5B8HA

Crystal structure of type iii pantothenate kinase (pank iii) from burkholderia cenocepacia complexed with pantothenate, imidodiphosphate, and amp
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
SEPHLLIDAGNSRIKWALADARRTLVDTGAFGHTRDGGADPDWSRLPRPRGAWISNVAGADVAARIDALLDARWPGLPRTTIRSRPAQCGVTNGYTTPEQLGSDRWAGLIGAHAAFPGEHLLIATFGTATTLEALRADGCFTGGLIAPGWALMMRALGTHTAQLPTLTTDIASGLLAGAQAEPFQVDTPRSLSAGCLYAQAGLIERAWRDLVAAWQAPVRLVLAGGAADDVARALTIAHTRHDTLILSGLALIAAD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Type III pantothenate kinase (PanK III) from Burkholderia cenocepacia complexed with pantothenate, imidodiphosphate, and AMP
rcsb
molecule keywords Type III pantothenate kinase
source organism Burkholderia cenocepacia (strain atcc baa-245 / dsm 16553 / lmg 16656 / nctc 132
molecule tags Transferase
total genus 74
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.33: Pantothenate kinase.
pdb deposition date 2015-04-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03309 Pan_kinase Type III pantothenate kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5b8hA01
3.30.420.490 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5b8hA02
3EKUA 5F1XA 1HKCA 4BG8A 5EY4A 2QWMA 5AQYA 3R9PA 1NGBA 2W40A 3QBWA 3UKRB 4CI6A 2IVOA 3VGLA 1ATRA 5AFUA 1XQSC 4MO5A 2YHYA 3SMPA 2Q0RA 4BRKA 1RGIA 3LDPA 1DEJA 3MCPA 1ZC6A 1JCEA 4CJ7A 1OKJA 3UKRA 5FPDA 5BPLA 5TKYA 3LDLA 3DXMA 3FGUA 3RSEB 1XC3A 2P9LB 3FZKA 1P8ZA 3IMXA 3LDNA 4B1UB 4F9OA 4BRFA 4YDUC 2GUPA 5AQHA 3RSEA 2P9LA 4GNIA 3LM2A 3P4IA 2ZF5O 2FSJA 2IIRA 4CD3A 4H0VB 2GWKA 1NGDA 1C0GA 1T44A 2HF3A 3EO3A 4XEIA 2DPNA 2FSNA 1NMDA 4BRLA 4MO4A 1X3NA 3ZX3A 3QMLA 4FPBA 2P9SB 2Q0UA 5AQWA 4FWMA 4B1XB 2E2OA 2P9SA 3FFKB 3FR0A 2HOEA 2ASPA 3WXKA 4M63C 3VEZA 1J6ZA 3H46O 3VEVA 1TYQA 4H5VA 5FPEA 1QHAA 3U9ZA 4JHDB 1H1VA 4O5FA 2ZWHA 3JS6A 1GLEG 4CZEA 1KAXA 3O1WA 1V4TA 3IUCA 4IJAA 5AQSA 2PBDA 3ULEB 4EFHA 5AQPA 2YCHA 4Y0WA 2F9WA 3A5MC 5KQDA 3WEEB 5AQJA 4IXCA 2P9NA 5EVZA 3A5OC 3R8EA 1HKGA 1S3XA 2E2PA 4K42A 4CZGA 3GL1A 3WEEA 2Q36A 1X9JA 3C0BA 4BRMA 4A2AA 4H5TA 3O4WA 3AY9A 3CQYA 1BDGA 3LM9A 3ZETA 3CI5A 3MK6A 2BTFA 5I9EB 3ENHA 4M7XA 4RCHA 2V7ZA 3DAWA 2NZTA 3IDHA 3A5LC 3CJ1A 3IFRA 3J8AA 4FOIA 3ZX2A 3HZ6A 3WQTA 5AQOA 4CBXA 2V7YA 2FSKA 4JN4A 2AA4A 1NWKA 3L0QA 2P9PB 5E84A 1LOTB 4BRCA 2QXLA 5AQLA 1QQMA 1QZ6A 3G25A 5LJVA 1NLVA 4M7YA 3O5BA 4QS8A 1EQYA 4PKIA 2IVPA 3H3OB 4WQ5C 3GBTA 3B8AX 1E4GT 4XH4A 3ID8A 1WUAA 4BVOA 3MMVA 4BGAA 3ZX0A 2FF3B 5ADXA 4IO8A 5AZIA 3U8XA 5F2RA 1MDUB 5AFUH 1GLAG 3QB0A 3GOIA 1NGIA 2I7PA 3AAPA 2A42A 3D2FB 3DWLA 3W0LA 1NGFA 3WXLA 2YJFA 3C7NB 4H5NA 2ZGZA 3A0IX 5LY3A 2CH5A 3CHWA 3CJ7A 3D2FA 3HTVA 1U2VB 5KPZA 3C7NA 3LL3A 1E4FT 4E1JA 3ZEUB 4BVPA 2V51B 3LDQA 1ZBSA 1U2VA 1GLBG 2AP1A 4B1VA 2QWNA 4PL7A 3MN5A 2ASMA 3ZEUA 4I6MB 4BC3A 3VEOA 2V52B 5LJWA 3M6GA 2YHXA 5AR0A 4FWNA 3CIPA 3QBXA 2QWRA 3O6WA 3M3ZA 4PL8A 4BG9A 1RDWX 4FWLA 2BUPA 2E1ZA 3L4IA 1QZ5A 1BU6O 1YXQA 2CGLA 1CZAN 3H6EA 4J8FA 4WQ5A 4H0OA 4ISGA 1HX1A 2GTDA 5AQMA 3WQUA 5AQRA 2P9UB 2Q1NA 2E8AA 4BR7A 4A2BA 4EHUA 1Z6RA 1RFQA 2QM1A 2ITMA 3FZFA 1QQOA 1YUWA 3S41A 1X3MA 4WQ4C 2YI1A 4O8KA 1HUXA 5AZJB 3U4LA 4FWOA 1SZ2A 4H5RA 3BUZB 3FZMA 3KVGA 4B1ZA 4BQLA 1BUPA 1V4SA 1T6DA 1BG3A 3SK3A 2E1YA 2H3GX 4JHDA 3HBTA 3WT0A 4BC2A 2P9KB 4BR5A 5AQXA 2Q31A 3VF2A 1IJJA 3ULEA 4YDUA 2FLOA 4BR4A 3MN9A 4BRQA 5BRFA 1KAZA 2YHWA 3WXJA 1NM1A 4H0PA 4K43A 3D2EB 1JCFA 3VEXA 2EWSA 2WUSA 3CJCA 4ISFA 4CZLA 4DHYA 2QW9A 3BP8A 4PKHA 3KHYA 4QS9A 3H1QA 3SMSA 2VCPA 3VEYA 4JD2B 5AQUA 4BROA 2NRHA 4BRDA 2NLXA 4H0TB 2KHOA 4EAHD 4PKGA 2E2NA 4A61A 2GEMA 4JD2A 2P9IB 4JAXA 3EKSA 3GG4A 5AQGA 1GLCG 5AQQA 1NGCA 1BA0A 5FPNA 5BR9A 1DKGD 1TUUA 4AM7A 3CJ9A 4DB3A 2E88A 3TU5A 3WUHA 3M1FA 3FE1A 3CQXA 1ATSA 3GE1A 3VERA 4CZHA 4B9QA 1MWKA 5ADXH 1G99A 1KAYA 2P9PA 2A41A 5AQVA 3L6QA 1KXPA 1JCGA 5BRHA 4L3QA 3A5NC 4BR9A 3EN9A 1Z05A 3I8BA 3FLCO 3AARA 2E2QA 4FWKA 3UKUB 5JICA 1HLUA 3HI0A 4EHTA 2IVNA 3UKUA 4BREA 1K8KB 5F0XA 4CZFA 3QFPA 4WYBA 4RWTA 1XUPO 3VF4A 1K8KA 2CH6A 3MN7A 2HMPA 2QWQA 4FWPA 5B8HA 3O08A 4QS7A 3CETA 2J4RA 1NGAA 5KPTA 3U9DA 2UYTA 5AQZA 3ATUA 2HF4A 1D4XA 1NGGA 2OANA 1BO5O 3ENOA 4CZMA 1TUYA 1DGKN 3GDQA 3VEWA 4LC9B 4BRGA 4Z94A 5AQFA 3CERA 1SQKA 5BN9A 4I6MA 1GLDG 1QQNA 3H45C 4KBOA 3UE5A 4BRIA 4H5WA 3BEXA 3KZBA 4HTLA 2A6AA 4FWRA 4NO7A 3DXMB 5EXWA 2GWJA 3VF6A 4BGBA 2QWPA 5CE3A 1GLFO 4CZIA 4A62A 3I33A 3CJBA 2P9UA 4RTFD 4BR2A 1Q18A 1WOQA 2CGKA 3HSCA 4FSVA 3VPZA 3CJAA 4B1WB 2QWLA 2GELA 3QDKA 5BPMA 1MA9B 2FF6A 4H03B 4CBWA 2VWBA 5AZJA 4EIAA 2Q97A 2FXUA 3DJCA 4XH1A 1Y64A 3H1VX 3VENA 4BC4A 5JLHA 2YJEA 1GLLO 1IG8A 3BF3A 3VESA 4CBUA 4BC5A 4CZJA 3O8MA 3R6MA 3EZWA 5KPRA 5EX5A 3F9MA 4ISEA 4NB4A 3O80A 1SAZA 1TYQB 2D1KA 4H0YB 2P9KA 2I7NA 5AQKA 1GLJO 2W41A 3ATVA 2D0OA 5FPMA 3BF1A 1HKBA 4FOEA 3O1BA 3QFUA 1HJOA 1MWMA 3WXIA 4K25A 5BREA 3FZHA 1U6ZA 3LDOA 4MLEA 3QICA 3TPQA 3D2EA 2P9NB 3FZLA 2A40A 3EL2A 2QWOA 3HM8A 5E26A 4FWSA 1LCUA 4H0XB 4DCHA 3VGKA 2E20A 3OHRA 4WQ4A 4FWQA 1YVNA 3AAQA 2P9IA 3VETA 3VOVA 1BOTO 3ZETB 5AQIA 2ZGYA 1ATNA 5BRDA 4MLHA 1YAGA 4BRAA 5JMVA 1NBWA 3JXUA 1S22A 4FL9A 3D7EO 2CGJA 3A8YA 4IWVA 1NGEA 2A3ZA 3MN6A 4JNEA 3W3DA 4BRPA 4K41A 5ELZA 4FO0A 4BRNA 4DQ8A 1R59O 1HPMA 2F9TA 1C0FA 4IZ9A 5BPNA 3MDQA 1BWFO 1ESVA 4GY2B 4BR0A 4HWIA 2PAVA 5BN8A 1NGJA 2D0PA 4BRHA 2Q2RA 1T6CA 5AQTA 4XH5A 4B1YB 4CZKA 4FPAA 5KQ8A 2VYPA 2A5XA 1ZXOA 2D4WA 1BA1A 3DXKB 5AZIB 3VGMA 4C23A 5AQNA 2ASOA 5EOYA 3SLCA 3DXKA 3UB5A 4BQZA 5JLFA 3H3NO 3SJHA 4CD1A 4AM6A 1NGHA 4IJNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3U6FA 4BG8A 4DQRA 3V81A 2WC9A 5AQYA 3R9PA 2W40A 4AQYK 4MO5A 4IFEA 4LH4A 4BRKA 3V9ZA 3J7ZO 5CZ1A 1S72N 1JXEA 1OKJA 4BACA 3ISNC 2VG7A 3RSEB 1P8ZA 1ILYA 3AVAA 4OPHA 2O8FA 1Q81O 3QLHA 3P4IA 2FSJA 1ZBIA 1W0HA 2Z1GA 2O8EA 1K73O 2EHGA 1HYZA 3IRXA 4KKOA 2HHUA 2GWKA 1J9AA 2BH1A 1O13A 2X74A 3ZSQA 2OPRA 3L2VA 5CHIA 4XEIA 2VQFK 2DPNA 1X3NA 3ZX3A 1REVA 1WSEA 1ZBUA 2O8CA 3L3UA 3VQ6A 4JI5K 4FWMA 4DTXA 4B1XB 1X9WA 3DLKA 2QXFA 3FFKB 3C6TA 1NOZA 3FR0A 2HOEA 3KLGA 4C8OA 3VEVA 4JLHA 1QE1A 4O5FA 4DSIA 4J2EA 4X66K 4IJAA 1V4TA 3IUCA 5AQSA 3LPTA 4BWMA 1NKEA 4B3TK 5AQPA 1NKBA 4FJXA 3AV9A 4ID5A 3WEEB 4HUGA 4GV6A 3A5OC 1IKYA 3GL1A 4F3OA 2KTQA 3WNEA 1NK5A 3PX0A 1D8YA 4H5TA 1UA0A 4OJRA 3AVJA 4CIEA 3O4WA 4DSEA 3VQQA 3AY9A 3SV4A 2RN2A 1N8RO 4RW6A 2O8DA 4CJ3A 3LM9A 3ZETA 4CGJA 4B08A 3NFAA 4DF8A 3PSIA 4RCHA 3AVBA 2KKZA 3SQ4A 3CJ1A 2A1RA 4AH9A 2HBKA 5JS2A 3F2KA 5AQOA 2V7YA 4IOXA 4FJIA 3L0QA 4JK9A 5I3UA 1DLOA 3ZT0A 2OCEA 2QXLA 1QQMA 2ZE2A 4MFBA 1BISA 3J80O 1U49A 1QSYA 1U48A 3QEWA 3CCJN 4PKIA 3H3OB 1S5JA 3GBTA 3B8AX 1E4GT 2XY6A 1Q9XA 1KCFA 3ZX0A 2XRIA 4CFCA 3OYKA 2BE2A 4EZ6A 4N41A 5AFUH 3SQ0A 1NK7A 3VQDA 1RTIA 1QS4A 3PSFA 3TARA 3DWLA 4QCLA 3WXLA 3NH2A 2ZGZA 3WXMB 3VQAA 3OYLA 3HTVA 1A5WA 4DFKA 3DMJA 2YNIA 4DU4A 3OA9A 4BY9C 3TSQA 3NCIA 3NE6A 2AP1A 1U2VA 3MEDA 4PL7A 2YKMA 3ZEUA 3TSUA 4DUYK 4J2AA 3VQ9A 3M6GA 1KFSA 3ULDA 2YHXA 4FJLA 3QBXA 3DOLA 4WFBL 1IO2A 5IT9O 1S1TA 1QZ5A 1BU6O 1YXQA 4B8AB 4J2BA 4FJNA 1HX1A 4BDPA 1DT9A 4FLXA 3T1YK 3PO5A 4A2BA 4RW7A 4Y1DA 2HMIA 4YORA 2JWKA 2E6LA 4CGFA 1GOBA 4E1NA 4FJ8A 4GKJK 1X3MA 5HL7L 1LWFA 4FM0A 1RT7A 3HO1A 4DS5A 5AZJB 4F2RA 1HNIA 4FWOA 1VRTA 4OLBA 1WBDA 1KTQA 3FZMA 3RMAA 4OGCA 1D9FA 4BQLA 1BUPA 1T6DA 3N4PA 3T1HK 2H3GX 4JHDA 3SUPA 2BANA 5MLCQ 2FBXA 4AHRA 3KD5E 1C6VA 4BR5A 4GMJB 1GOAA 2WONA 4JKHA 1NK6A 1IJJA 3HPOA 4JS4A 3ULEA 4YDUA 4ZTFA 5BRFA 3HOSA 2PYJA 4CJWA 3SBTA 4AHUA 1ZBHA 1XMOK 3VEXA 2IAJA 2EWSA 2WUSA 1BQNA 4CZLA 3MXIA 3KHYA 3CCSN 4W5RA 2HVHA 1TL3A 4H4OA 1JLCA 2VCPA 3AA2A 4DV3K 4JD2B 4BROA 1NNEA 2NRHA 3I55N 1N32K 2KHOA 2GEMA 5GADP 4LF4K 1WBBA 5KRSA 1NGCA 3PIPL 4PWDA 1DKGD 4K0KK 3OYNA 4DB3A 4LFBK 3AO4A 1ATSA 3VERA 4CZHA 4OKJA 4B9QA 1JLQA 4KFBA 4DU1A 5LL6Z 3L6QA 4EZ9A 4DLEA 4Z4HA 1T3VA 4L3QA 3EN9A 3FLCO 4FWKA 4CGGA 5JICA 4DR6K 1OH7A 4OGEA 4EHTA 4BREA 4C8KA 1YF5L 3DM2A 5F0XA 3SUOA 3VF4A 3OYIA 3QNNA 3CC4N 2CH6A 5C0YA 1NK0A 1HQUA 4HUEA 3O08A 1CZ9A 3MWPA 4KHSA 4C8MA 1YTUA 1J53A 4UY8O 2HHSA 5CR4A 5J2PA 1Z25A 2UUAK 1B9DA 1BO5O 3ENOA 1Q82O 4CZMA 4E3SA 3GDQA 4CW7B 3OY9A 1VSMA 2KFZA 2G8VA 4JK7A 4AILC 4I6MA 4DUZK 3UE5A 3H45C 2X6SA 1KVBA 4LF7K 4DFJA 3LWLA 3O9RA 4HTLA 1O1WA 2GWJA 4KRFA 3VF6A 3BZCA 3OYGA 4FJ9A 3B6PA 2O8FB 3RVCA 5DM6L 3OYAA 2P9UA 4BR2A 1Q18A 2O8EB 3OYCA 3HSCA 2RF2A 3EYZA 4FXDA 3R3LA 1C1CA 4CEOA 3QIOA 3M8SA 3DRPA 2QWLA 3ZSZA 2GELA 3QDKA 5BPMA 2P5GA 3CCRN 1EWRA 1BIUA 2VG5A 2OTJN 4DR1K 3SJJA 4YY3K 4EIAA 1N6QA 2FXUA 3DJCA 4XH1A 1Y64A 4BC4A 2O8CB 5JLHA 3ENBA 4DSFA 3EZWA 1BCOA 3VMFB 3AA3A 2F8TA 1RTDA 4IBNA 3OJUA 2ETJA 3ALYA 1SAZA 4DF4A 1WSFA 2WTUA 2UXDK 1K8AO 3ATVA 3QFUA 3NF9A 1HJOA 1EXQA 4HCBA 1RBTA 4Z4CA 2O8BA 4M41A 1XHZA 3QEVA 4JI4K 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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