5CBSA

Crystal structure of the glua2 ligand-binding domain (s1s2j) in complex with the antagonist (r)-2-amino-3-(3'-hydroxybiphenyl-3-yl)propanoic acid at 1.8a resolution
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
260
structure length
260
Chain Sequence
KTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Studies on Aryl-Substituted Phenylalanines: Synthesis, Activity, and Different Binding Modes at AMPA Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2,Glutamate receptor 2
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
total genus 83
structure length 260
sequence length 260
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cbsA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5cbsA02
1JEVA 1R9QA 2XXVA 3MC2A 1Y3QA 5I57B 2OWTA 3IOTA 4ZZEA 3FVGA 4MBPA 3MVWA 4KI0E 1NKXA 4DXBA 5FHOA 4WEDA 3S4UA 2RC8A 1SYIA 4AB6A 3MVXA 1JEUA 3V89B 1FQAA 3W9VA 5IAIA 1FQBA 3IR1A 2R71A 1S9TA 3IO4A 1DMBA 1MH3A 4YKKA 5M2VA 3M8UA 2XD2A 1XOCA 3KSJA 1OIBA 4I8CA 2E1SA 2QMXA 1GGGA 1FTMA 1CE2A 3LR1A 2W7YA 1LAHE 2PT1A 1MY1A 3VVEA 4QFLA 2XD3A 5B7DA 3PD8A 3PPOA 3FXQA 2V25A 2HEUA 4YKPA 2G29A 1B46A 1NNFA 1MPDA 2WKYA 4THIA 1MXZA 2VD3A 1LBCA 4MLVA 3QK6A 3T66A 3H6TA 1HSEA 5I2NB 2UYEA 4OZ9A 4C1UA 2I58A 2DE4A 2HZLA 5AA1A 3MP1A 4F3PA 4U21A 5JK4A 1B7ZA 2Y7RA 1LCFA 1JQFA 1TFAA 3B6QA 2XX7A 2NVUB 3SERA 1UTBB 3OEKA 4ELRA 5TP9A 3FJMA 5A5XA 3VLVA 5CBSA 2H99A 3E9XA 4KCDA 3T96B 1NL5A 3G3FA 1IITA 3FXRA 4H65A 2NUVA 3KJTA 4R72A 2I49A 5HM4B 4KHZE 1TWYA 2XXQA 2FNCA 3LSWA 3TCFA 1LSTA 3IK6B 3Q29A 2XXXA 1JVXA 2UYFA 5I56B 2AIXA 3OMBA 2XX9A 5I2KA 3E3KA 1Q35A 3FV2A 4X1DA 1PC3A 3FJ7A 4YB7A 3K4UA 2G93A 3G3JA 1TT1A 2I48A 3RT6B 1MPCA 1UTHA 1B4ZA 2OLBA 5H8HA 4F1YA 3TTNA 4IY6A 1JW5A 1Y4CA 4Q30B 1CB6A 1DTZA 1N0TA 3TTKA 2A5TA 3ONMA 1BIYA 2H4IA 3IOVA 3LSXA 3PUZE 1IEJA 3B6WA 5JTYB 3K01A 4JSDA 3IOWA 1P1WA 3P7IA 3ODBA 3GBBA 3RPWA 2D5WA 5CBRA 3CI8A 1NFTA 3UORA 2I6EA 4G8NA 3F11A 1EZ9A 4IO2A 3C36A 4R74A 4LP2B 4DIGA 4BDOA 3BFTA 2R6GE 1TXFA 3IJOB 3M3LA 4GL0A 1OQGA 5CC2A 1II5A 3O28A 4M4GA 3KJ7A 1FTJA 3U92A 4H67A 2HXWA 2QJEA 2DWJA 4OFJA 4FEDA 5DEXB 1FCKA 3PMVA 1NNKA 1QJMA 1FTKA 3SEYA 4EXKA 1IXCA 2DS9A 1DTGA 1POY1 5DVFA 4Z0IA 4R6KA 4G4PA 4FATA 1YPNA 3Q27A 3JYRA 4F22A 3VXCA 1BP5A 4U2RA 1MS7A 4OMBA 4JWXA 1B2HA 3N6UA 1LAXA 4KFQA 3K1PA 1GR2A 3O97A 3GBAA 2PX1A 2Z23A 4EUOA 4YAHX 4YMAA 4FEBA 4RPNA 2F7CA 1SI1A 2P2AA 4KYEA 1US4A 1P99A 3MW0A 1YTVA 2RCBA 3H06B 3FVNA 5FTHA 4PFWA 3K1NA 3PPPA 1LGBC 1MXUA 3GZGA 2XXPA 1FQFA 5I58A 2IA4A 4X1BA 4KCCA 2Y7IA 2GFEA 2DQVA 3KG2A 3VVFA 2RKMA 4OFOA 4F18A 1ATGA 3QYTA 4H5GA 5KZTA 5EYFA 4EQ7A 2QS3A 3PMWA 4XKNA 1I69A 4P0GA 3OENA 5AE4A 5KDTA 1B3HA 4QFKA 2KLFA 3KOSA 1B5HA 1A7LA 3EHTA 4FAJA 4RPOA 3N26A 3UGWA 5CMCA 3TYHA 1MXYA 4P0IA 3B6TA 5I2KB 1N7WA 1Y20A 2FYIA 3K6WA 1Y3PA 4H8JA 1QVSA 1UIUA 3VLUA 4P11A 4RY1A 3V83A 3OXNA 3VVDA 1XC1A 2CMOA 1XVXA 2QS2A 3K2DA 3ZS6A 1MPBA 1UTHB 3RNNA 2ONKE 5H8HB 3LBSA 1IZ1A 4RYAA 4FECA 4PETA 1DOTA 3SEXA 2AL4A 2GHAA 1NH7A 4OWDA 4MLQA 4ZZAA 3HN0A 1N7XA 4IO7A 1MXWA 4OESA 3EQ1A 3LC8A 4QSCA 2QMWA 3K1MA 5H8FB 1LFGA 4R2BA 3IOUA 5HBCA 3QIMA 4YB5A 1QKBA 2ALUA 2DSFA 4F31B 3MBPA 3K6VA 3LSFB 3WAFA 4KD5A 5H8QA 1SW1A 4MH5A 4I62A 2P0SA 3TCHA 3HO7A 4DXUA 1H76A 3WAEA 4IY5A 3EHUA 4RNSA 2PYYA 3G3IA 3FUZA 3QAXA 1ZBMA 4G68C 1MXXA 3I6VA 3IB0A 3MZ9A 1Z7NE 2X7QA 4LUBA 4MFIA 1ZKBA 2F6GA 3TZAA 2VGQA 4LQ2A 2YJPA 3R6UA 5DT6A 4IO3A 1S7YA 3W9WA 1USYH 2I0BA 4EQBA 2RF1A 1H43A 4NF5A 3MVYA 1OVBA 2R9JA 4PE5B 1OQHA 3TODA 1MQIA 4OEUA 1FQDA 1OMPA 4E0WA 5CMBA 2AYSA 1Y9UA 2XXUA 3OO6A 2LAOA 2V84A 4OQOA 3PPRA 1NH8A 1QW0A 3TELA 1YAEA 1MY0A 5L8DA 3H03A 3N5LA 1I6AA 2CZLA 3O6HA 4HS7A 1N76A 3DELB 3FZVA 4LATA 3FASA 4Z7EA 3SEUA 2F78A 4GFRA 1B32A 3TQLA 4NWDA 2ANJA 4AB5A 3DP4A 3FD3A 3CG3A 1P1NA 3H6UA 1R6ZA 3B7DA 1WDNA 4ZECA 3BKIB 1B3LA 3A09A 1ZIUA 1SW5A 3OEMA 4R6HA 1PEBA 3N6TA 1SVXB 5KDTB 2B3BA 4OTEA 2THIA 1FTLA 3TDJA 4OEVA 3RLFE 1KWHA 1B3GA 4Q8RA 5I59A 4H6DA 1AMFA 2H9BA 1HSLA 2E0SA 3FIRA 1OVTA 3CRBA 3UIFA 3H6VA 3GXAA 2O51A 4R75A 3IB1A 3O66A 4F3GA 1SW4A 3MZ1A 2PBWA 2QSXA 4C0RA 2F35A 2Q89A 3FVOA 3THIA 3ZSFA 1PB9A 4LONB 3SESA 1D4NA 1AOVA 1GV8A 3HSTA 3O2AA 3MWBA 4H0WA 4AQ4A 5DVJA 3KN8A 4YKIA 1MQGA 1XT8A 4KQPA 3HPIA 3SEWA 3U94A 1B6HA 3T9UA 4NF8A 3OOAA 3TUSA 3K02A 3DP6A 5J1DA 5FHMA 3CFLA 2XXRA 5H8QB 2O7IA 3C32A 3S2VA 3TTLA 4IGTA 2V93A 1LB9A 1XS5A 3W15C 4ND9A 3VXBA 4I1DA 1PB8A 4LZ7A 1B0LA 4JB7A 4R9GA 2DWAA 2Q9TA 2F36A 4BDMA 3IJXB 1R9LA 4F29A 1QUJA 1URSA 5ITPA 2PVUA 4GL8A 4F1VA 1JW4A 5F7VA 4GXSB 4PFTA 5TPAA 1P1UA 4HCYA 2XXHA 4N13A 3TTMA 4LA9A 5JEIA 2AL5A 5ISUA 1JETA 1YCJA 4QFPA 1ZLQA 3OELA 1H44A 3S9MC 4JXIA 1H45A 4NWCA 1D3KA 4ZE9A 3CVGA 2Z8DA 3SDFA 3OO9A 4GXAA 1MQHA 1M5DA 1RKMA 3C31A 2O6AA 1B5IA 1US5A 4KR5A 2DXYA 3DLNA 4UACA 3QXMA 2VHAA 4GLIA 1B3EA 2BJJX 3K6UA 3E13X 3BFUA 5CRYA 4R2FA 3TAJA 3ILTB 2V3UA 3M3KA 4BDNA 1MY3A 5KCJA 4F3BA 3MAMA 1D9YA 3A3UA 1O7TA 3T22A 4YICA 4XIGQ 4XKPA 4OFLA 4DCYA 4F19A 1ELJA 1O63A 1PBPA 5CI5A 2GHBA 1UQWA 4H5FA 1QUKA 2XXIA 4JBZA 4I9DA 4XKQA 1NNTA 4RK2A 2PT2A 3TEPA 3PV0E 2DE2A 2IEEA 2QS1A 3N94A 4H8IA 5AA2A 2RCAA 4KYDA 5I59B 1Z7ME 4LQ5A 5CMMA 1B58A 1AL3A 4BDLA 3Q28A 4K3FA 2REJA 4F2QA 3CSBA 3TMGA 5B70A 1R1NA 4DZ1A 1Y1ZA 3T93B 4DLDA 4LZ8A 3EHSA 4GRKA 2YPNA 3FV1A 1A8EA 4JWOA 2PMSA 3IORA 5TP9B 2UVJA 3O9PA 5L9OA 5ICQA 2OJTA 3HHFA 4G8MA 5A5XB 3IO6A 3H6WA 4H1XA 4ZE8A 4ZS9A 1HSJA 4WKMA 4MF3A 1P1QA 1VFDA 4GIZA 3JZJA 3S9NC 2OBGA 2H5YA 2V3QA 3H3GA 2OZZA 1MH4A 2REGA 1PBQA 2DE3A 3ILUB 5DTBA 3VLWA 2P1SA 3FVKA 2UVGA 4OETA 1ANFA 1EU8A 3T9VA 3U93A 3HCQA 2DVZA 1EZOA 4KYSA 3CR9A 1MXVA 1B7UA 2Z8EA 2DP8A 5I2NA 2D21A 3K00A 4R73A 5TU0A 2A5TB 4FIMA 4NMYA 1JNFA 3USDA 1ZU0A 5BUUA 4PFUA 4NF6A 1QKAA 3PGFA 5TPAB 5F1QA 2H98A 2NWJA 1IXGA 4ONYA 2Q8JA 1MG1A 1N84A 4ESWA 4M1VA 2XXYA 2XXWA 3PU5A 5EHMA 4JDFA 2QS4A 4GWOA 3T9HB 3PPQA 1AIVA 4TQUQ 1URGA 1JW1A 3H4ZA 4G68A 4EXLA 5EHSA 1JVYA 1GTKA 2O1LA 1LFIA 3VV5A 2Y7WA 4G77A 1SI0A 2O69A 3KN3A 4BDRA 3Q26A 3RN8A 4EQ9A 2Q88A 2O7UA 3KGCA 4POWA 1DSNA 2NXOA 2B65A 1VSOA 4U4XA 3MQ9A 3IB2A 3TCGA 3KFMA 3MVZA 1IIWA 1N3XA 1QULA 2VOZA 3C35A 3H7MA 4L17A 2F7AA 4ZEKA 2HAUA 1A40A 4F1UA 4TLLB 2XHDA 2H25A 3OD7A 1B0HA 3G3HA 3G3KA 3E4RA 1EH3A 1BLFA 5AA2B 4WXJA 2Z8FA 1FQEA 1XHYA 4RA1A 5DYHA 3RTWB 5FTIA 1M5CA 5L9MA 3UN6A 1IXIA 2UVHA 5CM6A 1F9BA 1MQDA 1SYHA 4YMBA 1DPEA 2GH9A 2DWHA 1Q1KA 1A8FA 4G2ZA 2ZMBA 3MUQA 4BLAA 5I58B 1A55A 4N07A 3KOTA 1URDA 1LB8A 4OVJA 5DEXA 1PDAA 4NEDA 2ZYKA 4PFYA 2HCAA 2GRVA 4IGRA 3HHGA 3TPAA 3PUXE 3RY3A 2NOOA 2HAVA 1T0KA 4QFNA 2ZNUA 1TFDA 2I0CA 3UK4A 3O6IA 1B7HA 5ELVA 3G3GA 2RINA 1QUIA 3KBRA 3EPEA 5HPQA 1AH5A 3PD9A 1IUDA 2F6PA 2I3WA 2HFBA 3SETA 3TFLA 3MJNA 4PP0A 4U1ZA 2OWSA 3MPKA 4O3BA 4XKRA 2VD2A 4DXCA 5I84A 1WODA 1ZMGA 3A3CA 4IO6A 1USYE 2Q2CA 3CFXA 1DPPA 4OERA 1Y3NA 2QRYA 4GQOA 4ISUA 4C1TA 1L5TA 3KN7A 2ESNA 4ECFA 1LLSA 5IKBA 1VR5A 1WVJA 1BKAA 3MP8A 1B40A 4ZEFA 2ZNSA 4R9FA 4QF9A 4G8HA 4NF6B 4ZEBA 1OLAA 3FGSA 2Q2AA 4O3CA 4R6YA 4ELOA 2DXRA 3IAZA 2UXAA 2O1MA 2DYXA 4ESXA 1MM7A 3K6XA 4N6PA 2Y7KA 4GOTA 2ABHA 5DVIA 1M5FA 4YB6A 3RT8A 3MPLA 1GVCA 4BDQA 2A5SA 1N04A 4NF4A 2ZYMA 1FTOA 3PUVE 1MY4A 4EDPA 4JSOA 4G68B 4U1OA 3FXUA 1Y1MA 5AA3A 2DWIA 2RC7A 1B51A 5H8SA 1MRPA 5ICTA 1O64A 1RYXA 3MZBA 4FJPA 1PB7A 3R7XA 3HV1A 4Q5TA 2ZYNA 1A54A 1POTA 1B9JA 4WEPA 1J1NA 4LVQA 4NE4A 3K0VA 4ZEIA 3OO7A 1IXHA 4ZEDA 4IB2A 3TQWA 4X48A 3LSLA 5ITOA 4OXVA 4NF5B 3U8QA 3I3VA 3T9XB 4RJZA 1LFHA 4RK9A 2OCUA 1I6BA 2QL3A 4QFOA 2F8DA 4GVOA 3MP6A 3JV9A 2I4CA 5H8FA 2F7BA 2X7PA 2HZKA 1SD3A 4ELQA 1SBPA 5BWJA 4TLMB 3PUYE 3Q25A 5CMKA 5FHNA 3IL1B 1B1XA 3QUJA 3RQTA 2X26A 3V5AA 5H8NA 3RGYA 1I6QA 1VFEA 2I3VA 3OO8A 3QSLA 2ONSA 3O29A 1NMUA 1Y4TA 2OK2A 3ZKKA 4POXA 5AA4A 3OSRA 1A99A 3V8XB 4E0XA 3OSQA 1UIVA 4QHQA 3I5OA 4NTLA 3G7WA 3LUYA 3ECRA 3TKDA 3VFJA 4OYVA 3AXFA 3RTFB 1OLCA 2XXTA 1IQ7A 4YKJA 3IX1A 3DM0A 3BBRA 4EF2A 4HTGA 4EF1A 5I57A 2XX8A 1B5JA 4XXUA 4GF8A 1RYOA 5K2XA 1H3DA 3FJGA 4KPTA 2I4BA 4DE8A 2ZNTA 3VE1B 4F2OA 3O6GA 2Y84A 4HCWA 3L6GA 1LBBA 1LCTA 4PQJA 2RC9A 5K2YA 3KEIA 1SDXA 1D9VA 1MQJA 4NF8B 4ZDMA 3C34A 2F34A 2DOJA 2VP1A 1MM6A 5L9SA 2ONRA 4DCXA 4U23A 4OENA 4NF4B 4X9TA 3L6HA 3EF7A 1ZJLA 1MY2A 1S50A 1NNPA 1B3FA 3KZGA 2F97A 4DDDA 3D4CA 4JWYA 2O84X 2Z22A 4TOZA 4OHNA 4QRZA 1SW2A 2UVIA 1VE4A 4IO5A 4FE8A 3PPNA 4LZ5A 3SEVA 1B1HA 3R26A 3FATA 3S9EA 1SQYA 4F3SA 3S9LC 2O68A 2V3TA 3VDFA 4RXLA 1UTBA 1BTJA 3PMXA 4Q0CA 2HQ0A 1FQCA 2M8CA 4F39A 2DVCA 3KSXA 3SKPA 1ZTYA 1LAFE 3UP9A 3ZKLA 4IO4A 3GLBA 4ELPA 1B4HA 4UA8A 3CSGA 4HW8A 1FW0A 3C33A 1EZPA 2ZXTA 1P1OA 4FORA 3PUWE 3RUMA 1N3WA 3CIJA 3CFZA 3C9HA 2B3FA 5I56A 3M3FA 2Y7PA 4U22A 5AA2D 3DP8A 3CG1A 1B52A 2F5XA 3TTRA 3QUFA 1XVYA 5LOMA 5H8NB 4XTCQ 2D3IA 5KCJB 1MDQA 2ZYOA 1M5BA 1M5EA 4O3AA 4QSEA 2YLNA 4U4SA 5AA4B 2FA7A 3U1OA 4QSDA 3C4MA 4YZZA 1B05A 5JTYA 3D4GA 3UA8A 1MDP1 1LAGE 2QPQA 3U72A 4YU0A 4GD5A 3EN3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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