5DT6A

Crystal structure of the drosophila glur1a ligand binding domain complex with glutamate
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
266
structure length
266
Chain Sequence
GSYDRNHTYIVSSLLEEPYLSLKQYTYGESLVGNDRFEGYCKDLADMLAAQLGIKYEIRLVQDGNYGAENQYAPGGWDGMVGELIRKEADIAISAMTITAERERVIDFSKPFMTLGISIMIKKGTPIKTPEDLTMQTDVNYGTLLYGSTWEFFRRSQIGLHNKMWEYMNANQHHSVHTYDEGIRRVRQSKGKYALLVESPKNEYVNARPPCDTMKVGRNIDTKGFGVATPIGSPLRKRLNEAVLTLKENGELLRIRNKWWFDKTEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Novel Functional Properties of Drosophila CNS Glutamate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Drosophila melanogaster
molecule keywords Glutamate receptor 1
total genus 88
structure length 266
sequence length 266
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-09-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dt6A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dt6A02
3RT6B 5AE4A 1MXZA 1RYXA 3UGWA 1UTBA 4ELQA 2XD3A 4IGTA 5H8HB 1Y3NA 2O7UA 4R2FA 4F3SA 3PV0E 3TFLA 2DXRA 4H5FA 3SDFA 3IOTA 5CMBA 4BDLA 1WODA 1P99A 3MQ9A 4XKQA 3K4UA 3KOSA 1XHYA 2OJTA 2O6AA 2DWIA 2Z8DA 4ECFA 3MZBA 4OEUA 3UP9A 4ZECA 5DVJA 3CI8A 4Q30B 1FTOA 5H8QB 1Q35A 3OD7A 4EF1A 2XD2A 1IXGA 3IAZA 1MM7A 4G8NA 5L9MA 4U21A 4F2OA 5FHMA 4H8JA 3TQWA 3DP4A 3H7MA 2THIA 2QRYA 3MW0A 1B4ZA 4JSDA 1XVYA 4P0IA 4F39A 3LSLA 3ZSFA 1TXFA 1POY1 4OFJA 3FVOA 3OOAA 3S4UA 4NWDA 1Z7ME 5AA3A 4BDNA 3K2DA 1N7XA 3M8UA 1MQJA 3QIMA 1N76A 1NNTA 4F18A 4LQ5A 1B6HA 3C31A 1IXIA 2DWJA 3MPKA 2V84A 1FTMA 4WEPA 3LUYA 4OERA 3K1MA 2Z8FA 3IK6B 2XXTA 1A8FA 3W9VA 4LQ2A 5FTHA 1Y4TA 3B6WA 4HCYA 3L6GA 4OFOA 4G68C 1B05A 3VE1B 4F2QA 3QK6A 3IO4A 3PU5A 3TDJA 1WVJA 3OSRA 3QSLA 1B4HA 2QS3A 3MC2A 2PT2A 1A40A 1A55A 4N6PA 2QMXA 2IEEA 3PD9A 5TPAB 3MJNA 1BTJA 3K6VA 4F31B 1FTKA 2UVJA 4ZS9A 3PMXA 5A5XA 4RPOA 5DEXA 2XXVA 3MVWA 4PFUA 2KLFA 4F3PA 1MY0A 5I58B 4ISUA 2F97A 3C36A 1FCKA 2ONRA 3RT8A 1I6BA 1LBBA 4ZEKA 1DMBA 3CG3A 4QFPA 1QW0A 1TWYA 1EH3A 3RLFE 1O63A 1HSJA 1FQAA 4JWYA 4O3CA 3R7XA 3TKDA 3S9NC 4RXLA 5H8NA 3FXUA 4TQUQ 4TLMB 3PUZE 4NE4A 4DDDA 2RC7A 4L17A 2Y7KA 4KHZE 4YZZA 2HXWA 5I2KB 1URSA 2DQVA 4DLDA 1O7TA 4KD5A 2Z23A 3IJXB 3PPOA 3DLNA 1F9BA 1UTBB 2REJA 1B32A 1R9QA 2RCAA 3U92A 3N26A 5L9OA 4GFRA 4QSDA 1IUDA 1JVXA 4P0GA 1N0TA 2O1MA 3E3KA 2Y7PA 4QF9A 2OWSA 1QJMA 2DWHA 1URDA 5HPQA 2HEUA 1S7YA 1M5FA 1MH3A 1IQ7A 1O64A 4MF3A 5TU0A 3E9XA 4LONB 4WEDA 3USDA 3MAMA 1AL3A 4HCWA 1MS7A 4EQ9A 1D3KA 4RY1A 3LSXA 4BDOA 1PB8A 4NWCA 4LZ5A 4BDRA 1POTA 2F36A 4KFQA 4DZ1A 2HCAA 3S9EA 4ND9A 3K01A 4LUBA 2QPQA 4DCXA 4OENA 1UIUA 3GLBA 3SETA 1XOCA 1JEUA 4YKJA 1LAGE 3KBRA 4POXA 2D5WA 1NNPA 1GVCA 3RPWA 5LOMA 2XX9A 3OENA 2ZYKA 3K1PA 4QFNA 1H44A 5KZTA 1QVSA 4IO6A 4PFWA 4ELRA 1XVXA 2O84X 1ATGA 3MP6A 4QSEA 4YKIA 1D9YA 2QSXA 3QYTA 1AMFA 4GF8A 4FEDA 3O6GA 4RPNA 3KEIA 4H8IA 5I84A 1DPPA 4Q5TA 3G7WA 2DP8A 4U2RA 4ZE8A 4R75A 4ZZAA 3G3KA 2QL3A 4FEBA 1GR2A 1JEVA 4XKRA 2NVUB 4POWA 1NH8A 2HZLA 3KSJA 5IKBA 3THIA 1MY3A 3O29A 4XKPA 1FQFA 3MVYA 4QFOA 3TUSA 2LAOA 2GFEA 1BKAA 2DE2A 3PGFA 1NH7A 4KYEA 1B3FA 1Q1KA 2ZXTA 2VD2A 2I6EA 1Y3PA 1R6ZA 3HSTA 1YPNA 2F7AA 2PVUA 3K02A 2ZYNA 1ZKBA 1SI1A 5AA2A 5KDTB 5A5XB 3MP1A 3OO7A 5DEXB 3O66A 3BFUA 3MVXA 4Q8RA 3N5LA 3R6UA 1NL5A 4PE5B 1PC3A 4M1VA 4YB5A 3CR9A 4LP2B 5I59A 2O7IA 5I56A 3BFTA 4U4XA 2AIXA 4O3BA 4DE8A 3O97A 4YICA 3TAJA 4AB5A 3H6UA 3HN0A 1B0LA 2OWTA 4PFTA 5CMKA 3I6VA 3A3CA 4X9TA 4THIA 4KYDA 4FECA 2ANJA 2I48A 4OXVA 1FQEA 5H8NB 2DOJA 4TOZA 3AXFA 3RUMA 5CBSA 3H03A 2ZNTA 1N3WA 1IIWA 1MXWA 3TCFA 3FIRA 3M3FA 1EZ9A 1QULA 3O9PA 2I0CA 4PFYA 3RQTA 3PD8A 2QJEA 2NUVA 1URGA 1MQHA 1MPCA 5L9SA 1JQFA 4KPTA 3RNNA 3EPEA 2E1SA 3OO6A 4YMAA 2P0SA 4ZEBA 4F3GA 3IB1A 4KQPA 3OELA 2I4BA 3SEVA 1UIVA 1II5A 3T9HB 2H99A 3PUVE 2IA4A 2G93A 1B9JA 4PETA 3VVEA 1OQGA 2H25A 2PMSA 4N07A 1HSEA 3U93A 1BP5A 3FJ7A 4GWOA 3SEXA 5I2NB 4JDFA 1Y20A 4YMBA 1FQCA 2X26A 1I6QA 3QXMA 1VSOA 1PDAA 4EQ7A 1ZU0A 5JEIA 1SYHA 1DTZA 1Y1ZA 1B3HA 5ELVA 3IJOB 4OZ9A 5F1QA 4DXUA 4U1OA 2UYFA 4IO2A 3WAEA 3OO8A 3CIJA 3Q27A 3T22A 4IGRA 3CG1A 1B3GA 1IXCA 1IZ1A 2GH9A 3MPLA 3PUXE 4GIZA 1OQHA 1SW5A 3V89B 1ELJA 3U1OA 3DP6A 1L5TA 5K2YA 1DPEA 4F29A 1B0HA 2I4CA 3ZKKA 4XIGQ 2PYYA 4FJPA 4GRKA 1QUKA 5CMCA 3LSFB 4GL8A 3C34A 5TP9A 3IORA 2DVCA 1UTHA 1YCJA 4MBPA 2D21A 4NF4A 2Y7IA 2I3WA 2D3IA 2QS1A 4ZEIA 3VDFA 2V3UA 3IX1A 4E0XA 1B51A 4MH5A 5ITPA 1NKXA 2O69A 2XXWA 3U72A 5I57A 1MDQA 3G3JA 4H65A 4U23A 2OLBA 4KYSA 2H4IA 3K6UA 1JW1A 3VLWA 1LSTA 3FVKA 1JNFA 3U8QA 4GXAA 4KCDA 3FXQA 4ZDMA 2DXYA 1PBPA 3FJGA 3ZKLA 3H6WA 4XXUA 5EHSA 5AA2B 1TFAA 2OK2A 2ESNA 3OO9A 5KCJA 3IOVA 4EXLA 4OWDA 3S9LC 3KN3A 3GXAA 4R9FA 3LC8A 3UK4A 1QKAA 4RNSA 3QAXA 5I59B 3M3KA 3T9VA 5I56B 3KN8A 4NF8B 3CRBA 2H98A 5AA2D 2XXQA 1LAXA 1MPBA 2F7CA 5J1DA 3O2AA 4JSOA 2ZNUA 5BUUA 4X1DA 3TMGA 3A3UA 1MPDA 1LB8A 3UA8A 3EHUA 3FASA 3FZVA 1IEJA 4UA8A 1XT8A 1MY1A 4I8CA 1Z7NE 1MQIA 2FYIA 1IITA 4U22A 2ONSA 2R9JA 5ISUA 3D4CA 4U4SA 4EQBA 4GOTA 2RC9A 1EZPA 4AQ4A 3K6WA 2Y84A 3FATA 2ONKE 5JTYA 3VXCA 4OEVA 3FUZA 2GRVA 1FTJA 2F5XA 4R2BA 4GD5A 4LVQA 4GXSB 3TZAA 1TT1A 4KR5A 2AL4A 2VOZA 4ZEDA 4F1YA 1P1WA 3W15C 2VGQA 2OBGA 2F6GA 3VVFA 5DT6A 1MH4A 4RJZA 4DXCA 4QHQA 3C35A 3SKPA 1LFHA 2XX7A 1AIVA 3V5AA 3PUWE 4FATA 4OESA 5EHMA 1PBQA 1GV8A 2ALUA 1RKMA 1N04A 1I69A 3JYRA 1QUJA 2X7PA 3N6UA 1B5HA 3DM0A 1B46A 3N6TA 4G4PA 3VV5A 4RA1A 3TTKA 1SW2A 1ZMGA 3MP8A 4C1TA 4BDQA 1EZOA 1B2HA 3ODBA 2H9BA 1QKBA 1LCTA 3CFLA 3BBRA 3D4GA 3KFMA 3VVDA 3IO6A 4R74A 4NF5A 4DIGA 3LSWA 4BDMA 1LBCA 3VLVA 3PPPA 4OYVA 4ZE9A 2FA7A 3HHFA 5TP9B 4G68A 4OHNA 4G77A 5CI5A 3FXRA 4JB7A 1UTHB 2UVHA 1P1NA 5EYFA 4NF4B 4C0RA 1JVYA 3UIFA 3RGYA 3G3HA 1BLFA 4FAJA 3EHTA 1UQWA 2QS2A 5CRYA 3ONMA 4IY5A 5ICTA 1LB9A 5I57B 4H67A 3TPAA 2O51A 4WXJA 5ICQA 1HSLA 2DYXA 4TLLB 3CFXA 3HCQA 2HFBA 4MLQA 3I3VA 3KGCA 1R1NA 4P11A 4NF6A 2GHBA 4NEDA 4YB6A 4XTCQ 3FD3A 3HHGA 3IL1B 1VE4A 4GVOA 1MDP1 3DELB 5KCJB 4C1UA 1SW4A 4LZ8A 1OLAA 3PPQA 3Q29A 4O3AA 1J1NA 3EF7A 1LGBC 3OMBA 4ELPA 1SDXA 4K3FA 3PMVA 5H8SA 2WKYA 2H5YA 2VP1A 2A5TA 1D4NA 2XXHA 2HZKA 5CMMA 1USYE 2M8CA 1CB6A 4YU0A 3IOWA 1B40A 1B1XA 4HW8A 4Z7EA 4JWOA 2QS4A 3K6XA 3QUJA 2VD3A 1Y3QA 2DS9A 3FJMA 3H06B 3MBPA 4X1BA 4RK9A 3UORA 1NNKA 1B7UA 1A7LA 1M5CA 4RK2A 4PP0A 3RN8A 4ELOA 3SEYA 2XXXA 4R72A 3IB2A 1I6AA 1VFDA 4KCCA 1AOVA 2HAVA 2F34A 3KJTA 5JTYB 2G29A 5AA4A 3PUYE 4QFLA 4IO5A 1B1HA 1VR5A 1SBPA 4JBZA 3S2VA 2X7QA 3KZGA 1SYIA 3EQ1A 3RTWB 1MXYA 3G3IA 5DVIA 2PBWA 3KJ7A 1KWHA 1D9VA 2V93A 4RYAA 4MLVA 4R9GA 3TQLA 1LFGA 2FNCA 4R6YA 4OETA 1CE2A 2AYSA 3GBBA 3M3LA 3MVZA 4H5GA 2UVIA 1FQBA 5CM6A 3UN6A 3HO7A 1P1OA 3KSXA 2V3TA 2XXUA 4YAHX 5H8FA 2E0SA 2OZZA 1ZJLA 4Q0CA 2UXAA 1NNFA 3TODA 1SD3A 2I49A 4AB6A 3GBAA 3CSGA 4FE8A 5M2VA 4IY6A 4OMBA 1P1UA 3V83A 4F3BA 5CC2A 3H3GA 3JV9A 1AH5A 4NF5B 2XXRA 3CSBA 1M5BA 3VFJA 4IB2A 1SI0A 5AA1A 3VXBA 4G8HA 3ECRA 1EU8A 1USYH 2AL5A 3LR1A 1ZTYA 2RINA 3ILTB 3ZS6A 4G68B 2F7BA 2B3BA 3A09A 4MFIA 4F22A 2NXOA 3C33A 4GL0A 3H4ZA 3TCGA 2RKMA 2RC8A 5FHOA 3FGSA 4JXIA 4QFKA 4N13A 3KN7A 4H6DA 1IXHA 3Q28A 2PX1A 3O28A 1SVXB 3G3FA 3P7IA 4NF6B 4ZEFA 2Q2AA 3K1NA 3MZ1A 1SW1A 2YJPA 1US5A 1Y9UA 2XHDA 2XXIA 4QSCA 4ESWA 3Q25A 2V25A 1N7WA 4IO3A 2HQ0A 3CFZA 1MG1A 4OQOA 4EUOA 3PPNA 3OXNA 3TTLA 4GQOA 4H0WA 4OVJA 1JW4A 1MXXA 5KDTA 4F19A 4YB7A 1PEBA 5FHNA 1A99A 4IO4A 3TELA 3B6TA 1DOTA 2F35A 4R6KA 3KG2A 2A5TB 1M5EA 2XXPA 4OTEA 2B3FA 2XX8A 4NMYA 4R6HA 4HS7A 2F8DA 4IO7A 3HV1A 1WDNA 3I5OA 3JZJA 1ZIUA 1XS5A 4M4GA 1GTKA 3C32A 3HPIA 3GZGA 3VLUA 2Q89A 2UYEA 1H3DA 3QUFA 3T9UA 1LLSA 4Z0IA 4YKPA 1ANFA 3FVGA 4F1UA 2I3VA 3SEUA 1BIYA 3RTFB 4FIMA 2DSFA 5CBRA 3MWBA 5DTBA 3OEKA 5DVFA 1Y1MA 1NFTA 1Y4CA 3Q26A 2ZMBA 3H6VA 1ZBMA 4X48A 4G8MA 3R26A 1LAFE 5AA4B 1OVTA 1YAEA 2ZNSA 1P1QA 4R73A 5F7VA 4H1XA 4U1ZA 5H8HA 1FQDA 2Y7WA 2Q8JA 4DCYA 1M5DA 2ZYOA 3FV1A 3F11A 1N3XA 2UVGA 3TCHA 1MXVA 4HTGA 3IB0A 3RY3A 4UACA 3KOTA 4G2ZA 1YTVA 2CMOA 2Q88A 3SEWA 3E13X 1GGGA 1PB9A 1B52A 2ABHA 5B70A 5DYHA 1SQYA 5H8FB 5HBCA 5H8QA 3TTMA 5I2NA 4NTLA 4BLAA 4KI0E 3CVGA 3H6TA 4XKNA 5L8DA 2NWJA 2Q9TA 3IOUA 2DE4A 2Z8EA 2ZYMA 3C4MA 2DE3A 4OFLA 4WKMA 4EDPA 3K0VA 3T66A 3K00A 1B3EA 1MY4A 5ITOA 2XXYA 3MZ9A 5K2XA 1MM6A 3TTNA 4F1VA 3T96B 5B7DA 2A5SA 4GLIA 2CZLA 2REGA 2OCUA 4ZZEA 4EF2A 3MUQA 4YKKA 3TTRA 3WAFA 2DWAA 1B3LA 1MQGA 2R71A 4LATA 1B5IA 1H76A 2VHAA 1FW0A 4FORA 3PMWA 2DVZA 3TYHA 1LCFA 5JK4A 4I1DA 4E0WA 1JETA 4LA9A 2P2AA 1B7ZA 1B7HA 1OIBA 3EN3A 1LFIA 1MY2A 2F6PA 3T9XB 3T93B 1S9TA 4I9DA 2V3QA 2HAUA 2R6GE 1OVBA 2RF1A 2QMWA 1T0KA 5BWJA 3B6QA 1DTGA 5HM4B 3BKIB 2GHAA 1VFEA 3W9WA 2PT1A 3SERA 1S50A 3G3GA 5FTIA 3EHSA 1A8EA 2I0BA 2NOOA 3DP8A 4JWXA 5TPAA 3LBSA 1B58A 1RYOA 3OEMA 2W7YA 2Z22A 3O6IA 4LZ7A 3OSQA 3TEPA 2O68A 1R9LA 1N84A 5I58A 5IAIA 2Y7RA 4QRZA 2YLNA 1LAHE 3N94A 1MQDA 2F78A 1DSNA 2B65A 2YPNA 3ILUB 1FTLA 1XC1A 2BJJX 3L6HA 2P1SA 4NF8A 3SESA 4I62A 4ONYA 3C9HA 4DXBA 3V8XB 1QUIA 3FVNA 4EXKA 1OMPA 2Q2CA 3FV2A 1TFDA 3S9MC 3O6HA 3B7DA 1H43A 1A54A 2RCBA 1US4A 1ZLQA 1MRPA 1PB7A 1B5JA 4ESXA 2O1LA 1H45A 3E4RA 1OLCA 4PQJA 2I58A 5I2KA 1JW5A 3U94A 3IR1A 3PPRA 1NMUA 1MXUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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