5BRHA

Crystal structure of trypanosoma cruzi glucokinase in complex with inhibitor dbt-glcn
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
367
structure length
367
Chain Sequence
MNIKELSLHELCEELKTPAWNVPLTFVGDVGGTSARMGFVREGKNDSVHACVTRYSMKRKDITELIEFFNEIIELMPASVIKRVKAGVINVPGPVTGGAVGGPFNNLKGIARLSDYPKALFPPGRSAILNDLEAGGFGVLAVSDAHVFSEYFGVMWEGTQWRTCEQEPAGSVIGRGRCLVLAPGTGLGSSLIYYNPMNQQHIVVPLELGSQTIPMRKDIDYIQTLHAELKLLPNYENMVSGAGLEFHYRQVVRGSRPPCSAGEIAKLASEGDANACKAMKKYHEYLMRVGSEASMALLPLTIVLVGDNIVNNAFFYRNPQNLKEMHREALNHEMERFGFQSRVTYLRQKKLLNLNLMGCYRCGLDLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Glucokinase 1, putative
publication title Structure-based approach to the identification of a novel group of selective glucosamine analogue inhibitors of Trypanosoma cruzi glucokinase.
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma cruzi (strain cl brener)
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
total genus 123
structure length 367
sequence length 367
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2015-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02685 Glucokinase Glucokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5brhA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 5brhA02
3I33A 4RCHA 3H45C 4EHUA 2QXLA 3CJBA 3D2EB 1NGCA 3WUHA 3JXUA 2ITMA 2GWJA 2ZGYA 4FSVA 4K25A 5AQNA 3FR0A 1KAYA 4BRQA 2V7ZA 1NM1A 3VOVA 3SJHA 1MWMA 4H0VB 5AQLA 3AAPA 5LY3A 3GE1A 2F9WA 4O8KA 4BRFA 1U6ZA 3KHYA 3HZ6A 1RFQA 5AQZA 3H46O 4BQLA 3IMXA 3VPZA 4BG8A 2E2QA 4H5WA 3EKUA 2FSJA 5TKYA 3A5LC 3DXKB 2ASOA 3LL3A 1U2VA 4L3QA 3VEOA 1ATNA 4CZLA 5F1XA 1TUYA 2IVPA 3O8MA 5E84A 3RSEB 3GBTA 5KQ8A 2YI1A 4AM7A 1ZBSA 1KAZA 3VEVA 4BRMA 3U4LA 3GOIA 3ZX2A 4CZEA 4BQZA 1MWKA 4B1XB 3CQYA 3U8XA 2P9NB 3CJCA 4EFHA 3OHRA 1X3NA 5EX5A 3H3NO 3AAQA 1LCUA 4H0TB 2P9KB 2W41A 4FWMA 4JHDB 3BP8A 3WEEB 3VETA 2P9UB 5BRDA 4A61A 3D7EO 1NGAA 2GWKA 1TUUA 3FZLA 3O1BA 2P9LB 3MCPA 4QS7A 3FE1A 1KXPA 2ZWHA 4FWRA 3R6MA 4CZHA 3WQUA 5JMVA 4FL9A 4B1YB 4MO4A 5EY4A 1NGBA 2A6AA 3VENA 2NZTA 2QWLA 5AZJB 4H5NA 4BGAA 3QBWA 3L4IA 5AQRA 2Q97A 1OKJA 3ULEA 4CBUA 3J8AA 4HTLA 3A0IX 4E1JA 1Z05A 1KAXA 2ASMA 4BRNA 4ISEA 4BGBA 4CBWA 4B1WB 5BPNA 4WQ4A 2FSKA 4B9QA 4BRIA 5CE3A 3O5BA 3M1FA 2KHOA 4KBOA 5AQMA 3DWLA 4FPAA 3CETA 4BG9A 1YAGA 2CGJA 4A62A 4FOEA 2E2OA 2QW9A 3P4IA 2QWOA 2E1ZA 2CH5A 1EQYA 1K8KA 3SMPA 3UKRB 4ISFA 3VEYA 1BOTO 2QWNA 1RGIA 3H1VX 2Q36A 3FZFA 2CGLA 2EWSA 1IG8A 3QICA 4FOIA 5BN9A 3D2FB 2A3ZA 5BPLA 2YCHA 4FO0A 4FWPA 3O1WA 3DXMA 3ENOA 2DPNA 5BN8A 5AQSA 3H6EA 3TPQA 1SAZA 1TYQA 2V52B 2Q1NA 3EKSA 1BU6O 4CZFA 4H03B 1NMDA 5KPTA 1BA0A 3VF6A 3A5OC 2IIRA 5JICA 3VGMA 3I8BA 5FPMA 4A2BA 2IVNA 5AQKA 2CH6A 1J6ZA 4XH5A 3QMLA 1NGEA 3ATVA 4IJNA 4BREA 4BC5A 2YHXA 3SMSA 5AQXA 2YHYA 5AQHA 1NGIA 4JN4A 4BC4A 3L0QA 3LDPA 4BR7A 1P8ZA 3C7NB 5AQGA 1C0GA 3WXIA 3O08A 5AQYA 1S3XA 5AQVA 3R9PA 2A40A 2FF6A 4YDUC 3F9MA 2FXUA 2D0OA 3BEXA 4ISGA 1T6CA 2E2PA 5AZIB 3VEXA 3HM8A 3DAWA 1GLCG 3A5NC 3ULEB 5BR9A 4BRHA 4BROA 5BRHA 3W3DA 3MN7A 3WXKA 5KPZA 1DGKN 3BF1A 5AQIA 3WXLA 4BR9A 4JAXA 2HMPA 1SQKA 1GLDG 3DJCA 2GUPA 3WT0A 3LM2A 1S22A 5FPNA 2P9PA 1BDGA 4CZJA 5ADXA 4CZGA 1QZ5A 1GLLO 2Q2RA 4BVOA 1K8KB 3CERA 2J4RA 2VCPA 4FWQA 3H3OB 1E4GT 1SZ2A 4B1VA 3JS6A 1NLVA 5AQPA 1HUXA 3M6GA 4BR4A 4WQ5A 1NGFA 4PL7A 3ZX3A 1ZC6A 3FFKB 3G25A 4MLHA 2I7PA 2W40A 4DQ8A 3GG4A 3DXMB 3WQTA 3ZETA 1H1VA 5JLHA 1QZ6A 4XH4A 1TYQB 1GLEG 2I7NA 1DEJA 1JCGA 2VWBA 2AP1A 1T6DA 3D2EA 4NB4A 2E8AA 1LOTB 3CJAA 3FZMA 3CJ7A 4M7YA 4BRDA 4LC9B 1CZAN 3R8EA 4IZ9A 3CJ1A 1HKBA 4FPBA 1C0FA 4PKGA 2A42A 1BG3A 4QS8A 1HLUA 3EZWA 4PKHA 2P9IA 1YUWA 1YVNA 1R59O 2QWRA 4Y0WA 4BRLA 5I9EB 1GLJO 1XQSC 1E4FT 1XUPO 2GTDA 2V7YA 1NBWA 1G99A 4FWKA 5LJWA 3DXKA 3LDOA 4H5RA 1V4SA 5AR0A 3S41A 3VF4A 2HF3A 3RSEA 5AFUA 3LDLA 5AQTA 3HBTA 5KPRA 1U2VB 3VERA 1ATSA 4BRKA 3VEZA 5ADXH 2QM1A 3FZKA 3KZBA 4M63C 4IJAA 4AM6A 5B8HA 4K42A 3WEEA 1QHAA 2V51B 2PBDA 2P9UA 4CD1A 3MMVA 2F9TA 3LM9A 1RDWX 4Z94A 4RWTA 4WQ4C 2E88A 1HPMA 2P9PB 4IO8A 4NO7A 1BA1A 3L6QA 4DCHA 4CD3A 4FWSA 4I6MA 4IWVA 4BR0A 3U9DA 3SLCA 4DB3A 3C0BA 5AZJA 3A8YA 2BUPA 4BRPA 4O5FA 5F2RA 4BC3A 1DKGD 1BO5O 4B1UB 1D4XA 4BVPA 1X9JA 2PAVA 5AQUA 3A5MC 4BR2A 2YHWA 1JCEA 1ZXOA 4BRAA 4H5TA 3O4WA 3ID8A 2A5XA 4CBXA 2GELA 2QWQA 4JD2A 3GDQA 1MA9B 4H5VA 1T44A 4K43A 3VGKA 3EN9A 3UKUA 4JNEA 4CI6A 3MK6A 1Q18A 3ZX0A 4CZMA 2ZF5O 5KQDA 4CZIA 4EIAA 4PKIA 5AFUH 1XC3A 3EL2A 4FWLA 5JLFA 3VGLA 2P9IB 3FLCO 4J8FA 1WOQA 3UKRA 3EO3A 2D1KA 4FWOA 4B1ZA 3VF2A 3UB5A 4PL8A 3CJ9A 1X3MA 3D2FA 3IFRA 1IJJA 4HWIA 3O80A 4BRCA 2CGKA 5FPDA 3U9ZA 1QQMA 4XH1A 3ZEUA 2H3GX 3HSCA 3O6WA 5AQWA 2VYPA 3AY9A 3CQXA 4QS9A 5E26A 3WXJA 4C23A 2P9SA 2UYTA 2E2NA 3KVGA 3AARA 3ATUA 2Q31A 5AQJA 3MN5A 4A2AA 1HX1A 3GL1A 2BTFA 4BRGA 1GLBG 4IXCA 1GLFO 2FF3B 4CZKA 4M7XA 3H1QA 3C7NA 4I6MB 3FZHA 1QQOA 3QDKA 4CJ7A 1YXQA 4DHYA 2Q0UA 3QBXA 2ZGZA 5AQOA 3QFUA 2FSNA 1Y64A 4BR5A 4MLEA 3MN9A 5BRFA 5AZIA 1QQNA 1JCFA 4H0YB 3CIPA 4FWNA 5LJVA 1ESVA 2A41A 4F9OA 2D0PA 2YJFA 4WQ5C 3HI0A 3MDQA 2HOEA 4JD2B 1HJOA 4H0PA 3VESA 3QFPA 4GNIA 2NRHA 1BWFO 4H0XB 4H0OA 4EAHD 2FLOA 2QWPA 1MDUB 1WUAA 3QB0A 3UKUB 5EXWA 3ENHA 2P9NA 1BUPA 3FGUA 2YJEA 3BF3A 5EOYA 2P9KA 1NWKA 1V4TA 4JHDA 2OANA 1NGGA 2WUSA 3M3ZA 4EHTA 1NGJA 2E1YA 3BUZB 3LDNA 3SK3A 1ATRA 5EVZA 2P9LA 3HTVA 1GLAG 5ELZA 2Q0RA 4YDUA 3MN6A 2IVOA 3B8AX 4XEIA 5AQQA 5F0XA 3LDQA 2HF4A 2D4WA 2NLXA 3W0LA 4BC2A 2QWMA 5AQFA 2GEMA 2E20A 4MO5A 4RTFD 4WYBA 5BPMA 3ZEUB 1HKGA 3CHWA 3UE5A 4K41A 1NGDA 3IDHA 3TU5A 3IUCA 1HKCA 2P9SB 1Z6RA 2ASPA 2AA4A 3VEWA 1NGHA 3CI5A 3ZETB 5BREA 4GY2B 5FPEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3I33A 3EE9A 3HVTA 2UUAK 1TK5A 3CCVN 3JXUA 3ZT3A 2GWJA 3ISNC 3AVKA 3FR0A 3RMDA 2V7ZA 1NM1A 1VRUA 3VOVA 3AO5A 1WBDA 5AQLA 1BIZA 2YHBA 4DSIA 4BRFA 4J2AA 4H5WA 1Q9YA 1WNSA 3ZSVA 4B8AB 1VAZA 3PUFA 2ASOA 4O4GA 1U47A 3LL3A 3PO4A 3TWHA 5C12A 4IG0A 3GBTA 1ZBSA 2HNDA 1WBBA 4BRMA 1KVBA 1MWKA 4JKEA 4DTSA 3CQYA 2P9NB 3K9JA 3OHRA 4AF1A 1X3NA 1Q86O 3D6RA 4CJUA 3WEEB 1M1KO 2W6LA 2P9UB 5BRDA 3TAEA 2YNFA 4B9NA 4LFCK 3FZLA 3TI0A 4IOAL 3L4QA 4CK2A 4HCBA 4KH6A 4KKOA 3MCPA 2OTLN 3CFRA 3V9WA 1VK0A 3V1OA 1QSYA 1KXPA 4FWRA 2F8SA 2UXCK 1C6VA 4NYNA 3ZT1A 4DR6K 5EY4A 1NGBA 4GW6A 5M1KA 2NZTA 5D3GA 5AZJB 4Z0UA 1S1WA 3HJFA 3I55N 1NK9A 4AILC 1A5VA 2FBXA 1SL0A 4CBUA 3I56N 1NJZA 1VQ5N 1L3TA 3PY8A 4E1JA 3DLKA 4CHNA 5BR8K 4ISEA 4FZYA 4B1WB 4AHSA 3HP9A 4B9QA 5CE3A 3O5BA 3M1FA 4NLCA 4E0DA 3MECA 5AQMA 1K73O 4J2EA 4BDPA 4HTUA 1SUQA 1QE1A 1YAGA 4C8OA 4LSLA 1A5XA 3P4IA 2QWOA 2E1ZA 1XHXA 1KFDA 2YKNA 3ZSYA 4ISFA 3VEYA 2G8KA 1RGIA 3Q7CA 2Q36A 3FZFA 4X64K 1TKDA 5HL7L 3CYMA 1YJNN 4J2BA 4FK2A 4FOIA 4CJSA 4KH4A 4NXMK 4YOUA 1XC9A 2QXFA 1ITGA 4LY7A 4KHNA 4DQQA 2GV9A 4CJTA 3ENOA 3K5LA 1IBMK 2VG6A 2P5GA 3HOSA 3KWGA 2Q1NA 1TKZA 3VQBA 4CJEA 3AVHA 4H03B 2O8BB 1ASVA 1BA0A 3CXCM 3A5OC 3VGMA 3I8BA 4M45A 2CH6A 4XH5A 1YTUA 3ATVA 4CVNE 3F73A 2YHXA 3OS0A 2YHYA 4JRQA 3OTOK 1VQ8N 4KV8A 5JVGL 1OVQA 3LDPA 4BY9C 1C0GA 3L3UA 3THXB 3MEGA 1N6QA 2IOCA 2X6NA 1EETA 2A40A 2FF6A 3IAYA 3KD1E 3V1RA 4E7HA 1WSGA 2D0OA 1JXEA 3ITHA 3L3VA 4ISGA 4PUOA 2IDOA 2F4VK 4BE1A 3DAWA 4DFPA 3TAMA 3AGKA 3BF1A 3V9XA 4OKJA 5KGWA 4KTWA 3WXLA 1JLCA 5M1QA 2HVIA 1XNRK 1K8AO 3CC2N 3OYGA 2GUPA 4CF9A 1Q9XA 3WT0A 1VQMN 5FPNA 1SKRA 1BDGA 3TANA 4X66K 4CZGA 4CGHA 3SBGA 3I8DA 2OCEA 4BWJA 1QVGM 3RVCA 1L3UA 3K5NA 1VSJA 4B1VA 3JS6A 3E9LA 4I9LA 3QNOA 4KHUA 2HHTA 4DFJA 4WQ5A 1NGFA 3FFKB 2I7PA 5GINA 3QIPA 2NRZA 3GG4A 1OH5A 2XY5A 3DXMB 4YORA 1RDDA 1RTDA 3ZETA 1H1VA 1QZ6A 4CIFA 3OJSA 1VQON 3SCXA 4W5NA 3SQ4A 4BRDA 1WLJA 4LC9B 3KTQA 3QEWA 4M3ZA 2QTDA 4IZ9A 3O9RA 4PKGA 1HKBA 2QKKA 3DRRA 1BG3A 1W7AA 3EZWA 3LALA 2AJQA 4DFMA 4Y0WA 4TSXA 1WSJA 3AA5X 4E89A 1HRHA 3KLFA 1D9FA 4FLVA 2UXDK 3CCMN 3TABA 1XNQK 3SV4A 3IS9A 1NBWA 4WE1A 2RHKA 3DXKA 3SUPA 3S3MA 1HR0K 1SL2A 5DM6L 3LDLA 5AQTA 3M8SA 4GV6A 3HK2A 1U2VB 2YNHA 4BRKA 3K5MA 3VEZA 2P1JA 2EHGA 4MFBA 3KZBA 3U6FA 3S3OA 4FJGA 1OH8A 1BQMA 4DKWA 4WF9L 3KLEA 4AM6A 3MX2A 3LP0A 1CZBA 1QHAA 4FCYA 4LF4K 2F9TA 3LM9A 1RDWX 3BGRA 4B3MK 1ZYQA 2FBVA 2P9PB 4AHVA 4IO8A 4DCHA 1BA1A 4QCLA 2HBLA 4BRPA 4DTOA 5F2RA 2JGUA 4B1UB 4DR1K 1RTJA 1RBTA 4B9UA 4IDKA 4DU1A 1ZXOA 1N34K 4FLUA 2KFNA 1K9MO 1IG9A 3ID8A 4CBXA 4JD2A 1MA9B 4YOWA 1IKYA 3TAPA 4LSNA 1T44A 4K43A 1JLGA 1L5UA 1DTTA 3T1YK 2YHAA 4CI6A 5KQDA 1BIUA 3L2WA 1T3VA 3QO9A 3WXMB 4OVLA 4LF6K 2P9IB 3V81A 3AA4A 4B3OA 1C1CA 4FWOA 3NH1A 1BI4B 1TKXA 1B92A 1JL1A 3TAFA 4M3UA 1X3MA 4M3YA 1A5WA 4J2DA 2CGKA 4JK7A 3E9OA 4XH1A 1KD1O 3G71N 3O3FA 3O6WA 2A1RA 5AQWA 1RBUA 1SKWA 4ZTJA 4C23A 3VQAA 2P9SA 2UYTA 3KVGA 3AARA 2Q31A 4KREA 2XO7A 4A5BA 1OH7A 4LFAK 2B5JA 4O55A 4ILHA 4NCGA 3LDSA 3NH0A 1HYSA 4BRGA 4JKGB 4ICLA 4C1NI 5HP1A 3E01A 2HNZA 3THWA 5FRMA 3QERA 4M7XA 4FJNA 1T8EA 4RW8A 4DSEA 2Q0UA 3OYIA 1JJ2M 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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