5AR8A

Rip2 kinase catalytic domain (1 - 310) complex with biphenylsulfonamide
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
302
structure length
255
Chain Sequence
ALPTIPYHKLADLRYLSRGASGTVSSARHADWRVQVAVKHLLREAEILHKARFSYILPILGICNLGIVTEYMPNGSLNELLHRKTEYPDVAWPLRFRILHEIALGVNYLHNMTPPLLHHDLKTQNILLDNEFHVKIADFGTIIYMPPENYASIKHDIYSYAVITWEVLSRKQPFEDVTNPLQIMYSVSQGHRPVINEESLPYDIPHRARMISLIESGWAQNPDERPSFLKCLIELEPVLRTFEEITFLEAVIQLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Human Rip2 Kinase Catalytic Domain Complexed with ATP-Competitive Inhibitors: Foundations for Understanding Inhibitor Selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RECEPTOR-INTERACTING SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE 2
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 255
sequence length 302
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5ar8A00
4OTFA 2UVXA 4ANMA 4HW7A 3LZBA 3VWAA 4B4LA 4ENYA 4DH8A 4IDTA 3ZFYA 3D15A 4NM0A 2C6OA 1W7HA 2F49A 2YDIA 1HCLA 3IDPA 4G6NA 2JAVA 3SHEA 3FZOA 3GCVA 2WTJA 1XQZA 1T46A 1UV5A 2X39A 3Q6WA 3JUHA 3F2NA 3FLNC 3DV3A 3AGLA 4D2PA 2FO0A 4PWNA 2R3LA 4RIYA 2E9PA 5HD4A 2YWPA 4FEQA 1B39A 3FMJA 2IZRA 3IS5A 1VEBA 4X0MA 4DG2E 3UE4A 3BX5A 4NTTA 3O50A 2Z60A 3C0HA 5AADA 4WBBB 4BHNA 3JY9A 3KXHA 4E5AX 5KMKA 4ZZMA 4FKRA 4E4MA 4R8QA 3UTOA 4ITJA 1A06A 2G2IA 4RFYA 2EXCX 3L8XA 3SRVA 4XG9A 1OL1A 1IASA 3DKOA 4JR7A 3CLYA 3ZC5A 3GBZA 4D5HA 5BVOA 2JKOA 2OJGA 2R64A 2X4FA 1Q3DA 4J7BA 5K5NA 1FMOE 1REJA 1YI6A 3P86A 4H1JA 5CZHA 3UVRA 4BF2A 4EZ3A 2EXMA 3H30A 4FSYA 2PSQA 1H08A 4LFIA 3QFVA 5KNJA 3IW4A 3G51A 4OT6A 5HZNA 2NPQA 2JAMA 5I9UA 4PPBA 2ZAZA 4WNMA 5EW8A 4ZTLA 5ETIA 5IUIA 3LFFA 3GOPA 4IM3A 4RJ6A 2F2UA 3VQUA 4FV8A 4TPTA 5CEQA 2QONA 2XZSA 2XA4A 3FZRA 5CU6A 3F3WA 4FIJA 1F0QA 4DYMA 2BRHA 5L2IA 2GHGA 3QZFA 3IW7A 3BBWA 3OG7A 5EKOA 2XJ2A 5H9BA 2A2AA 2XJ0A 4MKCA 4UX9A 3Q60A 4ZEGA 1RDQE 3POZA 5H8EA 1OKVA 1KE6A 3ZDUA 5AR2A 2YIQA 5HG9A 1XBCA 2XK9A 5F20A 1PF8A 2WU7A 4ACMA 5AX3A 4XJ0A 2BDFA 4GT4A 5EW9A 2VU3A 3BYVA 3V01A 3LLTA 2YISA 3LXNA 3FMEA 3VNTA 4BCHA 2CN8A 3MPTA 2W9ZB 4ZSLA 4OTWA 4U9AA 3E5AA 3BHHA 3PA4A 3OEFX 5ACKA 2WTKB 4H58A 4HJOA 5DE2A 3VS5A 4D1XA 5A14A 1KV2A 4FTLA 5H3QA 5LWNA 4LOOA 4I0RA 1R0EA 5HVKA 3BE2A 3EQGA 4H3QA 1JQHA 3BHTA 4XUFA 2QURA 2WEIA 1YXTA 5EOLA 3V8TA 3PY0A 4IB1A 3L8SA 3GB2A 3QTSA 2GSFA 2OO8X 4HVSA 4QP6A 3MA3A 2YCRA 3HV4A 3NS9A 3Q52A 3ENHA 4AT4A 4IEBA 1U5QA 1T45A 4CKIA 4B8LA 2GTNA 5IA3A 2QC6A 4UMUA 4FTMA 3DLSA 3GT8A 3HA8A 3A7JA 4Q5HA 4W4VA 2QOLA 4YO4A 2XNGA 5HG7A 1G5SA 2WNTA 5HTCA 3CQUA 4C58A 4I4EA 2X8EA 3FHRA 2GNHA 3LM0A 4I24A 4ZOGA 4F9CA 4N70A 1XWSA 2BCJA 4O22A 4E6CA 2R3FA 1KE9A 2CGWA 3JYAA 4DEIA 4E6QA 3W10A 3QQGA 4U97A 2CDZA 3QQFA 4IVBA 4O0TA 3KVWA 3ZTXA 5BUIA 4AT3A 4BGHA 2I0YA 4LUDA 4ZTNA 4HYHA 2FSLX 1PXMA 4C0TA 2ITPA 4Y5QA 2GFCA 1U59A 2R7BA 3IQ7A 1PMNA 2F9GA 3D5WA 4QMVA 3R71A 4FKIA 1GAGA 3ENMA 3I7CA 3QGYA 2XK8A 4FTIA 4YZ9A 1GZNA 3IDCA 4D0WA 4XG7A 3WE4A 3BV3A 4R5SA 4MBLA 4EOKA 4X2NA 2ITOA 3UNZA 4KAOA 3MTFA 5IKWA 3RINA 5FXQA 4QMYA 2ITNA 2VUWA 3NNWA 4GUEA 3VS2A 3I0OA 1URCA 2O3PA 5L6OA 4LMUA 3MY5A 3EQIA 4NSTA 5IH4A 3KRLA 5AP6A 3PIZA 1RE8A 4BDJA 1XH8A 4EK6A 3D7TA 3EYHA 5E8TA 3UQGA 3A62A 3PIYA 4V04A 1OL5A 3BQCA 3MWUA 4BBFA 4U3YA 2ONLC 3ACJA 3COMA 4H3BA 4C02A 4S30A 5CTPA 2W96B 1H0VA 1FGIA 1PMUA 2OICA 3FUPA 1G3NA 3NYNA 4G5JA 4MWIA 3ZFMA 4C7TA 1ZYLA 1OL7A 4F0IA 4EOOA 3DNEA 2GS7A 4BIEA 5GNKA 5HGIA 3KF4A 3W55A 1YOJA 2W17A 2BALA 3OEZA 4JT3A 2GMXA 4J8NA 2R0UA 4ANBA 4CFXA 4QNAA 3K3IA 3FLSA 3WYYA 2QOHA 2OJFE 3Q9YA 2HWOA 5TKDA 4CYIA 3QTWA 2W4OA 3HA6A 2CN5A 3QC4A 3CD3A 4YJOA 3DAKA 3MFRA 4ZJVA 1GZ8A 3NUSA 4C36A 3NGAA 1P5EA 5I3RA 4EOJA 4JRNA 5TOZA 2VTAA 4D4YA 2WMRA 4USEA 4FNYA 2IZTA 2VTOA 3AMYA 4DFXE 5HQ0A 4QMZA 3LQ5A 3HGKA 4IFCA 4DLJA 2BUJA 3PA5A 3I5NA 1Q3WA 3LXLA 5J95A 4CYJA 1Q24A 4HPTE 3P9JA 4U5JA 2UW5A 4FKOA 4RX5A 1IG1A 5CX9A 3D5XA 4YTHA 5AMNA 2R3KA 5AX9A 4AS0A 2X8DA 4AU8A 2IVSA 4A07A 4DEEA 4TWNA 3S1HA 3I60A 2ZJWA 3QX2A 4TWPA 5EDRA 4QTDA 4QMNA 1UKIA 3RBWA 4D4VA 5BUEA 1I09A 3TUCA 3MYGA 2PMLX 4RFMA 3FQEA 3UIMA 1SNXA 4EOIA 5CAUA 4MH7A 3KQ7A 4RIXA 2Y4IB 5CLPA 4DGOA 4WO5A 2O63A 5IUHA 4JRVA 4X3FB 4X3JA 5CI7A 2P2HA 5FRIA 2F7ZE 2X2MA 4AN2A 5DRBA 2Y4IC 3L9LA 5E1SA 5FBNC 3U87A 4OW8A 3KEXA 4PDPA 3R02A 3F69A 3OCSA 4APPA 4JOAA 4OGRA 3QXPA 4X3FC 3FL4A 4USDA 4YJRA 4D58A 4DEGA 5DIAA 2BVAA 3E62A 5A4CA 5LXMA 5ETAA 4IAZA 4C4IA 3CBLA 2OXYA 2NP8A 2VX1A 3A8WA 4CZTA 4LGHA 4S2ZA 2ITQA 4ZS0A 5AAFA 3BRBA 5BVNA 5BVEA 4IB0A 4I6BA 4M13A 2RGPA 2R3MA 1SVHA 3F5GA 4PP7A 3EQPA 2VD5A 3E8DA 4JQEA 4QYEA 4A4XA 2PVYA 4NFMA 5CEOA 5FQDC 2VWXA 1BI8A 1CKIA 4KSQA 5CXHA 4RA5A 2GS6A 5JMSA 4HOKA 5BVFA 4BRXA 3JPVA 4ZXTA 2V22A 2ZM4A 5AUVA 4IC8A 4KS7A 3R2BA 5L6WL 2YDKA 5CNOA 2VZ6A 2XH5A 3QC9A 3MBLA 3IG7A 4AFJA 3QCQA 3VRZA 4BICA 4D0XA 5LMBA 4AE6A 4KKHA 4EH5A 1P4FA 2BTSA 1H1QA 5ETFA 2XCHA 4HVHA 3LFCA 4R3PA 2ZB1A 3LIJA 5KBQA 4R1YA 3O8PA 4RQKA 4AACA 3Q3BA 1H01A 3L9PA 3OWLA 2F7EE 4OTRA 4MD9E 4C3FA 2QCSA 1E1XA 3UNJA 2OIBA 1M52A 1JSVA 3FQSA 4E4XA 4IW0A 4W4WA 3T3UA 3ZO3A 4A7CA 3PSDA 3K2LA 4DGLC 4AZVA 4EQMA 4LM5A 4BTFA 2J2IB 5J5SA 4RIYB 5JQ5A 3F3TA 4F9BA 4OBOA 4C4FA 4YMJA 5FDXA 3MFUA 5L4QA 1O6LA 3RP9A 4XS2A 2C6MA 4F09A 4YZCA 1RJBA 4LMNA 5HO6A 4MEDA 4JAJA 3G90X 4P5ZA 4FYNA 5E8WA 3SXSA 4C35A 4RJ3A 5HTIA 5I9XA 5CSVA 5L3AA 2Y4PA 1YOLA 4M69B 4TWCA 3SRVB 4XOYA 1OIQA 2C1BA 3CEKA 2WIHA 3HUBA 4IWQA 1BL7A 3MFSA 4DH5A 5BQ0A 5D41A 4DCEA 2XIXA 4J52A 3ZXTA 2FGIA 3NW6A 2C5XA 4CEGA 2P4IA 5CSHA 4JBVA 3LFBA 5JRQA 2BAKA 5CF5A 3UP7A 1LP4A 3DCVA 5LVNA 1Q8YA 4JX7A 3QUEA 4AA0A 4ANNA 5C26A 2B7AA 4RX8A 4WKQA 4K0YA 3O7LD 3WIGA 4FK3A 1Q8ZA 3MPMA 4MAOA 4UZDA 3IW5A 4IIRA 4XOZA 4UBAA 5LARA 4JDJA 3GCSA 3GUBA 3G6HA 3OD6X 4E6DA 2UVZA 3ODYX 2XKEA 1BMKA 3F2AA 3PY1A 2RFNA 4JLCA 3KRRA 5AP4A 4F6UA 3KL8A 2WPAA 2XIYA 3GI3A 5LMKC 4QPSA 4F1MA 5DT3A 1CM8A 4RWLA 4Y5HA 3KN6A 4HYSA 1ZMWA 3UOLA 3QA0A 2HENA 4ZLOA 2OXXA 4BDBA 4ASEA 4DH7A 4IWPA 1XR1A 3TKUA 2UW6A 4H3PA 4O27B 1YRPA 4ZTHA 3Q6UA 3P78A 3M1SA 3SXRA 2XK7A 2ITUA 1OKWA 1Z9XA 3I5ZA 4FC0A 3PXRA 4I22A 3UQFA 3KCKA 5JFSA 2O5KA 4ZP5A 2J0KA 2X6DA 4GW8A 4M84A 5C8MA 2WIPA 4PL5A 4D9TA 5CAVA 3PWYA 3PXFA 3EN4A 4C4GA 5CENA 3G9NA 4ZZOA 3RTPA 3PZEA 2IVVA 2B4SB 2EB2A 2DUVA 4FKJA 5JZNA 4NU1A 4B0GA 4DBNA 5K0KA 3QALE 4MXCA 4ASZA 3ORPA 4QQTA 2C1AA 4CFUA 4ZSEA 5DLSA 5HE1A 2WMXA 5CWZA 3VS0A 3VUHA 5FBOA 3SDJA 3TV4A 4DN5A 5LQFA 2QKWB 3I79A 4C34A 4OBQA 1OI9A 2PVJA 3R9OA 5AV0A 2HZ0A 4XG8A 5FTOA 1QPEA 4IJ9A 2BDJA 3TV7A 4F08A 4RVTA 1Q97A 2A19B 4AFEA 4AT5A 5J1VA 2A1AB 4OBPA 1TQMA 2R0IA 2VTIA 5BVKA 1URWA 3RWPA 1ZMUA 3AT2A 3ZLWA 5E7RA 3EN9A 4AOIA 3HL7A 3BLQA 4I20A 4FZ6A 3DK6A 2PVRA 5DHJA 4RC4A 5E91A 2JITA 1OM1A 3EIDA 5L2TA 4Y83A 2WQMA 2VV9A 1PYEA 2UW8A 5HCXA 4Z7GA 1YI3A 4QQCA 2X6EA 5GZ9A 4MK0A 3ZM4A 4JQ7A 3ORNA 3NYXA 2IWIA 5AUZA 3ZMMA 3QQJA 4U6RA 1Y57A 4RPVA 4QNYA 5HCZA 5AR3A 2HIWA 1FVVA 5IA2A 4NCTA 4AZFA 5IZFA 3MH1A 3WILA 1GZOA 1ZAOA 4BCMA 3R7IA 5T3QA 4YP8A 5GJDA 3NCGA 1BKXA 3OT8A 2I6LA 2VWBA 3D83A 3ZYAA 4BCNA 4K11A 4QD6A 4AZEA 1H1SA 3R8ZA 2ITZA 3D7TB 3S3IA 1H1PA 2G2FA 3GXLA 4X2JA 5DFPA 2Z8CA 4H39A 2UZBA 3R8MA 5IEVA 4NEUA 4AGWA 4QMLA 2AYPA 2JBPA 4CTCA 4FKGA 5D10A 2ITYA 2XIRA 1AGWA 3A8XA 4YTFA 4BBEA 5LVOA 2YLFA 4I5HA 5TF9A 2YIWA 2YIYA 3R8VA 3HV3A 3DY7A 1GOLA 4RVKA 3R8LA 1E9HA 3AT3A 4CKRA 2XYUA 2X9EA 4O96A 3RK7A 3UO5A 2ZV9A 5D7VA 1Z5MA 3DB6A 5LCJA 2GCDA 1WBSA 4BCJA 4DGMA 2XVDA 1PKGA 4GYIA 3VBQA 1R0PA 5FWKK 2BRBA 4FSWA 3WF5A 4ZY5A 4IWDA 2CLQA 2BAQA 4CCUA 3H10A 1S9JA 1B6CB 2QQ7A 2XK6A 3WF9A 4A9UA 2C6TA 4GT5A 1W8CA 5E8UA 3Q9WA 5IF1A 4AN3A 2QKRA 4BI2A 4IQ6A 3ZS5A 2J50A 5EM5A 2GDOA 4MD8E 4X6RA 4RC2A 3ZSIA 3V04A 1SM2A 5LCKA 4ANOA 3C51A 3TUBA 5DVRA 4HVIA 4Z3VA 4QTCA 4FL3A 1YDTE 4YHTA 2CMWA 3DXNA 1DM2A 1P14A 4PX6A 5HLNA 5LVPA 2R3HA 5TT7A 4I0SA 5HVJA 3OTUA 2C5YA 1FVTA 3B8RA 5C27A 4KKGA 4ZTRA 3HLLA 1AQ1A 1Q5KA 5DT4A 3ZCLA 5IG1A 2VX0A 4KIKA 3UOJA 1UKHA 5M57A 1YWVA 3V6SA 2V55A 5CEMA 3R7OA 4WNOA 4NM3A 4CFVA 2IW6A 3C50A 4TKSA 3WF7A 3OXZA 4BFMA 1YOMA 4RIXB 3ULZA 4XV1A 3HDMA 2EUFB 3W2QA 3COHA 2B53A 2C3LA 2F57A 4G5PA 4QMSA 5I9VA 1KE5A 2JDVA 3F7WA 3OTVA 4IBMA 4MXYA 4GK2A 4HYUA 3ZEPA 4DITA 3B2WA 1YXVA 3KXZA 4FUXA 5HVYA 2BROA 2REIA 3FMMA 4MBJA 3DJ6A 3Q53A 4AQCA 2PMOX 5AR8A 2PK9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 5EDQ A;  4CV8 A;  4FV4 A;  2UZW E;  3LHJ A;  2W1G A;  4FKV A;  5D11 A;  5IA5 A;  2E9U A;  5K4I A;  4BN1 A;  5CVH A;  4RRV A;  3I1A A;  4RX9 A;  2ITT A;  3Q5I A;  3FXX A;  1J1B A;  3NNU A;  3VS6 A;  4PMP A;  2P33 A;  1V0B A;  2W4K A;  2GU8 A;  3DJ7 A;  4PTE A;  3E88 A;  5KML A;  5E8X A;  3UO6 A;  5KMM A;  2BHH A;  2E9V A;  4AA5 A;  5DWR A;  2YJS A;  3SXF A;  3R1Y A;  4AGD A;  4M67 A;  3HMM A;  4WUN A;  3W2C A;  5AP5 A;  3UZP A;  1ZWS A;  1ERK A;  4IX5 A;  3EB0 A;  4GL9 A;  3F82 A;  4PY1 A;  4QMQ A;  4PTC A;  2XEZ A;  1CTP E;  3FV8 A;  4F70 A;  3U8W A;  3EN5 A;  3MI9 A;  4R6V A;  4UWY A;  5BNJ A;  4GII A;  3WIK A;  1NVS A;  1YWN A;  3P1A A;  3GGF A;  4C4H A;  1XKK A;  4CNH A;  5AND A;  1KWP A;  2F2C B;  3U4W A;  4IHP A;  1XBB A;  1KOB A;  5CQW A;  3O2M A;  4UN0 C;  3HV5 A;  4DFY A;  4BIB A;  5EHL A;  3ROC A;  2JGZ A;  2XRU A;  4O6L A;  3R83 A;  4YLK A;  4FTU A;  5H8G A;  3OT3 A;  2JIU A;  1L3R E;  3MIA A;  1O9U A;  3U9N A;  2ERZ E;  3TI1 A;  3ZBF A;  4IE9 A;  4MHA A;  4O0U A;  4XRJ A;  1W2D A;  3BQR A;  3SLS A;  5L2Q A;  4U40 A;  3DQW A;  4GUB A;  4RZW A;  3O71 A;  4X3F A;  5BYY A;  4Y73 A;  1YHS A;  3KC3 A;  5CEK A;  4TWO A;  3A60 A;  2RIO A;  1P2A A;  4GFO A;  4FTJ A;  3DAE A;  3BGZ A;  3PVG A;  4PUZ A;  3DA6 A;  1TQI A;  3NIE A;  5A4Q A;  3QRU A;  3FSK A;  4U0I A;  3LFQ A;  4DAW A;  5K4J A;  3C13 A;  5M53 A;  3GU6 A;  3UGC A;  2CCI A;  3HP2 A;  1OVE A;  2GNI A;  3V5Q A;  4ZY4 A;  3DOG A;  4XRL A;  1VYZ A;  2YIR A;  4AW1 A;  3ZON A;  4OTD A;  3BLR A;  2JDO A;  4M12 A;  2DYL A;  2XNO A;  3QZG A;  3OXI A;  4IMY A;  5K9I A;  3ERK A;  3R04 A;  4LRM A;  4PDS A;  4XCU A;  3I0Q A;  3BYU A;  5AAE A;  1Q62 A;  4BBM A;  4AOT A;  2QOO A;  2IO6 A;  1WBO A;  2I1M A;  4GJ3 A;  2JKM A;  2R3Q A;  3ORM A;  2OKR A;  4TN6 A;  5J87 A;  3RZB A;  2R3R A;  3FI3 A;  3TKI A;  4NK9 A;  4WSY A;  2IVU A;  4QP8 A;  2WMW A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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