5CRGA

Human skeletal calsequestrin, d210g mutant high-calcium complex
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
354
structure length
354
Chain Sequence
QEGLDFPEYDGVDRVINVNAKNYKNVFKKYEVLALLYHEPPEDDKASQRQFEMEELILELAAQVLEDKGVGFGLVDSEKDAAVAKKLGLTEVDSMYVFKGDEVIEYDGEFSADTIVEFLLDVLEDPVELIEGERELQAFENIEDEIKLIGYFKSKDSEHYKAFEDAAEEFHPYIPFFATFDSKVAKKLTLKLNEIDFYEAFMEEPVTIPGKPNSEEEIVNFVEEHRRSTLRKLKPESMYETWEDDMDGIHIVAFAEEADPDGFEFLETLKAVAQDNTENPDLSIIWIDPDDFPLLVPYWEKTFDIDLSAPQIGVVNVTDADSVWMEMDDEEDLPSAEELEDWLEDVLEGEINTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Calsequestrin-1
publication title Characterization of Two Human Skeletal Calsequestrin Mutants Implicated in Malignant Hyperthermia and Vacuolar Aggregate Myopathy.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Calcium binding protein
total genus 108
structure length 354
sequence length 354
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5crgA03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5crgA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5crgA02
1U6TA 1M2DA 1R5AA 2IL3A 1A8LA 3HCZA 2VL2A 3FZ4A 1THOA 4RI6A 2NDOA 5G1LA 4KDYA 1SJZA 3F4TA 1JLWA 2H70A 2F51A 4Q5QA 3U5RE 1DE2A 3ZFLA 3O76A 2D2ZA 3BCKA 4NAXA 1SL0B 5INYA 2FWFA 4CDOA 2REMA 1XW9A 2WCIA 3GKKA 5EL8A 5A4VA 1Q98A 1SK0A 1AQWA 1K0DA 4GSTA 4Q5RA 3UOMA 4ECIA 2MMZA 3FEUA 3DVWA 2WDUA 1TP9A 5IMDA 2GQMA 5HQPA 2B6MA 2FWGA 2HLSA 2HI7A 4TRXA 3M9KA 4MJAA 2VOCA 3KMNA 4XTSA 1BX9A 4ECJA 2YWIA 3KD0A 3VURA 3GX0A 4POLA 3N5OA 3TJGA 1K3OA 3ME8A 3D6IA 1G7OA 4GF0A 3TRPA 3LYPA 1RQMA 1MDJA 2B5YA 2K8VA 3GV1A 4XS1A 5ID2A 1EEJA 3LXZA 4JR6A 1F3BA 1N8JA 3BBYA 5GSSA 3ZYWA 2DMLA 1DUGA 4JE1A 2RUFA 5DJMA 3F0IA 2V41A 3F6FA 1R5PA 3RHCA 2G0FA 1ZL9A 1XFLA 2ON5A 1ILOA 4F82A 4ML1A 4PUAA 5AIVA 2ZCTA 4LL4B 4NV2A 3VI7A 3P8WA 2G2QA 4XIHA 4AJ6A 4IS0A 2H6XA 1B48A 2KOKA 3RHBA 3ZZXA 2WZ9A 1B9YC 3DEXA 5IMFA 4KCAA 5ENUA 3UL3A 5JWRB 2J9HA 2ALBA 3TKSC 4JR4A 2PGTA 4K6XA 3D21A 2JACA 4V2NA 3CBUA 3APSA 3FZ5A 3UARA 4O7HA 1GNEA 2R6KA 3FZ9A 3OR5A 1BAYA 2CAIA 4K8MA 2C0DA 5ECHB 2DJ1A 2VCTA 1U3IA 2B7JA 4FYBA 5J5NA 3J7Yb 3QFAC 1VF2A 3FW2A 2JSZA 2CVKA 2GVPA 5LNKe 2LUSA 4P3YB 3IBHA 3IXRA 2C0FA 2VLVA 1NW2A 1TTZA 3KIJA 2MMOA 5CYYA 4DSRA 2MBTA 4L8EA 2KHPA 5ECPB 4FYUA 2HXKA 3CRUA 3UJ1A 4EVMA 6GSXA 5D8IA 4LMWA 1SKWB 2OE1A 2HZFA 2HFDA 5B8BA 3ED3A 2LTKA 4H86A 3F4SA 3TGZA 1LJRA 1XXUA 4XS4A 4WETA 4IHUA 3C8EA 4MZCA 1O7UA 2YZHA 1UVZA 5GAPD 5E59A 4K1FA 5LCZA 2X8CA 2QC7A 4I6XA 1TRWA 2DIZA 4KX4A 4AGSA 3PINA 3CSHA 3M8NA 1Q4JA 2LRNA 4BWSA 2OACA 3KGKA 4KE3A 3M1GA 5JWOB 1X9MB 5ECRB 1F3AA 4JRRA 1F37A 10GSA 3M9JA 3LSZA 4E8EA 2VCZA 1GTAA 3GTUA 1GULA 5ELGA 3L4NA 2KUCA 2XHFA 2HSYA 1K0AA 3V1WA 1DE1A 2WULA 4KW6A 1PX7A 4YH2A 3GFKA 2V2GA 3E9JB 3TRQA 4NXIA 1TW9A 4HQSA 4OFTA 4ZB8A 3VPQA 1JZRA 2R37A 5G1KA 5IPHA 2H74A 4ECBA 2XBIA 4V1Ap 3GKNA 4YQVA 4XCSA 1ML6A 1PSQA 4ZXGA 2P0GA 1VF4A 2MYGA 3C73A 3QFBC 1PKZA 7GSSA 2DBCA 3IAS2 3MWHA 5J3RA 1F6MC 4ACSA 4OCEA 4HZ4A 3RDWA 1TK0B 3A2WA 2F8AA 2O8VB 1M0UA 1H4OA 5KN2A 1U87A 2FY6A 2HYXA 3FR6A 6GSWA 2K18A 2C3QA 1SK1A 2EIRA 3GKXA 3M0FA 4XHMA 2FA4A 1S3DA 2GSTA 3G7IA 5G5FA 2V1MA 3TJKA 5GSTA 1SL1B 1HQOA 1EZKA 1WPIA 5FHIA 5IMCA 2H01A 1X5DA 2HRNA 3DKSA 2L59A 1FB0A 3NIVA 1SK2A 2I3YA 4EC0A 5JCUA 2B7KA 4HOJA 2WJUA 1X5CA 2O87A 2H6ZA 1EP7A 9GSSA 4ECCA 1T7PB 2YJ7A 1KBNA 12GSA 2EIOA 2HZEA 3C7MA 1TI3A 2P5QA 2RM6A 3KTLA 3EVIA 3EMPA 4PNFA 3IAM2 1R4WA 2X8HA 5DAKA 5GZZB 1TU8A 2N5FA 4IVFA 4ZBAA 3CSIA 1AXDA 2OA7A 2PPTA 4EE0A 1VF3A 2XPDA 5JCGA 3KEBA 4DVCA 1FOVA 4POMA 1EOHA 2YP6A 3ZIJA 5DQYA 2OE0A 3GA4A 5G5EA 3UEMA 2LQQA 1LBKA 2OJLA 4MJBA 1WP0A 4ZBDA 5DDLA 2QGVA 3KP9A 3PH9A 2YN1A 1ERWA 3I69A 1XWCA 3BOAA 3KH7A 4J57E 1O73A 3FY7A 4FYCA 5ECIB 3F9UA 3US3A 5AGYA 1V57A 4MP4A 1GNWA 2WRTA 3APOA 3G7YA 4IQ1A 2FWEA 2HE3A 2H1AA 3VLNA 1IYIA 4MLYA 2FD3A 1Z7PA 4MJEA 5ECSA 3UMAA 2ZNMA 5DALA 3TCOA 1XOAA 2YOIA 4RI7A 1WE0A 4LL1B 1HNBA 4NHZA 3U6VA 6GSTA 1GSQA 5ELAA 5FWGA 4OD7A 2H66A 4ZL8A 1XW6A 1M9AA 1Z7RA 4KCEA 4EDYA 3TKRA 5ECKB 5KN1A 1GRXA 4BVYA 2A2SA 3KMOA 2B1LA 4MA9A 11GSA 3TDGA 2H8LA 6GSSA 4MZWA 5HR0A 2B5EA 2B5XA 1SU9A 1U88A 2TIRA 2NVLA 1FG4A 3WD6A 1ERVA 4IQAA 2L4QA 3EINA 4D73B 4ZB9A 1AQXA 5D73A 4KUNA 2LEGA 2VCQA 1SJ6A 3BJ5A 2NPBA 3GURA 4XRAA 3EMXA 1YF0A 4PXOA 2DMMA 4X0XA 2YANA 2IMEA 2VL3A 3P90A 4MDCA 4HU9A 3LGCA 4HJ2A 2O7KA 1BEDA 3Q6OA 1XWGA 4QQ7A 5COHA 4O92A 5H5QA 3NOFA 1O81A 2YJHA 2I81A 4TXOB 4PQIA 4GRFA 4X43A 3MSZA 1W4VA 1A8YA 5LD0A 3IC4A 2AUVA 1YF1A 3FR3A 2VM1A 5IPGA 2RM5A 2F8FA 4MABA 5G31A 1AW9A 4ID0A 3PR8A 5C04A 2NBSA 1OYJA 2X99A 5DBQA 1NM3A 4NV5A 2GSQA 1RW1A 2VAFA 3RAZA 4ML6A 3DWVA 3LWAA 1M7TA 1OC9B 2IN3A 2H76A 3FYGA 3VWWA 2CX3A 2LJAA 1WIKA 1AIUA 5IMVA 4MF6A 2MZCA 2R2JA 1ZYQB 3HHVA 2IFQB 2PWJA 4KNDA 4IELA 4YAVA 19GSA 2VIMA 3WYWA 4ZIJA 5HFIA 3G7JA 3HDCA 3K8NA 4TR1B 4FIWA 1X5EA 1A24A 2YV7A 5EPFA 1B4PA 4ISDA 5B6NA 1X9SB 5F06A 1JFUA 5EVOA 4O32A 1FVJA 5EY6A 3FZAA 4PQHA 1OAZA 4I97A 5IO2A 2DJ0A 3VK9A 4OCFA 1TI1A 2ON7A 6GSYA 2LSTA 6GSUA 22GSA 2KLXA 3LQ7A 4KB3A 1B4QA 1NHOA 1TXXA 8GSSA 2FA8A 2VL9A 1G0TA 4Q5NA 3O6TA 4L0UA 5G30A 4N10A 1GTIA 3F3RA 1OKDA 1BQ7A 3L9UA 1KEBA 4GXZA 2M46A 3EU3A 3LJRA 2R4VA 5ECLB 2M72A 4ILFA 4G10A 3GSTA 1B9XC 1M2AA 3H4KA 3ZRDA 1AAZA 3A2XA 2FCHA 2YNXA 3WGXA 5CRDA 4TR4A 2GT5A 4K7IA 1SKRB 4PURA 4O5RA 4OFMA 1NHYA 2VM2A 2AJQB 5ABRA 2DJKA 4IBPA 4LLRA 2CT6A 2OKAA 4Q5FA 2I9HA 5IM9A 16GSA 1YEPA 2K9FA 3I6AA 2L5OA 1JLVA 4TW5A 4TR0A 4YAPA 2VCWA 3BD2A 1XCCA 4ZILA 2H1BA 2E0QA 3QD9A 1X0RA 2JZSA 3APQA 3ZITA 5J4UA 4EUYA 4F2IA 3TJBA 2HT9A 3VWUA 3GIXA 2DJ3A 3HD5A 1SL2B 2CZ2A 3ZVJA 3QCPA 2P5RA 2IMFA 3S9FA 4POKA 4EDZA 5H5SA 4HS1A 3ZFBA 2KP1A 3E0UA 4WKWA 3O3TA 3ERFA 1OVNA 3VFIA 2VD1A 5HR1A 3A5WA 2VCVA 4WF5A 2Z9SA 4E8HA 4POBA 2M80A 4IN0A 1AC1A 1TRVA 1DSBA 4L5OA 2GSSA 2V32A 4AJ8A 2JADA 4I2TA 3H93A 3QAVA 1EP8A 2YCDA 3M3MA 5B6MA 3TJJA 5E4WA 1CQGA 5CREA 1TOFA 3I9V2 1YQ1A 3MNGA 3GRXA 2KP2A 3GHAA 3CYNA 2WS2A 1FAAA 4V1Ag 2F9SA 3RPPA 2B3SA 1VF1A 2MMAA 5IOXA 2EC4A 1W89A 4WEYA 3HXSA 2PN8A 3LXTA 2H1GA 4JBBA 2GQKA 2AB6A 3TOUA 1A23A 2LKUA 5F07A 2J23A 1GTBA 1SKSB 1S3CA 4N30A 3GL5A 1T4YA 1Z3EA 3DGQA 1WRYA 4LA1A 1EEMA 2PVQA 4TR3A 2K6VA 2VLUA 4EO3A 5A4WA 4J2FA 2F3MA 2WGRA 3W8SA 3SBCA 6GSVA 1T8EB 4IKHA 4MMMA 3GMFA 1Z5YE 3QAWA 3IA1A 1FB6A 4GWRA 2GT6A 1OE7A 1EGOA 4MF7A 4N0ZA 1JZWA 4V2LA 5HR3A 1S3AA 3F6DA 2GLRA 1FHEA 5JCWA 4I5QA 3TUEA 2RLIA 4BL7A 1XWBA 5F0GA 3TB2A 1SYXA 4NMUA 3MAKA 1TRUA 1ACVA 3HVVA 4MH2A 2YWOA 4F0BA 3UBKA 1IYHA 2C8UA 3VI5A 2AYTA 4GTUA 3WT1A 3HZ8A 4MZBA 1LU4A 2GS3A 1K0CA 1AUCA 1QXHA 3EWLA 4AF2A 1A2LA 2DJJA 1GSYA 3HJMA 3JCML 3R2QA 1EV4A 3KZQA 4F0CA 2PERA 2QKEA 2IJYA 4EL1A 1JZOA 4ZL7A 1Z6MA 1VRSD 2WB9A 2LNSA 4YQMA 2FWHA 3CRTA 4CHSA 3FRCA 1JHBA 2C80A 2PVOC 3TJFA 2MBSA 2X64A 4FO5A 4V2MA 1GLQA 2YWMA 1RK4A 5KEJA 2IMDA 1JZDA 1BG5A 4F03A 1T4ZA 4KA0A 2GZYA 5B8AA 1PX6A 1PKWA 5H5RA 4CW9A 3LEFA 5IQYA 5A4UA 2DSAA 1HD2A 1C72A 1EV9A 1TRSA 3UVTA 4HDEA 1QK8A 3EU4A 1KTEA 3IDVA 5DCGA 1TK8B 1XW5A 2GGTA 2O89A 2BMXA 1NSWA 4DSQA 3ZMKA 3UVHA 4PNGA 2H75A 2E7PA 2L6CA 1YEXA 4DSSB 4GSNA 2PBJA 1K0NA 4HUAA 1O6JA 1YDKA 1XBSA 1T00A 1MDKA 2JZRA 4IGJA 3HJOA 4AJ7A 3E3EA 3KCMA 1E6BA 3MDKA 1K0MA 2CZ3A 3CXGA 4WXTA 1XOBA 2HSHA 2A2RA 1QQ2A 1MDIA 4WR4A 3GL3A 4TOPA 4G19A 4GQCA 3QDNA 4KGIA 1Y6EA 3GSSA 4K7NA 1HNAA 1PL2A 1GLPA 1KNGA 3CSJA 2OADA 2H30A 13GSA 2IMKA 2TRCP 4QL7A 2H72A 3GUSA 4GCIA 1PN9A 1FO5A 1Z6NA 4QL9A 2JZTA 2C4JA 1GH2A 4BWQA 5AISA 4G2EA 4BA7A 4D73A 3CTGA 2IWTA 4K2DA 3DVXA 2RIIA 1G6YA 4TN8A 4TXVA 3ZVJD 1A2MA 3ISOA 3D4MA 1WMJA 3HVSA 2FGXA 3W8JA 1OC3A 1V58A 4Z7XA 2ES7A 1ERTA 1XZOA 5GAND 3GH6A 2I4AA 3IRAA 2QSIA 3IK7A 2CVBA 2V6OA 1QMVA 3GN3A 2FUG2 2CAQA 5D9VA 4TXOA 5AIXA 4PX1A 1Y25A 3DYRA 5CRWA 3N9JA 5F8BA 2PU9C 4BVXA 3LORA 3F3QA 2L5LA 1BJXA 1SJIA 1K0BA 3PGTA 1T1VA 5L71A 2DIYA 3UIWA 5ID2B 3DD3A 2P31A 3DMLA 1ZCPA 1TJDA 2VCXA 1E2YA 1GSEA 1J0FA 5DCHA 3VWVA 2R5GA 4KDXA 2GTUA 1GUKA 1OC9A 3IOSA 3TOTA 2X8GA 3RBTA 2FNOA 4HJMA 1EWXA 1OKTA 3FK8A 4HU7A 4K9ZA 2VD0A 1XIYA 4NHWA 3TKPA 4EXJA 2FHEA 2CV4A 1GUMA 3W6GA 1EGRA 2IFQA 1GSSA 3WGEA 2CX4A 4TR1A 2B1KA 2IPAA 3BCIA 1SENA 3ERGA 4IP6A 3KP8A 3IV4A 4G9HA 4PQ1A 1WJKA 4X1UA 4BPYA 3L9VA 2VLTA 3QPMA 3L0HA 3HA9A 5IMZA 1GUHA 1G7EA 3L78A 2H1DA 3F63A 4HQZA 4WR5A 4MJCA 2R3XA 4L5LA 3ZTLA 1XWAA 5KN0A 3D0ZA 4GSSA 1V9WA 1A2JA 1QUWA 18GSA 1FW1A 2E2MA 1PA3A 1URMA 2HRFA 2VUPA 2XPEA 4NPBA 2H71A 1GSDA 5JWQB 3HY2A 4I8BA 4OFNA 5HFKA 5IO0A 4KSOA 3ZIVA 3HZ4A 1YY7A 3QMXA 1ERUA 3EYTA 2JL4A 4XS4B 1ZGNA 4XRDA 5D9TA 5F05A 2HNLA 2H73A 3LFLA 1BYEA 4NWYA 4OWYA 5D96A 5HFGA 1TK5B 3TKSA 1YKCA 1I5GA 3DXBA 3HJPA 4DEJA 4XS6A 5A5KA 2CA8A 4GQFA 5CRHA 5B7CA 1N2AA 2OBIA 5CNWA 5CRGA 2C0EA 1O8XA 4KH7A 4EF0A 3D5JA 17GSA 4PGTA 4KSMA 2A4VA 1SD9A 2GZPA 14GSA 3P7XA 3AY8A 2N5BA 4RUVA 3GTUB 2PUKC 1ABAA 2BTOT 4K0NA 3VPTA 1TU7A 2LV3A 1F2EA 1FVKA 5J9BA 4L0WA 1ON4A 3H79A 1GP1A 4JZQA 4OO4A 1V98A 5FT3A 1YKAA 5ECNB 3G9BA 3Q18A 4ULXA 3Q19A 4PUFC 2GZZA 3WT2A 1HYUA 2CVDA 4RQXA 2C1YA 3GKMA 4TVEA 1PRXA 1DBYA 4WF4A 3GX8A 5KN3A 3DRNA 2ZUPA 1J9BA 1XWKA 1X9WB 1VGLA 2NTOA 2H0IA 2DLXA 2H0GA 2IIYA 4HI7A 1PGTA 4K7OA 2GQLA 1M2BA 3KM6A 5C00A 5CP1A 2YWNA 1YZXA 5IOWA 3LG6A 2H0HA 1G6WA 2OE3A 3GNJA 3UAPA 4EKZA 2I1UA 3ZMLA 2N5AA 3KH9A 4MPGA 3L9SA 2BJXA 4F9ZA 1B8XA 3HYPA 3QOUA 5J41A 4ZB6A 2V6KA 1PMTA 2LQOA 1WOUA 4TKYA 3VWXA 1U3AA 4OO5A 3F8UA 2DC5A 3GYKA 5AN1A 1MEKA 3P2AA 1AQVA 3EE2A 4HEA2 1A0RP 4RQRA 4ZBBA 5G2ZA 2YZUA 5D93A 1ZOFA 2YV9A 1MTCA 1ZYEA 4I2UA 4MCUA 2K8SA 3Q74A 1R7HA 2GDRA 3SWLA 1GTUA 5J9CA 1R26A 2MMNA 2E2GA 3TKQA 4J56E 3QAGA 2LRCA 3DIEA 2VO4A 5CO3A 3GH9A 1H75A 2HZEB 3KTBA 3LYKA 3D4TA 1XPVA 4JEDA 2AHEA 4N11A 2AV4A 5DQSA 1F9MA 5ECOB 1EOGA 1V40A 5D9XA 5DAKB 2C3NA 1GSUA 1A0FA 4KDUA 2L57A 3FHKA 3IPZA 1TDIA 3KJYA 3TRXA 5IIZA 5DJLA 1Z9HA 1M99A 1MD4A 2PMTA 1O8WA 1K3YA 3A3TA 4MH3A 2LRTA 2YPMA 2LS5A 3ZREA 3QR6A 3CMIA 1HNCA 2LJKA 1WWJA 4IJIA 1CQHA 4KAEA 4OMVA 1QFNA 4LMVA 4MF5A 1ZZYA 3D22A 3I43A 2LJRA 1O85A 5CAXA 4JU5A 3NZNA 1SD8A 3ERWA 1GWCA 5DVBA 1ST9A 2C3TA 1PD21 3HKRA 1XVWA 1XVQA 3UBLA 2AAWA 4WBJA 3C71A 20GSA 3J7Yk 5DALB 2GSRA 4IJ3A 1GSFA 4MPFA 2L4CA 1UA5A 4IW9A 4N0VA 3IK9A 3H8QA 2IMIA 3RPNA 3F4RA 4GLTA 1PL1A 5D9WA 4K0GA 2JSYA 3IHQA 3KXOA 4HZ2A 1T3BA 2DJ2A 2RUEA 2VL2C 1ZMAA 2H6YA 3C1SA 2O85A 3EC3A 3A2VA 1OE8A 4FH8A 2OBKA 2LNTA 3ZL5A 4ZL9A 2JU5A 3WGDA 1GL8A 2WFCA 3ZLPA 1M9BA 4MK3A 2H19A 1MD3A 2TRXA 3ME7A 5HR2A 4DSSA 1THXA 2L6DA 1I9DA 5ECMB 1UN2A 4YQUA 5ECQB 1K0OA 3C1RA 2XBQA 1PQNA 5IMAA 3FKFA 3H1NA 1K3LA 1SYRA 2CQ9A 2XC2A 3TKSE 1J08A 3CTFA 3HVXA 1TKDB 1UC7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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