5E4WA

Crystal structure of cpsrp43 chromodomains 2 and 3 in complex with the alb3 tail
Total Genus 26
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
26
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
b'DKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLAGS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for cpSRP43 chromodomain selectivity and dynamics in Alb3 insertase interaction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin-1
source organism Escherichia coli o157:h7
molecule tags Transport protein
total genus 26
structure length 109
sequence length 109
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-10-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5e4wA00
1R26A 4MPFA 2DMLA 1SJZA 4GQCA 3KCMA 4KGIA 5E59A 22GSA 3VI5A 4KA0A 2H66A 5G1LA 2C1YA 5G1KA 1YY7A 1H75A 5IMFA 5J4UA 4DSQA 2LJKA 1GRXA 1BG5A 4KH7A 3H8QA 5IOXA 3CSJA 2L4CA 4FIWA 12GSA 4I97A 1AIUA 1W89A 2C0EA 4YAVA 1AUCA 4V2NA 3GRXA 1XWCA 5ECRB 3KIJA 1PX7A 2VCWA 5HFGA 2TRXA 2B1LA 3KTBA 4TXVA 4AGSA 2R2JA 10GSA 4KCEA 5CNWA 5H5SA 1T4ZA 1YF0A 1EOGA 3KM6A 3TRXA 1WP0A 5ECKB 2G2QA 3I69A 17GSA 2CQ9A 2KLXA 1K0CA 4OMVA 5A5KA 4V1Ag 4GF0A 2VLUA 3WD6A 1AQXA 2RLIA 2XHFA 4E8HA 2IMFA 1Z7RA 4OWYA 1OC9A 2I9HA 4IHUA 1NM3A 3EINA 3RAZA 3GHAA 3DKSA 3I6AA 4RI6A 5HR3A 5HQPA 2OBKA 2XBIA 13GSA 4XCSA 3OR5A 2HRNA 3N9JA 3L9VA 2AJQB 2R37A 1B9XC 3DVXA 2MMOA 3KZQA 2KOKA 1F9MA 3DWVA 3H93A 4Z7XA 3K8NA 3VWVA 5IMCA 1HYUA 2HSHA 3IPZA 1OKTA 3D0ZA 1NHYA 4ZBDA 3AY8A 2B5XA 4N30A 3V1WA 3UAPA 4I2TA 3APSA 3EU4A 3GMFA 4ILFA 1OYJA 4ZB6A 2VCTA 3QAWA 2A2SA 1JZDA 1PA3A 3ISOA 9GSSA 3MWHA 1O6JA 2CX4A 3TCOA 4BWSA 2N5BA 1N2AA 2J9HA 4ZL8A 4MF5A 2H1GA 1ILOA 2CVKA 4EKZA 3HCZA 3RHCA 5B8BA 1GLPA 1H4OA 1KBNA 5DAKA 1MTCA 1YKAA 6GSSA 4NMUA 1XOAA 4KUNA 1ML6A 1A0FA 2K8VA 4Q5NA 1PX6A 4FYBA 3US3A 1YZXA 3ZVJA 2JZSA 4ZILA 3TJJA 2H6XA 2PN8A 5IIZA 1XPVA 4I8BA 1LBKA 1TRVA 3D4MA 3G7JA 5HFKA 3DGQA 2B5EA 3G9BA 1OVNA 1PMTA 5DDLA 4K6XA 3F9UA 3IR4A 1VRSD 4MH3A 3L78A 1U3IA 3HVXA 2HLSA 3NOFA 1VF3A 5IQYA 1DE1A 2OE0A 1OE8A 2CVBA 2F8AA 3FR9A 3VPQA 4BL7A 4L5OA 5CREA 1M9AA 4WKWA 3BJ5A 2OA7A 5AGYA 2H6ZA 5J5NA 3BBYA 4ML6A 3WGDA 2H72A 8GSSA 3MNGA 3W6GA 3IV4A 1F3AA 4MMMA 1V9WA 4IP6A 3H1NA 3TKRA 2FWEA 5IO2A 2OBIA 2O8VB 4XRDA 1ON4A 3BCIA 3ZRDA 3P8WA 3D22A 4K7OA 3UJ1A 2V6KA 3ZFLA 2DIZA 4DSSA 4MP4A 1UA5A 4WF4A 3DIEA 2P0GA 2C0GA 1S3DA 3F4RA 3GA4A 2VCZA 3TGZA 1YEPA 2O7KA 2IIYA 2VCQA 2CAIA 1SK1A 2LV3A 3Q6OA 4HZ2A 1PQNA 5J9BA 2C3TA 5EL8A 1DUGA 3FRCA 4XS1A 1HNCA 1O7UA 2WB9A 2NVLA 1SYXA 5HR1A 2LKUA 2XBQA 1WIKA 2VUPA 4MDCA 5ECMB 5AISA 2GDRA 2DJ1A 1TRWA 2A2RA 2DMMA 3BD2A 3QFAC 3UEMA 2ON5A 4G10A 5JWOB 1GSFA 4ID0A 2V6OA 3CRUA 4ZL7A 1QUWA 2CVDA 4HUAA 2CX3A 2B7KA 3GH9A 1MDIA 2GS3A 4HDEA 2MBTA 1TRSA 3ME7A 3H4KA 5DCHA 1GTIA 4O92A 5KN0A 4LMVA 4K1FA 1JLVA 2GQMA 5A4VA 4FH8A 2AV4A 2JACA 1OC8A 1QQ2A 3PINA 4PUAA 3MDKA 2O85A 4KSOA 1C72A 1B9YC 4MA9A 3QAVA 2O89A 3M9JA 4WXTA 1GLQA 4WR5A 1YEXA 4PNFA 5COHA 1WJKA 2EIQA 3EVIA 1Q4JA 4HU7A 2AHEA 1J0FA 1T7PB 4EUYA 4POBA 6GSUA 4IJIA 2YCDA 2EIRA 4QL9A 2CV4A 4JBBA 1PGTA 4OO5A 1R5PA 3GIXA 1MD3A 3VFIA 3A2WA 3DXBA 4MH2A 4HEA2 4EDYA 1JFUA 3CSIA 3LYPA 1ERWA 3IDVA 4ZBBA 4JU5A 3WT2A 2LQQA 1EP8A 5D96A 3E3EA 4ACSA 1S3AA 2H0IA 2BMXA 3ZREA 1XIYA 2K18A 2OJLA 5HFIA 2WJUA 5DALA 1GH2A 3EC3A 5F06A 2AUVA 4JR4A 4AF2A 1G6YA 1F3BA 3U5RE 3EE2A 5F05A 2H19A 4NWYA 4EXJA 2J23A 1NW2A 5FWGA 5JWQB 5DQYA 3UBLA 2DSAA 2H0GA 5D93A 1SKWB 2YOIA 1YDKA 2B1KA 2DJJA 1SL2B 4PX1A 1GSUA 2L5LA 5J9CA 4MF6A 4POLA 3E0UA 1VGLA 2X64A 4OO4A 3TJGA 5LCZA 2WZ9A 3HJPA 2K6VA 2PERA 2OACA 3APOA 1URMA 2EC4A 2FA8A 1ZL9A 1TU7A 4PXOA 2WULA 4ZB9A 4ZIJA 1EP7A 2C0FA 1GSSA 2GZZA 2AYTA 3GH6A 3L9SA 5L71A 2H1AA 4TW5A 3WYWA 2IPAA 4PURA 4XIHA 4HU9A 2PBJA 2V32A 1TW9A 4YH2A 2FLSA 3TRQA 3FEUA 1R4WA 5AIVA 1GNEA 4G19A 2PWJA 4TN8A 2CZ3A 3F6FA 1EZKA 4ZL9A 3U6VA 3TKSC 3VK9A 5IOWA 3A3TA 4ZB8A 1XWAA 1M2AA 3Q18A 2I3YA 2MYGA 3H79A 5LD0A 3LSZA 2B7JA 3KH7A 2H73A 1SENA 3HZ4A 3IE3A 4RQXA 4MABA 1R5AA 1IYIA 1XW5A 1W4VA 2H74A 1SK0A 2C4JA 1KNGA 3P7XA 3TUEA 4F03A 3HVVA 2YNXA 2AAWA 5IMZA 2ZCTA 5ELAA 5CP1A 2XPDA 1SD8A 1GSYA 2L6CA 2KP2A 3KXOA 1ACVA 1AXDA 2VO4A 4K0NA 2FNOA 3D6IA 4NV5A 2LEGA 2X8HA 4L0UA 2GQKA 3M1GA 5D9TA 3IOSA 1TDIA 5F0GA 1TU8A 4WEYA 3C1SA 2PVQA 4PQ1A 1ST9A 3CMIA 2VD1A 1FB0A 4IN0A 1GWCA 1ERVA 3SBCA 5EVOA 1TTZA 2L5OA 2N5AA 3IK9A 5KN1A 1PRXA 1TK0B 1BYEA 3LFLA 5CYYA 2H6YA 1YF1A 5HR0A 4EC0A 2YWIA 3I9V2 4LMWA 3J7Yb 1FG4A 19GSA 3ZFBA 2VLVA 4MZCA 2MMNA 4JR6A 2K8SA 4I5QA 4AJ7A 1XBSA 4XS4B 4V2MA 2LJRA 3CYNA 4H86A 6GSXA 1EEJA 1ZMAA 1RQMA 3G7YA 5IMVA 4OD7A 4L5LA 3GX8A 3F8UA 4K7IA 4TXOB 2Z9SA 1FVKA 1GTAA 3KD0A 4EDZA 1T3BA 2IMIA 3WGXA 3GNJA 3TJBA 4XHMA 1O8XA 1GUMA 3C73A 4WETA 5ENUA 4JRRA 4MJAA 2X99A 4X0XA 2H1BA 5ID2B 1X5EA 3EYTA 3A5WA 4F9ZA 4K0GA 2LNTA 2CZ2A 1XW9A 1XXUA 3GKKA 2PMTA 2FD3A 2LTKA 2WFCA 1U87A 3TKPA 3PGTA 2VL9A 4TR1B 3DEXA 2QSIA 2HFDA 2LRNA 2NTOA 5E4WA 3QD9A 1TJDA 2NPBA 4X1UA 4O5RA 3ZMLA 2JZRA 2FUG2 3ZL5A 5CO3A 1JZWA 1XW6A 4NAXA 2P31A 3F4TA 1HNAA 5KN2A 4MJBA 1GSDA 3VWUA 1AAZA 4LL1B 5D9WA 4TOPA 2H0HA 4JZQA 3DD3A 5ECSA 4GLTA 2PU9C 4OCEA 5FHIA 3KMNA 1GSQA 3QCPA 2ZNMA 3ERGA 4AJ8A 3P90A 4J57E 4GXZA 4TR0A 2F3MA 2PVOC 4F2IA 3FW2A 4K9ZA 2VM2A 3MSZA 3ZZXA 5D8IA 1N8JA 3MAKA 2RM5A 1SKSB 1QGVA 3CRTA 1GSEA 2ZUPA 1Z7PA 2D2ZA 1DE2A 5G2ZA 2DLXA 1XOBA 3HY2A 1EV4A 5EPFA 2N5FA 4MF7A 2RUFA 2YPMA 4GQFA 2HE3A 2E2MA 3KEBA 1A8YA 1Z5YE 5GAND 4IGJA 3CTGA 4CDOA 2MBSA 18GSA 4PQHA 2DBCA 2OKAA 5B6MA 2VLTA 1GL8A 5H5RA 3UBKA 5G5FA 1VF2A 1Z6NA 2XPEA 3ZYWA 4NHZA 4I2UA 1UVZA 1TRUA 3GKNA 4LL4B 5A4UA 2M46A 2JSYA 4HZ4A 3TKQA 5ECNB 1MDJA 3VPTA 2GQLA 5CRHA 3IRAA 4KSMA 3TB2A 6GSWA 3R2QA 4N0VA 3WGEA 4Q5QA 3RPNA 3GYKA 1E2YA 3FK8A 3ZTLA 5J41A 3F63A 5D9VA 1ERTA 1FB6A 1MEKA 4RUVA 2ON7A 4YQUA 1LJRA 1X9SB 4G2EA 4GSSA 4YAPA 1FHEA 4K2DA 3TKSE 2REMA 3UIWA 1U88A 1BJXA 1ZYQB 2FWGA 4KE3A 2PPTA 1TKDB 2JADA 3L4NA 1K0AA 5DJLA 5IMAA 4KW6A 3VLNA 3EU3A 3M3MA 5C04A 2R6KA 2YN1A 3D21A 1X5CA 2L4QA 4CHSA 3BOAA 3IXRA 1A2LA 3F4SA 3CSHA 3ZLPA 3RBTA 1MDKA 1S3CA 4V1Ap 1EEMA 3LQ7A 1DBYA 2V2GA 3HXSA 4XS4A 5ECQB 3FZ5A 5GSTA 5KEJA 1E6BA 2TIRA 3GSSA 4TR4A 3F3RA 4YQMA 3JCML 1OC9B 5FT3A 4J56E 3GV1A 3NZNA 2PUKC 3WT1A 1I9DA 3FR6A 3RHBA 2YWNA 1Z3EA 2YV9A 4OFTA 4TRXA 1Y6EA 4IQ1A 5CRGA 2DJ0A 1ERUA 2DC5A 2FGXA 2WGRA 2LQOA 2F8FA 4J2FA 5HR2A 1G0TA 4XS6A 4ECJA 1O73A 3GN3A 4IW9A 5GSSA 1EGOA 1TP9A 2NDOA 1THOA 3IHQA 3ZMKA 3PR8A 4FO5A 5ECLB 2P5RA 2QGVA 3FR3A 5ABRA 4G9HA 4HI7A 4IS0A 4BA7A 3M0FA 4NPBA 3RPPA 1ZYEA 1KEBA 5B8AA 3GUSA 2H30A 2I81A 2HNLA 4GSNA 1EOHA 3EMXA 2C3QA 1X5DA 1PKZA 1XFLA 2H1DA 3QDNA 1A2JA 3VI7A 1J9BA 4N11A 5GZZB 4BWQA 1AQWA 4GTUA 3KH9A 1T00A 3C1RA 3LEFA 3Q19A 3QFBC 5DAKB 4TKYA 1XWKA 1GTUA 1EWXA 3L9UA 1J08A 2MMAA 2JU5A 4ML1A 4OFMA 3GKXA 5CRDA 3DMLA 3SWLA 2JL4A 2DJ3A 3GFKA 4IVFA 1WPIA 4NXIA 2A4VA 4LLRA 14GSA 1DSBA 3D5JA 2VL3A 3HDCA 2C0DA 4HJ2A 1HNBA 1SJIA 1IYHA 2H75A 4EE0A 4IJ3A 2LNSA 20GSA 1QXHA 5ELGA 4ECIA 1TOFA 1G7OA 3E9JB 4O32A 2HZEB 1FOVA 1G6WA 1FVJA 2HZFA 1V40A 4JEDA 2GZYA 1A8LA 1X9MB 2FCHA 5JCGA 3IC4A 3LYKA 2H8LA 1GULA 2E7PA 3TJFA 4DSSB 4NHWA 1XZOA 4KX4A 2F9SA 2LJAA 1SL1B 3G7IA 4KCAA 1V57A 1M99A 2IJYA 2KHPA 6GSVA 3VURA 1WMJA 2M80A 2HXKA 3FY7A 1XWBA 3W8JA 1QFNA 2OE3A 3UVHA 5IMDA 5J3RA 2WRTA 2LUSA 3I43A 5KN3A 2IWTA 1UN2A 3FHKA 4ECCA 4QQ7A 2RIIA 5AN1A 3TOTA 5IO0A 1F2EA 1PKWA 4MJCA 4MK3A 4LA1A 2YWOA 6GSTA 2IFQB 2XC2A 4GSTA 3IAS2 3TDGA 4HQSA 1USBA 1B8XA 4IKHA 2DJ2A 4MCUA 3A2VA 3QPMA 2VIMA 3HJMA 1TK5B 1V98A 3KJYA 3LJRA 3P2AA 6GSYA 5DVBA 4IELA 1A23A 3HD5A 2GTUA 2YP6A 3UMAA 3C71A 2C3NA 2L6DA 4Q5RA 3FYGA 1JHBA 4EL1A 2YANA 2YWMA 3GX0A 1I5GA 2GT6A 2C80A 2HYXA 3GKMA 4X43A 2IMKA 5LNKe 2BTOT 4MZBA 1BQ7A 2QKEA 4JE1A 2KP1A 2R5GA 4OFNA 1UC7A 2M72A 5DBQA 1ZCPA 5D9XA 3EWLA 5B7CA 1CQHA 2GSSA 1EV9A 1HD2A 3IAM2 2AB6A 4MZWA 2DIYA 2JSZA 3DVWA 1GP1A 1K0NA 3TJKA 3J7Yk 4L0WA 2CA8A 1A0RP 4HS1A 3IA1A 4XTSA 3FKFA 5JCWA 4WBJA 3O76A 4F0CA 4POKA 2FY6A 2GSTA 4BVYA 3GURA 4BVXA 2ES7A 4GCIA 1YQ1A 2ALBA 5H5QA 1Z6MA 4PNGA 1JLWA 1M0UA 3LWAA 4ULXA 1GNWA 1NHOA 2FA4A 3TOUA 4KDUA 1X9WB 4GRFA 1QMVA 3GTUB 1BX9A 5CAXA 4QL7A 4D73B 2GSQA 4IP1A 3UVTA 3HKRA 3UARA 3QMXA 1XVQA 1HQOA 4ZXGA 1ZGNA 1TI1A 2EIOA 4V2LA 2FWFA 3ZVJD 1T1VA 1B4PA 4WF5A 16GSA 3HZ8A 1OE7A 1GTBA 2NBSA 5C00A 4TR3A 3ERFA 2IN3A 4EF0A 1SJ6A 1K3LA 5G31A 2B3SA 3FZAA 4O7HA 4TVEA 1YKCA 5DALB 4WR4A 1NSWA 1SU9A 2VL2A 4OCFA 2YJ7A 3APQA 2H01A 3KGKA 2G0FA 5IPHA 4CW9A 5DJMA 2LS5A 2HRFA 2E2GA 3HVSA 2HSYA 2WCIA 1JZOA 2HT9A 2YJHA 2V41A 2JZTA 4MJEA 2I1UA 3EMPA 3HYPA 1O81A 3EURA 3IBHA 1ABAA 1VF1A 2HZEA 1T4YA 1M2DA 3M9KA 2X8CA 2CT6A 3A2XA 2L57A 1BEDA 2F51A 1OAZA 4F82A 2QC7A 3S9FA 1YJ6A 5ECIB 2LRCA 4FYUA 2VOCA 3Q74A 3HJOA 4BPYA 3TKSA 3CXGA 4HQZA 1LU4A 3QOUA 2KUCA 2H70A 1WRYA 3LG6A 2IMDA 2R3XA 4IQAA 2LRTA 3QAGA 4XRAA 4DSRA 1Y25A 3LXZA 2GVPA 3O3TA 3QR6A 4KNDA 2FWHA 1OKDA 1ZOFA 5ECHB 1F6MC 4PGTA 3O6TA 1K3YA 5A4WA 2H76A 2TRCP 3ZITA 3NIVA 3BCKA 3LORA 3M8NA 4RQRA 1SL0B 2IFQA 1Q98A 4HJMA 3F3QA 3KP8A 1AC1A 1K3OA 2X8GA 1T8EB 1XVWA 1SK2A 2GLRA 1QK8A 3VWXA 2YV7A 2PGTA 1K0DA 1PSQA 2WDUA 1SKRB 4NV2A 11GSA 3KP9A 3LGCA 4HOJA 5CRWA 4AJ6A 2P5QA 3ZIVA 3IK7A 1THXA 3DRNA 4YQVA 1O85A 1WWJA 2GGTA 3KTLA 7GSSA 1TXXA 1RW1A 3C8EA 2I4AA 3C7MA 2YZUA 2L59A 5D73A 1AW9A 4KB3A 4I6XA 2BJXA 4TXOA 4WBRD 4GWRA 1CQGA 2MMZA 2B5YA 4MLYA 3GL5A 1B48A 1PD21 4IBPA 1RK4A 3N5OA 4ZBAA 1K0MA 4ISDA 1U6TA 4DVCA 1BAYA 1GUHA 1PL1A 5F8BA 1PN9A 1U3AA 5ID2A 1M7TA 1K0OA 3ME8A 1R7HA 2VM1A 2E0QA 2VAFA 4K8MA 1K0BA 5INYA 5B6NA 3HHVA 1JZRA 4F0BA 2GZPA 3L0HA 4EVMA 1M9BA 4PUFC 1MD4A 3VWWA 5DCGA 1FW1A 2GSRA 1V58A 3GL3A 1TI3A 4KAEA 3FZ9A 1AQVA 1OC3A 1PL2A 1M2BA 5ECOB 3GTUA 4D73A 1O8WA 1EGRA 1VF4A 4TR1A 2H71A 4L8EA 4MPGA 2RUEA 2CAQA 1B4QA 5IPGA 3ERWA 1Z9HA 4KDYA 1KTEA 2VCVA 5JWRB 1WOUA 5GAPD 1SYRA 3CBUA 4Q5FA 5EY6A 3ZIJA 5G5EA 1A24A 2IL3A 4POMA 2RM6A 5DQSA 2HI7A 4P3YB 3UL3A 3FZ4A 4DEJA 2YZHA 2VCXA 2K9FA 3LXTA 1ZZYA 3PH9A 3W8SA 3D4TA 1SD9A 2WS2A 4PQIA 3HA9A 3F6DA 4E8EA 1X0RA 5JCUA 3TRPA 2VL2C 1XWGA 2VD0A 4N0ZA 2IMEA 1FO5A 1TK8B 1V2AA 3DYRA 1A2MA 2R4VA 1XCCA 2V1MA 3RDWA 2B6MA 4KDXA 4N10A 4FYCA 2DJKA 4K7NA 1WE0A 4RI7A 3CTFA 2FHEA 5IM9A 5G30A 2LSTA 2MZCA 4EO3A 3UOMA 1GUKA 2GT5A 5F07A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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