The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
62
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structures and Coordination Behavior of Aqua- and Cyano-Co(III) Tetradehydrocorrins in the Heme Pocket of Myoglobin
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Myoglobin
|
| molecule tags |
Oxygen transport
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| total genus |
62
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-10-21 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2EB8 A; 4MQH B; 1C7D B; 1G0A A; 1G9V B; 1UVY A; 1OUU A; 1CH3 A; 1VHB A; 4MQI B; 2R1H A; 3WCU C; 1NZ4 A; 1HDA A; 3QJD A; 2MGF A; 3VRG B; 5HBI A; 3HHB A; 1AZI A; 1DXU B; 3A5A A; 5EV5 A; 3HXN A; 1UFP A; 4DWT A; 1A01 B; 1S5Y B; 2EKT A; 3S1I A; 1NXF A; 1EMY A; 3GDJ B; 3A2G A; 1N9X A; 1MYM A; 1YGD A; 2QLS A; 2ZFO C; 3UHK A; 1X46 A; 1YZI A; 1HRM A; 1RPS A; 3UH5 A; 2VRY A; 1JF4 A; 1D8U A; 2MB5 A; 1SWM A; 1JEB B; 1QSI A; 3WFT A; 2R4Z A; 1J3Z B; 1Y4B A; 3EOK B; 3WFX A; 4MQG B; 1YVT B; 4OOD A; 1YEV A; 3PT7 B; 2MGH A; 1I3E A; 1XZ7 A; 3GYS A; 1BZ0 A; 5JDO E; 3A59 B; 3R5I B; 3UHE A; 3PI1 A; 2R80 A; 1Y85 A; 3AQ5 A; 1CPW A; 1K1K B; 1ASH A; 2FRF A; 1V4W B; 1JL6 A; 1NAZ A; 1V75 B; 1MLN A; 2D2N C; 1Y7G B; 6HBI A; 4KMV A; 3EDA A; 1BJE A; 1LFT B; 1XXT B; 1DUO A; 1LA6 B; 1B0B A; 1Y22 B; 2V1I A; 1R1X A; 3D7O B; 1JZK A; 2XKI A; 3MJU A; 1IWH A; 4O2G A; 2AA1 A; 3NG6 A; 2D5Z A; 1Y7D A; 3U3E A; 1O1I B; 2AUP A; 1S5X A; 3W4U B; 1VXE A; 5CN7 A; 1YE0 B; 2QMB B; 3UGZ A; 1LUE A; 1CG5 B; 1J40 B; 1JP9 A; 4FC3 B; 1U7S A; 3UHX A; 2OLP A; 2ZLX B; 4HRT A; 1JP6 A; 1O1K A; 3SDN A; 2PGH B; 1K0Y B; 1MCY A; 5D5R A; 1Y4G A; 1YHU A; 1AJ9 B; 3UHR A; 1XY0 A; 1IOP A; 1NZ5 A; 3NL7 A; 1FN3 A; 1V4X B; 1G08 A; 3LQD B; 3BCQ B; 1Y8I B; 3NMM A; 4H2L B; 3FH9 B; 1J7Y B; 1HBA A; 4FH7 A; 1EW6 A; 2QSP B; 1M6C A; 1YH9 A; 1IBE A; 3ONZ A; 4HSX A; 1MKO B; 2HHE A; 2H8F A; 1F65 A; 3OZU A; 3D4X B; 1DWS A; 1VXH A; 1GCV A; 1N9I A; 1TU9 A; 4VHB A; 2W72 C; 1SDK A; 1A3N A; 1NPF A; 3WCW B; 3OZW A; 109M A; 4MPM A; 3WFW A; 1Y0T A; 1JL7 A; 1MWB A; 3GKT A; 1J3F A; 4N8T A; 1Y4R B; 3M3B A; 3OGB A; 1NZ3 A; 2ZLT B; 1Y2Z A; 111M A; 3DUT A; 1MNJ A; 2ZLV B; 4MAX A; 1DO1 A; 5CN6 A; 4MQH A; 1X9F C; 1C7D A; 2DHB B; 2ZT0 A; 4MQI A; 2NRL A; 1O1M A; 4NXC A; 4X0L B; 3DHT A; 1CMY B; 3VRG A; 2MBW A; 1MLF A; 3ARJ A; 1DXU A; 5MBN A; 1KD2 A; 2GTL B; 2KSC A; 103M A; 4N7O B; 1URY A; 4MXK A; 1A01 A; 3GDJ A; 5CN8 A; 1MBI A; 1HDS B; 1YMA A; 5HLU A; 1RQA B; 1DXC A; 1GCW A; 4O4T A; 1OR6 A; 1I3D A; 1Y09 B; 1J3Y B; 2ZSX A; 3MBA A; 1BBB B; 3G46 A; 1JF3 A; 2ZSZ A; 3AT5 B; 1JEB A; 2G0Z A; 4NI1 B; 1TES A; 1J3Z A; 3EOK A; 1MBD A; 4MQG A; 1MBS A; 1YVT A; 1LH5 A; 3PT7 A; 2R4Y A; 1VXC A; 3VAU A; 5F0B A; 1S0H B; 1XZ5 A; 1MYF A; 3HYU B; 1YEO B; 2GRZ A; 3A59 A; 105M A; 5CNC A; 1K1K A; 1CH9 A; 1HDA B; 1MLK A; 1V4W A; 1HLM A; 1Y4V B; 5CN5 A; 4G51 B; 1Y7G A; 3OJ1 A; 1GBU B; 3PI9 A; 1XXT A; 1LFT A; 3MN0 A; 3HXN B; 4PQB A; 1LA6 A; 3S65 B; 1YHR B; 1S6A A; 2NX0 A; 2OHA A; 1SDL B; 3VRE A; 107M A; 2ZT3 A; 3D7O A; 1O1O A; 3AQ6 A; 2LH1 A; 2B7H B; 2G14 A; 1CO9 A; 3ZJJ A; 1FDH G; 1O1I A; 2ZS1 D; 3ZOM A; 1A9W E; 3GOU B; 1FAW B; 1MBN A; 3UHV A; 1J7W A; 3BJ3 B; 1YE0 A; 1CH7 A; 1LFV B; 2EF2 A; 2QMB A; 2BK9 A; 1FLP A; 1DXV B; 1CG5 A; 3KUO A; 1LH6 A; 4SDH A; 4YU3 B; 1J40 A; 1YOG A; 4YU4 B; 4FC3 A; 1Y4P B; 1Y0W A; 2ZLX A; 2ZFB B; 1OUT B; 4ROL B; 3G52 A; 2PGH A; 2G0X A; 1K0Y A; 1MOA A; 1XZ7 B; 3QJE B; 1Y45 B; 2DXM B; 2R80 B; 1Y35 B; 1V4X A; 1DLY A; 3QM7 A; 2O5M X; 1BZ6 A; 3LQD A; 1Y8I A; 1M9P B; 3A0G B; 4H2L A; 3AG0 A; 1Q1F A; 3FH9 A; 4F6D A; 1J7Y A; 5EUI A; 4XDI A; 3PIA B; 3ECZ A; 7HBI A; 3WCT A; 2QSP A; 1XZU B; 2QU0 B; 3D1K B; 1MKO A; 2ZS1 C; 5KDQ B; 2D5Z B; 3CY5 B; 1MLH A; 3D4X A; 2EKU A; 1HJT A; 3IA3 B; 1CIK A; 4IRO B; 3MJP B; 1DUK A; 2AUO A; 1BAB B; 1OFK A; 4QAU A; 2ZS0 B; 4HHB B; 1Y0A A; 2BWH A; 1GDK A; 1Y4R A; 2ZLT A; 1Y5F B; 2ZLW B; 2ZLV A; 1YEU A; 1RVW B; 1Y5K B; 2HZ2 A; 1FN3 B; 2DHB A; 5AZQ A; 3UHS A; 3GQP B; 4F6I A; 4X0L A; 3NMM B; 5F2A A; 2WY4 A; 2G0R A; 1LHS A; 3PI4 A; 1NS9 B; 4M4B A; 2GTL A; 5HU6 A; 1Y0D A; 2BKM A; 4NS2 A; 2Z85 A; 3O7N A; 1F5O A; 3ZJQ A; 1VXD A; 1HDS A; 3HC9 A; 3BOM B; 3ORD A; 2O5O X; 2H8F B; 4H0B A; 2ZFO D; 1Y09 A; 1J3Y A; 1CH4 A; 1CP5 A; 1EWA A; 1BBB A; 4WJG 1; 1FSL A; 1GCV B; 2MGG A; 1XZV B; 3ZH0 A; 1SDK B; 3SZK A; 2GLN A; 4NI1 A; 3VRF B; 1CQ2 A; 5ILP A; 2LH2 A; 4L2M A; 1BZ1 B; 4ZVB A; 1VRF A; 2ZSP A; 4F6F A; 1YOI A; 3D1A B; 1MYH A; 1S0H A; 3MYM A; 3DUT B; 2SPO A; 3HYU A; 1MGN A; 3IC0 B; 2EB9 A; 1O1M B; 5HLX A; 2MGL A; 2QFK A; 3DHT B; 3MOU A; 1PMB A; 1Y4V A; 4G51 A; 3GLN A; 3NML A; 2G3H A; 1GBU A; 1KD2 B; 2D2N D; 1GZX B; 4NI0 B; 5EYS A; 5AZR A; 4OF9 A; 1FDH A; 2H35 B; 1YHR A; 3S65 A; 4U8U B; 1SDL A; 1HGC B; 3LR9 A; 1MOB A; 1SPE A; 1LFQ B; 1DTM A; 2B7H A; 3WCV D; 1GCW B; 1X3K A; 1MOC A; 2YRS B; 2AV3 A; 1MLS A; 3GOU A; 1FAW A; 1MNI A; 3KMF A; 3BJ3 A; 2GL3 A; 1RQ3 A; 1LFV A; 3PEL B; 1DXV A; 1MTK A; 4YU3 A; 2MHB B; 4YU4 A; 1ECN A; 1UC3 A; 1Y4P A; 1NEJ B; 3ZOL A; 2ZFB A; 2Z8A A; 2ZT2 A; 1OUT A; 4ROL A; 3OZV A; 3MKB B; 4G1B A; 2D2M B; 2G0V A; 3QQR A; 3S66 A; 3BJ1 B; 1XZ5 B; 3ODQ B; 3QJE A; 1Y45 A; 1UMO A; 5SW7 B; 2DXM A; 3LR7 A; 1Y35 A; 2BW9 M; 2W6Y A; 1M9P A; 3A0G A; 1JWN A; 2ZLU B; 3PI9 B; 1YFF B; 3PIA A; 3VRE B; 5CHQ A; 1Y7C B; 3TM3 A; 1O1O B; 2JHO A; 5KER B; 5EQM A; 1HBS A; 1XZU A; 3WCV C; 2QU0 A; 3D1K A; 1BZZ A; 1MLQ A; 3E55 A; 2SPM A; 1YDZ B; 5KDQ A; 3ZJL A; 1CBL A; 3CY5 A; 1O1J B; 1MWC A; 3ZJI A; 1JY7 B; 4FWY A; 1CO8 A; 3MVC A; 1J7W B; 4IRO A; 5B85 A; 2V1H A; 1MZ0 A; 3MJP A; 5CN9 A; 1THB B; 3G4W A; 1BAB A; 2IN4 A; 4F68 A; 3WI8 A; 1Y0W B; 2ZS0 A; 4HHB A; 1SI4 B; 4AVD A; 3UHG A; 3QM5 A; 1Y5F A; 1HAB B; 2ZLW A; 2OHB A; 3M3A A; 1RVW A; 1Y5K A; 101M A; 3WCW D; 3GQP A; 1X9F D; 1KR7 A; 1WMU B; 1YHE B; 1HHO B; 4ODC B; 1NS9 A; 5EUI B; 2LH6 A; 1O1P A; 3AQ7 A; 3WCT B; 1MWD A; 1VXG A; 5CNE A; 1YEQ B; 3O89 A; 3BOM A; 3ZJM A; 5B84 A; 4FWX A; 4PQC A; 1YG5 B; 1HBI A; 2O5L X; 2H8D B; 1G09 B; 2VEE A; 2HCO B; 4F4O A; 1Y4F A; 2GNW A; 1A0U B; 4JAC A; 2MGC A; 1XZV A; 5E29 B; 1FHJ B; 1MOD A; 2VYW A; 1WVP A; 3VRF A; 1DO4 A; 1HGB A; 1HSY A; 1BZ1 A; 1Y0A B; 2O5T X; 2GNV A; 4KN3 A; 2ZT1 A; 1UFJ A; 3D1A A; 1Y8H B; 3GQR B; 3M38 A; 1MBC A; 1HCO B; 4B4Y A; 2Z6T A; 1YEU B; 1HBR B; 3WCW C; 2V1J A; 1A9W A; 1LFL B; 3IC0 A; 3RGK A; 3PI2 A; 5IKS A; 3UHD A; 1VRE A; 1HBG A; 3G4R A; 4FWZ A; 3G53 A; 4DC8 A; 3WCU A; 5E6E B; 1S61 A; 1BVD A; 4DWU A; 1YGF B; 4M4B B; 1YMC A; 1LH1 A; 1QI8 B; 1GDJ A; 1Y0D B; 5HU6 B; 1GZX A; 4NI0 A; 2ZT4 A; 2H35 A; 3AQ8 A; 4U8U A; 1NPG A; 1HGC A; 2XYK A; 1SHR B; 3LHB A; 1LFQ A; 2W6X A; 1F63 A; 1QPW B; 1BIN A; 2GTL C; 1YVQ B; 2YRS A; 3UHT A; 1HDB B; 4MU5 A; 3NFE B; 3VHB A; 1MYI A; 4B3W A; 3PEL A; 4HSW A; 1V4U A; 3H57 A; 3SZK B; 5EYJ A; 2MHB A; 2QFN A; 2MGK A; 1OJ6 A; 1DO7 A; 1GDI A; 1VWT B; 1NEJ A; 2V1K A; 1A0Z B; 1IT2 A; 3MKB A; 2D2M A; 2GKM A; 1OR4 A; 5HAV A; 3BJ1 A; 1JW8 A; 3ODQ A; 1CQX A; 5SW7 A; 1DXD A; 1GJN A; 1O16 A; 5JDO F; 1MYT A; 1MLU A; 3OO4 B; 5ILR A; 2ZLU A; 1YOH A; 1CH1 A; 2AUQ A; 3QZX A; 2FRJ X; 1YFF A; 1Y0C B; 1DLW A; 2LH7 A; 2NSR A; 1J7S A; 2D60 B; 1HBB B; 1Y7C A; 5KER A; 1V5H A; 3WTG B; 2O5S X; 3K8B A; 1YDZ A; 1Y01 B; 1XYE B; 1O1J A; 1JY7 A; 1ECO A; 4O35 A; 1ABY A; 1MOH A; 1R1Y B; 1URV A; 1RQ3 B; 3UHQ A; 1XZ4 B; 1A6G A; 1DWR A; 2LH5 A; 1THB A; 3OO5 B; 3A5B A; 3P5Q B; 5EET A; 3G4U A; 1SI4 A; 3KMF C; 1Z8U B; 1J52 A; 2BMM A; 3S66 B; 1HAB A; 2ZWJ A; 3TLD A; 4MQJ A; 108M A; 2NRM A; 3ARK A; 1NQP B; 4UUR A; 3UH6 A; 2ZS0 D; 2RI4 B; 4KMW A; 3UHY A; 1WMU A; 1YHE A; 4NXA A; 4G1V A; 1HHO A; 1YHU D; 3K3U A; 4ODC A; 2BLH A; 4M4A B; 2G10 A; 1A4F A; 1QSH B; 1YEQ A; 2O5Q X; 1HBS B; 2VM0 A; 3WHM A; 1XQ5 A; 4MQC B; 1BZZ B; 1DXT B; 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1HBB A; 2ZST A; 5C6Y A; 1MYG A; 1UIW B; 3WTG A; 3QM8 A; 2G0S A; 1XYE A; 2ZFO B; 1JP8 A; 2SPL A; 4UZV A; 1CBM A; 1R1Y A; 4U8U C; 1IRD A; 3D17 B; 3QQQ A; 1XZ4 A; 1V4U B; 1MYZ A; 1PBX B; 4L7Y B; 3HF4 B; 3M39 A; 1W92 A; 3OO5 A; 4FH6 A; 1NIH B; 4MBN A; 3ARL A; 3P5Q A; 2D6C A; 3OK5 A; 5C6E B; 3G4Q A; 6HBW B; 1ABS A; 1NWN A; 3GKV B; 1DWT A; 2ZSN A; 1EBC A; 1DTI A; 1NQP A; 1C7C B; 4ILZ A; 1HBH B; 2BNL A; 1A00 B; 2RI4 A; 4XS0 B; 2C0K A; 2D2M C; 2MGE A; 2QSS A; 3EDB A; 2HBG A; 4ZVA A; 4M4A A; 2WTH A; 2D2N B; 1Y8W B; 1J7S B; 1QSH A; 3UHH A; 5AB8 A; 4MQC A; 3WCV B; 1DXT A; 3K8B B; 5E83 B; 1A3O A; 3V2V A; 2ZS1 A; 1L2K A; 1DKE A; 3ZHW A; 1ABY B; 3HRW A; 1BZP A; 3R0G A; 3WCT D; 4ESA B; 3DHR B; 2M6Z A; 1QXD B; 3QM6 A; 2HBS B; 4C0N A; 1Y83 A; 1CLS B; 3ZJP A; 4HRR B; 3WFU A; 1Y7Z A; 2HBC A; 1MBA A; 5JGG A; 1MBO A; 1Y8K B; 1QXE A; 2HHD A; 2HHB B; 2DN3 A; 2MYE A; 3H58 A; 4MQJ B; 2GKN A; 1G0B A; 1BIJ B; 2FAM A; 1NS6 A; 3QJB B; 5EU2 A; 1YEN A; 2ZSY A; 3GQG A; 3ECX A; 2G12 A; 2MYD A; 1Y4Q A; 3ZJH A; 1JZL A; 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