The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWCYDDATKTFTVTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| publication title |
Rotameric preferences of a protein spin label at edge-strand beta-sheet sites.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Streptococcus sp. group g
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| molecule tags |
Immune system
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| total genus |
15
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-05-22 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4D2K A; 4GLS C; 1D4B A; 1YMH E; 2PW9 A; 2GI9 A; 2IGG A; 1PGB A; 2N9L A; 2ONQ A; 2LHE A; 4KGR A; 5BMG A; 2RMM A; 1GB4 A; 2K0P A; 2EEL A; 2IGD A; 1K52 A; 2PLP A; 3FIL B; 2KDM A; 2IGH A; 2OED A; 5HG2 A; 4OZC A; 1EM7 A; 3FIL A; 2LHD A; 1P7F A; 2KWD A; 1GB1 A; 1QKZ A; 3MP9 A; 4MAC A; 1JML A; 1PGX A; 1XCQ L; 1YNT E; 2GB1 A; 2ZW0 A; 3GB1 A; 2J52 A; 1F2R I; 4WH4 A; 2N7J A; 5BMI A; 5HFY A; 2JZP A; 1Q10 A; 1P7E A; 4HKZ E; 1IGD A; 1K53 A; 1MHH E; 1MVK A; 4OZB A; 1HEZ E; 4KGS A; 1KH0 A; 1XF5 L; 5BMH A; 2LUM A; 2J53 A; 1FCL A; 4KGT A; 1FCC C; 1MPE A; 1K50 A; 1C9F A; 4HJG E; 5HI1 A; 2JSV X; 2ON8 A; 1HZ6 A; 2N9K A; 3UI3 A; 2QSD A; 2I38 A; 2RPV A; 2KQ4 X; 2KAC A; 1IGC A; 1F2R C; 1UWX A; 1FD6 A; 2NMQ A; 4IKG A; 1IBX B; 1PGA A; 2JWU A; 5HHD G; 2PTL A; 2I2Y A; 1IBX A; 2QMT A; 2JU6 X; 2KN4 A; 1ZXH A; 2JXT A; 2LGI A; 4IOI E; 3V3X A; 2ZW1 A; 1HZ5 A; 1XCT L; 5JXV A; 4OZA A; 1MHX A; 1MI0 A; 1K51 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3A4R A; 2B3A A; 1YMH E; 2JF5 A; 2PW9 A; 3Q3O C; 3OJ3 A; 2KFK A; 4HRO A; 5J17 A; 2BF8 B; 4IG7 B; 3AEC B; 4HXD A; 3N30 A; 5EE3 A; 5HG2 A; 5BYQ A; 3RN9 C; 2VH1 A; 2AQ3 B; 1CMX B; 2HJ8 A; 4W9E A; 3CSF A; 1NI2 A; 1OQQ A; 2IO3 B; 2YEP B; 3SDL C; 2DZI A; 1ZXI A; 2N7J A; 3ZQ4 A; 5HFY A; 4M00 A; 3SR6 A; 1E0Z A; 1IGD A; 3Q2A C; 5DPT A; 2QJL A; 3BVZ A; 3OG5 A; 4W9K A; 5D3D A; 1TYG B; 3VDZ A; 3NZS A; 3TUO A; 3ZJT A; 1Z2M A; 1KLG D; 1JWB D; 1MPE A; 2CU1 A; 2BWF A; 2IYD B; 4FHJ A; 2JYE A; 4TUU A; 2KO3 A; 2N9P C; 2LRU A; 3IT6 B; 2LMC A; 1S3S G; 1UWX A; 4AJY B; 3RCZ A; 1JCK B; 4DDG D; 2MP2 A; 2WXL A; 1CK1 A; 4JL9 A; 1CJE A; 1KJT A; 5D7G A; 1IBX A; 4N58 A; 5D3I B; 2LFI A; 4W9C A; 5E6N A; 3L0W B; 4IC7 B; 2K5P A; 2G45 B; 1WRD B; 2BGF A; 3BK2 A; 1GOZ A; 3VVW B; 3NS8 A; 2JXX A; 1STE A; 3AH7 A; 4S17 A; 3NVW A; 1WX7 A; 4NAW A; 1G6J A; 3MJW A; 2LHE A; 5LXI B; 2AQ2 B; 3RD2 A; 4LJO B; 5LLI A; 2V0G A; 2D5G A; 3R2I A; 2KLG A; 3CMM B; 2MBO A; 1JRO A; 2FAZ A; 2KDM A; 2PMV A; 4A20 A; 4J3O D; 2CJN A; 1V81 A; 4BFR A; 1ZUD 2; 5GMV A; 2H89 B; 3IAM 1; 4XWT A; 2EKE C; 1IPG A; 3FAH A; 3R7Q A; 4TV3 A; 1PGX A; 3WAM A; 3DVN V; 1YNT E; 2L7R A; 3TEW A; 3DHG C; 2ZW0 A; 4IUM B; 2XK5 B; 2N1W A; 4LDT B; 4G0N B; 2WDT B; 2Z59 B; 1EWY C; 3PZ7 A; 3T8M A; 4C7Y A; 2RR9 A; 4PK1 A; 3CIR B; 4C7Z A; 3ZYY X; 1UZX B; 2O2V B; 1DGJ A; 3KWV A; 2R2Q A; 1VDV A; 3Q8F A; 1FRR A; 3ENE A; 1QIL A; 2D10 A; 2RSU A; 1E9M A; 1VR9 A; 1N5X A; 3AI5 A; 2PPH A; 1RRB A; 1VD2 A; 3AEE B; 3U4E G; 3VTU A; 4CYE A; 2KDB A; 2HTM E; 2L05 A; 2PE9 A; 1T6B X; 2HE7 A; 3AU4 A; 2A5U A; 3B2F A; 3DBR I; 2N7E A; 3JSV B; 5JZE B; 1ISN A; 3R7R A; 3TL5 A; 1I4P A; 2BKR B; 5IAA C; 3U7Z A; 4P1C C; 3ZTD A; 2NBV B; 2M8S A; 2XEW A; 3V3X A; 2K3U A; 2K9X A; 4LNI A; 1ZDX A; 1OEY A; 3X0W A; 4GIV A; 4D2K A; 2IY0 B; 2M0A A; 1WFY A; 3Q8E A; 1D4B A; 1YX5 B; 4RGT A; 4IDI A; 1XQQ A; 4KGR A; 3A9K B; 2SEB D; 1T3Q A; 3PSE B; 4F7Z A; 4HRS A; 4EE2 A; 5IA7 A; 4WJN A; 1VJK A; 1P7F A; 1NYR A; 3DVN U; 1M4V A; 1PUT A; 2Z0D B; 4II2 B; 4O1N A; 2FBW B; 3OWE B; 4IWO A; 4DHJ B; 3MP9 A; 1I4G A; 3QCA A; 4S0R A; 4MGK E; 4JX1 C; 1UGM A; 2LJI A; 2J0M A; 5CTR C; 2BKF A; 3PRE A; 4HPP A; 1D5X C; 5E6O A; 2X8X X; 1SIF A; 3WIM A; 1C4C A; 3SHQ A; 5BYS A; 3L10 B; 1F77 A; 2IDY A; 3N1X C; 1ENF A; 3IXS A; 4G11 A; 4HKQ A; 4DK5 A; 2V3S A; 3DVG Y; 2HTH A; 3ZDM C; 1UH6 A; 2KC2 A; 3BWU D; 3B1L X; 2RPV A; 3ZNG C; 1TBE A; 2MEK A; 1ZE3 D; 2KDF B; 3RMK C; 1ZW7 A; 1FD6 A; 1Q0W B; 4KV2 A; 2YVC A; 1WE6 A; 2G4S A; 2PTL A; 2W54 A; 2WWZ A; 2O6V B; 2M4N A; 2GOW A; 3DPD A; 4DQO C; 2UWQ A; 2BYE A; 4HDQ A; 3DBH B; 2LGX A; 1KFY B; 5CX3 A; 1TS2 A; 4P16 A; 4BKG A; 3VTV A; 4C80 A; 1K51 A; 3GZN B; 1BXT A; 1WJU A; 2GBJ A; 2KC1 A; 4ANW A; 4IWP A; 4OVZ A; 1WM2 A; 1D5M C; 4ITK A; 3HUI A; 3RNE C; 5AZF A; 1L6U A; 5AEK B; 1UBI A; 4IWQ A; 3AE4 B; 2WDV B; 3Q8B A; 2J0J A; 1ESF A; 5CHV C; 3W5V B; 3L4P A; 4OHJ A; 3H7P A; 1GUA B; 1XD3 B; 2M56 B; 2NVU I; 5E6P A; 4YL8 A; 3N9Y C; 4KZC A; 1WJ6 A; 2D3B A; 2JPH A; 1PFD A; 1E90 A; 4NPN A; 2LGS A; 4P6V F; 4BKT A; 4B95 A; 3DBS A; 1WJN A; 4DHZ E; 3NJT A; 4UDU C; 4I6N B; 1WGY A; 4WQM A; 2ZVO A; 4MJS B; 5CHF A; 3PLV A; 4BKS D; 3HRD D; 1C9F A; 5HI1 A; 4A8X C; 2RPQ A; 1GC7 A; 1V2Y A; 2L32 A; 2PEA A; 2KHW B; 4XZ4 A; 4NQL B; 4ZYS A; 3WAO A; 3HVD A; 3OAW A; 3NY5 A; 2JZ3 B; 2V4L A; 1JWA D; 3HIZ A; 1VZ7 A; 4J6I A; 3W2D A; 1JRP A; 2AL6 A; 3BVM A; 1JWS D; 3BZD B; 3QK0 A; 1L0X B; 3LB8 C; 4JQW C; 3KLS X; 1R4M I; 3L13 A; 2IJ0 A; 1WGR A; 3AE6 B; 2LGI A; 2M0X A; 2KAJ A; 1V1P A; 1NYQ A; 1VCB A; 3MC8 A; 1MI0 A; 4FAD A; 2MJ3 A; 1QT9 A; 1SBB B; 1TZO A; 3TEX A; 3L17 A; 4EOY A; 4TQ1 A; 4KSL C; 2N9L A; 2BB6 A; 4W9D A; 2OJR A; 1GB4 A; 2JRI B; 1UEL A; 2KMC A; 2GMI C; 3ZUN A; 1MJD A; 2KQ7 A; 3ML8 A; 3K9O B; 4YXD B; 4RF0 A; 4GDL B; 1UBQ A; 2PLP A; 3FIL B; 1KLV A; 4FBJ B; 2LXA A; 3K9P B; 1OEY J; 1L0Y B; 1P3Q U; 3NVZ A; 3DBL I; 3O65 B; 4P7I A; 3AMZ A; 4PYZ A; 3VUX A; 4WH4 A; 3ETR A; 4HKZ E; 2KJH B; 3EEC A; 2J4X A; 4ZHP A; 1MVK A; 1RFA A; 3QA8 A; 4FUL A; 3ZLZ A; 5C1Z A; 4HPM B; 4P1B C; 4MH0 E; 2J53 A; 1HA5 A; 1TJE A; 1WXQ A; 4HJK A; 2K8C A; 4WAF A; 3Q3M C; 3R66 C; 1F1H A; 1FNU A; 2KT7 A; 3RFZ B; 1FM0 D; 5FR3 A; 3TBL D; 1U4A A; 2CHW A; 2DYM A; 3PZD A; 4KIK B; 4W9L A; 2WX0 A; 3ZTC A; 3GS2 A; 4M0W B; 2N9E B; 1IYF A; 4LTU A; 4EKU A; 3P1M A; 2V4I B; 2ZCC A; 1EWC A; 4HCP B; 1V49 A; 2KMM A; 3NOB A; 4BOS C; 5FK9 C; 3UIO B; 1KM7 A; 1L4D B; 3E56 A; 4L23 A; 2Y3A A; 3ALB A; 4MM3 A; 1WH3 A; 1PYW D; 3V6E B; 2CKH B; 2A4Z A; 2WU5 B; 1TKG A; 2NBW B; 3R3M A; 3D32 A; 2RMM A; 2KJR A; 2C5L C; 2XK5 A; 3M62 B; 4ANX A; 4OZC A; 1EM7 A; 2IZV B; 3ZJV A; 2WXI A; 3L16 A; 4BAX A; 3LJ3 A; 2XN9 C; 3PHW B; 2KTR B; 1ZGU B; 2BS3 B; 2W55 A; 4MAC A; 4B6W A; 1GPX A; 4XE0 A; 2GB1 A; 2JRH A; 1V9J A; 4A55 A; 1WI0 A; 3AE9 B; 1S1Q B; 2ZEQ A; 1CQV A; 1VRA B; 2WXH A; 5FKA C; 1KF6 B; 2KVR A; 4OW0 A; 1ET9 A; 4KGS A; 5D94 A; 3RNF C; 4AOF A; 4CQN A; 1MG8 A; 3H6N A; 1WWT A; 2CU3 A; 4ZHO A; 1WMH A; 1ROE A; 2OJW A; 4HJG E; 3UIN B; 1WSP A; 1HZ6 A; 3JSV A; 3DWG C; 1WXS A; 2KAN A; 3M63 B; 2PJH A; 3BVG A; 4GDK A; 1ACC A; 3ZW3 A; 2NMQ A; 4MGZ E; 5J18 A; 1WGH A; 4RCO A; 2L76 A; 3A33 B; 1K8R B; 2SAK A; 2JU6 X; 4RGO S; 2EMS A; 3SEB A; 3A9K A; 4KDI C; 2WXQ A; 1FO4 A; 2MQJ A; 1WM3 A; 1RFK A; 3I9V 1; 4BKS A; 3AE5 B; 1QOB A; 4PS3 A; 2IO2 B; 3APC A; 2R2O A; 4FHK A; 2Y5B B; 3B08 A; 1Q5W B; 1C78 A; 4ZRP A; 4BBN F; 2KWC A; 4GGQ A; 1JWM D; 2NCN A; 2V1Y A; 1D6E C; 3BY4 B; 1YN3 A; 5IOI A; 1C79 A; 2CS4 A; 1KOT A; 3VQI A; 3Q6B A; 1J7B A; 1WZ0 A; 4AUQ C; 1I7H A; 4RNA A; 3U2S C; 4N59 A; 1FPY A; 4GB9 A; 2WXO A; 3EFC A; 1WXV A; 3GB1 A; 2EMT A; 2JQR B; 4WUR A; 3P4R B; 3W1S A; 1WE7 A; 3P42 A; 2H88 B; 4TSS A; 3L08 A; 3PGE A; 1KH0 A; 4W9J A; 3UGB B; 2QC8 A; 5EE9 A; 4PS8 A; 2M19 A; 4NQK E; 4K1R B; 1TS5 A; 1DYQ A; 5JHA A; 4MEL A; 1YN5 A; 2XNA C; 4TMA B; 1T0R C; 2N7D A; 3T3N A; 4WWP A; 2RDB C; 2BPS A; 2AYO B; 4K7W A; 4JWS C; 5TSS A; 3SU8 X; 2BS2 B; 4YTP B; 2LWP A; 2MJD A; 1BT0 A; 1BUI C; 4X57 B; 1PQS A; 2TSS A; 1H8C A; 3KWL A; 4FA6 A; 3RNB C; 3GE8 C; 3Q3F A; 3N20 C; 1PGA A; 1Y56 A; 4ZOH C; 4C4V B; 4M01 A; 4WQO B; 2L00 B; 1QOG A; 2MW5 A; 4DDI D; 3PLU A; 4EFO A; 4EZL A; 1WXM A; 2E3T A; 5I4D A; 4GSW A; 2HD5 B; 2KLC A; 1HZ5 A; 1BML C; 1LXD A; 4W9I A; 3AE2 B; 4WJP A; 2DWQ A; 2G3Q B; 2KTF A; 4EUT A; 1XEE A; 4MSQ B; 1L6V A; 4TKN A; 2KFK B; 3A1Q A; 3TSS A; 3ZGZ A; 2K6D B; 3WAN A; 5EDS A; 1ZPS A; 3IHP C; 1TIF A; 1TT5 B; 2KZR A; 4M8N A; 4MT5 A; 4XX5 A; 2OHF A; 3VTW A; 2LJ5 A; 1SF0 A; 2L0F A; 2IGH A; 2HJ1 A; 4ASW C; 3MC9 A; 4NZL B; 4I6L B; 4MJS A; 2FCN A; 3AEB B; 1FXT B; 1FIQ A; 2R61 A; 2DAF A; 2M1M A; 2ZCB A; 3AEF B; 3V6C B; 5BMI A; 2NPT A; 4WJO A; 3I5J C; 1Z5S B; 2WDQ B; 3VRA B; 2ZVN A; 3DBR B; 5E6J A; 1JQ4 A; 2C9W B; 3RNA C; 1I4R A; 1NI3 A; 3P2B A; 1P0R A; 4ANU A; 2JSV X; 2BT6 A; 4FJZ A; 2N9K A; 5C23 A; 1P1A A; 2YEP F; 2IO0 B; 2MP2 B; 1WR6 E; 2K39 A; 1AW7 A; 4HDO A; 1IBX B; 3RZW C; 3W9C B; 4KX6 B; 1GNU A; 2WLB A; 5LNK 1; 2I2Y A; 2RGF A; 5DCN A; 1NDD A; 2Q5W D; 2LVO A; 1UNS A; 3P4P B; 3W1Y A; 2LVQ A; 4IOI E; 3R2T A; 4GDL A; 2FNJ B; 2WGS A; 5IP4 D; 3DBH I; 4NAW B; 4MDK E; 1EU3 A; 2BBC A; 2WXP A; 3H8H A; 3MHS D; 4E71 A; 4RFB A; 4LDT D; 3A9J B; 1V5O A; 4LNN A; 3GZN I; 2IGD A; 1V8C A; 3CWI A; 2KFJ A; 3P4Q B; 1WYG A; 2NTS A; 1TKE A; 2KNB A; 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1F2R I; 4ZDV A; 5AZH A; 2G4D B; 2JZP A; 1QF6 A; 1VZ6 A; 3B0A A; 4A6Q A; 4AWJ A; 4YTM B; 4FXC A; 1SJH D; 1XF5 L; 2GLS A; 2RD0 A; 3AM9 A; 1P9D U; 4XYC A; 2D07 B; 2I1J A; 3H7S A; 3KQ4 A; 3T9L A; 2O6V D; 3APF A; 3MHZ A; 1WX9 A; 3PO0 A; 5DPS A; 2DZK A; 2BS4 B; 4A3O A; 1J19 A; 2MRP A; 5KHO A; 2FIF A; 2MJE A; 1IP9 A; 2QSD A; 2REX A; 3B9J A; 3TCA A; 3IVF A; 1C76 A; 3M95 A; 3HHM A; 4DBG A; 3L54 A; 4URK A; 1SE9 A; 1X1M A; 1M94 A; 2ASQ A; 2WXJ A; 3QC8 B; 1OGW A; 4GN1 A; 1EUV B; 3KW5 B; 1SE2 A; 1Q1O A; 1L2N A; 2D11 A; 2MSE D; 1RAX A; 4GOC A; 5GXG B; 2ZW1 A; 1L4Z B; 1JAL A; 5G2N A; 1TY2 A; 1XLN A; 2GI9 A; 2MA9 B; 1PGB A; 5G5G A; 5L83 A; 5BMG A; 1ZOY B; 1UGJ A; 3TMP B; 1XXG A; 4AP4 C; 3NVV A; 4RMA A; 5JH5 C; 3LYY A; 1V6E A; 2QEJ C; 3A4S C; 1TZ1 A; 2CHZ A; 3H7P B; 1GB1 A; 3UF8 A; 3FC4 A; 1VZ8 A; 1QOA A; 3EC8 A; 3ABV B; 4US8 A; 4R3D A; 1RYJ A; 2BYF A; 3U30 A; 1JWU D; 3HK0 A; 4LCD E; 2V3P A; 3MFG A; 3PPA A; 2N4F A; 2J42 A; 2K8B A; 1CZP A; 3AN1 A; 5H92 C; 2O2V A; 4YWG G; 1NEK B; 4NNJ B; 4ZRK A; 4AJW A; 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