5DFBA

Crystal structure of brd2(bd2) mutant w370f in the free form
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SEQLKHCNGILKELLSKKHAAYAFPFYKPVDASALGLHDYHDIIKHPMDLSTVKRKMENRDYRDAQEFAADVRLMFSNCYKYNPPDHDVVAMARKLQDVFEFRYAKMP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain-containing protein 2
publication title New Synthetic Routes to Triazolo-benzodiazepine Analogues: Expanding the Scope of the Bump-and-Hole Approach for Selective Bromo and Extra-Terminal (BET) Bromodomain Inhibition.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 43
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5dfbA00
4NRBA 5FG6A 5DFBA 5FE0A 4O78A 4O77A 5CQ4A 4UIXA 4C67A 4NYWA 2DVSA 3UV4A 4TU4A 3UVDA 5A83A 5E0RA 5CY9A 4IR3A 3O35A 4O7AA 4Z1SA 2I8NA 4A9LA 5F2PA 5ENGA 5E9MA 5E9YA 5JWMA 5D3JA 5H85A 4E96A 5I88A 3FKMX 3IU6A 3P1DA 4QR5A 5D3HA 4BJXA 4QSPA 3Q2FA 4YBMA 5EWWA 3DWYA 5ETBA 5HLSA 4Q0NA 4HXLA 4LYIA 3LQIA 4CLBA 4HBWA 4N4IA 4QR4A 5AD2A 4TU6A 4QC3A 5CQ8A 4A9FA 4FLPA 5C8GA 4ZC9A 4J0RA 5C89A 3ONIA 4CFKA 4TZ2A 4LC2A 4YY4A 3MQMA 5IG6A 4LYSA 4A9MA 4Z93A 5EWVA 4NQNA 5DFCA 4A9JA 4UIUA 5I83A 2D9EA 4ZW1A 4TZ8A 4Z6IA 5II2A 4YYKA 3P1CA 2DKWA 4N3WA 5I89A 4QEUA 5EISA 4J3IA 3SVGA 4YYMA 4A9HA 5HRWA 5A7CA 5HRXA 5KO4A 4PTBA 4CUQA 5CUBA 5HQ7A 5G4SA 5I80A 5KTWA 3U5JA 5DYCA 3UV2A 4UYDA 3IU5A 4LDFA 5LVQA 5JI8A 5F25A 4YYIA 5CQAA 4HBVA 1JSPB 5CRZA 4NR7A 5H1VA 5IIDA 4XY8A 5LKXA 2DATA 5HJCA 5KTUA 5DY7A 5E3GA 5CUGA 4QC1A 5L96A 5LKZA 1WUGA 5E9VA 5A5SA 4UYFA 2FSAA 3U5PA 5DW1A 2E3KA 5TCMA 5L97A 3JVKA 4Z6HA 5EVAA 3Q2EA 4YABA 5J0DA 2MJVB 5I86A 3U5NA 3UVYA 5EWDA 3JVMA 4YBSA 4O7FA 5H1TA 2F6JA 3U5OA 5I29A 5CRMA 5BT3A 5FFVA 5EPRA 3NXBA 4TS8A 4BW2A 2DWWA 4QBMA 5EP7A 4YYJA 5K29A 2RNYA 3UW9A 5FFYA 5A81A 5IGNA 4QSVA 5C7NA 5E9KA 5CQTA 5D3NA 5DYUA 5F63A 3P5OA 5KU3A 2WP1A 5EI4A 4QUTA 3QZVA 4YY6A 2YW5A 4YADA 4UIVA 5EM3A 2G4AA 2D82A 4YH3A 4MR4A 3HMFA 4YYHA 5DX4A 4CUPA 4UYGA 3U5MA 5DYAA 5FE2A 5F61A 5IGMA 2KTBB 5D7XA 2RNWA 3K2JA 3P1FA 5D3RA 4MEQA 5DKCA 2E7NA 4BW4A 5AMEA 4LZSA 5HENA 5LJ1A 4O7BA 4NR8A 4MENA 5H1UA 5FB1A 5FFWA 5KHMA 5I40A 4QNSA 3I3JA 5CP5A 5EQ1A 1F68A 3G0JA 5TB6A 5I7XA 4O74A 5CZGA 5HRVA 3TLPA 5LUUA 4O72A 5FE4A 3UVXA 4YH4A 5F5ZA 3MULA 4WHWA 3O34A 4NS5A 4O7CA 5F3AA 4LZ2A 4AKNA 4HXRA 5FE6A 4QSWA 5DW2A 5FE9A 4A9KA 5FBXA 5II1A 4TYLA 5LVRA 3MB3A 3O37A 3AQAA 5C4QA 4OUFA 4O7EA 2RFJA 4A9IA 4IOQA 5FE1A 5E9IA 4TTEA 3JVLA 5CPEA 2YELA 4XYAA 4CUUA 5A5PA 2DVVA 5FH8A 5DYXA 4PCIA 5HEMA 2R0YA 5A5RA 5COIA 4TT4A 2RS9B 4UIYA 5D3LA 5HCLA 5KTXA 3AADA 2YDWA 3GG3A 5L8TA 5E9LA 3O33A 5A5QA 5A5OA 5EU1A 4MR6A 4QSQA 5CTLA 3S91A 4QSSA 4Y03A 2YEKA 4IR5A 4N4GA 4NXJA 4YAXA 5F62A 4YYDA 3RCWA 5A85A 4TT2A 1ZS5A 2OSSA 4WHUA 4OGIA 2F6NA 5FB0A 4NUCA 5F1LA 2OUOA 4YBTA 4UITA 3DAIA 5ENCA 5D24A 4XUBA 4PS5A 5AMFA 5EPSA 1EQFA 4QYLA 4N4HA 5CFWA 5CQ6A 5A5NA 4F3IA 4NR5A 4BHWA 2L85A 4IR4A 2R0SA 5EWHA 4ZQLA 4YYNA 3U5KA 4NYXA 3LJWA 5C85A 2NXBA 4CL9A 4O70A 5LKTA 4X2IA 5L98A 5CQ7A 5EWCA 4QSUA 5DLXA 3ZYUA 5HQ6A 5ENIA 4HBYA 5E73A 4QSRA 4Q0OA 4GPJA 4A9NA 4O75A 5CQ3A 2YQDA 4MEPA 4WIVA 4ALGA 5E3DA 2YYNA 4QR3A 4YK0A 4LRGA 4NR6A 2YEMA 5EPBA 5CGPA 4DONA 4NR4A 3U5LA 4YC9A 5HFRA 4UYEA 5L8UA 5G4RA 5I1QA 4N4FA 5DBMA 4KV1A 5DKDA 4OGJA 5D0CA 4PKLA 3O36A 3LQHA 5D3TA 4HXPA 5DLZA 5ACYA 5C87A 5FDZA 4QUUA 4LZRA 5E74A 4KCXA 5HFQA 4IR6A 4CUSA 4HXMA 1JM4B 1X0JA 4QSXA 4NUEA 5ENBA 4YATA 1WUMA 4LYWA 2OO1A 5FE3A 3QZSA 4MR3A 4NYVA 2DVQA 5BT5A 5CUCA 3MXFA 2H60A 5FE7A 3LXJA 2R0VA 4XUAA 4HXKA 5EICA 5F36A 2RNXA 5CUAA 3UV5A 4QEWA 4A9OA 4BW1A 4NUDA 5CU8A 4NQMA 5LJ2A 2I7KA 4HXOA 4RVRA 5A82A 4HXNA 4UIZA 3LQJA 3D7CA 3HMHA 4MEOA 5ENHA 2E7OA 3P1EA 4QSTA 3MUKA 5ENEA 3HMEA 3JVJA 5CS8A 1E6IA 4PY6A 3MB4A 5F60A 3S92A 4UYFB 5EK9A 4QB3A 4QZSA 2WP2A 4Z1QA 4YYGA 4ALHA 4CUTA 4KV4A 5FH7A 4CURA 4MR5A 5D3SA 2L84A 5D3PA 2RI7A 4NR9A 5HM0A 5E7DA 3SVFA 3G0LA 5HELA 4O71A 5D25A 5HQ5A 2DVRA 5DKHA 5ENJA 5ETDA 2LSPB 5EA1A 2R10A 4IORA 4J1PA 5FH6A 1N72A 5L99A 4A9EA 5CUDA 5DFDA 5EV9A 5F1HA 5IGKA 4CFLA 5BT4A 5FE8A 4QYDA 5I7YA 3UVWA 5LJ0A 5ENFA 5FG5A 2RO1A 4QY4A 4UYHA 4O76A 4BW3A 4HXSA 2N9GA 4IOOA 4LR6A 2L5EA 4UIWA 3QZTA 5EGUA 4HBXA 4TT6A 4NRAA 5AD3A 2GRCA 3SVHA 5FG4A 5CQ5A 4NRCA 4TQNA 5IBNA 4XY9A 4QEVA 5LKUA 5IGLA 5CUEA 5FE5A 4J0SA 5D26A 4PCEA 4C66A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NRBA 5FG6A 5DFBA 5FE0A 4O78A 4O77A 5CQ4A 4UIXA 4C67A 4NYWA 2DVSA 3UV4A 4TU4A 3UVDA 5A83A 5E0RA 5CY9A 4IR3A 3O35A 4O7AA 4Z1SA 2I8NA 4A9LA 5F2PA 5ENGA 5E9MA 5E9YA 5JWMA 5D3JA 5H85A 4E96A 5I88A 3FKMX 3IU6A 3P1DA 4QR5A 5D3HA 4BJXA 4QSPA 3Q2FA 4YBMA 5EWWA 3DWYA 5ETBA 5HLSA 4Q0NA 4HXLA 4LYIA 3LQIA 4CLBA 4HBWA 4N4IA 4QR4A 5AD2A 4TU6A 4QC3A 5CQ8A 4A9FA 4FLPA 5C8GA 4ZC9A 4J0RA 5C89A 3ONIA 4CFKA 4TZ2A 4LC2A 4YY4A 3MQMA 5IG6A 4LYSA 4A9MA 4Z93A 5EWVA 4NQNA 5DFCA 4A9JA 1ZKRA 4UIUA 5I83A 2D9EA 4ZW1A 4TZ8A 4Z6IA 5II2A 4YYKA 3P1CA 2DKWA 4N3WA 5I89A 4QEUA 5EISA 4J3IA 3SVGA 4YYMA 4A9HA 5HRWA 5A7CA 5HRXA 5KO4A 4PTBA 4CUQA 5CUBA 5HQ7A 5G4SA 5I80A 5KTWA 3U5JA 5DYCA 3UV2A 4AKIA 4UYDA 3IU5A 4LDFA 5LVQA 5JI8A 5F25A 4YYIA 5CQAA 4HBVA 1JSPB 5CRZA 4NR7A 5H1VA 5IIDA 4XY8A 5LKXA 2DATA 5HJCA 5KTUA 5DY7A 5E3GA 5CUGA 4QC1A 5L96A 5LKZA 1WUGA 5E9VA 5A5SA 4UYFA 2FSAA 3U5PA 5DW1A 2E3KA 5TCMA 5L97A 2EJNA 3JVKA 4Z6HA 5EVAA 3Q2EA 4YABA 5J0DA 1PUOA 2MJVB 5I86A 3U5NA 3UVYA 5EWDA 3JVMA 4YBSA 4O7FA 5H1TA 2F6JA 3ERRA 3U5OA 5I29A 5CRMA 5BT3A 5FFVA 5EPRA 3NXBA 4TS8A 4BW2A 2DWWA 4QBMA 5EP7A 4YYJA 5K29A 2RNYA 3UW9A 5FFYA 5A81A 5IGNA 4QSVA 5C7NA 5E9KA 5CQTA 5D3NA 5DYUA 5F63A 3P5OA 5KU3A 2WP1A 5EI4A 4QUTA 3QZVA 4YY6A 2YW5A 4YADA 4UIVA 5EM3A 2G4AA 2D82A 4YH3A 4MR4A 3HMFA 4YYHA 5DX4A 4CUPA 4UYGA 3U5MA 5DYAA 4AKGA 5FE2A 5F61A 5IGMA 2KTBB 5D7XA 2RNWA 3K2JA 3P1FA 5D3RA 4MEQA 5DKCA 2E7NA 4BW4A 5AMEA 4LZSA 5HENA 5LJ1A 4O7BA 4NR8A 4MENA 5H1UA 5FB1A 5FFWA 5KHMA 5I40A 4QNSA 3I3JA 5CP5A 5EQ1A 1F68A 3G0JA 5TB6A 5I7XA 4O74A 5CZGA 5HRVA 3TLPA 5LUUA 4O72A 5FE4A 3UVXA 4YH4A 5F5ZA 3MULA 4WHWA 3O34A 4NS5A 4O7CA 5F3AA 4LZ2A 4AKNA 4HXRA 5FE6A 4QSWA 5DW2A 5FE9A 4A9KA 5FBXA 5II1A 4TYLA 5LVRA 3MB3A 3O37A 3AQAA 5C4QA 4OUFA 4O7EA 2RFJA 4A9IA 4IOQA 5FE1A 5E9IA 4TTEA 3JVLA 5CPEA 2YELA 4XYAA 4CUUA 5A5PA 2DVVA 5FH8A 5DYXA 4PCIA 5HEMA 2R0YA 5A5RA 5COIA 4TT4A 2RS9B 4UIYA 5D3LA 5HCLA 5KTXA 3AADA 2YDWA 3GG3A 5L8TA 5E9LA 3O33A 5A5QA 5A5OA 5EU1A 4MR6A 4AKHA 4QSQA 5CTLA 3S91A 4QSSA 4Y03A 2YEKA 4IR5A 4N4GA 4NXJA 4YAXA 5F62A 3VKGA 4YYDA 3RCWA 5A85A 4TT2A 4AI6A 1ZS5A 2OSSA 4WHUA 4OGIA 2F6NA 5FB0A 4NUCA 5F1LA 2OUOA 4YBTA 4UITA 3DAIA 5ENCA 5D24A 4XUBA 4PS5A 5AMFA 5EPSA 1EQFA 4QYLA 4N4HA 5CFWA 5CQ6A 5A5NA 4F3IA 4NR5A 4BHWA 2L85A 4IR4A 3D1BA 2R0SA 5EWHA 4ZQLA 4YYNA 3U5KA 4NYXA 3LJWA 5C85A 2NXBA 4CL9A 4O70A 5LKTA 4X2IA 5L98A 5CQ7A 5EWCA 4QSUA 5DLXA 3ZYUA 5HQ6A 5ENIA 4HBYA 5E73A 4QSRA 4Q0OA 4GPJA 4A9NA 4O75A 5CQ3A 2YQDA 4MEPA 4WIVA 4ALGA 5E3DA 2YYNA 4QR3A 4YK0A 4LRGA 4NR6A 2YEMA 5EPBA 5CGPA 4DONA 4NR4A 3U5LA 4YC9A 5HFRA 4UYEA 5L8UA 5G4RA 5I1QA 4N4FA 5DBMA 4KV1A 5DKDA 4OGJA 5D0CA 4PKLA 3O36A 3LQHA 5D3TA 4HXPA 5DLZA 5ACYA 5C87A 5FDZA 4QUUA 4LZRA 5E74A 4KCXA 5HFQA 4IR6A 4CUSA 4HXMA 1JM4B 1X0JA 4QSXA 4NUEA 5ENBA 4YATA 1WUMA 4LYWA 2OO1A 5FE3A 3QZSA 4MR3A 4NYVA 2DVQA 5BT5A 5CUCA 3MXFA 2H60A 5FE7A 3LXJA 2R0VA 4XUAA 4HXKA 5EICA 5F36A 2RNXA 5CUAA 3UV5A 4QEWA 4A9OA 4BW1A 4NUDA 5CU8A 4NQMA 5LJ2A 2I7KA 4HXOA 4RVRA 5A82A 4HXNA 4UIZA 3LQJA 3D7CA 3HMHA 4MEOA 5ENHA 2E7OA 3P1EA 4QSTA 3MUKA 5ENEA 3HMEA 3JVJA 5CS8A 1E6IA 4PY6A 3MB4A 5F60A 3S92A 4UYFB 5EK9A 4QB3A 4QZSA 2WP2A 4Z1QA 4YYGA 4ALHA 4CUTA 4KV4A 5FH7A 4CURA 4MR5A 5D3SA 2L84A 3D1DA 5D3PA 2RI7A 4NR9A 5HM0A 5E7DA 3SVFA 3G0LA 5HELA 4O71A 5D25A 5HQ5A 2DVRA 5DKHA 5ENJA 5ETDA 2LSPB 5EA1A 2R10A 4IORA 4J1PA 5FH6A 1N72A 5L99A 4A9EA 5CUDA 5DFDA 5EV9A 5F1HA 5IGKA 4CFLA 5BT4A 5FE8A 4QYDA 5I7YA 3UVWA 5LJ0A 5ENFA 5FG5A 2RO1A 4QY4A 4UYHA 4O76A 4BW3A 4HXSA 2N9GA 4IOOA 4LR6A 2L5EA 4UIWA 3QZTA 5EGUA 4HBXA 4TT6A 4NRAA 5AD3A 2GRCA 3SVHA 5FG4A 5CQ5A 4NRCA 4TQNA 5IBNA 4XY9A 4QEVA 5LKUA 5IGLA 3VKHA 5CUEA 5FE5A 4J0SA 5D26A 4PCEA 4C66A
chains in the Genus database with same CATH topology
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