5EHMA

Crystal structure of the drosophila cg3822 kair1d ligand binding domain complex with nmda
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
b'ANLKNKTLVVTTILSNPYCMRKESAIPLSGNDQFEGYAVDLIHEISKSLGFNYKIQLVPDGSYGSLNKLTGEWNGMIRELLEQRADLAIADLTITFEREQAVDFTTPFMNLGVSILYRKGTPIESAEDLAKQTRIKYGALKGGSTAAFFRDSKISTYQRMWSFMESARPSVFTASNGEGVERVAKGKGSYAFLMESTSIEYVTERNCELTQVGGMLDTKSYGIATPPNSPYRTAINSVILKLQEEGKLHILKTKWWKEKRG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Novel Functional Properties of Drosophila CNS Glutamate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RE06730p,CG3822
source organism Drosophila melanogaster
molecule tags Membrane protein
total genus 84
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-10-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5ehmA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5ehmA02
2HZKA 1VFDA 2NUVA 2YLNA 2REGA 2F97A 5CM6A 4R2FA 3FVKA 1ZKBA 4I8CA 3MVXA 1YTVA 4YAHX 4I62A 1ZLQA 3TPAA 1PB7A 4R75A 1N0TA 2XXYA 3MPLA 3MBPA 3RTFB 3UGWA 3IB0A 1QUJA 3E9XA 2Z8EA 1Z7ME 4LQ2A 1Y3QA 1A99A 2OK2A 3VE1B 5I56A 3KOSA 3T96B 4AB6A 2UVIA 3GLBA 3KN3A 1ZU0A 4EXKA 1FTOA 4XKPA 3BFUA 1NNKA 5ITPA 1LAGE 5I59B 1CE2A 2ALUA 3LSXA 3OSQA 4IO6A 2Q9TA 4GVOA 3H6VA 4U4XA 4ELOA 1JW1A 4X1BA 3OMBA 2QRYA 2AYSA 5I57A 5AE4A 3TELA 1I6QA 4PP0A 3PV0E 4DZ1A 2HAUA 1LBCA 2VD2A 2F7BA 5H8FB 1EU8A 3ZKLA 1AL3A 1URDA 2O84X 1MY2A 4RPNA 5EHSA 1MXVA 1MXXA 4KCCA 4ESXA 4FIMA 4TLLB 1UTHB 4NEDA 4O3CA 1MQHA 3LSLA 4E0WA 3VFJA 4NE4A 3VVDA 1OLAA 5FHOA 3EHTA 3A3UA 1LFGA 1PB9A 3PUZE 4RNSA 3B6QA 2XXXA 4ELQA 2IEEA 2Y7RA 2VD3A 4F29A 2ZYOA 2I3WA 1IIWA 2F6PA 3L6GA 3UA8A 3OO7A 5CMMA 4MFIA 1PEBA 1A40A 1HSEA 4JSDA 4K3FA 2XXQA 3TCFA 1T0KA 4ZEKA 3QK6A 1SW4A 3FASA 3R7XA 2THIA 1TWYA 1NMUA 4RJZA 3RQTA 4NF6B 3FGSA 1SW1A 4QFLA 2ONKE 3VLWA 2Q89A 4KHZE 4EQBA 1NL5A 1NKXA 1N84A 4R72A 1MQJA 4ZEDA 3FXUA 4ZZEA 1WVJA 1MXWA 4AB5A 2V3UA 1Y9UA 5J1DA 3DP4A 4YKPA 4M1VA 4HTGA 2V84A 2I48A 4H5FA 1QJMA 4PFUA 4ONYA 3C34A 3DM0A 1SYHA 3E13X 2HXWA 1AIVA 2DVCA 5DVJA 1JEUA 5L9SA 3VDFA 4DXUA 3CFXA 1MPCA 4BDNA 3M3FA 1JVXA 3SESA 3K6WA 3WAFA 2PX1A 3T9UA 3QXMA 1JQFA 2DXRA 3EPEA 3TTLA 1D4NA 4Q0CA 2RC7A 1B4ZA 2A5TA 2DP8A 1R1NA 1SW2A 1AMFA 3SERA 2H99A 4F39A 2DSFA 4XKNA 3A3CA 5EHMA 2PT2A 4H0WA 3FATA 1PDAA 1M5EA 3KBRA 1I6AA 3KEIA 5KDTA 1D9YA 1J1NA 2H98A 3FJMA 4YB5A 4EF2A 3MZBA 1UTHA 2H5YA 3K4UA 4OFJA 2Q2CA 5HM4B 2V3QA 1IITA 2Q8JA 2AIXA 3FZVA 2RINA 3MAMA 5ELVA 5L8DA 5H8NA 2X26A 5CMKA 1TFDA 1FCKA 1LBBA 3RGYA 5DVIA 3QIMA 1SBPA 3DLNA 4NTLA 3KFMA 4IO2A 4WEDA 4FORA 4U2RA 3RNNA 5CBRA 2NOOA 2PMSA 3MP8A 1D3KA 4H6DA 3C9HA 1B46A 1TXFA 2QS3A 1JEVA 1FQBA 4ELRA 3IAZA 4ISUA 5F7VA 3H6UA 3CRBA 3TKDA 4IGTA 3CSBA 1H45A 5I2KB 2OJTA 1Q35A 3KJ7A 3MC2A 4N6PA 5DTBA 3U94A 1MY3A 4NF6A 3HCQA 3MQ9A 1SQYA 3K02A 3C33A 4FEDA 3TDJA 3O6GA 2G93A 5KCJA 5I57B 1OLCA 1GV8A 2D3IA 3QSLA 3TQWA 3IK6B 3PPQA 4FATA 3HO7A 2YJPA 1FTKA 1B6HA 2HFBA 1IXIA 2CMOA 2DE4A 1BTJA 3MZ1A 3B6TA 3DP8A 1I6BA 1AH5A 3S9MC 3S9NC 1S9TA 3CIJA 3PGFA 3K1MA 4F1YA 5TPAA 3IOWA 3U8QA 3MVWA 5AA2A 4HCYA 1MPBA 3E3KA 2B65A 1XHYA 4BDLA 1LAHE 1B0HA 2GHAA 2XXIA 4HS7A 1O7TA 1XVYA 1B58A 4H8IA 3K2DA 2ZYMA 4FECA 4WKMA 5KZTA 4IO7A 3UN6A 3EF7A 3S9LC 5HBCA 1DTGA 1RYXA 3U92A 1MY4A 4OFLA 3VXBA 3O97A 4U4SA 3S2VA 3DP6A 5TU0A 1GTKA 3U93A 4PETA 4U23A 2HCAA 3H4ZA 3EN3A 4NF8A 4XKRA 1SW5A 4G68A 1ZMGA 4JSOA 1GR2A 4Q8RA 4KCDA 1LCTA 4QSCA 2UXAA 4LATA 3C36A 4KYEA 3P7IA 3K1NA 1YPNA 3HHGA 1UIUA 3H3GA 2NVUB 3T22A 3K01A 1P1NA 3BBRA 3AXFA 1PBQA 2I3VA 4GL8A 4BDRA 2DWAA 4POWA 2BJJX 2M8CA 2FYIA 5CMBA 1I69A 3THIA 2DE3A 1GGGA 5BWJA 1B3EA 1SVXB 5JEIA 5I2NA 4LONB 1B7HA 4F3SA 4NF4A 3T93B 2QJEA 4GQOA 2B3FA 3FVGA 2ZNTA 2XX8A 1FTMA 3CFLA 1BKAA 3V83A 4ESWA 3LR1A 3IB1A 4EDPA 4UA8A 2ONRA 3VLUA 3IR1A 1B5IA 3O6HA 4R2BA 3RN8A 5I2KA 3TCHA 4NWCA 2RCAA 3GXAA 1SI1A 1B32A 3MP1A 3OEKA 4F1UA 4JB7A 4DCYA 4RXLA 3TQLA 1P1QA 3HSTA 1BIYA 2QPQA 2DXYA 3W15C 2Y7PA 1LAFE 1ELJA 1JNFA 1MRPA 3Q26A 3SEYA 1FW0A 3PMVA 4DLDA 1RKMA 2A5TB 3FV1A 2PVUA 4R9GA 2UVJA 3GBBA 1XOCA 3IJXB 1A8EA 3Q27A 3QUJA 2O6AA 1IQ7A 3IO6A 3E4RA 2P1SA 2QS4A 1JVYA 2ANJA 3KSXA 3RLFE 2ABHA 3T66A 4G68C 2HEUA 5KDTB 5K2XA 3L6HA 2OLBA 1MDP1 5H8QA 4XXUA 3PU5A 3ZKKA 2QMXA 3VV5A 1IXCA 2PBWA 5M2VA 4KD5A 5ITOA 3A09A 3SEWA 4QF9A 3TAJA 5B70A 4X9TA 4X1DA 1LFIA 3K6UA 5H8NB 3TUSA 1USYH 3ZSFA 3SKPA 2O69A 4EQ9A 2NXOA 3FJ7A 1MXUA 4GD5A 3QUFA 1ATGA 3MW0A 2XXPA 2V25A 1MPDA 3R6UA 1CB6A 5DYHA 3ZS6A 2UYEA 3IJOB 3UIFA 5CI5A 3OO6A 2DWHA 1LB9A 4Z0IA 4R6KA 5IKBA 1SDXA 1S7YA 3OO9A 3PPPA 2I4BA 4MH5A 2FNCA 3M3LA 3M8UA 2XD3A 4TQUQ 4WEPA 4EF1A 5KCJB 3UK4A 1FQAA 2CZLA 1II5A 4YMBA 4QRZA 4I9DA 4G2ZA 2O51A 2E1SA 3I6VA 2Y7IA 2QS1A 1US5A 1MM7A 1FTLA 1MY1A 2F34A 3RUMA 1UTBA 4YZZA 4YKKA 4IO5A 3PUVE 3LSWA 1ZJLA 2REJA 2QL3A 5TPAB 4EUOA 1N7WA 3VVEA 3KZGA 1P1UA 3FD3A 1FQDA 3PPRA 4TLMB 4Z7EA 5AA2B 4QFPA 2DOJA 4GOTA 4ZDMA 4EXLA 5I58A 3O9PA 4GL0A 2V3TA 1Q1KA 4ZEIA 1B2HA 1B51A 4HW8A 1B3HA 1QUKA 1Y3NA 4G4PA 2ZMBA 1MH4A 4C0RA 4YB7A 3N6TA 4ZZAA 3B7DA 1JW5A 3SEUA 1MDQA 2XXHA 1MM6A 1B4HA 2D21A 3C32A 4NF8B 2AL4A 1B9JA 4G68B 4JXIA 2ZXTA 1QUIA 3HV1A 3T9XB 3USDA 5CBSA 3WAEA 4H8JA 3O29A 1XVXA 2Q88A 1B52A 1POY1 3Q29A 1O64A 1Y3PA 2XXVA 3FV2A 4FJPA 2RC9A 1B7UA 2GH9A 5JTYA 2I0CA 4OQOA 4JWXA 4IO3A 4FEBA 1WODA 1P99A 5EYFA 4GFRA 3MJNA 4GLIA 5ICQA 1MQDA 3FJGA 3IO4A 5B7DA 5I2NB 4GXAA 4Q30B 4EQ7A 4X48A 4NF4B 3RPWA 3GBAA 1R9QA 2OCUA 4KR5A 4OVJA 1YAEA 3FXQA 3TTKA 3S4UA 1TT1A 5FTIA 2O7UA 5H8HA 3KN8A 5AA2D 1IXGA 2RF1A 4OHNA 3FUZA 2GHBA 2I58A 4ZS9A 3TMGA 5FHNA 1B7ZA 4U21A 2O1MA 1NH8A 3LUYA 3EQ1A 3CG1A 4LVQA 4JWYA 4DDDA 1VFEA 2HZLA 4POXA 2ZNSA 4OERA 3TTNA 3C35A 4RK2A 3D4GA 3TTMA 2F5XA 4MLQA 4LZ7A 3CSGA 2ZYNA 1PBPA 2YPNA 3PUYE 2Z22A 3CG3A 1VE4A 3IX1A 3SEXA 4F31B 1OVBA 2Z8FA 3ODBA 4FAJA 1Z7NE 4GRKA 1N76A 1M5FA 4F18A 1XS5A 5A5XA 4RA1A 3VXCA 1A54A 1L5TA 5H8QB 2FA7A 3PD8A 3OSRA 2E0SA 1HSLA 4F2QA 3PMWA 3O28A 1EZOA 4KYSA 1MH3A 2DS9A 3H06B 4ELPA 5CC2A 1M5BA 4L17A 1QKAA 3I3VA 2Y7KA 1OQGA 1B1HA 1M5DA 2F36A 4G8HA 1LGBC 3KOTA 3OO8A 2D5WA 1B5HA 2OBGA 1MQIA 1UQWA 4F19A 5L9OA 4LQ5A 2UVGA 4YKJA 4NF5A 3PMXA 2PYYA 1P1OA 4XTCQ 3Q25A 3TCGA 4THIA 3EHSA 1NH7A 2X7QA 1LLSA 4OWDA 1URGA 2H9BA 1B3LA 3O2AA 3G3IA 5TP9B 3V8XB 2Z8DA 1ZTYA 4FE8A 2R9JA 4RK9A 1B0LA 2KLFA 4IY5A 1YCJA 4OTEA 3G3HA 3RT8A 3W9WA 3FVOA 4LUBA 3IB2A 1UTBB 3VLVA 4R6YA 4DXCA 1Y20A 4QSDA 1VR5A 3ILUB 1B1XA 4MLVA 1USYE 3MVYA 1EZ9A 4ZEBA 3SETA 2F8DA 1O63A 4JDFA 2F78A 4E0XA 3DELB 3PUXE 3KN7A 4OXVA 3VVFA 4YMAA 2R71A 2XXTA 3TTRA 5I58B 1R6ZA 4DIGA 2P2AA 1DSNA 1MS7A 3Q28A 4I1DA 4OETA 1S50A 1VSOA 2O68A 3SDFA 1H3DA 4H65A 1QKBA 3N26A 3FIRA 1SD3A 4GWOA 3HN0A 1BP5A 3D4CA 4AQ4A 1QVSA 5AA1A 3N94A 4NWDA 4QHQA 1Y1MA 2F35A 3LSFB 3ECRA 4ZE9A 1NNPA 5JK4A 3PUWE 3TYHA 2VP1A 4Q5TA 4P0IA 4U1ZA 3MVZA 1UIVA 2O1LA 5JTYB 3FXRA 1B3GA 1FQFA 1OIBA 2XD2A 1MG1A 4R6HA 3OELA 2RKMA 1POTA 2Z23A 4OMBA 4QFNA 5DEXB 3IOUA 2HAVA 4DXBA 3HPIA 4LZ8A 2WKYA 1WDNA 4F22A 1FQCA 5I84A 3CFZA 1IUDA 4IB2A 4YB6A 1DPEA 1DPPA 2GFEA 1FTJA 1QULA 4F3PA 2W7YA 2DYXA 5H8HB 1Y1ZA 4ZEFA 3T9HB 2LAOA 3H03A 4YICA 3GZGA 1TFAA 4RY1A 4GXSB 1NNTA 3KG2A 5AA3A 4PFTA 2A5SA 4H1XA 4KFQA 4ND9A 1ZIUA 1R9LA 2VHAA 4OENA 4XIGQ 3ILTB 3KGCA 5TP9A 1LAXA 3V89B 1OQHA 2DQVA 1DTZA 2H25A 4ZECA 4P0GA 3B6WA 4YKIA 3KJTA 3I5OA 3HHFA 2OWTA 2I4CA 3S9EA 1DMBA 5HPQA 1IEJA 4RPOA 1NFTA 4PFYA 4MBPA 3KSJA 2F7AA 5CRYA 3TEPA 4F2OA 2DWIA 4G8MA 1ANFA 4P11A 4OYVA 3UP9A 2I6EA 4UACA 1A8FA 3H6WA 5AA4B 2X7PA 3EHUA 4JBZA 4LZ5A 3OD7A 3G3JA 1HSJA 3U72A 3JYRA 4R9FA 5DT6A 5A5XB 3QAXA 1EH3A 1XT8A 1MQGA 1JW4A 3G7WA 3K6VA 1A7LA 2GRVA 4LA9A 5ICTA 1Y4TA 1M5CA 1F9BA 5I59A 4R74A 1MXZA 1EZPA 1P1WA 4PE5B 1B40A 1AOVA 5FHMA 3K0VA 3V5AA 3MP6A 4QFKA 1US4A 1B3FA 4H5GA 3M3KA 1QW0A 3UORA 4PQJA 4R73A 3QYTA 4PFWA 2O7IA 4NF5B 1ZBMA 4QSEA 2B3BA 3IORA 3TFLA 3BKIB 3O6IA 4QFOA 2XXRA 2H4IA 4O3AA 5BUUA 5H8FA 3IL1B 1XC1A 5FTHA 2Q2AA 2ONSA 4BLAA 3RT6B 3MPKA 3LBSA 2P0SA 4KI0E 4XKQA 3OXNA 1OMPA 4IGRA 2OWSA 3OEMA 3TZAA 4G8NA 1DOTA 5DEXA 1LSTA 2F7CA 2VOZA 3MUQA 4BDOA 2AL5A 3PD9A 4OZ9A 5F1QA 4WXJA 3N6UA 4IO4A 4KPTA 2VGQA 4C1UA 4GIZA 4BDMA 3PPNA 2DE2A 2XX7A 4G77A 4U22A 3BFTA 1N3WA 3K1PA 1LFHA 2XX9A 5K2YA 1IZ1A 1JETA 2RCBA 2HQ0A 2V93A 1H76A 4F3GA 4M4GA 4OEUA 4JWOA 3RTWB 3MZ9A 5I56B 3G3GA 4HCWA 4RYAA 3H7MA 2F6GA 4U1OA 1KWHA 3G3KA 2PT1A 3PPOA 3O66A 4C1TA 4ECFA 4H67A 5H8SA 2ZNUA 2Y7WA 4IY6A 2QS2A 1MXYA 3H6TA 1B5JA 4OFOA 2DWJA 1SI0A 4OEVA 3N5LA 2IA4A 1LCFA 4N07A 5L9MA 2XXWA 3F11A 3LC8A 4NMYA 1BLFA 2ESNA 4TOZA 3OENA 1A55A 2RC8A 1GVCA 5AA4A 1N04A 3C31A 3TODA 2QSXA 2UYFA 5LOMA 4F1VA 3R26A 1D9VA 1OVTA 1H44A 3SEVA 3K00A 5DVFA 2UVHA 1B05A 1PC3A 3CVGA 4MF3A 2OZZA 1IXHA 3OOAA 2R6GE 4BDQA 1LB8A 3CI8A 3FVNA 3C4MA 3MWBA 3JV9A 4KYDA 4KQPA 1FQEA 4DCXA 1N7XA 1SYIA 2G29A 1N3XA 4O3BA 3RY3A 3JZJA 1RYOA 2ZYKA 1URSA 3U1OA 3T9VA 3G3FA 2XXUA 2XHDA 4GF8A 3CR9A 1H43A 4LP2B 5CMCA 2Y84A 1NNFA 3K6XA 4N13A 2NWJA 2I0BA 4OESA 4F3BA 4ZE8A 2I49A 4YU0A 1MY0A 1Y4CA 2DVZA 5IAIA 4DE8A 3W9VA 5ISUA 3IOTA 3IOVA 2QMWA 1PB8A 3ONMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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