5CBSA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the antagonist (r)-2-amino-3-(3'-hydroxybiphenyl-3-yl)propanoic acid at 1.8a resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
publication title Studies on Aryl-Substituted Phenylalanines: Synthesis, Activity, and Different Binding Modes at AMPA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cbsA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cbsA02
3C33A 5H8NB 3E4RA 4IY5A 3GZGA 3OMBA 3OD7A 2XXTA 5KDTA 5I2KA 2VHAA 4OENA 1SW1A 3JYRA 3IJOB 3KEIA 1F9BA 3N26A 5DVJA 1MG1A 5EHSA 3ZSFA 1LGBC 3C9HA 2Y84A 1POY1 4H5GA 3U72A 1GGGA 1B6HA 4QRZA 1MQGA 3M3FA 1BLFA 2F35A 1B58A 1MY2A 3SDFA 2HCAA 4P0IA 2OJTA 3FVNA 4F29A 4G68B 3Q28A 1I69A 3S9EA 1EU8A 1NKXA 4LZ8A 5I59B 4NF4A 3KOTA 3OSQA 3V5AA 4NWDA 3KN8A 3MZ1A 2WKYA 1AMFA 4GQOA 4C0RA 1B1XA 3KFMA 1JETA 3WAFA 4GXSB 1BKAA 4NF5A 4U23A 4Q30B 1FTJA 3B6QA 3VXBA 4N07A 1PEBA 5I57A 2O7UA 2ONKE 1S50A 3T9UA 3PUYE 1A54A 2ZYNA 1FTMA 1YTVA 1LSTA 4F1UA 4F39A 4KHZE 2XXHA 3U94A 5ITOA 4YMBA 3U92A 4IO5A 4YB7A 2PVUA 1LCTA 2Z23A 1D3KA 4H65A 2HEUA 2F6GA 3O29A 1TFAA 1VFEA 4XKQA 2RC9A 3C35A 2NUVA 1XOCA 4RYAA 3KSXA 4BDOA 3CVGA 3M8UA 5FHOA 4FATA 1N3WA 3S9MC 2DWJA 5BUUA 2Y7IA 1QKAA 1SI0A 4AQ4A 2BJJX 3TTLA 2R71A 5B70A 1PBQA 4GL8A 2ONRA 4F3GA 5B7DA 1NL5A 3PPRA 3T9XB 3MP8A 3B6TA 2ONSA 3RPWA 4OEUA 4NF8A 2DSFA 1Y3PA 3IR1A 5ICTA 4K3FA 4ELPA 3TCFA 1OQHA 3MZBA 4EQ7A 2YLNA 5JK4A 1J1NA 1UTBB 4TLLB 3FXRA 2Y7PA 4AB6A 3KN3A 1ELJA 4HTGA 4ELRA 4GVOA 3LUYA 4PFYA 3SESA 5L9OA 3TDJA 4BDMA 3O9PA 4YMAA 2HZLA 5TPAA 4R73A 2O1MA 4R72A 1P99A 4OQOA 3IJXB 4KCDA 4R9FA 4ZE8A 2UXAA 2XXRA 3I5OA 4OYVA 2DE4A 4LZ5A 4F31B 1PBPA 1SDXA 5L9SA 3UGWA 1TXFA 3CRBA 1D9VA 3FXQA 2Q2AA 3KZGA 4FEDA 1B7ZA 1MPBA 1US4A 1Y4CA 3FGSA 3SEUA 1B7UA 5KDTB 1ZIUA 2QMWA 4JWOA 5I84A 5KCJA 4HCWA 5LOMA 3OXNA 4F3PA 4NWCA 4YKJA 3QYTA 3C4MA 1JQFA 1MQDA 4U2RA 3RTWB 2ZYOA 4F3BA 2VP1A 3L6HA 4R6KA 3LBSA 3C36A 4MH5A 3PUWE 1B3EA 2D5WA 4PFWA 3K2DA 4LATA 1MM7A 1FW0A 3PPQA 2AIXA 1UIVA 2OZZA 3ZKLA 2GH9A 1SYHA 5CBRA 4KI0E 5CC2A 4TOZA 3CR9A 1II5A 1N7XA 1MXUA 4HS7A 4NF5B 1SBPA 4G8HA 3MVXA 5I57B 3K6WA 2RC7A 3GBBA 4OFJA 5L9MA 2UVGA 5IAIA 1USYE 2XHDA 3Q27A 3SEYA 3GXAA 2IA4A 3E13X 1A7LA 1H3DA 3PMVA 3FV1A 1LAXA 3TPAA 2W7YA 2DP8A 2UYFA 1Q35A 5CBSA 1B3HA 3FJMA 1QVSA 3N6UA 1N7WA 3DP6A 1H43A 4OVJA 4GD5A 4HW8A 2M8CA 4X9TA 4XIGQ 2V3UA 2H98A 3TFLA 3H06B 5FHMA 1N84A 4N13A 2V25A 3FJGA 1LLSA 1GR2A 4H67A 2E0SA 2B65A 2G93A 4GLIA 3G7WA 3PMXA 4BDQA 2QRYA 2PYYA 4NTLA 2F34A 3FVKA 2XX7A 5FTIA 5DTBA 5BWJA 2I6EA 4RJZA 2OBGA 4PETA 4OHNA 1QW0A 2E1SA 1AL3A 1JNFA 2I48A 3RGYA 2QMXA 2V3QA 3MQ9A 1B05A 1FQCA 2DWAA 4DXUA 4YICA 3T96B 2HXWA 1ZKBA 2QS3A 4L17A 3PPNA 4QSCA 3TODA 3H6VA 2HFBA 2QS1A 5ISUA 3D4GA 5TPAB 3IB1A 2RC8A 4G2ZA 4R74A 3TYHA 2P2AA 3PPOA 3O28A 4KPTA 4C1UA 3K4UA 1IEJA 3TELA 5ELVA 2RKMA 1XC1A 1Y3NA 4UA8A 2F5XA 4H1XA 1N04A 4RPOA 1DOTA 4U4XA 3TTNA 1BIYA 3VDFA 2Q89A 1B0HA 2I4CA 3MVYA 3CIJA 5H8FB 3VVEA 4IO4A 5CMBA 5TP9B 2PT1A 3LR1A 2QJEA 3I6VA 2X26A 5CM6A 1VE4A 4LQ5A 2ALUA 1YAEA 2P1SA 3SERA 3AXFA 2XD3A 4ESWA 4FAJA 3OEKA 4FEBA 4EF1A 4NEDA 3FUZA 5CMCA 1CB6A 1P1WA 1RKMA 5I58A 4WXJA 4GXAA 3HV1A 2F7CA 3E3KA 2IEEA 3K0VA 3KG2A 2B3FA 4R75A 1POTA 4G68C 4I1DA 1P1NA 1WODA 2DVZA 4PQJA 3CG1A 2H99A 4JB7A 3MVZA 1QUKA 2KLFA 1PC3A 1JW4A 2UVIA 1BTJA 3TCHA 1IXHA 4RPNA 4JWYA 3V89B 3UA8A 2REGA 5K2YA 2DOJA 1Y4TA 1MH3A 4YB6A 3IAZA 1FQAA 1CE2A 3DP4A 1ZMGA 4ZEIA 4Q8RA 4F2OA 4G8MA 3IOTA 1JVYA 4DXCA 2I3WA 2QSXA 5H8QB 4EUOA 1URDA 3Q25A 1B46A 3EF7A 5FTHA 3O2AA 3IO4A 2ZNUA 1IXIA 3TTMA 4QFOA 4DE8A 1NH7A 4OETA 2GHBA 4BLAA 4PFUA 2A5TA 3A09A 5EYFA 1WVJA 2XD2A 4O3AA 2NOOA 3KJTA 3JV9A 2XXVA 2ZXTA 4H6DA 3W9WA 4F3SA 2XXXA 1B51A 2GFEA 3FIRA 3QSLA 1M5BA 1Y9UA 1OLCA 1SQYA 3G3KA 5L8DA 4LVQA 1I6QA 1B4HA 1MY1A 4UACA 4EQBA 3TMGA 4F22A 3W9VA 2RCBA 3TTRA 1PB7A 2F7AA 3QXMA 4ND9A 5AA4A 3ZKKA 2OLBA 3ONMA 1Y3QA 4YKIA 2I49A 3OO8A 1TWYA 1SD3A 3K6XA 1NNPA 1LCFA 2HAVA 3N6TA 3UIFA 4U21A 1LFIA 4ZECA 3OO9A 3BFUA 3T22A 5CMMA 1LFGA 2AL5A 4E0WA 3RN8A 1IZ1A 3TAJA 3PGFA 2A5SA 1LBCA 1B9JA 3F11A 4QFKA 1A8EA 1P1QA 1FQEA 1HSJA 2AYSA 3IO6A 4BDRA 4H0WA 4DXBA 1URGA 1PDAA 4PP0A 5A5XA 3IB2A 1Z7ME 4XKPA 3RNNA 3M3KA 4MBPA 3M3LA 1WDNA 3E9XA 1SVXB 3VLWA 2PT2A 1M5FA 3MZ9A 3UORA 2XXIA 2F8DA 3OSRA 5F1QA 3TQWA 5I58B 3H4ZA 3EN3A 3GBAA 3Q29A 2QPQA 3RT8A 3MUQA 3R7XA 5AA2A 4G4PA 4I8CA 4KYDA 1B7HA 1D9YA 5H8SA 5JTYA 1MQIA 3O66A 1MXZA 1N0TA 1A8FA 2DE3A 1DTZA 3OELA 4IO3A 5HM4B 2YPNA 3K1MA 2DWIA 4Z7EA 4PE5B 5I2KB 5AA1A 1FTOA 3TEPA 3HN0A 2I0BA 3VLUA 3HHGA 3OEMA 4YKKA 1D4NA 4RA1A 3LSXA 3QK6A 5I2NA 1GTKA 1AOVA 2Z8FA 1O64A 5DVFA 4NF4B 5ITPA 1B1HA 1SW4A 2VD2A 1GV8A 1VSOA 2CZLA 1N3XA 1MXXA 1DTGA 5IKBA 1Q1KA 5J1DA 4JWXA 1MPCA 3VVDA 1B3LA 2V84A 4I9DA 1ZBMA 1M5CA 1US5A 1DPPA 1XVXA 3C32A 1URSA 4XKRA 3UN6A 3FJ7A 5H8NA 5K2XA 3HCQA 4Q5TA 5HPQA 1Z7NE 5DT6A 2UYEA 3MPLA 2HAUA 2Z8EA 2QS4A 1XS5A 4XXUA 4P11A 1BP5A 3CSGA 2LAOA 4MFIA 1TT1A 4YZZA 2F7BA 3C34A 1VFDA 4U1OA 2ZNSA 5AA3A 2DQVA 3IB0A 4OFOA 2ANJA 1KWHA 4G77A 4IO7A 4TQUQ 1H45A 1MRPA 5I59A 2PBWA 3K6UA 4PFTA 3PD8A 3U93A 4BDLA 3I3VA 4ELQA 2FYIA 1MQJA 3MVWA 1R9QA 2AL4A 3ZS6A 2V93A 3KSJA 3VFJA 1I6AA 3CFLA 1JVXA 2UVJA 5DVIA 4NF8B 2NWJA 4ZEBA 3OOAA 1JW1A 5FHNA 3LSLA 4DCXA 1IXCA 4R2BA 2I3VA 4KFQA 3S9LC 4RK2A 4X1BA 1RYXA 4QHQA 4RY1A 3CG3A 2XXWA 1NNTA 4YB5A 4KD5A 3OO6A 3IOVA 3MJNA 2DE2A 5DYHA 5JEIA 4NF6A 3BKIB 3FASA 3G3JA 1IITA 3LC8A 1PB8A 1IIWA 3G3FA 4EXLA 4M4GA 3CFXA 3SEWA 2Q9TA 5F7VA 4H5FA 3ODBA 3SEVA 4MF3A 4KCCA 4P0GA 4FORA 3FZVA 1DPEA 2X7QA 2VGQA 4OFLA 1UIUA 5JTYB 4R6YA 1FQDA 5DEXA 5CRYA 3H03A 4AB5A 3H6UA 3R26A 2I4BA 2H9BA 2XXQA 1OIBA 5KCJB 3JZJA 1LAFE 1B5HA 1JW5A 2XXYA 5AA2D 4MLQA 3O6HA 3MWBA 3W15C 3VXCA 2DS9A 1B3FA 3K1NA 4NMYA 3B7DA 1UTBA 1QUJA 2CMOA 2HQ0A 3N5LA 2VD3A 1FTKA 4E0XA 5I2NB 4N6PA 5TU0A 1MXVA 1SYIA 1HSLA 2O84X 1B40A 3HSTA 3B6WA 4H8IA 1EH3A 2B3BA 3QUFA 2RCAA 1O63A 3MAMA 2UVHA 4F1YA 2Y7RA 4QFPA 1TFDA 2Q8JA 1L5TA 3BFTA 3SEXA 3IX1A 1Y1MA 1LFHA 3FD3A 2ESNA 3LSFB 5I56A 3G3HA 2I0CA 3TCGA 2THIA 3IK6B 4LUBA 3H7MA 2R9JA 3IOUA 1PB9A 4ZDMA 4F1VA 4GL0A 4JSDA 4QFLA 2G29A 4DDDA 1LAGE 4LONB 3USDA 4XKNA 4HCYA 4ZEFA 4POXA 3TZAA 1IUDA 5M2VA 4ZZAA 4R6HA 4RXLA 2H25A 1M5EA 1GVCA 4GF8A 3O6GA 4ELOA 3VE1B 1B52A 5HBCA 3MP6A 2OWSA 3MPKA 4IGRA 4ZS9A 1SW2A 4JXIA 1HSEA 3K1PA 3PUXE 3O6IA 4U22A 4IY6A 5EHMA 1B3GA 2ZYMA 3H6TA 3T9VA 1OMPA 2QL3A 2REJA 2YJPA 2XX8A 2Z8DA 4GWOA 1NNFA 4U4SA 1R9LA 4ZZEA 4YKPA 3HPIA 2XXUA 4XTCQ 4ECFA 3EPEA 3KOSA 1B0LA 1MH4A 3S4UA 4KYSA 2H4IA 2ABHA 1MDQA 1M5DA 4IGTA 5CI5A 4NF6B 5AE4A 2GHAA 1ATGA 3FV2A 4QSEA 3QUJA 3DLNA 1UTHA 4QF9A 1N76A 2O7IA 1B5JA 2F36A 3N94A 1MY3A 3KN7A 3THIA 3V83A 1JEUA 4X48A 3EQ1A 2HZKA 4QFNA 4U1ZA 3V8XB 3S2VA 3G3GA 1MDP1 4JBZA 1B4ZA 5DEXB 1MM6A 1A55A 3RLFE 1ANFA 2F78A 1MS7A 4EF2A 1VR5A 2QS2A 2V3TA 2ZYKA 2H5YA 3D4CA 2X7PA 4ZEDA 1IQ7A 1P1OA 3A3CA 2OK2A 2I58A 4LQ2A 3IORA 1Y1ZA 3OENA 3FVOA 4LZ7A 4EQ9A 1NMUA 4DZ1A 3PMWA 1XT8A 4YAHX 3PUZE 1EZ9A 2O51A 1QUIA 3PD9A 4OWDA 4JDFA 4DLDA 2Q88A 3CI8A 2PMSA 4ZE9A 4GIZA 3T93B 3TKDA 1JEVA 1IXGA 4THIA 3ECRA 1O7TA 1EZOA 2XXPA 1YPNA 5H8FA 5TP9A 5I56B 3G3IA 3MBPA 1OLAA 5H8HA 3S9NC 1MXYA 2NVUB 2F97A 3KGCA 4JSOA 3A3UA 3IOWA 2OWTA 1XHYA 3PU5A 4KQPA 1AH5A 2A5TB 3EHUA 3HO7A 1NFTA 4OTEA 2NXOA 2O6AA 4I62A 1Y20A 4OXVA 1ZU0A 4OESA 1FQBA 1YCJA 1I6BA 2Y7KA 4F18A 3CFZA 3K6VA 4H8JA 4ONYA 2D21A 1OVTA 3GLBA 2OCUA 4GOTA 1FQFA 1H76A 3QIMA 3TTKA 2O68A 4RNSA 3P7IA 4OMBA 4EXKA 1B5IA 2DXRA 2PX1A 1EZPA 4FIMA 3IL1B 3UK4A 2P0SA 4MLVA 5AA4B 1OQGA 3LSWA 2FNCA 4WKMA 1XVYA 1UQWA 5H8QA 2ZMBA 4ZEKA 1S9TA 4GRKA 2DXYA 4GFRA 1USYH 4DCYA 4WEPA 4G68A 3MP1A 3UP9A 1T0KA 2Y7WA 3H6WA 2F6PA 4EDPA 1R6ZA 1QKBA 3U8QA 3TUSA 4O3BA 1MQHA 4LA9A 4FE8A 4ESXA 2DYXA 1UTHB 2R6GE 1A40A 1OVBA 2XX9A 1MY4A 3ILUB 3RT6B 1ZLQA 4Z0IA 4OZ9A 3MC2A 3RQTA 1A99A 1FCKA 1LB8A 1DMBA 3QAXA 4Q0CA 3MW0A 2FA7A 4YU0A 1LAHE 2GRVA 5A5XB 1MPDA 4F2QA 1MY0A 2Z22A 2Q2CA 4KYEA 1NNKA 1H44A 3CSBA 2DVCA 3K00A 3DM0A 1LBBA 1QJMA 4ISUA 1S7YA 3WAEA 3KJ7A 4RK9A 3RTFB 3RY3A 3KBRA 1AIVA 3R6UA 3T66A 4M1VA 3T9HB 4BDNA 1B2HA 3K02A 4X1DA 1LB9A 4POWA 3EHSA 3FATA 4G8NA 4FJPA 5AA2B 4F19A 3DELB 3C31A 1B32A 3VLVA 1R1NA 4QSDA 4OERA 3PV0E 3ILTB 4FECA 3PPPA 4LP2B 3K01A 1RYOA 3U1OA 3VV5A 4DIGA 4O3CA 1NH8A 4OEVA 2D3IA 1DSNA 3FXUA 2RF1A 5H8HB 3L6GA 4R2FA 5ICQA 1SI1A 3Q26A 4WEDA 1P1UA 1SW5A 1ZJLA 3HHFA 4TLMB 3VVFA 3O97A 3EHTA 3DP8A 4IO2A 3FVGA 3RUMA 3PUVE 2RINA 4C1TA 3TQLA 3SETA 4NE4A 1QULA 2VOZA 4KR5A 4IO6A 2ZNTA 2DWHA 4IB2A 2O1LA 3BBRA 3OO7A 4R9GA 5CMKA 3H3GA 3SKPA 2O69A 1FTLA 5KZTA 1ZTYA 1MXWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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