5BYIA

Human carbonic anhydrase ii with an azobenzene inhibitor (1d)
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Azobenzene-based inhibitors of human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2015-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5byiA00
1IF9A 4WR7A 3MHMA 1HCAA 4XFWA 2HKKA 1BNMA 1TEQX 4QIZA 4K0SA 1JV0A 3D9ZA 2HD6A 3SAXA 5IPZA 4ITOA 2VVBX 3S71B 4E3DA 4XZ5A 1AVNA 4R59A 4XIWA 1CA3A 4QK3A 3RZ8A 3HKNA 3F8EA 3B1BA 5CJFA 4QEFA 1LZVA 2QO8A 4M2UA 1IF4A 3FE4A 2NMXA 4Q8XA 3RZ7A 1HEAA 1TE3X 4QJOA 3KLDB 2AW1A 2CA2A 3M2XA 1G52A 4UOVA 1JD0A 3U7CA 5DOHA 4CACA 1TBTX 2NWPA 4K13A 5L3OA 3RZ5A 4TWMA 1Z9YA 4CNXA 2WEJA 4E5QA 1RZAA 3M1KA 3S77B 1I9PA 3S9TA 3CZVA 1YDCA 4QJ0A 5EHEA 3IBLA 3P5AA 1FR7A 2HFWA 4Z1KA 1BNWA 1G0FA 5FLTA 4ZX1A 1DMXA 4MDMA 1AZMA 1H9QA 2NNOA 3N0NA 1CNXA 4M2WA 3OIMA 4PQ7A 2NNGA 3Q31A 4ZWYA 1KWRA 5E2MA 5JG3B 1BNVA 4KUYA 4Q07A 3D8WA 1FQMA 4DZ9A 3HS4A 1YDBA 1G0EA 3P3JA 4Q09A 3KWAA 5E5UA 4PYXA 1LGDA 3ML2A 1CNIA 3DD0A 1CNWA 4L5WA 2NN1A 3S75B 3P3HA 1I9NA 2Q38A 3V3JA 2NWYA 4Y0JA 2HL4A 1CNGA 1LG5A 5SZ3A 3JXHC 3MHLA 4KUVA 4WUQA 4MTYA 3IBIA 3M40A 1URTA 1CCTA 2X7TA 5EHWA 1BNNA 2FOQA 2ILIA 1CAYA 3IAIA 2FMZA 3V3HB 6CA2A 5SZ5A 3M3XA 2X7UA 1F2WA 3S78B 2NN7A 4MDLA 3SBHA 3UYNA 4JSWA 4JS6A 2CBCA 4RUYA 1CAMA 1UGAA 4N0XB 9CA2A 4HT0A 5G01A 4Z0QA 3NB5A 1BNQA 5FLOA 1EOUA 3DBUA 4ZAOA 2FOUA 3DC3A 3DCCA 4HF3A 2FNNA 3P4VA 1H9NA 5EKHA 2WD3A 4QIYA 5FDCA 4QTLA 2ZNCA 3K7KA 2H15A 3IEOA 2FOYA 3F4XA 3FFPX 1HUGA 5FLQA 1ZGFA 3OYQA 1G53A 1UGGA 3MHCA 5FNHA 4FRCA 2WEGA 4LP6A 1HCBA 5FNLA 3F7BA 3CAJA 1HVAA 3MMFA 1KOPA 4G0CA 4RH2A 3HLJA 3M14A 4QK1A 1CZMA 3OKVA 4MLTA 4PZHA 2W2JA 4PYYA 4YYTA 5DSMA 3UYQA 3MNKA 5JEGB 4YXUA 4G7AA 4Q7PA 1BZMA 1RAYA 2OSMA 1OQ5A 4YXOA 5G0BA 4QSAA 4Z1NA 1TG9A 4ZWXA 1CVCA 5JQ0A 4IDRX 2FOVA 3DVDA 1CVDA 1RJ5A 3HKUA 1UGDA 2NNVA 4Q9YA 4RN4A 4YVYA 3S73B 3ML5A 1CAJA 2NWZA 2NXRA 3TVNX 3OIKA 4KP8A 4RFCA 4L5VA 4JSZA 4YGLA 1XEGA 2POVA 1YO1A 1ZSCA 4BF1A 5BRWA 1I90A 1CNCA 4HT2A 5BYIA 1CNJA 5L6KA 3HKQA 4JSAA 1G54A 3VBDA 3MHOA 5BRVA 4ZX0A 4RUZA 3RJ7A 1T9NA 2CBEA 3D92A 1DMYA 4XE1A 4QJPA 3S76A 1TG3A 5JEHB 3T5ZA 5DSQA 4YGJA 5EZTX 2NWOA 2FOSA 4M2VA 1G4JA 5DVXA 1KEQA 3T82A 1G6VA 1BN1A 1MOOA 5DSRA 5DOGA 3DAZA 3MYQA 3S74B 3M04A 4TWLA 1Z93A 4COQA 4FU5A 4RIVA 3MDZA 4MO8A 3TMJA 5FDIA 4YXIA 4K1QA 4YWPA 1BCDA 1ZFKA 5DSKA 1CRMA 3L14A 2Q1QA 1I91A 1CVBA 1YDAA 5FLSA 1CCSA 3RG4A 3T84A 3T85A 1BN3A 3KNEA 4Z1JA 3QYKA 1CALA 4K0TA 1CAZA 3U45X 2CBDA 5JGSB 2NXSA 3D93A 1CAOA 1CA2A 4QSIA 3JXGA 4K0ZA 3V3GB 1J9WA 5FL6A 2HOCA 3FW3A 3RYYA 3HFPA 1CAIA 1DCAA 1XPZA 5FNMA 2POWA 5EHVA 5JQTA 3K2FA 5FL4A 5FLPA 3U47A 3MHIA 5AMDA 4Q87A 1FQRA 1MUAA 1THKA 4QY3A 5E5RA 4Q81A 3M5TA 1IF7A 2VVAX 4CNRA 4KP5A 3OY0A 1OKLA 1KWQA 4L5UA 3R16A 1HUHA 4E3FA 4E9OX 1BNTA 3M2YA 4MLXA 3KOIA 3BETA 3DCSA 4YHAA 3W6HA 1V9EA 3MNAA 3MWOA 5E2SA 2GD8A 1CCUA 4KUWA 1FQLA 4CA2A 5HPJA 1BICA 2IT4A 1FQNA 3M96A 4Q7SA 1CNKA 2QOAA 4CNWA 5JDVB 1CNBA 4GL1X 3RYXB 5CA2A 5SZ1A 4HEYA 5JG5B 3CYUA 1HECA 3M1WA 3V5GA 1Y7WA 4Q49A 1UGBA 1G4OA 1RJ6A 1H4NA 2ABEA 1TH9A 3RYVB 4N16A 5FNIA 4R5BA 3V7XA 3DC9A 1FSRA 4DZ7A 3KS3A 1ZGEA 3PO6A 4MDGA 3IBUA 3M98A 5EKJA 3SBIA 3T83A 3ZNCA 5SZ4A 3SAPA 3R17B 4ETQC 1TTMA 4FPTA 1UGCA 2NNSA 1XEVA 4BF6A 3M5EA 4HEWA 1CRAA 3DV7A 4Q99A 3V2MA 1TEUX 5FLRA 3KKXA 4QSBA 3W6IA 3HKTA 3EFIA 1I9LA 5DSJA 3DCWA 2X7SA 5DSOA 5EH8A 1FSQA 3BL1A 5A25A 1RZDA 1RZEA 3MNJA 3DD8A 5G0CA 4E3GA 5DSNA 3RZ0B 4X5SA 5CLUA 5FNJA 3P58A 3IBNA 3EFTA 3DA2A 3N3JA 5BRUA 3CA2A 5DSLA 3P44A 4Q6EA 1OKNA 1CILA 3D0NA 4FVNA 4Q0LA 2WEHA 3ZP9A 4YX4A 4YGFA 4FVOA 5AMGA 1CVFA 1BN4A 4HBAA 4KNIA 1ZSBA 3S8XA 2Q1BA 4QJWA 1G46A 2CBBA 5FNKA 1ZNCA 1RAZA 2NXTA 4Q8ZA 5DRSA 2GEHA 3RZ1B 4RUXA 3RGEA 1CVAA 3MNUA 4ILXA 2H4NA 4Q90A 1YDDA 1RZBA 2FNKA 3DVBA 1ZH9A 5C8IA 2EU3A 1JCZA 4CQ0A 1I8ZA 4WL4A 4C3TA 2HNCA 4HU1A 3S97A 1ZFQA 3RYZA 1RZCA 4WW6A 1G1DA 4Q06A 3M67A 5JESB 4KNMA 1I9OA 4LU3A 1UGEA 3P5LA 4Q08A 1IF6A 3M5SA 3OKUA 1BNUA 1CAKA 3RG3A 4QJXA 3MNHA 5SZ6A 3GZ0A 5DSPA 1CANA 1CAHA 4JSSA 1ZE8A 3K34A 1CINA 1V9IC 2POUA 4ZWIA 4BCWA 4KNJA 1YO2A 5SZ2A 5E28A 4Q7WA 5SZ7A 2OSFA 4WUPA 1IF5A 2EZ7A 4KNNA 3M1QA 3MNIA 4ITPA 3M2NA 4IWZA 1UGFA 5EH5A 3JXFA 1OKMA 2FW4A 3F7UA 3V3FA 2WD2A 1FSNA 1HEBA 1FR4A 2EU2A 4ZWZA 5EIJA 1CNYA 5A6HA 1KOQA 3DVCA 5E2KA 4M2RA 1LG6A 3M2ZA 4PXXA 4YGNA 5CACA 1DCBA 4QSJA 1LUGA 3U3AX 4E49A 3BL0A 4FL7A 3PYKA 3TVOX 1CIMA 1I9QA 2CABA 1CNHA 1XQ0A 3M1JA 5JEPB 4RFDA 4WW8A 3RYJB 3NJ9A 3V2JA 2FNMA 3PJJA 4HEZA 5E2NA 4KV0A 4QK2A 5J8ZA 1TB0X 5FL5A 1A42A 3KIGA 1G3ZA 1I9MA 4Q7VA 4E4AA 1CVEA 4CNVA 4Q83A 3B4FA 3KOKA 5EH7A 3RLDA 1BV3A 3N4BA 3C7PA 7CA2A 5JGTB 2WEOA 1Z97A 8CA2A 5G03A 3IGPA 4KAPA 5DSIA 1FLJA 4YGKA 1HEDA 1AM6A 4Q6DA 4Q78A 5LMDA 3P55A 3T5UA 4LHIA 4Z1EA 3V3IB 1G45A 2F14A 4QJMA 5FNGA 4Q8YA 3LXEA 4E3HA 3S72B 2O4ZA 1ZSAA 5SZ0A 1G48A 4R5AA 4FIKA 5EOIA 1YO0A 3MZCA 3OYSA 4XIXA 5EKMA 3OILA 3N2PA 1IF8A 2CBAA 2QP6A 4RIUA 5BNLA 2FMGA 12CAA 2AX2A 3NI5A 5AMLA 5E2RA 3KONA 1CVHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1IF9 A;  4WR7 A;  3MHM A;  1HCA A;  4XFW A;  2HKK A;  1BNM A;  1TEQ X;  4QIZ A;  4K0S A;  1JV0 A;  3D9Z A;  2HD6 A;  3SAX A;  5IPZ A;  4ITO A;  2VVB X;  3S71 B;  4E3D A;  4XZ5 A;  1AVN A;  4R59 A;  4XIW A;  1CA3 A;  4QK3 A;  3RZ8 A;  3HKN A;  3F8E A;  3B1B A;  5CJF A;  4QEF A;  1LZV A;  2QO8 A;  4M2U A;  1IF4 A;  3FE4 A;  2NMX A;  4Q8X A;  3RZ7 A;  1HEA A;  1TE3 X;  4QJO A;  3KLD B;  2AW1 A;  2CA2 A;  3M2X A;  1G52 A;  4UOV A;  1JD0 A;  3U7C A;  5DOH A;  4CAC A;  1TBT X;  2NWP A;  4K13 A;  5L3O A;  3RZ5 A;  4TWM A;  1Z9Y A;  4CNX A;  2WEJ A;  4E5Q A;  1RZA A;  3M1K A;  3S77 B;  1I9P A;  3S9T A;  3CZV A;  1YDC A;  4QJ0 A;  5EHE A;  3IBL A;  3P5A A;  1FR7 A;  2HFW A;  4Z1K A;  1BNW A;  1G0F A;  5FLT A;  4ZX1 A;  1DMX A;  4MDM A;  1AZM A;  1H9Q A;  2NNO A;  3N0N A;  1CNX A;  4M2W A;  3OIM A;  4PQ7 A;  2NNG A;  3Q31 A;  4ZWY A;  1KWR A;  5E2M A;  5JG3 B;  1BNV A;  4KUY A;  4Q07 A;  3D8W A;  1FQM A;  4DZ9 A;  3HS4 A;  1YDB A;  1G0E A;  3P3J A;  4Q09 A;  3KWA A;  5E5U A;  4PYX A;  1LGD A;  3ML2 A; 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