5BN8A

Crystal structure of nucleotide-free human hsp70 nbd.
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Nucleotide binding to variants of the HSP70-NBD.
rcsb
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1A
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 127
structure length 379
sequence length 379
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 5bn8A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn8A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5bn8A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 5bn8A04
5AQFA 1RGIA 4B1VA 2H3GX 5EY4A 1LCUA 4CJ7A 2VYPA 4H5RA 2AP1A 4CZMA 4ISEA 4FSVA 3CERA 4CZGA 4K42A 1BA1A 1NGJA 5AZJA 3VPZA 1T6CA 2J4RA 5JICA 4CZHA 1BDGA 1Q18A 4JHDB 1ZXOA 2FF6A 3I33A 2VCPA 4PKGA 2W41A 5KPZA 2GELA 2QWOA 3MK6A 3FGUA 3MN7A 1TUUA 3F9MA 1GLAG 4BC2A 1ATSA 3C0BA 3VF4A 2IIRA 3VETA 4CZLA 1GLDG 1C0GA 4BR0A 1HLUA 3CJ1A 1HKGA 3MCPA 5AQIA 1EQYA 2CGKA 1U6ZA 3VESA 4CD1A 2FSNA 4IWVA 2AA4A 4QS8A 4B1ZA 5AR0A 2A42A 3EN9A 3EKSA 3MN5A 4HTLA 1GLCG 3SJHA 1Z05A 5BRFA 2D1KA 4FOIA 4JHDA 2ASPA 3TU5A 2D0OA 3VENA 3OHRA 3ENHA 3ZETB 5KPRA 2Q1NA 4EHTA 1NMDA 5B8HA 2HF4A 1GLFO 4EHUA 2VWBA 4BRPA 4H0YB 2DPNA 4MO4A 4AM7A 5BPLA 1NLVA 5LJVA 3CJCA 4BRHA 3LDQA 3CJAA 3A5NC 1S3XA 2V7ZA 2PAVA 2E1YA 3BF3A 4B1UB 3LL3A 4BR2A 1KAYA 1BWFO 2QM1A 4BRLA 4BRGA 1OKJA 5ELZA 2FSJA 4A62A 4BR7A 5AQRA 1JCFA 1YAGA 3GOIA 3ZEUB 2ASOA 3WXJA 1KAZA 1YXQA 3M6GA 5AQXA 3O1WA 3VF6A 4JAXA 3QFPA 2E2NA 2E88A 4BVOA 1KXPA 3QB0A 4H5NA 4CI6A 2YHWA 4WYBA 3VGMA 3LM2A 4BRMA 4FPAA 2IVPA 4YDUC 4H03B 3BUZB 5TKYA 3AAQA 4NB4A 3WXLA 5LJWA 5ADXH 2ZGYA 4BC5A 3DJCA 3SMPA 3WQTA 5AZJB 2E2PA 3H45C 3MN6A 1V4SA 3VF2A 1NGEA 1GLLO 1BU6O 1G99A 3H1VX 4Y0WA 3ULEA 1RDWX 4HWIA 3HI0A 4H0OA 3H46O 1MDUB 2ZWHA 2CH6A 2Q0RA 1D4XA 1NBWA 4K25A 5AQMA 5E84A 2V51B 3WXKA 4DCHA 3WEEA 5BR9A 5AQVA 4JN4A 2ZF5O 3AY9A 4J8FA 4A2AA 4BRFA 5BN8A 1CZAN 3GDQA 3ID8A 2Q31A 3S41A 4H0VB 3SLCA 4E1JA 4BC3A 3G25A 3LDLA 4BR9A 3A5MC 4ISFA 3UKUB 2HMPA 4BRKA 4CZJA 3WXIA 5LY3A 2GWJA 2P9SA 5AQHA 1JCEA 1IG8A 3L4IA 3VEYA 3ZX3A 3U9ZA 2I7PA 4GNIA 3W3DA 4H5WA 3U9DA 1HJOA 4EAHD 4BQLA 2D4WA 2E1ZA 1QZ5A 3C7NA 2HF3A 3VOVA 4BG8A 1T6DA 3CIPA 5AQOA 3MN9A 5AQKA 1ZBSA 4WQ5C 3D2FB 5EXWA 3B8AX 1ATRA 4BGAA 1T44A 3UE5A 3CJ7A 3FZFA 4WQ4C 4BVPA 4M7XA 3CQXA 4PKHA 4H0XB 2P9LA 4QS9A 2QWMA 4FWRA 3MDQA 3UKUA 1V4TA 4BR4A 3VEWA 4WQ4A 4B1XB 4CD3A 3FZLA 3L0QA 3MMVA 3LDNA 2UYTA 4H5TA 2E2QA 4BRQA 3VEZA 2GTDA 3EO3A 3GG4A 3CETA 3A8YA 4B9QA 1LOTB 5AQLA 5AQQA 2IVOA 2P9IB 1WOQA 3LDOA 2Q97A 4PL8A 4B1YB 4IJAA 2P9KB 3D2FA 3D7EO 1NGDA 2V52B 1ATNA 5KPTA 3ZX2A 3O5BA 3DAWA 5AFUH 2QWQA 3D2EB 5AQZA 3QICA 1E4FT 2E2OA 3ULEB 3KVGA 2YJFA 3HBTA 3EKUA 5JLHA 5CE3A 5BRDA 3EL2A 1MA9B 3CQYA 5FPMA 3CJ9A 3H6EA 3KZBA 4BG9A 1ESVA 4L3QA 4DHYA 3ATVA 3WEEB 3LDPA 3UKRB 4BR5A 5F0XA 4IXCA 3JS6A 4MO5A 1SQKA 3O1BA 4CZFA 5JMVA 1XUPO 2D0PA 2F9TA 3QBWA 4JD2A 2P9IA 2QWRA 3U8XA 3SMSA 4DB3A 4FWKA 2P9KA 5ADXA 4BRNA 2A5XA 1C0FA 4RCHA 2P9SB 4AM6A 1S22A 3DXKB 5I9EB 4BRIA 2V7YA 3I8BA 4YDUA 4KBOA 1DEJA 1NGHA 1DKGD 3D2EA 3JXUA 4BC4A 2GUPA 4A61A 1H1VA 3FE1A 2KHOA 5AZIB 1MWKA 4QS7A 1HUXA 2ITMA 3HZ6A 5JLFA 3R6MA 3C7NB 4FPBA 4I6MA 4BRCA 2W40A 3M1FA 3UKRA 3SK3A 3FFKB 1TYQB 4H0TB 3M3ZA 4IZ9A 1YUWA 1XC3A 5AQNA 4LC9B 4CBUA 4IJNA 2P9LB 1SAZA 1NGFA 2CGJA 1BG3A 3LM9A 3DWLA 1GLBG 1E4GT 1K8KA 3DXKA 3VGLA 2HOEA 2A3ZA 4FWOA 5KQ8A 3BF1A 5AZIA 3HM8A 3R8EA 1HKCA 2ZGZA 1U2VA 4CZKA 2P9UB 1SZ2A 2PBDA 5AQJA 1Z6RA 5FPEA 3QBXA 4B1WB 4FL9A 2FLOA 2YJEA 2Q2RA 1NGCA 4FWMA 3L6QA 2E8AA 1GLJO 3CJBA 4XEIA 3W0LA 2YHXA 1TYQA 3FZHA 3O6WA 5EX5A 1QZ6A 1XQSC 4EFHA 5BREA 4H0PA 2OANA 3FR0A 3O8MA 1DGKN 4FWPA 4WQ5A 5KQDA 1RFQA 3RSEA 4CZIA 4EIAA 4MLEA 5BPNA 4BRDA 4K43A 3HTVA 5AQPA 3O08A 4RTFD 4CBWA 1R59O 3FLCO 3O4WA 3IDHA 1HPMA 5AQGA 3CI5A 2NZTA 3IUCA 2A6AA 4BQZA 1HX1A 4XH4A 5FPNA 4BROA 4FWNA 5E26A 2F9WA 4XH5A 5AQTA 4JD2B 3UB5A 2P9UA 1MWMA 3A5LC 4A2BA 1NWKA 4FWQA 4F9OA 4FOEA 1NGBA 4CBXA 1BA0A 1YVNA 1ZC6A 1QQNA 3A0IX 4PL7A 3BP8A 5AFUA 3GL1A 4JNEA 2CH5A 1KAXA 3GE1A 3H1QA 4M63C 3DXMB 4Z94A 2Q0UA 2IVNA 5BPMA 3QMLA 2P9NB 2QWNA 2CGLA 4I6MB 2NRHA 3EZWA 1X9JA 4PKIA 5BRHA 1WUAA 3WUHA 2QXLA 2I7NA 2ASMA 1NM1A 3ENOA 4CZEA 1NGAA 5FPDA 1JCGA 4C23A 3VERA 1GLEG 3CHWA 5EOYA 3QFUA 4O5FA 3WQUA 2WUSA 1HKBA 1J6ZA 3FZMA 3AAPA 3P4IA 3QDKA 1BO5O 2QW9A 4IO8A 1P8ZA 2BUPA 2GWKA 1K8KB 2E20A 2NLXA 4O8KA 3WT0A 3ZX0A 1BUPA 2P9PB 2BTFA 3IFRA 4M7YA 4K41A 1X3NA 2A40A 4BGBA 2YCHA 3DXMA 5AQYA 5AQWA 5F1XA 1U2VB 4DQ8A 2P9NA 3ZETA 3H3OB 3KHYA 1TUYA 3U4LA 1QQMA 2YI1A 2GEMA 2FSKA 4ISGA 4H5VA 2A41A 4GY2B 4XH1A 4MLHA 4RWTA 3H3NO 4NO7A 5F2RA 4FWSA 3VEVA 1NGGA 3FZKA 3HSCA 3J8AA 3VGKA 3RSEB 1QQOA 3VEOA 1X3MA 2QWPA 1QHAA 1IJJA 4FWLA 5EVZA 3TPQA 3O80A 1Y64A 2QWLA 5AQUA 4BREA 5BN9A 2Q36A 1BOTO 3R9PA 3IMXA 4BRAA 3ATUA 2FF3B 3ZEUA 2YHYA 2P9PA 3VEXA 4FO0A 3BEXA 1NGIA 3GBTA 5AQSA 2EWSA 2FXUA 3A5OC 3AARA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3C6AA 1RGIA 4B1VA 4KRFA 4X64K 3DLLL 2ASCA 3L56A 4CJ7A 5EY4A 5HL7L 3ZT0A 4AEIA 3OVNA 4FSVA 4LF4K 3ZSVA 1RT5A 4K42A 1BA1A 1T7PA 1NGJA 4JK7A 5AZJA 3VQ9A 1T6CA 2E0HA 2J4RA 4ILGB 5JICA 3KLGA 1BDGA 2A7TA 4JHDB 1ZXOA 3I33A 3SUPA 4PKGA 1RDCA 4J2AA 4GKKK 2GELA 4W5RA 1UOCA 2YBRC 4BY9C 4FJMA 4BC2A 4YHHK 3PX0A 4FM1A 3C0BA 1POIA 4B9TA 5C0YA 3HL8A 4CZLA 1C0GA 3CJ1A 1HKGA 2LN8A 2Z1GA 4JS5A 3TAPA 3VESA 5JVGL 1RT2A 2AA4A 4MDAA 2LSNA 3SV3A 5AR0A 4FW1A 1EWRA 4H4MA 5C42A 4YOWA 1Q86O 3RWUA 2PZSA 2HBLA 1GLCG 3LZJA 1Z05A 1XHZA 4JHDA 2WBNA 4Z4CA 3TU5A 3OHRA 2G8IA 4R5PA 4Z4IA 1QS4A 1T7EA 4M3RA 3H08A 4DR3K 1WSFA 1B9DA 4LFAK 4N56A 1BRZA 1J9AA 3LALA 4CFAA 4G1QA 4H0YB 2DPNA 4Z4GA 5LJVA 3Q7BA 4BRHA 4EP5A 4LFBK 3LP2A 4OLAA 3AVBA 2NRXA 4FJNA 2HVIA 1XRSB 5I42A 1XMOK 3LL3A 2NRRA 5MLCQ 4AH9A 3QLHA 1KAYA 2QM1A 3KHWA 5HRNA 4B8CA 5ELZA 2FSJA 4BR7A 4FJ7A 5K14A 5AQRA 3WXJA 1KAZA 1EXQA 2YNIA 3NH2A 4O0IA 1Z25A 2VGNA 4YOVA 2E88A 3CPWM 1DLOA 4BVOA 1CZ9A 4H5NA 2UUAK 4DSIA 2YHWA 3VGMA 4M3UA 5TKYA 3BUZB 4DU1A 1RBSA 1SV5A 3L2UA 3AAQA 3RMDA 1S6QA 5D3GA 4KTWA 5ADXH 5AJ3K 4WCEL 1O13A 1IKYA 3SMPA 4OKEA 4DTXA 4CF2A 1CZBA 2E2PA 3AA5X 2X6NA 3H45C 1ASWA 5HOOA 1V4SA 1ASUA 3WNGA 3DRSA 2ZWHA 2CH6A 4AHTA 1C1CA 3MWPA 3KC6A 4K25A 3AO3A 2V51B 4DCHA 3S3MA 3WEEA 3VQCA 3TANA 3OW2M 2O8DB 4H0VB 5CZ2A 3RMCA 2RF2A 1N5YA 1X9WA 3O4NA 4CZJA 5LY3A 1WNSA 3WXIA 4BDPA 3D45A 4JKCA 3SAFA 1IG8A 5HRSA 3L4IA 4E7JA 3ZX3A 3G71N 2BH1A 2I7PA 3W3DA 3ZT1A 3U9DA 4G9ZA 1HJOA 1YT3A 4DR6K 3KD5E 1IV0A 4RW8A 1QZ5A 3K5NA 2VG5A 3CIPA 4DFKA 1TL1A 1NK8A 3L3VA 1RBTA 4QOZB 1ATRA 4JRPA 1T44A 3IRXA 4YOXA 3CCQN 4M3ZA 2LY5A 2KYQA 3CQXA 4NXNK 2O8DA 3LPUA 1YF5L 3O9RA 4QS9A 1LV5A 4MDBA 2KJAA 3E7RL 3VEWA 1M90O 4WQ4A 4AILC 2X74A 3FZLA 4IDHA 3LDNA 1KCFA 2UYTA 3LANA 4BRQA 3SUNA 4OX9K 2O8FA 3SQ1A 1RNHA 1IBKK 3JSMA 1WOQA 1CHZA 3KKSA 3E1YA 5J2MA 4PL8A 1SEGA 4B1YB 3QEVA 3NF8A 1RT7A 5FLXO 4FCYA 2HHHK 2Z1JA 3D7EO 1NGDA 1ATNA 3A2FA 5KI6A 5KPTA 4CECA 3CC2N 3LWLA 1U45A 2QWQA 5AQZA 3SQ0A 1RILA 1QTMA 2KZZA 3HPGA 2B5JA 2DFHA 4XJXA 3DLKA 5FPMA 4U67L 4BWMA 1S1VA 4YOYA 5FROA 1SN1A 3TAMA 2AJQA 1HYVA 5F0XA 3P39A 1ZYWA 1ZBIA 1UGLA 2LI7A 2D0PA 3ZSXA 3RVCA 1HJRA 3VQDA 4LF6K 2QWRA 3TAGA 4DQRA 2E6MA 4N47A 4CJRA 2NY9X 1OMYA 3VA3A 4HUEA 4CGDA 4BE7B 2NY8X 3NCIA 1C1AA 4RCHA 2F8TA 2HW3A 3L2RA 3D6RA 4KBOA 1KLMA 1RT6A 1DKGD 1KTQA 3BZKA 2XRIA 2GUPA 1UA0A 3NF6A 1H1VA 1S6PA 5C15A 4QS7A 2ITMA 4B9VA 4K8ZA 4FK0A 4UAFE 3SQ4A 4FPBA 4I6MA 3TTFA 5LMUK 4BRCA 4B8AB 3CMEN 3FFKB 4KB1A 4H0TB 3AA3A 4DWIA 1YUWA 4CE9A 4LC9B 3KD1E 1RT3A 2P9LB 3PO4A 1GPTA 1BG3A 1Q7YO 3CYMA 2RE2A 3G4SN 3QEPA 3E9PA 1K8KA 3VGLA 3I8DA 5LL6Z 2OYQA 3IG1A 2YX6A 4AF1A 4BE0A 4FW2A 1U2VA 4CZKA 4DS5A 4F3TA 1QVFM 5AQJA 4B1WB 3ZLJA 3T3FA 3CJBA 3AVHA 3FZHA 4CCHA 1IKVA 2LY6A 5EX5A 2YKMA 1U04A 4H0PA 2DY4A 2OANA 1F21A 5KQDA 1WWNA 1RFQA 4JI6K 3HTVA 3O08A 1R59O 3HVRA 2ZJQL 1TAQA 2XY8A 3KLFA 2ETJA 1CLQA 2RHKA 4BQZA 3OY9A 4AB0A 2HHSA 4A5BA 4PY5A 3UB5A 3HP6A 3KP0A 1ASVA 3A5LC 2B68A 1NWKA 3PIPL 4DS4A 3CCEN 4FOEA 3CCVN 4FLXA 4DTUA 1FH3A 1VRUA 4DG1A 3G10A 3IKMA 1ZC6A 4RW6A 3ZSRA 2G8HA 4PL7A 5AFUA 4H8KA 1LAWA 1KAXA 1XI1A 3DXMB 2O4GA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3C6A A;  1RGI A;  4B1V A;  4KRF A;  4X64 K;  3DLL L;  2ASC A;  3L56 A;  4CJ7 A;  5EY4 A;  5HL7 L;  3ZT0 A;  4AEI A;  3OVN A;  4FSV A;  4LF4 K;  3ZSV A;  1RT5 A;  4K42 A;  1BA1 A;  1T7P A;  1NGJ A;  4JK7 A;  5AZJ A;  3VQ9 A;  1T6C A;  2E0H A;  2J4R A;  4ILG B;  5JIC A;  3KLG A;  1BDG A;  2A7T A;  4JHD B;  1ZXO A;  3I33 A;  3SUP A;  4PKG A;  1RDC A;  4J2A A;  4GKK K;  2GEL A;  4W5R A;  1UOC A;  2YBR C;  4BY9 C;  4FJM A;  4BC2 A;  4YHH K;  3PX0 A;  4FM1 A;  3C0B A;  1POI A;  4B9T A;  5C0Y A;  3HL8 A;  4CZL A;  1C0G A;  3CJ1 A;  1HKG A;  2LN8 A;  2Z1G A;  4JS5 A;  3TAP A;  3VES A;  5JVG L;  1RT2 A;  2AA4 A;  4MDA A;  2LSN A;  3SV3 A;  5AR0 A;  4FW1 A;  1EWR A;  4H4M A;  5C42 A;  4YOW A;  1Q86 O;  3RWU A;  2PZS A;  2HBL A;  1GLC G;  3LZJ A;  1Z05 A;  1XHZ A;  4JHD A;  2WBN A;  4Z4C A;  3TU5 A;  3OHR A;  2G8I A;  4R5P A;  4Z4I A;  1QS4 A;  1T7E A;  4M3R A;  3H08 A;  4DR3 K;  1WSF A;  1B9D A;  4LFA K;  4N56 A;  1BRZ A;  1J9A A;  3LAL A;  4CFA A;  4G1Q A;  4H0Y B;  2DPN A;  4Z4G A;  5LJV A;  3Q7B A; 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