5E74A

Crystal structure of baz2b bromodomain in complex with acetylindole compound uzh50
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title The "Gatekeeper" Residue Influences the Mode of Binding of Acetyl Indoles to Bromodomains.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5e74A00
4CUTA 5IGMA 4BW1A 5BT4A 5I83A 4IOOA 4LZ2A 5I7YA 5D3SA 5DYXA 5EWVA 3QZTA 4LYIA 5A81A 5CQ5A 4IR3A 4QSUA 4NRAA 4IR4A 5LJ2A 5LVQA 5DYUA 4HXMA 3O33A 3UVYA 4YYMA 4O70A 5EGUA 5F2PA 5F60A 3AQAA 5D3RA 2RS9B 4YYKA 4QC1A 4HBVA 5CU8A 2DVQA 5ACYA 4O7AA 5F61A 5L8UA 5EWWA 5F1LA 4CUPA 4Z6HA 5IGLA 5AMEA 4NS5A 4NUCA 2DVSA 4NYWA 3P1EA 5FG4A 3GG3A 5CUCA 5G4RA 4HXKA 5EP7A 4BHWA 2OO1A 5FFWA 5EISA 2DVRA 4QC3A 5HJCA 5LKTA 4NYXA 3Q2EA 4QYLA 4AKNA 5KU3A 3P1DA 3MQMA 4NRCA 4YBMA 4XUBA 5ENIA 3NXBA 5EQ1A 4ZC9A 3U5NA 2MJVB 4Z1SA 4QEVA 4PY6A 4GPJA 5CUDA 4A9EA 4O7FA 1WUMA 4YYIA 4QSPA 5F63A 5CQ8A 4NUEA 5LKUA 4MR5A 5CS8A 4TZ8A 3LQJA 4A9KA 4NYVA 5HRWA 5HM0A 2R0SA 5FE8A 3ZYUA 5HEMA 4CURA 4O76A 4UYFA 3UV2A 3U5KA 4Z93A 5CUEA 4ZW1A 5CY9A 4CUUA 5I80A 5EWCA 3DAIA 4QUUA 4O77A 4LYWA 4NQNA 5ENEA 1EQFA 3MULA 3FKMX 4TT6A 2OUOA 5TCMA 5AMFA 3MXFA 5KHMA 4O74A 5KTWA 5DYCA 4QNSA 5A7CA 2YYNA 3QZVA 5E74A 5CQ4A 4KV4A 5CPEA 5E9KA 4TYLA 5DBMA 2G4AA 5IG6A 5TB6A 2R0VA 3U5JA 5IGKA 4MEPA 5KTUA 5HQ7A 2E3KA 4NRBA 5I86A 4YH4A 4QEUA 4WIVA 4LC2A 5D3HA 3JVLA 4KCXA 5BT5A 5DYAA 4UIWA 4WHWA 4A9OA 4UYDA 5ENJA 5FH7A 4O71A 5CQ3A 4QR4A 4XYAA 4Q0NA 4CUQA 1WUGA 4XY9A 5HQ6A 5I29A 2L84A 5DFBA 3SVFA 5ENFA 4YYNA 4N4HA 5IIDA 4E96A 4IORA 5E3GA 1N72A 4QEWA 4MEQA 5HRVA 5DW1A 4NQMA 5EWHA 3G0JA 3LXJA 3S91A 4F3IA 4QY4A 2YDWA 5L97A 4YADA 4QSWA 5F5ZA 5EI4A 2R0YA 5C8GA 4UYFB 3JVKA 4XUAA 5A82A 5CTLA 5A83A 5F36A 4BW2A 4CFKA 4CUSA 5II2A 4CL9A 2LSPB 4A9JA 4NXJA 3P1CA 4NUDA 5E9IA 4TT4A 4HXSA 3LQIA 5CQAA 5HFRA 5ENBA 5DLXA 4TTEA 4HXRA 4O7BA 5FE1A 5I88A 4A9HA 5D3TA 3MUKA 4ZQLA 4UIZA 5D3LA 5CRMA 4QB3A 5H1VA 4QSVA 1JSPB 5CRZA 5LUUA 4A9FA 4QUTA 3UVWA 4Z6IA 2FSAA 4QZSA 4Z1QA 3ONIA 4TU4A 5HCLA 5CGPA 5D3NA 5HELA 2DKWA 5E9YA 5F62A 4MEOA 5FE7A 5EV9A 3UV4A 5AD2A 4UIXA 2RNYA 2N9GA 5CUAA 5D26A 5EWDA 5HLSA 2DVVA 5FDZA 4LRGA 3K2JA 3LQHA 4A9LA 3Q2FA 4HXOA 2RNWA 5ETBA 4OGIA 4N4FA 4UYEA 4YAXA 4LDFA 5D0CA 4YYJA 5LJ1A 2GRCA 4X2IA 5BT3A 5FG6A 3P1FA 2H60A 4QSXA 5E9LA 5L96A 3D7CA 4WHUA 5CZGA 4UITA 5D3JA 5DKHA 5C4QA 5EVAA 5F3AA 5KTXA 3TLPA 3MB3A 4IOQA 5H1UA 5E9VA 4LR6A 2YQDA 4N3WA 4BW3A 5DFDA 4PCEA 5I89A 2DWWA 4LYSA 2L5EA 3DWYA 4C66A 4PTBA 3IU6A 4CLBA 4BW4A 1ZS5A 4TQNA 5I7XA 2NXBA 3SVGA 4KV1A 1F68A 2E7NA 4PKLA 2YEKA 2YEMA 3UV5A 4IR5A 4XY8A 4YK0A 4N4IA 5FB1A 3SVHA 5A5PA 4YYHA 2WP1A 4NR4A 3U5MA 4MR4A 4NR7A 4MR3A 5EK9A 5JI8A 4YY4A 5L98A 4J0SA 5HRXA 5H1TA 4HXLA 5II1A 4OGJA 5HFQA 4YABA 5L99A 4BJXA 4A9NA 4HBYA 4O72A 5FH8A 4MR6A 5A5SA 5F1HA 5FE3A 3JVJA 5IGNA 4LZRA 3O35A 1X0JA 5K29A 2RNXA 3MB4A 2I7KA 5E73A 5LJ0A 4PS5A 5FE6A 5FH6A 2R10A 4YY6A 3IU5A 5D7XA 4Q0OA 4A9IA 5H85A 5FB0A 5J0DA 5EPRA 5JWMA 5FE5A 5FG5A 4TS8A 4HXPA 3U5PA 4QR5A 4IR6A 4YATA 3JVMA 5CQ7A 4N4GA 4UYHA 3RCWA 5C85A 5COIA 5F25A 5FE2A 4YYGA 5ETDA 5I1QA 5FE4A 5G4SA 4NR9A 4QSQA 3UVXA 4LZSA 5DW2A 3U5OA 4YBTA 5A5OA 3I3JA 5DKDA 4C67A 4O7CA 3HMFA 5EPBA 2WP2A 4HBXA 5LVRA 2RI7A 5DY7A 5HENA 4J1PA 5CUBA 4A9MA 3O34A 4ALGA 4J0RA 5A5RA 3G0LA 4O75A 5ENHA 2RFJA 5E0RA 2YELA 2OSSA 4O78A 4QYDA 5D24A 5FBXA 5A5QA 4TT2A 5EU1A 5EA1A 4CFLA 5AD3A 5L8TA 4FLPA 4PCIA 3S92A 5A85A 3AADA 5LKXA 5IBNA 4YH3A 2I8NA 5KO4A 5EICA 3HMHA 4OUFA 4ALHA 3U5LA 5ENGA 5CP5A 4UIYA 2D82A 5HQ5A 2RO1A 5FE0A 5CQTA 5DLZA 4RVRA 5CUGA 4TZ2A 2E7OA 2F6JA 3HMEA 2L85A 3O37A 3O36A 5D25A 5CQ6A 4NR6A 4HBWA 2KTBB 5LKZA 5C7NA 5CFWA 4HXNA 5ENCA 2F6NA 5E9MA 4QSTA 4UYGA 5I40A 1JM4B 4QBMA 5D3PA 4YBSA 5C87A 4QR3A 5DX4A 3QZSA 5E7DA 4NR5A 4UIUA 5FFVA 2D9EA 2DATA 4J3IA 2YW5A 4QSSA 4UIVA 5C89A 4MENA 4DONA 3UVDA 4NR8A 4O7EA 5FE9A 5EM3A 5A5NA 4YYDA 5DFCA 5DKCA 1E6IA 3LJWA 5E3DA 5FFYA 5EPSA 3P5OA 3UW9A 4Y03A 4TU6A 4QSRA 4YC9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CUTA 5IGMA 4BW1A 5BT4A 5I83A 4IOOA 4LZ2A 5I7YA 5D3SA 5DYXA 5EWVA 3QZTA 4LYIA 5A81A 5CQ5A 4IR3A 4QSUA 4NRAA 4IR4A 5LJ2A 5LVQA 5DYUA 4HXMA 3O33A 3UVYA 4YYMA 4O70A 5EGUA 5F2PA 5F60A 4AKIA 3D1DA 3AQAA 5D3RA 2RS9B 4YYKA 4QC1A 4HBVA 5CU8A 3VKGA 2DVQA 1PUOA 4AI6A 5ACYA 4O7AA 5F61A 5L8UA 5EWWA 5F1LA 4CUPA 4Z6HA 5IGLA 5AMEA 4NS5A 4NUCA 2DVSA 4NYWA 3P1EA 5FG4A 3GG3A 5CUCA 5G4RA 4HXKA 5EP7A 4BHWA 2OO1A 5FFWA 5EISA 2DVRA 4QC3A 5HJCA 5LKTA 4NYXA 3Q2EA 4QYLA 4AKNA 5KU3A 3P1DA 3MQMA 4NRCA 4YBMA 4XUBA 5ENIA 3NXBA 5EQ1A 4ZC9A 3U5NA 2MJVB 4Z1SA 4QEVA 4PY6A 4GPJA 5CUDA 4A9EA 4O7FA 1WUMA 4YYIA 4QSPA 5F63A 5CQ8A 4NUEA 5LKUA 4MR5A 5CS8A 4TZ8A 3LQJA 4A9KA 4NYVA 5HRWA 5HM0A 2R0SA 5FE8A 3ZYUA 5HEMA 4CURA 4O76A 4UYFA 3UV2A 3U5KA 4Z93A 5CUEA 4ZW1A 5CY9A 4CUUA 5I80A 5EWCA 3DAIA 4QUUA 4O77A 4LYWA 4AKHA 4NQNA 5ENEA 1EQFA 3MULA 3FKMX 4TT6A 2OUOA 5TCMA 5AMFA 3MXFA 5KHMA 4O74A 5KTWA 5DYCA 4QNSA 5A7CA 2YYNA 3QZVA 5E74A 5CQ4A 4KV4A 5CPEA 5E9KA 4TYLA 5DBMA 2G4AA 5IG6A 3ERRA 2R0VA 5TB6A 3U5JA 5IGKA 4MEPA 5KTUA 5HQ7A 2E3KA 4NRBA 5I86A 4YH4A 4QEUA 4WIVA 4LC2A 5D3HA 3JVLA 4KCXA 5BT5A 5DYAA 4UIWA 4WHWA 4A9OA 4UYDA 5ENJA 5FH7A 4O71A 5CQ3A 4QR4A 4XYAA 4Q0NA 4CUQA 1WUGA 4XY9A 5HQ6A 5I29A 2L84A 5DFBA 3SVFA 5ENFA 4YYNA 4N4HA 5IIDA 4E96A 4IORA 5E3GA 1N72A 4QEWA 4MEQA 5HRVA 5DW1A 4NQMA 5EWHA 3G0JA 3LXJA 3S91A 4F3IA 4QY4A 2YDWA 5L97A 4YADA 4QSWA 5F5ZA 5EI4A 2R0YA 5C8GA 4UYFB 3JVKA 4XUAA 5A82A 5CTLA 5A83A 5F36A 4BW2A 4CFKA 4CUSA 5II2A 4CL9A 2LSPB 2EJNA 4A9JA 4NXJA 3P1CA 4NUDA 5E9IA 4TT4A 4HXSA 3LQIA 5CQAA 5HFRA 5ENBA 5DLXA 4TTEA 4HXRA 4O7BA 5FE1A 5I88A 4A9HA 5D3TA 3MUKA 4ZQLA 4UIZA 5D3LA 5CRMA 4QB3A 5H1VA 4QSVA 1JSPB 5CRZA 5LUUA 4A9FA 4QUTA 3UVWA 4Z6IA 2FSAA 4QZSA 4Z1QA 3ONIA 4TU4A 5HCLA 5CGPA 5D3NA 5HELA 2DKWA 5E9YA 5F62A 4MEOA 5FE7A 5EV9A 3UV4A 5AD2A 4UIXA 2RNYA 2N9GA 5CUAA 5D26A 5EWDA 5HLSA 2DVVA 5FDZA 4LRGA 3K2JA 3LQHA 4A9LA 3Q2FA 4HXOA 2RNWA 5ETBA 4OGIA 4N4FA 4UYEA 4YAXA 4LDFA 5D0CA 4YYJA 5LJ1A 2GRCA 4X2IA 5BT3A 5FG6A 3P1FA 2H60A 4QSXA 5E9LA 5L96A 3D7CA 4WHUA 5CZGA 4UITA 5D3JA 5DKHA 5C4QA 5EVAA 5F3AA 5KTXA 3TLPA 3MB3A 4IOQA 5H1UA 5E9VA 4LR6A 2YQDA 4N3WA 4BW3A 5DFDA 4AKGA 4PCEA 5I89A 2DWWA 4LYSA 2L5EA 3DWYA 4C66A 4PTBA 3IU6A 4CLBA 4BW4A 1ZS5A 4TQNA 5I7XA 2NXBA 3SVGA 4KV1A 1F68A 2E7NA 4PKLA 2YEKA 2YEMA 3UV5A 4IR5A 4XY8A 4YK0A 4N4IA 5FB1A 3SVHA 5A5PA 4YYHA 2WP1A 4NR4A 3U5MA 4MR4A 4NR7A 4MR3A 5EK9A 5JI8A 4YY4A 5L98A 4J0SA 5HRXA 5H1TA 4HXLA 5II1A 4OGJA 5HFQA 1ZKRA 4YABA 5L99A 4BJXA 4A9NA 4HBYA 4O72A 5FH8A 4MR6A 5A5SA 5F1HA 5FE3A 3JVJA 5IGNA 4LZRA 3O35A 1X0JA 5K29A 2RNXA 3VKHA 3MB4A 2I7KA 5E73A 5LJ0A 4PS5A 5FE6A 5FH6A 2R10A 4YY6A 3IU5A 5D7XA 4Q0OA 4A9IA 5H85A 5FB0A 5J0DA 5EPRA 5JWMA 5FE5A 5FG5A 4TS8A 4HXPA 3U5PA 4QR5A 4IR6A 4YATA 3JVMA 5CQ7A 4N4GA 4UYHA 3RCWA 5C85A 5COIA 5F25A 5FE2A 4YYGA 5ETDA 5I1QA 5FE4A 5G4SA 4NR9A 4QSQA 3UVXA 4LZSA 5DW2A 3U5OA 4YBTA 5A5OA 3I3JA 5DKDA 4C67A 4O7CA 3HMFA 5EPBA 2WP2A 4HBXA 5LVRA 2RI7A 5DY7A 5HENA 4J1PA 5CUBA 4A9MA 3O34A 4ALGA 4J0RA 5A5RA 3G0LA 4O75A 5ENHA 2RFJA 5E0RA 2YELA 2OSSA 4O78A 4QYDA 5D24A 5FBXA 5A5QA 4TT2A 5EU1A 5EA1A 4CFLA 5AD3A 5L8TA 4FLPA 4PCIA 3S92A 5A85A 3AADA 5LKXA 5IBNA 4YH3A 2I8NA 5KO4A 5EICA 3HMHA 4OUFA 4ALHA 3U5LA 5ENGA 5CP5A 4UIYA 2D82A 5HQ5A 2RO1A 5FE0A 5CQTA 5DLZA 4RVRA 5CUGA 4TZ2A 2E7OA 2F6JA 3HMEA 2L85A 3O37A 3O36A 5D25A 5CQ6A 4NR6A 4HBWA 2KTBB 5LKZA 3D1BA 5C7NA 5CFWA 4HXNA 5ENCA 2F6NA 5E9MA 4QSTA 4UYGA 5I40A 1JM4B 4QBMA 5D3PA 4YBSA 5C87A 4QR3A 5DX4A 3QZSA 5E7DA 4NR5A 4UIUA 5FFVA 2D9EA 2DATA 4J3IA 2YW5A 4QSSA 4UIVA 5C89A 4MENA 4DONA 3UVDA 4NR8A 4O7EA 5FE9A 5EM3A 5A5NA 4YYDA 5DFCA 5DKCA 1E6IA 3LJWA 5E3DA 5FFYA 5EPSA 3P5OA 3UW9A 4Y03A 4TU6A 4QSRA 4YC9A
chains in the Genus database with same CATH topology
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