5D37 | Genus

Total Genus 91

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	91
sequence length	256
structure length	256
Chain Sequence	MLAKRIDAALILKDGRVVKGSNFENLRDSGDPVELGKFYSEIGIDELSFWDITASVEKRKTMLELVEKVAEQIDIPITVGGGIYDFETASELILRGADKVEINTAAVENPSLITQIAQTFGSQAVVVYIAAKRVDGEFMVFTYSGTKNTGILLRDWVVEVEKRGAGEIVLGSIDRLGTKSGYDTEMIRFVRPLTTLPIIAHRGAGKTEHFLEAFLAGADAAKADSVFHSREIDVRELKEYLKKHGVNVRLEGLGSL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	De novo protein, lyase
source organism	Synthetic construct
publication title	Directed evolutionary changes in Kemp Eliminase KE07 - Crystal 16 round 7 rcsb
molecule keywords	De novo kemp eliminase KE07 round 7
total genus	91
structure length	256
sequence length	256
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2015-08-06

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	5d37A00

1YPIA 3NQFA 3S5NA 2A6LA 4TX9A 4Y90A 1WBJA 2A2IA 4BK9A 2DJXA 3ABOA 3N3MA 2OMAA 1A5AA 1PHWA 3BLFA 3YPIA 1MZHA 1Q6RA 5DXYA 3N14A 1BKSA 1YDNA 3STCA 2QCMA 1TPDA 4RV8A 2FFCA 3FOKA 3LCIA 3ZS4A 3L5AA 2BXVA 3EEGA 3G1SA 4UNLA 4O54A 3W1RA 4UTWC 4HT3A 5HR6A 1Q6OA 1EA0A 3A5VA 3W88A 3B8DA 4WY0A 4XWUA 2HS6A 3O1NA 3P62A 3CPRA 2PCQA 3W1QA 3OG3A 1Z48A 2NWRA 5LNRA 3LCGA 3R13A 4RXGA 4KFPA 5AHMA 1AW5A 1ZAHA 3F03K 1C8VA 2B0MA 1G6CA 1SUXA 1IXQA 2VFDA 2X1SA 4JX5A 2E6AA 3A24A 5D32A 3W73A 1H51A 3P8IA 3I65A 3U8GA 4IUOA 4XBSA 4LC8A 2B7NA 3UWWA 1KV8A 5HWMA 2EKCA 1SW0A 4UFHA 3DI1A 1W3NA 3SGZA 3VFLA 3UPBA 3DFPA 1K7EA 4FNPA 2J9ZA 4NT0A 4QSHA 2GVGA 4ADUA 3LCXA 3BG9A 1G4TA 3C56A 3W7MA 5CGQA 1R30A 3B4UA 4I9AA 1JQXA 3C2RA 1JR1A 3T40A 5DXXA 4A22A 3T4CA 2Z0IA 1LBMA 1AW1A 1FX6A 2TSYA 3G0XA 1QR7A 2X16A 1NSJA 4PL1A 3ABRA 4AWSA 3FKKA 4OQVA 1JUKA 1ICQA 4O0ZA 4TMCA 1L2UA 1SW7A 3IIVA 1R2RA 4O0KA 5HINA 5EKYA 3O15A 4UFLA 3TH6A 5I3IA 3KAOA 1UJPA 4NJKA 4JTIA 5CPOA 4JDYA 1UB3A 1EUAA 3GB6A 4JXCA 4QIUA 4JTTA 5FEZA 5HUPA 2QJHA 1KFLA 4Z08A 1K7XA 1DBTA 3PB0A 1O60A 1A5BA 1XBVA 2PRHA 3T55A 4PFMA 2FDSA 2C15A 1Z41A 4N6FA 4NZFA 3G1DA 4M7SA 4N6EA 3PG9A 3A21A 4X9SA 3QSRA 4FO4A 5DY3A 5CSSA 3SJ3A 3MHUA 4K7YA 4K36A 5D09A 4OU1A 1GOXA 2ZRVA 2G5WA 5IBXA 1I45A 4UTLA 2NXGA 1TB3A 2DZVA 2ZCGA 4Z0JA 2JKPA 1HFBA 4JDBA 3WK1A 3G1XA 4O4VA 4DO4A 3RFAA 3SIZA 4MIMA 1QCWA 5KZMA 5CPMA 4H4IA 1VQTA 3PULA 3MP3A 2H3BA 4G1KA 1F6KA 5BRBA 5CKSA 1ZAIA 3LI0A 4ZZ9A 5EPDA 1RVGA 1HL2A 3SZ8A 3QC3A 2NXHA 4IMEA 3W2JA 1QAPA 4RR4A 5FF7A 3IGXA 4JX6A 3NQAA 4ZQCA 1PV8A 1R46A 5I3HA 3TC6A 1F74A 3CEPA 1UASA 5DN1A 1TO3A 3MBFA 5GVJA 3JRKA 3G1AA 3IV3A 3QMSA 2BX7A 3MP4A 2NUWA 2Y63A 2YCEA 4HKPA 1VR6A 1EP1A 1H7NA 4QNWA 1DOSA 5BMWA 2YPIA 3IIZA 4LVFA 1C9DA 1H7PA 4ZQRA 1WV2A 3TQKA 3QRHA 1JCXA 1LBLA 4JD4A 1W37A 3HGRA 1ICPA 3G1HA 4NQ1A 4ICNA 3BG3A 1OFAA 4LT9A 4LS0A 1WQ5A 4DBEA 4N9BA 4FX8A 1F73A 4GUJA 4HN4A 1TQXA 3P8JA 3UXDA 3FYOA 3BPWA 1MEHA 1I2NA 3UXAA 1QPNA 2CLMA 2YYTA 3LHVA 4LNYA 3R5EA 3W07A 4QNEA 1O4UA 3TNOA 3S6DA 2EGZA 4NNBA 2QAPA 4RK8A 1EP2A 3W7GA 4N9CA 3B0PA 1N55A 4DPQA 3KRZA 4GUGA 1XBYA 3KRSA 2JGYA 1NF0A 2DZWA 3THQA 4NUWA 2V5BA 1SW3A 3EWUA 1SO4A 1G7UA 4DEFA 3B06A 3QEZA 1ME8A 2CZ5A 4IMCA 1DJQA 1HG3A 1W5NA 2GOUA 2V5LA 3QMTA 1LCOA 4M6VA 4MPQA 2PE4A 3GZ3A 3PF3A 1YXCA 1F6PA 3F4WA 2W79A 3DFSA 4LS2A 1OFPA 5D2YA 2WSRA 4MY8A 4MLJA 3W7IA 4OT7A 1P0NA 3EWZA 5IBXC 3Q58A 3A9IA 2F7FA 1GT8A 2C16A 4LTSA 1W5PA 1GJPA 1QPOA 4MY1A 3W1AA 1OHLA 5KMYA 3S1WA 1KTNA 2GQ8A 3U6WA 3RLVA 4K39A 2E68A 4WUIA 1FWRA 5HULA 1DQWA 3L5MA 5IM51 3ELFA 4NU7A 2WJZA 1J4EA 1ALDA 2HS8A 2R14A 5G5IA 1K03A 1Q6LA 3BK0A 3ATZA 1KA9F 1RZMA 1O5XA 1DQXA 2FPTA 4AB4A 2G96A 1R47A 2QDHA 3W2LA 1X1ZA 2A1YA 3HJZA 4GUIA 1EX5A 3Q37A 4GUHA 2O7SA 1NEYA 5U4NA 3UWQA 3FA5A 2JGQA 1H1YA 4R53A 4K7VA 4IPJA 2VOMA 3LTPA 4A2RA 5C54A 3W7JA 1TMHA 3LLDA 4EWND 3PUEA 3M5YA 3A23A 1WA3A 1SFLA 3IIOA 4JTSA 3NPXA 2H8XA 2WNQA 4AH7A 2PRLA 1KTCA 3TA6A 3EXSA 3INPA 1TPFA 3R89A 3UQNA 2V81A 1LRTA 4IMDA 5DELA 3B0VC 4RZ5A 1SO3A 3NQDA 2VEPA 4FNSA 4DF1A 1K8XA 4H3DA 1B9BA 1YPFA 2RFGA 4Z0SA 5D2VA 1SO5A 5F4XA 1F2JA 3OVRA 1TPH1 3GNDA 2ZZ3A 3N19B 3NQGA 3W7HA 5F4SA 2Y70A 2Z2UA 2WKJA 3TAOA 2YDAA 3E96A 3QPYA 4UTTA 3GIYA 5G2WA 4BFAA 3NEVA 3S1XA 2X2GA 5HR7A 4FNUA 2E6YA 1QO2A 5HWJA 3S5OA 4JIQA 4Y6GA 5LKYA 1WAUA 1YYAA 4KKXA 2VEKA 1X7FA 1MEIA 1GG0A 2ZZ5A 3O6CA 1SQ7A 1OABA 5EL1A 4CLMA 1JUEA 1PCWA 3P5ZA 2RHGA 5DBTA 3MI2A 4S2BA 3O6YX 2FB2A 1HO1A 2WQPA 3NDOA 2TMDA 3LRLA 3NQ7A 3W75A 2C14A 2F84A 4MVAA 2Z6IA 2NV2A 4AHQA 4UMCA 3MI6A 4CCEA 4FNQA 4QISA 4S1FA 5HMSA 5MHBA 1O94A 1XBZA 3G8EA 4GBUA 3THAA 3IGSA 1C29A 3N73A 2V30A 3CIWA 1KLYA 2ZBTA 4A2SA 2J9YA 4I7WA 1SZFA 1D9EA 4O18A 2YR1A 3WFAA 3LCHA 3L65A 1KM5A 2ZFAA 3UZ5A 1EWEA 1IIHA 4BI7A 5ABTA 5HQEA 2X1UA 1VC4A 2V2DA 4TU1A 1H1ZA 1X1OA 1KM6A 3USBA 3DI0A 5D05A 2QEZA 4DXVA 3EWBX 3R12A 2A4AA 3LHWA 1W5QA 3S5YA 4P2VA 4JGDA 4WY0F 3OA3A 4BI6A 1CW2A 4AHPA 5BW6A 4JTEA 3NNTA 5K4ZA 4O14A 1SZEA 3JR2A 5D2TA 5FF3A 1THFD 4LRSA 2ISWA 1K3UA 4LU0A 2Y7GA 2DZUA 1SPQA 1ZCOA 2KZHA 2GJNA 1LOLA 2QKFA 2ZRUA 3BLEA 3W23A 1MO0A 4OBTA 3SY5A 3HPSA 1YTDA 1H61A 3TXVA 3OVPA 2DORA 1TREA 4QM1A 1W3TA 2Y62A 1NFBA 8TIMA 4LVGA 5K4XA 2FQIA 3I7SA 1G4PA 3MHFA 3LXBA 5C55A 3O6DA 4O50A 4AAJA 3LRKA 4UCGA 3NVTA 5AOUA 3SGUA 2J27A 4POCA 4UTTC 1MXSA 4IXHA 1FY6A 1OFQA 1PIIA 1ME7A 3SECA 4O10A 1VGAA 3N9SA 1RPXA 3LHYA 3G1VA 4CQ8A 3PBUA 3NZ1A 4UUIA 3LCFA 1I8JA 4ADSA 3LBCA 3GAKA 4NX5A 3RNDA 3NL2A 3W7OA 5E1QA 4HNUA 5G1YA 1VYRA 4YLWA 1B4EA 2XN1A 1W0MA 2Y88A 3UWZA 1TYGA 3IVSA 1M5WA 1OK4A 1TPWA 1XM3A 3BG5A 3L0GA 2CFFA 2VKZG 2GJLA 1ONRA 5E0KA 4IGHA 4RKAA 2CZEA 4PEKA 2B7PA 4RLIA 3W1XA 4JIPA 3O07A 4ZMGA 4N2YA 3EWYA 4DQWA 4J9JA 2E77A 1D3HA 1XL9A 3HBLA 2QCNA 4TO8A 1Y0EA 3HB9A 4JYFA 4MJZA 3KVMA 3L9CA 4GC4A 2H3DA 4MLRA 3H55A 1W8SA 3UZJA 1DKWA 1ZHAA 3EB2A 2O7QA 3DAQA 2QCDA 2QUVA 3TUUA 1S3HA 4MKNA 1RD5A 1M7OA 2WSYA 1LROA 3E49A 3FYPA 3W86A 5FESA 3PSWA 1MSSA 2VEMA 5G4WA 2AQWA 5AYYA 4DF2A 1GYLA 3TJXA 2ZYFA 3MHGA 4WXZA 4AF0B 1QFEA 3O05A 1NVMA 1SZGA 3OBKA 2PRMA 3HOJA 1CI1A 1AG1O 1R2SA 4AWUA 3EX2A 2QCCA 1H7XA 3L66A 4PL2A 2WNZA 1OFOA 3W1TA 1JULA 1OFEA 2J24A 2TRSA 3W2UA 1JUBA 1QMLA 3QW3A 3NM3A 4IX0A 3GLCA 6ALDA 4RZ4A 3B05A 3I68A 3ABQA 3M47A 4U4MA 5TQLA 3TR2A 1KBJA 4MY9A 3IGUA 5EBUA 4D2JA 4N4PA 1JQVA 3QW4B 1JRBA 1G7VA 5CG7A 1K7FA 2A6NA 3F1QA 1F5ZA 1NF7A 2TPSA 3LI1A 4IJBA 4Z1CA 2GUUA 2W6RA 3UWYA 1K8ZA 3TDFA 1DHPA 4E2BA 4O17A 3C8FA 1FWTA 2Q3RA 3W9ZA 4BWLA 1W31A 2YGYA 4K37A 3UD6A 2OT0A 3L0NA 1TV8A 2QUTA 4OE7A 3BW2A 3PS7A 4ZL1A 3BO9A 4M19A 1YDVA 4Q32A 5CZSA 3LX9A 3FIGA 2CW6A 1AK5A 3G0UA 4UR7A 3ZWSA 4A21A 2VFFA 2QCLA 3VCRA 5HJLA 3DHFA 2R91A 5T26A 3KVJA 4GXMA 2C3ZA 1KM4A 1PHQA 3C6CA 3NPUA 4UMAA 3L21A 5A5WA 2QCFA 4O1BA 5D04C 3TXZA 2DU2A 3W85A 3P82A 3LCLA 4O12A 3W1NA 3R8RA 3C2FA 3W87A 4O8RA 4XQ6A 4JR5A 3E9AA 2DP3A 4QJ1A 4ZVJA 1TRDA 3P84A 1OFBA 1YADA 3QM3A 4JX4A 3PAJA 5SWUA 3M16A 5F1VA 2JBMA 1AL7A 2DJLA 3GYEA 3WJZA 3HGSA 1PCKA 3P7YA 4ZQMA 4B5NA 3STFA 1WYIA 3ATYA 1SZNA 4GNJA 4XTIA 3TSMA 3E0IA 2DZXA 3GXNA 1W3IA 4ONVA 4PCFA 4MJMA 5EYWA 3FS2A 3PR2A 3M6YA 4FNTA 5AC8A 4WQ6A 3P5YA 1WDWA 1JCLA 3W7PA 3NQ8A 2JK2A 4NNCA 1QPRA 1EUNA 4FXSA 5DCBA 5AC6A 5D02A 2PC4A 1XI3A 3TSDA 2ABAA 1RV8A 3N9RA 4P61A 3HGOA 2NX9A 4GJ1A 1VLWA 1WX0A 4XKYA 2GQAA 3ZFHA 3TKFA 3HQ1A 4TIMA 3IVTA 1XXXA 2CLIA 5CPNA 3GDTA 4FEZA 2HSAA 5DCDA 1BEUA 4DPPA 3HG5A 1U5JA 3A22A 3MUXA 1VRDA 3UWUA 2CZFA 3ZR4A 2QDGA 3W1LA 4HIBA 2B7OA 1TPC1 2GPTA 3IRDA 2BTMA 2C18A 1DORA 1VCVA 2QJIA 1TSIA 5AYZA 1YXDA 3QQ1A 4IMGA 4GUFA 4PH6A 1B57A 4O52A 3RMJA 5K2ZA 2V82A 4LVDA 1Z44A 4BWLC 3NQMA 3W6YA 4NX0A 2QCEA 3QF0A 3TE9A 1KFBA 2H90A 4NZJA 4FF7A 1UUMA 1DJNA 2ALDA 3KHJA 3UNDA 4A3UA 4EIVA 2ZRXA 2V2HA 3B04A 3G22A 3HPZA 3W1MA 2P1FA 1FCUA 3TFXA 2VEIA 3EXRA 6TIMA 3SI9A 1VJIA 1V5XA 2CU0A 4JTGA 1XFBA 3HG2A 1S5WA 4IPIA 3SFKA 1RR2A 3DFOA 3LTSA 3TFCA 3CWOX 3K30A 3UY7A 4GRSA 2Y6ZA 4JY9A 5AHLA 3EKZA 4Z1AA 4KFOA 5LHFA 3CIXA 4XBKA 2E6DA 1H62A 4AWTA 5CPLA 3DKLA 1TQJA 2X1RA 2C19A 2GVLA 4JN6A 1YTKA 3BV4A 1TPB1 4R34A 3BLIA 4LUIA 3S9YA 2LLEA 1LORA 3PBYA 1OFRA 1PL9A 2CLFA 3KOFA 1LDCA 3QQ0A 1LYXA 1SR9A 3PUDA 3PB2A 3O8AA 1T99A 2CLLA 4LVBA 5AN7A 2B4GA 1ZY9A 5D38A 1TV5A 4JS3A 4JTUA 5AFDA 1TTJA 1KFJA 4MOZA 1F76A 3S1UA 4ZQPA 4R7JA 3DXIA 3M1ZA 5F2IA 1D3GA 1KM0A 1SSDA 4AVFA 3NZRA 3NOEA 1Z42A 4O19A 4OWGA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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5D37A

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