5BRTA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase from pseudomonas azelaica with 2-hydroxybiphenyl in the active site
Total Genus 188
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
188
sequence length
581
structure length
554
Chain Sequence
AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGGSINIEFSADLSSLCEHKGDMYWMFGVAALRMIRPWNKWICVWGTKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
total genus 188
structure length 554
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5brtA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 5brtA01
3C4AA 1TDKA 5IQ1A 4H4SA 2WP5A 1NG4A 2YR6A 3DJEA 1KSUA 1CHUA 5LV9A 3G5SA 2VVLA 3CGDA 3G5QA 1OJTA 2ZZCA 5KOWA 3CIRA 4GCMA 5FS8A 2XYOA 1NEKA 4FK1C 2GR0A 2BS3A 4CNKA 2YQUA 1PBBA 4U8JA 1F3PA 1ZMDA 2XVFA 1EBDA 1F8SA 3VR8A 1NPXA 3DJGX 4NTCA 4P9SA 4REKA 3NKSA 4DSHA 2ZBWA 3AD8B 1PXAA 2X3NA 1H7XA 1OJCA 4GR1A 4U8IA 4EQRA 2Q6UA 1LJ1A 5BUKA 1L9DA 3C4NA 1ONFA 2BABA 3ABVA 3RNMA 3UKQA 2WP9A 5M10A 2V5ZA 4IVMB 3AEBA 1LV0A 2YLXA 4WX1A 3K7TA 3RP7A 4K5SA 3IHGA 1ZOYA 3CN8A 2BK3A 1YY5A 4KPRA 1H82A 2YR4A 4J34A 3AE5A 3NYFA 1H7WA 4ZN0A 2GMHA 1JRYA 1F8RA 2NVKX 2BS4A 2BS2A 3NH3X 4NEWA 5BVAA 4HA6A 2C72A 3UTGA 2WEUA 1QLBA 2Q0KA 3Q9TA 2VQ7A 1B8SA 2BCPA 2C67A 2R46A 2B9WA 1BGNA 2FJBA 3GYIA 2W0HA 1O95A 3SM8A 1LTXR 4U2LA 5BULA 5EB4A 1S2QA 2C66A 3FPZA 5C3JA 3KD9A 5KOXA 3E1TA 2ZZBA 1D4DA 2YG3A 3CNTA 3NYCA 3Q6JA 4J33A 4U2TA 2GEWA 2XLPA 4U8PA 4Z44A 4H2NA 4XWRA 4A5LA 1JEHA 4JNAA 3LOVA 5JCKA 1CJ2A 1M6IA 3CGEA 1H86A 1Q1WA 4YSHA 2XCGA 3QJ4A 1H83A 1DNCA 3AECA 3B6DA 4UDPA 4CCQA 2RGJA 4BV6A 2R9ZA 3KLJA 4APNA 1DOBA 3GD3A 2WU2A 5HHFA 1GPEA 1DODA 3RP8A 3DA1A 2XVHA 1LPFA 1NDAA 3OC4A 1JOAA 1GRFA 4H4PA 3AE1A 2X8CA 2YVFA 4OPUA 4U8OA 2Y6QA 4Y4NA 1JRZA 2BXSA 2XFPA 2X8GA 4J57A 2QCUA 2WPEA 4U8NA 2TPRA 2VVMA 3GRSA 3IHMA 2V61A 2BC0A 3UKPA 1B4VA 1KNPA 2FJEA 3CGCA 4H4ZA 4EM4A 3SFDA 1ZMCA 3KA7A 5KVHA 3QSEA 1IUTA 2I0ZA 3BI2A 3M12A 4OCGA 5KRQA 2B7RA 1GXFA 4FX9A 2X8HA 4Z26A 4JDRA 4GDEA 4EIQA 3K7QX 2FJAA 2IVEA 3NT6A 3REDA 3L8KA 3B3RA 2JAEA 4H4QA 2OLNA 3K30A 5CQFA 3VRDB 1E6EA 2APGA 2BCGG 4DGKA 1PBEA 4YSXA 4A6NA 2RABA 2XLTA 3K7MX 1VG0A 4YSZA 4H2PA 4K2XA 2AQJA 1VRQB 2RGHA 3NLCA 2DKIA 1KFYA 2OALA 1GERA 3AE6A 3CTYA 5FS6A 3GMBA 2DKHA 3NTAA 3AE2A 1ZOVA 5FS7A 4BK2A 5J60A 2WPFA 3I3LA 3FIMB 3GYJA 1OJ9A 4YTMA 1L9CA 4A9WA 5IPYA 5JCNA 1XANA 2YM1A 3GWDA 2A87A 4H4YA 3NGCX 4B68A 2CVJA 1KDGA 2NPXA 4TM4A 3LZWA 3QVRA 1JNRA 2WESA 1BKWA 1PS9A 3GDPA 1FEAA 4AOXA 4LIIA 4BURA 4HB9A 1TRBA 4UDQA 4A65A 3ZYXA 1YQ4A 1ZK7A 4EMIA 1UKVG 2WOIA 4DNAA 4B65A 2WDVA 1NHQA 3I6DA 2WPCA 4JQ9A 1N1PA 4OPLA 3CPIG 3SFEA 4K5RA 5KVIA 3BNUA 1Z6LA 4PAAA 1KSSA 2V60A 4JN9A 5HY5A 4I59A 5JCIA 1S2YA 2O9ZA 3DK4A 4YT0A 4H2QA 1TDOA 2XFUA 3EANA 3AE4A 5GSNA 2JBVA 4YKGA 3UOVA 4YSYA 2Q0LA 2GVCA 2YR5A 4BK3A 1S3BA 2V6OA 3AEEA 3BNMA 4U8LA 2R0CA 4YXDA 2XVEA 3PVCA 1D4EA 1GETA 4CCRA 1XHCA 2BACA 5ER0A 2C65A 2CULA 4X4JA 4E0VA 1PJ6A 4FK1A 2ARDA 2XFQA 3C96A 4OPGA 3VQRA 5KXJA 1FL2A 3ICTA 3OZ2A 1O94A 2VRMA 1IJHA 2VZ2A 4LU6A 3ZDNA 2VOUA 3KVEA 1YQ3A 5C2TA 3AEDA 4J56A 3IWAA 1TDFA 4B67A 3H8LA 4EQSA 5EB5A 2CFYA 1GRBA 1GRHA 1XPQA 1Y56A 2C70A 4USRA 2H88A 4AT0A 4EQXA 1NHRA 4C3XA 4N9XA 3AYIA 4CNJA 4IVOB 1TYTA 2BK5A 2J3NA 4AT2A 2VVLG 2C64A 2GV8A 1CC2A 2WU5A 5HYMA 2XLRA 2R0PA 2WHDA 1GEUA 1D7LA 3UOZA 1E1MA 1BZLA 2XLSA 3VR9A 1LQTA 3GD4A 4B66A 2RGOA 4Z43A 1CBOA 3QFAA 2QA1A 1CC6A 4U2SA 4K7ZA 2BK4A 1EL7A 1PDHA 4PABA 3S61A 3UOXA 3F8RA 4UP3A 1N4VA 2YWLA 1CF3A 1PXBA 1W4XA 1QO8A 2OA1A 4RG3A 1D4CA 1CL0A 4CY8A 1TDNA 1AOGA 2R0GA 3LB8A 2E1MA 4YTPA 1TDEA 3QSMA 1BF3A 2WQYA 1REOA 4EIPA 3AEAA 4XWZA 4X9NA 4USQA 1CC4A 1K4QA 3FG2P 2WDRA 2YVJA 3EPTA 2R4JA 4CY6A 2A8XA 3IC9A 3QFBA 1GRAA 2WOVA 2YG7A 3VRAA 4CBQA 2B9XA 1GRTA 4GUVA 4Y4LA 2EQ7A 3DGZA 3NK0X 4H4XA 3F8PA 3GMCA 4B69A 3AE8A 3LJPA 3NNEA 2YG4A 1D5TA 4OVIA 4DSGA 3URHA 2BC1A 2Z5YA 1RSGA 3UOYA 4BK1A 2Q7VA 3DK9A 4EQWA 3LADA 1JU2A 2GAHB 3BI5A 2HQMA 3CNSA 1PBFA 2GAGB 3AE3A 3DJDA 4B1BA 5FMHA 4EMJA 1JRXA 1GOSA 1SEZA 1OJAA 1N4UA 4H4TA 3ALLA 3AYJA 4BJYA 2GRTA 2PHHA 3AYLA 4TLXA 4C77A 4WCTA 4IA5A 3ATQA 1EL9A 4U8KA 1GNDA 3P4QA 4YWOA 2V3BA 1IUVA 4ZCDA 3SGLA 3NHOX 2GF3A 4Z24A 3KU9A 4I58A 1KF6A 2E4GA 1PHHA 2YLSA 3PO7A 1IUUA 2Z5XA 1E1NA 4MJWA 5CKUA 3R9UA 3D1CA 4H2RA 3UTFA 4TLZA 2V3AA 3NTDA 4Y4MA 4ZCCA 2Y6RA 2OLOA 1FOHA 2C73A 3VRBA 4TM0A 1Q1RA 2UZZA 1E7PA 3NK2X 3AEFA 4M52A 3UKKA 3G5RA 4TM1A 5U25A 2JK6A 3NN0X 3BHKA 1GREA 4Z2UA 1O5WA 2YG5A 3NRNA 2WOWA 4H4RA 2WBAA 2ACZA 2WDQA 5U1OA 1CJ4A 1P2HA 4GRTA 3V3NA 2TMDA 3JSKA 3RP6A 4H4UA 3UCLA 4D04A 3WE0A 3DK8A 4OPCA 1F6MA 2C76A 1L0VA 3GWFA 3ISHA 1H6VA 2YLRA 2YLWA 5TR3A 1GTHA 3H8IA 1MXTA 2WS3A 1PJ5A 3GRTA 4ADWA 3BI4A 3PS9A 4YKFA 4UDRA 3AE7A 2XLUA 1V59A 2B76A 4J2WA 2YG6A 3SQPA 2GR3A 4C74A 2R45A 1DOCA 1K0LA 2E5VA 2JB2A 3ADAB 3L1RA 4K8DA 1IUXA 4C5OA 3EAOA 1BGJA 2AR8A 3KPFA 1DJQA 4J36A 4TM3A 4XXGA 2XVJA 3FMWA 1NHSA 3ATRA 3AWIA 5DBJA 5M0ZA 3AD9B 1TYPA 2EQ8A 1E1KA 3P4PA 5BRTA 3RHAA 1PBCA 2VQBA 3UP5A 5JCLA 1ZP0A 2BA9A 1E39A 1E1LA 3ALMA 3FBSA 3CGBA 4K22A 3AE9A 4AOSA 1MOKA 4B64A 3KKJA 5KWFA 1GALA 4IV9A 2GR1A 2H89A 4Z2TA 2GQWA 1N4WA 1OJDA 2GH5A 3NIXA 5EBKA 4O5UA 1F8WA 3M13A 3T37A 3P1WA 4NEVA 3EF6A 3GSIA 4A6NB 3H4KA 3LZXA 1H81A 3NN6X 3UKFA 3CPJG 2C7GA 4IA6A 2IIDA 4H50A 4X9MA 1NG3A 1K0IA 1BWCA 4A7AA 1Y0PA 1RP0A 3UP4A 1P2EA 1PN0A 2JB3A 4OPDA 3CPHG 2OAMA 1FECA 2C3DA 3LXDA 5GRTA 4NZHA 1XDIA 4B63A 3II4A 2BYBA 1IUWA 1H84A 2IVDA 2C3CA 2VRLA 3V3OA 3UTHA 1JNZA 3O0HA 4EMWA 4FDCB 4U8MA 2PYXA 1DXLA 1K0JA 1GSNA 4KX6A 4AP3A 2YM2A 3DMEA 3AXBA 3QSSA 2WETA 3DJJA 1VG9A 1GT8A 1CJCA 3CNJA 4ECHA 3BHFA 4ICYA 4GDPA 4EM3A 2EQ6A 2JB1A 4GF7A 5IQ4A 1Q9IA 4Z2RA 1VQWA 2XVIA 2GR2A 3HZLA 1L9EA 2X50A 2QA2A 1NAAA 3CNDA 2F5ZA 1HYUA 1ELIA 1KNRA 1GRGA 3DH9A 1FEBA 1GESA 1LVLA 2X99A 1M64A 3NG7X 1VDCA 4D03A 1FCDA 1IUSA 2B9YA 1PXCA 1GV4A 3GDNA 2B7SA 2JKCA 4NTEA 3NYEA 3AB1A 1COYA 4H7UA 4JNQA 4NTDA 5J7XA 3UKLA 3UKAA 3UKHA 4LA1A 2YLTA 3ICSA 5L46A 2WP6A 1ZKQA 1D7YA 1ZY8A 1LQUA 4A79A 3NK1X 3V76A 3QVPA 1PBDA 2GMJA 4OPTA 4JY2A 2QAEA 4BJZA 1S3EA 4H4WA 3AEGA 4J31A 3D8XA 1MO9A 4JY3A 5JCMA 5EOWA 3S5WA 2YAUA 4C3YA 3CNPA 4H4VA 2YLZA 1B37A 5HXIA 3P4RA 1DJNA 4Z25A 2XDOA 2XFOA 1CJ3A 1EL8A 3ICRA 4RG4A 1ZX9A 2C75A 3DGHA 1Y56B 3F8DA 3P9UA 3P4SA 4YTNA 3M0OA 4OPIA 2CDUA 1NENA 1EL5A 1NHPA 1X31B 2R4EA 5U63A 2ZZ0A 4A99A 3ITJA 1DOEA 1RYIA 2AAQA 2FJDA 4O5QA 4AP1A 1ZDLA 1PJ7A 4CRTA 3ALJA 1QJDA 2A89A 3COXA 2EQ9A 2FBWA 2XFNA 2YVGA 2BXRA 3UTEA 3IF9A 3AD7B 5FS9A 2GQFA 1YKJA 2GB0A 1B5QA 1GTEA 4RSLA 1YQZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3C4AA 4KE3A 4H4SA 3DJEA 4GAVA 2L5OA 5LV9A 5KEJA 3G5SA 4EDZA 3LQ7A 2VCTA 2VVLA 4G9HA 3KGKA 3G5QA 1EEMA 2RM6A 4HU7A 2XYOA 1NEKA 2KP1A 4FK1C 2GR0A 1V2AA 2H6XA 2N5AA 4U8JA 1ZMDA 2XVFA 1EBDA 3Q18A 1NPXA 4P9SA 3NKSA 4IJ3A 2X3NA 1Z9HA 2LTKA 2QKEA 2IPAA 2JU5A 1SK1A 2VLUA 5BUKA 1L9DA 2A2SA 5J9CA 4ZB8A 4LLRA 4F82A 5M10A 2EC4A 5KN3A 4WX1A 1LV0A 1WJKA 1ZOYA 4ECCA 1GRXA 1YY5A 3WT2A 1H82A 5ID2B 4O5RA 3NYFA 2GMHA 4F9ZA 3QFAC 2I9HA 2L59A 4EO3A 2BS2A 3NH3X 2FWEA 2LRCA 3UJ1A 1QLBA 2VM1A 2Q0KA 2V2GA 2C3QA 1N2AA 5DJLA 3KH9A 2IIYA 3FRCA 5D9XA 4NAXA 5KOXA 3CNTA 2YG3A 2NVLA 3QFBC 3CBUA 2XLPA 4ML6A 4U8PA 1WPIA 2CV4A 4MJAA 2AAWA 3LXTA 1CJ2A 3GX0A 3K8NA 1H86A 3KD0A 3DWVA 2H19A 3A2VA 1WMJA 4PUAA 3BBYA 1LU4A 3QJ4A 4I2TA 4UDPA 4HUAA 2PVOC 2VL9A 3KLJA 1DOBA 1PSQA 2O85A 1MEKA 3SY4A 3I6AA 4TR4A 1GTUA 1W4VA 2YP6A 1LPFA 1NDAA 2XPDA 1JOAA 1GRFA 2YVFA 2M72A 4Y4NA 2XFPA 2X8GA 2H1GA 2VVMA 2VD1A 1IYHA 4HU9A 4D73B 1RQMA 1B4VA 3CGCA 4EM4A 1GNWA 3QSEA 1IUTA 2I0ZA 4OCGA 2EIOA 4KAEA 1QGVA 1M9BA 3GSSA 4FO5A 2IVEA 3REDA 1OAZA 3IPZA 4PQ1A 3APQA 3W6GA 4ZBBA 4A6NA 2RABA 4H2PA 2FNOA 4K2XA 1VRQB 2DKIA 3CTYA 5FS6A 1GERA 5B6MA 1U3AA 4RQXA 3AE2A 3DVXA 2B1KA 1O6JA 3ZFBA 3N9JA 4TR0A 2WPFA 3QD9A 1T1VA 4YTMA 5IPYA 3LSZA 4H4YA 2MMZA 2FWFA 2M80A 3G7YA 1JHBA 1KDGA 3VI5A 4O92A 4ISDA 3LZWA 1H75A 3LORA 2WESA 4AOXA 3MNGA 1GP1A 1WWJA 4KB3A 5DJMA 3H93A 3EURA 1YQ4A 3UEMA 3L4NA 3A5IA 2PVQA 3TGZA 4TXOB 1OC8A 4N11A 4MJBA 2QC7A 4K5RA 2B5YA 4PAAA 2H70A 2IMKA 5IQYA 4O32A 4WF5A 3ZL5A 1KSSA 4JN9A 3HVSA 3HYPA 5HY5A 1S2YA 4YT0A 4DSSB 1TDOA 3EANA 4G9KA 2Q0LA 5D96A 5J3RA 2B5EA 3GKMA 4N30A 1XWCA 4EVMA 2R6KA 2XVEA 3PVCA 1WE0A 2P5QA 1S3AA 3HHVA 1PJ6A 1M7TA 3L78A 3RAZA 2WS2A 3ICTA 3ED3A 5GSTA 2VRMA 4YQMA 1SYXA 2VOUA 22GSA 3C7MA 2CT6A 3C71A 4J56A 3H8QA 2P0GA 4K2DA 3S9FA 4AT0A 1Y56A 1U87A 5COHA 1AQXA 2HSYA 3AYIA 3RBTA 1TYTA 4AT2A 2LRTA 20GSA 2JACA 1N8JA 3P2AA 1TDIA 3ZZXA 4YAPA 1ERTA 2HRKA 5F05A 2WHDA 1GEUA 3UOZA 1FB6A 1E1MA 4B66A 3GURA 2QGVA 2QA1A 1ZGNA 4U2SA 1PDHA 2I4AA 4UP3A 1ZOFA 1Z7PA 4H86A 3HYVA 1TDNA 1AOGA 3LB8A 4MF5A 2E1MA 1SU9A 1TDEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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