5BUUA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (l483y-n754s) in complex with glutamate and bpam-321 at 2.07 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Synthesis and Pharmacology of Mono-, Di-, and Trialkyl-Substituted 7-Chloro-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-Dioxides Combined with X-ray Structure Analysis to Understand the Unexpected Structure-Activity Relationship at AMPA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 82
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-06-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5buuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5buuA02
2QS2A 2VOZA 5AA2D 3K00A 3RT8A 2UYEA 4LQ2A 4R9GA 4XKPA 1Y3NA 5B7DA 2RF1A 3BBRA 2O84X 1LFGA 1B05A 2D3IA 4TQUQ 4OWDA 2O6AA 1Z7ME 4XTCQ 2R9JA 3CFXA 3IR1A 4QF9A 1Q1KA 4DXBA 4O3CA 2GH9A 4OHNA 1POTA 3TZAA 2O1LA 3MPLA 1BTJA 5AA2A 5FHNA 3IJOB 4R75A 1DMBA 3U72A 5L9MA 2PVUA 1POY1 2OK2A 3DELB 3E9XA 1MQIA 2XD3A 3F11A 3WAFA 1SD3A 4G68B 2QJEA 5KDTB 3PMWA 3KBRA 2A5SA 4C1TA 5DEXB 1CE2A 2DSFA 3FXUA 4KFQA 2IEEA 4GXSB 3VVFA 4OYVA 3H7MA 3KJTA 4WEPA 1USYH 1FTJA 4JXIA 4EF2A 3SEYA 1M5EA 5DVIA 3W9VA 1P1UA 3U94A 3KOSA 2Z8FA 2ZNSA 2F6GA 4R73A 4IO6A 1AIVA 3FZVA 3H6WA 5FHOA 1EU8A 3W9WA 4GVOA 1Y1MA 4R9FA 1B3HA 3FV2A 1NKXA 1WODA 5CM6A 3LSLA 4EF1A 3EQ1A 1Q35A 1UQWA 3MAMA 1MPDA 5I2NA 4HW8A 4YMAA 3MBPA 1FTOA 5FHMA 4BDNA 2OZZA 2XXIA 3SERA 1MPCA 3D4GA 5CMBA 2I58A 2ZMBA 1ANFA 3DP8A 4NWDA 3FJMA 3OEKA 5BUUA 3B7DA 4GIZA 1NNKA 1NNTA 3SEVA 3S2VA 2XXXA 3M8UA 4FIMA 3ECRA 4ZE9A 4P0GA 5HPQA 1M5FA 3MC2A 3ZSFA 2R71A 3OELA 1S9TA 2GHAA 2XXVA 4KD5A 5TP9A 1Y4CA 1MXUA 2PX1A 4BDOA 4PFUA 1FCKA 2Q9TA 3HV1A 2XD2A 4DLDA 4KI0E 4DCXA 2KLFA 3H03A 2GHBA 4IGTA 2O69A 4LZ5A 1NMUA 3W15C 4RXLA 5A5XB 2H9BA 1IXCA 1MXWA 1IUDA 4F39A 3DP6A 1B3EA 4ZZAA 2NVUB 4F22A 3CRBA 2F78A 3USDA 1JVXA 1NFTA 2R6GE 3SKPA 5ITOA 4Q5TA 3G3HA 1B51A 3ILUB 4I9DA 5I84A 3N5LA 1OMPA 4AB6A 1URGA 3OO6A 3G3IA 3GXAA 5CMKA 1LGBC 3TTMA 5B70A 4IGRA 4BDQA 3H6TA 3DM0A 4JBZA 2ZNUA 1EZ9A 3QIMA 3I5OA 3S9NC 5KCJA 1VFEA 4PQJA 2NOOA 3LSXA 1D3KA 4OTEA 4YKIA 4U2RA 3RT6B 3TTNA 1PEBA 3RQTA 2I6EA 2ALUA 3JV9A 4OQOA 4MH5A 3U1OA 4NF6B 4RPNA 4OETA 1B3FA 4M1VA 4YAHX 2XXHA 2W7YA 1B1HA 1S7YA 3MP1A 4GD5A 4G8NA 1HSJA 3FJ7A 5CBSA 4KPTA 2PBWA 5KZTA 2V25A 4F2QA 1DPEA 1Y20A 2THIA 2VP1A 3IB1A 4GLIA 2QS1A 5AA4B 1GVCA 2UYFA 4LZ7A 4X1DA 4R6KA 4GWOA 3RUMA 3KEIA 2I3VA 4IY5A 5JEIA 3R26A 4FE8A 2Q2CA 3H06B 1LAXA 3FUZA 5I56A 1Y3QA 3ONMA 3CG1A 4ZZEA 4BDLA 5HBCA 1P1NA 1SBPA 4X1BA 1QW0A 1MY0A 3PUVE 1PDAA 4IO2A 4XKRA 4F31B 1B0LA 1XVYA 5HM4B 1ELJA 2H25A 3TODA 1B7UA 1LAGE 3L6HA 4FEBA 2I0CA 4JSOA 4DXCA 1MXVA 1URDA 5H8HA 1F9BA 3CVGA 4O3BA 1TT1A 1YCJA 1T0KA 4NWCA 3D4CA 1A99A 4GRKA 4PFWA 3MUQA 4EXLA 4OEUA 2G93A 5F7VA 4BDMA 5IKBA 3N26A 4G2ZA 2LAOA 4P0IA 4MLVA 4NF8A 1IXGA 3G3GA 3K6XA 1R9LA 5EHSA 4H65A 3UK4A 3C33A 3UIFA 5ICQA 2DWAA 5EHMA 3L6GA 2I4BA 2RCAA 4F1UA 3H4ZA 1IZ1A 2V3TA 3PV0E 4KYEA 4DXUA 4G77A 2XXTA 2A5TA 3PU5A 3B6WA 4PFYA 2RCBA 2V84A 2NXOA 2DWJA 5I56B 3HPIA 4I62A 5I2KB 1MXYA 3PD9A 2DP8A 2F36A 1IXHA 4YKKA 1BLFA 1FQFA 2HZKA 4HS7A 5I58A 3QYTA 3N94A 1DPPA 2I0BA 3CIJA 3UORA 3ZS6A 1MXZA 3IORA 2VD2A 2QS3A 3LBSA 1MM7A 1Y9UA 5I57A 3EHSA 3IB0A 1SVXB 1ZJLA 1B58A 1WDNA 1FQBA 4NMYA 2HAVA 3TTKA 1PBPA 3EPEA 1N3XA 4WEDA 3PMVA 5JTYA 5TU0A 4OERA 4QRZA 2XXPA 5IAIA 2Q2AA 4DIGA 4LONB 2DYXA 1MXXA 2CZLA 1B7HA 4NF8B 3JYRA 1BP5A 4LP2B 2P1SA 1P1OA 1HSEA 3VFJA 1H43A 4F1YA 1UTBA 3DP4A 3HCQA 1UIUA 4C0RA 1FQAA 1NL5A 1SW5A 3HO7A 4N13A 1MRPA 1H76A 4N07A 4UA8A 1ZIUA 1TFAA 3O29A 4Z0IA 5TPAA 4QFOA 4R2BA 5H8QB 1JW1A 3OO9A 3TAJA 3B6TA 1LB8A 4Q8RA 4JB7A 1I6BA 4DDDA 1S50A 2RKMA 2UVHA 5K2XA 1SI1A 2V3UA 2DE4A 4EUOA 4YICA 4POXA 5CI5A 2P2AA 4DZ1A 3PMXA 4OXVA 1DTZA 2NUVA 1XT8A 1D4NA 1LCTA 3LUYA 2ONSA 3OO8A 2O68A 2F8DA 4NF5A 4AQ4A 4OFOA 3VLWA 3MWBA 3PUYE 1O63A 4EQ9A 4F3BA 1HSLA 2DXYA 1I69A 4RK9A 3T93B 4QSDA 1LLSA 4OZ9A 1QUKA 2AIXA 2F7BA 5DYHA 3H3GA 3MVZA 1SYIA 3KN3A 1US5A 2NWJA 5CMCA 5BWJA 3MVXA 2Y7KA 1PB8A 2DQVA 5AA2B 3OSQA 2YPNA 1DSNA 1LCFA 4F19A 2FNCA 1N7XA 4QFLA 2I49A 3KGCA 2DS9A 1LSTA 3UGWA 2OBGA 3MP8A 4IO3A 3G3JA 2DOJA 4F3SA 2ZYMA 3IX1A 3MQ9A 1XOCA 3FXQA 4U1OA 2AL4A 2QRYA 1JW4A 3O6GA 2QMXA 1NNFA 1GTKA 2Q8JA 1AH5A 3QUJA 1N7WA 3OO7A 1RKMA 5H8NA 1VSOA 4F29A 1A40A 5L9OA 1CB6A 4ESXA 1LAHE 1D9VA 1D9YA 1B52A 3E3KA 2DE2A 4YU0A 1VR5A 3V8XB 3FD3A 5F1QA 2VHAA 3IOTA 5L8DA 4HTGA 1B3LA 2UVJA 2RC9A 4ZS9A 2H5YA 3UA8A 4DE8A 3LR1A 1H3DA 4KQPA 3QXMA 1NNPA 3TCHA 3I3VA 4NE4A 1ZMGA 4YZZA 1VFDA 3QSLA 3IB2A 1JEUA 1P1QA 4ECFA 4TLLB 2E1SA 3GBAA 1QUJA 3G3FA 4NF4A 1SDXA 5CC2A 4R2FA 1B9JA 5I2NB 3KN8A 1B46A 1I6AA 2QL3A 2B3FA 5ITPA 3B6QA 4MLQA 3MVWA 5DTBA 1PBQA 4ZDMA 2O1MA 4LATA 1R1NA 4MBPA 3HHGA 5JK4A 1OVTA 4IO4A 4WXJA 1DTGA 3AXFA 4G4PA 4BDRA 3PPQA 3VXCA 1ZTYA 2ZYNA 3C4MA 1NH7A 2ESNA 3VDFA 3O6IA 3O66A 1A8EA 5H8NB 1A55A 1MY1A 4RPOA 2O7IA 3OD7A 2Z23A 4I8CA 4HCWA 1N0TA 5TP9B 3PPPA 2HEUA 4JWYA 3IO4A 1MQHA 2BJJX 3RTFB 4N6PA 3TTLA 3KSXA 3O97A 4ONYA 4FAJA 3EN3A 3MZ9A 3TEPA 3PPNA 1MY2A 2UVGA 3V5AA 1PB9A 4G8HA 2FYIA 4NF4B 1MPBA 1QULA 3VLVA 1EZOA 4KCCA 5ICTA 1GGGA 3SEXA 3QUFA 1EZPA 2ONKE 1GV8A 3OEMA 3TCGA 4THIA 3MW0A 3CG3A 3TQWA 5CRYA 3ODBA 1LBBA 2QMWA 4YKJA 1MDP1 3FVNA 4FECA 1B40A 3VXBA 2F35A 3GZGA 4POWA 2HZLA 2E0SA 5KCJB 2ZYKA 3RGYA 3RNNA 4RK2A 1M5CA 1IIWA 4GF8A 3FJGA 2F7CA 3MZ1A 3DLNA 4Q30B 4H6DA 4PETA 4PP0A 4LZ8A 2GRVA 1RYOA 3KG2A 4RY1A 2O51A 1WVJA 3MPKA 4OFJA 2H99A 1Y1ZA 1MS7A 3E13X 4H0WA 4PFTA 3T22A 4F3PA 4RA1A 1OLCA 4ELPA 5M2VA 3IJXB 5CMMA 2XHDA 3RN8A 1UTHA 3JZJA 1LBCA 3O9PA 2Y7PA 4OFLA 1N76A 3TKDA 4GL0A 3RY3A 3K6UA 1YPNA 4E0WA 1R9QA 1EH3A 1OVBA 3OSRA 4ZEDA 4TLMB 5LOMA 2YLNA 1B2HA 3KSJA 3Q29A 1IQ7A 4G68C 1AMFA 4JWOA 2HCAA 3N6TA 4JWXA 2AYSA 4YB5A 4ZEIA 3M3KA 3CFZA 3K4UA 3RTWB 1BKAA 3PUXE 1B4ZA 1JW5A 1R6ZA 2WKYA 3H6UA 3TQLA 3FV1A 1MH3A 4ZEBA 5AE4A 3FGSA 4X48A 2HAUA 5EYFA 3SESA 3MP6A 4F2OA 3FVKA 2CMOA 4QHQA 4G8MA 2F7AA 4FJPA 4GFRA 5I59A 3C32A 4G68A 1FQEA 1H44A 4M4GA 1JQFA 1MDQA 2Z8DA 4KYDA 5J1DA 1SQYA 3GLBA 5H8HB 5DEXA 1M5DA 2B65A 2P0SA 1A8FA 3O6HA 5ISUA 4EQBA 2OCUA 4QFPA 2I4CA 4FEDA 4H5FA 2QSXA 2XXYA 1N3WA 3CSBA 1IXIA 3K02A 2DVZA 2OWSA 1LFIA 3T66A 1UTHB 1OIBA 1NH8A 4EQ7A 3CSGA 2F34A 2OWTA 4EXKA 4OEVA 2V93A 5AA1A 4ELQA 3EHTA 3U8QA 4QFKA 3MJNA 2Y84A 3TUSA 5L9SA 3OXNA 2ONRA 2XX9A 4YB7A 2A5TB 1SI0A 2OJTA 3K1MA 3CFLA 1B5HA 4IB2A 2F5XA 2RC8A 4TOZA 4LQ5A 1A7LA 3IL1B 4GXAA 2YJPA 3UP9A 4H8JA 2Q88A 2DVCA 2ANJA 4ESWA 2F97A 5I58B 3IK6B 5I59B 2M8CA 1USYE 2H4IA 1XHYA 3EF7A 3TFLA 3RPWA 5I57B 2Z8EA 4R6YA 4R72A 1J1NA 4LVQA 2H98A 3KN7A 3K6VA 3C31A 4YKPA 4MF3A 3TTRA 1MH4A 1JEVA 1MQGA 5JTYB 3KFMA 1URSA 2Q89A 1B4HA 3KOTA 2GFEA 3TPAA 3PUWE 2XXUA 5DT6A 4YMBA 1XC1A 1Z7NE 1UTBB 1L5TA 3M3LA 4K3FA 2XX7A 5A5XA 2PT2A 2AL5A 4OESA 2REJA 3FATA 3V83A 3HSTA 3Q28A 2X7QA 3PGFA 1JNFA 3ILTB 3QK6A 1UIVA 5TPAB 3IAZA 3IOUA 4F18A 4BLAA 3U93A 2ZYOA 2PMSA 3Q25A 1QKBA 3OOAA 1SW1A 4H5GA 3A3UA 1MG1A 1YTVA 4ELOA 2HQ0A 4R6HA 3IOWA 4OENA 3EHUA 3FIRA 3TELA 3MZBA 3BFUA 5DVFA 3G3KA 3RLFE 2QPQA 4NTLA 3Q27A 3PD8A 4ZEKA 3PPRA 5FTHA 4NF5B 4DCYA 1XVXA 3PPOA 4P11A 4EDPA 1B0HA 3T9UA 2D5WA 3WAEA 1O7TA 3V89B 3BKIB 2PYYA 4U21A 1US4A 2VGQA 2G29A 1LAFE 2Y7IA 4NF6A 4F3GA 1SW2A 2Z22A 3VV5A 3HHFA 4X9TA 4RJZA 3S4UA 3T9VA 1ZLQA 1MQJA 3TDJA 4IO5A 3LC8A 4JSDA 1MY3A 1MY4A 5DVJA 3R6UA 5ELVA 3I6VA 1B32A 1FTKA 4H8IA 4GOTA 3K6WA 1N84A 1OQGA 4QFNA 5AA4A 3K01A 3E4RA 2I48A 3GBBA 1B5IA 2Y7RA 3FVOA 3N6UA 1PB7A 1SYHA 3THIA 3VE1B 1QJMA 2DWHA 3KZGA 3LSWA 4Z7EA 2XXQA 3QAXA 3R7XA 2IA4A 4KR5A 3O2AA 2DWIA 2RC7A 1MQDA 3LSFB 4KYSA 4FATA 3TMGA 3PUZE 4LUBA 1MM6A 4I1DA 3T96B 3C9HA 3FVGA 4XXUA 4MFIA 4U22A 4H67A 4Q0CA 1H45A 3UN6A 2DXRA 2HFBA 3CI8A 3U92A 3G7WA 4JDFA 3CR9A 3OMBA 2FA7A 4L17A 2ABHA 4U1ZA 3IOVA 3O28A 4ZE8A 1GR2A 3H6VA 4PE5B 1O64A 1AOVA 2OLBA 5H8SA 1B1XA 1FTMA 4LA9A 1P1WA 4E0XA 1B3GA 1FW0A 1I6QA 4QSEA 3VVDA 4ELRA 1A54A 1VE4A 2REGA 3S9MC 1YAEA 1FTLA 4U4XA 1XS5A 4IY6A 1TFDA 3C36A 3S9LC 4KHZE 3A3CA 4UACA 1LFHA 2F6PA 4RNSA 4H1XA 2I3WA 3IO6A 4IO7A 4ISUA 2X7PA 1B6HA 1FQDA 1N04A 4OMBA 1QKAA 1ZKBA 1TWYA 4FORA 2UXAA 5CBRA 3K1NA 3FASA 5I2KA 1M5BA 3BFTA 5H8FA 3OENA 2HXWA 1AL3A 4ZECA 1LB9A 1DOTA 1FQCA 1ZU0A 1OLAA 3SETA 2V3QA 3K2DA 3M3FA 3TCFA 1B7ZA 4F1VA 1IEJA 1JETA 3KJ7A 2VD3A 3C34A 4NEDA 4RYAA 2D21A 3SEUA 4C1UA 3T9XB 3MVYA 4ZEFA 1BIYA 2B3BA 4HCYA 4QSCA 4YB6A 4XKQA 1P99A 2RINA 3K0VA 3SDFA 2Y7WA 3A09A 1Y4TA 4U23A 1B5JA 1QUIA 1TXFA 3VVEA 4XKNA 4OVJA 3ZKKA 4R74A 1IITA 3T9HB 2O7UA 4KCDA 4XIGQ 5AA3A 4AB5A 1SW4A 1ATGA 1QVSA 2UVIA 3FXRA 2XXRA 4GQOA 2XXWA 3SEWA 1KWHA 1II5A 1Y3PA 2XX8A 3P7IA 4GL8A 3VLUA 1OQHA 5K2YA 1PC3A 1JVYA 2ZNTA 2ZXTA 5H8QA 1ZBMA 4ND9A 5H8FB 2X26A 5KDTA 2DE3A 4O3AA 3Q26A 1RYXA 5FTIA 3C35A 2PT1A 3S9EA 3TYHA 2QS4A 3HN0A 3ZKLA 4U4SA 3K1PA 4WKMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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