5CUGA

Crystal structure of the bromodomain of bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2b (baz2b) in complex with 4-acetamidobenzoic acid (sgc - diamond i04-1 fragment screening)
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
b'SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK'
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal structure of the second bromodomain of bromodomain adjancent to zinc finger domain protein 2B (BAZ2B) in complex with 4-Acetamidobenzoic acid (SGC - Diamond I04-1 fragment screening)
rcsb
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 39
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5cugA00
2R0VA 4NR5A 4TU6A 5E9IA 4ZC9A 5I88A 5FE0A 5JWMA 4Y03A 5EK9A 4QSXA 4BJXA 5IGNA 5CQ3A 3U5LA 3UV2A 5C4QA 4NR4A 4BW2A 4MR4A 5IIDA 2DVVA 5DKCA 4Z1QA 4QSUA 4HXRA 5EWVA 4KV1A 5I80A 5ENFA 4DONA 1WUGA 5F1HA 3TLPA 5L96A 3QZVA 1N72A 4UITA 5D3PA 4QZSA 5F61A 4LDFA 5FBXA 5L99A 5IBNA 4PCEA 5ENIA 5F2PA 4NUDA 5CFWA 5KTXA 5LJ1A 4MEPA 2E7NA 5F25A 5ENBA 3AQAA 3DWYA 4XY8A 4N4GA 1ZS5A 4NYWA 4TT2A 3G0JA 5D3JA 4A9FA 5ENHA 5E0RA 4FLPA 3MB4A 4N3WA 5DY7A 4A9IA 4YYJA 5BT3A 4QC1A 5DLXA 5HFRA 2RS9B 5EPSA 5ETBA 5CU8A 3UVXA 4NQNA 3LJWA 4YY6A 2YELA 5E7DA 3UV5A 5CTLA 4TS8A 5CRMA 4UYFA 4TZ2A 5EPRA 3LQJA 4NYVA 5D3TA 4TTEA 4CUTA 4O7BA 3HMHA 4O72A 2L84A 4HBVA 4QB3A 4LC2A 4CUQA 4HXNA 2L85A 3O34A 4QUTA 5HEMA 5A82A 2F6NA 4UIXA 3Q2EA 4HXSA 5II2A 4RVRA 4CLBA 4O74A 5AMFA 5DX4A 5I7YA 5D0CA 5CQTA 3I3JA 4NR7A 4QNSA 4QSWA 4CURA 5AMEA 4E96A 3LQIA 5A7CA 4O77A 4QEUA 5I83A 3D7CA 2RO1A 1E6IA 4NS5A 5CS8A 3P5OA 5F60A 5A81A 5DFBA 2GRCA 3K2JA 4J3IA 4UIZA 5EV9A 4ALGA 4CUSA 5ENEA 3O33A 3ZYUA 2WP2A 5TB6A 3P1DA 5EA1A 5IGLA 3SVFA 4YYHA 3P1FA 4YC9A 5LKTA 2G4AA 3DAIA 5HFQA 4UIWA 4NRCA 4BW3A 4PTBA 4YYIA 3U5MA 5E73A 5EVAA 4YYKA 4IR5A 5FE8A 4UYHA 5I89A 5HRWA 4LYSA 3SVGA 5CQ7A 3U5KA 4CUUA 2D82A 5L97A 2OO1A 5ENGA 2YEMA 4YBMA 5KO4A 4A9OA 3G0LA 5E9KA 2YYNA 4UIUA 5KTUA 4WIVA 3RCWA 5FE7A 5H1VA 2RI7A 2LSPB 5L8TA 2RNXA 4TZ8A 4N4IA 4MR5A 4YK0A 3O37A 4QEVA 5DW1A 4HXOA 2R0SA 5FDZA 4YYNA 4BHWA 2E7OA 1F68A 5CQ8A 4O7FA 4YH4A 4J0RA 5E9VA 5FB1A 2YW5A 5CRZA 4O76A 4TT4A 5H1TA 2I7KA 4UYEA 5D26A 3MXFA 5DFDA 5ETDA 4LZRA 4X2IA 4CUPA 5FFYA 4MR6A 2R0YA 1WUMA 4QYLA 4WHWA 5FG6A 4NUEA 3IU5A 5BT5A 4BW1A 5A85A 4NRAA 5DFCA 5FE6A 4LZ2A 5EICA 3QZSA 5HRVA 4O7CA 3UV4A 5D3HA 3U5JA 5LKUA 4Q0NA 4PKLA 5HENA 5FH6A 4HXKA 2YEKA 4TU4A 5F63A 2YQDA 5FB0A 2DATA 4QSRA 5HELA 4QSSA 4IOQA 3QZTA 5I86A 2MJVB 4O75A 4CL9A 4PY6A 5LKXA 5D24A 4UIYA 5EQ1A 5COIA 5CUDA 5CUGA 4IR3A 2R10A 4QR5A 4QR3A 4N4HA 4A9EA 5AD2A 5EI4A 4YABA 2DVSA 1X0JA 5ENCA 5CY9A 5KTWA 2YDWA 3JVLA 4HBYA 5IG6A 5A5QA 5KU3A 2KTBB 4PCIA 5EPBA 5D3RA 4O70A 5A5RA 4HBWA 3LQHA 3UVWA 5HLSA 5G4RA 5EWWA 5CUCA 4NYXA 5HQ6A 5A5NA 3FKMX 5DYXA 3UVYA 5JI8A 4UYGA 5CQ6A 5ENJA 4YY4A 3MQMA 3O36A 4NUCA 5DKHA 4O78A 5F1LA 3SVHA 3U5OA 5LKZA 2DVRA 2DVQA 4XY9A 5A83A 4F3IA 5ACYA 5IGKA 4AKNA 4UIVA 5FFVA 4LYIA 4XYAA 3JVKA 1JM4B 4WHUA 5E3DA 5HRXA 5FE9A 3MB3A 5FE3A 3O35A 4YBSA 4HBXA 5DLZA 3ONIA 4QSPA 4A9NA 5CGPA 4YYDA 5I1QA 2H60A 4NR9A 5K29A 5DW2A 5H1UA 3NXBA 4YH3A 5D3LA 5FH7A 4NRBA 4YATA 4OGIA 5DYAA 4CFLA 5BT4A 5HJCA 4GPJA 4ZW1A 4HXMA 2D9EA 4YAXA 2RNYA 2DKWA 5L8UA 4TQNA 5LJ2A 3LXJA 5G4SA 5LJ0A 5EWHA 4CFKA 4IR4A 4C66A 5D25A 3JVMA 4NQMA 5KHMA 5I29A 5EISA 4NXJA 4Q0OA 2RNWA 3HMFA 5FE5A 5FH8A 5C8GA 4LZSA 4IOOA 4A9JA 5E3GA 4QSQA 2E3KA 4TT6A 4YBTA 3U5NA 5EP7A 5HM0A 4MEQA 4QR4A 2I8NA 1EQFA 2F6JA 5EWCA 3S92A 5F5ZA 4O7AA 5J0DA 4NR6A 4XUBA 4UYDA 4O7EA 2N9GA 5CQ4A 4A9HA 5LVRA 3MUKA 3P1CA 5CUEA 3JVJA 4N4FA 5LUUA 4ZQLA 4QYDA 5EWDA 4QC3A 5C89A 5H85A 3U5PA 1JSPB 2L5EA 4MEOA 5FE1A 5CPEA 5E9YA 4MR3A 3UVDA 5II1A 4XUAA 3UW9A 5F3AA 3AADA 3S91A 4YYGA 5A5PA 5D3SA 4C67A 4J0SA 3GG3A 5FE4A 4MENA 4KCXA 5D3NA 2RFJA 4A9MA 5EM3A 4HXLA 5HQ7A 2DWWA 4A9KA 5AD3A 5F62A 4IR6A 4NR8A 4TYLA 5IGMA 3P1EA 5DKDA 4LYWA 5E9MA 3Q2FA 4ALHA 4Z6IA 5FFWA 2FSAA 5A5OA 5C7NA 5HCLA 2WP1A 4J1PA 5CZGA 4Z6HA 4QY4A 4QEWA 5FG5A 5DYUA 4O71A 4UYFB 4QBMA 4YADA 5EGUA 5C87A 5L98A 3HMEA 5I7XA 5F36A 5FE2A 5C85A 5HQ5A 5DBMA 5CQAA 4LRGA 5EU1A 5I40A 2OUOA 4Z93A 5E74A 5E9LA 4PS5A 3MULA 5CUBA 5D7XA 5CP5A 5CUAA 4QUUA 2NXBA 4IORA 4QSTA 3IU6A 4A9LA 5LVQA 4OGJA 5FG4A 5TCMA 4HXPA 5DYCA 4LR6A 4BW4A 5CQ5A 4YYMA 4QSVA 4Z1SA 5A5SA 4OUFA 4KV4A 2OSSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2R0VA 4NR5A 4TU6A 5E9IA 4ZC9A 5I88A 5FE0A 5JWMA 4Y03A 5EK9A 4QSXA 4BJXA 5IGNA 5CQ3A 3U5LA 3UV2A 5C4QA 4NR4A 4BW2A 4MR4A 5IIDA 2DVVA 5DKCA 4Z1QA 4QSUA 4HXRA 5EWVA 4KV1A 5I80A 5ENFA 4DONA 1WUGA 5F1HA 3TLPA 5L96A 3QZVA 4AKHA 1N72A 4UITA 5D3PA 4QZSA 5F61A 4LDFA 5FBXA 5L99A 5IBNA 4PCEA 5ENIA 5F2PA 4NUDA 5CFWA 5KTXA 5LJ1A 4MEPA 2E7NA 5F25A 5ENBA 3AQAA 3DWYA 4XY8A 4N4GA 1ZS5A 4NYWA 4TT2A 3G0JA 5D3JA 4A9FA 5ENHA 5E0RA 4FLPA 3MB4A 4N3WA 5DY7A 4A9IA 4YYJA 5BT3A 4QC1A 5DLXA 5HFRA 2RS9B 5EPSA 5ETBA 5CU8A 3UVXA 4NQNA 3LJWA 4YY6A 2YELA 5E7DA 3UV5A 5CTLA 4TS8A 5CRMA 4UYFA 4TZ2A 5EPRA 3LQJA 4NYVA 5D3TA 4TTEA 4CUTA 4O7BA 3HMHA 4O72A 2L84A 4HBVA 4QB3A 4LC2A 4CUQA 4HXNA 2L85A 3O34A 4QUTA 5HEMA 5A82A 2F6NA 4UIXA 3Q2EA 4HXSA 5II2A 4RVRA 4CLBA 4O74A 5AMFA 5DX4A 5I7YA 5D0CA 5CQTA 3I3JA 4NR7A 4QNSA 4QSWA 4CURA 5AMEA 4E96A 3LQIA 5A7CA 3VKGA 4O77A 4QEUA 5I83A 3D7CA 2RO1A 1E6IA 4NS5A 5CS8A 3P5OA 5F60A 5A81A 5DFBA 2GRCA 3K2JA 4J3IA 4UIZA 5EV9A 4ALGA 4CUSA 5ENEA 3O33A 3ZYUA 2WP2A 5TB6A 3P1DA 5EA1A 5IGLA 3SVFA 4YYHA 3P1FA 3D1DA 4YC9A 5LKTA 2G4AA 3DAIA 5HFQA 4UIWA 4NRCA 4BW3A 4PTBA 4YYIA 3U5MA 1ZKRA 5E73A 5EVAA 4YYKA 4IR5A 5FE8A 4UYHA 5I89A 5HRWA 4LYSA 3SVGA 5CQ7A 4AKIA 3U5KA 4CUUA 2D82A 5L97A 2OO1A 5ENGA 2YEMA 4YBMA 5KO4A 4A9OA 3G0LA 5E9KA 2YYNA 4UIUA 5KTUA 4WIVA 3RCWA 5FE7A 5H1VA 2RI7A 2LSPB 5L8TA 2RNXA 4TZ8A 4N4IA 4MR5A 4YK0A 3O37A 4QEVA 5DW1A 4HXOA 2R0SA 5FDZA 4YYNA 4BHWA 2E7OA 1F68A 5CQ8A 4O7FA 4YH4A 4J0RA 5E9VA 5FB1A 2YW5A 5CRZA 4O76A 4TT4A 5H1TA 2I7KA 4UYEA 5D26A 3MXFA 5DFDA 5ETDA 4LZRA 4X2IA 4CUPA 5FFYA 4MR6A 2R0YA 1WUMA 4QYLA 4WHWA 5FG6A 4NUEA 3IU5A 5BT5A 4BW1A 5A85A 4NRAA 5DFCA 5FE6A 4LZ2A 5EICA 3QZSA 5HRVA 4O7CA 3UV4A 5D3HA 3U5JA 5LKUA 4Q0NA 4PKLA 5HENA 5FH6A 4HXKA 2YEKA 4TU4A 5F63A 2YQDA 5FB0A 2DATA 4QSRA 5HELA 4QSSA 4IOQA 3QZTA 5I86A 2MJVB 4O75A 4CL9A 4PY6A 5LKXA 5D24A 4UIYA 5EQ1A 5COIA 5CUDA 5CUGA 4IR3A 2R10A 3ERRA 4QR3A 4QR5A 4N4HA 4A9EA 5AD2A 5EI4A 4YABA 2DVSA 1X0JA 5ENCA 5CY9A 5KTWA 2YDWA 3JVLA 4HBYA 5IG6A 5A5QA 5KU3A 2KTBB 1PUOA 4PCIA 5EPBA 5D3RA 4O70A 5A5RA 4HBWA 3LQHA 3UVWA 5HLSA 5G4RA 5EWWA 5CUCA 4NYXA 5HQ6A 5A5NA 3FKMX 5DYXA 3UVYA 5JI8A 4UYGA 5CQ6A 5ENJA 4YY4A 3MQMA 3O36A 4NUCA 5DKHA 4O78A 5F1LA 3SVHA 3U5OA 5LKZA 2DVRA 2DVQA 4XY9A 5A83A 4F3IA 5ACYA 5IGKA 4AKNA 4UIVA 5FFVA 4LYIA 4XYAA 3JVKA 1JM4B 4WHUA 5E3DA 5HRXA 5FE9A 3MB3A 5FE3A 3O35A 4YBSA 4HBXA 5DLZA 3ONIA 4QSPA 4A9NA 5CGPA 4YYDA 5I1QA 4AKGA 2H60A 4NR9A 5K29A 5DW2A 5H1UA 3NXBA 4YH3A 5D3LA 5FH7A 4NRBA 4YATA 4OGIA 5DYAA 4CFLA 5BT4A 5HJCA 4GPJA 4ZW1A 4HXMA 2D9EA 4YAXA 2RNYA 2DKWA 5L8UA 4TQNA 5LJ2A 3LXJA 5G4SA 5LJ0A 5EWHA 4CFKA 4IR4A 4C66A 5D25A 3JVMA 4NQMA 5KHMA 5I29A 5EISA 4NXJA 4Q0OA 2RNWA 3HMFA 5FE5A 5FH8A 5C8GA 4LZSA 4IOOA 4A9JA 5E3GA 4QSQA 2E3KA 4TT6A 4YBTA 3U5NA 5EP7A 5HM0A 4MEQA 4QR4A 2I8NA 1EQFA 2F6JA 3D1BA 5EWCA 3S92A 5F5ZA 4O7AA 5J0DA 4NR6A 4XUBA 4UYDA 4O7EA 2N9GA 5CQ4A 4A9HA 5LVRA 3MUKA 3P1CA 5CUEA 3JVJA 4N4FA 5LUUA 4ZQLA 4QYDA 5EWDA 4QC3A 5C89A 5H85A 3U5PA 1JSPB 3VKHA 2L5EA 4MEOA 5FE1A 5CPEA 5E9YA 4MR3A 3UVDA 5II1A 4XUAA 3UW9A 5F3AA 3AADA 3S91A 4YYGA 5A5PA 5D3SA 4C67A 4J0SA 3GG3A 5FE4A 4MENA 4KCXA 5D3NA 2RFJA 4A9MA 5EM3A 4HXLA 5HQ7A 2DWWA 4A9KA 5AD3A 5F62A 4IR6A 4NR8A 4TYLA 5IGMA 3P1EA 5DKDA 4LYWA 5E9MA 3Q2FA 4ALHA 4Z6IA 5FFWA 2FSAA 5A5OA 5C7NA 5HCLA 2WP1A 4J1PA 5CZGA 4Z6HA 4QY4A 4QEWA 5FG5A 5DYUA 4O71A 4UYFB 4QBMA 4YADA 5EGUA 5C87A 5L98A 3HMEA 5I7XA 5F36A 5FE2A 5C85A 5HQ5A 5DBMA 5CQAA 4LRGA 5EU1A 5I40A 2OUOA 4Z93A 5E74A 5E9LA 4PS5A 3MULA 5CUBA 5D7XA 5CP5A 5CUAA 4QUUA 2NXBA 4IORA 4QSTA 3IU6A 4A9LA 5LVQA 4OGJA 5FG4A 5TCMA 4HXPA 5DYCA 4LR6A 4BW4A 5CQ5A 2EJNA 4AI6A 4YYMA 4QSVA 4Z1SA 5A5SA 4OUFA 4KV4A 2OSSA
chains in the Genus database with same CATH topology
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