5BRFA

Crystal structure of trypanosoma cruzi glucokinase in complex with inhibitor hpop-glcn
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
367
structure length
364
Chain Sequence
b'MNIKELSLHELCEELKTPAWNVPLTFVGDVGGTSARMGFVREDSVHACVTRYSMKRKDITELIEFFNEIIELMPASVIKRVKAGVINVPGPVTGGAVGGPFNNLKGIARLSDYPKALFPPGRSAILNDLEAGGFGVLAVSDAHVFSEYFGVMWEGTQWRTCEQEPAGSVIGRGRCLVLAPGTGLGSSLIYYNPMNQQHIVVPLELGSQTIPMRKDIDYIQTLHAELKLLPNYENMVSGAGLEFHYRQVVRGSRPPCSAGEIAKLASEGDANACKAMKKYHEYLMRVGSEASMALLPLTIVLVGDNIVNNAFFYRNPQNLKEMHREALNHEMERFGFQSRVTYLRQKKLLNLNLMGCYRCGLDLS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glucokinase 1, putative
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi (strain cl brener)
publication title Structure-based approach to the identification of a novel group of selective glucosamine analogue inhibitors of Trypanosoma cruzi glucokinase.
pubmed doi rcsb
total genus 122
structure length 364
sequence length 367
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2015-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02685 Glucokinase Glucokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5brfA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 5brfA02
3CI5A 3FLCO 1NGCA 4CD1A 3VESA 3GBTA 4H0XB 2Q1NA 4WYBA 3C7NA 5AQTA 3CJ7A 3QMLA 4A61A 1YUWA 3UKRA 2QWRA 1IJJA 3SMSA 1HJOA 1T6CA 2CH5A 1Z05A 2CGJA 2V7YA 3LL3A 4H0PA 2QM1A 3O4WA 3VEVA 3LDLA 4ISEA 4O8KA 2HMPA 1NGBA 3WXLA 3FE1A 1GLFO 2FF6A 1K8KA 1ATRA 4FWRA 2P9PA 3JXUA 2HF4A 1Q18A 2YCHA 1RFQA 3CJCA 1SAZA 4BRAA 1C0FA 1LCUA 3VF2A 4BRIA 5B8HA 2NZTA 1EQYA 1SZ2A 3ATVA 2YHXA 3L6QA 5JLFA 5F2RA 1KAYA 4AM7A 2OANA 5AQXA 4IJNA 1Z6RA 4BREA 2EWSA 2QWMA 4EFHA 1U2VB 4I6MB 2QWPA 3AARA 4FSVA 4IJAA 1TYQB 3EKSA 2YJFA 1U2VA 3O5BA 4PL7A 3IFRA 5AQOA 2A3ZA 2Q31A 4YDUA 4BRGA 1Y64A 3L4IA 4CJ7A 4H5NA 3R9PA 3VGMA 3MN9A 5BPLA 4CZIA 2P9IB 1HKCA 3QFUA 4HTLA 4XH1A 4B1ZA 2W41A 3KVGA 1ZC6A 3DJCA 3EL2A 2GWKA 4CZGA 3KZBA 3HZ6A 2QXLA 4MLHA 1OKJA 4B1XB 4BRPA 2P9IA 4FWSA 3A5MC 2P9NB 2ASOA 3EZWA 4MO4A 3RSEA 2P9LB 3HTVA 2E1ZA 5AQFA 5JMVA 2GTDA 5AQNA 1XC3A 1IG8A 4E1JA 4H5WA 5AQWA 4CI6A 5AFUH 4BR4A 2FSNA 4A62A 1BG3A 3QDKA 5AZIB 1BU6O 5AZJB 4BRKA 3GDQA 4BR2A 2PAVA 4BRDA 5I9EB 1T44A 5AQRA 4H0YB 3ZETB 4WQ5A 1TUUA 2P9PB 4BR5A 3L0QA 2AA4A 2AP1A 4KBOA 1ESVA 4XH5A 4EHTA 4BC4A 1GLLO 4FOEA 3I33A 3LM2A 3D2FB 1WUAA 2F9TA 3HSCA 3U9DA 2GWJA 4AM6A 1YXQA 2D4WA 2QWNA 3C0BA 4JD2B 4H5VA 1KAZA 1GLAG 3LM9A 3MDQA 3SLCA 2P9NA 3P4IA 2YHWA 4DQ8A 1V4TA 1P8ZA 1BA1A 3MN5A 4PKGA 2ITMA 1KXPA 3U4LA 1XQSC 3VEYA 4YDUC 2E2NA 3CJ9A 4H5TA 2P9UA 2Q97A 5AQMA 3WEEB 1G99A 4BRMA 5EOYA 3R6MA 3TU5A 3ZEUA 3U8XA 3O1BA 4FL9A 3LDOA 3F9MA 2E20A 5KQDA 2FF3B 3H46O 1NGHA 4FOIA 2NRHA 4K25A 3FFKB 4RCHA 3RSEB 2P9SB 3U9ZA 1T6DA 1TYQA 2D1KA 4H0VB 3CQYA 2PBDA 2QW9A 3ATUA 3VEXA 3VPZA 3VERA 3H1QA 3D7EO 5AZIA 3S41A 1XUPO 4M63C 5BRFA 3D2EB 5EXWA 3A5OC 1BA0A 3EKUA 4HWIA 4IXCA 3WXJA 3DXMB 4H03B 4B1UB 1GLJO 4JHDB 2BUPA 5BN9A 3WUHA 1QQNA 2V51B 3B8AX 1HUXA 3MMVA 4WQ5C 4M7XA 5FPNA 4L3QA 3GL1A 3H3OB 4BC5A 1HKBA 2P9KB 3G25A 2E2OA 4FWKA 2P9SA 3CJAA 3LDQA 1ZBSA 4BG9A 3CETA 4RTFD 2Q0RA 2P9LA 2FLOA 3LDPA 4MO5A 3UKRB 2FSJA 3VOVA 5LJVA 2CH6A 5AZJA 5BR9A 2HOEA 3SK3A 3R8EA 4CZMA 3VEZA 3H6EA 1BUPA 1JCGA 4IZ9A 1J6ZA 2F9WA 4GY2B 3WXKA 2ZGZA 3O08A 4M7YA 4Y0WA 5AQGA 5EX5A 3QB0A 3M1FA 3DXKA 4CBWA 3VENA 4B9QA 4A2AA 2CGKA 4BC2A 1GLEG 4WQ4C 2V52B 4FWQA 2YI1A 1NWKA 2IIRA 2E2PA 1ZXOA 5BPMA 3MCPA 2FSKA 3FZLA 4NB4A 3ENHA 1DEJA 3FZKA 4BRQA 3ZX3A 3JS6A 1DGKN 1QQOA 2P9UB 4BGBA 3O1WA 3QFPA 4C23A 5EVZA 1H1VA 3BP8A 4J8FA 4RWTA 4Z94A 3GE1A 2GUPA 3A0IX 5FPDA 2IVPA 2NLXA 1GLCG 3WT0A 4BR9A 5AQUA 5AQHA 2A5XA 3UKUB 4CZLA 2A41A 2IVNA 1QZ5A 2ZF5O 3HBTA 1MDUB 3DWLA 3EO3A 1QZ6A 3H45C 4ISGA 4JNEA 1RDWX 5KQ8A 4BC3A 3AY9A 4FWOA 5AQVA 5AFUA 3QBWA 4MLEA 4BG8A 1BWFO 3VF6A 3J8AA 4FWMA 1X3NA 3FZFA 3BUZB 3ENOA 3CQXA 2ZWHA 4B1WB 4B1VA 3IMXA 5AQKA 4K41A 1YAGA 3BF1A 3MN6A 2IVOA 4XH4A 5EY4A 1YVNA 1NGFA 1LOTB 1U6ZA 5ADXA 4NO7A 3VETA 4XEIA 4FWNA 2UYTA 5AR0A 3HI0A 1NGDA 3M6GA 3C7NB 1NGIA 2I7PA 5AQQA 4EHUA 3UE5A 3O6WA 3UB5A 4QS8A 4BRLA 1BDGA 2P9KA 1NBWA 2FXUA 3O80A 2VWBA 5AQLA 4EIAA 3D2FA 1NGJA 2V7ZA 1WOQA 4BRHA 4FWLA 2YHYA 3ULEA 3LDNA 2E2QA 1JCEA 2Q36A 4K42A 1HKGA 2QWQA 2GELA 3ULEB 3ZETA 3A5LC 1ATNA 3AAQA 5ELZA 3H3NO 1MWMA 3H1VX 4BQLA 3BEXA 1X3MA 3MK6A 5ADXH 4QS9A 4BRFA 3SJHA 3UKUA 5BPNA 1NMDA 3CHWA 5BN8A 3CJ1A 3ZEUB 3I8BA 4JN4A 1C0GA 1QQMA 3TPQA 5FPEA 3WQUA 2Q0UA 4H5RA 4ISFA 3FZHA 1S3XA 4I6MA 5JLHA 1RGIA 3A8YA 1BO5O 4JD2A 4CZKA 3QBXA 1GLBG 1TUYA 2W40A 5KPTA 1NLVA 5KPZA 3GG4A 3MN7A 5FPMA 3D2EA 3SMPA 2E88A 3VEOA 3ZX0A 3FGUA 3WXIA 1SQKA 5CE3A 4BRCA 2HF3A 3O8MA 2CGLA 4H0TB 2BTFA 3FZMA 3EN9A 2ASPA 3ID8A 4IWVA 3W3DA 3AAPA 3KHYA 4PKIA 4FWPA 4H0OA 1NGEA 1MA9B 4K43A 3GOIA 4FPAA 1MWKA 4IO8A 4PL8A 4BQZA 2E8AA 3QICA 1HLUA 2YJEA 3A5NC 3VF4A 5AQZA 2QWOA 3FR0A 5BRDA 3DXMA 4CZJA 4B1YB 1GLDG 2A6AA 2ASMA 4GNIA 4BROA 5LY3A 3W0LA 5KPRA 4LC9B 3DAWA 1QHAA 2QWLA 1R59O 5BREA 1ATSA 2D0PA 4O5FA 4JAXA 4CD3A 4BGAA 1NM1A 4DB3A 5LJWA 5AQSA 3VGLA 3CJBA 2E1YA 1BOTO 2Q2RA 4DHYA 4CBUA 5TKYA 1X9JA 1DKGD 5AQJA 3BF3A 4A2BA 2J4RA 4QS7A 2DPNA 4CZHA 4CZEA 1KAXA 5E26A 3VEWA 3WEEA 4BVPA 2D0OA 1NGGA 4PKHA 4DCHA 1JCFA 3OHRA 1S22A 4CBXA 1E4FT 4BRNA 5F1XA 3CIPA 3DXKB 5AQYA 3WQTA 5JICA 3HM8A 1V4SA 5BRHA 1NGAA 5AQIA 3VGKA 4WQ4A 4EAHD 2H3GX 3IDHA 5E84A 1HX1A 3ZX2A 2VCPA 4FPBA 2GEMA 2A42A 4BVOA 1HPMA 2A40A 2WUSA 3IUCA 2KHOA 4BR7A 2ZGYA 4FO0A 4JHDA 3CERA 4BR0A 1K8KB 4F9OA 3M3ZA 1CZAN 4CZFA 2I7NA 5F0XA 1D4XA 1E4GT 2VYPA 5AQPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CI5A 3RMAA 4H4OA 4WYBA 1VAZA 3DOKA 5A2QO 2XY8A 5AQTA 4A61A 3UKRA 2QWRA 3BDPA 3SCXA 1VQ7N 3SV3A 1JLGA 1S1WA 1T6CA 1C1CA 3LL3A 4DSLA 1RTDA 4DR5K 4E89A 3LDLA 4ISEA 4IO9L 5EU7A 1TK0A 1K8KA 3TARA 2HBLA 2D0BA 4BRAA 1KVAA 4NYNA 1EQYA 2JWLA 1KSPA 3ATVA 3M8RA 5F2RA 4AM7A 2OANA 1NK4A 5AQXA 4DR6K 4IJNA 1VSEA 4BREA 2QWMA 4M3YA 4EFHA 1KTQA 4M3RA 2HB5A 1Q9XA 3C6HA 4C1NK 1BI4A 2UXCK 4PL7A 3IFRA 3QEPA 4LSLA 4YDUA 5FDLA 3OYCA 3L4IA 1VSMA 4AF1A 5BPLA 1NK5A 4C8MA 1IV0A 1HKCA 4KH6A 3DRPA 3L2WA 3DJCA 4PY5A 3CG7A 3ZSWA 4B1XB 4BRPA 1OKJA 4DQRA 4YY3K 3S9HA 5DM6L 4MO4A 4JS4A 3HTVA 4FM2A 1M90O 5AQNA 4E1JA 3THXA 5AQWA 4CI6A 5AFUH 1RBVA 5AZIB 4AHSA 4NLBA 4X62K 3SNNA 1RBRA 4GKKK 4FJHA 1IBLK 4WQ5A 2F96A 4KBOA 3CCEN 1HMVA 4KH4A 4PQUA 4DR3K 3CFRA 4CK3A 3D2FB 1WUAA 1TGOA 3HSCA 4RW4A 2XY6A 4AM6A 1YXQA 4FJJA 3C0BA 1LV5A 1GLAG 3LM9A 2HHHK 1HJRA 4DQ8A 1X9WA 1LAVA 4JI4K 2XY7A 3ZYYX 3OYEA 5AQMA 4BRMA 3O3GA 2HW3A 2DFFA 5EOYA 3K0SA 3R6MA 3ZEUA 3LDOA 2E20A 1JLQA 4DR7K 2FF3B 1NGHA 2YNGA 2NRHA 2FBTA 3RMCA 2P9SB 1T6DA 2D1KA 1HNIA 2PBDA 4FJ8A 3EZ5A 1MU2A 3VERA 3HL8A 5AZIA 3D7EO 1XUPO 4M63C 3FFIA 5H1SQ 3TTCA 5EXWA 1B9DA 4YOWA 3DLRA 3OYKA 3ZSRA 1W9HA 4FLXA 2VGNA 4B1UB 4DWIA 4JHDB 1JLBA 2V51B 3AVFA 1HUXA 3MMVA 4OLAA 4DS5A 1W7AA 3ZSYA 5FPNA 4L3QA 4X66K 2P9KB 3AVBA 3ID6A 4O55A 3DLHA 4JI5K 4IKFA 1VRTA 3CETA 4DKWA 2Q0RA 2GX9A 1NKBA 3K57A 3CC7N 4PHTX 2YNHA 2FSJA 3PV8A 2CH6A 4FJ5A 3WNHA 3TANA 1BHLA 1LW2A 3VEZA 1JCGA 3K5LA 4GY2B 2KZMA 4I7FA 3WXKA 2BANA 4JI1K 4JI2K 1IO2A 3DXKA 3AA2A 5C25A 4KV8A 4Z4HA 5K14A 1NU0A 1GLEG 2NRWA 4CEFA 2KW4A 2RF2A 1XHXA 1B9FA 3FZLA 4DTPA 3ENHA 4DV2K 2RHKA 1QQOA 4JKHA 1QTMA 4FJMA 3THYA 4C23A 4J8FA 4Z94A 2QA4N 1IKYA 1S6PA 2GUPA 2HNDA 3NF6A 4ELVA 1KVBA 4B9VA 5FPDA 1VQNN 2O8CB 2R7YA 1NJWA 2IVPA 1GLCG 3I0RA 4IFYA 4BR9A 3V9WA 1YI2N 1WSJA 4GV3A 1OH7A 5AQHA 3UKUB 4JKGA 5MLCQ 2HHUA 1U4BA 2DFHA 4CHNA 3I8DA 3HBTA 1MDUB 1KLNA 1QZ6A 4FLVA 1WSEA 3PO5A 1RDWX 4BC3A 4JI8K 3MXJA 1YVUA 3AVNA 5HLFA 2G8KA 2HHWA 3OS2A 4FJIA 2WC9A 1UA1A 4YOXA 3BGRA 3CQXA 2ZWHA 4A57A 4MDBA 4B1VA 3SUOA 4K41A 3P39A 3SAGA 1LOTB 4NO7A 5LL6Z 5GADP 4DV0K 3V9XA 2UYTA 1VSLA 3HI0A 4B9NA 1IKVA 3ALYA 4EHUA 4WFNL 3O6WA 3QO9A 3UB5A 1XNRK 4BRLA 1ZBIA 2P9KA 3NCIA 2FXUA 4M3UA 1VRUA 1TK5A 2KLAA 1NGJA 4BRHA 3KK3A 2YHYA 1J5OA 1RDUA 1N5YA 3LDNA 2E2QA 1JCEA 3THXB 1Y97A 3OVNA 2EHGA 3ULEB 1ATNA 2E6LA 4CK1A 2HNYA 3AVAA 4OKJA 3BEXA 3SJHA 2HVIA 4CW7B 2YHBA 3BZCA 1D9DA 4Z4IA 3CHWA 2FBXA 1C0GA 4M3XA 2Q3SA 4H5RA 3NFAA 4I6MA 5JLHA 1OH6A 2GV9A 3L3UA 1GLBG 1TUYA 4CJVA 5KPTA 1NLVA 5KPZA 1QVGM 3GG4A 1BQNA 4JK9A 5FPMA 3SMPA 1DT9A 2E88A 4IFVA 3JSMA 3WXIA 5CE3A 4BRCA 2HF3A 1VSIA 2CGLA 2WFBA 2Z1GA 4H0TB 4CJEA 3SUPA 3K9JA 3KKSA 4LFCK 2BTFA 4BY9C 4KREA 3W3DA 3AAPA 3O9SA 3DYAA 4FWPA 4HVJA 1MA9B 3NMUA 4PL8A 1TV6A 3AV9A 2E8AA 5IWAK 2WOMA 3CC2N 3A5NC 4BWMA 3VF4A 5JVHL 3V1RA 2QWOA 1CXQA 3MX5A 4CZJA 1GLDG 2A6AA 4CGHA 1N6QA 4GNIA 5FRMA 3DAWA 1R59O 3LWLA 4CFCA 1YTAA 4CD3A 4O5FA 3OYBA 4K8ZA 4BGAA 4UY8O 4C8NA 2O8DB 2E1YA 5M1QA 4DV7K 2OPPA 4H4MA 1DKGD 3ZSVA 3EYZA 4CZHA 1S9GA 4IEIA 3VEWA 2P1JA 4DTXA 1Q81O 3DLBA 1NGGA 4PKHA 3L3VA 1E4FT 4DFMA 3ITHA 5AQYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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