5BN8A

Crystal structure of nucleotide-free human hsp70 nbd.
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 127
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bn8A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn8A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bn8A04
5AQOA 2CH5A 2CGJA 3A5NC 5AZIA 1YVNA 2YJEA 4BRKA 5AFUA 5LY3A 1BWFO 4CZKA 4PL8A 4H0PA 5BPMA 3P4IA 3GL1A 2P9KB 4Z94A 3ATUA 3QFPA 2DPNA 3QMLA 1JCGA 4EFHA 3I33A 2Q97A 3DJCA 4XEIA 3LDPA 2Q36A 3O1WA 3O5BA 4NO7A 4BR4A 5BREA 3EKSA 1MWKA 1BA0A 2VYPA 3QB0A 3U9DA 3MCPA 4ISGA 2ZGZA 4FSVA 1QQNA 2QWOA 5AQWA 2P9SA 3D7EO 4O8KA 4O5FA 3AARA 4YDUA 1P8ZA 3HI0A 5AQKA 3BUZB 3IFRA 4CZIA 2QM1A 4WQ4C 4HWIA 3ENHA 1MWMA 1HJOA 3HM8A 4CZMA 4FWQA 4PKIA 2CGKA 4K25A 4QS9A 3WEEA 2D0OA 3CJ7A 3JS6A 3VEZA 1BU6O 2OANA 4BG8A 2CH6A 4FWSA 5ELZA 4M7XA 4CZGA 4IO8A 3VOVA 1KAXA 1IJJA 3U4LA 4H0YB 4H0VB 5KPRA 3UKUB 1X3MA 3ULEB 3H1QA 3MN9A 1QQMA 3LDLA 4B1XB 4PKGA 2V7ZA 2P9UB 1NLVA 4MLHA 5CE3A 3VESA 3CJBA 2ZWHA 4H5RA 3HBTA 4CJ7A 1ATNA 4B9QA 3CHWA 1YXQA 4HTLA 4M7YA 3SJHA 2QWQA 3GDQA 4FWMA 2QWLA 1KXPA 3EO3A 4BC5A 1WUAA 4BRAA 3H3NO 3FZHA 3F9MA 3FZFA 5AQNA 2P9SB 1NGCA 5FPDA 5AQHA 2QXLA 4F9OA 2HOEA 4CZLA 1Z05A 1S3XA 5AQGA 4XH4A 1BO5O 4XH1A 3GE1A 2EWSA 1Z6RA 1OKJA 1NGGA 3H1VX 4CZHA 4H0XB 4BRGA 4CZEA 5JLFA 3WEEB 2HMPA 1HKGA 4XH5A 4DQ8A 3CQXA 5AR0A 3FFKB 2I7PA 3EN9A 4H5VA 3VEVA 1TUUA 1BDGA 3IDHA 4H5WA 5AQXA 4H0TB 4BGAA 1JCFA 3CI5A 4ISFA 2GEMA 3O08A 3D2FA 3O1BA 1ESVA 4A62A 5KPTA 3DAWA 4BG9A 5I9EB 2ASMA 5JLHA 2E20A 3BF3A 4I6MA 3MDQA 3AAPA 3MN5A 4GY2B 3BP8A 2HF3A 2E88A 4ISEA 1K8KA 1Q18A 2GTDA 5KQ8A 5KPZA 1ZC6A 4BR0A 4IJAA 1C0FA 3WXJA 3KVGA 3ID8A 3TU5A 5BR9A 1HKCA 1DGKN 1GLEG 2D1KA 2P9UA 5F1XA 3R6MA 4K42A 4BRPA 1GLDG 2FXUA 4WQ5C 2E8AA 5JMVA 2A41A 4WQ4A 4BRIA 1GLJO 1NGDA 4BRHA 1QZ6A 2FF3B 4E1JA 5BRHA 4M63C 4EHTA 1EQYA 3O8MA 3BF1A 2Q1NA 2FSJA 2P9IA 3O80A 5EY4A 1R59O 2AP1A 3LM9A 5EOYA 3UKRB 5AQVA 3VETA 5FPNA 4RWTA 1E4GT 5AQZA 2V52B 3D2FB 3C0BA 3CJ9A 1NM1A 5AFUH 1NGBA 3WXIA 4EHUA 4H5NA 3CETA 4A2AA 4I6MB 2NLXA 3CIPA 2IIRA 3ZX2A 1H1VA 3VEYA 3FR0A 3L4IA 1K8KB 1BUPA 2ZGYA 4NB4A 3O6WA 2YJFA 4RCHA 4C23A 1TUYA 4FPBA 3W0LA 2PBDA 4RTFD 5AQSA 4EIAA 4MO5A 4B1ZA 2V51B 3SMPA 3A5LC 5BRDA 3LDQA 3A5MC 3UE5A 5BN9A 1GLFO 2F9WA 2P9PB 3VERA 3SLCA 4H0OA 4BRQA 1CZAN 2Q31A 4JHDA 1GLAG 2VCPA 3ZETA 5AQUA 5AQTA 4CBUA 1DEJA 1LCUA 3A5OC 4J8FA 2UYTA 2A42A 4BC4A 2FLOA 2P9IB 4BRCA 2FSNA 1U2VA 3A8YA 2A40A 2J4RA 3VEXA 1YAGA 3EL2A 3I8BA 3VGKA 4AM6A 3U8XA 5AQFA 5KQDA 1Y64A 1IG8A 1E4FT 3CERA 5EVZA 1RDWX 2GWKA 3VF4A 2E2QA 3CJCA 3C7NB 4BRNA 3R8EA 1BA1A 4BQLA 1V4SA 1GLCG 4DCHA 1NMDA 1JCEA 1SZ2A 2H3GX 2ITMA 1HKBA 3QFUA 4BR5A 2CGLA 1NBWA 1SQKA 3UKRA 3VF2A 4BGBA 3LM2A 3GG4A 2Q0RA 4BQZA 3HTVA 2QWNA 4BC3A 5AQMA 3M3ZA 4BRFA 4B1UB 3MN7A 2GELA 3ZX0A 3M1FA 1KAZA 2E2OA 1T44A 2ASPA 3JXUA 3HSCA 2PAVA 4JHDB 4KBOA 3WQTA 3MN6A 4WQ5A 2QWMA 1MDUB 2A5XA 2D4WA 1NGHA 2A3ZA 2YI1A 3ZETB 5ADXH 3LDOA 4B1VA 2V7YA 4FWRA 4JN4A 3FE1A 3KZBA 3L0QA 1GLBG 3H3OB 4Y0WA 4CI6A 4BRDA 4FWNA 3CJAA 5LJWA 1U2VB 3KHYA 3QBXA 3DXMA 4A61A 3VF6A 4BVOA 4GNIA 4H5TA 3ZEUA 4BR7A 2P9PA 4IJNA 5AQRA 2YHYA 1TYQB 4FWOA 5AQLA 1G99A 1QQOA 1V4TA 3ZX3A 3G25A 3B8AX 4BR9A 2F9TA 3D2EA 3FZMA 5F0XA 4BC2A 1GLLO 2AA4A 2GWJA 2YHWA 1BG3A 2WUSA 3HZ6A 2QW9A 4WYBA 5AQIA 3VEWA 4FOIA 2FSKA 3M6GA 3GOIA 4FL9A 3R9PA 3EZWA 2VWBA 4K41A 4PKHA 3SMSA 3WQUA 5BPNA 1D4XA 5BPLA 5AZJA 3C7NA 1HX1A 1NGIA 1J6ZA 3W3DA 4JD2B 1RGIA 4L3QA 2YCHA 5E84A 3H46O 1ZXOA 3UB5A 3A0IX 5EXWA 4LC9B 4CD1A 2ASOA 3GBTA 3IUCA 4CZJA 1C0GA 1QZ5A 2E2NA 2NRHA 2A6AA 3WXLA 2Q0UA 2BUPA 3VGMA 2D0PA 5E26A 4FWLA 4BRMA 3DXMB 2P9LA 3MK6A 5AQYA 4CBWA 4B1YB 3QICA 2P9NA 3ZEUB 5AQJA 4H03B 5BRFA 3VPZA 4K43A 1ZBSA 4YDUC 5FPMA 2ZF5O 3WT0A 1X3NA 1XQSC 2IVOA 3VEOA 3O4WA 4IXCA 2HF4A 5B8HA 5F2RA 5JICA 1RFQA 3D2EB 2E1YA 4DB3A 3QBWA 4FWPA 5LJVA 2QWPA 4BR2A 5AZIB 4BRLA 2E1ZA 3FZKA 1HLUA 3OHRA 3H45C 2IVNA 3RSEA 1S22A 1T6CA 3AAQA 4BVPA 2I7NA 3FZLA 1TYQA 1XC3A 2E2PA 3BEXA 1NGJA 1NGAA 3ATVA 3CJ1A 5FPEA 3CQYA 1HPMA 5AZJB 2FF6A 2W41A 3SK3A 1MA9B 3DXKA 4DHYA 3L6QA 3IMXA 1T6DA 5BN8A 4FOEA 2BTFA 4BREA 3U9ZA 5TKYA 3DWLA 4FO0A 3EKUA 4IZ9A 2P9KA 5EX5A 2IVPA 3QDKA 4FPAA 4MO4A 4EAHD 4IWVA 2NZTA 2P9LB 4CZFA 1U6ZA 5ADXA 3WXKA 4JD2A 2P9NB 3VGLA 3FGUA 1BOTO 4JAXA 4CBXA 3AY9A 1HUXA 3TPQA 1X9JA 1XUPO 1LOTB 2Q2RA 4MLEA 1WOQA 1KAYA 1QHAA 3S41A 3H6EA 1ATRA 1NGEA 3WUHA 1YUWA 2QWRA 4A2BA 1SAZA 4QS7A 1NGFA 2GUPA 3LDNA 3MMVA 4BROA 4CD3A 4QS8A 3RSEB 2YHXA 3ENOA 2W40A 1NWKA 3LL3A 4AM7A 4PL7A 5AQQA 3VENA 4FWKA 1DKGD 3DXKB 3FLCO 3J8AA 4B1WB 4JNEA 3UKUA 2KHOA 1ATSA 3ULEA 5AQPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2WTUA 4DV2K 1YVNA 2XY6A 1Z25A 2W00A 5AFUA 5LY3A 1BWFO 3THWB 3P4IA 3GL1A 4C8KA 4BDYA 2P9KB 4Z94A 3ATUA 4DG1A 1Q81O 5IT9O 1RDBA 1SKWA 1VHXA 2HBJA 5BREA 2N69A 2IS3A 1BA0A 4FLTA 2HHTA 3NFAA 5AQWA 4C1NI 1JLGA 4NLCA 2G8FA 5A2QO 3OS1A 1OH6A 1JKHA 3C94A 1LQIA 1RDAA 1HNXK 3CCVN 2GBZA 1YJNN 5AQKA 3IFRA 4CZIA 4WQ4C 4HWIA 4AQYK 1IKXA 4DV3K 4HUGA 3HOSA 3D0PA 3CJ7A 1C1BA 3JS6A 3KC6A 3KOYA 3L3UA 4FWSA 3KOZA 5ELZA 4Z0UA 2KKZA 1S1WA 2BRZA 1VRTA 2ZQBA 1X3MA 4GKJK 2E2FA 1J53A 2V7ZA 4PKGA 3CMAN 4GV6A 3ZSRA 4MLHA 1S1XA 4CGJA 2MZ0A 1X9WA 2LI7A 3HBTA 4YOWA 4DU4A 3MWPA 2LJMA 1IBLK 4BC5A 3V1QA 4BRAA 1QTMA 3FZHA 3F9MA 1DQ7A 4PWDA 4CJ5A 2QXLA 2HOEA 1RBTA 1S3XA 5AQGA 4GW6A 3PO5A 4XH4A 4XH1A 2KJAA 3GE1A 4CIGA 1A5VA 1T7BA 3PX4A 3AA3A 4CZHA 4FW2A 4CJTA 4CZEA 3WEEB 1QSYA 2HMPA 1HKGA 1VQPN 1WBBA 3HT3A 4LF5K 2VY6A 3CQXA 2WC9A 4IOXA 5KRSA 3HK2A 1TKXA 4EP4A 3TAEA 1BDGA 4H5WA 2NRVA 1KSPA 3O3HA 4FVMA 2LR3A 3CI5A 2HHHK 2GEMA 3O08A 3D2FA 4JEPA 2E3FA 4PA1A 1CZBA 1O1WA 3PSFA 4BG9A 5I9EB 1CN2A 5JLHA 1FKOA 1MR4A 2XO7A 1VSKA 3BP8A 3SPYA 2E88A 3WNGA 5LMNK 4GVEA 3BDPA 1K8KA 1IBKK 3ZSZA 3PX6A 3ASMA 4V19S 4AH9A 4FJ9A 2JWKA 4IJAA 3ID8A 5JVHL 1GLEG 4J2AA 5BR8K 4E7KA 1KVAA 3DOLA 4JKGA 3C6UA 1GLJO 1VQ5N 1YHQN 1BK8A 1EO1A 1UA1A 4IEEA 3CPWM 4H4MA 1N5YA 2P9IA 3O80A 4CF2A 1WNSA 4DV6K 4B9VA 3SUNA 1HPZA 1J5OA 1E4GT 5GAHP 3QEXA 3WXMB 4JV5K 1KQSM 1I6FA 1NM1A 3CJ9A 4I2QA 3HYFA 4AHSA 4JKDA 1VQKN 3DLKA 2XY7A 2NLXA 4E72A 1H1VA 1I6GA 1ZBFA 3PSIA 2HNDA 1DT9A 1RDCA 2GV9A 4WE1A 3OYDA 3SQ0A 4DR4K 2YJFA 1Z26A 4KTQA 2G8IA 2D0AA 1TUYA 3W0LA 2PBDA 3OYBA 4YNQA 4B1ZA 2V51B 1K8BA 3E9PA 1JLFA 3A5MC 2F9WA 3OS2A 4CIEA 4JKEA 2Q31A 4JHDA 4CJSA 2IC3A 3AA2A 1SEGA 2KW4A 5DMRA 2YNGA 1LCUA 4O4GA 1WN7A 1HYZA 1ZU3A 4DLGA 2Z1JA 3VQBA 3DM2A 2A40A 3IAYA 3VEXA 3EL2A 3KOXA 3E1YA 3U8XA 2RF2A 1U04A 1QS4A 2KZZA 3VF4A 4KTZA 3CQ8A 1T3VA 4BRNA 4DV4K 4ICLA 2ZM6K 1NMDA 1SZ2A 3O9TA 2XY5A 3QFUA 4BR5A 4DWIA 3HM9A 5C2FA 4DQRA 4BQZA 1NRBA 1Q86O 5C12A 5AQMA 3M3ZA 3V9SA 2E4LA 3OVNA 1W7AA 3MN7A 2GELA 1L5UA 3M1FA 2VGMA 2BDPA 3HPHA 5C42A 4DV0K 3VQAA 1XNQK 2NRWA 3CFOA 2ITGA 1X9MA 1ICAA 2HW3A 2YI1A 2A3ZA 4O0JA 3LDOA 1S6QA 3FE1A 3AA4A 3KZBA 4B9SA 4GVMA 1S9EA 4Y0WA 1L4VA 3OYKA 3CJAA 1U2VB 3K5MA 3OBWA 3VF6A 4DR6K 4CHQA 4H5TA 3ZEUA 5FRMA 4BR7A 3M8PA 2E6LA 2P9PA 1ZFUA 2YHYA 4JLHA 1G99A 1IV0A 2GMOA 1NK4A 3WNEA 2E3GA 1B9FA 3C6AA 3D2EA 3L4QA 4JI0K 1ZBUA 3G6EN 3DRPA 2WUSA 5AQIA 3VEWA 4K8ZA 2KLAA 3NHGA 3VTIA 3R9PA 2X6SA 1OH8A 1NOYA 5BPNA 3ULDA 1EP4A 3NBPA 3I0SA 1HNWK 3PO4A 3EEQA 4JI6K 4E7IA 3G10A 2YC1C 4FM1A 3UIQA 4JD2B 3G0ZA 1MU2A 2W42A 1N34K 1EETA 3J7AP 2XY8A 2ZJRL 2LKBA 3ZSOA 3KK2A 3H46O 1NKCA 3NGYA 5EXWA 4CZJA 3B6OA 2D56A 3H08A 4I7FA 1WSEA 4C8NA 4MDBA 2BUPA 3VGMA 1VQ6N 3NF9A 2YV0X 4E7JA 4FWLA 4FLVA 3DXMB 2P9LA 3VQQA 4CJRA 3CFPA 4CBWA 3O3FA 5BRFA 4IKFA 1HQEA 4CEFA 2D0BA 4DUZK 4BY9C 1ZBSA 2YKNA 1RBSA 5KRTA 3M5RA 5C15A 1EX4A 1QSLA 1XQSC 1S6PA 5LMUK 3SUOA 1RFQA 1OMYA 4DB3A 3QBWA 4FWPA 1D8YA 4CJ3A 1TV6A 2QWPA 5LJVA 1XWLA 1IH7A 1VK0A 2E1ZA 4A57A 1WSGA 3OW2M 5M1OA 3VA0A 2IVNA 3F2KA 2PYJA 2I7NA 3TR8A 3PIOL 3OJSA 3BEXA 3FZLA 4BGAA 1NGJA 3CQYA 4FYDA 2FF6A 4Y1CA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2WTU A;  4DV2 K;  1YVN A;  2XY6 A;  1Z25 A;  2W00 A;  5AFU A;  5LY3 A;  1BWF O;  3THW B;  3P4I A;  3GL1 A;  4C8K A;  4BDY A;  2P9K B;  4Z94 A;  3ATU A;  4DG1 A;  1Q81 O;  5IT9 O;  1RDB A;  1SKW A;  1VHX A;  2HBJ A;  5BRE A;  2N69 A;  2IS3 A;  1BA0 A;  4FLT A;  2HHT A;  3NFA A;  5AQW A;  4C1N I;  1JLG A;  4NLC A;  2G8F A;  5A2Q O;  3OS1 A;  1OH6 A;  1JKH A;  3C94 A;  1LQI A;  1RDA A;  1HNX K;  3CCV N;  2GBZ A;  1YJN N;  5AQK A;  3IFR A;  4CZI A;  4WQ4 C;  4HWI A;  4AQY K;  1IKX A;  4DV3 K;  4HUG A;  3HOS A;  3D0P A;  3CJ7 A;  1C1B A;  3JS6 A;  3KC6 A;  3KOY A;  3L3U A;  4FWS A;  3KOZ A;  5ELZ A;  4Z0U A;  2KKZ A;  1S1W A;  2BRZ A;  1VRT A;  2ZQB A;  1X3M A;  4GKJ K;  2E2F A;  1J53 A;  2V7Z A;  4PKG A;  3CMA N;  4GV6 A;  3ZSR A;  4MLH A;  1S1X A;  4CGJ A;  2MZ0 A;  1X9W A;  2LI7 A;  3HBT A;  4YOW A;  4DU4 A;  3MWP A;  2LJM A;  1IBL K;  4BC5 A;  3V1Q A;  4BRA A;  1QTM A;  3FZH A;  3F9M A;  1DQ7 A;  4PWD A;  4CJ5 A;  2QXL A;  2HOE A;  1RBT A;  1S3X A;  5AQG A;  4GW6 A;  3PO5 A;  4XH4 A;  4XH1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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