5BRTA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase from pseudomonas azelaica with 2-hydroxybiphenyl in the active site
Total Genus 188
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
188
sequence length
581
structure length
554
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGGSINIEFSADLSSLCEHKGDMYWMFGVAALRMIRPWNKWICVWGTKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
total genus 188
structure length 554
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5brtA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 5brtA01
1GETA 2BS3A 1ZKQA 2WDQA 2WP6A 4NEVA 4NTCA 4IVMB 1PBFA 4U8NA 2BXRA 1IUXA 4M52A 3AEEA 4YTPA 2IVEA 2YR5A 1XANA 3LZWA 3Q9TA 1NEKA 1K0LA 1IUTA 2TMDA 2BC1A 1GXFA 3AYJA 1BGJA 1IUWA 2FJEA 1NDAA 3KPFA 5IPYA 2OA1A 4YSZA 3K7MX 4H4SA 1OJCA 4B65A 4X9NA 1LVLA 1HYUA 1TDOA 1OJDA 1QO8A 2C3CA 2O9ZA 1JU2A 1D7YA 1OJTA 1O95A 4PABA 5LV9A 4YSHA 2WDRA 3UKHA 4AT2A 2WS3A 1OJAA 2XVEA 3AEDA 5CQFA 1GRGA 3F8PA 4U8OA 4H2RA 3IHGA 1YY5A 2YM1A 3COXA 1GNDA 1TDKA 3BHKA 1FOHA 4H4PA 2WU5A 3K30A 2RGJA 3ISHA 1B8SA 1NG4A 2YLRA 3CGCA 3GRTA 3T37A 3V3NA 1L0VA 4OPGA 4GCMA 1JRZA 3B3RA 3CPHG 3UKAA 5IQ4A 2HQMA 2WP5A 4ADWA 1GREA 3AE5A 4J36A 4ZN0A 1D7LA 2GF3A 1QJDA 5KRQA 4REKA 1TDFA 5GRTA 4ZCDA 1FL2A 3O0HA 1H84A 3VRAA 2R4JA 1B4VA 2VQBA 3DK4A 1DOCA 1KSUA 2WOIA 1GRAA 2F5ZA 4K22A 3AE3A 4Z25A 2XLTA 1TDNA 1CJCA 2YG6A 2YG5A 2X99A 4P9SA 4CRTA 1F8SA 1E39A 3I3LA 1E1MA 1KSSA 1E1NA 4RG3A 2Q0LA 1GESA 1N4WA 3AEFA 4KX6A 3AEAA 4E0VA 2Z5XA 1Z6LA 3ICSA 4GF7A 5FS9A 1BKWA 2RABA 1JNZA 2AQJA 1M6IA 3NT6A 2IVDA 5JCLA 2GQFA 1DJNA 1L9CA 1D5TA 1EL8A 1TRBA 2X8HA 2JB2A 3F8DA 2DKHA 3RNMA 4C74A 4CCRA 3AYLA 4RG4A 1QLBA 2CDUA 1S2QA 3H4KA 4CY6A 3BNUA 2B9YA 1E7PA 2CFYA 3NG7X 4I59A 2WQYA 4JDRA 3K7TA 3RP8A 1BGNA 2OLOA 4NZHA 2WHDA 5JCIA 5JCNA 4K5SA 2BK3A 2GQWA 3AB1A 3ADAB 1GEUA 4WX1A 3NLCA 3AEGA 3GDPA 2FJDA 3LXDA 2CULA 2CVJA 1RSGA 4I58A 1M64A 4J57A 1D4DA 3FMWA 1EBDA 2E1MA 4RSLA 4C3XA 1GRTA 1Q1WA 3DA1A 4H4ZA 1S3BA 2YAUA 2JK6A 5L46A 5M10A 2FJBA 3EANA 4OPLA 2C67A 4EQWA 4O5UA 2QA1A 1S3EA 1GRFA 1PJ5A 2YG3A 4IVOB 4U2LA 3NIXA 4Z44A 5U63A 4GUVA 1MO9A 2YVJA 4BK1A 5HY5A 2ARDA 3NK0X 4TM4A 3NYEA 2X3NA 1PBDA 1D4CA 2FBWA 1CJ3A 2GAGB 1NAAA 3NK1X 1GRHA 2BK5A 3DGZA 2RGHA 4CCQA 3D8XA 5EB5A 5FS8A 4IA5A 3WE0A 2XVFA 2WPEA 1DJQA 3P4SA 3P9UA 1FEBA 3DJGX 2BS4A 3P4PA 2VOUA 3DH9A 1ZK7A 2GMJA 5U25A 1JNRA 2VZ2A 2YR4A 4EQXA 1CJ2A 3G5SA 3AE1A 4CNKA 1NPXA 3Q6JA 2OLNA 1AOGA 3QSSA 1PHHA 4KPRA 1DOEA 1N1PA 3CNTA 4BJYA 4BJZA 1D4EA 1FECA 3DJJA 2YVGA 3GWDA 3E1TA 1PN0A 3UTGA 3UOZA 1DODA 2WESA 3LB8A 4JY3A 4B63A 2DKIA 4U8JA 2C7GA 2JKCA 2VVLA 4A99A 4Y4MA 3FPZA 5M0ZA 2UZZA 2X8CA 2GB0A 3C4AA 3CPIG 4JNQA 4B64A 1CL0A 2BCGG 3AEBA 2AAQA 2YQUA 2YWLA 1REOA 2BABA 3NTDA 3VRDB 4FDCB 3G5QA 5HXIA 3M13A 3UP5A 1E6EA 3IWAA 4U2SA 3P4QA 1CJ4A 2GR2A 1P2EA 4U8KA 2EQ7A 1NENA 1GV4A 1H7XA 3LADA 2WOVA 5BULA 1KNRA 5FS6A 3UKFA 4B67A 1Y0PA 4JN9A 3H8LA 2VVMA 5U1OA 4DSHA 1K4QA 2GRTA 4Z2TA 1FEAA 4OPTA 5HHFA 4B69A 3UTEA 1RP0A 3GRSA 1L9DA 2VQ7A 2YM2A 2WPFA 4EIPA 4EM4A 1O5WA 3SFDA 4X4JA 1LTXR 3K7QX 4WCTA 2QA2A 2V6OA 3NK2X 2XCGA 1GTEA 4GDEA 4K8DA 3UOVA 2H88A 1KFYA 4AP1A 2OAMA 1VRQB 5FS7A 2JB3A 2C75A 2XFNA 3NN6X 4B1BA 1P2HA 3L1RA 3UTFA 4D03A 4H4YA 1LQTA 2C66A 2C72A 2GAHB 2Z5YA 3DK8A 4HA6A 4CBQA 4LIIA 1LPFA 4YWOA 4H4VA 5KVIA 3PO7A 4TM0A 4JNAA 2VRLA 2EQ9A 2EQ8A 1EL7A 4H4TA 2XLRA 5KWFA 4OPCA 2C70A 4BK3A 3R9UA 2A8XA 3UKKA 4DGKA 2APGA 3NH3X 2ACZA 2AR8A 2I0ZA 2XDOA 4OPUA 4U8IA 4FK1C 4YSYA 3EAOA 1ZX9A 1ZMCA 2ZZCA 3KLJA 4H4XA 3IHMA 4K2XA 1H86A 4J56A 4ICYA 3GMBA 1YQZA 2PYXA 1XHCA 4A9WA 4XWZA 1NG3A 1K0JA 1ZMDA 1CBOA 2BACA 3NN0X 3BI4A 3CGDA 3NKSA 4GRTA 1GTHA 1ZOYA 2BA9A 4H7UA 4Y4NA 2BC0A 2WEUA 2B9XA 1W4XA 3GYIA 1GERA 2QCUA 3LOVA 1DXLA 1H7WA 2B76A 2V61A 2XYOA 3AECA 3II4A 4Z24A 3RP7A 1GT8A 5J60A 5KXJA 1ZP0A 1BWCA 2OALA 2Y6QA 2YG7A 3CTYA 3VQRA 4K7ZA 3H8IA 3SFEA 3AE8A 3G5RA 3VR9A 1ZDLA 2C76A 2XLSA 1GRBA 3NYFA 1F8WA 2H89A 3QFAA 2C3DA 4Z2UA 4IV9A 4A7AA 2WBAA 3BHFA 2J3NA 1GPEA 2YG4A 4X9MA 4JY2A 3LJPA 4CNJA 4EMIA 4YT0A 4D04A 1F6MA 1EL9A 3AE2A 1COYA 3QVRA 4LA1A 2Q0KA 2XVJA 3UTHA 4EM3A 1H82A 2GVCA 4H4WA 4YKGA 3IF9A 5JCKA 3M12A 5KOXA 3DMEA 4ZCCA 3URHA 2XLPA 4HB9A 1YQ3A 2ZZBA 1NHRA 5BUKA 1PXCA 4MJWA 4TM3A 1Q1RA 3AXBA 2XVIA 2WETA 1X31B 2XLUA 3QSEA 2QAEA 1KDGA 1KF6A 2TPRA 4J34A 3I6DA 2NPXA 4OPDA 4USRA 3CNJA 4YKFA 2YR6A 4EIQA 1TDEA 2GH5A 2V60A 1Y56B 1JEHA 3AE9A 3PVCA 4NTDA 4B68A 4J2WA 2XVHA 2EQ6A 3FG2P 2V3BA 4O5QA 2R46A 5EB4A 3NTAA 1FCDA 4NTEA 3NHOX 4A79A 2PHHA 1BF3A 1ZY8A 5KOWA 3F8RA 5TR3A 1VG9A 3OZ2A 2X8GA 1XDIA 2B7SA 3M0OA 4OCGA 3C4NA 3SGLA 1YQ4A 1MXTA 4N9XA 1Y56A 1GOSA 2XFUA 3GMCA 5C3JA 5ER0A 4AT0A 2WPCA 2RGOA 3GWFA 1KNPA 4A5LA 3CN8A 3HZLA 2YLSA 4U8PA 5JCMA 4H50A 5C2TA 3LZXA 5EBKA 1PBBA 5EOWA 3GYJA 2YLZA 3ICTA 1PXAA 5GSNA 1PDHA 2R4EA 5J7XA 2GMHA 4Z26A 3VR8A 3AD9B 2JB1A 1LQUA 3KA7A 4C77A 1TYPA 5CKUA 4EMWA 1MOKA 4GR1A 4YTMA 2V5ZA 1CF3A 2YLTA 1NHQA 3ALJA 4UDQA 1TYTA 1F8RA 3CGEA 3OC4A 2E5VA 3GD3A 4H4RA 4B66A 2R45A 3ALMA 3UCLA 2X50A 3KU9A 3QJ4A 3ICRA 3SQPA 1OJ9A 1JRYA 4PAAA 2C64A 2Q6UA 4UP3A 4LU6A 4TLZA 2B7RA 3JSKA 1E1LA 1PBEA 3NYCA 2YVFA 4CY8A 2XFOA 4H2PA 2JAEA 3VRBA 5BVAA 1DNCA 1ONFA 4FK1A 1N4VA 3P1WA 3UKQA 4EQSA 4Z2RA 4J31A 3V3OA 4H4QA 3CNPA 4DSGA 2V3AA 3UKLA 3UKPA 1DOBA 1EL5A 1S2YA 4C3YA 1B5QA 3CIRA 4U8LA 2ZBWA 2E4GA 3UOYA 1PJ7A 3P4RA 2W0HA 2GV8A 3RP6A 1IJHA 4IA6A 3ATRA 4DNAA 1ZOVA 4OVIA 3AD7B 3SM8A 3ABVA 4BK2A 2R0GA 5HYMA 3CNSA 2R9ZA 1VG0A 3KKJA 4U8MA 2GR3A 4A6NB 4AOSA 1O94A 2C73A 1PS9A 4OPIA 4A65A 2GR1A 3GDNA 3BI2A 3ZDNA 2B9WA 4H4UA 1N4UA 4Y4LA 4BV6A 3EPTA 3B6DA 1IUVA 4A6NA 4GDPA 2FJAA 4TM1A 2JBVA 3DK9A 4XWRA 4YSXA 2VRMA 1RYIA 2XFQA 1E1KA 1LV0A 3FIMB 3S5WA 1CC2A 1K0IA 1YKJA 2Q7VA 4C5OA 3BNMA 2BK4A 4YTNA 3PS9A 1PXBA 4H2NA 3REDA 3S61A 3ATQA 3AYIA 4JQ9A 1H6VA 3DJDA 4TLXA 5DBJA 1GALA 5IQ1A 1VQWA 2GEWA 2WOWA 1IUUA 3QFBA 2VVLG 1V59A 5FMHA 1F3PA 1NHPA 1CHUA 1VDCA 3ITJA 4NEWA 3RHAA 2XFPA 4UDRA 1H81A 1H83A 1SEZA 4AP3A 3BI5A 4EQRA 1IUSA 2YLXA 3NNEA 4FX9A 1BZLA 1L9EA 4BURA 1PJ6A 2BYBA 2WP9A 2YLWA 1XPQA 3DJEA 2Y6RA 3AD8B 3DGHA 4YXDA 3KD9A 4J33A 2R0CA 3L8KA 1JOAA 1GSNA 2A89A 2BS2A 4UDPA 4Z43A 2R0PA 3GD4A 3NGCX 1CC4A 2WU2A 3AE7A 5BRTA 3CNDA 3IC9A 4U2TA 1LJ1A 4EMJA 5KVHA 1Q9IA 4H2QA 2A87A 3FBSA 3AE4A 1UKVG 3CPJG 4ECHA 3EF6A 2GR0A 4K5RA 4AOXA 4APNA 3AWIA 3ALLA 3UOXA 3UP4A 3QSMA 2NVKX 2IIDA 2BCPA 3AE6A 1NHSA 1PBCA 4XXGA 1ELIA 3CGBA 1B37A 2ZZ0A 3C96A 3D1CA 3KVEA 1JRXA 3NRNA 3QVPA 4USQA 2BXSA 3GSIA 1CC6A 2WDVA 3V76A 3ZYXA 2C65A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UIWA 4KA0A 2WDQA 1MTCA 1Z7PA 4L0WA 3A3TA 4RI6A 4ZXGA 5AIXA 4J56E 5ENUA 4U8NA 3LGCA 4WBRD 3AEEA 2YANA 2OACA 1TP9A 3LZWA 3Q9TA 1XWBA 3F3RA 2PN8A 1TOFA 2JZRA 5IQYA 4G19A 1BGJA 1M0UA 5IMZA 3EURA 4XIHA 5ECHB 5IPYA 4DVCA 5ECOB 4YSZA 4B65A 1LVLA 1S3RA 5KMSA 4H86A 1J9BA 5HQPA 3E3EA 2AUVA 1U6TA 3WGEA 2EC4A 3I43A 3OR5A 2WDRA 2Z9SA 5A5KA 2WS3A 3GYKA 2CZ3A 1SYXA 1OJAA 3UMAA 3GSTA 3COXA 4HSCX 5HR2A 1FOHA 4H4PA 1Y25A 2WU5A 2RGJA 4MNNA 2YLRA 3VPTA 3T37A 1JRZA 3CPHG 5IQ4A 2QKEA 2HQMA 2WP5A 1AC1A 2E2GA 3PR8A 1T00A 5CRDA 5GRTA 1FL2A 3HZ8A 2B1KA 1WIKA 2PWJA 2WB9A 1DOCA 1GRAA 2F5ZA 3AE3A 2YG5A 1T7PB 2YV7A 5CP1A 4EXJA 1E1MA 4RG3A 3BBYA 3KJYA 4MJEA 3HVVA 2PMTA 1I5GA 3EU3A 3ZFLA 1JNZA 2RABA 2AQJA 2GQFA 1L9CA 2X8HA 1TRBA 2DKHA 3TJFA 2MBSA 1QLBA 2CDUA 4CY6A 4BWQA 2YN1A 2HLSA 5G1KA 1V40A 3K7TA 1JZOA 4GXZA 4NZHA 3RP8A 1F3AA 1VF4A 3QR6A 4K5SA 3SXIA 5J3RA 4GCIA 1GEUA 3ADAB 1VF3A 5FT3A 2CULA 3TKSE 1OC9A 1O85A 1GRTA 5HFGA 3GTUA 3APQA 4G0IA 1ERWA 3ME7A 5A4VA 2FJBA 2H0IA 3EANA 1JLVA 3BJ5A 4EQWA 2R3XA 5ECQB 1S3EA 2YG3A 1PRXA 4FH8A 5U63A 5HY5A 1MO9A 1MD4A 3CQFA 2ARDA 4TM4A 4CDOA 3KD0A 4LMVA 5G2ZA 1D4CA 2NVLA 1PD21 1CJ3A 3WGXA 4ACSA 4NHWA 1M7TA 5EB5A 4HZ2A 2XVFA 1ACVA 2VD0A 1FEBA 1GTAA 1NHOA 2BS4A 2PVOC 1ZK7A 2VZ2A 1VF1A 1F6MC 1CJ2A 4CNKA 3Q6JA 1YKCA 1EOGA 4ZBBA 3QSSA 1PHHA 4BJZA 2VCTA 1FECA 4JZQA 1EV9A 4HJMA 3UOZA 3MAKA 5IMCA 4B63A 2K8VA 2DKIA 1G7EA 2C7GA 5ECPB 3FPZA 4GWRA 3C4AA 3CPIG 3VK9A 2L6DA 4K7NA 12GSA 3T2YA 2AAQA 2YWLA 1REOA 1M3IA 3NTDA 5HXIA 5HR0A 1PX6A 4U2SA 3P4QA 5ECIB 1GV4A 1H7XA 1TXXA 3GL5A 4KE3A 5IPHA 1KNRA 5EL8A 1RW1A 5ECRB 2C1YA 2HRKA 3LWAA 3TJGA 1AQVA 4ZL7A 3APOA 2GRTA 1FEAA 3SZ0A 1LU4A 5G31A 1EEMA 4ML1A 1RP0A 1ZL9A 2YCDA 2YM2A 2WPFA 4EM4A 4X4JA 3S9FA 2B5YA 3LJRA 3UJ1A 4WCTA 1UC7A 4AP1A 3UOVA 3F9UA 1KFYA 4KW6A 3NN6X 3L1RA 3KIJA 1MDIA 4YAPA 2C66A 2L57A 1YDKA 6GSYA 3FRCA 2FWHA 4ILFA 5KVIA 3UOMA 1SJ6A 4JNAA 1TKDB 2EQ9A 1EGOA 1PGTA 1EL7A 3D4TA 5D96A 3TJKA 1T4ZA 3LG6A 2L4CA 4PUFC 2BRYA 6GSSA 3UKKA 1EOHA 1OVNA 2H0HA 3HJMA 2TRXA 4LL4B 2I0ZA 2GT5A 4MPGA 4OPUA 5D9VA 1ZMCA 3IHMA 4J56A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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