5AYIA

Crystal structure of gh1 beta-glucosidase td2f2 n223q mutant
Total Genus 178
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
178
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
ERFPADFVWGAATAAYQIEGAVREDGRGVSIWDTFSHTPGKIADGTTGDVACDSYHRYGEDIGLLNALGMNAYRFSIAWPRIVPLGAGPINQAGLDHYSRMVDALLGAGLQPFVTLYHWDLPQPLEDRLGWGSRATATVFAEYADIVVRQLGDRVTHWATLNEPWCSAMLGYYLGVHAPGHTDLKRGLEASHNLLLGHGLAVQAMRAAAPQPLQIGIVLQLTPTYPASDSPEDVAAARRFDGFVNRWFLDPLAGRGYPQDMLDYYGAAAPQANPEDLTQIAAPLDWLGVNYYERMRAVDAPDASLPQAQRLDDPDLPHTADREVYPEGLYDILLRLHNDYPFRPLYITENGCALHDEIAEDGGIHDGQRQAFFEAHLAQLQRALAAGVPLKGYFAWSLLDNFEWAMGLSMRYGICYTNFETLERRIKDSGYWLRDFIAGQR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure and identification of a key amino acid for glucose tolerance, substrate specificity, and transglycosylation activity of metagenomic beta-glucosidase Td2F2
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-GLUCOSIDASE
molecule tags Hydrolase
source organism Metagenomes
total genus 178
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2015-08-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5ayiA00
5I78A 1WZLA 1ZJBA 2DSUA 1NWUA 3K8KA 1B31A 1BYDA 3NSNA 1H5VA 1EOKA 2X1IA 4PTMA 1CXEA 1JF6A 1NOWA 2WCAA 3GH7A 3KE0A 5CXPA 1VBRA 4HA4A 1GJWA 3BGAA 1VEMA 1D7FA 2FHBA 3WENA 5BXRA 3VD5A 1KB3A 2J47A 4U31A 1ISZA 2YOCA 1QNSA 1V6VA 3L4UA 1HVXA 3II1A 1L8NA 4P7LA 2OYMA 3AHXA 4JFSA 4KRTA 2W4XA 1UKOA 1U33A 1DWHM 2ZOXA 3U7VA 3AMLA 2ZX6A 1V0MA 2J62A 4ATLA 1VRXA 2A3EA 2XVGA 4M8UA 1G01A 3O6AA 5CJ5A 1DHKA 4XZBA 1WDRA 2DPEA 5GNYA 3PTQA 3WF3A 3GYCA 1CGYA 9CGTA 1B1YA 5AY7A 5GNZA 4B9ZA 2WC4A 2OWCA 1TMQA 1KGUA 4W89A 1NOFA 5KEZA 2PBGA 1KQZA 4AMCA 1UD4A 3L4XA 4AZ5A 3BCDA 2VRKA 1XH1A 3WDHA 1ODUA 2WANA 1OCQA 4R5EA 1B9ZA 4U2YA 4J28A 1ISYA 3IK2A 1UH2A 1BTCA 4OOUA 1WP6A 1MW0A 1E56A 4PN2A 1C91A 1I1WA 4L4OA 2VL4A 1UA3A 5E0CA 3TONA 3WNNA 1UWSA 1GQIA 2ZX9A 4GZIA 4GIAA 1CXFA 1UR2A 3WELA 1PX8A 4W8AA 3OLEA 6CGTA 3U5YA 5E0FA 3AIEA 4AZCB 3AQUA 2QHAA 5CZKA 2ZXAA 5A2AA 2GSJA 4W8LA 1E3ZA 2W61A 4AD0A 2WYSA 3AXXA 1J0IA 4BQ3A 3VNYA 4QDMA 4Q7NA 3ZR5A 3ALFA 4OOZA 4UQCA 1MW3A 1QI4A 3MUIA 2YLAA 5CPSA 2BY1A 4PBGA 1Y7VA 2XFYA 3FAWA 2DEPA 4M80A 4FF5A 3VMOA 1E0XA 3IJ7A 5A8MA 4BQ2A 1PEZA 1H49A 1UKSA 1ISWA 1QNOA 1WZMA 5EFFA 4X0VA 2Z1SA 3HU7A 3N12A 3N1AA 3RPMA 1E6ZA 5DMYA 3OLIA 1BVNP 3L4VA 5CPQA 4WKFA 1QBBA 3CIVA 3LPOA 3CHFA 3GXMA 4OIFA 4UQAA 1D2KA 5FIPA 2BVYA 1UOKA 2VMFA 1V0NA 1HN1A 4HA3A 3VGDA 1OSEA 5A8NA 4UQDA 4S3KA 4B15A 4PUEA 5IFPA 4BQ4A 1JFHA 1UWTA 4TVCA 5GNXA 4U3AA 5AC5A 3VNZA 2X2YA 5DT5A 3VGGA 4B3KA 2J75A 3BAYA 3GTNA 3POHA 1A47A 3SUTA 2VTFA 3ARTA 5ABFA 3DHPA 1HL9A 4J3WA 1LLOA 4P7NA 1BHGA 5D9MA 2E40A 3ZJ7A 1YQ2A 5DF0A 3PZQA 1KR0A 1ZBWA 1GOMA 1TG7A 1E5NA 1KBKA 2VRQA 3T08A 2D22A 1W9XA 2WMJA 3NUKA 4P7QA 4A3HA 3CZKA 5ABHA 4WIWA 8A3HA 1QHOA 1B90A 2X8RA 4NRSA 3K46A 5I0DA 4BS0A 2G8ZA 2IXVA 1JYVA 3M46A 2V38A 3FY1A 1ZBVA 1QNRA 4FLRA 3RIKA 3VKKA 3FAXA 1XC6A 2E9MA 4Z2GA 1VAHA 3A3HA 4PMYA 3ZMRA 3DYOA 1HKKA 4AW7A 1KXTA 2XWEA 3EDJA 1JZ8A 4UOQA 2WSPA 1DWAM 3FNDA 1PPIA 1C8YA 4HZ6A 3GH4A 1CENA 3S2CA 4XZWA 3L4ZA 2W92A 2E8ZA 3W81A 3A4XA 3DECA 3POCA 3ARYA 4GPNA 4PMXA 4CCCA 1W3JA 2TAAA 1JD7A 4TTGA 1UD6A 1E6XM 1PZ2A 2DH3A 1ZL1A 3QGVA 1C90A 2W62A 1V08A 4W7WA 2G3MA 4HPGA 2CYGA 3BH4A 3SUUA 5A6JA 3GZAA 4XV0A 2PWFA 3BSHA 4Z2IA 1W2PA 2WVSA 1H09A 2GDUA 2ZXQA 2DT0A 5F7UA 1HIZA 2ZUTA 1J0YA 3AHZA 3AS0A 4RE3A 1CGTA 3L4YA 2EEXA 1KWKA 4M82A 4ATDA 2X0HA 4PMQA 3I3EA 3GNRA 3NIYA 5LYRA 1CGWA 5I6SA 1JI2A 2CBIA 4UR9A 1ITCA 1XHGA 2WAGA 4W7UA 2CBVA 1FOBA 3RO8A 3T09A 3CUIA 3ECQA 5IDIA 3VIIA 1CIUA 2BY0A 1TA3A 3CZ8A 2VZVA 2E9BA 4P8XA 1Z32X 5CQ1A 2OSWA 3BCFA 2WHJA 3L2LA 2D1ZA 3QHOA 1JYWA 2ZXDA 2ZX5A 1E6PA 1QNPA 4IM4A 1Q6EA 1SMDA 1D3CA 3ZM8A 1PAMA 3UCQA 3AS2A 1E0WA 4X0NA 3ARQA 1B30A 2WBGA 3WEZA 3WQ6A 1J01A 4PTVA 2F61A 1WKYA 2XTKA 1J12A 5BROA 1B0IA 2WLYA 2PB1A 1GCYA 3WH6A 1EO7A 4UNIA 1EHNA 4PTWA 3SCRA 3AI0A 4GO9A 3WD2A 4Q22A 1OGBA 2WMGA 3W53A 2PI6A 4EAMA 4M1RA 1ISVA 1BLIA 3AMDA 2AAAA 1E9LA 3WDQA 1OIMA 4M24A 5IHSA 1OIFA 5A6MA 3CHDA 2DDXA 2E8YA 3J7HA 4CVUA 1EOMA 4WSJA 1E3XA 3N15A 4HMDA 4MPKA 2DQXA 5BRPA 3VPLA 3ARRA 1DWJM 1GOOA 1K9TA 3KZSA 3VIHA 2PWDA 2ZIDA 1U2YA 1HF6A 2DIEA 2EXOA 2VVNA 1W32A 1E72M 1M7XA 4HOXA 3T0AA 1PX3A 3PZNA 4DM1A 2WMIB 1EXPA 4NRRA 2ZUMA 4W5UA 3SCSA 4V27A 1HKJA 1GHSA 3WFZA 4UZSA 2JIEA 4DWSC 1NP2A 4P8UA 3D5HA 4HPHA 3CTTA 4MDPA 3WKZA 4AIOA 5CSUA 2XYLA 2WHLA 3EYPA 1BF2A 4UFIA 2WBKA 5A6AA 1VJSA 3AIVA 3WF0A 1XRVA 4AZ6A 3AZTA 4GI6A 2ZXBA 2BXYA 1VJZA 1GORA 1WO2A 2X05A 3WMBA 2W67A 3CGTA 3DC0A 4CGTA 1GOKA 5JBEA 1E6QM 3PTMA 2WXDM 4GINA 3ZT7A 3TTQA 2XWDA 2YA0A 2CESA 2J7BA 3BSGA 1LF1A 3L2MA 3BAJA 1GOWA 3TP4A 2WSKA 2GFTA 3GXIA 4JZ5A 3OG2A 1CECA 3BAWA 1O7AA 4D6EA 2V3FA 6TAAA 1OBAA 1C8QA 2VVSA 4PMVA 1DWFM 1H2JA 5LA1A 1KQYA 1QOXA 5HXMA 1RH9A 4P8WA 2QPUA 2PBOA 3WMSA 1BSIA 1M53A 1UWRA 3ARUA 3VTRA 2YL8A 1LWJA 3SEPA 1UWQA 5D8ZA 4IPNB 4H8HA 1WDQA 5ABEA 5JIWA 2EO7A 3SCPA 2RGMA 4CD8A 1HNYA 3QR3A 1KFWA 2CIPA 1C93A 2WKGA 1CXHA 3T2PA 3ARZA 1KCLA 3OLGA 1ISXA 2V3EA 4RE4A 1W9PA 5IFTA 3WH7A 4GXPA 3MSGA 4CVWA 5AC4A 3FN9A 2J25A 3WQVA 1OB0A 3PZIA 3L4TA 3GNOA 3VDHA 2XJ7A 1V03A 4Z2KA 3W26A 4AD2A 2CEQA 1NH6A 1B3ZA 4JHOA 4MTVA 3N9KA 2CPUA 4BA0A 2YBTA 2VX6A 4D1JA 1J9YA 5A8OA 1B3VA 2XUCA 2XM2A 3ZQ9A 5I23A 2YDRA 7A3HA 1GNXA 1JDCA 3PZTA 3THDA 2VI0A 1VBUA 2CBJA 1UHVA 1NOUA 2CXGA 4QAWA 1XSKA 2WB5A 2VQUA 1C92A 4MDOA 2DSKA 4YHEA 3GNPA 3MMDA 5BXTA 4TXEA 3A47A 1R87A 4TVDA 5CPTA 1E5JA 2D0HA 4MNMA 2CKRA 4H04A 1VFOA 4BZYA 3AXHA 1NWRA 4LXFA 3AYSA 1V3MA 1R7AA 3KWXA 4EK7A 1ZBCA 3NJ3A 2WVVB 3VGEA 2J79A 2VQTA 2WMHA 4M29A 4U33A 1FFRA 4JCLA 1GPFA 3APGA 3K1DA 3WL1A 1JXKA 4X9YA 5BCAA 5M17A 2ZUWA 1W1VA 3KL0A 1CPUA 2ZUVA 3EDDA 1H0GA 1EH9A 4WSKA 1SYTA 1W3KA 3K8LA 3WY1A 4JKLA 3KL5A 1XCWA 3IANA 2WPGA 3MV11 5CLWA 1KR1A 1W1YA 4TTUA 3MU7A 3W82A 3VIKA 5HPOA 3TTYA 1V3HA 5FOOA 2CNCA 3BLPX 3SUSA 3WDPP 3AIQA 3VO0A 1R85A 2DGAA 1TR1A 1F4AA 1JL8A 2XSAA 4GZEA 3FHAA 1EIBA 4KH2A 3AS1A 1ODZA 3KEHA 5A6BA 2AMGA 1Q6GA 1HX0A 3HJEA 1SFSA 4S3JA 4ATWA 4A3YA 3LMYA 4LYPA 1RP8A 4GQQA 4PYSA 2WMFA 1EQPA 4AZHA 3D3AA 1TUXA 4B3LA 3WMCA 3WD0A 4JL1A 4B9YA 4WKAA 3UERA 1UD5A 2GJXB 1JZ3A 2VOTA 1GVYA 1P6WA 5A6BD 1JYNA 8CGTA 3ZT6A 2D23A 1WB0A 4HTYA 2YDQA 1ZU8A 1GONA 4NF7A 4AZ7A 1PBGA 3ARSA 2XM1A 2WC7A 3KL3A 1E1FA 2CETA 1CEOA 4MB1A 4D71A 3FXYA 1CDGA 3WD4A 2EPLX 4DWSB 4Z2LA 3PZVA 3WEOA 4MAZA 3VOCA 1CNVA 5A6SA 1HVQA 2VURA 4RE2A 2VZUA 4TOQA 4WLCA 1PIGA 1X6NA 3AROA 3WUFA 2CITA 1V3LA 3VDAA 3RM8A 5BXPA 2VX4A 3O9NA 2XGIA 4CUCA 2VZTA 1UG6A 4Z2JA 4TVUA 4CD6A 3MUY1 1GOQA 2VUYA 4HZ8A 1Q6FA 1MWOA 1E1EA 2VRJA 5CGMA 3EBVA 4OZOA 1R86A 4UTFA 3CBWA 1QI3A 1KXVA 4JCMA 3TTSA 2DIJA 4PMRA 4AD5A 5E6ZA 3SIMA 4BQ5A 1IZJA 3MANA 4B16A 4UFLA 5FKYA 3WIJA 2MANA 4ACYA 1BFNA 4N42A 5AYIA 4YHGA 3WEMA 4UFMA 4LYQA 1JI1A 1XSJA 2WMIA 4CD4A 5A3HA 1HKIA 5AYBA 2Y8KA 1E0VA 4ZE5A 1KCKA 2WVUA 1E6SM 1MFVA 4V28A 5GPRA 3EMZA 3AISA 3GXDA 4JIEA 4AEFA 2VR5A 1V3KA 3GH5A 4DUWA 3A6OA 1XSIA 1OD8A 3QHNA 3WF2A 1RD6A 4WJXA 1V6WA 1UQZA 3WNLA 2ZX8A 1VEOA 2Y5EA 4YPJA 1JNDA 4N0RA 1LL4A 1X1NA 1VENA 3BAKA 4KWUA 2VO5A 1JXJA 2WCGA 3W0KA 1H3GA 4ZFMA 1TE1A 3WQ4A 4JFTA 3MV01 4AEEA 1KXHA 3RDKA 7TAAA 1WCGA 4HZ7A 4ACZA 1MQRA 1LG2A 1XD0A 5E6YA 4CD7A 1QHZA 5A69A 1K9FA 2VCAA 3WH8A 2Z1KA 4C7GA 4M81A 1WDPA 2CBUA 3WUEA 3MMWA 4DUVA 5HBFA 2JIWA 1UKPA 3ZJ6A 3IJ9A 3GBDA 3IJ8A 3W25A 1E15A 2EJ1A 1EO5A 1HP4A 3VD3A 4E8CA 1E6RA 3ZJ8A 3M6DA 4MNJA 3PZMA 3PZGA 4MAVA 3B8SA 3WD3A 3A4AA 4W8BA 3VIJA 1JIBA 2J78A 2YBUA 4D72A 4D1IA 4W85A 3CUJA 2XGBA 3VINA 1UH3A 5DEZA 2WWDA 4H41A 2GVYA 1JAEA 5EB8A 1CBGA 3NSMA 1HP5A 3WNOA 2OLHA 2J8FA 3SUWA 4R27A 1MVYA 4HA1A 4JFWA 4UFHA 3TTOA 3IAQA 4QCFA 1OT2A 4UFJA 1VFFA 2OWXA 1C8XA 4PRWA 3MO4A 4PSPA 3UG5A 3W38A 2OYKA 1E55A 7CGTA 1H11A 2VX5A 4W86A 1J10A 4PCTA 5DT7A 2JE8A 2IXUA 2VC9A 2EPMX 3L4WA 2JEQA 3VM7A 1UR0A 4F9DA 1B3YA 3CMGA 2NT1A 3VUPA 2WM0A 1V0LA 1WNOA 5D8WA 4EKJA 2QF8A 2WMKA 3T2QA 1TCMA 1X6LA 4MNKA 2FH8A 3OBAA 1B3WA 2E9LA 5A1AA 2AOSA 2O9TA 4OBSA 2WHMA 4CN6A 1BAGA 3B9EA 2PWHA 2ZICA 1W9VA 3NYDA 3SCNA 3PZOA 2JF7A 1EGZA 1V0KA 3IAPA 1CGXA 3ZOAA 1DTUA 1JF5A 1KGWA 3UG4A 5C70A 1SR0A 2WZEA 4UQ9A 1QI0A 2GJPA 1LL6A 1EDQA 5FL0A 1QPKA 2V3DA 1UWIA 2JALA 2BS9A 2VCCA 3QOKA 1E4IA 1XV8A 2W91A 1ZBKA 3VM5A 3UEQA 2PWEA 4AD3A 1EDTA 2BHUA 1MW1A 2Y2WA 5FL1A 3VILA 2F8QA 3RJYA 3BAIA 3VMNA 4JL2A 2OYLA 5HOSA 1GQLA 1MYRA 3VD9A 1H0IA 4J7RA 4D6FA 1E73M 5CG0A 4GZJA 4XX6A 1FH7A 3WBAA 1W2VA 5CGTA 4FLOA 5IXEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5I78 A;  1WZL A;  1ZJB A;  2DSU A;  1NWU A;  3K8K A;  1B31 A;  1BYD A;  3NSN A;  1H5V A;  1EOK A;  2X1I A;  4PTM A;  1CXE A;  1JF6 A;  1NOW A;  2WCA A;  3GH7 A;  3KE0 A;  5CXP A;  1VBR A;  4HA4 A;  1GJW A;  3BGA A;  1VEM A;  1D7F A;  2FHB A;  3WEN A;  5BXR A;  3VD5 A;  1KB3 A;  2J47 A;  4U31 A;  1ISZ A;  2YOC A;  1QNS A;  1V6V A;  3L4U A;  1HVX A;  3II1 A;  1L8N A;  4P7L A;  2OYM A;  3AHX A;  4JFS A;  4KRT A;  2W4X A;  1UKO A;  1U33 A;  1DWH M;  2ZOX A;  3U7V A;  3AML A;  2ZX6 A;  1V0M A;  2J62 A;  4ATL A;  1VRX A;  2A3E A;  2XVG A;  4M8U A;  1G01 A;  3O6A A;  5CJ5 A;  1DHK A;  4XZB A;  1WDR A;  2DPE A;  5GNY A;  3PTQ A;  3WF3 A;  3GYC A;  1CGY A;  9CGT A;  1B1Y A;  5AY7 A;  5GNZ A;  4B9Z A;  2WC4 A;  2OWC A;  1TMQ A;  1KGU A;  4W89 A;  1NOF A;  5KEZ A;  2PBG A;  1KQZ A;  4AMC A;  1UD4 A;  3L4X A;  4AZ5 A;  3BCD A;  2VRK A;  1XH1 A;  3WDH A;  1ODU A;  2WAN A;  1OCQ A;  4R5E A;  1B9Z A;  4U2Y A;  4J28 A;  1ISY A;  3IK2 A;  1UH2 A;  1BTC A;  4OOU A;  1WP6 A;  1MW0 A;  1E56 A;  4PN2 A;  1C91 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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