5E74A

Crystal structure of baz2b bromodomain in complex with acetylindole compound uzh50
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title The "Gatekeeper" Residue Influences the Mode of Binding of Acetyl Indoles to Bromodomains.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 41
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5e74A00
3UV2A 5A5PA 4HXKA 5ENEA 4CUQA 4YYDA 4LRGA 5JI8A 5F61A 4YY4A 4Y03A 5CQTA 5A5QA 5AD3A 5DX4A 3DWYA 4MEQA 5L99A 4OUFA 4UIYA 5II1A 4KV4A 4QYLA 4KV1A 5HFRA 4PTBA 4A9NA 5ETBA 5D3NA 3QZSA 2DWWA 5KO4A 4PCIA 4YH3A 4QR4A 4E96A 4IOOA 5DY7A 4N4HA 3LXJA 5D3LA 4Z93A 5I80A 4QSTA 4O72A 5C4QA 5AD2A 5I89A 5E3DA 2YEMA 4NXJA 4TT6A 3G0JA 4MR3A 5A5RA 5E7DA 2WP2A 4YADA 4CUSA 4UIUA 3ONIA 2DVRA 5L8TA 3AADA 5BT5A 5HCLA 4CURA 2L84A 5KHMA 4TT4A 4YBSA 4QC3A 2RFJA 4O75A 5D3PA 5F2PA 5TCMA 3UVWA 4UIVA 3U5PA 2DVVA 5CQ7A 4O7FA 3NXBA 5F62A 2F6JA 4LYSA 4QEUA 5EICA 5ENCA 5I7YA 5EK9A 5DFCA 5CRZA 5LKTA 2YEKA 3LQIA 5HQ5A 4ALHA 2F6NA 2E7OA 5DBMA 5E9MA 4QUTA 2GRCA 5FE3A 2R10A 3G0LA 5H85A 4UYGA 4HXSA 5CZGA 3DAIA 3O33A 5G4RA 4YATA 3UVYA 5D24A 4QSXA 5CU8A 4UITA 4A9IA 5IGMA 1EQFA 5A82A 5EV9A 5F5ZA 4HXOA 5C7NA 4HBWA 5FG5A 5D26A 5I29A 4Q0OA 2R0VA 2G4AA 5H1TA 4NR9A 4ALGA 5FE7A 4NR8A 3ZYUA 2L85A 4IR4A 4TS8A 4PY6A 4NQMA 5HENA 5FE4A 5HFQA 4NUEA 5FE2A 4BW4A 5DW1A 3MULA 4BHWA 4YYMA 4OGIA 4IR6A 5DYUA 5G4SA 3P5OA 4LDFA 5K29A 5L98A 4CFLA 1JSPB 4XUBA 4UIZA 4O77A 4IOQA 4LC2A 3SVFA 5ENIA 3GG3A 4YYGA 5FE8A 4XYAA 4NRBA 5E73A 5DYCA 3UVXA 4CUPA 4Z6IA 3MB3A 3U5LA 5EP7A 4NUCA 3UV4A 4YYHA 5FFVA 3O36A 4HXRA 5LJ0A 5A85A 5BT4A 4O7AA 5CQAA 2LSPB 4QUUA 5IBNA 5CY9A 5D7XA 4QEVA 4IR5A 5CFWA 2L5EA 2DATA 5I7XA 4QSQA 2R0SA 4QR3A 3P1DA 4O7CA 4NR6A 4YYKA 5C8GA 5D3SA 4QSPA 5AMEA 5EPBA 5CQ3A 5FH7A 4Q0NA 4MENA 5CUBA 4O78A 5E9LA 4HBVA 2RO1A 5FE6A 5E3GA 4QSRA 4O7BA 2DKWA 5EISA 5L96A 3QZTA 4QSSA 4Z1QA 5FE1A 4NR4A 2YQDA 3JVMA 5F25A 5FG4A 5E9VA 4NYXA 4QZSA 4UYFA 5I83A 5FFWA 3U5NA 4UIWA 5C85A 1E6IA 3P1CA 5H1VA 2OUOA 3HMEA 3SVHA 5C89A 5HELA 5KU3A 3P1EA 4O71A 2RI7A 5D3HA 4Z1SA 5FG6A 2D9EA 5BT3A 1WUMA 5CTLA 5IIDA 4ZC9A 5DKCA 3LJWA 3MQMA 5HJCA 3U5JA 4MR6A 4XY8A 2FSAA 3MXFA 3LQHA 5F36A 5I86A 4WHUA 4Z6HA 4RVRA 4YC9A 4N4IA 3QZVA 3U5OA 5J0DA 4TYLA 5A81A 2YYNA 4N3WA 5DFDA 3IU5A 5ETDA 5EQ1A 5HM0A 5HLSA 4YH4A 3D7CA 5I88A 4QNSA 4J0SA 4YK0A 4NYVA 4A9FA 4LR6A 5EGUA 3UV5A 1X0JA 2YELA 3MUKA 4MEPA 5IG6A 5CQ5A 4TTEA 5EWWA 4NS5A 4LYWA 4YYNA 4YY6A 4HXLA 4O70A 4DONA 5HRWA 3U5MA 2OSSA 3JVKA 4GPJA 5ENFA 4NYWA 5FE9A 3Q2FA 5A5SA 5EI4A 2E7NA 4TZ8A 5EU1A 2KTBB 3UVDA 4A9KA 5EPSA 2OO1A 5JWMA 4NQNA 4TQNA 5A5OA 4C66A 2RS9B 3MB4A 4QY4A 5H1UA 3RCWA 3HMFA 4ZW1A 4MR5A 5LJ2A 4QBMA 4CLBA 2WP1A 5DKHA 5CPEA 5DLZA 5EWHA 5EWVA 1ZS5A 2RNYA 5IGNA 2DVSA 4YAXA 5C87A 4NUDA 4CFKA 5HQ6A 1F68A 4O7EA 5CUEA 3I3JA 5II2A 5EVAA 5FBXA 4J0RA 5F3AA 4XY9A 5A83A 1WUGA 4CUUA 3UW9A 3AQAA 4OGJA 5EWCA 5AMFA 3U5KA 5EWDA 2I7KA 3IU6A 2RNXA 5FB0A 4NR7A 5D3TA 4QC1A 4QB3A 4UYHA 2DVQA 5D3RA 5E9KA 5FH6A 5KTUA 4ZQLA 4PKLA 5FFYA 5D0CA 4XUAA 4PS5A 4AKNA 4BW2A 5CUDA 5I1QA 5LVQA 4A9OA 4YABA 4MEOA 3Q2EA 4HXMA 3S92A 5E74A 4A9HA 2YDWA 5LKZA 5A5NA 4N4GA 4YYIA 4UIXA 5CGPA 5D3JA 5F60A 4QYDA 5KTWA 5CS8A 5LJ1A 5KTXA 3FKMX 5LKXA 2I8NA 4UYEA 4A9LA 2E3KA 5HRXA 4HXPA 4BW3A 2MJVB 5ENBA 4KCXA 2D82A 2R0YA 5F1LA 5CQ8A 4TT2A 3TLPA 2RNWA 4PCEA 2NXBA 4NRAA 5HEMA 5E0RA 4TU4A 5HRVA 4WIVA 4BW1A 5LUUA 4TU6A 5DKDA 4A9JA 5CRMA 3O35A 4CL9A 5ACYA 4QSVA 5CQ6A 5F63A 4YBMA 4HBYA 4F3IA 5LVRA 5ENJA 4LYIA 5IGLA 5DW2A 4IR3A 4BJXA 5FDZA 5TB6A 4QSUA 4A9MA 3O34A 4NR5A 3SVGA 4QR5A 4C67A 5ENHA 5IGKA 4LZRA 5HQ7A 3O37A 5LKUA 1JM4B 4YBTA 4MR4A 4J1PA 4J3IA 5FB1A 2N9GA 5I40A 3K2JA 2H60A 5DFBA 5ENGA 5CP5A 5A7CA 4NRCA 5CUAA 5FH8A 5FE0A 5E9YA 4WHWA 4FLPA 5EM3A 3JVJA 4O74A 5EPRA 4QSWA 5DLXA 5COIA 5FE5A 4LZSA 5CQ4A 4O76A 4A9EA 4N4FA 4QEWA 5CUGA 5EA1A 4TZ2A 5DYAA 5L8UA 4X2IA 4HXNA 3S91A 4CUTA 2YW5A 5L97A 4UYFB 5CUCA 3LQJA 5DYXA 5D25A 4YYJA 4LZ2A 3HMHA 5F1HA 4IORA 1N72A 3JVLA 4HBXA 5E9IA 3P1FA 4UYDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UV2A 5A5PA 4HXKA 5ENEA 4CUQA 4YYDA 4LRGA 5JI8A 5F61A 4YY4A 4Y03A 5CQTA 5A5QA 5AD3A 5DX4A 3DWYA 4MEQA 5L99A 4OUFA 4UIYA 5II1A 4KV4A 3D1DA 4QYLA 4KV1A 5HFRA 4PTBA 4A9NA 5ETBA 5D3NA 3QZSA 2DWWA 5KO4A 4PCIA 4YH3A 4QR4A 4E96A 4IOOA 5DY7A 1PUOA 4N4HA 3LXJA 5D3LA 4Z93A 5I80A 4QSTA 4O72A 5C4QA 5AD2A 5I89A 5E3DA 2YEMA 4NXJA 4TT6A 3G0JA 4MR3A 5A5RA 5E7DA 2WP2A 4YADA 4CUSA 4UIUA 3ONIA 2DVRA 5L8TA 3AADA 5BT5A 5HCLA 4CURA 2L84A 5KHMA 4TT4A 4YBSA 4QC3A 2RFJA 4O75A 5D3PA 5F2PA 5TCMA 3UVWA 4UIVA 3U5PA 2DVVA 5CQ7A 4O7FA 3NXBA 5F62A 2F6JA 4LYSA 4QEUA 5EICA 5ENCA 5I7YA 4AI6A 5EK9A 5DFCA 5CRZA 5LKTA 2YEKA 3LQIA 5HQ5A 4ALHA 2F6NA 2E7OA 5DBMA 5E9MA 4QUTA 2GRCA 5FE3A 2R10A 3G0LA 5H85A 4UYGA 4HXSA 5CZGA 3DAIA 3O33A 5G4RA 4YATA 3UVYA 5D24A 4QSXA 5CU8A 4UITA 4A9IA 5IGMA 1EQFA 5A82A 5EV9A 5F5ZA 4HXOA 5C7NA 4HBWA 5FG5A 5D26A 5I29A 4Q0OA 2R0VA 2G4AA 5H1TA 4NR9A 4ALGA 5FE7A 4NR8A 3ZYUA 2L85A 4IR4A 4TS8A 4PY6A 4NQMA 5HENA 5FE4A 5HFQA 4NUEA 5FE2A 4BW4A 5DW1A 3MULA 4BHWA 4YYMA 4OGIA 4IR6A 5DYUA 5G4SA 3P5OA 4LDFA 5K29A 5L98A 4CFLA 1JSPB 4XUBA 4UIZA 4O77A 4IOQA 4LC2A 3SVFA 5ENIA 3GG3A 4YYGA 5FE8A 4XYAA 4NRBA 5E73A 5DYCA 3UVXA 4CUPA 4Z6IA 3MB3A 3U5LA 5EP7A 4NUCA 3UV4A 4YYHA 5FFVA 4AKGA 3O36A 4HXRA 5LJ0A 5A85A 5BT4A 4O7AA 5CQAA 2LSPB 4QUUA 5IBNA 5CY9A 5D7XA 4QEVA 4IR5A 5CFWA 2L5EA 2DATA 5I7XA 4QSQA 2R0SA 4AKIA 4QR3A 3P1DA 1ZKRA 4O7CA 4NR6A 4YYKA 5C8GA 5D3SA 4QSPA 5AMEA 5EPBA 5CQ3A 5FH7A 4Q0NA 4MENA 5CUBA 4O78A 5E9LA 4HBVA 2RO1A 5FE6A 5E3GA 4QSRA 4O7BA 2DKWA 5EISA 3ERRA 5L96A 3QZTA 4QSSA 4Z1QA 5FE1A 2EJNA 4NR4A 2YQDA 3JVMA 5F25A 5FG4A 5E9VA 4NYXA 4QZSA 4UYFA 5I83A 5FFWA 3U5NA 4UIWA 5C85A 1E6IA 3P1CA 5H1VA 2OUOA 3HMEA 3SVHA 5C89A 5HELA 5KU3A 3P1EA 4O71A 2RI7A 5D3HA 4Z1SA 5FG6A 2D9EA 5BT3A 1WUMA 5CTLA 5IIDA 4ZC9A 5DKCA 3LJWA 3MQMA 5HJCA 3U5JA 4MR6A 4XY8A 2FSAA 3MXFA 3LQHA 5F36A 5I86A 4WHUA 4Z6HA 4RVRA 4YC9A 4N4IA 3QZVA 3U5OA 5J0DA 4TYLA 5A81A 2YYNA 4N3WA 5DFDA 3IU5A 5ETDA 5EQ1A 5HM0A 5HLSA 4YH4A 3D7CA 5I88A 4QNSA 4J0SA 3D1BA 4YK0A 4NYVA 4A9FA 4LR6A 5EGUA 3UV5A 1X0JA 2YELA 3MUKA 4MEPA 5IG6A 5CQ5A 4TTEA 5EWWA 4NS5A 4LYWA 4YYNA 4YY6A 4HXLA 4O70A 4DONA 5HRWA 3U5MA 2OSSA 3JVKA 4GPJA 5ENFA 4NYWA 5FE9A 3Q2FA 5A5SA 5EI4A 2E7NA 4TZ8A 5EU1A 2KTBB 3UVDA 4A9KA 5EPSA 2OO1A 5JWMA 4NQNA 4TQNA 5A5OA 4C66A 2RS9B 3MB4A 4QY4A 5H1UA 3RCWA 3HMFA 4ZW1A 4MR5A 5LJ2A 4QBMA 4CLBA 3VKGA 2WP1A 5DKHA 5CPEA 5DLZA 5EWHA 5EWVA 1ZS5A 2RNYA 5IGNA 2DVSA 4YAXA 5C87A 4NUDA 4CFKA 5HQ6A 1F68A 4O7EA 5CUEA 3I3JA 5II2A 5EVAA 5FBXA 4J0RA 5F3AA 4XY9A 5A83A 1WUGA 4CUUA 3UW9A 3AQAA 4OGJA 5EWCA 5AMFA 3U5KA 5EWDA 2I7KA 3IU6A 2RNXA 5FB0A 4NR7A 5D3TA 4QC1A 4QB3A 4UYHA 2DVQA 5D3RA 5E9KA 5FH6A 5KTUA 4ZQLA 4PKLA 5FFYA 3VKHA 5D0CA 4XUAA 4PS5A 4AKNA 4BW2A 5CUDA 5I1QA 5LVQA 4A9OA 4YABA 4MEOA 3Q2EA 4HXMA 3S92A 5E74A 4A9HA 2YDWA 5LKZA 5A5NA 4N4GA 4YYIA 4UIXA 4AKHA 5CGPA 5D3JA 5F60A 4QYDA 5KTWA 5CS8A 5LJ1A 5KTXA 3FKMX 5LKXA 2I8NA 4UYEA 4A9LA 2E3KA 5HRXA 4HXPA 4BW3A 2MJVB 5ENBA 4KCXA 2D82A 2R0YA 5F1LA 5CQ8A 4TT2A 3TLPA 2RNWA 4PCEA 2NXBA 4NRAA 5HEMA 5E0RA 4TU4A 5HRVA 4WIVA 4BW1A 5LUUA 4TU6A 5DKDA 4A9JA 5CRMA 3O35A 4CL9A 5ACYA 4QSVA 5CQ6A 5F63A 4YBMA 4HBYA 4F3IA 5LVRA 5ENJA 4LYIA 5IGLA 5DW2A 4IR3A 4BJXA 5FDZA 5TB6A 4QSUA 4A9MA 3O34A 4NR5A 3SVGA 4QR5A 4C67A 5ENHA 5IGKA 4LZRA 5HQ7A 3O37A 5LKUA 1JM4B 4YBTA 4MR4A 4J1PA 4J3IA 5FB1A 2N9GA 5I40A 3K2JA 2H60A 5DFBA 5ENGA 5CP5A 5A7CA 4NRCA 5CUAA 5FH8A 5FE0A 5E9YA 4WHWA 4FLPA 5EM3A 3JVJA 4O74A 5EPRA 4QSWA 5DLXA 5COIA 5FE5A 4LZSA 5CQ4A 4O76A 4A9EA 4N4FA 4QEWA 5CUGA 5EA1A 4TZ2A 5DYAA 5L8UA 4X2IA 4HXNA 3S91A 4CUTA 2YW5A 5L97A 4UYFB 5CUCA 3LQJA 5DYXA 5D25A 4YYJA 4LZ2A 3HMHA 5F1HA 4IORA 1N72A 3JVLA 4HBXA 5E9IA 3P1FA 4UYDA
chains in the Genus database with same CATH topology
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