The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
15
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sequence length |
56
|
structure length |
56
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Chain Sequence |
MQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWCYDDATKTFTVTE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Immune system
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| source organism |
Streptococcus sp. group g
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| publication title |
Rotameric preferences of a protein spin label at edge-strand beta-sheet sites.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Immunoglobulin G-binding protein G
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| total genus |
15
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-05-22 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Roll | Ubiquitin-like (UB roll) | Ubiquitin-like (UB roll) |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1P7F A; 2GI9 A; 1D4B A; 2KWD A; 5HHD G; 1MHX A; 1GB1 A; 1Q10 A; 2EEL A; 2KDM A; 1FCL A; 1QKZ A; 2N9K A; 2QMT A; 2LHD A; 2RMM A; 5HFY A; 4MAC A; 2PTL A; 1IBX A; 5BMG A; 4OZB A; 1PGB A; 1XCQ L; 2QSD A; 4HKZ E; 2KAC A; 2JWU A; 4WH4 A; 2LHE A; 1FD6 A; 2JXT A; 2ONQ A; 5JXV A; 2GB1 A; 1FCC C; 2N7J A; 1IGD A; 4IKG A; 1UWX A; 2PLP A; 1HZ5 A; 1K50 A; 2ZW1 A; 1YMH E; 2PW9 A; 1ZXH A; 3MP9 A; 2IGH A; 3FIL A; 2I2Y A; 4OZA A; 2IGD A; 4D2K A; 2LGI A; 1PGA A; 2OED A; 2J53 A; 2ON8 A; 2RPV A; 2ZW0 A; 2KN4 A; 4KGR A; 3UI3 A; 1MHH E; 1YNT E; 1P7E A; 3GB1 A; 4KGT A; 1F2R I; 1K51 A; 2I38 A; 1HZ6 A; 2JU6 X; 1XCT L; 1MI0 A; 1MPE A; 3V3X A; 1F2R C; 1K52 A; 2IGG A; 5BMI A; 2J52 A; 4HJG E; 4OZC A; 1IBX B; 2K0P A; 1IGC A; 5BMH A; 3FIL B; 1XF5 L; 1K53 A; 1EM7 A; 2KQ4 X; 1PGX A; 1MVK A; 2JSV X; 1HEZ E; 1KH0 A; 4GLS C; 1C9F A; 5HG2 A; 5HI1 A; 2LUM A; 2JZP A; 2N9L A; 1GB4 A; 1JML A; 4IOI E; 2NMQ A; 4KGS A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2KN5 A; 4EZK A; 2FAZ A; 4A6Q A; 2KDE B; 1UGJ A; 2LWP A; 2YEP F; 5H92 C; 2B3A A; 2KX3 A; 1E90 A; 4YSY B; 4IM3 A; 3TCA A; 5AUI A; 1WJN A; 5G55 A; 3C19 A; 1SE2 A; 5KHQ A; 5CX3 A; 1WX7 A; 1V86 A; 2BPS A; 3T8M A; 1GUA B; 1E7P B; 1JCK B; 3L4P A; 3H7S A; 2AQ2 B; 1NI3 A; 3KWL A; 1HQR D; 2JWU A; 4US9 A; 1U4A A; 5AZH A; 2LMC A; 4C4V B; 2JQR B; 1QOF A; 1RFA A; 2JXT A; 2H89 B; 2DLB A; 4XC2 A; 2FCQ A; 3ZVV A; 1ZKH A; 2AYO B; 2DWQ A; 2KVR A; 3AU5 A; 2DYB A; 2YLM A; 2MBB B; 1TKG A; 3VDZ A; 4BBN F; 1SB3 C; 2KOX A; 4HKQ A; 1RYJ A; 4BBN C; 3M63 B; 2WXF A; 3QAQ A; 2MQJ A; 2DX5 B; 3BZD B; 3K9P B; 1VZ8 A; 2KTR B; 1PDX A; 4KDL B; 2WX0 A; 4MGK E; 4GGQ A; 3L10 B; 3PRZ A; 4GDL B; 4LDT D; 1IUE A; 2M19 A; 1KRH A; 1JWU D; 3PZ7 A; 2KC1 A; 1Q5W B; 4LLG M; 3ABV B; 3NZU A; 2R2O A; 1FFU A; 2QIE B; 2WU5 B; 1ESF A; 1L2N A; 1IGC A; 5BMH A; 4ZOH C; 4HDQ A; 1SIJ A; 1I7H A; 1SJH D; 1HEZ E; 4II2 B; 2M1M A; 4GU2 A; 2CKH B; 2KMM A; 2LVO A; 1WY8 A; 1WWT A; 3WAO A; 4LK0 M; 4TSS A; 1XLO A; 3L17 A; 3M3J A; 3AE3 B; 4BAX A; 3TEY A; 4BKS A; 4A3O A; 2BTE A; 1JQ4 A; 4WWN A; 3DVN U; 3NS8 A; 2RMM A; 1OGW A; 1GG3 A; 4OHJ A; 2KKC A; 3ZUN A; 3CMM B; 1TKE A; 4HKZ E; 4F1S A; 4A9A A; 1UBQ A; 1SE4 A; 2PPH A; 2IO1 B; 4DXF A; 5JXV A; 3WAP A; 1FCC C; 4WIP A; 1JWB D; 1WGY A; 2C60 A; 2RR9 A; 2FUG 1; 3ZNH B; 3PZ8 A; 2MEK A; 5L95 C; 3W5V B; 2XK5 A; 3APD A; 3QK0 A; 4NQK E; 3LDZ E; 3OJ4 B; 1YJI A; 4NAW A; 1V81 A; 2L00 B; 2KFJ A; 2D3A A; 3C0R B; 3L16 A; 3HVD A; 2KFK A; 4C56 C; 2LJI A; 2RPV A; 2KJ6 A; 4W9F A; 1TS2 A; 4M0W B; 1WM3 A; 3GB1 A; 5C2T B; 1FNW A; 1T6B X; 4IW0 A; 1DOI A; 3C8Y A; 2W3R A; 5T8I A; 3FKY A; 1BXT A; 1EWY C; 3NRZ A; 1WJU A; 2WLB A; 1N5W A; 3PRP B; 2RD0 A; 3O65 B; 1WRD B; 1ZDV A; 4PYU A; 1V1P A; 3AEA B; 3VUW A; 1BML C; 4RCO A; 2Z8L A; 2D3B A; 4FN2 A; 5HG2 A; 2L8J A; 2E3T A; 2N9L A; 3T3N A; 4FJY A; 1QQR A; 4RMA A; 3VHT C; 1V8C A; 2KWV B; 3M62 B; 4USA A; 3P2B A; 3OAW A; 1GB1 A; 2IYD B; 2EEL A; 4AOF A; 2A4Z A; 3DWG C; 1ZXI A; 3EFU A; 4HDO A; 1X1M A; 1ZPS A; 1YJ1 A; 2RSU A; 1YOV B; 2KFK B; 3VR9 B; 1TZO A; 4IM0 A; 5IA7 A; 1E6E B; 1LFD A; 3J9C A; 1FM0 D; 2QIL A; 2WWZ A; 4LNF A; 3Q69 A; 4FUL A; 2LGX A; 3VTV A; 1IGD A; 3ML9 A; 4TQ0 A; 1UWX A; 1YQ4 B; 4ICV A; 5J17 A; 3ZIM A; 2M0A A; 3FIL A; 1V1P B; 4OZA A; 2KMC A; 2N9P C; 3AE6 B; 1V49 A; 2ZW0 A; 1WX8 A; 4QAY A; 1N63 A; 5AUK A; 1F77 A; 2LI5 A; 1FPY A; 3PT2 B; 3UGB B; 4A3P A; 3QX1 A; 2L83 A; 4AUQ C; 2LXC A; 4RF1 A; 3X23 A; 1MPE A; 2R61 A; 4RNA A; 3DVN V; 4FAD A; 3W1S C; 3VAW A; 3RFZ B; 5J2R A; 2HD5 B; 3Q8E A; 3R8B A; 1CMX B; 2MBQ A; 3UIO B; 4EFO A; 3Q2A C; 2KDB A; 1SE3 A; 1K53 A; 2KQ4 X; 3ZDM C; 4ZYN A; 2JSV X; 3SD5 A; 1V1O A; 4NJC A; 1EWC A; 1WE6 A; 2SAK A; 3R2I A; 1T5X D; 1WMH B; 4S17 A; 2W55 A; 3RCZ A; 1LO5 D; 4HCN B; 3EGR A; 3HUI A; 3V61 A; 1D4B A; 4W9H A; 2WGS A; 4MDK E; 1CJE A; 2K8C A; 2WXQ A; 1FNU A; 2N9K A; 1QOB A; 4MH8 A; 2L76 A; 3DVG Y; 2O2V B; 4L1B A; 5BMG A; 1GC6 A; 2K1F A; 3EFC A; 3R7R A; 1KLV A; 1E7V A; 2CJO A; 2LAS A; 3DHG C; 4OVZ A; 4EEW A; 4LNN A; 3TIX A; 2LRW A; 1J19 A; 1R4M I; 4EKU A; 4GMV A; 4W9K A; 4IKG A; 3TEX A; 3H6N A; 3VH4 B; 4M00 A; 3RUI B; 2D2Q A; 1K50 A; 3NVV A; 4HK2 A; 4K81 A; 1C3T A; 3MP9 A; 1JRP A; 4K1R B; 2KAJ A; 2LJ5 A; 1R4M B; 4MJS B; 4D2K A; 5LXH A; 1VZ6 A; 1YQB A; 1T3Q A; 4AWJ A; 4RGM A; 3AXC A; 2G1E A; 3I57 A; 4L23 A; 2QJL A; 3CWI A; 3PTF C; 3VRA B; 2I38 A; 3S2A A; 4CYE A; 4W9I A; 4HXD A; 2RDG A; 1XLN A; 2WXK A; 5DPT A; 1WIA A; 1JRO A; 1FEH A; 3MC0 B; 3Q14 C; 1I4R A; 1Q0W B; 3B1L X; 2IPK D; 4KDI C; 2RPQ A; 2LRU A; 2O6V B; 1Y8R C; 2LEK A; 5GMV A; 4PS3 A; 1AWD A; 3N1X C; 4MEL A; 4FA6 A; 4GXB A; 2WXJ A; 3B0A A; 1IP9 A; 2V1Y A; 4W9C A; 4P1C C; 2BKF A; 3EC8 A; 5IOI A; 2V3N A; 3RPF C; 3RYT A; 2NMQ A; 2VZK B; 4YSX B; 1LQB A; 3TUO A; 2Z0D B; 4A90 A; 2IBI B; 2KDI A; 2JRH A; 2IY0 B; 3MC9 A; 4EOY A; 2BYT A; 1WZ0 A; 1FCL A; 1T0Y A; 4LTU A; 3OWE B; 5IO9 A; 4WJP A; 1KLU D; 4YXD B; 2L0F A; 2DYM A; 4XZ4 A; 3V6C B; 4B0E A; 4A20 A; 1P0R A; 2DZK A; 2FCM A; 5BYR A; 4B95 A; 3BYT B; 1JWA D; 1D5Z C; 3TBL D; 1I4Q A; 4EZJ A; 3V62 A; 3ZTC A; 2OHF A; 2PLP A; 1I42 A; 3BVM A; 2NS5 A; 4XWT A; 2C9W B; 3AEC B; 3NG0 A; 4ZRI A; 3Q3N C; 1Z5S B; 3IXS A; 1S1Q B; 2FUH B; 2IGD A; 2VH2 A; 5IKC M; 3KQ4 A; 3VH3 B; 2LFI A; 3K9O B; 3ZXR A; 4KGR A; 4LCD E; 3UI3 A; 2DAJ A; 1MHH E; 3ZDT A; 1L6V A; 3A4R A; 5AZG A; 1I4H A; 3PRM B; 4AJY B; 1MI0 A; 2ZNV B; 3BY4 B; 3CSF A; 1E8Y A; 2YVC A; 3I3T B; 1SJE D; 5C3J B; 4WQM A; 5EE9 A; 2C7H A; 3N20 C; 1OFF A; 3HHM A; 1WR6 E; 2IO3 B; 2K3U A; 1NBF C; 4C4V A; 4P16 A; 2JZP A; 2IND C; 5LXI B; 4R3D A; 2ZVN A; 2FIF A; 2EKI A; 2L05 A; 2WXO A; 5HFY A; 3L08 A; 3UQA A; 3HM3 A; 1IBX A; 4WJQ A; 1QOA A; 1TY2 A; 4WQO B; 3CST A; 3AEG B; 1UZX B; 4XWW A; 3APF A; 3MC8 A; 2N9E B; 4GDL A; 2BQQ A; 3DHH C; 5E6P A; 4PK1 A; 3ZGZ A; 2MP2 A; 2WXI A; 2GB1 A; 4MH0 E; 3SHQ A; 1E8X A; 1YN5 A; 2LD9 A; 3HIZ A; 5D2M B; 3LB8 C; 3I9V 1; 2WXN A; 1F52 A; 2N0S B; 3A9J B; 1HTO A; 1GJZ A; 1B9R A; 2G4D B; 4LNK A; 2HTH A; 3AM9 A; 3ZNZ B; 3VUY A; 3AEF B; 2BYV E; 4LJO B; 5CHF A; 1WXM A; 4KSK C; 2WU2 B; 1WGK A; 3WAM A; 4CHK A; 3TEZ A; 2RGF A; 2M0X A; 1L7Y A; 2BT6 A; 3ZYY X; 1HZ6 A; 3A9K B; 1FRD A; 2LGD A; 2LVQ A; 4C7Y A; 2GBR A; 4MSQ B; 3IAS 1; 2PE9 A; 3KUZ A; 2MCN B; 3V3X A; 1F0Z A; 2JX5 A; 4II3 B; 1VR9 A; 1IBX B; 2K0P A; 1R4N I; 1T0S C; 3V60 A; 2HTM E; 1KH0 A; 3DCG A; 2MP2 B; 1E0Z A; 4RGT A; 1H4R A; 1ZOY B; 1N60 A; 4KGS A; 3WAL A; 1IPG A; 1FXI A; 2ICI A; 5LNK 1; 1KTK A; 1R4N B; 5I4D A; 2AQ1 B; 4NNJ B; 2Z59 B; 2D3G A; 5TSS A; 3IG3 A; 4ZDV A; 4MSM B; 2KQS A; 2BS4 B; 4CQN A; 1HA5 A; 3R7Q A; 2JVC A; 2W82 A; 3JSV B; 4M0W A; 3Q3F A; 3ZTD A; 4BKS D; 4ICU A; 4AJW A; 3AB5 A; 5CHW A; 2PE6 B; 4JPS A; 3AE8 B; 2JZ3 B; 3AE4 B; 5JHB A; 4WAA A; 2YEP B; 2Y5C A; 4ZHP A; 1WH3 A; 4HPP A; 2INP E; 3NOB A; 3H8H A; 5MPO A; 2DNF A; 2WYQ A; 1V80 A; 1RFK A; 2BYE A; 2CHX A; 3AED B; 4MGY E; 1YN3 A; 4NQL B; 3AU4 A; 3TEW A; 4HLE A; 4HWI B; 4W9G A; 1N62 A; 1Q1O A; 2QHO A; 1YX6 B; 1MG4 A; 1LM8 B; 2CHZ A; 1WYG A; 2KTF A; 2E6X A; 2MLB A; 1J7A A; 2IGG A; 3QIJ A; 4BFR A; 4HJG E; 2C7M B; 3Q8B A; 5BYQ A; 3QQ8 B; 1WR1 A; 3T9L A; 3BK1 A; 1NYQ A; 4WJN A; 1EM7 A; 2K8H A; 5KHO A; 2LXA A; 2J42 A; 3A1Q B; 3GZN I; 5EE1 A; 3TJP A; 2V9H A; 1I4P A; 3DOW A; 4HCP B; 1HTQ A; 2LUM A; 3OLM D; 4W9L A; 3RN9 C; 2CU1 A; 4YTP B; 1E8W A; 1MHX A; 3GZN B; 5D7G A; 4ZRJ A; 2KDM A; 2BS2 B; 4W9J A; 1P9D U; 2J7Q B; 4K3C A; 1BT0 A; 3DHI C; 2FCS A; 4OZB A; 3RNB C; 3DVG X; 3R3M A; 3QC8 B; 4FHJ A; 5DCN A; 3TMP B; 1C78 A; 1C4A A; 2K25 A; 3O13 A; 4M01 A; 1MJD A; 3NJT A; 3H9D A; 4C7Z A; 1FMA D; 2V3P A; 4HEA 1; 1C1Y B; 4P1B C; 3B9J A; 3MJW A; 2BBC A; 2WXR A; 3ZJT A; 2OOB B; 1D5X C; 2ZW1 A; 5FR3 A; 2IGH A; 3SFD B; 1E7U A; 2K22 A; 5JHA A; 1J7B A; 4Q2J A; 4HRS A; 1JWM D; 2KD0 A; 2ZJD A; 4XYC A; 2DZJ A; 2ON8 A; 1WXS A; 3PO0 A; 2KHW B; 1CQV A; 1WMH A; 5CTR C; 2NBV B; 3SEB A; 3P4P B; 1MG8 A; 3UIN B; 4DDG D; 1NEN B; 2Y5P A; 2NTT A; 2FID A; 5BYS A; 2KWU B; 2MBO A; 3UQB A; 4REZ A; 2AX5 A; 4IC7 B; 1RWS A; 2O2V A; 2W9N A; 4P6V F; 4DXA B; 3PV1 A; 1L6U A; 1EU4 A; 2K8B A; 1KOT A; 2IY1 B; 1L4D B; 1XF5 L; 4GN1 A; 4XGA B; 1XQQ A; 1ET9 A; 2ZZP B; 4ZHO A; 2MW5 A; 3QJZ A; 5DPR A; 2KXJ A; 2D10 A; 4IUM B; 2WDV B; 4BKG A; 2BGF A; 4NJ6 A; 3VTW A; 3ZLZ A; 2SEB D; 4RF0 A; 1Q10 A; 5G5G A; 2Z0E B; 4MJS A; 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5EE0 A; 4MM3 B; 5FK9 C; 2KVZ A; 2XNA C; 2MHJ A; 3DBL B; 3DBR I; 3RZW C; 2QCZ A; 3RNF C; 3GOE A; 2D5G A; 3P4R B; 4BOS C; 2M4N A; 1IYF A; 4DHJ B; 2MWS B; 4FBJ B; 2DZM A; 3A33 B; 1P1A A; 2N9X A; 2ZCB A; 4OW0 A; 2JXX A; 5D6J B; 4J6I A; 3DBR B; 3ZNG C; 3RZF A; 1FNV A; 2INC C; 2XBB C; 3FAH A; 5CHV C; 4O1N A; 4YTN B; 3Q3J A; 1CK1 A; 2ZVO A; 3Q8C A; 2JF5 A; 4KZ0 A; 3APC A; 4ANV A; 3ZQ4 A; 4DWF A; 3ZW3 A; 3QCA A; 4RM9 A; 3AMZ A; 3RMK C; 4NZL B; 3N1Y C; 1D3Z A; 1MFW A; 4FJV B; 5IP4 D; 2V3S A; 4AP4 C; 2KQ7 A; 1AYF A; 1WJ4 A; 3N1Z C; 3JYU A; 1SE9 A; 3MJ5 A; 4HVB A; 1WYW B; 4N6E B; 4YWG G; 1TJE A; 2AQ3 B; 2JT4 B; 2PMV A; 1P7F A; 1YJJ A; 4M8M A; 4URK A; 3A9J A; 4K3B A; 4TKN A; 5D3I B; 5HHD G; 2KX0 A; 4ITK A; 1WXV A; 2N1W A; 2AL6 A; 1WGR A; 3R66 C; 2LHD A; 1WRI A; 4LNO A; 1UEL A; 4DK5 A; 3KUD B; 4N9F 4; 2OJR A; 5H8Y E; 1ZUD 2; 1QF6 A; 2MBE A; 3WAN A; 4GDK B; 3A9K A; 3Q8A A; 2N7J A; 4YT0 B; 4KV2 A; 2WXP A; 1B1Z A; 4ZRP A; 2KT7 A; 3IBE A; 2KLC A; 3PHW B; 1TGZ B; 2V4L A; 1KJT A; 3ZRF A; 2BWF A; 2MH7 A; 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