1JXBA 1S1UA 4OKJA 1L3UA 3FZLA 1TK0A 4QS8A 5GINA 2BUPA 3V9ZA 3VQDA 3H3OB 4OPKA 4CK3A 1P90A 4BVOA 3EKUA 4ILJA 3ZX3A 1KVBA 4LF7K 3KLIA 1R0AA 1KCFA 3QBXA 1YJNN 2ZF5O 4Z4CA 2C1IA 4E19A 2EWSA 2IVPA 4EP4A 1O1WA 1YITN 2Q36A 4M63C 4DQQA 1GLCG 4HCCA 4L3QA 4BRMA 4LH4A 3PSMA 3P4IA 1ZXOA 3PSIA 3KLEA 3CJCA 3TWHA 1N36K 3A5MC 3M8SA 1VQKN 3QESA 4HUGA 1I2VA 1ZYWA 3QEIA 4KHWA 3LWLA 4AM7A 1WSFA 4H5RA 1Y64A 4O55A 3CCEN 1EQYA 4ISGA 3VQEA 1Q9YA 2P9NA 3F9KA 3NH1A 4JD2A 3NE6A 3LZIA 3RWUA 2BTFA 3SBTA 3NF7A 1YT3A 1YTUA 4M42A 1FKPA 3AO5A 3RRGA 5AQIA 3AVAA 3ZT3A 4CIFA 2NRXA 4A5BA 2P9NB 3OS2A 4DTUA 2HBLA 4JD2B 3B6OA 1W9HA 3Q7BA 3THXA 3K5OA 2GMOA 3K0SA 3BUZB 3HOTA 2ZQBA 5BPLA 4FJKA 5E26A 3ZSRA 1IKVA 3ZCMA 4A2AA 4RW9A 2Q0RA 3ZSQA 1HLUA 4EHUA 3VF2A 2RE2A 3VQQA 1U48A 3GE1A 1G99A 5AQKA 2N2QA 3EL2A 4DSFA 1BCOA 2BE2A 2Z1HA 4ID1A 1FK9A 1TUUA 5K14A 2LY5A 3S41A 3AGKA 2YHAA 5JVHL 2FF3B 2OTJN 1I39A 3AVCA 1WSIA 4XEIA 3E9PA 3KZBA 4KHQA 2K35A 4NCAA 2LJMA 4JEPA 1HNVA 1NMNA 2E1YA 5AZJB 3TSQA 2VY6A 1U04A 1P0AA 4DTOA 1RT6A 1J5EK 2E2FA 4BRFA 1C55A 3AVLA 1RTDA 4DCHA 1HKCA 4HHTA 4GV9A 1BMRA 4IG0A 1G15A 4DQIA 2HMIA 4IOXA 4WE1A 5LJVA 4FJXA 3WT0A 4CFDA 4FM1A 4AHRA 3QEXA 4GVMA 4F8RA 4M3WA 3DAWA 2YC1C 2ZJRL 2F96A 3H45C 2D56A 4BRAA 5CHIA 4KKOA 3O5BA 2Q3SA 4CGJA 4DV3K 2YKMA 1VHXA 4DV0K 2W40A 4CJQA 3TI0A 4AAZA 2KYQA 1WSGA 2QKBA 2HHQA 2P9IB 3NGYA 4H5TA 4H4OA 1FW6A 4CVNE 1MU2A 3GG4A 2VG6A 2OANA 5LMUK 4DUZK 4KHNA 4EZ6A 4K25A 3SBGA 2E8AA 4NCGA 3OYLA 4I9QA 5C2DA 3ID8A 2P9KA 4JKDA 1XUPO 1YF5L 2E20A 4YOYA 1HMVA 4C8LA 4AHCA 4BECA 3DI6A 1NKEA 3FZKA 3SI6A 4ZTJA 1VSFA 2E6MA 1ZFUA 3O08A 2CGLA 1WBDA 3D2FB 3ULEB 2F4VK 4JS5A 3QINA 4BWMA 4BRCA 4JI5K 4BC3A 3EY1A 4X65K 3L3VA 4H8KA 3NAEA 1BG3A 5ADXA 3LP3A 3HO1A 3KK2A 3NF8A 3DLHA 3L2QA 1JXEA 3U4LA 1Q9XA 2FC0A 4CJ3A 4QS9A 2YHYA 3CQXA 1D4XA 1SNBA 2E88A 1D8YA 2HVHA 5F2RA 1VNBA 3QI7A 5M1QA 3NH0A 3V81A 3E66A 4BRKA 2HVIA 4RW7A 4CHPA 1NK7A 4BQZA 1NOYA 3IG1A 4DHYA 4CJRA 4CJVA 1MYNA 4B9LA 1XRSB 4NO7A 3HVTA 1RT3A 3J7ZO 3QNOA 3R6MA 4FPBA 4CEFA 3MEEA 3WXJA 3SPZA 1JZAA 2X6SA 3H6EA 3V9SA 4FWNA 4I6MB 1WSEA 4B1WB 1RDAA 1LWEA 1KV0A 3UKUA 4KH4A 2QKKA 5TKYA 1IBKK 1RBRA 2KGQA 1QQCA 4QOZB 3OBWA 1IG9A 1PX9A 1EWQA 1BA0A 5FPDA 4YORA 3PIPL 4WFBL 3ZETA 1C1CA 3KLHA 1HJOA 1UOCA 2KHOA 4KHSA 4FL9A 5KTQA 4Z4HA 4DFJA 4DQRA 1HPMA 1VQON 3S5TA 1NNEA 3H1VX 1MWKA 4HUEA 4M41A 2GBZA 4JNEA 3ZT0A 1IKYA 1IO2A 3VERA 4B9UA 4B3OA 3C7NA 3DRPA 1T7PA 4CZFA 4I7FA 1TL1A 2Z1IA 1BI4A 5BREA 2E5LK 1K8KA 1HNIA 5C10A 3VA3A 4PKGA 3C7NB 3AO1A 3N4QA 1WBBA 5C42A 4XH5A 1BI4B 2P9SB 3CETA 4A62A 3RMAA 4JKAA 3BEXA 3PV8A 1JCFA 3QEVA 4G1QA 5ELZA 1JLAA 3C6UA 1T44A 3ZT4A 1Z6RA 2MZ0A 4NXNK 3TAMA 1CZ9A 5EXWA 4H5VA 2LR3A 1K8BA 2ASCA 2GV9A 1SL2A 4IFVA 2GUIA 2KJAA 2Q0UA 3KC6A 1GLDG 1T6CA 4BRNA 1WN7A 1TKXA 3HP6A 1S1WA 1LOTB 2PBDA 1S6QA 2GELA 2OPPA 4DUYK 1ZBLA 4LFBK 2YIPA 4CK2A 2PYJA 5AQJA 1QZ6A 3VOVA 4BDYA 4JI8K 3TSPA 4IOCL 3L2VA 4OPAA 5IT9O 2IGIA 3P39A 4BE2A 2AA4A 4DSKA 1ATSA 3SV3A 1OMYA 3PO5A 4DTNA 2DFHA 4BGAA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3WXK A;  4BR5 A;  1J9A A;  2OPR A;  5AQO A;  3SK3 A;  3CCL N;  1WOQ A;  3OYF A;  3C65 A;  2Z1J A;  3DOL A;  3ALY A;  4BQL A;  3CQY A;  4JKB A;  5KPT A;  3CCV N;  4CZI A;  3F9M A;  3UIQ A;  1JXB A;  1S1U A;  4OKJ A;  1L3U A;  3FZL A;  1TK0 A;  4QS8 A;  5GIN A;  2BUP A;  3V9Z A;  3VQD A;  3H3O B;  4OPK A;  4CK3 A;  1P90 A;  4BVO A;  3EKU A;  4ILJ A;  3ZX3 A;  1KVB A;  4LF7 K;  3KLI A;  1R0A A;  1KCF A;  3QBX A;  1YJN N;  2ZF5 O;  4Z4C A;  2C1I A;  4E19 A;  2EWS A;  2IVP A;  4EP4 A;  1O1W A;  1YIT N;  2Q36 A;  4M63 C;  4DQQ A;  1GLC G;  4HCC A;  4L3Q A;  4BRM A;  4LH4 A;  3PSM A;  3P4I A;  1ZXO A;  3PSI A;  3KLE A;  3CJC A;  3TWH A;  1N36 K;  3A5M C;  3M8S A;  1VQK N;  3QES A;  4HUG A;  1I2V A;  1ZYW A;  3QEI A;  4KHW A;  3LWL A;  4AM7 A;  1WSF A;  4H5R A;  1Y64 A;  4O55 A;  3CCE N;  1EQY A;  4ISG A;  3VQE A;  1Q9Y A;  2P9N A;  3F9K A;  3NH1 A;  4JD2 A;  3NE6 A;  3LZI A;  3RWU A;  2BTF A;  3SBT A;  3NF7 A;  1YT3 A;  1YTU A;  4M42 A;  1FKP A;  3AO5 A;  3RRG A;  5AQI A;  3AVA A;  3ZT3 A;  4CIF A; 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