5E4WA

Crystal structure of cpsrp43 chromodomains 2 and 3 in complex with the alb3 tail
Total Genus 26
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
26
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
DKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLAGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for cpSRP43 chromodomain selectivity and dynamics in Alb3 insertase interaction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin-1
molecule tags Transport protein
source organism Escherichia coli o157:h7
total genus 26
structure length 109
sequence length 109
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-10-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5e4wA00
1WP0A 5ECRB 3GX0A 2QC7A 1XWCA 1MD4A 4RI7A 1TJDA 2DC5A 1ILOA 1U87A 2K8VA 4OMVA 2G0FA 1T4ZA 3TKSE 1JZDA 3IK7A 2X8HA 2LRCA 1PA3A 3OR5A 2TIRA 1GL8A 1AQVA 4XHMA 2WZ9A 4PURA 3TOTA 1PX6A 5KN1A 3APOA 5CREA 1YJ6A 2F51A 1XWGA 2JSZA 3TJGA 4PQ1A 4ECJA 2H66A 2GSSA 4L8EA 3P2AA 1NHOA 2C0DA 2KP2A 4J57E 5IQYA 1DSBA 3ME8A 2DJ0A 17GSA 5ELGA 4FIWA 4D73B 2QSIA 2LJRA 1I5GA 3EURA 3C7MA 5J3RA 2GSTA 3NOFA 2JU5A 2DJ3A 4NXIA 1VRSD 1SU9A 5IIZA 2CT6A 2DMLA 3P8WA 5B6MA 5F8BA 2GLRA 4O32A 2P0GA 4ECIA 2TRXA 2EC4A 3S9FA 1O81A 3N9JA 22GSA 1M7TA 5DBQA 1T00A 3D6IA 5H5RA 1ML6A 4IN0A 4KNDA 4FO5A 1GSSA 1SK1A 2H0IA 5ECPB 3RHCA 4WXTA 2L5LA 2HRFA 2I9HA 1M2BA 5F05A 1GUMA 2L5OA 1ZGNA 2I3YA 4MF5A 1XXUA 4OWYA 4IS0A 5JCWA 1TKDB 4MP4A 5FHIA 1KEBA 2YWMA 4PNFA 4PGTA 1RW1A 4Q5RA 3UVHA 2R2JA 3VK9A 3ZIJA 3ZVJA 3UAPA 3GUSA 5ECNB 1WJKA 4NHZA 1X9MB 2WJUA 4K7OA 3F63A 1UN2A 2MBTA 1CQHA 3ZREA 3BCKA 4Q5FA 4JR4A 5B6NA 4OFNA 1A0FA 5HR3A 1PMTA 3ZVJD 2VCZA 2M72A 3ZTLA 2C3TA 1H4OA 2GQLA 3TB2A 2R37A 2YZUA 2VLVA 5ECIB 4CHSA 4ECCA 3U6VA 1K0OA 4K7NA 5CYYA 2IFQA 4MF7A 2HXKA 4MMMA 1F3BA 4FYUA 5IMCA 1FVKA 4WR5A 1O8WA 3H8QA 2ON5A 2QGVA 2GT6A 3GFKA 4QL7A 3AY8A 1M9BA 2R6KA 3PGTA 1AAZA 1QQ2A 3ERWA 1YKCA 4MF6A 2AHEA 2CVKA 1TK5B 3Q18A 1SKWB 2VUPA 3GTUA 3IR4A 2DJKA 4FYBA 5D93A 2NBSA 1A8YA 3TJFA 1WPIA 2O87A 3IHQA 4ILFA 3ZIVA 4TR0A 2LRTA 4K7IA 1SJIA 1U3IA 2RUFA 4FH8A 4F0BA 3H1NA 3QAWA 4GSSA 4P3YB 5DDLA 1GTAA 2VCQA 4N0ZA 2KOKA 3KD0A 2R3XA 5IOWA 3VWVA 5ELAA 1A2MA 3DWVA 3TKPA 5ID2A 3LG6A 1ACVA 1SL1B 4WBJA 16GSA 2PVQA 1OC9B 3M8NA 4PQHA 4BL7A 1XW6A 4XTSA 5AIVA 5AN1A 1PQNA 5IMDA 2JZTA 4MH2A 3WT1A 5IM9A 1SL0B 3L9UA 1CQGA 2NTOA 3U5RE 1Y25A 4ML6A 4HOJA 1ZYEA 1M2DA 2C3NA 3GMFA 4ZILA 2H76A 4MZCA 3QR6A 2MYGA 3I69A 2DSAA 1F2EA 4KGIA 1XFLA 4MJAA 5B8AA 1MDJA 1OKDA 1XIYA 3KH9A 3EINA 3DKSA 3HKRA 2L6CA 1USBA 3KTBA 3RBTA 3FRCA 4KCAA 1GSEA 1GH2A 3E0UA 2OACA 4G9HA 1XWAA 2PWJA 3M3MA 2L6DA 2FUG2 2IFQB 4HJMA 2MMZA 4IP6A 1URMA 1GTIA 2H1DA 6GSXA 3O3TA 4BVXA 1FOVA 4KH7A 1AW9A 2ZUPA 3LQ7A 2WRTA 4CW9A 2H19A 5F07A 5AISA 3L9SA 2M46A 2PPTA 3ERGA 1F9MA 1YF0A 3KIJA 2I1UA 2PVOC 1EGRA 3HYPA 4CDOA 3IOSA 1ERTA 3GTUB 1YEPA 2V6KA 4KDYA 3EE2A 2KP1A 2VD0A 5DCGA 4Z7XA 2R4VA 5EPFA 1HQOA 4FYCA 5IO2A 2JACA 1PSQA 4IBPA 2FWGA 2HT9A 1R5PA 4HU9A 2V1MA 5GSTA 3UOMA 5ECMB 2H30A 2N5AA 1B4PA 4MPGA 3J7Yk 2Z9SA 4XIHA 2GZYA 3V1WA 2J9HA 3DVXA 3UBKA 1KNGA 4XRAA 4IQ1A 5J4UA 2A2RA 4ZB8A 2K6VA 2N5BA 1TTZA 3F6FA 5LNKe 5ID2B 2BJXA 2MMAA 1WMJA 3I43A 3M0FA 2GQMA 2P31A 4BVYA 2YN1A 2XHFA 2C0GA 3GSSA 2A4VA 1BAYA 5CRHA 4NV2A 3UEMA 1XZOA 2WGRA 3UJ1A 1XCCA 4J2FA 1K3LA 3QCPA 3KEBA 1NW2A 4N10A 2EIRA 1W89A 3F6DA 2WDUA 5L71A 3KCMA 3D4TA 4I2UA 5LCZA 2DJ1A 1V2AA 4L0WA 3HJOA 2H6ZA 4KA0A 4EXJA 2O7KA 2B1KA 4TOPA 3VFIA 1YY7A 5ENUA 4IJIA 1VF4A 2CX4A 4O7HA 2LEGA 4PNGA 4GQCA 2IPAA 1VF2A 3I9V2 4HUAA 2IIYA 2XBIA 4D73A 1PL2A 3KMNA 2HSYA 4XS1A 1F6MC 2FWEA 5KN0A 4XRDA 1AUCA 1A0RP 1LBKA 3EC3A 3APQA 1FHEA 3GIXA 3F4SA 1TP9A 3BBYA 2NPBA 3VI5A 2A2SA 3TJJA 4LL1B 5JWRB 3FZ5A 3EU4A 4PUAA 1TK0B 3FR6A 3PH9A 3ERFA 11GSA 1GSDA 3VWUA 1GSQA 4MCUA 1GSFA 5D9TA 3KP9A 1K3OA 2VL3A 5FT3A 1A2JA 5A4WA 3D4MA 4RI6A 3DEXA 2OE1A 1N2AA 3F8UA 2CAQA 5INYA 1J0FA 3GH6A 1XW5A 1M99A 4YAVA 2LNTA 2XC2A 2E7PA 2HZFA 3TRQA 2JZSA 5G30A 2L4CA 1ERUA 2O89A 2X99A 4I97A 2FY6A 3ME7A 3GYKA 2LKUA 1EP7A 2RM5A 1EOHA 1YEXA 2DBCA 3Q19A 5COHA 5A4UA 1XWKA 2IMDA 1GWCA 3APSA 3CMIA 4BWSA 5D9WA 3CRUA 4JR6A 1WIKA 3F4RA 1SKSB 2VM2A 5CRWA 4EDZA 2GDRA 2JSYA 2MZCA 2V32A 1ERVA 4XS6A 3EMPA 1TRUA 1QGVA 2C4JA 4V2NA 4ZIJA 14GSA 2X64A 2GGTA 2AV4A 3KGKA 1YQ1A 4EKZA 3H79A 4LLRA 4KX4A 2FGXA 2B5XA 1SENA 2LS5A 4KW6A 4IW9A 5G5EA 1BX9A 2X8CA 3GA4A 4V1Ag 1Z3EA 4ZBAA 3MWHA 3DMLA 4WR4A 2RLIA 1X9WB 1PX7A 3TJKA 5KN2A 3ZZXA 5ECSA 4GTUA 2CVDA 3MDKA 3MAKA 2MMNA 2WB9A 2K8SA 5A4VA 3SWLA 1GLQA 3ZL5A 2VCTA 4ZB6A 3QD9A 1AQWA 4F03A 2HI7A 1Z7RA 4X43A 1PKZA 1M0UA 3HJMA 3GRXA 2IJYA 2EIQA 3WYWA 3JCML 1OE8A 2YZHA 3DRNA 1OKTA 3VLNA 1GSYA 1XW9A 5GAND 3KZQA 1AXDA 2F3MA 2XBQA 5C04A 4MH3A 2K9FA 1XWBA 2E0QA 2VD1A 2XPEA 3UMAA 1OC9A 2LNSA 3C8EA 3EMXA 3HXSA 4PQIA 1LU4A 1EP8A 4HEA2 5E4WA 5F06A 1XPVA 4NHWA 1QMVA 3TKQA 1IYHA 3H93A 5CAXA 2LSTA 2FWHA 1EGOA 2ZNMA 3TRPA 2JADA 3CRTA 2KLXA 1U6TA 2YWNA 4PXOA 4EUYA 4IP1A 2YP6A 3E3EA 3DVWA 1AC1A 1U3AA 3BD2A 2OADA 1TK8B 2B7KA 3VWWA 1YKAA 3WGEA 3QFAC 1MDKA 5IOXA 4OCFA 1A24A 2QKEA 4V1Ap 4H86A 3TRXA 4AJ8A 2IMIA 2YPMA 3EWLA 3LXZA 5B8BA 1W4VA 2LJAA 4NMUA 2OA7A 2WCIA 4KCEA 3RPNA 4X1UA 4K2DA 1DUGA 4DEJA 2CV4A 4K9ZA 3K8NA 1F37A 2IMFA 3CSJA 4NWYA 4Q5QA 2K18A 4AF2A 3W8SA 4HI7A 1K0CA 1J9BA 1G6WA 2PUKC 4HQZA 4EF0A 2F8FA 2C3QA 2HYXA 1IYIA 1T1VA 4AJ7A 3D22A 4KAEA 4LMVA 5A5KA 3C73A 2MMOA 1MDIA 2C1YA 3TKRA 1V40A 3ZRDA 4TR3A 1SD9A 3DGQA 4K1FA 1FB0A 3RPPA 3ZFLA 5GZZB 3C71A 4EL1A 1TI1A 2PN8A 1K0NA 1GNEA 2JL4A 4LL4B 5ECLB 2BMXA 3IC4A 4TRXA 2AYTA 3CTGA 1A8LA 1E2YA 1EZKA 3GSTA 3HJPA 5H5QA 4TXVA 2B3SA 3M9KA 5J9CA 4F9ZA 4BPYA 3GL5A 4TR4A 4MJBA 1PL1A 1I9DA 3HD5A 3GV1A 2H1GA 2B7JA 4BWQA 2HNLA 2IMEA 1R26A 1YZXA 2LTKA 2D2ZA 3P90A 2FWFA 3US3A 3VWXA 1TOFA 3KJYA 3Q6OA 4QQ7A 1X5DA 1OC8A 5AIXA 2DLXA 4WETA 1OC3A 4L5LA 4KSMA 2E2GA 1JLWA 2AB6A 4WF5A 3KTLA 4KB3A 1NM3A 1V57A 4ZXGA 4N11A 4RQXA 5IMZA 2VCVA 1TXXA 3NZNA 3LORA 1RK4A 5GAPD 1EOGA 4K0NA 1SKRB 3ZITA 6GSVA 3EYTA 4ECBA 4WF4A 2PERA 1O6JA 1V98A 1THOA 5GSSA 1OVNA 5C00A 3HY2A 5DJMA 3F3RA 3GL3A 2C0FA 4ZBBA 3M9JA 1BQ7A 4ZL9A 4KDUA 2X8GA 4TXOA 3TDGA 3FK8A 2HFDA 1WE0A 1PRXA 1TU8A 5ECKB 5KEJA 3IPZA 5JWQB 3HA9A 1ZCPA 4IQAA 1GTUA 2PBJA 2YANA 4PUFC 2VCWA 1XVWA 2O8VB 5CRDA 4K6XA 1GRXA 4HDEA 1LJRA 5G1LA 1B8XA 1KTEA 5DAKA 4OD7A 3A2VA 5EY6A 3LYKA 2VM1A 1V9WA 3GURA 3LSZA 2H75A 2YWOA 1NSWA 2OE0A 4NAXA 5HR2A 4HQSA 4POLA 3DYRA 2XPDA 6GSTA 4ULXA 2P5QA 4WEYA 1UA5A 2HZEA 4XCSA 1X5EA 4GF0A 1GUHA 5IMFA 3ZMLA 3FW2A 1AIUA 2H72A 2H0GA 3MNGA 3RAZA 1EV4A 3WT2A 1HYUA 1BG5A 4ACSA 2BTOT 1PGTA 2N5FA 1EWXA 5AGYA 2HE3A 2LV3A 4MZWA 3H4KA 3IRAA 1GSUA 4X0XA 4EVMA 3UVTA 3BOAA 3QDNA 3GKXA 4OFMA 4YH2A 1GLPA 3TUEA 4E8HA 3Q74A 4I8BA 1HNCA 1Q4JA 1GUKA 3QAVA 5E59A 4N0VA 1S3DA 4GSNA 4OO4A 2GSRA 1XVQA 2JZRA 2V2GA 1FO5A 1B9XC 1Z9HA 4DSRA 3M1GA 2YOIA 3FR3A 3O76A 3SBCA 3MSZA 3HVSA 4YQUA 3A5WA 2H0HA 2FCHA 3FY7A 4TXOB 2L4QA 3PR8A 1KBNA 1BYEA 4E8EA 1QXHA 1SK0A 3TJBA 3L9VA 5ECHB 4TR1A 3O6TA 5CRGA 5DALA 6GSSA 3HDCA 2H01A 2OE3A 2DIYA 1C72A 3IA1A 1F3AA 3WGXA 2VL2A 1ABAA 5EL8A 2V41A 2B5YA 1EV9A 1R7HA 1ON4A 1TDIA 4DSQA 5ECQB 4MJCA 3A3TA 2C0EA 2KHPA 5DAKB 1X5CA 2VLUA 4GQFA 5D9XA 3VI7A 5IMVA 3F4TA 4G2EA 2CVBA 3G7JA 1SK2A 4L5OA 1DE2A 3CSIA 4AJ6A 4N30A 2H6XA 1G7OA 4F2IA 3HZ4A 4DVCA 2HZEB 3FZ9A 3ED3A 1HNBA 2RM6A 3BCIA 5CNWA 2O85A 1TRSA 3GH9A 4XS4A 3TGZA 1PKWA 4BA7A 3TKSA 1V58A 2RIIA 1FVJA 4MLYA 2OBIA 6GSYA 3UL3A 1SL2B 1XBSA 2OKAA 4MA9A 1GNWA 2KUCA 1SD8A 2F9SA 3IXRA 2HLSA 9GSSA 3G7IA 3D0ZA 4ZB9A 1G7EA 2YWIA 2DJ2A 3TCOA 3R2QA 3GHAA 4L0UA 1ZL9A 1MD3A 1UC7A 3FR9A 3F0IA 5FWGA 1MEKA 3QMXA 1T7PB 1O85A 1YDKA 4MZBA 19GSA 4IVFA 1ZZYA 2L59A 1B9YC 3D5JA 4IKHA 4O92A 5JWOB 3IV4A 3FZ4A 2FA8A 3EU3A 4TR1B 2LQQA 5DALB 5D8IA 3RDWA 1A23A 2IMKA 3VPTA 2REMA 4TW5A 3QFBC 2VIMA 4WBRD 2YV9A 1K0MA 3C1RA 5G5FA 3G7YA 2VLTA 3L0HA 2H1BA 2VL9A 3DD3A 4TKYA 5DVBA 3I6AA 4TVEA 5HFKA 4YQMA 2PMTA 3FZAA 4LA1A 2WULA 2G2QA 3CXGA 3VURA 4YAPA 4HU7A 3HVVA 2B6MA 3F3QA 3F9UA 5LD0A 3IAS2 3UARA 1K0DA 5IMAA 5G1KA 3HHVA 1UVZA 5D9VA 4JEDA 2OBKA 5CO3A 3L4NA 1WRYA 10GSA 4XS4B 4RQRA 4DSSA 3NIVA 1VF3A 3W8JA 2IL3A 3C1SA 5DQSA 2HRNA 3LGCA 5D73A 1JZOA 6GSUA 4RUVA 2VL2C 2WFCA 3TOUA 3GKMA 4G10A 1SYRA 1X0RA 3LEFA 4EO3A 3ZMKA 1PN9A 1Z6MA 3CTFA 2B1LA 2PU9C 2EIOA 4O5RA 1Z5YE 2VCXA 3LJRA 2FA4A 1JFUA 1SJZA 5EVOA 2AJQB 5ECOB 1OYJA 2J23A 3CBUA 4NV5A 1AQXA 2FLSA 1S3AA 5J9BA 1TRWA 1ERWA 1DBYA 1OAZA 1G0TA 2ZCTA 1O7UA 3KH7A 1M9AA 2CA8A 3TKSC 5DCHA 4GLTA 1TW9A 4GCIA 1Z7PA 3UIWA 3FYGA 3IK9A 2R5GA 3VPQA 2DJJA 2ON7A 4GSTA 2OJLA 1X9SB 3LXTA 3J7Yb 1JLVA 1XOAA 4Q5NA 1K3YA 3LFLA 3P7XA 4OO5A 4JZQA 2YJHA 2I81A 1JZRA 4KUNA 3W6GA 2RUEA 1ZYQB 3GKKA 4EE0A 1Y6EA 2CZ3A 7GSSA 5JCUA 2WS2A 4WKWA 1JZWA 3FHKA 4ZL8A 2LQOA 4HJ2A 3QOUA 4AGSA 1M2AA 2H70A 3WD6A 5H5SA 3CYNA 1NHYA 1T4YA 1G6YA 3DXBA 1BEDA 4MJEA 1BJXA 4IHUA 1O8XA 5HFGA 3HCZA 1Z6NA 2ES7A 3RHBA 1GTBA 4IGJA 4F0CA 2L57A 2H1AA 13GSA 2VOCA 3ISOA 4F82A 4MDCA 2DMMA 2GT5A 3IDVA 3GX8A 4G19A 3IBHA 4I2TA 4DSSB 4GWRA 1VF1A 1R5AA 1O73A 1RQMA 2NDOA 2GZZA 1ZOFA 4JBBA 1B4QA 20GSA 2P5RA 1THXA 2PGTA 2YCDA 4ZBDA 3IAM2 2GSQA 3CSHA 5D96A 4JU5A 1B48A 5HR1A 5J41A 1PD21 5IO0A 5DJLA 2M80A 2GS3A 1K0BA 4NPBA 3D21A 3KXOA 2B5EA 1HD2A 1ST9A 4IJ3A 4EDYA 5HQPA 1FG4A 1S3CA 1GULA 1QUWA 1N8JA 4YQVA 4HS1A 4ML1A 2FHEA 2VO4A 1T3BA 4TN8A 3ZYWA 3GN3A 3A2XA 3G9BA 1TI3A 1YF1A 2F8AA 3KMOA 1Q98A 5J5NA 1DE1A 2IN3A 4MABA 2MBSA 2LRNA 4K8MA 3HVXA 4I5QA 1SJ6A 1QK8A 2LJKA 4ISDA 1VGLA 4IELA 5ABRA 4GRFA 1T8EB 1FW1A 3KP8A 1WWJA 1EEMA 2C80A 1WOUA 2CZ2A 2YJ7A 4POKA 3GKNA 3N5OA 4PX1A 1ZMAA 3GNJA 3EVIA 3QAGA 4MK3A 1HNAA 3E9JB 1FAAA 3PINA 3KM6A 1A2LA 3HZ8A 5G2ZA 1OE7A 2H8LA 5KN3A 4V2MA 3QPMA 3UBLA 4LMWA 2GQKA 1K0AA 4EC0A 2AAWA 8GSSA 2NVLA 2V6OA 5HFIA 5IPGA 2IWTA 2TRCP 5F0GA 4OCEA 2H71A 3L78A 1SYXA 6GSWA 1H75A 3ZLPA 4ZL7A 1XOBA 2H6YA 2C8UA 2CX3A 4JE1A 1TRVA 2E2MA 3WGDA 2FD3A 2LUSA 2AUVA 2H73A 1GP1A 2H74A 1TU7A 3LWAA 4OFTA 1QFNA 4KDXA 4V2LA 5G31A 1E6BA 4HZ2A 2VAFA 1JHBA 3LYPA 4QL9A 3FEUA 5JCGA 4POBA 2DIZA 4KE3A 2ALBA 4J56E 4I6XA 4K0GA 3BJ5A 4POMA 4KSOA 12GSA 2CQ9A 3A2WA 1MTCA 1J08A 2GVPA 2YV7A 5CP1A 5DQYA 1U88A 4HZ4A 3ZFBA 2HSHA 4JRRA 18GSA 1EEJA 2I4AA 5IPHA 1R4WA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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