5CRHA

Human skeletal calsequestrin, m53t mutant high-calcium complex
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
354
structure length
354
Chain Sequence
QEGLDFPEYDGVDRVINVNAKNYKNVFKKYEVLALLYHEPPEDDKASQRQFETEELILELAAQVLEDKGVGFGLVDSEKDAAVAKKLGLTEVDSMYVFKGDEVIEYDGEFSADTIVEFLLDVLEDPVELIEGERELQAFENIEDEIKLIGYFKSKDSEHYKAFEDAAEEFHPYIPFFATFDSKVAKKLTLKLNEIDFYEAFMEEPVTIPDKPNSEEEIVNFVEEHRRSTLRKLKPESMYETWEDDMDGIHIVAFAEEADPDGFEFLETLKAVAQDNTENPDLSIIWIDPDDFPLLVPYWEKTFDIDLSAPQIGVVNVTDADSVWMEMDDEEDLPSAEELEDWLEDVLEGEINTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Characterization of Two Human Skeletal Calsequestrin Mutants Implicated in Malignant Hyperthermia and Vacuolar Aggregate Myopathy.
pubmed doi rcsb
molecule tags Calcium binding protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords Calsequestrin-1
total genus 113
structure length 354
sequence length 354
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5crhA03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5crhA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5crhA02
4EDZA 2LNSA 2YJHA 1TRWA 5F05A 5HQPA 3LSZA 2AB6A 2QC7A 1TK5B 3P90A 4IJIA 3ZMLA 2VIMA 4KDYA 2GS3A 2DJJA 2VL3A 1K0OA 1ZMAA 1K3YA 4LL4B 3RPNA 1AIUA 1QMVA 5COHA 2NPBA 1EP8A 3VI5A 1M0UA 5D9TA 2XBQA 4E8HA 1K0BA 4KUNA 4NXIA 4NMUA 4I2UA 2H0HA 2RM5A 4ZL7A 4WETA 4POKA 1NHYA 4ML1A 3KTBA 3CXGA 3CMIA 5FT3A 6GSUA 2EC4A 3K8NA 4Z7XA 2XPDA 1EEMA 4POBA 3H1NA 3L4NA 4L5OA 3QOUA 3DGQA 3ED3A 3N9JA 1HQOA 2H01A 3FZAA 2TIRA 2LJKA 4PQHA 2CAIA 2VUPA 4ISDA 4OMVA 1E6BA 2X8CA 4YAPA 3VWWA 2EIQA 1PD21 2DSAA 2I4AA 4ILFA 3ZVJD 1M99A 1EWXA 5G1KA 5L71A 1NHOA 1GTBA 2YP6A 4POLA 2ZNMA 3ME7A 1SL0B 3HKRA 3WGXA 2B5EA 5AIVA 3TUEA 4NAXA 2MZCA 1TK0B 2HT9A 3GURA 4XHMA 4MJEA 3GSTA 2VOCA 2C8UA 3HHVA 2CZ2A 5ABRA 1B9XC 5H5RA 2J23A 5G1LA 5DAKA 1V2AA 3Q19A 1A23A 5ECNB 1H4OA 1HYUA 4L0WA 3Q74A 2I81A 2L5LA 2VL9A 2H74A 3DMLA 1FAAA 2L4CA 1XXUA 1F9MA 2N5AA 3ZLPA 4MZBA 3ZYWA 5LNKe 3IR4A 2HSHA 3LJRA 1F37A 2B1LA 3GNJA 2VCWA 2DJ2A 4ZBBA 2YCDA 4ZIJA 3FW2A 2P5RA 4QL9A 4OFNA 5IPHA 1U88A 5F06A 5B8AA 2X8HA 2VCZA 4ML6A 5FWGA 4EXJA 1T4ZA 1Q98A 2LKUA 1GH2A 1T8EB 3E0UA 1O7UA 1CQGA 1NW2A 5D93A 4QQ7A 4MABA 3L9VA 1A8LA 1AQWA 2ES7A 2KHPA 4ZBDA 3QPMA 2PU9C 4KE3A 4KSOA 1V58A 1XOAA 3QDNA 2H73A 3TB2A 4EDYA 1OVNA 3PH9A 2IFQB 1YDKA 2AAWA 5AISA 3FZ5A 3BBYA 1ERVA 4J57E 4XCSA 2WFCA 1M2AA 1NSWA 2WCIA 11GSA 1RK4A 3ERFA 5DALA 1B8XA 1U3AA 5EL8A 5C04A 1JFUA 3TJJA 2V41A 4O92A 4TKYA 4IBPA 5KN3A 3HJOA 4IHUA 3D6IA 3F63A 1AXDA 1TU7A 1UN2A 2YNXA 5A4VA 1Z9HA 4GQCA 4N30A 1WWJA 3FKFA 1LU4A 1OE8A 3EU4A 5J9CA 2R4VA 1TI1A 2L6DA 4EKZA 1J08A 1HD2A 3D0ZA 1GTIA 5HR0A 5J4UA 5KEJA 2E2GA 4TVEA 2F51A 5ID2A 2VD0A 1G7EA 3UJ1A 1YZXA 1BEDA 4HEA2 4IVFA 4DVCA 2WJUA 3HDCA 5EPFA 3UOMA 2HRFA 1ZL9A 1O85A 4ECCA 1B48A 2CA8A 2H6XA 2K8VA 5DVBA 4ZBAA 2PWJA 5G31A 1G7OA 2FUG2 1MDKA 3QR6A 2HI7A 4DSSA 3JCML 3DEXA 5JWOB 2P0GA 2FGXA 1MEKA 4TXVA 3HJPA 4ID0A 2BJXA 2VLTA 1KEBA 3SBCA 1M2DA 1URMA 4Q5FA 6GSYA 2WS2A 4V1Ag 4N11A 2CVDA 4ZL8A 3U6VA 2IMEA 1QUWA 4YQUA 1DE2A 2GQMA 3IV4A 3F6FA 4IKHA 1WP0A 4PUAA 4FIWA 1X5EA 4ECIA 3ZTLA 2MMZA 2I3YA 1MDIA 2R5GA 4J56E 2H19A 4JR6A 1FVJA 4NWYA 3G7JA 3FR9A 1AUCA 3EMPA 2NDOA 5DQYA 1M2BA 2V32A 1T1VA 2QSIA 3C8EA 4ACSA 2OA7A 3EMXA 3GKXA 2GDRA 4POMA 1Y25A 1W89A 2GT5A 4XRDA 3W8JA 2DIZA 1T4YA 2JADA 1ON4A 3GH9A 4N0VA 2C0GA 2NBSA 3ERWA 3WGDA 1YF1A 1TP9A 2I1UA 2DJ1A 2GSRA 4WXTA 2KUCA 4MF7A 1ABAA 3KMNA 5HR1A 1BX9A 1YEPA 5HR3A 3QAGA 5J9BA 2J9HA 3WD6A 3QMXA 4EE0A 3VPQA 3ERGA 2JSYA 5ECPB 3GIXA 2FHEA 4QL7A 2V6OA 4WR4A 4HU9A 4TN8A 1VF4A 16GSA 4HJ2A 1K3OA 3TKPA 2X8GA 2CQ9A 1J0FA 3LXTA 2HSYA 5DAKB 4PX1A 6GSWA 1RQMA 4EO3A 1ML6A 4ZB8A 4HDEA 3LYPA 1G0TA 1PX6A 1JZRA 2NTOA 3SWLA 2CV4A 2VCXA 5E4WA 3A5WA 4ZB9A 5DCGA 1C72A 1V98A 2P5QA 3HYPA 2O85A 3BD2A 1PL2A 4H86A 3HA9A 1GRXA 3EWLA 4GXZA 5IOXA 4K7OA 2IWTA 4MH2A 1G6YA 1Z6NA 2OE3A 1GWCA 4I6XA 3TKSE 2WDUA 4WF4A 3TDGA 3UBKA 1FG4A 4KCAA 2YV9A 4KH7A 4MJBA 2CX4A 1VF1A 5J41A 3GRXA 2XHFA 2K8SA 4G9HA 4TOPA 1ACVA 4WR5A 3UAPA 5B6MA 2B7KA 4X0XA 2FA8A 1Q4JA 3GX8A 3DKSA 2M80A 4YH2A 3ZRDA 4ZL9A 1XFLA 4WBRD 3GTUA 2FWEA 1FO5A 1SENA 1DE1A 5GZZB 3UMAA 1SKWB 1SKSB 2FWHA 4EC0A 5ELAA 5DALB 2F9SA 5ECMB 1BQ7A 4AF2A 4I5QA 1OE7A 3J7Yb 1O81A 2OACA 3IA1A 5EVOA 4G10A 2LTKA 4FYCA 3RHCA 5J3RA 7GSSA 3RDWA 4J2FA 4MH3A 4MLYA 1YJ6A 2LSTA 3MWHA 3A2WA 4DSQA 2MMOA 5G30A 1XW6A 5ECLB 2OE1A 1R5AA 2E0QA 2GGTA 1ZOFA 5ID2B 3TJKA 3TGZA 1BG5A 1ERWA 2GSQA 3IC4A 4BPYA 3DXBA 2FNOA 6GSTA 3GHAA 1N8JA 2BMXA 3W8SA 3AY8A 2FWGA 2H30A 17GSA 4GQFA 5B7CA 4GCIA 4HQZA 5JCUA 1GUHA 5LCZA 1GUKA 4LLRA 1XIYA 3D5JA 4DSSB 4IN0A 2K18A 4TXOA 1DBYA 3GL5A 1F3AA 5G5FA 2CT6A 2LRTA 3VWVA 1XCCA 1OC9A 1JLVA 1JLWA 1A8YA 2CAQA 5AIXA 3CYNA 3DVXA 2EIRA 1O8XA 1VF2A 3GN3A 5IOWA 2IMFA 3A3TA 3IE3A 2TRXA 1SK2A 2LQOA 2HZEA 4WF5A 3F3QA 1XW5A 4Q5QA 3PGTA 1FB0A 2O8VB 3KH7A 3ZITA 1E2YA 3S9FA 1T3BA 1X9WB 1J9BA 1TXXA 5D9VA 4BWSA 3CSJA 2CVKA 2VD1A 4FH8A 4KA0A 4MF5A 2YJ7A 2GZPA 2H1AA 4HJMA 2H70A 1SK0A 3FR6A 2H75A 4MPGA 5ECHB 1OC3A 3HVVA 3IK9A 4OCEA 5A4WA 4I97A 18GSA 4HS1A 1JHBA 3GKKA 5B6NA 3DIEA 1TTZA 4L5LA 4IJ3A 2X99A 1EV4A 3LQ7A 4BWQA 2KP1A 4PNGA 4HI7A 3APOA 4ECJA 1R7HA 1WPIA 4PUFC 4YQMA 2L59A 2D2ZA 5F07A 1FOVA 5CYYA 1K0CA 4YQVA 1ST9A 3N5OA 1QFNA 4K8MA 2H72A 4MPFA 3C1RA 3GMFA 2VLVA 3D22A 5GAPD 1K3LA 5DQSA 2F8FA 1S3CA 3C1SA 4DSRA 3EE2A 5D9WA 3CBUA 3EYTA 2ON7A 2OJLA 1SU9A 2WULA 3MDKA 1GUMA 4FYUA 5D73A 2HYXA 2RUEA 5ECQB 5CRGA 3MNGA 3D4MA 4AGSA 3LEFA 1SJ6A 8GSSA 5IQYA 1GLQA 3HD5A 6GSSA 5DJLA 2XBIA 4TR1B 4RQXA 1X9SB 2YWOA 1S3DA 4I8BA 2GLRA 1AC1A 1TW9A 3TKQA 1EZKA 4I2TA 19GSA 4OFTA 4RI6A 1EP7A 2GTUA 4NHZA 4HZ2A 5CO3A 2K6VA 4F0BA 5DCHA 3ZZXA 4PGTA 3HZ8A 3VFIA 3VLNA 1Z3EA 4ULXA 2OE0A 3M1GA 3GL3A 4RQRA 2WGRA 3M9KA 5AN1A 2G0FA 4K0GA 3EC3A 4D73A 2PGTA 1AQXA 1WMJA 2C3QA 1PSQA 1U3IA 3KH9A 5KN2A 1T7PB 1MDJA 1ZYEA 3LG6A 4JEDA 1FB6A 1AQVA 3GTUB 1HNBA 1K0DA 3H4KA 3GYKA 5G5EA 3TKSA 4K7NA 1I5GA 3U5RE 2GZZA 12GSA 4K7IA 3M9JA 2CZ3A 3WT1A 3F4TA 4EL1A 1JZOA 1GSEA 5D96A 4BA7A 2PN8A 5B8BA 3O3TA 4V1Ap 3GKNA 1N2AA 1ZYQB 22GSA 1XWGA 5KN1A 5CRWA 5GSTA 4L8EA 1GSSA 1GTAA 1YKAA 2KOKA 2HZFA 2GZYA 4Q5NA 1TRSA 4MJAA 3L78A 2VL2A 3O6TA 1K0NA 1XWCA 2HRNA 5LD0A 1XOBA 4PXOA 2GSSA 4K6XA 3US3A 3H93A 2XC2A 2OKAA 2N5BA 1THXA 4HOJA 3FK8A 4BVYA 3ZFLA 1XPVA 1X9MB 3Q6OA 1T00A 3F3RA 3QAVA 4Q5RA 3TRPA 4CW9A 1OC9B 5IMZA 2DC5A 2A2RA 4V2LA 1FHEA 2F3MA 1A0RP 2YWIA 2FD3A 3L9UA 1HNCA 5A5KA 3IOSA 2C0FA 4OWYA 3DD3A 4NHWA 5CAXA 2L4QA 3QCPA 4GF0A 2V6KA 2PERA 3FR3A 3HVXA 2IMDA 3F4RA 5HFGA 2AHEA 2AYTA 4XRAA 2O89A 3HXSA 1WE0A 9GSSA 2AUVA 2H6YA 6GSVA 1V40A 3GKMA 1TK8B 3IBHA 2IL3A 1ERTA 3F4SA 3FY7A 1GULA 4LMVA 3RAZA 3L0HA 2DIYA 3KEBA 2H0IA 1FVKA 3D4TA 1GTUA 3TCOA 2VCQA 2H6ZA 6GSXA 1TKDB 5IPGA 4N10A 2VL2C 1SKRB 2GVPA 1H75A 1QXHA 2OBIA 2AV4A 1GNEA 4JBBA 3KCMA 3ZVJA 4NV5A 4AJ7A 5EY6A 1ZCPA 3NZNA 2DBCA 1NM3A 3APSA 3H8QA 1PX7A 3EU3A 2JL4A 4OFMA 3UEMA 2DJ3A 3BJ5A 5CRHA 1PGTA 3VURA 3D21A 5IMDA 5CP1A 1USBA 3P7XA 5F8BA 4WEYA 1BAYA 3R2QA 3A2XA 4F82A 1GLPA 1EOGA 1O6JA 5IO0A 1GL8A 3UBLA 4MDCA 1TRVA 1SL2B 2C4JA 3C7MA 3RHBA 3LWAA 2FWFA 3GX0A 1VGLA 1R5PA 2HLSA 4L0UA 1GSDA 1YEXA 3TRQA 1XWKA 3BOAA 3HY2A 1GSUA 5CRDA 2PPTA 2L6CA 4IS0A 3WT2A 1TU8A 5H5QA 4ZXGA 1TJDA 2JU5A 5HFIA 2YPMA 1X5DA 3DWVA 4PQIA 2K9FA 1IYHA 3LFLA 2R6KA 3ZL5A 2OADA 1FW1A 4AJ8A 2RM6A 1PMTA 1XW9A 3FRCA 4MP4A 3W6GA 3V1WA 3CSHA 2LEGA 3VK9A 1B4QA 5IMCA 4X1UA 2PMTA 2V1MA 1Y6EA 4PQ1A 1GSYA 2REMA 1Z5YE 5DDLA 1A0FA 2RLIA 2DMMA 5IIZA 2L5OA 3LXZA 1BYEA 1OC8A 2VAFA 4HQSA 4GRFA 2RIIA 3KP8A 3GA4A 4KAEA 4JU5A 3ZIJA 1PA3A 4GTUA 3ZREA 4CHSA 3I43A 2C3TA 3KMOA 4TRXA 1KBNA 4KNDA 4LA1A 2GQLA 1WJKA 3F6DA 3KXOA 4IQAA 4CDOA 3FZ9A 1MD3A 3C71A 3I6AA 3LYKA 2IJYA 4PURA 1LBKA 1WOUA 4KW6A 4BVXA 3L9SA 2AJQB 1SYRA 1ZZYA 3PINA 2LNTA 2MBSA 2ZUPA 3HVSA 3ME8A 3HCZA 3KM6A 2ZCTA 4IP6A 4K0NA 4IP1A 3TOUA 3C73A 3IXRA 3VWUA 5ECSA 4MZWA 4BL7A 3NOFA 1M9AA 2YV7A 3IAS2 5CREA 1EOHA 4K9ZA 3KJYA 3KTLA 4NV2A 1G6WA 20GSA 4EVMA 5JCGA 2E2MA 1QQ2A 1VF3A 3ZIVA 4MMMA 5J5NA 2B1KA 5ECIB 3UVTA 4NPBA 5D8IA 5JWQB 4OCFA 2V2GA 1MTCA 2YANA 2LRCA 4G2EA 5F0GA 2P31A 4FYBA 1A2MA 1O73A 3M8NA 5FHIA 4OO4A 2KP2A 4JE1A 1GSFA 2HXKA 5GAND 2FY6A 3QD9A 1PKZA 3MAKA 2OBKA 1Z7RA 3M3MA 1ILOA 1SJIA 3BCIA 4KDUA 2VLUA 2X64A 2LS5A 2IIYA 3HJMA 3TRXA 4E8EA 5ECRB 2LUSA 1EGRA 4WKWA 3DVWA 4V2MA 1O8WA 4MCUA 3GSSA 3GFKA 3IRAA 1DSBA 2B5XA 1KTEA 4OO5A 2H8LA 2LJAA 3RPPA 3IK7A 4KDXA 3M0FA 1OKTA 1UA5A 2VM1A 3CTFA 5JCWA 3DRNA 3TJBA 3Q18A 3LGCA 2JACA 3TJFA 2R2JA 4EF0A 4O5RA 3WYWA 5IMAA 1R4WA 2B6MA 4KX4A 5IM9A 3DYRA 1YQ1A 1OAZA 1LJRA 2JSZA 5ELGA 2H1BA 2VCVA 1QGVA 2B3SA 1F2EA 3LORA 1PKWA 1OYJA 1F6MC 5ECOB 2YN1A 2ON5A 4HU7A 2VCTA 4XS4A 2IPAA 3O76A 2M72A 3KZQA 1YY7A 4MJCA 4TR3A 3UARA 1SYXA 3FEUA 2C80A 2H1GA 1DUGA 2A4VA 4JZQA 1R26A 2VM2A 2C0EA 3HZ4A 1XWBA 1WIKA 5ENUA 4GWRA 3RBTA 2WB9A 4KGIA 4K1FA 1OKDA 1YF0A 4ZILA 1JZDA 5JWRB 2H66A 3P8WA 1MD4A 3E3EA 4GSTA 5A4UA 2DLXA 1V57A 3IHQA 5KN0A 3FZ4A 1YKCA 2GQKA 1QK8A 2F8AA 4WBJA 1GNWA 4MZCA 4EUYA 5INYA 3WGEA 2DMLA 4F2IA 2LJRA 1JZWA 4GSNA 1CQHA 2M46A 1X0RA 1U6TA 2ALBA 1V9WA 2G2QA 3KIJA 5CNWA 1HNAA 1PN9A 1B9YC 1X5CA 2IMIA 1THOA 4IGJA 4LL1B 3KD0A 3KGKA 1PRXA 2FA4A 1SD9A 1AW9A 5H5SA 2H1DA 2WZ9A 4HZ4A 3QAWA 1SJZA 2R3XA 2C3NA 1XBSA 3NIVA 4KCEA 5IO2A 3H79A 3GUSA 4IW9A 4F0CA 2LV3A 4TXOB 2MMNA 2E7PA 1A2LA 4XS6A 3KP9A 3VWXA 2GSTA 3UIWA 1VRSD 3G7YA 4V2NA 5GSSA 1W4VA 1F3BA 5D9XA 3F8UA 2TRCP 2CX3A 1GSQA 3A2VA 4DEJA 2JZTA 2HFDA 4HUAA 2DJ0A 3TKRA 2YZUA 4F9ZA 2HZEB 2IMKA 3TKSC 2XPEA 2B5YA 3ISOA 4TR4A 5DJMA 3UVHA 1XVWA 3I69A 3QFAC 4YAVA 4O32A 2LQQA 1XVQA 3EURA 2MBTA 4OD7A 2C1YA 1K0MA 5AGYA 1RW1A 2FCHA 2B7JA 3P2AA 3F9UA 4KSMA 5IMFA 1Z7PA 2L57A 2MYGA 1SD8A 3G9BA 3F0IA 3UL3A 3IAM2 3I9V2 4FO5A 4ZB6A 3ZFBA 2RUFA 5E59A 3OR5A 2KLXA 2EIOA 2HE3A 2VO4A 4X43A 4XIHA 3ZMKA 4MF6A 2WRTA 4ECBA 1EV9A 4IQ1A 3GV1A 2CVBA 3CTGA 1UVZA 4KB3A 2DJKA 1EGOA 2JZRA 4RI7A 3BCKA 2C0DA 3FYGA 2Z9SA 2QKEA 2IN3A 1I9DA 2FLSA 2I9HA 1TI3A 1A2JA 10GSA 4RUVA 1AAZA 2H0GA 2YOIA 4MA9A 4N0ZA 4IELA 1U87A 4AJ6A 2R37A 1XWAA 1M7TA 2BTOT 4JR4A 1A24A 3VPTA 3APQA 2PVQA 3FHKA 4TR1A 4PNFA 2H76A 4MK3A 5HFKA 1ERUA 2YWMA 3GH6A 1IYIA 3QFBC 1GP1A 14GSA 1M9BA 13GSA 2A2SA 4P3YB 2H71A 3EVIA 3EINA 3TJGA 2PVOC 2MMAA 2NVLA 1SK1A 2IFQA 1S3AA 2PBJA 1TRUA 3TOTA 3IDVA 1SL1B 4XS4B 2QGVA 4GSSA 1K0AA 4JRRA 4K2DA 4O7HA 3MSZA 1TDIA 1ZGNA 1PQNA 3E9JB 4G19A 1PL1A 4XTSA 2GT6A 2O7KA 1Z6MA 1EEJA 3CRUA 3VI7A 4D73B 1BJXA 2O87A 3J7Yk 1KNGA 2PUKC 1TOFA 2HNLA 2JZSA 4XS1A 4GLTA 3PR8A 1B4PA 3G7IA 4LMWA 5ECKB 4F03A 1XZOA 5DBQA 3CRTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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