5CBSA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the antagonist (r)-2-amino-3-(3'-hydroxybiphenyl-3-yl)propanoic acid at 1.8a resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
publication title Studies on Aryl-Substituted Phenylalanines: Synthesis, Activity, and Different Binding Modes at AMPA Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cbsA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cbsA02
2E0SA 2Q9TA 3CVGA 2O1LA 3HV1A 1AIVA 3S9MC 3O29A 4PFWA 3FV2A 3GLBA 1MH4A 4G77A 5FTIA 1MXUA 3VVFA 1MQDA 3OEKA 3HPIA 4C1UA 2XXPA 5KZTA 4ZECA 4KYSA 2ZNTA 4ZEIA 3FXQA 1QKAA 2RC9A 3THIA 3V83A 4DXUA 2H99A 1TFAA 1LAFE 1YTVA 4P11A 2GFEA 1MQGA 4YAHX 1SI0A 4M1VA 4QF9A 3ECRA 1SW5A 1IITA 1SYIA 1I6BA 1ZIUA 1QUJA 2FYIA 2VD3A 5F1QA 1D9YA 3BFTA 1D9VA 4NF8A 4G68B 2XXWA 2H5YA 1B3LA 3K1NA 2F78A 2PBWA 4EF1A 1LFGA 2VHAA 4EXKA 1B0HA 1B7ZA 4R2FA 1Y4CA 4MF3A 5HM4B 1DOTA 4NF6B 3IOTA 3B6QA 4KHZE 2DWAA 2Z8DA 3LR1A 1EZPA 3QIMA 2HQ0A 4TQUQ 5DYHA 2OBGA 4X9TA 1P1UA 3CRBA 3QAXA 1ATGA 2F35A 5AA1A 4TOZA 4N07A 3O28A 3KN7A 5I58A 1YAEA 2XXIA 1B51A 4IO6A 1SW1A 5JK4A 4F2OA 3IORA 1UTHB 1US4A 1FTKA 3G3FA 2QL3A 1N0TA 5DEXA 1Q35A 3LUYA 1O63A 2OZZA 2P1SA 2F36A 3FJMA 1B5HA 2KLFA 2ZNUA 2HCAA 3S2VA 2XXRA 2DXYA 2XXYA 4RYAA 1RYOA 1ZTYA 4NWDA 3K6VA 1F9BA 3CSGA 2AL5A 1MY1A 3VLWA 3OO6A 1II5A 5TPAB 2YJPA 5F7VA 4LA9A 1PB9A 3U94A 1NMUA 1B4ZA 3MZ9A 2UXAA 3B6WA 3ILTB 1A8FA 4PP0A 2XXUA 4ZEDA 1ANFA 4GVOA 4HCYA 1B52A 2F7CA 4QFKA 4Q30B 3FATA 2Q8JA 2I4CA 3OO7A 4Z7EA 2I3WA 3MBPA 4LONB 1QVSA 1B4HA 3LSLA 4ESXA 1B58A 5A5XB 2VD2A 2XX7A 5KDTA 1MDP1 1B32A 3IOUA 2RKMA 4H5FA 3ZKLA 1DMBA 1XHYA 1BTJA 3PPQA 4R6KA 1MXVA 2DVCA 2ONRA 5JTYA 5KCJA 3Q29A 3K1PA 2X26A 4IB2A 4G8MA 5HBCA 3N5LA 4NF5A 1XS5A 4GFRA 1B5JA 1SVXB 1B5IA 3QUFA 1B1XA 4IGTA 4OFJA 4R72A 3VE1B 5ICQA 1NKXA 1QUKA 1MM6A 4YB5A 1LLSA 4RXLA 3SEXA 5J1DA 4RNSA 4RY1A 1O64A 4F3GA 1EZOA 2ZXTA 3RTWB 3T9UA 2Y84A 4N6PA 3FJGA 2THIA 3JZJA 4QFOA 3RLFE 2AIXA 4RK2A 2XHDA 4U4SA 3OENA 2G93A 3TTKA 1PB7A 2DWJA 3ZS6A 3H03A 1LAGE 3VXBA 3H6WA 5ELVA 3DLNA 2XD2A 5AA4B 4AB5A 3CG3A 3GZGA 4F1UA 4POWA 3TTRA 1B05A 4MLQA 1B3EA 3MQ9A 4OEUA 4RA1A 4ZE8A 3O2AA 3KOTA 2UVIA 4G68C 1FTJA 5B7DA 1Y3QA 2OWTA 1M5FA 3VLVA 3TUSA 4RK9A 3IX1A 4YMAA 3KBRA 1TXFA 1JQFA 4Q0CA 4ZEFA 2CMOA 3O6HA 4XKNA 3K4UA 3E13X 3TYHA 4H6DA 2QSXA 3UA8A 1OLCA 1H45A 3FZVA 2H9BA 4DZ1A 2V3TA 5ICTA 1Q1KA 1H43A 3H6TA 4PQJA 5H8NA 2DP8A 2REGA 2Z23A 4ND9A 5EHMA 2DE3A 1AOVA 1MXXA 3TPAA 1LGBC 2E1SA 2NOOA 3TTMA 4NF4A 1MPBA 2ONSA 3IB1A 3I3VA 4ZE9A 4YICA 4P0IA 1N3XA 1TWYA 1JW5A 1Y9UA 1FQDA 5BWJA 4TLLB 5B70A 4F29A 5FTHA 5DT6A 1M5BA 3EN3A 1JVXA 2OCUA 1B1HA 3HCQA 5IAIA 4GIZA 1USYE 3T22A 4KR5A 4BDLA 2O51A 2V84A 1HSLA 2I48A 1POY1 2Z8FA 3E9XA 3EHSA 3DP6A 3VXCA 4KQPA 3TKDA 4H8IA 5H8FA 1T0KA 2Z22A 3PU5A 1FQEA 2P0SA 4NTLA 3LBSA 2PX1A 4IO7A 1PBPA 2B65A 3O9PA 5KCJB 3TCGA 3KEIA 4LP2B 2OLBA 1PB8A 5AA3A 5K2XA 1M5CA 3KG2A 3AXFA 2YPNA 1A7LA 4PETA 4G2ZA 1O7TA 3IJXB 4KPTA 5BUUA 2ZYKA 2R71A 3A3UA 5DVJA 4X1DA 2A5TA 1VFEA 3MWBA 3FASA 3MVZA 3S9LC 1URSA 3V89B 3K02A 3K6WA 3O6IA 2VOZA 3G3JA 4GD5A 3TELA 1USYH 1TT1A 4DCYA 2V93A 3PUZE 2GHBA 1UTBA 3VVDA 3VLUA 4NEDA 4R75A 4C1TA 5TU0A 3WAFA 3SEUA 1UIUA 4O3BA 2HEUA 1A99A 5HPQA 4OTEA 1J1NA 4DXBA 4LVQA 3OO9A 1IQ7A 1LAHE 1ELJA 3PPRA 3P7IA 2B3FA 2O68A 3LSFB 1AH5A 1P1WA 1Z7NE 5TP9A 1N7XA 3V8XB 4I8CA 2R9JA 3U1OA 3UP9A 1MXYA 4E0XA 4ELQA 3GBBA 4F39A 5I2KA 3CFZA 3CFLA 2PYYA 3C31A 1DTGA 3IO4A 3G3HA 3DP4A 4JWOA 3C36A 4FATA 4EQBA 4I1DA 3D4GA 4YKJA 1IIWA 4X1BA 2XX8A 2QS1A 2RCBA 4XKQA 5CC2A 4Q8RA 3K1MA 3MAMA 5CMMA 1QKBA 4IO5A 2ZNSA 4FEBA 1LCTA 3IOWA 4NF4B 3U8QA 3UGWA 3U92A 3K6UA 5ISUA 3ONMA 4P0GA 2V3QA 4ZEKA 3O97A 3MZ1A 3PPPA 1JETA 5I2NB 2IA4A 2QMXA 3RGYA 4U1OA 2O7UA 4JBZA 4U4XA 2CZLA 4FORA 4N13A 4R9GA 3FV1A 5DVIA 2Q2AA 1ZKBA 4GWOA 2W7YA 3F11A 4YKIA 5H8QB 3RT8A 4OETA 3LC8A 3IR1A 3PUVE 2OJTA 1NNTA 3RNNA 1P99A 2G29A 1MDQA 1MY3A 1DTZA 1NH7A 4IO4A 3FGSA 3S4UA 1B7HA 3K2DA 3FVOA 4F18A 5I57B 5DVFA 4GRKA 4KFQA 4OFLA 1GVCA 2DSFA 4O3AA 2H25A 4YZZA 2A5TB 4ZS9A 3MC2A 1MXWA 5H8HB 4QFNA 3QYTA 1POTA 1FQFA 3C32A 3RY3A 2PVUA 2LAOA 1N84A 4G8NA 1B9JA 1OMPA 3B7DA 1UTBB 1OIBA 1S9TA 5L9OA 3RUMA 4DE8A 2GRVA 1JW4A 2DS9A 1SW4A 1BP5A 1TFDA 5I59A 3N6UA 1OQGA 1B3FA 2PT2A 1RYXA 3KOSA 3IO6A 1BIYA 1L5TA 4FE8A 5JEIA 2V3UA 2F97A 4H65A 1VR5A 4F2QA 1Y1ZA 3K6XA 4LATA 3TCFA 3CR9A 3IL1B 1LBCA 1GTKA 5I56A 3KFMA 3CIJA 3T9XB 1NNPA 5ITOA 4PE5B 3TFLA 4OVJA 4JWXA 5CM6A 3SEYA 4M4GA 3L6HA 1M5EA 1URDA 4PFYA 3ILUB 1Z7ME 2V25A 4BDNA 3IB2A 1UQWA 1OLAA 2X7PA 4NF8B 1QUIA 3KN8A 3MPLA 2F6PA 4F1VA 3MVYA 4EXLA 3G7WA 4ZZEA 1SBPA 4LZ5A 3Q28A 5AA2A 4WXJA 4L17A 4XKRA 1Y3NA 3OOAA 5FHOA 2I6EA 3CFXA 2H98A 1JNFA 1MRPA 2F34A 2DQVA 4F1YA 1SQYA 4OMBA 1D3KA 5EYFA 3HN0A 1LAXA 3Q26A 1CB6A 2I4BA 3GBAA 3UN6A 4KI0E 5I58B 5L8DA 5LOMA 4H1XA 1XC1A 1MXZA 1BLFA 1VE4A 3N94A 1VFDA 2HZLA 3QXMA 3LSWA 3FD3A 1VSOA 1ZMGA 1Y20A 3TCHA 2AL4A 1XVXA 4THIA 5DEXB 2QS3A 3HHFA 3O6GA 4LUBA 4FECA 3IOVA 4R73A 2DYXA 4XKPA 1GGGA 3W9WA 1HSEA 1LSTA 3U93A 2O69A 4HW8A 3CI8A 4IO3A 4ELOA 3CSBA 1ZLQA 2R6GE 3S9NC 4U21A 4GOTA 1MQIA 3RQTA 4YKKA 1Y4TA 2UVJA 4EQ9A 1PEBA 3H7MA 1IXIA 4ZZAA 3PMWA 2GH9A 3EF7A 1ZBMA 4LZ8A 5I84A 4PFUA 2QRYA 4GF8A 4ZEBA 3S9EA 2REJA 4G68A 4KYDA 1WVJA 2GHAA 4K3FA 4F19A 2RCAA 4FEDA 3QSLA 1LFIA 3HO7A 4NF6A 4H5GA 3ZKKA 3MVWA 2Y7KA 3A3CA 2XXHA 1CE2A 4OZ9A 2D5WA 5CMCA 4OENA 5KDTB 5CBRA 1IUDA 3TTLA 3V5AA 3OXNA 3B6TA 3T9VA 1MM7A 1IXCA 5JTYB 1IZ1A 2DE2A 3C9HA 4U23A 3R6UA 4NF5B 1FQBA 2HAUA 3TODA 1P1OA 3TTNA 3SDFA 4H8JA 3I6VA 5AE4A 2I49A 1Y3PA 3IB0A 1LCFA 3FJ7A 1MQHA 3OSRA 1SDXA 2Z8EA 2F7AA 4QRZA 3PPNA 3C33A 2HXWA 4QSDA 4H0WA 2VP1A 1PDAA 3HSTA 4EUOA 2QS2A 4QFPA 1LB9A 3RTFB 4H67A 2DVZA 4MLVA 4EF2A 3KGCA 2RC7A 2A5SA 1OVTA 3G3KA 3FVGA 3KSXA 4JSDA 3T9HB 4LQ2A 2HFBA 3VFJA 5TPAA 4XIGQ 3EHUA 4ONYA 2FA7A 1FW0A 2Y7PA 5CRYA 3FVNA 4QSEA 4GXSB 5CMKA 3PGFA 2XXXA 4ELPA 3H4ZA 2M8CA 2ZYNA 1MG1A 2HZKA 2QS4A 4IY6A 1DPEA 4XXUA 4O3CA 4OESA 4Q5TA 3MPKA 4NE4A 3FVKA 1MS7A 4ZDMA 4HTGA 2XXVA 2P2AA 1P1QA 4F3BA 3DP8A 2ZYOA 1B7UA 4LZ7A 5A5XA 3D4CA 4F3SA 1H76A 4ESWA 1FTLA 4FIMA 3SKPA 1FCKA 1WDNA 2Y7WA 5H8NB 3KSJA 2O6AA 4R2BA 1B2HA 1D4NA 1P1NA 3OD7A 4NWCA 1SYHA 4BDOA 1A55A 3E3KA 4KCDA 3G3IA 2FNCA 4OERA 3TQWA 5K2YA 1DPPA 1S7YA 3G3GA 3BFUA 2ANJA 1GV8A 5FHNA 4HCWA 4DCXA 4OXVA 1N3WA 4EDPA 1EH3A 1SI1A 4DLDA 3C34A 3L6GA 4JWYA 5M2VA 3H3GA 3W9VA 2XXTA 4GXAA 2F8DA 5H8FB 5CMBA 2I3VA 3BKIB 4DIGA 3HHGA 3VDFA 2PT1A 2OK2A 1OVBA 4DXCA 5AA4A 1A8EA 3Q25A 1US5A 2F7BA 3H6UA 4OQOA 4LQ5A 1B46A 1MY4A 4GL8A 3MZBA 1NL5A 4KD5A 1IEJA 2Y7RA 2DWHA 5L9MA 2QMWA 3FUZA 2UYFA 3MJNA 3JYRA 3W15C 1MPDA 3T93B 1SD3A 1ZJLA 2X7QA 1FTMA 1B3GA 1MY2A 3KJTA 2XXQA 2Q88A 2UYEA 3OO8A 1NNFA 2VGQA 4POXA 2I0BA 3I5OA 1PBQA 3PMXA 1NH8A 4UA8A 4QFLA 4OHNA 3PD9A 1NNKA 5ITPA 4AQ4A 1SW2A 3R26A 5EHSA 4RJZA 1XOCA 2ESNA 5L9SA 1R1NA 3FIRA 2RC8A 4G8HA 1JEUA 4F22A 2O1MA 4U1ZA 3OELA 3TZAA 5TP9B 4MH5A 2UVHA 4R9FA 4PFTA 3OEMA 4RPOA 1EU8A 3U72A 4BDMA 3LSXA 1N7WA 3PUXE 4GL0A 2Q89A 4I9DA 5AA2D 1N04A 4ELRA 3TDJA 2QPQA 3K01A 4JSOA 5I2KB 2Q2CA 4XTCQ 4HS7A 2O7IA 3UIFA 1FQAA 2RINA 3FXUA 2AYSA 3ODBA 3PV0E 4WEDA 3EQ1A 3K0VA 3IK6B 3QK6A 4BDRA 3DM0A 3UORA 5H8SA 3EPEA 4ECFA 4WKMA 4OEVA 4QHQA 4BDQA 1MY0A 4R6HA 5CBSA 1R6ZA 4R74A 1UIVA 2I58A 3RN8A 3SEVA 2O84X 3PMVA 1MPCA 5DTBA 4EQ7A 2D3IA 3TMGA 1YPNA 3KN3A 4OFOA 1FTOA 4JDFA 3PD8A 1XVYA 2YLNA 1XT8A 1B0LA 4E0WA 4WEPA 4JB7A 4KCCA 3A09A 1BKAA 3H6VA 1I69A 3DELB 1LFHA 5CI5A 1R9QA 5FHMA 1N76A 4X48A 3FXRA 5IKBA 1IXHA 4Z0IA 3WAEA 4IY5A 2F6GA 2I0CA 3MP1A 4KYEA 1Y1MA 2NUVA 1EZ9A 2B3BA 3Q27A 3M3FA 2XD3A 3KZGA 1ZU0A 4YMBA 2DXRA 4YB6A 2UVGA 4MBPA 4TLMB 4IO2A 1YCJA 3PPOA 2HAVA 3TAJA 2ALUA 3MVXA 2OWSA 1FQCA 4U22A 1JVYA 2PMSA 4F3PA 1WODA 2DWIA 1B3HA 3UK4A 3TQLA 3O66A 1GR2A 2D21A 3KJ7A 4GLIA 2NXOA 2NVUB 1OQHA 2F5XA 3MUQA 1AMFA 1I6AA 3SETA 2DOJA 3M3LA 3H06B 3C35A 4YB7A 5I59B 3JV9A 4YKPA 4OWDA 3R7XA 3C4MA 1H44A 1JEVA 1JW1A 2ABHA 2RF1A 2Y7IA 2XX9A 1B6HA 4MFIA 3N26A 5I56B 5I2NA 3SESA 3IJOB 1IXGA 1S50A 1PC3A 3RT6B 4I62A 2DE4A 1LB8A 4AB6A 4R6YA 3RPWA 3BBRA 4C0RA 3USDA 3PUYE 2BJJX 1AL3A 1M5DA 1A54A 1RKMA 4UACA 5H8QA 1LBBA 1NFTA 3MW0A 4BLAA 3EHTA 4JXIA 3OSQA 4QSCA 3TEPA 1H3DA 1MQJA 4F31B 4G4PA 1QW0A 2ZYMA 1HSJA 4FJPA 1I6QA 4ISUA 1B40A 4OYVA 2NWJA 3T96B 3M8UA 4YU0A 1QJMA 1MH3A 1UTHA 3IAZA 4GQOA 3ZSFA 3MP6A 5I57A 3SEWA 3PUWE 1A40A 3T66A 5AA2B 4RPNA 3M3KA 4NMYA 1QULA 2ZMBA 4DDDA 3MP8A 4U2RA 3OMBA 4FAJA 2ONKE 1DSNA 2IEEA 5H8HA 3GXAA 3VVEA 1KWHA 3K00A 4IGRA 1URGA 2QJEA 3VV5A 3N6TA 2WKYA 3CG1A 2H4IA 3SERA 3E4RA 1R9LA 3QUJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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