5CRGA

Human skeletal calsequestrin, d210g mutant high-calcium complex
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
354
structure length
354
Chain Sequence
b'QEGLDFPEYDGVDRVINVNAKNYKNVFKKYEVLALLYHEPPEDDKASQRQFEMEELILELAAQVLEDKGVGFGLVDSEKDAAVAKKLGLTEVDSMYVFKGDEVIEYDGEFSADTIVEFLLDVLEDPVELIEGERELQAFENIEDEIKLIGYFKSKDSEHYKAFEDAAEEFHPYIPFFATFDSKVAKKLTLKLNEIDFYEAFMEEPVTIPGKPNSEEEIVNFVEEHRRSTLRKLKPESMYETWEDDMDGIHIVAFAEEADPDGFEFLETLKAVAQDNTENPDLSIIWIDPDDFPLLVPYWEKTFDIDLSAPQIGVVNVTDADSVWMEMDDEEDLPSAEELEDWLEDVLEGEINTE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Characterization of Two Human Skeletal Calsequestrin Mutants Implicated in Malignant Hyperthermia and Vacuolar Aggregate Myopathy.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Calsequestrin-1
source organism Homo sapiens
molecule tags Calcium binding protein
total genus 108
structure length 354
sequence length 354
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5crgA03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5crgA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5crgA02
1ERWA 2JL4A 1NHYA 2R6KA 1ZMAA 1M0UA 3LYKA 2H0IA 2IWTA 1XWKA 1GLQA 1UVZA 3KCMA 6GSVA 5E4WA 5DALB 4E8HA 2JZSA 1QGVA 5DBQA 5DJLA 3WT2A 2Z9SA 3GKKA 1GUMA 5DCHA 1A2MA 4O5RA 3ZIVA 2H75A 1EP8A 4BWSA 3UMAA 1SJIA 2JADA 4MK3A 1R5AA 2VM2A 5GAPD 4ZXGA 2IPAA 2PVQA 2V2GA 3HA9A 3FRCA 2QSIA 1V57A 2EIOA 1TXXA 1V40A 4ZL9A 2PGTA 3HXSA 4MDCA 3FEUA 1FB6A 2TRCP 4E8EA 4L0UA 4KSOA 4PQ1A 4IQAA 2H6ZA 3FZ4A 4D73B 2MBSA 4IS0A 5IO0A 4G9HA 3U5RE 5HQPA 3G9BA 1V58A 2H1GA 2BTOT 2ALBA 2OBIA 1XOAA 2NTOA 1USBA 1O8WA 4F9ZA 1E6BA 4MPFA 2H76A 5D8IA 4MJAA 1K0BA 3DD3A 2DBCA 4OD7A 1EEJA 1G6WA 4KDUA 2XBQA 2HFDA 1VGLA 1HQOA 1R26A 1AXDA 2CT6A 3UVHA 4I2TA 4AGSA 2LJAA 2PPTA 3H79A 1BEDA 1JZDA 6GSSA 3WYWA 3E9JB 1WMJA 2L5OA 4MMMA 1G0TA 1SL2B 2E2MA 4WETA 5G31A 1URMA 3CSHA 1B4QA 4HDEA 3EVIA 1JLVA 4MZCA 4IKHA 3GSTA 1X9MB 1ERUA 2PVOC 2V32A 4LA1A 4X1UA 3C71A 4PGTA 1PD21 5A4UA 2GQLA 2H01A 1X9SB 2O8VB 5LD0A 3A2XA 4WKWA 2GSRA 3US3A 4G19A 1GLPA 1ERVA 5F8BA 2NDOA 4PUFC 4HU9A 4ZL7A 3GYKA 3WGXA 2YWIA 1MD4A 1SL0B 2REMA 1PGTA 1TP9A 1A0RP 3EE2A 2WULA 4ULXA 1N8JA 1QK8A 4X0XA 5J5NA 4GSNA 2BJXA 2IMKA 4KAEA 1I5GA 5IM9A 1YQ1A 2GTUA 4NV5A 2C0GA 4DSSA 2L6CA 4ZL8A 3GNJA 1QUWA 1TI3A 3FR3A 1A23A 3LXTA 4TXOA 1OKTA 3DKSA 1GP1A 3F4TA 3LWAA 1Z3EA 1GTBA 1KNGA 2KHPA 4V2NA 4DEJA 5IMZA 5G1KA 1GRXA 2O85A 3FW2A 3UJ1A 2H6XA 2OE0A 2VIMA 2HSYA 1IYIA 2P5QA 3ZLPA 2B1KA 5FHIA 1TU8A 2CVBA 4MJBA 4EXJA 3EU4A 5INYA 5F05A 5FWGA 1BYEA 5IMCA 2HT9A 2AYTA 1AQVA 3EINA 3UAPA 4OFNA 3D0ZA 4IP6A 3V1WA 12GSA 4V1Ap 2VUPA 2EIRA 3TRPA 4IBPA 1Z7RA 1K3YA 5D9XA 4Q5QA 3C73A 3CRUA 5HR1A 5D9WA 3CTFA 5DAKA 4POBA 2H8LA 4EDYA 1O73A 3QAVA 4IW9A 4MH2A 2B5YA 1GSEA 2H74A 4RQXA 1SK1A 4MF5A 3M0FA 2YP6A 4PUAA 1K0NA 1AAZA 2RM6A 1AW9A 4MPGA 3QFAC 1TRSA 3IC4A 3F9UA 2FA8A 1YEPA 2ZCTA 2LQOA 5HFKA 5ECMB 3O76A 1V98A 5IMDA 3RHCA 3GUSA 2A2SA 2YV9A 3ZTLA 5G2ZA 4HUAA 2WJUA 2GZYA 2L57A 2GZZA 2CQ9A 2OADA 2GDRA 3CYNA 1IYHA 2R37A 5JCGA 4I6XA 4ZB9A 4L5OA 1X9WB 1PX6A 2O89A 4ECBA 3A2WA 1SK0A 1XIYA 4XS1A 1K0AA 1WOUA 3BBYA 1YF0A 1G7OA 2LRCA 3F6FA 1K0OA 4JZQA 1XW5A 2L4CA 2B1LA 2I1UA 2B5XA 4LL1B 4K0NA 5B6MA 1FOVA 2ZUPA 4WF4A 1K0CA 2H0GA 2F51A 4EF0A 3TKRA 5CRWA 4NMUA 5GSTA 1XOBA 1NHOA 1EV4A 2C4JA 1JZWA 3RPNA 3TJFA 3QDNA 4EKZA 5ELAA 2JSZA 1R5PA 1BAYA 3KXOA 2WGRA 2VL2A 1HYUA 1A2JA 4HJMA 3IR4A 3RBTA 1KBNA 20GSA 2OA7A 2DJ1A 3BCKA 5J41A 1SKRB 1FG4A 1YJ6A 3GFKA 2F8AA 3KIJA 5F07A 3IA1A 5ECLB 1PX7A 4KUNA 5DALA 2C3NA 3F4SA 3CSIA 4DSRA 4HEA2 4F0CA 2GT6A 2VLTA 2VCZA 3TCOA 3QFBC 2FHEA 5H5QA 5CAXA 1SKSB 4ML6A 1EEMA 1Z6NA 3GURA 2A4VA 3FR6A 1SL1B 4K7NA 2DJKA 4EE0A 3M8NA 2YZHA 1AUCA 2YWOA 2JSYA 3ERWA 2YPMA 4O7HA 4DSQA 4EDZA 5DDLA 4TXVA 1RK4A 3HY2A 4O32A 1EOHA 4OMVA 3ME8A 2FUG2 2GQMA 2L5LA 2YOIA 3DRNA 1DBYA 5KN0A 1VF4A 5F0GA 4JU5A 2ON5A 1UA5A 1XWAA 2H1AA 1YF1A 5DQYA 3W8JA 4D73A 4ZILA 1GSQA 3HJMA 2HE3A 2H30A 2VCWA 5AN1A 3HD5A 1Q4JA 2C3QA 2RLIA 5G1LA 3I43A 2P31A 1F2EA 3CBUA 4KCEA 4Q5FA 3GX0A 1M9BA 4HQZA 3DYRA 1NM3A 3K8NA 3BOAA 1K0MA 2HXKA 3APSA 2FWEA 4PNGA 2V1MA 1TRWA 1XVQA 3TKQA 4TR3A 1SYXA 5HR3A 3DIEA 2AJQB 3C7MA 1PSQA 2IL3A 3CRTA 3EWLA 1YZXA 4KA0A 1TK5B 2YWNA 4HI7A 5B8BA 2GT5A 3FKFA 2CVKA 6GSTA 1J0FA 4OCEA 2IJYA 4CHSA 2GZPA 3EU3A 3UEMA 6GSYA 1H75A 4PNFA 1ML6A 5IMVA 3Q74A 4CDOA 2EIQA 4HZ4A 4PQHA 1FAAA 1CQHA 1WE0A 3ZL5A 18GSA 2YNXA 4TN8A 4ECIA 1SJ6A 10GSA 4ZBBA 2C1YA 3L9VA 3TRQA 4XHMA 3M9JA 3W8SA 4MA9A 3F3RA 3Q6OA 3HZ4A 1NSWA 4CW9A 5ECIB 4TR4A 2GSTA 5AGYA 1OKDA 1TKDB 2K18A 2J9HA 2D2ZA 1B4PA 2MMOA 1GNEA 4WXTA 2OBKA 1PL1A 2GSQA 1X5EA 4ML1A 1Z9HA 4V2LA 1OVNA 3GMFA 3QPMA 2F8FA 3KTLA 3C1SA 3ZRDA 4KW6A 3Q18A 1X5DA 3I9V2 1F37A 4IJIA 4OO4A 2VL2C 3EMPA 1S3AA 2FWGA 5A4WA 4NAXA 5FT3A 1WP0A 1B48A 1XVWA 5JWRB 3VWUA 4KSMA 2I3YA 3HVSA 3PINA 4J56E 1EP7A 1Y25A 3MAKA 5EVOA 2VCTA 3VLNA 3TKSE 1V9WA 4K9ZA 1Q98A 4G10A 2YANA 3APOA 4HOJA 4LL4B 1UN2A 5CRDA 4F0BA 4OO5A 1X5CA 3TOUA 2R5GA 2ZNMA 2R2JA 1ZOFA 3F3QA 2DJJA 3MSZA 4BA7A 2HLSA 3OR5A 3F4RA 5DQSA 3C1RA 2CVDA 3ZVJA 1M2DA 4WBRD 3BD2A 3IDVA 4TKYA 5D96A 3ZZXA 1HD2A 4FYUA 5JWQB 1CQGA 3VURA 5H5SA 3ERFA 3GX8A 1G7EA 5GZZB 1TK0B 1MDKA 5J3RA 3KH9A 5ECOB 4BPYA 2YCDA 3VK9A 2JU5A 5ECHB 1TTZA 1ERTA 1TW9A 2OE1A 4H86A 2H72A 3R2QA 2K9FA 4JR6A 1FO5A 2YV7A 2VCVA 4WF5A 4J57E 4GXZA 22GSA 2VCQA 1XBSA 4POKA 2A2RA 3GKNA 3GTUB 4DVCA 5LCZA 2IFQB 4IQ1A 2LJRA 3L0HA 3TGZA 1WJKA 1AQXA 3LGCA 3J7Yb 4K8MA 1GUHA 3N9JA 1QMVA 1GUKA 2HNLA 4F03A 1B9YC 4XS4B 5B8AA 4WR4A 2I4AA 2G2QA 4XRDA 1ILOA 3WGEA 1A0FA 3E3EA 1N2AA 5IO2A 5ABRA 1VF2A 1ACVA 3ZITA 2H6YA 1H4OA 4FYCA 2C0DA 4BVXA 3HJOA 5CYYA 3IE3A 5E59A 4EL1A 1EOGA 3FR9A 5HR0A 1M2AA 9GSSA 3VFIA 5J4UA 4YAPA 2GS3A 4OFMA 3F6DA 3TKPA 4PX1A 5CRHA 5J9BA 5JCUA 2B7JA 2P0GA 5ECRB 4HQSA 4N11A 4TVEA 2RM5A 1OE7A 1MDJA 3MWHA 1UC7A 1EGRA 2RUFA 1VF1A 2QGVA 4RI7A 4BWQA 4ECJA 4JEDA 2GLRA 3G7JA 3DGQA 4V1Ag 1C72A 4IELA 4AJ8A 3LXZA 5CO3A 2GVPA 5AISA 1ON4A 4F2IA 3LYPA 4HS1A 2H0HA 5KEJA 3QCPA 5ELGA 1O6JA 4MABA 3EURA 2WDUA 4WBJA 3IRAA 1FVKA 2KOKA 2MZCA 3GRXA 2AV4A 3BCIA 1FW1A 3TDGA 4QL7A 2H66A 2YJHA 5AIXA 4DSSB 1OC9B 3RDWA 1R4WA 2V41A 3HCZA 1I9DA 2CZ2A 4TXOB 2TRXA 1W89A 2TIRA 3GKXA 3VWXA 4KB3A 1BG5A 4NPBA 3FYGA 5COHA 3UBLA 5CREA 3KP8A 2FWHA 4HZ2A 4N10A 1B8XA 5F06A 1OE8A 8GSSA 5EPFA 1GSYA 1JZOA 3ZIJA 3LFLA 1BX9A 1T4YA 4I2UA 2WS2A 2VLVA 5IMFA 1TU7A 1SENA 2QC7A 2J23A 4KDXA 2VL3A 3IV4A 2DLXA 4K0GA 3KM6A 1BQ7A 3KTBA 2L4QA 2XC2A 1W4VA 2WFCA 3D5JA 3HKRA 2M80A 5AIVA 4YQUA 6GSUA 3G7IA 4J2FA 2YJ7A 3HYPA 3DWVA 4AJ7A 1LJRA 2IMIA 3H8QA 2KP1A 3TOTA 3HVVA 2C8UA 4X43A 3NZNA 3VPQA 3L9UA 4Z7XA 2GSSA 4MH3A 1T00A 2H71A 2NVLA 3VWVA 4RI6A 4TR1B 1TOFA 1ZYQB 2LV3A 3PGTA 3S9FA 1M99A 2P5RA 1LU4A 3HHVA 1O7UA 4NXIA 5KN2A 1JLWA 2C3TA 4K7IA 1XXUA 3F63A 3A5WA 2MMAA 3UL3A 2E7PA 3CSJA 4BVYA 3F8UA 3EMXA 1HNAA 2V6KA 3IBHA 4IVFA 2HZFA 2M72A 3PR8A 2PMTA 5IQYA 4POLA 1WPIA 1A24A 3KD0A 1XW6A 17GSA 4OWYA 1FVJA 4XIHA 4FIWA 2VAFA 3P2AA 4K7OA 2IN3A 1OC8A 4ECCA 2OKAA 3EC3A 3RHBA 1E2YA 1GSUA 2IIYA 2PUKC 1GSDA 2DIYA 4RUVA 4WR5A 1SYRA 4P3YB 1XFLA 1F3AA 1XPVA 2NBSA 1GTAA 2QKEA 3M1GA 3ERGA 2B5EA 1Y6EA 3QAWA 1PMTA 4GTUA 1OC3A 2X8HA 2C0EA 4ILFA 4POMA 2LEGA 4XS6A 2E0QA 4YH2A 5J9CA 4MF7A 1KTEA 1F3BA 5D9TA 3MNGA 1XZOA 1Z6MA 1GTUA 1TI1A 1U6TA 3LJRA 4FH8A 1NW2A 3KP9A 2HRFA 3SBCA 3ZMKA 2C0FA 4XTSA 1ZGNA 3P7XA 1GH2A 1GWCA 2H1DA 2WCIA 4K2DA 1MDIA 4LLRA 4EUYA 1F9MA 4FO5A 3JCML 1PN9A 2JACA 1VF3A 5JWOB 2JZRA 2ES7A 1SU9A 2DJ2A 3RPPA 3DXBA 2C80A 2VCXA 2HI7A 1TRVA 5HFIA 3UVTA 1KEBA 5IIZA 2FGXA 4IN0A 1K3OA 5D93A 2IMEA 1G6YA 4PURA 2LRTA 2CV4A 6GSXA 1F6MC 2N5AA 3IOSA 4MCUA 2O87A 1AQWA 2I81A 3HJPA 5DJMA 3QR6A 2CA8A 1FHEA 3QAGA 4TOPA 2XPEA 1GNWA 3P90A 5HR2A 1JZRA 3GA4A 2XBIA 5ID2B 2AB6A 3Q19A 3IK9A 1WWJA 19GSA 3SWLA 5G5FA 4IJ3A 4K1FA 3GSSA 3APQA 4JRRA 4V2MA 3M3MA 1TJDA 3ED3A 4KCAA 1GTIA 3GL3A 3DEXA 3TKSA 2HZEB 3HZ8A 2L6DA 2OACA 1U88A 3GTUA 1ZL9A 3UIWA 3H93A 1K0DA 2X8CA 3WGDA 2DIZA 2B7KA 2IFQA 1M7TA 3DVXA 3KMOA 3L78A 2LUSA 3GKMA 2OJLA 1SK2A 3KMNA 4LMWA 4XS4A 4AF2A 3LG6A 5B6NA 2HRNA 1SJZA 2XPDA 5C00A 1YKAA 3I69A 6GSWA 2VD0A 2DJ0A 1EGOA 1A2LA 2CZ3A 2K6VA 1O8XA 2H19A 3GIXA 4KNDA 3GHAA 4PQIA 2MYGA 3FZ9A 4TRXA 2PU9C 11GSA 2LKUA 1WRYA 5ENUA 2FLSA 1JHBA 3GH9A 3M9KA 3DMLA 3L4NA 1XCCA 3CXGA 2YWMA 2I9HA 4F82A 3O3TA 4YQVA 2RIIA 3EYTA 2DC5A 2FCHA 2HSHA 4YQMA 2LS5A 5H5RA 4HJ2A 3LORA 2VD1A 3KH7A 2GQKA 3O6TA 4N0VA 4O92A 1HNCA 3TJGA 4QQ7A 2LSTA 3IPZA 5DCGA 5A4VA 4WEYA 3N5OA 3ZFBA 4L5LA 3QD9A 3HDCA 3IHQA 3VI7A 3BJ5A 3ZYWA 2IMFA 1LBKA 3F0IA 1YY7A 3CTGA 1PKWA 4GSSA 5HFGA 3WD6A 1A8YA 2OE3A 2N5FA 4KX4A 4ZBDA 2F9SA 1O81A 1FB0A 1EZKA 1U3AA 3IXRA 1K3LA 2E2GA 4ZBAA 1R7HA 1GULA 1MTCA 1HNBA 1PL2A 4ACSA 1DSBA 1OC9A 3NIVA 4EC0A 1ABAA 1S3CA 1XWGA 2LTKA 2H1BA 2EC4A 3IK7A 1Z5YE 1RW1A 3G7YA 3ZFLA 2LQQA 4MZWA 4Q5NA 3P8WA 1V2AA 3D22A 1WIKA 2N5BA 4MZBA 3ZREA 2H73A 4GRFA 1T8EB 1TK8B 4MJEA 3MDKA 2CX4A 4N30A 5C04A 1M2BA 4GQCA 2YN1A 1QFNA 4GWRA 1SD8A 2AAWA 5IOXA 2CAQA 5KN3A 3TJKA 3GL5A 1RQMA 4YAVA 2HYXA 2CAIA 4IGJA 2JZTA 1OAZA 1PKZA 2FA4A 5EY6A 3GN3A 5ECSA 1U3IA 3A2VA 5G5EA 14GSA 3L9SA 1U87A 1M9AA 1VRSD 4XCSA 1PQNA 2V6OA 4ZIJA 3FY7A 1EWXA 3WT1A 4FYBA 16GSA 1ZYEA 4MP4A 2X99A 1AIUA 3QMXA 5IPHA 1XWBA 13GSA 3I6AA 1GL8A 2DMLA 3D4MA 1MD3A 1THOA 2LJKA 1GSFA 4TR0A 5CRGA 1T3BA 3TKSC 1GSSA 1DE2A 2VOCA 1QQ2A 2LNTA 3IAS2 1B9XC 4N0ZA 4TR1A 5CNWA 3PH9A 2GGTA 2B3SA 3LQ7A 5DVBA 5ECNB 2MMZA 4EO3A 4G2EA 1TDIA 4BL7A 3LSZA 1YKCA 3KEBA 3TB2A 3UARA 5D9VA 4KE3A 3A3TA 4ZB8A 2B6MA 3FK8A 3AY8A 1MEKA 3TJJA 2R3XA 2K8VA 4MLYA 2VM1A 3HVXA 2X8GA 4GQFA 4L0WA 4NV2A 1ST9A 1T4ZA 4NHZA 3ZVJD 3VPTA 2G0FA 3D21A 3KZQA 2LNSA 1DE1A 5ECQB 2WZ9A 3IAM2 2FNOA 3NOFA 3ME7A 4JE1A 4RQRA 4GLTA 2L59A 4OCFA 4HU7A 5IMAA 5GAND 3D6IA 5D73A 2YZUA 2XHFA 4I5QA 2FWFA 4ZB6A 5A5KA 2O7KA 2H70A 4I8BA 7GSSA 1BJXA 2KP2A 2AUVA 2MBTA 4JR4A 1S3DA 2VLUA 3GV1A 3GH6A 4NHWA 5ECKB 5B7CA 1A8LA 2IMDA 3H1NA 1TRUA 3ISOA 4XRAA 3QOUA 2RUEA 4LMVA 1THXA 2WRTA 4ID0A 3DVWA 3W6GA 4KGIA 1XWCA 3E0UA 1T7PB 3CMIA 2ON7A 5DAKB 2DSAA 4IHUA 4NWYA 2DMMA 4KDYA 1JFUA 4ISDA 1YEXA 4JBBA 1Z7PA 3ZMLA 3TUEA 1SD9A 3H4KA 3TRXA 1PRXA 2MMNA 3TJBA 5JCWA 4Q5RA 1J08A 1ZCPA 3RAZA 1X0RA 2PN8A 1EV9A 2VO4A 4L8EA 2M46A 1ZZYA 2AHEA 2KLXA 2FY6A 3FHKA 2KUCA 1YDKA 5EL8A 5ID2A 2CX3A 4AJ6A 2NPBA 1O85A 4K6XA 3KJYA 4IP1A 5ECPB 1PA3A 2PWJA 3UOMA 1AC1A 4QL9A 5IPGA 2PERA 1OYJA 2K8SA 3LEFA 2FD3A 2F3MA 4KH7A 4MJCA 3VWWA 3UBKA 2HZEA 3KGKA 4GCIA 3J7Yk 4I97A 2LRNA 3D4TA 5G30A 3U6VA 2R4VA 1DUGA 3FZAA 5IOWA 3FZ5A 5CP1A 2DJ3A 1J9BA 4GSTA 1SKWB 2WB9A 3VI5A 4PXOA 5L71A 1T1VA 2X64A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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