5BREA

Crystal structure of trypanosoma cruzi glucokinase in complex with inhibitor cbz-glcn
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
367
structure length
367
Chain Sequence
b'MNIKELSLHELCEELKTPAWNVPLTFVGDVGGTSARMGFVREGKNDSVHACVTRYSMKRKDITELIEFFNEIIELMPASVIKRVKAGVINVPGPVTGGAVGGPFNNLKGIARLSDYPKALFPPGRSAILNDLEAGGFGVLAVSDAHVFSEYFGVMWEGTQWRTCEQEPAGSVIGRGRCLVLAPGTGLGSSLIYYNPMNQQHIVVPLELGSQTIPMRKDIDYIQTLHAELKLLPNYENMVSGAGLEFHYRQVVRGSRPPCSAGEIAKLASEGDANACKAMKKYHEYLMRVGSEASMALLPLTIVLVGDNIVNNAFFYRNPQNLKEMHREALNHEMERFGFQSRVTYLRQKKLLNLNLMGCYRCGLDLS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glucokinase 1, putative
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi (strain cl brener)
publication title Structure-based approach to the identification of a novel group of selective glucosamine analogue inhibitors of Trypanosoma cruzi glucokinase.
pubmed doi rcsb
total genus 119
structure length 367
sequence length 367
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2015-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02685 Glucokinase Glucokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5breA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 5breA02
5AZIA 5FPNA 3UKRA 5TKYA 4H03B 5JMVA 5AQQA 4JAXA 5E84A 3UE5A 4FWQA 2V51B 3GE1A 2CGKA 5AQWA 4BC3A 1IG8A 1NGFA 5FPEA 3LDLA 3VEVA 1SQKA 2ZWHA 3A5OC 4BRQA 3I33A 1TYQA 4MLEA 1BOTO 4CBUA 1NGEA 2P9PA 3ENHA 3CJAA 3CI5A 5AQHA 4K25A 2P9KA 4BC4A 3S41A 4PL7A 4BRLA 4BQZA 2V52B 4IJAA 2AP1A 2P9IB 5AQFA 5BRDA 2E8AA 2EWSA 3AY9A 1QZ5A 3DAWA 3G25A 3JXUA 4XH4A 1SZ2A 1ESVA 1SAZA 3H46O 4H5TA 5BRFA 1HKGA 1NWKA 2KHOA 2V7ZA 4BG8A 3MN5A 3VETA 2HMPA 3FZMA 4BG9A 2YCHA 3F9MA 2D4WA 1NLVA 3J8AA 4M63C 3A0IX 3ZX2A 2A5XA 3DWLA 1MA9B 4MLHA 1H1VA 3KHYA 3MN7A 4K42A 3HSCA 2P9NB 2YHWA 1QHAA 5JLFA 1OKJA 1DKGD 2E20A 4K43A 1HX1A 4BRFA 3LM9A 3IUCA 1GLDG 4FWKA 4DCHA 4EHUA 3MK6A 4H0PA 4CBXA 3MN6A 4QS7A 4WQ4A 3SLCA 2ASOA 1YXQA 3ZEUA 3ATVA 5BREA 1R59O 5AZJB 4B1WB 4BREA 3ULEA 3VESA 4BRHA 2E1YA 2A3ZA 2VCPA 1ZC6A 2CH5A 3HM8A 4BRIA 3ZETB 4BRDA 4O8KA 2FLOA 3BF1A 4FWLA 3O1BA 3WQUA 2NRHA 2CH6A 4FWMA 5AQMA 3QFPA 5BRHA 3RSEB 5EOYA 3IMXA 2UYTA 4J8FA 4CBWA 4CZEA 3EKUA 4BGAA 5BN8A 1HPMA 1JCEA 3CERA 2VWBA 2GWKA 5LJVA 3O80A 5AQTA 4FWPA 3M3ZA 4CZIA 4F9OA 3A5NC 4IXCA 5AQZA 3LDQA 4WQ5C 5EX5A 1ATSA 1KAXA 1G99A 2IIRA 3CJ1A 3EL2A 1Q18A 3H1QA 3VEYA 4BR2A 4L3QA 2D1KA 4WQ5A 3EN9A 2P9UA 2OANA 4FO0A 2W41A 3LM2A 3QDKA 4CD3A 2P9LB 1NMDA 2ZF5O 3ZX3A 3H45C 4YDUC 4FWSA 3O08A 3RSEA 1BA1A 3A8YA 3CQXA 5AQGA 2Q1NA 1RFQA 3SMSA 1DEJA 3AAQA 3DXMA 4BVOA 1MWMA 3VEXA 4NB4A 1C0GA 4EIAA 3H3NO 2FSNA 1Z05A 3VF6A 2IVPA 3ATUA 4QS8A 3WUHA 4LC9B 4IJNA 5KPZA 2J4RA 2I7PA 1NBWA 4H0OA 3MMVA 4IO8A 1XQSC 3ENOA 3CETA 3CJ9A 1GLBG 3BF3A 4CJ7A 2P9PB 2GUPA 3O8MA 4I6MB 1NGBA 3JS6A 2DPNA 4M7XA 5EVZA 2Q2RA 3O4WA 2GTDA 3P4IA 4H5NA 1HKBA 2HF3A 5AQXA 1TUYA 1GLCG 2P9SB 5AQPA 1TUUA 1GLFO 2HOEA 3GL1A 1NGCA 5F2RA 1QQOA 3D7EO 5LY3A 2FXUA 2GWJA 2PAVA 5BN9A 4B1VA 1V4SA 4FSVA 3VF4A 4H0XB 1LCUA 1BA0A 5B8HA 3I8BA 5AQLA 4XH1A 4HTLA 3IFRA 3R6MA 3VOVA 1EQYA 2AA4A 3A5MC 2QW9A 2QWQA 4ISEA 4JD2B 3H3OB 3AAPA 3LDNA 3FE1A 3AARA 2FF6A 5KQ8A 4EAHD 4XEIA 4FWNA 4M7YA 4A61A 1MDUB 2QXLA 5FPDA 3L4IA 2P9SA 2VYPA 3QMLA 3WT0A 3IDHA 2IVOA 4XH5A 5BR9A 2A40A 4FPBA 4PKIA 4FWOA 3VGKA 3D2EA 2ITMA 4I6MA 2QWMA 3FR0A 4GY2B 4B9QA 2YI1A 2CGJA 3FGUA 3CJCA 5LJWA 4CZHA 1HLUA 3D2FA 5ELZA 4AM6A 5ADXH 3KVGA 5BPNA 5FPMA 2HF4A 1QQNA 4BC5A 4EFHA 4B1XB 1T6CA 1BU6O 4JHDB 1KAYA 4H0YB 5AQVA 3D2FB 2YJEA 5BPLA 4DHYA 3FZKA 4BR7A 1JCGA 5I9EB 4JNEA 4H5RA 3WQTA 4Z94A 5AQYA 1YAGA 3QBXA 1X3MA 3WXJA 5JICA 4JD2A 3B8AX 5AQIA 4CI6A 3VENA 2QM1A 2A6AA 1E4GT 5ADXA 4WYBA 2Q0UA 2IVNA 5E26A 5EXWA 3BP8A 4BC2A 3QBWA 2A41A 2A42A 2WUSA 3BEXA 4BQLA 2F9WA 4B1ZA 2QWNA 1BO5O 3TPQA 3U8XA 2P9LA 3H6EA 4AM7A 2FF3B 5F1XA 1GLEG 1XC3A 4FWRA 3FZFA 3BUZB 4FOEA 4DQ8A 1QQMA 3DXKB 4CZFA 2P9UB 3QB0A 5AQUA 3GDQA 1BUPA 1GLJO 1ZBSA 5AFUH 1NGDA 3ZX0A 3EO3A 4WQ4C 1RGIA 5AQNA 3VGLA 1NGHA 1K8KA 2H3GX 1NGAA 1NGGA 1YVNA 1ATNA 2E2PA 3O5BA 3O6WA 2GELA 4BRAA 2PBDA 4H0VB 2Q31A 2E2QA 2QWPA 3DJCA 2Q36A 1BWFO 2F9TA 3ZETA 3WXKA 3UKUA 3A5LC 4A2AA 3WXLA 4BR9A 2Q0RA 1Z6RA 1DGKN 3CJ7A 4PL8A 5AFUA 3CJBA 2E1ZA 1JCFA 2ASPA 2D0PA 2I7NA 2NLXA 2V7YA 3HTVA 4GNIA 4JN4A 4NO7A 3SMPA 4BROA 4BR0A 3W0LA 1J6ZA 1GLAG 2E88A 4CZLA 3HZ6A 1KAZA 3MN9A 3VF2A 1GLLO 1ZXOA 4BR4A 2YJFA 4EHTA 3L6QA 4HWIA 4E1JA 4BRGA 4YDUA 1LOTB 5AQSA 5KPTA 3EKSA 4O5FA 1X9JA 2QWOA 3R8EA 4A62A 1RDWX 5AZIB 1KXPA 4CD1A 2ZGYA 3HBTA 1K8KB 4BRKA 2BTFA 3VEWA 3VEOA 3M1FA 5AQOA 4RCHA 4H5WA 3ULEB 1S22A 3QFUA 3DXKA 4FPAA 3FLCO 3TU5A 1YUWA 5AQKA 3ZEUB 4H5VA 2FSKA 3GOIA 3CQYA 1Y64A 2D0OA 4Y0WA 4BRNA 1T44A 4QS9A 4CZJA 1NM1A 3VERA 3VGMA 4A2BA 4BRMA 4CZKA 1HJOA 3U4LA 4C23A 5EY4A 4MO4A 1D4XA 1BDGA 3C0BA 4CZMA 5AQJA 2BUPA 3LDOA 3LDPA 2YHYA 4MO5A 3VEZA 1BG3A 3FFKB 3L0QA 4ISGA 1U2VA 5KQDA 3GG4A 3MCPA 3LL3A 3UB5A 3M6GA 3W3DA 4ISFA 2FSJA 2NZTA 3D2EB 1HUXA 2ASMA 1TYQB 4RTFD 4KBOA 3QICA 4BRPA 3WXIA 4BVPA 3SJHA 2P9IA 4BR5A 3GBTA 2GEMA 4PKGA 3SK3A 3U9ZA 4H0TB 1NGIA 5AZJA 5BPMA 4B1YB 4PKHA 3UKUB 2P9NA 4BGBA 2P9KB 4B1UB 4K41A 3KZBA 1U2VB 3WEEA 3UKRB 4BRCA 3FZLA 4JHDA 1XUPO 2W40A 1T6DA 3VPZA 1WOQA 3CHWA 2Q97A 3OHRA 5CE3A 3C7NA 1S3XA 3EZWA 1QZ6A 4FOIA 1CZAN 3CIPA 5KPRA 1V4TA 3DXMB 3ID8A 1MWKA 3FZHA 1E4FT 3H1VX 1X3NA 3MDQA 2E2OA 3O1WA 2E2NA 5AR0A 4DB3A 3U9DA 3R9PA 1P8ZA 1IJJA 2QWRA 4IZ9A 1NGJA 3HI0A 1ATRA 3WEEB 4CZGA 2QWLA 4FL9A 4IWVA 1WUAA 2YHXA 2ZGZA 3C7NB 4RWTA 1C0FA 5F0XA 2CGLA 5AQRA 5JLHA 1HKCA 1U6ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4DU3A 5AZIA 3UKRA 3AVNA 5TKYA 1WSEA 5AQQA 4JS5A 3TAPA 1TKDA 3UE5A 3ZSWA 5AQWA 3PO4A 4C8LA 4EZ9A 1I3AA 5FPEA 5HP1A 4C1NI 5J2QA 4IFYA 3LDLA 1CXQA 3QINA 2JWLA 4CBUA 1NGEA 3ASMA 3TWHA 4BC4A 4BQZA 4AHCA 4IJAA 4IOAL 2AP1A 2P9IB 4CJLA 3DOKA 5AQFA 1UWBA 2EWSA 3AY9A 1QZ5A 3JXUA 4XH4A 2O8CA 3H46O 4DV1K 5BRFA 2KHOA 4BG8A 3MN5A 1VQKN 2YHAA 1TAQA 1BHLA 3TABA 3CPWM 1T05A 3O9TA 3KD5E 4JKGA 1H1VA 4JEPA 1RT3A 4IFEA 3NFAA 2YHWA 2O8EB 1TK0A 4K43A 3ZT3A 1HX1A 3ZSYA 3SQ4A 2B5JA 1FKOA 1UA1A 1Q7YO 2O4IA 4CBXA 4E7LA 4JI0K 4DTSA 5C42A 4WQ4A 2ASOA 1RBTA 5BREA 1R59O 3P39A 1N34K 5AZJB 4B1WB 4GW6A 2HW3A 3DLLL 2W6LA 2E1YA 2A3ZA 2VCPA 1QS4A 2G8HA 4W5OA 1C0MA 1J54A 3KK3A 1JLGA 3SUNA 3E9PA 4BRIA 2WFBA 1Y97A 4BRDA 4O8KA 2OZSA 2FLOA 3G6EN 3BF1A 1W2BM 4FJLA 2ZM6K 3NGZA 2G8FA 3IMXA 4HUEA 3QETA 2UYTA 4C8MA 3TSQA 2VWBA 2GWKA 3VQ7A 3V4IA 1QTMA 4JKEA 4YOUA 3TI0A 4CEEA 2A1SA 1WN7A 2JGUA 4BWMA 1IV0A 3CM5A 4F9OA 4IXCA 5T7BA 2DY4A 3LDQA 1KAXA 2OTJN 5M1PA 1Q18A 3P38A 3QLHA 2D1KA 4WQ5A 2OANA 1CXUA 1RT4A 1NMDA 2P9LB 3V9SA 3ZT2A 1K73O 1DLOA 4AHRA 1W7AA 1HRHA 4A5AA 3PX0A 3C6HA 3SUQA 1R0AA 3BGRA 3LP2A 5HOOA 1DEJA 3S3NA 4CE9A 4BVOA 1OVQA 4IDKA 1MWMA 1KRPA 4EIAA 1Z05A 1T7PA 1BCOA 3OW2M 4IJNA 1U04A 1SV5A 2RN2A 3OYDA 2HHUA 2WONA 2OPRA 4CJ4A 4DR3K 2E5LK 3BF3A 3K59A 3VQAA 4CJ7A 1RT2A 2P9PB 4JK7A 2GUPA 3O8MA 3ALYA 5HRRA 2Q2RA 3O4WA 5J2PA 4DFPA 4U7BA 5EU7A 4DV0K 4F4KA 4FK0A 4JI7K 1TUUA 2HOEA 3VQ5A 1HNZK 3PSIA 4CHZA 1WNSA 4CK1A 2RKIA 1LAWA 1XMOK 3RMAA 4QCLA 3O3FA 2ATQA 3EZ5A 4KTQA 2X6SA 3MWPA 4FJKA 5B8HA 5AQLA 3O4QA 4XH1A 3T1YK 2OPQA 3LANA 2P1JA 3R6MA 1EQYA 2QWQA 3B6OA 3PV8A 3LALA 3TSPA 4ISEA 3HT3A 4KB1A 4JD2B 3TARA 1RDBA 3H3OB 5SWMA 1HYZA 5C2DA 4XEIA 3K0SA 4PQUA 5CHIA 4DG1A 2UXDK 3EEQA 2HHTA 5GAGP 2KLAA 3E66A 3NVMA 3RMDA 4JKDA 2VYPA 2VGMA 3QMLA 2IVOA 4G1QA 2A40A 4FPBA 1FXXA 5M1OA 2B4JA 2G8VA 2E6LA 1EKEA 3F2KA 4LY7A 3C94A 3T1AA 5C0YA 4GV9A 4YOTA 4B9SA 1HLUA 1S9GA 1W97L 5C24A 5K14A 5BPNA 3KK2A 4FJGA 4FCYA 3AA3A 3J7AP 4JHDB 1HPZA 1KAYA 5AQVA 3CCEN 4KHUA 4KHNA 4I2PA 3PSFA 4KKOA 2PFUA 3TAQA 1CLQA 3DI6A 4LFBK 1KLNA 1X3MA 4B3MK 3P5JA 5JICA 3DRRA 5AQIA 4AF1A 4CI6A 5C12A 5HRSA 4OKKA 4CEDA 5E26A 3U3YA 3BP8A 3PIOL 3QBWA 2WUSA 4BQLA 1BISA 4JKCA 2QWNA 4M3WA 3AVMA 3TPQA 4OPAA 3HPHA 1NJZA 1VSEA 1TKZA 5F1XA 3VQPA 4I9QA 3DXKB 3L2RA 3NE6A 4DV4K 3C6UA 1GLJO 5AFUH 3EO3A 3QEVA 5C10A 3AO3A 1K8KA 3I55N 3NCIA 3THYA 4A57A 1HNVA 2E2QA 3T19A 1EXQA 2XY7A 2X78A 4A2AA 3WNHA 3WXLA 4BR9A 4Z4HA 2Q0RA 3BY5A 4IO9L 3SBGA 3SCXA 1LWEA 3SV3A 4M3YA 4B9TA 3VQ9A 2I7NA 2D0PA 2V7YA 3SJJA 3HTVA 1SKRA 4Y1CA 4BROA 3L2WA 3LAKA 3AVAA 4BY9C 1MU2A 2E88A 4CZLA 4DKWA 4FLXA 3R3LA 1HQEA 3RRGA 2YJFA 4LF8K 5I42A 4M3XA 4DF8A 4BRGA 4YDUA 1N5YA 2PY5A 3E9LA 3EKSA 4O5FA 1JLQA 3TSUA 1X9JA 3LWMA 4DR1K 2QWOA 3R8EA 4CJVA 4BE1A 2YHBA 3VA3A 5SZTA 1XMQK 3HBTA 2ZE2A 4KHWA 2GBZA 3VEOA 1C1CA 3TTFA 1JLFA 3OYKA 4H5WA 3SQ2A 5KRSA 3ULEB 3DXKA 1RILA 5AQKA 4H5VA 3T69A 3V9ZA 3CQYA 3WNEA 4PA1A 1GOCA 2IS3A 4GV6A 1NK7A 3SAFA 4IOCL 4QS9A 2EX3A 4CZJA 4DTPA 4A2BA 3DRPA 4DS5A 4CZKA 4C23A 4MO4A 5JVGL 4CHYA 4E0DA 4CZMA 3EE8A 1Z26A 3CCSN 2BUPA 3NF8A 3C95A 4F3OA 1YITN 5DM7L 3VQBA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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