5BN8A

Crystal structure of nucleotide-free human hsp70 nbd.
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
b'AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 127
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bn8A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn8A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bn8A04
1T6CA 5TKYA 1HLUA 3FZHA 2FF6A 2GWJA 4FWLA 3UKUB 3ZX0A 3ZETB 2A6AA 3LDOA 3R9PA 4FL9A 2D0PA 1EQYA 3R6MA 5FPNA 2PBDA 4NO7A 3DXMA 4IJAA 4QS8A 5AZIB 1G99A 4FPAA 3U8XA 3VEOA 5AQMA 3LM2A 2E2OA 3DXKA 1QZ6A 4H0PA 3GE1A 4BQZA 4BRMA 4H5RA 3M1FA 1YXQA 4FWRA 4JD2A 3VEXA 2I7NA 4BRHA 4GY2B 1OKJA 4I6MB 5KQ8A 3GOIA 5AQJA 4BG8A 2QWRA 2D0OA 2P9NA 1BA0A 1HKCA 4FWMA 4FSVA 1NBWA 4C23A 1E4FT 1BUPA 1QQOA 3WUHA 5EVZA 4B1ZA 1IJJA 1KAZA 2YI1A 3QBWA 4BR7A 1GLCG 1NLVA 3C0BA 3MN7A 4BGAA 2QWPA 2QM1A 1R59O 1Q18A 5AQHA 2FXUA 4H5WA 3UKUA 3LM9A 2QWMA 3A8YA 1NGAA 5BR9A 2A40A 3UE5A 3ID8A 1MA9B 2ZF5O 1ATSA 1ZXOA 3QICA 2V7ZA 3FGUA 5AZJA 3CJBA 4B1VA 3RSEA 4CD3A 4JN4A 1NGDA 1KXPA 2Q2RA 1X3MA 3O6WA 5ADXA 2BUPA 1MWKA 1NGBA 3MCPA 3VGKA 2P9PB 5ADXH 1K8KB 5AQPA 3HM8A 3VEWA 2V52B 1TYQB 3I33A 2KHOA 5F2RA 4ISGA 1HPMA 4H0VB 3O1WA 4BRLA 3ZX3A 1NMDA 4DB3A 4GNIA 1BG3A 1X9JA 1XUPO 4PKIA 1BO5O 4HTLA 2QWOA 5AFUH 2GWKA 4FWSA 3FE1A 2CGJA 1S3XA 1ESVA 1GLLO 3H46O 1YVNA 3QDKA 4RWTA 1DKGD 3FZFA 5BPMA 1X3NA 3HZ6A 2NZTA 4IO8A 4MLEA 4O8KA 2H3GX 4BRIA 4PKHA 3DXMB 2DPNA 4BC3A 5JICA 2Q31A 2D1KA 3AAPA 5AQRA 2IVNA 4FWOA 4ISFA 2IIRA 4YDUC 2FSKA 3CJ9A 3MMVA 5BRHA 1E4GT 3FR0A 3SLCA 2FLOA 4BREA 3LDPA 3DJCA 1HJOA 5F0XA 2Q97A 4JD2B 3GL1A 2AA4A 5AQKA 2P9SA 3U4LA 4MO4A 4BG9A 3ZEUA 3AARA 4H0TB 2ASMA 1RFQA 4XH4A 3DAWA 1ATRA 2E1YA 2ZGZA 5AQSA 1V4SA 3HBTA 5EX5A 3CJ7A 3WQUA 2P9LA 4XH5A 1DGKN 3S41A 5AR0A 3CQYA 4PL7A 3ENOA 4M7YA 2NLXA 5ELZA 4Y0WA 3O08A 2I7PA 2HMPA 3H3OB 4FOEA 4A2BA 3O8MA 2GELA 5JLHA 3O1BA 4K43A 4RCHA 2P9UA 5AQYA 4QS7A 3VGLA 5AZJB 1U6ZA 5EY4A 2FF3B 3VESA 2CH5A 3RSEB 2A41A 4CZFA 3CJAA 3GDQA 3WXJA 3B8AX 3LDLA 4H03B 2QW9A 1TUUA 1HKGA 3U9ZA 2A42A 3CHWA 4BRPA 4BVOA 5KPRA 4BRNA 2GTDA 5AQNA 3GBTA 4BRKA 4K25A 4CJ7A 4A2AA 5BRDA 4JNEA 3QFUA 3ULEA 4L3QA 2HF4A 5AQLA 5BN9A 3M6GA 3QBXA 3FFKB 3WEEA 1C0GA 3WXIA 2YJFA 4O5FA 2ITMA 2ZWHA 3O4WA 4WQ4A 3KHYA 3TPQA 4FWKA 2E88A 4K42A 3WT0A 2QWLA 2FSNA 4BR5A 3I8BA 2P9IB 2ZGYA 5AQQA 3A5OC 2CH6A 3M3ZA 3AAQA 4QS9A 4EHUA 1ATNA 2CGLA 1RDWX 3H1VX 3H6EA 3W3DA 1D4XA 2P9SB 4EFHA 2W40A 4XH1A 1BU6O 4DHYA 5FPEA 3O80A 3ZEUB 1GLEG 2V7YA 4B1WB 2Q1NA 3WXKA 3QB0A 1KAYA 4LC9B 1HX1A 1Z05A 3C7NA 3AY9A 2P9LB 2HF3A 3CQXA 1T44A 4FOIA 2GUPA 3VF2A 4MO5A 3F9MA 1GLBG 2CGKA 3VETA 4BRGA 4CZKA 5AQXA 3WXLA 2BTFA 3EO3A 4WYBA 3SMPA 4PL8A 3VEYA 1HKBA 3SJHA 3D7EO 1YAGA 4RTFD 1SZ2A 1WOQA 3MN9A 3IDHA 2P9UB 3CERA 3D2EA 3EKUA 3IMXA 3P4IA 5AQUA 1SQKA 5EXWA 1XC3A 4IZ9A 4FWPA 2P9IA 2E2PA 4A62A 3VENA 3ATVA 4IJNA 5CE3A 3QMLA 5KPZA 3HTVA 2E20A 5AQZA 1LOTB 2P9KA 5JLFA 4A61A 4B1XB 1NGIA 4BRDA 1GLJO 3CIPA 3ULEB 4BRCA 1QQNA 1C0FA 1XQSC 4DCHA 4BVPA 1QQMA 4B1YB 1YUWA 3WEEB 4CZGA 1NGJA 1Y64A 3UKRA 3MK6A 2Q36A 4CD1A 2FSJA 3EN9A 4BQLA 1SAZA 4BRFA 5B8HA 1MDUB 2Q0UA 4DQ8A 1JCEA 3BP8A 3J8AA 2F9WA 3ATUA 2ASPA 5BPNA 2V51B 3MN5A 4AM7A 4ISEA 4JHDA 4IXCA 1U2VB 4WQ5A 4B9QA 4H5VA 5KPTA 3LDNA 1ZBSA 4JAXA 3D2FA 3H3NO 4BROA 2IVOA 4CBXA 4H5TA 3BEXA 4H0XB 1NGHA 4EHTA 1QZ5A 4F9OA 1BDGA 1LCUA 1ZC6A 4CBWA 3A0IX 2QWNA 4BR0A 3C7NB 1DEJA 2F9TA 2J4RA 2OANA 3OHRA 5F1XA 2A5XA 3SMSA 4E1JA 4WQ4C 4EIAA 4H0YB 5E26A 5BN8A 4CZHA 4BGBA 3A5NC 4BRAA 3VF6A 4FWQA 3ZX2A 3H1QA 4HWIA 1NGGA 2VCPA 4BC5A 3VGMA 4CZEA 4M7XA 1MWMA 3JXUA 3D2EB 1P8ZA 4Z94A 3CJCA 3JS6A 2YHYA 3TU5A 3WQTA 5BREA 1S22A 5FPDA 4K41A 1GLDG 3W0LA 4EAHD 5AQVA 3EKSA 3ZETA 1U2VA 1NWKA 3BUZB 2WUSA 5LY3A 4BC2A 2HOEA 3U9DA 4XEIA 3CJ1A 5AQTA 3IUCA 5EOYA 5AZIA 4CBUA 3O5BA 4CZLA 2UYTA 2P9KB 2IVPA 3SK3A 5JMVA 1IG8A 3HI0A 5KQDA 3FLCO 4J8FA 2ASOA 3BF3A 1JCGA 1V4TA 4CZIA 1NGEA 2E8AA 5AQFA 3CI5A 3FZMA 5BPLA 1CZAN 3H45C 4B1UB 2W41A 3L4IA 3A5MC 3EZWA 4I6MA 2E2NA 2AP1A 2YJEA 2YCHA 2YHXA 4H0OA 1T6DA 3VF4A 5FPMA 5AQWA 5AQIA 3UKRB 1BWFO 5AQGA 1Z6RA 4H5NA 3FZKA 4BC4A 1RGIA 2EWSA 1JCFA 2Q0RA 4FPBA 5AFUA 2QXLA 4BR9A 2E2QA 5E84A 3L6QA 1GLAG 3DWLA 5I9EB 3FZLA 3EL2A 4JHDB 3IFRA 5LJVA 1BA1A 1TUYA 2YHWA 5AQOA 1KAXA 1NM1A 3MN6A 2NRHA 3HSCA 3R8EA 2D4WA 3D2FB 2VWBA 1NGCA 4AM6A 2E1ZA 4FO0A 3L0QA 4M63C 1QHAA 2QWQA 4CZMA 1H1VA 3VEZA 2A3ZA 3DXKB 2GEMA 4IWVA 4BR4A 4BRQA 4BR2A 3VOVA 3ENHA 4MLHA 2P9PA 1K8KA 3UB5A 4YDUA 4FWNA 4CI6A 3LDQA 3CETA 1NGFA 1TYQA 3GG4A 1BOTO 3MDQA 2VYPA 3VEVA 1WUAA 3LL3A 3VERA 4CZJA 2P9NB 5BRFA 3G25A 3BF1A 5LJWA 4KBOA 3QFPA 1HUXA 2PAVA 1J6ZA 3KZBA 4PKGA 3VPZA 3KVGA 1GLFO 4WQ5C 4NB4A 3A5LC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4I7FA 4OX9K 4ELUA 2KLAA 1RT2A 3TAEA 4DU1A 4M42A 3DRRA 4FWLA 4Z4HA 2KZMA 3ZETB 4M3XA 3KLFA 1VSIA 3ENBA 3J81O 2C1GA 4CEFA 4KI6A 1EQYA 3LWLA 1Z26A 3DXMA 1G99A 3MAQA 1WSFA 5AQMA 5KK4A 3AVLA 2HSTA 3GE1A 4BQZA 4HTUA 2E6LA 4H5RA 1YXQA 2KKZA 3ZSQA 3Q7BA 1CN2A 3U3GA 4DR7K 4C8KA 1C1CA 1OKJA 4I6MB 4DUYK 5AQJA 2P5OA 3TTCA 2D0OA 4C23A 1NBWA 3C6TA 2KGQA 1QQOA 1BIUA 3AO2A 2YNFA 3C0BA 4DG1A 5C25A 4MDBA 4CEEA 3NFAA 4BGAA 2QWPA 2O8FB 1EETA 1X9WA 2A1SA 3KTQA 3AVIA 4BDYA 1BI4B 3O9UA 3CC2N 1MA9B 3R2VA 4CK3A 3EYZA 2E0HA 3OBYA 4H8KA 3JYTA 1WNSA 5JS1A 1TAUA 4O44A 1KXPA 2Q2RA 5C24A 3R3LA 3F73A 4KH5A 5EU7A 1IKXA 5ADXA 1C55A 1NGBA 3KIOA 3DI6A 3MCPA 5E41A 4DTSA 2P9PB 3HM8A 1SN1A 2KPYA 3ID6A 2KHOA 2QKKA 5F2RA 1HPMA 4JEPA 3O1WA 4ILGB 3BGRA 3QIOA 3ZCMA 1RT7A 3O4NA 4GNIA 1HNIA 1NK4A 2B68A 3O3GA 4LF7K 1LQIA 2QWOA 3HSTB 1YHQN 2GWKA 4YOTA 2CGJA 2FBXA 1WSHA 5BPMA 4KHSA 2NZTA 4IO8A 1YJWN 2KTQA 4UAFE 4W5OA 4CGJA 2O8CA 2DPNA 4BC3A 5JICA 1BQMA 1T7BA 2D1KA 4Z4CA 4BACA 4RG8A 4RW9A 4FWOA 3CCQN 5KRSA 4DLGA 3CJ9A 3MMVA 4O55A 5DK5A 1QE1A 1GOAA 2FLOA 4DF8A 2O8EB 2P51A 1B3CA 4DR2K 1LAVA 3GL1A 3SUQA 4CEOA 2P9SA 1FK9A 4KHUA 4KHQA 4C8OA 3AARA 4H0TB 4K8ZA 4GVEA 5IWAK 4X66K 3KD5E 2YV0X 1BL3A 1QQCA 3WQUA 2X78A 4JKCA 1VSFA 4AQYK 3S41A 4N76A 4DU4A 3OYFA 5ELZA 2EHGA 4DR3K 3KKRA 2HMPA 3ZSXA 4W5NA 3T1YK 2GELA 1VQKN 4RCHA 3QETA 4K0KK 1UA1A 1JLAA 3HM9A 5AZJB 1GOBA 2FF3B 1GOCA 1ZYWA 3ZSOA 4FXDA 1BISA 1I2UA 4KO0A 4Y1DA 3VTIA 3K5MA 3MEDA 4KHNA 4Q5VA 4DV4K 4FJXA 2O8EA 2NRZA 4N47A 3NVMA 3NH2A 4PY5A 1LWFA 2GL1A 2OTLN 1HKGA 3CHWA 2HBMA 3C6AA 3NF8A 5GAHP 3SCXA 1YTUA 5KPRA 4FLTA 2WTUA 3RMDA 3RRHA 3T1HK 1ZVEA 4CJ7A 4EZ6A 4KB0A 4FJ5A 4YY3K 3WNFA 4BY9C 1FJGK 3KLHA 3NDKA 3QBXA 1GPSA 3M8SA 1PX9A 1BCMA 4JI2K 4LFCK 4ZHRA 4KFBA 3KJVA 2YJFA 3P83D 1RCHA 3WT0A 2QWLA 4O0JA 4B8CA 1NK8A 3AVMA 3SV3A 2HW3A 1KD1O 2JWLA 4OKJA 2ZGYA 3L8BA 4M3UA 2CH6A 3IG1A 1D9FA 4QS9A 1JLFA 3VA3A 4EHUA 4OVLA 1ATNA 1RDWX 1SN4A 3DLGA 3H1VX 3W3DA 4EFHA 3KC6A 4DSJA 4C1NI 5SZTA 2GMOA 1ZBUA 4ILHA 3WXKA 4LC9B 3J7AP 1U4BA 3AY9A 2P9LB 2OYQA 3CQXA 4CF8A 3OYCA 2DY4A 1IH7A 2RN2A 3KOYA 3OBWA 3V9XA 3O3FA 3THYA 3TWHA 1HKBA 2OPSA 3CC7N 4IFYA 1NK7A 3CCMN 1Q9XA 1SQKA 1VNBA 5GIOA 3OYJA 2PZSA 4IZ9A 1YIJN 5CR4A 2E2PA 2NRXA 1NK9A 1NJXA 4IJNA 1TKTA 1RTDA 1HYSA 3OYIA 3ZSWA 5FROA 1GPTA 3VMFB 1HNVA 4E1NA 1YITN 3THXA 1RILA 1D8YA 5AQZA 3MWPA 5HRPA 2ZJQL 4FM2A 4LD0A 3O9RA 3JAMO 2ETJA 1VNAA 2QI2A 3T19A 1O1WA 1NU0A 3IAYA 3AA2A 1YUWA 4CJVA 2LSNA 1SEGA 3EY1A 2IDOA 2VG6A 4B9LA 2NRVA 3EN9A 2XY6A 5C42A 4BRFA 1S6PA 4MFBA 5B8HA 3BP8A 1C0TA 4HVJA 4EP5A 1I94K 1VSKA 2ASPA 3DRSA 2V51B 3WNGA 4ISEA 4B9QA 2MBKA 2HNZA 4N56A 2NNWA 1T03A 4FJLA 5KPTA 1T05A 3VQ6A 3OS2A 4H0XB 4FLYA 3O3HA 5CZ1A 1LCUA 5KGWA 4CBWA 3ASMA 3A0IX 5IT9O 2F9TA 2J4RA 2NRWA 2OANA 4WQ4C 4EIAA 5HRSA 4H0YB 5E26A 3A5NC 4BRAA 2LT8A 4NXNK 1AHOA 1IBKK 1NGGA 2VCPA 5M1PA 3SQ2A 4CEDA 3TU5A 4KV8A 1NOZA 4DS5A 5GINA 4FW1A 1S1XA 4K41A 4OPAA 4EAHD 1KSPA 1LQHA 1VQLN 3CCSN 4E19A 1I2VA 1P00A 4E7LA 5HRRA 4BC2A 3CCEN 3U9DA 4CBUA 3K5NA 4V1DC 2WFBA 1XHZA 1U48A 1YJ9N 3NGZA 2UYTA 2P9KB 1P0AA 3E9OA 3DLHA 1T3VA 1ZU3A 3WXMB 1KC8O 4A5BA 1NPIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4I7F A;  4OX9 K;  4ELU A;  2KLA A;  1RT2 A;  3TAE A;  4DU1 A;  4M42 A;  3DRR A;  4FWL A;  4Z4H A;  2KZM A;  3ZET B;  4M3X A;  3KLF A;  1VSI A;  3ENB A;  3J81 O;  2C1G A;  4CEF A;  4KI6 A;  1EQY A;  3LWL A;  1Z26 A;  3DXM A;  1G99 A;  3MAQ A;  1WSF A;  5AQM A;  5KK4 A;  3AVL A;  2HST A;  3GE1 A;  4BQZ A;  4HTU A;  2E6L A;  4H5R A;  1YXQ A;  2KKZ A;  3ZSQ A;  3Q7B A;  1CN2 A;  3U3G A;  4DR7 K;  4C8K A;  1C1C A;  1OKJ A;  4I6M B;  4DUY K;  5AQJ A;  2P5O A;  3TTC A;  2D0O A;  4C23 A;  1NBW A;  3C6T A;  2KGQ A;  1QQO A;  1BIU A;  3AO2 A;  2YNF A;  3C0B A;  4DG1 A;  5C25 A;  4MDB A;  4CEE A;  3NFA A;  4BGA A;  2QWP A;  2O8F B;  1EET A;  1X9W A;  2A1S A;  3KTQ A;  3AVI A;  4BDY A;  1BI4 B;  3O9U A;  3CC2 N;  1MA9 B;  3R2V A;  4CK3 A;  3EYZ A;  2E0H A;  3OBY A;  4H8K A;  3JYT A;  1WNS A;  5JS1 A;  1TAU A;  4O44 A;  1KXP A;  2Q2R A;  5C24 A;  3R3L A;  3F73 A;  4KH5 A;  5EU7 A;  1IKX A;  5ADX A;  1C55 A;  1NGB A;  3KIO A;  3DI6 A;  3MCP A;  5E41 A;  4DTS A;  2P9P B;  3HM8 A;  1SN1 A;  2KPY A;  3ID6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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