5BR9A

Crystal structure of an uncharacterized protein with similarity to peptidase yeaz from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
217
structure length
217
Chain Sequence
b'HMSTLLALDTSTEACSVALLHEGRALSHYEVIPRLHAQRLLPMVRDLLDEAGVALSAVDAIAFGRGPGAFTGVRIAIGVVQGLAFALQRPVLAVSDLAILAQRAYREQGAERVAAAIDARMDEVYWGCYQLQQGEMRLAGSEAVLPPERVAVPWDAAAADWFGAGTGWGYVERMPQRPVALDASLLPHAEDLLSLAGFAWARGEGVEAEQALPVYLR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of an uncharacterized protein with similarity to peptidase YEAZ from Pseudomonas aeruginosa
rcsb
molecule keywords Uncharacterized protein
source organism Pseudomonas aeruginosa (strain atcc 15692 / pao1 / 1c / prs 101 / lmg 12228)
molecule tags Unknown function
total genus 63
structure length 217
sequence length 217
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00814 Peptidase_M22 Glycoprotease family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5br9A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5br9A02
2PAVA 4BR4A 4YDUA 3UKRA 3KHYA 1KAXA 2FLOA 3QB0A 2UYTA 1T6CA 4PKGA 3VEWA 4A61A 5F2RA 1XC3A 3DJCA 4BQZA 2OANA 4AM7A 1T44A 1JCFA 2FF6A 1ESVA 3DXKA 4JAXA 4H5TA 3D2FA 4JHDB 3O80A 4JD2B 4O5FA 5AQKA 1KAYA 2J4RA 5AZIB 2NRHA 1QQMA 2GUPA 4FWKA 5KPTA 4BC3A 1RDWX 1QZ5A 3MK6A 3H46O 3VEXA 3O8MA 3RSEB 4DQ8A 5AQYA 4XH5A 4BRPA 5JLFA 1SAZA 2A6AA 3CJCA 2FSKA 4BR0A 1E4FT 3FZLA 2BUPA 3EKUA 3EL2A 3EZWA 4BRLA 1NM1A 2IVNA 3JXUA 3TU5A 2P9UA 3I33A 4BR9A 2CH6A 4PL8A 5LJWA 2FXUA 4K42A 3O4WA 3CJ9A 1GLLO 3CJAA 1BA1A 3VEVA 4F9OA 3QBWA 1NGDA 3BEXA 1GLBG 3L4IA 2D4WA 3B8AX 3GBTA 1KXPA 3FZFA 2H3GX 1LCUA 4CBWA 1DKGD 1TUYA 3QBXA 4K25A 5AQFA 4FWPA 4I6MA 4FOEA 1ZXOA 3O5BA 3D2EA 4WQ5C 1GLCG 3GOIA 3UKUA 3BF1A 2E1YA 5AQSA 4BRQA 2P9UB 4BRAA 1BDGA 5JLHA 5KPZA 1V4SA 2A5XA 2WUSA 1ZBSA 3U8XA 3HM8A 3S41A 3U9ZA 3WQUA 4QS9A 5AFUH 4WQ4C 3SJHA 3VGMA 3DWLA 3H1VX 3ATUA 5AQXA 3FLCO 3H3OB 1RGIA 3WXJA 1BWFO 2P9LA 4NB4A 4EHTA 2NLXA 2Q97A 2QXLA 4B1UB 4BRKA 3CQYA 4A2AA 4M7YA 2V51B 2E1ZA 2ASPA 3CJBA 2GEMA 5CE3A 4J8FA 3ZEUA 3M3ZA 5ADXH 3QFPA 2QWLA 4IO8A 4FWLA 3SK3A 3U4LA 3BUZB 4H0OA 1HKGA 4BRHA 3A5OC 4BVPA 3DXMB 4XH1A 2E8AA 2P9LB 3MCPA 2FF3B 3VEYA 3VGKA 4FWNA 1XUPO 4JHDA 5BN9A 3MN6A 2YHXA 3VGLA 4MLHA 5EX5A 1SZ2A 3JS6A 2VWBA 5AQLA 5AZIA 4CZMA 1U2VA 5BPMA 4RWTA 5EOYA 5AQNA 4H0TB 3HI0A 3MN9A 1YXQA 1MWKA 2EWSA 4M63C 5EXWA 5KQDA 1BG3A 4L3QA 3ZX2A 4BC5A 1DEJA 2A40A 4FOIA 3TPQA 1ATRA 3RSEA 2Q0RA 1NGAA 3HBTA 1BUPA 3L0QA 4GY2B 4Y0WA 4BQLA 1HX1A 1K8KB 1NWKA 4BRCA 5BPLA 1S3XA 3ULEB 1YUWA 4H5NA 4MO4A 5KQ8A 3F9MA 3G25A 4RTFD 1LOTB 1HKCA 5BN8A 3VOVA 4BRMA 3A0IX 3KZBA 2ZF5O 1U2VB 4GNIA 4CZJA 1TUUA 3LDPA 2IVOA 3CERA 4H5VA 2HF3A 1NGFA 1C0FA 3ID8A 3FZMA 4MLEA 3CJ1A 1QQOA 2P9IA 3CQXA 4BR5A 1HLUA 2E20A 3H45C 3M6GA 3LDOA 2ASOA 4FSVA 4FWMA 1IJJA 3VETA 2P9NB 4BRGA 5BPNA 4DCHA 3QDKA 4YDUC 5AQVA 1J6ZA 4EAHD 3MN5A 3H6EA 1GLJO 5AQHA 3FZHA 3VEZA 1BO5O 1HKBA 2A41A 2QWQA 2P9KA 3A5MC 4FPAA 2Q1NA 3O1BA 3J8AA 4B9QA 1NGCA 2P9IB 4K43A 3O08A 3W0LA 3FZKA 4O8KA 3AARA 1XQSC 3DAWA 1T6DA 2QWPA 4CJ7A 3VF6A 2V7YA 4ISGA 2YJFA 5FPDA 1GLEG 5BREA 5AQJA 3W3DA 2YI1A 2HMPA 3WUHA 2P9SA 2GTDA 3HTVA 3I8BA 1BOTO 2CGLA 4H0YB 5ADXA 3CI5A 3WXIA 4E1JA 5I9EB 4XEIA 4EFHA 5FPNA 5JICA 3FR0A 5KPRA 2Q2RA 5AQZA 3QFUA 2QWMA 3R9PA 2P9KB 3KVGA 3P4IA 4BGBA 1NGIA 3D7EO 4PKIA 3DXMA 1NGJA 5AQWA 4FWSA 4IZ9A 4LC9B 1X3NA 3SMSA 1SQKA 4AM6A 4CZFA 5F1XA 2CGJA 4KBOA 4EHUA 5B8HA 1GLDG 2P9SB 3MDQA 1RFQA 2VCPA 1V4TA 2YJEA 3LL3A 5EY4A 4C23A 4CBUA 2QWOA 3WXLA 4BG9A 1NGHA 4H0XB 1OKJA 2DPNA 2E2NA 3OHRA 4BC4A 1DGKN 1GLFO 1H1VA 1GLAG 1MA9B 2VYPA 4IJAA 3WQTA 2IIRA 1Z6RA 4BVOA 4CD1A 4HTLA 3LM9A 4MO5A 3CETA 5ELZA 4CI6A 1K8KA 1D4XA 3HZ6A 3VF2A 4H0VB 3FE1A 1NLVA 2QWNA 3EN9A 1E4GT 3ULEA 4ISEA 1HPMA 3R6MA 3SMPA 3MN7A 1NGGA 1Z05A 3GE1A 3QICA 1ATSA 5BR9A 2HOEA 3AAQA 1TYQB 4H03B 1MDUB 2CH5A 4DB3A 5AZJA 5BRHA 2ZGYA 3ZX3A 4CZGA 3EKSA 1X9JA 1WUAA 3BF3A 2QM1A 2P9PB 3H1QA 5AR0A 4B1VA 3FFKB 3FGUA 5FPEA 4FWRA 2ASMA 2KHOA 3AAPA 1WOQA 3VENA 3GDQA 2P9NA 5AQPA 3VEOA 3VPZA 4BR2A 4NO7A 3IFRA 4IXCA 4FO0A 3ENHA 1NMDA 2ZWHA 5JMVA 4BRIA 2FSJA 5AQIA 3UE5A 5AZJB 3LM2A 4Z94A 1QQNA 3A8YA 3WEEB 3BP8A 4BRFA 2A42A 4A62A 3A5LC 2GELA 5AQOA 3U9DA 4B1XB 3O6WA 3WXKA 3ZETB 4B1ZA 3CIPA 4CZLA 4BREA 3AY9A 2F9WA 4WQ5A 4DHYA 1NBWA 3O1WA 3VF4A 4CZKA 3IDHA 3UKRB 3HSCA 4BGAA 3LDQA 3EO3A 2D0PA 5AFUA 4WQ4A 4CZEA 3DXKB 4K41A 4WYBA 2W40A 4H5WA 1HUXA 2GWKA 4JNEA 5AQMA 1EQYA 3D2FB 1JCEA 4JN4A 4B1WB 3UB5A 2I7NA 2NZTA 4ISFA 2IVPA 5E26A 4BRNA 1JCGA 1QHAA 4CD3A 1G99A 2Q0UA 5FPMA 4IWVA 5AQGA 5AQRA 3ZX0A 3IUCA 4BRDA 1IG8A 1P8ZA 2Q36A 2D0OA 1X3MA 2I7PA 4HWIA 2GWJA 4PKHA 1ATNA 4XH4A 4B1YB 1NGEA 3ATVA 4BC2A 4BROA 1MWMA 2E2QA 1HJOA 3ENOA 3GL1A 3LDLA 1BU6O 3MMVA 5LJVA 2A3ZA 2FSNA 4QS8A 2Q31A 1CZAN 4FPBA 2D1KA 3WT0A 4A2BA 2F9TA 5AQUA 4PL7A 1TYQA 4FWOA 5BRFA 2BTFA 2YHWA 2QW9A 3CHWA 5F0XA 1NGBA 3M1FA 4M7XA 4BG8A 1R59O 4FWQA 3SLCA 1BA0A 2W41A 4EIAA 2E88A 2YHYA 5AQQA 1C0GA 3H3NO 5EVZA 2ITMA 4BR7A 4H0PA 2P9PA 4RCHA 4I6MB 1QZ6A 3D2EB 5AQTA 2HF4A 5LY3A 2AP1A 3UKUB 4CBXA 1YVNA 2QWRA 3QMLA 3LDNA 3C7NA 3L6QA 4IJNA 3VERA 5BRDA 2YCHA 3A5NC 3IMXA 3CJ7A 4QS7A 1S22A 2CGKA 1KAZA 4CZIA 3GG4A 2ZGZA 4H5RA 1U6ZA 4CZHA 1Y64A 1ZC6A 3WEEA 5E84A 2V7ZA 2V52B 1Q18A 2AA4A 2E2PA 4JD2A 3VESA 5TKYA 3ZETA 2PBDA 1YAGA 4FL9A 2E2OA 3C0BA 3ZEUB 3R8EA 3C7NB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DTOA 3SCXA 4IEIA 4A5BA 4DFMA 3P39A 4JI0K 4H4OA 2UYTA 2NRRA 4A61A 5F2RA 1OH8A 3DLEA 4DLGA 1T44A 3DXKA 1S6PA 4NCGA 2E5LK 4DSLA 4O5FA 4DTNA 1KAYA 4CK1A 2XRIA 3HVTA 5AZIB 2NRHA 4ILGB 3ALYA 1QQMA 1ZBUA 4FWKA 4PQUA 3TSUA 1QVFM 4FVUA 1RDWX 3H46O 4X64K 4DQ8A 5AQYA 1N8RO 1SKSA 5M1PA 3TAEA 3KLIA 1SAZA 3CJCA 4C8OA 5C12A 2FSKA 2PY5A 4E19A 1JL2A 3V9UA 2IVNA 3JXUA 1CXQA 3TU5A 3AO2A 3CQ8A 5LJWA 1FK9A 4K42A 4IFYA 3THXB 1NK8A 1IBLK 3CC4N 5KI6A 3CD6N 4EZ9A 3VEVA 2XO7A 1RT3A 1P90A 3IS9A 3MEDA 3QBWA 4FJ9A 1EWRA 3BEXA 3ENBA 2DTUA 3OY9A 1NNEA 3P38A 3B8AX 1KXPA 3K58A 1W7AA 3QBXA 3ZT1A 2YNFA 1ZXOA 1RBVA 3O5BA 3D2EA 3NDKA 1GLCG 3TSQA 3M5RA 4BRAA 2P9UB 4DSEA 1IH7A 5KPZA 1KLMA 5M1OA 2YNHA 3PIPL 3L4QA 1VAZA 4QS9A 1JLCA 2D0CA 3H1VX 1KVCA 5M1QA 4DQSA 4Z4EA 3H3OB 1RGIA 3M8RA 2DY4A 1BWFO 4EHTA 2NLXA 5HOOA 2QXLA 3HM9A 2W42A 4JI8K 3NBPA 1E3MA 2V51B 1L3SA 3LWMA 2ASPA 5CE3A 4CF1A 3ZEUA 3NGYA 1TV6A 4B9SA 3QFPA 2QWLA 3THYA 4CEEA 3SK3A 4C8MA 1IBMK 1RCHA 3U4LA 5I3UA 3U3YA 4JKGB 4JKCA 1XI1A 3NFAA 3HP9A 2GUIA 3PO5A 1VQON 2PZSA 4DWIA 4XH1A 2Z1GA 2P9LB 3T1YK 3R1XA 1TAQA 1HNZK 1XUPO 1JLFA 3V9ZA 3VGLA 4MLHA 2ETJA 4CGHA 2B4JA 1SZ2A 2VWBA 4CZMA 1U2VA 4NYNA 3HVRA 4M63C 5EXWA 3ZX2A 4CGIA 2KFNA 3NVKA 1OVQA 3HBTA 1NWKA 1J5EK 4BRCA 1KSPA 2B5JA 1XNQK 3ULEB 3F9KA 3F9MA 3G25A 5T7BA 1VQPN 1HKCA 5BN8A 3CCLN 2IDOA 3R3LA 1HPZA 2ZF5O 4CZJA 3CCJN 2Z1IA 1TUUA 3OTOK 3U6FA 3CERA 3VMFB 2Q3SA 4B8CA 3I56N 3NVMA 1C0FA 3IG1A 3TARA 3FZMA 1UA0A 1NJZA 1VRUA 1QQOA 1BI4B 5GIPA 4XIUA 3M6GA 3WNEA 1L3VA 4DSKA 2ASOA 3QEPA 4CJKA 1IJJA 3VETA 3EE9A 1JL1A 3QDKA 1J6ZA 4EAHD 2VQEK 1GLJO 4YOUA 4MDAA 3IKMA 1RT7A 3LZIA 4A5AA 1HKBA 3K57A 1J53A 4IG0A 1T3VA 2HVIA 1NGCA 4K43A 3W0LA 3OA9A 4O8KA 1S5JA 1LWCA 4LFCK 4JLHA 2GBZA 3PLAA 5AQJA 4B3RK 4IDHA 5CYMA 4FJLA 3HTVA 4OVLA 1BOTO 4H0YB 1JXEA 4CEBA 1RT1A 4DR5K 4JI1K 5GIOA 1YTAA 3RRGA 4FJ8A 1REVA 2P9KB 1RTJA 3P4IA 2QI2A 3D7EO 4CHZA 3O3HA 4FWSA 1X3NA 1SQKA 1T8EA 3S9HA 2CGJA 3AVAA 5B8HA 4CIGA 1V4TA 2YJEA 2KW4A 4AILC 4B9UA 4C8KA 4CBUA 3WXLA 4OLAA 2DFHA 4KHQA 4GV6A 1Y97A 1GLFO 2NUBA 3KD5E 1HMVA 3ZT2A 4TSXA 1VQ8N 4BDPA 4MFBA 5ELZA 1HQEA 3MXJA 1NK7A 1NK0A 1K8KA 3VF2A 1D4XA 1QQCA 4M3TA 1KVBA 1TL1A 3RMBA 4ELTA 1NLVA 3EN9A 1SS6A 4K8ZA 1X9SA 4ISEA 3R6MA 5DK5A 3SMPA 5C0YA 4HVJA 1NGGA 3GE1A 2QXFA 1IV0A 3QICA 4WE1A 5BR9A 4DR4K 2FBTA 3AA4A 2WTUA 3AA5X 2VG6A 1S1UA 5BRHA 4EP5A 1CZ9A 5KRSA 5JVGL 4CZGA 2O8FA 3BF3A 2KTQA 4GW6A 3NCIA 3O3FA 2ASMA 4FZZA 5DM6L 1TAUA 3QEVA 4LF8K 4IFVA 4NO7A 1JXBA 1OH6A 2ZJPL 4E89A 3ENHA 4N41A 3ZSWA 2ITGA 4B9MA 3UE5A 1IBKK 4Z94A 3IAYA 3MEGA 4KHPK 3PIOL 3A5LC 3WXKA 4CZLA 3AY9A 1NBWA 5HRPA 3I55N 3CPWM 4CZKA 2E6MA 3AVMA 3V4IA 3UKRB 4N76A 4BGAA 3LDQA 3EO3A 4PA1A 3IRXA 3KKRA 4DR1K 3L3VA 4FLTA 4WYBA 2UXDK 1HUXA 4CJWA 4E7HA 2KKZA 1EQYA 2HVHA 1JCEA 3DOKA 3OYLA 4B9TA 1VQMN 2I7NA 3MX5A 3QERA 5HRSA 1B9DA 1JCGA 4KH5A 4BRNA 4CF0A 1QHAA 4ILHA 1CLQA 1G99A 4CK2A 3PY8A 3NF8A 4IWVA 3ZX0A 4IKFA 1YJWN 2E4LA 1IG8A 1MU2A 5GAGP 2D0OA 4QCLA 1F21A 1WN7A 1HNIA 4CE9A 4HWIA 3K5LA 4PKHA 4JKAA 4PWDA 4XH4A 4B1YB 1NGEA 4PUOA 1MWMA 5LJVA 2A3ZA 1BCOA 1K73O 3E9LA 4M42A 1ZBHA 1YJ9N 3RMCA 4RG8A 4PL7A 1YHQN 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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