5BRDA

Crystal structure of trypanosoma cruzi glucokinase in complex with inhibitor benz-glcn
Total Genus 124
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
124
sequence length
367
structure length
367
Chain Sequence
MNIKELSLHELCEELKTPAWNVPLTFVGDVGGTSARMGFVREGKNDSVHACVTRYSMKRKDITELIEFFNEIIELMPASVIKRVKAGVINVPGPVTGGAVGGPFNNLKGIARLSDYPKALFPPGRSAILNDLEAGGFGVLAVSDAHVFSEYFGVMWEGTQWRTCEQEPAGSVIGRGRCLVLAPGTGLGSSLIYYNPMNQQHIVVPLELGSQTIPMRKDIDYIQTLHAELKLLPNYENMVSGAGLEFHYRQVVRGSRPPCSAGEIAKLASEGDANACKAMKKYHEYLMRVGSEASMALLPLTIVLVGDNIVNNAFFYRNPQNLKEMHREALNHEMERFGFQSRVTYLRQKKLLNLNLMGCYRCGLDLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glucokinase 1, putative
publication title Structure-based approach to the identification of a novel group of selective glucosamine analogue inhibitors of Trypanosoma cruzi glucokinase.
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma cruzi (strain cl brener)
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
total genus 124
structure length 367
sequence length 367
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2015-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02685 Glucokinase Glucokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5brdA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 5brdA02
1MWKA 4PKHA 5EY4A 2QW9A 2YI1A 4K41A 3I33A 3KZBA 3UE5A 3DXMA 3AY9A 4BC2A 4BG8A 4RWTA 1BA1A 1U2VA 3QICA 4IZ9A 4CZEA 4FPBA 1WOQA 3FFKB 4RTFD 4BVPA 1NGCA 3CJBA 4CZGA 2ZGZA 3IDHA 3KVGA 4CZJA 2W40A 2BTFA 2GELA 1GLFO 4CBWA 2E88A 3M3ZA 5AZJA 3SLCA 4JAXA 4M7XA 3D2EB 5AQPA 4BGBA 1RDWX 5KQ8A 1GLEG 3TU5A 3WXKA 5AQZA 4BRIA 2P9UB 3D7EO 3ULEB 5AQSA 2CH6A 3MN5A 2DPNA 4JHDA 3BP8A 3DXKA 2ASPA 3IMXA 1IJJA 1LCUA 1HJOA 1NGBA 4FWNA 3WQUA 3O4WA 1NLVA 4DHYA 5TKYA 2Q36A 2W41A 4FOEA 2A40A 4M7YA 3HTVA 2A3ZA 1KAYA 3R6MA 4BRGA 5BN9A 3CETA 3G25A 4H5TA 2P9KB 5BRFA 2D1KA 3FZMA 2J4RA 4BQZA 2FXUA 4WQ5A 4PKGA 3VF4A 4BRQA 4BVOA 5JLHA 2QWPA 3SMSA 4BRFA 5E26A 1YVNA 4QS9A 4AM6A 5AFUH 1X9JA 1JCFA 3VF2A 1E4FT 3L6QA 2P9IB 4WQ5C 3QBXA 2YCHA 1BA0A 1NGHA 3A0IX 1YAGA 3HI0A 4NO7A 4BRMA 2FSKA 2IIRA 4JD2A 2E2PA 3H3OB 4B1VA 4Y0WA 2FF6A 2GUPA 1ZBSA 2P9PA 2P9LA 3ZEUA 2ASOA 3RSEA 4CZHA 1T6CA 1D4XA 5ADXA 4XH4A 1BOTO 5EVZA 4YDUA 5AQRA 5BRHA 2A5XA 3ENOA 3O1WA 1TUYA 3HZ6A 4J8FA 4FWMA 3M1FA 1ATRA 2QXLA 5AQHA 4BRHA 4BR4A 3O5BA 5FPMA 2ASMA 4YDUC 3UKRB 4RCHA 5AQMA 3VEVA 1H1VA 3O8MA 5EXWA 1S3XA 2QWQA 5F2RA 1QQMA 1QQOA 1YUWA 2CGJA 1HKCA 2ITMA 3EKSA 5AQQA 1T44A 3HM8A 5E84A 3U4LA 4BC4A 4DB3A 5AZIB 1WUAA 3C7NB 1GLDG 2KHOA 5FPEA 2BUPA 1DEJA 4EHUA 4IO8A 3U9ZA 2D4WA 4H5WA 3ATUA 2A6AA 4CBXA 3A5LC 3VEZA 2Q31A 1HKGA 2QWMA 5ADXH 3CJ9A 4H5RA 4IJNA 1C0GA 4HTLA 1NGFA 4IJAA 4EIAA 3H45C 3WT0A 4I6MB 3S41A 4LC9B 3U8XA 4A2BA 4DCHA 4B1WB 3QFPA 4ISEA 5AQVA 4BRPA 3A5NC 5BPLA 3VOVA 1MA9B 1ZXOA 2V7YA 1X3NA 2IVOA 2V51B 1ATNA 4DQ8A 4PL8A 5BRDA 2FSJA 3MN9A 4QS8A 5AQNA 2CGLA 3LL3A 4BR0A 4B9QA 4CZFA 4XH5A 3LDOA 4BR5A 1DKGD 2H3GX 4CI6A 1LOTB 2Q1NA 1V4SA 3J8AA 3JS6A 2NZTA 1CZAN 1T6DA 4H5NA 2Q0UA 4ISFA 4PL7A 4M63C 3MDQA 3W3DA 3D2EA 3ATVA 3DXMB 4CBUA 1IG8A 3BF3A 3ULEA 4BRNA 2Q97A 4BC5A 4F9OA 5BR9A 3IUCA 2ZWHA 3DAWA 5AQKA 2YJEA 2P9NA 4BC3A 4MLHA 2QM1A 3O6WA 2IVPA 2YJFA 3MN7A 5AZJB 3VGLA 3VF6A 4B1ZA 3FZHA 1HLUA 3W0LA 3EN9A 1XQSC 2D0OA 1Z6RA 3AAPA 5JMVA 4BG9A 4BROA 3VEOA 1QQNA 4JHDB 3R8EA 1G99A 3ZETA 4B1UB 2FLOA 4AM7A 3WXIA 3U9DA 3WXJA 4Z94A 4L3QA 1NGAA 3ENHA 4H0OA 3GBTA 3CJCA 4B1YB 4A2AA 3LDLA 1QZ5A 1TUUA 4MO4A 5AQTA 2YHYA 2V7ZA 4H0TB 5KQDA 2GTDA 3GOIA 4EFHA 1BG3A 4MLEA 1OKJA 3D2FA 3OHRA 1NGDA 4E1JA 3EKUA 3O1BA 1SAZA 5LJWA 3H6EA 4BREA 2E2QA 2HMPA 3WEEA 4FOIA 3ZX0A 3BF1A 2GEMA 1XC3A 3FZFA 3LM9A 4CZMA 4JD2B 4A61A 5LY3A 1JCGA 1NGJA 3BUZB 2VCPA 4FSVA 1KAXA 4CJ7A 1GLAG 1J6ZA 2E8AA 3ZEUB 3QFUA 4CZKA 3RSEB 3GE1A 3L0QA 4O8KA 3CQYA 4JNEA 5KPTA 2E1ZA 3CIPA 3FZLA 1YXQA 1SZ2A 3A8YA 3H3NO 3UB5A 3ID8A 5AQIA 5AR0A 5BPMA 1BDGA 3TPQA 3WQTA 1QHAA 1HX1A 4FWQA 5ELZA 5KPZA 3QMLA 3EO3A 5AQLA 1TYQA 3H1QA 4WQ4A 3MMVA 2P9SA 2HF4A 3HBTA 4BRKA 3VESA 1BO5O 2E2OA 3F9MA 1MWMA 4NB4A 4CD1A 1K8KA 3ZX3A 3LDQA 4FWOA 1RFQA 3MN6A 1U6ZA 4FWRA 3UKUB 3SMPA 4WQ4C 4XEIA 5BPNA 2PAVA 5AQUA 4K43A 5F1XA 3CJ7A 4WYBA 4H03B 2CGKA 3IFRA 4BRAA 1V4TA 3C0BA 2FSNA 2A42A 4BQLA 1S22A 2Q2RA 3CJ1A 4FWLA 5AQFA 3MK6A 1JCEA 1BUPA 1R59O 2QWOA 3GDQA 1NMDA 2HF3A 2CH5A 1BU6O 1NBWA 2I7PA 4IXCA 4O5FA 3QDKA 3FZKA 1NGEA 4FWPA 3EZWA 4HWIA 4FWSA 3VEWA 3I8BA 3B8AX 3FLCO 1NWKA 2QWLA 5AQXA 5JLFA 3O08A 2P9UA 4H5VA 3CERA 1U2VB 3KHYA 1GLJO 1GLCG 5AFUA 2NRHA 3JXUA 4CD3A 3QB0A 5BREA 3AAQA 2AP1A 2WUSA 1Q18A 4FL9A 1SQKA 4BRDA 4K42A 2V52B 3VEYA 1X3MA 5B8HA 2NLXA 3AARA 2GWJA 3DXKB 2P9KA 5EX5A 4GNIA 1KAZA 1ZC6A 3DJCA 1P8ZA 2P9NB 5AQYA 3H1VX 4XH1A 5KPRA 3P4IA 1C0FA 5JICA 4MO5A 4CZLA 3FGUA 2P9IA 4BGAA 2VWBA 5AQGA 5BN8A 3ZETB 1Z05A 3CJAA 1GLLO 2QWNA 1BWFO 1NGIA 4JN4A 4K25A 3GL1A 3L4IA 3BEXA 4PKIA 3VGKA 4H0XB 1NM1A 3ZX2A 1EQYA 5FPNA 2E2NA 2GWKA 1GLBG 3QBWA 3VENA 5CE3A 4QS7A 3EL2A 3R9PA 4CZIA 3VPZA 3D2FB 4EHTA 1Y64A 3A5MC 4BRCA 3WUHA 2I7NA 2YHXA 2P9PB 2P9LB 3FE1A 3VERA 2E20A 2FF3B 2VYPA 3UKRA 4KBOA 2HOEA 5I9EB 4BR9A 3WEEB 2Q0RA 4ISGA 2OANA 2ZF5O 3H46O 5AQJA 1HKBA 3GG4A 5LJVA 3WXLA 2E1YA 1QZ6A 3VETA 4H0PA 4A62A 4B1XB 4BR2A 3VGMA 3FR0A 4BR7A 4FO0A 3C7NA 4H0VB 5AZIA 1KXPA 1ESVA 2D0PA 1DGKN 3DWLA 4IWVA 3HSCA 3LDPA 1RGIA 3CI5A 2F9TA 3MCPA 4FWKA 3CQXA 2AA4A 5F0XA 1E4GT 4BRLA 3LDNA 4EAHD 2IVNA 5EOYA 1NGGA 4I6MA 3UKUA 3LM2A 1HUXA 2EWSA 3M6GA 5AQOA 2QWRA 2A41A 1ATSA 2UYTA 3O80A 3VEXA 2YHWA 1TYQB 1HPMA 4H0YB 1XUPO 5FPDA 4FPAA 2P9SB 2ZGYA 2F9WA 5AQWA 3SJHA 4C23A 2PBDA 1K8KB 3A5OC 3CHWA 3SK3A 1MDUB 4GY2B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4FJHA 3SUOA 2NRXA 3C6AA 3NF8A 2QW9A 2YI1A 3AO1A 2YV0X 4BC2A 2IOCA 1IH7A 5HBMA 4CZEA 3AA2A 4CVNE 4DFMA 3ZT2A 3CQ8A 3IDHA 3KVGA 4AHRA 2GELA 3QINA 1GLFO 5AZJA 5GIPA 5DK5A 4JV5K 3DLKA 1N36K 4NCGA 4CK2A 5C2FA 3DXKA 1IJJA 1LCUA 1NGBA 4CIGA 4JI1K 4EP5A 4EZ6A 2A40A 4KB0A 3QEPA 5KGXA 5BN9A 3SCXA 1HPZA 4H5TA 3RMDA 2FXUA 4JKEA 3VF4A 4PKGA 4BRQA 4BVOA 5J2PA 2QWPA 3MEEA 4O4GA 2HBLA 4DUYK 2P5GA 4CJWA 1RT1A 4ID1A 1BISA 1D8YA 4NLCA 3VF2A 1KVBA 2P9IB 3SAFA 1QTMA 1YHQN 2VQEK 1QSSA 1EXQA 2YCHA 3A0IX 2O4GA 1XC9A 1RNHA 4FLUA 2FSKA 2VWJA 1HMVA 1SV5A 1T03A 1NJYA 3RMAA 2FF6A 1ZBSA 4KHPK 1RDUA 3V81A 2YKMA 2Z1JA 4KH5A 3K5NA 4HUFA 1OH6A 3O1WA 4OKJA 4YORA 2QKBA 1HQUA 3PX4A 3LWMA 2KFZA 4FWMA 1RTIA 3KLFA 3M1FA 2QXLA 4BRHA 5FPMA 4A5BA 2ASMA 4AHTA 4I9QA 4OJRA 3UKRB 3CC2N 1S1VA 2W6KA 4RCHA 1H1VA 3VEVA 4DV4K 4DSEA 4DKWA 3THYA 2QXFA 4GMJB 1KC8O 3MCAB 5HRNA 1T44A 5J2MA 5IWAK 1UAXA 1RDBA 2ZM6K 1XWLA 2A1SA 3SQ4A 4BC4A 1TK0A 3PY8A 2KQ2A 1IO2A 1DEJA 4EHUA 4RW7A 3U9ZA 3PX6A 2A6AA 3VEZA 4OVLA 1YT3A 3CCMN 2UXBK 1EWRA 2BANA 2Q31A 5KTQA 1HKGA 4UQGA 3N4QA 1C0GA 2KFNA 1NGFA 4IJAA 3EY1A 3VQEA 3OYJA 3U8XA 3OYEA 4JK7A 3QFPA 1X9SA 2X78A 3VOVA 2V7YA 1T3VA 3CCJN 1TK5A 1ATNA 4AF1A 2FSJA 4CFCA 1N32K 3NGZA 1SL1A 3LL3A 4B9QA 4PUOA 5T7BA 3LDOA 4CI6A 1T6DA 4M63C 3VQ5A 3D2EA 3VTHA 4R79A 3ULEA 5C25A 4FJLA 1XMOK 1E3MA 4ZHRA 2YJEA 3OTOK 3SQ2A 3QIPA 4AHCA 4B3TK 1K9MO 3VGLA 1NKEA 2AJQA 4OPAA 3W0LA 1Q9YA 5JMVA 4JKGB 1TAQA 4FK2A 3CYMA 3TSPA 4FLTA 3I8DA 3R8EA 4B1UB 3WXIA 3U9DA 4DR2K 3TSQA 4H0OA 4X64K 2ZD1A 3CJCA 4A2AA 3LDLA 5M1PA 1TUUA 4M3TA 3M5RA 4DTPA 2EX3A 4H0TB 3CPEA 3GOIA 4DV7K 4MLEA 1LW0A 3NGIA 4CFBA 4E1JA 3C6HA 3V9XA 5I3UA 4Z4EA 4YY3K 1SAZA 4C8KA 3H6EA 3AA4A 4A57A 4BREA 3ZT0A 3WEEA 1RT2A 3CXCM 2YHBA 4OLBA 3BF1A 2GV9A 3CC4N 3OYHA 3OYKA 2D0CA 4JD2B 1JCGA 1WSIA 4LFAK 1M90O 4CW7B 1SL0A 2RN2A 3D0PA 1GLAG 1J6ZA 4N56A 4CZKA 3VMFB 4CGJA 3O9UA 2D0AA 3HK2A 1JXEA 4O8KA 4JNEA 5KPTA 1A5VA 4ZTFA 5LMNK 4LF8K 4FJNA 1JLCA 4R5PA 3RMCA 3S3OA 2GBZA 4E89A 3O4QA 3SNNA 1WBBA 4FXDA 3KLGA 4U67L 1KLMA 4E7JA 1QHAA 1HX1A 3PLAA 5ELZA 3O4NA 1KCFA 3K2PA 2IS3A 3QIOA 1IKVA 1R0AA 3HBTA 4KHWA 1VRUA 3OS0A 4CJSA 4CD1A 1QSLA 2OPRA 1QE1A 1RFQA 4NXMK 3UKUB 3IAYA 4E3SA 1SL2A 4C1NK 4WQ4C 4CFAA 5AQUA 1RBUA 4DFKA 2XY5A 4M3WA 3DLHA 3TAQA 3OA9A 2G8KA 2CGKA 2DFEA 3R1XA 1BQMA 4LFCK 4O0IA 3TAPA 2FBXA 2A42A 3ENBA 4KV8A 1BUPA 1HNWK 2HF3A 2CH5A 1VSKA 4RW8A 3V4IA 4O5FA 1YJ9N 2ZE2A 4N5SA 4ELVA 1NGEA 4FWSA 1GOAA 1B92A 4NCAA 1HNZK 1IKXA 3Q7BA 4N41A 1GLJO 4CGHA 1NK5A 1GLCG 3EE8A 1T05A 4KHNA 2KZZA 2RE2A 2NRHA 4CD3A 2EHGA 3V9ZA 3AAQA 3QERA 1U47A 3VA3A 1GOBA 1Q18A 4CK3A 4Z4HA 3N4PA 1SQKA 2F8TA 1FK9A 3HSTB 3DXKB 2G8FA 4CEDA 3EYZA 1TKZA 2JLEA 1P8ZA 1D5AA 3NFAA 3C6TA 4M3ZA 3S9HA 1BIZA 5M1OA 3P4IA 1HNXK 4KTWA 2E6LA 4WFAL 3OYFA 3OYCA 5A2QO 2P9IA 1WNSA 2VWBA 1XHXA 5BN8A 4WFBL 2HSTA 1W0HA 3CJAA 1GLLO 1VAZA 4CEZA 3SI6A 1BWFO 4E0DA 3OYIA 4JN4A 1U48A 3OYLA 4KHSA 3HL8A 4JS4A 2HHVA 4WCEL 3UIQA 5FPNA 4B9TA 2GWKA 3VENA 3ZSVA 3K5LA 3R9PA 3VPZA 1WSFA 5C15A 3WUHA 2YHXA 3VERA 2FF3B 2ETJA 3UKRA 5I9EB 2HOEA 3KWIA 3M8QA 4E7LA 2Q0RA 1VQON 4PWDA 1ZBIA 3OW2M 3F73A 1QZ6A 1W97L 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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