5CRHA

Human skeletal calsequestrin, m53t mutant high-calcium complex
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
354
structure length
354
Chain Sequence
b'QEGLDFPEYDGVDRVINVNAKNYKNVFKKYEVLALLYHEPPEDDKASQRQFETEELILELAAQVLEDKGVGFGLVDSEKDAAVAKKLGLTEVDSMYVFKGDEVIEYDGEFSADTIVEFLLDVLEDPVELIEGERELQAFENIEDEIKLIGYFKSKDSEHYKAFEDAAEEFHPYIPFFATFDSKVAKKLTLKLNEIDFYEAFMEEPVTIPDKPNSEEEIVNFVEEHRRSTLRKLKPESMYETWEDDMDGIHIVAFAEEADPDGFEFLETLKAVAQDNTENPDLSIIWIDPDDFPLLVPYWEKTFDIDLSAPQIGVVNVTDADSVWMEMDDEEDLPSAEELEDWLEDVLEGEINTE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Characterization of Two Human Skeletal Calsequestrin Mutants Implicated in Malignant Hyperthermia and Vacuolar Aggregate Myopathy.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Calsequestrin-1
source organism Homo sapiens
molecule tags Calcium binding protein
total genus 113
structure length 354
sequence length 354
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5crhA03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5crhA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5crhA02
3JCML 3ZMLA 3DXBA 2AUVA 3DMLA 2X8HA 4K2DA 3HCZA 2X64A 1JZWA 4K0NA 5IMVA 4WBJA 2HYXA 5CNWA 3RHCA 4L0UA 2NTOA 3QPMA 1O6JA 3C8EA 4ZXGA 2LRNA 4RUVA 1S3DA 3GKXA 3KEBA 4K8MA 4JZQA 2YOIA 4XRAA 1EEMA 2LEGA 4XS1A 2QSIA 3HVVA 1B4PA 4KAEA 4MK3A 1V2AA 4G19A 1PMTA 1LBKA 3H93A 2HNLA 1GSFA 4JR4A 1YQ1A 8GSSA 2EIQA 3HD5A 3VFIA 3CTGA 1XOBA 2DJ0A 3E9JB 3AY8A 1BEDA 3P8WA 1GL8A 3A5WA 4TKYA 2H0IA 2NBSA 5A4WA 2C8UA 4V2MA 1FG4A 2P5QA 3CBUA 3LYPA 4HZ4A 5C04A 1GWCA 4MZCA 5JWQB 3ME8A 14GSA 2ZCTA 4YQUA 4L5LA 2VLUA 4KDXA 2X99A 5D9VA 3BCIA 1BJXA 3KH7A 5CAXA 2MYGA 4KSOA 2FA4A 3WD6A 4YQVA 4O92A 3DVXA 4KB3A 1GNEA 3DGQA 1EP8A 1O8WA 1SJIA 4PNGA 5EY6A 4FYBA 1MDJA 2H70A 4EO3A 3QR6A 3UOMA 2L4QA 4HJMA 2LS5A 1I5GA 2VM1A 3PR8A 3PH9A 2VM2A 4HI7A 1EOHA 3LEFA 1UVZA 3OR5A 4N0ZA 1T1VA 3LQ7A 3ZFBA 2HRNA 2L4CA 1ZCPA 4EVMA 1GUHA 5J9CA 1FOVA 5COHA 5F8BA 1GP1A 2WFCA 5ECOB 3LG6A 1CQGA 4PX1A 3QAGA 1I9DA 4XHMA 3TGZA 1T4YA 1F37A 3FZAA 2Z9SA 4MJEA 2TRCP 5ECNB 5IMFA 3L9SA 1PGTA 4K0GA 4IP1A 1GTIA 2JZRA 20GSA 2GZPA 2OE3A 4OFNA 3APSA 4K7IA 1E6BA 2ALBA 1SL2B 3DWVA 2GSTA 2HI7A 4PQ1A 1H4OA 1W4VA 4E8HA 2IMIA 2LJRA 3MAKA 3F0IA 1TI1A 4IN0A 2DBCA 1SKSB 3A2VA 3FY7A 3GKMA 3HHVA 16GSA 1X5CA 3ZL5A 3CRUA 5ECSA 3L4NA 3TJJA 11GSA 4GCIA 4Q5FA 4KX4A 2VL2C 2G0FA 1WRYA 2L6DA 3F6DA 1O73A 1HYUA 2V41A 1K0MA 3N5OA 2CVBA 2KHPA 3SWLA 3LXTA 3TUEA 5CREA 2GTUA 3EC3A 3I69A 2N5AA 4TVEA 3GMFA 3ZMKA 4I6XA 4ECJA 4P3YB 2XPEA 3F4SA 4ZB8A 5ECLB 1SYXA 1THXA 3S9FA 4IQAA 4KSMA 3IE3A 1PRXA 5GAPD 2OA7A 5G31A 5A4VA 1XWBA 3GSSA 3D6IA 3V1WA 1FO5A 1ZL9A 2H66A 5JCUA 4YH2A 2M46A 2MMNA 3HVXA 4TN8A 1V58A 4PGTA 2IMEA 5J9BA 3K8NA 5C00A 2YPMA 1N8JA 2YZHA 4N0VA 3F9UA 4F9ZA 1WOUA 2N5FA 4ZB9A 1F6MC 2P5RA 4QL9A 3O3TA 1BX9A 4BL7A 5LCZA 3M8NA 4TR3A 5G5EA 1AC1A 2GQLA 1TK5B 3VURA 2GZYA 2IL3A 2AHEA 4XRDA 3TRQA 1PQNA 1YF1A 4QL7A 4KH7A 1GTUA 4AJ6A 1PL1A 1JZRA 3WT1A 3FKFA 4ZBDA 4POBA 5L71A 3FK8A 1Y25A 1H75A 2B7KA 3ZTLA 2JADA 2H74A 4MF5A 2YANA 3ZVJA 3ERGA 2DMMA 3WGDA 2IMFA 4OFMA 1PN9A 3MSZA 1SK2A 3VPQA 2KP1A 2WJUA 1U87A 3H8QA 3P90A 3ERWA 5HR3A 2CQ9A 4N11A 2VOCA 1JFUA 3TKSC 2OE1A 2C3NA 4TR1B 4KUNA 2AB6A 4WR4A 6GSWA 2H72A 4IHUA 5ECMB 2H1GA 2O85A 2RM6A 2YJHA 1PSQA 1EGOA 2X8CA 1X9SB 3LSZA 1OE8A 1OC9A 1A8YA 2H6ZA 1A2JA 5D9TA 4HU7A 2B1LA 4DVCA 3A2WA 2VCXA 2CX3A 5ECRB 4WEYA 1EV4A 4ZL7A 3F3RA 4OO5A 3VWVA 3HKRA 4LL4B 4PXOA 1AW9A 5DAKB 4F82A 2NDOA 3FYGA 3DYRA 2IMDA 1G7EA 1ERWA 1TRVA 2JSZA 1FVKA 3ZYWA 4XS6A 4IJ3A 3IC4A 3RDWA 2I4AA 3U6VA 2B7JA 4POLA 3MDKA 3F4RA 4RQRA 2CVKA 5H5RA 1SK1A 2KUCA 1IYIA 1FB6A 4OFTA 3C1RA 3F6FA 3TB2A 1XPVA 3KMOA 4OO4A 4TOPA 6GSSA 5CRWA 2K18A 3QFBC 3QOUA 1MEKA 1TU7A 2H0GA 3G7IA 5ELGA 2GDRA 2XPDA 3GRXA 4MA9A 3VK9A 2I1UA 3D5JA 4O5RA 5INYA 1G0TA 4NV5A 3IA1A 2L5LA 5JWOB 5GAND 1V9WA 2CVDA 1TK8B 1XXUA 4L0WA 4IQ1A 1VRSD 2ON7A 3VWUA 2C0GA 2HRFA 2C0FA 2VAFA 4TXOB 3TJGA 5J5NA 3GFKA 4X0XA 3KTBA 2PBJA 2FNOA 4YAPA 1PA3A 4KCEA 2MBTA 2IFQA 3IRAA 3TOUA 1FAAA 2I3YA 4POKA 2IWTA 5EL8A 4EE0A 1T4ZA 2QC7A 2PMTA 4MCUA 3Q74A 4NHZA 4PUAA 5FHIA 10GSA 4K7NA 2LKUA 4JE1A 2V2GA 2PVQA 1V98A 2H6YA 1M99A 1A2MA 2E2MA 1MDKA 2R4VA 3D22A 5G30A 3O76A 5ECHB 2EIRA 3WYWA 5B6MA 4GSSA 1JLVA 3HJPA 2C1YA 3GV1A 5GSTA 3LXZA 3ISOA 3US3A 4K6XA 4WF4A 1XWCA 3GNJA 1VF1A 2V6OA 5HFKA 6GSTA 4RQXA 1DE1A 4N30A 4EC0A 4V1Ap 5HFIA 1WWJA 1TP9A 5AGYA 3BD2A 2CZ2A 1PKZA 1GTAA 4MF6A 1XVWA 2OE0A 4NV2A 4ZIJA 3FR9A 4L8EA 1SD9A 4D73A 4MP4A 2X8GA 3BJ5A 1J0FA 1G6WA 2H01A 1F3AA 4GF0A 4XS4B 17GSA 3EU4A 1K3OA 4MPFA 3CYNA 2A2SA 4ILFA 1HD2A 1X9WB 5IOWA 2LV3A 4HUAA 3W6GA 3TJKA 2JU5A 3KXOA 2DJ2A 1AUCA 1N2AA 2RIIA 2FD3A 1O81A 1S3CA 4OCFA 2B5YA 1THOA 3H1NA 1J08A 3FR6A 4ZL8A 2JSYA 3CMIA 2OJLA 3IOSA 1JZDA 4KGIA 1UN2A 3EYTA 2XBIA 2RUFA 1SD8A 3W8SA 1GSYA 2YP6A 2HSHA 4AGSA 1BYEA 2CT6A 2HLSA 1JLWA 3ZRDA 1GUMA 1K0DA 3UAPA 2F51A 2V1MA 2DMLA 2R2JA 4JR6A 2GSQA 1A23A 3QCPA 3EWLA 2C3TA 2NPBA 2O8VB 3EURA 3KZQA 2IIYA 2R5GA 1NSWA 4K1FA 4TR1A 1VF3A 3DRNA 4ZL9A 1ZMAA 3GKNA 2CAIA 5ECQB 3HA9A 3J7Yb 4DSQA 1M2AA 3IAM2 3TJFA 3GKKA 5KEJA 3GH6A 2L6CA 1XW5A 2C0DA 3DIEA 1F2EA 4L5OA 2K8SA 4EL1A 2H76A 5G1KA 3TOTA 1OE7A 1A8LA 2YJ7A 2WDUA 13GSA 4LMWA 2IPAA 4J2FA 3L0HA 1YKCA 3Q19A 4FO5A 4ACSA 2H8LA 2R37A 3KIJA 4KDUA 4OMVA 1TJDA 3ZZXA 5J4UA 4TRXA 3D4TA 2MZCA 2C3QA 3IPZA 3M0FA 3IBHA 1SJ6A 1FW1A 3APQA 3Q18A 1ERTA 3HZ8A 5B7CA 4EDZA 3IR4A 2FCHA 2E0QA 2JL4A 1SU9A 3WGXA 4X1UA 1FVJA 1TDIA 2WRTA 2PVOC 3G9BA 1SKRB 1SJZA 4MH3A 2ON5A 2VL3A 2IMKA 3TKQA 3E0UA 3H4KA 3RHBA 3GHAA 1OC3A 3NZNA 5IM9A 2HZEA 1YEPA 3DVWA 1XZOA 6GSVA 1FB0A 5H5QA 2YV7A 4KE3A 2VLVA 2B1KA 2RLIA 1AAZA 3FZ9A 3M3MA 3RBTA 4O32A 2YWMA 1TRWA 4V2LA 5D9WA 2VIMA 4AF2A 3TKRA 5DBQA 4FYCA 3IDVA 2MMZA 3IHQA 3H79A 3CSJA 3VWWA 1K0AA 5FWGA 4BVYA 1XIYA 1QFNA 2YCDA 4NXIA 5DDLA 2QGVA 2DJKA 2H6XA 5JCGA 1WIKA 4F0CA 3UEMA 1XOAA 3ERFA 3CRTA 3KJYA 4NWYA 5DJMA 2LNSA 1O7UA 3A3TA 2GT6A 2WZ9A 2FLSA 1GNWA 4RI6A 3F63A 3ZIJA 1NW2A 1YJ6A 3RAZA 1M9BA 1AQVA 2L59A 1KTEA 2GGTA 3UMAA 1EV9A 4NAXA 3I43A 1UA5A 2J23A 1WMJA 4IVFA 3W8JA 3HJMA 1URMA 2P0GA 4GXZA 3E3EA 2RUEA 3ED3A 1T8EB 1EEJA 2LSTA 4EDYA 5IO2A 1TKDB 1OAZA 1Z7RA 1XVQA 2ES7A 2GS3A 2PERA 2CV4A 4ZILA 3KGKA 2OBIA 1GUKA 1F3BA 2FWEA 4IKHA 3TRPA 1EWXA 1F9MA 3F4TA 1YY7A 1GH2A 2RM5A 3QFAC 4JU5A 3IK9A 3FR3A 1KBNA 2DSAA 2VCQA 3HYPA 1R5AA 4FYUA 3N9JA 3UIWA 2K6VA 3KP8A 2GT5A 3G7YA 3D21A 4ZB6A 1OKDA 5GZZB 4GTUA 2GQMA 2LQOA 5D93A 3TDGA 2VL2A 1W89A 1QUWA 4HZ2A 1J9BA 2GSRA 3UARA 5IQYA 3KCMA 2AJQB 4PQHA 1DBYA 4MJBA 1O8XA 4Q5QA 3NIVA 1B48A 5F0GA 1X0RA 4ID0A 4J56E 1LU4A 4WBRD 3QMXA 5D9XA 5E4WA 1QGVA 2OACA 4I5QA 4GQFA 1B9XC 2VD1A 2H19A 1SENA 2AYTA 3FZ4A 1ILOA 1Z7PA 1HQOA 2EIOA 4BWQA 2DIZA 3TCOA 3LORA 3VLNA 1PD21 4Q5RA 1A0RP 3FRCA 4IW9A 5J41A 2A2RA 3APOA 1AQXA 2H1BA 4ZBAA 4OWYA 2K9FA 3UVTA 4MLYA 2EC4A 2PU9C 1XWAA 1QMVA 2BTOT 3M9JA 1M2BA 3NOFA 1GULA 4I8BA 1LJRA 4ECCA 2REMA 22GSA 5ECKB 4I97A 1DE2A 18GSA 2YN1A 3ZIVA 2HZFA 3VI7A 3HVSA 4I2UA 5HR0A 2H71A 3GSTA 1QXHA 2YNXA 2GQKA 5AN1A 2H1DA 1ST9A 4HQZA 1YEXA 5FT3A 5IMAA 1E2YA 4NPBA 2GSSA 3KD0A 2B6MA 3LFLA 2GZZA 2PN8A 4IELA 2FUG2 3EINA 3ZVJD 2IN3A 1PX7A 5G1LA 19GSA 3IV4A 5LNKe 2B5XA 3QD9A 3VPTA 1KEBA 2CZ3A 4ULXA 2XC2A 2MMAA 4CHSA 1G7OA 3LJRA 5CRGA 3HDCA 1GTBA 1Z3EA 2LJAA 4GSTA 5IMCA 2DC5A 3P7XA 5IIZA 2FWHA 2OADA 1AIUA 2FWGA 1T3BA 3IK7A 1TRSA 1XW6A 2CA8A 3G7JA 3PGTA 4GLTA 3GL5A 2V32A 1ACVA 4WR5A 1RW1A 2O89A 4F0BA 4Q5NA 4ML1A 2VCZA 5HFGA 4OD7A 1TRUA 3F3QA 4K7OA 3ZREA 1USBA 3UVHA 1GSEA 4MJCA 2YZUA 5IPGA 3L9UA 3CXGA 4K9ZA 3D0ZA 1K0NA 1KNGA 1MD4A 2V6KA 4N10A 4EXJA 2WGRA 2WB9A 5DJLA 1V57A 3BOAA 2TRXA 1UC7A 5CRHA 1Q4JA 1VF4A 5CYYA 3RPNA 1K0OA 2PWJA 2R6KA 1GSSA 1MTCA 1FHEA 1WP0A 2VL9A 3GURA 2NVLA 1X5DA 3GTUB 2F9SA 4V1Ag 1X9MB 1B9YC 2O87A 2ZNMA 2VCVA 4BWSA 2IJYA 1BQ7A 2AV4A 5HR2A 1SL0B 2FHEA 4G10A 2A4VA 2OBKA 3C1SA 3CTFA 1CQHA 3M1GA 3RPPA 4KNDA 2GVPA 3BBYA 2FA8A 2YWOA 5GSSA 2KP2A 4G2EA 2F3MA 5F06A 3HZ4A 2DIYA 1ML6A 5LD0A 1M0UA 3HJOA 1K0BA 3QAWA 2HXKA 1A2LA 2VD0A 3GH9A 3MWHA 1XFLA 2YWNA 4QQ7A 4KW6A 4IJIA 2LNTA 2L57A 4BPYA 1B8XA 2I81A 4MABA 4KCAA 4TXVA 4LMVA 1GSQA 1BAYA 1RK4A 2WULA 4LLRA 4J57E 2L5OA 3KTLA 2M72A 2YWIA 2KOKA 1HNAA 2XHFA 3FEUA 4JBBA 2C80A 1U3AA 5F07A 2FY6A 4HOJA 1YZXA 2BMXA 3L78A 1XWGA 4XTSA 2LJKA 4IBPA 3TJBA 3I6AA 4PNFA 5DALB 3UBKA 5JWRB 3GYKA 4EUYA 4V2NA 1OC9B 2LRTA 1XBSA 1GLQA 1OVNA 5KN3A 2KLXA 1GLPA 1S3AA 3FHKA 2E2GA 2B3SA 5DQSA 3U5RE 4DSSB 4IGJA 1TOFA 1SL1B 6GSUA 3KM6A 4JEDA 5DAKA 1EGRA 1ABAA 4XCSA 1MD3A 1AXDA 1OC8A 1ZOFA 3MNGA 3C71A 5A4UA 3P2AA 2HT9A 5AISA 1TU8A 4KDYA 4NHWA 5DCHA 4XIHA 1TXXA 4PUFC 4HJ2A 5G2ZA 4ISDA 5KN1A 3R2QA 4FH8A 4MF7A 5ID2B 4ZBBA 1Z6NA 5B6NA 3KH9A 4HDEA 7GSSA 5ABRA 1PX6A 3CSIA 5KN0A 4GRFA 3QAVA 4TR4A 5IMZA 3SBCA 3Q6OA 4LL1B 2C4JA 5IO0A 1SK0A 2I9HA 4MMMA 3GX8A 3LWAA 4OCEA 5J3RA 3TKSE 5CO3A 1SKWB 3LYKA 4WETA 2WS2A 2VCTA 4FIWA 3ZITA 2XBQA 5A5KA 3ZLPA 2TIRA 1WE0A 1EZKA 2F8FA 4MDCA 3C7MA 4MZBA 3DKSA 4ECBA 2JZTA 1GSUA 1Y6EA 3EE2A 2VO4A 2BJXA 2R3XA 3ME7A 1YKAA 3FZ5A 2PPTA 4TXOA 1ERVA 3WT2A 2D2ZA 2VUPA 12GSA 5H5SA 2YV9A 5DVBA 1JHBA 4YQMA 2PGTA 5ECIB 4GWRA 2J9HA 2IFQB 5ECPB 2LUSA 4JRRA 2H0HA 4PURA 4WXTA 1TI3A 1Z6MA 1X5EA 5ELAA 3D4MA 3ZFLA 1PL2A 5F05A 4AJ7A 2VLTA 1RQMA 1ZYQB 1Z5YE 2HFDA 5ENUA 4LA1A 1XW9A 2LRCA 3DEXA 4EKZA 2G2QA 4TW5A 1Q98A 5DCGA 1QK8A 1ERUA 1R26A 4BVXA 2K8VA 5IMDA 2VCWA 5IOXA 2HSYA 1NHYA 1M2DA 3WGEA 3PINA 2DJJA 3GTUA 2GLRA 3BCKA 3I9V2 3HXSA 4I2TA 4AJ8A 3VI5A 5AIVA 3UBLA 4XS4A 4D73B 1U3IA 5B8AA 5HR1A 4DEJA 5EVOA 1YF0A 3M9KA 4PQIA 4EF0A 3UJ1A 2DJ3A 4CDOA 1GRXA 3QDNA 1U6TA 1ZYEA 2CAQA 5HQPA 1K3YA 4MH2A 3L9VA 1R7HA 4KA0A 1OYJA 2OKAA 3HY2A 1YDKA 5DQYA 1WJKA 1JZOA 2FWFA 2WCIA 1Z9HA 3EU3A 1A0FA 1BG5A 1OKTA 3KP9A 2DJ1A 6GSYA 2P31A 4HEA2 1M7TA 1T00A 3TRXA 1G6YA 5D8IA 1XCCA 3GUSA 1QQ2A 1GSDA 5CP1A 4HS1A 4ECIA 1ZGNA 5B8BA 1TK0B 2H75A 5EPFA 5D73A 1MDIA 1NM3A 4POMA 4E8EA 2LQQA 2H30A 3EMPA 4RI7A 4H86A 4TR0A 3C73A 1M9AA 1A24A 5DALA 4MZWA 3GX0A 1K0CA 4BA7A 4HU9A 1VGLA 3IXRA 1R5PA 3A2XA 2H1AA 4O7HA 1U88A 2ZUPA 3UL3A 4HQSA 1HNCA 2HE3A 5D96A 4NMUA 6GSXA 1DUGA 3TKPA 4DSSA 4GQCA 1XWKA 3DD3A 1PKWA 2FGXA 2E7PA 5AIXA 4DSRA 1T7PB 1C72A 1ZZYA 1AQWA 4MJAA 2QKEA 4Z7XA 5IPHA 5E59A 1O85A 3F8UA 4IS0A 2AAWA 3GN3A 5ID2A 4F2IA 3FW2A 2B5EA 2DLXA 3VWXA 3CSHA 1DSBA 4G9HA 3GIXA 3EVIA 5CRDA 1VF2A 2MMOA 3LGCA 9GSSA 1V40A 4GSNA 2PUKC 5G5FA 3O6TA 3GL3A 2M80A 1TW9A 4X43A 3GA4A 4YAVA 1R4WA 1EP7A 2C0EA 2H73A 1EOGA 3IAS2 2HZEB 2N5BA 2JZSA 3EMXA 1B4QA 3KMNA 1ON4A 5JCWA 1IYHA 1SYRA 4WKWA 5KN2A 1TTZA 2MBSA 4F03A 2O7KA 2JACA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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