5CUDA

Crystal structure of the bromodomain of bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2b (baz2b) in complex with 6-chloropurine (sgc - diamond i04-1 fragment screening)
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of the second bromodomain of bromodomain adjancent to zinc finger domain protein 2B (BAZ2B) in complex with 6-CHLOROPURINE (SGC - Diamond I04-1 fragment screening)
rcsb
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
total genus 39
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5cudA00
5CQ3A 3TLPA 5KTXA 4UIUA 5KTWA 4HXLA 2F6JA 4NXJA 4LC2A 5I86A 3U5NA 5FE1A 5I40A 3QZTA 5E9YA 1JM4B 4QSRA 5CQ7A 4LDFA 4PY6A 3P1CA 5CQ8A 4O75A 4A9IA 5CUEA 5EK9A 4Z6HA 4NR9A 5ENJA 2OUOA 4HXNA 4LZRA 5DYXA 4Z6IA 5CRMA 4IR3A 4QZSA 5A5PA 3AQAA 5DKDA 1WUMA 5J0DA 4QBMA 3ONIA 4XUBA 5A5SA 4YATA 4YYJA 5FG5A 4UIWA 2I8NA 5EPSA 5FE5A 5AMFA 4J0RA 3NXBA 5D24A 5BT5A 4A9MA 4OGJA 4HXPA 3U5KA 4AKNA 4J1PA 4QR3A 4CUPA 5IGNA 4PCIA 5EGUA 2YYNA 5FFYA 5K29A 3HMFA 4UITA 5BT3A 3QZSA 4UYDA 5HLSA 5EU1A 5E9IA 5EA1A 4CFLA 3MUKA 5I83A 3G0LA 4YYGA 2YEMA 4YYMA 5LVQA 4O72A 3JVKA 3LQJA 4HBWA 2WP1A 4N3WA 3IU5A 4MEPA 4A9HA 5E9KA 4YYKA 5DFDA 5D3HA 5AD3A 4ZQLA 2RNXA 2E3KA 5L98A 4XYAA 3UV4A 3P1EA 4N4FA 5HEMA 4QC1A 2FSAA 4TYLA 1JSPB 4A9NA 3SVHA 5HCLA 4LR6A 5KO4A 5EWDA 4O74A 4UIYA 2RO1A 4O76A 5TB6A 4QSSA 5CRZA 4YBTA 4IORA 3UW9A 1N72A 2DWWA 4QSUA 5L8TA 4NQMA 3IU6A 4HXRA 2YQDA 5L8UA 5LKZA 3LQIA 5LKXA 5C7NA 5A5OA 2RS9B 5FH6A 4NR8A 4E96A 5A7CA 4N4HA 5D3NA 5F3AA 5CQ4A 5F36A 4UYFA 4CURA 4F3IA 4UYGA 4FLPA 4NRCA 3HMEA 5EISA 4QSVA 5CS8A 5L96A 5EWWA 4YYIA 5DX4A 3MQMA 4C66A 5HQ7A 3JVJA 4HXMA 4N4IA 4UYEA 5DW2A 4QB3A 2YDWA 3U5PA 2WP2A 5ENCA 5IGMA 3JVMA 5F62A 2L84A 5I88A 4YH4A 5II2A 1E6IA 4QEVA 5DW1A 5L99A 4MR4A 4WHUA 5ACYA 5DLXA 4TU6A 5LKTA 4QR4A 4TQNA 4YK0A 4MENA 5DKHA 4IOOA 1ZS5A 4QYLA 5F1HA 4QR5A 5BT4A 4RVRA 5F63A 5E9MA 4KV4A 4A9KA 5HENA 4X2IA 3AADA 4NR7A 4NYVA 4Q0OA 4O71A 4O7AA 4YY6A 4Y03A 2YELA 5DBMA 4NRBA 5CUAA 5C87A 5CQTA 4XUAA 5A83A 2D82A 4NUCA 4BHWA 4NRAA 4A9LA 3S91A 5DFBA 4HXOA 4CUSA 4PKLA 3P5OA 4KV1A 4NR5A 5LVRA 1WUGA 5IG6A 5CQ5A 4Z1QA 4NQNA 3MB4A 4UYHA 4IR6A 5DY7A 4A9OA 5HFRA 4ZW1A 5FE9A 4QSQA 2L5EA 5CZGA 2F6NA 4CLBA 4UIZA 3UVWA 3RCWA 2RNYA 5EQ1A 5CTLA 5FE7A 4UIVA 3K2JA 2DVRA 5FG4A 5FB0A 3MXFA 3O37A 5D3RA 5COIA 5A5QA 4MEQA 5LJ0A 4A9EA 4CUQA 5LJ2A 2DVVA 3QZVA 5DYAA 5E7DA 3U5MA 4YH3A 4YBSA 5D7XA 5CUCA 5A82A 2D9EA 5CP5A 2N9GA 5A85A 5DKCA 5F60A 3DWYA 3UVYA 3Q2EA 5E3DA 5EP7A 5TCMA 5EI4A 3O34A 4UYFB 5D3SA 3ZYUA 5ETBA 4HBYA 4A9FA 2NXBA 5LJ1A 4LYIA 2RNWA 5EWVA 5G4RA 2I7KA 5HJCA 4LYWA 4LRGA 5FDZA 4GPJA 5ENIA 5L97A 5EM3A 5I7XA 5EICA 4CFKA 4TZ2A 4WHWA 2OO1A 4CUTA 4O78A 5HFQA 5LKUA 4YBMA 4NR6A 4TT2A 4NYWA 5HELA 4NR4A 4TT4A 5HRXA 3UVDA 5DLZA 5CQAA 2LSPB 4QY4A 5HQ5A 2DVQA 3UVXA 5H1TA 3I3JA 2R0VA 4XY8A 4HBVA 4MR3A 5A5RA 3D7CA 5CQ6A 2DKWA 5A81A 4TU4A 2G4AA 4HXSA 5FE8A 4N4GA 4Z1SA 3LXJA 4QEUA 4TS8A 3DAIA 1X0JA 4PS5A 5HM0A 1EQFA 4QUTA 5CUBA 3O33A 5EWCA 4IR5A 5FH8A 4YY4A 3Q2FA 4OGIA 3HMHA 5KTUA 2YW5A 5E9VA 5CGPA 4A9JA 4LYSA 4MR5A 2R10A 3MB3A 4Q0NA 4QSPA 5F61A 5FH7A 4NUEA 3FKMX 2DVSA 4YYHA 4YYNA 5D3LA 4BW1A 4J0SA 5D25A 5E74A 3U5LA 4J3IA 2RFJA 4QEWA 2OSSA 4TT6A 2YEKA 4TZ8A 4BJXA 5LUUA 5ENBA 2R0SA 3O36A 5FB1A 5F5ZA 5DYUA 5I29A 4WIVA 5CPEA 5D3PA 5F1LA 4YYDA 5H1UA 4QYDA 5FE6A 4BW2A 5HQ6A 4IR4A 4IOQA 2DATA 1F68A 4QSXA 5F25A 5ENFA 2KTBB 4C67A 5IGKA 4DONA 5ENEA 5KHMA 5DFCA 2MJVB 4XY9A 5E0RA 2GRCA 2R0YA 3SVGA 4BW4A 5CUDA 5FE4A 5H85A 2L85A 5I89A 4O77A 4YAXA 5EVAA 5FBXA 5FFVA 5FG6A 4TTEA 3P1FA 4YADA 5C4QA 4ALGA 5I7YA 5FE3A 4PCEA 3U5JA 3UV2A 5FE2A 5HRVA 5CUGA 5EV9A 5C85A 4YABA 5CU8A 2E7OA 5D26A 5E73A 5JWMA 5DYCA 5IBNA 3UV5A 2H60A 5A5NA 5ETDA 4ZC9A 4QSWA 3U5OA 5D3JA 5IIDA 5D3TA 4O7CA 4LZSA 4QC3A 5II1A 4BW3A 4UIXA 4Z93A 5H1VA 4NYXA 5G4SA 5CY9A 4OUFA 5EWHA 5D0CA 4QSTA 4QUUA 4NS5A 4CL9A 5AMEA 4PTBA 4O7FA 3GG3A 4QNSA 2RI7A 3P1DA 4HBXA 5ENHA 4LZ2A 5EPRA 5EPBA 4CUUA 3O35A 5C8GA 3LQHA 4KCXA 3LJWA 5IGLA 4O7EA 5E9LA 3JVLA 5E3GA 4YC9A 5KU3A 3MULA 5FFWA 5AD2A 4O7BA 4ALHA 5C89A 4HXKA 2E7NA 4MEOA 5CFWA 4O70A 5I1QA 4NUDA 5JI8A 5FE0A 5HRWA 5F2PA 3S92A 5ENGA 5I80A 3G0JA 4MR6A 3SVFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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