5AQWA

Fragment-based screening of hsp70 sheds light on the functional role of atp-binding site residues
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
382
structure length
379
Chain Sequence
b'KAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILIKST'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords HEAT SHOCK 70 KDA PROTEIN 1A
publication title A fragment-based approach applied to a highly flexible target: Insights and challenges towards the inhibition of HSP70 isoforms.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Chaperone
total genus 120
structure length 379
sequence length 382
ec nomenclature ec 3.6.3.51: Transferred entry: 7.4.2.3.
pdb deposition date 2015-09-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5aqwA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqwA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5aqwA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5aqwA04
4NB4A 3VF2A 2YJEA 1NGAA 2P9SB 4H03B 4O8KA 4BGBA 4BR5A 5AQVA 2FXUA 2YJFA 5FPDA 5F0XA 2E1ZA 3EZWA 1BO5O 5EVZA 2E88A 3ZEUA 4YDUA 3CQYA 4CZEA 2IVNA 1K8KB 4H0TB 4H0PA 1ATRA 4MO4A 1ESVA 2F9WA 3A5MC 3CJAA 4H0XB 4MLEA 1ZC6A 3U9ZA 2VCPA 3VEVA 2E1YA 2Q0UA 5AQKA 3CETA 2P9NA 4AM7A 1YVNA 3CI5A 2UYTA 4FPBA 1DEJA 3M1FA 1JCGA 3VEWA 4BC4A 3BUZB 2D4WA 4WQ5A 3U9DA 4BC2A 3HI0A 4CBWA 3A0IX 3GG4A 2V51B 4H5RA 4A2BA 2CGLA 3HBTA 1JCFA 3VGLA 4H5NA 2P9LA 1U2VB 3IDHA 1BU6O 3F9MA 4BRNA 3H1QA 4B1YB 3W0LA 3QB0A 3WEEA 4H0VB 1NGGA 4B1XB 1E4GT 2P9IB 3C0BA 1Z6RA 1XQSC 4FWLA 4BC3A 4BRMA 4CZJA 5FPNA 4BG8A 5EY4A 3LDNA 1MWMA 1ZXOA 1X9JA 2V7ZA 2HF3A 4I6MB 4WQ4C 5ELZA 2P9SA 3GOIA 4BGAA 1RFQA 2Q2RA 1HKGA 3A5OC 1BUPA 3ZX0A 1MDUB 5B8HA 1RGIA 4FWPA 3SMPA 1MA9B 2GUPA 4FWSA 4PL8A 3VGKA 4B9QA 2EWSA 2D1KA 3CHWA 3OHRA 3HZ6A 3C7NB 2BTFA 2CH5A 3QMLA 2GEMA 5AQSA 4CZGA 2BUPA 4HWIA 1WUAA 4PKHA 4BRKA 1KAZA 1K8KA 1T6DA 1LCUA 1QQNA 1SZ2A 1S3XA 1WOQA 4XH4A 4B1VA 2QWNA 1V4TA 2D0PA 2KHOA 3A5NC 1T6CA 3WQUA 5AQPA 3WUHA 3ULEB 4JD2B 2ITMA 3H1VX 4BRPA 5AZJB 5AQWA 5ADXH 4BR2A 4BC5A 3R6MA 3U4LA 4BRFA 3WXLA 4K43A 4WYBA 3GBTA 2FSNA 1R59O 4BREA 1YXQA 2OANA 5AQQA 1GLEG 4FSVA 1NGEA 3AY9A 4PKIA 5KQDA 2QM1A 1NBWA 1U2VA 2HF4A 3AAQA 4K42A 3SMSA 4CZFA 4FL9A 1OKJA 4CZLA 4GNIA 3O1WA 4BR9A 4CBUA 2P9IA 2A40A 2PAVA 4FWQA 3VENA 3H6EA 3O1BA 2ASPA 2YI1A 3AARA 5JMVA 2D0OA 3CJ9A 4I6MA 3R8EA 2GTDA 3H45C 3ZX3A 1HJOA 5FPMA 2NLXA 3IFRA 3LDLA 5BPLA 3FGUA 4XH5A 3U8XA 2E2PA 3QFUA 3CJCA 2A42A 5E26A 3EKSA 3BEXA 2P9UB 3C7NA 3MN7A 1EQYA 3IUCA 3MK6A 5AQGA 1NWKA 3P4IA 2QWMA 3WQTA 5CE3A 5AQRA 2CH6A 2QWPA 1QHAA 4IXCA 2I7NA 3A8YA 4EAHD 4EHTA 3ULEA 2P9KB 4JD2A 4BRDA 4FWKA 3QBXA 3FZKA 5AQIA 5AZJA 5F1XA 1NMDA 3VEZA 3DXKB 3MCPA 4PL7A 2QWOA 3JXUA 5TKYA 5AR0A 2VYPA 1ATNA 4M63C 1YUWA 3O5BA 4M7YA 4RCHA 1QZ6A 4XH1A 1GLAG 4H5TA 2GWKA 5BRHA 3LL3A 4JHDB 3VOVA 1NGBA 4B1UB 5EXWA 5JICA 2IIRA 2QWQA 4BRGA 4DHYA 4MLHA 2ZGYA 3VESA 2IVPA 3ATUA 2H3GX 4FOIA 5BPNA 2NRHA 5AQOA 2AA4A 3S41A 4BR0A 2YHYA 3ENOA 1CZAN 4FPAA 3WT0A 4CZMA 3FZMA 3D2FB 4H0OA 3WXKA 4DB3A 3VPZA 2P9UA 3KZBA 2FSJA 1U6ZA 3VEXA 4FO0A 1YAGA 3UE5A 4BG9A 2V52B 3VEOA 1C0GA 1QQMA 3A5LC 3FZLA 3ATVA 1HKCA 1S22A 5BRFA 4EFHA 5BR9A 3KVGA 4YDUC 3VGMA 4AM6A 3FLCO 4Y0WA 1RDWX 5AQXA 2P9KA 1QZ5A 2QWRA 3FE1A 2E2OA 1NGFA 2FF3B 4BROA 2E2NA 3DXKA 3ENHA 4FOEA 1GLCG 4BVOA 1JCEA 3ZX2A 5ADXA 3CERA 4WQ5C 4BVPA 3I33A 2YHXA 3AAPA 3GE1A 1NM1A 4KBOA 4ISGA 3EN9A 3R9PA 3UKUB 4CZKA 4Z94A 4M7XA 2A5XA 1D4XA 2ASOA 1HLUA 3UKRB 4JHDA 3B8AX 5E84A 3D2EB 3EL2A 5KPZA 4O5FA 1KAYA 2ZGZA 1NGHA 5BN8A 3BF3A 2QW9A 2E8AA 2GWJA 1BA1A 5FPEA 1XC3A 4BRLA 3J8AA 3D2FA 1GLFO 5JLHA 2NZTA 1BG3A 4PKGA 3SK3A 4B1WB 1BWFO 3SJHA 3FR0A 4E1JA 2F9TA 3LM2A 3IMXA 4A61A 5AFUA 3KHYA 1ATSA 2Q97A 5AFUH 4JN4A 1HKBA 5AQFA 4DQ8A 1X3NA 1C0FA 5AQTA 3QICA 4QS7A 3WXIA 2A41A 4FWOA 3BF1A 5AQHA 4JAXA 5F2RA 2GELA 3O8MA 3D7EO 4HTLA 2P9PB 2HMPA 5AQJA 3QDKA 4BRIA 1GLBG 3LDQA 1BA0A 3ZETB 1NGJA 2Q1NA 2AP1A 3G25A 4CZIA 2QWLA 3HSCA 2PBDA 1NGIA 3TPQA 5EX5A 3QFPA 3QBWA 4WQ4A 2IVOA 1MWKA 5AZIB 5AQNA 3UKUA 1DKGD 3HTVA 3O80A 3FZFA 4CD1A 2W41A 3TU5A 3HM8A 3JS6A 3UKRA 4B1ZA 1BDGA 3WXJA 4RWTA 3D2EA 5LY3A 3ID8A 2CGJA 5EOYA 2VWBA 4A62A 5JLFA 3L4IA 5BPMA 3M3ZA 2DPNA 4H5VA 2QXLA 4RTFD 3FZHA 4C23A 4ISEA 1H1VA 3VEYA 4QS8A 2WUSA 1T44A 2I7PA 2V7YA 3MMVA 1ZBSA 3CIPA 1V4SA 3EKUA 1GLLO 5KPTA 1Z05A 1LOTB 4MO5A 1XUPO 3W3DA 4H5WA 2ASMA 4NO7A 1DGKN 3EO3A 2FLOA 4K41A 1IJJA 2A6AA 3FFKB 3MDQA 2P9PA 4CD3A 2A3ZA 2YCHA 2FF6A 5AQLA 3I8BA 3ZETA 5AQZA 4GY2B 2Q31A 1X3MA 1HX1A 4J8FA 2CGKA 2ZWHA 4XEIA 2ZF5O 1HUXA 3VF6A 5BN9A 1NLVA 3CJBA 5AQUA 3DAWA 1KAXA 3CQXA 5AZIA 5AQYA 4K25A 3RSEB 4EHUA 3LDPA 1TYQB 3MN5A 3DXMB 3VETA 1BOTO 3MN6A 1Y64A 4F9OA 3L6QA 4IJAA 4IWVA 5I9EB 2E20A 2FSKA 2Q0RA 3VF4A 1TUYA 3BP8A 3DWLA 4IZ9A 2J4RA 4BR7A 4LC9B 4L3QA 1IG8A 4IO8A 1NGDA 2Q36A 1Q18A 3CJ1A 3O4WA 3ZEUB 4BRQA 3M6GA 4FWNA 4BR4A 1G99A 5AQMA 2HOEA 3SLCA 1HPMA 2E2QA 4QS9A 1SQKA 4CBXA 2YHWA 3DJCA 2W40A 2P9NB 3H46O 3L0QA 3O08A 4BRHA 1SAZA 4IJNA 4A2AA 5KPRA 4H0YB 1QQOA 3GDQA 1J6ZA 1GLDG 1P8ZA 5LJVA 5BREA 4CJ7A 3GL1A 4JNEA 4FWRA 3LM9A 4ISFA 2P9LB 5BRDA 5LJWA 4FWMA 4BRCA 3LDOA 4EIAA 4CZHA 3O6WA 1NGCA 3H3NO 3VERA 4DCHA 3WEEB 1GLJO 4CI6A 5KQ8A 3MN9A 1E4FT 4BQLA 3RSEA 4BQZA 3CJ7A 1TYQA 3H3OB 3DXMA 1TUUA 3UB5A 4BRAA 1KXPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2KBHA 3VF2A 3NDKA 1NGAA 2P9SB 4H03B 3G6EN 3TTDA 3PV8A 1IV0A 5AQVA 4AEIA 3HOTA 5FPDA 5EVZA 2E88A 2DFHA 4DKWA 1KTQA 4JI0K 5MLCQ 2NRVA 4A5AA 1K8KB 4H0TB 2JGUA 3PLAA 4NYNA 2F9WA 3CJAA 3VTIA 4CQKA 4DF4A 2GL1A 3VEVA 2E1YA 1YI2N 2Q0UA 4JI1K 5FLXO 1ZBLA 4WFAL 4I2PA 2ZJQL 2UYTA 3F73A 1LW0A 2D4WA 4E3SA 3VQDA 1IKYA 1X9SA 1CZBA 3A0IX 3GG4A 3O4QA 2V51B 4A2BA 4WCEL 3VGLA 3CFPA 2P9LA 1U2VB 5JENA 2Q3SA 4JI8K 4CFAA 4ELUA 4H8KA 3WEEA 1HYSA 1NGGA 1RBUA 2P9IB 4O4GA 4CJ4A 1P90A 3M8QA 4JI3K 3OA9A 3K2PA 1RTDA 5FPNA 4BG8A 1VQ5N 5EY4A 4E1NA 4I6MB 2Z1JA 3AVLA 1BL3A 1WSJA 4DMNA 3GOIA 3A5OC 4H4MA 1BUPA 1RGIA 3L4QA 2GUPA 3RVCA 2GBZA 2X78A 2X6SA 4CF8A 4NLBA 3OHRA 4RG8A 4IEIA 2O8FA 3QMLA 5SWMA 4HWIA 1VSEA 1TKTA 3KD5E 2HB5A 3OYCA 5I42A 3LP3A 3TTFA 1ITGA 4XH4A 2OPSA 3M8RA 1LW2A 1WBDA 2QWNA 3ULDA 3U3YA 4Z0UA 1D9DA 4JD2B 2PYLA 3KOXA 3H1VX 4BRPA 1A5VA 5K14A 3PIPL 2OTJN 1K8BA 1R59O 1YXQA 2OANA 5AQQA 2QA4N 1S1WA 4FSVA 1NGEA 1NOYA 3QIOA 1NBWA 4K42A 2HF4A 3S9HA 3HK2A 4CZFA 1D5AA 4FW1A 4CJSA 4YY3K 4FWQA 3I8DA 4HUEA 4CJQA 2OA8A 3O1BA 4X66K 2Z1GA 4LY7A 2D0AA 3OS0A 4JRPA 1P0AA 3IAYA 3CJ9A 3LPUA 3ZSQA 1EWQA 4QCLA 2BE2A 2LSNA 4DSJA 4JKCA 5BPLA 4NXMK 4JI6K 4CEFA 3CQ8A 3U8XA 2E2PA 3QFUA 2ZM6K 3CJCA 2A42A 1RDDA 3QIPA 1JLFA 1RNHA 4YFUA 4CHPA 1Z26A 2LJMA 1I39A 3MK6A 5AQGA 4IG0A 4CHYA 5CY4A 1GOBA 3B6OA 3DLBA 4IXCA 3HXMA 2VGMA 4LH4A 3T19A 1ZBFA 3HP9A 3KJVA 1ASUA 2NRWA 1UA0A 4CEQA 4BE7B 3FZKA 3AA4A 5AZJA 2O8EB 4DSIA 2NRTA 1NMDA 5FRMA 3DXKB 1WSGA 4FJNA 5CZ2A 5FRNA 3BZKA 3L3VA 4F3TA 2VYPA 3HRGA 1QZ6A 2BH1A 2N66A 3OVNA 2XO7A 1N8RO 4WE1A 3LL3A 4JHDB 4CEZA 3AGRA 1NGBA 3AV9A 3VOVA 5JICA 3E7RL 4FLTA 2QWQA 3OS2A 4DR5K 2IVPA 3CC2N 4M3XA 1W7AA 5BPNA 2NRHA 5AQOA 3S41A 5J2NA 3ENOA 1CZAN 2P5OA 3MWTA 3AVAA 4MQ3A 4N5SA 3OYGA 1VSJA 4Z4CA 1MR4A 1D9FA 3VPZA 1VNAA 1IO2A 3KZBA 1BHLA 2F7TA 1EX4A 4LH5A 3VEOA 5IT9O 1BI4B 3A5LC 3FZLA 4Q5VA 1S22A 4FZZA 4OGCA 1OH7A 3VGMA 3TSUA 1WSFA 3FLCO 2P9KA 3FE1A 3ZT3A 2F8SA 1NGFA 1O1WA 1PE4A 3SAGA 3CG7A 4FOEA 2OYQA 2O8DA 2A7TA 1JCEA 3ZSZA 2HBLA 2LKBA 2AJQA 4FLXA 5ADXA 3P38A 3V4IA 3SZ2A 3K5LA 1LQHA 4IFVA 4J2AA 3GE1A 1DT9A 4CHZA 4CJTA 3KLEA 4FJ5A 4CZKA 3O3GA 4Z94A 2UUBK 1S1TA 3ZLJA 1JXCA 2G8VA 1JZAA 1A5WA 1D4XA 3VQ4A 3KIOA 1HYZA 4FK0A 3RMCA 4CIEA 4GVMA 4AAZA 2JWKA 1X9WA 2HHQA 4GV3A 3HSTB 3MX2A 1K73O 3R1XA 4Y1DA 2D56A 3KKSA 1XNQK 1BA1A 4CK1A 4AHUA 2E3FA 3VA0A 4BRLA 1VQ4N 3SF4D 4KO0A 3SV4A 4GV6A 5JLHA 3OJUA 3SK3A 3WNHA 4DR6K 1BWFO 1KFSA 4E1JA 4AQYK 4C1NK 3IRXA 2JLEA 1QSYA 2YEOA 3OYBA 3P1GA 2Q97A 5M1OA 3SI6A 4JN4A 5M1FA 1RT5A 1Q9XA 1C0FA 3LPTA 5AQTA 3WXIA 1OVYA 3LDSA 1OZZA 4Z4HA 1QSSA 3CW4A 5F2RA 4XJXA 4F2RA 4HTLA 3KP1A 4DG1A 3QEXA 2P9PB 2HMPA 2W42A 1YTAA 2RE2A 4I9LA 1BA0A 3ZETB 4CHNA 1JLCA 3QI7A 4CZIA 4BDYA 5LMUK 4CESA 3AGKA 5FROA 3QBWA 2IS3A 2IVOA 3E66A 1MWKA 5AZIB 5AQNA 3HTVA 3O9SA 4CD1A 2W41A 3JS6A 4FXDA 3AVHA 3D2EA 4OLBA 2VWBA 3O9UA 4BE1A 4B3OA 5JLFA 4KTZA 4B9LA 4E89A 5BPMA 3M3ZA 2DPNA 1IKWA 1NH5A 1ZU3A 4RTFD 3WXMB 3FZHA 4OX9K 4C23A 2KFZA 1H1VA 3VEYA 2FBVA 1EKEA 1N5YA 1S1UA 4KB1A 2O4GA 2V7YA 3VA3A 3ZSRA 1VSKA 3CIPA 3OYNA 5C0YA 4JKGA 4YOVA 2LN8A 1WSIA 3AVCA 1LOTB 1XUPO 1EWRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2KBH A;  3VF2 A;  3NDK A;  1NGA A;  2P9S B;  4H03 B;  3G6E N;  3TTD A;  3PV8 A;  1IV0 A;  5AQV A;  4AEI A;  3HOT A;  5FPD A;  5EVZ A;  2E88 A;  2DFH A;  4DKW A;  1KTQ A;  4JI0 K;  5MLC Q;  2NRV A;  4A5A A;  1K8K B;  4H0T B;  2JGU A;  3PLA A;  4NYN A;  2F9W A;  3CJA A;  3VTI A;  4CQK A;  4DF4 A;  2GL1 A;  3VEV A;  2E1Y A;  1YI2 N;  2Q0U A;  4JI1 K;  5FLX O;  1ZBL A;  4WFA L;  4I2P A;  2ZJQ L;  2UYT A;  3F73 A;  1LW0 A;  2D4W A;  4E3S A;  3VQD A;  1IKY A;  1X9S A;  1CZB A;  3A0I X;  3GG4 A;  3O4Q A;  2V51 B;  4A2B A;  4WCE L;  3VGL A;  3CFP A;  2P9L A;  1U2V B;  5JEN A;  2Q3S A;  4JI8 K;  4CFA A;  4ELU A;  4H8K A;  3WEE A;  1HYS A;  1NGG A;  1RBU A;  2P9I B;  4O4G A;  4CJ4 A;  1P90 A;  3M8Q A;  4JI3 K;  3OA9 A;  3K2P A;  1RTD A;  5FPN A;  4BG8 A;  1VQ5 N;  5EY4 A;  4E1N A;  4I6M B;  2Z1J A;  3AVL A;  1BL3 A;  1WSJ A;  4DMN A;  3GOI A;  3A5O C;  4H4M A;  1BUP A;  1RGI A;  3L4Q A;  2GUP A;  3RVC A;  2GBZ A;  2X78 A;  2X6S A;  4CF8 A;  4NLB A;  3OHR A;  4RG8 A;  4IEI A;  2O8F A;  3QML A;  5SWM A; 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