5BRFA

Crystal structure of trypanosoma cruzi glucokinase in complex with inhibitor hpop-glcn
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
367
structure length
364
Chain Sequence
b'MNIKELSLHELCEELKTPAWNVPLTFVGDVGGTSARMGFVREDSVHACVTRYSMKRKDITELIEFFNEIIELMPASVIKRVKAGVINVPGPVTGGAVGGPFNNLKGIARLSDYPKALFPPGRSAILNDLEAGGFGVLAVSDAHVFSEYFGVMWEGTQWRTCEQEPAGSVIGRGRCLVLAPGTGLGSSLIYYNPMNQQHIVVPLELGSQTIPMRKDIDYIQTLHAELKLLPNYENMVSGAGLEFHYRQVVRGSRPPCSAGEIAKLASEGDANACKAMKKYHEYLMRVGSEASMALLPLTIVLVGDNIVNNAFFYRNPQNLKEMHREALNHEMERFGFQSRVTYLRQKKLLNLNLMGCYRCGLDLS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glucokinase 1, putative
publication title Structure-based approach to the identification of a novel group of selective glucosamine analogue inhibitors of Trypanosoma cruzi glucokinase.
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma cruzi (strain cl brener)
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
total genus 122
structure length 364
sequence length 367
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2015-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02685 Glucokinase Glucokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5brfA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 5brfA02
3JXUA 3ZX2A 1BA0A 1KAZA 2P9PB 2FF3B 2D0PA 2A41A 4WYBA 1Z6RA 3H3OB 1WUAA 4FL9A 2P9SB 5AQHA 3I33A 2CGKA 1RDWX 3W3DA 4JD2A 1V4TA 3O1WA 4MLHA 3R8EA 2CH6A 1HUXA 3I8BA 2GWJA 2HOEA 1NGBA 2IIRA 4DCHA 2CGJA 5LJWA 3WXJA 3QFPA 4FSVA 5EY4A 1BUPA 2A6AA 5EXWA 3AAQA 1SQKA 1WOQA 5AQKA 5AZJB 2VCPA 2V51B 4BRDA 1XUPO 2VYPA 4PKGA 2FSKA 1NGHA 4CD3A 2YHYA 2W40A 3RSEA 1NM1A 3LM2A 4JHDA 1GLLO 2YHWA 3A8YA 3VPZA 1GLJO 2D1KA 1QQNA 3C0BA 3R6MA 2UYTA 4H0OA 5JICA 3DXMA 1BWFO 1HLUA 4BRLA 2OANA 2ZWHA 4BG8A 5BRHA 4NB4A 1P8ZA 4BRKA 3GDQA 3LDOA 3LM9A 3MN5A 2IVPA 4FWPA 3O80A 5CE3A 1X3MA 3ZETB 3O1BA 4EHUA 2V7YA 4BR9A 4QS8A 2P9LA 5AQYA 3GBTA 3VF6A 3KVGA 1U2VB 4WQ4C 3GL1A 5ELZA 2QM1A 3EKUA 4L3QA 2YJFA 3WXIA 3FZLA 2QWQA 4CBUA 4AM6A 1KAYA 4H0TB 4YDUA 5JMVA 4PL7A 4BRCA 3HM8A 2NLXA 1TUUA 3CJ1A 3QICA 3M1FA 3KHYA 4H0XB 3EN9A 4K25A 1H1VA 3IFRA 3VGMA 3IMXA 3WXLA 4BQLA 1NGEA 4M63C 5BPLA 2ZGZA 1OKJA 3UB5A 3D2EA 2I7NA 4A2BA 3BP8A 3FGUA 5BN9A 4JAXA 3QFUA 3VOVA 1NGFA 2NZTA 3KZBA 1ZXOA 3H1VX 4PKHA 5EOYA 2GTDA 3ENHA 3A5MC 4GNIA 5I9EB 5KQ8A 3EKSA 3H3NO 3EL2A 1NGGA 4CZIA 5ADXA 3LDQA 2P9UA 3TU5A 2P9KB 4BRFA 3IDHA 4BRAA 3M3ZA 4I6MA 4FWOA 3UKUB 4JN4A 4JD2B 4DQ8A 2PBDA 5AQOA 1NLVA 1YAGA 2D4WA 3HTVA 3CIPA 3ULEA 3DJCA 4BC4A 4IJNA 4Y0WA 5KPTA 5TKYA 4H0PA 2AP1A 1IJJA 2E20A 1R59O 2ZF5O 4FOEA 1DGKN 4ISEA 3M6GA 1ATNA 1YUWA 1KXPA 1CZAN 4H0YB 3VEXA 3VEVA 4BRGA 4H5VA 5AR0A 3VGKA 4BGBA 4IXCA 1BOTO 5F1XA 4MO4A 2Q0RA 4JHDB 2Q36A 4FPAA 2D0OA 4B1XB 4BC3A 3FZFA 4CZFA 3UKRB 3WEEB 3LL3A 3VEWA 4XH4A 3UE5A 4H5WA 2P9NA 4CBXA 2GELA 3HZ6A 1C0FA 4O8KA 2E1ZA 3FZHA 3FE1A 4A62A 5AQUA 4B1YB 3SK3A 2BUPA 1K8KB 4M7YA 2QW9A 3BEXA 4CZEA 2IVNA 2ITMA 4HTLA 3A5OC 2FF6A 2HF3A 1Z05A 1NGJA 2E2OA 4H0VB 4FWNA 3GOIA 1GLEG 5AQJA 2P9PA 2AA4A 2FSNA 4WQ5C 3O5BA 2QWPA 5JLFA 4BVPA 3BF3A 3C7NB 2E8AA 2PAVA 2KHOA 4QS9A 2P9SA 5AQRA 1DKGD 4IWVA 3D2FB 4BROA 1BG3A 1BU6O 3AY9A 3WQUA 4CZLA 3QBWA 4FPBA 4MO5A 2GEMA 1ESVA 1JCGA 5E84A 1JCEA 1GLDG 1Y64A 4B1UB 5AQFA 4F9OA 4ISGA 3A5NC 1ZBSA 3L6QA 3O6WA 1TYQB 3VEYA 2Q97A 3F9MA 3P4IA 4CJ7A 5AFUA 4BGAA 4CD1A 2E1YA 5EVZA 5LJVA 3L0QA 3VERA 2P9IB 3LDLA 1HKGA 2E88A 2HMPA 3MMVA 4E1JA 3QMLA 4KBOA 3FLCO 3R9PA 4M7XA 1GLAG 1RFQA 4BRMA 4BRNA 3AARA 2GUPA 3H46O 3DXKB 2F9TA 1IG8A 3W0LA 3BUZB 2QXLA 3D7EO 4RCHA 5BR9A 5FPDA 3GG4A 5AQIA 1RGIA 3FR0A 4XH5A 5AZIB 3ZEUB 5BRFA 3HBTA 4FWRA 1NGCA 1S3XA 3CJBA 3JS6A 3VEZA 4IO8A 3ZETA 1NGIA 1GLFO 4GY2B 5AQLA 4BQZA 2FSJA 1BA1A 4QS7A 4BR5A 4K43A 4BRIA 5AQWA 1HKBA 3H6EA 3EZWA 1J6ZA 3QDKA 2A3ZA 4Z94A 2ASPA 3EO3A 1XC3A 2QWRA 4B9QA 1U2VA 3VETA 4XH1A 3SJHA 5KQDA 4BG9A 4RTFD 4BRHA 4PKIA 3ATUA 4XEIA 4H5NA 1HPMA 1HX1A 1T44A 3VF4A 5AQVA 1QZ5A 3AAPA 4BR7A 5ADXH 3CQYA 2FLOA 2ASOA 2EWSA 5F2RA 2Q1NA 3U4LA 1ZC6A 3H45C 1LCUA 1T6DA 3CI5A 3TPQA 3ATVA 3U9DA 2YHXA 2J4RA 1X9JA 3CJ9A 3CERA 3CJ7A 3VF2A 3SLCA 4CZMA 1LOTB 4BR0A 4CI6A 3VESA 3MDQA 1GLCG 4FWLA 2A5XA 1S22A 5AQZA 3QBXA 5B8HA 3MN7A 1TUYA 3RSEB 3WUHA 4NO7A 1C0GA 2DPNA 2V7ZA 3J8AA 4DHYA 3ENOA 4WQ5A 2QWLA 4IJAA 2P9KA 3HI0A 2Q31A 4ISFA 3DXMB 1QZ6A 1NMDA 1NBWA 5KPRA 1NWKA 3VEOA 2A40A 1SZ2A 4MLEA 3FZMA 4BC5A 1JCFA 4BC2A 3WT0A 4BVOA 3S41A 5BN8A 1T6CA 3UKUA 3BF1A 2A42A 5LY3A 1MDUB 1EQYA 2V52B 2E2QA 3O08A 5E26A 5AQPA 4BREA 4EIAA 4H03B 3HSCA 1E4FT 2FXUA 4H5TA 5AQTA 2VWBA 2I7PA 2P9LB 4WQ4A 2WUSA 1V4SA 2W41A 4FWMA 3O8MA 2E2NA 3OHRA 3U8XA 4CZJA 3G25A 4DB3A 1MWKA 3MN9A 5FPEA 3A0IX 1YVNA 3CJAA 4A2AA 3H1QA 4EHTA 1BO5O 4EFHA 4FWKA 2ASMA 4C23A 3UKRA 4B1WB 3WEEA 3IUCA 3MK6A 3SMPA 4HWIA 5AZJA 4B1VA 1HJOA 4PL8A 1SAZA 2YI1A 1G99A 4BR4A 4CZGA 1K8KA 1NGAA 1GLBG 3O4WA 4AM7A 5AQQA 2QWMA 3D2EB 5AFUH 3WXKA 4K42A 4LC9B 2Q2RA 3SMSA 5BPNA 3LDNA 3FZKA 2YJEA 3A5LC 4EAHD 1QQMA 3FFKB 4IZ9A 1XQSC 3C7NA 4FO0A 4JNEA 2YCHA 2HF4A 3DWLA 1E4GT 3D2FA 4RWTA 2P9UB 4H5RA 1BDGA 4K41A 4I6MB 5KPZA 1KAXA 2QWOA 3ZX0A 5JLHA 1ATSA 5AQMA 4J8FA 3QB0A 1U6ZA 3MCPA 2IVOA 4BRPA 3ID8A 3ULEB 3CJCA 1NGDA 1TYQA 3MN6A 4FWSA 2ZGYA 3VGLA 5FPNA 5AQXA 2GWKA 5BRDA 2P9IA 3DAWA 1ATRA 3CQXA 4CBWA 2Q0UA 2NRHA 2CGLA 1QHAA 3ZX3A 3LDPA 4A61A 1Q18A 1MWMA 1YXQA 3DXKA 2F9WA 4YDUC 1DEJA 5BPMA 5AQSA 5F0XA 4CZHA 1HKCA 3CETA 5EX5A 3GE1A 3VENA 5AZIA 4O5FA 3ZEUA 2BTFA 1X3NA 5FPMA 5AQGA 1D4XA 2P9NB 2QWNA 3B8AX 3L4IA 5AQNA 3U9ZA 3WQTA 4BR2A 3CHWA 2CH5A 4B1ZA 4CZKA 1QQOA 4FWQA 4FOIA 4BRQA 2E2PA 1MA9B 2H3GX 5BREA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2UUAK 1KAZA 2P9PB 3VQ9A 3LP3A 4GV9A 2YNGA 3H3OB 4O44A 4LF6K 4W5RA 4M3RA 2P9SB 4EP5A 4KB0A 1HNVA 2CGKA 3PUFA 1IBLK 2D0BA 3O1WA 1HUXA 4LH4A 2GWJA 4DCHA 5LJWA 1XNRK 5DM7L 2A6AA 5EXWA 3MEGA 2LSNA 1SQKA 3Q7CA 1XUPO 2VYPA 1ZYQA 1NGHA 4O55A 1JLCA 4YY3K 3V9SA 3L3VA 1SS6A 2DFHA 3ZSQA 5HOOA 2WFBA 4JHDA 4B3RK 3A8YA 3VPZA 3SNNA 1QQNA 3NF9A 3NH2A 4H0OA 1HYZA 4U7BA 3QEXA 2ZWHA 1C0MA 1X1PA 3LDOA 3K9KA 4N41A 3J7YP 3MXJA 2IDOA 3KD1E 1XMOK 1VQ7N 4F8RA 3ZETB 1Q86O 4EHUA 5FLXO 4RW6A 4QS8A 2P9LA 4JYAK 4QOZB 4JI2K 4WQ4C 4N47A 4DS4A 1Q8IA 3OYLA 4F3OA 1RBTA 4PHTX 2YJFA 1T3VA 4E3SA 4DTMA 4BACA 4IBNA 3ZSWA 5KTQA 4JKGB 4ZTJA 4B9MA 5JMVA 4C8NA 4B9VA 1BCMA 1TUUA 2OA8A 3M1FA 2NRVA 3KHYA 5SZTA 3DLBA 4FJIA 1ILYA 3L2VA 4K25A 3TARA 1H1VA 3IMXA 3AA4A 3TTFA 3KK2A 4L8RB 4M41A 3S3OA 2Z1HA 4AHCA 4JK8A 3P31A 3BP8A 3CPWM 5BN9A 4JAXA 4CHOA 1NGFA 2IC3A 4KV8A 3KZBA 1D5AA 4PKHA 2GTDA 4LF7K 4CJEA 1YTAA 3A5MC 2GBZA 2D0AA 5I9EB 3EL2A 4MDAA 4CZIA 1XHZA 5D3GA 3LDQA 3TU5A 4FLUA 3IDHA 4RW8A 3PO5A 4BRAA 4IG0A 1RTHA 4FZYA 3P5JA 2NRTA 3LPUA 4FWOA 3OYDA 3UKUB 2DY4A 4JD2B 3VQCA 4JKFA 1I94K 3NVMA 3ULEA 1I3AA 3MCAB 1HNXK 1KVBA 2KZMA 1S1VA 1DGKN 4N56A 1KXPA 1CZAN 4H0YB 1VQ8N 4OVLA 4FJHA 5AR0A 3VGKA 1BOTO 3R3LA 3TR8A 4FPAA 4FVMA 2IOCA 3UKRB 2KFNA 3BDPA 1WAFA 4H5WA 4ELUA 4CBXA 1NK4A 1C0FA 2PFUA 3VQDA 3FZHA 4CHZA 4CK1A 2QA4N 4DR3K 3DLKA 4R5PA 1ZBFA 4E19A 1J53A 2QW9A 3BEXA 3KLFA 3VTHA 4O0JA 5TKWA 3A5OC 1FKPA 2FF6A 4FW1A 4AQYK 1N33K 4CVNE 4FWNA 4OGCA 5AQJA 2P9PA 2AA4A 4W5TA 3JYTA 1B9FA 3KLHA 5JLFA 4BVPA 3BF3A 2E8AA 2YHAA 2P9SA 2AJQA 3HPOA 4MDBA 1BU6O 3AY9A 3K5LA 3OBWA 4E7HA 2ETJA 5E84A 5SWMA 1GLDG 1Y64A 1U04A 3ZSZA 5M1FA 3C6TA 4LFCK 1ASWA 1JLGA 2NRWA 3AVIA 4ISGA 3T7ZA 4CFCA 3CCMN 3VEYA 3P4IA 3B6PA 3HP9A 1XC9A 4CF1A 3EY1A 3VERA 2ITGA 3LDLA 2E88A 1UA0A 4JI7K 3MMVA 4Z0UA 1GLAG 3AVGA 2QKBA 2XY7A 4BRNA 4C8LA 3H46O 4CFDA 3DXKB 3AGKA 1BI4B 3W0LA 4B3SK 4M3UA 3D7EO 1WAJA 2WOMA 5BR9A 3RMAA 5FPDA 3GG4A 3S3NA 4X66K 3FR0A 3CMEN 4HUFA 1HQUA 4E7JA 4FWRA 1WN7A 4F3TA 4DQRA 3CJBA 2Z1GA 3OBYA 3ZETA 3C6UA 4CJ4A 5A2QO 5AQLA 4BRIA 2HB5A 1HKBA 3EZWA 5M1NA 4Z94A 2A3ZA 5J2PA 1VSFA 1XI1A 4FK4A 3VETA 1FKOA 1QSSA 4RTFD 4E0DA 3CG7A 3NBPA 1HPMA 1KFSA 3QLHA 1XWLA 1RDAA 1T44A 1VRUA 3C6AA 4HVJA 3RTVA 1WLJA 5AQVA 1RBVA 5ADXH 1SKWA 4KH6A 4KHSA 3DLEA 4LH5A 5F2RA 1KD1O 3OYBA 3SZ2A 1LCUA 5HBMA 3TPQA 4K8ZA 1Q82O 3BY5A 3ATVA 1EP4A 3K9JA 3CJ7A 5GIOA 4B3MK 1WNSA 3VESA 3ZSRA 4A5BA 5HL7L 1WSGA 3LZJA 1S22A 4CHQA 3RSEB 3WUHA 4NO7A 2W6KA 1WSFA 3NH0A 3QETA 3ZLJA 5I42A 3ENOA 5LL6Z 4A5AA 3SPYA 2HHQA 2YHBA 1R0AA 3WXMB 3MXIA 2HSTA 3DXMB 4Q5VA 3NCIA 1NMDA 3VQ4A 1NBWA 2HBKA 2ZE2A 1RDBA 4MLEA 4DSJA 3S41A 3UKUA 3CCEN 3AVAA 5AQPA 4BREA 3AGRA 3HSCA 3PO4A 3LP1A 1YJWN 4MFBA 1RTIA 3LAMA 3V1OA 2E6MA 3KKRA 3ZSYA 3QEPA 2VWJA 1WBBA 3O8MA 3ISNC 5H1SQ 3CCQN 1RDDA 4F4KA 3U3GA 4JI1K 3HM9A 5FPEA 1ZBIA 4CECA 4FJNA 4DR6K 5GAGP 4A2AA 3H1QA 1ZBLA 1ASVA 4ID5A 1BO5O 2YV0X 1QSLA 2ASMA 4B3OA 3SQ2A 2HHTA 3UKRA 1WSHA 3IUCA 3BZKA 3SMPA 5AZJA 4DQQA 1OH6A 3O4NA 1G99A 4NYNA 3NF6A 3I8DA 2QWMA 5CZ2A 2QKKA 4N76A 1VSEA 1BISA 2ZJQL 4J2AA 4ELTA 1IV0A 2EHGA 3FFKB 3VQ6A 3DOKA 1TK5A 3CCVN 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 4AM7 A;  2YNF A;  3CCU N;  5AFU H;  5JVG L;  4K42 A;  4LC9 B;  1KLN A;  4FXD A;  3J81 O;  4DV7 K;  3FZK A;  2UU9 K;  3HXM A;  3QER A;  1TL1 A;  1YT3 A;  4DTO A;  4IZ9 A;  3E1Y A;  4FJJ A;  4JNE A;  4FJG A;  2YCH A;  3K58 A;  3D2F A;  3LZI A;  2VGN A;  3T1A A;  3THW A;  4H5R A;  4CHN A;  3F5T A;  2PZS A;  1NK7 A;  5JLH A;  2G8F A;  1TV6 A;  3QB0 A;  1BIU A;  4BRP A;  1RCH A;  3ID8 A;  3ULE B;  4KHP K;  4FJX A;  1TYQ A;  4IEE A;  5BRD A;  3RR8 A;  3DLG A;  1ATR A;  1TKT A;  2Q0U A;  1QHA A;  2BE2 A;  1Q18 A;  2UUC K;  1YXQ A;  4CF9 A;  4J2D A;  4E89 A;  2RF2 A;  1HKC A;  3CET A;  3D45 A;  3VEN A;  2KQ2 A;  4ICL A;  3KLE A;  2X74 A;  1ITG A;  4JI6 K;  2JWK A;  4CK3 A;  5FPM A;  2QWN A;  3F9K A;  5AQN A;  3U9Z A;  4BR2 A;  1BHL A;  4B1Z A;  2HHS A;  3CFO A;  5EU7 A;  3Q7B A;  1ZBU A;  3OYM A;  4GMJ B;  1NK5 A;  4CES A;  1TGO A;  4JKH A;  1LW2 A;  2H3G X; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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