5E59A

Crystal structure of reduced state of a novel disulfide oxidoreductase from deinococcus radiodurans
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
231
structure length
231
Chain Sequence
SEKIRVDIWSDIACPWCYIGKRRFESALGQFPQRDQVEVVWHSFELDPSARPLNPIAMRDGLAMKYSISPAQAQGSLDHMTQTAAQEGLEYHFDRVKLANTFLAHQLIHYAAEQGQGDAMKERLLRAYMSEGQNVNDLDTLQKLAAEVGLDAGAARAALEAGTYAQAVRYDEAQAQQLGITGVPFFVLGGKYGVSGAQAPETLLGALSQVWAEQHPAPLTMLGQDAPAEGC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title drFrnE Represents a Hitherto Unknown Class of Eubacterial Cytoplasmic Disulfide Oxido-Reductases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FrnE protein
source organism Deinococcus radiodurans (strain atcc 13939 / dsm 20539 / jcm 16871 / lmg 4051 /
molecule tags Oxidoreductase
total genus 86
structure length 231
sequence length 231
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5e59A01
1M2BA 4TN8A 3U6VA 1G7EA 4IQAA 3N5OA 2G0FA 4XTSA 1R5AA 4I5QA 3TRQA 1OYJA 1XWAA 2PERA 1M0UA 4MJCA 3F8UA 3ZYWA 2VUPA 1S3DA 1K0DA 2LJKA 2PUKC 3KZQA 3RAZA 3P8WA 3ZFLA 2IPAA 3LXZA 5IQYA 1XCCA 2EIQA 2VM2A 1GUMA 4I8BA 2NBSA 5LNKe 5HR3A 1MDJA 3CRUA 2LRCA 3M8NA 2WGRA 4OFMA 2FLSA 2GSRA 2BMXA 2A2SA 2ZCTA 3BCIA 1SYRA 2H71A 1GL8A 2LEGA 4HU9A 1TK8B 4L5OA 1H75A 4PUAA 3HZ8A 4JZQA 2E2GA 4DSRA 4D73B 3G7JA 2YZHA 4KA0A 1EOGA 2IIYA 10GSA 2ZNMA 2F9SA 4PQIA 2LKUA 2LNSA 1O73A 2X99A 2PPTA 4POMA 3OR5A 2LQQA 2MZCA 2H0IA 4LMWA 2J23A 2L5LA 2C1YA 2V1MA 2K8VA 7GSSA 4K1FA 3HJPA 3SBCA 2F8FA 3VFIA 1XBSA 2VAFA 4BL7A 1TRWA 4TR1B 2LJAA 4YH2A 1Y25A 2JU5A 4OO5A 2X8CA 1MDIA 2IMKA 4PQ1A 2FUG2 2WB9A 2JZRA 2OBKA 1KBNA 4HOJA 2GZZA 4IHUA 2VL3A 2YJHA 3ZIJA 1SJ6A 2B5EA 5CAXA 3FEUA 1QFNA 3QOUA 1XW5A 4ML6A 4MCUA 3LYPA 2WULA 2B6MA 1YEPA 2PVQA 1EEMA 4HS1A 2HI7A 2DJ3A 2VO4A 3F9UA 4KW6A 4TR4A 2NPBA 4TW5A 3IV4A 5B7CA 1M2DA 1Y6EA 2WJUA 2VOCA 2C0FA 1UA5A 4KDXA 3KCMA 2YV7A 3APQA 1OE7A 3DEXA 4KCEA 3F63A 5IMFA 1U3IA 2FA8A 4DEJA 5EPFA 5G5EA 3M0FA 1XPVA 1F3BA 1O81A 2H66A 3VK9A 1MTCA 2ON5A 5ELGA 3H93A 1SL0B 5J4UA 5F8BA 2JACA 5DDLA 1X9WB 4TOPA 3ZVJA 4I2TA 2H01A 1BJXA 3U5RE 3QDNA 4PX1A 4ECIA 3F4RA 3LGCA 5GAND 2DMMA 4MZCA 2PN8A 3K8NA 1BAYA 1SKWB 4FYBA 3DD3A 3HD5A 1B4PA 3UEMA 1XIYA 1ERUA 4YQUA 4IP6A 3ZZXA 2L6CA 2IFQA 1SKRB 1YDKA 4XS6A 4ZB8A 3PGTA 3RDWA 4HQSA 5ID2B 1Z5YE 1DSBA 4AGSA 6GSWA 4WF5A 1A8LA 2FWFA 1ZOFA 1X5CA 2CAQA 3ME7A 1PN9A 3JCML 3GL5A 4QL9A 2QGVA 4GWRA 3FR3A 4ZBDA 1U6TA 1T8EB 1IYHA 3EU4A 1WIKA 1FVJA 1TK0B 3QR6A 3D4TA 4K0NA 5D93A 2G2QA 3TKSE 4MP4A 3FZ9A 2RM6A 4AJ8A 3BBYA 3BJ5A 2IN3A 1VF3A 4G9HA 5DCHA 2GQKA 3F6FA 1TRVA 1BYEA 4JEDA 1T00A 1Z6NA 4WXTA 1LU4A 2H73A 2VCVA 3CSHA 3TKQA 4KCAA 3TB2A 3QAVA 4TXVA 2R5GA 4BWSA 2B7JA 1AC1A 4GLTA 3A2VA 4ILFA 1XW6A 1WMJA 1YKCA 1KEBA 4MABA 3TKRA 4ACSA 1PKZA 3HYPA 4TR0A 2MBTA 2K9FA 2LSTA 2OACA 5B8BA 22GSA 2XC2A 4XS4A 3F4SA 4HDEA 1C72A 3S9FA 4MF6A 3ZMLA 3I6AA 3G7IA 3DYRA 3FZ5A 4KAEA 4KSOA 3GTUA 4MMMA 1GULA 2CZ2A 4EL1A 3TKSA 2YWNA 5CRDA 1KNGA 2CA8A 5H5RA 2VCTA 2HZEB 1QMVA 2JSZA 4K7NA 4JBBA 1NW2A 2YNXA 4L5LA 1OKDA 2VLUA 2MMOA 2V6KA 3GNJA 2KP1A 1THXA 4KGIA 3L9VA 3HHVA 5FWGA 3RPNA 2OE1A 4XRAA 3HKRA 1EV4A 2RUEA 2Z9SA 5C00A 3IAS2 1IYIA 1WJKA 2FA4A 3GMFA 1NHOA 2P31A 3E0UA 3DKSA 4TXOA 1QXHA 4MH2A 4ZB6A 4I2UA 1U3AA 1O8WA 1RQMA 3LQ7A 4FH8A 3O6TA 2MYGA 1WRYA 1GSUA 2REMA 5DJLA 4K8MA 4EKZA 2FWHA 2YZUA 2OA7A 1I9DA 1V2AA 4QL7A 3MSZA 1AIUA 4TR3A 2GDRA 4TVEA 4KUNA 1G0TA 2LQOA 5E59A 4BWQA 1K3LA 2C8UA 3RHCA 5KN3A 1MD3A 5IO2A 5JCGA 2HSYA 4EDZA 3DWVA 5AGYA 5F05A 1M7TA 3HY2A 4O92A 4GSNA 2OE3A 2IFQB 1UVZA 3L0HA 2H30A 16GSA 2DC5A 3HJOA 2YANA 3FZAA 3KTLA 1ST9A 1AUCA 2P5RA 2C80A 2JSYA 3IDVA 3DXBA 4XHMA 2NDOA 5COHA 2M46A 1MD4A 3P7XA 2A2RA 1FB0A 4FIWA 4IN0A 1OC8A 1XOAA 5ECMB 4XRDA 2KHPA 4NV5A 5A4VA 2LRTA 3H8QA 1N2AA 1UN2A 3LWAA 1YF1A 3TOUA 1TDIA 4FYUA 5D9VA 1W4VA 1FO5A 1UC7A 1K0AA 4L8EA 1M99A 5LD0A 4N0ZA 1TOFA 1TI1A 5G5FA 4PURA 1O85A 1PL2A 1EGOA 1V9WA 3CSJA 2VCWA 5ECKB 1EGRA 3WYWA 5ENUA 2B1KA 4OO4A 4QQ7A 3UJ1A 3UIWA 4YAVA 2D2ZA 1A2LA 1RW1A 2GSQA 1GSQA 1J08A 3ED3A 2VIMA 1SJIA 3ME8A 5ECIB 1K0NA 1GNWA 1SD8A 1G7OA 1U87A 4V2MA 2KP2A 5HFGA 4PGTA 2H70A 4JE1A 3C7MA 4Q5QA 4K7OA 3KXOA 1OC9A 3VLNA 1TRUA 1TJDA 2AHEA 4IELA 1TI3A 5F0GA 2MMZA 4IP1A 4AF2A 5A4WA 1ERVA 1DUGA 2HZFA 4JRRA 1JZOA 9GSSA 2IJYA 1PD21 2O7KA 2KUCA 2HT9A 3F3QA 1FOVA 3W8SA 4YQMA 1Q98A 2YPMA 2GQLA 3LJRA 4HUAA 3ZTLA 2LS5A 4J2FA 3A5WA 5IOXA 2H1DA 1QUWA 6GSSA 1VRSD 4LMVA 4HI7A 1GSFA 5J9BA 1EP8A 4MPFA 2PGTA 5J9CA 1R26A 2YOIA 1PRXA 2K8SA 1O6JA 5HQPA 1YF0A 3ZL5A 4K9ZA 1BEDA 1XWGA 4IVFA 4NHWA 3Q18A 3VURA 2V2GA 3DGQA 2FNOA 3LYKA 5J5NA 1QK8A 4WKWA 3LSZA 2FGXA 5C04A 5E4WA 5IPGA 2NTOA 4EDYA 4DVCA 5IPHA 5A4UA 2CVDA 1OE8A 2OADA 3EU3A 3EMXA 3GKXA 1GTUA 4WETA 4ULXA 2PMTA 1ACVA 2L57A 3GA4A 4MZWA 4MJEA 2QC7A 3TOTA 2DBCA 5CO3A 12GSA 2LRNA 3D6IA 2RM5A 1VF2A 1T4YA 1A2JA 4J57E 3KIJA 4KDYA 4LLRA 1F2EA 3HZ4A 3O3TA 1TRSA 1K0MA 4MH3A 1MDKA 3WGEA 3HDCA 4WR4A 3RBTA 3IXRA 3RHBA 1J0FA 1WWJA 3ZLPA 4MLYA 3FY7A 4WF4A 2H1AA 3UAPA 3TCOA 2CV4A 3CYNA 1NSWA 2CT6A 3FW2A 2DJ2A 3WT2A 4F03A 1VF4A 3WD6A 3FR6A 2L4CA 4NWYA 2PU9C 2JZTA 4MZBA 2CZ3A 1PX7A 3F0IA 1MEKA 4OFTA 3W8JA 4RI6A 1FB6A 2O85A 5ECSA 1TKDB 4WEYA 1A0FA 1AQXA 3EVIA 1K0OA 2N5FA 4NV2A 6GSUA 3IR4A 3PR8A 1B48A 5DVBA 3WT1A 3KEBA 5DQYA 2CX3A 3QAGA 3UOMA 1ZZYA 1Z3EA 1URMA 1HNCA 1LBKA 2AV4A 1F3AA 1OAZA 2L6DA 1O8XA 2YV9A 4ZBBA 3APOA 2C0EA 1SENA 1PL1A 1HNBA 2DJ0A 3EC3A 4DSSA 3D0ZA 1T7PB 1TK5B 4RQRA 2VCQA 2N5AA 2FHEA 3I69A 1HQOA 4HQZA 3L4NA 2R6KA 4PQHA 4ISDA 3G7YA 1TU8A 2K6VA 2YP6A 1XWCA 4J56E 2VL2A 2VL9A 3A3TA 3M9KA 3CRTA 1E2YA 1HNAA 4F0CA 1GUHA 3KTBA 5IMCA 3M9JA 5G31A 3DVXA 5AIVA 4K6XA 3GH6A 1QGVA 3NIVA 3WGDA 4MA9A 4KE3A 4MK3A 1GTBA 2FCHA 4KB3A 1LJRA 3TRXA 2AAWA 4IW9A 1EP7A 3HXSA 1AW9A 5D96A 5LCZA 3KJYA 1M2AA 1EZKA 1OC3A 3FZ4A 3ZMKA 4XIHA 1GSDA 5ECQB 3IK7A 1TXXA 3IAM2 4X43A 4F9ZA 4GTUA 4OCFA 1SK2A 3HA9A 2DMLA 5IMVA 1SL1B 3IE3A 4OWYA 4N0VA 1DE2A 20GSA 1T1VA 3KH9A 2GVPA 3MWHA 1YZXA 1TU7A 18GSA 1GWCA 3GX0A 3GL3A 1PQNA 5EVOA 3ZIVA 2RLIA 4MJBA 5DAKA 1SYXA 2XBQA 1XOBA 1B4QA 3UL3A 1A8YA 2DJKA 4GXZA 4N10A 4IJIA 4HJ2A 3ZREA 2H0HA 2CQ9A 2IMIA 2C0DA 1X9MB 3KD0A 8GSSA 1EWXA 3LG6A 3R2QA 4OFNA 2YWOA 3QFBC 3EMPA 1TTZA 1SJZA 1B8XA 2H1BA 3EE2A 4MPGA 5ECHB 5HFIA 5D9WA 4Q5FA 1PSQA 2P0GA 5KN0A 1ZYQB 4F2IA 4O7HA 4ECCA 1TW9A 3NOFA 2EIOA 4O5RA 5DQSA 1BG5A 4GSTA 5ECNB 2CAIA 1AXDA 1Q4JA 3GRXA 4MDCA 2IWTA 1J9BA 1V98A 4EF0A 4KSMA 2IMDA 2B3SA 5D9TA 4HEA2 4K0GA 5G1LA 2B1LA 2XHFA 1ABAA 1N8JA 1U88A 2WRTA 5AIXA 1JZRA 2X64A 3E3EA 1JLVA 3MAKA 2H75A 3DMLA 1XVWA 2PVOC 1A24A 2OJLA 5CNWA 2TIRA 1R7HA 2IMEA 4NAXA 1V58A 2L5OA 3TGZA 4D73A 2R3XA 4TKYA 3QD9A 2M72A 5GZZB 4Q5NA 4DSQA 3AY8A 3V1WA 3LFLA 1FW1A 4V2NA 2CX4A 2VD0A 4CHSA 5ECLB 1Z7RA 3TKPA 6GSTA 3M3MA 1WE0A 4KNDA 3BD2A 3GHAA 4I97A 2I4AA 3WGXA 3TJJA 6GSXA 2QKEA 3GKKA 1T4ZA 1SD9A 4LL1B 2O87A 3G9BA 3ERWA 4POLA 3CSIA 4EUYA 2GGTA 2MMNA 1V40A 2PWJA 5B8AA 1GP1A 1X0RA 4IBPA 3SWLA 2VCXA 1VF1A 2LJRA 2I1UA 4L0UA 5DALA 1FG4A 3KH7A 17GSA 1AAZA 3KM6A 4GRFA 2I81A 2IL3A 4CW9A 5IIZA 3KMNA 1USBA 4XS4B 2H72A 2HRNA 3D21A 5B6MA 5AISA 4ZILA 2ALBA 5GAPD 2VM1A 5CREA 4PXOA 2GLRA 1NM3A 1ERWA 3L9SA 4WR5A 5B6NA 1TP9A 3QFAC 1PA3A 2DIYA 4FYCA 5HR0A 3GTUB 3IA1A 5GSTA 2E7PA 1ZGNA 5FHIA 2HNLA 4JU5A 5G2ZA 1AQWA 2YWIA 5HR2A 5IOWA 3DIEA 1EOHA 4OD7A 5CRGA 4V1Ag 6GSVA 1ERTA 4PNFA 2WZ9A 1JHBA 4TRXA 2H6XA 2H0GA 2WDUA 2ZUPA 4BPYA 1WPIA 1Z7PA 3J7Yk 1XW9A 4ZXGA 1SL2B 3GYKA 2MMAA 3VWXA 3Q6OA 1SU9A 1SKSB 5H5SA 5KN2A 1HYUA 1YJ6A 4AJ6A 2JL4A 3M1GA 3ZITA 4TXOB 2HRFA 3IHQA 5ID2A 5J3RA 5D8IA 5DCGA 3US3A 2TRXA 3IK9A 1ML6A 4EO3A 1FHEA 4BVXA 3CBUA 5JWQB 2AJQB 4E8HA 2AB6A 1ZYEA 3FR9A 1B9YC 1GTAA 4IKHA 2H6YA 1A0RP 3GX8A 5AN1A 4ECJA 1E6BA 5JCUA 1PKWA 3CTGA 1XWBA 3J7Yb 5ELAA 2GZYA 2OKAA 3KMOA 4F0BA 3HCZA 3GUSA 2JZSA 3C1RA 3GH9A 1OVNA 3VWVA 1QQ2A 1FVKA 3FRCA 4HJMA 3CTFA 4F82A 3UVTA 2V41A 4G19A 3UARA 2CVKA 2M80A 3TRPA 3D4MA 3EURA 3KGKA 2VD1A 2VLVA 2A4VA 4LA1A 3IOSA 4CDOA 3EINA 2F3MA 2BJXA 3MDKA 1A23A 1A2MA 1WP0A 2JADA 3VPTA 2OE0A 2N5BA 5DJMA 1R5PA 4EE0A 1S3CA 2RUFA 3D5JA 2IMFA 1SK0A 4V1Ap 3HVXA 3HVVA 3C8EA 3DVWA 3IPZA 2HZEA 1GLQA 1VGLA 5DALB 1H4OA 1ZMAA 5KN1A 5ABRA 3ISOA 1ILOA 4OCEA 3W6GA 1XXUA 5D9XA 2RIIA 3TJBA 3ZVJD 3VWWA 1ZCPA 3P90A 3VI7A 3BOAA 4NHZA 3C1SA 3H4KA 1XZOA 3EYTA 5F06A 3N9JA 2LTKA 3HVSA 3D22A 5CYYA 4ZL7A 1SK1A 3Q19A 4MF5A 1K0CA 3P2AA 5CRHA 2GT5A 5ECPB 2C0GA 3IBHA 4YQVA 3CXGA 1FAAA 4GF0A 3TJGA 2GQMA 1X9SB 5IMDA 2H19A 1K3YA 4G2EA 1T3BA 2YCDA 4V2LA 1BQ7A 1F37A 4Q5RA 5ECRB 3O76A 1OC9B 4KH7A 2DSAA 3GKMA 4N30A 3LXTA 2H1GA 3EWLA 5HFKA 4N11A 2VCZA 2C3TA 3GSSA 3UBKA 2H76A 4K2DA 2H6ZA 2I3YA 2O89A 2K18A 1GSEA 4BVYA 1OKTA 2X8HA 1GTIA 5GSSA 5INYA 1DE1A 2OBIA 4ZB9A 5G30A 4X1UA 1B9XC 4GCIA 4I6XA 4ML1A 11GSA 3GFKA 1GRXA 2GSTA 4WBJA 1GNEA 3UBLA 4NMUA 2J9HA 5EL8A 3H79A 4L0WA 2XBIA 5JWRB 5EY6A 3LORA 3HJMA 4XS1A 4OMVA 5IO0A 3PH9A 2HYXA 2H8LA 3LEFA 1YEXA 3GURA 2C3NA 4KX4A 4RI7A 2O8VB 3KP9A 3RPPA 1O7UA 2HSHA 3ZRDA 1JZDA 3FYGA 1DBYA 3TJFA 5KEJA 2ON7A 5F07A 4IS0A 1XWKA 3QCPA 1GH2A 2B5YA 3GSTA 1JFUA 1V57A 3ZFBA 4AJ7A 3F4TA 2F8AA 1JLWA 2EIRA 2L59A 5L71A 4POBA 1Z9HA 1EEJA 1CQGA 1RK4A 3BCKA 1K0BA 1F9MA 1G6WA 1YY7A 4RQXA 1M9AA 1PGTA 4ZL8A 4ID0A 5D73A 2XPEA 3L78A 4MF7A 5CP1A 2HFDA 2B5XA 2WCIA 3L9UA 3NZNA 1GSYA 4FO5A 2H74A 2F51A 4E8EA 3QAWA 5J41A 2GSSA 1ON4A 3APSA 5G1KA 4MJAA 5IMZA 4O32A 3F3RA 4P3YB 1XVQA 4H86A 2C3QA 1XFLA 4ECBA 1KTEA 5JWOB 2GT6A 2DJ1A 2TRCP 4IGJA 4X0XA 2VL2C 5H5QA 6GSYA 4RUVA 3TUEA 3VPQA 3C71A 2R37A 2DIZA 2QSIA 3UVHA 3QPMA 1HD2A 2GZPA 3GIXA 4EC0A 2MBSA 1WOUA 3GN3A 4POKA 4LL4B 1YQ1A 4BA7A 2FD3A 4WBRD 3QMXA 3A2WA 2V6OA 4HZ4A 4GSSA 3TJKA 2XPDA 1R4WA 4NPBA 4YAPA 5DBQA 3GV1A 3Q74A 4JR6A 2NVLA 2BTOT 13GSA 4DSSB 2R2JA 2YJ7A 2LV3A 1EV9A 3VI5A 4K7IA 1GLPA 2CVBA 3ERGA 3PINA 2DJJA 3UMAA 2LUSA 3ERFA 3TKSC 2YN1A 4ZIJA 2PBJA 1X5DA 5FT3A 2FWEA 1X5EA 4TR1A 4EXJA 3C73A 3F6DA 2HE3A 4GQFA 1ZL9A 3A2XA 2L4QA 4PUFC 2ES7A 1M9BA 4G10A 3KP8A 2C4JA 1GUKA 3IRAA 5IM9A 5HR1A 3CMIA 1THOA 4KDUA 2I9HA 1G6YA 2KLXA 5CRWA 3IC4A 5IMAA 2HLSA 4HZ2A 4IQ1A 4XCSA 2FWGA 4EVMA 1GSSA 2KOKA 2YWMA 19GSA 2GS3A 2DLXA 2EC4A 1YKAA 2HXKA 2VLTA 2P5QA 4ZBAA 1W89A 1BX9A 14GSA 1NHYA 1JZWA 1F6MC 1AQVA 3FK8A 4Z7XA 4ZL9A 5DAKB 1I5GA 3H1NA 2AYTA 2X8GA 1PMTA 4NXIA 2E2MA 2WS2A 1S3AA 1CQHA 2B7KA 2AUVA 1PX6A 2FY6A 2E0QA 3I43A 3TDGA 4PNGA 2WFCA 3E9JB 1K3OA 3GKNA 3MNGA 5JCWA 4GQCA 2GTUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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