5BT3A

Crystal structure of ep300 bromodomain in complex with sgc-cbp30 chemical probe
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
114
structure length
114
Chain Sequence
IFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKSPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDIWLMFNNAWLYNRKTSRVYKYCSKLSEVFEQEIDPVMQSLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Histone acetyltransferase p300
publication title Crystal structure of EP300 bromodomain in complex with a 3,5-dimethylisoxazol ligand
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 43
structure length 114
sequence length 114
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5bt3A00
5FG6A 5E9KA 1X0JA 5TB6A 5F3AA 5AMFA 4YAXA 4A9HA 5F1HA 5FG4A 4LR6A 4HXMA 2RO1A 4HXOA 3JVLA 5HENA 5EISA 4BW2A 5E3DA 5I1QA 4UITA 4QSUA 4NYXA 4TZ8A 5D3LA 2R0SA 4IR4A 5DKDA 5I89A 5CU8A 4TT4A 2YQDA 4QYDA 4UIXA 5G4SA 3LJWA 4QC1A 4A9IA 4PCEA 4C67A 4MENA 5KTXA 2I8NA 4QEVA 4MR5A 5L98A 4HXNA 3UVWA 5LUUA 4IORA 5IIDA 5DLZA 5D3NA 1EQFA 4MEOA 4QSVA 5CFWA 2D9EA 4HXKA 5CQ6A 5ENBA 5LVQA 2KTBB 5E9IA 5II1A 3Q2EA 5IGKA 3IU6A 2N9GA 2YEMA 3P1EA 5D0CA 4PY6A 5F61A 2DWWA 4NR5A 5KTWA 4A9LA 4MEQA 4ZQLA 5KHMA 5F1LA 4HXPA 2DVQA 4YK0A 5H85A 4A9EA 5C8GA 3HMFA 2RNXA 4KV1A 5IGLA 1JM4B 3QZTA 2E3KA 4PS5A 5A82A 5C7NA 5E9VA 3O34A 4UYFA 5E3GA 3U5LA 5CUGA 4X2IA 4NUCA 5F36A 2R0VA 2GRCA 2YW5A 3DWYA 3RCWA 2DVSA 4HBXA 5HJCA 5I88A 5CQAA 5KTUA 5CGPA 5CUEA 2RFJA 4YYNA 4CURA 3MULA 3P1CA 4O7EA 4XY9A 4Z93A 5CPEA 3JVMA 5FE5A 3U5PA 2YYNA 2R10A 4UYFB 5HEMA 3DAIA 3JVKA 5CS8A 5DY7A 5EGUA 4HBYA 3UW9A 5HM0A 5CUDA 4NQMA 3IU5A 4YY4A 4PTBA 5LJ2A 2I7KA 5FFVA 2RS9B 5D3JA 4QSXA 4NS5A 4QSTA 5EWHA 3FKMX 5EV9A 5EM3A 4KV4A 4F3IA 5BT5A 3MUKA 4IR6A 4LRGA 4IOQA 5HLSA 5FE6A 3UVDA 1N72A 2FSAA 3P1FA 4OGIA 4Z6IA 4YYJA 5EQ1A 4YYIA 5HQ7A 5D3PA 4QSPA 4LYWA 5CQ5A 4CUTA 5ETDA 4ALHA 5FH7A 5I7YA 5HRVA 4QBMA 5H1TA 3O35A 5AD3A 4WIVA 5CRMA 5I29A 4YATA 4O75A 4MR6A 4CLBA 4PCIA 5F60A 5JI8A 5ENCA 4YBMA 5II2A 5CUCA 4YYKA 4FLPA 5A5PA 4UYEA 4HXLA 2D82A 2WP1A 4YYDA 4LYSA 2R0YA 2DVRA 4J0SA 3TLPA 3U5NA 2L85A 5LKUA 4ZC9A 5HFRA 4YC9A 2DVVA 5LJ0A 3AADA 5J0DA 5F62A 3AQAA 4QUTA 4DONA 2WP2A 4QSRA 5H1VA 4NUDA 5EK9A 4LDFA 4A9MA 4CFKA 4HBVA 5DX4A 5TCMA 4CUPA 4HXRA 5EWCA 4QR5A 5E7DA 5EWVA 5BT4A 5HRXA 4OGJA 4IOOA 5G4RA 3U5OA 5EVAA 4TT6A 4XYAA 5DKCA 4N3WA 5DYUA 4NR4A 4O78A 5L8UA 4Z1SA 5IBNA 5HRWA 4YADA 4QC3A 4NRAA 5CY9A 5CTLA 4TU4A 4O74A 5E9MA 2L5EA 4N4GA 3LQHA 3ONIA 4O7FA 5I7XA 4O72A 4YH3A 4O71A 5A5SA 5EPRA 5CP5A 3O33A 4Q0OA 2F6NA 5DFDA 2RNYA 5HCLA 5EPBA 5I86A 5DFBA 5LKTA 5FE1A 3UV4A 5FG5A 5A83A 3Q2FA 5C87A 4PKLA 5F25A 4BW1A 4C66A 4MR3A 4QSQA 4TS8A 5C85A 4QZSA 3P1DA 3HMEA 4YH4A 5D26A 5ENIA 5CQ4A 4NR8A 5FFYA 4A9KA 5I40A 4QY4A 5EWWA 5F2PA 3U5MA 4J1PA 5COIA 5HFQA 5D7XA 4CUSA 4YBTA 3SVGA 5E73A 4BW4A 4NYWA 5IGNA 5FDZA 5L8TA 4QSSA 4NR6A 5LVRA 5F63A 5EPSA 5HQ5A 3O36A 5I83A 5D3HA 1JSPB 2MJVB 4NUEA 4TT2A 5FH6A 5K29A 5KO4A 4J3IA 4QB3A 5CQ3A 1ZS5A 4LZ2A 4YY6A 3HMHA 4A9FA 5CUAA 5BT3A 3MB3A 4XUAA 5FE0A 5E9YA 4A9NA 5A85A 5D3SA 2RI7A 5CQ8A 1WUGA 4BW3A 1E6IA 4TYLA 4WHUA 3GG3A 3ZYUA 4UYGA 5ENJA 4WHWA 4CUUA 5ETBA 3MQMA 4Q0NA 4QSWA 5DFCA 2F6JA 3U5JA 2OO1A 3QZVA 4YBSA 5FE8A 3JVJA 5DYCA 5A5QA 3QZSA 3U5KA 2YDWA 4LZRA 5DYAA 5FE4A 5ENEA 3LQIA 5L97A 2OSSA 4A9JA 4QEWA 4UIUA 4OUFA 5EI4A 5A81A 4QEUA 5JWMA 5DW1A 5AD2A 5FBXA 5DBMA 4O7AA 4YABA 4XUBA 5E74A 3I3JA 4TTEA 4NRBA 5FH8A 4N4FA 3G0LA 5E9LA 5C4QA 4RVRA 5DYXA 3G0JA 4QR3A 4XY8A 4MEPA 4BJXA 4UYDA 5A5RA 4N4IA 4J0RA 5CUBA 4NRCA 5LKZA 2L84A 5LJ1A 3SVFA 5A7CA 4LZSA 4Z1QA 4O76A 2H60A 4NXJA 5ENFA 5L96A 4Z6HA 3UV2A 2YEKA 4NR9A 4ALGA 5DKHA 4Y03A 4YYHA 1WUMA 5EP7A 2E7NA 3MB4A 4CUQA 5ENGA 4HBWA 3D7CA 4LYIA 5C89A 4O7BA 4KCXA 5L99A 5EU1A 4BHWA 4LC2A 5AMEA 3P5OA 5EICA 4IR5A 4GPJA 4QNSA 5A5OA 4NR7A 5KU3A 3S92A 3UVYA 4IR3A 4UIZA 5F5ZA 5IG6A 5HQ6A 5I80A 4TQNA 4QYLA 4UYHA 5EWDA 4CL9A 3K2JA 4A9OA 4CFLA 4UIVA 5IGMA 1F68A 5HELA 2OUOA 5CQTA 4TZ2A 5D25A 3O37A 5ACYA 3S91A 5LKXA 5CZGA 5FB0A 2YELA 4HXSA 5D24A 4ZW1A 3SVHA 4N4HA 5H1UA 3UV5A 5D3RA 2LSPB 4NYVA 5ENHA 5FE7A 2E7OA 4E96A 3UVXA 4MR4A 2RNWA 4QR4A 2DATA 5EA1A 4O77A 3NXBA 5FE3A 4O7CA 4YYMA 5D3TA 3LQJA 3LXJA 4QUUA 5FB1A 5DLXA 2NXBA 4AKNA 2G4AA 4NQNA 5E0RA 4UIWA 3MXFA 4UIYA 5FFWA 4O70A 5A5NA 5FE2A 5FE9A 2DKWA 5DW2A 5CRZA 4YYGA 4TU6A 5CQ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FG6A 5E9KA 1X0JA 5TB6A 5F3AA 3ERRA 5AMFA 4YAXA 4A9HA 5F1HA 5FG4A 4LR6A 4HXMA 2RO1A 4HXOA 3JVLA 5HENA 5EISA 4BW2A 5E3DA 5I1QA 4UITA 4QSUA 4NYXA 4TZ8A 5D3LA 2R0SA 4IR4A 5DKDA 5I89A 5CU8A 4TT4A 2YQDA 4QYDA 4UIXA 5G4SA 3LJWA 4QC1A 4A9IA 4PCEA 4C67A 4MENA 5KTXA 2I8NA 4QEVA 4MR5A 5L98A 4HXNA 3UVWA 5LUUA 4IORA 5IIDA 5DLZA 5D3NA 1EQFA 4MEOA 4QSVA 2EJNA 5CFWA 2D9EA 4HXKA 5CQ6A 5ENBA 5LVQA 2KTBB 5E9IA 5II1A 3Q2EA 5IGKA 3IU6A 2N9GA 2YEMA 3P1EA 5D0CA 4PY6A 5F61A 2DWWA 4NR5A 5KTWA 4A9LA 4MEQA 4ZQLA 5KHMA 5F1LA 4HXPA 2DVQA 4YK0A 5H85A 3D1DA 4A9EA 5C8GA 3HMFA 2RNXA 4KV1A 5IGLA 1JM4B 3QZTA 2E3KA 4PS5A 5A82A 5C7NA 5E9VA 3O34A 4UYFA 5E3GA 3U5LA 5CUGA 4X2IA 4NUCA 5F36A 2R0VA 2GRCA 2YW5A 3DWYA 3RCWA 2DVSA 4HBXA 5HJCA 1ZKRA 5I88A 5CQAA 5KTUA 5CGPA 5CUEA 2RFJA 4YYNA 4CURA 3MULA 3P1CA 4O7EA 4XY9A 4Z93A 5CPEA 3JVMA 5FE5A 3U5PA 2YYNA 2R10A 4UYFB 5HEMA 3DAIA 3JVKA 5CS8A 5DY7A 5EGUA 4HBYA 3UW9A 5HM0A 5CUDA 4NQMA 3IU5A 4YY4A 4PTBA 5LJ2A 2I7KA 5FFVA 2RS9B 5D3JA 4QSXA 4NS5A 4QSTA 5EWHA 3FKMX 5EV9A 5EM3A 4KV4A 4F3IA 5BT5A 3MUKA 4IR6A 4LRGA 4IOQA 5HLSA 5FE6A 3UVDA 1N72A 2FSAA 3P1FA 4OGIA 4Z6IA 4YYJA 5EQ1A 4YYIA 5HQ7A 5D3PA 4QSPA 4LYWA 5CQ5A 4CUTA 5ETDA 4ALHA 5FH7A 5I7YA 5HRVA 4QBMA 5H1TA 3O35A 5AD3A 4WIVA 5CRMA 5I29A 4YATA 4O75A 4MR6A 4CLBA 4PCIA 5F60A 5JI8A 5ENCA 4YBMA 5II2A 5CUCA 4YYKA 4FLPA 5A5PA 4UYEA 4HXLA 2D82A 2WP1A 4YYDA 4LYSA 2R0YA 2DVRA 4J0SA 3TLPA 3U5NA 2L85A 5LKUA 4ZC9A 5HFRA 3VKHA 4YC9A 2DVVA 5LJ0A 3AADA 5J0DA 5F62A 3AQAA 4QUTA 4DONA 2WP2A 4QSRA 5H1VA 4NUDA 5EK9A 4LDFA 4A9MA 4CFKA 4AKHA 4HBVA 5DX4A 5TCMA 4CUPA 4HXRA 5EWCA 4QR5A 5E7DA 5EWVA 5BT4A 5HRXA 4OGJA 4IOOA 5G4RA 3U5OA 5EVAA 4TT6A 4XYAA 5DKCA 4N3WA 5DYUA 4NR4A 4O78A 5L8UA 4AI6A 4Z1SA 5IBNA 5HRWA 4YADA 4QC3A 4NRAA 5CY9A 5CTLA 4TU4A 4O74A 5E9MA 2L5EA 4N4GA 3LQHA 3ONIA 4O7FA 5I7XA 4O72A 4YH3A 4O71A 5A5SA 5EPRA 5CP5A 3O33A 3VKGA 4Q0OA 2F6NA 5DFDA 2RNYA 5HCLA 5EPBA 5I86A 5DFBA 5LKTA 5FE1A 3UV4A 5FG5A 5A83A 3Q2FA 5C87A 4PKLA 5F25A 4BW1A 4C66A 4MR3A 4QSQA 4TS8A 5C85A 4QZSA 3P1DA 3HMEA 4YH4A 5D26A 5ENIA 5CQ4A 4NR8A 5FFYA 4A9KA 5I40A 4QY4A 5EWWA 5F2PA 3U5MA 4J1PA 5COIA 5HFQA 5D7XA 4CUSA 4YBTA 3SVGA 5E73A 4BW4A 4NYWA 5IGNA 5FDZA 5L8TA 4QSSA 4NR6A 5LVRA 5F63A 5EPSA 5HQ5A 3O36A 5I83A 5D3HA 1JSPB 2MJVB 4NUEA 4TT2A 5FH6A 5K29A 4AKGA 5KO4A 4J3IA 4QB3A 5CQ3A 1ZS5A 4LZ2A 4YY6A 3HMHA 4A9FA 5CUAA 5BT3A 3MB3A 4XUAA 5FE0A 5E9YA 4A9NA 5A85A 5D3SA 2RI7A 5CQ8A 1WUGA 4BW3A 1E6IA 4TYLA 4WHUA 3GG3A 3ZYUA 4UYGA 5ENJA 4WHWA 4CUUA 5ETBA 3MQMA 4Q0NA 4QSWA 5DFCA 2F6JA 3U5JA 2OO1A 3QZVA 4YBSA 5FE8A 3JVJA 5DYCA 5A5QA 3QZSA 3U5KA 2YDWA 4LZRA 5DYAA 5FE4A 5ENEA 3LQIA 5L97A 2OSSA 4A9JA 4QEWA 4UIUA 4OUFA 5EI4A 5A81A 4QEUA 5JWMA 5DW1A 5AD2A 5FBXA 5DBMA 4O7AA 4YABA 4XUBA 5E74A 3I3JA 4TTEA 4NRBA 5FH8A 4N4FA 3G0LA 5E9LA 5C4QA 4RVRA 5DYXA 3G0JA 4QR3A 4XY8A 4MEPA 4BJXA 4UYDA 5A5RA 4N4IA 1PUOA 4J0RA 5CUBA 4NRCA 5LKZA 2L84A 5LJ1A 3SVFA 5A7CA 4LZSA 4Z1QA 4O76A 2H60A 4NXJA 5ENFA 5L96A 4Z6HA 3UV2A 2YEKA 4NR9A 4ALGA 5DKHA 4Y03A 4YYHA 1WUMA 5EP7A 2E7NA 3MB4A 4CUQA 5ENGA 4HBWA 3D7CA 4LYIA 5C89A 3D1BA 4O7BA 4KCXA 5L99A 5EU1A 4BHWA 4LC2A 5AMEA 3P5OA 5EICA 4IR5A 4GPJA 4QNSA 5A5OA 4NR7A 5KU3A 3S92A 3UVYA 4IR3A 4UIZA 5F5ZA 5IG6A 5HQ6A 5I80A 4TQNA 4QYLA 4UYHA 5EWDA 4CL9A 3K2JA 4A9OA 4CFLA 4UIVA 5IGMA 1F68A 5HELA 2OUOA 5CQTA 4TZ2A 5D25A 3O37A 5ACYA 3S91A 5LKXA 5CZGA 5FB0A 4AKIA 2YELA 4HXSA 5D24A 4ZW1A 3SVHA 4N4HA 5H1UA 3UV5A 5D3RA 2LSPB 4NYVA 5ENHA 5FE7A 2E7OA 4E96A 3UVXA 4MR4A 2RNWA 4QR4A 2DATA 5EA1A 4O77A 3NXBA 5FE3A 4O7CA 4YYMA 5D3TA 3LQJA 3LXJA 4QUUA 5FB1A 5DLXA 2NXBA 4AKNA 2G4AA 4NQNA 5E0RA 4UIWA 3MXFA 4UIYA 5FFWA 4O70A 5A5NA 5FE2A 5FE9A 2DKWA 5DW2A 5CRZA 4YYGA 4TU6A 5CQ7A
chains in the Genus database with same CATH topology
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