5BUUA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (l483y-n754s) in complex with glutamate and bpam-321 at 2.07 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITYVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLSEQGLLDKLKNKWWYDKGECG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
publication title Synthesis and Pharmacology of Mono-, Di-, and Trialkyl-Substituted 7-Chloro-3,4-dihydro-2H-1,2,4-benzothiadiazine 1,1-Dioxides Combined with X-ray Structure Analysis to Understand the Unexpected Structure-Activity Relationship at AMPA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 82
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-06-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5buuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5buuA02
2FNCA 3T66A 5F1QA 3DP4A 1B4HA 1Y3NA 1R9LA 2I48A 4NF5B 1B1XA 4GL0A 4ZDMA 5AE4A 5DEXB 3UIFA 3U72A 4DXUA 1XC1A 1GVCA 3M3FA 1VR5A 4QFPA 3ZS6A 3BBRA 4MH5A 5CRYA 3RQTA 3HN0A 3V83A 1QULA 3C35A 1D9VA 4PETA 4G4PA 2GH9A 1P1OA 5DVJA 3N6UA 4C0RA 4NF4A 3QUFA 3TTRA 1R1NA 1DTZA 3ZKKA 2P2AA 4DDDA 1FTJA 2D21A 2V3UA 2HXWA 2VGQA 3B6QA 3IR1A 1MXXA 4Q30B 3LSXA 1XOCA 2XXYA 3BKIB 2PVUA 4ZZAA 5L8DA 1JVYA 4YAHX 2V25A 4YMAA 3CIJA 4NWDA 3K6WA 5L9SA 4KYSA 1NH7A 3QK6A 1MS7A 1LFGA 4GXSB 1N0TA 3DP8A 4POWA 3U94A 4OWDA 4R75A 1JW1A 5ICQA 3LUYA 4M1VA 4XKNA 4I62A 4NF5A 4OFJA 3KN8A 5DEXA 3RY3A 1DPEA 1J1NA 4NWCA 1M5FA 5HBCA 1QUKA 4G2ZA 3R7XA 2XX9A 1R6ZA 2DYXA 4TLMB 3TAJA 2QMWA 3FVKA 1MG1A 3N94A 4GF8A 4YB5A 3TQWA 3IJXB 1MY4A 4DCXA 5AA3A 1FQBA 5H8NB 3IB1A 4HTGA 3BFUA 3EPEA 3TTKA 1A55A 3PPPA 3O9PA 5CM6A 1B52A 3PMXA 3JYRA 4R2BA 1OIBA 1HSJA 4OVJA 2FA7A 4IO6A 1B40A 2DE2A 1A99A 4FAJA 4OENA 2X26A 1VE4A 2OK2A 2VOZA 3U93A 1SD3A 1B58A 4JSDA 3N5LA 4BDNA 2Y7PA 2RKMA 3G3GA 1QUIA 1MQGA 1JW4A 2B3FA 3O28A 4KD5A 3CR9A 2ZNUA 4RY1A 1P1NA 2I49A 4BDOA 3VVEA 3QXMA 3Q25A 4PP0A 1FTKA 4ONYA 1FCKA 1F9BA 3O6GA 1S7YA 4F18A 3KN3A 2QJEA 4H5GA 3T9VA 4ELRA 1PBPA 5AA2B 4HCWA 3TQLA 3D4GA 3UA8A 4G68C 2ZYNA 4LVQA 2DP8A 3TTMA 1MQDA 3OENA 3A3CA 2O84X 3K2DA 2HQ0A 3IOTA 3PMWA 2E1SA 2F78A 3C34A 4FEDA 5ITOA 3VXBA 5CBRA 1EZ9A 1QUJA 3CSBA 2HAVA 3ILTB 3S9MC 2OCUA 3W9VA 1JNFA 2X7QA 5H8NA 4ISUA 3U1OA 1B32A 1SBPA 3MJNA 4H6DA 1IEJA 1PB8A 1B0LA 1OMPA 4F22A 1LFHA 2I3VA 2H4IA 1B1HA 4FJPA 3V89B 5I56B 2RC8A 3L6GA 3H4ZA 1MM6A 3TZAA 1O64A 3T22A 5AA2D 1NL5A 4DZ1A 3FGSA 4GQOA 4YB6A 1DOTA 2DWHA 4AB5A 5BWJA 5H8HB 3T9HB 2XXHA 3MAMA 1M5EA 3IOWA 3ZSFA 1EU8A 2O7IA 3H3GA 1TXFA 4XKPA 4OXVA 4QSCA 1ZKBA 3TPAA 3G3JA 3Q28A 5AA2A 2X7PA 3H6UA 1M5CA 4ZEIA 2VP1A 3KGCA 4LQ2A 1IITA 3LBSA 3MVYA 1LFIA 1B51A 3PD9A 2REGA 4U21A 4LA9A 1PDAA 3P7IA 1NFTA 4RXLA 3TELA 1ZMGA 5KDTB 5CC2A 1MM7A 4JDFA 3PPNA 1IQ7A 2OLBA 3MP6A 4M4GA 3K6VA 2Y7WA 4GIZA 2QL3A 2XXIA 3O6HA 2DE3A 3CFZA 1S9TA 3R26A 4N13A 1I6BA 5IKBA 3ECRA 5A5XB 1N7XA 3HSTA 1AH5A 4THIA 5I56A 3S9LC 3CFXA 5HPQA 3OEKA 4P11A 5TP9B 5H8HA 5KZTA 2P0SA 4FE8A 3B6WA 1MH3A 2RCBA 1NNKA 3OMBA 4OHNA 4LUBA 5I2NB 5I84A 1H45A 3RN8A 1XHYA 3OO9A 3SEYA 2THIA 3FVOA 3SETA 5ITPA 3MW0A 3ILUB 4JWOA 2FYIA 2RC7A 4KFQA 2UVJA 2O69A 1II5A 1UIVA 4ECFA 1B3LA 1MPCA 1GTKA 1WDNA 1LGBC 5KDTA 3FVNA 5DTBA 2RINA 2R6GE 4F1UA 3U92A 1YTVA 3VE1B 4LZ8A 5DT6A 3O2AA 3IO4A 4YKJA 3PGFA 3Q27A 1N3WA 4L17A 4DIGA 1R9QA 4JWYA 2R9JA 4ZEFA 3G3FA 5TPAB 4AB6A 1JEVA 5A5XA 1Y1MA 1FW0A 2CMOA 3CI8A 2PT2A 1AIVA 1US4A 3LC8A 4C1TA 2V93A 4RA1A 1LAGE 3H6TA 4QFLA 5TP9A 3KJTA 3MWBA 3K6XA 5K2XA 1A8EA 2NWJA 1A8FA 3GZGA 4DCYA 2QS2A 3PPQA 3O6IA 5M2VA 5I2NA 1I6QA 4BDRA 3TODA 3S9NC 2WKYA 3MBPA 5CBSA 2P1SA 4Q8RA 5I59B 3H03A 5I58B 1EZPA 3VXCA 4NTLA 1CB6A 4ELPA 4LONB 4JSOA 3RTFB 1DMBA 4TLLB 2PYYA 2O68A 1Q1KA 4EDPA 3FJMA 4I9DA 1MRPA 3PUXE 1BTJA 2E0SA 3A3UA 1IIWA 1Y1ZA 1PC3A 2DXYA 5TPAA 2I3WA 4XXUA 3G3KA 2Y7KA 2I0CA 4QF9A 1KWHA 2YLNA 1TFDA 2QRYA 4ZE8A 3OO6A 3IAZA 1DSNA 1OQGA 3PUZE 5EYFA 1N3XA 1B05A 4RPNA 3RNNA 3TMGA 1PB7A 4TQUQ 2I4BA 4OFLA 4R9FA 4KCDA 2UYFA 3O29A 4ZS9A 2XXUA 1N04A 2OBGA 3VV5A 5LOMA 1BP5A 3EHUA 1B5IA 4ZEDA 5EHSA 4F2OA 5I59A 5I58A 4FORA 1UQWA 4AQ4A 2NUVA 2QSXA 1IUDA 2UVGA 2XX8A 1PB9A 5H8QB 4ZE9A 5CMBA 1LAFE 2DE4A 5H8FB 1TT1A 4MBPA 1JQFA 4HS7A 4NE4A 3HCQA 2F5XA 2PMSA 3TYHA 1I6AA 1FQCA 1P1QA 1P99A 2RF1A 3SERA 1O63A 2F6GA 2DOJA 5DVFA 4U2RA 2RCAA 3FVGA 3H6WA 2H98A 2XXPA 1URSA 4JBZA 3FIRA 2B65A 3MZBA 1NKXA 4OQOA 3RGYA 1Z7ME 1ZTYA 1BIYA 4R6HA 3CFLA 4H0WA 1USYE 2REJA 4F2QA 5K2YA 1P1UA 3V5AA 3MP1A 3KOSA 2I0BA 1EZOA 3K1NA 3MPKA 4YKKA 3SEUA 3QYTA 1BKAA 1FQFA 1MXUA 4JB7A 4NMYA 4FEBA 2XD2A 4EF2A 1AMFA 1I69A 1XS5A 3M3LA 1MXZA 4GFRA 5FTIA 4XKQA 3O97A 3E13X 1WVJA 5DYHA 4LATA 3I3VA 2A5SA 2F35A 4Q5TA 3MVXA 4XKRA 3SDFA 2XHDA 2R71A 5H8QA 3MZ9A 3O66A 4KYDA 1HSLA 2Y7RA 4H8IA 1A40A 3GLBA 4DXBA 5H8FA 2XXWA 5J1DA 1MXVA 3H6VA 2NVUB 1IZ1A 4XIGQ 4EXKA 1AL3A 2O6AA 4OTEA 4UA8A 4HW8A 2DVZA 2ZYOA 3HO7A 1T0KA 5BUUA 3PUWE 1MQHA 3UORA 4P0IA 2G93A 4EQ7A 4IB2A 3IX1A 1SYIA 2VD3A 2AL4A 2OWTA 4PE5B 4WEPA 4FATA 3G7WA 2Q89A 3KN7A 2XXRA 1MQIA 2Y7IA 3TCGA 1ZLQA 3K1PA 4N6PA 3USDA 1B0HA 1LB8A 3VVDA 5B70A 2XXXA 1EH3A 3N6TA 3EF7A 3FV1A 1B5JA 3BFTA 4U22A 2QS1A 2ZNSA 1H43A 2GHBA 3IOUA 3VLUA 2D3IA 1QKBA 5AA4B 1LCTA 1NNTA 3PMVA 2UVHA 3AXFA 5DVIA 2AYSA 2UVIA 3QAXA 4OZ9A 4U23A 1SW5A 4LZ5A 2XXQA 4KR5A 2PX1A 4R2FA 5JTYB 2ZYKA 1IXCA 4G68B 4C1UA 3KG2A 2QPQA 4XTCQ 1B3EA 3MUQA 4ESWA 3OELA 2Q2CA 4X48A 3TCHA 4F39A 1O7TA 1ELJA 3T93B 4MLVA 4OEVA 1MPBA 4GOTA 1JEUA 2IEEA 4PFUA 4QHQA 1B7HA 1NMUA 3HHGA 3RUMA 4ZEKA 5JEIA 3GBBA 4BLAA 1OLCA 5ICTA 4R74A 1UTHB 3I5OA 3E3KA 3RTWB 4NEDA 3RT6B 3T96B 4QSEA 4RPOA 1UIUA 4KI0E 4GD5A 4IGRA 1B46A 3FXUA 3K02A 2HAUA 4U4SA 1D9YA 1Y20A 1B9JA 3CG3A 4R9GA 3FD3A 1A7LA 2AIXA 1XVXA 2F7AA 4F29A 1B7UA 4QFOA 3K00A 3PPOA 4RK2A 2PBWA 5AA4A 1SYHA 3OXNA 1OVBA 1L5TA 3B6TA 4R73A 4RK9A 4U4XA 4GRKA 2QMXA 1D3KA 1JETA 1ZBMA 1N76A 4ELOA 3IB2A 1QJMA 4E0WA 3PUYE 5JTYA 3U8QA 4G68A 1YAEA 3ONMA 4IGTA 3B7DA 3FXQA 4OYVA 4G8HA 4F1YA 1US5A 1IXIA 3HHFA 1ZIUA 5FHMA 2DWAA 1P1WA 3I6VA 4F3GA 1N84A 3M3KA 4R72A 2XXVA 3CG1A 1B3FA 2H99A 1FQDA 2OJTA 1UTHA 1RYOA 4F31B 1H76A 2KLFA 3TUSA 3DELB 4QSDA 1SW4A 3KOTA 4DE8A 2UYEA 4YKPA 2NXOA 2DWJA 4N07A 4ESXA 1DPPA 1Y4CA 1MXWA 1NH8A 2ZNTA 3FJ7A 2OWSA 1OVTA 3TKDA 2H9BA 2XX7A 4F3BA 2DQVA 1IXHA 1FTMA 4H8JA 3V8XB 4EQ9A 3F11A 4YZZA 4Q0CA 4RJZA 2RC9A 4UACA 3CSGA 4BDMA 3C4MA 4HCYA 1B7ZA 1IXGA 1SI1A 1LBCA 2DWIA 2Y84A 1B5HA 3W15C 3G3IA 4Z7EA 5F7VA 4O3CA 2Q2AA 4GLIA 2F97A 2XXTA 1NNFA 1B2HA 4POXA 1LLSA 1SDXA 5FTHA 4OFOA 3HPIA 1MY0A 3D4CA 2ANJA 3Q29A 2I58A 3VDFA 4ZEBA 2Z22A 3RT8A 1MQJA 2OZZA 2PT1A 2HZKA 2W7YA 4NF6B 1Y9UA 1MXYA 3E9XA 1URGA 2F7BA 3TDJA 3KZGA 2Z23A 3CRBA 3FUZA 4TOZA 2Z8EA 1OLAA 4H5FA 3VVFA 3KEIA 3SESA 5IAIA 3R6UA 3H06B 3THIA 2D5WA 1MY3A 2ONKE 4ZZEA 4ND9A 3UN6A 5I57B 1GGGA 5L9MA 3K01A 1S50A 2F6PA 3C31A 3VLWA 1B3HA 1GV8A 1ANFA 3OO7A 1LBBA 2O51A 4JXIA 1QKAA 2A5TB 4YU0A 4IO5A 3WAEA 4OETA 3JV9A 4PQJA 4G77A 5L9OA 3N26A 1FTLA 3UGWA 1MDP1 3MC2A 4U1OA 2HEUA 3PUVE 3MVWA 1GR2A 2GHAA 1LSTA 2YPNA 2V84A 4PFYA 4YKIA 1ZJLA 4NF6A 3T9UA 5HM4B 3OOAA 3PPRA 1SI0A 3HV1A 4O3BA 4LZ7A 3IL1B 2QS4A 5AA1A 1RYXA 1Z7NE 2AL5A 5JK4A 3TCFA 4Z0IA 1MY1A 1NNPA 4EQBA 1BLFA 2CZLA 1RKMA 5I57A 3FASA 5FHOA 3TTLA 2ESNA 3G3HA 4IO7A 2DSFA 2YJPA 2LAOA 2I6EA 2IA4A 4QFKA 4G8NA 1Y3QA 3MZ1A 4PFTA 2F7CA 4GWOA 4KCCA 3GXAA 3SEVA 2A5TA 1FQEA 2QS3A 4F19A 4H1XA 1Y3PA 1UTBB 3IORA 2O1MA 3MPLA 3T9XB 2O1LA 1LB9A 4YB7A 3FXRA 4FECA 3W9WA 1MDQA 2ZMBA 3DLNA 3KFMA 3MVZA 3TTNA 4RNSA 1SVXB 3OSQA 4K3FA 3LSWA 4LP2B 4H65A 2HZLA 3FV2A 3OO8A 1XVYA 4PFWA 1LAHE 4ELQA 3K4UA 4IO2A 3VFJA 4DXCA 1TFAA 5KCJB 3IJOB 2O7UA 1TWYA 4IO4A 3LSFB 1SQYA 5I2KB 1D4NA 4DLDA 2ONSA 1QW0A 2DS9A 5EHMA 1H3DA 2H5YA 1A54A 3EHTA 3SEXA 4F1VA 1QVSA 4NF8B 4OESA 4G8MA 4YICA 1B4ZA 1JW5A 1M5BA 1H44A 3OSRA 3TFLA 4F3SA 4R6KA 4FIMA 1URDA 4GVOA 4OEUA 2DVCA 3L6HA 4O3AA 3EN3A 1MY2A 3ZKLA 2ZYMA 2ABHA 1B3GA 2BJJX 1UTBA 4OERA 1VFEA 3KSJA 4IY5A 1MPDA 1XT8A 1Q35A 3RLFE 3SKPA 2VHAA 3LR1A 1JVXA 2F8DA 1SW2A 1USYH 3C36A 4I1DA 1B6HA 4KHZE 3MP8A 3FZVA 3OD7A 4IY6A 4WEDA 2F36A 3C9HA 2Z8FA 5KCJA 3LSLA 3KBRA 3QIMA 2VD2A 2ALUA 5I2KA 3IOVA 2NOOA 1CE2A 4KPTA 4U1ZA 1WODA 5CI5A 3UK4A 2UXAA 4P0GA 5ISUA 4I8CA 4EXLA 5FHNA 4IO3A 4YMBA 2GRVA 5B7DA 4KYEA 3ODBA 1POTA 4NF8A 4X1BA 4EF1A 4BDLA 3IK6B 1OQHA 3OEMA 1VSOA 4EUOA 1N7WA 5ELVA 2H25A 3DP6A 2V3QA 5CMCA 3EHSA 4KQPA 3K6UA 3MQ9A 3PV0E 4MLQA 1AOVA 1M5DA 2F34A 2Q9TA 2GFEA 3IO6A 1POY1 3Q26A 3PD8A 3GBAA 2Z8DA 3VLVA 4X9TA 3FATA 1VFDA 3C33A 4GL8A 1PEBA 3KSXA 4ZECA 2XD3A 3S2VA 3K1MA 4WKMA 3S4UA 2ONRA 1LAXA 1DTGA 2ZXTA 4LQ5A 1HSEA 3RPWA 1LCFA 1FTOA 3KJ7A 2V3TA 3A09A 3PU5A 4QRZA 2Q8JA 1ATGA 4MFIA 4GXAA 3WAFA 5TU0A 3TEPA 3DM0A 4BDQA 2DXRA 4MF3A 2HCAA 2Q88A 2HFBA 1YCJA 4RYAA 3H7MA 4NF4B 3UP9A 1YPNA 4E0XA 4F3PA 1MH4A 4QFNA 4X1DA 4H67A 3CVGA 3EQ1A 3E4RA 2B3BA 3JZJA 2M8CA 4R6YA 4OMBA 3SEWA 3C32A 5CMMA 2G29A 2I4CA 1SW1A 3S9EA 3K0VA 4WXJA 4JWXA 3IB0A 3M8UA 3QUJA 1Y4TA 1ZU0A 3FJGA 5H8SA 5CMKA 3QSLA 1PBQA 1FQAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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