5BRTA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase from pseudomonas azelaica with 2-hydroxybiphenyl in the active site
Total Genus 188
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
188
sequence length
581
structure length
554
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGGSINIEFSADLSSLCEHKGDMYWMFGVAALRMIRPWNKWICVWGTKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
total genus 188
structure length 554
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5brtA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 5brtA01
3AXBA 1PDHA 1K0JA 3F8DA 2YG3A 4J34A 2GMHA 3UKKA 1ZKQA 1PJ5A 2E1MA 1TRBA 3UKFA 4YSZA 3ABVA 2YR4A 4M52A 2BK5A 4CY6A 2X50A 3AB1A 1E1MA 2IIDA 2YG4A 5U63A 1B5QA 1UKVG 5HYMA 1N4VA 1Y56B 1MO9A 1L0VA 2OALA 3P1WA 4K7ZA 3QVRA 3HZLA 1JRZA 4TM0A 3CGBA 3NN0X 4U8NA 4WCTA 3UP5A 3GMBA 3RNMA 2YVFA 1GREA 1F8SA 5C3JA 1TDOA 1XANA 1NHRA 1TYPA 2H88A 2XVEA 4UDQA 1NHSA 2V3AA 4A7AA 4Y4MA 1S2QA 4KX6A 1IUUA 1RP0A 4XXGA 1K0IA 1MOKA 3AE6A 4UDRA 2WU5A 3UOZA 2GR0A 2QA1A 4HB9A 4B64A 2Q0LA 3EPTA 4AOXA 4E0VA 4D04A 3QJ4A 2C66A 1MXTA 2NPXA 2BABA 4C77A 2XFPA 3CN8A 1DOCA 5KOXA 1KNRA 2BK4A 4A65A 1CF3A 5JCIA 5M10A 2YM1A 3VQRA 3NK2X 5JCMA 5KVHA 4ADWA 3DJEA 3GWFA 3QVPA 4A5LA 2PHHA 2X8CA 3AEFA 1QLBA 2BXRA 4D03A 2ZBWA 2XLPA 2Z5YA 4OCGA 1P2EA 3UP4A 2BCGG 1F8RA 5HY5A 4OPUA 2C70A 1H7WA 1COYA 5DBJA 1ZDLA 1ZK7A 2A89A 1GPEA 2GEWA 1NG3A 3K7TA 4A6NB 1D5TA 2BK3A 3JSKA 3LZXA 2ARDA 2FJBA 5KRQA 1ZOVA 4Z2TA 4NEVA 1XPQA 2WDVA 4EMWA 3ISHA 1LTXR 2HQMA 3ICSA 1CJ4A 1ONFA 4ECHA 1ELIA 2EQ6A 1BGJA 4X9MA 2YR5A 1H82A 1D7LA 5EBKA 3GMCA 1PJ7A 4CCQA 1IUTA 4H4VA 4OPTA 3CPIG 1S3EA 1EL7A 4JY3A 1GTEA 1VQWA 1Z6LA 4GF7A 4IVMB 2XLUA 3EF6A 2YAUA 4BURA 3FIMB 1JRYA 3NT6A 5LV9A 2YG5A 4ZCDA 2B7RA 2GQWA 1PS9A 2EQ9A 1SEZA 2H89A 2EQ7A 4RSLA 3AWIA 5EB5A 4YT0A 4H4QA 3NGCX 4OPLA 4H4SA 5U25A 2YVJA 4I59A 3AE5A 3KD9A 4YTPA 2CFYA 1CHUA 2R4JA 3FMWA 2WPFA 1ZP0A 5KWFA 4GDPA 3G5RA 4AP1A 3KA7A 1B8SA 1JNRA 2F5ZA 4BJZA 1NENA 2GR1A 3AEAA 3OZ2A 3KKJA 1YQ3A 3ITJA 1NHPA 2VRLA 3C96A 3UOVA 3BI5A 1GRBA 4DNAA 4J33A 1NDAA 2OLNA 2OA1A 3NIXA 1O95A 4AOSA 3AE1A 2BCPA 1CC2A 1E1KA 1VDCA 2IVEA 3ALLA 3GYIA 4U8PA 4CNJA 5BUKA 1CC4A 4TLXA 1NHQA 1GEUA 3VR8A 4OPCA 4X9NA 4H4UA 2R0PA 1OJAA 2OAMA 3NN6X 3DK8A 1K0LA 3IHGA 2R4EA 2XLTA 3II4A 4TM4A 1ZMDA 4APNA 4O5UA 3BNUA 3K7MX 2WP5A 2BS3A 4FX9A 3LZWA 4PAAA 3LB8A 1JEHA 3K30A 3ICTA 3CTYA 1O94A 5CQFA 4EQRA 2VZ2A 3D1CA 3UKQA 3S61A 3CGCA 3RP6A 3NG7X 2B9WA 3P4RA 1ZY8A 3CNPA 1REOA 3Q6JA 4Z2RA 3CIRA 3LADA 1K4QA 4BK2A 5IQ4A 2UZZA 2JBVA 2V6OA 2XFUA 4N9XA 2BC1A 4U8KA 3GDPA 3PS9A 3SQPA 3EAOA 2IVDA 3UTFA 4EM3A 3H8LA 2YLXA 1E1LA 1GSNA 2AR8A 2B7SA 4J56A 3AEBA 4CNKA 4EM4A 1D4EA 1GXFA 1EBDA 1EL9A 3CNSA 1LVLA 1N4UA 2QAEA 4FK1A 4H4YA 3G5SA 4YXDA 2WBAA 1L9DA 1JNZA 2FJDA 3ALJA 4J31A 2WP6A 5EB4A 2O9ZA 4H2QA 3UOXA 2C3CA 3ZYXA 2B9YA 3CPJG 2WOVA 2WPCA 3COXA 4LA1A 1NG4A 1GTHA 2FJAA 4AP3A 1FL2A 2ZZCA 4K5RA 4CRTA 1DXLA 1F6MA 1H6VA 2WEUA 1RYIA 2YG7A 4EMJA 4OPGA 1GERA 3DJJA 4H2PA 2GR2A 4REKA 1IJHA 4EQXA 5FS6A 5HHFA 3NYEA 2C73A 5FS9A 2CDUA 4GR1A 4K5SA 2YR6A 4NTCA 2BS2A 4BV6A 1V59A 1CJCA 1GT8A 4U2LA 3SGLA 1H86A 2GV8A 4B65A 2DKIA 1O5WA 1P2HA 2XVIA 4YTNA 3T37A 3WE0A 4A9WA 4YWOA 3KLJA 4C3YA 4IA6A 5BRTA 3NNEA 3LJPA 4C74A 2WU2A 2B9XA 2RGJA 3VRBA 3H8IA 4EIPA 2BA9A 3GD4A 4H2RA 3UKLA 2GAHB 5J60A 1VG0A 3O0HA 4RG4A 4HA6A 3V3OA 1KF6A 3M0OA 2YQUA 2R45A 4GRTA 3M13A 1TDNA 5CKUA 3C4NA 4TM3A 4I58A 3DK9A 2Q0KA 4JDRA 4YSYA 4K2XA 5KVIA 1LV0A 3S5WA 2NVKX 2ZZ0A 4X4JA 2APGA 3L1RA 2VOUA 1W4XA 3AE8A 1Y56A 2JAEA 5TR3A 4U2TA 1E1NA 5ER0A 4B68A 1BWCA 3UCLA 3SM8A 2AAQA 3NHOX 1PXCA 4YSHA 5BVAA 4YTMA 1ZX9A 2GQFA 4USQA 2GAGB 1AOGA 3GD3A 3NRNA 2J3NA 3DK4A 4K22A 2QA2A 4U8JA 4OPIA 3AE4A 2E4GA 2FBWA 3DMEA 3DJDA 1D4CA 4J57A 3NH3X 1FCDA 2C65A 2XVJA 2VVLA 4A79A 3NTAA 1F8WA 2C67A 2VQBA 3ATRA 2FJEA 3C4AA 3QFAA 4TM1A 1S2YA 2GH5A 3AYJA 3URHA 3L8KA 3IC9A 3NLCA 4Z44A 1M64A 5HXIA 3G5QA 2YM2A 2WPEA 4GCMA 2GMJA 1JU2A 2ZZBA 2TPRA 1H7XA 3OC4A 1S3BA 4C5OA 2WP9A 3EANA 1GRTA 2BACA 3UKAA 4UDPA 4JY2A 1FOHA 3FG2P 1DOBA 2Q7VA 1KDGA 1GESA 3DA1A 4AT2A 3PO7A 3V3NA 2XDOA 4A6NA 1CBOA 4IVOB 5JCNA 4BJYA 4CBQA 1OJDA 3NK1X 1FECA 1X31B 4P9SA 1DNCA 1Q1RA 3AE7A 3P4SA 2XFQA 3BHKA 4H4XA 4IA5A 4A99A 2XFNA 3NKSA 2C75A 1E7PA 2XVHA 4JN9A 4DSHA 1GETA 1PBFA 2CVJA 3FBSA 2GRTA 2W0HA 3AE9A 2VVMA 5L46A 4IV9A 3REDA 1OJCA 1TDEA 3IHMA 4H2NA 5GSNA 1DJNA 5U1OA 4BK1A 4JNQA 4XWZA 4J36A 3AEDA 2A8XA 4ICYA 2EQ8A 5EOWA 3UTGA 1XHCA 4U8OA 4FK1C 1YKJA 1GRAA 1D7YA 3UOYA 1N4WA 2YLTA 2JK6A 2X8GA 2C7GA 1IUVA 4C3XA 2JKCA 1IUSA 3F8RA 1GV4A 4Z24A 5IPYA 3QSSA 1JRXA 1Q1WA 1PBBA 1PXBA 2V5ZA 3AYLA 4LIIA 4DSGA 1GRHA 2X99A 4EIQA 1ZMCA 3B6DA 3Q9TA 3GYJA 1CJ3A 2B76A 2Z5XA 3GDNA 1IUXA 3RP8A 3F8PA 3QSMA 1PBEA 2XLSA 5FMHA 5FS7A 4FDCB 4GUVA 5FS8A 3UKPA 4U8MA 4B67A 1KFYA 3NYCA 2V3BA 4LU6A 1KNPA 1CC6A 1LPFA 4H4RA 3CNJA 2VRMA 2WDQA 3FPZA 1E6EA 3UTEA 3RP7A 2C72A 2YVGA 2WOWA 2VVLG 2GF3A 3I3LA 3CNTA 1OJ9A 4O5QA 3DJGX 2C3DA 4H4TA 2GR3A 3AE2A 3CPHG 2YLZA 2WHDA 3PVCA 3DH9A 4KPRA 3UKHA 3KVEA 4YSXA 3AEEA 2X8HA 2AQJA 4OVIA 1F3PA 3NK0X 1PBDA 4B63A 2BS4A 2XLRA 3P4PA 1PHHA 3SFDA 3KU9A 2RABA 3BNMA 4H4ZA 1Q9IA 1IUWA 3GRSA 4H50A 4Z43A 5IQ1A 2R0CA 4B69A 2V61A 4U8LA 2A87A 4WX1A 1GOSA 2BYBA 1DODA 2QCUA 1H83A 4Z2UA 3VR9A 1PXAA 1N1PA 1PJ6A 4AT0A 4U2SA 1NAAA 4H7UA 2R9ZA 2XFOA 1L9CA 1GRFA 1KSSA 1TDFA 3AE3A 2WESA 3KPFA 2BC0A 1VRQB 4UP3A 2JB2A 3AECA 1YQZA 3CGDA 4JQ9A 4Z25A 3GSIA 1DJQA 5GRTA 3SFEA 3GWDA 4NTDA 4U8IA 1LQUA 4EQSA 2R0GA 1D4DA 1H84A 1EL8A 1BGNA 1ZOYA 3H4KA 2DKHA 2CULA 3LOVA 2RGOA 2YWLA 2X3NA 3AD7B 4OPDA 4TLZA 3DGHA 1H81A 4YKFA 3V76A 3VRAA 3AD9B 1BZLA 3ALMA 4EQWA 4USRA 3NTDA 1M6IA 1BF3A 4Y4LA 4Z26A 4ZCCA 2TMDA 1EL5A 3NYFA 5JCLA 4YKGA 2BXSA 3CNDA 3AEGA 1TDKA 4H4PA 1PBCA 2RGHA 2Y6QA 4B1BA 2YLRA 1FEAA 2XCGA 1JOAA 4CY8A 1GALA 2GVCA 4JNAA 4RG3A 2E5VA 3UTHA 2XYOA 1L9EA 1OJTA 3BI2A 3ZDNA 1GRGA 4J2WA 1FEBA 3IF9A 3AD8B 2I0ZA 2WETA 2C64A 1CL0A 4XWRA 2OLOA 2PYXA 4BK3A 1RSGA 4NTEA 1YY5A 3BHFA 1YQ4A 1BKWA 2XVFA 1PN0A 1QO8A 3E1TA 3P9UA 3VRDB 4CCRA 1LJ1A 1GNDA 1VG9A 2VQ7A 2WOIA 5C2TA 1Y0PA 3GRTA 2WS3A 1B37A 1HYUA 4K8DA 2YG6A 2WDRA 3M12A 3I6DA 2V60A 2C76A 3AYIA 4H4WA 5KXJA 3QFBA 1TYTA 2YLWA 3CGEA 4PABA 3QSEA 4DGKA 2JB3A 4ZN0A 2YLSA 1NEKA 2GB0A 3P4QA 2ACZA 3B3RA 1LQTA 1NPXA 5BULA 3RHAA 3LXDA 4B66A 5JCKA 1QJDA 4MJWA 1KSUA 3ADAB 1DOEA 4Y4NA 5J7XA 1CJ2A 5KOWA 3DGZA 3BI4A 1E39A 4NEWA 4EMIA 2R46A 3ICRA 2Q6UA 2Y6RA 3ATQA 3IWAA 3R9UA 3D8XA 3K7QX 4NZHA 2WQYA 1B4VA 2JB1A 1XDIA 5M0ZA 4GDEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2H70A 6GSVA 3UKKA 1QK8A 1TRBA 3UKFA 2YR4A 1ZZYA 2BK5A 1UC7A 5U63A 1O8WA 1OAZA 4IBPA 1RK4A 1Y56B 3GN3A 2L6DA 3P1WA 4U8NA 1F8SA 4F03A 1XANA 4EC0A 4AJ7A 4UDQA 3US3A 5CAXA 1X5DA 2J23A 4Y4MA 4KX6A 3LYKA 4BIKA 1XOAA 2WDUA 2Q0LA 1GSUA 1PN9A 1FAAA 4RQRA 4E0VA 4D04A 3GIXA 2C66A 1MXTA 5KMQA 4JU5A 2XFPA 4WKWA 1DOCA 1KNRA 3EVIA 1GL8A 3NK2X 3DJEA 3F4TA 3GWFA 4A5LA 3IXRA 2X8CA 2HZFA 1QLBA 4D03A 1NHOA 3AY8A 2XLPA 2Z5YA 4OCGA 1V9WA 2O85A 1K0CA 4LLRA 4OPUA 1GNEA 5DBJA 1USBA 2GEWA 1RW1A 3SZFA 3A2VA 2WDVA 4EMWA 1FOVA 5KNLA 1UA5A 2F9SA 2HSHA 3GL5A 1T4ZA 11GSA 1G0TA 2YR5A 3EYTA 6GSTA 1PJ7A 3ME7A 4KDUA 4JY3A 1Z6LA 1VRSD 1VQWA 3HDCA 3FIMB 2FWGA 5DVBA 2IWTA 4WETA 2YG5A 2K8VA 3R2QA 3H8QA 1V57A 3SX6A 4GQCA 5EB5A 3RPPA 2C0DA 4I59A 3AE5A 2R4JA 3FMWA 2LV3A 2I4AA 5JCUA 3GH9A 4WXTA 1B8SA 4ML1A 3AEAA 3OZ2A 1X0RA 3G9BA 3KKJA 2LUSA 3UOVA 3BI5A 1GRBA 4DNAA 1MDKA 3NIXA 4AOSA 3T0KA 4Z7XA 3ISOA 3LXTA 4EO3A 1FG4A 5A4UA 3WGXA 4KCEA 1VDCA 3GYIA 4U8PA 4GWRA 4CNJA 3IA1A 4MPGA 4ECCA 1NHQA 2OAMA 3TB2A 3NN6X 2ZCTA 1FB6A 2DJ2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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