5E8UA

Tgf-beta receptor type 1 kinase domain (t204d,i211v,y249f,s280t, y282f,s287n,a350c,l352f)
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
306
structure length
306
Chain Sequence
GHMTIARDIVLQESVGKGRFGEVWRGKWRGEEVAVKIFSSREERSWFREAEIFQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVTDFHEHGNLFDYLNRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCICDFGLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWEIARRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKIMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEGIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structures of apo and inhibitor-bound TGF beta R2 kinase domain: insights into TGF beta R isoform selectivity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords TGF-beta receptor type-1
total genus 106
structure length 306
sequence length 306
ec nomenclature ec 2.7.11.30: Receptor protein serine/threonine kinase.
pdb deposition date 2015-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5e8uA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5e8uA01
1KUTA 4HVGA 3DZQA 2HK5A 2GCDA 2Q83A 3EN5A 3K5VA 4IDVA 3M42A 2JFLA 2G2FA 4XG4A 4PMPA 5KHXA 4GT3A 3OW4A 3SGCA 2QG7A 3W1FA 3CBLA 5A3XA 3R7IA 2C69A 3ANRA 3EKKA 4JNWA 5AP0A 4GV1A 2CJMA 3W16A 3NYXA 4IX4A 4I4EA 2OJIA 3EN7A 5DH3A 2R3HA 2VN9A 3KF4A 1JLUE 4FK3A 3VHKA 4AUAA 5BUEA 4EH3A 4I0SA 5AV0A 4XH6A 2C3JA 4PL4A 2XP2A 3KRXA 3ZONA 4BCJA 3L9MA 1F0QA 3DNEA 4Z55A 3PA4A 4N4SA 5IH6A 1IASA 3IDPA 2WMTA 3E93A 2ACXA 2C1BA 5DT3A 4P90A 5KMMA 1PKDA 4K18A 2BAKA 5HGIA 4YC6A 1H00A 4KIKA 5HORA 3NSZA 3PSCA 2WQOA 1GZKA 3LJ1A 3Q4CA 5EOLA 5IZFA 1JVPP 1JSVA 2VWYA 2X8EA 1EH4A 4PTEA 3FC1X 1GZ8A 1UWJA 3LHJA 1PRYA 4G3CA 4AGCA 1MRVA 3MB7A 2J6MA 3V5TA 4D2WA 5FEQA 2C6TA 2HW6A 1XHAA 3KMUA 3EIDA 4I5HA 4IWQA 4O22A 4H3BA 4U45A 4CNHA 3S00A 2NPQA 4BI0A 5AR5A 3PA5A 2NP8A 1PW2A 2YM7A 2FUMA 4TWNA 4BTMA 2PE2A 5CT7A 4EBVA 5DGZA 3QYWA 2XH5A 3RI1A 4EORA 3E8NA 4ZLZA 5KKRC 4G16A 4DH5A 5FEDA 1G8AA 4KKGA 4LI5A 4EZ3A 2JDSA 1OECA 3RP9A 5AV4A 3PXZA 2W5BA 3FDNA 1J91A 3QALE 2H34A 2B4SB 4GEOA 5AR7A 3MESA 5IQCA 2C5OA 4YR8A 4FSMA 3NYOA 4G1WA 4FZ6A 4WNMA 3QWKA 1NW1A 4C33A 1YDSE 2YCFA 4QNYA 1H1WA 2ITXA 2QOLA 4C35A 5CAVA 1GZNA 4ARKA 2XIZA 3A8WA 4UMTA 5IEYA 2VTIA 3P7AA 5I3OA 4DA5A 3ORMA 2YACA 4IVAA 1CM8A 2Y4PA 3MFSA 5HLPA 3AT2A 4HZRA 1U4DA 4C36A 3DLSA 3Q9YA 3EH9A 5BX0A 5BMSA 3CTQA 1WAKA 3COHA 5FBOA 3GENA 3BQCA 2JDTA 2YM3A 4DFZE 5D11A 4AACA 5IQFA 4FTMA 4KS7A 3QD2B 3F88A 4IE9A 1JSUA 5CQWA 5ANJA 3U9CA 4HGEA 5KNJA 4BBMA 4U40A 3D2KA 4DFLA 3BHHA 5DNRA 3KMMA 3NNXA 2WPAA 4EZ7A 1Q8YA 2QU5A 3S0OA 3BLQA 4ENYA 2X81A 4L01A 4W4XA 4F4PA 2F7EE 1DI8A 5AM7A 3BKBA 5LMKC 2QKRA 3K2LA 2ZMDA 2R3LA 3KFAA 5JSMA 2E9VA 3U6JA 5IF1A 4RBLA 1UNHA 3FLQA 4QT1A 4P2KA 3V04A 4V0GA 3FI8A 2PSQA 1WBSA 3NUPA 4ZIMA 4FV3A 1NVRA 3BBWA 2CKOA 2JEDA 5KMKA 4ACCA 4O7RA 3DAJA 4FX3A 3NUSA 4IB1A 4CV9A 5JGAA 3TNIA 2C6DA 2EU9A 2XNPA 5LMBA 3BX5A 1M52A 1OIRA 2B9HA 5L2QA 3CIKA 4I4FA 3UNJA 3KB7A 5AP2A 1WFCA 2R0UA 2YISA 4RJ4A 4D2VA 1ZLTA 3QQHA 2PZIA 4WIHA 4F0IA 4YZCA 1ZY4A 4MQ2A 5DIAA 1GZOA 4FTRA 2G2HA 2FB8A 1Y6AA 1YWNA 2UZEA 4R1VA 1U46A 2W1FA 4Y95A 5CU3A 2EUFB 5AP7A 3GCSA 2ERKA 1P5EA 3F3WA 4F09A 3QQJA 3UDBA 3M1SA 5DN3A 3UMWA 3TKHA 3V3VA 4BDBA 4HYSA 3RPSA 4AQCA 5GZAA 1OBDA 4WO5A 2CCIA 3UO5A 3LMGA 3CP9A 3DGKA 1PYXA 1PXJA 3R7OA 2P33A 4E3CA 2B1PA 5C8KA 2BRGA 3M2WA 3TUBA 1OMWA 3IGGA 3S2PA 3TI1A 4U5JA 1H24A 2CKEA 2YZAA 4F7JA 3R21A 1GAGA 4J71A 5EYMA 3RBWA 1OKYA 4S2ZA 5M56A 4YZBA 4HVSA 3UOJA 2GMXA 3MPAA 4JOAA 5HX6A 4JQEA 4F1MA 1PXNA 5DG5A 3FEGA 3LFFA 4R3CA 4XRLA 5J79A 2W17A 2O2UA 3DTWA 4MBIA 1ZYSA 4APPA 5E8UA 3WZEA 2R3MA 2GQRA 3V01A 3ZRKA 3ZM9A 3S95A 2W05A 1UVRA 3DJ7A 4MXYA 4BKYA 5FTGA 3BHYA 4U9AA 2HZ4A 5HCXA 2VO3A 3FI3A 3WF7A 4KABA 3ELJA 2CKPA 4DT8A 2JIIA 1H0WA 3A62A 3QXPA 4PTCA 4HNIA 2DS1A 1DAYA 4FTQA 4L46A 4XS2A 3IW4A 2VZ6A 2PL0A 3PPKA 2JDRA 2XK3A 3KRWA 4V04A 3FQEA 5FD2A 1UNLA 4BDFA 3PDTA 5E9EA 2GNIA 4MH7A 2H9VA 4NSTA 3UO6A 5CT0A 2CSNA 4FIFA 3SLSA 2RFDA 4CGAA 4F08A 4TWCA 3ATSA 3P23A 2GNFA 5IUHA 3Q6UA 3MN3A 1FVVA 3PUPA 5K0KA 3WI6A 3O23A 1PMUA 3OVVA 1LEWA 5EYCA 4AG8A 4AF3A 4QMMA 3WBLA 5HIEA 3IW7A 2PWLA 4S30A 4E4MA 2OH0E 4IM3A 4TRLA 2ONLC 3BYMA 2C0OA 4W4YA 4F7SA 4DGGA 5TT7A 5BNJA 1KV2A 1W7HA 3FMDA 3QKMA 1RDQE 2PMOX 3EQDA 5KZIA 4BGQA 3K3JA 4CZYB 3ATTA 4O7LA 4RC4A 3EMGA 3PWYA 3VWAA 3T9IA 1IEPA 4YHTA 4I93A 4LGHA 5L2WA 2FH9A 1XH7A 4RVLA 3TNPC 3I4BA 3MIAA 2O0UA 1RW8A 2WQBA 4FSUA 4ZY6A 4L7SA 4RQVA 3NPCA 2QOOA 4U3ZA 2R3PA 2ZB1A 4QTDA 4YGAA 4PNKA 3UQFA 2OWBA 2XNBA 5IQDA 3DBFA 5DWRA 4G3GA 3U9NA 4YO6A 4A4LA 2FO0A 2FGIA 3QZHA 5CQUA 4JBPA 4I6FA 3RAIA 3SOCA 2OZAA 4YPDA 5IISA 2O5KA 4PTGA 4R7BA 3FZPA 3NZ0A 3MY0A 2BAJA 2IZUA 2XRWA 3TG1A 4J96A 1OVEA 4GJ3A 2HOGA 4B8LA 3IOKA 4M97A 5BVKA 4FNZA 4FT5A 4XOYA 5EM6A 5TKDA 1ZARA 3OG7A 3V5JA 4A9UA 3GNIB 4EJNA 2B55A 4EUUA 3UQCA 5HI2A 3LMIA 4I20A 4XG6A 4HPUE 5IH5A 2PY3A 5K3YA 4CRSA 4RQKA 5LMAA 5EFQA 4NJ3A 4JBQA 3R7EA 3ZZEA 4QNAA 3UIXA 3KXGA 5KMIA 3OWPA 3RNYA 3PRIA 3VF9A 4J52A 2G1TA 4BHNA 4CXAA 3A7JA 4YUQA 3GU6A 3HP2A 1TQPA 4YJSA 2J4ZA 1Q97A 3PY3A 3TT0A 4AGWA 5E92A 4IADA 3EHAA 3G90X 4FF8A 4FKQA 5C01A 5JEBA 3NIZA 1UU3A 3FZSA 2YAKA 2XUUA 3QRTA 5AX9A 4IAKA 5ETFA 2X0GA 5JZNA 3F66A 4PMMA 4PY1A 4DG2E 3F5XA 5J5TA 2QOIA 3LXKA 2RGPA 4H36A 5E1SA 3FMMA 4FSZA 1IAJA 4HVHA 5A4QA 3ULIA 2QHNA 1LPUA 1YXUA 2WMXA 5FP5A 4IB5A 3I7CA 3DZOA 3JUHA 3RJCA 4EKKA 5AAGA 3U6IA 4IZ7A 1JBPE 2XM9A 4L68A 4QRCA 4I5MA 4ZTMA 5ANDA 5HOAA 3IDCA 4FSWA 1WBOA 3DBQA 5LVMA 5CVHA 4MTAA 3QUPA 4QMPA 3O7LD 4WKQA 3R1NA 4AZFA 4ACMA 5A54A 3CKWA 4O0TA 2XBAA 3KVWA 4O83A 4DINA 5CALA 2BKZA 4LMUA 2R4BA 1OKZA 3FQHA 2C3LA 2P4IA 5HG7A 5M44A 1IA9A 3GCUA 4L6QA 3TNWA 5J9LA 4TPTA 4DGMA 4FEXA 5CASA 3F82A 3DAKA 1UV5A 2FYSA 3EL7A 3VNTA 1QPDA 3KRRA 1GIJA 2VX1A 3NNVA 2WQMA 4FKPA 3TL8A 2PULA 5D7VA 1KE5A 3MBLA 1PMNA 1PJKA 3AGLA 4RJ5A 2R3NA 1ZYCA 2ZJWA 3KY2A 4GSBA 5CLPA 3OY3A 3AXWA 3G51A 4ENXA 2UZUE 3V6SA 3LFCA 2C47A 5CSHA 1O9UA 4O0UA 2O3PA 4EH2A 2YWVA 3FV8A 4CCBA 5BVNA 4WOVA 4RLKA 4X21A 3ZBFA 4EC8A 2PMLX 4RFYA 2XK9A 4XX9A 5HBEA 2YCRA 4FOCA 4HVIA 2C5VA 2WU7A 3DK7A 4FICA 4QMVA 3HRBA 3P7BA 2XB7A 2YEXA 2YWPA 3CCNA 5K5NA 4E6DA 2I0EA 2OF2A 3PTGA 1PF8A 4PP9A 3FWQA 3DQXA 4ITHA 3D7ZA 3RM6A 4A07A 4C59A 2JLDA 3FUPA 3LW0A 3OTUA 3MVMA 4PDOA 2YERA 4GU6A 3VULA 4BBEA 3FMEA 3R6XA 3UG1A 3TZ7A 3FHIA 2WXVA 2VO7A 3HDMA 2XKFA 3EQPA 4NCTC 2QG5A 5JRSA 3KU2A 4YLJA 3HUCA 1ZOEA 4RJ6A 5GHVA 3W2OA 2X8DA 4JT3A 3R9DA 4ZTLA 2VTRA 3FKLA 4FKGA 2WTWA 3OF0A 4R5YA 1YHWA 2JAVA 5BVEA 2R2PA 5AAEA 5I9ZA 4ZZMA 4NTSA 4ALVA 4GVJA 4GFGA 3T8OA 4AZVA 5JQ5A 4XNEA 1A9UA 3NUAA 3FMLA 3PSBA 4AU8A 3KULB 4KIPA 4ZZNA 3AT3A 3BBTB 3ID6C 5AADA 3KEXA 3OTVA 2ZM4A 3C5UA 2W1CA 3MH3A 3Q4UA 3R1QA 4UY9A 3NRMA 4W9WA 1KE7A 5BVWA 3LJ2A 3CJFA 4F1OA 3LKMA 3F3ZA 4G9RA 3OP5A 5IQAA 4MXXA 3MI9A 5K4JA 2C6IA 1ND4A 5CF5A 5CF8A 4YZMA 4RFZA 1WVXA 4ZZOA 3RPYA 3OW3A 4EK3A 3HMNA 3RMFA 1T46A 2YZLA 5HU9A 4RC3A 5IEXA 3D83A 4FZFB 3C4ZA 5M07A 3WF9A 5AP5A 1Y8YA 2NRUA 3AD6A 3PIYA 5F95A 2YDIA 4D2PA 3HYHA 5DR2A 1XBBA 4PPCA 1R1WA 2VNYA 4LMNA 4NM0A 1SVGA 2HXQA 4R1YA 5C03A 5L8LA 4E73A 3LPBA 5LVOA 4ZSAA 2J0KA 3DCVA 5JKGA 1XJDA 4M3QA 4CFXA 4E6AA 3WF5A 4G34A 3EKNA 2ZM1A 3LLTA 2FSTX 4M13A 4O0VA 3VUKA 5JFWA 2QOBA 5AR2A 2WOTA 5HKMA 3R2YA 3DFCB 4Z3VA 4JDHA 3FHRA 4AA0A 4AGUA 3VS2A 4CFFA 4EOOA 4FV8A 4DH1A 4F6WA 4UXQA 2J0LA 2HELA 4YHJA 4QMZA 1ZY5A 4I5CA 1GNGA 2GHMA 2OXXA 1X8BA 3TUDA 4WNPA 4UMRA 1FBNA 4O0XA 4ZJIA 3UIBA 4B7TA 3FBVA 4NFMA 4Y72A 4Y5HA 3LCDA 4TNDA 4FTCA 1VYWA 3PVGA 4UN0C 2WHBA 2VGPA 3QUEA 1LUFA 4AWIA 4Z7HA 4O7TA 2FSMX 3CKXA 3CTHA 3JY9A 3RK9A 4CKIA 4KKEA 3QTZA 3LCSA 2GS7A 5CU2A 4DAWA 5JFXA 3O96A 3W55A 5IA5A 1XBAA 4DYMA 3BEAA 2ZV9A 3UP7A 2A27A 4WHZA 5G1XA 4C4FA 4L44A 3ORIA 4XLVA 4MD7E 1U59A 5EK7A 5AV3A 2ZB0A 4C4JA 3GC8A 4EHGA 5JT2A 5IPJA 3WIKA 3DK6A 1VJYA 1Y6BA 4IC7A 4YC8A 5EDPA 3RCDA 4D2RA 5JGBA 5AP4A 4QTCA 4ZTHA 4I92A 3GCVA 4JS8A 4LUEA 4S34A 4UYAA 3UMXA 4LYNA 3MTFA 2UUEA 2QVSE 1XQZA 3MVJA 2IVSA 3PVUA 4F9CA 1YVJA 1PXOA 1JNKA 3QQLA 2PUUA 2KTYA 4TYHA 3SV0A 4C58A 4BIBA 3QTWA 2YITA 4WUAA 1NVSA 4TNBA 4AOJA 4J8MA 2J5FA 5G6VA 2IN6A 5M4CA 2ZOQA 2JKMA 2X7FA 2IW9A 3POOA 4IJ9A 2VWZA 3OC1A 3HV4A 4YZNA 3MW1A 1IAHA 2G9XA 5L6PA 3BPRA 1ZMVA 2WEIA 4A4XA 5CF6A 4ZMFA 4YJRA 2EXEA 4BVUA 4NTTA 3RM7A 2VAGA 4Q5EA 4FV4A 4E5BA 1J1BA 3ORPA 5GZ8A 2C5YA 4JRVA 4GUEA 4QP4A 3VQHA 4ZLYA 1FOTA 2PVLA 3DAEA 4RGJA 5FTOA 4BIEA 2EXCX 3UQGA 5EYDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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