5E59A

Crystal structure of reduced state of a novel disulfide oxidoreductase from deinococcus radiodurans
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
SEKIRVDIWSDIACPWCYIGKRRFESALGQFPQRDQVEVVWHSFELDPSARPLNPIAMRDGLAMKYSISPAQAQGSLDHMTQTAAQEGLEYHFDRVKLANTFLAHQLIHYAAEQGQGDAMKERLLRAYMSEGQNVNDLDTLQKLAAEVGLDAGAARAALEAGTYAQAVRYDEAQAQQLGITGVPFFVLGGKYGVSGAQAPETLLGALSQVWAEQHPAPLTMLGQDAPAEGC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Deinococcus radiodurans (strain atcc 13939 / dsm 20539 / jcm 16871 / lmg 4051 /
publication title drFrnE Represents a Hitherto Unknown Class of Eubacterial Cytoplasmic Disulfide Oxido-Reductases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FrnE protein
total genus 86
structure length 231
sequence length 231
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5e59A01
3QD9A 1SD9A 2DJ3A 1OC9B 5HFGA 5DCGA 4WR5A 1SU9A 4ACSA 2F3MA 2YWMA 1VF3A 4NHZA 5ID2B 2HNLA 3J7Yb 3M8NA 2NPBA 3FZAA 2LNSA 1AQXA 4EXJA 4GLTA 1FAAA 2I4AA 2HSHA 2H30A 2ALBA 1T00A 2C80A 2YP6A 6GSWA 2K9FA 5IMCA 2L4QA 4FYCA 4ZIJA 4XIHA 5DCHA 2XBIA 3O76A 3IAS2 4XCSA 2VL9A 2QSIA 4TRXA 2AAWA 4P3YB 3KH7A 5H5QA 2P31A 3DEXA 5CO3A 3VPQA 2CVDA 3UARA 1O81A 3FK8A 2R5GA 1YDKA 2DLXA 5ECSA 2AB6A 1PKZA 5HFIA 3LEFA 1KNGA 1XVWA 3N5OA 2PUKC 3H93A 2DC5A 3D6IA 2O85A 1FOVA 2AUVA 2WZ9A 4K2DA 5IIZA 4J57E 4RI6A 2VM1A 2OE3A 3GTUB 3ZLPA 4MF7A 4E8EA 3EVIA 2P5RA 3LYPA 1THOA 1XZOA 1PRXA 1R26A 1K0DA 2X8GA 3GL3A 4FO5A 4MJAA 3FKFA 1J08A 2JZSA 1VF4A 2EC4A 2GGTA 2E2GA 1PGTA 5G2ZA 2CZ3A 3BJ5A 3F6DA 4K7OA 5ELGA 1GTUA 4D73B 1GNWA 3C8EA 3TJFA 1Z7PA 2H71A 4I97A 2H0HA 3IK7A 3L78A 9GSSA 4HEA2 4ZBDA 2C0EA 2H6YA 1GWCA 6GSTA 3IDVA 3HZ4A 3E9JB 1M99A 4XS4B 1X5DA 2VCQA 2RUEA 1FB6A 3FW2A 2HFDA 1GSFA 2X8CA 5DDLA 6GSUA 4NV2A 1JLWA 3WYWA 4TR1A 1EGRA 3IR4A 3KP8A 4LMWA 2OE0A 1GSDA 3ME7A 3D4TA 1OAZA 5D9VA 2F8FA 4LA1A 5ABRA 5GZZB 2FD3A 1T7PB 2VL2C 1JZWA 4TW5A 19GSA 3ZMLA 4V1Ag 2LQQA 5AIXA 3KTBA 3BBYA 1U88A 3VK9A 2DJKA 5AN1A 1ACVA 2WDUA 2WS2A 2RUFA 2V2GA 2CVBA 2RM5A 2IFQA 5ECOB 3DIEA 1ERTA 2GVPA 4MABA 2IMDA 1Z9HA 3IA1A 1BEDA 1XFLA 2E2MA 4F9ZA 1MD3A 2I81A 1X9WB 1A23A 2I1UA 2JU5A 4JR4A 5G5EA 3GKKA 4KGIA 3GKMA 2OADA 2KUCA 4TN8A 1FG4A 4EDZA 4MF6A 4KNDA 4ZILA 2E7PA 5JWOB 20GSA 3EE2A 4I5QA 3NIVA 4IJIA 1B9XC 5JCWA 1MEKA 2CA8A 4IQ1A 1XWGA 4MPFA 4TKYA 4V2LA 2FUG2 2VCWA 3G7IA 3Q74A 2DJJA 2CVKA 3KMOA 1HNCA 1A0RP 1OC3A 1V57A 1PN9A 2LS5A 2YZHA 1TU8A 2FWEA 2GLRA 5F0GA 1ZCPA 1XWCA 3I9V2 4IJ3A 1EEMA 4G19A 2WRTA 1X9MB 1GLPA 2GTUA 2B3SA 4PUAA 5A4UA 4BVYA 2V32A 1A2JA 4PGTA 3O3TA 4ECJA 1A8YA 2VL2A 4X1UA 1SJIA 2O7KA 3KP9A 3KXOA 5FWGA 2LKUA 4FH8A 2JL4A 3ZVJA 5B6NA 2L4CA 1TK5B 1QXHA 2YJ7A 2DMMA 4NHWA 2PWJA 5LCZA 2LUSA 1DBYA 5CREA 3A5WA 1QUWA 3CRTA 3H8QA 3A2VA 4CW9A 3VWUA 3TGZA 3DYRA 4K6XA 1R5AA 3U6VA 6GSYA 1E2YA 3CTFA 4GSSA 4MF5A 2C3TA 2L5LA 1SK2A 4KSMA 2GSSA 2VLTA 4F0BA 1T4YA 3F3RA 3U5RE 1LJRA 1O7UA 1PL1A 2YOIA 4O7HA 3FHKA 2L6DA 4GTUA 1V40A 5DQYA 2LEGA 2J23A 2NBSA 4K0GA 3IRAA 3GH9A 3PH9A 4V2MA 4ZXGA 4I6XA 1ZL9A 1A8LA 2FNOA 4AJ7A 4MLYA 3DVWA 3WGDA 3HXSA 1ABAA 2C3QA 2H66A 3F0IA 2NVLA 1M2AA 2VO4A 1UN2A 5DJLA 4BL7A 4NMUA 2VCZA 2LTKA 4E8HA 1VGLA 2PGTA 1X5EA 3VWVA 1V58A 2KLXA 1SL1B 2QC7A 3GYKA 1OC8A 3PINA 5E59A 3LXZA 4PQIA 4QQ7A 1R7HA 2B6MA 4MCUA 2VLUA 2XHFA 2VCTA 4HQSA 4N0VA 4TXOB 4MJEA 1DE2A 4Q5RA 4OO4A 3KJYA 4JRRA 2DIYA 1GULA 4TXVA 4OCFA 2L59A 4F0CA 4ML6A 4F03A 3QAGA 2HYXA 1M0UA 4DSSA 1JHBA 1GLQA 2L57A 3F4RA 5FT3A 4JZQA 3HCZA 1FVJA 4L5LA 1UVZA 2CV4A 4EVMA 1YZXA 3GSTA 1QFNA 3PGTA 4RI7A 4MP4A 2BMXA 1AAZA 5D8IA 1OKDA 5EL8A 2V1MA 3APOA 3TRXA 3H1NA 4EDYA 3EU3A 3WT1A 1NM3A 5CAXA 13GSA 5GAPD 4G10A 2LSTA 1TXXA 4MPGA 2VCVA 3SWLA 2GSTA 4K7NA 4BWSA 3C73A 4ULXA 3TRQA 4EKZA 2EIRA 2OKAA 2MBSA 4IBPA 3FEUA 3N9JA 1Y6EA 1GH2A 3I43A 2MMAA 1JFUA 1ML6A 1PD21 5KEJA 2RLIA 5ECKB 2PPTA 3HYPA 4XTSA 1F37A 1F2EA 1GUKA 1DUGA 4OD7A 4QL9A 4KE3A 1TOFA 4KA0A 2LRTA 5IMZA 2IN3A 4CDOA 3CTGA 3D21A 2GQLA 2E0QA 3VWXA 2CAQA 5D9XA 2R6KA 4ZB8A 3ME8A 2QKEA 2WB9A 2OBKA 1Z6MA 1SYRA 5HR2A 1SL2B 5ENUA 2DSAA 5DAKA 3M1GA 1EOHA 2A2RA 3P90A 3LGCA 3HHVA 2F9SA 1AQWA 3HVVA 5CRWA 2A2SA 1PMTA 4F82A 4ZBBA 3RPNA 4KH7A 2R2JA 4PXOA 4BPYA 2HXKA 2LJAA 3OR5A 1XCCA 4OCEA 2IJYA 1EV9A 5IO0A 3G7YA 3KZQA 1QMVA 1X9SB 4KX4A 4PQHA 1S3DA 2GS3A 3A3TA 1TRWA 2FCHA 1DSBA 2H8LA 3CSHA 1YEPA 1TJDA 3ZTLA 3TKSC 4JR6A 1OE7A 5DALB 1A24A 1ZMAA 2PU9C 4PUFC 4ILFA 4TR0A 3D4MA 3RAZA 1EP8A 4L0UA 4IELA 3DRNA 2D2ZA 4KCAA 1TRSA 2VM2A 5HR3A 2H72A 1KBNA 3MSZA 4XRAA 1BYEA 1T1VA 4EF0A 3F6FA 2RM6A 3GX0A 4J56E 4AF2A 4BA7A 3GSSA 5ELAA 1RQMA 1XOBA 4IQAA 2C4JA 2GQKA 5D9TA 2HZFA 1TDIA 1AXDA 1MTCA 3QDNA 5B8BA 2I9HA 1GSSA 3VLNA 2ES7A 2HZEA 2H0IA 1IYHA 4MH3A 4WF5A 4MJBA 1Z3EA 5ECQB 1TRVA 2MMOA 5C00A 3CSIA 3EU4A 2F51A 2KOKA 1SKSB 3LFLA 3GMFA 4RQRA 2IL3A 4YQMA 3ISOA 1FW1A 2KP1A 3KIJA 4EL1A 2C0DA 1K0OA 2FY6A 3F3QA 2LV3A 3TCOA 2YWNA 2VIMA 3TJGA 1THXA 3W8JA 2YN1A 2GSRA 1QK8A 4OFTA 2FA8A 3TKPA 1A0FA 5IMDA 2B5XA 5COHA 3FYGA 4O5RA 2AYTA 1A2LA 4I2UA 3F4TA 1YKAA 4GF0A 1K3LA 2TIRA 3L9VA 3ZFLA 4YQVA 5IQYA 5IM9A 3W8SA 1VF1A 2ON5A 5IPGA 3WGXA 1OYJA 4MZWA 3CBUA 1MDJA 2A4VA 3GA4A 1XXUA 2WJUA 4MK3A 1U3AA 1Q98A 3C7MA 1M2BA 2P0GA 4QL7A 4HUAA 1YF0A 2X8HA 3VFIA 1SENA 1ZOFA 1ERUA 2C3NA 2B1KA 2R4VA 2VLVA 1GP1A 4X0XA 2DIZA 2PN8A 5LD0A 7GSSA 1Q4JA 2WCIA 1ST9A 5HFKA 2WULA 4OO5A 4TR1B 4O32A 4PQ1A 3F8UA 1EOGA 1M2DA 3FR9A 1N2AA 1XW5A 2FWHA 5JCUA 3TRPA 3MDKA 4DSQA 4K9ZA 1K3OA 2YWOA 2R3XA 3IK9A 3GN3A 1K0BA 2IMIA 3JCML 3SBCA 2Z9SA 4KW6A 3TJKA 3UEMA 3C1SA 1TU7A 4K1FA 4HDEA 1TI1A 1ZZYA 2REMA 4GSTA 2H75A 1BQ7A 4JU5A 2M80A 2IFQB 2CX3A 1I5GA 2TRCP 2L6CA 2B7KA 1JZDA 2VCXA 1OKTA 1K0NA 3RHCA 3UBKA 2AV4A 2K8VA 2C8UA 5DJMA 2HRNA 1TK8B 3KD0A 1HYUA 1F3AA 3UJ1A 1PKWA 4Z7XA 1LBKA 1DE1A 3IE3A 2HRFA 4L0WA 3KTLA 4PNGA 4N11A 1BAYA 1J9BA 2X64A 2LQOA 5H5RA 3GKNA 2AJQB 3IHQA 2H76A 3LWAA 1O8XA 1EP7A 4HJ2A 5ECRB 2HE3A 1ERWA 1PX7A 5CRGA 3UBLA 4G9HA 1JLVA 2IMKA 2YCDA 1ERVA 3L9SA 4MA9A 4N0ZA 5EY6A 1R5PA 3ZITA 4ZL9A 5A5KA 3IPZA 1S3AA 5KN0A 5INYA 3HD5A 3QAWA 3P7XA 1GSYA 4HU9A 4DVCA 2OACA 1G7EA 3TDGA 3A2WA 2ZCTA 3FR3A 1U87A 1TKDB 1YEXA 4PNFA 1IYIA 1G7OA 4HU7A 2H19A 1F3BA 3GURA 3EURA 3IC4A 1BJXA 3HVXA 5HQPA 22GSA 3M0FA 3GUSA 5F06A 2TRXA 5F07A 3UVTA 5ECHB 1M9BA 3LSZA 5JCGA 2OE1A 1UA5A 1OVNA 5H5SA 2VD1A 16GSA 1T3BA 2K6VA 1WJKA 3ERGA 2YANA 1W89A 5LNKe 4POMA 1JZRA 1GRXA 3QAVA 2KP2A 4GSNA 2JSZA 2QGVA 2B5EA 3CSJA 3S9FA 1N8JA 1SK0A 3W6GA 4ECCA 2ZUPA 5FHIA 1AIUA 3A2XA 2GQMA 1HQOA 5C04A 5J5NA 4NV5A 3P2AA 3RHBA 3UIWA 2XBQA 1V9WA 5G1KA 2V6KA 2OA7A 3NZNA 5A4VA 4MZBA 1SL0B 3FZ9A 2DJ1A 4LL4B 3CXGA 3E0UA 3IXRA 1X5CA 1SJ6A 3HJMA 5IMAA 2LJKA 4K0NA 2DJ0A 3DXBA 3ED3A 4IN0A 2C0FA 3BCKA 3H4KA 4AJ8A 5ECMB 5HR1A 4Q5QA 2HLSA 5DQSA 2H0GA 1MD4A 4AGSA 3QR6A 1FHEA 1RK4A 1I9DA 4DSSB 1FVKA 1OC9A 4BVXA 3EYTA 3LG6A 5ID2A 3UVHA 3V1WA 1WWJA 3QFAC 1A2MA 1QGVA 2IMFA 3L4NA 4J2FA 4WBJA 3LJRA 4HJMA 3DGQA 4POKA 4YAPA 3RPPA 1SKRB 1GSEA 1B4QA 1GNEA 4MDCA 1EV4A 1SJZA 3APSA 1ILOA 3EC3A 3HKRA 3GV1A 3H79A 4KUNA 1XIYA 4RUVA 1J0FA 4Q5NA 4Q5FA 1T8EB 2C0GA 2M46A 6GSSA 2YZUA 5CRHA 4ZBAA 2VOCA 1BX9A 1O8WA 2LNTA 3IOSA 3TKRA 3VI5A 1NW2A 3WD6A 2CZ2A 3D0ZA 2BJXA 5AGYA 2HI7A 5J41A 2H6ZA 2KHPA 5GSTA 2IIYA 5DBQA 3ERWA 1GTAA 1B4PA 3GTUA 12GSA 3Q18A 2IWTA 1XOAA 4MMMA 4KSOA 1K0CA 1TP9A 4KCEA 4V2NA 5J3RA 1XWAA 2H70A 2GT5A 2O87A 3VURA 2JZRA 3HJOA 1B9YC 2B5YA 4L5OA 4BWQA 1OE8A 1GUHA 2H1BA 1AQVA 3L9UA 4WXTA 4KB3A 4FIWA 4D73A 5DAKB 1Y25A 3VI7A 2FHEA 4IVFA 1WP0A 2GZPA 3QFBC 1MDIA 3EMXA 4HZ2A 3AY8A 3C1RA 4XS6A 1AUCA 3P8WA 4IP1A 4TR3A 10GSA 2YJHA 5IMFA 2PMTA 4ZB6A 4ECIA 4PURA 4XS4A 3MWHA 3NOFA 4V1Ap 3F9UA 4N10A 3FZ5A 4LLRA 4KDXA 5IMVA 3UOMA 1JZOA 2K8SA 4I8BA 1XVQA 1C72A 3UL3A 1BG5A 1FO5A 3HA9A 5G30A 1T4ZA 2DJ2A 3EWLA 1ZYQB 4ZL7A 3CRUA 4JBBA 5DVBA 2CX4A 2HT9A 2L5OA 4EUYA 3J7Yk 3M9JA 4PX1A 3DWVA 1EZKA 4ECBA 2YPMA 4OMVA 3DVXA 4I2TA 2CT6A 5JWQB 4TOPA 2GT6A 3GH6A 1FB0A 5IO2A 5KN3A 4HOJA 2HSYA 4IHUA 3DD3A 4IW9A 11GSA 4L8EA 3TKSA 3MNGA 1PL2A 5ECIB 3FZ4A 3KH9A 4TVEA 2DMLA 4FYUA 4K7IA 1M7TA 1WOUA 4WF4A 2HZEB 4FYBA 3QPMA 3GRXA 2PERA 3US3A 1USBA 5GSSA 2H74A 4ML1A 4OFNA 5CRDA 2G0FA 2IPAA 1ZGNA 4GRFA 2LRCA 1HD2A 4NWYA 3RBTA 1XWBA 4ZL8A 3IV4A 2JACA 2EIQA 3DMLA 1ON4A 2VAFA 3HDCA 1F9MA 4XHMA 4AJ6A 5L71A 1PA3A 2MMNA 4XRDA 2VL3A 1AW9A 3ZFBA 4ZB9A 3DKSA 3APQA 1CQHA 6GSVA 2GSQA 2CQ9A 3ERFA 1TRUA 3GFKA 2O8VB 2WFCA 2LRNA 4X43A 2FGXA 2V6OA 2YV9A 3CYNA 5KN1A 1CQGA 1Z5YE 3FY7A 4RQXA 3I6AA 5KN2A 1XPVA 2OJLA 4H86A 4HQZA 3IBHA 1EEJA 3TOTA 4MZCA 5J4UA 2N5BA 4OWYA 1XBSA 4CHSA 3GNJA 2YNXA 2H1GA 17GSA 3F4SA 1KTEA 3G7JA 5F05A 4XS1A 3TUEA 3BCIA 3M3MA 1TI3A 2MYGA 2H1AA 3FR6A 4WETA 3F63A 3HZ8A 3Q6OA 2JADA 3HJPA 2O89A 2DBCA 2XPEA 2YV7A 4WKWA 1EWXA 2H73A 1XWKA 5A4WA 4IS0A 4K8MA 4G2EA 2MMZA 4NXIA 3LQ7A 1WRYA 2WGRA 5ECPB 2FWFA 2G2QA 4NAXA 1AC1A 3ZVJD 1KEBA 3G9BA 5GAND 2GZYA 5AISA 3EMPA 2NTOA 2B1LA 1S3CA 4WR4A 5J9CA 1MDKA 5IOWA 1VRSD 3GL5A 1F6MC 1Z6NA 1WPIA 3CMIA 3GIXA 2ON7A 1K3YA 4POBA 3ZIVA 4LL1B 2XPDA 4GQFA 2H6XA 2N5FA 4ISDA 1URMA 2NDOA 3ZREA 1E6BA 3KCMA 2JSYA 4KAEA 4KDYA 5D9WA 3TKQA 1NHOA 14GSA 1GTIA 1WE0A 2GZZA 1G6YA 1PQNA 1G0TA 5ECLB 2F8AA 2N5AA 1W4VA 2YWIA 1SK1A 1B8XA 2XC2A 3TOUA 1O73A 3D5JA 2PVOC 5J9BA 4TXOA 5B7CA 5CNWA 3TJBA 1GSQA 1B48A 2LJRA 4IKHA 1U3IA 3M9KA 4KDUA 3L0HA 4NPBA 4HZ4A 3RDWA 5G31A 2FWGA 3ZMKA 4DSRA 3GHAA 2C1YA 1R4WA 5CP1A 8GSSA 1SKWB 3C71A 6GSXA 1V98A 3KM6A 4YH2A 2VUPA 3ZYWA 2FLSA 2EIOA 3EINA 3TB2A 1UC7A 2H1DA 3K8NA 3BOAA 1PSQA 1PX6A 3QOUA 2J9HA 1U6TA 4TR4A 3R2QA 2CAIA 3E3EA 1M9AA 1NSWA 2B7JA 3VWWA 2IMEA 2K18A 1VF2A 4O92A 4IGJA 1H75A 4ID0A 1TTZA 2PVQA 3I69A 2X99A 3LYKA 1YF1A 1YQ1A 3KEBA 4WEYA 3WGEA 3QCPA 5IOXA 2AHEA 5D73A 4F2IA 3KMNA 1TK0B 3GX8A 1LU4A 1RW1A 4EO3A 2R37A 3TJJA 1H4OA 1QQ2A 3HVSA 2I3YA 2GDRA 3ZL5A 4EE0A 2MZCA 3UAPA 4EC0A 1GSUA 1ZYEA 2FA4A 1GUMA 3VPTA 3WT2A 1O85A 5D93A 2PBJA 2VD0A 4GWRA 1XW6A 3ZRDA 4JE1A 3QMXA 4HS1A 3FRCA 2ZNMA 1HNAA 3KGKA 3D22A 1O6JA 2V41A 18GSA 1EGOA 1HNBA 5EPFA 1K0MA 4LMVA 5CYYA 5IPHA 4GCIA 1YKCA 2RIIA 3O6TA 4POLA 1V2AA 1WIKA 4MJCA 4GQCA 1XW9A 1Z7RA 4YAVA 4HI7A 3LXTA 1K0AA 4OFMA 1X0RA 4N30A 5B8AA 2M72A 5ECNB 5HR0A 5E4WA 3LORA 3TKSE 1SYXA 2BTOT 3HY2A 4GXZA 1SD8A 3BD2A 5G5FA 4JEDA 3ZZXA 3ZIJA 3Q19A 5EVOA 4YQUA 2MBTA 1GL8A 3PR8A 3UMAA 1TW9A 1YJ6A 5AIVA 5B6MA 5D96A 2H01A 3GKXA 5DALA 2P5QA 1NHYA 5JWRB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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