5EHMA

Crystal structure of the drosophila cg3822 kair1d ligand binding domain complex with nmda
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
ANLKNKTLVVTTILSNPYCMRKESAIPLSGNDQFEGYAVDLIHEISKSLGFNYKIQLVPDGSYGSLNKLTGEWNGMIRELLEQRADLAIADLTITFEREQAVDFTTPFMNLGVSILYRKGTPIESAEDLAKQTRIKYGALKGGSTAAFFRDSKISTYQRMWSFMESARPSVFTASNGEGVERVAKGKGSYAFLMESTSIEYVTERNCELTQVGGMLDTKSYGIATPPNSPYRTAINSVILKLQEEGKLHILKTKWWKEKRG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Drosophila melanogaster
publication title Novel Functional Properties of Drosophila CNS Glutamate Receptors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RE06730p,CG3822
total genus 84
structure length 261
sequence length 261
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-10-28
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5ehmA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 5ehmA02
4E0WA 3QUFA 3KSXA 3UP9A 3W15C 4BDRA 4OXVA 4ZZEA 5L8DA 2HAVA 2XXYA 4R75A 4F19A 1H3DA 1LLSA 2PX1A 1DPPA 4OEUA 2F6GA 3VLVA 1USYH 4LATA 1JVYA 4YAHX 5FHNA 3O6HA 3G3KA 1DPEA 3THIA 5AA1A 3FASA 3CG3A 2ZMBA 4KD5A 2Y7IA 3IOVA 4Z7EA 3K01A 2F78A 3IX1A 1B7ZA 2Z8EA 4R2BA 4R9FA 1UIVA 4QRZA 3C31A 1ZLQA 3CI8A 2ZNSA 2F34A 2QPQA 1NKXA 4I1DA 1US5A 3B6QA 2DWJA 3MPLA 4WEDA 4EF1A 4OESA 4G8MA 4LQ2A 2OWTA 3IO4A 5I2NA 4U1ZA 1B58A 3OOAA 3KSJA 4XXUA 2QS1A 1MY2A 3FD3A 1BTJA 3B6TA 4GLIA 1GGGA 4GQOA 4OYVA 4GL8A 2QS2A 1FCKA 3Q28A 1UTBB 4ZEDA 3R26A 3TTKA 3FJGA 4N6PA 4NF6B 4KHZE 2W7YA 4FE8A 3IOUA 2QRYA 4F2OA 5K2YA 4LUBA 1B1XA 5CMBA 2XX7A 1A55A 2PT2A 2DE4A 3RGYA 3SERA 3H6WA 5CBSA 1I6QA 5ISUA 2V3TA 4BLAA 4ISUA 5DVFA 1AIVA 5I84A 4WKMA 3PMVA 4QF9A 2D5WA 5ELVA 5H8HB 3O66A 4MLQA 4RA1A 3PMWA 3QAXA 2DXRA 3H03A 3FVKA 3TQWA 4XKRA 2XHDA 4EQ9A 4H0WA 1H43A 3DELB 1NNTA 3QXMA 4C0RA 2ZYNA 3E3KA 1KWHA 1N04A 3CSGA 5IKBA 4N13A 1B3EA 1NL5A 4NF8B 3H3GA 1MXXA 1XOCA 2F5XA 3IOTA 2RINA 4RPNA 4C1UA 3V83A 4GVOA 3KFMA 4FORA 4GFRA 4FAJA 3KZGA 2Q9TA 3DP4A 2HEUA 1TWYA 1A8FA 4R72A 1QUJA 4MFIA 3CFXA 2PMSA 2DWAA 2F8DA 3E13X 4NF5B 4ELOA 1SYIA 3EF7A 1M5DA 4NTLA 1B46A 1R9LA 2UYEA 1LAFE 2AL5A 2IA4A 2ZNUA 4G68B 4QFKA 2I58A 5HM4B 1MQGA 1Y3NA 1P1NA 2XXVA 3R7XA 1N0TA 2M8CA 1OLAA 4X48A 4KFQA 3KBRA 2O1MA 4U22A 3TTMA 2DVCA 1Z7ME 3OMBA 2E0SA 4KPTA 1PB8A 1UTHA 2Y84A 3SEUA 4JBZA 4U23A 3G3FA 3T9HB 3CFLA 4NMYA 3L6GA 2I0BA 2LAOA 2F7CA 4NF4A 2Y7RA 3HCQA 2Q8JA 1IQ7A 3O6GA 2NWJA 5KZTA 1OIBA 3IJOB 4YU0A 2UXAA 5AE4A 5CM6A 3RPWA 1YCJA 3HO7A 4HS7A 4EDPA 5AA4B 1NNFA 3FXRA 4IO3A 2ZYOA 4LVQA 3GLBA 1MDP1 2AIXA 2ANJA 3G3JA 3PUWE 3A09A 1EZOA 4RK2A 2DE2A 3P7IA 1MPBA 4U1OA 3FATA 1ZJLA 4KR5A 4OWDA 1B0HA 2A5TB 1MH4A 4WEPA 5FTIA 1L5TA 3AXFA 4ZEKA 1NMUA 3K0VA 3MWBA 5IAIA 3W9VA 4DIGA 5KCJA 4GRKA 3H6UA 1IITA 5DVIA 4OFOA 1MXWA 1B5JA 3RT8A 1WVJA 5H8NB 5H8FB 1B40A 1GVCA 2H99A 1QULA 1MQHA 3GXAA 3OO7A 1NNPA 3C33A 3DLNA 4JWYA 1PB9A 3QSLA 1XVXA 3TMGA 3T22A 3C35A 3DM0A 3T9XB 2ABHA 2R6GE 4H5GA 1B3FA 2CZLA 4THIA 3N6UA 3MVZA 3MP1A 5K2XA 2DP8A 1P1UA 5I57B 3LSFB 1SW2A 1PB7A 2X7QA 1SDXA 3MP6A 1AOVA 1QKAA 1EZ9A 4ZE9A 2F36A 1MPDA 3T93B 4JSOA 4OFJA 2ESNA 3PPOA 4RPOA 4YICA 3BFUA 2XXUA 1TFDA 1US4A 5EHMA 1IXHA 2GH9A 1A54A 3SEVA 5H8SA 2QSXA 2NVUB 4UA8A 4KQPA 4E0XA 3EHSA 3Q26A 5L9SA 3TTLA 4OZ9A 4F39A 1SI1A 1PBPA 4F1VA 1EH3A 4IO4A 3FJMA 4QFNA 1MY1A 1A7LA 1N3WA 3PD8A 1N7WA 4OFLA 2ZYKA 1FTJA 1H44A 4DXUA 4P0IA 4HCWA 2DVZA 1WDNA 2XXXA 1BIYA 3SKPA 3U1OA 1B9JA 1OVBA 5KDTB 2ZNTA 3JYRA 2Y7WA 3FVNA 3QYTA 2RC9A 3ONMA 2VOZA 1B6HA 3OEKA 3H6TA 3UGWA 3VVEA 1B2HA 1URSA 4U4SA 5CBRA 3K6XA 4OENA 3OO6A 4N07A 4PP0A 2B3FA 4LQ5A 2Z8DA 4X9TA 3S4UA 1I69A 2Z22A 5TP9B 2XXRA 4TOZA 1P1OA 4U21A 4OQOA 1SVXB 2QL3A 3N6TA 4OERA 3Q27A 4EQBA 4UACA 1POY1 4IO2A 3FXUA 1JNFA 3N26A 4R6HA 3RN8A 3VFJA 3FZVA 4LONB 2RKMA 5ICQA 2F97A 2FNCA 4PFTA 4MH5A 4Q8RA 5AA2B 5EHSA 3A3CA 1USYE 5JTYB 4KYSA 4RYAA 3PD9A 2D21A 5CRYA 5EYFA 4POXA 1D9VA 1NH8A 3MC2A 2HAUA 2HQ0A 3SEWA 4C1TA 1CE2A 3MBPA 3K02A 3OO8A 1H45A 3IL1B 4ZEFA 1I6AA 3PPPA 3MPKA 5I59B 1FW0A 3LR1A 4GOTA 4QSCA 4PETA 3MVYA 5I58B 3TPAA 5HBCA 3B6WA 3BKIB 2X7PA 3O28A 5I56B 4I9DA 2O84X 1ELJA 2O7IA 3K6UA 4G4PA 1MM6A 2XXTA 3N5LA 1B3GA 2P1SA 3V8XB 1YAEA 2AL4A 3EN3A 1SW1A 4O3BA 3PUXE 2HCAA 1XC1A 1A99A 2ONSA 4JSDA 2IEEA 1D9YA 5M2VA 1HSLA 1URGA 2F7AA 3QUJA 4HCYA 5DEXB 3GBAA 5BUUA 3CSBA 1B51A 3H7MA 3MQ9A 1Y1ZA 1WODA 3VV5A 1MY4A 1MQDA 4DDDA 3G3IA 1PEBA 1LBCA 4DCXA 4IGTA 3KN3A 2B3BA 1D3KA 3M8UA 5CMKA 4RK9A 2Y7KA 4KCCA 2G29A 3KGCA 1Y3QA 4FJPA 1GTKA 4G68C 2O51A 1ANFA 2O7UA 1MQIA 4R6YA 1F9BA 5HPQA 5TPAA 2FYIA 4H8JA 3K00A 2I4CA 3LC8A 3ILUB 2BJJX 3C34A 2O69A 3LBSA 4TLLB 2YJPA 3IORA 1N84A 1B7HA 1TXFA 2I48A 4IGRA 1HSEA 3RQTA 5A5XB 3LUYA 1B4HA 4AB6A 2HZKA 1OMPA 2QMXA 4LA9A 3CG1A 4L17A 4GXAA 1IXGA 4H8IA 3V5AA 2YLNA 2VHAA 4O3AA 2XXIA 1MXVA 2Q88A 2PYYA 3TODA 5ITOA 1B4ZA 1B5IA 3G7WA 3O9PA 3CVGA 3VLUA 1DTGA 4YMAA 4G8NA 2XD2A 4ELPA 3HHFA 4R2FA 3TELA 4NEDA 1IZ1A 3FGSA 5FTHA 3TCGA 3T9UA 3C9HA 3RTFB 4OMBA 3M3FA 2HFBA 1R1NA 5I2NB 5JEIA 5H8QB 4Z0IA 3LSXA 1O7TA 4Q5TA 1NNKA 2DWIA 3IB1A 3MP8A 1FQBA 3TTNA 1N76A 4F3GA 2ZXTA 3LSWA 2QJEA 5CMCA 4FATA 4GWOA 4F2QA 4KCDA 4EXKA 1JEUA 2Q89A 2V84A 1QJMA 1FQCA 3ILTB 3M3LA 1YPNA 3KJ7A 2VP1A 1QUIA 1LBBA 1R6ZA 3C32A 2OJTA 3R6UA 3KN8A 3G3GA 4U2RA 2QMWA 2RC8A 2NXOA 3O97A 2RCAA 1XHYA 2F6PA 3IR1A 3S9LC 2THIA 4H67A 5AA3A 3DP6A 2XX8A 1QVSA 1OLCA 4ESXA 1SYHA 2R71A 5I2KA 3K2DA 2DXYA 3S9EA 3FIRA 4BDQA 3L6HA 1EU8A 1BKAA 3HN0A 1ATGA 1TT1A 3K1NA 2H5YA 1FTKA 4QSDA 3PUVE 1B32A 4YKJA 4POWA 3K6VA 1JEVA 3RUMA 4F3SA 2HXWA 3U92A 4LZ7A 2UVJA 4GXSB 3TZAA 3FXQA 4LZ5A 1GV8A 1BLFA 4YZZA 4G2ZA 1S7YA 1MXZA 1D4NA 4F18A 1A40A 2I3VA 4TLMB 2UVHA 1B0LA 1MG1A 3H06B 1DTZA 2B65A 3KN7A 2OCUA 3UN6A 4LP2B 3TEPA 2UVIA 1FQFA 1LFIA 4TQUQ 1PBQA 1PDAA 2V25A 1RYOA 3VLWA 3MZBA 3RLFE 4XTCQ 4X1BA 1Q1KA 1UIUA 1QKBA 4PQJA 4WXJA 2H25A 2V93A 1IUDA 1B52A 4R6KA 1JW5A 1AL3A 3RT6B 1LSTA 3D4CA 1UTHB 4YMBA 1SQYA 3MUQA 1MM7A 3UORA 3MW0A 1P1WA 3OEMA 4I8CA 1P99A 1MXYA 5F7VA 4IB2A 2RF1A 3IB0A 3VXBA 3IOWA 1UTBA 1MH3A 2ZYMA 4NF4B 1B1HA 3TCHA 3EHUA 4IO6A 4PFUA 4AQ4A 2H9BA 4NF6A 1A8EA 2I0CA 1SI0A 2A5SA 2DWHA 1II5A 2Q2AA 5F1QA 1UQWA 3ZSFA 3PMXA 4BDMA 3G3HA 3VVDA 3BBRA 1ZU0A 4R73A 4R74A 3S2VA 2OWSA 5H8HA 2UVGA 1N3XA 1NH7A 4HW8A 1BP5A 2XX9A 3I5OA 1LAXA 1JVXA 1LAGE 1QUKA 3HPIA 1SD3A 1ZIUA 3BFTA 1ZBMA 3PUYE 1H76A 4K3FA 3OD7A 4F1YA 5KCJB 5BWJA 3K4UA 1JQFA 3MJNA 5ITPA 1AH5A 2XD3A 2PVUA 4NF8A 3TQLA 3ZKLA 1B3LA 3TUSA 3T66A 3RNNA 3SESA 5ICTA 4RJZA 3A3UA 2NUVA 3PPNA 5A5XA 3Q25A 2GHAA 4H6DA 4ZZAA 5AA2D 2QS4A 3VVFA 3ODBA 3KOTA 3U8QA 4YKPA 3I3VA 1B7UA 4U4XA 4YKIA 3E4RA 1M5EA 2Z23A 3Q29A 5J1DA 4ESWA 1RKMA 3GZGA 2OZZA 1MRPA 3K1MA 2PT1A 3W9WA 4YB7A 4H5FA 1GR2A 4NF5A 4ND9A 1SBPA 4OEVA 3FUZA 2E1SA 4H1XA 3O29A 3WAEA 2F7BA 1SW4A 4G68A 2ONKE 1MDQA 3T96B 3IB2A 1Y20A 4ZEIA 3IJXB 3CFZA 3PGFA 5B7DA 4KYEA 3ZS6A 2O6AA 3TKDA 1VE4A 2I4BA 4G8HA 3VDFA 1LFGA 5H8QA 2VGQA 1MXUA 3C36A 3MVXA 4GL0A 2OK2A 3LSLA 4XIGQ 5DT6A 1O63A 5L9OA 4YKKA 1I6BA 3ZKKA 3MAMA 2ALUA 1IXIA 4I62A 1B05A 1Y1MA 1DMBA 1M5BA 4NE4A 3M3KA 3QK6A 1S50A 1JW1A 4DLDA 4ELRA 2GHBA 5FHOA 1IEJA 1FQDA 1OQHA 2P0SA 4BDLA 5AA4A 1O64A 1IXCA 3MZ9A 3IAZA 3SDFA 4QFOA 3KJTA 4OTEA 2O1LA 4NWDA 3U94A 3FJ7A 2P2AA 1NFTA 3TDJA 1POTA 2RCBA 4YB5A 4GF8A 2PBWA 3TYHA 2A5TA 1ZMGA 3S9MC 2UYFA 3OSRA 4XKNA 4ZE8A 2NOOA 3QIMA 1ZKBA 3USDA 1JW4A 5H8NA 5H8FA 2G93A 3SEXA 4FECA 5DVJA 2VD3A 4M4GA 4ZECA 1ZTYA 3JZJA 1M5CA 1LCTA 4XKQA 2QS3A 3RY3A 1FTOA 1N7XA 4QFPA 1M5FA 3GBBA 2I6EA 5I57A 1JETA 1R9QA 1Y4CA 3UA8A 2F35A 1LCFA 1QW0A 1Y4TA 1LB9A 1Z7NE 3MVWA 4KI0E 4AB5A 4F31B 4M1VA 4RNSA 3HV1A 2XXHA 4G77A 3EPEA 3UIFA 2ONRA 2RC7A 2KLFA 5FHMA 3V89B 2DSFA 2XXWA 3N94A 4ECFA 4EUOA 1B3HA 1Y3PA 3FVOA 1S9TA 3H6VA 4FEDA 4MBPA 4MF3A 4QFLA 3C4MA 1VFEA 1VFDA 1YTVA 4DZ1A 5JK4A 2OBGA 1OVTA 2XXQA 4LZ8A 2VD2A 2DE3A 4EQ7A 1XVYA 1CB6A 1Y9UA 2I49A 2OLBA 3O6IA 1LFHA 5CMMA 4RY1A 1FTMA 2WKYA 4JDFA 4OVJA 5KDTA 1LGBC 1URDA 3PPQA 3SETA 1DOTA 4F1UA 3IO6A 1B5HA 5CI5A 1T0KA 4P11A 4RXLA 3SEYA 2V3QA 4EXLA 3E9XA 3ECRA 4F3BA 3H4ZA 2O68A 4JB7A 4HTGA 3OELA 3PUZE 2D3IA 3B7DA 5TP9A 4EF2A 1RYXA 3EQ1A 5TPAB 4ONYA 4ELQA 2AYSA 1EZPA 4IO7A 4PFYA 3VXCA 4IY6A 4FEBA 1AMFA 3K6WA 1LB8A 3OXNA 4ZEBA 4XKPA 3T9VA 1MQJA 5CC2A 1MY3A 3UK4A 4PE5B 5AA2A 1MY0A 3TFLA 2Q2CA 1XT8A 4ZDMA 3KG2A 1MS7A 5JTYA 2DQVA 3WAFA 3VE1B 5L9MA 3KOSA 1FTLA 3PV0E 3PU5A 1FQEA 2XXPA 2DYXA 5DTBA 4O3CA 3CR9A 4GD5A 2REGA 4DXCA 4IO5A 3U72A 2H98A 1P1QA 3DP8A 3U93A 5I59A 3TCFA 4BDOA 2YPNA 5LOMA 5I58A 3I6VA 3IK6B 4DCYA 5I56A 2Z8FA 3O2AA 5B70A 2CMOA 4R9GA 4IY5A 4Q0CA 3FVGA 4DXBA 3OENA 4F29A 4H65A 1FQAA 4DE8A 4F22A 4JWXA 1TFAA 3F11A 5DEXA 3EHTA 4X1DA 4FIMA 3FV2A 4P0GA 3JV9A 2GFEA 3OO9A 1VR5A 4GIZA 2FA7A 2H4IA 4JXIA 4QSEA 4OETA 2GRVA 5DYHA 2HZLA 2R9JA 4NWCA 4OHNA 3CIJA 3HSTA 1MPCA 3S9NC 2X26A 5I2KB 1J1NA 2DS9A 1XS5A 4BDNA 3RTWB 1Q35A 4Q30B 3CRBA 2REJA 3HHGA 3FV1A 4ZS9A 1HSJA 1DSNA 5TU0A 1IIWA 3K1PA 3D4GA 1OQGA 2V3UA 4KYDA 3KEIA 2Y7PA 3PPRA 2DOJA 3TAJA 4PFWA 4QHQA 3TTRA 3OSQA 2I3WA 1PC3A 4MLVA 4YB6A 4F3PA 1LAHE 3MZ1A 1SW5A 1VSOA 4JWOA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4E0WA 3QUFA 3KSXA 3UP9A 3W15C 4BDRA 4OXVA 4ZZEA 5L8DA 5I3SA 2HAVA 2XXYA 4R75A 4F19A 1H3DA 1LLSA 2PX1A 1FPJA 1DPPA 4OEUA 2F6GA 3VLVA 1USYH 4P1LA 4LATA 1JVYA 4YAHX 5LDZA 5FHNA 4PDDA 3O6HA 3G3KA 1DPEA 3THIA 5AA1A 3FASA 3CG3A 2ZMBA 4KD5A 2Y7IA 3IOVA 4Z7EA 1DK4A 2XA5A 3K01A 2F78A 3IX1A 1B7ZA 2Z8EA 4R2BA 4R9FA 1UIVA 4QRZA 3B50A 3C31A 1ZLQA 3CI8A 2ZNSA 2F34A 2QPQA 1NKXA 4I1DA 1US5A 3B6QA 2DWJA 3MPLA 4MHFA 5IZ3B 4WEDA 4EF1A 4OESA 4G8MA 4LQ2A 2OWTA 5IM2A 3IO4A 5I2NA 4U1ZA 1B58A 5EYHA 3OOAA 3KSJA 4XXUA 2QS1A 1MY2A 3FD3A 4PGPA 1BTJA 3B6TA 4GLIA 1GGGA 4GQOA 2DDKA 4OYVA 4GL8A 2QS2A 1FCKA 3Q28A 1UTBB 4HE1A 4PFRA 4ZEDA 3R26A 3TTKA 3FJGA 4N6PA 4NF6B 4KHZE 2W7YA 4FE8A 3IOUA 2QRYA 1LEVA 4OVRA 4F2OA 5K2YA 4LUBA 2F3DA 1B1XA 5CMBA 4PC9A 2XX7A 1A55A 2PT2A 2DE4A 3RGYA 3SERA 3H6WA 5CBSA 1I6QA 5ISUA 2V3TA 4BLAA 4ISUA 3MYUA 5DVFA 1FBGA 1AIVA 5I84A 4WKMA 3PMVA 2P3NA 1FPLA 4QF9A 2D5WA 5ELVA 5H8HB 3O66A 4MLQA 4RA1A 3PMWA 3QAXA 2DXRA 3H03A 3FVKA 3TQWA 4OVQA 4XKRA 2XHDA 4EQ9A 4H0WA 1H43A 3DELB 4N15A 1NNTA 2JJKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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