5CUGA

Crystal structure of the bromodomain of bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2b (baz2b) in complex with 4-acetamidobenzoic acid (sgc - diamond i04-1 fragment screening)
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Crystal structure of the second bromodomain of bromodomain adjancent to zinc finger domain protein 2B (BAZ2B) in complex with 4-Acetamidobenzoic acid (SGC - Diamond I04-1 fragment screening)
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5cugA00
4QSXA 4PTBA 5L98A 5II2A 4Z6IA 5I7XA 4NUDA 3ONIA 4QB3A 4IR3A 5F25A 5D3TA 5FFVA 5KTUA 5A82A 5E73A 1N72A 4YY4A 3MB3A 5EGUA 5F63A 2NXBA 4UIXA 5FH6A 3HMFA 5HFRA 3O36A 5ENJA 5D26A 2OSSA 4UIZA 5CY9A 2F6JA 4MEQA 3O34A 3TLPA 4YYDA 5HEMA 5FE6A 4XYAA 4A9HA 5KU3A 4FLPA 4TU6A 2OO1A 4O78A 4TYLA 4HXPA 5FH8A 4O72A 3I3JA 4XY9A 5DFCA 4LYWA 5HM0A 4NR9A 4YYKA 4O74A 5CP5A 5EM3A 5DYAA 4BW2A 2DVSA 5AD3A 2YYNA 4KV4A 2KTBB 5E74A 5E9IA 4Z6HA 3U5KA 5HRWA 2DVRA 5G4RA 4OUFA 5D3PA 4UIUA 5KHMA 2I8NA 4A9NA 2YQDA 3QZVA 3K2JA 3U5MA 5HELA 3UW9A 3U5JA 2D82A 5EV9A 2RI7A 5CFWA 1ZS5A 2DATA 5I29A 4QNSA 4UIYA 4A9KA 4J3IA 5C7NA 4HXLA 3U5LA 5JWMA 3IU5A 4WHUA 5BT5A 4NQNA 5E9VA 4YK0A 4NXJA 5D7XA 5H1TA 5D3JA 5D3SA 4YY6A 4UYEA 3O33A 3S92A 2E7OA 2R0SA 4NR4A 3P1EA 5D0CA 4CFLA 3JVMA 4NR6A 4LZ2A 5ENGA 4J0RA 4ZQLA 4QC3A 3O37A 5CQ7A 4HBWA 5HRVA 4MR4A 4QBMA 5FH7A 4QEWA 5BT4A 5ENBA 5ENCA 5ETDA 4OGJA 5LKZA 1E6IA 5K29A 5EPBA 3LXJA 4YBSA 5LKUA 4MR5A 4NUCA 5H85A 4BW4A 5EISA 3JVJA 5E9LA 4LZSA 5HQ6A 5DW2A 4Q0NA 4XUBA 3LQJA 4TS8A 2YDWA 5CU8A 2R0VA 2YELA 4QSTA 3AADA 4QSVA 5FE8A 3JVKA 5II1A 4IR6A 4CUQA 4QR3A 5LKTA 4BHWA 5D25A 5HJCA 2OUOA 4ZC9A 4ZW1A 4O7FA 2FSAA 2DKWA 3LQHA 4HBVA 4YBTA 4IR4A 4N4IA 3D7CA 5TCMA 5EWWA 5F62A 4NR7A 4O77A 2R10A 3MQMA 1EQFA 4MEPA 2E7NA 5IGLA 4BW3A 5I7YA 5AMFA 5E9YA 5FB1A 5I83A 5FE9A 4CURA 1JSPB 4QR4A 4O7CA 3MULA 4HXKA 5FG6A 2D9EA 4YH3A 5E3GA 3O35A 3UV2A 4UIVA 4QY4A 5CGPA 4C67A 4UYFB 5EQ1A 5DY7A 5CUAA 1WUMA 3MUKA 5E9KA 5HQ7A 3LJWA 4UITA 4YYHA 4N4HA 4Z93A 5DYCA 5F3AA 5EP7A 5C87A 2WP1A 4LZRA 4UYFA 5CUGA 5F1LA 5CUCA 5D24A 4YH4A 4LYSA 5DLZA 5EWHA 4E96A 4CUPA 5A5PA 4IR5A 2RFJA 4HXOA 2N9GA 4C66A 3SVGA 3QZSA 3UV4A 5CQ5A 5CQ3A 4YYNA 4PKLA 2F6NA 2DVVA 5F5ZA 4MEOA 3QZTA 4Q0OA 3UVXA 4J1PA 4NYXA 3JVLA 3MB4A 4QC1A 1X0JA 5E9MA 4O75A 5A5OA 4CFKA 4KV1A 5EA1A 5I88A 5DKHA 4YYJA 5EI4A 5IGMA 4CUSA 5EWDA 4TZ2A 3UV5A 5DW1A 5IGKA 4NRBA 3LQIA 5A5RA 2GRCA 2RS9B 5HFQA 4PS5A 4A9OA 5DYXA 1F68A 5EWVA 4WIVA 5L97A 2RNWA 2DVQA 4UIWA 4QUTA 4TT2A 4UYGA 3MXFA 3ZYUA 5DKDA 4NQMA 4IOQA 4IORA 3UVDA 4O71A 4MR3A 5A85A 2RNXA 3Q2EA 1WUGA 5CPEA 5FE1A 5FBXA 4Z1SA 5HENA 5G4SA 4A9JA 5CTLA 5I80A 5E3DA 4TT6A 5D3HA 5COIA 2L5EA 5D3RA 5JI8A 3AQAA 2YW5A 5HRXA 4X2IA 5DYUA 4O70A 4TTEA 2WP2A 2H60A 5ENHA 3HMEA 5F1HA 5ACYA 5FE5A 5CQ8A 5EVAA 3FKMX 5EWCA 5EPRA 3U5NA 4XUAA 5DBMA 4BW1A 5FE4A 5F61A 4DONA 4CLBA 5E7DA 4QYDA 3P1FA 5ENFA 4MR6A 5D3NA 4YBMA 4ALGA 3RCWA 4Y03A 4UYDA 4NYWA 5CUDA 4NS5A 5IG6A 3G0LA 5HLSA 4TU4A 4J0SA 5E0RA 5H1VA 5CS8A 3DWYA 4LR6A 5CUEA 4ALHA 4TZ8A 3UVYA 4QEVA 4HXNA 5FE2A 4A9MA 5FG4A 4LRGA 5I89A 4MENA 5HCLA 4NR5A 5DFBA 4BJXA 4YABA 3SVFA 4O7AA 4PY6A 4WHWA 5CQAA 5EU1A 5AMEA 3UVWA 5BT3A 4XY8A 2RNYA 3IU6A 3Q2FA 4QSRA 5TB6A 4UYHA 5F36A 5I40A 5IBNA 4O7EA 2YEMA 4QSSA 4LYIA 5A83A 5KTWA 4HBYA 5IIDA 4NRAA 5FE0A 2I7KA 4KCXA 4YYIA 2L84A 4TT4A 5FB0A 5A5SA 5FFYA 4O76A 4RVRA 4N4FA 3DAIA 5EPSA 3NXBA 5LJ0A 4QR5A 4LDFA 4HXMA 5DKCA 2L85A 5KO4A 4N3WA 5EK9A 5L99A 5FDZA 2DWWA 4GPJA 4OGIA 3GG3A 5LJ1A 5J0DA 4PCEA 4A9IA 5LKXA 2MJVB 4YAXA 4A9EA 2RO1A 4QEUA 4CL9A 4YYMA 5DX4A 4YC9A 4O7BA 3S91A 5EICA 4NUEA 5FFWA 4QSUA 5F2PA 4YADA 5A7CA 4QSPA 3P5OA 5LVRA 5I1QA 5IGNA 5F60A 4NRCA 4QSWA 4N4GA 4YYGA 5HQ5A 4HXSA 4YATA 5CQ6A 5DLXA 5C85A 4QSQA 4QUUA 4TQNA 4CUUA 5LUUA 5CUBA 4HBXA 5L96A 5C4QA 5ENIA 5LJ2A 4NR8A 4A9FA 5KTXA 4F3IA 5CZGA 5D3LA 5A81A 4AKNA 3P1CA 4LC2A 3U5OA 5LVQA 5I86A 2LSPB 5A5NA 5CQ4A 5L8UA 3P1DA 2R0YA 4NYVA 5CRMA 3SVHA 5C8GA 5CQTA 5CRZA 5C89A 2YEKA 3HMHA 4A9LA 2G4AA 4CUTA 5FG5A 4Z1QA 5H1UA 5ETBA 2E3KA 5L8TA 5FE3A 4QYLA 5ENEA 4HXRA 5DFDA 1JM4B 5A5QA 5FE7A 3U5PA 4IOOA 4QZSA 5AD2A 4PCIA 3G0JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QSXA 4PTBA 5L98A 5II2A 4Z6IA 5I7XA 4NUDA 3ONIA 4QB3A 4IR3A 5F25A 5D3TA 5FFVA 5KTUA 5A82A 5E73A 1N72A 4YY4A 3MB3A 5EGUA 5F63A 2NXBA 4UIXA 5FH6A 3HMFA 5HFRA 3O36A 5ENJA 5D26A 2OSSA 4UIZA 5CY9A 2F6JA 4MEQA 3O34A 3TLPA 4YYDA 5HEMA 5FE6A 4XYAA 4A9HA 5KU3A 4FLPA 4TU6A 2OO1A 4O78A 4TYLA 4HXPA 5FH8A 4O72A 3I3JA 4XY9A 5DFCA 4LYWA 5HM0A 4NR9A 4YYKA 4O74A 5CP5A 5EM3A 5DYAA 4BW2A 2DVSA 5AD3A 2YYNA 4KV4A 2KTBB 5E74A 5E9IA 4Z6HA 3U5KA 5HRWA 2DVRA 5G4RA 4OUFA 5D3PA 4UIUA 5KHMA 2I8NA 4A9NA 2YQDA 3QZVA 3K2JA 1ZKRA 3U5MA 5HELA 3UW9A 3U5JA 2D82A 5EV9A 2RI7A 5CFWA 1ZS5A 2DATA 5I29A 4QNSA 4UIYA 4A9KA 4J3IA 5C7NA 4HXLA 3U5LA 5JWMA 3IU5A 4WHUA 5BT5A 4NQNA 5E9VA 4YK0A 4NXJA 5D7XA 5H1TA 5D3JA 5D3SA 4YY6A 4UYEA 3O33A 3S92A 2E7OA 2R0SA 4NR4A 3P1EA 5D0CA 4CFLA 3JVMA 4NR6A 4LZ2A 5ENGA 4J0RA 4ZQLA 4QC3A 3O37A 5CQ7A 4HBWA 5HRVA 4MR4A 4QBMA 5FH7A 4QEWA 5BT4A 5ENBA 5ENCA 5ETDA 4OGJA 5LKZA 1E6IA 5K29A 5EPBA 3LXJA 4YBSA 5LKUA 4MR5A 4NUCA 5H85A 4BW4A 5EISA 3JVJA 5E9LA 4LZSA 5HQ6A 5DW2A 4Q0NA 4XUBA 3LQJA 4TS8A 2YDWA 5CU8A 2R0VA 2YELA 4QSTA 3AADA 4QSVA 5FE8A 3JVKA 5II1A 4IR6A 4CUQA 4QR3A 5LKTA 4BHWA 5D25A 5HJCA 2OUOA 4ZC9A 4ZW1A 4O7FA 2FSAA 2DKWA 3LQHA 4HBVA 4YBTA 4IR4A 4N4IA 3D7CA 5TCMA 5EWWA 5F62A 4NR7A 4O77A 2R10A 3MQMA 1EQFA 4MEPA 2E7NA 5IGLA 4BW3A 5I7YA 5AMFA 5E9YA 3ERRA 5FB1A 5I83A 5FE9A 4CURA 1JSPB 4QR4A 4O7CA 3MULA 4HXKA 5FG6A 2D9EA 4YH3A 5E3GA 3O35A 3UV2A 4UIVA 4QY4A 5CGPA 4C67A 4UYFB 5EQ1A 5DY7A 5CUAA 1WUMA 3MUKA 5E9KA 5HQ7A 3LJWA 4UITA 4YYHA 4N4HA 4Z93A 5DYCA 5F3AA 5EP7A 5C87A 2WP1A 4LZRA 4UYFA 5CUGA 5F1LA 5CUCA 5D24A 4YH4A 4LYSA 5DLZA 5EWHA 4E96A 4CUPA 5A5PA 3VKHA 4IR5A 2RFJA 4HXOA 4AKHA 2N9GA 4C66A 3SVGA 3QZSA 3UV4A 5CQ5A 5CQ3A 4YYNA 4PKLA 2F6NA 2DVVA 5F5ZA 4MEOA 3QZTA 4Q0OA 3UVXA 4J1PA 4NYXA 3JVLA 3MB4A 4QC1A 1X0JA 5E9MA 4O75A 5A5OA 4CFKA 4KV1A 5EA1A 5I88A 3D1BA 5DKHA 4YYJA 5EI4A 5IGMA 4CUSA 5EWDA 4TZ2A 3UV5A 5DW1A 5IGKA 4NRBA 3LQIA 5A5RA 2GRCA 2RS9B 5HFQA 4PS5A 4AKGA 4A9OA 5DYXA 1F68A 5EWVA 4WIVA 5L97A 2RNWA 2DVQA 4UIWA 4QUTA 4TT2A 4UYGA 3MXFA 3ZYUA 5DKDA 4NQMA 4IOQA 4IORA 3UVDA 4O71A 4MR3A 5A85A 2RNXA 3Q2EA 1WUGA 5CPEA 5FE1A 5FBXA 4Z1SA 5HENA 5G4SA 4A9JA 5CTLA 5I80A 5E3DA 4TT6A 5D3HA 5COIA 2L5EA 5D3RA 3D1DA 5JI8A 3AQAA 2YW5A 5HRXA 4X2IA 5DYUA 4O70A 4TTEA 2WP2A 2H60A 5ENHA 3HMEA 5F1HA 5ACYA 5FE5A 5CQ8A 5EVAA 3FKMX 5EWCA 5EPRA 3U5NA 4XUAA 5DBMA 4BW1A 5FE4A 5F61A 4DONA 4CLBA 5E7DA 4QYDA 3P1FA 5ENFA 4MR6A 5D3NA 4YBMA 4ALGA 3RCWA 4Y03A 4UYDA 4NYWA 5CUDA 4NS5A 5IG6A 3G0LA 5HLSA 4TU4A 4J0SA 5E0RA 5H1VA 5CS8A 3DWYA 4LR6A 5CUEA 4ALHA 4TZ8A 3UVYA 4QEVA 4HXNA 5FE2A 4A9MA 5FG4A 4LRGA 5I89A 4MENA 5HCLA 4NR5A 5DFBA 4BJXA 4YABA 3SVFA 4O7AA 4PY6A 4WHWA 5CQAA 5EU1A 5AMEA 3UVWA 5BT3A 4XY8A 3IU6A 2RNYA 3Q2FA 4QSRA 5TB6A 4UYHA 5F36A 5I40A 5IBNA 4O7EA 2YEMA 4QSSA 4LYIA 5A83A 5KTWA 4HBYA 5IIDA 4AI6A 4NRAA 5FE0A 2I7KA 4KCXA 4YYIA 2L84A 4TT4A 5FB0A 5A5SA 5FFYA 4O76A 4RVRA 4N4FA 3DAIA 5EPSA 3NXBA 5LJ0A 4QR5A 4LDFA 1PUOA 4HXMA 5DKCA 2L85A 5KO4A 4N3WA 5EK9A 5L99A 5FDZA 2DWWA 4GPJA 4OGIA 3GG3A 5LJ1A 5J0DA 4PCEA 4A9IA 5LKXA 2MJVB 4YAXA 4A9EA 2RO1A 4QEUA 4CL9A 4YYMA 5DX4A 4YC9A 4O7BA 3S91A 5EICA 4NUEA 5FFWA 4QSUA 5F2PA 4YADA 5A7CA 4QSPA 3P5OA 3VKGA 5LVRA 5I1QA 5IGNA 5F60A 4NRCA 4QSWA 4N4GA 4YYGA 5HQ5A 4HXSA 4YATA 5CQ6A 2EJNA 5DLXA 5C85A 4QSQA 4QUUA 4TQNA 4CUUA 5LUUA 5CUBA 4HBXA 5L96A 5C4QA 5ENIA 5LJ2A 4NR8A 4A9FA 5KTXA 4F3IA 5CZGA 5D3LA 5A81A 4AKNA 3P1CA 4LC2A 3U5OA 5LVQA 5I86A 2LSPB 5A5NA 5CQ4A 5L8UA 3P1DA 2R0YA 4NYVA 5CRMA 3SVHA 5C8GA 5CQTA 5CRZA 5C89A 2YEKA 3HMHA 4A9LA 2G4AA 4CUTA 5FG5A 4Z1QA 5H1UA 5ETBA 2E3KA 5L8TA 5FE3A 4QYLA 5ENEA 4HXRA 5DFDA 1JM4B 5A5QA 5FE7A 3U5PA 4AKIA 4IOOA 4QZSA 5AD2A 4PCIA 3G0JA
chains in the Genus database with same CATH topology
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 4QSX A;  4PTB A;  5L98 A;  5II2 A;  4Z6I A;  5I7X A;  4NUD A;  3ONI A;  4QB3 A;  4IR3 A;  5F25 A;  5D3T A;  5FFV A;  5KTU A;  5A82 A;  5E73 A;  1N72 A;  4YY4 A;  3MB3 A;  5EGU A;  5F63 A;  2NXB A;  4UIX A;  5FH6 A;  3HMF A;  5HFR A;  3O36 A;  5ENJ A;  5D26 A;  2OSS A;  4UIZ A;  5CY9 A;  2F6J A;  4MEQ A;  3O34 A;  3TLP A;  4YYD A;  5HEM A;  5FE6 A;  4XYA A;  4A9H A;  5KU3 A;  4FLP A;  4TU6 A;  2OO1 A;  4O78 A;  4TYL A;  4HXP A;  5FH8 A;  4O72 A;  3I3J A;  4XY9 A;  5DFC A;  4LYW A;  5HM0 A;  4NR9 A;  4YYK A;  4O74 A;  5CP5 A;  5EM3 A;  5DYA A;  4BW2 A;  2DVS A;  5AD3 A;  2YYN A;  4KV4 A;  2KTB B;  5E74 A;  5E9I A;  4Z6H A;  3U5K A;  5HRW A;  2DVR A;  5G4R A;  4OUF A;  5D3P A;  4UIU A;  5KHM A;  2I8N A;  4A9N A;  2YQD A;  3QZV A;  3K2J A;  3U5M A;  5HEL A;  3UW9 A;  3U5J A;  2D82 A;  5EV9 A;  2RI7 A;  5CFW A;  1ZS5 A;  2DAT A;  5I29 A;  4QNS A;  4UIY A;  4A9K A;  4J3I A;  5C7N A;  4HXL A;  3U5L A;  5JWM A;  3IU5 A;  4WHU A;  5BT5 A;  4NQN A;  5E9V A;  4YK0 A;  4NXJ A;  5D7X A;  5H1T A;  5D3J A; 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