5ECSA

Crystal structure of fip1 with gsh
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
214
structure length
214
Chain Sequence
b'LPILLDYWPSMFGMRARVALREKGVEFEYREEDFSNKSPLLLQSNPIHKKIPVLVHNGKPVCESLNVVQYVDEAWPEKNPFFPSDPYGRAQARFWADFVDKKFTDAQFKVWGKKGEEQEAGKKEFIEAVKILESELGDKPYFGGDSFGYVDISLITFSSWFQAYEKFGNFSIESESPKLIAWAKRCMEKESVSKSLPDSEKIVAYAAEYRKNNL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis of jasmonate-amido synthetase FIN219 in complex with glutathione S-transferase FIP1 during the JA signal regulation
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase U20
source organism Arabidopsis thaliana
molecule tags Transferase
total genus 87
structure length 214
sequence length 214
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2015-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 5ecsA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5ecsA01
1N2AA 4MP4A 1Q4JA 4IS0A 4NPBA 1K3YA 4POLA 1BQ7A 2HQTA 2MBSA 5ECQB 2H01A 1MTCA 5BMUA 2V1MA 1CQHA 1ZYQB 3IK7A 5EL8A 5IIZA 4JEDA 4TR3A 1YEXA 3GA4A 2HSNB 1Z7PA 3IV4A 3FYGA 3BD2A 2WCIA 5CRDA 3F6FA 3UMAA 3Q74A 2H1BA 4I5QA 3GKMA 4BL7A 1TK8B 3EURA 3DMLA 3FHKA 5ECMB 4K7IA 1ZZYA 2YWOA 1RQMA 4HJ2A 2PMTA 2JADA 1OC9B 5ID2A 3D22A 3ZMLA 5IO2A 4BVXB 4PXOA 3M3MA 2L4CA 2YV7A 5D96A 3HA9A 4ECCA 2H6YA 1M7TA 8GSSA 2GS3A 3CSIA 1VRSD 1ON4A 2VL2A 2FUG2 1YF1A 3KCMA 4ZL9A 1A24A 1I5GA 3I9V2 4WR5A 2NTOA 5HR0A 4PQHA 4PQ1A 3W8JA 2HZFA 3TOTA 2MMNA 3DEXA 3LJRA 1EP7A 2H0GA 3SWLA 1WRYA 2L57A 2C4JA 2OA7A 5ELGA 3H79A 1GSEA 3TRXA 3GTUB 2DJKA 5KN1A 2ON7A 2K6VA 1ML6A 3C8EA 3TB2A 1K0DA 1R4WA 1GLQA 3HZ4A 3LYKA 1JZWA 1BAYA 5DBQA 1Y6EA 3LGCA 3G7JA 3ZFBA 4FQUA 4PUAA 4NHZA 5F05A 2H72A 2I3YA 4K9ZA 1AAZA 2LUSA 2C0FA 4X1UA 2YNXA 5G5EA 1XIYA 4ISDA 2GSTA 2O8VB 4K2DA 3VFIA 3GYKA 4XTSA 3CTFA 2RUEA 3ZFLA 3FK8A 2NVLA 2HSMA 3HVSA 2C3TA 3IRAA 4N30A 4IQ1A 2WFCA 5F07A 4ILFA 4KNDA 4ML1A 2YCDA 1WPIA 3GRXA 2YZUA 2GQLA 3FZAA 2CX4A 3DIEA 3EC3A 3MSZA 4P3YB 3QAVA 5DALA 2JACA 2MYGA 5E59A 2LRCA 4USSA 2YJHA 3GX0A 4MJBA 3IBHA 3BOAA 4J56E 2PBJA 2IFQA 1DBYA 3JCML 3QR6A 4LMVA 2RUFA 4K6XA 1XWAA 3GHAA 1U3IA 4RUVA 5KN3A 1SK2A 3VPQA 2LEGA 4ZB9A 2P0GA 1UA5A 2F8AA 4XS4A 3D4TA 5D73A 4ZBDA 5IMAA 3C71A 3SBCA 2E7PA 1PL2A 4RI6A 3APQA 1TI3A 3GKNA 1SJ6A 5J41A 2L59A 2N5AA 3F0IA 4JU5A 5L71A 1I9DA 1K0BA 2EIOA 3ED3A 5GSSA 2R4VA 5HFGA 4ECBA 2VAFA 4G0IA 1RW1A 3C1RA 4GF0A 1O73A 2VLVA 5D8IA 1T4YA 3G7IA 1HNAA 2I9HA 2HZEB 5INYA 3KH9A 1XWBA 1WMJA 1SU9A 3VURA 2B7KA 1TU8A 3LQ7A 1JFUA 3E9JB 4IVFA 2VM2A 4WR4A 2C80A 2GZYA 1XOBA 2LV3A 1X0RA 3EMXA 4MJAA 3PGTA 4KDYA 2O85A 2AYTA 3DRNA 3FKFA 5COHA 4N0ZA 4OFMA 2VCVA 4L5LA 4TKYA 1LJRA 4JZQA 1SL2B 5DJLA 2C0EA 3QD9A 1SKWB 2CZ2A 1FOVA 3N9JA 5DVBA 2F9SA 4EUYA 3KEBA 5LCZA 3KZQA 1FG4A 1TW9A 2MMAA 2O7KA 1SK1A 5FT3A 4FYUA 4PNGA 2LKUA 1GTIA 2LNSA 2N5BA 5IOXA 2LJKA 4PGTA 2MBTA 2HNLA 3RHBA 4PUFC 3QMXA 1ERVA 3DXBA 3I43A 2GQMA 4WXTA 4Q5RA 2VCQA 4HDEA 3AY8A 1M0UA 3TRQA 1R26A 3TRPA 5IMVA 4G0KA 3GNJA 3RAZA 4IJIA 2YOIA 3F4TA 4XS1A 1EEJA 1JHBA 2B5XA 4JBBA 4DVCA 2NBSA 2R37A 3WGXA 1YDKA 1QXHA 3GFKA 3FR3A 1OVNA 19GSA 2RM5A 4IBPA 2JL4A 2V6OA 4BL7B 3F3QA 1GSDA 1YQ1A 1ERTA 1WWJA 3TKSC 2JSZA 1NM3A 4IJ3A 3A3TA 2DJ0A 2E0QA 1ACVA 2F3MA 1T4ZA 4BA7A 3WT2A 2R5GA 3APSA 1Z7RA 2HYXA 2H73A 3APOA 5CRHA 5EVOA 2XPDA 2J9HA 2MMOA 3DD3A 1GUKA 1S3DA 1G7EA 2XBQA 1R5AA 1Z9HA 2H19A 5IMCA 1AW9A 1H75A 3QCPA 4DSSA 5ECNB 1MD4A 1YY7A 5DAKA 2MZCA 1OKTA 4TR4A 5GSTA 2WGRA 1GULA 4V2LA 3E3EA 4LMWA 2V6KA 2OBIA 2JU5A 1G6WA 4GTUA 2H1GA 2ZNMA 3G9BA 3TCOA 1SENA 2A2RA 2QSIA 1EWXA 5KN0A 3KP9A 1VF1A 4MJCA 4WF5A 2ZCTA 5JCGA 2B5YA 1T7PB 5H5SA 1Z3EA 1BJXA 3LEFA 2FGXA 4F9ZA 4GSTA 3GUSA 1B4PA 1X5DA 3A5WA 2YWIA 3CXGA 3EWLA 1S3AA 4O92A 3NZNA 4XRDA 4WBJA 2GGTA 4K8MA 3H4KA 3DGQA 3LORA 1XWCA 2H1DA 1MDIA 1ZOFA 2OKAA 1LBKA 3TJFA 3EE2A 3QFAC 2HSMB 1KTEA 2LSTA 3R2QA 2VCZA 5DCGA 1XFLA 1W89A 4Z7XA 2DJ2A 2HRNA 11GSA 2DSAA 2G2QA 4OCEA 2KP2A 2AJQB 5DALB 4NV5A 5ELAA 2VIMA 3LXZA 3FR6A 2NDOA 1TK0B 1K3LA 3F8UA 2L6CA 4KSMA 3MWHA 3GL5A 2IFQB 4GCIA 4PQIA 3L9VA 3VI7A 4KCEA 1GSQA 4G2EA 3QAWA 5A4WA 1F3AA 3ZMKA 4EF0A 3HY2A 4MZCA 1J9BA 1H4OA 1R7HA 3HVVA 4I8BA 3Q6OA 4XS4B 4YAVA 3M0FA 3TOUA 4MMMA 2X99A 2M80A 3KTLA 3LSZA 4OFNA 3F3RA 3RHCA 4ECJA 1A0FA 1YZXA 1TRUA 3HXSA 2RIIA 2CVBA 3L78A 4IP1A 2K8VA 1FHEA 3HKRA 4G19A 2JZRA 1F9MA 4HQZA 3UAPA 4L8EA 12GSA 2N5FA 4N11A 5A4UA 1V9WA 2GT6A 3PH9A 2P31A 4XRAA 3DKSA 4ZL8A 2ZUPA 2FD3A 4IP6A 3ZITA 1XOAA 4YQUA 1V57A 1MDKA 2KUCA 5D9VA 4V1Ap 5CREA 2C3QA 1M9AA 1KBNA 3UVTA 1V58A 1F2EA 4KB3A 3C73A 4K0NA 2GQKA 1TRWA 1NSWA 1JLWA 4D73A 2LNTA 1A0RP 1ZL9A 4TRXA 1O85A 2PVQA 1K0OA 4GSSA 10GSA 2I4AA 5KN2A 2WRTA 3NOFA 4FYBA 3ZIVA 2VLUA 3IXRA 1X9WB 2L5OA 16GSA 4V2NA 14GSA 1IYIA 2YWMA 1X9MB 3TGZA 5DDLA 1K3OA 2H75A 1Q98A 5D9TA 2VLTA 2CVKA 2CT6A 4OCFA 3E0UA 4DEJA 4F0BA 3QOUA 5C04A 3KMOA 4HU7A 2WS2A 1AC1A 3U5RE 5GAPD 1GL8A 3WGDA 3ZVJD 3IK9A 2LJAA 4MABA 1UC7A 4ULXA 3TKPA 2A4VA 2P5RA 4G9HA 4RI7A 2VL3A 2K9FA 1ZMAA 3D6IA 3L9UA 3TKRA 1RK4A 3KXOA 3EINA 3IC4A 1WOUA 1SKRB 1JZOA 1E6BA 4TR1A 5DQYA 1B4QA 2VO4A 3HJPA 2OBKA 1TKDB 5ECSA 5E4WA 5A4VA 5H5RA 2H30A 5DQSA 1SYRA 1OE7A 4ACSA 4F03A 3J7Yb 1Y25A 3UOMA 3OR5A 1UVZA 1K0NA 4NMUA 2GZZA 4O7HA 2QGVA 3C1SA 1M2BA 7GSSA 2LRNA 1EP8A 5HR1A 5ECHB 3QDNA 4FH8A 18GSA 4HQSA 4EDZA 4DSSB 3RPNA 2VD1A 5J9BA 3UEMA 1YKAA 3P90A 2IN3A 3MDKA 2HT9A 1SJIA 2E2MA 3VWXA 3PPUA 4ID0A 2VUPA 3GSTA 4TXOA 4DSQA 4EO3A 5DJMA 4NWYA 5J3RA 5ECRB 2H1AA 1HNCA 1SD8A 2J23A 4G10A 3N5OA 5ENUA 2TIRA 4Q5NA 5DCHA 2GLRA 4ZILA 4YAPA 5GAND 4MPFA 4WBRD 3VI5A 2ALBA 3S9FA 1KNGA 1GSYA 1O81A 2FA8A 3UL3A 1A2MA 4KAEA 1SYXA 1FW1A 2B1KA 4F0CA 4AGSA 5FHIA 2TRXA 3VLNA 1ERUA 1Z6MA 5JWOB 2DIYA 1FVJA 4ZXGA 3IAM2 2LRTA 2LS5A 5ECOB 2PPTA 2CVDA 4E8HA 3ERGA 2AV4A 6GSXA 1EV9A 5B6MA 2KHPA 2X64A 1PQNA 4NV2A 1EGRA 2H0IA 2HLSA 1GTUA 2B5EA 1TXXA 9GSSA 1FVKA 4F82A 2OE0A 3HYPA 2D2ZA 3FRCA 2H66A 3VWUA 3P2AA 1W4VA 2GZPA 1WJKA 1G6YA 2WDUA 5FWGA 1FAAA 1HQOA 3US3A 4IN0A 2CA8A 1PN9A 1U6TA 1PL1A 4KGIA 4MK3A 3HJOA 2IMKA 4QL9A 3DWVA 4OFTA 2FWFA 1QGVA 2GSRA 3GMFA 3IE3A 4GXZA 4BWQA 1F3BA 5GZZB 3HD5A 2HRFA 3J7Yk 3IAS2 1TP9A 3KGKA 2LQQA 1F6MC 1URMA 5EPFA 1EZKA 3EU4A 1BG5A 2DMMA 3W8SA 4HOJA 4V2MA 1AQWA 3FZ5A 2TRCP 3ME7A 1DE1A 5A5KA 5ID2B 4YQMA 2YP6A 1XW5A 2WULA 3K8NA 2HXKA 4I97A 1V98A 3PR8A 1SKSB 1GSSA 1K0AA 2H74A 6GSWA 1GWCA 3CTGA 3RBTA 4IW9A 2VL2C 5EY6A 1XBSA 3LWAA 4GQFA 4OWYA 1QMVA 4HU9A 3A2WA 4D73B 2HRAA 1JZDA 4O32A 4ZBAA 5IQYA 1B48A 4WETA 4PX1A 4MPGA 2AAWA 5B8AA 1THXA 3C7MA 4BWSA 2FNOA 3WD6A 4DSRA 2HFDA 5IPHA 1A2LA 3F4RA 4FO5A 4NAXA 3F9UA 1K0CA 2YZHA 3GURA 5CP1A 2FWGA 3W6GA 1QFNA 3ZREA 1EOGA 1GNEA 1GRXA 3QPMA 2YV9A 3FW2A 4JE1A 1YKCA 1SK0A 2I1UA 1EEMA 2XHFA 6GSVA 1PMTA 1PX7A 4WKWA 2VOCA 1V40A 5F06A 4JR6A 4CHSA 4PURA 2M72A 2GSQA 4HI7A 3BBYA 1O8WA 1LU4A 3BCKA 2FA4A 2IJYA 4ZBBA 3NIVA 1VGLA 2OADA 2DIZA 1TU7A 1V2AA 1XCCA 3V1WA 1OE8A 1EV4A 2L4QA 1Z5YE 4MH2A 2H76A 2GSSA 5CO3A 4LL4B 1XWKA 4HUAA 3P8WA 4IGJA 2LTKA 2IL3A 3LG6A 1B8XA 3VWVA 4TR1B 1YJ6A 1FB0A 2C1YA 2WZ9A 3CSHA 2YANA 1NHOA 3G7YA 1WE0A 1OC8A 2NPBA 1QQ2A 1U3AA 2OE1A 2WJUA 2HE3A 4K7OA 1M2DA 2IMDA 4ZB6A 2YN1A 4G0LA 4POKA 2OE3A 2JZTA 5JWQB 1A23A 1M9BA 4YH2A 4HJMA 3HDCA 2FLSA 3F6DA 2MMZA 3P7XA 5JCWA 4RQXA 1T3BA 4KF9A 4KSOA 3UARA 2VCTA 3R3EA 4EVMA 2KLXA 4POBA 4ML6A 1WIKA 4L0UA 4POMA 3GL3A 3CBUA 5IPGA 2PVOC 4TOPA 3TUEA 3FY7A 4K7NA 5ECKB 4LLRA 2K18A 2VD0A 1M99A 2QKEA 2YWNA 1O8XA 4I2UA 4K1FA 1YF0A 4Q5QA 2PGTA 3DVWA 2H0HA 2GVPA 2FCHA 2K8SA 3GH9A 4TXOB 1F37A 1AUCA 1AQXA 4V1Ag 4GWRA 2CZ3A 3Q19A 1GTBA 1T1VA 2PN8A 5G2ZA 3A2XA 3MAKA 1N8JA 3GV1A 4QL7A 1NHYA 1XW6A 4K0GA 4OO4A 4PNFA 3RPPA 4N10A 1JLVA 3TKSA 4OD7A 1G7OA 5HR3A 2X8GA 4IHUA 1DSBA 5B7CA 1SD9A 2PU9C 1AXDA 4WF4A 4I2TA 5B8BA 1B9YC 1QK8A 3VWWA 2B6MA 4ZB8A 2OACA 3D4MA 3ZLPA 1GH2A 3RDWA 2B3SA 1VF4A 1MEKA 4KH7A 2PERA 3KH7A 2WB9A 3D21A 4KA0A 1AIUA 4BVYA 2H70A 1TDIA 1NW2A 4KE3A 1OAZA 5D9XA 1EOHA 3I69A 4EDYA 3ZYWA 2PWJA 4ECIA 1GUMA 5ABRA 2DBCA 4F2IA 1OYJA 4AJ8A 1PA3A 1J08A 5J9CA 1TRSA 3KD0A 5F8BA 1FO5A 2IMEA 1O7UA 4LL1B 1XWGA 3PINA 2RM6A 3GKXA 5IOWA 2BMXA 1JZRA 4TN8A 4MZBA 2LQOA 2CX3A 2IPAA 4IELA 3UVHA 1ILOA 3CRUA 3LFLA 4OMVA 2XPEA 5CRGA 4CW9A 1J0FA 3DVXA 2GDRA 4HEA2 2REMA 2QC7A 4KDUA 3HCZA 5AN1A 3ISOA 3D0ZA 3MNGA 4J2FA 4GSNA 5AGYA 3UBKA 2HI7A 4KCAA 1GTAA 4KW6A 1K0MA 3M8NA 3FZ9A 6GSYA 4CDOA 1GUHA 3EMPA 1GSUA 3LYPA 1M2AA 4AJ6A 3UBLA 4MA9A 4TW5A 2C0GA 2EIQA 4E8EA 4YQVA 4XCSA 4XS6A 3IHQA 3IOSA 4MLYA 3ZL5A 4L5OA 3KMNA 2XBIA 4MH3A 4N0VA 4MZWA 5ECLB 4IQAA 5G5FA 5CNWA 1XVWA 2R3XA 1C72A 4HZ4A 2V41A 2VL9A 17GSA 4RQRA 2KP1A 5AISA 2GTUA 1PSQA 2HRKA 4EC0A 3ZIJA 3H8QA 2BJXA 4OO5A 3CYNA 5ECPB 3F63A 3HZ8A 1MD3A 3TJGA 5DAKB 2I81A 1DE2A 1EGOA 4JRRA 1TOFA 2F51A 2LJRA 2PUKC 5J4UA 2O87A 3UJ1A 5HQPA 1S3CA 1TK5B 3TKSE 3ME8A 2CAQA 1PKWA 1BEDA 1A8LA 1OC3A 2FWHA 2JSYA 4EXJA 2JZSA 4I6XA 1GLPA 3WGEA 5D93A 1HD2A 5C00A 3KM6A 1VF2A 3BCIA 3H1NA 3Q18A 3QAGA 2Z9SA 2UZ8A 4IKHA 1GNWA 1OC9A 2OJLA 1ST9A 4BVXA 3KIJA 4FYCA 3FR9A 3ZRDA 3LXTA 1ZYEA 3TDGA 3ZZXA 1OKDA 1AQVA 1X9SB 5LNKe 2H71A 4H86A 5JWRB 3TJJA 3M9JA 1ABAA 4Q5FA 3GSSA 3O6TA 2XC2A 1Z6NA 2E2GA 2YJ7A 2VCWA 5AIXA 2DMLA 2CV4A 13GSA 1T8EB 5G31A 2C3NA 1USBA 2V32A 3O3TA 3VK9A 2G0FA 6GSTA 4HZ2A 3QFBC 3ZTLA 3L0HA 2X8HA 1TI1A 1E2YA 1U87A 3FEUA 3A2VA 3TKQA 1WP0A 3GH6A 3M9KA 3GTUA 3KJYA 4MDCA 2BTOT 1PGTA 1ZCPA 3H93A 4AF2A 2AHEA 2H6XA 4KUNA 5G1LA 4AJ7A 3HJMA 4EL1A 5IO0A 2C8UA 4EKZA 4JR4A 1XW9A 1PKZA 3ERFA 5G1KA 3M1GA 2FY6A 4GRFA 5LD0A 1XPVA 2H6ZA 4KX4A 3HHVA 1CQGA 3EU3A 4L0WA 3EVIA 5CRWA 5ECIB 2ES7A 2AB6A 4MF7A 4WEYA 1PD21 1U88A 1VF3A 1HYUA 1A8YA 3IA1A 2RLIA 2IMFA 4O5RA 2HSHA 1GSFA 3CMIA 2O89A 4FIWA 3ERWA 2V2GA 4MCUA 2A2SA 2CAIA 2M46A 3BJ5A 1TTZA 1YEPA 3CSJA 1A2JA 3EYTA 2IMIA 2H8LA 2DJJA 1QUWA 4GLTA 4HS1A 5D9WA 1X5EA 2DLXA 3TJBA 4MF6A 1UN2A 2R2JA 4NXIA 4BPYA 2P5QA 3GKKA 4TVEA 3GIXA 5B6NA 6GSSA 3KP8A 2X8CA 2DC5A 5J5NA 5JCUA 2AUVA 3WYWA 2CQ9A 1ERWA 1ZGNA 2FWEA 3DYRA 4LA1A 1MDJA 5IMDA 4BVYB 5H5QA 2DJ1A 3U6VA 3HVXA 4TR0A 1TJDA 4X43A 1IYHA 2EC4A 4J57E 2HSYA 2C0DA 3IDVA 3IR4A 3GX8A 2EIRA 3L9SA 2HZEA 3KTBA 2DJ3A 5IMZA 2R6KA 3FZ4A 3VPTA 2VCXA 5G30A 5IMFA 1SL1B 3O76A 5HFIA 1PX6A 3D5JA 3UIWA 3L4NA 6GSUA 2YPMA 3IC8A 1TRVA 5IM9A 22GSA 4X0XA 5CYYA 4KDXA 4ZL7A 2IWTA 3GN3A 4QQ7A 3IPZA 5F0GA 4MJEA 4XHMA 1XVQA 1PRXA 2KOKA 1O6JA 1BX9A 1HNBA 3WT1A 20GSA 1XXUA 4GQCA 2B7JA 1THOA 4XIHA 5KEJA 3F4SA 4EE0A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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