5BUUA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (l483y-n754s) in complex with glutamate and bpam-321 at 2.07 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Synthesis and Pharmacology of Mono-, Di-, and Trialkyl-Substituted 7-Chloro-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-Dioxides Combined with X-ray Structure Analysis to Understand the Unexpected Structure-Activity Relationship at AMPA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
total genus 82
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-06-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5buuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5buuA02
4RPOA 5J1DA 1TXFA 2VGQA 4XXUA 1HSJA 1EZ9A 2GH9A 1IUDA 3FJGA 5L8DA 1QULA 4P11A 4R9FA 1PDAA 3K02A 2UVHA 4GLIA 4I8CA 4YB5A 2V3TA 2ZMBA 2ABHA 3EF7A 4HCYA 3A3CA 4ZDMA 1O64A 3LSLA 3T66A 3N94A 1SW5A 2X7QA 3I3VA 4OZ9A 2AIXA 1S9TA 1NL5A 2RKMA 1USYH 2I58A 3IK6B 4G2ZA 4JXIA 4OHNA 3KOTA 4PFWA 3K1NA 3VVEA 2AL5A 5CI5A 3N5LA 4DE8A 2RF1A 1FTJA 4KD5A 1ZLQA 1OMPA 1MY1A 4IY6A 2XX8A 3U1OA 4OVJA 4EF1A 4M1VA 1BLFA 4QFPA 4LONB 4EQBA 4YMAA 3S2VA 4RK2A 4LQ5A 1ZIUA 5H8HA 4GD5A 4WXJA 3EN3A 4NF5B 3LR1A 3EHSA 3I5OA 2WKYA 5TP9A 1ZJLA 5A5XA 4OXVA 1LCTA 4MFIA 2B3FA 1LB9A 4DXCA 2AL4A 1JNFA 3B6WA 3QYTA 4PFTA 4PE5B 1A8EA 1MQIA 3ILUB 1FQCA 4QFOA 2YLNA 2ONSA 5M2VA 1II5A 3IB2A 5DT6A 2QMXA 3MZ1A 3Q27A 4JWOA 4ND9A 1NH8A 1B51A 3OENA 3T9UA 3QIMA 3MPLA 1BTJA 2UVJA 3O6GA 1LAXA 3SERA 2GFEA 4YKIA 4GL0A 2QSXA 3PPRA 1R1NA 4OENA 4JSDA 3G3JA 4YICA 2VD2A 3PPNA 1UIUA 1FQDA 2HXWA 2DXRA 3UN6A 3VV5A 4G68B 1EH3A 3HV1A 3MP6A 2QS4A 2CZLA 3ZKLA 5DVFA 5CBSA 1GTKA 3VLVA 2VHAA 4NF4B 3TMGA 1MRPA 1NNKA 2O51A 3SKPA 3TTLA 5H8HB 2F36A 3MVXA 3M8UA 2Q8JA 1B7HA 3HO7A 1B3HA 3H6WA 3G3IA 3VFJA 3VVFA 4DXUA 2P0SA 4TLMB 2F7CA 3OEKA 4H67A 1S7YA 3T22A 3KN3A 1USYE 1XS5A 3TQLA 4TQUQ 1Y3NA 2Q89A 4FE8A 3TQWA 2XXVA 3K6VA 5I57B 3SETA 3KG2A 2OBGA 3K6WA 4YAHX 4EQ7A 3Q28A 5AE4A 3CRBA 3GLBA 2QS2A 3KZGA 3PD8A 4NF8A 4POWA 1ATGA 1UTBB 2DVCA 4JWXA 3RNNA 1H76A 5AA2D 2NVUB 1MQJA 1B40A 4ONYA 3FVOA 4U22A 3FJ7A 4LZ8A 2UXAA 2Z8DA 2I0CA 2FYIA 4ZEIA 4Z7EA 5BUUA 1B4HA 2Q2AA 3IOVA 3MP1A 1GR2A 2VP1A 1POTA 1MY2A 5FTIA 1CB6A 4ISUA 4ZS9A 5TPAB 4QFKA 3SEVA 4YB6A 3A3UA 3IORA 4G8MA 4GIZA 3H6TA 2DWIA 4HS7A 4C1UA 2R71A 3VDFA 2B3BA 5ITPA 2W7YA 2RCBA 3SEYA 2HZKA 2QMWA 5KCJB 1M5CA 2HEUA 1B58A 4BDRA 3MP8A 1UTHB 3FXRA 3UP9A 4KYSA 3TTNA 3K01A 3RUMA 3MVYA 2OWTA 1P1OA 5CC2A 4FORA 1QVSA 1WVJA 4TOZA 4RJZA 1EZPA 3H6UA 4RY1A 2F97A 2H99A 4OFJA 4F1VA 2A5TA 4ZZEA 4OFOA 1KWHA 3MVZA 1Y4TA 1MPBA 3UK4A 4BDLA 3OOAA 5I2NB 2Z8FA 2GHAA 5JK4A 3TUSA 4ZECA 3K1PA 3OO7A 4FIMA 2AYSA 1PB9A 2VOZA 5DYHA 1IZ1A 3OEMA 2XXRA 5EYFA 3TCHA 2O84X 3QUFA 4GXAA 4LATA 4FJPA 5ELVA 1OLCA 3C36A 3S9MC 1OVBA 2H98A 1AIVA 2DYXA 3ODBA 5HBCA 1B5JA 2G29A 2DQVA 3BFUA 3THIA 4AQ4A 1Y3PA 2RC8A 4EUOA 4ZEDA 5HPQA 1M5DA 4OEUA 5CMCA 1IEJA 1B5IA 4R72A 3T9HB 3TYHA 1Y3QA 4TLLB 2V25A 4XKQA 2ZNSA 3HSTA 3N26A 4X9TA 4NTLA 4ZEKA 2I3VA 4XIGQ 1BP5A 4GOTA 4AB5A 3OELA 2H4IA 4OERA 1B0LA 1Q1KA 3FJMA 1MDP1 1WDNA 3PPOA 3FVGA 3O6HA 4NEDA 5L9OA 3GBAA 4OYVA 2Z8EA 4R6HA 5AA2B 3BKIB 3S4UA 5CMKA 1B1XA 3SEWA 2Q2CA 2E1SA 4KPTA 3IJOB 4KI0E 1N0TA 2X26A 3PGFA 1JEVA 1DOTA 1JVYA 4EXLA 3BFTA 2KLFA 4FECA 4EXKA 4DDDA 2HZLA 1FTKA 3QSLA 4H0WA 1N7XA 2QRYA 4R6KA 4XTCQ 4PP0A 4PFUA 2O7UA 4U1ZA 3TCFA 4THIA 1IXHA 1P1UA 1A8FA 1T0KA 3FXQA 3MBPA 1F9BA 3MJNA 2H9BA 2XXXA 1MY3A 4KHZE 3EPEA 3G7WA 1QJMA 2I6EA 3M3KA 4OEVA 4EF2A 3K0VA 1S50A 2F7AA 2RC7A 1PB7A 3MUQA 1PEBA 3O97A 1D9VA 2Y7RA 2NXOA 3TFLA 5AA2A 5I56A 1Y9UA 3M3LA 3O6IA 2V93A 5K2YA 3RT8A 3W15C 3VLWA 1LB8A 5H8SA 3U72A 1B32A 2XX9A 5BWJA 3QK6A 5H8FB 4DCXA 3GZGA 5JTYA 5CRYA 4GVOA 3C4MA 2OLBA 4LA9A 1A7LA 1NNFA 2UYEA 2F5XA 1NFTA 3O9PA 3PD9A 3RTFB 4G8HA 4ESXA 4YKKA 3C32A 1DPPA 1LAHE 1MXUA 2XXIA 3E4RA 1NNTA 3LUYA 1N3XA 3B7DA 4F18A 4MF3A 2V3QA 1MPCA 3OO6A 3TTKA 3IO4A 2REGA 3Q29A 1XHYA 2DE2A 4QRZA 2ZYKA 1B2HA 1RKMA 2R9JA 1JVXA 1JETA 4XKNA 3QXMA 4Q8RA 4LP2B 4N07A 3KSXA 3K2DA 5B70A 3TZAA 4LZ7A 1UTBA 3D4CA 1AH5A 3FV2A 4GWOA 4KCDA 1FQFA 3TKDA 1D4NA 3F11A 2YPNA 2D3IA 4H65A 4RPNA 4DLDA 5DVJA 3E9XA 3T93B 4O3AA 2PX1A 4QFLA 3BBRA 1L5TA 3ZKKA 3ZSFA 4EDPA 5I59A 5KCJA 1AL3A 2QS1A 3L6GA 3CSBA 4QSDA 3L6HA 4ELPA 1ZTYA 4P0IA 4NF6B 3K6UA 1B0HA 2LAOA 3K00A 3KSJA 1DTZA 4KCCA 2DP8A 1LFIA 1OQHA 2ESNA 2Y7WA 3RY3A 3FASA 5FTHA 4QSEA 3FGSA 4C1TA 1H3DA 1B6HA 1ZU0A 2DXYA 3ECRA 1P1NA 1GVCA 1AOVA 3FXUA 3HPIA 3K1MA 2XHDA 3LC8A 3MQ9A 2XXTA 4OWDA 2B65A 1SDXA 3RTWB 3IJXB 1FW0A 3IOUA 3KFMA 5KDTA 3PUXE 1B3EA 3W9VA 4QF9A 4BDQA 1LFGA 1SVXB 3R6UA 2HAUA 3MW0A 4UACA 2M8CA 3K4UA 1DMBA 3SDFA 3AXFA 4BLAA 1HSEA 1OVTA 4OETA 4F22A 3H06B 1LSTA 3KGCA 4IO5A 4F2OA 1SI1A 1N84A 1SI0A 3TCGA 2F78A 1FQEA 1I6BA 4IO3A 1D9YA 4R6YA 5K2XA 2PYYA 3KJ7A 5EHMA 5H8QB 3UA8A 3FD3A 3CG3A 3VE1B 2O7IA 1OQGA 4NF4A 4AB6A 1LCFA 4U1OA 4FAJA 3QUJA 4JBZA 3TPAA 3IO6A 1QUIA 4U23A 3GBBA 3RQTA 3LSFB 3U92A 3UORA 3WAFA 4F3BA 4IO7A 2DE4A 3P7IA 2I4CA 1B7ZA 2XXQA 3CFZA 2F34A 3OD7A 1URGA 4BDMA 4XKRA 2OZZA 4F29A 3FVNA 1HSLA 4FATA 5I57A 3K6XA 1LFHA 1FCKA 4LZ5A 2I48A 3FATA 4M4GA 3MZBA 4IO6A 4ELRA 5AA4A 1ZKBA 4GL8A 2ZYMA 3QAXA 4QSCA 4NMYA 1A40A 1ZMGA 4MBPA 1ZBMA 4RA1A 4G68A 2PVUA 2XXHA 5TPAA 4X1DA 4O3CA 1SBPA 2UVGA 2V84A 5H8QA 4R9GA 1LBBA 3KOSA 1BKAA 1IXIA 1JW4A 3O2AA 1NMUA 4KQPA 5KZTA 3M3FA 1GGGA 5TP9B 2IEEA 2QL3A 2YJPA 1YAEA 2F7BA 3T9VA 2ONKE 1SW2A 3MZ9A 1URDA 1LAGE 3PPPA 3MAMA 1TT1A 3JZJA 5I2KB 4YB7A 4I1DA 1ANFA 1FTLA 1NH7A 1O63A 2H25A 2HFBA 1H43A 2XXYA 1H45A 1R6ZA 4KYEA 3DP4A 4ZEFA 1GV8A 2DWHA 4U4SA 3N6TA 2H5YA 3T96B 1MXXA 1B46A 4RNSA 1PB8A 4FEBA 1UTHA 3TODA 5AA3A 4Q0CA 1FTOA 3HHGA 4RK9A 3TTRA 1OIBA 2P2AA 2RC9A 2THIA 2XX7A 1B5HA 1UQWA 4OESA 2NOOA 3DELB 4JSOA 4HTGA 5JTYB 4ZE9A 5H8FA 3EHUA 4R2FA 2RINA 1Z7NE 1LBCA 2Q88A 2QJEA 5F1QA 3TAJA 4WEPA 2UYFA 3CFXA 1VR5A 3B6QA 3PUZE 3OO8A 3ZS6A 2FNCA 2P1SA 1YTVA 5DVIA 3LBSA 1IQ7A 2UVIA 3U93A 3EHTA 4BDOA 1FTMA 1N76A 3DP8A 3OMBA 4PFYA 5FHOA 1OLAA 2I0BA 3O66A 1LLSA 3SESA 1MS7A 3FVKA 3VLUA 3FIRA 3SEUA 3KJTA 3RPWA 4F3SA 1NKXA 1B3FA 5IAIA 2ANJA 1JW1A 4NWDA 3FZVA 1TFAA 1Y20A 2PMSA 2O1LA 3SEXA 1R9QA 4WKMA 2I3WA 2XXUA 3H3GA 4FEDA 5TU0A 3U8QA 4K3FA 5I58B 1QKBA 1P99A 5LOMA 3VXCA 1TFDA 1QKAA 4X48A 3IX1A 3V5AA 3CVGA 3G3GA 4HW8A 1DSNA 4MLQA 4NWCA 4O3BA 5ITOA 5ISUA 3UGWA 3C31A 2Y7KA 4EQ9A 2PT2A 1QUKA 4G8NA 5H8NB 4IY5A 1O7TA 4GF8A 5KDTB 1SYHA 2NWJA 4ZEBA 2F35A 3E3KA 3S9LC 4U4XA 3G3HA 4NE4A 3IB0A 1MXWA 1URSA 4IGTA 2DOJA 2O69A 1Y4CA 3IL1B 4H8IA 3IB1A 1MM7A 5DTBA 1R9LA 5L9MA 3FUZA 4DIGA 3OSQA 1A54A 3FV1A 4IO2A 4PETA 4R2BA 3TELA 1MY4A 1US5A 5I59B 4GFRA 2CMOA 4H5FA 4R73A 2D5WA 3UIFA 3EQ1A 1XOCA 4BDNA 4F1UA 5AA4B 3CSGA 2F6GA 2Q9TA 3Q26A 1Y1ZA 4DXBA 5ICTA 5I2KA 3LSXA 1BIYA 1M5BA 1XVXA 2DS9A 1JEUA 2HAVA 3H03A 1WODA 1QUJA 4G68C 4R75A 4F3GA 3IR1A 2XD2A 4Z0IA 2PBWA 1B05A 1RYOA 2ZYNA 1MG1A 1XVYA 2GHBA 3H6VA 3C34A 3CI8A 3MWBA 5AA1A 2F8DA 2VD3A 3PV0E 2OWSA 1TWYA 3PMVA 4I62A 4R74A 1US4A 1PBPA 2OCUA 2QS3A 1SQYA 3E13X 3R7XA 4KR5A 1IITA 5CBRA 2ZYOA 4UA8A 3T9XB 1IXGA 2ONRA 2IA4A 4DZ1A 2DE3A 3OSRA 2I49A 1DTGA 3U94A 3DP6A 3PMWA 2R6GE 3V89B 1VSOA 1Z7ME 3D4GA 4GXSB 3WAEA 3HHFA 2ZNTA 2V3UA 3H7MA 3JYRA 3PUVE 5DEXA 3C35A 4ECFA 3PU5A 3RGYA 1AMFA 5F7VA 2G93A 3G3FA 1B52A 1FQBA 1MH3A 3CFLA 1CE2A 1SW1A 2OJTA 2XXWA 4F3PA 3MVWA 4KYDA 2F6PA 1SW4A 4MH5A 4F1YA 3TEPA 4LQ2A 1MY0A 3MPKA 5EHSA 1EZOA 3C9HA 4F39A 5L9SA 4YZZA 1EU8A 3KBRA 4DCYA 4F2QA 4OQOA 2XD3A 4NF6A 4QFNA 4NF8B 1I69A 1XC1A 4PQJA 4I9DA 4RXLA 2E0SA 1MXZA 3OXNA 2Z23A 4X1BA 3B6TA 3A09A 3N6UA 4Q30B 4RYAA 2Z22A 3HCQA 4HCWA 5DEXB 4E0XA 3PUYE 4H1XA 3RT6B 1MPDA 1MXVA 2HQ0A 4ELQA 1D3KA 3S9NC 4Q5TA 4C0RA 1M5EA 1PC3A 1Q35A 1UIVA 4YMBA 4XKPA 3USDA 5ICQA 2Y84A 4ZE8A 5CM6A 1MDQA 3RN8A 1MQHA 1MQGA 1XT8A 2ALUA 3VVDA 2XXPA 2I4BA 1N7WA 5I56B 4E0WA 4KFQA 4U21A 5HM4B 1B1HA 1B3LA 1J1NA 4H8JA 3ILTB 4G77A 3I6VA 1YCJA 3MC2A 3OO9A 4IB2A 4OTEA 3ONMA 4JWYA 4U2RA 3V8XB 4F19A 5IKBA 3TTMA 1FQAA 4IGRA 2Y7PA 5FHNA 4JB7A 2O6AA 2DSFA 4LVQA 5FHMA 2RCAA 4OFLA 1QW0A 1VFEA 1A99A 1JQFA 4G4PA 4GRKA 1Y1MA 4JDFA 3H4ZA 3KN7A 4N13A 4F31B 4MLVA 2QPQA 1B9JA 3O28A 4POXA 2DWAA 1MXYA 1N3WA 3GXAA 2GRVA 1SD3A 4GQOA 3W9WA 2OK2A 3KEIA 1LGBC 2A5SA 1POY1 1MM6A 4YKPA 2DVZA 1IIWA 1MQDA 1RYXA 3IOWA 3CIJA 4ESWA 1IXCA 4QHQA 1A55A 1N04A 5CMBA 1NNPA 2A5TB 4YU0A 1MH4A 4H6DA 3PPQA 2BJJX 1H44A 4P0GA 3CR9A 1I6AA 2NUVA 2ZXTA 1P1WA 5I2NA 1B3GA 3IAZA 4H5GA 5I84A 4WEDA 2D21A 2DWJA 1B4ZA 4ZZAA 3TDJA 3V83A 2PT1A 3HN0A 1YPNA 3KN8A 1VFDA 2HCAA 3PUWE 4L17A 3PMXA 3S9EA 3JV9A 2O1MA 3RLFE 2ZNUA 4YKJA 1M5FA 1DPEA 3VXBA 5I58A 1PBQA 3IOTA 1VE4A 3O29A 3CG1A 1B7UA 5A5XB 1LAFE 1ELJA 2X7PA 3G3KA 3LSWA 3R26A 3DLNA 4LUBA 5JEIA 1I6QA 5CMMA 1JW5A 3Q25A 3DM0A 4IO4A 4ELOA 2Y7IA 2REJA 1SYIA 2O68A 4N6PA 5H8NA 4NF5A 4OMBA 2FA7A 3C33A 5B7DA 1P1QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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