5BREA

Crystal structure of trypanosoma cruzi glucokinase in complex with inhibitor cbz-glcn
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
367
structure length
367
Chain Sequence
MNIKELSLHELCEELKTPAWNVPLTFVGDVGGTSARMGFVREGKNDSVHACVTRYSMKRKDITELIEFFNEIIELMPASVIKRVKAGVINVPGPVTGGAVGGPFNNLKGIARLSDYPKALFPPGRSAILNDLEAGGFGVLAVSDAHVFSEYFGVMWEGTQWRTCEQEPAGSVIGRGRCLVLAPGTGLGSSLIYYNPMNQQHIVVPLELGSQTIPMRKDIDYIQTLHAELKLLPNYENMVSGAGLEFHYRQVVRGSRPPCSAGEIAKLASEGDANACKAMKKYHEYLMRVGSEASMALLPLTIVLVGDNIVNNAFFYRNPQNLKEMHREALNHEMERFGFQSRVTYLRQKKLLNLNLMGCYRCGLDLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-based approach to the identification of a novel group of selective glucosamine analogue inhibitors of Trypanosoma cruzi glucokinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase 1, putative
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi (strain cl brener)
total genus 119
structure length 367
sequence length 367
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2015-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02685 Glucokinase Glucokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5breA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 5breA02
2ZGZA 2FXUA 3L4IA 4FO0A 1RDWX 3HBTA 2NRHA 1X3NA 2HMPA 3LDPA 3HZ6A 5AQZA 3QBWA 5KQ8A 2E1ZA 3H3OB 2E88A 2A40A 1GLCG 1V4SA 5EOYA 1XQSC 3ATVA 3VEVA 2E2PA 1NGEA 2FLOA 3DJCA 4XH4A 4IJAA 4CJ7A 3GDQA 4EIAA 4RTFD 5AQRA 3CERA 4CZFA 3C7NB 4FSVA 3MMVA 1SAZA 3BUZB 3QFUA 1IG8A 2A5XA 3VF4A 1S22A 2W40A 4WQ4C 4CZJA 1Z05A 3A5MC 5AR0A 5TKYA 4BGBA 4XH5A 5AFUH 2IVNA 4MO4A 2Q36A 1HJOA 2QWNA 1BO5O 4JHDB 4PKGA 1Y64A 3C0BA 2E20A 5I9EB 1BA1A 4ISEA 1BU6O 4MLHA 1ZC6A 2A6AA 3UKUB 2GELA 3VOVA 4CBUA 2GWJA 5AQYA 2PAVA 1NGIA 3CQYA 3EZWA 5AQNA 2Q31A 4JD2A 4WQ5A 2A42A 3QB0A 2GUPA 1S3XA 4GY2B 1NGHA 2E2NA 4BROA 1DEJA 1XUPO 4B1VA 1HPMA 4Z94A 3O8MA 3SLCA 3VPZA 4IWVA 1JCFA 1YUWA 5AQTA 4EFHA 4BRGA 5F0XA 1ESVA 4NO7A 3SMSA 5AQUA 3U4LA 1JCGA 3VEOA 3SJHA 4FWQA 4BC3A 3F9MA 2E1YA 1GLJO 4BR4A 5EY4A 1BUPA 2I7PA 4BVOA 3MN5A 4A62A 4B1WB 2P9UA 3QDKA 4M63C 4BRHA 2ZWHA 2ASOA 3CJ1A 4XH1A 2HF4A 2QWLA 2P9UB 5AZJA 4CZKA 4JAXA 2QW9A 2NLXA 4FWMA 4BG8A 4Y0WA 5AZJB 4DB3A 4H03B 3W0LA 3A0IX 2OANA 1DGKN 4WYBA 3MN7A 2YJFA 3WXKA 1HKBA 3B8AX 4HWIA 3MK6A 5FPNA 4LC9B 4H0XB 5ADXA 1LOTB 4H5NA 2H3GX 2Q97A 5BRDA 1Z6RA 3I8BA 4E1JA 3SMPA 3BF3A 5EXWA 2D4WA 4BR2A 1NBWA 5EVZA 4B1XB 3CETA 3I33A 3J8AA 2E2QA 3GE1A 2EWSA 4CBWA 2D0PA 4FPAA 4HTLA 4ISGA 4H0TB 1SQKA 3WEEB 2V52B 3EKSA 3CJBA 5BN8A 2IVPA 1U6ZA 2P9SB 2QWOA 5KPZA 2VYPA 4RWTA 2Q1NA 2D0OA 4FPBA 3IDHA 2ASPA 1GLAG 2A41A 4PL8A 5AQSA 4F9OA 2HOEA 2F9TA 5E84A 4BRQA 5FPDA 1ATSA 3S41A 1NGGA 1DKGD 2IVOA 3JS6A 4PL7A 2QWQA 4FWKA 5LJVA 3R9PA 3A5OC 2NZTA 4B1ZA 3O80A 2QXLA 3A8YA 1YXQA 4BRAA 3QBXA 1T6DA 2QM1A 2BTFA 4FOIA 4B1YB 2QWPA 2VWBA 3H1QA 4DQ8A 1V4TA 1ZXOA 1HX1A 5AQMA 3O6WA 1H1VA 4O8KA 3CJAA 3ID8A 4IXCA 5JICA 4CI6A 3TU5A 2BUPA 5KQDA 3U9ZA 2P9LA 1NGFA 1E4FT 4WQ5C 3AY9A 3UKRA 4M7XA 3P4IA 1K8KA 5E26A 3ZEUA 1MDUB 4MO5A 3W3DA 4H0VB 3O08A 3LL3A 4EHUA 3KVGA 3LDOA 3FLCO 3ZEUB 1K8KB 4BREA 3HTVA 5AQXA 4BRIA 1RGIA 3IMXA 4IJNA 3CIPA 3L6QA 2KHOA 4K25A 1HUXA 4JD2B 3WQTA 4AM6A 4ISFA 3M1FA 3H6EA 4IZ9A 1CZAN 4QS8A 4CD3A 3M3ZA 2AP1A 4DHYA 3VEYA 4M7YA 4I6MA 3VGLA 4BC5A 4O5FA 3ATUA 2I7NA 4QS9A 1RFQA 1T6CA 1KAYA 5ADXH 5FPEA 1GLFO 1D4XA 3ULEA 1E4GT 3CJ7A 4K42A 1QHAA 1NGCA 3CHWA 3H3NO 3ULEB 3ZETA 1C0FA 4J8FA 5KPTA 1HKGA 5AQIA 3FZHA 3FZKA 2GEMA 5B8HA 3LDLA 3U9DA 4A2BA 4FWOA 2CGLA 4GNIA 5LY3A 3BF1A 5AQJA 3A5NC 4CZGA 2CGKA 1J6ZA 3D2FA 1T44A 2J4RA 3U8XA 2P9NA 2DPNA 1KAXA 1BWFO 2YCHA 4CD1A 3QFPA 4BVPA 3ZX0A 3D2FB 3EKUA 2FSKA 5AZIA 3WXJA 3FZMA 2P9NB 2HF3A 3GL1A 1WUAA 5F2RA 3O4WA 1QZ5A 1XC3A 3GOIA 3H46O 3HI0A 1HKCA 3R8EA 5AZIB 2YI1A 2A3ZA 2GWKA 3MDQA 4BC4A 2FSJA 2W41A 1EQYA 3AAPA 3A5LC 1GLLO 2V7ZA 4FWRA 5BPLA 4BRKA 5AQFA 3WUHA 4BRLA 2D1KA 4CZHA 5JLFA 4BQZA 4H0PA 3CQXA 3R6MA 4BRCA 4H5WA 3DXMA 1WOQA 1X3MA 3D7EO 3G25A 1KXPA 2UYTA 1YVNA 2FF3B 4CZIA 4L3QA 1R59O 4BR7A 3LM2A 1QQMA 1LCUA 3DXMB 3UE5A 1Q18A 5BR9A 5BPMA 2Q0RA 4FWNA 4FWSA 2YJEA 3RSEA 4XEIA 2VCPA 5AQKA 1G99A 3VGKA 4BC2A 2Q0UA 2FSNA 5F1XA 1HLUA 2CGJA 4A2AA 3VF2A 3RSEB 5AQPA 4YDUA 3CJ9A 2P9KA 3QMLA 3HM8A 4NB4A 1YAGA 4PKIA 3AARA 3ENHA 3O1BA 2P9KB 3C7NA 5AQHA 5BPNA 2WUSA 5CE3A 4A61A 1NMDA 2FF6A 4CZEA 3OHRA 4H0YB 4AM7A 5AQGA 1JCEA 4FOEA 1NGJA 2ITMA 2E2OA 1NLVA 3O1WA 5BREA 4BR9A 3LM9A 2ASMA 2P9LB 4JHDA 1MWKA 1GLBG 2ZF5O 1U2VA 1X9JA 4JNEA 3UKRB 4CZLA 4K43A 3EO3A 1SZ2A 3UKUA 3HSCA 4C23A 4EHTA 2YHXA 4BR0A 5AQVA 2Q2RA 1BDGA 3FE1A 1U2VB 4FWLA 3VENA 1ATRA 2P9PA 3JXUA 4EAHD 4WQ4A 3QICA 4RCHA 3VEZA 3AAQA 2QWRA 3DXKA 5KPRA 3WT0A 5BRFA 2E8AA 4BG9A 2P9PB 3ZX3A 5ELZA 4BRDA 2P9IA 4B9QA 5AQWA 1OKJA 3FZFA 4H5RA 1MA9B 3DXKB 3TPQA 1NWKA 1TUUA 3M6GA 2P9IB 3GBTA 1TUYA 3FGUA 1MWMA 3VEXA 1IJJA 2IIRA 5AFUA 3D2EA 4I6MB 2F9WA 3VF6A 1TYQA 3UB5A 1NGDA 3DAWA 5JMVA 3CJCA 5BN9A 3KHYA 3DWLA 4H5VA 1GLEG 2V51B 2YHYA 2PBDA 3D2EB 3O5BA 3FFKB 1KAZA 3MN6A 3IFRA 1ZBSA 1TYQB 5AQQA 3KZBA 3WXLA 3MN9A 4BRNA 3BP8A 4BGAA 3MCPA 3ZETB 3LDNA 4IO8A 4QS7A 3EN9A 4BRFA 4FL9A 3GG4A 3VGMA 1BOTO 3FZLA 4BRPA 5EX5A 4CZMA 4FWPA 1GLDG 1QZ6A 3IUCA 3FR0A 3H1VX 4CBXA 1BG3A 3VERA 3WQUA 5AQOA 5AQLA 3CI5A 4DCHA 3VESA 4KBOA 4MLEA 5FPMA 3L0QA 3WXIA 2V7YA 4B1UB 5BRHA 1BA0A 1QQNA 3SK3A 3ZX2A 4H5TA 1QQOA 3EL2A 3LDQA 1NM1A 3VETA 5LJWA 2CH5A 2AA4A 2ZGYA 5JLHA 3VEWA 1ATNA 1NGBA 3BEXA 2QWMA 3WEEA 3ENOA 4YDUC 3H45C 4JN4A 2P9SA 2CH6A 2GTDA 4K41A 4BQLA 4PKHA 1P8ZA 4BRMA 2YHWA 4BR5A 4H0OA 1C0GA 1NGAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FXUA 4E3SA 3DLBA 1JJ2M 4CEEA 1X3NA 3O4NA 3SI6A 1N33K 3TAMA 3QBWA 4KHNA 2E1ZA 4GMJB 2A40A 2E4LA 4X64K 5CY4A 1WSFA 5EOYA 3VEVA 1TK8A 4XH4A 1GOCA 3IRXA 1DTTA 4EIAA 2HHUA 2YKMA 3CERA 4A5BA 1L5UA 4CEBA 3BUZB 2ZJRL 2A5XA 3HOSA 4AHSA 4JI5K 4FJXA 3F9KA 2B6AA 4CJRA 5C12A 5AFUH 4W5OA 2QKBA 2Q36A 1U45A 1IO2A 3PLAA 3C0BA 1BA1A 4ISEA 1BU6O 2HHHK 2Z1JA 4XIUA 1T8EA 4CGHA 2GELA 1VQ5N 3VOVA 4ICLA 1O13A 2GWJA 3MX2A 1SKSA 1WBBA 4M42A 3EZWA 4BDZA 3T7ZA 2Q31A 3AO1A 4DG1A 4WQ5A 1P90A 3IS9A 1S3XA 4GW6A 2E2NA 4BROA 1VSIA 4Z94A 4KV8A 3SLCA 4IWVA 3L3VA 1TVRA 4FJIA 3DOLA 1WSJA 4JV5K 1R0AA 5F0XA 4DUYK 4OLAA 4DF8A 1KSPA 3MXJA 3SJHA 2P5OA 4K8ZA 1OH8A 5CYQA 2YNGA 3S3NA 3CCRN 2I7PA 2PZSA 4MQ3A 4BVOA 3D45A 1YTUA 4B1WB 3O3GA 1IH7A 4EP5A 3ZSRA 2HF4A 4FZZA 3K5LA 4IDHA 1ZYQA 4UY8O 3C6UA 3THYB 4JAXA 2NLXA 2W42A 4FWMA 4MFBA 2RN2A 3W0LA 4DKWA 4YOTA 4YOYA 1VQPN 1DGKN 2YJFA 1JLGA 3RMCA 3OBWA 4YNQA 2IGIA 4HWIA 1S1TA 1DLOA 5FPNA 3OYCA 4H0XB 2H3GX 2Q97A 4LH5A 4YHHK 3LAMA 2BGGA 3I8BA 3BF3A 5EXWA 1IKXA 3I33A 3OVNA 2E2QA 4G1QA 3VQ9A 4FJNA 2NRXA 2EWSA 3NVKA 3CMAN 4CBWA 2D0PA 1NJWA 3KKRA 3SCXA 1VSMA 3TAEA 4RW7A 4H0TB 1IG9A 4RW6A 1VSHA 2V52B 4DV4K 1OVYA 2EX3A 1U6ZA 2P9SB 2B4JA 2VYPA 4RWTA 4DTXA 3IDHA 1NU0A 3RMAA 4PL8A 4FK4A 1TV6A 4NLBA 1ATSA 3NHGA 3EE8A 1HYSA 3JS6A 2QWQA 4RW8A 1UA0A 1T05A 3A5OC 2XRIA 4B1ZA 5K14A 5GAHP 3A8YA 1ASWA 4BRAA 3QBXA 4BWMA 4B9VA 4OLBA 1N8RO 2BTFA 4FOIA 4B1YB 3LAKA 4J2EA 4HCCA 3HL8A 3C6TA 1V4TA 4N47A 1RDDA 1H1VA 4H8KA 2QXFA 4OPHA 1S5JA 4J2AA 3CD6N 3HPHA 5FDLA 4CEAA 3AGRA 2PFUA 3HOTA 4WQ5C 4GKJK 4M7XA 5E26A 2WTUA 2VG7A 1MDUB 1WSGA 3TI0A 3O08A 3KVGA 1NK4A 4ELUA 1K9MO 1CZ9A 4JKEA 3ZEUB 3NAEA 5JVHL 1X9WA 3HTVA 4O5BA 1RGIA 4NCBA 1IV0A 3O9SA 5HRPA 2WOMA 2YV0X 2VG5A 3L2RA 3SUNA 3KKSA 3RMBA 4AM6A 4ISFA 1RT6A 3LALA 1KD1O 3T1AA 1WB9A 4FYDA 2AP1A 4DHYA 4O44A 4LF9K 3VGLA 4U67L 3ATUA 4N76A 1KAYA 1L3TA 4DLEA 3O9RA 1GLFO 1D4XA 3ULEA 1E4GT 3CJ7A 1SUQA 5CYMA 1J9AA 1NGCA 4KH6A 2OPSA 4IO9L 3C6AA 1C0FA 4A5AA 1XMOK 1DT9A 2P1JA 5B8HA 2ATQA 4DWIA 4A2BA 2PYJA 2CGLA 2Z1HA 4C8MA 1T44A 2J4RA 3U8XA 4FJ9A 2P9NA 3OJSA 3OY9A 3C94A 3QFPA 4BVPA 3D2FB 3AA3A 3PSFA 2KZZA 3FZMA 1HNXK 3J7YP 3VQPA 1HYZA 2UXCK 1BIUA 1HNWK 3C65A 2OYQA 1QZ5A 1C0TA 1Z25A 1NK5A 2YI1A 4LSLA 2GWKA 2FSJA 1O1WA 2W41A 3AAPA 5J2NA 5HLFA 3A5LC 4LF4K 2ZJPL 5AQFA 2O8BA 3NGZA 3DYAA 5FROA 3R6MA 4KAZA 3DXMA 1KXPA 5M1NA 4KB0A 2X6SA 1LCUA 3HYFA 2GX9A 1Q18A 3CQ8A 4Z4CA 2Q0RA 1MU2A 1HPZA 3CF5L 2VCPA 2HNDA 2O8EA 5AQKA 1G99A 3K5NA 1KVBA 3V9WA 5F1XA 3BGRA 4FLZA 1HLUA 4PY5A 2X74A 3CJ9A 1QVFM 1LWCA 1LW2A 4E7KA 4NB4A 1RDBA 2WONA 3U3GA 4FLYA 3V9UA 3ASMA 3QERA 4CGJA 3C7NA 4CJEA 4J2BA 4DTOA 1NK0A 5CE3A 1RBUA 3SPZA 3AO5A 1NMDA 3NVMA 3S3OA 3E9PA 5AQGA 1JCEA 2E2OA 4DSKA 4J2DA 1XMQK 3MXMA 3CPEA 1NOYA 4FW2A 4F3TA 3LP2A 4LSNA 1JL1A 3SQ2A 1U2VB 2E6MA 1ATRA 2P9PA 4RW9A 4E1NA 5GAGP 4O0JA 3VEZA 3AAQA 3QEXA 3SJJA 1I39A 4W5TA 3V1RA 4N56A 5HRRA 5BRFA 4BG9A 1K6YA 3ZX3A 5ELZA 1CZBA 3QEIA 5AQWA 2RHKA 3SV4A 4H5RA 1MA9B 3DXKB 2FBYA 3IAYA 4ELTA 2I5JA 4NXMK 1IBKK 4IOXA 3MAQA 1I94K 2P9IB 1YTAA 1TUYA 4WFAL 3FGUA 4BE1A 4CIFA 1QSSA 5AFUA 2KZMA 4NYFA 4M3TA 5HRSA 2F9WA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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