5DVBA

Crystal structure of s. cerevisiae tsa2
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
199
structure length
199
Chain Sequence
YFQGMVAEVQKQAPPFKKTAVVDGIFEEISLEKYKGKYVVLAFVPLAFSFVSPTEIVAFSDAAKKFEDQGAQVLFASTDSEYSLLAWTNLPRKDGGLGPVKVPLLADKNHSLSRDYGVLIEKEGIALRGLFIIDPKGIIRHITINDLSVGRNVNEALRLVEGFQWTDKNGTVLPCNWTPGAATIKPDVKDSKEYFKNAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of TSA2 reveals novel features of the active-site loop of peroxiredoxins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule keywords Tsa2p
total genus 65
structure length 199
sequence length 199
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2015-09-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5dvbA00
1XIYA 3GMFA 5IMDA 3N9JA 1U3IA 2YPMA 4PX1A 1R7HA 2PUKC 3F4TA 3GV1A 4EDYA 3ZITA 4ZILA 1XFLA 2H01A 1UN2A 1WJKA 2YN1A 4MPGA 3SWLA 2MYGA 5J5NA 4E8HA 2H19A 2LKUA 4DEJA 4IJ3A 3CYNA 2V32A 2TIRA 1M2BA 2JSZA 3WGEA 4FYBA 3FRCA 4LMWA 4EDZA 1PL1A 4MF6A 2HSHA 1EOGA 2AV4A 3A3TA 1GL8A 4CHSA 3D0ZA 2YWOA 1XW6A 1XWCA 1XBSA 2EIOA 4MF7A 5E59A 5F07A 3CBUA 2WFCA 4O5RA 3TJFA 4DSRA 5AGYA 1YZXA 4ZB9A 4TR3A 4AJ7A 2DJKA 1B4QA 4L0WA 4TW5A 2AAWA 3Q19A 3GH6A 5DCGA 1K0NA 3M9KA 2GSRA 3GTUA 2OE1A 2ZUPA 3KD0A 3WT2A 3ZIJA 1SD9A 5ECKB 3ED3A 4V2LA 2NVLA 2B1LA 2OADA 2CVDA 4IJIA 1YEXA 1ZCPA 4EUYA 3D4TA 2OBKA 3F6DA 2X8CA 1FB6A 3D4MA 2V41A 4I2TA 5ECQB 4NPBA 1USBA 3UVHA 6GSWA 3PGTA 3CXGA 4BA7A 1I9DA 4NV5A 3EVIA 1F3BA 3UARA 1VF2A 1T4ZA 2JADA 2X8HA 3RPPA 3LWAA 1XZOA 1BEDA 1TK0B 1K0MA 2JZRA 5D9VA 4G10A 5LNKe 1R4WA 3P90A 3G7JA 1G7EA 4TN8A 1T4YA 3AY8A 1RQMA 4ULXA 1NSWA 3ZRDA 5ELGA 1M7TA 4KCEA 1M9AA 4ZL8A 2LUSA 1R26A 3DIEA 5JCUA 5ECNB 5EL8A 1TKDB 3TRPA 4XTSA 2E2GA 2PBJA 1WP0A 4GQCA 2L4CA 1PKWA 1TXXA 1SU9A 5CAXA 1G0TA 4JBBA 4OFTA 4KH7A 1K3YA 3GHAA 2G0FA 3LGCA 4AJ8A 5DALA 4XS1A 2H6YA 1AQWA 2A2RA 4KGIA 3C7MA 3I9V2 3ZREA 1AUCA 1IYIA 1U3AA 16GSA 1PN9A 2WS2A 2GT6A 2DMMA 1J0FA 1GTIA 5CRWA 3IV4A 5ELAA 2K18A 5IQYA 1A2MA 2C3TA 4FO5A 3DRNA 18GSA 2L57A 2DSAA 5DQSA 4GCIA 4MP4A 4KX4A 4N0VA 2B1KA 1I5GA 1A2LA 2P31A 3PH9A 1K0CA 4K1FA 1S3AA 4PQHA 3I6AA 1K0OA 3C71A 1ZYQB 4KB3A 3E9JB 3LXTA 2I9HA 4EKZA 4TRXA 4BWQA 2E0QA 3EE2A 2IJYA 2IFQB 3HJPA 4GQFA 4IKHA 3KH7A 5EY6A 4BPYA 1SKRB 3FYGA 2FY6A 4PUAA 3UEMA 5L71A 1Z7RA 3FKFA 3QOUA 3RHCA 3QFBC 1AXDA 1V2AA 1E2YA 4PURA 2IPAA 3ZIVA 5IO0A 2DIYA 4KA0A 4POBA 4ML1A 1TTZA 1WWJA 2DMLA 5ID2B 1ST9A 2XBIA 3VK9A 1TJDA 2PN8A 4OO5A 2NDOA 3UL3A 2VLUA 4HDEA 1LBKA 4KAEA 5ECOB 1MTCA 3RDWA 3IA1A 1GUKA 2IMKA 3L4NA 4QL9A 3WD6A 1EOHA 1NW2A 4G2EA 4TXOB 2WDUA 2IIYA 2DLXA 4XHMA 4XS4A 1XVQA 4NHZA 1VRSD 1ZL9A 2YZHA 2VCXA 1SD8A 5CNWA 1SJZA 1Z6MA 3FW2A 2VL3A 1XWGA 2YWIA 2CA8A 1X0RA 4ML6A 3HHVA 4DVCA 3F6FA 3D21A 1TK5B 1URMA 1E6BA 5C04A 3GX0A 4TVEA 2VOCA 5G1KA 2XPEA 1K0DA 5GSTA 1B8XA 4O32A 2HNLA 2RLIA 2C4JA 1PX7A 3A2WA 4ECIA 2AJQB 1DBYA 1SL2B 2NPBA 2WULA 2X99A 2HRNA 3K8NA 1BJXA 4RI6A 1Z3EA 2X64A 4JR6A 3KJYA 3ZMKA 2F3MA 2GZPA 4EVMA 3VFIA 3UJ1A 2QGVA 1GSFA 20GSA 2OE3A 4IQAA 3VI5A 1X5EA 1HQOA 4J57E 2FA4A 3IAS2 3HDCA 2KUCA 4EL1A 3ZL5A 1B4PA 4V1Ag 1A23A 2N5BA 1SENA 2H8LA 4ILFA 2OE0A 3LYKA 2DJJA 3FY7A 1PA3A 5KN0A 1X5DA 2IMDA 4ZIJA 5ABRA 3IC4A 3IAM2 4IGJA 5IMAA 3GKKA 2TRCP 3FZ4A 3KTLA 3HZ8A 3QMXA 1ON4A 5CRDA 6GSXA 2FWGA 3GTUB 3VURA 2M80A 2V2GA 4RUVA 2ON7A 2VIMA 1FVKA 2LJAA 4N0ZA 3TRQA 1W4VA 3DKSA 5H5RA 4E8EA 2YJHA 2C3QA 4IELA 5AIVA 2H1AA 4IS0A 2VCVA 3APSA 3GFKA 4K6XA 2LRNA 4MZCA 2FLSA 2GSQA 2BMXA 1N8JA 3IRAA 4HU7A 4ZL9A 3EMPA 2C0FA 5KN1A 3E3EA 4POMA 4KNDA 1PRXA 3FR3A 2WRTA 2C3NA 1SL1B 2KP2A 3KMOA 3HVSA 1O85A 5A4WA 4MCUA 1S3DA 1Q98A 1SK2A 5CO3A 1HNAA 4ECBA 2PWJA 3CRUA 1PQNA 3IDVA 1V57A 3KXOA 3WGDA 3ZTLA 3MSZA 1F2EA 5GAPD 2RM5A 3IOSA 2F8AA 3ERFA 1JFUA 4HJ2A 5G30A 2YP6A 2VCWA 1KTEA 2H66A 2LSTA 2H70A 1GWCA 4MH2A 1Z9HA 5EVOA 1GH2A 4ZBAA 3LORA 4GXZA 2V6OA 3ZMLA 5JWOB 2VAFA 2YNXA 2R4VA 2I4AA 5DALB 2QKEA 2MMZA 4PNFA 4TR0A 3M8NA 1F9MA 3BJ5A 3LEFA 4O92A 4OCFA 5G2ZA 2OJLA 4MZWA 3C1RA 4Q5NA 3F8UA 3KIJA 2VLVA 1PKZA 1QGVA 3GSSA 2FA8A 3D22A 4OWYA 5FHIA 3F63A 4F9ZA 2VO4A 3F9UA 2WGRA 5AIXA 3F3QA 4K7NA 2ALBA 4TXVA 2H74A 3UAPA 3IBHA 3P7XA 6GSSA 2IMEA 3QDNA 3VLNA 2M72A 5F8BA 5IOXA 2YOIA 1OKDA 3ZVJA 2GVPA 2MZCA 2C80A 1Q4JA 4BWSA 1U6TA 1W89A 3GH9A 1BQ7A 4PQIA 13GSA 5ECRB 1T1VA 4OFNA 1ERTA 2B5XA 2WCIA 3KEBA 2R3XA 3MAKA 1RW1A 1CQGA 2GS3A 3BCIA 5ECMB 3OR5A 3L9SA 1FAAA 2VCTA 3IXRA 4HUAA 5DQYA 1KEBA 4K0GA 4CW9A 2REMA 3VWUA 2EC4A 5B7CA 7GSSA 1LJRA 3LFLA 3M3MA 4PXOA 1GSQA 1MDJA 2FWHA 1X9MB 1A8YA 2ES7A 3G7YA 2LJRA 4TR1A 1XWAA 2LRCA 2HI7A 3EWLA 2YWMA 4MDCA 4NXIA 5E4WA 3FK8A 1XPVA 2P0GA 5DCHA 3F4SA 2R5GA 4K8MA 1GSEA 4ACSA 4IP6A 2F8FA 3TKSE 2CT6A 1WE0A 2JU5A 3HY2A 2H0HA 4XS4B 3QD9A 2I1UA 1XCCA 4GWRA 5DBQA 3EU4A 1G6YA 2CZ2A 3TJJA 2CX3A 2MMOA 3KP8A 3WGXA 4KSOA 2H75A 2GDRA 5B8BA 2WZ9A 2H1GA 1TK8B 2QSIA 5KN2A 3LQ7A 4TR4A 3DWVA 4YQUA 1YJ6A 1MDIA 3M0FA 4OMVA 1GNEA 4NV2A 5HR1A 1IYHA 3ZZXA 2GTUA 2GLRA 1MDKA 3DMLA 3DVWA 5DDLA 3A5WA 2O8VB 2E7PA 5GSSA 4HZ2A 2VL9A 4H86A 1AQXA 1J9BA 2H0GA 2DJ1A 1VGLA 3IE3A 1J08A 3LXZA 5AN1A 4ZL7A 4JEDA 1A0FA 5G31A 2AHEA 4KDXA 4Q5RA 2CZ3A 1AQVA 4KSMA 3TKRA 4GSSA 2CAQA 3HD5A 4WEYA 3NOFA 4HEA2 3BD2A 4KDUA 1HNBA 1YKAA 1SK0A 4YQVA 3RPNA 3O76A 4EF0A 3GIXA 2LNTA 3HA9A 2JZSA 1OE7A 5HR3A 1WRYA 2J23A 5IPHA 4K9ZA 3L78A 2PERA 3FZ9A 1V40A 4X1UA 2A4VA 5J4UA 1O81A 3HVXA 4BVXA 1BX9A 1XW5A 2H71A 3APQA 3RHBA 1EGOA 2N5FA 1NHOA 1ZOFA 5J41A 1MEKA 1GLQA 3ZYWA 1PMTA 2GGTA 4ZB6A 1JHBA 4HJMA 4ECJA 1UVZA 1PD21 2VM1A 1X5CA 2GQMA 3IHQA 4LL1B 3GKXA 1U87A 3CSJA 4I2UA 4KUNA 1X9WB 5ENUA 2MBSA 1TRWA 2NTOA 2TRXA 4L5LA 4F0BA 2O89A 2D2ZA 3LYPA 1PGTA 1BAYA 5F05A 4X43A 1FW1A 4I6XA 1H75A 3KM6A 3LJRA 1RK4A 4N10A 3H79A 4HOJA 1V58A 3PR8A 2LTKA 2HZEA 2VD0A 12GSA 1B9XC 3DXBA 3GL3A 3KP9A 3RBTA 3GL5A 2B7KA 5IPGA 1OC3A 1YY7A 2IMFA 2PVQA 4FH8A 4L5OA 3I69A 3VWWA 1FO5A 4JZQA 3VPTA 1MD4A 3KZQA 3DGQA 1G7OA 14GSA 1GUHA 2VM2A 3TKQA 4LL4B 3Q18A 4F03A 4MJCA 4Q5QA 3KGKA 1F3AA 4WF5A 4X0XA 2N5AA 3EMXA 4WBJA 2HLSA 2PGTA 1V9WA 4P3YB 3RAZA 4N11A 2HZFA 4L8EA 2YV9A 2KLXA 3W8JA 2CAIA 3FEUA 4HQZA 3ZLPA 4D73A 1A0RP 5ECLB 5IIZA 1X9SB 1FOVA 1QUWA 5CRHA 3UBKA 5DVBA 1N2AA 4HS1A 2OKAA 4FYCA 5B8AA 3EINA 1O7UA 3FR6A 5D9TA 1Z6NA 3DD3A 4OO4A 17GSA 2VLTA 5B6MA 5IO2A 3F3RA 3C8EA 1GTAA 4NHWA 1JZRA 3SBCA 4YQMA 5G5EA 5HFIA 19GSA 1A8LA 4O7HA 1Y6EA 1QQ2A 5CRGA 4G19A 4TR1B 1OKTA 2KP1A 2PVOC 4IBPA 4XRAA 4AF2A 2YCDA 2MBTA 4OFMA 3NIVA 2WJUA 5EPFA 1OC9A 4KDYA 4PQ1A 4JE1A 2F51A 3TGZA 3O3TA 2ON5A 2G2QA 3C1SA 4J56E 1KBNA 5HR2A 2H6XA 5HQPA 1TW9A 2YWNA 1M0UA 4ID0A 3UBLA 2CVKA 5A5KA 3TDGA 4K7IA 3QAVA 2VUPA 3E0UA 1GUMA 2YJ7A 3US3A 1OE8A 2HXKA 3BOAA 2V6KA 1C72A 3H8QA 4JU5A 1T7PB 2IFQA 2CQ9A 3FZAA 2IL3A 1JLWA 1PSQA 2PU9C 5HFKA 1WOUA 4G9HA 1U88A 3F4RA 2GT5A 2B3SA 3DYRA 3G7IA 3HCZA 1QK8A 3G9BA 1TOFA 5D9WA 1JLVA 2GQKA 2K6VA 4DSSA 3ERGA 2GSTA 4YAPA 2PPTA 3TJBA 2L6CA 4F2IA 5F0GA 1GSSA 4LA1A 2JSYA 2NBSA 2LRTA 2O85A 1Z5YE 2HSYA 2L5OA 4EE0A 3MDKA 1XW9A 4AGSA 4MK3A 4K7OA 3HXSA 4TOPA 3PINA 4V1Ap 1TRSA 1MD3A 4I97A 2XPDA 5H5QA 2P5QA 4DSQA 3Q6OA 2K8VA 4CDOA 3TUEA 5D8IA 4HI7A 4ZBDA 5KN3A 4LLRA 1ZGNA 1SJIA 3L9VA 1GNWA 3GKMA 3O6TA 4YAVA 1TDIA 4K0NA 3UIWA 2OA7A 2HYXA 1OAZA 1O8XA 2XBQA 4POKA 1M99A 3D5JA 4MJEA 1EP7A 4QL7A 1THXA 4ISDA 3WT1A 2V1MA 2RUEA 2C1YA 5DJLA 2L6DA 1EP8A 4FIWA 2PMTA 2X8GA 5ECSA 1HNCA 3QPMA 6GSUA 5J9BA 5DAKA 5G1LA 5D73A 4XCSA 4EO3A 2RM6A 1JZDA 2FHEA 5CYYA 5IOWA 6GSVA 2BJXA 3R2QA 1JZWA 5A4UA 5FWGA 4OCEA 2HE3A 1JZOA 4IQ1A 2CX4A 4HZ4A 3U5RE 4EC0A 4WF4A 4MA9A 4BVYA 4WXTA 4I8BA 5IMVA 1SK1A 2DC5A 1K3OA 3KMNA 4N30A 3TKSA 1CQHA 4GF0A 3DEXA 5IM9A 2HRFA 5B6NA 3DVXA 5D96A 2FNOA 2QC7A 1T3BA 1K0BA 2HFDA 1DUGA 2H0IA 5IMZA 3EC3A 1QXHA 5COHA 1ERVA 2HZEB 2VL2C 2MMNA 1YEPA 3ZFLA 4L0UA 1B9YC 5A4VA 1B48A 3H4KA 3MNGA 3BCKA 3GKNA 3ERWA 4V2NA 3ME7A 2O7KA 2JACA 1O6JA 2DBCA 1TI3A 2A2SA 4IW9A 3S9FA 4GTUA 3FR9A 1A2JA 1GULA 2AUVA 3J7Yb 3UOMA 3CSHA 2VCQA 3M1GA 1TRUA 4I5QA 4RI7A 3CSIA 2LQOA 2M46A 1F37A 5J3RA 2H1BA 2OBIA 5J9CA 4ZB8A 1WIKA 5ECHB 1QMVA 1FG4A 4D73B 4KE3A 1QFNA 2JZTA 4IN0A 3GN3A 2FWFA 1GSUA 3P8WA 4WBRD 4PUFC 1SKSB 5IMFA 3LSZA 5H5SA 2H1DA 3GSTA 2C0GA 5CP1A 2R2JA 1V98A 3UMAA 1YDKA 2B7JA 4EXJA 4IVFA 2E2MA 1ERWA 4BL7A 3L0HA 3NZNA 1UA5A 4K2DA 1GSYA 5JCGA 1XWBA 2DJ3A 2K8SA 2H73A 5DJMA 1XWKA 4XRDA 1YKCA 1KNGA 4POLA 11GSA 4GSNA 5C00A 2FUG2 3TOTA 4QQ7A 3L9UA 3GNJA 2H30A 22GSA 1SL0B 1WPIA 6GSYA 2AYTA 2LQQA 2GZYA 3IK7A 3C73A 2XHFA 4RQRA 1AW9A 4MH3A 5F06A 3FZ5A 1LU4A 2DJ0A 4WETA 3TJGA 2FD3A 1EEJA 3VWXA 5JWQB 2F9SA 2IN3A 3GA4A 1FHEA 3MWHA 3TOUA 1TI1A 2EIRA 2O87A 2FCHA 1XOBA 1OC9B 1ABAA 2L59A 2J9HA 4J2FA 2CV4A 5LCZA 3QCPA 3JCML 2FWEA 4NAXA 3ZFBA 2LS5A 4IP1A 1EV9A 3IPZA 4XS6A 4MZBA 5HR0A 2VL2A 2KOKA 4MPFA 2GSSA 2C0EA 4PNGA 1YQ1A 2C8UA 4XIHA 4OD7A 1GLPA 3WYWA 5ECPB 1THOA 2YZUA 3TJKA 10GSA 1M2AA 4KW6A 3HVVA 4MJAA 1PX6A 2YV7A 3M9JA 1GSDA 3GURA 3H1NA 5ECIB 4DSSB 1G6WA 1DE1A 1SYRA 1AIUA 2B5EA 2WB9A 2LV3A 3W8SA 2VD1A 3FHKA 1O8WA 1OYJA 1TRVA 3VWVA 1K3LA 2GQLA 4IHUA 1GTBA 4HU9A 1UC7A 4V2MA 1NHYA 3A2XA 3GRXA 1YF0A 3Q74A 1XOAA 4Q5FA 3HYPA 1M9BA 1DSBA 2EIQA 4ZBBA 5G5FA 3QAGA 1TP9A 2R37A 1Y25A 1ML6A 2HT9A 1FVJA 1XVWA 3EURA 3J7Yk 4RQXA 4AJ6A 3CMIA 2ZNMA 4JRRA 4LMVA 1YF1A 3F0IA 2OACA 4ECCA 1EZKA 4MF5A 1TU8A 5AISA 2L4QA 4TKYA 1BG5A 3QR6A 2C0DA 6GSTA 3QAWA 1OC8A 2CVBA 3HJMA 2YANA 4FYUA 3IK9A 1T00A 5CREA 5LD0A 3EYTA 5DAKB 3CTGA 3APOA 1ACVA 1PL2A 1F6MC 3GYKA 1K0AA 2H6ZA 3GX8A 2ZCTA 1GP1A 1M2DA 3GUSA 2VCZA 4WR5A 4MABA 3TKPA 2R6KA 2GZZA 1AC1A 1OVNA 4MLYA 3VI7A 1SKWB 5FT3A 3HJOA 2P5RA 4NWYA 1A24A 4PGTA 2H76A 3ME8A 4ZXGA 5INYA 5KEJA 3HKRA 2DJ2A 2L5LA 4JR4A 4MMMA 2BTOT 2Z9SA 1SJ6A 1ERUA 1HYUA 1VF1A 1VF3A 1ZZYA 5D93A 1R5PA 3TB2A 1XXUA 1BYEA 1ZYEA 3ISOA 3TCOA 2IMIA 2MMAA 3KH9A 2B5YA 3P2AA 4F82A 1GTUA 2RUFA 4NMUA 3CRTA 4Z7XA 2DIZA 2IWTA 3W6GA 1R5AA 4WR4A 3LG6A 5GZZB 3ZVJD 1DE2A 4WKWA 3I43A 4KCAA 3TKSC 1S3CA 1EV4A 1FB0A 1EEMA 3TRXA 3IR4A 2JL4A 2KHPA 5D9XA 1GRXA 4GLTA 1T8EB 3D6IA 3QFAC 4MJBA 3BBYA 2I3YA 5IMCA 3A2VA 3N5OA 2RIIA 1H4OA 3HZ4A 2LEGA 2XC2A 1ILOA 3EU3A 2K9FA 4GRFA 4HQSA 2FGXA 3KTBA 1Z7PA 1O73A 4F0CA 8GSSA 5JWRB 1VF4A 1TU7A 5ID2A 1NM3A 5GAND 1ZMAA 9GSSA 1SYXA 2LNSA 3U6VA 1EWXA 3V1WA 5JCWA 2AB6A 3H93A 1EGRA 2B6MA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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