5D93A

Oxidoreductase fragment of mouse qsox1 in complex with a fab fragment from a mouse qsox1-specific antibody
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
240
structure length
240
Chain Sequence
MSVLYSSSDPLTLLDADSVRPTVLGSSSAWAVEFFASWCGHCIAFAPTWKELANDVKDWRPALNLAVLDCAEETNSAVCREFNIAGFPTVRFFQAFTKNGSGATLPGAGANVQTLRMRLIDALESHRDTWPPACPPLEPAKLNDIDGFFTRNKADYLALVFEREDSYLGREVTLDLSQYHAVAVRRVLNTESDLVNKFGVTDFPSCYLLLRNGSVSRVPVLVESRSFYTSYLRGLPGLTR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Overcoming a species-specificity barrier in development of an inhibitory antibody targeting a modulator of tumor stroma.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Sulfhydryl oxidase 1
source organism Mus musculus
molecule tags Oxidoreductase
total genus 75
structure length 240
sequence length 240
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 1.8.3.2: Thiol oxidase.
pdb deposition date 2015-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
A PF18108 QSOX_Trx1 QSOX Trx-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5d93A01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5d93A02
2FUG2 3QD9A 3FZ4A 1BAYA 1X9WB 3O3TA 4NMUA 2DJJA 8GSSA 2V32A 3H93A 2YV7A 3UARA 4TOPA 2H6YA 5ECOB 2B1LA 2R37A 5HFGA 2C0EA 1YQ1A 1VGLA 3WGDA 1I5GA 3IK9A 1RK4A 2VD0A 2WB9A 1ZYEA 1AUCA 3QPMA 4ZXGA 1V9WA 4FH8A 2AAWA 2VL2C 2H74A 1ERUA 4FYUA 3EVIA 2KP1A 3HVXA 2F8AA 3TCOA 4RQRA 5J9BA 2WZ9A 2EIOA 1J0FA 3QAWA 4KAEA 3QOUA 1JLWA 5J3RA 1A24A 4RQXA 3BD2A 5ID2A 3FY7A 1THOA 4XS6A 3GX0A 4ID0A 1A8YA 4BA7A 4YQUA 4MJCA 2FD3A 2VCVA 4TR1B 4HOJA 1PL2A 3D4MA 4LA1A 3HY2A 1EGOA 1OC8A 2FNOA 1GTBA 3F8UA 3I9V2 1U88A 4ECBA 3C8EA 4I6XA 5D9WA 3V1WA 3F63A 2AUVA 5IMAA 2HZEA 4QL9A 1F3BA 2E0QA 4PGTA 3D21A 2JZSA 2FGXA 2H1DA 1N8JA 3LORA 1GL8A 1QMVA 4NV5A 2DLXA 3TJBA 1O81A 3VLNA 2TRCP 5JWRB 5DALA 5ECQB 4MF6A 3KMOA 3DVWA 1T1VA 1U6TA 5AISA 4E8EA 4O7HA 3ZLPA 3NIVA 4F9ZA 5CRGA 3HJPA 2XBIA 2ON5A 4MDCA 3JCML 3DEXA 5IMZA 2FWHA 3G7IA 1Z3EA 3D0ZA 3GV1A 2I9HA 3QCPA 2IFQB 4TVEA 5COHA 4IS0A 4XIHA 2DJ0A 3IAS2 1OYJA 3F0IA 2KP2A 2RIIA 5ECRB 4ILFA 3UL3A 4GXZA 2L6DA 1BX9A 4I2UA 5DJMA 2GSSA 2HT9A 3LXTA 1FO5A 1YEPA 1ILOA 1KBNA 1JFUA 3IDVA 2X64A 2F9SA 1J08A 3QAGA 1A2MA 1XWBA 4RUVA 1SYRA 3QFAC 3E9JB 4HZ4A 1KEBA 3RHCA 1PSQA 1WP0A 4Q5FA 4JE1A 3KJYA 3ZVJA 1K0MA 5ELGA 1GULA 3GTUB 3GFKA 5ECMB 4GWRA 2E7PA 1ERTA 3WT1A 5F06A 4MZWA 4EL1A 4MJAA 4PQIA 1BYEA 2B5EA 5B8AA 4GQFA 6GSXA 2DMLA 1B48A 1EP8A 4KA0A 1NHOA 4DVCA 1O8WA 2IWTA 2L5LA 1GUKA 1SK2A 2CV4A 1X5CA 2H0IA 5AGYA 1GNWA 5EVOA 4MPGA 2LV3A 3ZL5A 4EC0A 1U3AA 4V1Ag 2R4VA 4O32A 3BJ5A 3KTBA 4F03A 4TKYA 3H8QA 1VF4A 3KP9A 1FB6A 3F3QA 4OCEA 3VWUA 2PN8A 2X8CA 5CRHA 1S3DA 3M1GA 4BWSA 3F3RA 4J57E 3P90A 3A3TA 5IQYA 1ON4A 2G0FA 3QFBC 2QSIA 5DQSA 1JHBA 1N2AA 4IN0A 6GSYA 3LWAA 1TDIA 1AQXA 3HVSA 2EIQA 1EZKA 2DSAA 3O76A 1TKDB 2CVBA 4MH3A 5ECHB 4WR5A 1E2YA 5KN0A 3BCKA 5ECPB 2PVQA 1G6WA 1WWJA 1TP9A 1XWGA 4K7OA 1O7UA 1XWKA 2OE0A 3GX8A 3DKSA 1EGRA 2CZ2A 1ZMAA 1HNCA 2HRNA 1JZWA 2VOCA 3MNGA 4HQSA 4KCAA 3TKSE 2WJUA 2VLVA 1T7PB 3APQA 2GZPA 5DCGA 5IPGA 2M80A 4MZBA 4MLYA 1B8XA 2V1MA 3CSIA 3UBKA 2PPTA 3C71A 5D8IA 1EWXA 4RI6A 4OCFA 1SL2B 1TTZA 5E59A 1B9YC 1S3AA 2J23A 2LTKA 1X5EA 10GSA 5KN3A 2LJAA 4IW9A 5GAPD 3RPPA 5JCGA 1BEDA 5D96A 1RW1A 1EEJA 4XS4B 1SENA 3TJKA 2E2GA 5G31A 3M9JA 1GLPA 3L4NA 3MWHA 1TXXA 1F37A 1WMJA 2NVLA 5A4WA 1VF1A 2DC5A 4GLTA 3VI5A 4MPFA 2AJQB 3HVVA 3CBUA 4MJBA 4OD7A 3VWWA 4KSOA 4KB3A 1XVWA 2VCTA 2DJ3A 4MZCA 5J41A 1XW9A 3IPZA 2DJKA 1Z6NA 3DWVA 3KM6A 1X9MB 2IMIA 1PRXA 4YQVA 2H76A 3CSHA 5H5QA 4MJEA 1A0FA 3ZRDA 4HJ2A 2C3NA 4JR6A 4TXOA 3D6IA 4K0NA 1GSSA 2LEGA 4IVFA 1QFNA 2PMTA 3J7Yb 4OO5A 3GKKA 3ERWA 4EE0A 1UA5A 1SKRB 1V98A 2XHFA 4IJ3A 1YEXA 4N10A 5HR3A 2O85A 1XCCA 2B5XA 2P5QA 2I3YA 2MYGA 4Q5NA 1O73A 3HA9A 1TRVA 4OWYA 2ALBA 4N30A 1XOBA 2FLSA 3N9JA 5JCWA 2GSRA 3HZ4A 2LRNA 1K3LA 3TKSC 2NBSA 3DD3A 1OC3A 3S9FA 3LG6A 2M72A 2C0GA 2GSQA 4JEDA 1IYIA 2ZNMA 4GF0A 4H86A 3HZ8A 3D5JA 3G7JA 1B4QA 1GSFA 5AN1A 1HNAA 3MAKA 2V2GA 2WFCA 2HZFA 4V2MA 4TXVA 2FWGA 3LYKA 4FIWA 5G1LA 4ZL8A 3A2WA 4ISDA 2I81A 4K9ZA 4MH2A 1A8LA 3FR9A 1OE7A 2DIZA 3UJ1A 3EMPA 1QUWA 1XBSA 2ON7A 2YJ7A 2LSTA 3O6TA 2PGTA 4HS1A 1K0BA 3F4RA 2CT6A 3L9UA 3VWXA 2L6CA 4WF4A 2GS3A 4L0UA 1F3AA 2YWMA 2MBTA 5G5EA 1QXHA 2K8SA 3MSZA 1BQ7A 4XS1A 4GCIA 4EDYA 5HFKA 4WETA 2A2RA 2C4JA 5F8BA 2X8GA 4Q5RA 2QKEA 3GIXA 4POKA 3FZAA 5IM9A 1W89A 5HR0A 1Z7PA 1TJDA 1SYXA 4K0GA 4ECJA 2IIYA 2H8LA 3WT2A 2C80A 4IGJA 5CNWA 4O92A 4TRXA 2C1YA 5HFIA 4GSTA 3BBYA 1TU7A 4KH7A 3RDWA 4ZBBA 3FZ9A 4N0VA 4OFMA 5GSSA 1DBYA 2DJ2A 2HSYA 2TIRA 3FW2A 2GZYA 4ML1A 1TRWA 4PUAA 2IMDA 5ECLB 1V58A 5ID2B 1KTEA 3EU4A 1X0RA 4YAVA 2EC4A 2NTOA 2VM1A 2XBQA 1TI3A 3GL3A 4V1Ap 1EOGA 2RUFA 2YWIA 1UC7A 2JADA 4BL7A 1GTUA 3GYKA 1Q98A 1U3IA 2H70A 1AAZA 4JRRA 3WYWA 4XHMA 3PR8A 3L9SA 3ISOA 3UOMA 6GSUA 5IMDA 1SL1B 6GSVA 2I4AA 1PX7A 5ECKB 1MTCA 5B6MA 2P5RA 2F51A 4CDOA 1SD8A 4LMVA 4KUNA 2CX3A 4POLA 2C8UA 3QR6A 3F9UA 3H79A 3UVHA 4D73A 3FHKA 4TR4A 1OC9A 2HI7A 1WOUA 3P8WA 3DIEA 4WBRD 2MMZA 4I8BA 1XWCA 3IOSA 5KN1A 2X99A 1THXA 2JU5A 1BJXA 3I43A 18GSA 1O8XA 3G9BA 1A2LA 4LL4B 4KNDA 4LLRA 1Z7RA 3EINA 4I97A 2CVKA 3RAZA 1K3YA 5DJLA 3RBTA 5KEJA 3C1SA 2IPAA 3KIJA 2KHPA 2CAIA 3L9VA 2VD1A 5G1KA 2B3SA 3VPQA 3F4SA 3F4TA 3ZFLA 4IELA 4FYCA 5CRDA 3TJJA 3FR6A 2YANA 1GUMA 2VM2A 2GQLA 5DAKB 4F0CA 5H5RA 1PN9A 1M2AA 5IOXA 1V40A 1ZGNA 1XW6A 5D9XA 3TRQA 3ZFBA 1J9BA 3GTUA 4G9HA 4F82A 1DE2A 2VCZA 2PERA 2GSTA 2WS2A 4G10A 1Q4JA 3US3A 4TR3A 1SK0A 2H30A 1NW2A 2H6XA 2C0DA 1JZDA 4BWQA 3C1RA 1ML6A 3IAM2 2HLSA 3ERFA 5IOWA 2P0GA 4OFTA 5G2ZA 2GQKA 3TOUA 2F8FA 1HYUA 3VI7A 2AHEA 4YH2A 3UVTA 2N5FA 3TGZA 1V2AA 3TJGA 4WBJA 2HNLA 11GSA 5AIXA 4WEYA 2A4VA 3QDNA 2LRTA 2V41A 4OO4A 4GSSA 3NZNA 2O87A 3ZVJD 4PX1A 4J2FA 1SJ6A 2FA8A 3DGQA 1GTIA 3GN3A 2H1BA 2PUKC 4EXJA 5FWGA 2IL3A 4KGIA 2K18A 1SJIA 1M99A 1EOHA 1YZXA 2K6VA 4N0ZA 3IC4A 6GSSA 3H1NA 3ZZXA 2OBIA 1FW1A 1VF3A 2I1UA 2FWEA 2OACA 2XC2A 2YWNA 4ECIA 3HJOA 2MBSA 2P31A 4X0XA 2L4CA 6GSTA 4NV2A 1EEMA 2PBJA 2NPBA 4DSSA 3FK8A 2X8HA 1GLQA 2WCIA 2ES7A 1K0CA 3C73A 2GT6A 3LQ7A 2B6MA 3GRXA 2YWOA 5G30A 3FKFA 2VO4A 2YCDA 3DRNA 3HHVA 4HQZA 4EO3A 3VWVA 4XRDA 5GAND 5GZZB 3UMAA 3NOFA 4IP6A 3GUSA 4ZB9A 4E8HA 1H75A 1AQWA 2KOKA 3UEMA 3ZIJA 4EUYA 2MMOA 2AYTA 1YF1A 4HU7A 1K3OA 5ECSA 5ECNB 2H73A 3K8NA 4K2DA 1O85A 2AV4A 1ERVA 1DSBA 1FAAA 1H4OA 3LGCA 1DE1A 3UAPA 1V57A 2FCHA 2YV9A 4NXIA 3LXZA 4MABA 4J56E 1XXUA 2TRXA 2WRTA 1R26A 5C00A 4XS4A 5JWOB 3TOTA 1QK8A 3LFLA 4KDUA 5D9TA 4IHUA 3GKMA 1XIYA 1YKAA 3APOA 1GSQA 2HRFA 4HZ2A 2IJYA 4G2EA 1WE0A 3SBCA 4KCEA 2D2ZA 5KN2A 1MDJA 2H66A 2Z9SA 3M0FA 2VL2A 4IQ1A 1CQHA 1JZRA 2O7KA 3QMXA 2GTUA 3TUEA 2B7JA 3GL5A 3KP8A 1YDKA 4F2IA 1PQNA 3RPNA 3M9KA 3EU3A 4EVMA 2GDRA 1IYHA 3RHBA 5EL8A 1GWCA 4AF2A 3HDCA 4JU5A 3E3EA 1TK0B 1TOFA 3KH9A 3SWLA 4QQ7A 1XW5A 5AIVA 1TW9A 1I9DA 17GSA 3LEFA 2IN3A 5DVBA 2FY6A 4AJ6A 2ZCTA 2IMFA 3IV4A 4AGSA 4X43A 2DJ1A 4TXOB 1Z6MA 2O89A 1U87A 4NWYA 1JZOA 2C3QA 2H0GA 3TRXA 5ELAA 2VL9A 4L5LA 2AB6A 1G7OA 2VCXA 3TKPA 1TI1A 5EY6A 3WGEA 1WPIA 2B5YA 2OBKA 2KLXA 2GGTA 1S3CA 4KX4A 3PH9A 4TR0A 4X1UA 5CP1A 2EIRA 4LMWA 3I69A 4KE3A 1MD3A 1XOAA 1FVKA 2DMMA 4POBA 1TRUA 1Z5YE 4PXOA 4AJ8A 4IP1A 1F6MC 1GSDA 3IXRA 2YZUA 4ZBAA 2H19A 4XTSA 2OE3A 1M9AA 1PA3A 4JR4A 5HR2A 3EMXA 4K7IA 2DBCA 2CA8A 4WXTA 2PU9C 3M3MA 2VCWA 5B8BA 1FVJA 4WF5A 1X9SB 5JCUA 2H1GA 1DUGA 3VK9A 1XPVA 1PKZA 3I6AA 1MDKA 2FWFA 2H72A 1HQOA 1B9XC 3H4KA 3FEUA 1WRYA 4GRFA 3WD6A 4ECCA 2R6KA 4P3YB 3GURA 4KDXA 1GTAA 2LNSA 3L0HA 1EP7A 3IR4A 3AY8A 2BMXA 1M2BA 5D9VA 4WKWA 3IRAA 4GTUA 5LD0A 3GSSA 4PURA 3GH9A 4O5RA 5CYYA 5B6NA 3P7XA 1SK1A 4JZQA 2J9HA 1PX6A 4KW6A 3W8SA 3LYPA 2B1KA 3Q6OA 4ZL9A 3U5RE 1SKSB 5LNKe 2RLIA 5INYA 4HJMA 1ZYQB 3TJFA 1USBA 1AIUA 3IA1A 5DDLA 1TU8A 3LJRA 5F07A 4I2TA 5DBQA 2H0HA 3G7YA 4GQCA 3HJMA 4TR1A 2GVPA 3HXSA 2WDUA 1G0TA 2K9FA 1YKCA 3A2VA 4YAPA 2N5BA 4XCSA 2R3XA 3KCMA 5FT3A 3WGXA 3BCIA 4NHZA 2N5AA 3GKNA 1G7EA 7GSSA 1R7HA 2LUSA 3FRCA 16GSA 5J5NA 3M8NA 2VIMA 1LU4A 4DSRA 5F0GA 3IK7A 1TK8B 1MDIA 5D73A 3U6VA 13GSA 3J7Yk 2HZEB 3QAVA 9GSSA 1W4VA 2C0FA 2H01A 3EWLA 2R5GA 3EC3A 2CAQA 2VLTA 3IE3A 2JL4A 4HUAA 4AJ7A 2JSZA 1XZOA 1A0RP 4ZILA 5CAXA 4N11A 5DALB 2MZCA 5L71A 5J4UA 2RM6A 5J9CA 2YP6A 3KTLA 2YPMA 2IFQA 4DSQA 4D73B 4ML6A 4PQ1A 1K0NA 3HYPA 2VAFA 3A5WA 1CQGA 3CTGA 1OC9B 1AC1A 4ULXA 1T4ZA 3KMNA 2WGRA 1BG5A 4HI7A 1K0OA 5JWQB 1SL0B 1HD2A 5C04A 4MK3A 4IJIA 4NAXA 1TRSA 3ZMKA 1ABAA 4FYBA 5H5SA 5CREA 3Q18A 4XRAA 2ZUPA 5IIZA 5D93A 1FG4A 2LNTA 2V6OA 1FOVA 4DEJA 2IMEA 2JZTA 5CO3A 3ZMLA 1R5AA 3GMFA 3W8JA 2YJHA 3CYNA 5DAKA 3TDGA 5ENUA 5IMVA 4CW9A 2QC7A 4EDZA 1YJ6A 1SU9A 3P2AA 3ZYWA 3TKQA 2RUEA 2YOIA 2E2MA 1ZZYA 2LQQA 3ME7A 4PQHA 3TRPA 2H75A 5IO0A 1GSYA 3VFIA 4NHWA 3GHAA 3ZREA 2LQOA 1T8EB 1SKWB 1MD4A 5A4VA 3L78A 1R4WA 2MMNA 1AQVA 4KDYA 2CX4A 2VCQA 4L8EA 2RM5A 4IKHA 4PNFA 3KGKA 1ZCPA 1OKDA 5A5KA 3CRUA 2F3MA 1NSWA 3ED3A 1ERWA 6GSWA 4OFNA 1R5PA 1OE8A 3F6FA 5EPFA 2FA4A 1UVZA 3W6GA 4K8MA 2HXKA 5B7CA 2VL3A 2H6ZA 4HDEA 1Y6EA 3R2QA 2K8VA 2VLUA 1PL1A 3HKRA 3D4TA 4FO5A 3KD0A 1VRSD 2L59A 4V2LA 4ZB6A 2JACA 2WULA 1FB0A 3Q19A 4I5QA 2OA7A 2YNXA 4K7NA 1GSUA 3C7MA 3CXGA 3KH7A 2YN1A 1LBKA 2B7KA 1WIKA 1WJKA 1URMA 3EURA 2HE3A 3ERGA 3UBLA 1G6YA 1OVNA 1VF2A 1F2EA 1A2JA 1GH2A 3TKSA 4MP4A 5IMCA 1XWAA 4GSNA 5F05A 2PWJA 2OE1A 14GSA 1OAZA 2LJRA 4L0WA 4TW5A 5ECIB 5HQPA 2LKUA 4Z7XA 2GT5A 2JZRA 3ZIVA 4ZIJA 5IO2A 2L5OA 3BOAA 5ABRA 2MMAA 5IPHA 1AXDA 22GSA 4DSSB 1Z9HA 4L5OA 3KXOA 4CHSA 3CTFA 3GKXA 2NDOA 4K1FA 1YY7A 4K6XA 3CMIA 3EYTA 5E4WA 1C72A 4BVXA 1SJZA 2REMA 2LJKA 1NHYA 1T00A 3ZTLA 2PVOC 3APSA 2O8VB 3TKRA 4G19A 3PINA 4QL7A 3OR5A 3GH6A 4ZL7A 4MMMA 1XFLA 2FHEA 1ZL9A 2GLRA 2R2JA 2OADA 2VUPA 1YF0A 2OKAA 20GSA 3VPTA 1GUHA 1T3BA 3N5OA 1T4YA 4TN8A 4KSMA 5CRWA 1F9MA 5HR1A 1B4PA 3DXBA 1M9BA 1PGTA 3D22A 2H71A 19GSA 3IHQA 3MDKA 4EF0A 1EV9A 2CQ9A 5G5FA 1QQ2A 1PKWA 12GSA 4MF5A 4PUFC 2V6KA 2H1AA 3HCZA 1E6BA 2G2QA 4V2NA 3F6DA 4ZB8A 5DQYA 3KZQA 3KEBA 1GP1A 2CVDA 4MCUA 4WR4A 2HFDA 1JLVA 2QGVA 2LS5A 1NM3A 1Y25A 1ST9A 3DMLA 1M0UA 4BPYA 2XPDA 2JSYA 4LL1B 3HD5A 2C3TA 1TK5B 2HYXA 4ACSA 2KUCA 2OJLA 3PGTA 1HNBA 1PD21 1M7TA 5A4UA 3Q74A 1GRXA 2GZZA 1ZOFA 3A2XA 3VURA 2XPEA 1UN2A 5FHIA 2GQMA 3LSZA 1GNEA 1PMTA 4IBPA 2BTOT 2BJXA 1X5DA 3UIWA 3GA4A 4ZBDA 4RI7A 1RQMA 1KNGA 3FYGA 1O6JA 2L4QA 2IMKA 2M46A 2YZHA 4EKZA 3GSTA 4NPBA 5LCZA 5IMFA 1LJRA 3FZ5A 2A2SA 4PNGA 4BVYA 3E0UA 1K0DA 1SD9A 4HU9A 4MF7A 1K0AA 3DVXA 4POMA 2DIYA 2CZ3A 2HSHA 3GNJA 1QGVA 4OMVA 4F0BA 1A23A 3DYRA 1ACVA 3ME8A 3TB2A 4Q5QA 3ZITA 1MEKA 1EV4A 3IBHA 3FR3A 4JBBA 5GSTA 4YQMA 1AW9A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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