5BN8A

Crystal structure of nucleotide-free human hsp70 nbd.
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 127
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bn8A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn8A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bn8A04
1SAZA 2F9WA 1YUWA 3BP8A 5AQNA 1XC3A 3EZWA 5E84A 4IJAA 4K25A 4FPAA 3FZKA 1RFQA 3VF6A 1X3MA 3A5LC 3A0IX 5BPMA 1NM1A 3U9DA 4PKIA 5AZJA 3VOVA 4BRHA 1MWKA 3CJ1A 1HKBA 3LDLA 1BOTO 3AAPA 3ULEA 3ATVA 2HF3A 1OKJA 2CGJA 4CJ7A 4AM6A 4RCHA 1ZC6A 3ZETA 4F9OA 3MK6A 3H1VX 2ZF5O 3KZBA 1QHAA 2E2PA 3WT0A 1IJJA 4H5NA 1NMDA 3UE5A 4XEIA 2A5XA 3MN5A 4FWQA 4XH1A 3EN9A 3O6WA 4ISFA 1EQYA 3O80A 4XH4A 3QB0A 3WEEB 4BVOA 4E1JA 2P9NB 2GTDA 3WXJA 5AQHA 1WOQA 3GDQA 1NGFA 1R59O 2E2QA 3HZ6A 2V7ZA 4WQ4A 4CBWA 5AQPA 4CZIA 2GELA 2QW9A 1KAYA 5B8HA 4B1ZA 5ADXA 1HLUA 1NBWA 3QDKA 1ATSA 3UKRB 3CIPA 3G25A 2FSJA 4A61A 4M7YA 2A6AA 1NWKA 3DXMB 3BF3A 2P9UA 3O5BA 4FWKA 3LDNA 4K42A 4H0PA 4BREA 5AQFA 4JHDA 2AP1A 4B1WB 3M3ZA 3ID8A 5AQIA 1V4SA 3HTVA 2E88A 3QFUA 1T6CA 1TUYA 4M7XA 3GBTA 5KQDA 2NRHA 4YDUA 2A42A 4PL8A 3A5OC 2GEMA 2CGLA 4BROA 2CGKA 2GWJA 2Q0UA 2KHOA 4FOIA 2QWLA 5E26A 3CJ7A 5AZJB 4CD1A 3H3OB 1BDGA 3WQUA 1GLEG 1IG8A 2CH5A 3CJAA 2PAVA 3VEVA 2P9PA 1GLJO 1GLLO 3UB5A 4BC4A 1RDWX 3DXKA 2D0PA 1P8ZA 2BUPA 5AQZA 1YXQA 3HBTA 3HM8A 5KPZA 3WXLA 4JD2A 1BU6O 5JLHA 2E20A 3ZX3A 2J4RA 4IXCA 2W41A 2YCHA 2YHXA 4B1XB 2UYTA 2I7NA 3O08A 3EKSA 3CETA 3VEYA 3LL3A 2QM1A 1ESVA 3UKUA 5AQLA 3AAQA 4IO8A 2FLOA 2VWBA 4MLEA 1C0FA 2AA4A 2P9LA 2E2NA 2ZWHA 3A8YA 2D4WA 4A62A 1X3NA 4B1UB 4BRFA 3QICA 1TUUA 1QZ6A 3FGUA 3FZFA 5FPDA 4FWLA 3BEXA 4FOEA 5AQOA 4WQ4C 2W40A 4BRKA 4GY2B 3QBWA 3IMXA 3VERA 5AQRA 5AFUA 1KAZA 1C0GA 3W3DA 4FPBA 4RWTA 1RGIA 4HWIA 4EIAA 5JMVA 5ELZA 1S3XA 1NGCA 5FPNA 5BN9A 3LDOA 3HI0A 3R6MA 4JNEA 1QQNA 5AQSA 4O5FA 3MDQA 3QMLA 2P9UB 2P9SB 3WXKA 2FSKA 3FZMA 1KAXA 5EY4A 4DB3A 1U6ZA 1GLAG 3ATUA 5AQVA 3FE1A 3IFRA 3S41A 2NLXA 3LM9A 3SK3A 5LJVA 3VPZA 2QXLA 1BO5O 2BTFA 3RSEA 4DCHA 3VESA 3U9ZA 4KBOA 3EO3A 2IVNA 1BA1A 1BA0A 4B9QA 1E4FT 4BR2A 1CZAN 2A41A 1TYQA 4H0XB 3D2EA 3VGKA 1U2VA 3FZLA 3O4WA 4YDUC 4FWPA 3MN7A 4BC2A 2PBDA 4CZLA 1SQKA 3TPQA 4CZMA 3VEXA 3O1WA 4BQZA 3WXIA 4QS9A 3L6QA 1Q18A 4QS8A 3D2FA 4CZFA 4H0VB 2P9KB 1HPMA 1NGIA 2E2OA 2P9PB 3M6GA 1HJOA 3DXKB 5EX5A 3SMPA 2D1KA 3O1BA 5AQJA 3O8MA 4H03B 3H1QA 4BRNA 4BG9A 3DWLA 3SMSA 4CBXA 5EVZA 4JD2B 4JAXA 5BRFA 1HKCA 1MWMA 4ISGA 3H6EA 3ZX2A 4CZGA 5LY3A 3BF1A 5I9EB 2Q36A 3ZX0A 1K8KB 3GOIA 1J6ZA 3W0LA 5AQTA 3C7NB 3IUCA 4H5VA 3A5NC 4PL7A 5BN8A 3VF4A 2F9TA 1QZ5A 2FF6A 3M1FA 5F1XA 1WUAA 1V4TA 2VYPA 2IVPA 4H5WA 4BGBA 4BRGA 4MO5A 1DKGD 3H46O 2YJEA 4RTFD 3U4LA 4BRLA 2V7YA 4BRQA 4MLHA 1NGHA 3VEOA 2VCPA 2GUPA 2FSNA 5BPNA 3U8XA 5AQUA 2FF3B 2A40A 3FFKB 2ASPA 2E1YA 5KPTA 3J8AA 4PKHA 5AR0A 4LC9B 4WQ5C 3L0QA 5AZIA 4NB4A 3ULEB 2YI1A 3CJ9A 3TU5A 3GG4A 3WQTA 4DHYA 3RSEB 4QS7A 3CJBA 3ZETB 1GLDG 1ATRA 4XH5A 1S22A 1TYQB 3D2EB 4BRIA 3VETA 2FXUA 3FR0A 1YVNA 4FWNA 3B8AX 4A2BA 1E4GT 3CJCA 1MDUB 1DGKN 3H45C 4AM7A 1NLVA 2CH6A 4B1YB 2ASMA 1NGJA 4JN4A 3I8BA 4I6MA 4CI6A 3EKUA 3D7EO 2QWPA 3VEZA 2YHWA 5JLFA 3VENA 1XQSC 1NGBA 1HKGA 3CQYA 1LOTB 4CZHA 4PKGA 2IIRA 4CZEA 1ZXOA 3ENHA 3VGMA 3MN9A 5JICA 1ATNA 1MA9B 5BPLA 1T6DA 3IDHA 4IJNA 1D4XA 4FWMA 2ITMA 4L3QA 2ASOA 4K41A 2Q0RA 4EHTA 2P9IA 3DXMA 5AQGA 2A3ZA 3FLCO 4WQ5A 2IVOA 1JCFA 4JHDB 5AQYA 3CERA 1Z05A 2HF4A 1T44A 3LM2A 2V52B 4H5RA 1NGEA 4BRCA 4ISEA 5BRDA 1GLBG 1NGGA 1ZBSA 5KPRA 4FSVA 1BWFO 4BG8A 1Z6RA 2HMPA 4BRMA 3FZHA 5F2RA 3VF2A 4BR4A 4H0TB 4BR7A 2QWNA 1KXPA 2WUSA 4C23A 4EHUA 2Q2RA 4M63C 5AZIB 3HSCA 1NGDA 1LCUA 4Y0WA 4BC3A 4NO7A 5BRHA 3MCPA 3KVGA 3VGLA 3F9MA 3ZEUA 3JXUA 1XUPO 2D0OA 4J8FA 4EAHD 1G99A 4O8KA 3MN6A 3C0BA 5ADXH 5AQXA 1QQMA 1H1VA 1YAGA 2YHYA 3SLCA 2I7PA 3LDQA 3UKUB 1BG3A 2Q1NA 2E1ZA 3SJHA 4I6MB 4A2AA 5AQMA 4CZJA 3DJCA 2QWRA 2P9LB 4H0YB 1JCGA 1HUXA 4BR9A 5BR9A 3JS6A 4IZ9A 3AY9A 5AQWA 3GL1A 3BUZB 4Z94A 2V51B 3EL2A 4BGAA 2OANA 3L4IA 4CBUA 5AQQA 5AQKA 4BVPA 5F0XA 4MO4A 3I33A 2P9IB 4EFHA 3ENOA 5CE3A 1NGAA 1HX1A 2P9SA 3CI5A 2QWOA 2YJFA 1SZ2A 3P4IA 3VEWA 4WYBA 4GNIA 4FWRA 4DQ8A 2H3GX 5LJWA 2E8AA 4FWSA 4BQLA 1U2VB 4BRPA 2NZTA 2EWSA 2ZGZA 4CZKA 2QWMA 2Q31A 3R9PA 5KQ8A 2GWKA 5BREA 5FPEA 3R8EA 3KHYA 4IWVA 3D2FB 3AARA 2P9KA 3WEEA 4H0OA 3CQXA 3WUHA 4HTLA 2P9NA 2Q97A 4BR5A 1GLFO 4FO0A 4BR0A 4H5TA 4K43A 5EOYA 4BRAA 3DAWA 4FL9A 1GLCG 1X9JA 3MMVA 2ZGYA 3A5MC 3ZEUB 3CHWA 5EXWA 1JCEA 3H3NO 1DEJA 4B1VA 2QWQA 5FPMA 2HOEA 4FWOA 2DPNA 3OHRA 3UKRA 4BRDA 1K8KA 5AFUH 5TKYA 3QFPA 3C7NA 3LDPA 1Y64A 3GE1A 1BUPA 1QQOA 4CD3A 4BC5A 3QBXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VQBA 1LQIA 3OS2A 3J80O 2UUAK 3MXJA 4DR6K 3EZWA 4E3SA 4K25A 3KOYA 3FZKA 3MAQA 3AA5X 3NF8A 5C2DA 4ELVA 3A5LC 4PUOA 1NRAA 1M90O 1NM1A 2DY4A 3LP1A 4BRHA 4CEOA 5HL7L 1ICAA 3ULEA 4ZTFA 2P1JA 4DV7K 4CJ7A 4AM6A 4LSLA 3CM5A 4O8UA 4YOUA 3AVAA 3MK6A 3TSQA 1VSLA 3SAGA 2Z1IA 4OO1J 1QHAA 2GMOA 3R1XA 4H5NA 3L8BA 1BHLA 2A5XA 3U3GA 4FWQA 1W7AA 3DMJA 3EN9A 4CERA 1EQYA 1TAUA 1ZVEA 3QEPA 4E1JA 1U48A 2P9NB 2GTDA 3WXJA 3BGRA 4YOTA 4YOYA 3TTCA 4LF7K 3V9UA 1O13A 1VQON 3LP3A 2LSNA 1LWFA 1IKXA 2HHUA 1HLUA 1WMTA 4LF9K 2DTUA 1NBWA 1TV6A 3LP2A 3UKRB 2OA8A 4CFCA 2UU9K 4IFEA 5KGWA 3SUOA 2LN8A 5CY0A 2OZSA 2FBXA 1NE5A 3AVCA 3ID8A 4FVUA 4ILGB 3M8SA 4IG3A 2E88A 1RT7A 1TL3A 2HBMA 1T6CA 1TUYA 4M7XA 4YNQA 2B5JA 4CIEA 4CW7B 3CQ8A 2GX9A 2OZMA 4PL8A 4AH9A 4FJJA 2GEMA 3VQEA 4B9UA 4DV2K 4M3UA 2Q0UA 1VQ9N 4JI3K 1Q7YO 4FK2A 4A5BA 2VGMA 2YHBA 4N5SA 4ELUA 1BDGA 5FRMA 3V1QA 3VA3A 4J2DA 2O8DB 3E9PA 4BECA 3CJAA 2PAVA 3VQ6A 3OJUA 1SL1A 4E19A 5AQZA 2EX3A 1JLGA 1RBSA 2UYTA 3O08A 3ZCMA 3E9OA 4J2AA 3CETA 3VEYA 3LL3A 2QM1A 3SV3A 2EHGA 1ESVA 3JYTA 4FVMA 5LMNK 4G9ZA 4JLHA 3PIOL 3AAQA 4IBNA 3NBPA 4IFVA 2P9LA 2E2NA 3DLHA 4AHSA 3QNOA 4ICLA 1Z25A 1X3NA 4B1UB 3QICA 1QZ6A 4FWLA 3BEXA 4N76A 4LFCK 4DUYK 4GY2B 1NU0A 3J7YP 3HJFA 1C55A 1RGIA 4HWIA 4JKGB 1J53A 3THXB 2HBKA 3HI0A 3K9JA 5AQSA 4Q5VA 3OYHA 3WXKA 3AO3A 5A2QO 4DTJA 1KAXA 5EY4A 1W9HA 1U6ZA 3IFRA 3MWPA 4NXMK 2NLXA 3LM9A 3VPZA 2QXLA 4CEBA 2IVNA 4J2BA 4AF1A 3DRSA 1S9EA 3KJVA 1OZZA 1T05A 4BR2A 4CF8A 1TYQA 4H0XB 1YHQN 3NGYA 4CE9A 3O4WA 4BC2A 3MN7A 2PBDA 1SQKA 3TPQA 3KLIA 4X66K 3O1WA 4BQZA 3WXIA 3SNNA 2D56A 3SPZA 3LALA 4QS9A 3ZSWA 1Q18A 4GVEA 4CZFA 5C12A 1HPMA 3KTQA 4OLBA 1NGIA 4NYNA 2P9PB 1HJOA 4DS5A 3DXKB 4NYFA 2LKBA 2D1KA 3O1BA 4H03B 3SMPA 4KHSA 4BRNA 1X9SA 2G8FA 4BG9A 3AA2A 1ZBFA 1VSIA 2ETJA 4BE1A 1SUQA 4CZGA 1POIA 5I9EB 1B92A 1VSDA 3ZX0A 1K8KB 1TGOA 3C7NB 1OVYA 4CECA 2KLAA 4H5VA 3D6RA 4CCHA 5BN8A 4CEFA 1CZBA 1WUAA 4C8OA 1JXCA 1HYVA 5BR8K 4FZXC 1ITGA 2GL1A 3O9UA 1DKGD 1DTTA 3U4LA 5KRTA 4F3TA 4BRLA 4BRQA 1LW0A 5JS2A 1U49A 1ZYWA 4UAFE 3U8XA 5AQUA 2FF3B 4CK2A 2E1YA 1WWNA 4LH4A 1XC9A 3O3HA 4JRQA 3DLBA 1RT2A 3LPTA 4WQ5C 3ULEB 2O8EA 3L2VA 3TU5A 4KTQA 3SUQA 2O8BA 3M8RA 3K58A 4ID5A 3TABA 1ILYA 1RDCA 1VSJA 2ATQA 4XH5A 1C1CA 1W0HA 3MXMA 2ZJQL 3CCRN 2FXUA 3CC2N 1GOAA 1XNRK 1YVNA 1E3MA 2JDQD 3B8AX 3LWMA 3VMFB 3J81O 1DLOA 1RT6A 2BH1A 1KFSA 4KI6A 1NGJA 3DLEA 5MLCQ 4CI6A 1SN1A 3EKUA 4W5NA 3VEZA 4FXDA 4KKOA 3FFIA 1LOTB 3THVA 2IIRA 4CZEA 1KRPA 5I42A 1VQNN 3ZSQA 1TL1A 4IJNA 3V4IA 1HQEA 4L3QA 3SPYA 1VSKA 4EHTA 3NF9A 1BISA 4WQ5A 1VRTA 4FZYA 2IVOA 5M1KA 1JCFA 4C8MA 1NH5A 3CMEN 5GIPA 2KBJA 4KAZA 3OVNA 1KVAA 4HUGA 3IKMA 1KVCA 4DMNA 4PA1A 3LM2A 2UXBK 3KK2A 4KV8A 4KHUA 1L3UA 5KPRA 4FLVA 3RMBA 2HMPA 4DFJA 3QIOA 4CEDA 4DS4A 3VF2A 4GKJK 2QWNA 1KLMA 4AHUA 1VQKN 4MDAA 5AZIB 3HSCA 4KPYA 1LCUA 1WSIA 2QA4N 5BRHA 1FKPA 4BEBA 3KVGA 1N33K 4L8RB 5CZ1A 1WSFA 1XRSB 3ZEUA 1WN7A 4DG1A 5J1EA 3I0SA 4UAEF 4EAHD 4O8KA 1GOCA 4DV3K 5HBMA 4F8RA 5ADXH 3SJJA 2I7PA 3L3VA 5FRNA 3HK2A 3B6OA 4DSEA 2Q1NA 3SI6A 4I6MB 5AQMA 2QWRA 2P9LB 1JCGA 1HUXA 4BR9A 4ILHA 3MECA 2F7TA 1JXEA 4AHCA 4KRFA 4N41A 4QOZB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3VQB A;  1LQI A;  3OS2 A;  3J80 O;  2UUA K;  3MXJ A;  4DR6 K;  3EZW A;  4E3S A;  4K25 A;  3KOY A;  3FZK A;  3MAQ A;  3AA5 X;  3NF8 A;  5C2D A;  4ELV A;  3A5L C;  4PUO A;  1NRA A;  1M90 O;  1NM1 A;  2DY4 A;  3LP1 A;  4BRH A;  4CEO A;  5HL7 L;  1ICA A;  3ULE A;  4ZTF A;  2P1J A;  4DV7 K;  4CJ7 A;  4AM6 A;  4LSL A;  3CM5 A;  4O8U A;  4YOU A;  3AVA A;  3MK6 A;  3TSQ A;  1VSL A;  3SAG A;  2Z1I A;  4OO1 J;  1QHA A;  2GMO A;  3R1X A;  4H5N A;  3L8B A;  1BHL A;  2A5X A;  3U3G A;  4FWQ A;  1W7A A;  3DMJ A;  3EN9 A;  4CER A;  1EQY A;  1TAU A;  1ZVE A;  3QEP A;  4E1J A;  1U48 A;  2P9N B;  2GTD A;  3WXJ A;  3BGR A;  4YOT A;  4YOY A;  3TTC A;  4LF7 K;  3V9U A;  1O13 A;  1VQO N;  3LP3 A;  2LSN A;  1LWF A;  1IKX A;  2HHU A;  1HLU A;  1WMT A;  4LF9 K;  2DTU A;  1NBW A;  1TV6 A;  3LP2 A;  3UKR B;  2OA8 A;  4CFC A;  2UU9 K;  4IFE A;  5KGW A;  3SUO A;  2LN8 A;  5CY0 A;  2OZS A;  2FBX A;  1NE5 A;  3AVC A;  3ID8 A;  4FVU A;  4ILG B;  3M8S A;  4IG3 A;  2E88 A;  1RT7 A;  1TL3 A;  2HBM A;  1T6C A;  1TUY A;  4M7X A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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