5EB8A

Crystal structure of aromatic mutant (f4w) of an alkali thermostable gh10 xylanase from bacillus sp. ng-27
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
354
structure length
354
Chain Sequence
VQPWAWQVASLADRYEESFDIGAAVEPHQLNGRQGKVLKHHYNSIVAENAMKPISLQPEEGVFTWDGADAIVEFARKNNMNLRFHTLVWHNQVPDWFFLDEEGNPMVEETNEAKRQANKELLLERLETHIKTVVERYKDDVTAWDVVNEVVDDGTPNERGLRESVWYQITGDEYIRVAFETARKYAGEDAKLFINDYNTEVTPKRDHLYNLVQDLLADGVPIDGVGHQAHIQIDWPTIDEIRTSMEMFAGLGLDNQVTELDVSLYGWPPRPAFPTYDAIPQERFQAQADRYNQLFELYEELDADLSSVTFWGIADNHTWLDDRAREYNDGVGKDAPFVFDPNYRVKPAFWRIID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of aromatic mutant (F4W) of an alkali thermostable GH10 xylanase from Bacillus sp. NG-27
rcsb
molecule keywords Beta-xylanase
molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus sp. ng-27
total genus 140
structure length 354
sequence length 354
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2015-10-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 5eb8A00
2XFYA 2VJXA 4J28A 1J9YA 1LG2A 3K8LA 4A3HA 4PRWA 3WENA 1UD3A 1SYTA 3WDIA 3KL0A 3ZJ7A 3L4UA 1G9HA 1VBRA 4E8CA 2YBUA 1FP9A 3EDKA 3ZMRA 2WC4A 3AS1A 3ZIZA 4AD4A 3WMSA 1JAKA 4CN4A 1W1VA 3CIVA 2V5CA 2VCCA 1WPCA 1UR9A 3NSNA 2J7EA 2VTFA 2RGLA 1NH6A 3TTOA 3AS3A 2G4FA 4PSRA 2DDXA 2FHCA 4UQBA 3AMDA 2J8FA 1Q6CA 3GXDA 4M24A 3S6TA 1SMAA 1UD4A 4PCTA 4UFLA 1D2KA 3B9DA 5BXTA 3PZVA 4NSBA 4CVUA 2OSWA 5ABHA 1V0KA 2J8GA 3NCOA 1E72M 2V3FA 1UZ1A 1VJSA 2WB5A 1D3CA 4ZENA 2XPKA 5BXPA 2XYLA 4OZOA 1UR0A 3UR7A 1B3XA 2BVTA 3L4ZA 3AZRA 1TCMA 5HXMA 4TTGA 4AEEA 4AZ7A 4AZGA 2J74A 5DT5A 3VGHA 1GVIA 4D6HA 2WVTA 4CVWA 1QI2A 3KEHA 1Q6DA 2WLZA 2VVNA 5I5RA 1KWGA 3SCOA 2BVDA 5C71A 2VOTA 3W28A 3WNKA 1OGGA 2GFTA 1HN1A 2YIHA 4MAZA 1UUQA 5CLTA 4PMOA 4DM1A 1PX8A 7A3HA 4D6DA 1HT6A 2VX7A 1WE5A 1E0WA 4UFHA 3BGAA 1M03A 4QDMA 5ABGA 5JBEA 4M56A 1DEDA 3GXFA 2UY5A 1JNEA 4OOZA 1UD2A 1PIFA 1DWAM 2XFRA 5A2CA 4ATWA 2ZWYA 1GHRA 3SUVA 2VI0A 1E6XM 1MW3A 1C8XA 1ZL1A 1J0JA 1WB0A 5IXEA 4D6FA 4OBRA 1EO7A 4H04A 2W4XA 4UCFA 3BAKA 1CXKA 3WF1A 1HJVA 1NOWA 4KGJA 2BHZA 3WN6A 1M04A 1CEOA 1V3IA 4U2YA 2OSXA 2D2OA 1H49A 1CGUA 1SMDA 3WD2A 4J3UA 5HPCA 2X8RA 5E09A 1BYAA 2XIBA 1WNOA 4PTXA 4U5KA 2W63A 1UKTA 3S2CA 2WMIB 4MB1A 1XRVA 1OM0A 3HN3A 4AD1A 1HKJA 2WAGA 4EE9A 1H5VA 1JNDA 1E6ZA 1UWSA 1V0LA 3SCRA 4C7DA 2VVSA 4LGXA 3VM7A 2W67A 1V3JA 2VCAA 1V6WA 3VD9A 4OUEA 3WDQA 1CGWA 4DM2A 1KQZA 1MWOA 2D0GA 3CGTA 5E6ZA 2XHYA 4GIAA 2GJXB 2A3AA 4P7QA 3OGVA 4P8XA 4L4PA 4ACYA 1VB9A 2ZUUA 1V03A 1BHGA 1TE1A 1GJUA 4ATDA 1E6SM 2QPSA 4HOWA 2YLLA 2O92A 2BXZA 1VFOA 2CBVA 5A8MA 4BQ3A 4JCMA 2ZX5A 2D0HA 3SIMA 2YBTA 3RPMA 5FL1A 1W9VA 2C0HA 2ZXBA 1GZJA 2DSVA 3BMWA 1HJQA 2V3EA 4GO8A 2ZX8A 1M53A 4TX8A 3ARQA 4Y7EA 3RM8A 3L4TA 1VF8A 4CU7A 3GM8A 1UG6A 1OD0A 4UZSA 1KGXA 3WH8A 1G1YA 3I3BA 1P6WA 3GH7A 4JHZA 3KL5A 3ZR5A 1MQPA 4AD2A 1HNYA 3KE0A 1QNRA 4ML4A 4XV0A 3CHFA 1MQQA 2VZTA 4TTUA 3AMGA 1WDPA 4MDPA 2DSWA 5A6BD 2BNJA 4GZJA 4NRRA 5IFTA 2CERA 4WKHA 3ARPA 1W91A 2WANA 1QHPA 3ZT5A 1W1PA 3MSGA 1NQ6A 1R8LA 4J3VA 3AZSA 1MFVA 5CJ5A 5BCAA 1LWJA 3CLWA 4QLJA 3W38A 4GI6A 5DEZA 3QR3A 5HPOA 1ITXA 5EBAA 4D6EA 4MADA 3SCWA 6TAAA 2XVNA 3MMWA 4W86A 1JYVA 2EQDA 5FCZA 1UHVA 1KBBA 3DYOA 5BRPA 3J7HA 5AYIA 3W53A 3CH9A 2Z1SA 2WVVB 1C91A 4HOXA 3UR8A 1OGBA 2XGIA 2JFEX 2YJQA 1J0YA 2WHMA 3I3DA 4CKQA 3TP4A 2YOCA 2D22A 1B3YA 1EDGA 2G3MA 5M3WA 1I1XA 1ISZA 3VINA 1DWHM 3TOPA 2D3LA 1KR0A 3ECQA 4DUWA 1GVYA 1JZ2A 3BC9A 1C93A 1R86A 2ZXQA 1WP6A 1FOBA 1H09A 4D6IA 3T0BA 4EANA 5TD4A 5A6JA 2HVMA 1O7AA 1CXLA 1BG9A 1OGSA 2E9MA 4UQEA 1CLXA 1U2YA 2BFGA 4RE4A 4PMVA 1WDQA 1E56A 4DWSD 2J4GA 4A4AA 1TG7A 1VAHA 1UKSA 4TX6A 4AD5A 5M5DA 1KFWA 2MANA 3MV01 1XSIA 4YN5A 5CGMA 1ISWA 3N17A 1F4HA 4X0VA 5DF0A 3CZKA 2X05A 1C92A 4UOZA 1QBAA 2WWCA 1JD9A 3LPFA 4P7RA 3NIYA 1NM9A 3WH6A 2DT1A 2J77A 1E6RA 2VC9A 1UD8A 2WMKA 1XSKA 4W5ZA 3VIPA 1XC6A 5CPQA 2OYMA 1G94A 5ABFB 1NP2A 3ZR6A 2WSKA 3AIEA 4RE2A 4ZE4A 3ARTA 1E4NA 2CKSA 4PTWA 3U57A 2DEPA 1BAGA 4AZHA 4D72A 3BXWA 1ZBCA 4J3WA 3PZGA 5A6MA 2YDRA 4R27A 1E6PA 2Y8KA 3WD4A 4H8HA 3VDBA 3ZO9A 3BSHA 4GPNA 3WNLA 3OZPA 4J3TA 5ABEA 4H8VA 1HP4A 2EPKX 3G6LA 2WW5A 3W27A 2DSZA 4M1RA 4BZYA 4V28A 3PHAA 1FH9A 3AS0A 3CUIA 1B1YA 3VU2A 3ZSTA 3CUJA 3VIGA 3K4DA 5D9PA 1E15A 4FK9A 3O6AA 1HKIA 4X0NA 1BG4A 2YKKA 3BMVA 3VMNA 2G3NA 3UEQA 3W24A 1V3HA 1BVNP 3SCVA 2ZE0A 1UR1A 1RP9A 1RD6A 1GQJA 1SR0A 4FLRA 1JZ8A 4UQDA 2WMJA 1V3MA 2ZIDA 3AIRA 2ZXAA 3WF4A 1E6QM 1EDTA 1V6YA 3IANA 3EDEA 4CD7A 1V3LA 1B3WA 4W93A 5BXRA 1JGIA 2XJ7A 3AIBA 2A3BA 4JFVA 1J0ZA 1OB0A 4D1JA 4JKKA 2ZWZA 4Q22A 1E0VA 2BY1A 1OWQA 3IAPA 3W6LA 2CYGA 4HMEA 1GOOA 3M6DA 4PN2A 2YA0A 3APGA 4CN1A 1X6NA 8A3HA 1H41A 3ALFA 1MXDA 2D20A 2D24A 4QAWA 4FLSA 1B0IA 1TVNA 3BAIA 4QFUA 2VT0A 3A47A 2XIIA 3DECA 5EFDA 1BPLB 4WSKA 1NOUA 4ACZB 1W2VA 1QNOA 1VJZA 4CD5A 3AHXA 4UR9A 3VGEA 5CLWA 2OLHA 3ARRA 1X6LA 3L4VA 1C8QA 3QOMA 1DWFM 3VDCA 4JFTA 1FA2A 4AZ6A 1XHGA 4MJ4A 3RDKA 4J27A 3SUTA 2ZX6A 1ECEA 3GNOA 4YPJA 3I3EA 4S3JA 1UA7A 1BVZA 4JKMA 4E8DA 1V02A 4M82A 1JFXA 2XWDA 1QHOA 4JFWA 1J12A 5JIWA 3ZT6A 3BCFA 1ITCA 4TOQA 3CZLA 3RJXA 2BY2A 2YL9A 3PBGA 2IXUA 5IFPA 2V5DA 1TMQA 2DT0A 3NJ3A 5ECUA 2F8QA 3EMCA 2E3ZA 5CXPA 2WBKA 3O2LA 1J18A 3FNDA 4AD3A 1H0GA 3BCDA 4AD0A 1XD0A 5GQBA 3VMOA 1C3FA 3WUEA 3LPPA 3SCPA 4AEFA 1C7SA 2CCRA 3CHDA 3AS2A 1V6UA 3JUGA 1AMYA 1W9DM 3W6MA 4WJXA 3DYPA 2V3DA 1QVBA 1GONA 2DT2A 3VD7A 4IPNB 1QBBA 3GDBA 3WQVA 2WMIA 1JXJA 5I78A 5E6YA 3OLGA 4ZXOA 4LYRA 3VIMA 2DSUA 4TVDA 4M8UA 2ZUWA 1VEMA 3ZJ8A 3VGBA 2CBUA 1UOKA 3FY1A 2WC7A 1MFUA 1HP5A 1C8YA 2WYSA 3AISA 1QI3A 1DP0A 1EGZA 2VRJA 3SCNA 1PPIA 4K68A 2WHLA 4W8LA 2GJXA 4CU8A 3AXIA 5LA0A 4MNKA 4IM4A 4MTVA 2BVYA 4UFIA 1K9EA 4HPGA 1KQYA 1H1NA 1LL6A 2QLYA 2Y4SA 3WQ8A 4NZCA 3WL1A 5A6AA 1DWJM 2IXVA 2B31A 4CCEA 4GINA 2YA2A 1J0IA 2XTKA 3WQWA 3E1F1 3K4AA 2XGBA 4E2OA 4UOJA 4UFJA 4PMRA 5AC4A 1UWTA 4P8WA 3ZM8A 3SEPA 3AI0A 2WBGA 2WVUA 4HZ6A 4AWEA 1ISYA 2JEQA 1CPUA 2WMGA 1US2A 3ZJ6A 4URIA 2BHUA 2YDQA 3U5YA 4OBSA 2DT3A 4QCFA 5CQ1A 1EO5A 1O6IA 4S3KA 3PZOA 3VNZA 1EIBA 1KCLA 5FOOA 1GNXA 2ZX7A 1GOWA 2VURA 4AIOA 1RP8A 4W89A 5CPTA 3OBAA 4TUFA 4HOZA 3VUPA 1I1WA 4KH2A 3WH9A 1E3ZA 1W3KA 2CEQA 3UG5A 2J7GA 2E9BA 1CWYA 2PB1A 2VRKA 1GJWA 2EJ1A 3BH4A 3O9NA 4F66A 1J11A 2WVVA 1WO2A 2EO7A 3FHQA 1HKKA 1CXHA 2W5FA 3NDZA 1EOMA 4DWSB 4P7OA 3VX0A 3WFLA 2EPNA 3AJ7A 1OINA 4P8UA 5CZKA 2XSBA 3N9KA 2BV9A 2WNWA 5JUVA 1TA3B 3L2MA 4HZ7A 3UG4A 5KEZA 5EB8A 1QNSA 2O9OA 4KWUA 4LPCA 2GDUA 1JDDA 2DIEA 2CITA 2Q8XA 1MQRA 3AHVA 1HJSA 1VENA 4JFSA 4H2CA 4Z2GA 2CETA 4EKJA 4P7NA 1AQMA 5A2AA 1A47A 1F4AA 1NP0A 1H11A 4JIEA 1ZBVA 3CHCA 3EBVA 5JIPA 1E1FA 1NARA 1QI0A 1DHKA 3W26A 1ISXA 1DWGM 2NW0A 2J78A 3GBEA 4W85A 2UWFA 1E40A 3A6OA 3ZOAA 2NT0A 2DSKA 4HA4A 5LYRA 5I6SA 5A2BA 1JG9A 3AHTA 3CBWA 3CUFA 1WAWA 3W37A 1D7FA 1CBGA 1BTCA 2VX4A 2QMJA 4NF7A 4OKDA 4MDOA 1NWUA 4PCSA 3RM9A 4BS0A 1JFHA 3TTYA 1JIBA 3WNPA 2WWDA 1S46A 3VMPA 1BLIA 2FGLA 3MUY1 2O9RA 3WFZA 3PZMA 5DMYA 3PTMA 1WZMA 3DHPA 2VZUA 5I2UA 3RO8A 1KXTA 1JZ6A 2J62A 4ZEPA 2GUYA 1BGGA 3DHUA 2GK1A 4W87A 4YHEA 4CUCA 1JYXA 5CGTA 1W1YA 4F9JA 4GI8A 2G8ZA 3VD5A 3T2QA 5JBFA 1HVXA 2E0PA 1HIZA 1JYWA 1C90A 4M81A 3U7VA 5EFFA 1B30A 4UNIA 3CZJA 2FH8A 2VX6A 2ZUNA 1QPKA 1PBGA 3M07A 1E4IA 4PYSA 3IAQA 1JDAA 1JI2A 2XSAA 2QMKA 2W92A 2WC3A 1UA3A 3MU7A 3IK2A 2FDMA 5A1AA 4LYQA 2E8ZA 3THDA 4IUGA 4Z2HA 3VDHA 1E6NA 2O9PA 1ZBWA 4PMNA 1TR1A 1JYNA 1OIFA 2DH2A 2RGMA 3CZGA 2XUCA 3T2OA 1XV8A 1ZU8A 2JALA 5FD0A 3BAJA 4KRUA 4R5EA 1OIMA 1MYRA 4AW7A 4OOUA 4UTFA 3WEZA 1CECA 4MB3A 2WKGA 4C7FA 1Q6FA 4MB4A 8CGTA 4KRTA 5E70A 2PWEA 3AXXA 1L8NA 1ZS2A 3T2PA 2OSYA 5I3DA 1BQCA 1KXHA 3CO4A 4XZWA 1FHDA 2CBIA 4EAMA 4QP0A 1W9XA 3AZTA 4OJYA 1E73M 3WDJA 3WD1A 5A94A 1CYGA 2EPLX 2GJPA 1RPKA 3F4VA 4F8XA 1B31A 4B3KA 3ARUA 2J75A 1KXQA 1Q6EA 3N18A 1EOKA 4N42A 4J3SA 4ACZA 4A3YA 2E9LA 1EHAA 5HOSA 2WHKA 4U31A 3TTQA 4V27A 3SUSA 1R7AA 5JBDA 2AAAA 1CGTA 2BY0A 3QHOA 1WCGA 1V6XA 2PC8A 3QGVA 3UETA 1IZJA 4AYSA 1UQZA 2C8NA 1UWUA 2WZHA 3WQ4A 4X9YA 3BAXA 3HMCA 5CG0A 4XB3A 2XVKA 1XH0A 4PMZA 1ESWA 5D8ZA 1J01A 1KR1A 3A4AA 1UWRA 4GXPA 3WF3A 1TFVA 1WZKA 4N0RA 4JL2A 1G0CA 1E1EA 1GQLA 5DFAA 2WVSA 4BCEA 1TZ7A 3WUBA 1B3VA 1VFUA 1K6AA 3WSUA 3WNOA 2CXGA 1W9PA 3DYMA 5GPRA 2XFFA 1E4MM 3WIJA 2QF8A 2WCGA 4FLOA 5EMYA 3RJYA 2JIWA 2DQXA 3W81A 1J0KA 3D3AA 4BQ5A 1GOKA 1NOFA 4D6GA 4W5UA 5C8BB 3VGDA 4U3AA 4FF5A 2OYKA 4AIUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2XFY A;  2VJX A;  4J28 A;  1J9Y A;  1LG2 A;  3K8L A;  4A3H A;  4PRW A;  3WEN A;  1UD3 A;  1SYT A;  3WDI A;  3KL0 A;  3ZJ7 A;  3L4U A;  1G9H A;  1VBR A;  4E8C A;  2YBU A;  1FP9 A;  3EDK A;  3ZMR A;  2WC4 A;  3AS1 A;  3ZIZ A;  4AD4 A;  3WMS A;  1JAK A;  4CN4 A;  1W1V A;  3CIV A;  2V5C A;  2VCC A;  1WPC A;  1UR9 A;  3NSN A;  2J7E A;  2VTF A;  2RGL A;  1NH6 A;  3TTO A;  3AS3 A;  2G4F A;  4PSR A;  2DDX A;  2FHC A;  4UQB A;  3AMD A;  2J8F A;  1Q6C A;  3GXD A;  4M24 A;  3S6T A;  1SMA A;  1UD4 A;  4PCT A;  4UFL A;  1D2K A;  3B9D A;  5BXT A;  3PZV A;  4NSB A;  4CVU A;  2OSW A;  5ABH A;  1V0K A;  2J8G A;  3NCO A;  1E72 M;  2V3F A;  1UZ1 A;  1VJS A;  2WB5 A;  1D3C A;  4ZEN A;  2XPK A;  5BXP A;  2XYL A;  4OZO A;  1UR0 A;  3UR7 A;  1B3X A;  2BVT A;  3L4Z A;  3AZR A;  1TCM A;  5HXM A;  4TTG A;  4AEE A;  4AZ7 A;  4AZG A;  2J74 A;  5DT5 A;  3VGH A;  1GVI A;  4D6H A;  2WVT A;  4CVW A;  1QI2 A;  3KEH A;  1Q6D A;  2WLZ A;  2VVN A;  5I5R A;  1KWG A;  3SCO A;  2BVD A;  5C71 A;  2VOT A;  3W28 A;  3WNK A;  1OGG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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