5BREA

Crystal structure of trypanosoma cruzi glucokinase in complex with inhibitor cbz-glcn
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
367
structure length
367
Chain Sequence
MNIKELSLHELCEELKTPAWNVPLTFVGDVGGTSARMGFVREGKNDSVHACVTRYSMKRKDITELIEFFNEIIELMPASVIKRVKAGVINVPGPVTGGAVGGPFNNLKGIARLSDYPKALFPPGRSAILNDLEAGGFGVLAVSDAHVFSEYFGVMWEGTQWRTCEQEPAGSVIGRGRCLVLAPGTGLGSSLIYYNPMNQQHIVVPLELGSQTIPMRKDIDYIQTLHAELKLLPNYENMVSGAGLEFHYRQVVRGSRPPCSAGEIAKLASEGDANACKAMKKYHEYLMRVGSEASMALLPLTIVLVGDNIVNNAFFYRNPQNLKEMHREALNHEMERFGFQSRVTYLRQKKLLNLNLMGCYRCGLDLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glucokinase 1, putative
publication title Structure-based approach to the identification of a novel group of selective glucosamine analogue inhibitors of Trypanosoma cruzi glucokinase.
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma cruzi (strain cl brener)
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
total genus 119
structure length 367
sequence length 367
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2015-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02685 Glucokinase Glucokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5breA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 5breA02
1V4SA 4RCHA 2ZF5O 3I33A 3WT0A 1GLAG 4CZMA 3KHYA 2IVOA 5LJWA 4FWQA 1GLLO 4B1UB 4M63C 3BEXA 4IXCA 5TKYA 3ENOA 4CD1A 4RWTA 1QZ5A 4FSVA 1NGGA 3VEXA 4BG9A 3HM8A 3VEWA 3QBWA 2YHXA 1IJJA 4XH4A 3UE5A 4BVOA 5KPTA 3MN6A 2P9NB 3VERA 3ENHA 2BUPA 3CQYA 3MN9A 4FWKA 5JLHA 1HLUA 4CZLA 4E1JA 4BRNA 2P9IB 1YVNA 1RGIA 5AZJA 4ISGA 2FSNA 1JCFA 1V4TA 3QDKA 3MN7A 3EZWA 4M7XA 3WEEA 4K41A 4I6MB 5EX5A 1ESVA 3HI0A 2F9TA 2QWOA 4RTFD 3MN5A 3CJ1A 1K8KB 3FR0A 2E2QA 3ZX3A 4M7YA 4BRKA 1DGKN 1H1VA 3EL2A 1IG8A 1HKGA 1BOTO 4K25A 4BRHA 2D0OA 2P9PB 1BO5O 2J4RA 2Q36A 4MLHA 4BR2A 2VWBA 4CJ7A 1ZXOA 4JD2A 1YXQA 2ZGZA 3C7NB 4WQ4C 1MWMA 2V7ZA 4H5TA 3VF6A 5KQ8A 5EOYA 2KHOA 4BQLA 4DB3A 2Q31A 1D4XA 1ZC6A 3WQUA 1KXPA 1XQSC 1YAGA 3FGUA 3D2FB 2HF4A 5AZIB 4FWRA 1SZ2A 3W0LA 3O08A 1NGCA 3L6QA 1Z6RA 5JMVA 2E20A 3R6MA 3MCPA 3HBTA 4IJNA 2ASMA 4B1ZA 4J8FA 3VEOA 1RFQA 4Z94A 5BRHA 2NRHA 4EHTA 3LDLA 3CHWA 1GLDG 3WUHA 4EFHA 4C23A 1XC3A 3LDPA 2GWJA 3U4LA 4MLEA 2PAVA 1QQNA 4FWPA 4H5WA 1GLJO 4H5RA 3WQTA 5AQGA 3U8XA 2YHWA 2D0PA 3ZX0A 1WOQA 3SMSA 5E26A 3LM9A 2E88A 2IIRA 3FLCO 4PL7A 5AZJB 4EIAA 3H1QA 2QW9A 1LCUA 5FPEA 3WEEB 2I7PA 3UKUA 1NGJA 1HKBA 1YUWA 1GLFO 5AQPA 1T6DA 2ASPA 3O8MA 2PBDA 1TUYA 4FWMA 2FF6A 4CZHA 4BRLA 3DAWA 5JICA 1MDUB 3H3OB 4CZFA 3KVGA 3H3NO 2GTDA 4FWNA 2P9PA 4BC4A 4CBWA 1KAZA 1NGFA 5AQXA 3U9ZA 4CBXA 2NLXA 4BR7A 3CI5A 4JD2B 2AA4A 3EKSA 5BREA 4WQ5C 1BU6O 2E1ZA 2GEMA 4BGBA 3CERA 2GELA 1ATRA 3B8AX 3FZFA 5AQTA 3FZKA 1TYQA 5BPNA 3A5LC 1QQMA 1BUPA 3G25A 4PKHA 3VGMA 1DKGD 3HTVA 4CZEA 1ZBSA 2CH6A 3FZMA 3CJ9A 4B1YB 5AFUA 2QWMA 3CJAA 1S22A 4EAHD 3WXKA 3VF4A 2Q0UA 3AAQA 4IO8A 5AQKA 3F9MA 3O80A 3IMXA 4B9QA 4AM6A 4Y0WA 2FSKA 2A6AA 3OHRA 4K42A 2P9LA 3MK6A 5AQIA 2FSJA 3UKUB 3DXKA 5FPDA 4BRQA 1QHAA 4H5VA 3R8EA 5KPZA 2EWSA 4H0YB 3VGKA 5KPRA 4CZGA 3C0BA 4H0PA 1HX1A 3RSEA 2E1YA 5AQWA 4BGAA 3A8YA 3SJHA 1WUAA 3BF1A 2HOEA 2QM1A 3A0IX 2F9WA 2DPNA 4CD3A 4QS9A 4DHYA 1NBWA 3AARA 2H3GX 1Y64A 3JXUA 3QFUA 3MDQA 2V7YA 3O4WA 2YI1A 1TYQB 2IVNA 4GNIA 4BR5A 2YJEA 2QWLA 1NGEA 4K43A 3FE1A 4NO7A 1OKJA 5AQYA 4A2AA 2W40A 5ADXA 2D1KA 3WXJA 2QXLA 3M1FA 4DCHA 1U2VA 4QS8A 5AQQA 3D7EO 3W3DA 4FOIA 4BRIA 3LDQA 1GLCG 4BRMA 4BR9A 3O1WA 1X9JA 1C0FA 4BC3A 2GUPA 3VPZA 3WXLA 4BRGA 3CJBA 4MO5A 1QQOA 3S41A 1P8ZA 2UYTA 1LOTB 2Q97A 1CZAN 4ISFA 4JHDA 1R59O 1NGBA 2P9LB 5BPLA 4BVPA 4FL9A 3DXKB 1C0GA 4O8KA 2ZGYA 5AR0A 2D4WA 2QWRA 3H46O 2HF3A 4QS7A 2A41A 3SLCA 1NWKA 1SQKA 3RSEB 1SAZA 3VF2A 4BC5A 3J8AA 3UB5A 2CGJA 3CIPA 2Q0RA 1HKCA 5ELZA 3VEYA 4BR0A 3GG4A 1QZ6A 5AQRA 5FPNA 5KQDA 4PKIA 1U6ZA 5JLFA 1BDGA 5BPMA 1GLEG 4FWOA 2OANA 2P9UA 4BQZA 4B1WB 5BN8A 3GOIA 3M6GA 3CJCA 2P9KA 4HTLA 1X3NA 4FPAA 2V52B 2NZTA 3IDHA 4AM7A 3FFKB 3QBXA 2W41A 3QB0A 5I9EB 4H0XB 1U2VB 3DJCA 3U9DA 3EKUA 1BWFO 3D2EA 4CI6A 1KAYA 3KZBA 4O5FA 3HSCA 4A62A 4FWLA 3TU5A 3ATVA 5AQMA 1T6CA 4IZ9A 3VEVA 4BREA 4H5NA 2FF3B 1NGDA 3FZLA 4YDUA 4BRAA 4BRDA 1HUXA 3LDNA 1DEJA 4JHDB 1RDWX 1E4FT 1KAXA 2FXUA 3ZETA 3ULEA 3O6WA 1T44A 3DXMA 4WQ4A 3A5NC 3ZEUA 4A2BA 2CGLA 1HPMA 3CETA 3LDOA 5AQJA 4XH5A 5BN9A 2WUSA 3GBTA 4WYBA 5LY3A 3WXIA 3QMLA 1TUUA 3MMVA 4H0VB 5EY4A 5AQFA 4BRFA 1BG3A 1ATNA 5FPMA 4JN4A 2YHYA 4BROA 3SK3A 4CZJA 5ADXH 3A5MC 5BRFA 2A3ZA 2A40A 3QICA 3IUCA 1NGHA 3UKRA 4B1VA 4CZIA 2HMPA 2P9UB 3BUZB 4BR4A 2P9SA 4FO0A 3VGLA 4B1XB 4BRPA 2VYPA 2CGKA 2P9KB 4L3QA 1EQYA 3BP8A 1J6ZA 1Q18A 3GDQA 5EVZA 3ZX2A 1HJOA 3LM2A 5B8HA 3VETA 1ATSA 4EHUA 4YDUC 2E2PA 5AQHA 2QWQA 3AY9A 2ITMA 3EO3A 3AAPA 2GWKA 2I7NA 4BC2A 4GY2B 3D2EB 4IJAA 2FLOA 4NB4A 3I8BA 5BRDA 5LJVA 1JCEA 5F2RA 4JNEA 4H03B 4XH1A 3H45C 1JCGA 3FZHA 4IWVA 2A5XA 2YJFA 1NM1A 3ATUA 5E84A 4FWSA 3L4IA 3DWLA 3GL1A 3HZ6A 1XUPO 2YCHA 4FPBA 1NMDA 3ZETB 3ULEB 2E8AA 1NGAA 2QWPA 3DXMB 4WQ5A 2E2NA 4XEIA 3ZEUB 3EN9A 3IFRA 1G99A 2AP1A 5EXWA 3R9PA 3VENA 3SMPA 2ZWHA 3H6EA 3GE1A 2ASOA 3O5BA 4ISEA 2P9NA 3O1BA 4DQ8A 5AQZA 2A42A 1S3XA 3LL3A 3QFPA 3CJ7A 3M3ZA 1BA0A 4A61A 3CQXA 2E2OA 2P9IA 3P4IA 3VESA 4PKGA 2CH5A 4HWIA 3UKRB 5AFUH 1X3MA 2IVPA 4I6MA 4FOEA 3TPQA 1GLBG 2P9SB 4MO4A 5CE3A 3JS6A 5AQVA 1NGIA 4KBOA 3L0QA 1E4GT 3BF3A 3VOVA 1K8KA 2Q2RA 5AQSA 3VEZA 4JAXA 4BG8A 1BA1A 4CZKA 5BR9A 2QWNA 4H0OA 5AQLA 2VCPA 2V51B 4F9OA 3A5OC 4BRCA 2Q1NA 1MWKA 5F1XA 4CBUA 3ID8A 4PL8A 5AQOA 4H0TB 5F0XA 3C7NA 4LC9B 1Z05A 5AQUA 2BTFA 1MA9B 5AQNA 1NLVA 3D2FA 3H1VX 5AZIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HVRA 4RCHA 3RR8A 1KVCA 3I33A 3WT0A 1BI4B 4CF1A 4CIGA 4LF5K 2HBJA 3ULDA 4DV7K 4BG9A 3HM8A 3VEWA 1NK7A 1CZBA 2YHXA 1Q86O 3LAKA 3MN6A 2P9NB 4OX9K 4FJJA 5JLHA 1HLUA 2G8IA 2P9IB 4ELUA 3MECA 2QKKA 1VQNN 3CF5L 4CGDA 3CFRA 3WEEA 4M7XA 3I55N 1ESVA 3KK7A 5HROA 2F9TA 1LWFA 3MN5A 1FXXA 1VRUA 2E2QA 2KZMA 4M7YA 3MXMA 4ILHA 5FDLA 3VTIA 3AGKA 1FK9A 3EYZA 1B92A 3OYDA 3SAGA 4CJ7A 1ZXOA 4UY8O 1YXQA 2OPRA 3C7NB 3VF6A 5I3UA 4JKDA 1NJZA 3KKRA 2Q31A 4GW6A 3WQUA 4BE1A 1XQSC 2IDOA 4CGIA 3WNFA 5JVHL 1SZ2A 1TVRA 2EHGA 4HUFA 1S9EA 3MCPA 1YTAA 4ZHRA 4B1ZA 4J8FA 3PX4A 3DLEA 3NBPA 4EHTA 5KTQA 4CEOA 1Q7YO 3LDPA 4U67L 3AGRA 3M8QA 4LF4K 1WAJA 3JYTA 4H5WA 1WSFA 4Z4GA 3LM9A 1C0MA 4DQSA 2B4JA 4FJLA 4JS4A 4I9LA 1LCUA 5FPEA 3WEEB 1NGJA 3G71N 4BE0A 2JGUA 3AVKA 5BR8K 4C8KA 3L2RA 1RTIA 2I5JA 1A5VA 4CJ4A 1MDUB 3RTVA 2ZM6K 3RRGA 4DF8A 3C6AA 1TKDA 1ZBHA 3HRGA 3THYA 3NVKA 4EZ9A 4WQ5C 1T7PA 4BGBA 3HT3A 5J2MA 2GELA 1ATRA 1N33K 2WONA 4O8UA 5AQTA 3P1GA 3G0ZA 1TYQA 3L8BA 3A5LC 4DR5K 4DQIA 4OJRA 4DQQA 4PKHA 4JI7K 4KHWA 4DSIA 3RR7A 2ITGA 3LDSA 2QWMA 1LV5A 1KCFA 4BY9C 4DSFA 5CHIA 2Q0UA 4OGCA 3AAQA 1EP4A 3O80A 2UU9K 4QOZB 4B9QA 1NK6A 4Y0WA 2GBZA 3QEVA 4F3TA 5AQIA 4C8MA 2HHXA 5HRSA 1FJGK 3LANA 4BRQA 3R8EA 3IKMA 4CZGA 4I7FA 3AVGA 3C0BA 3KLIA 1RT1A 1HX1A 4V19S 5AQWA 3J80O 4FJ9A 3A8YA 3M8SA 3PO4A 3SJHA 1RT2A 3BF1A 3O9UA 1L3UA 4NCAA 3TSUA 4RW4A 4B3MK 3QINA 3NCIA 1NBWA 3AARA 4CF0A 3DLKA 4FYDA 3THYB 3QLHA 3AVFA 1HPZA 2PYLA 5GAHP 4KTWA 3MDQA 2V7YA 3O4WA 3P5JA 1TYQB 2IVNA 2YNIA 1VAZA 1UAXA 1U45A 4DTMA 1ITGA 4QS8A 3D7EO 4JKFA 3W3DA 1VHXA 4FOIA 1GLCG 4BRMA 2KFNA 3O1WA 1IG9A 3AO1A 2GUPA 2NUBA 1HQUA 3WXLA 3AVMA 2F8TA 3H08A 4I2QA 4B3OA 2HBMA 2UYTA 1LOTB 4OKEA 2Q97A 1NJWA 5BPLA 3ZSWA 2Z1GA 4WFBL 2GV9A 1C0GA 2ZGYA 5HRPA 3J81O 3PO5A 3VQ5A 2UUCK 1RDAA 1SAZA 4DU4A 1K9MO 3QNOA 1OVQA 3J7AP 3SUOA 5E41A 4JI3K 3SQ2A 1JL2A 2YNHA 4CJQA 4CJ5A 2VWKA 2DFFA 4AHUA 1K6YA 1EWRA 4AQYK 4DU3A 1X3NA 4FPAA 2V52B 1LAVA 2NZTA 4FCYA 1QVGM 3FFKB 4DLGA 3S3MA 4Y1DA 4CGGA 4E1MA 4H0XB 3U9DA 4J2BA 4KHSA 4E3SA 1I94K 3TU5A 4CHZA 4PHTX 1T6CA 3VEVA 1X9MA 4M3YA 2FF3B 1WBBA 2YNGA 1RILA 4DWIA 4DV5K 4BRDA 2E6MA 1HUXA 2LSNA 1RDWX 3NVMA 1E4FT 3CFPA 1M90O 1X1PA 3SAFA 1A5XA 4WQ4A 4A2BA 4CEQA 4BDZA 1TAQA 2FBXA 2Z1IA 4XH5A 5BN9A 4CEFA 5LY3A 3QMLA 3THVA 1FW6A 1TUUA 2A1RA 5EY4A 3AA2A 1YVUA 1ATNA 2ETJA 4CIEA 4JN4A 3KD5E 1TKZA 4WE1A 3CCJN 3A5MC 5KGWA 5BRFA 1S1TA 2A3ZA 4DFKA 4AHTA 3SUNA 3CM5A 4CJPA 2X78A 2VG6A 4FLVA 1QSYA 3KJVA 3OYHA 3RWUA 1NK5A 4BR4A 4YOVA 4BRPA 3D45A 4ID1A 3K59A 3BP8A 3CPWM 1J6ZA 3GDQA 3NF9A 2ITMA 2GWKA 2I7NA 4BC2A 4N41A 3LAMA 3BY5A 3ASMA 3QO9A 4HUEA 1RBTA 3DOLA 3CCQN 4FJHA 5J2NA 4M3XA 2W42A 1VQ6N 3I56N 4AH9A 1P90A 5D3GA 1S1WA 3FFIA 2YJFA 3ATUA 1SS6A 5E84A 3HPOA 3QEIA 3F5TA 3OY9A 1SL2A 4M42A 3NAEA 5GAEP 1XUPO 1NMDA 3K9KA 1NGAA 4XEIA 4DTPA 5HBMA 3ITHA 1IO2A 4DUZK 3O5BA 4ISEA 3QERA 1VSKA 4W5RA 1BCMA 3OS0A 4JI6K 1Q81O 3M3ZA 1JLEA 3KLGA 5HP1A 4YOYA 3CQXA 4IDHA 4M3TA 3DM2A 4CJRA 2XY8A 4A57A 1N6QA 2OA8A 2NRXA 4I6MA 3SPZA 2KFZA 2OCEA 1HYZA 1NGIA 1Z25A 1BL3A 1E4GT 4CEZA 3VEZA 4DG1A 1BA1A 2ZJPL 4YOXA 2QWNA 1S72N 3L4QA 4H0OA 4A59A 4F9OA 4NXNK 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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