5B6MA

Crystal structure of human peroxiredoxin 6 in reduced state
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
221
structure length
221
Chain Sequence
b'GLLLGDVAPNFEANTTVGRIRFHDFLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKLIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNCEEPTEKLPFPIIDDRNRELAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFVFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKKLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures of human peroxiredoxin 6 in different oxidation states
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-6
source organism Homo sapiens
molecule tags Oxidoreductase
total genus 71
structure length 221
sequence length 221
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain2 5b6mA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5b6mA01
3BJ5A 3RHBA 4F2IA 2DJ2A 3LXZA 1V40A 4HQZA 4IJ3A 3IDVA 4V1Ap 2LSTA 1TRVA 2H6ZA 4NAXA 3APSA 1PA3A 1Z5YE 4JR4A 2RUFA 2YOIA 3HJMA 5F06A 1GTBA 1GSSA 1SENA 4FIWA 3BOAA 3ZMLA 4X1UA 1SU9A 3LQ7A 5FWGA 1G6YA 1XZOA 2H72A 4F9ZA 1EWXA 4FYUA 2CQ9A 3Q19A 4IJIA 4N0VA 3TRPA 1CQGA 2GQKA 1EGRA 2IFQB 1FVJA 4IKHA 1GNWA 1J08A 2H66A 2P5RA 1FO5A 1V57A 4PUFC 3Q6OA 5ECKB 3D22A 4IGJA 3ZFBA 3GURA 4LA1A 5KEJA 2CVKA 5AIVA 1EV9A 1T4YA 2HZEB 4PX1A 4PNGA 1PL2A 1WPIA 1YZXA 1HNCA 1DSBA 4NWYA 2P5QA 2J9HA 1SL2B 2QKEA 1OE8A 5IMDA 1FOVA 4XHMA 2NDOA 1WP0A 1WRYA 3DMLA 5JCGA 5IO2A 1R7HA 2A2RA 2WCIA 1M9BA 5F07A 4ML6A 2B1LA 2ZCTA 3MDKA 2XBQA 5J41A 1R5AA 2L5OA 1BQ7A 4AJ7A 2K18A 3A5WA 4MPFA 5CREA 2LEGA 4IN0A 1TKDB 3VWXA 3UAPA 5ABRA 5KN1A 1U88A 1MDIA 4WXTA 1XIYA 4XRDA 3R2QA 1KNGA 3EWLA 5ECSA 1OKDA 1SD8A 1TI3A 4WETA 2KP1A 4HS1A 2V6OA 4POMA 1MEKA 2OA7A 2OACA 3WT1A 4DSRA 4WF5A 2JZSA 3TJJA 3H4KA 3LEFA 1DBYA 1FG4A 2AUVA 1X9MB 2CV4A 5B8AA 6GSSA 5GAND 4MP4A 4BA7A 2YJHA 3KP8A 3TRQA 3C8EA 1T4ZA 4YQVA 3DEXA 5A4UA 2AHEA 4XTSA 2RLIA 5J3RA 2MMOA 2CZ3A 2OE1A 1XWGA 4LL4B 3ZLPA 1YEXA 3L9SA 1TDIA 4G19A 4TXVA 2G2QA 1MDJA 2JZRA 5G5EA 5EPFA 4F0CA 4P3YB 2G0FA 1NHYA 1SK2A 3M8NA 5J9BA 3QFAC 3WGXA 1YEPA 2VD1A 3KGKA 2DJ3A 4MH3A 16GSA 1K0NA 3HJOA 1GSDA 1HNBA 3L4NA 3TKRA 1NSWA 3CRUA 1J0FA 5E4WA 3IAM2 3KCMA 4MZCA 4ZB8A 4ECIA 3CSJA 5ECPB 3BBYA 3EU3A 14GSA 4MJCA 2H0IA 4QQ7A 3FEUA 5IMAA 1VGLA 3PR8A 4ZIJA 2H8LA 13GSA 1GUHA 3UOMA 4X43A 5B7CA 3L9UA 4ULXA 3GTUA 2ON7A 1TK0B 3ZREA 5DAKB 1F3BA 3VWUA 3OR5A 2CVDA 1SL0B 4K9ZA 8GSSA 2DBCA 1TK8B 1WMJA 4J2FA 1GH2A 4E8HA 1M2BA 4I97A 5FHIA 2VM2A 4NHZA 4IVFA 4TR1A 3L9VA 5CRDA 4TW5A 4IP6A 2KHPA 3LYKA 1B4PA 2YWMA 3KM6A 5INYA 2RM6A 4GSTA 1NW2A 3EURA 3F6FA 3CSIA 2GZPA 2IL3A 4XIHA 2YV9A 1A8YA 2O87A 3P2AA 5J9CA 2HT9A 2C1YA 2QC7A 4KSOA 1MD3A 3TJGA 1F3AA 3IAS2 1ACVA 2YZUA 1R4WA 4GWRA 4I5QA 5GSSA 4N10A 1O7UA 1JHBA 1GWCA 2K8SA 2F8FA 3LG6A 2VCTA 3KIJA 4AJ6A 1AIUA 3ME8A 1OAZA 2HNLA 4BVXA 4OFMA 1M2DA 2H19A 3ZMKA 4EKZA 3L78A 2IMKA 3D6IA 3UIWA 2EIQA 5HR3A 3TUEA 4Q5NA 1FAAA 3I69A 4TR3A 2GSSA 1PRXA 3DRNA 4IELA 1PKWA 2A4VA 2HYXA 4PXOA 3FZ5A 1K3LA 5KN0A 4TVEA 2LKUA 2X8HA 2FUG2 2CX4A 4EE0A 2LTKA 2O8VB 4XS4B 1Y6EA 2NVLA 2WB9A 1XPVA 3LJRA 3Q18A 4YAVA 4Q5QA 6GSUA 2N5AA 5HFIA 4RQXA 2FGXA 4FO5A 3TKPA 2H74A 3KJYA 5AISA 5ECRB 3HVVA 4PQIA 2LS5A 3IK7A 2IN3A 1QK8A 12GSA 1A0RP 4NHWA 4K6XA 3GKKA 4N0ZA 2DMLA 3FR9A 2GQMA 2NBSA 4EDYA 3D4TA 2IMFA 4BWQA 5DVBA 2L4QA 4L0UA 2VLTA 4DSSA 1U87A 1AUCA 4WR4A 2HE3A 5DALA 1GULA 1A8LA 5KN3A 2E7PA 2FHEA 2B5XA 1VF1A 4RI6A 1XVQA 4I2TA 1ST9A 4ID0A 1XWCA 5ID2A 3QMXA 4F0BA 4ECCA 1T8EB 4EC0A 3HA9A 1DE1A 1G7OA 5AIXA 5LD0A 4IQAA 2IWTA 5D9XA 1TI1A 1YF1A 4KX4A 1CQHA 2JACA 3HD5A 9GSSA 1OVNA 2LV3A 3N9JA 2Z9SA 1AXDA 1MD4A 1SJ6A 4BVYA 4F03A 4NXIA 2WDUA 2DSAA 3HVXA 2WJUA 3LSZA 4PQ1A 4X0XA 4YAPA 1JZRA 3GNJA 3GX0A 5F0GA 4K1FA 1B9YC 4L8EA 1G6WA 2CAQA 3IC4A 2YN1A 3F4TA 2DJKA 2IMIA 4TR0A 4ZL7A 4CDOA 2K9FA 4I8BA 3TB2A 1I5GA 1NM3A 1K3OA 4WEYA 1GSUA 5ENUA 3KH7A 1Z7PA 2RM5A 2MMZA 2VCWA 1MTCA 1UVZA 4WBJA 1S3DA 2H6XA 5CRGA 5D96A 1QFNA 3GYKA 4IBPA 5EVOA 3C1SA 2O85A 3TKQA 1WOUA 5ECQB 1EZKA 2I1UA 1U3AA 2YNXA 1AAZA 3QAVA 1G7EA 3CMIA 2DJ1A 3QPMA 1YDKA 4RQRA 2VLVA 1HYUA 1XFLA 1YKAA 3F3RA 3N5OA 2HI7A 4HJMA 1YKCA 2XPDA 5AN1A 3KMOA 4H86A 4ZL9A 5DCGA 2NTOA 2OBIA 4GQFA 4TN8A 2YWOA 1GP1A 4DSQA 3V1WA 4MPGA 2AV4A 1QGVA 1R5PA 22GSA 3QAGA 1V9WA 1S3AA 1LU4A 1JFUA 1T7PB 3TJKA 4OFNA 3IBHA 3GH6A 2P31A 3KD0A 2ZNMA 2HXKA 4POBA 1O6JA 3VWVA 2DMMA 3ZITA 1I9DA 1TRUA 1A0FA 1THXA 2PUKC 6GSXA 1V2AA 5G5FA 1AQXA 1K0DA 1O73A 1K0AA 3WD6A 1TP9A 3WYWA 4MJEA 5EL8A 3GKXA 5CRHA 4K0NA 3O3TA 3TOTA 1M99A 4EUYA 3PGTA 3QOUA 3IRAA 4KE3A 2FWGA 5CNWA 2GQLA 3K8NA 3NOFA 5A4VA 4K0GA 1E2YA 3IHQA 3PH9A 3VWWA 1LJRA 2H1BA 2OJLA 1AQVA 3W8JA 1J9BA 2HZEA 4ZILA 2NPBA 3GL5A 2R5GA 2J23A 4LLRA 2YPMA 5ECLB 1G0TA 1A2LA 4MLYA 1PGTA 2V2GA 1OC3A 1FW1A 3VLNA 2KOKA 2WULA 4V2MA 1URMA 4ZBBA 1SYXA 2RUEA 2V32A 2H75A 1M0UA 2QSIA 3WGDA 4HUAA 1GUKA 5H5RA 1HQOA 1SKWB 4TOPA 1F6MC 4IW9A 4ZB9A 3GSTA 3UBLA 1V58A 3HZ4A 3D4MA 5G30A 4ZBAA 1Z3EA 3S9FA 1A2MA 4HOJA 5H5QA 2V41A 5D9VA 2MMNA 3DXBA 2PU9C 2C0EA 4ZL8A 5CRWA 4I6XA 2GSTA 3I9V2 3CBUA 3VPQA 3LYPA 2CVBA 3CRTA 2HRNA 3J7Yk 2VIMA 1GTAA 4OFTA 3DIEA 2B7KA 1X5CA 5LCZA 3EVIA 5IIZA 1XW5A 2YCDA 4PQHA 3ZTLA 4O32A 1BEDA 5D9TA 5CAXA 1RQMA 1M2AA 1SK0A 1R26A 3HCZA 3LFLA 4OCEA 4N11A 4MABA 5G2ZA 2DIZA 3G7IA 2E0QA 2LQQA 2GT6A 3HZ8A 2KP2A 4ZBDA 3TKSA 1ML6A 1GNEA 1O81A 5C00A 1ERUA 1K0BA 3TKSE 2WS2A 4OWYA 6GSYA 1GSYA 5D93A 2AB6A 2VL2A 2HFDA 4EO3A 2YJ7A 2GDRA 1QMVA 4MZBA 3GA4A 5F05A 2BTOT 2PBJA 4KW6A 1BG5A 2YP6A 2VCQA 2K6VA 2L5LA 1TOFA 2GGTA 1SJZA 3KH9A 3F63A 3BCKA 3GX8A 4L5OA 1A2JA 1C72A 3E9JB 1OE7A 1MDKA 3P8WA 2C0DA 1RK4A 1ERTA 2DC5A 1GTUA 4KDYA 4V2LA 1TJDA 2C3TA 1QUWA 4JEDA 2JL4A 1OC9B 5HR0A 6GSTA 4JBBA 1N8JA 3G7JA 5JWOB 2H1DA 4Q5RA 5DAKA 2PMTA 3KMNA 5CYYA 3GSSA 5IPGA 2LRCA 2GVPA 1WWJA 1EP8A 1PMTA 3AY8A 1AW9A 2L57A 1M9AA 4XS1A 4TR1B 4AF2A 1Q4JA 1XBSA 2TRXA 2GLRA 3FHKA 1Z7RA 3EU4A 2OKAA 3ZVJD 2GSRA 4PUAA 1THOA 3KTLA 5HFGA 4GRFA 5B8BA 4GSSA 3MWHA 2OE0A 3NIVA 1F2EA 2VCZA 3UVHA 2X64A 5IM9A 3QDNA 1SKSB 2PN8A 2FA4A 5IOXA 2B6MA 5ECNB 2PVOC 2JSZA 1GSEA 5D9WA 2L6DA 4IQ1A 3EMXA 4AGSA 2H76A 3WT2A 1ZL9A 4ECJA 2OE3A 4HU9A 1YY7A 5ECOB 2LRTA 5B6MA 1ZYEA 3CSHA 3ZFLA 3GH9A 3MNGA 2X8GA 4ILFA 1VF2A 1M7TA 3LXTA 2XHFA 1GTIA 3IK9A 4KAEA 2RIIA 4L5LA 1ERVA 1EGOA 4IP1A 2H70A 4OD7A 5A5KA 1GLQA 4XS4A 4GQCA 5IMFA 4KCEA 2VLUA 1B48A 1ON4A 1WE0A 2AJQB 4GTUA 4KH7A 2CX3A 2H71A 1GL8A 2B7JA 4KB3A 3HY2A 2AYTA 4CW9A 3H79A 3APQA 3US3A 3DGQA 3DVXA 4K7IA 3LWAA 4O7HA 2FA8A 1ZZYA 2LJKA 2R6KA 3MAKA 4ZXGA 1DE2A 4HEA2 4V1Ag 3KTBA 4F82A 4ZB6A 5IOWA 4DSSB 3ZRDA 3CYNA 4GF0A 3RPNA 2H6YA 1EEMA 3Q74A 3ZVJA 1K0CA 1XWKA 3UBKA 2F8AA 2YV7A 2C80A 2C3QA 1PL1A 1WJKA 1SL1B 3ERWA 1A23A 4D73B 2M80A 1JLVA 2C8UA 4EDZA 2VUPA 1IYIA 2B3SA 4ISDA 3FY7A 5G31A 2PERA 2KLXA 1TU7A 5HQPA 4K7OA 4LL1B 3ZIJA 2QGVA 2P0GA 4RUVA 5IMCA 4POLA 3FZ4A 3QR6A 3I43A 2JU5A 2WZ9A 1T1VA 1ABAA 3HJPA 1XW9A 1EOGA 2HZFA 2XC2A 3IOSA 4GCIA 4TKYA 5G1LA 1X0RA 2R37A 2IMDA 2DJ0A 2ZUPA 1VF4A 2LJRA 2VL3A 4EF0A 5JCWA 1AC1A 1X5DA 4WBRD 4TXOB 4HZ2A 3F6DA 2VM1A 2VL9A 3HXSA 2PWJA 4K8MA 2WGRA 3EE2A 1Z6MA 1GRXA 4ACSA 3TKSC 2CZ2A 4RI7A 2FLSA 1PKZA 1KTEA 5DCHA 1EOHA 1YQ1A 2YWIA 5DQSA 2C0FA 2N5BA 5F8BA 3W6GA 3HKRA 1ZOFA 2H73A 2H0GA 1GUMA 1BYEA 5G1KA 2VL2C 4Z7XA 3ERGA 4BPYA 4J56E 1T3BA 1Y25A 5HR1A 4O92A 1UN2A 3ZZXA 3DD3A 2C3NA 1ZGNA 3TCOA 1PX7A 1AQWA 6GSVA 2F51A 3FR3A 4PNFA 1RW1A 1X9WB 3APOA 3A2VA 2IPAA 1GSFA 2AAWA 2L59A 4MJAA 3GKMA 3ME7A 2XPEA 2EC4A 3KZQA 1PX6A 2HLSA 2OBKA 2JADA 5C04A 4DVCA 1QXHA 4KCAA 18GSA 1QQ2A 2BJXA 2VO4A 4WR5A 3TJBA 2ES7A 5IQYA 2E2MA 4ML1A 4KGIA 1VF3A 4AJ8A 4XCSA 2FWFA 2IFQA 3KP9A 4MH2A 5CP1A 2F3MA 4QL7A 1N2AA 2R2JA 3ZIVA 1SYRA 5EY6A 1FB6A 4XS6A 5GZZB 3H8QA 3IE3A 4V2NA 3RPPA 2M46A 2YZHA 2VCXA 3F3QA 3L0HA 3D0ZA 4HDEA 4K7NA 2K8VA 5IMVA 2EIOA 3M1GA 4MF7A 2ON5A 4YH2A 7GSSA 4NPBA 3CTGA 3PINA 5DQYA 5L71A 3GRXA 2LRNA 5IO0A 1YF0A 3FR6A 1EV4A 4HQSA 5IMZA 3UVTA 3GIXA 4MF5A 5ECMB 4OCFA 4GLTA 4WKWA 2IIYA 3ISOA 1A24A 3MSZA 2GT5A 2IMEA 2VD0A 3U5RE 4LMVA 2B5YA 4HU7A 4O5RA 4MZWA 2N5FA 1S3CA 5J5NA 2TIRA 4N30A 3A2XA 3KEBA 4G2EA 3C7MA 5HFKA 2H1AA 5GSTA 4MA9A 3C1RA 2X99A 4DEJA 4MMMA 2PGTA 4FYBA 3HDCA 5H5SA 20GSA 1UC7A 1O85A 3G7YA 1JZDA 2GS3A 3FZ9A 5ECIB 4YQMA 4QL9A 3ZYWA 1GLPA 2MYGA 2V6KA 2JZTA 1U3IA 3U6VA 5D8IA 4JRRA 1TRSA 5COHA 4YQUA 3FYGA 5ECHB 2REMA 2I9HA 4KNDA 2H0HA 3C71A 3ED3A 1YJ6A 3FRCA 3TOUA 3KXOA 3D21A 1H4OA 1W4VA 5FT3A 4MJBA 3VI7A 3VK9A 2FNOA 2X8CA 3DYRA 2FWHA 4OO5A 2BMXA 1U6TA 3GV1A 4JE1A 3IA1A 1PN9A 4KDXA 1K0OA 3RAZA 3EYTA 2E2GA 2O7KA 3BD2A 1EEJA 1XWBA 4EVMA 3QAWA 3TJFA 4K2DA 4PGTA 2PPTA 4JU5A 3SBCA 2B5EA 2I3YA 2CT6A 1E6BA 3VPTA 4BL7A 5IPHA 4PURA 1NHOA 4CHSA 2YANA 4IS0A 5CO3A 2C4JA 5A4WA 4LMWA 3WGEA 5KN2A 1BX9A 3GTUB 1XXUA 2H1GA 1Q98A 5DBQA 1ZMAA 2MBSA 4GXZA 2L4CA 1KBNA 2KUCA 2I4AA 1OC9A 3IPZA 3QD9A 4HI7A 5GAPD 1SD9A 3DWVA 3P7XA 1GSQA 2VOCA 3IXRA 1PD21 1TTZA 2I81A 1ERWA 4L0WA 3GUSA 5JCUA 3H1NA 1F9MA 3P90A 2ALBA 5ELGA 4JR6A 3RDWA 3VI5A 1Z9HA 1BJXA 2MMAA 2DIYA 3C73A 1X9SB 1B4QA 3HVSA 1V98A 4MDCA 4HZ4A 2GTUA 4MK3A 3HHVA 3F8UA 3NZNA 4EXJA 2FCHA 2F9SA 1XOAA 4XRAA 4TR4A 3G9BA 1PQNA 3LGCA 2LNSA 4J57E 4KSMA 1X5EA 1XOBA 4G10A 5E59A 1DUGA 3DVWA 4KUNA 1OYJA 3JCML 5D73A 4POKA 3QCPA 3ZL5A 3J7Yb 3FW2A 1VRSD 3HYPA 2VAFA 1JLWA 2FD3A 3UARA 1USBA 1B8XA 3CTFA 1K0MA 3M0FA 4MCUA 1EP7A 3RHCA 2JSYA 3UMAA 19GSA 4MF6A 1ILOA 2LNTA 1TU8A 1JZWA 2FY6A 2H30A 5JWRB 3EMPA 1OC8A 4NV2A 4HJ2A 2O89A 2D2ZA 1HD2A 4KA0A 10GSA 4TRXA 2WRTA 3QFBC 3BCIA 2L6CA 1SJIA 1BAYA 1FHEA 3IR4A 1XVWA 2FWEA 3LORA 4IHUA 3M3MA 3TDGA 3O76A 2LQOA 3E3EA 1XWAA 1KEBA 2WFCA 3TRXA 3M9JA 3GKNA 4OMVA 5DALB 5LNKe 3EC3A 3F4RA 4I2UA 5J4UA 1OKTA 2R4VA 1O8WA 5ID2B 2M72A 4FH8A 2LJAA 2DJJA 1F37A 2B1KA 2DLXA 3FKFA 3O6TA 3CXGA 1FB0A 1O8XA 1TW9A 2TRCP 3FK8A 1T00A 1LBKA 2IJYA 1HNAA 4E8EA 1K3YA 2HSYA 1B9XC 1WIKA 4D73A 2XBIA 5DDLA 2EIRA 1TK5B 1UA5A 5DJMA 3TGZA 2R3XA 2C0GA 3ERFA 2PVQA 5DJLA 2HSHA 4GSNA 2GZYA 3GFKA 1Z6NA 2OADA 3I6AA 3A2WA 3E0UA 2H01A 3F0IA 5JWQB 2V1MA 4JZQA 1FVKA 1ZYQB 1W89A 5ELAA 1TRWA 4FYCA 3VFIA 1JZOA 17GSA 3A3TA 5AGYA 3W8SA 6GSWA 3GN3A 4TXOA 4OO4A 2GSQA 4NMUA 3GL3A 3H93A 3RBTA 2GZZA 3IV4A 4Q5FA 3GHAA 1SK1A 2VCVA 2MZCA 4BWSA 2MBTA 3M9KA 2CAIA 3FZAA 3GMFA 3DKSA 3SWLA 2LUSA 3F4SA 1SKRB 11GSA 4WF4A 1ZCPA 5B6NA 1PSQA 5HR2A 2A2SA 1XCCA 4KDUA 3F9UA 3EINA 3UEMA 3D5JA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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