5BRDA

Crystal structure of trypanosoma cruzi glucokinase in complex with inhibitor benz-glcn
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
367
structure length
367
Chain Sequence
MNIKELSLHELCEELKTPAWNVPLTFVGDVGGTSARMGFVREGKNDSVHACVTRYSMKRKDITELIEFFNEIIELMPASVIKRVKAGVINVPGPVTGGAVGGPFNNLKGIARLSDYPKALFPPGRSAILNDLEAGGFGVLAVSDAHVFSEYFGVMWEGTQWRTCEQEPAGSVIGRGRCLVLAPGTGLGSSLIYYNPMNQQHIVVPLELGSQTIPMRKDIDYIQTLHAELKLLPNYENMVSGAGLEFHYRQVVRGSRPPCSAGEIAKLASEGDANACKAMKKYHEYLMRVGSEASMALLPLTIVLVGDNIVNNAFFYRNPQNLKEMHREALNHEMERFGFQSRVTYLRQKKLLNLNLMGCYRCGLDLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Glucokinase 1, putative
publication title Structure-based approach to the identification of a novel group of selective glucosamine analogue inhibitors of Trypanosoma cruzi glucokinase.
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma cruzi (strain cl brener)
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
total genus 124
structure length 367
sequence length 367
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2015-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02685 Glucokinase Glucokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5brdA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 5brdA02
4BC3A 3IUCA 3HTVA 3UKRB 1GLAG 3QFUA 2P9UB 3M3ZA 3B8AX 4B1ZA 4M7YA 1HKCA 5AQPA 3DXKB 1HPMA 4RTFD 1TYQA 3A5LC 3KHYA 4H5RA 1LCUA 5ADXA 2ITMA 1K8KB 1ATSA 3VF6A 2YHXA 3ATVA 1XC3A 3CJ1A 4BVOA 2Q0UA 4FO0A 3R9PA 2VCPA 3BF1A 4E1JA 2UYTA 2W41A 1DKGD 3C0BA 1WUAA 3BUZB 1ATRA 4H03B 2WUSA 3QBXA 4JNEA 5AR0A 1RFQA 1S22A 5AQXA 3H1VX 3CERA 1C0FA 4BR5A 2HMPA 1S3XA 4EHTA 2FSJA 2E2PA 4QS9A 4YDUA 4B1UB 5E84A 5EX5A 2Q1NA 2IVNA 4B1YB 5AFUA 1HLUA 4BRNA 4CZIA 3L6QA 4FOEA 3EO3A 1NGBA 2EWSA 2P9SB 4DCHA 1HKBA 3GDQA 3QFPA 4CZJA 3WXKA 5LJVA 4PL8A 1Z05A 2A5XA 2ZWHA 4FWOA 2YJFA 2E2QA 1Q18A 3DXMA 2Q2RA 3WT0A 3U8XA 3VEOA 4BR2A 3FGUA 3LL3A 3UKUB 3VF2A 4ISFA 4FWKA 4O8KA 4BRDA 4A61A 4B9QA 4J8FA 4M7XA 1GLFO 3C7NA 2V51B 2FF6A 4CBWA 3UB5A 2GWJA 4MLHA 1HX1A 4H5NA 4RCHA 4PKIA 5ELZA 5AQQA 2E1YA 4FL9A 1QQOA 5AZIB 4DQ8A 1NGJA 3DAWA 3AY9A 2FSNA 3HI0A 2ZGZA 3EL2A 5AQRA 1NGDA 3M6GA 1NWKA 5F0XA 5AQSA 2HOEA 2QWLA 4BRCA 4MLEA 1QQMA 5JLHA 3WQUA 3VGLA 2CH5A 2CGKA 2D0PA 4WQ5C 5KPZA 3DWLA 2A41A 3O1WA 4CI6A 3CHWA 2YI1A 3O4WA 3VETA 2ASMA 3O1BA 4BRHA 5JICA 3D2EB 2E2NA 1BWFO 3VF4A 1GLBG 3ID8A 4BC5A 3TU5A 4BC4A 5LY3A 3FE1A 4EAHD 4CZHA 1NGCA 1TUUA 3WXIA 5AZJB 3BEXA 1HJOA 1GLEG 2NRHA 4PKGA 2QW9A 3HM8A 4H0XB 5LJWA 4A62A 3TPQA 1V4SA 1GLDG 3W3DA 4CBUA 2A3ZA 4I6MA 1QZ6A 5AQGA 2QWPA 1CZAN 3ZX3A 2V7ZA 4IXCA 4PL7A 3GG4A 2VYPA 3HBTA 3G25A 2FSKA 3RSEB 4BRPA 3LM2A 2D1KA 3VGMA 2P9KA 4JHDB 4BC2A 4BGBA 1HKGA 1MWMA 2Q0RA 3MK6A 5FPNA 3ZX2A 5BPLA 3FZLA 4FWNA 4FPAA 5BRHA 4H0TB 5BN9A 2GEMA 4JD2A 4WQ4A 2A6AA 3DJCA 1KAXA 3CI5A 2HF4A 2GTDA 3MCPA 3LDOA 3GL1A 5FPDA 2E1ZA 1NBWA 4H0YB 3CJ9A 5BRDA 2QWOA 1H1VA 3CIPA 4WYBA 3KZBA 1BG3A 1U2VB 3CJBA 4M63C 1QQNA 3SMSA 2YHYA 1BOTO 2Q97A 1YUWA 3BF3A 4H0PA 3CETA 3HSCA 5AQNA 3IMXA 5AQTA 4BREA 2ZGYA 4FPBA 3MDQA 4ISGA 1T6DA 1NM1A 3ATUA 1X3NA 3WEEA 2IVPA 4IJNA 4KBOA 3MN5A 2J4RA 5AQLA 2P9PA 3D2FB 1BA0A 2P9IB 4CZMA 1NGIA 4CZKA 4FWMA 2A42A 2QWQA 4BRKA 3A8YA 5FPEA 2P9NA 3H6EA 4GY2B 3ZEUA 1BUPA 1V4TA 2W40A 4FWSA 4BR7A 2ASOA 3UKRA 1SAZA 2QWMA 2QXLA 2P9UA 3FFKB 1RDWX 2OANA 3JS6A 3RSEA 4NO7A 3MN9A 4H5WA 1SQKA 3DXKA 3I8BA 3U4LA 1NLVA 4LC9B 1DEJA 1TUYA 4FWPA 1ATNA 5AQKA 4MO4A 4B1WB 3H46O 2IVOA 1K8KA 3O80A 5AQZA 1BA1A 4MO5A 5EY4A 3ULEB 2E8AA 2GWKA 3FZMA 5AQYA 3H1QA 1KAZA 4Y0WA 3CJCA 3FLCO 3L0QA 3AARA 4BR9A 4BG8A 4BRIA 5EVZA 3AAQA 4H5VA 3CQYA 4YDUC 3O6WA 4GNIA 1HUXA 2IIRA 3QMLA 3U9DA 1JCFA 4C23A 3U9ZA 2V52B 3VOVA 2E2OA 4XH5A 1Y64A 1ZC6A 3FZKA 4FSVA 1E4GT 3MMVA 3VPZA 1WOQA 2QWNA 3VESA 4CZGA 4Z94A 5AQVA 5BPMA 2P9IA 1MA9B 5EOYA 4DHYA 2P9SA 2A40A 5JMVA 3A5MC 4CZEA 2P9LB 4CD1A 1Z6RA 3MN7A 3R6MA 3CQXA 4K41A 4BRMA 2FF3B 5AQIA 4FWQA 2CH6A 3ENHA 1C0GA 2YJEA 3CJAA 4BRLA 1IJJA 1R59O 1BDGA 3AAPA 3L4IA 4BRGA 3KVGA 3MN6A 4FWLA 3VERA 1T44A 3IDHA 3UKUA 2QM1A 5BR9A 2D4WA 5AQJA 3GE1A 1RGIA 3VGKA 3FZFA 3P4IA 2I7PA 1KAYA 1ZXOA 2D0OA 2V7YA 3F9MA 3O08A 1E4FT 4HWIA 5AFUH 3WUHA 4EIAA 3QB0A 4CZFA 2E20A 3GOIA 4CZLA 4QS7A 3EKUA 3ENOA 3D7EO 5AZIA 3VEVA 3EN9A 4FOIA 1MWKA 1X3MA 3VEWA 4H0OA 2PAVA 3O8MA 3WXJA 3DXMB 2YHWA 3QICA 3BP8A 1D4XA 3S41A 4NB4A 5AQMA 3SJHA 4BVPA 3JXUA 5AQFA 1MDUB 3LDQA 3ZX0A 1NGEA 3C7NB 4IZ9A 1U6ZA 3D2EA 3VEYA 3W0LA 1XQSC 1IG8A 4BRAA 4EFHA 5AQHA 1YVNA 2HF3A 4BG9A 2AA4A 4F9OA 5BPNA 2CGLA 1OKJA 4IWVA 3H3OB 5AZJA 4BGAA 4XEIA 2H3GX 4IO8A 4BROA 3ZETB 3M1FA 5KPTA 2P9LA 4DB3A 3H45C 2BUPA 1GLLO 1GLCG 4CBXA 2BTFA 3EKSA 1SZ2A 2CGJA 1NGGA 4XH1A 5EXWA 3J8AA 4WQ4C 3SLCA 3OHRA 5B8HA 5CE3A 5FPMA 4JHDA 4QS8A 4B1XB 4WQ5A 3R8EA 4AM7A 5AQUA 1NGHA 3CJ7A 4CJ7A 3LDLA 4ISEA 4A2AA 3A5NC 4K43A 4BRQA 4RWTA 4IJAA 4A2BA 4BQLA 4I6MB 1YXQA 5E26A 2NZTA 3GBTA 4PKHA 4K25A 1EQYA 2E88A 2GUPA 3WQTA 5I9EB 2F9TA 2Q36A 2YCHA 4BR0A 3HZ6A 1U2VA 2ZF5O 3LM9A 1G99A 2P9KB 4FWRA 1KXPA 1NGAA 4BR4A 4EHUA 5KQDA 4XH4A 3SK3A 1TYQB 3I33A 4L3QA 3UE5A 3H3NO 5F2RA 1LOTB 3A0IX 3LDNA 2F9WA 2I7NA 4JD2B 5ADXH 5JLFA 3D2FA 3VEXA 3ZETA 2Q31A 1JCGA 3QDKA 5TKYA 1XUPO 1QHAA 1QZ5A 1BU6O 1YAGA 2FXUA 5BN8A 5AQOA 4CD3A 4BRFA 4H0VB 1T6CA 1P8ZA 2NLXA 3WXLA 4HTLA 5BREA 2FLOA 1NMDA 4B1VA 1DGKN 1GLJO 5AQWA 4AM6A 3A5OC 5BRFA 3SMPA 1BO5O 4K42A 1J6ZA 4O5FA 4JAXA 3QBWA 3WEEB 3FZHA 4H5TA 2ASPA 2DPNA 3LDPA 3O5BA 3VEZA 4BQZA 3VENA 2P9PB 1ESVA 1ZBSA 2PBDA 2GELA 1JCEA 5F1XA 1NGFA 3ULEA 2QWRA 4JN4A 5KPRA 2P9NB 3FR0A 1X9JA 2AP1A 5KQ8A 3ZEUB 3IFRA 2VWBA 3EZWA 2KHOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BC3A 3SCXA 2GV9A 4DR1K 3QEXA 2G8FA 4B1ZA 2W6LA 4CEQA 5IWAK 5C42A 1HPMA 4RTFD 3SPZA 5ADXA 2IC3A 3AA5X 4GKJK 3VQ9A 3OTOK 2YHXA 4OKKA 3M5RA 2HNZA 1RBRA 4FZXC 1RTJA 3C0BA 3KD5E 1XC9A 3G10A 4FLUA 2WUSA 4JNEA 1FKPA 1FXXA 1RFQA 4R5PA 2Z1HA 3CERA 4BR5A 3KK1A 1S3XA 4N56A 4ZTJA 1NK6A 4EHTA 3WNFA 2KW4A 1VQLN 2UXBK 1QS4A 4FCYA 4EP5A 5HRSA 4R79A 4CZIA 4F2RA 5DM7L 3CCQN 4KB1A 4FOEA 3NH2A 3CCSN 3EO3A 2P9SB 4IEEA 1SKSA 3P83D 4PL8A 4O4GA 1KSPA 1YIJN 3HM9A 2A5XA 2ZWHA 3MWPA 3PSIA 3C6UA 2D0CA 2E2QA 4NXNK 2Q2RA 3WT0A 1SL2A 4LF6K 3AVLA 3LL3A 3UKUB 3M8SA 4CIEA 4FWKA 1LAWA 1GLFO 4J2AA 4CJPA 2YV0X 3VQAA 1XHXA 3TAMA 2XRIA 5AQQA 2KZMA 5BR8K 4AHUA 4JI0K 2FSNA 1ZBFA 3M6GA 4V19S 4IDKA 1TK5A 2QWLA 4BRCA 1KC8O 3VMFB 5JLHA 5DK5A 2CH5A 3QNNA 1JLEA 1RDDA 5EU7A 3U3YA 3DWLA 2UUCK 1C1AA 2ASMA 3D2EB 1EETA 4FJGA 3MXMA 2O8CB 2E2NA 1VQ8N 3DLLL 3NDKA 4CFCA 4OLAA 5M1FA 3FE1A 4EAHD 4CZHA 3KLHA 1NGCA 1TUUA 4JYAK 3BEXA 1HJOA 4DSLA 1Y97A 1WAFA 2NRHA 2QW9A 4ELUA 1VQKN 1GLDG 3W3DA 4DU4A 5AQGA 1U48A 5CHIA 5CR4A 3SZ2A 1CZAN 4CW7B 1HPZA 2OA8A 2D0BA 4Z4IA 3D45A 4BDZA 3GG4A 2OCEA 4RW6A 3LP3A 1N8RO 1UA1A 4DS5A 3OYNA 4LF7K 3VGMA 3DRSA 4UQGA 2XY8A 4BC2A 4AHSA 3EE9A 4DFJA 4KH6A 3LAKA 1M1KO 4H0TB 2GEMA 3NF9A 4JD2A 4WQ4A 1QQCA 4GVEA 4CJFA 3NF7A 3ZSOA 3DJCA 1QSYA 5HLFA 5KGXA 4JS4A 1WAJA 3DOLA 4CEFA 1RT6A 4JKDA 1LAVA 4JI5K 2E1ZA 4H0YB 3TAPA 3C95A 3CJ9A 2QWOA 1P90A 4M63C 5M1QA 2NRRA 1VHXA 3BF3A 3HSCA 3KWGA 3IMXA 4LSLA 4BREA 2VWJA 2ZGYA 3MDQA 4ISGA 1VSDA 3HL8A 2Y1JA 3SV3A 4IJNA 4CHYA 3E1YA 4CEZA 3PIOL 4RW8A 3D2FB 4LFCK 4CZMA 2P9IB 2P9NA 3V9ZA 1BUPA 3SV4A 1V4TA 2JWKA 4FK0A 4FLZA 3UKRA 2Q3SA 3FFKB 3RMDA 4NO7A 1UOCA 3NAEA 3RTVA 1NLVA 1X9WA 4FWPA 4XIUA 5AQKA 3K58A 5GIPA 1XMOK 4MO4A 2KFNA 1K8KA 4DR2K 3ULEB 2XY5A 2GWKA 1LWEA 2HBKA 3FZMA 3KD1E 3CJCA 3FLCO 1OH7A 2F4VK 3DLKA 4AQYK 4H5VA 1ZBLA 3CQYA 2G8UA 1HUXA 3MXIA 1NU0A 1KVBA 2IIRA 4FLWA 3U9DA 4C23A 3U9ZA 4CK1A 1K9MO 1LWFA 3DMJA 4W5RA 1NNEA 3FZKA 1E4GT 2HHWA 3AA3A 4RG8A 2QK9A 1WOQA 2QWNA 4CZGA 3QEPA 1NKBA 3VA0A 4G9ZA 2P9IA 1BGXT 2Z1GA 4O55A 1TK8A 1MA9B 3ZLJA 3HP9A 5SWMA 1D9FA 4YNQA 3AA4A 3I0SA 3MN7A 1NK8A 1J53A 4K41A 2G8HA 2CH6A 4NYNA 1ZBHA 4YY3K 1VSHA 2YJEA 4BRLA 3O9UA 3L4IA 4DV2K 3UIQA 2YNFA 5M1KA 4K0KK 4JEPA 4JK7A 3P38A 1RDUA 3R3LA 2IGIA 3PO4A 2D0OA 3O08A 2ATQA 3QESA 1RT3A 3SQ0A 4NLCA 2UXDK 1XHZA 3KTQA 4QS7A 5AZIA 3VEVA 4KHQA 3K0SA 2P51A 3T69A 2XY7A 1S1UA 4H0OA 2PAVA 3IKMA 3WXJA 2O8FB 3SI6A 4CESA 2G8VA 2YNIA 5AQMA 4BVPA 3HXMA 1MDUB 1KFDA 4JI8K 3C7NB 2VQFK 3VEYA 4E1MA 1YVNA 3IS9A 2CGLA 2HVHA 3C65A 3CCRN 2HBLA 1HNVA 2H3GX 2QKBA 3RR8A 1VSLA 3H45C 1GLLO 5J2MA 1RT1A 1L3SA 4M3WA 4KHYA 5EXWA 2O4GA 4IOXA 3MECA 2O8DA 4C8NA 3TAQA 3N4PA 3WXMB 3L2VA 5B8HA 1JXBA 3V1OA 5CE3A 1BL3A 5FPMA 4AILC 4B1XB 3SQ1A 1A5VA 4WQ5A 4DSKA 4OO1J 3PSFA 1KLNA 5JS2A 4ISEA 3C94A 1VQ9N 3ENBA 4A2BA 4K8XA 1L3TA 3SUOA 2NZTA 3GBTA 3TR8A 3VQPA 1BQNA 5SZTA 4B9LA 4FLTA 4BE0A 1EQYA 3P31A 4ICLA 4CJEA 2Q36A 3TAFA 1VRTA 1HR0K 1VQ7N 1EWRA 1JKHA 4KREA 3LM9A 4FWRA 4O8UA 3F73A 3SK3A 1TYQB 3ZSQA 1QVFM 3UE5A 3NH0A 1LOTB 3QIOA 4BWJA 2UXCK 3OA9A 2F9WA 2I7NA 2BDPA 4B3MK 4M3ZA 4JKGB 3SBTA 3VEXA 4NYFA 3QDKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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