5D24A

First bromodomain of brd4 bound to inhibitor xd26
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
126
structure length
126
Chain Sequence
MNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title 4-Acyl Pyrrole Derivatives Yield Novel Vectors for Designing Inhibitors of the Acetyl-Lysine Recognition Site of BRD4(1).
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 45
structure length 126
sequence length 126
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5d24A01
5COIA 5DYCA 3U5PA 3GG3A 5E9LA 5II2A 5F61A 5HM0A 4HXNA 2RNXA 5FH6A 2WP1A 3SVGA 2RNWA 5A81A 4QC3A 5CQ6A 5EWVA 4A9NA 5A5QA 5EV9A 5ENIA 4TT6A 5F3AA 5IGLA 3JVLA 5FFWA 4LR6A 4O76A 5IG6A 4QY4A 5JWMA 4QYLA 4Z1SA 4YADA 4OGIA 5I7YA 5HRXA 5I1QA 5L98A 5DBMA 3P1DA 4MEOA 2L5EA 1X0JA 3O37A 5A5OA 4OGJA 4N4FA 4PCEA 2G4AA 5DY7A 4O74A 5CUAA 5FFVA 5DKDA 2R0SA 3O34A 4A9EA 4A9HA 4YATA 5DW2A 4CL9A 3ONIA 2E3KA 4J1PA 4UYFA 5C4QA 5HLSA 4LC2A 5D24A 3O36A 5CFWA 5D26A 5L97A 4IORA 5FG4A 4A9MA 5FBXA 5DX4A 5DYAA 3UW9A 4PTBA 5I7XA 4YABA 2OUOA 4NR5A 4NYXA 3U5NA 2F6JA 4QEUA 5EI4A 4YYIA 5KTWA 5ENEA 4BJXA 2I7KA 5TB6A 2LSPB 4QR5A 5CQ8A 5KTUA 2F6NA 4XUAA 5D3RA 4NYVA 4N4GA 4C67A 1N72A 5F1LA 3AADA 4F3IA 5CPEA 5DKCA 4TZ8A 4TYLA 4Z6HA 4YAXA 4E96A 4YYMA 5LVRA 5E9IA 5EPSA 3D7CA 4BW3A 4TZ2A 4UYEA 5CUCA 5FFYA 2RNYA 2YELA 4O72A 5LKZA 5EP7A 5A83A 4OUFA 4O7BA 4MR4A 5LVQA 5D7XA 3U5LA 5G4SA 2YQDA 5HEMA 5LUUA 4NR6A 4NS5A 2OO1A 4IR3A 4QSTA 4TU6A 2YDWA 5AMEA 4O7EA 5FE2A 4XYAA 2DATA 5CU8A 2R0VA 5FE5A 3Q2EA 5II1A 5EICA 2NXBA 3I3JA 3S92A 4UIZA 5E9KA 3UV2A 3SVHA 5L8TA 4CLBA 5E0RA 4PCIA 3DWYA 4TTEA 2DKWA 4PY6A 4UIYA 2YW5A 4QSPA 4CFKA 4QSQA 5CS8A 4X2IA 5CUEA 4NR9A 5H1UA 4Z1QA 4YYJA 5E73A 5FH8A 5JI8A 4HXKA 4Z93A 3IU5A 4CURA 4QEVA 4BHWA 4YC9A 4CUUA 5IGMA 5LJ0A 5HFRA 5EGUA 3SVFA 3QZTA 4CUQA 4XY9A 4QUUA 4UIWA 3U5KA 5DLZA 5E3GA 5CP5A 5E3DA 5D3SA 4YBSA 4A9JA 5A5SA 4NRBA 5FE7A 4N3WA 4O78A 2YEMA 5D0CA 2YEKA 4HXMA 5EPBA 3MXFA 3MUKA 5BT5A 5CTLA 5HENA 4WHWA 3LQIA 1WUGA 4NYWA 5BT3A 4QNSA 4NUCA 4MENA 5FE1A 5KHMA 5A5PA 5D3PA 5DYUA 3LJWA 4ZQLA 4HXLA 4O7AA 4QR4A 3LQJA 5IGNA 5ETDA 4TU4A 3UV4A 3HMFA 5F5ZA 4LZRA 5A85A 5J0DA 5F63A 5FE8A 5DYXA 3MULA 4O7CA 3UVXA 5C87A 4AKNA 5EPRA 2YYNA 4HBXA 4NXJA 4LYSA 1JM4B 4YBMA 4UYHA 5HRVA 4QSVA 4KV1A 5FE9A 5IIDA 1EQFA 3G0LA 4QBMA 4ZW1A 4YY6A 5ENFA 2E7NA 4UIXA 4NR8A 5I86A 4WIVA 4A9KA 4ZC9A 1ZS5A 4CFLA 4Q0OA 2RFJA 4DONA 4TQNA 5D3NA 5FE3A 4J3IA 5E9YA 4IR5A 2L85A 4YH3A 4A9OA 2MJVB 5CQ4A 5A7CA 4CUPA 3TLPA 4YYHA 4N4IA 5CQAA 4RVRA 4QSSA 5EM3A 5EQ1A 3U5JA 5FG6A 5TCMA 2GRCA 5L96A 5CRMA 4QUTA 5E74A 4XY8A 4MEQA 3UVYA 4TS8A 5L99A 4N4HA 2E7OA 4HBWA 2RS9B 3JVKA 4IR6A 4MR5A 5I83A 4LYIA 2FSAA 5KU3A 4UYGA 5HELA 5FB0A 4NRCA 5H1VA 5G4RA 5KO4A 4Y03A 4NUEA 5F1HA 5HCLA 4PS5A 5ENCA 4Q0NA 4HXRA 5AMFA 5I80A 5AD3A 5FE0A 4YYDA 4HXOA 4QSUA 3Q2FA 3UVDA 5C89A 5ENGA 4UYDA 4QR3A 5F62A 4ALHA 5HQ5A 4MEPA 4O70A 4O7FA 4LDFA 5FB1A 3K2JA 5IBNA 5CQ5A 5FG5A 4C66A 2D9EA 4QSWA 5ETBA 3HMEA 5D3TA 4LZ2A 5C8GA 2RI7A 5C85A 5EWDA 5CZGA 4A9LA 3UV5A 5DFDA 5C7NA 4NUDA 5EK9A 5I29A 4MR6A 5E7DA 5A5NA 5F60A 5K29A 5IGKA 5CQTA 3P5OA 2R0YA 3LQHA 5EWCA 3QZVA 4NRAA 4GPJA 5AD2A 5CUDA 5BT4A 5D25A 1F68A 4UIUA 2I8NA 5LKTA 4J0RA 3UVWA 4QSRA 4YY4A 5EWHA 3IU6A 4HXPA 5E9MA 5EU1A 4WHUA 5F36A 4YYGA 5EA1A 2DWWA 2R10A 2OSSA 4MR3A 5CGPA 4BW4A 5F25A 4BW2A 5HQ6A 5HJCA 5DFBA 3P1CA 5EWWA 4LRGA 2D82A 3MB3A 5CUBA 5FH7A 4QB3A 5DFCA 4QEWA 5FE6A 2RO1A 4LYWA 5CY9A 3MB4A 4NR7A 3ZYUA 5HRWA 5FDZA 4QSXA 4QYDA 1JSPB 5CRZA 3JVMA 3O33A 4KV4A 5DLXA 4A9IA 5I89A 5ACYA 4PKLA 3U5OA 5EVAA 4IOQA 3DAIA 4Z6IA 3U5MA 3JVJA 2KTBB 5D3JA 5DKHA 4KCXA 3QZSA 2H60A 4NR4A 4ALGA 5LJ2A 5LKXA 4LZSA 5H1TA 3NXBA 4TT4A 5EISA 3LXJA 4YK0A 5I40A 3RCWA 4A9FA 5ENJA 1E6IA 4TT2A 4HXSA 4UYFB 2L84A 5D3LA 4CUSA 4UIVA 4YYNA 5CUGA 5I88A 4NQNA 3MQMA 5ENBA 4YYKA 4UITA 4J0SA 2DVVA 5HFQA 5A82A 5KTXA 4FLPA 4QC1A 3AQAA 4O75A 4YH4A 4BW1A 5CQ3A 3HMHA 4HBVA 5D3HA 4IOOA 3FKMX 5DW1A 4NQMA 4O77A 4IR4A 4XUBA 5LJ1A 3O35A 4QZSA 5FE4A 5CQ7A 5LKUA 3P1FA 4HBYA 1WUMA 3S91A 5HQ7A 5E9VA 5L8UA 2WP2A 3P1EA 4CUTA 5ENHA 4O71A 4YBTA 2DVSA 2DVRA 5A5RA 5H85A 3G0JA 2DVQA 5F2PA 2N9GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ERRA 5COIA 5DYCA 3U5PA 3GG3A 5E9LA 5II2A 5F61A 5HM0A 4HXNA 2RNXA 5FH6A 2WP1A 3SVGA 2RNWA 5A81A 4QC3A 5CQ6A 5EWVA 4A9NA 5A5QA 5EV9A 5ENIA 4TT6A 5F3AA 5IGLA 3JVLA 5FFWA 4LR6A 4O76A 5IG6A 4QY4A 5JWMA 4QYLA 4Z1SA 4YADA 4OGIA 5I7YA 5HRXA 5I1QA 5L98A 5DBMA 3P1DA 4MEOA 2L5EA 1X0JA 3O37A 5A5OA 4OGJA 4N4FA 4PCEA 2G4AA 5DY7A 4O74A 5CUAA 5FFVA 5DKDA 2R0SA 3O34A 4A9EA 4A9HA 4YATA 5DW2A 4CL9A 3ONIA 2E3KA 4J1PA 4UYFA 5C4QA 5HLSA 4LC2A 5D24A 3O36A 5CFWA 5D26A 5L97A 4IORA 5FG4A 4A9MA 5FBXA 5DX4A 5DYAA 3UW9A 4PTBA 5I7XA 4YABA 2OUOA 4NR5A 4NYXA 3U5NA 2F6JA 4QEUA 5EI4A 4YYIA 5KTWA 5ENEA 4BJXA 2I7KA 5TB6A 2LSPB 4QR5A 5CQ8A 5KTUA 2F6NA 4XUAA 5D3RA 4NYVA 4N4GA 4C67A 1N72A 5F1LA 3AADA 4F3IA 5CPEA 5DKCA 4TZ8A 4TYLA 4Z6HA 4YAXA 4E96A 4YYMA 4AKGA 5LVRA 5E9IA 5EPSA 3D7CA 4BW3A 4TZ2A 4UYEA 5CUCA 5FFYA 2RNYA 2YELA 4O72A 5LKZA 5EP7A 5A83A 4OUFA 4O7BA 4MR4A 5LVQA 5D7XA 3U5LA 5G4SA 2YQDA 5HEMA 5LUUA 4NR6A 4NS5A 2OO1A 4IR3A 4QSTA 4TU6A 2YDWA 5AMEA 4O7EA 5FE2A 4XYAA 2DATA 5CU8A 2R0VA 5FE5A 3Q2EA 5II1A 5EICA 2NXBA 3I3JA 3S92A 4UIZA 5E9KA 3UV2A 3SVHA 5L8TA 4CLBA 5E0RA 4PCIA 3DWYA 4TTEA 2DKWA 4PY6A 4UIYA 2YW5A 4QSPA 4CFKA 4QSQA 5CS8A 4X2IA 5CUEA 4NR9A 5H1UA 4Z1QA 4YYJA 5E73A 5FH8A 5JI8A 4HXKA 4Z93A 3IU5A 4CURA 4QEVA 4BHWA 4YC9A 4CUUA 5IGMA 3D1DA 5LJ0A 5HFRA 5EGUA 3SVFA 3QZTA 4CUQA 4XY9A 4QUUA 4UIWA 3U5KA 5DLZA 5E3GA 5CP5A 5E3DA 5D3SA 4YBSA 4A9JA 5A5SA 4NRBA 5FE7A 4N3WA 4O78A 2YEMA 5D0CA 2YEKA 4HXMA 5EPBA 3MXFA 3MUKA 5BT5A 5CTLA 5HENA 4WHWA 3LQIA 1WUGA 4NYWA 5BT3A 4QNSA 4NUCA 4MENA 5FE1A 5KHMA 5A5PA 5D3PA 5DYUA 3LJWA 2EJNA 4ZQLA 4HXLA 4O7AA 4AKHA 4QR4A 3LQJA 5IGNA 5ETDA 4TU4A 3UV4A 3HMFA 5F5ZA 4LZRA 5A85A 5J0DA 5F63A 5FE8A 5DYXA 3MULA 4O7CA 3UVXA 5C87A 4AKNA 5EPRA 2YYNA 4HBXA 4NXJA 4LYSA 1JM4B 4YBMA 4UYHA 5HRVA 4QSVA 4KV1A 5FE9A 5IIDA 1EQFA 3G0LA 4QBMA 4ZW1A 4YY6A 5ENFA 2E7NA 4UIXA 4NR8A 5I86A 4WIVA 4A9KA 4ZC9A 1ZS5A 4CFLA 4Q0OA 2RFJA 4DONA 4TQNA 5D3NA 5FE3A 4J3IA 5E9YA 4IR5A 2L85A 4YH3A 4A9OA 2MJVB 5CQ4A 5A7CA 4CUPA 3TLPA 4YYHA 4N4IA 5CQAA 4RVRA 4QSSA 5EM3A 5EQ1A 3U5JA 5FG6A 5TCMA 2GRCA 5L96A 5CRMA 4QUTA 5E74A 4XY8A 4MEQA 3UVYA 4TS8A 5L99A 4N4HA 4AI6A 2E7OA 4HBWA 2RS9B 3JVKA 4IR6A 4MR5A 5I83A 4LYIA 2FSAA 5KU3A 4UYGA 5HELA 5FB0A 4NRCA 5H1VA 5G4RA 5KO4A 4Y03A 4NUEA 5F1HA 5HCLA 4PS5A 5ENCA 4Q0NA 4HXRA 5AMFA 5I80A 5AD3A 5FE0A 4YYDA 4HXOA 4QSUA 3Q2FA 3UVDA 5C89A 5ENGA 4UYDA 4QR3A 5F62A 4ALHA 5HQ5A 4MEPA 4O70A 4O7FA 4LDFA 5FB1A 3K2JA 5IBNA 1ZKRA 5CQ5A 5FG5A 4C66A 2D9EA 4QSWA 5ETBA 3HMEA 5D3TA 4LZ2A 5C8GA 2RI7A 5C85A 5EWDA 5CZGA 4A9LA 3UV5A 5DFDA 5C7NA 4NUDA 5EK9A 5I29A 4MR6A 5E7DA 5A5NA 3VKGA 5F60A 5K29A 5IGKA 5CQTA 3P5OA 2R0YA 3LQHA 5EWCA 3QZVA 4NRAA 4AKIA 4GPJA 5AD2A 5CUDA 5BT4A 5D25A 1F68A 4UIUA 2I8NA 5LKTA 4J0RA 3UVWA 4QSRA 4YY4A 5EWHA 3IU6A 4HXPA 5E9MA 5EU1A 4WHUA 5F36A 4YYGA 5EA1A 2DWWA 2R10A 2OSSA 4MR3A 5CGPA 4BW4A 5F25A 4BW2A 5HQ6A 5HJCA 5DFBA 3P1CA 5EWWA 4LRGA 2D82A 3MB3A 5CUBA 5FH7A 3D1BA 4QB3A 5DFCA 4QEWA 5FE6A 2RO1A 4LYWA 5CY9A 3MB4A 4NR7A 3ZYUA 5HRWA 5FDZA 4QSXA 4QYDA 1JSPB 5CRZA 3JVMA 3O33A 4KV4A 5DLXA 4A9IA 5I89A 5ACYA 4PKLA 3U5OA 5EVAA 4IOQA 3DAIA 4Z6IA 3U5MA 1PUOA 2KTBB 3JVJA 5D3JA 5DKHA 4KCXA 3QZSA 2H60A 4NR4A 4ALGA 5LJ2A 5LKXA 4LZSA 5H1TA 3NXBA 4TT4A 5EISA 3LXJA 4YK0A 5I40A 3RCWA 4A9FA 5ENJA 1E6IA 4TT2A 4HXSA 4UYFB 2L84A 5D3LA 4CUSA 4UIVA 4YYNA 5CUGA 5I88A 4NQNA 3MQMA 5ENBA 4YYKA 4UITA 4J0SA 2DVVA 3VKHA 5HFQA 5A82A 5KTXA 4FLPA 4QC1A 3AQAA 4O75A 4YH4A 4BW1A 5CQ3A 3HMHA 4HBVA 5D3HA 4IOOA 3FKMX 5DW1A 4NQMA 4O77A 4IR4A 4XUBA 5LJ1A 3O35A 4QZSA 5FE4A 5CQ7A 5LKUA 3P1FA 4HBYA 1WUMA 3S91A 5HQ7A 5E9VA 5L8UA 2WP2A 3P1EA 4CUTA 5ENHA 4O71A 4YBTA 2DVSA 2DVRA 5A5RA 5H85A 3G0JA 2DVQA 5F2PA 2N9GA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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