The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
64
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sequence length |
152
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structure length |
152
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Chain Sequence |
GLSDGEWQQVLNVWGKVEADIAGHGQEVLIRLFTGHPETLEKFDKFKHLKTEAEMKASEDLKKHGTVVLTALGGILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISDAIIHVLHSKHPGDFGADAQGAMTKALELFRNDIAAKYKELGFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Direct observation of ultrafast collective motions in CO myoglobin upon ligand dissociation.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxygen storage
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| molecule keywords |
Myoglobin
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| total genus |
64
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| structure length |
152
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| sequence length |
152
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-07-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1HDS B; 3CY5 B; 1A3N B; 1MBD A; 3VRF B; 4G1V A; 2R4X A; 1GDJ A; 1RQ3 A; 3MKB A; 4FC3 B; 4OOD A; 1SWM A; 3KMF A; 4TYX A; 3R5I A; 2QSP A; 1ITH A; 2ZLU A; 3UH5 A; 1A00 A; 4TWU A; 2W6Y A; 2ZSZ A; 3MBA A; 1OJ6 A; 3BCQ B; 1GDL A; 1KFR A; 1THB A; 1MYZ A; 3NFE B; 3HYU B; 1LFY B; 4MQG A; 1HSY A; 1OUT A; 3S66 B; 1Y4B A; 3WHM A; 2KSC A; 3PI2 A; 2V1E A; 1C7B B; 2ZLX A; 1O1K B; 1LA6 A; 1HDA B; 2DC3 A; 3WI8 A; 2BLJ M; 1YIE B; 4O2G A; 1A4F B; 2RI4 B; 2WTH A; 5JDO F; 4HRT B; 4F6J A; 1JDO A; 3LB1 A; 1HGB B; 1AJ9 B; 4HRR A; 1A3O B; 4MAX A; 3WCT C; 3BOM B; 2R1H B; 4ODC A; 3LR9 A; 3IC2 A; 5CN8 A; 1YGD B; 2IG3 A; 3ARJ A; 1CBM A; 1LH1 A; 1A6G A; 3E5O A; 3W4U A; 1WVP A; 1GZX B; 5HAV A; 1Q1F A; 4PQC A; 2OLP A; 1XZU A; 4DWT A; 1S0H B; 1LTW A; 4F4O A; 4FWZ A; 1YHR B; 1HAB B; 1YZI B; 1MOA A; 1Y4G A; 1JZM A; 1X9F A; 2H8F B; 3WCU D; 2R80 B; 1NEJ A; 3AT6 B; 3AT5 B; 1ABW A; 1N9X A; 1NPG A; 2LH2 A; 4KJT A; 1BZ0 B; 3WCV A; 2LHB A; 3UHX A; 1XQ5 B; 3G4R A; 1K1K A; 2O5T X; 4B4Y A; 2PGH A; 4DC8 A; 2OHB A; 3PT7 B; 3GKV A; 2O5Q X; 3NG6 B; 2NRL A; 1RSE A; 2MHB A; 1ECA A; 1KD2 B; 1M9P A; 3ZOM A; 3PT8 A; 1DXV B; 1TU9 A; 3BJ3 A; 5C6E A; 1UMO A; 3H58 A; 1HDB A; 3MJU A; 2CMM A; 1HLB A; 6HBI A; 5HLX A; 2OHA A; 1C7D A; 1HGC A; 1Y0D B; 1YOH A; 5AB8 A; 3GQG B; 1HGA A; 1YVT A; 1HBB A; 1HBH A; 2W72 A; 1DWT A; 1Y0T B; 4PQ6 A; 3EOK B; 5MBN A; 1XZ2 A; 3WCW A; 5HLQ A; 3O7N A; 3M3B A; 4NXA A; 3KUO A; 1BJE A; 1UIW A; 1JP8 A; 2W6V B; 1RQA A; 1VHB A; 2ZFO D; 1RVW A; 4QAU A; 103M A; 1FSX A; 3D1A A; 2XKG A; 1YGF B; 2V1H A; 5HU6 A; 1LH2 A; 1LUE A; 4F6D A; 4KMV A; 2VYZ A; 2W31 A; 3V2Z A; 2XYK A; 2D2N D; 1CIO A; 3DHT A; 1A01 B; 4C0N A; 5EE4 D; 1JZL A; 1MNK A; 2HBD B; 1DXT B; 2JHO A; 3B75 A; 5B84 A; 2G11 A; 1YDZ A; 1MYI A; 1MBC A; 1Y35 A; 1QPW A; 2QMB B; 4PQB A; 3ZJP A; 1PBX B; 3OO5 B; 1Y4P A; 5EYS A; 1S56 A; 4XS0 A; 1G08 A; 5CN9 A; 4U8U A; 2Z6S A; 4L7Y A; 2V1F A; 1YEQ A; 2QU0 B; 3KUN A; 109M A; 1J3Y B; 2BWH A; 6HBW A; 3G46 A; 4AVE A; 1YE0 B; 1X3K A; 3WCU B; 1Y31 A; 1Y83 B; 1QSH A; 1O1I B; 1O1O A; 3D17 B; 3ZOL A; 2G0V A; 4X0L B; 1YHU A; 2HBF B; 3TM3 A; 4KN3 A; 3EDB A; 3VRE B; 1LFT B; 1Y8W A; 1ASH A; 1XZV A; 112M A; 1A01 A; 1S6A A; 1HDS A; 3CY5 A; 1F5P A; 4NI0 B; 1A3N A; 1JL7 A; 2XKH A; 3VRF A; 1JF3 A; 1V07 A; 1Y09 A; 1Y85 B; 4FC3 A; 1LH7 A; 1T1N B; 3LB2 A; 3LQD B; 1XCH A; 1Y0W A; 1YG5 B; 2FRF A; 4NS2 A; 4UIQ A; 3K8B A; 3QM5 A; 2MB5 A; 2ZT2 A; 3P5Q B; 3BCQ A; 3ZH0 A; 5CMV A; 3UHQ A; 3NFE A; 3HYU A; 1LFY A; 3S66 A; 4H2L A; 3WHM B; 2ZFO B; 2D6C A; 1C7B A; 4FH6 A; 4C44 A; 4ZVA A; 3D1K B; 1O1K A; 1MLM A; 1HDA A; 1LA6 B; 2BK9 A; 2BLH A; 2LH6 A; 1GLI B; 3HXN B; 3UH3 A; 1SDK A; 2ZLT B; 1YIE A; 2QFN A; 1A4F A; 1FSL A; 5CNB A; 4HRT A; 4YU4 A; 5EET A; 2R4Z A; 3UH6 A; 3E4N A; 3WCT D; 1A3O A; 5CN7 A; 3BOM A; 2R1H A; 2R4W A; 2AA1 B; 1MLL A; 1YGD A; 4IRO B; 3IA3 B; 3UHT A; 1F65 A; 3UHS A; 1MYG A; 4H0B A; 3GDJ B; 5HBI A; 1GZX A; 104M A; 1HV4 B; 2ZT3 A; 1W92 A; 1BIN A; 5HY8 B; 2ZSR A; 3K9Z A; 107M A; 1YHR A; 1EBT A; 5KER B; 1CH5 A; 1HAB A; 1YZI A; 2H8F A; 3QM9 A; 2R80 A; 3E55 A; 3AT6 A; 3AT5 A; 1YE2 B; 1C40 B; 4N7N B; 1BVD A; 1BZ0 A; 3UHH A; 1XQ5 A; 2AUR A; 2PGH B; 3PT7 A; 2GRZ A; 1KD2 A; 1B0B A; 1M9P B; 1HAC B; 1R1Y B; 1IDR A; 1DXV A; 3ECX A; 3PT8 B; 3H57 A; 3ZJN A; 2DXM A; 1A0U B; 1V4X B; 3AG0 A; 4F6G A; 1Y0D A; 1NAZ A; 3DUT B; 3QZX A; 2O5S X; 3AQ8 A; 2LH7 A; 1A6M A; 1Y0T A; 3EOK A; 5MBA A; 2D5Z B; 1J3Z B; 2HZ2 A; 1J7W A; 5EU2 A; 5ILE A; 5E29 B; 4MPM A; 1O1N B; 1MBS A; 1MWC A; 2W6V A; 3R0G A; 1VXE A; 4MQH B; 3QJD B; 1RQA B; 2WTG A; 4F6B A; 1YVQ B; 3BJ1 B; 1YGF A; 2MGI A; 1DLY A; 2O5B X; 1SHR B; 2MYE A; 3S65 B; 2ZSY A; 3CIU B; 2MGJ A; 1NZ5 A; 4M4A B; 1MWD A; 2ZS1 C; 2D2N C; 5CN6 A; 2XKI A; 2SPM A; 2D5X B; 2HBD A; 3PEL B; 3RJN B; 2OH9 A; 5EE4 C; 1DXT A; 1UX9 A; 3WCT B; 3D7O B; 1C7C B; 2MYA A; 2GRH A; 1MBA A; 2VEB A; 1MBN A; 2DN2 B; 2QMB A; 2VYY A; 4M4B B; 1PBX A; 3OO5 A; 2ZLV B; 1FDH A; 1COH B; 4U8U B; 3G53 A; 2QU0 A; 3TM9 A; 1V5H A; 3GYS B; 1J3Y A; 1GDK A; 2D2M C; 1YCA A; 4MQJ B; 1YEU B; 1YE0 A; 1CH2 A; 1VXC A; 3V2V A; 3WCU A; 1O1I A; 1QSH B; 3UHU A; 1MOC A; 3D17 A; 3MYN A; 4X0L A; 1PMB A; 2HBF A; 3A2G A; 3EU1 B; 1LFT A; 3HEN A; 1YMA A; 1YMC A; 4F69 A; 5CN4 A; 4NI0 A; 2G14 A; 5EYJ A; 1MLR A; 1DM1 A; 1H1X A; 1Y85 A; 1Y09 B; 1LFL A; 3PI8 B; 1T1N A; 1MOB A; 3LQD A; 1MLQ A; 2MGC A; 2B7H B; 1YG5 A; 1Y0W B; 1GJN A; 1J41 B; 1Y4Q B; 1F5O A; 1OR6 A; 3VRG B; 3K8B B; 1HJT A; 3P5Q A; 1MZ0 A; 1HRM A; 4ESA B; 5ILM A; 1FDH G; 2HZ3 A; 4L2M A; 3ECZ A; 1EW6 A; 2O5O X; 1HBS B; 1YIH B; 4H2L B; 2ZFO A; 3AQ5 A; 1FAW B; 3ED9 A; 3HEP A; 3D1K A; 3PI9 A; 2ZSQ A; 4ROM B; 1GLI A; 2EKT A; 3HXN A; 1JEB B; 2Z6T A; 3PIA B; 1SDK B; 2ZLT A; 5JDO E; 3RGK A; 1UFJ A; 1CQX A; 2BW9 M; 4N7O B; 4YU3 A; 4YU4 B; 2H35 B; 2HZ1 A; 1URY A; 3ODQ B; 2V1G A; 1MLU A; 2AA1 A; 4FH7 A; 4IRO A; 1NQP B; 3BJ2 B; 3ZJO A; 1EWA A; 4NXC A; 3GDJ A; 2G0Z A; 2QSS B; 4O35 A; 1MNJ A; 5ILP A; 3A59 A; 1HV4 A; 1VXA A; 5HY8 A; 1S5X A; 1G9V B; 5ILR A; 1CH3 A; 5KER A; 2C0K A; 2GKN A; 1YH9 B; 1FN3 B; 1BAB B; 2GL3 A; 1MLS A; 1VXB A; 3HF4 B; 1CH4 A; 1YE2 A; 1C40 A; 1OBM A; 4N7N A; 2VRY A; 1YEV B; 1IRD B; 2LH5 A; 2ZLW B; 2HBC B; 111M A; 1HAC A; 1R1Y A; 4WJG A; 1X46 A; 5EUI B; 3DHR B; 1MYF A; 1A0U A; 4JYQ A; 1LH5 A; 2DXM B; 5EQM A; 1V4X A; 2ZST A; 1Y7C A; 2GTL C; 4MBA A; 3NMM B; 3DUT A; 1LFZ B; 2MYB A; 4SDH A; 1DTM A; 1CLS B; 1UVY A; 2AV0 A; 1CH1 A; 2Z6N A; 2NSS A; 2D5Z A; 1MNO A; 1J3Z A; 2GNV A; 3HC9 A; 2ZS0 C; 1J7W B; 1HBI A; 5E29 A; 1NWN A; 2ZT4 A; 1O1N A; 1HBG A; 1IWH B; 4MQH A; 5AZQ A; 3QJD A; 1BZ1 B; 4FWX A; 1Y22 B; 1YVQ A; 3OJ1 A; 1NZ4 A; 3BJ1 A; 3OGB A; 3UHG A; 2D60 B; 1FLP A; 1SHR A; 3GLN A; 1V4U A; 1UX8 A; 108M A; 3S65 A; 1B86 B; 3CIU A; 2VYW A; 2ZS1 D; 1NXF A; 1MNI A; 1LFV B; 4M4A A; 2Z85 A; 2OIF A; 110M A; 1FHJ B; 3OZW A; 5B85 A; 1SDL B; 1GBU B; 2D5X A; 3PEL A; 2EVK A; 2EVP A; 3D7O A; 3SZK A; 3WCT A; 1Y7Z B; 1C7C A; 2MGA A; 1DWS A; 2PEG B; 1IT3 A; 1BZR A; 1YCB A; 3S1J A; 3QZZ A; 1MYM A; 2DN2 A; 2G12 A; 2V1J A; 4M4B A; 3ZJR A; 2ZLV A; 2HBS B; 3D4X B; 1COH A; 1MYH A; 2VLY A; 2MGH A; 1A6N A; 1DO7 A; 1MLH A; 2MGD A; 1Y45 B; 3GYS A; 2D2M D; 5EV5 A; 1IBE B; 2ZT1 A; 1LHT A; 4MQJ A; 1DWR A; 1YEU A; 2SPL A; 3QQR A; 2WY4 A; 1JY7 B; 2IN4 A; 3WFT A; 1VRF A; 1LHS A; 1VRE A; 2VM0 A; 1HBA B; 102M A; 2M6Z B; 1JZK A; 1NIH B; 3EU1 A; 4HSW A; 1HHO B; 4N8T B; 2ZSS A; 2NRM A; 4UZV A; 3AQ7 A; 3PI8 A; 1LFL B; 2GLN A; 2B7H A; 1MOH A; 5JDO C; 2G3H A; 1J41 A; 1Y4Q A; 3VRG A; 2RAO B; 1J7S B; 2SPO A; 4ESA A; 4TWV A; 1NWI A; 1HBS A; 1CPW A; 1HLM A; 1YIH A; 1YOI A; 1XY0 B; 5CN5 A; 1FAW A; 2DN3 A; 4MU5 A; 106M A; 5CNC A; 3PI9 B; 2O58 X; 1MBO A; 1MOD A; 4ROM A; 3UHN A; 2E2Y A; 1JEB A; 3PIA A; 4ILZ A; 1NZ2 A; 2H8D B; 4O4T A; 1U7S A; 4G51 B; 4N7O A; 1Y01 B; 2G0S A; 3WFW A; 2ZS1 B; 1Y0C B; 2D2N B; 4YU3 B; 2AV3 A; 2H35 A; 105M A; 4MQK B; 1XZ5 B; 2VLX A; 1CO8 A; 3ODQ A; 1MLJ A; 1RPS B; 3ECL A; 3ZJJ A; 3GQR B; 1NQP A; 3HHB A; 2MGK A; 3BJ2 A; 1N9F A; 1A9W A; 2QFK A; 3OK5 A; 2QSS A; 2GKM A; 3UGZ A; 1SPG B; 3A59 B; 1SPE A; 1MBI A; 2EF2 A; 1O1P B; 1G9V A; 1S5X B; 2ZSX A; 1O1L A; 1YH9 A; 1FN3 A; 1BAB A; 3OVU C; 2D2M B; 1ECD A; 3HF4 A; 1BZP A; 1YEO B; 3O89 A; 3IC0 B; 1L2K A; 3TLD A; 1YEV A; 1NZ3 A; 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3QM8 A; 3OO4 B; 1HBA A; 2LH3 A; 2M6Z A; 2MGL A; 1QXE B; 3QM6 A; 1NIH A; 1Y8K B; 1HBR B; 1RQ4 B; 3ZJQ A; 2MGB A; 1ABY A; 3A9M A; 1DXU B; 1X9F C; 1CH7 A; 1HHO A; 4N8T A; 3G4U A; 3WCV C; 1BZ6 A; 2SPN A; 3G4Q A; 1CQ2 A; 1N9I A; 2GDM A; 5JDO D; 2GTL B; 1BVC A; 2RAO A; 3G52 A; 5D5R A; 4NK1 A; 1J7S A; 1S61 A; 1YMB A; 3WCP B; 4O4Z A; 1MWB A; 2ZS0 B; 2HCO B; 1Y5K B; 3G4Y A; 4H07 A; 1XY0 A; 5SW7 B; 2W72 C; 4F6I A; 3ZJS A; 3GOU B; 2DN3 B; 3WCW C; 2BMM A; 1YEN B; 3UHV A; 1RTX A; 1MLO A; 1DUO A; 3A0G B; 1VXH A; 1G09 B; 4DWU A; 1XZ4 B; 2H8D A; 1Z8U B; 4G51 A; 1MLF A; 2ZS1 A; 1Y0C A; 2D2N A; 4NZI A; 4F6F A; 2HHD B; 1D8U A; 4MQK A; 1VXF A; 1XZ5 A; 1IRC A; 1RPS A; 1UT0 A; 3GQR A; 3OZV A; 4PNJ A; 1XXT B; 3HHB B; 1MNH A; 3UHC A; 3S1I A; 2FRJ X; 2MGE A; 3LR7 A; 1MLG A; 1SPG A; 1HCO B; 1Y0A B; 3UHD A; 1NS6 B; 3PI1 A; 1O1P A; 1VWT B; 1CMY B; 1Y7D B; 3UHE A; 1O1L B; 1GVH A; 2D2M A; 1YEO A; 3HRW B; 2ZSO A; 1OFK A; 2W6W A; 3IC0 A; 4U8U C; 1J40 B; 2W6X A; 1Y4F B; 1QSI B; 1CIK A; 1J3F A; 1SI4 B; 3FH9 A; 1QXD A; 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