5C04A

Crystal structure of the f37h mutant ahpe from mycobacterium tuberculosis
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
153
structure length
153
Chain Sequence
b'SMLNVGATAPDFTLRDQNQQLVTLRGYRGAKNVLLVFHPLAFTGICQGELDQLRDHLPEFENDDSAALAISVGPPPTHKIWATQSGFTFPLLSDFWPHGAVSQAYGVFNEQAGIANRGTFVVDRSGIIRFAEMKQPGEVRDQRLWTDALAALT'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The active site architecture in peroxiredoxins: a case study on Mycobacterium tuberculosis AhpE.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative peroxiredoxin MT2298
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule tags Oxidoreductase
total genus 54
structure length 153
sequence length 153
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2015-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5c04A00
5D9VA 2D2ZA 4BA7A 1EGOA 3G9BA 1AW9A 1F6MC 4P3YB 2LKUA 3LSZA 1M99A 4TOPA 4L8EA 1WMJA 2JU5A 4OO5A 1OE7A 2L4CA 2E2MA 5ECMB 3IRAA 4OFTA 4EDZA 1TRUA 2B5XA 3H4KA 1CQHA 3Q6OA 5KN3A 1JZDA 1U3AA 4TN8A 1VF3A 3O3TA 4HEA2 1U3IA 4YQVA 2H71A 3FR9A 3KH9A 3FZ5A 1XWCA 3F63A 1TKDB 1ZL9A 1NHOA 1DE2A 4ULXA 5IO0A 4EKZA 3HVVA 4EXJA 4J57E 1OE8A 2H6YA 4KGIA 4K2DA 1GTAA 4MJCA 3W8JA 3WYWA 1WWJA 4ML6A 5CRGA 1K3OA 2A2RA 5D9XA 2C80A 2WZ9A 1T4YA 1XPVA 5ECPB 1ERUA 1JZWA 5D9WA 1BEDA 2KLXA 3ERFA 4HQSA 5FHIA 3GH6A 1TK8B 2H0IA 1GNEA 3D5JA 3IV4A 14GSA 3ZMLA 1GUHA 1YF0A 3DD3A 1IYHA 2GT5A 4K7IA 4HOJA 2AB6A 4WEYA 5C04A 3TRXA 4ILFA 5CREA 1SJZA 3A2WA 1JLVA 2RIIA 4HUAA 3MDKA 1EZKA 2J23A 4I8BA 3D0ZA 1LBKA 3ZZXA 5G5FA 4X0XA 3ZLPA 3DMLA 2H76A 5DBQA 3LQ7A 1MTCA 4MJBA 2H70A 1VF2A 2DJ2A 1EOGA 3QD9A 1GLPA 4EUYA 2IPAA 1RQMA 3RAZA 4N10A 4ZBAA 3EU3A 1YJ6A 1SYXA 4NXIA 1AQVA 5FT3A 4NHZA 2K8SA 2DBCA 4PUFC 1F37A 2R4VA 1BG5A 1MEKA 3KZQA 3DEXA 3TJFA 3F3RA 1XIYA 1NHYA 2PBJA 2F8FA 2OE3A 2VL3A 5CO3A 2H8LA 1PD21 3LG6A 1GNWA 3GRXA 6GSYA 4RI7A 4TR1B 17GSA 1PKZA 2B7KA 3CBUA 3DGQA 1VF4A 1A2LA 1M2DA 3I43A 3M1GA 2R5GA 1WJKA 2YZHA 3GFKA 2X8HA 1EEJA 4TR1A 2RM6A 1R5PA 1J0FA 1TOFA 5GZZB 3DWVA 2AAWA 4Z7XA 3LGCA 3UL3A 2N5BA 5A4WA 4IHUA 1DBYA 4KSOA 3LYPA 1B4PA 5HR0A 5G1KA 2L4QA 2LRNA 3CMIA 4V1Ap 3HJPA 3FK8A 18GSA 4L0UA 2C0EA 3GX0A 3L4NA 1V9WA 3UJ1A 2V1MA 2KP2A 2J9HA 3GMFA 5IMFA 4BPYA 5HFKA 4WBJA 4HS1A 9GSSA 3QMXA 2IWTA 4XCSA 1NM3A 5IMZA 1HNBA 1O85A 1SJIA 5KN0A 3L9VA 3TJGA 4IKHA 5D96A 2LEGA 4HDEA 4DVCA 4HU9A 3BCIA 2VCTA 1ZCPA 5G30A 2XPDA 4JEDA 2F3MA 1TU8A 3GN3A 4PUAA 4TR3A 4WR4A 2MBTA 2V2GA 5B8AA 2GQLA 4KH7A 4IJIA 4FIWA 3EVIA 4POMA 4O32A 2OE0A 5LD0A 4POLA 4EF0A 1PRXA 3K8NA 19GSA 1DUGA 3VK9A 5JCUA 3ZYWA 3I6AA 5KEJA 1XVQA 3E0UA 3TUEA 2CVDA 3C71A 4QL9A 3I9V2 3WGDA 1AC1A 20GSA 2K6VA 1ABAA 2C3TA 3EWLA 4BVXA 1B4QA 5A5KA 6GSSA 2B5EA 3ZIJA 1NSWA 3FZAA 4IVFA 4XRAA 4BWSA 3UEMA 2FLSA 1AUCA 2DMMA 1SENA 1V98A 3HA9A 2PGTA 3ZRDA 2H73A 1Z7PA 3ZREA 2FWHA 4Q5FA 2GSSA 2H0HA 1EEMA 4K1FA 4AJ7A 1QUWA 4EC0A 3HVXA 3IR4A 2GDRA 4RI6A 3F6FA 2CX3A 3FZ4A 2YZUA 3UVTA 3A3TA 4MPGA 5G5EA 1F3AA 3KP8A 3QAVA 5KN1A 3G7IA 3HKRA 2CZ2A 4OD7A 3ZTLA 1PQNA 2DIYA 2DSAA 2GS3A 2O89A 1M2BA 3M9KA 2H19A 1SJ6A 2H1GA 2IL3A 3TRPA 5HR3A 2H0GA 2VD1A 3SBCA 5IO2A 1R5AA 2NBSA 4GSSA 4WF4A 3LORA 4HZ4A 5C00A 3IOSA 1THOA 4XS1A 1YF1A 2AJQB 3H93A 1GSUA 1TDIA 3MNGA 5JCGA 2VCVA 3Q18A 4KSMA 4L0WA 13GSA 2L6CA 3M8NA 2C8UA 4CHSA 2OKAA 2RUFA 5IMAA 5B8BA 4LLRA 4HI7A 2VIMA 4NMUA 4N0VA 3IPZA 5DALB 1F2EA 3GTUA 5GAPD 2H1AA 4IP6A 3EMPA 3CSHA 4ISDA 3APSA 4MZWA 2LTKA 1G6WA 3UMAA 2GT6A 1XWAA 5DALA 5IMCA 5ID2A 5J41A 4OFMA 4TR0A 1HNCA 3GA4A 2OBIA 5IOXA 4MP4A 3PGTA 1XOAA 1XWBA 3W6GA 1YKCA 3EINA 5LCZA 4V2LA 4XTSA 3GL3A 3BJ5A 3F4SA 2G2QA 3ERGA 4X1UA 1PL2A 3VFIA 2ON5A 2ZCTA 3ZITA 1THXA 2L59A 3KM6A 3VWWA 3GSSA 2R3XA 3RDWA 2CV4A 1GSQA 1PL1A 4HJMA 1YDKA 4F0BA 1UN2A 1E2YA 2MMNA 3P7XA 2HSHA 1SK0A 4ZL8A 4QL7A 1BAYA 1X5DA 4PNFA 1O7UA 3FEUA 1Q98A 3RHBA 1OKDA 1B8XA 1ZGNA 1BX9A 2NTOA 4ZB6A 2VLUA 1RW1A 3APOA 4PURA 22GSA 1SKWB 4JE1A 1FVJA 2YV7A 3RPPA 4K0NA 4K9ZA 1PGTA 5HR1A 3ZFBA 4K0GA 2YWIA 2X8GA 2LNTA 4KAEA 3HY2A 2X64A 1FOVA 5IOWA 2N5AA 3GL5A 3ERWA 2HNLA 3BBYA 1EV9A 5J5NA 2VD0A 1ST9A 2WCIA 3HDCA 2VUPA 4N11A 2VL9A 5GSSA 2YOIA 4E8HA 4GRFA 4KCAA 4HU7A 6GSTA 3J7Yk 1Z9HA 5DJMA 1H75A 3EURA 4DSQA 2GQKA 2FY6A 3GURA 4WXTA 2HYXA 12GSA 5IMVA 2KOKA 1OKTA 2H01A 3TKSA 1EV4A 5CRHA 2JSZA 3IK7A 2CQ9A 3CRUA 4IP1A 1Z7RA 3FZ9A 3ZVJA 4O5RA 2O87A 3TKPA 2I9HA 1EWXA 4ZIJA 4E8EA 2YNXA 1O81A 1JZRA 1TK0B 2NPBA 1SL0B 2E0QA 1J9BA 2V32A 2XBQA 1T7PB 2H74A 4KA0A 2DJJA 3PH9A 3NIVA 1Z5YE 2C3NA 1ZOFA 1DSBA 5GAND 1ZYQB 2VOCA 4HZ2A 5LNKe 4MJEA 3RHCA 3A2XA 3M3MA 5D8IA 3R2QA 3NZNA 2GSRA 4ZL7A 4G9HA 3IAS2 2AHEA 1OC8A 3UBLA 2HLSA 3ED3A 2C3QA 5F8BA 4GLTA 6GSUA 5HFIA 2ZNMA 4I97A 2AYTA 1VRSD 4MA9A 5F05A 1SD9A 2FUG2 5H5SA 4RUVA 1UVZA 5EVOA 1TRVA 1XZOA 2L5OA 1K0AA 1J08A 5AIVA 3KMOA 4MF6A 2VAFA 4AF2A 4G10A 3RPNA 2H1DA 4ZXGA 3UOMA 2VLTA 2PU9C 1O6JA 1U6TA 1A2JA 2PN8A 4PX1A 1T4ZA 3UIWA 2HZEB 3GHAA 3PINA 4MZCA 1QFNA 5IQYA 3W8SA 3C1RA 4N30A 4L5OA 3E3EA 1WOUA 2H66A 2FA4A 2QC7A 1DE1A 1V58A 5H5QA 3H79A 1YEPA 2MYGA 2GVPA 5ECRB 4I6XA 4MF7A 2HZEA 3TJJA 5ECQB 5J9CA 2CVKA 4PGTA 1X9SB 1PA3A 3GX8A 2B6MA 4BL7A 2X8CA 1M9BA 4QQ7A 2V6OA 3GKNA 1I9DA 1GRXA 2XC2A 2V41A 2KUCA 5ECOB 5CRWA 4MDCA 2JL4A 3G7YA 3VI5A 1MD4A 1ZYEA 2CAQA 4NHWA 2DJ3A 3EYTA 1GSEA 3J7Yb 1OC3A 2REMA 4ZILA 4V1Ag 2TRCP 4YAPA 2VO4A 4PQIA 3VLNA 3HYPA 2GLRA 4Q5RA 3KJYA 5ELAA 5D73A 1TRWA 1SKRB 4TXOA 1LU4A 1RK4A 2HXKA 1YKAA 1UC7A 1HYUA 2H6ZA 3KH7A 1YY7A 1BYEA 5ECKB 2C1YA 1QMVA 2OBKA 5F07A 3CTFA 1FG4A 1JZOA 4TVEA 3FY7A 4IJ3A 4MABA 2O8VB 2LRTA 5ENUA 3CTGA 1FHEA 2QKEA 1GWCA 2LQQA 4AGSA 4ECJA 5HR2A 1PN9A 5CYYA 1JLWA 2VLVA 2XBIA 3TOUA 3DYRA 5ECIB 3DVXA 1PKWA 5DQSA 4GWRA 1FO5A 3TB2A 3C73A 1WRYA 2GZPA 4HQZA 4LA1A 4GQCA 4WKWA 5D9TA 2IJYA 1TI1A 1TP9A 3P2AA 2GZYA 1W89A 2YPMA 3VURA 1YEXA 4GF0A 1MDKA 1ACVA 4X43A 2VCQA 1TXXA 1A0FA 4YH2A 1R7HA 4FYCA 5HQPA 5IIZA 1GSFA 1A8LA 3HHVA 2YANA 3IA1A 2MMZA 1XW9A 5L71A 2YJHA 1VF1A 1GSDA 1XCCA 3FKFA 1TW9A 3QPMA 1AQXA 1GSSA 3F8UA 1GLQA 1SD8A 2B5YA 3C7MA 4K6XA 3GKKA 4J56E 2I1UA 1GUKA 5FWGA 2KP1A 1K0OA 3BCKA 4WETA 2R6KA 3M0FA 1ILOA 5JWOB 3MAKA 4K8MA 4KDUA 3A2VA 4NWYA 2LV3A 5G31A 4CW9A 2FNOA 1ZZYA 3ISOA 3PR8A 4PQ1A 2GSQA 4FO5A 2HFDA 1Q4JA 2HI7A 3GTUB 4IQ1A 4ECCA 4KDYA 4NPBA 5DJLA 4CDOA 4BWQA 3DXBA 2P0GA 1BQ7A 1K0MA 5E59A 1R4WA 1YQ1A 3KP9A 4EL1A 5ID2B 4LMVA 5CAXA 3VWUA 2O7KA 2A2SA 10GSA 1QQ2A 3C8EA 4XHMA 1X0RA 3FRCA 4D73A 2MMOA 2V6KA 2GGTA 3EE2A 2PPTA 4LL4B 1WE0A 2LNSA 4I5QA 1F9MA 4XRDA 2ON7A 2HE3A 2DJKA 1A0RP 3LWAA 2FWGA 1YZXA 2P5RA 4XS6A 1SL2B 2YV9A 8GSSA 1VGLA 1TJDA 2H75A 1XOBA 2RUEA 3QFBC 5GSTA 7GSSA 2LJAA 4TRXA 4MZBA 4PNGA 4MCUA 4FH8A 3GIXA 4OMVA 1N2AA 1O8WA 1PSQA 1JHBA 3MSZA 1OVNA 3ZL5A 4GSTA 4DEJA 2P5QA 3UVHA 3ZVJD 2RLIA 3F6DA 3TDGA 2IMDA 1T1VA 3LJRA 4F82A 2OA7A 3LXZA 4IQAA 2CX4A 1TI3A 2BJXA 2WRTA 3QAGA 3VPTA 1B48A 2LJKA 5DQYA 4DSRA 2NDOA 3UAPA 2PUKC 1GP1A 3D4TA 2DJ0A 2L6DA 2B1LA 3H1NA 3TKRA 2EIQA 4FYBA 3RBTA 4TXVA 1FVKA 1EP7A 2DJ1A 2IMFA 4NV5A 2M46A 1ERVA 3VWXA 3IK9A 4KNDA 4DSSB 4YQMA 3F4TA 3D4MA 1X5CA 5DCGA 3D6IA 2IMEA 1A23A 16GSA 3KTLA 5CRDA 1K0DA 2HZFA 5D93A 5DDLA 3ZIVA 4DSSA 1TU7A 1HQOA 3TCOA 2AUVA 1ERWA 5B6MA 5INYA 2MBSA 4XIHA 2ZUPA 2NVLA 2VM2A 4PXOA 1NW2A 1K0NA 3TRQA 3APQA 2PMTA 2H72A 5EL8A 2WS2A 2YJ7A 2PERA 4F2IA 3QOUA 2HRNA 1FAAA 1SL1B 2JZTA 3TJKA 1WP0A 2FWEA 3F4RA 2EC4A 1G7OA 5ECLB 1QK8A 3LYKA 2R2JA 4J2FA 4AJ6A 3QDNA 5DCHA 1OC9B 1HD2A 2ES7A 1WPIA 2O85A 5F06A 3A5WA 1Z6NA 2IIYA 5CNWA 5IPGA 1GTBA 4F0CA 2PWJA 1KTEA 4NAXA 1W4VA 2LRCA 1PX6A 2YP6A 5J9BA 4MK3A 1OC9A 5DVBA 3GKXA 3MWHA 4OO4A 2YCDA 4V2NA 4F9ZA 2F8AA 1GUMA 2E2GA 4EVMA 3F9UA 3L0HA 2CAIA 2VL2A 3QFAC 2B7JA 1O8XA 4TW5A 3DIEA 4LMWA 4OCEA 4G2EA 2JSYA 2BMXA 1SYRA 2DIZA 3P8WA 3CRTA 1O73A 2IMIA 4IELA 3P90A 1U87A 3DKSA 4ECIA 2CA8A 2HRFA 3GUSA 2K18A 2BTOT 4YQUA 2I4AA 4TKYA 4G19A 1SK2A 1B9XC 5E4WA 2L5LA 2X99A 2C0DA 2CZ3A 5DAKB 3NOFA 4MPFA 3GKMA 2GQMA 1R26A 2WJUA 3TKSE 1ON4A 3L9UA 1G6YA 1G7EA 2WB9A 1TK5B 3KEBA 1C72A 2K9FA 1Z3EA 2LQOA 2GTUA 5DAKA 3G7JA 4ZBBA 2A4VA 4JBBA 1Z6MA 2FWFA 5F0GA 3O6TA 4EE0A 5A4VA 1X9WB 1TRSA 2VM1A 2QSIA 1F3BA 4F03A 4O92A 3GV1A 4KX4A 3N5OA 2HT9A 1OYJA 1UA5A 3V1WA 4ZBDA 3WD6A 3IAM2 3Q74A 5JWQB 1S3DA 1M0UA 5JCWA 3IC4A 2IMKA 4MH3A 3VWVA 6GSVA 1A8YA 2C0FA 1SU9A 3ME7A 2GZZA 1S3CA 2FD3A 4FYUA 2IFQB 3Q19A 2WFCA 3F0IA 3CSIA 2FA8A 1XWKA 4TXOB 2L57A 3GH9A 1A2MA 1B9YC 2B1KA 1XWGA 2IFQA 3VI7A 5ELGA 2R37A 4YAVA 3ZMKA 5AN1A 1GULA 2EIRA 4KW6A 5COHA 1JFUA 4MMMA 1IYIA 1TTZA 1KBNA 4GSNA 3N9JA 4JRRA 4WBRD 4EDYA 3UARA 2PVOC 4MF5A 4XS4B 1X5EA 3EU4A 5IMDA 5EPFA 1URMA 4POBA 1CQGA 5AGYA 3HJOA 3AY8A 3JCML 4L5LA 6GSXA 2AV4A 4GQFA 2LSTA 2OACA 4XS4A 4KUNA 2E7PA 3UBKA 4RQXA 1ERTA 2OE1A 2WGRA 3I69A 5AISA 3E9JB 1AXDA 3GYKA 3TJBA 3U6VA 5ABRA 1QXHA 2QGVA 4V2MA 3CSJA 3D22A 3IE3A 4LL1B 1M9AA 2RM5A 3H8QA 3WGXA 3QCPA 1EOHA 3HVSA 4WF5A 3M9JA 4TR4A 1SKSB 1Y6EA 2OADA 5KN2A 4GCIA 4KB3A 1A24A 3EC3A 4ML1A 2TIRA 1X9MB 3HZ8A 1V57A 3TGZA 2IN3A 4ECBA 2YWMA 3FHKA 2LS5A 4I2TA 4WR5A 3GSTA 3KCMA 3US3A 2EIOA 5HFGA 1K3YA 2JADA 2P31A 4BVYA 1USBA 1HNAA 3ZFLA 4PQHA 4EO3A 4KE3A 3KGKA 1MD3A 1Y25A 5ECHB 2DLXA 1KNGA 4JR6A 1T8EB 2HSYA 2H30A 3FW2A 3LFLA 2XHFA 2TRXA 2CT6A 2KHPA 1XFLA 3S9FA 5H5RA 3HJMA 3FR3A 2VCWA 4N0ZA 4RQRA 3L9SA 1PX7A 3QAWA 4KDXA 1PMTA 4K7OA 1U88A 1I5GA 5ECSA 1AQWA 4ID0A 1GTUA 1WIKA 4GTUA 4IS0A 4D73B 1M7TA 4KCEA 2F51A 1QGVA 1MDJA 4IN0A 3DRNA 2OJLA 3TOTA 3IHQA 1EP8A 3FYGA 5CP1A 4ZL9A 4OFNA 2DC5A 2PVQA 1T00A 3KMNA 2JZSA 5G1LA 3D21A 2YWOA 3WT1A 3TKQA 2JACA 4JU5A 5IM9A 2GSTA 2B3SA 2FGXA 3KIJA 1EGRA 4Q5QA 3FR6A 3LXTA 4I2UA 3QR6A 2FHEA 3IDVA 1FW1A 3F3QA 3HXSA 2Z9SA 4MJAA 5A4UA 5EY6A 4IGJA 1OAZA 2ALBA 1SK1A 3GNJA 1MDIA 2I81A 2K8VA 4IBPA 5G2ZA 1K0BA 5JWRB 2YWNA 5IPHA 2C0GA 2H1BA 4AJ8A 1KEBA 11GSA 3CYNA 2JZRA 3TKSC 4MLYA 3L78A 4ZB8A 1V2AA 4NV2A 4GXZA 1XXUA 5ECNB 3O76A 5AIXA 1BJXA 1S3AA 4O7HA 2LJRA 1N8JA 3HD5A 3WGEA 3VPQA 1GH2A 3OR5A 3DVWA 2LUSA 1ML6A 1V40A 3IXRA 4OCFA 2VCXA 5B6NA 4K7NA 4JR4A 1FB6A 1M2AA 2C4JA 2FCHA 1GSYA 1T3BA 5B7CA 2N5FA 2XPEA 1K0CA 3SWLA 2WDUA 3EMXA 1AAZA 3HZ4A 2VL2C 3ME8A 2I3YA 4IW9A 5J3RA 1H4OA 1G0TA 4MH2A 2WULA 1GL8A 2F9SA 1LJRA 2G0FA 3LEFA 4H86A 4ZB9A 6GSWA 3U5RE 2DMLA 5J4UA 1AIUA 2H6XA 3C1SA 4HJ2A 4ACSA 1E6BA 3CXGA 3IBHA 3KTBA 3KXOA 3BD2A 3WT2A 2YN1A 2M72A 2VCZA 4POKA 4Q5NA 1XBSA 3HCZA 1XVWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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