5CUDA

Crystal structure of the bromodomain of bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2b (baz2b) in complex with 6-chloropurine (sgc - diamond i04-1 fragment screening)
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Crystal structure of the second bromodomain of bromodomain adjancent to zinc finger domain protein 2B (BAZ2B) in complex with 6-CHLOROPURINE (SGC - Diamond I04-1 fragment screening)
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 39
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5cudA00
5ENCA 3UVWA 5CQ6A 4O77A 3D7CA 4WIVA 5I1QA 4YH3A 4BJXA 4UYHA 4YATA 4TT2A 4ALGA 3ZYUA 4IR6A 4KCXA 4O7AA 5HENA 5CUGA 5DKDA 5TCMA 3LXJA 4CUSA 2R0SA 4XUAA 5DYCA 3U5JA 4LRGA 4HXRA 5CQAA 5EU1A 3K2JA 5I40A 5J0DA 2RNXA 5ENJA 1WUGA 3UVXA 2WP2A 5A5NA 3IU6A 4TTEA 5H1UA 3MB3A 5HRXA 3O36A 3FKMX 4IR4A 2D82A 5IGKA 4LYWA 4A9MA 3U5PA 5LUUA 4BW2A 5I83A 5G4RA 2DVQA 5D3NA 4QY4A 4ZC9A 5H1VA 4UYFB 5EV9A 5F25A 4NRCA 3U5OA 4HXNA 3UVYA 4A9JA 3JVLA 4FLPA 3P1DA 5CUDA 5L8TA 5CUEA 3QZSA 3O35A 4HBXA 5HCLA 5KTXA 4N4HA 4NQMA 5A7CA 3LQIA 2YELA 5F2PA 4F3IA 5A81A 4HXMA 2YW5A 5F5ZA 5ENFA 5LJ1A 2YYNA 4MENA 5LKTA 4YYMA 4QEUA 4GPJA 3P1FA 5HEMA 4A9KA 5ENIA 5D3TA 2RNWA 4C66A 1EQFA 4Z93A 3S92A 5EVAA 3I3JA 5EM3A 3P1CA 5CRZA 5CU8A 5D24A 4NR6A 3U5LA 4TQNA 5IBNA 4HXPA 4PKLA 5COIA 4PCEA 4KV4A 5HFRA 4PY6A 4NR8A 4TYLA 3Q2FA 5FB0A 4J1PA 5ENHA 2N9GA 5H1TA 4PCIA 4OUFA 5F3AA 2R0YA 4YY4A 5EWWA 2MJVB 3LQHA 4IOOA 5ACYA 4QR3A 4YYNA 2G4AA 4TT6A 4QUUA 4Z6IA 5AD2A 4LR6A 5EICA 4NS5A 3DAIA 4YYHA 5LJ0A 4Y03A 5F1HA 5KU3A 3RCWA 5EWDA 5D3HA 1N72A 4UITA 3DWYA 5I29A 1JM4B 5FE6A 4NYXA 5HRVA 4QSRA 2E7NA 4N3WA 2RS9B 5FE9A 4BW1A 5EPBA 5EPSA 5F60A 4ZQLA 4QC3A 5EK9A 4HXKA 5JI8A 3S91A 3U5NA 5I7YA 5ETDA 5FG5A 2YEKA 3MUKA 4NUEA 4TZ8A 5CQ4A 4CURA 2OSSA 4YYDA 4NYVA 5LKZA 5I80A 5FE8A 5ENEA 2RO1A 4MEOA 3QZVA 4IR5A 3AADA 4O7CA 5ENGA 5KTUA 5LJ2A 5E0RA 1WUMA 4NR9A 5CS8A 4QSSA 3P1EA 5CY9A 5AD3A 5A82A 4E96A 3GG3A 5F61A 3U5MA 2L5EA 5HJCA 4O74A 5E3DA 5DYXA 4TS8A 5CGPA 3SVGA 5EWVA 5E3GA 5F62A 4A9FA 5CPEA 2R0VA 5D3LA 2E7OA 3O34A 4QNSA 2DVRA 3QZTA 4UIWA 4Z1SA 5BT5A 4CUQA 1X0JA 4QB3A 4BHWA 5DX4A 5L8UA 4MR3A 2YDWA 4HBVA 4YK0A 4NRBA 5CUBA 5FH8A 4OGIA 4O71A 4O7EA 5IIDA 4QBMA 5A5SA 2GRCA 4O75A 5D3RA 3MB4A 5L96A 5FDZA 2L85A 5FE1A 4QR4A 5FFWA 5KHMA 5K29A 4YYGA 4UIYA 5EISA 5BT3A 2D9EA 4XY8A 5D7XA 4UIZA 4UYDA 4YYIA 4O78A 4PTBA 5A5RA 2L84A 5DW1A 3JVKA 5IG6A 4QSWA 1F68A 5CQ5A 3HMEA 3P5OA 4XY9A 5FE0A 5CQTA 5A5OA 4UYGA 5E9LA 5CZGA 3G0JA 5G4SA 4CUUA 4RVRA 5HQ6A 4QYLA 5JWMA 4IOQA 4QSPA 5CRMA 4MEPA 3Q2EA 5FG4A 3UV2A 2YEMA 4N4IA 3MXFA 5EQ1A 4UIUA 5CQ3A 4OGJA 5FH6A 4NR4A 5FE2A 4XYAA 4QZSA 2I7KA 4O72A 4QSVA 4XUBA 5FE3A 2NXBA 5D0CA 4Q0OA 3UVDA 4LZ2A 4UYEA 4MR4A 5FH7A 4MEQA 4LC2A 5DLXA 5DLZA 4Z1QA 5I88A 3LQJA 3MQMA 5LKUA 3O33A 4O76A 4YYJA 4QSTA 5FFYA 2DWWA 4WHUA 4A9IA 4UIVA 5DW2A 5I89A 3U5KA 2LSPB 2RNYA 4O70A 4QEWA 4QEVA 3ONIA 5D3PA 1JSPB 5L97A 2E3KA 4QSXA 5LVQA 5CP5A 4MR6A 4O7FA 5D3JA 4J3IA 5E9VA 5CUAA 2R10A 5E9IA 4YBTA 3MULA 5C85A 5HELA 4WHWA 5CQ8A 5HFQA 3SVHA 4CL9A 4A9LA 3TLPA 4LZRA 5KO4A 5L98A 3UV5A 4CLBA 3SVFA 5C89A 5EWHA 5HLSA 1E6IA 5D26A 5FE7A 4YBSA 4QYDA 4IR3A 4TU4A 2RI7A 4Q0NA 4N4GA 5IGNA 5FB1A 4YABA 4HBYA 4Z6HA 4NYWA 4A9HA 5DFCA 5CQ7A 5C4QA 4QC1A 2KTBB 2DKWA 4CFLA 5EWCA 5II2A 4LYIA 5FG6A 5HQ5A 5I7XA 4UYFA 4CFKA 5A5PA 2RFJA 5DKCA 2WP1A 2OO1A 2DVSA 4TZ2A 5BT4A 5EI4A 4LZSA 4YH4A 5E74A 5DYUA 5CTLA 2OUOA 4BW3A 5I86A 3LJWA 4BW4A 4TT4A 5EA1A 2H60A 5CFWA 4O7BA 2F6NA 5LVRA 5HQ7A 4N4FA 5D3SA 5II1A 5A5QA 4NUCA 5F63A 4J0SA 4ALHA 2DVVA 5DFDA 3HMFA 4NR5A 5C7NA 5LKXA 4CUPA 5HRWA 3UV4A 3O37A 4QR5A 5H85A 4HXSA 4LYSA 5FFVA 4QUTA 4QSUA 4HXOA 4A9NA 5IGLA 4HXLA 4DONA 4NXJA 3UW9A 4HBWA 5D25A 5CUCA 4NR7A 4ZW1A 5ENBA 4NRAA 5FE5A 5F36A 1ZS5A 5IGMA 4NQNA 5E7DA 2I8NA 5DFBA 5HM0A 4YBMA 4C67A 5AMEA 3JVJA 3NXBA 5DKHA 5E9MA 5L99A 4X2IA 3HMHA 3AQAA 4YYKA 5DY7A 4YAXA 4YC9A 5AMFA 5EP7A 5EGUA 3G0LA 5C8GA 4CUTA 4A9EA 5C87A 2DATA 5DBMA 2F6JA 5KTWA 4AKNA 3IU5A 5E9KA 2YQDA 2FSAA 4QSQA 5F1LA 5ETBA 5E73A 4TU6A 4J0RA 5TB6A 4KV1A 4YADA 4MR5A 4A9OA 5A83A 4IORA 5EPRA 5A85A 5DYAA 5FE4A 4PS5A 3JVMA 4YY6A 5FBXA 4UIXA 5E9YA 4LDFA 4NUDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5ENCA 3UVWA 5CQ6A 4O77A 3D7CA 4WIVA 5I1QA 4YH3A 4BJXA 4UYHA 4YATA 4TT2A 4ALGA 3ZYUA 4IR6A 4KCXA 4O7AA 5HENA 5CUGA 5DKDA 5TCMA 3LXJA 4CUSA 2R0SA 4XUAA 5DYCA 3U5JA 4LRGA 4HXRA 5CQAA 5EU1A 3K2JA 5I40A 5J0DA 2RNXA 5ENJA 1WUGA 3UVXA 2WP2A 5A5NA 3IU6A 4TTEA 5H1UA 3MB3A 5HRXA 3O36A 3FKMX 4IR4A 2D82A 5IGKA 4LYWA 4A9MA 3U5PA 5LUUA 4BW2A 5I83A 5G4RA 2DVQA 5D3NA 4QY4A 4ZC9A 5H1VA 4UYFB 5EV9A 5F25A 4NRCA 3U5OA 4HXNA 3UVYA 4A9JA 3JVLA 4FLPA 3P1DA 5CUDA 5L8TA 3D1DA 5CUEA 3QZSA 3O35A 4HBXA 5HCLA 5KTXA 4N4HA 4NQMA 5A7CA 3LQIA 2YELA 5F2PA 4F3IA 5A81A 4HXMA 2YW5A 5F5ZA 5ENFA 5LJ1A 2YYNA 4MENA 5LKTA 4YYMA 4QEUA 4GPJA 3P1FA 5HEMA 4A9KA 5ENIA 5D3TA 2RNWA 4C66A 1EQFA 4Z93A 3S92A 5EVAA 3I3JA 5EM3A 3P1CA 5CRZA 5CU8A 5D24A 4NR6A 3U5LA 4TQNA 5IBNA 4HXPA 4PKLA 5COIA 4PCEA 4KV4A 5HFRA 4PY6A 4NR8A 4TYLA 3Q2FA 5FB0A 4J1PA 5ENHA 2N9GA 5H1TA 4PCIA 4OUFA 5F3AA 2R0YA 4YY4A 5EWWA 2MJVB 3LQHA 4IOOA 5ACYA 4QR3A 4YYNA 2G4AA 4TT6A 4QUUA 4Z6IA 5AD2A 4LR6A 5EICA 4NS5A 3DAIA 4YYHA 5LJ0A 4Y03A 5F1HA 5KU3A 3RCWA 5EWDA 5D3HA 1N72A 4UITA 3DWYA 5I29A 1JM4B 5FE6A 4NYXA 5HRVA 4QSRA 2E7NA 4N3WA 2RS9B 5FE9A 4BW1A 5EPBA 5EPSA 5F60A 4ZQLA 4QC3A 1ZKRA 5EK9A 4HXKA 5JI8A 3S91A 3U5NA 5I7YA 5ETDA 5FG5A 2YEKA 3MUKA 4NUEA 4TZ8A 5CQ4A 4CURA 2OSSA 4YYDA 4NYVA 5LKZA 5I80A 5FE8A 5ENEA 2RO1A 4MEOA 3QZVA 4IR5A 3AADA 4O7CA 5ENGA 1PUOA 5KTUA 5LJ2A 5E0RA 1WUMA 4NR9A 5CS8A 4QSSA 3P1EA 5CY9A 5AD3A 5A82A 4E96A 3GG3A 5F61A 3U5MA 2L5EA 5HJCA 4AKHA 4O74A 5E3DA 5DYXA 4TS8A 5CGPA 3SVGA 5EWVA 5E3GA 5F62A 4A9FA 5CPEA 2R0VA 5D3LA 2E7OA 3O34A 4QNSA 2DVRA 3QZTA 4UIWA 4Z1SA 5BT5A 4CUQA 1X0JA 4QB3A 4BHWA 5DX4A 5L8UA 4MR3A 2YDWA 4HBVA 4YK0A 4NRBA 5CUBA 5FH8A 4OGIA 4O71A 4O7EA 5IIDA 4QBMA 5A5SA 2GRCA 4O75A 5D3RA 3MB4A 5L96A 5FDZA 2L85A 5FE1A 4QR4A 5FFWA 5KHMA 5K29A 4YYGA 4UIYA 5EISA 5BT3A 2D9EA 4XY8A 5D7XA 4UIZA 4UYDA 4YYIA 4O78A 4PTBA 5A5RA 2L84A 5DW1A 3JVKA 5IG6A 4QSWA 1F68A 5CQ5A 3HMEA 3P5OA 4XY9A 5FE0A 5CQTA 5A5OA 4UYGA 5E9LA 5CZGA 3G0JA 5G4SA 4CUUA 4RVRA 5HQ6A 4QYLA 5JWMA 4IOQA 4QSPA 5CRMA 4MEPA 3Q2EA 5FG4A 3UV2A 2YEMA 4N4IA 3MXFA 5EQ1A 4UIUA 5CQ3A 4OGJA 5FH6A 3D1BA 4NR4A 5FE2A 4XYAA 4QZSA 2I7KA 4O72A 4QSVA 4XUBA 5FE3A 2NXBA 5D0CA 4Q0OA 3UVDA 4LZ2A 4UYEA 4MR4A 5FH7A 4MEQA 4LC2A 5DLXA 5DLZA 4Z1QA 5I88A 3LQJA 3MQMA 5LKUA 3O33A 4O76A 4YYJA 4QSTA 5FFYA 2DWWA 4WHUA 4A9IA 4UIVA 5DW2A 5I89A 3U5KA 2LSPB 2RNYA 4O70A 4QEWA 4QEVA 3ONIA 5D3PA 1JSPB 5L97A 2E3KA 3ERRA 4QSXA 5LVQA 5CP5A 4MR6A 4O7FA 5D3JA 4J3IA 5E9VA 5CUAA 2R10A 5E9IA 4YBTA 3MULA 5C85A 5HELA 4WHWA 5CQ8A 5HFQA 3SVHA 4CL9A 4A9LA 3TLPA 4AI6A 4LZRA 5KO4A 5L98A 3UV5A 4CLBA 3SVFA 5C89A 5EWHA 3VKGA 5HLSA 1E6IA 5D26A 5FE7A 4YBSA 4QYDA 4IR3A 4TU4A 2RI7A 4Q0NA 4N4GA 5IGNA 5FB1A 4YABA 4AKGA 4HBYA 4Z6HA 4NYWA 4A9HA 5DFCA 5CQ7A 5C4QA 4QC1A 2KTBB 2DKWA 4CFLA 5EWCA 5II2A 4LYIA 5FG6A 5HQ5A 5I7XA 4UYFA 4CFKA 5A5PA 2RFJA 5DKCA 2WP1A 2OO1A 2DVSA 4TZ2A 5BT4A 5EI4A 4LZSA 4YH4A 5E74A 5DYUA 5CTLA 2OUOA 4BW3A 5I86A 3LJWA 4BW4A 4TT4A 5EA1A 2H60A 5CFWA 4O7BA 2F6NA 5LVRA 5HQ7A 4N4FA 5D3SA 5II1A 5A5QA 4NUCA 5F63A 4J0SA 4ALHA 2DVVA 5DFDA 3HMFA 4NR5A 5C7NA 5LKXA 4CUPA 5HRWA 3UV4A 3O37A 4QR5A 5H85A 4HXSA 4LYSA 5FFVA 4QUTA 4QSUA 4HXOA 4A9NA 5IGLA 3VKHA 4HXLA 4DONA 4NXJA 3UW9A 4HBWA 5D25A 5CUCA 4NR7A 4ZW1A 5ENBA 4NRAA 5FE5A 5F36A 1ZS5A 5IGMA 4NQNA 5E7DA 2I8NA 5DFBA 5HM0A 4YBMA 4C67A 5AMEA 3JVJA 3NXBA 5DKHA 5E9MA 5L99A 4X2IA 3HMHA 3AQAA 4YYKA 5DY7A 4YAXA 4YC9A 5AMFA 5EP7A 5EGUA 3G0LA 5C8GA 4CUTA 4A9EA 5C87A 2DATA 5DBMA 2F6JA 5KTWA 4AKIA 4AKNA 3IU5A 5E9KA 2YQDA 2EJNA 2FSAA 4QSQA 5F1LA 5ETBA 5E73A 4TU6A 4J0RA 5TB6A 4KV1A 4YADA 4MR5A 4A9OA 5A83A 4IORA 5EPRA 5A85A 5DYAA 5FE4A 4PS5A 3JVMA 4YY6A 5FBXA 4UIXA 5E9YA 4LDFA 4NUDA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5ENC A;  3UVW A;  5CQ6 A;  4O77 A;  3D7C A;  4WIV A;  5I1Q A;  4YH3 A;  4BJX A;  4UYH A;  4YAT A;  4TT2 A;  4ALG A;  3ZYU A;  4IR6 A;  4KCX A;  4O7A A;  5HEN A;  5CUG A;  5DKD A;  5TCM A;  3LXJ A;  4CUS A;  2R0S A;  4XUA A;  5DYC A;  3U5J A;  4LRG A;  4HXR A;  5CQA A;  5EU1 A;  3K2J A;  5I40 A;  5J0D A;  2RNX A;  5ENJ A;  1WUG A;  3UVX A;  2WP2 A;  5A5N A;  3IU6 A;  4TTE A;  5H1U A;  3MB3 A;  5HRX A;  3O36 A;  3FKM X;  4IR4 A;  2D82 A;  5IGK A;  4LYW A;  4A9M A;  3U5P A;  5LUU A;  4BW2 A;  5I83 A;  5G4R A;  2DVQ A;  5D3N A;  4QY4 A;  4ZC9 A;  5H1V A;  4UYF B;  5EV9 A;  5F25 A;  4NRC A;  3U5O A;  4HXN A;  3UVY A;  4A9J A;  3JVL A;  4FLP A;  3P1D A;  5CUD A;  5L8T A;  5CUE A;  3QZS A;  3O35 A;  4HBX A;  5HCL A;  5KTX A;  4N4H A;  4NQM A;  5A7C A;  3LQI A;  2YEL A;  5F2P A;  4F3I A;  5A81 A;  4HXM A;  2YW5 A;  5F5Z A;  5ENF A;  5LJ1 A;  2YYN A;  4MEN A;  5LKT A;  4YYM A;  4QEU A;  4GPJ A;  3P1F A;  5HEM A;  4A9K A;  5ENI A;  5D3T A;  2RNW A;  4C66 A;  1EQF A;  4Z93 A;  3S92 A;  5EVA A;  3I3J A; 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