5BRFA

Crystal structure of trypanosoma cruzi glucokinase in complex with inhibitor hpop-glcn
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
367
structure length
364
Chain Sequence
MNIKELSLHELCEELKTPAWNVPLTFVGDVGGTSARMGFVREDSVHACVTRYSMKRKDITELIEFFNEIIELMPASVIKRVKAGVINVPGPVTGGAVGGPFNNLKGIARLSDYPKALFPPGRSAILNDLEAGGFGVLAVSDAHVFSEYFGVMWEGTQWRTCEQEPAGSVIGRGRCLVLAPGTGLGSSLIYYNPMNQQHIVVPLELGSQTIPMRKDIDYIQTLHAELKLLPNYENMVSGAGLEFHYRQVVRGSRPPCSAGEIAKLASEGDANACKAMKKYHEYLMRVGSEASMALLPLTIVLVGDNIVNNAFFYRNPQNLKEMHREALNHEMERFGFQSRVTYLRQKKLLNLNLMGCYRCGLDLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure-based approach to the identification of a novel group of selective glucosamine analogue inhibitors of Trypanosoma cruzi glucokinase.
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma cruzi (strain cl brener)
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Glucokinase 1, putative
total genus 122
structure length 364
sequence length 367
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2015-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02685 Glucokinase Glucokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5brfA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 5brfA02
1BWFO 1HPMA 3VF6A 3IFRA 4CZLA 3VF4A 5CE3A 4BRCA 1BG3A 3ATVA 3WQUA 4IXCA 3HI0A 3SJHA 1E4GT 2V7YA 1XC3A 4RTFD 3R9PA 3CQXA 3VEXA 2FSJA 5AQHA 2A5XA 5FPNA 1U2VA 4DCHA 2A6AA 3ZETB 4MLHA 4XEIA 3VOVA 4EAHD 4H5NA 5BN8A 1D4XA 2HMPA 3GL1A 2F9TA 3IDHA 3L6QA 4FWRA 4QS7A 5EX5A 1YAGA 3I33A 5JICA 2CGJA 2E1ZA 1TYQA 2A40A 1IJJA 2V52B 1RDWX 3CJ7A 4NB4A 5AQGA 2GWKA 4FWLA 3VEWA 3ZEUB 5BRHA 3VF2A 2YJEA 1NGEA 5BPMA 1S3XA 4H5RA 3ZX3A 4PKHA 2Q2RA 4FOEA 2E20A 3WXKA 3CJ1A 3EZWA 4DQ8A 4WQ5A 1ZC6A 3CQYA 2P9PA 4PL8A 4JNEA 1WUAA 4I6MA 2E2QA 3C7NB 2VYPA 3UKUB 5AZJA 3ZETA 4CD1A 4FPBA 4EHTA 5AQMA 3DXMA 1HKCA 1NLVA 1NMDA 4FWQA 3CJ9A 3SLCA 5FPEA 2VWBA 4XH4A 1NGAA 1BOTO 1ATNA 1TUUA 2GTDA 3O1WA 4JHDB 3UE5A 1HKBA 2GWJA 1V4SA 4IO8A 1KXPA 2BUPA 3GG4A 5AR0A 5FPDA 3O6WA 4FOIA 1U6ZA 3VEYA 2IVPA 5E84A 3LM9A 2P9PB 3C7NA 3L0QA 1P8ZA 2NZTA 4I6MB 3O1BA 5AQRA 4MO4A 4CZGA 4NO7A 3H1VX 2P9NB 4BRMA 2BTFA 2QM1A 3VENA 5AQYA 4B1UB 2IVNA 5AQPA 5BREA 3TPQA 2ZGYA 4Y0WA 2QWNA 5BR9A 4H5VA 1X3NA 3BF1A 3FZMA 3M3ZA 4O5FA 3A5NC 2DPNA 3KHYA 1JCGA 2AP1A 4DB3A 4BR9A 1LCUA 5AQWA 1YXQA 5TKYA 2CGLA 4JAXA 3ULEB 5JLFA 1QZ6A 4EFHA 2D4WA 1NGHA 1GLBG 2FF6A 2UYTA 4BRIA 3H45C 4O8KA 3KVGA 4BG9A 1E4FT 4K25A 3R6MA 4BRKA 4XH5A 2P9IA 4H0PA 1QHAA 3ZX2A 2NLXA 1NWKA 4FL9A 4CBUA 1IG8A 1GLLO 1NGIA 3H1QA 2P9LB 4FWNA 4BRLA 1KAXA 3QDKA 4B1YB 4YDUC 2H3GX 4BROA 2FSKA 3U9DA 4BG8A 4IJAA 1YVNA 5AQVA 3O5BA 3CETA 1X9JA 2YHXA 1GLFO 2D1KA 3AARA 3J8AA 4H0YB 5EOYA 2F9WA 3S41A 1TUYA 3WEEA 2Q97A 3MK6A 1NBWA 5F2RA 3EL2A 5EXWA 3H46O 1C0FA 5AQUA 1GLEG 1BA0A 3JS6A 4GY2B 1KAZA 1G99A 2IIRA 2PBDA 4E1JA 2YHYA 1NGCA 4CI6A 3CHWA 4BRGA 3M6GA 3D2FB 4JD2A 2YCHA 4BR7A 3DXKA 3QICA 4QS8A 2A41A 1CZAN 1RGIA 5B8HA 4IWVA 2GUPA 3A5MC 3HZ6A 2V7ZA 3QBXA 2Q36A 2YI1A 3DXKB 3G25A 4WQ5C 5AQNA 5AZJB 1ZXOA 3UKUA 4H03B 4CZMA 3VPZA 4PKIA 2QWLA 3GDQA 4A62A 3FLCO 1HUXA 1EQYA 4H0XB 4HTLA 3MDQA 3EKSA 1HJOA 3GBTA 3ZX0A 1QQOA 1ATRA 4H5TA 3ULEA 4BREA 1ATSA 2IVOA 5JMVA 4H0OA 2OANA 4B1WB 4K41A 4A2BA 3U4LA 3FZKA 4BRFA 3VEZA 3AAQA 1MDUB 5KPZA 5E26A 4M63C 2J4RA 5AQLA 2NRHA 2A3ZA 3HTVA 1NM1A 5BRFA 3BP8A 3H3NO 3ID8A 4H0VB 1S22A 3U8XA 4FWSA 1NGDA 2HOEA 2P9LA 5EVZA 5KQDA 3O4WA 4JN4A 3KZBA 5AQIA 4CZIA 5LY3A 3MN6A 3VESA 4F9OA 4JHDA 2ITMA 2P9UA 3LDLA 2P9IB 5JLHA 4WYBA 2V51B 3EO3A 5AQFA 4CBXA 1GLCG 2P9UB 2ZGZA 2FXUA 1WOQA 2VCPA 2ZWHA 2FLOA 1Z6RA 1MA9B 4BQZA 4BVOA 4WQ4A 4BGBA 1NGBA 3QBWA 2YHWA 3W3DA 4M7XA 5F0XA 4BRHA 1HX1A 1MWKA 1SZ2A 3HBTA 3WT0A 1OKJA 4BRAA 4CZEA 3LL3A 4B1ZA 4Z94A 5BN9A 3FGUA 4FPAA 5KQ8A 5KPRA 4BRNA 3IUCA 2QWOA 5BPNA 5FPMA 4BGAA 1LOTB 3VEVA 5BRDA 3VERA 3W0LA 3LDNA 3ENHA 5AZIB 3OHRA 1DEJA 3WEEB 2ASPA 3QFPA 4A2AA 3DAWA 3CJCA 5AQTA 1T44A 3D7EO 2Q31A 3QB0A 3VGMA 1YUWA 2E2OA 1JCFA 2E1YA 2W40A 4RWTA 1BA1A 1Y64A 4IZ9A 4XH1A 2QWRA 3CERA 1NGFA 3H3OB 1NGJA 2ASOA 3C0BA 3DXMB 2GEMA 1QQNA 5AQZA 3GE1A 4CZKA 3JXUA 1Q18A 2E88A 4YDUA 3U9ZA 4JD2B 2QWMA 4FWPA 3O08A 3UKRB 1BDGA 3FZFA 3D2FA 2PAVA 3A5LC 3SK3A 3HSCA 2AA4A 3FE1A 2I7PA 1NGGA 3MCPA 1HKGA 1K8KB 3SMSA 3ZEUA 2Q1NA 2QWQA 5AZIA 3R8EA 4BQLA 2ZF5O 1KAYA 3LDQA 3MMVA 3WUHA 5ADXA 4FO0A 3LM2A 5AQQA 2YJFA 2P9SA 3CJAA 4FWOA 2P9NA 4K43A 4J8FA 4M7YA 2W41A 1ESVA 3B8AX 4BVPA 5AQXA 3CIPA 1SAZA 4B1XB 4BC2A 4H0TB 5AQJA 4BC5A 3P4IA 3RSEB 2QXLA 3DWLA 2HF4A 3EKUA 1R59O 1C0GA 4DHYA 3A0IX 5AQKA 2I7NA 4BR0A 5EY4A 1H1VA 4BRPA 4FWKA 5KPTA 4CJ7A 3SMPA 2EWSA 4HWIA 2D0OA 2HF3A 1BO5O 3VEOA 1DGKN 3TU5A 3D2EA 2QW9A 3O8MA 4A61A 1DKGD 3BF3A 1SQKA 1JCEA 1QQMA 4KBOA 2E8AA 4BC4A 3WQTA 5AFUA 3WXLA 4B1VA 1T6DA 1TYQB 4ISGA 3MN9A 5ELZA 4IJNA 2CH5A 2D0PA 3GOIA 2QWPA 3A5OC 1V4TA 3ATUA 4H5WA 3AY9A 3O80A 1XQSC 4MO5A 1GLDG 1J6ZA 1Z05A 3A8YA 3I8BA 4CBWA 5LJWA 2FF3B 3ENOA 4ISFA 3D2EB 4ISEA 4CZHA 4B9QA 1GLAG 2ASMA 4BRQA 3FZHA 2P9KB 3WXIA 3FZLA 4BR5A 5AFUH 3BEXA 5AQSA 3EN9A 2GELA 3BUZB 4L3QA 4LC9B 2Q0UA 3AAPA 3VETA 5AQOA 5LJVA 5ADXH 5I9EB 3F9MA 1BUPA 2FSNA 2WUSA 2P9KA 4BRDA 5BPLA 3UB5A 3RSEA 3CI5A 3IMXA 2CGKA 1ZBSA 2CH6A 3L4IA 3MN5A 1HLUA 3LDOA 1BU6O 4GNIA 1XUPO 3DJCA 1GLJO 4BR4A 2E2PA 4K42A 4FSVA 4EIAA 3QMLA 4FWMA 3QFUA 3FFKB 4CZJA 1QZ5A 2P9SB 3MN7A 3VGKA 4PL7A 3VGLA 3FR0A 4EHUA 1MWMA 1X3MA 4MLEA 4CD3A 4QS9A 4PKGA 4CZFA 2KHOA 4AM6A 3WXJA 2E2NA 4RCHA 3M1FA 5F1XA 1K8KA 4BR2A 3LDPA 3CJBA 4BC3A 1T6CA 4C23A 2Q0RA 3UKRA 1RFQA 3HM8A 1U2VB 2A42A 4WQ4C 4AM7A 3H6EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2F8TA 3RWUA 1HPMA 3VF4A 4LH4A 3EYZA 1A5XA 3J7AP 4J2EA 4M3UA 4IXCA 3SJHA 5JVHL 2O8CA 2V7YA 1KRPA 3TANA 3R9PA 4E0DA 2HHSA 2A5XA 3NH0A 1B9DA 4MLHA 1GOCA 4W5TA 4H5NA 4JK7A 2W42A 1D4XA 2F9TA 2Z1GA 4FWRA 4QS7A 5EX5A 3TSUA 1QSYA 1XI1A 4E89A 3LPTA 1J54A 3L8BA 3MXMA 2A40A 2V52B 1RDWX 3P39A 2YNFA 4NB4A 1SKSA 4FWLA 1IH7A 3AGKA 2VWJA 2ZQBA 3C94A 3WXKA 3EZWA 3CQYA 2P9PA 2OTJN 1RTHA 4I6MA 3C7NB 1RBSA 5HRRA 1WSGA 2QKKA 2ATQA 1OVYA 2QKBA 3DXMA 4JKGA 3CJ9A 3THYA 1BOTO 3UE5A 3KK3A 1SKWA 3DM2A 4IO8A 5AR0A 1NKEA 1I94K 3ALYA 3O6WA 4OKJA 4PQUA 3T1YK 4ZTFA 3LM9A 1X9MA 1P8ZA 3H1VX 3O3FA 2VGMA 3D0PA 1JLQA 2QM1A 3LP1A 5AQYA 2ZJRL 4B1UB 3NGZA 3J7ZO 4J2BA 4NYNA 3BF1A 4O5FA 2XO7A 4B3TK 1KTQA 2DPNA 1BISA 1NNEA 1JCGA 4RW7A 1VQMN 4LF5K 4LF8K 5C12A 4MQ3A 3AVIA 1SL0A 1YJ9N 2D4WA 1NGHA 4BRIA 4O8KA 3P31A 4KREA 4Z4EA 3A2FA 1NG9A 1S5JA 1E4FT 4KHQA 4BRKA 4DF4A 3MEGA 3VQ8A 3MXJA 4RW4A 3CD6N 2Z1JA 1RBVA 1NWKA 4FL9A 3SQ0A 1J5OA 1GLLO 1NGIA 3TWHA 3VTIA 3ZT0A 3HVTA 2OTLN 1YT3A 1KAXA 1IKWA 2B6AA 3ZSVA 4BROA 2NNWA 4GV6A 3TARA 1YVNA 4JRPA 2O8FA 1WLJA 4JKEA 1TAUA 3SBGA 3AVJA 3J8AA 1HQUA 1NK9A 5EOYA 2F9WA 4DTOA 3S41A 4LFAK 1W7AA 3WNEA 3PV8A 3D45A 2OCEA 4G9ZA 5EXWA 3H46O 3MEEA 1KVCA 4CF1A 4GKKK 2VG6A 4A5BA 3JS6A 4GY2B 4JEPA 1G99A 3HSTB 3E9OA 2KQ2A 4CJVA 1NGCA 2HBLA 1OH8A 1WAJA 4LSNA 2YCHA 3QICA 1VQNN 3T1AA 3RMBA 2A41A 2XY5A 4Z4FA 1CZAN 1RGIA 4FVUA 5B8HA 3HP6A 2GUPA 4U7BA 1YI2N 3HZ6A 1HYSA 5HP1A 3T7ZA 4JI1K 1XNRK 4AHTA 3CCMN 4JKCA 4WQ5C 2Z1HA 1ZXOA 3ZT3A 4PKIA 4DV1K 4PWDA 3GDQA 1LWEA 1HUXA 4HTLA 1NK7A 2DFHA 4YORA 5C25A 1ATRA 4H5TA 4CEBA 3ULEA 1BI4A 1T3VA 3HVRA 5DM7L 4Z4GA 5GIOA 3QINA 3QEPA 3ZT2A 3EE8A 4OGCA 1CLQA 1NK0A 3VTHA 4FLXA 4C1NI 3VQ6A 5AQLA 4J2AA 3V81A 2NRHA 5JS1A 2D0AA 5FRNA 5BRFA 1XNQK 3BP8A 4KPYA 4MDAA 3U8XA 4FJLA 3VQEA 4NCBA 1BQNA 1BHLA 4JN4A 2HBJA 3OYCA 2OPRA 3VESA 3MWPA 3LZIA 4JHDA 2HBMA 3LDLA 5I42A 4MFBA 2V51B 4E7IA 4KTZA 4HVJA 3PSIA 5CY4A 3IS9A 4BVOA 3KLIA 4WQ4A 3O3GA 3M5RA 4B9MA 4BRHA 1MWKA 1SZ2A 4FLVA 3ZSQA 1OKJA 4Z94A 2ZE2A 3FGUA 4OKEA 5KPRA 5M1OA 4IFVA 4AH9A 5IWAK 1TV6A 1LOTB 3LP3A 4BGAA 5FLXO 3W0LA 3OYDA 1VQLN 3P83D 4FW1A 4CJRA 5DK5A 4FJ8A 1D9FA 4A2AA 5GAGP 3DAWA 1HYZA 2FBTA 2WBNA 4CGGA 4Y1DA 4DSFA 1C0UA 1SV5A 3LANA 1YUWA 3K58A 4F2SA 4RW6A 1R0AA 4LF9K 1Y64A 3DMJA 4OJRA 3ZT1A 3C6UA 1FXXA 4IZ9A 5GINA 4YY3K 1TK8A 1CZ9A 2EX3A 1NGJA 4L8RB 4DFJA 3DXMB 5M1NA 1B92A 3I8DA 2GBZA 4JD2B 3OYEA 3SNNA 3PO4A 2D5RA 4DUYK 3SJJA 3NMUA 1BQMA 5HRSA 1HR0K 4EP5A 2P51A 3C6TA 5FRMA 3ZSOA 4KV8A 1X9WA 2G8IA 3MCPA 4FJ9A 1T03A 3SMSA 1EETA 3AVFA 2Q1NA 1OH7A 3R8EA 2WONA 3BGRA 1KAYA 3LDQA 5CYMA 4B8AB 4FO0A 1F21A 5AQQA 2YJFA 1Z26A 1UA0A 4J8FA 2IOCA 1YIJN 4BVPA 5AQXA 2GX9A 4B1XB 1UAXA 5AQJA 4BC5A 3LDSA 3EKUA 4OX9K 4FLUA 4C8NA 5JS2A 4IG0A 2PYJA 5EY4A 4CJLA 4I7FA 4BWJA 4NXNK 2QA4N 4DTXA 4BRPA 4CJ7A 1VQKN 5J2PA 3V6DA 3TAGA 5M1FA 4LD0A 3F2KA 3OJSA 3O8MA 1OH6A 4C8MA 2XRIA 1NKBA 2ZD1A 4JS4A 4KBOA 1NK8A 3C6HA 3L4QA 4M3YA 4CHQA 2YV0X 4HCBA 4IJNA 2UUCK 4IDHA 3GOIA 2Z1IA 4AILC 3ATUA 2FBYA 4ICLA 2HHQA 5LJWA 5C24A 5GAEP 4ISFA 4YNQA 4CZHA 4BE2A 4FJXA 1VQ7N 1KVAA 3VQ7A 4DTMA 1MU2A 4ZHRA 1KC8O 2G8UA 1DTQA 4B9VA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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