5D93A

Oxidoreductase fragment of mouse qsox1 in complex with a fab fragment from a mouse qsox1-specific antibody
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
240
structure length
240
Chain Sequence
MSVLYSSSDPLTLLDADSVRPTVLGSSSAWAVEFFASWCGHCIAFAPTWKELANDVKDWRPALNLAVLDCAEETNSAVCREFNIAGFPTVRFFQAFTKNGSGATLPGAGANVQTLRMRLIDALESHRDTWPPACPPLEPAKLNDIDGFFTRNKADYLALVFEREDSYLGREVTLDLSQYHAVAVRRVLNTESDLVNKFGVTDFPSCYLLLRNGSVSRVPVLVESRSFYTSYLRGLPGLTR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Sulfhydryl oxidase 1
publication title Overcoming a species-specificity barrier in development of an inhibitory antibody targeting a modulator of tumor stroma.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
molecule tags Oxidoreductase
total genus 75
structure length 240
sequence length 240
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 1.8.3.2: Thiol oxidase.
pdb deposition date 2015-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
A PF18108 QSOX_Trx1 QSOX Trx-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5d93A01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5d93A02
3GL3A 1K3YA 2GT6A 2C80A 5G5EA 1B48A 2GZYA 3A2WA 5CREA 2E2GA 3EC3A 2VCWA 4PQHA 2H1AA 4XRDA 2JL4A 2FWEA 1EV4A 4MA9A 3U6VA 4ZBBA 2NDOA 4K7NA 2KHPA 3RDWA 2VCQA 1X5CA 2H66A 2CAQA 2E2MA 5D9VA 2HSYA 2R2JA 5IMDA 2OE0A 4TOPA 3QAGA 4OWYA 3ZIVA 4TXVA 3BJ5A 4GQCA 2B5XA 4TRXA 4WR4A 1R5AA 2CVBA 4ZILA 4TVEA 4TR1B 4AJ7A 2J23A 3TCOA 4I97A 3GURA 2L59A 3F6DA 5IMVA 1GSYA 3HA9A 5J3RA 2V2GA 1NM3A 5J4UA 1BG5A 1ZL9A 4F9ZA 1AXDA 1FB0A 4DVCA 1HNCA 1V40A 2RUEA 5ECKB 2PVQA 4YQUA 3APQA 4EL1A 2LRCA 3GH6A 4MF6A 2QGVA 2P31A 4PXOA 3DD3A 5GSTA 4ECBA 2H1DA 4O7HA 1R5PA 4N10A 3N9JA 4KW6A 4AGSA 2WFCA 2FWFA 1PRXA 4KE3A 4X1UA 4PX1A 2A4VA 2GQMA 5H5QA 3O76A 1RK4A 5ID2A 3C8EA 4MJBA 1XWAA 2CVDA 4OD7A 1PX7A 1K0BA 1YZXA 3A2VA 3TKSC 2FHEA 1TRWA 2K6VA 3VI5A 3F6FA 2LEGA 1ZGNA 7GSSA 2H70A 4IN0A 2IWTA 2F9SA 2X99A 5DALB 4HJ2A 3GMFA 1V57A 1F9MA 4J56E 2YV9A 4POMA 1Z6MA 4KA0A 3RPNA 2PUKC 2YV7A 1ZOFA 1TRUA 1A2MA 3MSZA 3UVTA 4DSSB 5DQYA 1SJ6A 2O7KA 1MDKA 1MEKA 2FUG2 2BMXA 2DIYA 3NZNA 1U3IA 5IMZA 1V9WA 4MP4A 1UC7A 3A2XA 3DIEA 5LD0A 2X64A 3GTUA 5F07A 1AIUA 3M9KA 1DUGA 4JR6A 4O92A 3CSJA 4NHZA 3F3RA 1R4WA 1TXXA 3GN3A 4HJMA 2RIIA 4YQVA 3G9BA 6GSXA 4MK3A 5B6NA 4Q5QA 2O85A 2YP6A 5ECSA 3GIXA 1NHOA 2LTKA 1EP8A 4PGTA 3RHBA 4I2TA 1FVKA 4GRFA 3E3EA 2PMTA 5F0GA 5HR1A 5FWGA 5B8AA 2DJJA 2FD3A 4KH7A 4KSOA 1O85A 3KD0A 1G7OA 1AUCA 4KAEA 4JR4A 4X43A 3D5JA 2DJ3A 1GUKA 5D9TA 6GSVA 5E4WA 1HYUA 3KEBA 3P7XA 5IIZA 5FHIA 3APSA 1T3BA 5GAPD 4KUNA 1S3AA 1SK0A 2H6XA 1AW9A 2H1BA 1K0NA 5CRHA 3QFAC 2AB6A 4JEDA 12GSA 2IIYA 1TK0B 3VFIA 1T1VA 3PGTA 1KTEA 1AC1A 2IFQB 1TI1A 1TU7A 4AF2A 1T4YA 2GSSA 3DWVA 2AV4A 4L0UA 4ZL9A 1XOAA 4OFTA 2K8SA 5IPGA 3QPMA 2FCHA 2N5FA 2GGTA 4I8BA 3LEFA 3C7MA 10GSA 3PINA 3TOUA 3MAKA 1K0CA 5DBQA 3ZREA 2PPTA 3H93A 4EC0A 1A23A 2K9FA 3QR6A 3L4NA 3WT1A 3TUEA 3US3A 3FW2A 3U5RE 2CAIA 3M1GA 1C72A 2KP1A 2R6KA 5DAKB 4NAXA 1FAAA 1A2LA 5G1LA 4FYBA 2AJQB 1EGOA 4ECCA 3ZLPA 2K8VA 5A5KA 4IW9A 4POKA 3ZMLA 1SJZA 3GX8A 3CTFA 1TW9A 5G31A 4EKZA 4O32A 1SYRA 3CSIA 3TJBA 3W6GA 1DE2A 3LYKA 1ZMAA 2O8VB 1KNGA 3HDCA 1PA3A 4MF7A 1GUMA 2QC7A 5HQPA 5A4WA 4FO5A 1XW9A 1Y6EA 3FZ9A 1WRYA 1CQGA 3KTLA 2NVLA 3F4RA 4MPGA 2C3QA 3F8UA 1DE1A 4XHMA 2GT5A 2P5QA 1A8YA 2OE1A 2B6MA 4K7IA 3V1WA 3F4SA 1JZWA 1TI3A 4I6XA 5B6MA 4MCUA 5ELGA 3TKRA 4AJ6A 3FEUA 1RQMA 1GTAA 2R5GA 1A2JA 2HXKA 4L8EA 4EUYA 3CMIA 3UBKA 1XVWA 1SL2B 1GWCA 3VLNA 3VWVA 1Z6NA 3KTBA 3I69A 3ISOA 1Q98A 5ECRB 4BVYA 1GTBA 1WPIA 1GSFA 1EOGA 4PURA 1XWKA 1JZDA 3J7Yb 3TKSA 2WB9A 1RW1A 4HEA2 5D73A 1DBYA 5D9XA 2OACA 2GSTA 1R26A 5G1KA 1ZYEA 3BOAA 2HI7A 5CP1A 1O8XA 1EZKA 3ZITA 2OBKA 4OCFA 4YQMA 3FZ4A 3L0HA 4G2EA 4RI7A 1BYEA 1FOVA 2HYXA 3IV4A 1ERTA 1K0MA 2GZZA 1ILOA 2C0EA 3D21A 4OFMA 4ZL7A 2LNSA 3HVSA 4N11A 3D4MA 4LA1A 1SD8A 4WBJA 22GSA 5KN1A 3ED3A 5IMAA 3E0UA 4WEYA 4DSRA 4YAPA 4J57E 1TKDB 3IRAA 1M99A 2HZEA 4ECJA 3VPTA 4K9ZA 1AQXA 5AN1A 3DRNA 3FR3A 19GSA 1OC3A 2LJKA 1OC9B 4HQSA 2K18A 2XBIA 1ERUA 4NPBA 1N8JA 4KB3A 1FO5A 2F8AA 3FK8A 4PNFA 4JBBA 5CNWA 1TP9A 1HD2A 2GZPA 5J9CA 4GLTA 3O6TA 1AQVA 1K0OA 4FYCA 5IM9A 5D8IA 4CDOA 1B4PA 1U87A 1Y25A 3KM6A 4XS1A 3NIVA 3BD2A 4K0NA 4ZL8A 3EYTA 2QSIA 3APOA 5IPHA 1JZOA 2VLUA 5EL8A 4IGJA 3IAS2 3Q18A 2EC4A 2HFDA 4BVXA 2LQQA 2ON7A 18GSA 2V6KA 3IA1A 2VCZA 4MF5A 1XW5A 3C71A 4JZQA 5ECIB 2F51A 4TXOA 3LORA 2WDUA 5JWRB 4MABA 3A3TA 5ECLB 4DEJA 2VM1A 2H19A 1VF4A 3HYPA 3P8WA 5GZZB 4HU9A 2VL3A 5IOWA 4HUAA 3ZIJA 1U6TA 2L5LA 4WETA 4KDUA 4HZ4A 1W89A 3FKFA 3RAZA 5ECPB 3UVHA 5KN2A 4FIWA 3KMOA 2P0GA 3L78A 4GXZA 2VCVA 3ERGA 3QAWA 4G19A 1Z3EA 2LSTA 1UN2A 1SL1B 2VO4A 2MMZA 3TJKA 3QDNA 1S3CA 5EPFA 1VGLA 2PU9C 3F4TA 1CQHA 1SK1A 3P90A 1T8EB 3UL3A 3EINA 2TRCP 5HR2A 4TR4A 3LYPA 2L6CA 4GCIA 3ZVJA 6GSWA 2LNTA 3DXBA 5DCGA 1BX9A 4EF0A 1GTUA 3DYRA 3QAVA 4ACSA 2H30A 1BJXA 2PVOC 3F63A 6GSTA 2V6OA 1M9AA 1E6BA 1F3BA 3ZTLA 1JLWA 3HJPA 5J9BA 4XCSA 5IOXA 1GL8A 2H0IA 4XRAA 1YEXA 4HQZA 2FWHA 2YZHA 1EP7A 2X8HA 4N0ZA 4LMWA 4KX4A 1TU8A 5EY6A 4QL9A 1F2EA 2LV3A 1HQOA 3W8SA 1TRSA 2RM5A 1PMTA 5HR3A 1QK8A 1SYXA 4EXJA 2HRFA 2I4AA 3O3TA 1IYHA 2R37A 1YF0A 5HFGA 3Q6OA 4LMVA 5IMCA 5KEJA 1O7UA 2H0HA 2X8GA 2NBSA 1PN9A 1FW1A 2D2ZA 1GH2A 4IHUA 3ZMKA 3CTGA 1TTZA 1SKRB 4OO5A 1M7TA 2A2RA 2L57A 4IQ1A 3JCML 3ME7A 2B5YA 2DBCA 5B8BA 1QUWA 4MLYA 2YWNA 4IKHA 2KOKA 1WE0A 3D0ZA 2NTOA 3A5WA 4L0WA 1EWXA 4TW5A 4I2UA 2WRTA 5F06A 1G0TA 3FZAA 5JCGA 1GUHA 4Q5RA 2O89A 1USBA 2RLIA 3VPQA 5B7CA 1PKWA 5IO0A 2H73A 4F03A 2H01A 5C04A 4XS4B 4XS6A 3PH9A 2OBIA 4NWYA 1PL1A 1ERVA 1XXUA 3IE3A 5CYYA 2OJLA 1GSSA 1O73A 1XVQA 3VWWA 3DEXA 4WR5A 1J0FA 1I5GA 2WZ9A 4I5QA 1KBNA 4IQAA 4D73A 3GSSA 1A0FA 5AIVA 5AGYA 5JWOB 1WJKA 3UBLA 2DMLA 4GTUA 4NMUA 1OYJA 1URMA 4WF4A 3F3QA 1AQWA 1OC9A 1WWJA 4HZ2A 1EGRA 3CYNA 3EE2A 3TKSE 2R3XA 5LCZA 3VWXA 8GSSA 2IMKA 2AAWA 3G7YA 2HNLA 1T00A 1VF3A 4BPYA 1A0RP 1X9SB 3W8JA 4RUVA 1NW2A 2OE3A 1LBKA 4MDCA 5ECNB 1PGTA 4N0VA 1EOHA 1GLQA 1MD4A 3UMAA 1YKCA 1T4ZA 1PD21 3LJRA 4RI6A 4ZIJA 2DLXA 1R7HA 1M9BA 5JWQB 4ZB9A 1Z7PA 3D4TA 5DDLA 3IOSA 2E7PA 4IJ3A 3GYKA 4G10A 1J9BA 2FWGA 4MZBA 1S3DA 1EEMA 3MDKA 3TRQA 14GSA 4XIHA 5A4UA 1AAZA 3BBYA 2VL2C 2C3TA 3WGEA 3DVWA 4FH8A 1OKDA 3HZ4A 3VWUA 2P5RA 4IELA 3FRCA 1H75A 2FGXA 2VLTA 1F6MC 3LGCA 2VM2A 2HZFA 2X8CA 3C73A 1A24A 4MH3A 5IO2A 1SKWB 3HJMA 4TR1A 1HNBA 5IMFA 2HLSA 3C1RA 4BWSA 5D93A 5E59A 3WGDA 3PR8A 1ERWA 1U88A 4BA7A 5J41A 5COHA 2YOIA 2IMEA 4Z7XA 2XHFA 3DKSA 5HFIA 4TN8A 1B4QA 4WBRD 4F0CA 2DMMA 2CX3A 1GRXA 4ZBDA 3HY2A 2OA7A 2XPDA 2H6YA 4K2DA 2B7KA 4G9HA 1K0AA 2O87A 1HNAA 2H0GA 4ML6A 3GFKA 3GKKA 2JADA 2L4QA 2REMA 4MMMA 5DCHA 4PUFC 3FYGA 1B9XC 2HRNA 2YANA 3I9V2 1V98A 3M3MA 5GAND 5KN0A 5KN3A 2L4CA 1TDIA 3L9SA 1Z5YE 5H5SA 5DJLA 4QL7A 1E2YA 2LKUA 1MDJA 3IK9A 3GTUB 3LFLA 3Q19A 5DALA 3J7Yk 2YJHA 1NSWA 5ELAA 1V2AA 3IK7A 2G2QA 4KSMA 2TRXA 4WKWA 2CVKA 1VRSD 3EU4A 2CV4A 5DVBA 3KP8A 1W4VA 3HKRA 4DSSA 2LJRA 4PNGA 3SWLA 2XBQA 2YJ7A 5D9WA 2R4VA 4PQIA 5ECQB 2IJYA 3Q74A 2N5AA 1PQNA 1ABAA 4OMVA 3UAPA 3WT2A 1SJIA 1BAYA 2H72A 1O81A 4JRRA 2QKEA 3LG6A 2PERA 3LSZA 2B7JA 5ECHB 2FA8A 1VF1A 1QGVA 2VCTA 3IDVA 2JSYA 4KDYA 1XW6A 4NXIA 3H8QA 2FY6A 3MWHA 3ZRDA 16GSA 1FVJA 3HD5A 2TIRA 2I81A 3TJJA 2H76A 1G6WA 2IPAA 5DJMA 3ZFBA 2EIQA 4H86A 2IMIA 1ON4A 2I3YA 4ILFA 2JACA 2XC2A 3HZ8A 1TK8B 1OE8A 4ULXA 1XBSA 3GKMA 2VAFA 3I6AA 5CAXA 3GRXA 4V2LA 3IAM2 3HCZA 5C00A 3IPZA 3S9FA 5JCWA 1U3AA 4EDZA 3HXSA 3LWAA 2VL9A 3M9JA 4HI7A 4ZB8A 1GNWA 3VK9A 2ON5A 3RHCA 3M0FA 2GVPA 4O5RA 3E9JB 2B1LA 3TRXA 2CZ2A 4F82A 3FHKA 2HE3A 4GQFA 2IFQA 2WULA 2DSAA 1G7EA 2VIMA 3EMXA 3FZ5A 4EO3A 4MJCA 3KIJA 4HOJA 4PQ1A 3IC4A 2JU5A 1LJRA 2B1KA 2WCIA 3VI7A 1T7PB 3H79A 2DC5A 5ABRA 3IHQA 4OO4A 2YWMA 9GSSA 2M46A 1MDIA 2MMAA 4MH2A 3C1SA 3HVVA 5D96A 1I9DA 6GSSA 3CBUA 3HJOA 2CX4A 3ZL5A 5DAKA 4K1FA 4IP6A 1MTCA 1EV9A 3TRPA 3TDGA 4AJ8A 1WP0A 2DJ0A 1XFLA 4V2MA 3LXTA 3KGKA 3KZQA 1SD9A 2LRTA 1G6YA 3KCMA 1Z7RA 2EIOA 3QCPA 2NPBA 3QFBC 2C0DA 4KGIA 1ACVA 2GSQA 5FT3A 1EEJA 2CT6A 2YN1A 1FHEA 2VL2A 2AHEA 3FR6A 1X0RA 1XPVA 3UJ1A 1XWGA 4KCEA 1DSBA 4ML1A 4ECIA 2GTUA 2C8UA 1XOBA 4GSNA 4E8EA 1GSDA 2C1YA 3KXOA 4P3YB 2H6ZA 3GUSA 1ZCPA 1YJ6A 2N5BA 2WJUA 4WXTA 3WGXA 4WF5A 5JCUA 3GKNA 2HSHA 3R2QA 2L6DA 3QOUA 2WS2A 1B9YC 2GSRA 4NV2A 2L5OA 1OE7A 3D6IA 1ST9A 1JFUA 2C0FA 2V41A 2MMNA 2MYGA 1X5DA 2YWOA 2V1MA 1BEDA 4MJEA 4IVFA 1M2BA 5J5NA 2VLVA 2DJ1A 1VF2A 1K3LA 1LU4A 2KUCA 3L9UA 4TR3A 4L5OA 3GA4A 1XWCA 2C3NA 5G30A 2CA8A 4BL7A 1GSQA 5CRGA 1XCCA 3EVIA 4MPFA 2FNOA 17GSA 3LXZA 4Q5NA 1M2AA 1GULA 4N30A 3KP9A 2VUPA 1O6JA 3DVXA 1X9WB 1YDKA 1PSQA 2GLRA 1OAZA 2DIZA 4OFNA 2HZEB 3HVXA 2HT9A 4EDYA 3TB2A 5CRWA 5LNKe 4HU7A 2I9HA 2MMOA 4GSSA 4LL1B 2YWIA 3IXRA 3ME8A 5G5FA 1O8WA 3NOFA 1THOA 4XTSA 1OVNA 1QMVA 2E0QA 1Z9HA 5HR0A 3L9VA 3GNJA 2IL3A 5G2ZA 1SKSB 2GQKA 3VURA 1FB6A 2Z9SA 4HS1A 2ZNMA 2GDRA 3G7JA 3OR5A 1BQ7A 4OCEA 2MBTA 3IBHA 1OC8A 1YY7A 4L5LA 4TR0A 4CHSA 2H1GA 2V32A 4LL4B 2LRNA 3ERWA 2EIRA 2C4JA 1GP1A 1X5EA 4IS0A 2H75A 1SL0B 3H4KA 1SU9A 3D22A 3EMPA 4QQ7A 3KJYA 2KP2A 5CRDA 2G0FA 3DMLA 2LJAA 4K6XA 3WD6A 4TXOB 1KEBA 4GF0A 2RUFA 4IBPA 1FG4A 2B3SA 4MZCA 2J9HA 4V1Ag 1V58A 2ZCTA 1F37A 1WMJA 3P2AA 1GSEA 2IN3A 3TKPA 1XZOA 4MZWA 2FA4A 2DJ2A 4CW9A 5F8BA 3UIWA 3KH9A 4X0XA 3N5OA 1PL2A 2LS5A 4MJAA 4POLA 3CSHA 5A4VA 2KLXA 4GWRA 3FY7A 1GNEA 4K7OA 4NV5A 2C0GA 3EU3A 3H1NA 4NHWA 3KH7A 1X9MB 5ENUA 3GX0A 1TOFA 2PGTA 4RQRA 5GSSA 2JZSA 2MBSA 4F0BA 1MD3A 2YNXA 4ISDA 3RBTA 1F3AA 4GSTA 5ECOB 3GHAA 3QD9A 3TGZA 5IQYA 3BCKA 2F3MA 3GV1A 1YF1A 1XWBA 4KNDA 3EWLA 3HHVA 1B8XA 2LQOA 1GTIA 2B5EA 4PUAA 5F05A 5ID2B 1ZZYA 2A2SA 1WIKA 1YEPA 2JZRA 1IYIA 2BJXA 3AY8A 4LLRA 1Q4JA 3ERFA 1TK5B 2ZUPA 1SK2A 4IP1A 5INYA 3CRUA 3IR4A 4EE0A 3CXGA 20GSA 1M0UA 1GSUA 2ALBA 2I1UA 1J08A 5DQSA 3CRTA 1YQ1A 1A8LA 2JZTA 1QFNA 5ECMB 2M72A 4E8HA 4YH2A 3SBCA 4YAVA 4KCAA 3ZFLA 1N2AA 2IMFA 3GH9A 1UVZA 3UEMA 1ZYQB 2FLSA 1JLVA 5HFKA 2PBJA 3BCIA 3ZZXA 2F8FA 3RPPA 4ZB6A 1PX6A 2ES7A 2H71A 2YZUA 2VD1A 4JU5A 1THXA 4KDXA 3WYWA 3F9UA 4HDEA 1TRVA 2VD0A 3TJFA 1M2DA 2PN8A 3QMXA 2PWJA 5AISA 1XIYA 2XPEA 2LUSA 4ID0A 3G7IA 1K3OA 4Q5FA 4TKYA 3K8NA 4FYUA 11GSA 1PKZA 1SENA 2VCXA 5L71A 1QXHA 4DSQA 4K0GA 2WGRA 4EVMA 3F0IA 3ZVJD 3M8NA 3FR9A 4K8MA 2BTOT 2RM6A 3TOTA 1JHBA 3KMNA 3GKXA 1H4OA 4D73B 4V2NA 3LQ7A 2GQLA 2IMDA 1JZRA 3I43A 4ZXGA 3GL5A 2GS3A 5H5RA 3TKQA 3UARA 4F2IA 6GSYA 2OKAA 13GSA 2DJKA 4JE1A 2H74A 1TJDA 4POBA 5CO3A 4ZBAA 2AUVA 4BWQA 4XS4A 4J2FA 2YCDA 3TJGA 3GSTA 2OADA 4V1Ap 1UA5A 2VOCA 2MZCA 3UOMA 6GSUA 1K0DA 5AIXA 1YKAA 1GLPA 1ML6A 3MNGA 3ZYWA 2CZ3A 1WOUA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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