5CBRA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the antagonist (s)-2-amino-3-(3,4-dichloro-5-(5-hydroxypyridin-3-yl)phenyl)propanoic acid at 2.0a resolution
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
publication title Studies on Aryl-Substituted Phenylalanines: Synthesis, Activity, and Different Binding Modes at AMPA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
total genus 87
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cbrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cbrA02
3CSGA 4YB6A 3HPIA 1EZ9A 1QUJA 2H4IA 3MJNA 4G68A 1D4NA 4F3PA 3C34A 1HSEA 4F1YA 4K3FA 1B4HA 1NNPA 1B51A 1VE4A 3MVXA 2ZYOA 1ANFA 3OMBA 1B7ZA 1MXWA 3T9UA 1QKAA 4R2BA 3Q25A 3H6UA 4F29A 3O6IA 1FTOA 3IJOB 2HAVA 5I2NB 4M1VA 4RYAA 1MY0A 4O3CA 1XT8A 5M2VA 3MUQA 3OSQA 5I59A 2DVZA 4C1TA 1J1NA 3VE1B 3U1OA 2P1SA 2W7YA 2V3UA 4ND9A 3O6GA 4M4GA 4RPNA 4F19A 3IB1A 5CMMA 5H8SA 3PUYE 5AA2B 3QXMA 3LSWA 4F3SA 2ANJA 5I2KA 2PVUA 2F8DA 2F6GA 4NEDA 2D5WA 1XVYA 1OQHA 3PPPA 1URGA 4F3GA 3ILUB 5KZTA 1UQWA 1WODA 4ZECA 1H3DA 5DEXB 4EF1A 2ZYNA 4EQBA 4WEDA 1XVXA 1JW4A 3MP6A 2F36A 1TFAA 1P99A 4U23A 4RJZA 3HHFA 2ZXTA 4DCXA 4ZEBA 4LUBA 4U4SA 3N94A 4H5FA 3OO8A 2Y84A 2HXWA 4XTCQ 1GR2A 1ATGA 4R73A 3TQLA 3PMVA 3U92A 1FTLA 4U1OA 4UACA 4OENA 3RLFE 1PB7A 5CBSA 5TP9A 3MP1A 4OFLA 4N13A 2I49A 2H25A 3RQTA 3IB2A 2XX9A 1XC1A 4R74A 1HSJA 2DQVA 3B6WA 3FVKA 3FZVA 5TU0A 3B6QA 3M3LA 3GBBA 2O69A 4PFUA 1MDQA 4BDNA 3MBPA 3RY3A 3OOAA 1B3LA 3CG1A 2GH9A 4G77A 4OMBA 1PEBA 3R7XA 5L8DA 3GXAA 1Z7NE 3RTWB 3TFLA 4E0XA 2XXUA 1N3WA 4G8HA 4TLLB 2ZMBA 3MQ9A 1VFDA 4POWA 3RGYA 1A40A 3VVEA 4U22A 4Q5TA 1NH7A 4GWOA 1URDA 2HCAA 3KGCA 4GLIA 4JBZA 2XXIA 5DVFA 4XKPA 1B2HA 3LR1A 4DLDA 2OJTA 3ODBA 4F22A 3PUWE 1RYOA 2QRYA 3H03A 1P1NA 5AA2D 5ISUA 1MXUA 3IO6A 2F7BA 4U4XA 3HSTA 3IX1A 2DE3A 1S9TA 4PQJA 2ZNTA 2X7QA 2P2AA 2ONSA 4AQ4A 3O9PA 2DXYA 1LFHA 2UVIA 2Q88A 2Q2AA 4X48A 3C32A 2I6EA 4IB2A 2F34A 3FXRA 2D21A 3LC8A 4LQ5A 4PE5B 4QF9A 3ZS6A 4OVJA 1D3KA 3G3HA 1B32A 2FNCA 5CC2A 2Y7IA 2B65A 4KPTA 2HFBA 4RK9A 2Z8FA 3SETA 3PUZE 2V3QA 3FXUA 1R6ZA 1OLCA 3ZKLA 5KCJB 3LSFB 3V83A 1USYH 5I56B 4GD5A 4ELPA 3K4UA 5JK4A 1ZU0A 2I3VA 4GXSB 2QPQA 2QSXA 5ITOA 4XKQA 3DP6A 3K02A 3FV1A 1B7UA 4JSOA 1LFIA 2VD3A 3T9XB 1LCTA 3SERA 5I57A 4QFPA 1DPPA 3Q26A 3DM0A 1BTJA 2BJJX 4IO2A 3TZAA 1NH8A 1YAEA 5I58B 4EXLA 5FHMA 1B3GA 4ELOA 1B5HA 1LLSA 1CB6A 1FQAA 1I6QA 3CRBA 1MQJA 3UORA 1HSLA 4I1DA 2OLBA 3PGFA 5JTYA 1QULA 4GFRA 2PT2A 1CE2A 5ICQA 1IEJA 1QUKA 1FCKA 1H76A 3H6TA 3MW0A 3LSLA 1UTHA 4AB5A 3QUFA 1A8FA 4GOTA 3I3VA 1O63A 3ECRA 1B0LA 2O6AA 2R6GE 3TQWA 2QS1A 1MDP1 4WKMA 1SI0A 1MXVA 4ZEIA 5H8HA 1US5A 5LOMA 2M8CA 3IOVA 1POY1 4NF4B 3K01A 2F7CA 1US4A 2F7AA 4FEDA 3MPKA 4OTEA 1Z7ME 2RCAA 2GHAA 1B3FA 4JSDA 2Q89A 4NWDA 2OZZA 1POTA 2UVJA 3BFTA 2XD2A 1FQEA 4KI0E 2QS2A 5AA2A 3V89B 2P0SA 4U21A 4OFJA 1JW5A 1IUDA 1IXGA 3A3CA 3ONMA 1QKBA 2DWJA 1NNFA 1O64A 3B6TA 5EHMA 1ELJA 3F11A 2Z23A 1OIBA 2NOOA 3OXNA 5CMBA 4OERA 1VFEA 2WKYA 1MXYA 3CFZA 2XXPA 4Z0IA 3MVZA 1R9QA 4KCCA 1DPEA 4BLAA 1A99A 4IGRA 4Q30B 5F1QA 1PBPA 2LAOA 3HN0A 4HTGA 3MWBA 4QRZA 4BDMA 1OVBA 1SBPA 1Y3NA 5H8QA 1SYHA 3BFUA 2NVUB 1MY4A 3TCFA 1NKXA 5H8NB 4TLMB 4E0WA 4DXCA 3PMWA 4QFOA 3CSBA 1JQFA 4YICA 3RT8A 1IIWA 1XHYA 3FGSA 4H1XA 4ESWA 3PPRA 2XXXA 3FVNA 3KOTA 4H65A 4RXLA 2DWAA 3TTRA 2XXYA 1MQDA 2H98A 5I84A 5K2YA 3C36A 1UIUA 1UTBA 2PT1A 3OD7A 1P1QA 2QMWA 1M5FA 3OELA 3UGWA 1DSNA 4F18A 1R9LA 5CRYA 2XHDA 1DTZA 3E3KA 4NMYA 1Y4TA 1ZLQA 2ESNA 3FXQA 1B6HA 3PU5A 1PB8A 3I5OA 4NF6B 3FJMA 3VLWA 2REGA 4GQOA 3QK6A 3USDA 1JEVA 5TPAB 1RYXA 5DVJA 4N6PA 3PD9A 1FQFA 5H8FB 5IAIA 1MY2A 4OQOA 4QFLA 2UXAA 3H7MA 3G3FA 4ZZAA 3K6XA 2VD2A 4KCDA 2NXOA 1R1NA 3C35A 4XXUA 1H44A 3FATA 4MH5A 2THIA 2YPNA 3C4MA 1A7LA 2Z8DA 2O7UA 1EZPA 2F35A 3E4RA 5KCJA 2PMSA 3FVGA 1SD3A 1SQYA 3K6WA 2DS9A 3L6GA 1S50A 5I56A 2X7PA 2ONKE 2A5TB 3TKDA 3IORA 2Q8JA 4EUOA 2Y7KA 4YB5A 3N6TA 2ZNUA 4N07A 5EHSA 1JVYA 2F5XA 2DE4A 1OMPA 3EQ1A 3S4UA 3VXBA 1H45A 4XKRA 1SW2A 2F6PA 3TCHA 3UP9A 3TTMA 2UYEA 4JB7A 4F2OA 2NUVA 3KN8A 1YCJA 1Q35A 3KZGA 5I58A 1LCFA 3RN8A 3AXFA 3TCGA 2NWJA 4C0RA 1Y1ZA 4THIA 1BP5A 4PFTA 2DP8A 5AA4B 3EHSA 3QYTA 1TWYA 5CMKA 3RT6B 4YAHX 2RF1A 4IO3A 3W9VA 4F1UA 1LGBC 3QUJA 2CZLA 4ZE8A 3V8XB 4NF8A 1JETA 3N5LA 4G68B 3FJ7A 4LVQA 3UIFA 4ELQA 4IO5A 4KYSA 4EQ7A 4OETA 4I62A 3M3FA 1MG1A 2ONRA 1BKAA 2UYFA 4NF5B 3RNNA 2I0CA 3SEYA 4PFWA 3S9MC 2IEEA 2R71A 5KDTA 3TDJA 1I69A 5I59B 3IJXB 4G8MA 3KJTA 3T66A 2DWIA 3E13X 3O29A 4NE4A 4R72A 1VSOA 4X1DA 1GV8A 3JV9A 1P1WA 1PC3A 1F9BA 3T93B 4PFYA 3SEXA 1WVJA 4DCYA 5I2KB 1GVCA 3SESA 1IITA 4ZEKA 4IO6A 1D9VA 2F97A 3OO7A 2REJA 1A8EA 4MBPA 1TFDA 2ALUA 3A09A 1SW1A 2HZKA 4ESXA 1AIVA 1Y4CA 3U72A 1T0KA 4LATA 4DZ1A 3T96B 3LBSA 2R9JA 3TUSA 1B4ZA 4TOZA 2YLNA 3CIJA 1YPNA 4Q0CA 4ZE9A 3QAXA 2HAUA 4OFOA 1B58A 1M5CA 3A3UA 3SKPA 1N3XA 1IXIA 4KHZE 4L17A 1MY3A 4KFQA 2VOZA 1TT1A 1B1HA 4KR5A 4F39A 1P1UA 3H3GA 4OHNA 2QL3A 3P7IA 1M5DA 3VVDA 5BUUA 4QFKA 5A5XB 2Y7WA 3MZ9A 3FJGA 1A55A 4AB6A 3G3JA 4JWYA 3FD3A 2XXTA 3IOTA 3KN3A 2RKMA 2HEUA 4H8JA 4LP2B 3EF7A 1IXHA 3LSXA 1QW0A 4EF2A 5CMCA 2ABHA 3Q29A 1USYE 2XXWA 4ISUA 3S9LC 2GRVA 4RY1A 3KFMA 5I2NA 3IO4A 1FTMA 4NTLA 3WAEA 1AOVA 5TPAA 1QJMA 3U93A 1SYIA 3FASA 3H6VA 2F78A 4LZ7A 2QMXA 3K1PA 3PUVE 1LAGE 4OESA 1N76A 4YKKA 2OWSA 5B70A 4X1BA 3G7WA 3JYRA 2XXQA 3MVWA 2E0SA 5K2XA 1B5JA 3VFJA 3TYHA 1H43A 5CI5A 1D9YA 4P0IA 1BIYA 2RC9A 5B7DA 2V25A 3MC2A 5BWJA 4ZS9A 1N04A 1ZJLA 4MLVA 5DEXA 3OENA 2OK2A 5HPQA 4C1UA 3PPNA 4YKIA 1Y9UA 4RNSA 3H6WA 2RINA 4I9DA 3K2DA 3Q28A 4GL0A 1FTJA 4YU0A 3DP4A 1Y3PA 2AIXA 1ZBMA 4HS7A 2O1MA 3G3GA 3KBRA 3EHUA 4ZZEA 4BDLA 1O7TA 4H8IA 1L5TA 3R26A 2DE2A 3RPWA 4PP0A 2GHBA 2FYIA 5I57B 3PV0E 3OEKA 2QS3A 3T9HB 3K00A 1MRPA 2HQ0A 4GIZA 4G4PA 3K0VA 2RC8A 1I6AA 4QSDA 4DDDA 4NWCA 2XXHA 1NNTA 3K1NA 2FA7A 4O3BA 1N84A 4H67A 3WAFA 4GF8A 3SDFA 2XXVA 5JTYB 2B3BA 3S2VA 3I6VA 4HCWA 3MPLA 4LA9A 4HW8A 2I4CA 3HHGA 2G93A 4DE8A 1AMFA 4QSCA 2XX8A 5DVIA 1UTHB 2IA4A 4LZ8A 3V5AA 1B1XA 4F1VA 2Q2CA 4G8NA 2I0BA 2A5SA 2O68A 5H8HB 4ECFA 3SEVA 1UIVA 1MXZA 4NF5A 4R6HA 4ONYA 1MQGA 5F7VA 5FHOA 1SVXB 2O1LA 4H0WA 3RUMA 1ZKBA 3ILTB 3CG3A 4RK2A 4YKPA 3CI8A 4X9TA 3SEWA 1SDXA 4WXJA 4F3BA 2KLFA 2GFEA 3RTFB 3H06B 2DXRA 1QUIA 1LAHE 4KYEA 2O51A 3FV2A 3N6UA 4FE8A 2DSFA 4YB7A 3O97A 5L9MA 4BDRA 1II5A 1MPBA 4YMBA 1PBQA 3IOUA 1MY1A 4FAJA 1YTVA 1OLAA 3Q27A 4JWOA 1XOCA 4YMAA 3OEMA 1MH3A 2E1SA 4LQ2A 3KG2A 4H5GA 4I8CA 4R6YA 1B3EA 4IY5A 4G2ZA 4G68C 1IZ1A 5IKBA 3VLUA 2UVHA 2PYYA 3H4ZA 2ZNSA 4FORA 4OEUA 3TELA 1DOTA 1SI1A 1B5IA 5JEIA 5EYFA 5H8QB 4ZDMA 5ELVA 4GL8A 2ZYKA 1TXFA 2QS4A 4MLQA 1XS5A 1QVSA 3D4GA 4F2QA 1B0HA 3EPEA 2QJEA 1ZMGA 1DMBA 2XXRA 4KD5A 3GLBA 4RA1A 5A5XA 1WDNA 4DXBA 3CFLA 2PBWA 5FTIA 1MS7A 1PDAA 3JZJA 1OQGA 2O7IA 4P11A 1B46A 3PMXA 3BBRA 3QSLA 4QFNA 3IAZA 1NNKA 1UTBB 1FQDA 2UVGA 5FTHA 1ZTYA 1NFTA 3EHTA 1MM6A 2OBGA 1Q1KA 4HCYA 2AYSA 4TQUQ 3TEPA 3W9WA 4NF4A 1EU8A 1SW4A 2XX7A 4LZ5A 4YZZA 3TAJA 5AA3A 2AL4A 3PPQA 5AA1A 1LBCA 1BLFA 1VR5A 3KSJA 5CBRA 3OO9A 1LFGA 2O84X 5L9SA 3FUZA 4GRKA 1N7XA 4R75A 3G3KA 3DP8A 5HBCA 4OZ9A 3UK4A 3TPAA 3U8QA 3GBAA 4ELRA 3N26A 1B52A 3GZGA 4JDFA 2Z22A 3HCQA 1Y3QA 3CFXA 3VDFA 1EH3A 2ZYMA 4KYDA 4H6DA 4P0GA 4LONB 1P1OA 3IL1B 2V3TA 2B3FA 2Q9TA 4FEBA 3VXCA 3HO7A 2X26A 4FJPA 4QSEA 1ZIUA 4IY6A 1LAXA 4XIGQ 4OWDA 1OVTA 5HM4B 2CMOA 3KSXA 1MM7A 3VVFA 2H99A 2OCUA 1N7WA 1JW1A 3TODA 3MZ1A 2DYXA 3DLNA 3TTKA 1JNFA 2I58A 4POXA 3G3IA 3DELB 1IQ7A 1AL3A 4EDPA 1JEUA 2I48A 2RC7A 3PUXE 3ZSFA 5TP9B 2DOJA 5H8NA 4R9FA 2RCBA 2VGQA 1NMUA 3KN7A 4DXUA 1PB9A 3FVOA 1M5EA 1KWHA 2V93A 5AE4A 4U1ZA 2VP1A 4MFIA 3KEIA 1FTKA 3O66A 3TTLA 3C31A 3BKIB 3MVYA 2I4BA 1NL5A 5FHNA 3M8UA 1MPCA 3IB0A 3TTNA 3CVGA 3UA8A 5CM6A 3ZKKA 4Q8RA 3OSRA 4IGTA 1MPDA 2YJPA 4OEVA 4OXVA 3HV1A 1RKMA 5DYHA 2HZLA 1MH4A 3EN3A 4GVOA 3O2AA 1Y1MA 3W15C 1DTGA 4KQPA 1B05A 2DWHA 3L6HA 3IK6B 4Z7EA 3SEUA 3R6UA 4EXKA 3KOSA 4YKJA 4FIMA 4NF8B 4NF6A 3PPOA 4PETA 4U2RA 4XKNA 3C9HA 3VLVA 3VV5A 5H8FA 2DVCA 4FATA 2PX1A 4DIGA 2V84A 3E9XA 1FW0A 2I3WA 2D3IA 4EQ9A 4MF3A 1LB9A 2AL5A 1GTKA 1B3HA 5KDTB 1IXCA 4IO7A 1JVXA 3CR9A 4UA8A 1LBBA 3M3KA 5J1DA 3O6HA 2OWTA 1B40A 3S9EA 4RPOA 3MZBA 4QHQA 1EZOA 1A54A 1LAFE 3S9NC 3B7DA 1GGGA 5ICTA 1AH5A 4FECA 2XD3A 4O3AA 1FQBA 5L9OA 1MXXA 1I6BA 1N0TA 2A5TA 3PD8A 2H9BA 1FQCA 4ZEDA 2G29A 4WEPA 4JWXA 5ITPA 2Y7PA 4ZEFA 3U94A 3KJ7A 4OYVA 1MQIA 4R6KA 4BDQA 3LUYA 3T9VA 2VHAA 3C33A 5DTBA 1URSA 3T22A 3K6VA 3THIA 3K6UA 3D4CA 1MQHA 2Z8EA 3UN6A 3IOWA 1LB8A 1SW5A 3QIMA 5DT6A 1S7YA 3OO6A 4F31B 1M5BA 3O28A 4R2FA 4BDOA 4JXIA 3IR1A 3MP8A 3K1MA 4GXAA 5AA4A 1B9JA 3MAMA 2H5YA 3FIRA 1B7HA 1LSTA 4R9GA 3TMGA 1Y20A 4IO4A 2Y7RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NOHA 3CSGA 4YB6A 3HPIA 1EZ9A 1QUJA 2H4IA 3MJNA 4G68A 1D4NA 1RDYA 4P8BA 1NUXA 4F3PA 3C34A 1HSEA 4F1YA 4K3FA 1B4HA 1NNPA 2KR0A 1B51A 1VE4A 3ISPA 3MVXA 2ZYOA 1ANFA 3OMBA 1B7ZA 1MXWA 3T9UA 1NV4A 1QKAA 4R2BA 4GX4A 4N6KA 3Q25A 3H6UA 4F29A 3O6IA 1FTOA 3IJOB 2XWKA 2HAVA 5I2NB 4M1VA 4RYAA 1MY0A 4O3CA 1XT8A 5M2VA 3MUQA 3OSQA 5I59A 2DVZA 4C1TA 1J1NA 3VE1B 3U1OA 2P1SA 1FBPA 2W7YA 2V3UA 4ND9A 3O6GA 4M4GA 4RPNA 4F19A 1YZ0A 3IB1A 5CMMA 5H8SA 3PUYE 2P3VA 5AA2B 3QXMA 3LSWA 4MNCA 4F3SA 2ANJA 5I2KA 2PVUA 2F8DA 2F6GA 2FHYA 3LUZA 4NEDA 2D5WA 1FBHA 1XVYA 1OQHA 3PPPA 4MIJA 4PBHA 5A5LA 2WEFA 1AWBA 1URGA 4F3GA 4NN3A 3ILUB 2FIXA 5KZTA 1UQWA 1WODA 4ZECA 1H3DA 4PFBA 4GWSA 5DEXB 4EF1A 2ZYNA 4EQBA 4WEDA 1XVXA 3E79A 1JW4A 3MP6A 2F36A 1TFAA 1P99A 4U23A 4RJZA 3HHFA 2ZXTA 4DCXA 4ZEBA 4LUBA 4U4SA 3N94A 4H5FA 3OO8A 2Y84A 4N8YA 2HXWA 4XTCQ 1GR2A 5I5PA 1ATGA 4R73A 3TQLA 3PMVA 3U92A 1FTLA 4U1OA 4UACA 4OENA 3RLFE 1PB7A 5CBSA 2Y5LA 5TP9A 3MP1A 4OFLA 4N13A 2I49A 2H25A 3RQTA 4PDDA 3IB2A 2XX9A 1XC1A 4R74A 1HSJA 2DQVA 3B6WA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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