5CQ4A

Crystal structure of the bromodomain of bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2b (baz2b) in complex with 3'-hydroxyacetophenone (sgc - diamond i04-1 fragment screening)
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Crystal structure of the second bromodomain of bromodomain adjancent to zinc finger domain protein 2B (BAZ2B) in complex with 3'-Hydroxyacetophenone (SGC - Diamond I04-1 fragment screening)
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5cq4A00
5F62A 5DBMA 1X0JA 5D7XA 4ZQLA 4F3IA 3O33A 5FG5A 3O37A 4BW3A 3G0JA 5FH7A 3Q2FA 4HBXA 4YYHA 5D3LA 5D0CA 3ZYUA 5H85A 4N4FA 4MEQA 5HM0A 4UYHA 5I80A 5ACYA 4HXPA 5CUCA 3P5OA 3U5MA 5KTWA 4YYNA 4XY8A 4IOOA 5I83A 5LKZA 5EU1A 3LXJA 2RFJA 2NXBA 5E9LA 3UV2A 4A9NA 3U5PA 4HBVA 5ENFA 5FG6A 3NXBA 2OSSA 5D3RA 4UIYA 5ETDA 4NR4A 3RCWA 3JVLA 4ZC9A 5CQ3A 3QZSA 2YEMA 5I89A 4QR3A 4FLPA 4YATA 5EWDA 2G4AA 5EPRA 4ALHA 5FE9A 5F61A 5KU3A 5A5SA 4IR5A 3TLPA 5EPSA 3IU5A 5BT4A 4CL9A 4NRBA 5HEMA 2LSPB 5LJ2A 4A9KA 4YH4A 3SVFA 2F6NA 4CUPA 4Q0NA 3UVYA 4YBSA 5CU8A 5I1QA 4NUDA 5E7DA 4LC2A 4QY4A 4NR6A 5D26A 5HQ5A 4QSSA 5DW2A 5E73A 4GPJA 4CURA 5DW1A 3U5NA 5FE3A 4Y03A 3UV5A 3SVHA 4QSRA 5FBXA 5BT3A 2E3KA 3AQAA 4XY9A 3JVJA 5KTXA 2R0VA 4QEWA 2KTBB 2MJVB 4LYWA 5CQ5A 2FSAA 4O7BA 5CUBA 5F1HA 4TU6A 5TB6A 4O70A 5F36A 2L84A 5DYAA 4QSVA 4NUEA 2R0YA 3GG3A 5EK9A 4NYVA 4QYDA 3O36A 4J1PA 4YAXA 5FE8A 4MENA 5DX4A 5I7XA 5EWWA 4KCXA 5F3AA 5HFRA 4MR3A 4YC9A 5DLXA 4DONA 5EICA 3LQIA 4CUSA 5C4QA 5FE7A 3HMHA 5DKCA 4TZ8A 5LUUA 3MQMA 4IOQA 5A5OA 4HXLA 5DLZA 5HLSA 5ENJA 2DKWA 5HRVA 5D24A 4A9LA 4YYDA 3U5LA 4IR4A 2RI7A 5A5NA 5EGUA 5DYXA 5FH6A 5I88A 3QZVA 2DATA 4UYGA 5JI8A 4PS5A 5DFDA 4CUUA 3UVWA 5CQTA 5ENEA 3HMEA 5DYCA 2DWWA 5HJCA 4O76A 5DFBA 1JSPB 4NQNA 2RNXA 2WP1A 4Q0OA 4MR6A 2D9EA 4PTBA 5H1TA 5FB1A 4J0SA 4O78A 2DVSA 5DKHA 4TU4A 4BJXA 4Z93A 3P1FA 5II1A 4Z1QA 4PCEA 4YYGA 4N4GA 3P1DA 5F1LA 4YABA 4MEOA 1ZS5A 5LJ1A 5FFYA 2I8NA 5FE2A 3LJWA 5L8TA 4NR7A 5EA1A 4NR8A 3Q2EA 5EPBA 3UVXA 5FE1A 2L5EA 5HRXA 4UIZA 4TT2A 3MB4A 3O34A 4CLBA 5CQAA 4YYMA 2RS9B 2YELA 5E3DA 5EI4A 4TTEA 5E9YA 4PCIA 4LR6A 2E7NA 5I29A 4QEVA 4NYXA 5EVAA 5A81A 2R0SA 2YDWA 2RNWA 5G4SA 4LRGA 5CY9A 1JM4B 5FG4A 5CUEA 3U5OA 4J3IA 5HCLA 3SVGA 4UYDA 5IGLA 3MUKA 4NS5A 4TZ2A 3DWYA 4QB3A 4N3WA 5CQ8A 5H1VA 4N4HA 2D82A 5FH8A 2L85A 5AMFA 5CTLA 2I7KA 5CP5A 5HFQA 4IORA 2OUOA 5AD2A 5FDZA 4QC3A 4NUCA 4QC1A 4QR4A 5A5QA 5IGMA 5E9IA 5A7CA 3O35A 5ETBA 5L98A 4NXJA 3U5KA 5EISA 3ONIA 5L97A 4QR5A 4OUFA 5IBNA 4WIVA 5FFWA 4CFKA 5AMEA 5ENCA 4WHWA 4CFLA 5CZGA 4KV1A 4RVRA 4HXRA 4QBMA 5E9MA 3MULA 5FE0A 4LZSA 5D3PA 3S91A 5CGPA 5LVQA 3U5JA 4ZW1A 2YYNA 5C87A 4X2IA 4BW4A 5CRZA 5I40A 3FKMX 4QSUA 5A5PA 4TT4A 3D7CA 5H1UA 4QYLA 5J0DA 4HXMA 4UIUA 4QUUA 5F2PA 4NRAA 4HXOA 4QUTA 4NR5A 3K2JA 4ALGA 5E9VA 5KHMA 5L99A 5DY7A 4Z1SA 5I7YA 4QSQA 5DYUA 3MXFA 4QZSA 4YBMA 3I3JA 3JVMA 4UIWA 4XUBA 5CRMA 4O74A 5F63A 2YEKA 5CUDA 5CPEA 5CUAA 3DAIA 5HQ7A 4UIXA 5E0RA 4AKNA 4O7CA 5A85A 5EM3A 2R10A 3AADA 4IR6A 4YYJA 4YK0A 4YBTA 4NYWA 4O7AA 4QEUA 5JWMA 5LJ0A 4NR9A 5ENGA 4HXKA 4LDFA 4YADA 5L96A 5EWCA 5LKXA 5F5ZA 5COIA 5TCMA 4O7EA 4OGIA 5ENBA 4Z6IA 4A9HA 5KO4A 5FFVA 4A9JA 2RO1A 4HBYA 5CUGA 4XUAA 5HELA 4CUQA 2YW5A 4YY4A 1F68A 4LYIA 2DVVA 4BW2A 5LKTA 5IG6A 4QNSA 4UIVA 4IR3A 3P1CA 5ENIA 4QSXA 4LZ2A 5E74A 5EP7A 2OO1A 5FB0A 5K29A 4O75A 5KTUA 5CQ7A 4OGJA 3UV4A 5D3JA 4A9FA 5C85A 4HXNA 4YH3A 5DFCA 5G4RA 3JVKA 2N9GA 5HQ6A 5D25A 3IU6A 4O72A 4A9EA 4E96A 5AD3A 5ENHA 5CFWA 4Z6HA 5IGNA 2DVRA 4YYKA 5E9KA 3UVDA 4NRCA 4MR5A 2GRCA 1E6IA 1WUGA 4QSTA 2F6JA 4LYSA 4TT6A 5C89A 5CQ6A 3QZTA 5F25A 4KV4A 4WHUA 5L8UA 4C67A 3LQJA 4UITA 5LVRA 5I86A 4A9OA 5HENA 5CS8A 4O71A 4BW1A 4N4IA 2RNYA 4LZRA 4CUTA 3LQHA 4TS8A 5C7NA 5IGKA 4QSPA 5IIDA 4UYFB 4YY6A 5FE5A 5A82A 3MB3A 4NQMA 4TYLA 4PY6A 5LKUA 1EQFA 5E3GA 1WUMA 4O77A 5EWVA 4UYEA 4UYFA 4C66A 2YQDA 4HBWA 3P1EA 5EQ1A 4J0RA 3G0LA 5FE4A 4YYIA 4MR4A 5HRWA 2H60A 4PKLA 3S92A 4A9MA 4BHWA 5D3HA 5DKDA 4A9IA 2E7OA 4TQNA 4HXSA 5FE6A 5A83A 1N72A 4O7FA 5CQ4A 5BT5A 5II2A 4QSWA 2WP2A 4MEPA 5F60A 5D3NA 5D3TA 5D3SA 5A5RA 5C8GA 2DVQA 4XYAA 3HMFA 5EV9A 3UW9A 5EWHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5F62A 5DBMA 1X0JA 5D7XA 4ZQLA 4F3IA 3O33A 5FG5A 3O37A 4BW3A 3G0JA 5FH7A 3Q2FA 4HBXA 4YYHA 5D3LA 5D0CA 3ZYUA 5H85A 4N4FA 4MEQA 5HM0A 4UYHA 5I80A 5ACYA 4HXPA 5CUCA 3P5OA 3U5MA 5KTWA 4YYNA 4XY8A 4IOOA 5I83A 5LKZA 5EU1A 3LXJA 2RFJA 2NXBA 5E9LA 3UV2A 4A9NA 3U5PA 4HBVA 5ENFA 5FG6A 3NXBA 2OSSA 5D3RA 4UIYA 5ETDA 4NR4A 3RCWA 3JVLA 4ZC9A 5CQ3A 3QZSA 2YEMA 5I89A 4QR3A 4FLPA 4YATA 5EWDA 2G4AA 5EPRA 4ALHA 5FE9A 5F61A 5KU3A 5A5SA 4IR5A 3TLPA 5EPSA 3IU5A 5BT4A 4CL9A 4NRBA 5HEMA 2LSPB 5LJ2A 4A9KA 4YH4A 3SVFA 2F6NA 4CUPA 4Q0NA 3UVYA 4YBSA 5CU8A 5I1QA 4NUDA 5E7DA 4LC2A 4QY4A 4NR6A 5D26A 5HQ5A 4QSSA 5DW2A 5E73A 4GPJA 4CURA 5DW1A 3U5NA 5FE3A 4Y03A 3UV5A 3SVHA 4QSRA 5FBXA 5BT3A 2E3KA 3AQAA 4XY9A 3JVJA 5KTXA 2R0VA 4QEWA 2KTBB 2MJVB 4LYWA 5CQ5A 2FSAA 4O7BA 5CUBA 5F1HA 4TU6A 5TB6A 4O70A 5F36A 2L84A 5DYAA 4QSVA 4NUEA 2R0YA 3GG3A 5EK9A 4NYVA 4QYDA 3O36A 4J1PA 4YAXA 5FE8A 4MENA 5DX4A 5I7XA 5EWWA 4KCXA 5F3AA 5HFRA 4MR3A 4YC9A 5DLXA 4DONA 5EICA 3LQIA 4CUSA 5C4QA 5FE7A 3HMHA 4AI6A 5DKCA 4TZ8A 5LUUA 3MQMA 4IOQA 5A5OA 4HXLA 5DLZA 5HLSA 5ENJA 2DKWA 3D1DA 5HRVA 5D24A 4A9LA 4YYDA 3U5LA 4IR4A 2RI7A 5A5NA 5EGUA 4AKGA 5DYXA 5FH6A 5I88A 3QZVA 2DATA 4UYGA 5JI8A 4PS5A 5DFDA 4CUUA 3UVWA 5CQTA 5ENEA 3HMEA 5DYCA 2DWWA 5HJCA 4O76A 5DFBA 1JSPB 4NQNA 2RNXA 2WP1A 4Q0OA 4MR6A 2D9EA 4PTBA 5H1TA 2EJNA 5FB1A 4J0SA 4O78A 2DVSA 5DKHA 4TU4A 4BJXA 4Z93A 3P1FA 5II1A 4Z1QA 4PCEA 4YYGA 4N4GA 3P1DA 3VKGA 5F1LA 4YABA 4MEOA 1ZS5A 5LJ1A 5FFYA 2I8NA 5FE2A 3LJWA 5L8TA 4NR7A 5EA1A 4NR8A 3Q2EA 5EPBA 3UVXA 5FE1A 2L5EA 5HRXA 4UIZA 4TT2A 4AKIA 3MB4A 3O34A 4CLBA 5CQAA 4YYMA 2RS9B 2YELA 5E3DA 5EI4A 4TTEA 5E9YA 4PCIA 4LR6A 2E7NA 5I29A 4QEVA 4NYXA 5EVAA 5A81A 2R0SA 2YDWA 2RNWA 5G4SA 4LRGA 5CY9A 1JM4B 5FG4A 5CUEA 3U5OA 4J3IA 5HCLA 3SVGA 4UYDA 5IGLA 3MUKA 4NS5A 4TZ2A 3DWYA 4QB3A 4N3WA 5CQ8A 5H1VA 1ZKRA 4N4HA 2D82A 5FH8A 2L85A 5AMFA 5CTLA 2I7KA 5CP5A 5HFQA 4IORA 2OUOA 5AD2A 5FDZA 4QC3A 4NUCA 4QC1A 4QR4A 5A5QA 5IGMA 5E9IA 5A7CA 3O35A 5ETBA 5L98A 3ERRA 4NXJA 3U5KA 5EISA 3ONIA 5L97A 4QR5A 4OUFA 5IBNA 4WIVA 5FFWA 4CFKA 5AMEA 5ENCA 4WHWA 4CFLA 5CZGA 4KV1A 4RVRA 4HXRA 4QBMA 5E9MA 3MULA 5FE0A 4LZSA 5D3PA 3S91A 5CGPA 5LVQA 3U5JA 4ZW1A 2YYNA 5C87A 4X2IA 4BW4A 5CRZA 5I40A 3FKMX 4QSUA 5A5PA 4TT4A 3D7CA 5H1UA 4QYLA 5J0DA 4HXMA 4UIUA 4QUUA 5F2PA 4NRAA 4HXOA 4QUTA 4NR5A 3K2JA 4ALGA 5E9VA 5KHMA 5L99A 5DY7A 4Z1SA 5I7YA 4QSQA 5DYUA 3MXFA 4QZSA 4YBMA 3I3JA 3JVMA 4UIWA 4XUBA 5CRMA 4O74A 5F63A 2YEKA 5CUDA 5CPEA 5CUAA 3DAIA 5HQ7A 4UIXA 5E0RA 4AKNA 4O7CA 5A85A 5EM3A 2R10A 3AADA 4IR6A 4YYJA 4YK0A 4YBTA 4NYWA 4O7AA 4QEUA 5JWMA 5LJ0A 4NR9A 5ENGA 4HXKA 4LDFA 4YADA 5L96A 5EWCA 5LKXA 5F5ZA 5COIA 5TCMA 4O7EA 4OGIA 5ENBA 4Z6IA 4A9HA 5KO4A 5FFVA 4A9JA 2RO1A 4HBYA 5CUGA 4XUAA 5HELA 4CUQA 2YW5A 4YY4A 1F68A 4LYIA 2DVVA 4BW2A 5LKTA 5IG6A 4QNSA 4UIVA 4IR3A 3P1CA 5ENIA 4QSXA 4LZ2A 5E74A 5EP7A 2OO1A 5FB0A 5K29A 4O75A 5KTUA 5CQ7A 4OGJA 3UV4A 5D3JA 4A9FA 5C85A 4HXNA 4YH3A 3VKHA 5DFCA 5G4RA 3JVKA 2N9GA 5HQ6A 5D25A 3IU6A 4O72A 4A9EA 4E96A 5AD3A 5ENHA 5CFWA 4Z6HA 5IGNA 2DVRA 4YYKA 5E9KA 3UVDA 1PUOA 4NRCA 4MR5A 2GRCA 1E6IA 1WUGA 4QSTA 2F6JA 4LYSA 3D1BA 4TT6A 5C89A 5CQ6A 3QZTA 5F25A 4KV4A 4WHUA 5L8UA 4C67A 3LQJA 4UITA 5LVRA 5I86A 4AKHA 4A9OA 5HENA 5CS8A 4O71A 4BW1A 4N4IA 2RNYA 4LZRA 4CUTA 3LQHA 4TS8A 5C7NA 5IGKA 4QSPA 5IIDA 4UYFB 4YY6A 5FE5A 5A82A 3MB3A 4NQMA 4TYLA 4PY6A 5LKUA 1EQFA 5E3GA 1WUMA 4O77A 5EWVA 4UYEA 4UYFA 4C66A 2YQDA 4HBWA 3P1EA 5EQ1A 4J0RA 3G0LA 5FE4A 4YYIA 4MR4A 5HRWA 2H60A 4PKLA 3S92A 4A9MA 4BHWA 5D3HA 5DKDA 4A9IA 2E7OA 4TQNA 4HXSA 5FE6A 5A83A 1N72A 4O7FA 5CQ4A 5BT5A 5II2A 4QSWA 2WP2A 4MEPA 5F60A 5D3NA 5D3TA 5D3SA 5A5RA 5C8GA 2DVQA 4XYAA 3HMFA 5EV9A 3UW9A 5EWHA
chains in the Genus database with same CATH topology
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