The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
14
|
sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGCTTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Rotameric preferences of a protein spin label at edge-strand beta-sheet sites.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Immune system
|
| source organism |
Streptococcus sp. group g
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| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
|
| total genus |
14
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
|
| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F, G, H
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-05-22 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1IBX B; 1FCC C; 1MI0 A; 1IBX A; 4KGS A; 1K53 A; 2RMM A; 2OED A; 2LGI A; 2LUM A; 2ONQ A; 1GB4 A; 2ZW0 A; 2NMQ A; 1YMH E; 2KAC A; 5BMI A; 1P7F A; 5BMG A; 2KDM A; 2JXT A; 2I2Y A; 4OZB A; 1UWX A; 2JSV X; 2JU6 X; 2JWU A; 1PGX A; 1F2R I; 2PW9 A; 3V3X A; 4OZA A; 1PGA A; 2QMT A; 2RPV A; 1KH0 A; 2N7J A; 2I38 A; 2JZP A; 1XCQ L; 4IOI E; 1C9F A; 1PGB A; 5HFY A; 1F2R C; 4HJG E; 4KGR A; 4D2K A; 4OZC A; 5HHD G; 1HEZ E; 2N9L A; 1K52 A; 1FCL A; 5BMH A; 1HZ6 A; 4MAC A; 3MP9 A; 4GLS C; 2GI9 A; 1MPE A; 4KGT A; 1XF5 L; 2J53 A; 2K0P A; 2KQ4 X; 5JXV A; 2EEL A; 1K51 A; 5HI1 A; 3UI3 A; 1Q10 A; 1FD6 A; 1QKZ A; 1YNT E; 2IGH A; 1ZXH A; 1IGC A; 1MHH E; 1HZ5 A; 1D4B A; 2GB1 A; 1XCT L; 2IGD A; 4IKG A; 2KN4 A; 1EM7 A; 2LHD A; 1MVK A; 5HG2 A; 2J52 A; 1K50 A; 1MHX A; 2QSD A; 1IGD A; 4HKZ E; 2KWD A; 2N9K A; 2IGG A; 2PTL A; 4WH4 A; 1P7E A; 2PLP A; 1JML A; 2LHE A; 1GB1 A; 2ZW1 A; 2ON8 A; 3GB1 A; 3FIL B; 3FIL A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2IY1 B; 4ZDV A; 2LZ6 A; 4EKU A; 1IBX A; 2L0T A; 1ZGU B; 3PGE A; 4S17 A; 3RCZ A; 2N9P C; 4ANV A; 3TEW A; 5BMG A; 1TTN A; 1WGG A; 3SFE B; 2PVO D; 1E8Y A; 2KHW B; 2NS5 A; 2RDB C; 1QZE A; 3N1Y C; 4S0R A; 2K25 A; 3DDC B; 3KLS X; 3WAN A; 3NVZ A; 2LGS A; 3FC4 A; 3VTW A; 3EEC A; 4HXD A; 2WDV B; 3DBH B; 3ZIM A; 3N1X C; 3ZQ4 A; 4ITK A; 1SXT A; 3I5J C; 2C9W B; 3NY5 A; 3HRD D; 4ZRJ A; 3T8M A; 3IAS 1; 2KDI A; 3RNB C; 5E6P A; 3MP9 A; 4W9E A; 1MFW A; 1Q5W B; 3QC8 B; 1MJD A; 1XF5 L; 3WAL A; 2ZVO A; 3QCA A; 3R2T A; 3PRZ A; 2IO2 B; 3NS1 A; 2MP2 A; 3QK0 A; 4RM9 A; 1FXI A; 2EEL A; 2K9X A; 1ZW7 A; 1Q10 A; 3P4P B; 1Y56 A; 4NJ6 A; 4OVU A; 1SIF A; 2FNJ B; 5BYQ A; 3SR6 A; 4J3O D; 1GJZ A; 4ANX A; 1AYF A; 1E7V A; 4IKG A; 1YJJ A; 2BBC A; 1N60 A; 1IUE A; 4EEW A; 4RNA A; 2G9H D; 1TZ1 A; 4GOC A; 3DWM A; 3AEC B; 1NEK B; 2KT7 A; 3W1Y A; 2JPH A; 1JWM D; 1L0V B; 4NPN A; 1FO4 A; 5EE9 A; 4K7U A; 1TY0 A; 2G4S A; 1MI0 A; 1WGK A; 3C8Y A; 2QC8 A; 3NVY A; 1S1Q B; 3H9D A; 3JYU A; 1JW9 D; 4WJQ A; 3NZU A; 3DVG Y; 1L6V A; 5GMV A; 4KKJ A; 5G5G A; 1KJT A; 2KK8 A; 3GZN I; 1IPG A; 2WDR B; 2LXA A; 4K7S A; 2BKR B; 3VUW A; 4IDI A; 1RFA A; 4XWW A; 1C9F A; 2C7N B; 3VR9 B; 3L16 A; 1JQ4 A; 3T3N A; 4K3C A; 2IY0 B; 4MSQ B; 2DZI A; 3U7Z A; 3IBE A; 1F0Z A; 2DAF A; 2R2O A; 1WR1 A; 2WX1 A; 3LDZ E; 2A5U A; 1U4A A; 3APC A; 2VH2 A; 2WLB A; 3HVZ A; 2JZ3 B; 3Q8E A; 1WGD A; 3Q8C A; 4YXD B; 2XBB C; 4YSZ B; 2M8S A; 2KMA A; 4TMA B; 4I6N B; 2M56 B; 1V81 A; 3VDZ A; 3LYY A; 3C19 A; 5DPT A; 3U8Z A; 2FCN A; 2IO0 B; 3DBS A; 3AU4 A; 2WXQ A; 2KN4 A; 5DCN A; 4M01 A; 1OEY J; 3ZJU A; 2WX0 A; 1WM2 A; 3DVG X; 4N58 A; 2BS3 B; 1LXD A; 1E0Z A; 2BYV E; 1ZDV A; 2WWZ A; 3DCG A; 2WU5 B; 2N1W A; 1KLU D; 2ON8 A; 1WRD B; 1WX7 A; 3WCQ A; 4KIK B; 1KLG D; 1GG3 A; 4KGS A; 3A1Q A; 3JVZ X; 3AMZ A; 4GXB A; 2ZW0 A; 1YQ4 B; 4A8X C; 3NOB A; 1TKG A; 3T9L A; 4LNF A; 4JLC A; 3B08 A; 1V1P A; 3HK0 A; 3X0W A; 3K9P B; 1OQY A; 2N9E B; 4EFO A; 4HCN B; 1H4R A; 1C4P A; 5J18 A; 1WZ3 A; 3VUY A; 4E74 A; 1I4R A; 4KDL B; 3GOE A; 1OQR A; 1WXQ A; 5TR5 A; 4B95 A; 4O1N A; 1N62 A; 4OZA A; 3PHW B; 2LGY A; 1VR9 A; 1OQQ A; 2BWE S; 4BKS A; 4F7Z A; 1WI0 A; 1XLO A; 1V97 A; 2N4F A; 4E71 A; 5HHD G; 4P1C C; 1KOT A; 1NVI D; 2WXH A; 4HK2 A; 2J4X A; 3AB5 A; 1AW7 A; 4GDL A; 2WDT B; 1DYQ A; 4ZYS A; 2KTR A; 2GLS A; 5CHV C; 2LJ5 A; 4GSW A; 4GB9 A; 2PE9 A; 1UZX B; 3APD A; 3RI7 C; 3ZVV A; 3PRP B; 3UF8 A; 1WIA A; 1P98 A; 2DYO A; 1TS3 A; 3NRZ A; 1TT5 B; 1AAR A; 3MC0 B; 1Q1O A; 2MQJ A; 4ICU A; 4GN1 A; 1ENF A; 4HEA 1; 2XN9 C; 1YJ1 A; 1I4P A; 4FBJ B; 4JIO U; 5IKC M; 1WYW B; 3V60 A; 2FCS A; 4LNO A; 5C2T B; 2D3A A; 2WXP A; 2IND C; 2L52 A; 1R4M I; 3N3K B; 4M00 A; 1BML C; 5E6O A; 2BWF A; 2ACZ B; 1L4Z B; 2V3P A; 2NMQ A; 2DBY A; 4LNI A; 3WA0 A; 3GE8 C; 4C56 C; 3AE2 B; 2HTH A; 3Q2A C; 3BVZ A; 4C7Z A; 2K8B A; 4E3C A; 2QDF A; 4NAM A; 2CHW A; 1KLV A; 1N5X A; 4C80 A; 4PYU A; 4NJ7 A; 2CKH B; 4IOI E; 1MG4 A; 4OVV A; 4HJG E; 4ANU A; 3ZNZ B; 3PLU A; 4DXG A; 4BBN C; 2L00 B; 1TKY A; 3RNF C; 4MJS A; 1XLQ A; 1D5X C; 2JZZ A; 3AE6 B; 4KKI A; 5EE0 A; 3RYT A; 2MX2 A; 3ZNH B; 3B0A A; 3NZS A; 2ZCB A; 3VUX A; 4AP4 C; 3N30 A; 2BGF A; 4RGM A; 1FD6 A; 2INN E; 3OG5 A; 3IXS A; 2BB6 A; 4UDU C; 3KYD D; 3ZUN A; 1ZPS A; 4ZRQ A; 2DZK A; 2MBQ A; 1X1M A; 1EF1 A; 2FIF A; 3SEB A; 2OJW A; 3M62 B; 2LMC A; 3QAQ A; 3IG3 A; 2PEA A; 3V62 A; 1IGD A; 3KYC D; 3PTF C; 1JCK B; 2PTL A; 1P7E A; 1RRB A; 1ZUD 2; 1N61 A; 3EUB 2; 4WJP A; 2D11 A; 1RYJ A; 1YOV B; 3O13 A; 5TSS A; 3FIL B; 4I6L B; 3Q3N C; 2RR9 A; 1YMH E; 1RLF A; 4RF0 A; 2Q5W D; 2G3Q B; 2D2Q A; 2W3S A; 2O6V A; 4AWJ A; 2J0M A; 3AV8 A; 2PIA A; 1WX8 A; 2KAJ A; 3JSV B; 4J6I A; 4MT5 A; 4TKN A; 2K3U A; 1VD2 A; 2BQQ A; 3E56 A; 1L2N A; 4PT5 A; 4NJC A; 1XD3 B; 3HIZ A; 2MJE A; 3MJ5 A; 1BUI C; 4B6W A; 3TSS A; 3H7P B; 4IG7 B; 1QOG A; 1E8X A; 1KH0 A; 2SEB D; 4LLG M; 2QEJ C; 1T6B X; 2WXM A; 3V05 A; 1UNS A; 4MGY E; 3RPF C; 3TEX A; 3AH7 A; 1K52 A; 1PYW D; 4ICV A; 1YQ3 B; 1QOA A; 5G5H A; 1T3Q A; 3DVN U; 2LD9 A; 1T0Q C; 5IN7 A; 2V9H A; 1D3Z A; 1V9J A; 3R66 C; 1V80 A; 1E9M A; 3DHH C; 2WYQ A; 3KH0 A; 3UI3 A; 3RN9 C; 5JZE B; 2EMT A; 4ZYN A; 2RDG A; 1ESF A; 2EKI A; 2Z59 B; 4M8N A; 3M95 A; 3RNE C; 1IGC A; 1MHH E; 1HZ5 A; 3GE3 C; 2IGD A; 2N9X A; 1A70 A; 1YQB A; 5IA7 A; 1FNV A; 5D2M B; 1FMA D; 1P1A A; 2BS2 B; 3R8B A; 5AZH A; 4JX1 C; 1BXT A; 1QF6 A; 3EFC A; 3L08 A; 3B9J A; 5H8Y E; 3ZDM C; 4F8C B; 2ZPN A; 1AWD A; 1C77 A; 2DEN B; 1WYG A; 3PZD A; 4YSX B; 4HWI B; 2KYW A; 2O2V A; 3AXC A; 1NEN B; 2QJL A; 1XLN A; 4P7I A; 2BB5 A; 2C5L C; 3Q3O C; 2XK5 B; 3AM9 A; 4HPL B; 3VH3 B; 3NVW A; 5EE1 A; 2I2Y A; 1F1H A; 2WDQ B; 4F1S A; 4XDD A; 4EZL A; 1RAX A; 4MH0 E; 1UEL A; 1PGX A; 1UBQ A; 3BY4 B; 2C7H A; 4US8 A; 2ASQ A; 1ET9 A; 4A3O A; 2MBO A; 3UGB B; 2KOX A; 4OW0 A; 3DQV A; 4IW0 A; 3AU5 A; 4ZHP A; 1YJI A; 2HTM E; 1F2R C; 1ZE3 D; 1JRO A; 2D3C A; 2FBW B; 2GMI C; 4A90 A; 3BYY B; 3DBL I; 2N0S B; 1KF6 B; 3AE7 B; 4JWS C; 2BTE A; 2GI9 A; 4FJV B; 4XWT A; 2C7M B; 4AS1 A; 2IYD B; 2CU1 A; 4PS7 A; 1VDV A; 1D5Z C; 5FR6 A; 4DBG A; 1D5M C; 2Z8L A; 4TQ1 A; 1QKZ A; 3MJW A; 4FXC A; 1T0Y A; 2WGS A; 3NG0 A; 1ZXH A; 2KTF A; 3PZ7 A; 1QT9 A; 4FA6 A; 2VH1 A; 4FHJ A; 1F52 A; 3W2D A; 2AQ1 B; 2LEK A; 3DOW A; 1WY8 A; 2V4L A; 5IAA C; 1EF5 A; 2K22 A; 3ZTC A; 3QHT A; 2KQS A; 2GBM A; 3MC8 A; 1KM7 A; 4CYE A; 2EKE C; 3DBR I; 1J7A A; 2G4D B; 4AJY B; 4JGH B; 3E9S A; 2WXI A; 4KSK C; 2DYM A; 2LGI A; 4W9J A; 2FCQ A; 2WS3 B; 1KTK A; 4W9G A; 2RD0 A; 1WF9 A; 2ZNV B; 1ROE A; 2UU7 A; 3L13 A; 4G3X B; 1JRU A; 4NZL B; 2MSE D; 1T5X D; 3BZD B; 3KUZ A; 3HM6 X; 5T8I A; 2MCN B; 4DK5 A; 4PYZ A; 3LXF A; 3BII D; 4EE2 A; 3B1L X; 2SAK A; 5BYR A; 4RF1 A; 3TIX A; 2KFJ A; 1GAQ B; 2OJR A; 1F77 A; 4KDI C; 3AE5 B; 1UBI A; 2LVO A; 1HZ6 A; 1NBF C; 1PUT A; 4XGA B; 2K39 A; 4LNN A; 2ZPY A; 1MPE A; 2MHJ A; 4IM2 A; 4C4V B; 1XT9 B; 4MM3 B; 1YX5 B; 2JT4 B; 3ZO5 B; 2DLB A; 1K8R B; 1PQS A; 2CHX A; 3NJT A; 5D7G A; 4P6V F; 2AEH A; 3LB8 C; 1UWM A; 5DPS A; 1GC6 A; 4I6P A; 3N32 A; 1XXG A; 1TBE A; 3L10 B; 2BVC A; 3P2B A; 1YIW A; 2WP9 B; 4M02 A; 3KQ4 A; 2FID A; 1C1Y B; 3GP7 A; 2NBW B; 4W9I A; 2CR5 A; 2EMS A; 4LJP B; 1WH3 A; 3L4P A; 4MGK E; 2JXX A; 4WJO A; 1NI2 A; 3ZJT A; 2NTT A; 3WIM A; 2MWS B; 2AQ3 B; 5LLI A; 2Y5P A; 3MFG A; 5I4D A; 3CF6 E; 2MA9 B; 3UQB A; 3DBL B; 1OTR B; 1SE4 A; 2V3S A; 1IP9 A; 1IBX B; 5CTR C; 1M94 A; 2WNM A; 2DAJ A; 1TKE A; 4URK A; 2RMM A; 3QX1 A; 4GU2 A; 2VRR B; 3OAW A; 3EC8 A; 4EZJ A; 2MH7 A; 1WZ0 A; 3TUO A; 1UWX A; 3I3T B; 2JU6 X; 1EU3 A; 4FN2 A; 4YWG G; 3ENE A; 2WU2 B; 3A9K A; 4NQL B; 3VHT C; 2KDB A; 2PW9 A; 3ABV B; 3AEB B; 2JX5 A; 2MEK A; 3AUL A; 1ZXI A; 4A6Q A; 4XE0 A; 2I38 A; 1T0S C; 4NAW B; 2KDF B; 1WXS A; 1I4H A; 1PGB A; 3R7Q A; 3UQA A; 4W9K A; 4GDK B; 3KW5 B; 1EU4 A; 2WXR A; 5JHB A; 3DBR B; 4ZHO A; 4IUM B; 1L6U A; 2L32 A; 1SE3 A; 3RD2 A; 2PKO A; 2KO3 A; 2V1Y A; 5IOI A; 3QJZ A; 2JWZ A; 2K0P A; 1VJK A; 1SJH D; 4WAA A; 3ML9 A; 2KVZ A; 1K51 A; 3QIJ A; 4K7W A; 4MH8 A; 1EUV B; 5CHW A; 4KSL C; 3RNC C; 2WXF A; 4DXF A; 1SJE D; 3ETR A; 1IYF A; 5G55 A; 2JVC A; 3EA6 A; 2GOW A; 1D4B A; 2GB1 A; 3V6C B; 1XCT L; 1STE A; 4M0W B; 2CS4 A; 3M63 B; 5D3D A; 1GC7 A; 1FNU A; 3CST A; 2INP E; 2KXJ A; 2WXN A; 4MGZ E; 2LVQ A; 2JY6 A; 1Y8R C; 4KVG B; 4PS8 A; 4XZ4 A; 2NCN A; 2KNB A; 4YL8 A; 1TS5 A; 5G2N A; 2M1M A; 1J19 A; 4YTP B; 3GZN B; 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4ZOH C; 2KLG A; 2JWU A; 1I4Q A; 5L83 A; 1C79 A; 3HM3 A; 1V1O A; 4A3P A; 4ASW C; 4HLE A; 1VCB A; 2JZP A; 1WFY A; 4W9F A; 2GRI A; 3L54 A; 3Q8F A; 3A9J B; 1WXM A; 4DHJ D; 1ZP0 B; 2IDY A; 3VQI A; 3EHV A; 1WJ4 A; 4OVZ A; 3DPD A; 2V3N A; 2CU3 A; 3MHS D; 4GDL B; 3ML8 A; 4LDT B; 4TUU A; 1WMH B; 4WJN A; 3DBH I; 1QQR A; 1GOZ A; 2FUG 1; 2ZEQ A; 4JQW C; 2JYE A; 3B2G A; 1FFV A; 3PSE B; 4RMA A; 1FPY A; 4DXA B; 1CJE A; 3VFK A; 4C00 A; 3VTV A; 3SU8 X; 3OWE B; 4BBN F; 4GMV A; 4BKG A; 1R4M B; 4XX5 A; 4BVU C; 4JL9 A; 2M4N A; 3PLV A; 2VZK D; 2D3B A; 2QCZ A; 1B1Z A; 4WUR A; 4A20 A; 1MHX A; 2V4I B; 1VZ7 A; 4HRS A; 4BZA A; 2Z0E B; 4BKS D; 3W5U B; 2KFK B; 4PS3 A; 1JAL A; 2J0J A; 2ZW1 A; 4RCO A; 3VRA B; 3ZLZ A; 1UD7 A; 4IC7 B; 2BT6 A; 1FCC C; 2IPK D; 1NI3 A; 1WJ6 A; 5BYS A; 2KDE B; 2KVR A; 4H2A A; 1HTQ A; 4LDT D; 1DOI A; 1TS4 A; 1L7Y A; 3ZDT A; 3AEA B; 3RUL A; 1P9D U; 3BIN A; 3TJP A; 3MHZ A; 1R7S A; 3EFU A; 4B0M A; 4FLH A; 4BOZ B; 5BO4 B; 4USA A; 2WXJ A; 2KZR A; 5E6N A; 1C76 A; 2K5P A; 5LXH A; 2KQ7 A; 2MJD A; 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