5EHMA

Crystal structure of the drosophila cg3822 kair1d ligand binding domain complex with nmda
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANLKNKTLVVTTILSNPYCMRKESAIPLSGNDQFEGYAVDLIHEISKSLGFNYKIQLVPDGSYGSLNKLTGEWNGMIRELLEQRADLAIADLTITFEREQAVDFTTPFMNLGVSILYRKGTPIESAEDLAKQTRIKYGALKGGSTAAFFRDSKISTYQRMWSFMESARPSVFTASNGEGVERVAKGKGSYAFLMESTSIEYVTERNCELTQVGGMLDTKSYGIATPPNSPYRTAINSVILKLQEEGKLHILKTKWWKEKRG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Novel Functional Properties of Drosophila CNS Glutamate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RE06730p,CG3822
molecule tags Membrane protein
source organism Drosophila melanogaster
total genus 84
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-10-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5ehmA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5ehmA02
1QULA 4FEBA 4R9FA 2RC9A 1MPCA 2DP8A 4ZE9A 1M5EA 4NMYA 4LZ8A 1O64A 2OWSA 2XXTA 3VE1B 3MZ1A 2ONRA 5CMKA 3TPAA 1B52A 2A5TB 1P99A 2DE3A 1A40A 3FVOA 4F31B 2R71A 4ZDMA 2A5SA 3TAJA 4GF8A 4BDMA 1MM6A 2RKMA 3MPLA 3FUZA 1ZJLA 4YKKA 1UIVA 4QFKA 3BKIB 2Q88A 1EH3A 3KGCA 4NF5A 2NOOA 3TQLA 4MLVA 1B40A 2ZYNA 3RT6B 1PB7A 2F97A 3MVWA 1PC3A 4BDQA 5DEXA 4MF3A 4OMBA 3OXNA 3T9HB 2XXQA 1HSEA 2I4BA 1GVCA 4LUBA 3B7DA 2DWAA 3PMVA 4KYSA 1MXZA 4OYVA 1P1UA 2I58A 2DE2A 5F7VA 4QFNA 5ICTA 3HO7A 2F8DA 3O9PA 3T93B 1Y3QA 4GWOA 4Z7EA 3ZKKA 2V3UA 4EUOA 1Y4CA 3QIMA 2NVUB 4BDLA 1I6AA 2I48A 5ELVA 4OEVA 3FXQA 3S9NC 3GZGA 1Q1KA 5I57B 1YAEA 2XXVA 1JEUA 4ZEFA 1A55A 3Q27A 3IB0A 1IITA 1B58A 5H8NB 2OZZA 2XXIA 3U94A 1LBBA 3HHFA 1AMFA 5H8QA 1FQFA 1S9TA 4RK2A 4NF8B 2D3IA 3PGFA 4WEDA 3VVEA 3R7XA 3RTFB 2PBWA 3MZBA 1MXUA 4THIA 1BKAA 1D9YA 1LCTA 3OOAA 1OLCA 2XX7A 5CMBA 4H5GA 3IOVA 4NE4A 4ZS9A 1VSOA 2XXWA 4FEDA 4YKPA 4FATA 5TP9B 3K1MA 2R6GE 4NF4A 5I56A 5FHNA 3Q29A 1XVYA 2I49A 2D5WA 3DM0A 3AXFA 2UXAA 4GVOA 2Z8DA 4POWA 5FHMA 1B05A 1P1WA 3S4UA 4DCXA 4XIGQ 4GIZA 1B9JA 3K2DA 4U4XA 2ZXTA 2RF1A 4Q30B 1YPNA 3K1NA 1SI1A 4L17A 4ZEDA 4HS7A 4POXA 3DP8A 4G4PA 5J1DA 1QVSA 2H4IA 1RYOA 1OVTA 2UVHA 4IO6A 2UYFA 5CI5A 1FQBA 3HPIA 4LVQA 4X1BA 4ESXA 4I1DA 4PFTA 3EPEA 4WEPA 2DOJA 4YMAA 1GTKA 4DXUA 3MP6A 3TTMA 3K4UA 1UIUA 2Y7PA 1SYHA 3R6UA 2F5XA 3KEIA 4IY6A 3CRBA 3KN7A 2HEUA 1M5CA 3IORA 1LLSA 1H76A 4BDRA 4RK9A 2V84A 2D21A 4H67A 3QUJA 4YKJA 4LZ7A 2Z8EA 4X9TA 1FTKA 5TPAB 4U22A 3C35A 2P0SA 4U23A 4DIGA 3FJ7A 1FQCA 1QUKA 3IX1A 4JWYA 2I4CA 2HZLA 1B3FA 3CIJA 3UA8A 4OQOA 2VP1A 4Q8RA 1B7ZA 1Y1MA 2F7CA 3MBPA 3B6QA 4ZEIA 3MJNA 1VR5A 5FTIA 5H8FA 1FTOA 3O97A 1JW1A 4N07A 4G8NA 3N6UA 3QXMA 1FQEA 1D4NA 1LCFA 5JTYA 1LAGE 2CZLA 4PFYA 1R9QA 1MQIA 4OFOA 4IB2A 2QS1A 2ZYOA 2QMXA 1D3KA 4OERA 3S9MC 3W15C 4YB5A 1JNFA 4ZZAA 1ZKBA 2GFEA 1NL5A 3IL1B 3H7MA 1B0HA 4G68A 3RY3A 1JQFA 4F3PA 5ICQA 1R6ZA 1QUIA 2XXPA 1R1NA 3JYRA 3SEVA 5I59A 4H5FA 1ZU0A 2VOZA 1B3GA 1I69A 2XHDA 5I58A 2DWIA 3I3VA 4UA8A 2HZKA 5I2NA 4JBZA 4E0WA 5TU0A 1QW0A 1WODA 4LZ5A 3M3LA 3K02A 2I0BA 3CG1A 3IB2A 4ELOA 3OELA 3UORA 4YKIA 2PYYA 1IEJA 4GLIA 3MQ9A 4QSDA 3RNNA 3VLVA 1URDA 3GBAA 2PX1A 3H6VA 1SDXA 3KZGA 2F7AA 3T22A 4NEDA 4P11A 2NUVA 1DOTA 4XKPA 2F6GA 3U8QA 2HAUA 3PPQA 4XXUA 2QRYA 3O2AA 4YZZA 4Q5TA 1DPEA 4X1DA 4QFOA 2I3VA 4R2BA 5AA4B 1LAXA 4PP0A 2DQVA 1USYH 4XKNA 4OVJA 1MPDA 2Y7KA 5EHMA 4ELQA 4R6HA 4ND9A 4GL0A 3TUSA 1PB8A 1XOCA 3T9UA 1NKXA 2REJA 2KLFA 3LSXA 1TFDA 2F35A 2V93A 4Z0IA 5BWJA 5I57A 3C9HA 3GBBA 1AIVA 1LB8A 2UVJA 2QS4A 3C31A 3KG2A 1S7YA 3K01A 3DELB 1FQAA 2CMOA 2FNCA 5KZTA 5KDTB 5CM6A 4KYEA 4Q0CA 3PMXA 1UQWA 3K6UA 3FXRA 4DXBA 1DTZA 3MPKA 2RC7A 3JZJA 5JK4A 1B5IA 4QRZA 4M1VA 2W7YA 1OQHA 3FJGA 3LUYA 3ZS6A 4GXAA 4OFJA 2QSXA 3V8XB 3QAXA 3W9VA 3PU5A 1NH7A 3U93A 1EZ9A 1D9VA 3IOTA 3VLUA 4GXSB 2GHBA 3F11A 3CG3A 2RC8A 2FA7A 2YLNA 4U4SA 3D4CA 3O6HA 2AL5A 2ZNUA 4BDNA 2HFBA 2GRVA 3KFMA 1USYE 1QJMA 2LAOA 2G29A 3LSLA 2OWTA 1IIWA 3C4MA 4YAHX 3IJOB 3K6XA 1UTBA 4ELRA 1AL3A 5BUUA 3G3FA 2DE4A 2P1SA 1TT1A 3MVZA 1A8FA 1B3LA 2OCUA 3TTRA 5F1QA 3V5AA 5I84A 4PE5B 2Y84A 3MWBA 2F34A 3SESA 4U2RA 4DXCA 5AA2B 3H6TA 4FORA 3LSFB 2IA4A 4QHQA 2O1MA 3I5OA 5DVIA 1IUDA 2R9JA 4KPTA 4R74A 3O6IA 1AH5A 4DLDA 4F1YA 1Q35A 1N84A 3TMGA 4JDFA 3WAFA 3TODA 2UVIA 3ZKLA 3FGSA 1MRPA 1Z7NE 2O68A 4PETA 4RPOA 3GXAA 2HCAA 1TWYA 2XX9A 1N7WA 4ELPA 3M3KA 5CC2A 4R6YA 2OLBA 4G77A 1JETA 4HCYA 1GV8A 2V25A 1LB9A 3QYTA 3IK6B 3IJXB 3B6WA 5A5XA 1VFDA 3MAMA 3Q28A 4TQUQ 2B65A 4G8HA 4IGTA 3FJMA 5HM4B 4TLLB 2F6PA 4DDDA 3MUQA 1XVXA 2M8CA 2F7BA 2F36A 1II5A 1Y1ZA 2FYIA 3UP9A 2Y7IA 3UN6A 1EU8A 2UVGA 3FV2A 3KN8A 2H99A 4R73A 1S50A 4H65A 5IKBA 4NF5B 4F2QA 1B46A 1M5BA 1MQJA 3SERA 1NNKA 4ECFA 4HW8A 3FIRA 4IO3A 2XXYA 4QFPA 5DEXB 1LFGA 3HHGA 1OMPA 3TELA 5H8SA 3A09A 3PUYE 4BDOA 3T9XB 4F3SA 2P2AA 4H0WA 1EZPA 1LSTA 4EF1A 1M5DA 4H8IA 3UGWA 5HBCA 4MFIA 4OESA 2HXWA 3OENA 2O1LA 3A3CA 2ALUA 1B0LA 2OJTA 1POTA 4RY1A 3K1PA 4F18A 3RT8A 4KCCA 4ZE8A 2REGA 3H03A 5H8HA 1JEVA 1B3EA 3CFLA 1NH8A 1PDAA 4XKRA 3T9VA 2DYXA 3PPPA 3WAEA 3JV9A 3MVXA 1MY2A 4KHZE 1UTHB 2H98A 4R9GA 1B3HA 3TTLA 4EQ7A 3VV5A 3KBRA 2RCBA 2GHAA 1WVJA 4QSCA 3Q25A 5AA4A 1NNFA 2X7QA 5H8QB 3N5LA 3E13X 4NF6B 2DWHA 3SEYA 1OQGA 3IB1A 2ZYKA 3FVKA 3MC2A 4WKMA 3O66A 4KI0E 3KN3A 3TEPA 3S2VA 1A7LA 3PV0E 4U1OA 4PQJA 1BIYA 4R75A 1A99A 1ZMGA 5CMMA 3A3UA 4GFRA 5I56B 5AA2D 1PEBA 1SD3A 2DVCA 1MXYA 3TQWA 3SEUA 5DT6A 1SI0A 3FZVA 3R26A 3IO4A 1MQGA 5KDTA 2PT1A 1MY3A 3PD9A 1JW4A 2I0CA 3M3FA 4IGRA 4H6DA 3IO6A 4FAJA 1Y3NA 5LOMA 1BTJA 1I6BA 2O7IA 4F1UA 4OWDA 3SEWA 3EQ1A 3V83A 5B7DA 3UIFA 4O3BA 3OSRA 3G3HA 4YB6A 3PPRA 1FTMA 2A5TA 4F19A 3OEMA 3LR1A 3SKPA 4H1XA 2Q2CA 4X48A 3MP1A 3VVDA 1QUJA 1HSJA 1OIBA 5FTHA 1F9BA 3L6GA 2Z22A 3H06B 3ECRA 2H5YA 3EF7A 1GGGA 1SQYA 3SDFA 1TFAA 1NNTA 4UACA 1B2HA 1SVXB 1IQ7A 4FE8A 4EQBA 5ITPA 4DE8A 2E0SA 1FQDA 1LAFE 3PMWA 2VD2A 1JVYA 3BFTA 4MBPA 3KJTA 4MH5A 2DS9A 4GL8A 4LATA 3QSLA 1IXCA 2PT2A 3CI8A 1H43A 3CSGA 1ZTYA 4GOTA 3C32A 3K6WA 4F29A 1N3WA 1Y3PA 3ILUB 1B7UA 5H8FB 3I6VA 4IO4A 1SBPA 2DXYA 4F3BA 3G7WA 1WDNA 3U72A 1B4ZA 2PMSA 3EHUA 4MLQA 2OBGA 3OSQA 3FVGA 1B5JA 4DZ1A 3IOWA 3PUWE 5H8NA 3FD3A 1IZ1A 4IO2A 2X7PA 1NNPA 4NF8A 3TDJA 3CR9A 3TCFA 2H9BA 1DSNA 1MY4A 1MY1A 3C33A 4YU0A 1CE2A 5EYFA 1MH4A 3CFZA 1L5TA 4QF9A 3EHTA 5TP9A 4ISUA 2O6AA 3KOTA 3OO9A 5DYHA 3RLFE 1IXGA 1URGA 1GR2A 4WXJA 4EDPA 2ANJA 1R9LA 4RJZA 2VGQA 2RINA 3PUVE 5I59B 2NWJA 1PBPA 2Q9TA 3GLBA 1MXXA 5L9SA 1IXIA 1B32A 3USDA 1URSA 1MM7A 5I58B 3HV1A 4EXLA 5I2KB 4K3FA 3BBRA 3HCQA 5I2NB 1VFEA 4KD5A 5CBRA 5CMCA 1B5HA 1QKBA 4C0RA 3O6GA 4F39A 2THIA 4GQOA 4U1ZA 3VDFA 3E9XA 4JSOA 1US4A 2ZNSA 4M4GA 1NFTA 1XT8A 5ISUA 3CSBA 3TTKA 4OZ9A 3SEXA 4KFQA 3UK4A 3QUFA 2G93A 4DCYA 4LA9A 4RA1A 4O3AA 4GRKA 4N13A 3KSXA 3TZAA 5KCJB 2Y7WA 3O29A 5M2VA 3QK6A 2Q89A 4OHNA 1LFHA 4HTGA 5TPAA 3T96B 3RGYA 3P7IA 3ODBA 2O69A 4OENA 3FVNA 4OFLA 2I6EA 1TXFA 3H3GA 3VFJA 5K2YA 4EF2A 1Y20A 3VXCA 2XXXA 1MXWA 1MDP1 2DVZA 3MZ9A 2HQ0A 3RUMA 1FW0A 1UTHA 3OEKA 1XHYA 2OK2A 3N26A 5DTBA 3K00A 1QKAA 3ONMA 4NF6A 2VD3A 4ZECA 1YTVA 4LP2B 2V3TA 3EN3A 1RYXA 4JSDA 4C1UA 3VXBA 1HSLA 1P1QA 1DMBA 2ONKE 4KCDA 2DXRA 4PFWA 3U92A 1ZIUA 3N6TA 2Z23A 2QL3A 2O84X 1B51A 1IXHA 3FASA 1LFIA 5K2XA 1P1NA 1Y4TA 2E1SA 3B6TA 3THIA 3M8UA 4I8CA 1A8EA 1H3DA 4JWOA 4TLMB 2Q8JA 1SYIA 1Y9UA 1VE4A 5IAIA 4R2FA 4YMBA 4N6PA 1H45A 1N04A 4E0XA 3U1OA 3Q26A 3TYHA 3OO7A 3CVGA 4IO7A 1LGBC 5L8DA 5JEIA 4I62A 1US5A 2YPNA 3TKDA 3LSWA 3RTWB 4G8MA 1B7HA 1EZOA 4G2ZA 3V89B 3LC8A 4GD5A 3H6UA 1SW4A 1MY0A 4AB5A 2V3QA 5ITOA 4C1TA 4LONB 1N76A 1MS7A 3G3GA 4IY5A 5AA1A 1LAHE 1UTBB 3ILTB 1BLFA 3T66A 3KSJA 4JWXA 4TOZA 4R72A 3FXUA 2DWJA 4G68C 2XXRA 2Z8FA 1B1HA 4OTEA 3TTNA 1A54A 1B4HA 4RNSA 3MW0A 5L9MA 4F22A 3OD7A 1B6HA 3O28A 3C34A 2XXUA 3OO8A 1OVBA 1YCJA 1T0KA 4YB7A 3SETA 3K0VA 2ZYMA 1MDQA 3E3KA 1ZLQA 1JW5A 1DTGA 4EXKA 2YJPA 2GH9A 3S9LC 1MQHA 4XKQA 3OO6A 4O3CA 2ABHA 4NWDA 3PUZE 3E4RA 3BFUA 1XC1A 4KQPA 1FTLA 1ELJA 2QPQA 3KJ7A 1LBCA 1JVXA 3G3JA 5CBSA 3L6HA 4KR5A 4NF4B 3N94A 4FECA 2NXOA 1BP5A 3IAZA 4OXVA 3IOUA 3PPNA 3PD8A 4RYAA 5A5XB 1PB9A 1ZBMA 3HN0A 4YICA 2BJJX 1O7TA 2IEEA 3DLNA 4R6KA 5DVJA 3G3IA 1MH3A 3W9WA 1N3XA 1MXVA 2QMWA 3VLWA 1SW1A 2XX8A 4LQ5A 4OEUA 2F78A 2VHAA 3OMBA 4RXLA 4EQ9A 5DVFA 5B70A 2ZMBA 4AQ4A 1SW5A 4NWCA 5EHSA 2ZNTA 2Y7RA 2XXHA 2O7UA 1O63A 1OLAA 5L9OA 4JXIA 1XS5A 1FCKA 4NTLA 3DP6A 3RQTA 1I6QA 5I2KA 3C36A 1H44A 3FATA 5AE4A 5CRYA 1Z7ME 2RCAA 1MQDA 4QFLA 2H25A 4PFUA 4XTCQ 4JB7A 3KOSA 4P0IA 1AOVA 2PVUA 2HAVA 3G3KA 1M5FA 2I3WA 3EHSA 3VVFA 4AB6A 3HSTA 2ESNA 1MG1A 4F3GA 2B3FA 3DP4A 1N7XA 3MVYA 2QJEA 4IO5A 4QSEA 2QS3A 5H8HB 2UYEA 4U21A 3TFLA 3K6VA 4F2OA 1POY1 3IR1A 2Q2AA 5KCJA 3FV1A 4ESWA 1MPBA 1J1NA 4FIMA 4ZZEA 2DSFA 4KYDA 5FHOA 3PUXE 3ZSFA 4FJPA 2AL4A 2WKYA 3H6WA 3D4GA 5AA2A 5HPQA 3MP8A 4F1VA 1PBQA 3S9EA 5JTYB 3TCHA 2X26A 3LBSA 1KWHA 4LQ2A 4ZEKA 4RPNA 3TCGA 2AYSA 1ATGA 4H8JA 4ONYA 4I9DA 2AIXA 1RKMA 1ANFA 3RN8A 2XD2A 4OETA 2ONSA 4BLAA 5AA3A 3H4ZA 4P0GA 4ZEBA 3RPWA 4G68B 1N0TA 1NMUA 1SW2A 2O51A 1FTJA 1B1XA 1CB6A 3CFXA 2B3BA 2XD3A 2QS2A 3PPOA 4HCWA 1P1OA 1DPPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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