5BN8A

Crystal structure of nucleotide-free human hsp70 nbd.
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
b'AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 127
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bn8A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn8A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bn8A04
2BUPA 4RCHA 1KAYA 2P9PA 2E8AA 3GDQA 3AAQA 1TYQA 2CGJA 3FLCO 4PL8A 1RFQA 4ISGA 4CZGA 3O08A 2J4RA 3H46O 3P4IA 4WQ4C 3CIPA 5JICA 4Z94A 2CH5A 5CE3A 2QXLA 4RWTA 5BPNA 4IJAA 2D0PA 4FWRA 2VYPA 5FPMA 4BC5A 3UE5A 4Y0WA 4BQZA 1G99A 3A8YA 4XH5A 3ZX0A 1GLEG 1K8KB 1GLDG 3HZ6A 1JCGA 2V51B 1ATSA 1K8KA 3ULEB 2NLXA 4B9QA 2A41A 3ENOA 5AFUA 3ATVA 1QZ6A 2P9NB 2P9IA 1HLUA 4I6MB 2FSNA 2P9NA 3FZKA 2E2OA 4KBOA 3A5LC 1Q18A 3WXLA 3QFUA 3EZWA 1HJOA 3EL2A 1BOTO 3W3DA 2E20A 1C0GA 1CZAN 3I33A 4K41A 1HKGA 5JMVA 3H1VX 2A6AA 4YDUA 3RSEA 4ISEA 3D7EO 1BO5O 3FR0A 1NGJA 1ESVA 3KHYA 1SAZA 2GWKA 3GE1A 4CZEA 5BRFA 1MWKA 3MK6A 2W40A 2ASPA 4H0OA 3MMVA 2IVPA 5KPRA 4FWSA 5AZJB 1U2VB 3L6QA 4BRDA 3FGUA 2P9UB 5AZJA 1LOTB 2QWPA 5ELZA 1NMDA 1U2VA 2GWJA 2P9UA 4CZFA 3FZFA 1NGEA 2YHYA 3R9PA 4H0YB 4IWVA 3EKSA 4CZLA 5F2RA 4DHYA 2WUSA 4H0TB 1NGCA 2A3ZA 5FPEA 3CHWA 1HKCA 3WUHA 4WQ4A 3AY9A 3MN5A 4BRFA 3CJAA 4H03B 3L0QA 2AP1A 2QWRA 1MA9B 3MN9A 3HSCA 1KAXA 1XC3A 2QM1A 3EN9A 2IVNA 4BRLA 4JD2A 4FOEA 4FWMA 4QS8A 4NB4A 1E4FT 1QZ5A 3VPZA 3LM9A 5AQHA 3WT0A 3FZMA 1WOQA 3VEYA 3FE1A 3WQTA 3S41A 1IJJA 4CBXA 4O8KA 5ADXH 1R59O 2QWMA 4BRHA 5AQVA 3R6MA 4H5TA 4BVPA 1S3XA 4FWNA 2KHOA 3O5BA 3ZX3A 5BREA 4XEIA 5AQTA 1Z05A 3QBXA 4IO8A 2P9KA 3UB5A 2V7ZA 2HMPA 4B1WB 3VEXA 2FXUA 2D4WA 2FF3B 1YVNA 4FWQA 4BR5A 2P9PB 5BR9A 3VF4A 1NBWA 4MLEA 5AQGA 4BGAA 5AQZA 5EXWA 1RGIA 2YHWA 5AR0A 3SJHA 1WUAA 1SQKA 3HM8A 4MO5A 3MDQA 2FSKA 4K25A 3D2FA 4BRPA 1T44A 3B8AX 1XQSC 3O4WA 4MLHA 5AZIA 3LDPA 2DPNA 3VGLA 2Q97A 1V4TA 4BRKA 5EY4A 2A5XA 1HKBA 1NLVA 2NZTA 1DGKN 4CBUA 1XUPO 4JN4A 3C7NA 3O8MA 4JNEA 4GY2B 1H1VA 4AM7A 1NGBA 2P9IB 3UKUB 3WEEB 3LDLA 1OKJA 3WXJA 3UKUA 3WEEA 1X3MA 4H5RA 1QQOA 3TPQA 3D2EA 4FWLA 3DXKA 3LDOA 4B1YB 3F9MA 5ADXA 5LY3A 4WQ5A 3H6EA 3G25A 4FWPA 5KQDA 3DXMB 4CZMA 3QB0A 2Q0UA 5JLHA 2D1KA 1HX1A 4HWIA 3CI5A 3RSEB 5EX5A 5KPTA 3DXMA 4BG8A 4H5WA 3IUCA 4L3QA 1ZXOA 2E2NA 2A42A 3FFKB 5AQOA 1QHAA 3VGMA 2FSJA 2V7YA 4QS7A 2YJEA 5AQMA 1QQMA 3CJCA 1KAZA 3WXIA 4H0VB 2I7NA 4BRIA 2A40A 3VEWA 1ZBSA 2IIRA 3VEOA 3WQUA 2CH6A 4PKHA 4BC3A 4MO4A 2OANA 4B1ZA 4CZIA 4B1XB 3M6GA 3MCPA 4QS9A 2F9TA 3SK3A 2Q1NA 3BF3A 4DQ8A 1D4XA 4ISFA 2PAVA 2QWQA 3BF1A 3LL3A 3SLCA 1ZC6A 4BRCA 4K43A 5AQRA 3GG4A 3GBTA 2Q31A 3O6WA 5AQQA 2H3GX 3EO3A 4GNIA 1U6ZA 3MN6A 2GTDA 4CD3A 2P9SA 2IVOA 1X3NA 1KXPA 4A2AA 4BG9A 3A0IX 5KPZA 1ATNA 2E88A 1YUWA 5BRDA 4JD2B 5BPLA 2Q36A 3KZBA 4B1UB 3VEZA 4WQ5C 1BA1A 1GLJO 4DCHA 5TKYA 3LDQA 2YJFA 2Q0RA 4FO0A 3U4LA 4FPAA 4M7YA 4O5FA 2QWNA 3FZLA 2CGKA 4PKIA 4EAHD 2AA4A 4BR4A 5F1XA 3SMSA 3CJBA 4PL7A 3KVGA 4BRAA 2YI1A 3CERA 2ZGYA 3VOVA 1ATRA 2P9KB 4C23A 3L4IA 2FF6A 2E1ZA 4JHDB 4RTFD 4AM6A 5B8HA 1BA0A 4BRNA 3BP8A 3DWLA 4JHDA 3DJCA 1NWKA 3UKRA 5FPNA 4K42A 2ASMA 5LJVA 1BG3A 3QICA 2QWOA 3CJ7A 1NGGA 1NGIA 5AQWA 4BRMA 4EHUA 3BUZB 1C0FA 3O1WA 3D2FB 3H45C 3ZETA 5AZIB 4IJNA 1T6DA 1RDWX 4IXCA 3ZEUA 4CD1A 2EWSA 4XH4A 3CQXA 3VENA 1GLCG 3U9ZA 1LCUA 5AQLA 1TUYA 5AQPA 2HF4A 3C7NB 3O80A 4LC9B 4BQLA 1YXQA 2GEMA 2PBDA 1BWFO 4BROA 3U8XA 2F9WA 4BRGA 4BREA 3O1BA 3D2EB 3EKUA 3AARA 3DXKB 3HBTA 4BRQA 3CJ1A 3BEXA 3ATUA 4EHTA 3GL1A 2I7PA 5FPDA 3HI0A 4CJ7A 3FZHA 3HTVA 5E84A 3M1FA 2HOEA 3ZX2A 1YAGA 3SMPA 4E1JA 4F9OA 4M63C 5AQJA 1GLLO 4IZ9A 4BVOA 4CI6A 4J8FA 1HUXA 5EOYA 4FWKA 3VEVA 3DAWA 3C0BA 2ITMA 3ULEA 4BR9A 3AAPA 3A5MC 3CJ9A 2ZGZA 3IFRA 4CZKA 3J8AA 3I8BA 2BTFA 3CETA 5AQYA 1TUUA 4FSVA 3IDHA 4CBWA 4I6MA 1JCFA 2Q2RA 2YCHA 4DB3A 2W41A 4XH1A 2VCPA 2QWLA 2E2PA 4BR2A 3MN7A 1E4GT 2ASOA 5AQXA 4A2BA 5BN9A 5AQFA 2ZWHA 4PKGA 2HF3A 4BC4A 3H1QA 1EQYA 4BR0A 1NM1A 1SZ2A 3R8EA 4WYBA 3H3OB 5BRHA 2FLOA 3JXUA 2ZF5O 5JLFA 3M3ZA 2NRHA 2UYTA 2P9SB 3H3NO 3VGKA 4A61A 4CZHA 1GLAG 1P8ZA 1NGFA 1V4SA 1Z6RA 4HTLA 1JCEA 1NGDA 3ENHA 4H5VA 5AQIA 3QDKA 1GLBG 3ID8A 5AQUA 1MWMA 4BC2A 1NGAA 5F0XA 2D0OA 4B1VA 3LM2A 3GOIA 3IMXA 4EIAA 5E26A 3VESA 1HPMA 2CGLA 5AQNA 4FL9A 4M7XA 4H0XB 1BU6O 3A5NC 4FOIA 5BN8A 4EFHA 1QQNA 1GLFO 3QMLA 3JS6A 1BDGA 4H0PA 4CZJA 4FPBA 4A62A 3WXKA 2GUPA 2P9LB 1DKGD 1J6ZA 1S22A 4NO7A 3TU5A 2VWBA 1X9JA 2P9LA 2E2QA 3A5OC 3QFPA 4JAXA 3UKRB 2E1YA 5BPMA 1MDUB 5AFUH 3VF6A 1NGHA 4BGBA 4YDUC 3U9DA 4BR7A 3W0LA 1BUPA 3VERA 2YHXA 5AQSA 4H5NA 5LJWA 3VETA 3ZETB 2GELA 3QBWA 3LDNA 1T6CA 3OHRA 1Y64A 3ZEUB 4FWOA 5KQ8A 3CQYA 5EVZA 1IG8A 1DEJA 2V52B 3VF2A 5I9EB 5AQKA 1TYQB 2QW9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BCOA 3GKUA 2P9PA 4F8RA 4H4OA 3AAQA 1TYQA 3LPTA 1T7AA 3AA4A 3MECA 4AHCA 1RT4A 4DSIA 4CZGA 3EYZA 3O08A 2HHHK 4UQGA 5JICA 3SUPA 4Z94A 2G8WA 5CE3A 3CD6N 4RWTA 4C8NA 1JLCA 2W42A 3VQ5A 4AAZA 1IKXA 2VYPA 3KOWA 3I0SA 4I2QA 3VQ8A 4Y0WA 4JI7K 4FLVA 4DTSA 2NY9X 3PSFA 5FLXO 1GLEG 3SQ4A 1K8KB 3ZT3A 3NMUA 3MWTA 1ATSA 4HHFA 3T1YK 4B9QA 3R3LA 1M90O 4X62K 3HT3A 2YIOA 4DV2K 1YTUA 1BHLA 4YOWA 2ZJQL 3A5LC 3O3GA 3WXLA 3EZWA 3W3DA 2O8FA 3OYGA 3I33A 4ICLA 1OMYA 3TANA 5JMVA 4F4KA 1NJXA 4JI2K 3H1VX 4FW2A 4JKAA 1S6PA 3PSIA 3RSEA 2KYQA 1LWEA 3NF7A 1BO5O 3FR0A 3L8BA 3VTHA 4CGGA 4CZEA 1NPIA 1KLMA 4IG3A 1FK9A 3OVNA 2NRVA 4DFKA 3U6FA 4IEIA 3VTIA 4B9LA 2Z1JA 4FWSA 3QEVA 2LSNA 4BRDA 3OYHA 2P9UB 4BE2A 1VQ6N 3ZSZA 4O55A 2GWJA 4K8XA 1RNHA 4AHRA 3FZFA 1C6VA 1U49A 4E0DA 3R9PA 4WF9L 5F2RA 1WMTA 2WUSA 3MEEA 4AHTA 1EWRA 3I8DA 4A59A 3S5TA 2I5JA 2KZMA 4O44A 2YV0X 1D9FA 4Y1DA 1HJRA 1TVRA 4ID5A 3D0PA 2AP1A 1UA1A 4DSFA 4I9QA 4WCEL 3TTDA 1ZBLA 3PX4A 4J2AA 2GMOA 4QS8A 3O9UA 3CM5A 3QI7A 2G8KA 4CERA 4DTRA 3TWHA 1WAJA 3SUQA 5AQHA 4JEPA 3WQTA 2D0AA 4CBXA 2RKIA 4ZHRA 4FJXA 2VQFK 1TKZA 3IKMA 4NLBA 2E6LA 2PYLA 4LSNA 4CF9A 1IG9A 3I0RA 4B3SK 2WOMA 4B1WB 3OYBA 1WLJA 1N36K 2P9PB 2PZSA 5D3GA 1S9EA 4KI6A 2F4VK 5AQGA 4BGAA 3V1OA 5AQZA 1RT2A 4W5OA 3L56A 1HNXK 4C8OA 3AGRA 4K25A 3CW4A 2HMIA 3K5OA 4MLHA 4KHQA 2ZM6K 1BMRA 4B9MA 1B9DA 4W5NA 1TK8A 3PX0A 4KH4A 1QVFM 3OA9A 3UIQA 4PQUA 2A5XA 1HKBA 4YOUA 4JKFA 3DRPA 3C7NA 4GY2B 2K35A 4FJ8A 4B9SA 3LDLA 3HPGA 3E1YA 4Q0BA 4DTUA 3UKUA 4B1YB 3F9MA 2O8FB 1WWNA 4CF1A 3K5MA 2X78A 3AO1A 4LY7A 3C94A 4CZMA 2D1KA 1RILA 3RSEB 3CXCM 1KC8O 3MXIA 4UADE 4H5WA 3NF6A 1BQMA 1RT3A 3RRGA 5AQOA 3KLEA 3VGMA 2FSJA 1NRBA 1QQMA 3CJCA 1WB9A 1KAZA 4FW1A 4NXNK 4YOVA 2A40A 4CJTA 1B7DA 3AVAA 3K59A 4CIEA 1EX4A 3LP3A 3CCSN 4YORA 4BC3A 2OANA 2ATBA 1WSJA 3OJUA 2E0HA 1UGLA 1OH7A 2WBNA 1ASVA 2ZD1A 4FJJA 3BF1A 4MQ3A 3LL3A 2B6AA 3THWA 1W2BM 1S1WA 2ZQBA 4KHWA 2YNFA 3CCUN 1S1VA 3NE6A 3T1AA 3O6WA 1NK6A 2Z1IA 3NF8A 4CJWA 3VMFB 1TAQA 4CD3A 3SBGA 2IVOA 1X3NA 1KXPA 3AVMA 1ZVEA 3L3VA 4JKGA 3AA3A 5GAEP 2MZ0A 1YUWA 1HNZK 3AVIA 4O0JA 4WQ5C 1WAFA 1K73O 5I42A 3SNNA 1VQPN 4PY5A 2QKBA 5TKYA 4IG0A 3LDQA 2YJFA 4FO0A 3U4LA 3SF4D 2XO7A 3QEPA 2Z1HA 2QWNA 4M3TA 1QE1A 2G8IA 4CEEA 4EAHD 4F2SA 3LALA 3AVCA 5F1XA 3SMSA 4PL7A 4OVLA 1TL3A 2YI1A 3L2UA 2ZGYA 3TABA 1ATRA 4O8UA 2E1ZA 4AM6A 1JLGA 2HHWA 3BP8A 4JHDA 4DR2K 4KHPK 3OYJA 2ASCA 2B4JA 4K42A 5LJVA 3QEIA 3QICA 1NKBA 5AQWA 4N56A 4DG1A 4CFBA 2HHVA 2LJ7A 1A5WA 1DLOA 2E4LA 1GOAA 4AHVA 2R7YA 4OX9K 4IJNA 4CJVA 3CCEN 4JI8K 4FJ5A 4W5QA 3PLAA 3M8QA 1RTDA 1HNVA 2XY8A 4JI1K 5AQLA 4O4GA 1TUYA 3O80A 3C7NB 4CE9A 3O9SA 3HO1A 1T8EA 1NJWA 1KV0A 1DJTA 2PBDA 4AILC 3NHGA 2F9WA 1K6YA 2N2RA 4AB0A 2D5RA 4OLBA 1C55A 4LFAK 3CC4N 1NKCA 3O4QA 4CJ7A 5FPDA 3FZHA 5E84A 3Q7BA 4YFUA 4DV6K 3ZX2A 4E1JA 4IZ9A 3A2FA 4CI6A 1HUXA 4FWKA 2OCEA 3DAWA 1YT3A 3AAPA 3A5MC 4DR1K 2ZGZA 2OTLN 1SL1A 1ZVGA 2GUIA 3IDHA 4C8KA 4CBWA 4BE0A 4CQKA 4KRFA 4WFBL 3SZ2A 2YBRC 4JKEA 5DM7L 1RDCA 1OH8A 3MWPA 3P83D 3QERA 3OYEA 3TAMA 3C65A 2ZWHA 1I94K 4E7LA 4FK2A 5BR8K 3THXA 1OH5A 5GIPA 3THWB 1X1PA 4BR0A 1SZ2A 5LMNK 1C1BA 1QS4A 4DF4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1BCO A;  3GKU A;  2P9P A;  4F8R A;  4H4O A;  3AAQ A;  1TYQ A;  3LPT A;  1T7A A;  3AA4 A;  3MEC A;  4AHC A;  1RT4 A;  4DSI A;  4CZG A;  3EYZ A;  3O08 A;  2HHH K;  4UQG A;  5JIC A;  3SUP A;  4Z94 A;  2G8W A;  5CE3 A;  3CD6 N;  4RWT A;  4C8N A;  1JLC A;  2W42 A;  3VQ5 A;  4AAZ A;  1IKX A;  2VYP A;  3KOW A;  3I0S A;  4I2Q A;  3VQ8 A;  4Y0W A;  4JI7 K;  4FLV A;  4DTS A;  2NY9 X;  3PSF A;  5FLX O;  1GLE G;  3SQ4 A;  1K8K B;  3ZT3 A;  3NMU A;  3MWT A;  1ATS A;  4HHF A;  3T1Y K;  4B9Q A;  3R3L A;  1M90 O;  4X62 K;  3HT3 A;  2YIO A;  4DV2 K;  1YTU A;  1BHL A;  4YOW A;  2ZJQ L;  3A5L C;  3O3G A;  3WXL A;  3EZW A;  3W3D A;  2O8F A;  3OYG A;  3I33 A;  4ICL A;  1OMY A;  3TAN A;  5JMV A;  4F4K A;  1NJX A;  4JI2 K;  3H1V X;  4FW2 A;  4JKA A;  1S6P A;  3PSI A;  3RSE A;  2KYQ A;  1LWE A;  3NF7 A;  1BO5 O;  3FR0 A;  3L8B A;  3VTH A;  4CGG A;  4CZE A;  1NPI A;  1KLM A;  4IG3 A;  1FK9 A;  3OVN A;  2NRV A;  4DFK A;  3U6F A;  4IEI A;  3VTI A;  4B9L A;  2Z1J A;  4FWS A;  3QEV A;  2LSN A;  4BRD A;  3OYH A;  2P9U B; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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