5BRHA

Crystal structure of trypanosoma cruzi glucokinase in complex with inhibitor dbt-glcn
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
367
structure length
367
Chain Sequence
MNIKELSLHELCEELKTPAWNVPLTFVGDVGGTSARMGFVREGKNDSVHACVTRYSMKRKDITELIEFFNEIIELMPASVIKRVKAGVINVPGPVTGGAVGGPFNNLKGIARLSDYPKALFPPGRSAILNDLEAGGFGVLAVSDAHVFSEYFGVMWEGTQWRTCEQEPAGSVIGRGRCLVLAPGTGLGSSLIYYNPMNQQHIVVPLELGSQTIPMRKDIDYIQTLHAELKLLPNYENMVSGAGLEFHYRQVVRGSRPPCSAGEIAKLASEGDANACKAMKKYHEYLMRVGSEASMALLPLTIVLVGDNIVNNAFFYRNPQNLKEMHREALNHEMERFGFQSRVTYLRQKKLLNLNLMGCYRCGLDLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi (strain cl brener)
publication title Structure-based approach to the identification of a novel group of selective glucosamine analogue inhibitors of Trypanosoma cruzi glucokinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glucokinase 1, putative
total genus 123
structure length 367
sequence length 367
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2015-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02685 Glucokinase Glucokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 5brhA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 5brhA02
1EQYA 1RGIA 1U2VA 4K43A 4BRQA 3DXKA 4YDUA 4AM7A 2ASOA 3O5BA 4PKGA 3GBTA 5AR0A 3M3ZA 4EHTA 3AAPA 3ZX3A 4H5WA 3CJ9A 3QMLA 2V7ZA 3HTVA 2P9IB 4JD2B 4B1VA 5EX5A 2YHXA 1NGJA 5KPRA 1H1VA 3CJ1A 1DGKN 4BRHA 3EKUA 3ZX2A 1QQOA 3VENA 2GELA 1J6ZA 3FZMA 3VF6A 1X9JA 2V51B 4IO8A 1V4SA 3CJAA 2ZF5O 3VEWA 5KQDA 3QBWA 1Z05A 4IZ9A 4BRDA 3BF3A 2Q1NA 3FZFA 1V4TA 1TYQB 3QB0A 3SJHA 3DWLA 4J8FA 5KPTA 1BA1A 3H45C 5AZJB 1ZXOA 3F9MA 2OANA 3LL3A 4EAHD 2PAVA 4MLEA 2J4RA 1IG8A 2QM1A 2V7YA 3U4LA 2AP1A 1NBWA 1NGGA 2H3GX 2ZGYA 5JICA 1GLLO 3H1QA 1NGHA 4Y0WA 1ZC6A 1K8KA 3WXIA 4BG9A 1HKBA 4NB4A 1NGBA 3UE5A 4BG8A 2P9SA 4B1ZA 4QS9A 1NGDA 2W41A 3EKSA 3VEVA 5JMVA 4BR7A 2AA4A 2GWKA 3DAWA 1DEJA 3O80A 2Q31A 1GLCG 2Q0UA 2ZWHA 3JS6A 3CHWA 1QHAA 1C0FA 5BPNA 2FF3B 2CGLA 4B1UB 2P9UA 4PL7A 2A41A 2CH6A 2P9LB 2FSJA 3UKRA 4F9OA 2KHOA 4MO5A 2Q97A 2FXUA 3IMXA 4GY2B 5AQYA 4BRIA 2QWMA 4CZJA 2P9PA 2PBDA 5BPMA 5LY3A 1LOTB 4WQ5A 4H5NA 4CBWA 2NLXA 3MN9A 4PL8A 2BUPA 2ITMA 1X3MA 4BRCA 3D2EA 3TU5A 3CI5A 2I7NA 3RSEA 5F2RA 3G25A 3LM2A 1BU6O 1ZBSA 2QWPA 1HKGA 1YUWA 5BN9A 1BA0A 3SMSA 5AQLA 4CZMA 1IJJA 5FPDA 1NGAA 4FWOA 3WEEB 1NM1A 3EZWA 3HSCA 4DB3A 4M7XA 3VF2A 4EIAA 3A0IX 1MWMA 2E2NA 1DKGD 5EXWA 1YXQA 3U9ZA 1GLJO 4BQLA 2W40A 3A5OC 4ISFA 5CE3A 4CZHA 1NGIA 2IVNA 3I8BA 1P8ZA 4BR9A 3A8YA 4AM6A 2IVPA 3H3NO 3HM8A 3MMVA 3CQXA 1BUPA 1XUPO 1NLVA 2HF4A 3FE1A 3CERA 4IJAA 5BR9A 3AAQA 4BR4A 4H0VB 3FFKB 2HF3A 3VPZA 4H0PA 2NRHA 1XQSC 3QFPA 3CQYA 3D7EO 5AQXA 5AFUA 1SQKA 3IUCA 2F9WA 3D2FB 4MO4A 1NGCA 3CJ7A 3KHYA 1K8KB 5BRDA 3SK3A 1E4FT 2D0OA 3S41A 1BDGA 2E2PA 3FLCO 1KAZA 3BEXA 3C0BA 1KAYA 4BRKA 1XC3A 3QFUA 5AQTA 3H1VX 3ZETA 5F0XA 1T6DA 3L4IA 4DCHA 3B8AX 1WUAA 1NWKA 1R59O 4IJNA 1TUYA 4CI6A 3GL1A 4JHDA 3UKUB 1T44A 3O08A 1D4XA 3LDPA 3O8MA 1JCFA 3LM9A 1T6CA 1ATRA 2P9NA 4YDUC 2YHYA 3VOVA 2I7PA 3O4WA 5AQSA 4CBUA 4FWPA 4FOEA 4FWSA 3UKRB 2ASMA 2GWJA 3WUHA 2YJEA 4RTFD 5TKYA 4I6MA 3O1BA 4BRGA 5BPLA 4H0XB 5KQ8A 4XH4A 1QZ6A 2P9PB 5ELZA 3H6EA 5E26A 4CZGA 3VGLA 1GLDG 1QQNA 3W0LA 1KAXA 5AQVA 4FWLA 4BGAA 1LCUA 4BROA 4CZIA 3RSEB 1QQMA 4BREA 3J8AA 4B9QA 5BRFA 2QW9A 4EFHA 2V52B 4CBXA 1YVNA 3EL2A 4H0TB 2WUSA 3AARA 2GUPA 5F1XA 2E20A 4K25A 5AFUH 3BP8A 4H03B 3CJCA 5E84A 1MDUB 2A3ZA 5FPMA 1ESVA 3C7NB 3ENOA 3GDQA 3DXMA 1WOQA 3OHRA 4NO7A 3CIPA 3SLCA 1U6ZA 4EHUA 1SZ2A 3WXKA 4H5VA 1NGEA 5AQKA 4BR2A 4BRFA 2P9KA 1U2VB 4FWMA 1Q18A 1HX1A 4O5FA 3DXKB 4O8KA 4C23A 5AQIA 3H46O 4BRLA 4BC2A 3QBXA 4FO0A 4H0OA 4QS7A 1GLEG 5AQFA 3I33A 4B1WB 4MLHA 4IWVA 2F9TA 4Z94A 1JCEA 4BC3A 5EY4A 2FF6A 4HWIA 3FZKA 4QS8A 3MCPA 3VEOA 2E1YA 1S22A 3U9DA 5JLHA 3VETA 4BRAA 4H0YB 5JLFA 4CZLA 2Q0RA 3KZBA 4CJ7A 2QWNA 5FPEA 1ATSA 4L3QA 3VGKA 2QWLA 2FLOA 3M6GA 3VESA 3ENHA 4FWQA 4BC4A 5KPZA 1TUUA 4K41A 5AQOA 4A62A 4XEIA 5EVZA 2A6AA 3LDNA 3ZETB 3R6MA 4JNEA 4A2AA 3O1WA 1SAZA 4B1XB 4LC9B 4BRMA 4CD3A 3LDQA 3M1FA 2GTDA 3VEYA 1CZAN 2D0PA 1MA9B 5AZIA 3VGMA 4FWNA 4M7YA 2QWOA 3MN6A 2YI1A 1KXPA 2Q36A 5ADXA 2VWBA 3UB5A 2Q2RA 2P9NB 3EN9A 4XH1A 4BRNA 1RFQA 4PKIA 3H3OB 1HJOA 4PKHA 5AQRA 4CZEA 1S3XA 3BUZB 5FPNA 2DPNA 4I6MB 2D4WA 5AQPA 2P9SB 2YCHA 5EOYA 3ZEUA 1JCGA 1RDWX 4BVPA 3WT0A 3WEEA 3R8EA 3WQTA 3A5LC 4B1YB 3A5MC 3ULEA 3VEZA 3BF1A 4WQ4C 3U8XA 1HKCA 2IIRA 3ID8A 1C0GA 1X3NA 5I9EB 2NZTA 3IDHA 4E1JA 2P9UB 5AQGA 3QDKA 3JXUA 2HMPA 4FWRA 4H5RA 3VF4A 4BR5A 3ZX0A 4A2BA 4ISGA 1HLUA 3FR0A 1ATNA 4KBOA 4BVOA 2YJFA 3DXMB 3WQUA 3W3DA 1GLAG 3EO3A 4IXCA 2CGKA 3CETA 4JAXA 5AQQA 3FGUA 2CH5A 5AQZA 4JD2A 2P9IA 5AQHA 2P9KB 3A5NC 3GG4A 2ZGZA 2IVOA 2E2OA 3D2EB 2FSKA 3D2FA 4ISEA 4BC5A 4M63C 3DJCA 2E88A 3FZHA 2E8AA 3P4IA 1QZ5A 3IFRA 5ADXH 4BR0A 4GNIA 5AQUA 2EWSA 2D1KA 1E4GT 5B8HA 2UYTA 2BTFA 4JN4A 5AQWA 1Y64A 3GOIA 3SMPA 1TYQA 1MWKA 3MN5A 1BWFO 3ATVA 3FZLA 5AZJA 3R9PA 4A61A 3UKUA 4BRPA 2QWQA 1G99A 4FPBA 3L6QA 3MDQA 4FPAA 4FWKA 5BRHA 2VYPA 4CZKA 3MK6A 1OKJA 5AQJA 3TPQA 4FOIA 4RWTA 4WQ5C 4CZFA 1BG3A 1HPMA 1HUXA 4WYBA 3HZ6A 4XH5A 4K42A 3HI0A 3HBTA 4DHYA 1GLBG 2VCPA 4FL9A 5AZIB 2QWRA 3KVGA 2A40A 5BREA 1BO5O 2E1ZA 3O6WA 2ASPA 1GLFO 2FSNA 4BQZA 3WXJA 3LDLA 1NGFA 1NMDA 5LJVA 3VERA 2HOEA 1Z6RA 2CGJA 3CJBA 3WXLA 4BGBA 5LJWA 3AY9A 2QXLA 3MN7A 3ZEUB 2E2QA 2YHWA 2P9LA 5BN8A 4DQ8A 4HTLA 2A5XA 3ATUA 4H5TA 4CD1A 4RCHA 1BOTO 3L0QA 3C7NA 5AQMA 3QICA 3ULEB 4WQ4A 2GEMA 4FSVA 3LDOA 3VEXA 5AQNA 4JHDB 3GE1A 1YAGA 2A42A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QESA 1A5VA 1U2VA 3LP0A 1S5JA 3OYDA 4W5NA 1KD1O 3AO2A 3P1GA 2F8TA 4CFAA 1Q81O 1C0MA 5T7BA 3PY8A 1Y97A 3V1RA 5IT9O 1HYVA 1K9MO 2A1SA 2E4LA 3LAMA 4HTUA 4E7IA 3NGZA 2HHVA 1TK8A 3MEEA 3KLEA 4AF1A 4B9SA 3ZCMA 3V9UA 2VQEK 4DV5K 1F21A 4BRHA 1UOCA 4YOTA 4JEPA 4X66K 1JXEA 4NYNA 4O44A 3S9HA 2ZJPL 4BRDA 4JLHA 2Q1NA 3SQ0A 3PLAA 4DFJA 1V4TA 4DQPA 4QOZB 1BQMA 3SJHA 5KPTA 4J8FA 1L3TA 1QTMA 4CEEA 5AZJB 3F9MA 2O8FA 2OANA 4DFMA 3OS2A 4CGGA 4CK3A 3H1QA 2HHXA 1ZC6A 1K8KA 3WXIA 4LY7A 1WSFA 3LP1A 3UE5A 4IOCL 4LFBK 4KH5A 5GAGP 4PA1A 1NJXA 4M3XA 2AA4A 4C8MA 1DEJA 1REVA 4Q5VA 4CHYA 1T3VA 2RF2A 2Q31A 2G8KA 3DI6A 1VAZA 1QHAA 1C0FA 3AO4A 4FJKA 2CGLA 4C8KA 4PL7A 1FW6A 2YNFA 2FSJA 3UKRA 1U4BA 4YOXA 4IOAL 2QTDA 4GKKK 3E1YA 3THWA 3IMXA 4GY2B 4B08A 4E0DA 4FYDA 1Q7YO 1VQNN 5LMNK 1VQON 1U45A 1KLMA 3V1OA 4FJ9A 1P90A 4H5NA 1KCFA 5CY4A 2ITMA 4Y1DA 1X3MA 1W7AA 3RSEA 5F2RA 1FKOA 4ILGB 2QWPA 4W5TA 4FK2A 3ZSWA 4CZMA 2HHSA 4W5RA 4FWOA 1NM1A 4B8CA 3SAGA 4M7XA 1RT6A 2E2NA 4BQLA 4CF0A 4MQ3A 2ZM6K 3BZKA 1NGIA 4U7BA 3T7ZA 1XC9A 2HBMA 3A8YA 1JLCA 4AM6A 1N36K 2OTJN 2IVPA 3HM8A 4DLEA 3MMVA 2QEXN 1XUPO 4CECA 4J2BA 2HF4A 3TANA 4C8NA 4N41A 4M45A 4A5BA 5BR9A 4KH4A 1W97L 1WSIA 4CJSA 3AVCA 4HCBA 3SUOA 3CF5L 4DSJA 4FJHA 4DTSA 1Q9YA 3IUCA 1S1VA 3D2FB 1ZBLA 4MO4A 3LANA 1K8KB 1E4FT 1OH6A 4BDPA 3TI0A 2E2PA 3FLCO 1BI4B 3V1QA 1KAYA 2B6AA 4BRKA 1XC3A 5AQTA 5GIOA 5F0XA 3I0SA 4KTQA 4IJNA 5HRRA 3KD5E 3GL1A 4JHDA 4IFVA 3OW2M 1T44A 4DTMA 4NXNK 1VQ6N 3QINA 2YHYA 3G6EN 5AQSA 3G71N 1KFDA 4FOEA 4CHNA 3UKRB 2GWJA 3SBGA 4RTFD 4BE2A 3THWB 4DSEA 2P5GA 4I6MA 3O1BA 4CF8A 1XNRK 5KQ8A 4XH4A 3H6EA 4CZGA 2ZE2A 1GLDG 2I5JA 3PX4A 3CCVN 4CJQA 4BROA 4JK8A 3RSEB 1T05A 3MECA 1TK0A 1EWRA 1TKTA 1J54A 4DTRA 4H0TB 3OYEA 3RMAA 4DG1A 3P83D 4CEZA 3OYKA 3DXMA 2XY7A 4NO7A 1HQUA 3OA9A 4CJTA 5AQKA 2RHKA 1XMQK 4BRFA 2P51A 4FLWA 2BE2A 1Q18A 2ITGA 4O5FA 3NGIA 4CEOA 3V9WA 3H46O 4BC2A 4B1WB 4MLHA 4CJRA 1J53A 3CFRA 3F2KA 2F9TA 3VA3A 5AJ3K 4AH9A 4KV8A 3CFOA 3VEOA 2E1YA 1UAXA 3AVLA 5C10A 4BRAA 4H0YB 3KIOA 5JLFA 4CJ7A 4H8KA 5FPEA 2QWNA 3SQ4A 2HNZA 4KTWA 3VESA 1SKWA 3VQEA 3VQ4A 2FBXA 5KPZA 1WBDA 1BGXT 3AVMA 2D5RA 3T3FA 4JNEA 4CIGA 3O1WA 4PY5A 4BRMA 3VQ6A 2FBYA 4YHHK 2E6MA 4JI7K 2OCEA 1B9FA 5C0YA 3VEYA 1MA9B 4JKGB 3DOKA 3NF8A 2QWOA 3ASMA 2YNHA 2D0CA 3KKRA 1HYZA 3UB5A 2Q2RA 2OZMA 1RFQA 3SUNA 3H3OB 4PKHA 1KTQA 2OZSA 4CZEA 1UA0A 4KHNA 5AQPA 2DPNA 4I6MB 2YCHA 4MFBA 3ZEUA 1JCGA 4BVPA 1YI2N 4EZ6A 3WEEA 3HPOA 3VQ8A 3S3NA 5FLXO 4DS4A 4E7KA 2IGIA 2HVIA 4B9UA 3ZSQA 4B9MA 4AHVA 3ZSXA 5K14A 2HMPA 1XHXA 4H5RA 3VF4A 4V19S 4BR5A 5HOOA 3L2VA 4ISGA 1HLUA 3EY1A 3TARA 3M8PA 2O8EB 4GW6A 4E3SA 3DOLA 2YJFA 3DXMB 4MDBA 3WQUA 4ILJA 2O8BB 3OYIA 4GKJK 3FGUA 4JD2A 2P9IA 3NF6A 3QIPA 2HBJA 2IVOA 2E2OA 4JKHA 2FSKA 2WBNA 4BC5A 4JI5K 4KI4A 4FLZA 3QERA 4DV2K 3K57A 4ELUA 2EWSA 3DLGA 3O3HA 1OH5A 3LWMA 4KB1A 3TAPA 4M3UA 1L3SA 5M1FA 3MX5A 3MAQA 1KRPA 4JN4A 3O9RA 3AO3A 3CG7A 3MN5A 3FZLA 1VQ7N 1TGOA 3F9KA 2OPPA 3KWGA 4FJ7A 3AVAA 3THXA 1OKJA 4FLVA 2KZZA 5HL7L 3OJUA 3V9XA 1BG3A 1HUXA 2YKMA 4WYBA 4XH5A 5C25A 4E1NA 1TL3A 2ZQBA 1NK7A 4I2PA 3OYNA 1T8EA 3LZIA 1QSLA 4J2EA 3LDLA 1NKBA 2GUIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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