5DSIA

Structure of co2 bound holo-form of human carbonic anhydrase ii with 0 sec (no) warming
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Tracking solvent and protein movement during CO2 release in carbonic anhydrase II crystals
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-09-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 5dsiA00
3HKTA 3M14A 4KP8A 4MLXA 4WUQA 3R17B 1H9NA 1UGCA 5FLOA 5FDIA 3DVDA 3S9TA 1CNGA 5FL4A 5BYIA 4YYTA 1IF8A 4RIUA 1Z97A 4Z0QA 2FOYA 2Q38A 2HOCA 3RG4A 4XFWA 1EOUA 12CAA 1UGDA 4N0XB 4JSZA 5SZ6A 1H9QA 1FSQA 2FW4A 1BN4A 1XPZA 3MMFA 5L3OA 5CJFA 4JSWA 4QIZA 3EFIA 5CACA 4RN4A 1CAHA 3RG3A 3SBIA 3OILA 1BCDA 3S71B 3U45X 5DSOA 3RZ8A 5G0CA 4M2VA 4CACA 5FNJA 3PO6A 1ZE8A 4R5BA 3DCCA 3V2MA 3DV7A 1G6VA 1H4NA 3DC3A 4QK2A 7CA2A 5EKHA 4Q08A 2CBBA 2CBAA 3BL0A 1ZGEA 1JCZA 3B1BA 1RZEA 4BF1A 4PQ7A 3S97A 5EKMA 1HCBA 3KIGA 3M04A 3V3JA 1YO1A 2FNMA 1OQ5A 5SZ5A 3V3FA 5BRWA 1CNYA 3F7UA 3DVCA 2NXRA 5A25A 5JQTA 3ML5A 1CA3A 3DCSA 4Q09A 4COQA 1CALA 3MHOA 4FVNA 4PYXA 4Q87A 5EH8A 5JESB 1OKLA 1RZBA 5FNMA 3W6HA 3MNAA 3KOIA 4DZ9A 3TVOX 2F14A 2NNGA 4KP5A 4QJOA 4E3DA 2AX2A 3OIMA 3P5LA 3KONA 4ITOA 4YXUA 3ZNCA 1HCAA 4ZWIA 4FU5A 3LXEA 1FQMA 1IF4A 4YVYA 2EU3A 4YWPA 5DSLA 1TBTX 1FQNA 4FVOA 1CNBA 3DBUA 4ZWYA 5JGTB 1XEGA 2FOQA 4Q49A 1IF9A 4WUPA 3DA2A 1G1DA 1BNMA 4QSJA 4Q06A 1BNUA 1TEUX 5CLUA 4IWZA 4M2WA 4HEWA 5JEGB 3V3IB 1RAZA 3GZ0A 2AW1A 3S77B 5FLTA 1CVDA 5AMLA 1AZMA 5BRVA 3MHMA 4ZWXA 2ZNCA 3RYXB 4KNNA 5FLPA 3QYKA 1Z93A 4BCWA 3KWAA 4Q8XA 4Q99A 3S76A 3OIKA 3PYKA 3VBDA 1T9NA 3S74B 4E3FA 4R59A 4YXOA 3RJ7A 4LP6A 1YDDA 2FOSA 4XZ5A 3KNEA 4YGLA 4RH2A 4QSBA 2X7UA 2NXSA 1HEBA 1IF5A 2POUA 3IEOA 3M1WA 2EU2A 5FNHA 1IF7A 4MTYA 1BNTA 2Q1BA 2QP6A 5A6HA 5JG3B 4FPTA 2NNOA 1RAYA 2NXTA 4FL7A 5DSMA 3FW3A 3RZ1B 4E3GA 3N2PA 1LZVA 3T5UA 4QIYA 5EZTX 4YX4A 3M5EA 3S8XA 2WEOA 4K13A 3V5GA 3MNHA 3UYQA 4CNXA 1CAOA 5FLRA 1UGBA 4CNRA 3DC9A 3HKUA 1LUGA 3IBIA 4Q7VA 2H15A 3MHIA 3R16A 4Q0LA 5SZ2A 1DCBA 4YXIA 3B4FA 3F7BA 1RZAA 2NN7A 2CABA 4QK1A 1CAJA 4Q6DA 3KS3A 3ZP9A 4BF6A 1YDAA 3F8EA 1KWRA 3DAZA 4GL1X 4KNMA 4WR7A 1CVCA 1CVHA 2WD3A 1CCUA 4LU3A 4XIXA 3HKQA 3S78B 4CNVA 5E2MA 4X5SA 2QO8A 2CBDA 2FOUA 3M2ZA 1XQ0A 4ZX0A 3ML2A 4PYYA 1LG6A 1CRAA 5FNLA 1I9QA 2HD6A 4QJXA 4L5VA 1CVBA 3D92A 3P4VA 2FOVA 4ILXA 5JEPB 5JDVB 4Z1JA 4PXXA 2Q1QA 1ZSCA 2FNNA 3MWOA 4WL4A 5BRUA 3NI5A 3V2JA 1KOQA 1BNWA 3IBLA 3N0NA 1CVFA 3JXHC 3MNIA 4QJ0A 4HBAA 2HL4A 3K2FA 1G46A 3FE4A 1HECA 3RZ7A 1HUGA 1BNNA 5JGSB 3TMJA 4E3HA 1ZSAA 4KNJA 4RFCA 5G01A 4RUXA 1I9MA 1FR7A 3M2YA 1G48A 1OKNA 4QK3A 4Q78A 3T85A 1CNHA 3P5AA 1V9IC 4HT2A 1G3ZA 1CAIA 1CNWA 4WW6A 1TB0X 5DSPA 3U3AX 1BN1A 1CAKA 1HUHA 3P3HA 3OYSA 4HF3A 3MNUA 1KWQA 1I9LA 1CNIA 1AVNA 1ZFKA 1CAMA 4QSIA 3MNJA 2VVAX 3CYUA 5EIJA 2GEHA 5DSRA 1UGAA 2FMZA 2WD2A 3Q31A 4LHIA 5SZ3A 1CZMA 4HEYA 4MLTA 2W2JA 3T84A 5FNIA 4CNWA 5HPJA 1CNXA 1I9PA 1ZH9A 4C3TA 4Q8ZA 1TEQX 5E2SA 2HKKA 5G03A 1UGEA 2OSFA 4JSAA 4YGJA 3SAXA 1JV0A 2GD8A 3DD0A 4YGNA 4ETQC 3TVNX 4XIWA 9CA2A 3K34A 3W6IA 3HS4A 5AMDA 1TE3X 5E2KA 2ILIA 3D93A 5E28A 4JS6A 1LG5A 3HFPA 3SAPA 2H4NA 1ZFQA 2X7TA 4KUVA 4M2UA 4RFDA 3IBNA 4KUYA 2FNKA 5SZ7A 3N4BA 4YHAA 2CA2A 5DVXA 1JD0A 1MUAA 4N16A 3RGEA 1I91A 1RZDA 3S73B 5JG5B 3N3JA 3RZ5A 4MDMA 2VVBX 1CA2A 4K1QA 1CNKA 4RUYA 5EHEA 4K0ZA 5EH5A 1Z9YA 4QJPA 2CBEA 3T83A 3OYQA 1OKMA 3DCWA 4R5AA 3M5TA 3IAIA 1AM6A 1BN3A 1FSNA 1ZSBA 1TG3A 4HU1A 4M2RA 5FLSA 4RUZA 2NNVA 5E5RA 5BNLA 3M3XA 4IDRX 4Q90A 5FL6A 1DCAA 4MO8A 1UGGA 4MDLA 3IGPA 4YGKA 3CZVA 1CIMA 3MDZA 4HT0A 1DMXA 4UOVA 2OSMA 3L14A 4K0TA 1A42A 3M5SA 4QJMA 3DVBA 5EOIA 4ZX1A 5E2NA 3KKXA 5DSNA 5DSIA 3M2NA 3M67A 5FLQA 5EH7A 3JXFA 2WEGA 1CCTA 4XE1A 3U47A 3K7KA 1G53A 2HFWA 3KOKA 4KAPA 4Q7WA 4KV0A 5EKJA 3OY0A 1YO0A 3RZ0B 4QJWA 5LMDA 3M1JA 1KOPA 2NWOA 4ITPA 3BL1A 2X7SA 1BNQA 1IF6A 1J9WA 1HEDA 4TWLA 1FQLA 1CAYA 1I90A 3D0NA 3S75B 3CA2A 1CCSA 5EHVA 1V9EA 1MOOA 4Q7PA 1CINA 3M98A 1RZCA 4JSSA 3M96A 5SZ4A 1Y7WA 3SBHA 4MDGA 3V3GB 4E4AA 3DD8A 3OKUA 1F2WA 1I9NA 2NWYA 4HEZA 5EHWA 1I9OA 2HNCA 5SZ0A 4PZHA 3HLJA 3JXGA 3MHCA 5DRSA 5FNKA 1G4OA 4Z1KA 1FLJA 2NWPA 1FR4A 2CBCA 3V7XA 2POVA 5G0BA 4Q6EA 2WEJA 1G54A 2IT4A 3P3JA 3RYYA 4DZ7A 5C8IA 5FDCA 1ZNCA 1CVAA 3F4XA 1BNVA 1RJ5A 4L5UA 4Q81A 5L6KA 1G0EA 4CQ0A 4FRCA 4L5WA 1CANA 1CRMA 1DMYA 3D9ZA 1URTA 1KEQA 1BZMA 5DSKA 3C7PA 5E2RA 3FFPX 3RYZA 4Z1EA 5FNGA 3T82A 1CILA 6CA2A 1BICA 4QEFA 4QY3A 2FMGA 5IPZA 1HVAA 2NN1A 1I8ZA 3P55A 1BV3A 4G7AA 5DSQA 5JQ0A 1CNJA 4E49A 3P58A 2NWZA 2NMXA 3P44A 4E9OX 5FL5A 3D8WA 3KLDB 4ZAOA 3T5ZA 4Q7SA 3MNKA 3MZCA 4KNIA 1YDBA 3U7CA 3EFTA 4Y0JA 4FIKA 3V3HB 4KUWA 3M1QA 3MHLA 4YGFA 5J8ZA 3MYQA 1FQRA 4QSAA 3RYVB 5DOGA 4K0SA 1G0FA 4Q9YA 2ABEA 4ZWZA 1YDCA 5E5UA 1TTMA 1XEVA 4Q83A 5SZ1A 1CNCA 1LGDA 5DOHA 1THKA 2EZ7A 3NJ9A 1UGFA 1G45A 3M1KA 1CVEA 2O4ZA 2QOAA 3BETA 5AMGA 1CAZA 3NB5A 3PJJA 3HKNA 3RYJB 3S72B 3UYNA 2WEHA 5CA2A 1FSRA 4Q07A 4QTLA 4Z1NA 1RJ6A 3M40A 5DSJA 2POWA 5JEHB 1G4JA 4TWMA 2NNSA 4E5QA 1TH9A 1ZGFA 4Q8YA 3M2XA 8CA2A 1G52A 3RLDA 4WW8A 3IBUA 1YO2A 3CAJA 3OKVA 4G0CA 1HEAA 4CA2A 1TG9A 4RIVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3HKT A;  3M14 A;  4KP8 A;  4MLX A;  4WUQ A;  3R17 B;  1H9N A;  1UGC A;  5FLO A;  5FDI A;  3DVD A;  3S9T A;  1CNG A;  5FL4 A;  5BYI A;  4YYT A;  1IF8 A;  4RIU A;  1Z97 A;  4Z0Q A;  2FOY A;  2Q38 A;  2HOC A;  3RG4 A;  4XFW A;  1EOU A;  12CA A;  1UGD A;  4N0X B;  4JSZ A;  5SZ6 A;  1H9Q A;  1FSQ A;  2FW4 A;  1BN4 A;  1XPZ A;  3MMF A;  5L3O A;  5CJF A;  4JSW A;  4QIZ A;  3EFI A;  5CAC A;  4RN4 A;  1CAH A;  3RG3 A;  3SBI A;  3OIL A;  1BCD A;  3S71 B;  3U45 X;  5DSO A;  3RZ8 A;  5G0C A;  4M2V A;  4CAC A;  5FNJ A;  3PO6 A;  1ZE8 A;  4R5B A;  3DCC A;  3V2M A;  3DV7 A;  1G6V A;  1H4N A;  3DC3 A;  4QK2 A;  7CA2 A;  5EKH A;  4Q08 A;  2CBB A;  2CBA A;  3BL0 A;  1ZGE A;  1JCZ A;  3B1B A;  1RZE A;  4BF1 A;  4PQ7 A;  3S97 A;  5EKM A;  1HCB A;  3KIG A;  3M04 A;  3V3J A;  1YO1 A;  2FNM A;  1OQ5 A;  5SZ5 A;  3V3F A;  5BRW A;  1CNY A;  3F7U A;  3DVC A;  2NXR A;  5A25 A;  5JQT A;  3ML5 A;  1CA3 A;  3DCS A;  4Q09 A;  4COQ A;  1CAL A;  3MHO A;  4FVN A;  4PYX A;  4Q87 A;  5EH8 A;  5JES B;  1OKL A;  1RZB A;  5FNM A; 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