5D96A

Oxidoreductase fragment of mouse qsox1 in complex with a fab fragment from an antibody targeting mouse and human qsox1
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
237
structure length
237
Chain Sequence
LYSSSDPLTLLDADSVRPTVLGSSSAWAVEFFASWCGHCIAFAPTWKELANDVKDWRPALNLAVLDCAEETNSAVCREFNIAGFPTVRFFQAFTKNGSGATLPGAGANVQTLRMRLIDALESHRDTWPPACPPLEPAKLNDIDGFFTRNKADYLALVFEREDSYLGREVTLDLSQYHAVAVRRVLNTESDLVNKFGVTDFPSCYLLLRNGSVSRVPVLVESRSFYTSYLRGLPGLTR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Overcoming a species-specificity barrier in development of an inhibitory antibody targeting a modulator of tumor stroma.
pubmed doi rcsb
molecule tags Immune system
source organism Mus musculus
molecule keywords Sulfhydryl oxidase 1
total genus 74
structure length 237
sequence length 237
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 1.8.3.2: Thiol oxidase.
pdb deposition date 2015-08-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
A PF18108 QSOX_Trx1 QSOX Trx-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5d96A01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5d96A02
4FIWA 1HNCA 4HOJA 1SJ6A 5ECQB 1A2JA 1S3AA 2EC4A 1QUWA 2TRXA 3IOSA 2B1KA 4OCEA 2O8VB 2C1YA 2VLVA 1J0FA 4ZILA 2X8GA 1ERVA 3LEFA 1PKWA 4HQZA 1FOVA 4KB3A 4G2EA 4JE1A 1ERWA 1GP1A 3TOTA 5ECMB 3WT1A 5F05A 1OKDA 3L9SA 2VL9A 2FNOA 4PUFC 5H5RA 1GSDA 2YNXA 1UN2A 1XFLA 3HZ8A 2H6YA 3HCZA 3QOUA 5D93A 13GSA 4XTSA 4KX4A 2ZCTA 5ECPB 1ZYEA 2YWOA 1PMTA 1PSQA 4TOPA 5HFGA 3GA4A 1YJ6A 3KGKA 3KZQA 3VI7A 2M72A 4MDCA 1K3OA 2C80A 3EVIA 2F51A 5A4UA 3LYKA 1XXUA 2V2GA 3IXRA 4BWSA 1TXXA 2F9SA 2VCQA 1PL2A 2OBIA 2P5QA 3NIVA 12GSA 1XIYA 2L4QA 5B6NA 2GSQA 3ED3A 4DSRA 2OJLA 1RK4A 2GSSA 4NAXA 2LRTA 4MF7A 4NV2A 1SENA 1TW9A 4JR6A 3CMIA 2HSYA 2GSTA 3TUEA 4OCFA 2IFQB 5IO2A 1XWKA 5A4WA 4KA0A 2E2GA 2K8SA 3TJFA 3CSIA 3KP8A 3HJOA 5F8BA 1T8EB 4H86A 1Z3EA 3IC4A 3CSHA 1YF0A 3QR6A 3KTLA 1TRSA 3GSTA 2HI7A 2OKAA 4GCIA 3FZ5A 9GSSA 2YWMA 3KMOA 2LS5A 2DJJA 2PERA 3E3EA 4K0GA 5COHA 2KLXA 2C0FA 1GTUA 3HHVA 3ZIVA 3EURA 1MD3A 5IMFA 1THXA 1W89A 3LSZA 4OO5A 2YCDA 3IE3A 2PWJA 2DJKA 1OE7A 4D73B 2AUVA 2IPAA 3LJRA 3GH9A 2FWGA 4WF5A 2VIMA 1S3DA 1ST9A 3GKKA 3W8JA 1TK0B 1OC3A 1MD4A 1A0FA 2EIRA 2F8FA 1MTCA 3WGEA 6GSUA 1M0UA 1JHBA 5G31A 5H5SA 4I2UA 4OWYA 1AQVA 5HR3A 3GH6A 1A24A 5DALA 4MP4A 4F82A 1SK0A 4AJ7A 2VM2A 1M7TA 2MMOA 1BAYA 2FGXA 3A2XA 4YAPA 4N11A 1AAZA 1ERTA 2YOIA 3C1SA 3KM6A 1O6JA 1SJZA 3FR9A 4F0BA 4JEDA 3VPQA 2KOKA 5ECSA 1GUMA 1SYXA 2VD1A 5IMVA 2C3TA 1QFNA 3IAM2 2YZHA 6GSXA 2REMA 2YV7A 4CDOA 4E8EA 4I8BA 2H73A 2GS3A 1E2YA 2K9FA 4ZBBA 4OMVA 3I69A 4POLA 1X0RA 2H1AA 4HU9A 2VLUA 1EP7A 1M2BA 4AGSA 2MMZA 4TXVA 1F37A 2HYXA 1V98A 4ID0A 3FZAA 1DE2A 3LYPA 19GSA 5CRDA 3W6GA 2IJYA 2M46A 2YWNA 1YZXA 4IHUA 2X8HA 4GTUA 2BJXA 2QGVA 2LNSA 2H76A 4GQFA 4IELA 1WOUA 2A2RA 1GSFA 1YF1A 2BTOT 4NXIA 3D21A 1G6YA 4L5OA 5KN0A 4IJ3A 2Z9SA 3ME7A 3DGQA 2CV4A 3VFIA 2H0HA 2WCIA 1PX6A 4NHWA 4IQ1A 5IIZA 1MDJA 4XS4B 5ECKB 5CRWA 3UARA 2PPTA 2N5FA 2IMIA 5LNKe 4XS1A 1XW9A 1U87A 5DCHA 4BWQA 5INYA 4TXOA 3CYNA 1HNAA 3TRXA 6GSYA 4KAEA 1M2AA 3FEUA 2ZUPA 4FYUA 2TIRA 3KXOA 4BA7A 4K9ZA 4RI6A 5GZZB 2FA4A 2C0DA 4O5RA 4TN8A 4TKYA 1AQWA 4ZBAA 1T4ZA 2AV4A 2YJHA 2I4AA 1EGRA 1JLWA 3I9V2 2YPMA 3R2QA 4JBBA 2DBCA 2WRTA 1I9DA 2M80A 2B6MA 3D5JA 2YV9A 1FG4A 4ML6A 4XCSA 2YZUA 3QFAC 3UIWA 2MBSA 3U5RE 3F4SA 1K0MA 5JWRB 2CT6A 2ZNMA 1X5CA 4ZIJA 5B8AA 5CRGA 1Y25A 2I3YA 3EU4A 5EY6A 5JWOB 1DE1A 2IN3A 5CNWA 4PUAA 2RM5A 3M1GA 3FZ4A 4KCEA 3IAS2 3DEXA 6GSSA 2GGTA 1QMVA 3D22A 4ZXGA 4QL9A 4MJEA 2HFDA 1OC9B 4G10A 5IMCA 3F3RA 3TKPA 2JU5A 2VCWA 2GZYA 3RHBA 1EP8A 5ABRA 1SD9A 5IOWA 1J9BA 3A2WA 4WEYA 3I43A 3H93A 4ECIA 2CQ9A 1YKAA 4O92A 4ZB6A 3FRCA 3GKMA 3L0HA 1OE8A 2LJAA 2R5GA 5FT3A 1TRVA 1SL1B 3CRUA 3HXSA 1Q4JA 3UAPA 3BOAA 3LXTA 3ERWA 4EF0A 1T4YA 3DVWA 4I2TA 2WULA 4ACSA 3ZL5A 4ZL9A 5KN3A 3TKRA 2XPEA 4IS0A 3LFLA 4NHZA 2R6KA 2HE3A 3WYWA 3G7YA 3HVXA 4TVEA 2DJ3A 3NOFA 1XZOA 3ZYWA 2GVPA 4N0ZA 4TR4A 3EWLA 1BX9A 3WD6A 3DRNA 2FLSA 3ERGA 2H70A 3HJPA 2DIYA 4JRRA 2IMKA 2WB9A 5IPHA 3RPNA 3FK8A 4PQHA 1UA5A 1DSBA 2R3XA 1PA3A 2RUEA 2VD0A 4XRAA 2H74A 4DEJA 4K7IA 1QK8A 3L9VA 3BCIA 3EMXA 1U88A 2B1LA 3ZMKA 4XHMA 4HI7A 1R5PA 1O8WA 3EE2A 3CTGA 1FHEA 1SU9A 4L5LA 4XIHA 4JZQA 5DAKB 3LGCA 2GZZA 2NTOA 3DD3A 3F3QA 4V1Ap 3QMXA 4ML1A 2DIZA 4XRDA 4MLYA 2L6DA 1NHYA 4TW5A 5DCGA 2OA7A 4LLRA 5IO0A 3BBYA 2H01A 3QCPA 2LUSA 2HNLA 4EVMA 3PR8A 5AIXA 2IWTA 1G0TA 1AIUA 1O8XA 4GRFA 4I97A 1O81A 4K6XA 1F3BA 5ECHB 4NPBA 1ZL9A 1G6WA 5D9WA 2H19A 4ZBDA 1BG5A 3O76A 2C3QA 2HXKA 3APQA 3GIXA 4NWYA 1K3LA 3KD0A 3M0FA 5DDLA 2TRCP 3E9JB 3FR3A 4OFNA 4PGTA 2N5AA 2H71A 4YH2A 1TOFA 4ECBA 3A3TA 3MAKA 2JSZA 4HJMA 2LSTA 4RQRA 4PNFA 1CQGA 3Q74A 2YP6A 1A2LA 2HZEB 5ENUA 4P3YB 3US3A 1R4WA 2VL2C 4DSSB 4HJ2A 2IFQA 5ELGA 1F3AA 4KH7A 4IKHA 3A2VA 4V2MA 2L57A 1TDIA 2L5OA 3GNJA 1GTBA 2FCHA 3VWUA 2P0GA 4KDYA 5G30A 3MNGA 2OE1A 3P8WA 2H6ZA 5G5EA 3DYRA 2DSAA 1THOA 4KGIA 2DJ2A 2KHPA 1WP0A 3RBTA 2IMDA 3EINA 2LV3A 2V41A 2LJRA 4GF0A 2FUG2 4WXTA 3D4TA 1PGTA 3TOUA 3HZ4A 3QAWA 4MZWA 4D73A 3P90A 3L9UA 1KEBA 5IM9A 4ZL8A 2AB6A 2EIQA 2PN8A 4WETA 2O87A 4AF2A 2VCTA 4I5QA 1B8XA 3M9KA 1GLQA 1X9SB 3F6DA 2H30A 2O89A 2JZTA 2NDOA 2YN1A 2J9HA 2O85A 2P5RA 4BPYA 1C72A 3HY2A 1X5EA 10GSA 1TI1A 2V6OA 5IMAA 3ZIJA 2MBTA 4V2NA 1OKTA 1U3AA 3PINA 3IDVA 4IJIA 2I9HA 3ERFA 3H4KA 2EIOA 3BJ5A 3EMPA 3P2AA 1SK1A 3TJGA 5EVOA 3F0IA 1XWCA 2WS2A 5IMDA 1WPIA 4L0UA 2HLSA 5CYYA 1T7PB 4IP6A 5E59A 2AJQB 3UOMA 5AISA 5FWGA 5EL8A 4L0WA 2ON5A 1G7EA 1GULA 2CAQA 2ALBA 2DC5A 2MMAA 5ELAA 5HR0A 2VL2A 3ZFBA 3CTFA 4MF5A 3KP9A 3UVHA 5A5KA 4MJAA 2R4VA 2F8AA 3OR5A 3HA9A 1X9WB 1ABAA 3GYKA 2GQKA 1FB6A 4JR4A 1UC7A 4IQAA 3TRQA 1WMJA 3D4MA 2B5YA 1LU4A 1TRWA 4ZL7A 3L4NA 5GAND 1AQXA 1GWCA 1XPVA 1IYHA 2I81A 4K7OA 2JL4A 1B48A 1M2DA 5B8BA 2MYGA 1GNWA 1VRSD 4GLTA 4AJ8A 3GFKA 2OE3A 3FR6A 3FYGA 3D0ZA 5DJLA 2B5XA 4GXZA 1B9YC 1Z7RA 2QKEA 2E7PA 1WRYA 1A8LA 4EDYA 3Q19A 3TJJA 3DVXA 2PGTA 2WFCA 3DXBA 4XS4A 5GAPD 2L59A 4POKA 5IOXA 2H1BA 3IK7A 5KEJA 5IMZA 1TU7A 2VAFA 4IVFA 3WGDA 4YQUA 1O85A 2CZ2A 1BYEA 2E2MA 2O7KA 3ZREA 3RDWA 5DALB 1B9XC 1WWJA 3GL5A 1UVZA 3UL3A 5CREA 4KSOA 3VPTA 1TI3A 1I5GA 3HVSA 4WR5A 4MCUA 1H75A 5J9BA 5D9XA 3H79A 3TJBA 2ON7A 3LG6A 2VM1A 1EZKA 1JZDA 4AJ6A 3GTUB 1IYIA 2ES7A 1HD2A 1SL2B 2BMXA 4MABA 3SWLA 3ZVJD 3ZLPA 3QFBC 3DWVA 3TKSE 1F6MC 3APOA 3QPMA 2I1UA 1XOAA 1PX7A 3TKSC 4RUVA 5JCUA 4DVCA 6GSVA 1SJIA 1GTIA 2JACA 4V1Ag 4K0NA 1OVNA 4IBPA 4CHSA 2DLXA 3ZTLA 1YKCA 1JZRA 4ECCA 3KEBA 4EUYA 5F06A 3IK9A 2JSYA 1EOHA 2WJUA 4V2LA 4X43A 3S9FA 2K6VA 3TJKA 3P7XA 3TGZA 4HZ4A 4GWRA 4TR3A 2H66A 5J41A 4X0XA 4BVXA 5CRHA 4MZCA 4DSQA 4NV5A 1XWAA 1PN9A 5IPGA 5B7CA 1SKSB 3GSSA 4Q5RA 1X9MB 1QGVA 1GNEA 3LWAA 1TRUA 4OFTA 3CRTA 2GQLA 4LA1A 1ON4A 3W8SA 2B7KA 4MPGA 1A8YA 2B3SA 2JADA 2C0GA 2PUKC 1SYRA 3EYTA 2C0EA 2LRNA 2WZ9A 2R37A 1HQOA 3VURA 4G19A 2NVLA 1GLPA 4MZBA 4FH8A 2WGRA 4F0CA 1JLVA 2FA8A 4HZ2A 2VO4A 2N5BA 3TKSA 3GX8A 3H1NA 5JCWA 2GSRA 2GQMA 5ECLB 2XBIA 1A23A 2YWIA 1F9MA 2AYTA 4QL7A 2LNTA 5LCZA 1ML6A 1XVQA 3J7Yk 1EV4A 5ECOB 3I6AA 1EOGA 4RQXA 4MH2A 2QSIA 3UMAA 4F03A 5D8IA 4EKZA 3RPPA 2B7JA 3LORA 4MJCA 2PVQA 2HT9A 5DVBA 3GMFA 3F9UA 3F4TA 1GUKA 1Z5YE 3APSA 2HSHA 2YJ7A 3TKQA 3TCOA 5LD0A 1TKDB 2PU9C 4O32A 1AXDA 2X99A 3HVVA 4LMWA 3RHCA 2OADA 5ID2B 3FZ9A 3FY7A 3ZFLA 3MWHA 1DUGA 1BEDA 4N30A 3ZZXA 1SK2A 4QQ7A 1FAAA 1N2AA 4HS1A 3Q18A 3C1RA 3BD2A 2A4VA 4BL7A 1GH2A 1V2AA 4K7NA 3GN3A 5G1LA 1GSSA 2C4JA 5HR2A 2H0IA 4TR1B 4POMA 4F2IA 1K3YA 2HZEA 4MK3A 5GSSA 1VF4A 3D6IA 1GUHA 2H1GA 4DSSA 1EGOA 1Q98A 5EPFA 5AN1A 1W4VA 2DJ1A 1ERUA 4IW9A 5D73A 1A0RP 5G2ZA 2X8CA 1M99A 22GSA 1GSUA 2WDUA 1K0NA 5DQYA 5ECNB 3M9JA 4Q5QA 2XPDA 4KDXA 2CVBA 4ZB9A 3KH7A 1R26A 2KP1A 2H1DA 2D2ZA 3LXZA 4WKWA 3GKNA 1PKZA 4XS6A 3VWXA 4PURA 5D96A 2XBQA 3K8NA 4KDUA 3C73A 1ZZYA 2V1MA 4WBJA 5HR1A 4J2FA 2AHEA 2L6CA 2C8UA 3FKFA 3G9BA 3GHAA 5CAXA 4GSTA 3PGTA 1YEXA 3ZRDA 1GL8A 3VLNA 1YY7A 2CA8A 1K0OA 4MF6A 5ECRB 2YANA 3WT2A 4ILFA 1GSEA 1URMA 5CO3A 1TK8B 3QDNA 2H72A 3KH9A 1T1VA 3GX0A 1S3CA 1K0DA 2IMFA 4IN0A 4OFMA 1V40A 2G0FA 4J56E 4IP1A 3EU3A 4IGJA 1WE0A 1MDKA 1QQ2A 1XBSA 3F6FA 4HEA2 4GSNA 1TJDA 5C04A 2OE0A 3J7Yb 5C00A 2H75A 4ULXA 1GRXA 1R7HA 1SL0B 2L4CA 1MEKA 1GSQA 4G9HA 2PMTA 1XWBA 2JZSA 1WJKA 3H8QA 5G1KA 17GSA 1VGLA 1JZOA 5CP1A 3FHKA 4ISDA 2AAWA 1JFUA 2MZCA 4YQVA 4MMMA 5KN1A 1K0BA 4Q5NA 3CSJA 4FYCA 3GL3A 2H6XA 4ZB8A 3RAZA 4MA9A 1OYJA 5D9TA 2OBKA 5J4UA 2FD3A 1TTZA 3GUSA 1WIKA 2XC2A 1EEJA 3G7JA 1SD8A 20GSA 3V1WA 3GKXA 3KTBA 3A5WA 1CQHA 2VL3A 3N5OA 5A4VA 5HQPA 4EDZA 1Z7PA 1V57A 2KUCA 1PL1A 2VOCA 1SKWB 3CXGA 1XOBA 2H8LA 4K1FA 4N0VA 4ECJA 1K0AA 1M9BA 3TDGA 1EEMA 1FW1A 1Z9HA 3HD5A 3HJMA 4PQ1A 2JZRA 3VWWA 1EWXA 4GQCA 1T00A 1OAZA 3FW2A 3C8EA 4EC0A 2VCXA 1HYUA 2LQOA 5J9CA 1VF3A 4N10A 1G7OA 5AIVA 1VF2A 2OACA 1PQNA 3E0UA 1EV9A 3EC3A 3IBHA 3Q6OA 1BQ7A 1B4PA 3GTUA 1TU8A 2GLRA 4YQMA 1XW6A 1TP9A 2FWFA 3IHQA 8GSSA 16GSA 4GSSA 2X64A 1Z6MA 4YAVA 5L71A 11GSA 2VCZA 3GRXA 4PX1A 3HYPA 3IA1A 2A2SA 2NBSA 3DMLA 1DBYA 4CW9A 3VK9A 1V58A 2CZ3A 2NPBA 4O7HA 1RW1A 3O3TA 1LJRA 3QAGA 1NM3A 1JZWA 4KW6A 1KBNA 5ECIB 3GV1A 3HDCA 2HZFA 6GSTA 5F07A 4WR4A 5JCGA 5KN2A 2XHFA 4KCAA 2P31A 1XW5A 3MDKA 2V6KA 3M3MA 4LMVA 1X5DA 1GTAA 1OC8A 1NSWA 3KCMA 4TR0A 4HQSA 1RQMA 3ISOA 1O7UA 4RI7A 5F0GA 3C71A 1YDKA 3DKSA 4Z7XA 1FO5A 4EXJA 1AC1A 2F3MA 4KNDA 1AW9A 4FO5A 3DIEA 2H0GA 2CAIA 2GT5A 1U3IA 1J08A 1N8JA 3WGXA 1ZOFA 18GSA 1Y6EA 1R5AA 2CVKA 5G5FA 1ACVA 2LKUA 5D9VA 2IL3A 4I6XA 1H4OA 4MJBA 2DJ0A 1F2EA 4HU7A 3ZITA 2LTKA 1OC9A 1E6BA 4WF4A 1SKRB 3BCKA 3QAVA 1XVWA 2IIYA 2VLTA 1FB0A 4E8HA 4L8EA 3KIJA 2B5EA 5AGYA 4MPFA 1K0CA 7GSSA 3U6VA 2KP2A 2GZPA 4LL1B 2FWEA 5DBQA 3IR4A 2RLIA 1YQ1A 1GSYA 1ZCPA 1FVJA 2R2JA 2V32A 3F4RA 4POBA 5HFIA 4LL4B 4K2DA 2DMMA 4WBRD 4EO3A 3CBUA 3UBLA 5HFKA 4TXOB 3KJYA 6GSWA 2L5LA 1LBKA 1BJXA 2MMNA 1VF1A 3F8UA 5JWQB 2RIIA 3ME8A 3UEMA 4KUNA 5DQSA 2HRFA 3GURA 2CVDA 4JU5A 3NZNA 1KNGA 4EE0A 1NW2A 1ZGNA 3IV4A 2PVOC 3UVTA 2DMLA 1YEPA 1TK5B 2C3NA 3AY8A 2G2QA 1ZMAA 4EL1A 3MSZA 3M8NA 2GTUA 2RM6A 5IQYA 3UJ1A 2FY6A 5ID2A 2CX4A 1T3BA 2HRNA 3L78A 1A2MA 2J23A 3LQ7A 1U6TA 1PD21 4KSMA 4OO4A 4PQIA 1FVKA 4MH3A 3N9JA 1ZYQB 1O73A 5DAKA 4PNGA 14GSA 3PH9A 4Q5FA 3HKRA 4HDEA 3F63A 4NMUA 3VI5A 5DJMA 1XCCA 1KTEA 2K18A 5B6MA 2K8VA 3TB2A 2QC7A 1ILOA 2GDRA 2VUPA 4HUAA 4TR1A 4TRXA 2GT6A 3TRPA 1QXHA 3ZMLA 1XWGA 3QD9A 2IMEA 5J5NA 1B4QA 1PRXA 2LEGA 5H5QA 3C7MA 3G7IA 5E4WA 4K8MA 3VWVA 1MDIA 3IPZA 3O6TA 3SBCA 3ZVJA 2LJKA 3IRAA 3KMNA 1V9WA 2FWHA 4X1UA 4J57E 4KE3A 4PXOA 2RUFA 1M9AA 4BVYA 3JCML 2CX3A 4FYBA 4F9ZA 1AUCA 5FHIA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite