5CBRA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the antagonist (s)-2-amino-3-(3,4-dichloro-5-(5-hydroxypyridin-3-yl)phenyl)propanoic acid at 2.0a resolution
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
b'KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Studies on Aryl-Substituted Phenylalanines: Synthesis, Activity, and Different Binding Modes at AMPA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 87
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cbrA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cbrA02
3S9EA 1FTJA 5EHMA 3N6UA 1D9YA 1II5A 3HN0A 1B3EA 2ZMBA 4DXCA 4QF9A 5FHMA 1FTKA 1AL3A 2G29A 3VLWA 4GQOA 1OVTA 2XXUA 4PFYA 2DE2A 2UVHA 1LBCA 4PP0A 2Y7PA 3LSXA 3O6HA 1CB6A 1OLAA 4KYEA 5DVJA 1B0LA 3FV2A 4IGTA 3N26A 4N13A 3MVWA 1SW4A 4GRKA 4YKJA 2I6EA 2CMOA 2DVCA 5I2NB 3TUSA 3DELB 1D3KA 3EHSA 1BP5A 4ESXA 3M3KA 4M1VA 3O2AA 4OMBA 2Y84A 1YTVA 3OXNA 2FA7A 2UVIA 3OEMA 1PB9A 4G8MA 3PMVA 4KPTA 2NXOA 3ILTB 2XXYA 1VE4A 2ZNUA 2M8CA 5I57A 2F7BA 1B5IA 4F22A 4R9GA 3R6UA 3ONMA 1FTLA 3KOTA 3MC2A 4EUOA 3OELA 3RT6B 3TYHA 2OZZA 4IY6A 4N6PA 3K00A 1NNPA 1FTOA 1B3FA 1URDA 4GF8A 4OTEA 3FATA 4QSDA 3O9PA 3CI8A 2GHAA 4FAJA 1HSJA 2OJTA 3PMXA 3THIA 2ONSA 3FVKA 4ZE8A 3BFUA 2ABHA 1P99A 4OVJA 3CVGA 1FQEA 3K4UA 4H5FA 5CC2A 4HCWA 2QSXA 3OOAA 3GZGA 5AA4B 2CZLA 1YPNA 3ZKKA 5AA2D 3BBRA 1ELJA 1JNFA 4X1DA 5F1QA 3A3CA 1MXVA 1PC3A 3VDFA 1SVXB 5H8HB 4ZZEA 1SQYA 2Q88A 2THIA 3KFMA 4IY5A 2XX9A 1IXCA 4R9FA 3FVNA 1H44A 4TLMB 4ELQA 4OFJA 4GXAA 4RXLA 1DPEA 3ODBA 1ZJLA 5H8HA 2DE4A 1R6ZA 4C1UA 1IEJA 3KGCA 1WODA 3FASA 4YB6A 3FXQA 5AE4A 1GVCA 3V83A 4LZ7A 2V93A 2ZNSA 4WXJA 1O63A 5CM6A 3FJMA 4H0WA 4ELRA 4ZEKA 4DLDA 4TLLB 5DVFA 3GLBA 3W9WA 5DEXA 4OHNA 1R9LA 1P1OA 1VFDA 1Q1KA 3M3LA 3OSQA 1H76A 2A5TB 2RC8A 2PYYA 1JW5A 2RF1A 2V3UA 1N84A 2HAUA 4XKPA 4EXLA 1YAEA 3OEKA 4ZEDA 1N04A 4R2FA 1I6BA 4F3BA 1MY2A 4L17A 3T9VA 3D4GA 2PT1A 4F2QA 1Y3PA 3V89B 1B2HA 4OEUA 1ANFA 3EHTA 4QSEA 2R6GE 2RCAA 1A7LA 3FVGA 1USYE 1LSTA 2XXRA 1OLCA 1AH5A 2R71A 2OK2A 4IO2A 3OO6A 3H06B 3RTFB 4GWOA 3IOTA 1A40A 5H8QA 3H6UA 1LLSA 3QXMA 2I48A 1M5EA 4R6KA 3MWBA 3PPOA 4HTGA 4QFLA 3TTLA 3OSRA 3MZBA 3FZVA 2QS1A 1D4NA 4H67A 1EZ9A 3MP6A 1SYIA 2GH9A 1PB7A 5FTIA 5ELVA 1EH3A 4LP2B 4F3SA 4YICA 4H6DA 3QYTA 2P2AA 1UIUA 2UYEA 2I4BA 1B7HA 4MH5A 2XHDA 2XXHA 4OENA 3S9MC 3U92A 3E13X 4OYVA 2XD3A 3PPQA 3U1OA 4DDDA 1R9QA 2X26A 4PFTA 4GFRA 4ECFA 1XC1A 3KJ7A 2QMWA 4JDFA 4NE4A 1Y3NA 4RK2A 3TFLA 2XXPA 2LAOA 3R7XA 3MQ9A 3K02A 5TP9A 2AL4A 2DWIA 3CFLA 1FQDA 4XTCQ 2RKMA 4HW8A 3MZ9A 2DSFA 3QIMA 1LAGE 2XX7A 1MY3A 2F78A 4HS7A 2NVUB 3PPRA 1RYXA 1P1QA 3QAXA 1IXIA 2Q2AA 4X1BA 4NF8B 5A5XB 5BWJA 3IB1A 1SBPA 2DXRA 5IKBA 1MY4A 4JWOA 4C0RA 2REGA 3LSWA 1A8EA 3TKDA 1QKAA 2XX8A 3EF7A 4OXVA 2AL5A 1LFIA 2I0BA 1ZKBA 2QS2A 3HHFA 1MY1A 4IO3A 1MH3A 4LQ2A 3EN3A 5KDTB 1I6AA 2IEEA 1MXXA 2Q8JA 3H4ZA 4QFPA 2B3BA 3TCGA 5I58A 1MH4A 2F5XA 3D4CA 2Z23A 1BIYA 1P1NA 4X48A 4F2OA 4R74A 1B7UA 1S50A 4RPNA 4XKQA 1B7ZA 5AA2A 2D21A 1MXUA 3E3KA 3TQLA 5FTHA 3RGYA 2H4IA 4JBZA 4FE8A 2Y7KA 1POY1 3TEPA 4YKIA 3PUWE 1M5DA 2Z22A 3IR1A 1JW4A 1M5CA 1YCJA 4X9TA 4FEDA 1SW1A 1I69A 1N7XA 2HQ0A 2KLFA 3RN8A 1AIVA 5TPAB 4KI0E 4Q30B 1URGA 1SW5A 1HSEA 3KN7A 4GXSB 3UIFA 4F29A 5L9MA 1I6QA 3CIJA 4NF5A 3USDA 3MAMA 2F36A 2I58A 3RTWB 1DOTA 4GD5A 2QS4A 4F31B 3FV1A 1UTHA 2PVUA 5CMMA 5JK4A 3GBAA 5DT6A 3CG1A 5TPAA 4IB2A 5B70A 2F6PA 1ZMGA 2X7QA 5CRYA 4F39A 1MM7A 1PEBA 5CMBA 5H8SA 3R26A 1SDXA 1IQ7A 4POWA 4POXA 4OWDA 2E1SA 1L5TA 4FATA 5I57B 5L9OA 1XVYA 1JETA 4NF6B 2Q2CA 4OQOA 2F6GA 2BJJX 4KCCA 1FQAA 3VE1B 1B52A 4R73A 2W7YA 3MZ1A 1Y3QA 1B05A 2RC9A 3U72A 1UQWA 3KN8A 4F3PA 2QS3A 4K3FA 3TMGA 1A99A 1B58A 4U21A 4BDQA 5ITOA 4EDPA 2QJEA 1IXHA 3TTNA 4EQ9A 4IO6A 4NWCA 1FQCA 5HPQA 4NF6A 2O6AA 4FEBA 3IORA 4R75A 1J1NA 2DXYA 1FTMA 2DOJA 1MPDA 3G7WA 1FQFA 4P11A 1PBQA 4JSOA 5I2KA 2ZYMA 3B6WA 3K1PA 1ZTYA 2QL3A 3DP8A 4Z7EA 1VSOA 1O64A 3OO7A 2HZLA 3C36A 4KYSA 3VV5A 1MQIA 1QJMA 4QRZA 3Q27A 4F1VA 1QKBA 4XKNA 3E4RA 4YMAA 4G68C 4O3BA 3KEIA 2REJA 2O69A 3CRBA 2OBGA 2DYXA 3KOSA 4GIZA 3DP6A 5F7VA 1Z7NE 3TTKA 3FUZA 4I62A 1LFHA 3BFTA 1Y4TA 1MQHA 4GL0A 3RUMA 2X7PA 4KQPA 1B46A 1US4A 4HCYA 3CSGA 4M4GA 3IB2A 2PMSA 3TAJA 3H7MA 1OQGA 1PBPA 2ONRA 4DZ1A 1JVXA 2V84A 3GBBA 1B9JA 3UA8A 1LB8A 1JEUA 1B1XA 2PX1A 2GFEA 1LGBC 1LCFA 3S9LC 3V5AA 5I84A 3IL1B 3G3IA 3PUZE 4DXUA 4RA1A 1IITA 1B5HA 3TPAA 3RPWA 3S2VA 4U1OA 4ZEIA 2ZYKA 1A8FA 4U4SA 4R72A 4NEDA 4NWDA 3N94A 1TFDA 4R2BA 5DEXB 3FIRA 3Q28A 3OENA 2O7UA 4DXBA 2PBWA 5JTYA 1VR5A 4GVOA 1QUIA 4WEDA 4H8IA 3VVEA 1NNKA 1B40A 3H03A 4R6HA 5H8NA 1QW0A 3QSLA 5CMCA 1DSNA 1WVJA 4FJPA 3Q29A 1Y1MA 2O1MA 3OMBA 3T22A 4KD5A 1US5A 2ANJA 3G3GA 1Y20A 1B3LA 3CFZA 1AMFA 3TZAA 4G77A 1WDNA 5TU0A 3UP9A 2FNCA 2ZYOA 3U94A 4F3GA 1B3GA 1JEVA 4G4PA 3VVDA 5H8QB 4YB5A 2Y7IA 3MP1A 5DVIA 4QFKA 3S4UA 1FCKA 2ALUA 4U23A 4U1ZA 2QRYA 5EYFA 1P1UA 1USYH 2RCBA 4YB7A 1M5FA 3T93B 3G3HA 3K0VA 3WAEA 2G93A 3CSBA 4ZE9A 5KCJA 5I56A 4LONB 2A5SA 3SEUA 4IGRA 3SESA 5HM4B 3CFXA 3LSLA 1ZU0A 2ESNA 4ZDMA 4YU0A 1QULA 2VGQA 3HV1A 4RY1A 1QVSA 5CBRA 1MG1A 5FHOA 3E9XA 3IOWA 3TCHA 3G3KA 4LZ5A 3JYRA 2HZKA 1BTJA 3IO6A 5TP9B 4Q5TA 3K01A 3EHUA 3PV0E 4UACA 4O3CA 4R6YA 1GR2A 4QHQA 5LOMA 4ELPA 2AYSA 3UN6A 2DWAA 3SETA 4PFWA 2Q89A 4JWXA 4P0GA 4MBPA 4THIA 4U22A 1ZIUA 2H98A 3UORA 1LAFE 2OWSA 1HSLA 4AB5A 3IAZA 3HO7A 4Q0CA 3O29A 3PPNA 1MQDA 2O1LA 3G3JA 2P1SA 1B6HA 2H9BA 5ICTA 5K2XA 3FGSA 3K6UA 2V3QA 4H5GA 3VLUA 4G68A 1MQGA 4LATA 2Q9TA 4AB6A 5ITPA 4GLIA 4P0IA 5I58B 3K6VA 1ZLQA 3RLFE 4MFIA 1TT1A 5ISUA 3O6IA 4TQUQ 3RNNA 4WKMA 3IO4A 5AA2B 4KHZE 1OQHA 1NKXA 2O68A 4U4XA 2O84X 4OERA 1RKMA 3SEXA 1TFAA 1MXZA 4XIGQ 2F35A 1POTA 3I5OA 4XXUA 3DM0A 4RJZA 3GXAA 2Z8EA 3C4MA 2I0CA 3T66A 3KSJA 3MVYA 4LQ5A 2XXIA 4DCXA 3Q26A 4ESWA 3TQWA 3VFJA 3S9NC 1SD3A 3VVFA 5CBSA 3JV9A 5I59A 3PGFA 4G8HA 1OIBA 1B5JA 4O3AA 4LA9A 2V3TA 4YKPA 2B65A 4NF5B 3CG3A 4E0XA 1SI1A 3T96B 1MXYA 3Q25A 3F11A 3CR9A 1UTHB 3LSFB 2XXXA 1PB8A 4LUBA 2VD3A 4NF4A 2B3FA 5H8FA 4WEPA 4ZS9A 3MVZA 4MF3A 4QSCA 2I4CA 1CE2A 2UVJA 1XVXA 4EQBA 3MP8A 3H3GA 2XXTA 4PE5B 4QFNA 4AQ4A 1SYHA 4UA8A 3O97A 1IZ1A 3FJGA 4YKKA 2RINA 3UGWA 2Y7WA 3EPEA 1MPCA 1JVYA 1PDAA 2XD2A 1T0KA 1MQJA 3FXRA 2F8DA 3O28A 3T9HB 4DE8A 3MJNA 3N6TA 2NOOA 4JSDA 4GOTA 1B1HA 1M5BA 1A54A 3DP4A 1JQFA 4I9DA 1H3DA 2DP8A 3O66A 3B6TA 4RNSA 2YJPA 4ZECA 3HCQA 5EHSA 3PUYE 4JXIA 5I2KB 2GRVA 3PUVE 1A55A 3OO9A 5AA3A 1LBBA 5L8DA 4ND9A 2F97A 5JEIA 3B6QA 2HEUA 3RY3A 2O7IA 1B4ZA 3TCFA 1LAXA 3O6GA 5I2NA 2VHAA 3JZJA 4E0WA 2Z8FA 4RYAA 2NWJA 3C9HA 1NH7A 2UYFA 3LR1A 3G3FA 3PU5A 1IXGA 3VLVA 2F7CA 3FJ7A 1S7YA 3ZSFA 1B4HA 1SI0A 4ZEFA 3MPLA 1NNFA 5DTBA 3HHGA 1IUDA 4RPOA 3A3UA 1DPPA 3MBPA 1BKAA 3L6HA 3A09A 3SEYA 3SKPA 4G2ZA 4BDNA 2H5YA 1Y1ZA 3KBRA 3H6VA 4LVQA 4U2RA 1Y9UA 1EZOA 4OEVA 2NUVA 2FYIA 4FECA 4MLVA 3C33A 2HFBA 3PUXE 2R9JA 4I1DA 3OD7A 4ZZAA 1O7TA 5B7DA 1XHYA 4NMYA 3QUJA 3IK6B 1FQBA 1XS5A 2H25A 3LUYA 5DYHA 3VXBA 1TXFA 2OCUA 1GV8A 1LFGA 1MY0A 3H6TA 3SEWA 4EF1A 4KCDA 3FVOA 3HSTA 4GL8A 4OFLA 3KSXA 5JTYB 3QUFA 5AA4A 5L9SA 2XXWA 2QPQA 4H8JA 3U93A 1B32A 2F34A 4NTLA 3SEVA 1MRPA 1JW1A 4F18A 4Z0IA 3MUQA 5H8NB 3SDFA 1NFTA 4ELOA 1S9TA 2HCAA 3M3FA 3ZS6A 2ZNTA 1D9VA 4EQ7A 1EZPA 4KYDA 3C35A 3M8UA 2ONKE 2HAVA 4PFUA 4XKRA 1MPBA 2V25A 4EXKA 1DTGA 3B7DA 4DCYA 3I3VA 2DQVA 1OVBA 4QFOA 2P0SA 1URSA 1MXWA 2ZXTA 3KG2A 4KFQA 4F1YA 4EF2A 3RQTA 2O51A 3IOUA 2UXAA 2PT2A 1Z7ME 3IOVA 4ONYA 2HXWA 2YLNA 4MLQA 1N0TA 3EQ1A 5KCJB 1FW0A 5I56B 2OLBA 4G8NA 1B3HA 3ECRA 3ILUB 3BKIB 1NMUA 3K1NA 1B0HA 1UIVA 4Q8RA 3I6VA 4YAHX 5M2VA 4IO5A 3U8QA 2F7AA 2A5TA 3W9VA 2ZYNA 2RC7A 3FD3A 1N3WA 3P7IA 2WKYA 1OMPA 3AXFA 4OESA 5CI5A 4YMBA 1AOVA 1IIWA 3V8XB 3C32A 1Y4CA 2GHBA 1NL5A 1H43A 2D3IA 1XT8A 5HBCA 1KWHA 4BDMA 1TWYA 3WAFA 3LC8A 5AA1A 4H1XA 5IAIA 2VD2A 1DTZA 3QK6A 3C31A 1B51A 4ISUA 1QUKA 1R1NA 1GTKA 1QUJA 2AIXA 4JWYA 4BDOA 2DVZA 3T9XB 3TTRA 3TDJA 1RYOA 3N5LA 4BLAA 1N7WA 2Y7RA 3TTMA 2D5WA 1P1WA 1EU8A 5BUUA 2VP1A 4TOZA 4G68B 4N07A 1DMBA 3MVXA 3KN3A 3PD8A 4F1UA 1LCTA 3W15C 3UK4A 4YZZA 1VFEA 5K2YA 1LAHE 3MPKA 4H65A 4PQJA 1BLFA 4PETA 4IO4A 3IJXB 2DE3A 4OETA 2Z8DA 2XXVA 2VOZA 1H45A 1UTBB 2DWJA 3OO8A 3HPIA 2E0SA 2I49A 3DLNA 1LB9A 4OZ9A 2UVGA 4OFOA 3VXCA 4DIGA 3C34A 3FXUA 4IO7A 4ZEBA 1NNTA 3LBSA 2DS9A 2XXQA 3T9UA 3TODA 3SERA 2H99A 3KJTA 3KZGA 4RK9A 5KZTA 1UTBA 1SW2A 5I59B 3IX1A 5CMKA 4JB7A 2QMXA 4LZ8A 1MM6A 3L6GA 4NF8A 5A5XA 3RT8A 4C1TA 1GGGA 2YPNA 3IB0A 1XOCA 3K2DA 1MS7A 3H6WA 2I3WA 1MDQA 1NH8A 4FORA 3PD9A 4NF4B 4KR5A 5H8FB 4I8CA 3K6WA 1F9BA 3IJOB 2IA4A 3ZKLA 3TELA 3PMWA 2OWTA 3MW0A 5KDTA 1ZBMA 3PPPA 3K1MA 5J1DA 1ATGA 3K6XA 2I3VA 4BDRA 1MDP1 1N3XA 5ICQA 1N76A 4FIMA 1Q35A 4BDLA 2DWHA 4F19A 5FHNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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