5DT6A

Crystal structure of the drosophila glur1a ligand binding domain complex with glutamate
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
266
structure length
266
Chain Sequence
GSYDRNHTYIVSSLLEEPYLSLKQYTYGESLVGNDRFEGYCKDLADMLAAQLGIKYEIRLVQDGNYGAENQYAPGGWDGMVGELIRKEADIAISAMTITAERERVIDFSKPFMTLGISIMIKKGTPIKTPEDLTMQTDVNYGTLLYGSTWEFFRRSQIGLHNKMWEYMNANQHHSVHTYDEGIRRVRQSKGKYALLVESPKNEYVNARPPCDTMKVGRNIDTKGFGVATPIGSPLRKRLNEAVLTLKENGELLRIRNKWWFDKTEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Glutamate receptor 1
publication title Novel Functional Properties of Drosophila CNS Glutamate Receptors.
pubmed doi rcsb
source organism Drosophila melanogaster
total genus 88
structure length 266
sequence length 266
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-09-17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dt6A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5dt6A02
4TOZA 1BKAA 1VSOA 4RYAA 2R9JA 1LB9A 3K6VA 1M5BA 2DVCA 3HN0A 1D9YA 4YMBA 4ESXA 2P1SA 4R75A 2QRYA 3GBBA 1GVCA 2A5SA 3C31A 2Y7IA 5JEIA 3OXNA 3LSWA 2F35A 5AA2B 4LA9A 1SQYA 4F2QA 2CZLA 5H8NA 2ZYKA 2RF1A 2DE3A 4OENA 5B7DA 4G4PA 3K2DA 1B3FA 4DZ1A 1USYH 1DSNA 4BDOA 2XX8A 1ELJA 4NMYA 1M5FA 2Q2CA 4RNSA 4DCXA 2DWHA 2YJPA 2UVGA 3QUJA 5TU0A 1YCJA 3FATA 4HCWA 4Q5TA 4OFOA 1URDA 3VVEA 1Y3PA 3FUZA 3TQLA 2FYIA 5HM4B 1QW0A 4O3AA 4HW8A 3M3FA 3RQTA 4X48A 2GHAA 2RC8A 4NF6B 3G3KA 4QHQA 4GD5A 2H99A 1OIBA 3DLNA 4F39A 2REJA 1EZPA 5KCJA 3O29A 2Z8FA 1IZ1A 4MLQA 2KLFA 2Z8DA 3H6VA 4I1DA 2UYEA 2E0SA 2PMSA 4N07A 4GQOA 1JEVA 4KCCA 4LONB 3T9UA 1PB9A 2H25A 1R9LA 4C0RA 1ZKBA 3TTNA 1GGGA 3PD9A 4IY6A 1AIVA 3UIFA 3T22A 2F97A 3TCFA 2OWSA 4R74A 4ZECA 5JTYB 2P2AA 3K1NA 2ONRA 3LR1A 2F6PA 3PGFA 1YPNA 2XD3A 4KYSA 3ZKLA 4LUBA 3FIRA 1UTHA 2DOJA 1NKXA 1OLAA 2BJJX 3K6XA 3MZBA 1FTJA 4ZEKA 1VE4A 2DS9A 3RGYA 1LB8A 3IL1B 3IJOB 3DM0A 1AH5A 1TT1A 2R71A 4UA8A 1AOVA 1MQGA 2X26A 5AA4A 2ESNA 2DE4A 1DOTA 1H45A 3C35A 2LAOA 3T9XB 5AA2A 3SERA 1I69A 1N84A 2OK2A 3K00A 5L9MA 2DWIA 1B0LA 3K6UA 4IGRA 5DTBA 4XTCQ 1A7LA 3KN7A 1MQDA 1B3HA 3HSTA 3O28A 4H8IA 2PYYA 3PMWA 3OEKA 1USYE 3OENA 4JBZA 1WDNA 3DP4A 3W15C 3ZKKA 4PQJA 4IGTA 4RJZA 2DQVA 2F5XA 2VGQA 2XXIA 4ZDMA 1URGA 3RY3A 1Y4CA 3KG2A 2DXRA 5L9SA 1KWHA 2B3FA 3PUWE 1NL5A 3G7WA 3F11A 5ELVA 3IOWA 3MBPA 3PPOA 4KYEA 2ZYNA 1B05A 3IORA 1Y1ZA 2V3QA 2AL4A 2Y7PA 1PBPA 3KN8A 3KOTA 4AB6A 4OFLA 4QFPA 3FVNA 4EUOA 4U2RA 5F1QA 2OWTA 3V8XB 4IO4A 1JW1A 2GRVA 3EHUA 3MC2A 3O6IA 3S4UA 1I6BA 3A3UA 2UVJA 2H9BA 1LFGA 3FV1A 5I58B 1SVXB 4FE8A 4DLDA 2XHDA 1Q1KA 3SEVA 3E4RA 1OQHA 3M8UA 3SEXA 3UK4A 2GHBA 2Q89A 5DVIA 4FECA 1JW4A 4X1BA 2XXHA 2Y7RA 3VE1B 1US5A 3C32A 1QVSA 3DELB 2HAUA 4FEBA 4YB7A 3PU5A 3FVGA 2H4IA 2A5TA 4BLAA 4G8MA 4GF8A 4Q0CA 1NH7A 5CC2A 4R73A 1S9TA 1FQAA 3VVFA 3CVGA 3ILUB 1JETA 1LAFE 4FIMA 1TFAA 1AL3A 5H8FB 1GTKA 1D4NA 3G3GA 2I48A 2HEUA 4ELQA 4ZEIA 2I0CA 4JWXA 4H6DA 3C34A 3Q27A 4MFIA 1B52A 4R6KA 4KR5A 1A54A 4OFJA 2O6AA 2VP1A 1M5EA 2NOOA 1H44A 3P7IA 3IOUA 5ITPA 3UORA 4G2ZA 1EU8A 1MRPA 3IK6B 4ECFA 4QFNA 2I3WA 4FATA 3PD8A 4Q8RA 1N7WA 3HV1A 5CBRA 2HAVA 5I2NA 4F2OA 1Z7NE 4G8NA 3KSJA 2DWJA 1MM7A 3IB0A 1DPEA 3CRBA 2Z23A 1RYXA 2AIXA 3VFJA 3MP1A 1IXCA 2B3BA 3V89B 4XKPA 1L5TA 1B51A 1IXIA 1OLCA 4YAHX 4MF3A 1LGBC 1B2HA 1J1NA 2PBWA 3SKPA 1POY1 2HXWA 2HQ0A 5L8DA 2QPQA 2XXWA 1MQIA 3VLVA 3D4GA 3TZAA 3W9WA 1QUIA 3T96B 1I6QA 3CIJA 3UN6A 3BFUA 2DXYA 4IO6A 5KCJB 4YKIA 3K4UA 3H6TA 2ZXTA 4R6YA 3UGWA 5K2XA 1ZTYA 2F34A 1M5CA 1XT8A 4LZ5A 1SYIA 4GL8A 1B5IA 3R26A 3FJMA 3RNNA 3OSQA 3EF7A 1ATGA 4F1UA 5FTHA 4LZ8A 4K3FA 3RTFB 2PX1A 3IB1A 3R7XA 1PEBA 4EXKA 4AQ4A 4ZS9A 1NNKA 1P1QA 1N0TA 1UTHB 1B7UA 4H5GA 4MH5A 2UVHA 4U4SA 1BLFA 4JDFA 2X7QA 2RINA 4KQPA 1M5DA 4F1VA 3B7DA 3M3LA 4H1XA 3VXCA 4DE8A 1B7HA 2H5YA 1F9BA 4NF4B 5AA4B 2I6EA 4AB5A 3C33A 3U8QA 1O7TA 4JB7A 3PMXA 3LBSA 3V5AA 3Q28A 3C36A 1IXGA 4QRZA 1XVYA 4OWDA 4H0WA 3L6GA 3TTKA 1D9VA 3HHGA 1SD3A 5BWJA 4IY5A 3N6UA 4OZ9A 2FA7A 4UACA 2XXRA 2O51A 3Q26A 1MH4A 1MXXA 4F22A 2Q8JA 2RC7A 4O3BA 1A99A 3FXRA 2Q2AA 3VXBA 5FHOA 2QS4A 5AA3A 3OEMA 4G68C 3KEIA 3FGSA 3CFZA 5M2VA 1YAEA 1NMUA 4IO5A 2HFBA 2HCAA 3WAEA 2O69A 3Q29A 4EF2A 3T9VA 1II5A 3I6VA 1HSEA 2V93A 3H3GA 4YB6A 3THIA 1IXHA 3G3JA 3CSBA 4NWCA 3T93B 4OYVA 3QIMA 4THIA 4I8CA 3S9NC 1B3GA 1MH3A 3I3VA 3OO6A 1QKBA 2G93A 3A3CA 4BDMA 3RT6B 1FTKA 1DPPA 2NVUB 1H3DA 5HPQA 3H6UA 3S9LC 1POTA 3O6HA 2DE2A 3S2VA 2XXYA 3N26A 2Z8EA 4F1YA 4LQ5A 4E0WA 4LQ2A 2I49A 3K1PA 5TPAA 4MLVA 4X1DA 1US4A 2A5TB 1B5HA 3A09A 2B65A 3IO4A 3MWBA 4TLMB 1MY4A 4KYDA 4GFRA 3CSGA 3HPIA 3SDFA 4NF4A 2WKYA 3PUXE 1IUDA 4H8JA 3KJ7A 1XOCA 4G68B 1B0HA 4P0GA 2QS2A 4NE4A 1YTVA 2PT1A 3IOTA 3MP6A 3ONMA 4U1OA 3R6UA 2HZKA 5J1DA 3E9XA 1DTZA 3PPNA 3BFTA 1LAGE 3MZ9A 5AA1A 1ZU0A 1ZJLA 3T9HB 4F3PA 3H7MA 4NWDA 1NH8A 4JWOA 1JVYA 4ESWA 2XXTA 1B1HA 3VDFA 1B46A 2XX9A 1MQHA 1IIWA 1URSA 2IA4A 4QFOA 1EZOA 4KFQA 5I2NB 1B4HA 1MXVA 2ZNUA 2X7PA 3H6WA 3O9PA 4YKKA 2ALUA 1JW5A 3CFXA 4BDNA 1QULA 3CR9A 1RKMA 3BBRA 5H8SA 4DIGA 2Z22A 1B1XA 5EHSA 1N04A 3FVOA 1MY0A 1BP5A 3EHTA 3RLFE 2ZNTA 4RXLA 1MPBA 4RY1A 5FHNA 3DP6A 4ELPA 1MQJA 3TCGA 2RC9A 3TUSA 3K02A 3N6TA 1MPCA 3G3FA 2UXAA 1GV8A 1Y20A 3FXQA 3W9VA 1PB7A 3B6TA 4DXUA 4IO7A 3SETA 4GLIA 1B3EA 4JSOA 1WVJA 1VR5A 3GBAA 4U22A 4ZEFA 3LUYA 4R9FA 3OO9A 3BKIB 4LZ7A 1TWYA 1O63A 2OLBA 4POWA 2V3UA 2VD3A 3FV2A 4FORA 3KSXA 3K0VA 3PMVA 4JSDA 4X9TA 4F3SA 2DVZA 1H43A 1VFEA 3E13X 3AXFA 4F3GA 2NXOA 4G77A 2O1MA 4G68A 2DSFA 1XC1A 5CM6A 4KI0E 4EF1A 1DTGA 3FD3A 4C1TA 1OVTA 3MAMA 1MY2A 4Z0IA 2D5WA 3TTRA 1QUKA 3TYHA 1TXFA 4XKRA 4YKPA 3O66A 1MG1A 1ZIUA 3QAXA 4YMAA 2XXUA 4U23A 2REGA 5CI5A 5CMMA 1IITA 3QYTA 5B70A 3OD7A 3EPEA 4IB2A 1A8EA 3MPKA 5ITOA 1Y9UA 1B7ZA 2QJEA 2AYSA 3KBRA 1QJMA 1FQBA 5H8HA 4WKMA 3LSLA 3K6WA 1IEJA 2THIA 1LLSA 4OTEA 3MVZA 3KFMA 2RCAA 1MXWA 3HO7A 2QMWA 3GZGA 4QF9A 2XX7A 5IAIA 4ZEDA 3USDA 1NNTA 2O1LA 5CBSA 4PE5B 3SESA 3U72A 4RK2A 1AMFA 5LOMA 3JYRA 2F7CA 3C4MA 1MDQA 1NNPA 4YICA 4GXSB 2I3VA 3C9HA 1PDAA 4NF8A 3TDJA 3FASA 3MUQA 2Y7WA 3QXMA 3OO7A 3PPRA 4OQOA 4R72A 3QSLA 3OMBA 3I5OA 1N3WA 4NF5A 3RUMA 3O97A 1MY3A 3MW0A 5HBCA 1FTLA 4EDPA 1CB6A 1FCKA 1LAXA 4ZE8A 3RPWA 4N13A 3M3KA 4WEDA 2IEEA 2XXXA 2OJTA 3VLWA 1PB8A 1LSTA 4QFKA 1MPDA 3RN8A 1B3LA 3TKDA 3V83A 4R9GA 5TPAB 1Y4TA 4PP0A 3VLUA 2Y84A 2GFEA 3TTMA 5AA2D 2DP8A 5A5XB 1EH3A 4KPTA 2ANJA 5F7VA 2OCUA 3DP8A 3TCHA 4L17A 3RT8A 1Y3QA 5CRYA 2YLNA 1NFTA 4NTLA 4QSDA 4PFYA 4TLLB 1Y3NA 2QSXA 2ZYOA 2OBGA 2D21A 3N94A 3S9EA 3LSXA 1B6HA 4ZZAA 4O3CA 5H8QA 4FAJA 3IJXB 1XVXA 1FQEA 4OEUA 3L6HA 4GIZA 1TFDA 4LP2B 4DXBA 1R1NA 1MM6A 5KDTA 3HHFA 5I57A 3PUZE 3CG1A 2W7YA 3D4CA 2NWJA 2O7IA 5FHMA 2I0BA 2OZZA 1UIVA 3ODBA 4PFUA 3LC8A 2VHAA 2V3TA 4BDQA 1SI1A 1CE2A 4EQ7A 5K2YA 4LVQA 2QL3A 4GWOA 2GH9A 3PUYE 1Z7ME 4F29A 3TMGA 4OESA 1ZLQA 3IR1A 5IKBA 1SW2A 4KD5A 2M8CA 2YPNA 4QFLA 4ZZEA 4GXAA 4JXIA 2PT2A 1PBQA 3GXAA 5ICTA 3WAFA 5DEXA 1WODA 1S50A 2I4CA 4RK9A 3TEPA 2VD2A 5I59A 3MVWA 3OSRA 2UVIA 1MXYA 5I56B 4G8HA 1O64A 1B9JA 2ABHA 3KJTA 4JWYA 4PETA 1A40A 4POXA 2UYFA 4ISUA 1UQWA 4OHNA 2DWAA 3TELA 1A55A 1Q35A 3UP9A 4WXJA 3EN3A 3U94A 1VFDA 5A5XA 1T0KA 1SDXA 3KN3A 2P0SA 3PV0E 3ZSFA 3E3KA 2QMXA 5AE4A 2ZYMA 1N3XA 4ZEBA 3OO8A 3SEWA 1R6ZA 2XXPA 1Y1MA 3MPLA 5BUUA 2O68A 4GVOA 2VOZA 4M4GA 4H5FA 5FTIA 2ONKE 3KGCA 4HTGA 4OETA 4YB5A 1SBPA 4M1VA 4RPNA 4HCYA 3HCQA 5DYHA 2RCBA 3IOVA 1I6AA 3H03A 1LFIA 1A8FA 3SEUA 4H67A 3TODA 3FJGA 3CFLA 1SI0A 1OQGA 4ZE9A 3ILTB 4LATA 3O6GA 1BTJA 4OERA 1NNFA 1B58A 1IQ7A 1FTMA 4I9DA 3O2AA 1MXZA 4ND9A 4TQUQ 4U4XA 3K01A 2F7AA 3G3IA 3K1MA 5H8HB 2RKMA 1B32A 1FQFA 3OELA 1B4ZA 1EZ9A 2Q9TA 2ZNSA 3LSFB 1N76A 1LFHA 4EXLA 1JEUA 4NF6A 5L9OA 1R9QA 3G3HA 5ISUA 1UIUA 1P1NA 4F31B 3Q25A 4BDRA 5TP9B 1H76A 5CMCA 2NUVA 1OMPA 1ZMGA 4R2BA 3B6WA 4GL0A 3U92A 3T66A 3IX1A 2QS1A 1FTOA 5I56A 3S9MC 4XKQA 3H06B 2V25A 4FJPA 3U1OA 3MVXA 5CMBA 4E0XA 4NF8B 2AL5A 1OVBA 4YKJA 1UTBB 2R6GE 4PFWA 4QSEA 4R6HA 3CG3A 3U93A 5JTYA 1MS7A 5I84A 4NF5B 3MJNA 1LAHE 4P0IA 4DDDA 3PPQA 1SW5A 2HZLA 3B6QA 3RTWB 4IO3A 1P1WA 5KZTA 2I58A 3OOAA 1QKAA 3QUFA 2FNCA 1RYOA 3FZVA 5ICQA 1HSLA 2ONSA 5JK4A 2I4BA 4WEPA 2D3IA 5I2KB 1XS5A 4NEDA 2F78A 4XKNA 4DXCA 4BDLA 1LCTA 4IO2A 4Z7EA 3EHSA 2Q88A 3VV5A 4I62A 3QK6A 3IAZA 3CI8A 1B40A 2G29A 1BIYA 1JVXA 3IO6A 4QSCA 3MZ1A 4EQ9A 4ONYA 5H8QB 3SEYA 4U21A 2XD2A 1PC3A 1SYHA 3UA8A 3PUVE 1P99A 1JNFA 1SW4A 1MDP1 3FVKA 2PVUA 4FEDA 1LBBA 5KDTB 3MQ9A 1FQDA 4OMBA 5I57B 4ELOA 2H98A 3JV9A 2O84X 4F19A 4RA1A 5CMKA 5H8NB 1QUJA 3MVYA 3TFLA 3PPPA 1LBCA 2ZMBA 4KCDA 2F36A 3JZJA 5DT6A 4RPOA 3ZS6A 2Y7KA 4KHZE 4YU0A 4F3BA 2QS3A 4DCYA 4GRKA 1P1UA 2F7BA 4EQBA 3FJ7A 1ANFA 5EHMA 3TAJA 1DMBA 3ECRA 4GOTA 4H65A 1SW1A 5TP9A 3TQWA 1FQCA 3KOSA 5DVJA 4F18A 4Q30B 2O7UA 4P11A 5I58A 1GR2A 2XXVA 2V84A 1LCFA 1B5JA 1FW0A 1S7YA 2F8DA 4OXVA 4R2FA 3GLBA 4MBPA 1UTBA 5DEXB 3EQ1A 3FXUA 1N7XA 2CMOA 1XHYA 3KZGA 5I59B 3H4ZA 4U1ZA 4C1UA 4OVJA 4YZZA 4N6PA 3MP8A 4XXUA 3TPAA 1MY1A 4XIGQ 1P1OA 3IB2A 2DYXA 2E1SA 5I2KA 4OEVA 1MXUA 5EYFA 2F6GA 5DVFA 4PFTA 3N5LA 1ZBMA 4HS7A 1HSJA 5H8FA 3TTLA 2XXQA 4ELRA 1JQFA 3VVDA 1D3KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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