5D93A

Oxidoreductase fragment of mouse qsox1 in complex with a fab fragment from a mouse qsox1-specific antibody
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
240
structure length
240
Chain Sequence
MSVLYSSSDPLTLLDADSVRPTVLGSSSAWAVEFFASWCGHCIAFAPTWKELANDVKDWRPALNLAVLDCAEETNSAVCREFNIAGFPTVRFFQAFTKNGSGATLPGAGANVQTLRMRLIDALESHRDTWPPACPPLEPAKLNDIDGFFTRNKADYLALVFEREDSYLGREVTLDLSQYHAVAVRRVLNTESDLVNKFGVTDFPSCYLLLRNGSVSRVPVLVESRSFYTSYLRGLPGLTR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Overcoming a species-specificity barrier in development of an inhibitory antibody targeting a modulator of tumor stroma.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Sulfhydryl oxidase 1
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mus musculus
total genus 75
structure length 240
sequence length 240
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 1.8.3.2: Thiol oxidase.
pdb deposition date 2015-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
A PF18108 QSOX_Trx1 QSOX Trx-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5d93A01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5d93A02
3V1WA 3F8UA 5INYA 3UOMA 2GGTA 4QL9A 4BVYA 1YEXA 2RLIA 1YDKA 2R5GA 4PUAA 4DSSA 4JZQA 2GQMA 1QUWA 1PQNA 2H73A 2IMIA 2DLXA 5EL8A 1TU8A 3SWLA 5FHIA 2LS5A 2BTOT 1GH2A 3HVVA 1G0TA 3APQA 3KH7A 2KP1A 3BJ5A 1S3CA 5HFKA 12GSA 3KIJA 17GSA 2PWJA 4P3YB 3OR5A 2V1MA 3HDCA 4IN0A 4EXJA 4GLTA 1XFLA 2QGVA 3UJ1A 3Q6OA 2VLUA 1VF4A 1SK1A 2DJ2A 4HEA2 3GH9A 1TI3A 3UARA 1B48A 4TVEA 2B6MA 4EKZA 3M3MA 2G0FA 3PINA 1Z7PA 5GSSA 4WBJA 4IQAA 3DGQA 5G30A 1PL2A 2JU5A 2DIZA 2YPMA 4NHZA 3HJPA 1VF1A 4ISDA 5B6NA 2AAWA 2ON7A 4IP1A 5CRGA 2C4JA 1A8YA 2KOKA 4CDOA 1XBSA 1RW1A 2AUVA 3A3TA 1XW9A 4G10A 3HJOA 3CTFA 5ECQB 2LRTA 2GTUA 3CMIA 4HJ2A 4ZXGA 1OE7A 1YEPA 2CZ2A 1QMVA 5HR0A 4EF0A 1X9WB 3W8SA 4LA1A 5DCGA 3P2AA 6GSXA 3TKPA 4AGSA 2LUSA 5CO3A 5IM9A 3KTLA 3GKNA 1T7PB 5FT3A 7GSSA 3QDNA 4V2MA 1X9SB 2IMDA 3DD3A 6GSTA 5J9BA 1GNWA 3E0UA 1ERTA 3A2VA 3ZMLA 3C7MA 1K0DA 5H5SA 1Z6NA 2C0EA 2V32A 2X8GA 5IPHA 4HS1A 4TXOB 3KZQA 1HD2A 4IJIA 2YP6A 4FIWA 5IO2A 3FRCA 4AJ6A 3IDVA 3QAVA 4JR6A 5AIVA 3CSHA 3LJRA 2R6KA 3DRNA 2EIQA 5ECIB 3FHKA 1B4PA 4KB3A 4AF2A 3RDWA 4DEJA 3I9V2 2IMEA 1TW9A 1SK2A 3L9VA 5IOWA 3IXRA 4KCEA 1JZRA 2RM5A 2CVDA 4NAXA 1IYIA 4HI7A 1OC8A 2HRNA 2VD0A 4DSQA 2PBJA 4V2LA 3FR6A 4PGTA 11GSA 2XBIA 4IS0A 1R7HA 2X8HA 4K6XA 3HA9A 2H30A 4ZB8A 1FVJA 1F3BA 3HCZA 1ML6A 4MJBA 2TIRA 4GQFA 2JSYA 1YY7A 1PSQA 3KGKA 1GSSA 1HNCA 2C3TA 1CQHA 5D73A 4MABA 1S3DA 14GSA 1N8JA 3BD2A 1XVWA 1J9BA 1ON4A 1EGRA 3UMAA 1E6BA 2MMOA 2JACA 3TKSA 1GTUA 2H76A 4TR3A 4K1FA 3TB2A 2VUPA 5CREA 5LD0A 2RIIA 3BCIA 2XPDA 1TI1A 3QCPA 4I5QA 1AXDA 4IW9A 2FUG2 2FWFA 3QOUA 4KCAA 2B5XA 4IP6A 3CSJA 1TTZA 1A8LA 4F9ZA 3N5OA 3E9JB 2JADA 4IQ1A 4MJEA 5CNWA 4ZBBA 1U3AA 1MDKA 3GRXA 4K7IA 4BVXA 4JE1A 2BJXA 1OYJA 1JLVA 3EINA 5D9VA 1O73A 4E8EA 3D22A 3JCML 3IE3A 1E2YA 2GSQA 2WZ9A 3ZTLA 1J08A 5ECMB 3J7Yb 2GS3A 2IN3A 1GRXA 4BWSA 5IMDA 1EZKA 4N0VA 3RPNA 2H66A 3TJFA 4GXZA 1GSYA 3CRTA 1V98A 5ECLB 2YZUA 3EVIA 2H74A 1JZWA 5G1KA 2HZEA 1K3LA 1XIYA 1MTCA 1IYHA 1AC1A 5CP1A 2YWIA 1GSQA 1FOVA 2AJQB 3QFBC 1X5CA 3H93A 1TP9A 1BG5A 2V2GA 4XHMA 4Q5RA 1SYXA 5IQYA 2H19A 1SJZA 3K8NA 2LQOA 1SKSB 1AW9A 3GUSA 1Y6EA 3IK7A 1JZDA 2H6YA 2XC2A 3HVSA 2FY6A 2M80A 1M2DA 3TJGA 1OE8A 4L5LA 4MF7A 1X9MB 3IR4A 1BQ7A 1THOA 4JEDA 5JCUA 4IKHA 3GURA 2FA8A 1TU7A 3IAS2 2LEGA 4OO4A 5CRHA 1UA5A 5DAKA 3F3QA 4OFMA 2VCWA 2P0GA 3S9FA 5ECHB 2GLRA 3RHBA 1A2LA 1ZYEA 3ZFLA 5IOXA 1BAYA 4DSSB 3TJKA 3TDGA 4V1Ap 2AV4A 3RAZA 2NPBA 3FZ9A 3O3TA 2WJUA 5HQPA 2CV4A 4KDXA 2B7KA 1GTAA 5D9TA 2YV9A 3ZZXA 2K18A 3LWAA 4KE3A 3GKKA 4ECBA 4J2FA 3UL3A 5ABRA 2LNTA 4OCFA 4IHUA 5H5QA 5GZZB 3F63A 1PA3A 2CAQA 2FWHA 3KTBA 3C71A 1SL2B 1X5EA 2D2ZA 3NZNA 1Q98A 3GMFA 4RI7A 1V57A 2YWMA 2H6ZA 4ZIJA 1XW5A 2TRXA 2QSIA 4WR4A 5J3RA 1F3AA 1WPIA 2IPAA 4POMA 4WETA 3ZITA 3M9KA 1WRYA 4Q5QA 2LRCA 3HJMA 2CT6A 1TXXA 1ERUA 6GSVA 3C1RA 2B1KA 1GWCA 4LL4B 5B7CA 1GUKA 4MZWA 2O85A 1W4VA 5IPGA 2ES7A 5JWQB 1GSEA 2CX3A 5IMFA 1WMJA 4XRDA 5EY6A 1EV9A 1KEBA 5EVOA 5ECKB 1EWXA 5CYYA 2O89A 3TKSE 3TKSC 2FHEA 1TK8B 5HR3A 3C8EA 1H75A 5G5FA 4F82A 1X5DA 4KGIA 2IIYA 1V58A 1U6TA 2VAFA 2LSTA 1SENA 1THXA 1UN2A 1MEKA 2JZRA 3DIEA 4JR4A 4N0ZA 2YCDA 1O81A 4I2TA 4IVFA 2WCIA 8GSSA 1WE0A 3LORA 1EEJA 1M9BA 2CVKA 3O6TA 1K0BA 3HZ4A 4HJMA 2C0FA 1QFNA 3GH6A 2PGTA 2MYGA 2DC5A 2H0HA 3W8JA 4I2UA 1PRXA 1M0UA 3H79A 1AAZA 4MPGA 10GSA 4XS1A 4KNDA 4NMUA 3TUEA 1GUMA 3P7XA 3LXZA 2LJRA 3I6AA 1GSFA 3DEXA 2O7KA 2VCQA 3M1GA 3QAGA 2IWTA 2R37A 4O7HA 2WULA 4DVCA 1G6YA 3MAKA 3UBLA 5AGYA 2REMA 3BCKA 4N11A 2VL2C 2VM1A 4GSTA 4TKYA 1URMA 1TRSA 2IL3A 1FG4A 1VF3A 3GL3A 3L9UA 1EV4A 4X0XA 3F4RA 2I81A 1V9WA 2XBQA 3F6DA 2WDUA 4XTSA 2MMAA 3WT2A 5GAND 2H70A 4YAVA 1XWKA 3WT1A 1PMTA 5B8BA 3UIWA 3GX8A 4ZL7A 5J41A 4XS6A 3DWVA 1ZYQB 2N5AA 2AB6A 3A5WA 2DJ3A 4GCIA 3GNJA 1LU4A 1JHBA 4KX4A 1RQMA 3TOUA 5IMAA 2FNOA 4ZB6A 2IJYA 3CBUA 2LJAA 3GSTA 2C3NA 1YKAA 3PR8A 4K8MA 4NHWA 1MDIA 2OACA 1ACVA 2VL9A 1OAZA 2K8SA 2L6CA 1SYRA 4J56E 3IC4A 4BPYA 1F37A 2YN1A 4TRXA 2N5FA 2BMXA 2WRTA 1FVKA 1O8XA 2DIYA 5ECSA 1YZXA 4N10A 2X99A 3H8QA 1ABAA 3ZL5A 2M46A 5B6MA 4HZ2A 2CAIA 4POBA 4EDYA 3KH9A 3M8NA 1RK4A 3WGDA 2DMLA 5J4UA 1PL1A 3Q74A 3KD0A 4ZBAA 5D8IA 1DSBA 5KN0A 1VF2A 1B9XC 2HI7A 3TKQA 2NDOA 2PN8A 1K0NA 3ZIVA 3IOSA 2GZZA 2GVPA 2ZCTA 2FWEA 2M72A 4K0GA 2HZEB 1ZMAA 1XOAA 2EC4A 4G19A 2AYTA 5HR1A 4GF0A 4KSMA 3FEUA 5F8BA 1O8WA 3QPMA 1EOHA 4V1Ag 5A5KA 4XS4A 2FWGA 1AQWA 5G1LA 4PNGA 5AIXA 1TOFA 3DYRA 3MWHA 2OE3A 2LQQA 1LBKA 3LFLA 4EC0A 4ZL9A 4WR5A 5GSTA 4J57E 5JCWA 3HD5A 3GHAA 2C80A 4HDEA 3FW2A 2JZSA 2H01A 3CRUA 2H8LA 5DQSA 1NSWA 2LNSA 5ELAA 5D96A 1O7UA 2YV7A 2EIOA 3UVHA 6GSUA 3PGTA 2KP2A 4EVMA 3KCMA 3HZ8A 3AY8A 1N2AA 3KMOA 5FWGA 5KN2A 4HUAA 2H1GA 5DAKB 1K3YA 4YH2A 3ME7A 3D21A 1FB0A 2NVLA 3I69A 1SJIA 2C0DA 4KH7A 5DBQA 1WWJA 2FD3A 3DMLA 4JBBA 3DVWA 2GSSA 3EE2A 3FK8A 1ERVA 4K7NA 1NM3A 5F06A 4ID0A 3ERFA 3M9JA 3F0IA 4WKWA 1BYEA 4MDCA 2GSRA 1TRUA 5F0GA 5DJMA 1U87A 1TDIA 4ULXA 4MJCA 5GAPD 2WB9A 3QAWA 2X8CA 1UVZA 3RPPA 3L78A 3GA4A 2IFQB 2VCXA 1MDJA 4FYCA 1SKRB 1R5AA 4Q5NA 5KN3A 2FA4A 4CW9A 4KDYA 3TRPA 2H71A 3FR3A 2YWOA 1AQXA 3KXOA 2LTKA 2VL2A 3VWUA 3GTUB 4FYUA 5H5RA 1ZGNA 1BJXA 2RUEA 1H4OA 1T8EB 4WEYA 4YAPA 1T4ZA 1V2AA 1GTIA 1YJ6A 2J9HA 3J7Yk 1KBNA 3HVXA 3D0ZA 2E2GA 5D9XA 1PX6A 1GUHA 4K0NA 22GSA 3CXGA 1FHEA 5EPFA 4HU7A 5A4WA 2H6XA 2OE1A 3GL5A 3VFIA 5LCZA 3WYWA 2H1DA 13GSA 3DVXA 1R5PA 2VO4A 3UEMA 1BEDA 3TKRA 1Z3EA 3GN3A 1FAAA 5G2ZA 5LNKe 4MMMA 3ZFBA 2LV3A 2ALBA 3GFKA 19GSA 3Q19A 4ML1A 1XWAA 1SU9A 2N5BA 2TRCP 4PUFC 2YANA 1K0CA 4Q5FA 5IMCA 2OKAA 3VPTA 18GSA 3IV4A 1OKTA 3EMPA 4K7OA 3H1NA 6GSSA 4ECIA 4HOJA 4DSRA 4L0UA 3FZ4A 1T00A 4K2DA 3TJJA 4ZBDA 2QC7A 1M2AA 1A0FA 3ZVJD 4H86A 5IMVA 5C00A 3IRAA 3KJYA 4AJ8A 1B4QA 2IMKA 2IFQA 1ILOA 5DCHA 2DMMA 1XPVA 4NPBA 2GT6A 4TR1A 1PN9A 4F0BA 2ON5A 3VURA 2L5LA 4TN8A 2B7JA 2L57A 1OC9B 4QQ7A 3FZAA 4ECJA 2CVBA 5JCGA 3GTUA 3D6IA 2VD1A 2KLXA 3MSZA 1XOBA 2VOCA 4L8EA 1AUCA 5DJLA 3G9BA 4O92A 2P5RA 1EP7A 1LJRA 1WP0A 4WXTA 1J0FA 1EP8A 1T4YA 3TJBA 4ILFA 1ZCPA 2VM2A 4OFNA 2MMZA 3RBTA 4BWQA 4PNFA 5CRWA 2NTOA 5COHA 3ZYWA 4TOPA 1A2JA 1GL8A 3HHVA 2JL4A 1GP1A 2C1YA 4MP4A 2EIRA 2HE3A 5JWRB 1A0RP 2ZUPA 3BBYA 3LYPA 4G9HA 1WIKA 1T1VA 3IPZA 3VI7A 1WJKA 2PVQA 2I9HA 3F4TA 2E2MA 2GSTA 2VLVA 1NHYA 1DBYA 1Q4JA 1R26A 4PQ1A 2C8UA 1MD4A 2MBSA 4HQZA 3IHQA 1QK8A 4EL1A 3VWXA 5G31A 3GSSA 1U3IA 5J5NA 2H75A 5G5EA 5ELGA 1XWCA 5ENUA 5B8AA 1ST9A 4ML6A 4MLYA 5E4WA 2KHPA 3WD6A 5ECNB 1GSUA 2DJKA 4WBRD 1TKDB 2V6OA 3MDKA 1TRWA 4MA9A 1GLQA 3VI5A 3A2WA 3I43A 1GULA 3WGEA 1CQGA 4ZL8A 4POLA 2NBSA 4GTUA 5DVBA 2H1BA 2A2RA 3F4SA 1ZL9A 1XZOA 4KAEA 4BL7A 4KSOA 4JRRA 3F3RA 4XS4B 2R2JA 2A2SA 4L0WA 4NV5A 4IGJA 4YQUA 3NOFA 3R2QA 3LQ7A 4OCEA 1OC9A 1FB6A 2LRNA 5KEJA 1ERWA 2F8FA 3G7JA 3LXTA 4ACSA 3D4MA 2DJ0A 3IK9A 1Y25A 2DJ1A 2L59A 4V2NA 3ED3A 3A2XA 3KEBA 2OBIA 1AQVA 3UBKA 1XXUA 2GDRA 4I97A 2FCHA 3F6FA 1SD9A 5HFIA 5F07A 4NXIA 4XCSA 2PUKC 4AJ7A 1K0MA 1SKWB 3QD9A 1HYUA 3EU4A 3HYPA 1FO5A 3EYTA 5KN1A 4TR0A 2OADA 4L5OA 1JFUA 4KUNA 1B9YC 3HY2A 1M2BA 1HNBA 4OD7A 1A24A 1V40A 3CYNA 4OMVA 1FW1A 4E8HA 1XCCA 2GZYA 2DSAA 3FY7A 3TCOA 5C04A 3GX0A 2HSYA 5JWOB 5F05A 5J9CA 2PMTA 4GSSA 2F8AA 4RQRA 1OVNA 2X64A 1Z7RA 1GNEA 2B5YA 4LMWA 2J23A 3EURA 5DALA 3IBHA 2FGXA 2WS2A 3GYKA 1O6JA 3NIVA 3DXBA 2B1LA 5ECRB 1W89A 3ERWA 3G7IA 1MD3A 2F9SA 5ECPB 2E7PA 1GSDA 5HR2A 2XHFA 3ZVJA 1C72A 5IIZA 4MZBA 5CRDA 1UC7A 1K0OA 2L6DA 4MZCA 4N30A 4FH8A 2CZ3A 2PPTA 1BX9A 3P8WA 2L4CA 2P31A 1TJDA 3KP9A 9GSSA 1PKZA 1NW2A 4F2IA 1A23A 3QR6A 5ECOB 3SBCA 4FO5A 2B5EA 1QGVA 2B3SA 3L4NA 1SL1B 1I9DA 2GQKA 1DE1A 4PQIA 2CX4A 2A4VA 1PD21 2O87A 4K9ZA 2I1UA 1QXHA 1PGTA 1TK5B 5IO0A 16GSA 2V6KA 5A4UA 3ZRDA 1S3AA 3IAM2 3MNGA 3UAPA 4FYBA 5D9WA 1X0RA 1U88A 3HKRA 1QQ2A 4RUVA 4RI6A 4D73B 2WGRA 4GQCA 2I4AA 4OFTA 4BA7A 2GT5A 2XPEA 3UVTA 5ID2B 2VIMA 4GRFA 3KMNA 2MBTA 2FLSA 3EC3A 1NHOA 4MCUA 4IELA 3FZ5A 4KDUA 3CSIA 3GV1A 4I8BA 2PERA 20GSA 3VWVA 2C3QA 5IMZA 3WGXA 3F9UA 2R3XA 4IBPA 1EEMA 4RQXA 5A4VA 4GSNA 4KA0A 4TR1B 3C1SA 4O32A 2HFDA 1JZOA 3ERGA 1USBA 3KM6A 1A2MA 2VCTA 3M0FA 1I5GA 3ME8A 4G2EA 5CAXA 3TRQA 4TXOA 4ZILA 4EDZA 1OC3A 2RUFA 3FYGA 4IJ3A 3APSA 2V41A 3L0HA 2L5OA 1VGLA 2DBCA 1ZOFA 2PVOC 3ZREA 2K9FA 2P5QA 1F2EA 1OKDA 1KTEA 2GZPA 6GSWA 4ECCA 1EGOA 2HXKA 3LYKA 3US3A 3APOA 2HT9A 1R4WA 4PXOA 3N9JA 2YOIA 2IMFA 4HZ4A 2CQ9A 2C0GA 3VPQA 1AIUA 4YQVA 3D5JA 4MF6A 1HNAA 3GIXA 4LL1B 4TR4A 1PKWA 4X43A 4JU5A 2F3MA 1YQ1A 3LSZA 3D4TA 1EOGA 4XIHA 1GTBA 2HLSA 2OBKA 3LGCA 4OO5A 1G6WA 5L71A 2VCZA 4WF4A 2PU9C 3E3EA 4F0CA 4HQSA 1YF0A 1SK0A 2VCVA 2OE0A 2H0GA 2GQLA 1XW6A 4NV2A 3IA1A 4O5RA 1KNGA 3TGZA 4CHSA 4D73A 1PX7A 2RM6A 4EUYA 1XWGA 2HRFA 4LMVA 6GSYA 1SL0B 1YF1A 4PX1A 5ID2A 4NWYA 3ISOA 4QL7A 2K8VA 2JZTA 3PH9A 2HZFA 2MMNA 4LLRA 3HXSA 1SJ6A 3GKXA 3Q18A 4GWRA 4ZB9A 5DDLA 1VRSD 2LKUA 4MK3A 3W6GA 4PURA 2QKEA 3LG6A 3FR9A 4TW5A 2H72A 3U6VA 4MPFA 1DUGA 1WOUA 2K6VA 3EU3A 1SD8A 4TXVA 3VWWA 1T3BA 1XVQA 1GLPA 4F03A 3TRXA 3KP8A 3CTGA 2YZHA 2KUCA 1M7TA 3H4KA 3G7YA 1F9MA 2HYXA 1M9AA 2HNLA 2JSZA 2OA7A 1G7EA 4X1UA 3QMXA 4I6XA 1TRVA 3FKFA 4EO3A 3LEFA 2H0IA 3U5RE 1F6MC 2WFCA 3C73A 4WF5A 2DJJA 4KW6A 2YWNA 5HFGA 2LJKA 4EE0A 2L4QA 1B8XA 3ZLPA 1TK0B 3EMXA 2VL3A 3P90A 2ZNMA 2H1AA 1XWBA 1JLWA 4HU9A 4MH2A 3DKSA 5AN1A 1Z9HA 2VLTA 2YNXA 3VK9A 1O85A 2YJ7A 3RHCA 2G2QA 2R4VA 3BOAA 3QFAC 4MH3A 1YKCA 1K3OA 2YJHA 1ZZYA 4MF5A 5AISA 2MZCA 2O8VB 2OJLA 2CA8A 1DE2A 2HSHA 4YQMA 2AHEA 3EWLA 4POKA 2Z9SA 4XRAA 3O76A 4MJAA 4PQHA 3ZMKA 3TOTA 1Z5YE 3GKMA 1M99A 3L9SA 5DQYA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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