5BRTA

Crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase from pseudomonas azelaica with 2-hydroxybiphenyl in the active site
Total Genus 188
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
188
sequence length
581
structure length
554
Chain Sequence
b'AETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGGSINIEFSADLSSLCEHKGDMYWMFGVAALRMIRPWNKWICVWGTKEEAKKIIHEIIGTDEIPVEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGTAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords 2-hydroxybiphenyl-3-monooxygenase
publication title A crystal structure of 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase with bound substrate provides insights into the enzymatic mechanism.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
total genus 188
structure length 554
sequence length 581
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5brtA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 5brtA01
1BGNA 4DNAA 1CHUA 2WDQA 1GEUA 2X99A 2C72A 3FMWA 3K7QX 1KFYA 1X31B 3NK0X 2GH5A 2BCPA 3ADAB 4NTCA 4BURA 4B1BA 4USQA 2QAEA 3D8XA 1XPQA 2GR0A 4D04A 2WU5A 2Z5YA 2C3CA 2A89A 3ICTA 4IVMB 1VDCA 3AE2A 4LA1A 4Z26A 4B66A 1OJCA 4O5UA 3SGLA 3UP5A 1H6VA 2C73A 3QJ4A 5IPYA 3G5QA 3AYLA 3IHMA 4OPCA 3VQRA 4A7AA 4EM4A 5J60A 1O5WA 1TDFA 5KOXA 3KU9A 2BXRA 4JNQA 5HYMA 1W4XA 4APNA 1LQUA 3C4AA 3H4KA 1KNPA 4U8PA 3C4NA 4BK2A 4EQWA 3QSMA 1PN0A 1H82A 1BZLA 1TRBA 2B9XA 2B7SA 3NTDA 3NG7X 3RP6A 1GV4A 2BS3A 2RABA 2I0ZA 2YG7A 2ZBWA 3GWDA 2X8CA 5CQFA 4YSYA 4RG4A 1IJHA 3K7TA 2NPXA 2BA9A 1N1PA 1ZMDA 1JRZA 1NAAA 2WS3A 1OJTA 4DGKA 4EQRA 1PJ6A 2OLOA 2B9YA 5HHFA 3QSSA 4TLZA 4YTPA 1DJNA 4GUVA 1DNCA 1N4UA 4OPGA 4YSZA 1CJCA 2JBVA 4GDPA 4JN9A 4YWOA 3UCLA 1E1NA 1ONFA 3NT6A 3UTHA 2IVEA 4H2RA 1MOKA 1Y56B 2WPFA 4EM3A 2WPCA 3UKHA 2APGA 3B3RA 4Z44A 2YLZA 1V59A 2RGJA 2TMDA 3NLCA 1BGJA 4JNAA 1PHHA 2TPRA 5KRQA 3PVCA 1FCDA 2GRTA 2YLSA 3P1WA 3G5SA 1B8SA 4BJZA 1YY5A 1RP0A 1FECA 1L9DA 1O94A 1K0JA 2Q6UA 2WEUA 2XFPA 3AD9B 3M13A 4O5QA 4X9NA 2CULA 3QFAA 4TLXA 3CPIG 4YKGA 3AEEA 1CC4A 2BC1A 3DK9A 4U8LA 2VVLG 2WBAA 3F8DA 1KSUA 2RGHA 3AD8B 1FEAA 3SFDA 4Z2RA 1RSGA 1SEZA 2YM2A 5KWFA 3CNDA 4XWZA 1GPEA 1S3BA 4Z2UA 5GRTA 2WDVA 1PBDA 1L9CA 1D4CA 5BULA 1EL8A 1PBBA 2R0GA 1RYIA 4J31A 4I58A 4YSXA 5BVAA 2GQWA 3KKJA 4UDQA 1EL5A 3UKFA 2C70A 1PJ7A 2W0HA 3NRNA 3Q6JA 2FJAA 2XLRA 3V3OA 3V3NA 4J33A 5BRTA 3BNMA 2C67A 3PS9A 2GAHB 4GCMA 1ZMCA 1XANA 2VQ7A 4EMJA 1JNRA 5EB4A 4CCQA 3I6DA 2XLPA 3BI4A 3GSIA 4WX1A 3LJPA 5IQ1A 3CGDA 3AWIA 3BI2A 1PXCA 1GTHA 2XLUA 3FBSA 5KVIA 1L0VA 2R4JA 2YWLA 1HYUA 3P4QA 4A9WA 2CDUA 2R46A 2X3NA 4C3XA 1B37A 2V5ZA 3DMEA 2YG5A 3GDPA 2WP9A 3LOVA 3KPFA 3L8KA 4U8MA 4GR1A 4ZCDA 2YM1A 3DK4A 3VRAA 4XXGA 2FJDA 3EANA 1QO8A 1BWCA 4C77A 4DSGA 4K5RA 3GD4A 3UKPA 3H8LA 2JB3A 4UDPA 1IUUA 4J34A 4H4QA 2YLTA 4JY2A 2YG6A 4XWRA 1KF6A 1L9EA 1PBFA 1GT8A 3GDNA 2R9ZA 3BHKA 3GYIA 3T37A 4TM1A 3CTYA 2OAMA 3CGBA 1PBCA 3NK2X 4AT2A 5FS8A 3OC4A 1GRAA 1F3PA 3LZWA 2XLTA 3KA7A 4B65A 2Q7VA 3AE4A 3AEBA 4A65A 4OPTA 3UTGA 2AQJA 4H4PA 3CGCA 2QA1A 1JNZA 3DH9A 4U8IA 5GSNA 3S5WA 1PS9A 2J3NA 5U1OA 2YVJA 1CBOA 2C75A 5C3JA 4CCRA 1LTXR 4Z25A 1CL0A 2C3DA 2V3AA 3EAOA 4CY6A 3RNMA 3UKAA 3DGHA 3NHOX 1Q9IA 5J7XA 3IHGA 3CNTA 1BF3A 3UP4A 1AOGA 1QLBA 1PXAA 3ZDNA 1FOHA 2EQ7A 2X50A 3NN6X 4K5SA 4ZCCA 2YLRA 2H88A 4GF7A 1TYTA 2ACZA 2YR5A 3CNJA 4LIIA 2YR4A 4A6NB 2E1MA 2GV8A 1LQTA 1XHCA 3AB1A 4H4VA 1GXFA 2AR8A 3KD9A 3S61A 3UKQA 1CJ2A 1CJ3A 2JB2A 3F8PA 4WCTA 4U8NA 2Y6RA 4J57A 3GD3A 2EQ8A 1D7YA 1QJDA 1GRTA 1H83A 1VG9A 1ZY8A 4J2WA 5CKUA 2XVHA 1LPFA 3LZXA 4Z43A 3AE8A 4A79A 4YTNA 1NHRA 1NENA 2XVEA 4OPIA 4ICYA 2JB1A 4I59A 3P4SA 1P2HA 1IUVA 5JCLA 2R0CA 5KVHA 1M6IA 4YKFA 1DXLA 1GRFA 4H4TA 3NK1X 3AE7A 1DODA 3NKSA 4EQXA 5L46A 2VZ2A 3D1CA 2BK4A 4NTDA 3NYFA 4X9MA 4TM4A 3HZLA 3SM8A 2BS2A 3C96A 3NH3X 5LV9A 3SQPA 2VRLA 1F8SA 2Y6QA 1ZKQA 2WHDA 3VRDB 4IA6A 4OVIA 2B76A 2X8HA 3ALLA 3O0HA 4AOXA 2WPEA 3P4RA 4GRTA 1K0LA 2YAUA 1Q1RA 1ZOYA 4BV6A 1Y56A 1N4VA 3AE6A 1D5TA 3CPHG 4UP3A 1NHPA 5HY5A 3CNSA 3GYJA 4NEVA 4GDEA 2E4GA 3QVRA 3REDA 4JY3A 2C64A 5EB5A 1ZX9A 2C66A 2XFNA 2WDRA 2XFUA 5IQ4A 5JCMA 3DJDA 4BK1A 3P4PA 4EQSA 4NEWA 3V76A 1YKJA 4E0VA 1REOA 2IVDA 2B7RA 2GR2A 3FPZA 1YQZA 2PYXA 1CC2A 1E7PA 4YSHA 3OZ2A 1K4QA 2WP5A 2YQUA 3GRSA 4P9SA 2XYOA 4CNJA 2XFQA 4U8KA 3GRTA 4B67A 3ALJA 3DK8A 4H2QA 3NYEA 2BABA 3JSKA 2CFYA 3F8RA 3M12A 3RP8A 3UKLA 3ZYXA 4C5OA 4H2PA 1DOCA 1IUXA 4IV9A 4LU6A 3IF9A 1B5QA 1OJ9A 3P9UA 3R9UA 5KXJA 3COXA 1D7LA 2DKIA 3AE3A 1NEKA 4CBQA 2IIDA 1TDEA 2FBWA 3AECA 1BKWA 2YVFA 4NZHA 2RGOA 5FMHA 1DJQA 1PDHA 1TDKA 1JEHA 3DJGX 3ICSA 4N9XA 1K0IA 3CPJG 3II4A 1GRBA 1M64A 1NG3A 1JRXA 1PXBA 1DOEA 4C74A 2GB0A 1XDIA 2WU2A 1TYPA 3GWFA 3AE9A 3EF6A 2GVCA 1PJ5A 4H4XA 2C76A 3L1RA 2ZZBA 4HA6A 2XVJA 4PABA 4H4SA 4REKA 1GSNA 1TDNA 4EMWA 1VQWA 2WESA 2BK3A 1NG4A 1EBDA 3KLJA 4CRTA 3VR8A 3ISHA 1LJ1A 2QCUA 4HB9A 2JK6A 4FK1C 1H84A 1S3EA 4K22A 3SFEA 1F8RA 1LV0A 2XVFA 5EOWA 2VRMA 1YQ4A 1E1KA 1JRYA 4MJWA 3URHA 2C7GA 2OALA 3LADA 2H89A 4AP3A 5JCKA 4AP1A 1ZP0A 4KPRA 4AT0A 2WOVA 2BCGG 4PAAA 4YT0A 3BNUA 4YTMA 2V6OA 1O95A 1DOBA 2B9WA 4H4YA 2VVMA 4CY8A 4B68A 4OPUA 4ECHA 2E5VA 3PO7A 2GAGB 4M52A 3CN8A 4NTEA 3IWAA 1JU2A 1PBEA 2WP6A 4B63A 3G5RA 2JKCA 2Z5XA 1FL2A 4OPLA 3AEGA 1S2QA 3NN0X 5M0ZA 1ZOVA 5KOWA 1E6EA 4A5LA 4EMIA 2BYBA 3FG2P 1IUTA 2A87A 4U2TA 1JOAA 4DSHA 2BC0A 3DJJA 2X8GA 4H2NA 4TM3A 2DKHA 2WOWA 2ZZCA 4OPDA 3UKKA 3ITJA 2OLNA 1F8WA 2Q0KA 2XLSA 1H7XA 1NDAA 3CGEA 1COYA 4BK3A 1IUSA 1GALA 1H7WA 1NHSA 2GEWA 2OA1A 3AXBA 4K2XA 2JAEA 1IUWA 5M10A 3M0OA 1ZDLA 4B69A 2GMHA 3VRBA 3AE5A 3ATQA 4A6NA 5FS7A 3K7MX 3NNEA 2R4EA 1UKVG 5EBKA 2YLXA 4Z2TA 3ABVA 4JQ9A 3BI5A 3AYJA 2XVIA 4H50A 3NGCX 3CNPA 2BS4A 3AYIA 1D4DA 1GREA 1VG0A 4U8JA 4Y4LA 4H7UA 2R45A 4H4UA 4H4ZA 3AD7B 2WQYA 3CIRA 5JCIA 5C2TA 4U8OA 2V61A 4EIPA 2V3BA 2BACA 4EIQA 3AE1A 4UDRA 5TR3A 2GQFA 4KX6A 1CF3A 4C3YA 5HXIA 4FDCB 3KVEA 1GETA 3QFBA 4H4RA 3AEAA 1GRHA 3ICRA 1YQ3A 1NHQA 3IC9A 2NVKX 4J56A 1D4EA 2R0PA 1E1LA 2XFOA 1Y0PA 2WETA 2Q0LA 4U2SA 4A99A 1EL7A 4FK1A 3UTFA 2CVJA 5U63A 4Y4MA 5BUKA 3LB8A 2WOIA 2PHHA 2FJEA 1N4WA 1VRQB 3DGZA 5DBJA 5FS6A 3UTEA 4ADWA 3AEDA 1KDGA 2HQMA 1Z6LA 5FS9A 1E39A 1GRGA 2YR6A 3NYCA 4OCGA 3UOZA 1KNRA 2C65A 2GF3A 4B64A 1H81A 1GESA 4X4JA 1F6MA 1LVLA 4RG3A 2ZZ0A 3VR9A 4U2LA 1MO9A 4AOSA 3UOVA 3RP7A 1CJ4A 2YG3A 4FX9A 2VQBA 1GOSA 4USRA 3I3LA 1KSSA 1TDOA 2EQ6A 1NPXA 4Y4NA 3GMBA 2O9ZA 3DA1A 1P2EA 2VOUA 2YG4A 5U25A 3E1TA 3B6DA 3NTAA 2GR1A 1MXTA 2ARDA 1GNDA 1OJDA 4IA5A 1GERA 4JDRA 4K7ZA 3QVPA 2BXSA 3UOYA 1E1MA 1H86A 3UOXA 3LXDA 1OJAA 1Q1WA 2GR3A 4CNKA 3WE0A 4BJYA 2BK5A 4TM0A 4IVOB 3QSEA 5ER0A 2XDOA 3NIXA 1GTEA 1S2YA 1CC6A 4J36A 3BHFA 2XCGA 3DJEA 2UZZA 4D03A 2F5ZA 3K30A 3EPTA 3GMCA 3H8IA 2EQ9A 2VVLA 4Z24A 5JCNA 2YLWA 2A8XA 2V60A 4YXDA 1B4VA 2FJBA 1ELIA 4ZN0A 4H4WA 3RHAA 1EL9A 2AAQA 1FEBA 1ZK7A 4RSLA 3AEFA 2YVGA 3FIMB 2QA2A 4K8DA 3ALMA 2GMJA 3ATRA 3Q9TA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LEFA 2WDQA 1GEUA 4PQIA 3FMWA 3TRXA 3NK0X 4WETA 2RUEA 3K8NA 5J9CA 3GKKA 4NTCA 4USQA 4GCIA 3D8XA 4YQUA 5ECLB 2WU5A 2Z5YA 3ED3A 3GUSA 5B6MA 1VDCA 4Z26A 2H66A 3RHBA 3SGLA 2C73A 16GSA 4EM4A 1ZYNA 2JSZA 1O73A 2HRKA 2IMEA 3N5OA 1PSQA 4APNA 3C4AA 2VLUA 4U8PA 2MMOA 3RPPA 1GTAA 2OKAA 4FO5A 5ECQB 1PN0A 5ECMB 2IFQA 2JL4A 3QMXA 12GSA 4JU5A 1FAAA 3GWDA 2X8CA 1TK8B 1YF0A 1N1PA 1ZMDA 4TXOA 3QAWA 1NAAA 1OJTA 4NHWA 3HA9A 4DGKA 2GTUA 1WPIA 2OLOA 2B9YA 3LW9A 2H1GA 3FHKA 5F0GA 5IO2A 4YTPA 3M3MA 1DNCA 2MZCA 4YSZA 1IYHA 4DSSA 2JBVA 4JN9A 3QAGA 3KIJA 2TMDA 3BCIA 3ZZXA 2F51A 1BGJA 3ZFLA 3P1WA 1A0RP 3LYPA 4BJZA 1YY5A 1RP0A 1O94A 4O5QA 1K0JA 2XFPA 3M13A 1E6BA 4ISDA 4XS4A 4HJ2A 1XW5A 2H70A 4JEDA 4XTSA 1GL8A 2VVLG 3F8DA 1B48A 3AD8B 1FEAA 3SFDA 1ZCPA 1EEMA 4TXVA 2WDVA 1EP8A 1VRSD 4NXIA 3GX8A 5D9VA 4II2A 5BULA 1HD2A 1PBBA 4V2LA 2R0GA 1RYIA 4J31A 4ID0A 5DBQA 5BVAA 1X9WB 1M99A 3UKFA 4IP1A 1PJ7A 5G1LA 4MH2A 3FZ9A 2FJAA 2W0HA 3V3OA 4POLA 1WIKA 2DSAA 2A4HA 4MCUA 1OAZA 5IMZA 4ZB6A 4GCMA 1ZMCA 2VQ7A 4DEJA 1FG4A 4CCQA 4IVFA 4RUVA 4WX1A 4CDOA 3VWWA 4GWRA 1L0VA 2YWLA 3LWAA 4A9WA 4ZXGA 2VIMA 3P4QA 1H4OA 1B37A 5B6NA 5KMPA 4ILFA 2WP9A 1H75A 2GZYA 3VPQA 3KPFA 4HI7A 3L8KA 3GFKA 4EDYA 5ENUA 1ST9A 2GSTA 2H75A 4HZ4A 2R5GA 4C77A 1BWCA 3FEUA 1WP0A 3BCKA 3UKPA 2JB3A 1X5DA 3F3QA 2VL3A 4J34A 2M80A 2QGVA 3OR5A 4XWRA 3GDNA 1X5EA 3L78A 3GYIA 4TM1A 1G6WA 2JSYA 5EL8A 3NK2X 5FS8A 1N8JA 5KMRA 1O7UA 1K0OA 3KA7A 4TOPA 2H1BA 3AEBA 2C0FA 3UTGA 3DH9A 5GSNA 1WE0A 5INYA 4MABA 4PURA 4TR4A 4V2MA 5C3JA 4CCRA 1LTXR 2H74A 2V3AA 3EAOA 5D96A 3VLNA 5L71A 3RNMA 3NHOX 3UKAA 1Q9IA 3F3RA 3HDCA 1BF3A 1QLBA 1PGTA 2X50A 4USSA 5KMSA 1V98A 1K3LA 2E2MA 5D9TA 4GF7A 4G2EA 4K6XA 2E1MA 2GV8A 1XWCA 4H4VA 2PWJA 1GXFA 1PFOA 1CJ2A 3H1NA 3IHQA 2Y6RA 4J57A 1ERTA 2EQ8A 3D4MA 1D7YA 1QJDA 1GRTA 1VG9A 4J2WA 5CKUA 1ML6A 2VO4A 2BMXA 3KP9A 4A79A 4FH8A 2AUVA 2GZZA 3FZ5A 4ICYA 5ELGA 3GTUB 1A0FA 1M2DA 1SJ6A 2OADA 5KVHA 1BYEA 1DXLA 3GH6A 4MNNA 4EQXA 1M2BA 1TW9A 5L46A 4TRXA 2H6ZA 1XWAA 4LLRA 3NYFA 1J0FA 4X9MA 5F07A 3SM8A 5JWOB 4EE0A 3MWHA 5LV9A 2VRLA 1F8SA 3SY4A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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