5B6MA

Crystal structure of human peroxiredoxin 6 in reduced state
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
221
structure length
221
Chain Sequence
GLLLGDVAPNFEANTTVGRIRFHDFLGDSWGILFSHPRDFTPVCTTELGRAAKLAPEFAKRNVKLIALSIDSVEDHLAWSKDINAYNCEEPTEKLPFPIIDDRNRELAILLGMLDPAEKDEKGMPVTARVVFVFGPDKKLKLSILYPATTGRNFDEILRVVISLQLTAEKRVATPVDWKDGDSVMVLPTIPEEEAKKLFPKGVFTKELPSGKKYLRYTPQP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structures of human peroxiredoxin 6 in different oxidation states
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-6
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 71
structure length 221
sequence length 221
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain2 5b6mA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5b6mA01
2KUCA 5IMCA 3GTUB 3VURA 2C8UA 4N11A 2AV4A 3FZ4A 2WGRA 3R2QA 2P0GA 5H5RA 3FRCA 3GYKA 1JZOA 3HZ4A 1K3LA 1TRUA 5E4WA 13GSA 2VM2A 2ZCTA 3KTBA 1A0RP 1F9MA 3HVVA 4LMWA 5JWQB 2FY6A 4WBJA 2H72A 4GTUA 2GSQA 2IMKA 3ZTLA 3QDNA 1GSFA 5AIVA 4L5LA 5JWRB 1M2DA 4Z7XA 5DJLA 2C4JA 3HYPA 2LQOA 5KN2A 4KW6A 2FHEA 2B1KA 3FR6A 1FAAA 2LKUA 3M9KA 1FB0A 5IO0A 2CA8A 4XRAA 3GX0A 1ZCPA 2C1YA 1GSSA 3TKSC 1V98A 2WFCA 4K0GA 4XHMA 3QAGA 2HRNA 4MP4A 5B7CA 3ZZXA 4D73A 3AY8A 3FZAA 3P90A 1XCCA 3DGQA 4IJIA 1OC8A 4GSNA 1O6JA 4K1FA 4YAVA 1AQXA 3LXZA 4EO3A 4MCUA 1LJRA 5DJMA 2YZHA 1GLQA 2DJ2A 2JZTA 1F3BA 2XPEA 3TB2A 2YCDA 5INYA 4OFNA 2C80A 2J9HA 3HJOA 3LWAA 1EWXA 2K6VA 1BYEA 4HS1A 2PGTA 3QMXA 1ZOFA 4V2NA 2J23A 1O7UA 2VCQA 2VCWA 1XVWA 3W6GA 3H8QA 4ZILA 2LQQA 1AIUA 3L9UA 3GL3A 1OAZA 4TXOB 1T4ZA 2H0HA 2EC4A 4Q5NA 1GP1A 3LGCA 5ID2B 4K7OA 2TRCP 1SD8A 3DEXA 4EC0A 3D4MA 3QAVA 1MDIA 2H76A 3QOUA 2JZSA 2L5OA 4WETA 3VWWA 5KN3A 1HQOA 4G19A 1MDJA 2HSYA 1ZYEA 5CRWA 5IMAA 3EMPA 3CYNA 3TKQA 1AUCA 2LEGA 5IMVA 3CSHA 3CRUA 4WBRD 3H93A 1T1VA 1X0RA 1U88A 4GSTA 3H1NA 4GRFA 1THOA 1B4PA 4F2IA 4ZB6A 1XVQA 3TJKA 3LJRA 3PGTA 2XBIA 4N0VA 2IFQB 4IN0A 1U87A 1HNAA 3Q6OA 4PGTA 4PX1A 6GSUA 11GSA 2FWFA 2N5BA 1V58A 4J2FA 1Z7PA 1FW1A 6GSYA 1GNWA 4L5OA 2JU5A 2QKEA 5ECSA 3G9BA 4LA1A 1YY7A 3EYTA 1OKDA 4E8HA 3I43A 3NIVA 3GV1A 4IP1A 4KH7A 2HZEB 1PL1A 2PWJA 3ZITA 4BWSA 2RM6A 1HNBA 5CAXA 1YDKA 3ERGA 2GSSA 4N30A 2H30A 3HKRA 3MWHA 4TXVA 4KSOA 2CX4A 2JZRA 3KJYA 3UIWA 3M8NA 5IMDA 2JADA 4MMMA 3HY2A 4JR6A 1FO5A 1E2YA 1RW1A 1F2EA 1UA5A 5A4UA 3P2AA 4MPGA 9GSSA 2MMOA 2LRNA 3F9UA 3S9FA 5ECIB 1TTZA 1SK1A 4RQRA 3KH9A 1R26A 4PQHA 2A2RA 2WB9A 1SD9A 1PKWA 3ZYWA 4I5QA 1Z6MA 2K8SA 5L71A 4Q5FA 1I5GA 4KAEA 1M2BA 5G1LA 1PKZA 1WJKA 2IL3A 2VOCA 4EDZA 1M7TA 2A2SA 2FWEA 2ZNMA 4MF7A 5JCGA 3IPZA 5LD0A 7GSSA 4MK3A 1EOHA 4XS4B 4MZWA 3M3MA 4IQ1A 1PL2A 4TR1B 4QL7A 3BOAA 5ABRA 1GWCA 3RPPA 1VF3A 4G2EA 3UVTA 4ZB9A 2CVKA 4F03A 5IOXA 4TR0A 4RI7A 3IBHA 1TI1A 1J0FA 5G1KA 4F9ZA 2CQ9A 3F3RA 2GQMA 4TKYA 4GF0A 1XW9A 2OE0A 5EPFA 4X1UA 1Q4JA 5ECRB 2OADA 5J3RA 2F8FA 5IIZA 4KDXA 3G7IA 3L78A 2OE3A 3HZ8A 2WCIA 3KMNA 4MJBA 4JU5A 4FYCA 1ZYQB 2MYGA 1PMTA 3VWVA 3VK9A 3WD6A 5D96A 5EL8A 4OFMA 1B4QA 5DQSA 1B48A 4WF5A 1TXXA 2IPAA 1ERWA 3E9JB 1TJDA 3TKSA 3HD5A 3A2WA 1S3CA 1ACVA 2H70A 1A0FA 4MH3A 2JACA 4NHZA 4XTSA 3F4TA 2PERA 1AAZA 3F63A 4I2TA 5DAKA 3J7Yk 2HLSA 2YV9A 4E8EA 4IP6A 2DLXA 2B7JA 1NHOA 3DXBA 3MSZA 3TJJA 4K9ZA 3ERFA 5ELGA 1PRXA 3BD2A 2L59A 3LQ7A 3F3QA 5DCGA 3PR8A 2HNLA 1TW9A 2KP1A 4K8MA 1XZOA 4O92A 5J9BA 2LV3A 3VPQA 2DJKA 2V6KA 1KEBA 1TRSA 4ML1A 4OO5A 4JBBA 5LCZA 1ZGNA 3TOUA 19GSA 3HHVA 3W8SA 4EVMA 3ED3A 4MABA 4ZBAA 4OCFA 5IOWA 2H1AA 4O7HA 3FW2A 2KHPA 3F4RA 3MAKA 3GTUA 3GX8A 3FK8A 1KTEA 2L5LA 3MNGA 5ELAA 5ECHB 1ERUA 1BQ7A 3EC3A 4IVFA 4RUVA 2PBJA 4NXIA 3C71A 5KN1A 2I3YA 2RUEA 3IE3A 6GSWA 5EVOA 1PA3A 1XXUA 2F8AA 1OYJA 1TU8A 3CTGA 3TRPA 4BVYA 1W89A 1Z3EA 4EDYA 5C00A 4KNDA 2RM5A 1SL2B 4N0ZA 5DVBA 1ZZYA 4ILFA 4BL7A 5GSTA 4V2LA 1WIKA 6GSVA 3A3TA 1BJXA 1U3IA 18GSA 4XS6A 4XS1A 10GSA 4HU9A 1XOAA 1XOBA 4PUAA 3IAM2 4IQAA 1UVZA 4ECIA 3PINA 3C8EA 4HDEA 1XWCA 3E3EA 2IMFA 3N9JA 2VCTA 4HZ2A 4ACSA 2HZFA 2L57A 1GUHA 1NSWA 3IHQA 3P8WA 5D9XA 3APSA 5H5QA 4AJ7A 1TK8B 3KCMA 3HVSA 5DQYA 1YF1A 3C7MA 4EF0A 3U6VA 4MLYA 3HVXA 2FNOA 2MBSA 4HJMA 5G5FA 4NPBA 1XWGA 4EE0A 1SK0A 3DWVA 4J57E 1ST9A 2C0EA 3HJMA 1GULA 2CVBA 1CQHA 1M99A 4Q5RA 2WULA 4HI7A 1R5PA 1G6YA 2WJUA 4TRXA 1RQMA 4K7NA 1EEMA 5IMZA 1EP8A 2I4AA 3F4SA 3P7XA 3UEMA 2YWOA 4PXOA 1ZMAA 1E6BA 4FO5A 3F6FA 1ML6A 1SJ6A 5D9VA 1T3BA 5CP1A 3DVWA 5HR2A 2E2MA 4TXOA 4I97A 5CO3A 1MTCA 1SL0B 3GRXA 1H4OA 3F6DA 2OBIA 2R4VA 1OC9A 2E2GA 2C0GA 1ABAA 3TKRA 5HR0A 2XHFA 2H8LA 4ML6A 2LNSA 3C73A 3IC4A 3LSZA 4ECCA 2LJKA 4NMUA 1G7EA 2HXKA 4HU7A 1M2AA 2V41A 1QUWA 1Z9HA 2H6XA 2H1DA 4WXTA 1FVKA 4ZL9A 2MMNA 1AC1A 1PQNA 4AF2A 2GS3A 4K7IA 4FH8A 2PVQA 2IFQA 3O3TA 2C0FA 1B9YC 2X64A 2V6OA 3BCKA 3ME8A 3IK9A 2HT9A 1FB6A 1A2LA 2V2GA 5D8IA 4KSMA 4BA7A 4V1Ag 1YF0A 2E0QA 3QAWA 4MJCA 1K0NA 1TK0B 2LJRA 4FYUA 1YZXA 3FYGA 3GKMA 4RI6A 3TRQA 4F82A 1OVNA 1WRYA 4H86A 3NOFA 2WZ9A 4QL9A 4IELA 4JR4A 4P3YB 1S3AA 1ILOA 4POLA 2Z9SA 5CNWA 4PNFA 2VLTA 3BBYA 1QGVA 4Q5QA 1U3AA 4O32A 16GSA 2GSRA 3QCPA 4TR4A 5F05A 2YJ7A 4CHSA 1SK2A 1H75A 2XBQA 4G9HA 2B3SA 2GTUA 1SYRA 1A8YA 4EUYA 1OC3A 3LEFA 3D4TA 4PNGA 3KEBA 1AQVA 1YQ1A 2YWNA 3BCIA 1KNGA 2EIOA 3ZLPA 2D2ZA 3ZRDA 1AXDA 4F0BA 1SKSB 2PVOC 4NV5A 1PN9A 1WP0A 1Q98A 2YZUA 3Q18A 5JCWA 2PN8A 2G0FA 2R6KA 3IAS2 4HZ4A 3CMIA 1FHEA 5B6NA 1VF2A 4EL1A 4XIHA 4KGIA 2FA8A 3KTLA 3TGZA 1JHBA 2VD0A 3ZIJA 5DALB 2DMLA 4TR1A 1ERVA 3M0FA 3WGXA 1MEKA 1XWKA 3GMFA 2CT6A 3BJ5A 1PSQA 3V1WA 3GL5A 2B1LA 2LS5A 1PX7A 1GTUA 1DBYA 3I69A 3UBLA 3UL3A 2MZCA 3VLNA 3WYWA 2H6ZA 3IK7A 2NVLA 4WR4A 4PUFC 2X99A 2LJAA 3APOA 2F3MA 3GKNA 1THXA 4TN8A 4YQVA 3RAZA 2ES7A 2NPBA 1OE7A 2VO4A 5A5KA 2LSTA 1O85A 2LUSA 4YAPA 3TJFA 8GSSA 4KB3A 1GUKA 2FWGA 3GN3A 5J5NA 2CAQA 4DSRA 2VCXA 2DJJA 5C04A 1ON4A 1TKDB 1K3YA 2N5FA 4K2DA 4YQMA 3D21A 2B5XA 2BJXA 4ZXGA 1K0BA 1V57A 1TP9A 5G5EA 4FIWA 1SJIA 1BX9A 1MD4A 2MBTA 3GKKA 4POKA 1WE0A 2QGVA 4ZL7A 2DSAA 2LTKA 3PH9A 3F8UA 4YH2A 4GSSA 4XCSA 2DBCA 2EIQA 2AB6A 5DCHA 2GQKA 1T8EB 3APQA 4WF4A 2AJQB 4WKWA 1QQ2A 4OMVA 1PGTA 2ZUPA 4L0WA 3TJGA 2LRTA 4ZBBA 1OE8A 1TI3A 1YKAA 2YPMA 2X8CA 1N8JA 5COHA 4ZIJA 4PQIA 3FEUA 3O76A 3DMLA 3FZ5A 2ALBA 4IJ3A 4TOPA 2P5RA 2DJ1A 3QD9A 2PUKC 2M46A 3GUSA 2IMIA 2GZYA 3O6TA 2IJYA 1SKRB 3L9SA 4QQ7A 3CSJA 3GSSA 2O7KA 5DBQA 2TIRA 1BAYA 4K0NA 3SBCA 2C3QA 5ECMB 4ECBA 3IRAA 3FZ9A 3Q19A 1C72A 5H5SA 4NAXA 1GUMA 5CYYA 3ZFBA 2BMXA 5ENUA 2CVDA 2B6MA 1XBSA 4OCEA 4DSSB 3WGDA 4GWRA 3Q74A 4CDOA 4FYBA 3D6IA 1QMVA 2VAFA 1EOGA 1S3DA 3RDWA 5IQYA 1SL1B 3QR6A 5B8BA 3IXRA 12GSA 1GSEA 2H74A 4AJ6A 2FLSA 2IIYA 1SENA 2AHEA 3LYKA 4IHUA 2REMA 1FVJA 1F6MC 4MJAA 1JZDA 1Y25A 3DD3A 3LORA 5ECOB 2DMMA 5B8AA 5J41A 3IA1A 1IYIA 1WWJA 4NWYA 1FG4A 4MH2A 3CTFA 1WMJA 3LYPA 4GLTA 2CX3A 3H4KA 3D5JA 2YWIA 4EKZA 2DIZA 1JLVA 2V1MA 3EURA 3HXSA 1BEDA 1JLWA 3KMOA 5IM9A 3KD0A 4MF6A 2HYXA 4NHWA 3GFKA 4V1Ap 3VFIA 2GVPA 3ME7A 1SU9A 2MMAA 3QPMA 3UMAA 1PX6A 5KEJA 1UN2A 2FCHA 2H1GA 2PPTA 3G7YA 1HNCA 5GZZB 1U6TA 6GSSA 5FWGA 2FUG2 3ZFLA 3EMXA 1FOVA 3TCOA 1V40A 2F9SA 4KA0A 4OD7A 3DYRA 1EZKA 2L4QA 2OA7A 3GHAA 4X0XA 3TKSE 4O5RA 1RK4A 1Z7RA 5G31A 1J9BA 4KX4A 1K0CA 4CW9A 3E0UA 2F51A 5ECNB 4WEYA 4ZB8A 4PURA 3HCZA 3U5RE 3W8JA 2VL3A 2EIRA 1VF1A 5AN1A 1GTBA 4MZCA 5A4VA 4HQSA 2GT5A 1ZL9A 3GURA 4HOJA 2VLUA 2YJHA 2M80A 1O8XA 3DKSA 3TUEA 2FA4A 5E59A 3RBTA 1B8XA 2HSHA 5CRGA 1USBA 4GCIA 4I6XA 2K18A 4DEJA 4IBPA 4F0CA 3KM6A 3LXTA 3N5OA 5IPHA 1XW6A 2O87A 5HFGA 1A2MA 2FWHA 2PU9C 4ID0A 2YWMA 4GXZA 2O89A 5J4UA 1K0DA 1YEPA 1Z5YE 5ECPB 2IMEA 5HR3A 2I81A 3RHCA 4ZL8A 5ID2A 2OE1A 1TRWA 2H71A 5D9WA 5D93A 1M0UA 4I8BA 2IN3A 3US3A 2KLXA 1K0MA 3M9JA 2QC7A 5F8BA 2C3NA 2NTOA 3VWUA 5IMFA 1AW9A 1GRXA 4G10A 1WOUA 5GSSA 3WGEA 2MMZA 1Z6NA 1IYHA 1EEJA 1V9WA 1XFLA 2H73A 4BWQA 2JSZA 3WT1A 4KDYA 2AYTA 3KP9A 1XWAA 2H1BA 3ZMLA 2GQLA 1MD3A 3HJPA 4D73B 5ECQB 4TR3A 6GSXA 1XWBA 2YP6A 2VD1A 3GSTA 3IR4A 2H0GA 3LG6A 3ZMKA 1K0AA 2P5QA 1GLPA 2VL2C 1EV4A 3IV4A 1A2JA 2N5AA 4LL4B 3TRXA 2JSYA 3L0HA 1OC9B 4NV2A 4IS0A 4GQCA 5G30A 3L9VA 3UBKA 2NDOA 3UARA 3NZNA 3G7JA 3MDKA 2HRFA 1TRVA 2HZEA 3GH6A 3TOTA 1URMA 4ECJA 3ZIVA 3I6AA 4K6XA 4MA9A 2GZPA 4ISDA 1ERTA 17GSA 1YJ6A 2AUVA 2TRXA 2OBKA 3CXGA 22GSA 1EGOA 4MZBA 1XW5A 3ZREA 3GKXA 1K0OA 3ZL5A 2L6CA 2VLVA 5ECLB 1GL8A 4OWYA 4L0UA 1EP7A 3VWXA 2GGTA 14GSA 5HR1A 1YEXA 1QK8A 4OO4A 1N2AA 2VIMA 2RUFA 2X8GA 3KIJA 5HFIA 5DALA 5IPGA 3OR5A 1YKCA 4JEDA 4WR5A 2CAIA 1NW2A 2DIYA 3DRNA 3EU4A 5LNKe 1GTAA 3RPNA 2G2QA 2QSIA 2VUPA 2WDUA 2DJ0A 1O73A 4TW5A 1O8WA 3KH7A 1WPIA 2DJ3A 2XPDA 5D9TA 3H79A 2M72A 4BVXA 3TJBA 4HJ2A 4LLRA 4PQ1A 1LBKA 1X5DA 2X8HA 1DE1A 3EE2A 4TVEA 3UVHA 4OFTA 3VI5A 4XS4A 2HI7A 5AISA 1F3AA 3J7Yb 1TU7A 1M9AA 1JZWA 3DIEA 2ON7A 5J9CA 4POMA 2RLIA 1XIYA 1X9SB 1KBNA 2KOKA 4IW9A 1VF4A 3RHBA 1NM3A 1V2AA 4JZQA 4V2MA 3QFAC 2YN1A 5F06A 3A2XA 1BG5A 1QXHA 1VRSD 2YV7A 1DSBA 1CQGA 2GZZA 1GNEA 3FHKA 4KCAA 1TK5B 2RIIA 1X9MB 1VGLA 4HUAA 1GSDA 2B5YA 3FR9A 2AAWA 2I1UA 4KCEA 4LL1B 1JFUA 3CRTA 4DVCA 3F0IA 3SWLA 3GNJA 1SJZA 3C1RA 4KE3A 2GDRA 2WS2A 2HFDA 2YANA 2KP2A 4MDCA 5JWOB 2FGXA 2O8VB 2H19A 5FT3A 3IDVA 4RQXA 1T00A 1G6WA 2IWTA 5F0GA 1GSQA 2CZ3A 5GAND 2IMDA 2R5GA 3CBUA 3HDCA 5AGYA 3D22A 3UJ1A 4GQFA 2R2JA 1NHYA 3GIXA 5CREA 4J56E 2WRTA 4JRRA 5IO2A 3VPTA 2CV4A 5ECKB 1W4VA 1SKWB 3FY7A 1A23A 1GH2A 5JCUA 1PD21 4KUNA 4AJ8A 4ZBDA 2R37A 4POBA 3EWLA 4LMVA 1O81A 3A2VA 5DDLA 2LRCA 1M9BA 4DSSA 4ULXA 2H75A 1HD2A 2C0DA 2H01A 4YQUA 2DC5A 1R7HA 6GSTA 1DUGA 2XC2A 3C1SA 2YNXA 3FR3A 1MDKA 3FKFA 3LFLA 2PMTA 3L4NA 2CZ2A 1EV9A 3ZVJD 4MPFA 5F07A 1UC7A 2B5EA 1QFNA 3DVXA 3KXOA 20GSA 1A8LA 3WT2A 3K8NA 5CRHA 5EY6A 5HFKA 4L8EA 2BTOT 1AQWA 1XPVA 3GA4A 1A24A 1HYUA 2O85A 1X9WB 5KN0A 3CSIA 2A4VA 1GSYA 1T7PB 3D0ZA 2I9HA 1I9DA 1X5EA 2H6YA 1R4WA 2HE3A 1DE2A 2P31A 3UOMA 3VI7A 4XRDA 2L4CA 2ON5A 2GSTA 2B7KA 3ERWA 2VCVA 3I9V2 2R3XA 2GT6A 4DSQA 4BPYA 3EINA 2JL4A 1T4YA 4AGSA 1K3OA 3IOSA 3ISOA 5AIXA 3HA9A 2E7PA 2FD3A 2OKAA 2OACA 3TKPA 5DAKB 4MJEA 1GSUA 3QFBC 1TDIA 4KDUA 1J08A 3GH9A 2VL2A 2VM1A 3KP8A 2H0IA 2NBSA 5D73A 5A4WA 1Y6EA 4EXJA 1TOFA 5CRDA 5B6MA 3ZVJA 1X5CA 2VL9A 4MF5A 1B9XC 4JE1A 2V32A 1JZRA 1SYXA 3M1GA 2GLRA 2K8VA 4IKHA 2OJLA 4X43A 3TDGA 2YOIA 2VCZA 3KGKA 3EU3A 2K9FA 1G0TA 5HQPA 2H66A 5FHIA 1G7OA 1OKTA 5G2ZA 1F37A 3UAPA 1GTIA 1R5AA 3EVIA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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